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Dissertations / Theses on the topic 'Recherche de chemin de reaction'
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Yang, Xiaotian. "New transition state optimization and reaction path finding algorithm with reduced internal coordinates." Thesis, Sorbonne université, 2021. http://www.theses.fr/2021SORUS481.
Full textAbstract:
Les caractéristiques d'une réaction chimique sont largement déterminées par les structures moléculaires associées au réactif, au produit, à l'état de transition et au chemin qui les relie. Par conséquent, localiser les points stationnaires sur la surface du potentiel moléculaire est la première étape vers une modélisation numérique réussie. Mathématiquement, les réactifs, les produits et les intermédiaires réactifs sont des minima locaux sur la surface d'énergie potentielle. Deux minima locaux sont reliés par un point stationnaire qui est un maximum le long du chemin de réaction mais un minimum dans toutes les autres directions. Ce point de selle est appelé l'état de transition (TS) entre les deux minima locaux. Une fois que tous les points stationnaires importants sur la surface du potentiel ont été localisés, on peut modéliser l'ensemble du processus de réaction, y compris le (s) mécanisme (s) de la réaction et ses propriétés cinétiques et thermodynamiques (vitesse de réaction, constante d'équilibre, exothermicité, etc. réactions en plusieurs étapes, l'existence d'intermédiaire (s) complique le mécanisme de réaction. De plus, il peut y avoir plusieurs chemins de réaction possibles, dans lesquels différentes structures intermédiaires relient les mêmes réactifs et produits. Dans ces scénarios compliqués, avoir un chemin complet d'énergie minimale montrant La manière dont les réactifs et les produits sont reliés par diverses séquences de structures est particulièrement utile, car elle fournit aux chercheurs des détails atomistiques sur le mécanisme de réaction. Cela peut être utile, par exemple, pour concevoir de meilleurs catalyseurs. [...]The characteristics of a chemical reaction are largely determined by the molecular structures associated with the reactant, the product, the transition state, and the path connecting them. Therefore, locating the stationary points on the molecular potential surface is the first step towards successful numerical modeling. Mathematically, reactants, products, and reactive intermediates are local minima on the potential energy surface. Two local minima are connected by a stationary point which is a maximum along the reaction path but a minimum in all other directions. This saddle point is called the transition state (TS) between the two local minima. Once all the important stationary points on the potential surface have been located, one can model the whole reaction process, including the mechanism(s) of the reaction and its kinetic and thermodynamic properties (reaction rate, equilibrium constant, exothermicity, etc.. For multistep reactions, the existence of intermediate(s) complicates the reaction mechanism. In addition, there may be multiple possible reaction paths, wherein different intermediate structures connect the same reactants and products. In these complicated scenarios, having a full minimum-energy path showing how reactants and products are connected by various sequences of structures is especially useful, as it provides researchers with atomistic detail about the reaction mechanism. This can be useful, for example, for designing better catalysts. [...]
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Gruber, Monique. "Henri Suso ou la recherche d'un chemin mystique à l'aide du texte et de l'image." Thesis, Metz, 2008. http://www.theses.fr/2008METZ020L.
Full textAbstract:
Des trois mystiques rhénans importants, Suso est le seul à avoir accompagné ses textes d'images suggestives, souvent reflets de ses images mentales et de ses visions. Après avoir étudié, dans une première partie, sa vie et ses oeuvres, nous tentons de dresser un résumé de ses travaux illustrés, bien qu'un seul manuscrit ait été supervisé par lui ; mais les artistes postérieurs ont suivi assez fidèlement ses conseils. Nous avons essayé de décrire la civilisation des images dans laquelle baigne Suso, et surtout comment il réalise, à partir de là, une véritable oeuvre pédagogique, se donnant en exemple et traçant, à l'aide des images, un chemin mystique à l'égard des religieuses dont il a la charge. En seconde partie, nous "chassons les images par les images" : après avoir examiné en détail un manuscrit du XIVe siècle, nous nous livrons à un travail de comparaison entre les différents Exemplaires connus. Mais ces images chassées les unes par les autres aboutissent à leur disparition finale : et notre troisième partie explique, d'après Suso, le processus de rejet, par le détachement -ou Entbildung, pour aboutir à l'Uberbildung, transformation dans la déité : l'union mystique, prélude de la vision béatifiqueOf the three Rhenish mystics, Suso is the only one that accompanied his texts with suggestive pictures, often the reflection of his mental images, of his visions. In the first part, after studying his life and works, we have attempted to give a summary of his illustrated writings ; even though one manuscript only was supervised by him, the artists after him worked on his advice. We have also tried to describe the civilization of images surrounding him and, above all, how, therefrom, he managed to pass his teachings, giving himself as an example and, with images, tracing the mystic way for the nuns he was in charge of. In the second part, we have shown "images driving out images": after scrutinizing a manuscript of the 14th century, we have conducted a work of comparison between the different Exemplars known. But these images driven out by other images in the end, lead to their disappearing, and in the third part, we have shown the process of rejection, as Suso saw it, through detachment - on Entbildung, leading to Uberbildung, i.e transformation into the Deity : the mystic union, a prelude to the beatific vision
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Chabrier, Alain. "Génération de colonnes et de coupes utilisant des sous-problèmes de plus court chemin." Angers, 2003. http://www.theses.fr/2003ANGE0029.
Full textAbstract:
Les méthodes de génération de colonnes ont depuis quelques années fait l'objet de nombreuses publications concernant la résolution d'un nombre croissant de problèmes d'optimisation combinatoire. Elles reposent sur une uti-lisation particulière de la méthode du simplexe sur un problème décomposé et restreint. Un problème auxiliaire permet de générer les variables non prises en compte initialement. Dans cette thèse nous nous intéressons aux cas où le problème auxiliaire est un problème de plus court chemin dans un graphe. Di-verses améliorations ont été proposées dans la littérature, mais elles se limitent souvent à des instances particulières de la classe de problèmes traités. Cette thèse vise à faciliter la réutilisation d'améliorations entre différents problèmes. Pour cela, nous présentons d'abord un formalisme générique per-mettant de modéliser les problèmes ainsi qu'une description de la recherche de solutions utilisant des goals. Nous présentons ensuite plusieurs améliorations pratiques applicables à di-vers problèmes. Plus concrètement, les contributions comportent : - un algorithme efficace de plus court chemin élémentaire dans le sous--problème, - une combinaison d'heuristiques d'expert et de programmation par con-traintes pour le sous-problème, - des stratégies de recherche pour le sous-problème, - une contrainte globale de plus court chemin en programmation par con-traintes pour le sous-problème, - l'introduction de coupes dans le problème maître décomposé, - des heuristiques et stratégies de recherche dans le problème maître. Ces améliorations sont enfin validées par la résolution de trois applications réelles de natures très différentes : la tournée de véhicules, la planification de ressource et la conception de réseau. Pour chacune des applications, nous donnons des résultats expérimentaux montrant l'apport de l'une ou plusieurs de ces améliorations sur la qualité des résultats obtenus. Un environnement de génération de colonnes et de coupes a également été développé permettant de mettre en oeuvre facilement l'ensemble de ces idéesIn recent years, column generation methods have been the subject of many publications about solving a greater number of combinatorial optimisation pro-blems. They correspond to a particular use of the revised Simplex method on a decomposed and restricted problem. An auxiliary problem generates new va-riables not present initially. In this thesis, we focus our interest on the cases where the auxiliary problcm is a constrained shortest path problem in a graph. Various improvcments have been proposed in thc literature, but they arc all limitcd to a particular problem. This thesis proposes to facilitate thc reuse of those improvcments in different problems. For this, we propose a generic formalism to model such problems and a description of thc scarch for solutions using goals. We then present new and different practical improvements applicable te varions problems. More precisely, the contributions are : an efficient algorithm for elcmentary shortcst path in the subproblem, a combination of expert heuristics and Constraint Programming in the subproblem, search strategies for the subproblem, a Constraint Programming global constraint for shortest path subproblem, cutting planes applied to the path-based master problem, heuristics and search strategies for the master problem. Those improvements are validated on three different real applications : ve-hicle routing, crew scheduling, and network design. For each of those applications, we produce several experimental results sho-wing how some combinations of the proposed contributions help to improve the ultimate solutions. Finally, a column and cut generation framework has been implemented that eases the development of such applications and that includes most of our pro-posal
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Gueye, Fallou. "Algorithmes de recherche d'itinéraires en transport multimodal." Thesis, Toulouse, INSA, 2010. http://www.theses.fr/2010ISAT0042.
Full textAbstract:
Ce travail de thèse s’est intéressé au transport urbain de passagers dans un contexte d’offre de transport multimodale consistant en la coexistence de plusieurs modes de transport. Dans la pratique, un problème de transport multimodal nécessite la prise en compte de plusieurs objectifs et de contraintes spécifiques liées aux modes ou à la séquence de modes utilisés. De telles contraintes sont appelées contraintes de viabilité.Cette thèse CIFRE s’est déroulée en collaboration avec la société MobiGIS, spécialisée dans le conseil et le développement d’applications autour des Systèmes d’Information Géographiques.Le problème étudié dans cette thèse est celui de la recherche d’itinéraires viables multimodaux point à point bi-objectif pour lequel il s’agit à la fois de minimiser le temps de trajet et le nombre de changements de mode. Compte tenu notamment des objectifs considérés, ce problème est de complexité polynomiale.Sur la base d’une modélisation multi-couches des réseaux de transport multimodaux et d’une modélisation par un automate à états finis des contraintes de viabilité nous avons proposé différents algorithmes de résolution de ce problème basés sur le principe de fixation et extension de labels. Nous avons également proposé une règle de dominance basée sur les états de l’automate de viabilité et permettant d’élaguer le nombre de labels explorés par nos algorithmes. Des adaptations en bidirectionnel ou en utilisant le principe de la recherche A_ ont également été proposées.Les algorithmes proposés ont été évalués sur une partie du réseau de transport de la ville de Toulouse et les expérimentations ont mis en évidence l’intérêt de la règle de dominance basée sur les états ainsi que de l’approche bidirectionnelle développée.Un prototype logiciel implémentant différentes fonctionnalités des algorithmes de plus courts chemins a été développé. Il permet notamment de réaliser des calculs d’itinéraires point à point, des calculs d’accessibilité ou des calculs de distancierThis thesis focuses on urban passenger multimodal transportation. In practice, a multimodal transportation problem requires taking into account several objectives and specific constraints related to modes or sequence of used modes. Such constraints are called viability constraints. This work has been carried out in collaboration with MobiGIS, a company specialized in consulting and development of applications around Geographical Information Systems.The problem studied in this thesis is the bi-objective multimodal viable point-to-point shortest path, aiming at minimizing the total travel time and the total number of mode changes. Given the considered objectives, this problem is polynomial.On the basis of a multi-layered graph model of the multimodal transportation networks, and of a finite state automaton model of the viability constraints, we propose various algorithms for solving this problem, based on the principle of label setting and extension.We also proposed a new dominance rule based on the states of the automaton to reduce the number of labels explored by our algorithms. Bidirectional and A* variants are also proposed.The algorithms are evaluated the transportation network of the city of Toulouse and experiments demonstrate the interest of the proposed dominance rules and bidirectional approach. A prototype software implementing different features of the shortest path algorithms has been developed. It notably enables calculations of point-to-point routes, accessibility and origin-destination matrices
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Sauvanet, Gaël. "Recherche de chemins multiobjectifs pour la conception et la réalisation d'une centrale de mobilité destinées aux cyclistes." Thesis, Tours, 2011. http://www.theses.fr/2011TOUR4006/document.
Full textAbstract:
Les travaux présentés dans cette thèse visent à proposer des méthodes de calcul d’itinéraires adaptés aux cyclistes à l’échelle d’une agglomération. Plusieurs critères sont considérés, comme la distance, la sécurité et l’effort. La difficulté est de calculer des chemins de compromis sous une contrainte de temps de quelques secondes pour pouvoir intégrer ce calculateur à un site web. Deux approches ont été abordées pour résoudre ce problème. L’approche a posteriori dans laquelle l’ensemble des solutions de compromis est calculé et l’approche a priori dans laquelle les préférences de l’utilisateur sont prises en compte et permettent d’orienter la recherche pour privilégier les chemins les plus prometteurs. Enfin, nous proposons de modéliser le réseau routier sous la forme d’un graphe adjoint pour pouvoir prendre en compte de nouveaux critères nécessitant, par exemple, des coûts sur les enchaînements d’arcs. L’ensemble de ce travail a permis de développer le service Géovélo qui est un calculateur d’itinéraires multiobjectif adaptés au vélo. Le service est disponible sous la forme d’un site web et d’applications mobilesThe work presented in this thesis aims at proposing methods for computing bicycle paths across a metropolitan. Several criteria such as distance, safety and effort must be considered in the path computation. The difficulty is to compute paths under a time constraint of a few seconds, in order to integrate the computation in the respond-time of a web page.Two approaches were discussed to solve this problem. The first one is an a posteriori approach where all compromise solutions are computed and the second approach is an a priori method that takes user preferences into account to guide the search by the selection of the most promising sub-paths first. Finally, we propose to model the road network as a line graph to take into account new criteria,requiring costs on arc sequences for example. All this work was necessary to develop the service Géovélo, which is a multiobjective route planner adapted to bicycle. The service is available on a website and as mobile applications
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Moisan, Hervé. "Développement agricole et localités chemin critique d'une pratique de recherche sociologique dans les territoires villageois de la plaine ouest des Vosges /." Lille 3 : ANRT, 1989. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb37616600p.
Full text
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Delhome, Raphaël. "Modélisation de la variabilité des temps de parcours et son intégration dans des algorithmes de recherche du plus court chemin stochastique." Thesis, Lyon, 2016. http://www.theses.fr/2016LYSET010/document.
Full textAbstract:
La représentation des temps de parcours est un enjeu influençant la qualité de l’information transmise aux usagers des réseaux de transport. En particulier, la congestion constitue un inconvénient majeur dont la prise en compte n’est pas toujours maîtrisée au sein des calculateurs d’itinéraires. De même, les évènements comme les réductions de capacité, les perturbations climatiques, ou encore les pics de fréquentation incitent à dépasser la définition statique des temps de parcours. Des travaux antérieurs se sont focalisés sur des temps dynamiques, i.e. dépendants de la date de départ, de manière à affiner le détail de la représentation, et à prendre notamment en compte le caractère périodique des congestions. La considération d’informations en temps réel est aussi une amélioration indéniable, que ce soit lors de la préparation du trajet, ou lorsqu’il s’agit de s’adapter à des perturbations rencontrées en cours de route. Ceci dit, aussi fines qu’elles soient dans les calculateurs disponibles, ces modélisations présentent un inconvénient majeur : elles ne prennent pas en compte toutes les facettes de la variabilité des temps de parcours. Cette variabilité est très importante, en particulier si l’on considère le niveau d’aversion au risque des usagers. En outre, dans un réseau multimodal, les correspondances éventuelles rendent encore plus critique l’incertitude associée aux temps de parcours. En réponse à ces enjeux, les présents travaux de thèse ont ainsi été consacrés à l’étude de temps de parcours stochastiques, i.e. vus comme des variables aléatoires distribuées.Dans une première étape, nous nous intéressons à la modélisation statistique des temps de parcours et à la quantification de leur variabilité. Nous proposons l’utilisation d’un système de lois développé dans le domaine de l’hydrologie, la famille des lois de Halphen. Ces lois présentent les caractéristiques typiques des distributions de temps de parcours, elles vérifient par ailleurs la propriété de fermeture par l’addition sous certaines hypothèses afférentes à leurs paramètres. En exploitant les ratios de moments associés aux définitions de ces lois de probabilité, nous mettons également au point de nouveaux indicateurs de fiabilité, que nous confrontons avec la palette d’indicateurs classiquement utilisés. Cette approche holistique de la variabilité des temps de parcours nous semble ainsi ouvrir de nouvelles perspectives quant au niveau de détail de l’information, notamment à destination des gestionnaires de réseaux.Par la suite, nous étendons le cadre d’analyse aux réseaux, en utilisant les résultats obtenus à l’étape précédente. Différentes lois de probabilité sont ainsi testées dans le cadre de la recherche du plus court chemin stochastique. Cette première étude nous permet de dresser un panorama des chemins identifiés en fonction du choix de modélisation. S’il est montré que le choix du modèle est important, il s’agit surtout d’affirmer que le cadre stochastique est pertinent. Ensuite, nous soulevons la relative inefficacité des algorithmes de recherche du plus court chemin stochastique, ceux-ci nécessitant des temps de calcul incompatibles avec un passage à l’échelle industrielle. Pour pallier cette difficulté, un nouvel algorithme mettant en oeuvre une technique d’accélération tirée du cadre déterministe est développé dans la dernière partie de la thèse. Les résultats obtenus soulignent la pertinence de l’intégration de modèles stochastiques au sein des calculateurs d’itinérairesThe travel time representation has a major impact on user-oriented routing information. In particular, congestion detection is not perfect in current route planners. Moreover, the travel times cannot be considered as static because of events such as capacity drops, weather disturbances, or demand peaks. Former researches focused on dynamic travel times, i.e. that depend on departure times, in order to improve the representation details, for example concerning the periodicity of congestions. Real-time information is also a significant improvement for users aiming to prepare their travel or aiming to react to on-line events. However these kinds of model still have an important drawback : they do not take into account all the aspects of travel time variability. This dimension is of huge importance, in particular if the user risk aversion is considered. Additionally in a multimodal network, the eventual connections make the travel time uncertainty critical. In this way the current PhD thesis has been dedicated to the study of stochastic travel times, seen as distributed random variables.In a first step, we are interested in the travel time statistical modeling as well as in the travel time variability. In this goal, we propose to use the Halphen family, a probability law system previously developed in hydrology. The Halphen laws show the typical characteristics of travel time distributions, plus they are closed under addition under some parameter hypothesis. By using the distribution moment ratios, we design innovative reliability indexes, that we compare with classical metrics. This holistic approach appears to us as a promising way to produce travel time information, especially for infrastructure managers.Then we extend the analysis to transportation networks, by considering previous results. A set of probability laws is tested during the resolution of the stochastic shortest path problem. This research effort helps us to describe paths according to the different statistical models. We show that the model choice has an impact on the identified paths, and above all, that the stochastic framework is crucial. Furthermore we highlight the inefficiency of algorithms designed for the stochastic shortest path problem. They need long computation times and are consequently incompatible with industrial applications. An accelerated algorithm based on a deterministic state-of-the-art is provided to overcome this problem in the last part of this document. The obtained results let us think that route planners might include travel time stochastic models in a near future
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Moisan, Hervé. "Développement agricole et localités : chemin critique d'une pratique de recherche sociologique dans les territoires villageois de la plaine ouest des Vosges." Paris 10, 1988. http://www.theses.fr/1988PA100160.
Full textAbstract:
L'auteur présente les résultats des travaux effectués dans les Vosges, dans le cadre d'une unité de recherche du département systèmes agraires et développement de l’INRA (Versailles). L'étude couvre les cantons de Neufchâteau, Coussey, Bulgneville, Chatenois. L'objectif est de cerner les déterminants locaux de la diversité de situations de développement agricole analysées à différentes échelles d'espace (des parcellaires d'exploitation aux groupes de communes) au cours de sept opérations de recherche) 1975-1987), dont le suivi des états généraux du développement agricole. La problématique présente un point de vue localiste, défendu à l'encontre des théories délocalisantes en agronomie, en économie et en sociologie rurales, afin d'étudier l'articulation entre le développement des exploitations et le développement des villages, en s'appuyant sur le concept de référentiel technique local, de profil technique et de trajectoire de villages. Les résultats principaux sont d'ordre méthodologique. Trois approches convergentes sont privilégiées : la prise en compte systématique des représentations que les acteurs locaux ont de leur territoire ; l'articulation des réseaux sociaux et du territoire; le recours à une analyse sociotechnique de l'activité agricole, qui nécessité pour le sociologue une relation étroite avec les agronomes sur des objets communs (ex: la parcelle). Des supports cartographiques sont utilisés pour valoriser la vision endogène des agriculteurs et des techniciens agricoles sur leur environnement proche pour élaborer par recoupements successifs des diagnostics de fonctionnement du système agraire localThe author presents the results of research carried out in the Vosges area of eastern France, within the framework of a research unit of the INRA research department on agrarian systems and development (Versailles). The study deals with the cantons of Neufchâteau, Coussey, Bulgneville and Chatenois. The objective is to detect the local determinants responsible for the diversity of agricultural situations analyzed at different spatial levels (from farm fields to groups of villages) during seven research operations (1975-1987), in particular the follow up of the states' general of agricultural development. The work promotes a localist point of view which is set here against "delocalizing" theories in agronomy, rural economy and sociology, in order to investigate the articulation between farm development and village development using the concept of "local technical referential", of technical profile and of village trajectory. The major results are methodological. Three converging approaches are privileged: the systematic consideration of the representations local actors have of their territory; the articulation of social networks with the territory; the sociotechnical analysis of farming activity, which requires that sociologists work closely with agronomists on common objects (e. G. The fields)
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Sauvanet, Gaël. "Recherche de chemins multiobjectifs pour la conception et la réalisation d'une centrale de mobilité destinée aux cyclistes." Phd thesis, Université François Rabelais - Tours, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00603891.
Full textAbstract:
Les travaux présentés dans cette thèse visent à proposer des méthodes de calcul d'itinéraires adaptés aux cyclistes à l'échelle d'une agglomération. Plusieurs critères sont considérés, comme la distance, la sécurité et l'effort. La difficulté est de calculer des chemins de compromis sous une contrainte de temps de quelques secondes pour pouvoir intégrer ce calculateur à un site web. Deux approches ont été abordées pour résoudre ce problème. L'approche a posteriori dans laquelle l'ensemble des solutions de compromis est calculé et l'approche a priori dans laquelle les préférences de l'utilisateur sont prises en compte et permettent d'orienter la recherche pour privilégier les chemins les plus prometteurs. Enfin, nous proposons de modéliser le réseau routier sous la forme d'un graphe adjoint pour pouvoir prendre en compte de nouveaux critères nécessitant, par exemple, des coûts sur les enchaînements d'arcs. L'ensemble de ce travail a permis de développer le service Géovélo qui est un calculateur d'itinéraires multiobjectif adaptés au vélo. Le service est disponible sous la forme d'un site web et d'applications mobiles.
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Benabdelouahed, Djafer. "Etude experimentale de la reaction proton (deuton, x) pion negatif : recherche de resonances multibaryoniques." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1987. http://www.theses.fr/1987STR13194.
Full text
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Hizem, Mohamed Mejdi. "Recherche de chemins dans un graphe à pondérationdynamique : application à l'optimisation d'itinéraires dans les réseaux routiers." Phd thesis, Ecole Centrale de Lille, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00344958.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est le développement d'algorithmes et de modèles permettant l'optimisation d'itinéraires dans les réseaux routiers. Dans un premier temps, ce travail de recherche étudie le problème de l'interception d'un mobile dans un graphe. Dans ce contexte, l'objectif est de calculer un itinéraire optimal permettant de rejoindre une cible mobile dont la trajectoire est connue. Cette problématique est traitée pour plusieurs situations (un poursuivant/un objectif et plusieurs poursuivants/plusieurs objectifs) et pour plusieurs types de graphes (graphes statiques et graphes FIFO). Pour chaque cas, un algorithme de résolution est proposé et l'optimalité du résultat qu'il retourne est démontrée. De plus, un ensemble de simulations est réalisé afin de vérifier l'efficacité des algorithmes en termes de temps de calcul. Dans un deuxième temps, une nouvelle classe de graphes dynamiques est définie : les graphes dynamiques avec intervalles. La particularité de ces graphes est que le poids de chaque arc dépende du temps et qu'il est représenté par un intervalle. Pour ce nouveau type de graphes, le problème du plus court chemin est étudié. Ce problème peut être vu soit en tant que problème d'optimisation monocritère soit en tant que problème d'optimisation multicritère. Pour chaque cas, le problème est formulé et des approches pour la résolution sont proposées.
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Laine, Elodie. "Analyse de l'activation du facteur oedémateux de Bacillus anthracis par la calmoduline, en vue de la recherche d'inhibiteurs." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00483602.
Full textAbstract:
La virulence de la bactérie Gram+ Bacillus anthracis, responsable de la maladie du charbon, est due à la présence d'une capsule et deux toxines. Chaque toxine résulte de l'assemblage de l'antigène protecteur (PA) avec l'un des deux facteurs, létal (LF) ou oedémateux (EF), dans le cytoplasme de la cellule hôte. EF est une adénylyl cyclase, qui transforme l'ATP en AMPc de manière incontrôlée, provoquant des dérèglements cellulaires. Elle est activée par la calmoduline (CaM), impliquée dans de nombreuses voies de signalisation du calcium. Des structures cristallographiques et une étude par RMN ont montré que la stabilité du complexe EF-CaM dépend du niveau de calcium fixé à CAM. Des simulations de dynamique moléculaire du complexe, avec 0, 2 ou 4 ions calcium, ont permis de caractériser l'effet du calcium sur la plasticité conformationnelle des deux partenaires et de proposer un modèle de l'interaction EF-CaM. L'analyse conjointe des corrélations dynamiques et des influences énergétiques a fait émerger le concept de connexité du réseau de résidus comme critère de stabilité. La large transition conformationnelle induite chez EF par la fixation de CaM a été décrite, grâce à la détermination d'un chemin de réaction plausible, par modélisation moléculaire. Les conformations intermédiaires obtenues ont servi à guider la recherche rationnelle d'inhibiteurs de la toxine EF, dans le cadre d'une approche combinant méthodes computationnelles et expérimentales. Une stratégie innovante, impliquant le criblage virtuel d'une poche allostérique plutôt que du site catalytique de l'enzyme, a identifié six molécules actives, inhibant totalement l'activité de EF à des concentrations de 10-100 microM.
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RAMANANTSIZEHENA, RAKOTOSON GEORGETTE. "Spectroscopie alpha appliquee a la recherche d'elements trace et a l'identification de noyaux produits par reaction nucleaire." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1986. http://www.theses.fr/1986STR13074.
Full text
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Géry, Mathias. "Indexation et interrogation de chemins de lecture en contexte pour la recherche d'information structurée sur le web." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2002. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00004453.
Full textAbstract:
L'explosion du Web représente un nouveau défi pour la Recherche d'Information (RI). La plupart des systèmes actuels d'accès à l'information sont basés sur des modèles classiques, qui ont été développés pour des documents textuels, atomiques et indépendants et qui ne sont pas adaptés au Web. La structure du Web est un aspect essentiel de la description de l'information. Les travaux qui utilisent cette structure pour la RI simplifient le modèle du Web en un graphe orienté, dont les noeuds sont des pages HTML et les arcs sont des liens hypertextes, sans tenir compte du type des liens. L'objectif de ce travail est de prendre en compte l'impact des liens lors de la phase d'indexation et à la phase d'interrogation d'un système de Recherche d'Information Structurée (SRIS). Le modèle de RI proposé est fondé sur un modèle d'hyperdocuments en contexte considérant quatre facettes de la description d'information sur le Web : le contenu, la structure hiérarchique, la lecture linéaire/déambulatoire et le contexte. Un hyperdocument est modélisé par un contenu au sens des documents structurés, un ensemble de chemins de lecture et un contexte (espace d'information accessible et espace d'information référençant). Un processus d'indexation spécifique est proposé pour chaque facette. L'évaluation de notre système SmartWeb montre l'intérêt de l'information accessible combinée avec le contenu. Puis, à l'aide de collections de test structurées construites automatiquement, nous montrons l'intérêt d'une indexation au niveau des documents structurés et des chemins de lecture. Le modêle est également implanté dans un SRIS complet, montrant ainsi la faisabilité de notre approche dans sa globalité et sur le Web. En particulier, le typage des liens est à la fois un des aspects les plus importants du modèle et une difficulté majeure de sa mise en oeuvre : nous montrons qu'il est possible d'extraire une structure hiérarchique du Web et d'identifier différentes granularités d'information.
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Szacherski, Pascal. "Reconstruction de profils protéiques pour la recherche de biomarqueurs." Phd thesis, Université Sciences et Technologies - Bordeaux I, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00788410.
Full textAbstract:
Cette thèse préparée au CEA Léti, Minatec Campus, Grenoble, et à l'IMS, Bordeaux, s'inscrit dans le thème du traitement de l'information pour des données protéomiques. Nous cherchons à reconstruire des profils protéiques à partir des données issues de chaînes d'analyse complexes associant chromatographie liquide et spectrométrie de masse. Or, les signaux cibles sont des mesures de traces peptidiques qui sont de faible niveau dans un environnement très complexe et perturbé. Ceci nous a conduits à étudier des outils statistiques adaptés. Ces perturbations peuvent provenir des instruments de mesure (variabilité technique) ou des individus (variabilité biologique). Le modèle hiérarchique de l'acquisition des données permet d'inclure ces variabilités explicitement dans la modélisation probabiliste directe. La mise en place d'une méthodologie problèmes inverses permet ensuite d'estimer les grandeurs d'intérêt. Dans cette thèse, nous avons étudié trois types de problèmes inverses associés aux opérations suivantes: 1) la quantification de protéines cibles, vue comme l'estimation de la concentration protéique, 2) l'apprentissage supervisé à partir d'une cohorte multi-classe, vu comme l'estimation des paramètres des classes, et 3) la classification à partir des connaissances sur les classes, vue comme l'estimation de la classe à laquelle appartient un nouvel échantillon. La résolution des problèmes inverses se fait dans le cadre des méthodes statistiques bayésiennes, en ayant recours pour les calculs numériques aux méthodes d'échantillonnage stochastique (Monte Carlo Chaîne de Markov).
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Hizem, Mohamed Mejdi. "Recherche de chemins dans un graphe à pondération dynamique : application à l'optimisation d'itinéraires dans les réseaux routiers." Ecole Centrale de Lille, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/docs/00/34/49/58/PDF/Memoire_de_these_MM_HIZEM_-_version_finale.pdf.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est le développement d'algorithmes et de modèles permettant l'optimisation d'itinéraires dans les réseaux routiers. Dans un premier temps, ce travail de recherche étudie le problème de l'interception d'un mobile dans un graphe. Dans ce contexte, l'objectif est de calculer un itinéraire optimal permettant de rejoindre une cible mobile dont la trajectoire est connue. Cette problématique est traitée pour plusieurs situations (un poursuivant/un objectif et plusieurs poursuivants/plusieurs objectifs) et pour plusieurs types de graphes (graphes statiques et graphes FIFO). Pour chaque cas, un algorithme de résolution est proposé et l'optimalité du résultat qu'il retourne est démontrée. De plus, un ensemble de simulations est réalisé afin de vérifier l'efficacité des algorithmes en termes de temps de calcul. Dans un deuxième temps, une nouvelle classe de graphes dynamiques est définie : les graphes dynamiques avec intervalles. La particularité de ces graphes est que le poids de chaque arc dépende du temps et qu'il est représenté par un intervalle. Pour ce nouveau type de graphes, le problème du plus court chemin est étudié. Ce problème peut être vu soit en tant que problème d'optimisation monocritère soit en tant que problème d'optimisation multicritère. Pour chaque cas, le problème est formulé et des approches pour la résolution sont proposéesThis thesis aims to develop algorithms and models for optimizing itineraries in road networks. The first part of this work treats the problem of intercepting a mobile in a graph. In this context, the goal is to compute the optimal path to reach a moving target with a known itinerary. This problem is studied for different situations (one pursuer/one target and several pursuers/several targets) and for different types of graphs (time-independent graphs and FIFO graphs). For each case, an algorithm is suggested and its optimality is proven. Moreover, simulations are conducted to check the algorithms efficiency in terms of execution time. In the second part of this thesis, a new class of time-dependent graphs is defined : the time-dependent interval graphs. The distinctive feature of these graphs is that the edge weight is time-dependent and it is defined by an interval. For this new class of graphs, the shortest path problem is studied. This problem can be viewed either as mono-objective optimization problem or as a multi-objective optimization problem. For each case, the problem is formulated and approaches for resolution are proposed
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Sevenet, Nicolas. "Recherche de marqueurs génétiques dans la maladie de Crohn : polymorphime des loci de classe II du système HLA." Paris 5, 1994. http://www.theses.fr/1994PA05P240.
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GARIN, LAURE. "Recherche de marqueurs de la gvhd apres greffe de moelle osseuse chez l'enfant : valeur de l'expression des molecules hla-dq et hla-dr." Lyon 1, 1993. http://www.theses.fr/1993LYO1M059.
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EBERLE, FREDERIC. "Peut-on guerir la leucemie myeloide chronique par l'interferon-alpha ? recherche de la maladie residuelle par une technique d'amplification genique (polymerase chain reaction)." Aix-Marseille 2, 1993. http://www.theses.fr/1993AIX20903.
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Wang, Zhanjun. "Optimisation avancée pour la recherche et la composition des itinéraires comodaux au profit des clients de transport." Thesis, Ecole centrale de Lille, 2015. http://www.theses.fr/2015ECLI0029/document.
Full textAbstract:
Avec les problèmes présents dans le secteur de transport, qu'ils soient financiers ou environnementaux, la mobilité avancée peut y remédier avec la mise à profit de la complémentarité entre les différents modes de transport. Dans ce contexte, nous nous focalisons dans cette thèse à la mise en œuvre d'un système d’information de transport avec la recherche et la composition des itinéraires comodaux pour les clients. L'enjeu est d'être capable de répondre aux attentes des usagers avec des solutions satisfaisantes permettant de proposer des itinéraires optimaux pour gérer efficacement l’intermodalité. Dans un souci pratique, nous fournirons des itinéraires attractifs respectant les contraintes imposées même pour les requêtes simultanées. Nous utilisons des techniques d'accélération permettant de réduire l'espace de recherche pour la planification d’itinéraire. Les itinéraires attractifs sont décomposés en sections de route sur lesquelles les différentes demandes et les offres disponibles sont mises en relation. Les combinaisons des sections de route permettent d'aboutir à un ensemble de solutions intéressantes. L’aspect distribué et dynamique du problème nous a permis d'employer une modélisation basée sur le paradigme agent. Ainsi, l’alliance entre les systèmes multi-agents et les algorithmes génétiques que nous avons mis en place s'avère très utile pour gérer l’articulation de l’intermodalité entre ces différents modes de transport. Les résultats de simulation présentés montrent l’efficacité des méthodes proposéesNowadays, the environment impact of transport is significant. In an attempt to address these problems, in this work, we are interested in the implementation of a transport information system, which integrates the existing means of transport to respond users' requests, including public transport and the shared transport like carpooling and car-sharing. In this context of application, we elaborate algorithms to provide attractive paths with respect to the imposed constraints, even for simultaneous requests. Different acceleration techniques for path planning are used to reduce the search space for a better performance. The attractive paths are divided into route sections on which the available offers are allocated to different requests, which is treated as one resource allocation problem using metaheuristics algorithms. With consideration of the distributed and dynamic aspects of the problem, the solving strategy makes use of several concepts like multi-agents system and different optimization methods. The proposed methods are tested with realistic scenarios with instances extracted from real world transport networks. The obtained results indicate that our proposed approaches can efficiently solve the itinerary planning problems by providing good and complete solutions
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Gregoire, Anne-Sophie. "Mise au point d'une technique de PCR multiplex pour la recherche de microdélétions sur le chromosome Y." Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05P165.
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Houissa, Asma. "Les algorithmes d’apprentissage pour l’aide au stationnement urbain." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLV001.
Full textAbstract:
L’objectif de cette thèse est de développer, d’intégrer et de tester une nouvelle approche algorithmique d’aide au stationnement dans les centres urbains. Considérons différents types d’infrastructures déployées allant de la détection des entrées/sorties des véhicules jusqu'à la variation dans le temps du nombre de places de stationnement disponibles dans chaque portion de rue, nous montrons qu’il est possible de proposer une méthode efficace qui détermine un itinéraire qui minimise l’espérance de temps pour trouver une place de stationnement disponible et de prédire la disponibilité des placesde stationnement.Pour cela, la zone urbaine choisie sera donc considérée comme un ensemble de ressources de stationnement (segments de rues).Nous modélisons d’abord cette zone urbaine par un graphe où les sommets désignent les carrefours et les arcs représentent les portions de rues. Les paramètres essentiels pour notre modèle de réseau urbain sont la capacité de stationnement et le temps de parcours des portions de rue.L’originalité et l’aspect innovant de notre approche s’appuient sur deux principes.Le premier principe concerne le guidage comme une ressource : il ne s’agit pas de guider vers une place libre mais de proposer un parcours qui optimise l’espérance de temps de trouver une telle place. Pour cela nous déterminons dans une zone centrée sur une destination donnée, le parcours à effectuer par un véhicule pour minimiser son espérance de temps de trouver une place destationnement le plus rapidement possible.Ainsi nous avons mis en œuvre un algorithme d’apprentissage par renforcement basée sur la méthode LRI (Linear Reward Inaction) et la méthode Monte Carlo pour minimiser l’espérance de temps de trouver une place de stationnement en zone urbaine.Nous avons comparé cet algorithme avec une approche globale basée sur l’évaluation arborescente à profondeur bornée.Le second principe repose sur la prédiction des places de stationnement disponibles par périodes de temps homogènes où on ne s’intéresse pas à une place de stationnement en temps réel mais aux places de stationnement par zones. Il s’agit alors pour le système de pouvoir prédire le potentiel de places libres dans chacune des ressources pour les prochaines périodes. On ne vise donc pas ici la prédiction de la disponibilité de chaque place ; chaque ressource sera considérée comme une zone de stockage dont la disponibilité sera établie en grande partie en fonction des flux d’entrée et de sortie de la portion. Pour ce principe, nous avons donc déterminé par algorithmes de calculs et d’apprentissages la probabilité qu’il y ait au moins une place libre pour stationner dans un tronçon de rue pour un créneau de temps donné. Les principales données nécessaires pour effectuer ces calculs sont les séries temporelles d’entrée sortie de chaque véhicule aux intersections des rues et les variations des places de stationnement au cours du temps.Nous avons évalué les performances de notre approche par simulations sur des données générées aléatoirement et des données réelles obtenues sur un quartier de VersaillesThe objective of this thesis is to develop, to integrate and to test a new algorithmic approach to help parking in urban centers.Given the different types of deployed infrastructure : from input-output detection of vehicles to time variation of the number of available places within each street segment, we propose an efficient method to determine an itinerary that minimize the time expectation to find an available place and also to predict the availability of the parking places.We have chosen an urban area and we have considered it as a set of parking resources called street segments. More exactly, this urban area is considered as a graph where the vertexes represent the crossroads and the arcs represent the street segments. The essential parameters of our urban area model are the parking capacity and the time crossing of each street segment. The originality and the innovation of our approach are based on two principles.The first one is the guidance as a resource, i.e., it means that the proposed itinerary is not the one that lead to an available parking place but rather the one that minimized the time expectation to find an available parking place. In order to achieve that we determine, in a an area centered on a given destination, the itinerary to follow by the vehicle in order minimize its time expectation to find an available parking place as quickly aspossible.We have designed and realized a reinforcement learning algorithm based on the LRI method (Linear Reward Inaction) and a Monte Carlo method to minimize the time expectation to find an available parking place in the urban area. We have compared this algorithm to a global approach based on tree evaluation with bounded depth. The second principle is based on the prediction of the parking places by homogeneous time period where we are not interestedon a parking place in real time but rather on the parking places byarea. In other terms, the system predict the potential available parkingplaces by resource for the next time periods. Thus, we don’t aim to predict the availability of each parking place, i.e., each resource is considered as stock area and its availability is assessed in major part in function of the street segment input-output flow. For this principle, we have determined by a learning algorithm the probability that there is at least one available parking place in a street segment within a given time. The major data needed to compute this probability are the time series of input-output of each vehicle in street intersections, and the variation of the available parking places through the time.We have evaluated the performance of this approach by simulation based on random generated data and on real data of a district in Versailles
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MAINARDI, LEDUC ANNIE. "Etude moleculaire de la translocation t (11;14)(q13;q32) chez une patiente atteinte de leucemie prolymphocytaire en vue de la recherche de la maladie residuelle par pcr (polymerase chain reaction)." Lille 2, 1993. http://www.theses.fr/1993LIL2M074.
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Guessous, Sai͏̈da. "Recherche de "Chlamydia trachomatis" dans les produits biologiques : étude sur 180 prélèvements de quatre techniques de diagnostic." Paris 5, 1995. http://www.theses.fr/1995PA05P192.
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Rodrigues, Nuno. "Recherche et évaluation d'antalgiques originaux : les activateurs des canaux potassiques TREK-1." Thesis, Clermont-Ferrand 2, 2011. http://www.theses.fr/2011CLF22181.
Full textAbstract:
Les antalgiques utilisés aujourd’hui sont des produits anciens et plusieurs d’entre eux datent du 19ème siècle. La morphine demeure l’antalgique de référence pour les douleurs dites par excès de nociception, mais elle est à l’origine d’effets indésirables gênants et graves. Il a été démontré que l’effet antalgique de la morphine passait par l’activation des canaux potassiques TREK-1. Les travaux de recherche ont donc comme objectif la recherche d’antalgiques originaux activateurs de TREK-1. Nous avons synthétisé des activateurs de TREK-1 décrits dans la littérature puis nous avons évalué leur activité antalgique in vivo (writhing test) ce qui nous a permis d’identifier le CDC comme molécule « lead ». Nous avons ensuite synthétisé 43 analogues du CDC que nous avons évalué pour leur effet antalgique ainsi que leur capacité à activer les canaux TREK-1 (électrophysiologie). Ces molécules ont été préparées en 3 à 12 étapes avec des rendements de 3 à 72 % en utilisant des réactions telles que : aldolisation, oléfination de Watsworth et Horner, Peterson, estérification …Des résultats très prometteurs ont émergé de cette étude de relation structure-activité avec 8 molécules qui se démarquent avec un très bon effet antalgique (>50% inhibition de la douleur) ainsi qu’une bonne activation des canaux TREK-1 (R>2). Enfin nous avons analysé les résultats de cette étude par modélisation moléculaire (QSAR) ce qui nous a permis d’identifier les caractéristiques structurales essentielles de ces moléculesAnalgesics used today are old products and several of them date from the 19th century. Morphine remains the analgesics of reference for pains called by excess of nociception, but it is at the origin of awkward and serious side effects. It was shown that the analgesic effect of morphine passed by the activation of potassium channels TREK-1. The objective of this work is thus to develop original analgesics, activators of TREK-1. We synthesized activators of TREK-1 described in the literature and we evaluated their analgesic activity in vivo (writhing test) which enabled us to identify CDC as a lead molecule. We then synthesized 43 analogues of CDC which we evaluated for their analgesic effect and their ability to activate TREK-1 channels (electrophysiology). These molecules were prepared in 3 to 12 steps with yields ranging from 3 to 72 % by using reactions such as : aldol reaction, Watsworth and Horner’s olefination, Peterson’s olefination, esterification … Very promising results emerged from this structure-activity relationship study with 8 molecules which display a very good analgesic effect (>50% inhibition of pain) as well as a good activation of TREK-1 channels (R> 2). Finally we analyzed the results of this study by molecular modeling (QSAR) which enabled us to identify the essential structural characteristics of these molecules
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RABBIA, ISABELLE. "Evolution de la viremie chez les patients atteints d'une hepatite chronique a virus c traites par interferon alpha : recherche d'une correlation entre la viremie et la reponse au traitement." Toulouse 3, 1993. http://www.theses.fr/1993TOU31510.
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Luca, Aurélie de. "Espaces chimiques optimaux pour la recherche par similarité, la classification et la modélisation de réactions chimiques représentées par des graphes condensés de réactions." Thesis, Strasbourg, 2015. http://www.theses.fr/2015STRAF027.
Full textAbstract:
Cette thèse vise à développer une approche basée sur le concept de Graphe Condensé de Réaction (GCR) capable de (i) sélectionner un espace optimal de descripteurs séparant au mieux différentes classes de réactions, et (ii) de préparer de nouveaux descripteurs pour la modélisation « structure–réactivité ». Cette méthodologie a été appliquée à la recherche par similarité dans une base de données contenant 8 classes de réaction différentes; et à la cartographie de son espace chimique en utilisant des cartes de Kohonen et de cartes topographiques génératives. La seconde partie de la thèse porte sur le développement de modèles prédictifs pour le pKa et pour des conditions optimales pour différents types de réaction de Michael impliquant à la fois les descripteurs d’effet électronique et des descripteurs calculés sur les GCRThis thesis aims to develop an approach based on the Condensed Graph of Reaction (CGR) method able to (i) select an optimal descriptor space the best separating different reaction classes, and (ii) to prepare special descriptors to be used in obtaining predictive structure-reactivity models. This methodology has been applied to similarity search studies in a database containing 8 different reaction classes, and to visualization of its chemical space using Kohonen maps and Generative Topographic Mapping. Another part of the thesis concerns development of predictive models for pKa and for optimal conditions for different types of Michael reaction involving both CGR-based and Electronic Effect Descriptors
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Demonchaux, Patrice. "Recherche d'agents radioprotecteurs : synthèse et mécanisme d'action de composés de type intercalant-aminothiol." Grenoble 1, 1988. http://www.theses.fr/1988GRE10016.
Full textAbstract:
Les intercalants utilises sont des amino-9 chloro-6 methoxy-2 acridines des amino-4 chloro-7 quinoleines et des amino-4 chloro-7 methyl-1 quinoleiniums sur lesquels ont ete introduites des chaines analogues a celles de la cysteamine et du wr 2727; etude de l'affinite de ces composes avec l'adn
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Kaafarani, Nizar. "Recherche de Chlamydia Trachomatis par amplification génique dans le sperme avant fécondation in vitro : une série de 103 couples." Bordeaux 2, 1998. http://www.theses.fr/1998BOR23015.
Full text
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Charvet, Michael. "Recherche de l'apparition du phénomène de multifragmentation dans le système 32S+27Al." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1997. http://www.theses.fr/1997GRE10065.
Full textAbstract:
Le sujet de recherche presente dans ce memoire concerne la physique des ions lourds aux energies intermediaires, et plus precisement l'analyse du mode de desexcitation des systemes composites formes dans les collisions noyau-noyau. L'etude des noyaux chauds a mis en evidence la correlation qu'il existe entre l'energie deposee dans un systeme et son mode de desexcitation. Ainsi, a basse energie, les phenomene d'evaporation (emission de particules legeres de charge un ou deux) et d'emission binaire sequentielle (dont l'evaporation est un cas particulier) gouvernent le mode de desexcitation du systeme cree en voie de sortie. Lorsque l'energie croit, on observe l'apparition simultanee de fragments, dits de masse intermediaire (imf), dont la charge est superieure ou egale a trois. Ce phenomene, appele multifragmentation, fait aujourd'hui l'objet de nombreuses etudes car il pourrait refleter l'existence d'une transition de phase dans la matiere nucleaire. Ce travail s'inscrit dans le cadre d'une recherche du seuil d'apparition de ce phenomene. Pour ce faire, differentes experiences sur le systeme #3#2s+#2#7al ont ete realisees a l'aide du multidetecteur amphora, dans une gamme d'energie comprise entre 24,5 et 37,5 mev/nucleon. L'analyse des donnees, qui a largement fait appel aux techniques d'analyse multidimensionnelle developpees par le groupe (ces techniques permettant d'optimiser l'accord entre l'experience et la simulation), a permis de mettre en evidence un changement de mecanisme de desexcitation du systeme composite cree dans les collisions les plus centrales. A 24,5 mev/nucleon, les donnees sont compatibles avec un processus de desexcitation binaire sequentielle ; au dela, elles sont compatibles avec un processus de type multifragmentif, a ceci pres que l'on observe, experimentalement, un surplus d'energie cinetique pour les fragments. Ce surplus d'energie, incompatible avec un mecanisme purement thermique peut s'expliquer par la presence d'energie d'expansion dans nos echantillons. L'energie radiale extraite de nos donnees croit avec l'energie de bombardement : de 0 mev/nucleon a 24,5 mev/nucleon jusqu'a 0,8 mev/nucleon pour la plus grande energie faisceau.
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MONTRADE, MARIE-PIERRE. "Recherche et identification de residus de -agonistes. Methodes d'analyse par chromatographie gazeuse couplee a la spectrometrie de masse. Etude d'une reaction specifique avec le n,n-dimethylformamide dimethylacetal." Nantes, 1995. http://www.theses.fr/1995NANT2067.
Full textAbstract:
Cette etude qui s'inscrit dans le cadre du controle de l'utilisation illegale des -agonistes comme promoteurs de croissance en productions animales, presente une serie de travaux en spectrometrie de masse consacres a la recherche et a l'identification de leurs residus. Tout d'abord, une methode d'extraction et des modalites de detection et d'identification par chromatographie gazeuse couplee a la spectrometrie de masse (gc-ms) ont ete recherchees afin de pouvoir caracteriser (conformement aux criteres d'identification definis au niveau europeen) la presence de residus dans un prelevement d'urine. Dans le protocole retenu, a visee multi-residus, l'echantillon urinaire (ph 6,0) est extrait et purifie sur une phase mixte ; l'elution etant effectuee par un melange acetate d'ethyle: hydroxyde d'ammonium a 32% (97: 3, v/v). L'extrait est alors trimethylsilyle et analyse en gc-ms en mode impact electronique (ei) et en ionisation chimique positive (pci, methane). L'interet de derivations cycliques (de type 2-(dimethyl)silamorpholine ou methylboronique) qui apportent des informations structurales significatives en ei, est aussi presente. Au cours d'une premiere etude in vivo, de fortes doses de salbutamol ont ete administrees per os a des veaux pendant 7 jours. Les conditions optimales d'hydrolyse enzymatique des formes conjuguees du salbutamol ont ete recherchees et une methode d'extraction tissulaire combinant une extraction liquide/liquide (ph 9,8) a l'aide d'un melange acetate d'ethyle: isopropanol (60: 40, v/v) et une extraction purification sur phase mixte, a ete mise au point. Cette etude preliminaire a permis de constater l'elimination rapide de cette molecule et d'evaluer les limites des techniques d'analyse reposant sur l'utilisation d'un analyseur quadripolaire. Les resultats obtenus ont en effet montre que, meme en cas de surdosage, les residus de salbutamol deviennent difficiles a identifier dans les tissus apres une courte periode de retrait (7 jours). Aussi convenait-il d'ameliorer ces methodes afin de pouvoir augmenter le delai pendant lequel l'identification de residus reste possible. L'utilisation d'un spectrometre de masse a double focalisation et a geometrie inverse en fragmentometrie de masse haute resolution (hrsim) a permis d'atteindre cet objectif. La methode gc-ms hrsim mise en uvre (derives tms, ei, r 10 000), autorise l'identification de residus de clenbuterol presents a la concentration de 20 pg. G#-#1 dans des prelevements de muscle squelettique, apres 17 jours de sevrage d'un animal ayant recu 5 g. Kg#-#1. J#-#1 de clenbuterol pendant 15 jours (deuxieme etude in vivo). Enfin, en recherchant d'autres modalites de derivation, une reaction specifique avec le n,n-dimethylformamide dimethylacetal (dmf-dma) a ete mise en evidence. Des travaux en spectrometrie de masse ont permis d'analyser les mecanismes impliques ; l'etude de la formation de composes polaires et thermosensibles a ete facilitee par l'utilisation de l'ionisation par bombardement atomique rapide (fab). Il s'avere que la fonction amine secondaire du groupement ethanolamine des -agonistes se condense avec le dmf-dma pour donner un intermediaire ethanolamide. Des produits de reaction inedits, formes a temperature elevee par deshydratation de cet intermediaire, ont ete identifies. Il a aussi ete montre a partir d'un cas particulier (le salbutamol) que le dmf-dma peut reagir avec les alcools primaires. A cote de leur interet fondamental, ces observations pourraient etre exploitees pour elargir le champ du depistage (jusque-la limite aux 16 -agonistes etudies dans ce travail) et faciliter l'identification de nouveaux analogues. D'autres domaines d'application devraient egalement etre concernes par ces resultats
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Meunier-Komosa, Nathalie. "Recherche moléculaire de Tropheryma Whippelii dans le liquide articulaire de patients affectés de rhumatismes inflammatoires inclassés." Bordeaux 2, 2001. http://www.theses.fr/2001BOR23015.
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Brun, Arnaud. "Recherche du virus d'Epstein-Barr dans le sang périphérique de patients greffés rénaux ou en attente de greffe." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR2P017.
Full text
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Fixler, Noémie. "Recherche de nouveaux agents anticancéreux dérivés d'acridine et de benzo(b)(1,7)phénanthroline : synthèse et étude de réactivité." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1994. http://www.theses.fr/1994GRE10091.
Full textAbstract:
Recherchant de nouveaux anticancereux reagissant sur l'adn, nous avons synthetise differents derives de la 3-aminoacridine, de la proflavine, de la 10-hydroxy-benzo(b)(1,7)phenanthroline, et de la 6,9-dichloro-2-methoxyacridine. A une partie intercalante, nous avons ainsi associe une fonction alkylante dans le but d'augmenter l'activite biologique. Certains des nouveaux composes prepares sont des precurseurs potentiels de quinone-methides ou quinone-imine-methides, connus dans la litterature pour etre tres reactives. La reactivite des derives de type alcool benzylique, les plus interessants au niveau pharmacologique, a ete etudiee de facon plus approfondie. Outre une reactivite photochimique tout a fait particuliere, ceux-ci reagissent avec les nucleophiles et montrent un taux de fixation covalente sur l'adn particulierement eleve
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Auboeuf, Didier. "Recherche des mécanismes transcriptionnels impliqués dans les anomalies de l'expression de gènes dans le tissu adipeux chez les sujets diabétiques de type 2." Lyon 1, 1998. http://www.theses.fr/1998LYO1T147.
Full text
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Chevalier, Jérémie. "Optimisation des routes de départ et d'arrivée aux approches des grands aéroports." Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30092.
Full textAbstract:
Les TMAs (Terminal Maneuvering Areas) sont aujourd'hui un goulot d'étranglement de l'espace aérien, dans lequel les avions quittent leur phase de croisière pour atterrir à un aéroport, ou au contraire effectuent leur montée pour rejoindre leur route de croisière. Afin d'éviter la congestion de ces zones, il est nécessaire de construire des routes de départ et d'arrivée efficaces. Dans ce travail, une solution pour la création de routes de départ et d'arrivée est proposée, prenant en compte la configuration des pistes, les environs de l'aéroport, ainsi qu'un ensemble de contraintes opérationnelles telles que les angles de montée ou de virages limités. Les routes sont en deux parties : un chemin horizontal construit dans un graphe discrétisant la TMA, auquel est associé un cône d'altitudes. L'ensemble des routes est optimisé à l'aide d'un algorithme de recuit simulé. Dans ce processus, à chaque itération, chaque route est construite en valuant les arcs du graphe, puis en effectuant une recherche de chemin dans celui-ci. Les coûts des arcs sont choisis de manière à éviter autant que possible les phénomènes de zigzag. Plusieurs tests ont été effectués : un sur un cas artificiel créé spécifiquement pour cette approche, et trois autres sur des cas tirés de la littérature. Les résultats obtenus sont satisfaisants au regard de l'état actuel de la gestion du trafic aérien et des contraintes afférentesThe bottleneck of today's airspace is the Terminal Maneuvering Areas (TMA), where aircraft leave their routes to descend to an airport or take off and reach the en-route sector. To avoid congestion in these areas, an efficient design of departure and arrival routes is necessary. In this work, a solution for designing departure and arrival routes is proposed, which takes into account the runway configuration, the surroundings of the airport and operational constraints such as limited slopes or turn angles. The routes consist of two parts: a horizontal path in a graph constructed by sampling the TMA around the runway, to which is associated a cone of altitudes. The set of all routes is optimized by the Simulated Annealing metaheuristic. In the process and at each iteration, each route is computed by defining adequately the cost of the arcs in the graph and then searching a path on it. The costs are chosen so as to avoid zigzag behaviors as much as possible. Several tests were performed, one on an artificial problem designed specifically to test this approach and the three others on instances taken from the literature. The obtained results are satisfying with regard to the current state of air operations management and constraints
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Youssefi, Mohammad. "Recherche de nouvelles synthèses de sélénophosphonates : Préparation et étude de la réactivité d'ène-phosphoramides fonctionnels." Nancy 1, 1986. http://www.theses.fr/1986NAN10105.
Full textAbstract:
La recherche d'une méthode de synthèse de phénylséléno phosphate d'alkyle (RO)::(2)P(O)CH::(2)SePh a permis de trouver un nouveau réactif de Grignard (ETO)::(2)P(O)CH::(2)MGCL. Les propriétés de ce nouveau réactif ont été étudiées et comparées à celles des autres organométalliques correspondants connus lithiens et cuivreux. Ce réactif de Grignard conduit à une synthèse originale de sélénophosphonates. Utilisation des phosphates d'alkyle comme agents d'alkylation pour la synthèse de dithioesters. Des énephosphoramides fonctionnels ont été obtenus pour la première fois et la réactivité carbonique de l'un d'entre eux a été étudiée
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Strogova, Polina. "Techniques de réécriture pour le traitement de problème de routage dans les graphes de Cayley." Nancy 1, 1996. http://www.theses.fr/1996NAN10352.
Full textAbstract:
Cette thèse traite des problèmes de routage dans les réseaux d'interconnexion de machines massivement parallèles, dont les processeurs sont relies entre eux suivant une topologie de graphe de Cayley (connue pour de bonnes propriétés quant au routage). Dans notre modèle chaque processeur, représente par un sommet, possède une mémoire individuelle qui permet d'effectuer un calcul local. Il ne partage avec d'autres processeurs que des canaux de communications, qui sont modélisés par des arcs. Nous étudions le problème de routage simultané qui se pose lors de la programmation, pour une application donnée, d'un schéma de communication entre les processeurs. Le problème de routage simultané consiste à trouver les chemins disjoints par lesquelles les messages, émis par les processeurs-sources, circuleront avant d'arriver aux processeurs-destinataires de messages. Nous traitons ce problème en toute généralité, en supposant que le graphe de Cayley est défini par un ensemble de générateurs du groupe qu'il représente. Notre but est de diviser le problème de routage simultané initial en sous-problèmes de routage simultané pour les sous-graphes de Cayley indépendants, afin de réduire la complexité du problème initial et pouvoir traiter les sous-problèmes en parallèle. Nous introduisons dans la thèse une nouvelle décomposition récursive d'un graphe de Cayley fini en une union arc-disjointe de graphes de Cayley d'un sous-groupe et de graphe dit frontière de décomposition. En utilisant cette décomposition, nous divisons le problème de routage simultané initial en sous-problèmes de routage simultané pour les sous-graphes de Cayley et pour la frontière. Nous formulons un problème d'optimisation combinatoire, dont la résolution permet de faire un choix global optimal de sommets intermédiaires dans les sous-graphes de décomposition. La formulation du problème d'optimisation combinatoire utilise un nouvel algorithme de calcul de cout minimal d'un chemin entre deux sommets d'un graphe de Cayley. Cet algorithme utilise les techniques de réécriture. L’inefficacité des outils de déduction automatique existant dans le cas de grands groupes (i. E. De taille supérieure a 10 000 éléments) nous a poussé à introduire une nouvelle structure de données pour la complétion de groupes finiment présentés, appelée graphes patch. Les graphes patch représentent d'une façon compacte des systèmes de réécriture pour les groupes. L’application des règles d'inférence pour la complétion des groupes, utilisant les graphes patch, accélère le processus de complétion et permet d'économiser de l'espace mémoire, en évitant de copier les mots et d'engendrer certaines équations redondantes. Toutes les nouvelles méthodes et procédures de la thèse sont illustrées par de nombreux exemples.
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Sellami, Bachir. "Afgar : un système à base de connaissance basé sur les objets pour l'Aide à la Fabrication des Grilles de service des Agents Roulants de la SNCF." Compiègne, 1992. http://www.theses.fr/1992COMPD556.
Full textAbstract:
Cette thèse, effectuée à la demande de la SNCF, apporte une contribution à la résolution du problème des grilles de service des agents roulants. Elle a donné lieu à AFGAR. Le problème posé est un problème complexe, combinatoire, pour lequel il n'existe pas d'algorithme efficace. Concrètement il s'agit, partant d'un ensemble de journées de travail, de trouver si possible la meilleure succession de journées de travail et de repos périodiques qui respectent les contraintes temporelles, règlementaires et humaines. Le principe méthodologique de la démarche de modélisation a été de faire une séparation nette entre un modèle du processus avec sa logique de fonctionnement et un modèle de la stratégie de résolution (du problème) avec sa logique de raisonnement. Ayant à représenter deux types de connaissances (structurelles et fonctionnelles d'une part, expertes et déductives d'autre part), le choix d'un formalisme hybride (objets et règles) s'imposait. Nous avons donc opté pour le générateur (hybride : règles et objets) de systèmes experts SMECI. La partie raisonnement est basée sur le modèle systémique Opérand, Information et Décision (OID). La partie fonctionnement est basée sur une méthodologie objet qui permet de structurer tant les classes que les instances. En synthèse, nous proposons une ébauche de méthodologie de développement des systèmes à base de connaissances
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Ouafi, Rachid. "Analyse et contrôle des réseaux de trafic urbain par la méthode de Frank-Wolfe." Paris 6, 1988. http://www.theses.fr/1988PA066453.
Full textAbstract:
La méthode de Frank Wolfe offre une approche efficace pour la résolution des programmes convexes avec contraintes linéaires. Dans le contexte des réseaux de transport l'algorithme se réduit à une série de problèmes de plus court chemin et de recherches unidimensionnelles. Nous présentons une approche unifiée de la résolution d'une large variété de problèmes lies au système de planification du trafic urbain par la méthode de Frank Wolfe. Enfin, nous proposons une modification de l'algorithme de Frank Wolfe pour la résolution du problème de l'affectation du trafic urbain.
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Moukaddam, Mohamad. "Évolution de la structure en couches dans les noyaux de masse moyenne : Recherche de l'orbitale 2d5/2 neutron dans le 69Ni." Phd thesis, Université de Strasbourg, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00746802.
Full textAbstract:
La fermeture de couche de l'oscillateur harmonique à N=40 dans le 68Ni est faible et perd sa rigidité après l'enlèvement (ou l'ajout) de paires de protons. Les calculs effectués dans cette région de masse prédisent un nouvel îlot d'inversion à N=40 semblable à celui à N=20 et montrant que le placement de l'orbital neutron 2d5/2 est un ingrédient essentiel pour l'interprétation de la structure nucléaire à N≈40. La différence d'énergie 1g9/2-2d5/2 a été déterminée dans le noyau 69Ni en utilisant la réaction de transfert d'un neutron d(68Ni,p) en cinématique inverse. L'expérience réalisée au GANIL utilisait un faisceau de 68Ni à 25,14 MeV/u. Les noyaux 68Ni séparés par le spectromètre LISE3 ont ensuite interagit avec une cible de CD2 d'épaisseur 2,6 mg/cm2. Le dispositif expérimental était composé principalement des détecteurs CATS/MUST2-S1/EXOGAM couplés à une chambre d'ionisation et un scintillateur plastique. Les moments angulaires et les facteurs spectroscopiques de l'état fondamental (Jπ = 9/2+) et d'un doublet d'états (Jπ = 5/2+) autour de 2,48 MeV, associés à la population des orbitales 1g9/2 et 2d5/2, ont été obtenus après la comparaison des sections efficaces différentielles et des calculs ADWA. Les spins des états observés ont été attribués après comparaison aux calculs de modèles en couches dans un grand espace de valence. La position de l'orbitale 2d5/2 dans 69Ni a été établie pour la première fois. Nos mesures confirment l'hypothèse de la faible différence d'énergie (≈2,5 MeV) entre l'orbitale neutron 2d5/2 et l'orbitale 1g9/2 et son importance pour décrire la structure des noyaux autour de N=40.
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Bellalouna, Monia. "Problèmes d'optimisation combinatoires probabilistes." Phd thesis, Ecole Nationale des Ponts et Chaussées, 1993. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00568759.
Full textAbstract:
L'étude du domaine récent que constituent les problèmes d'optimisation combinatoires probabilistes (POCPs) forme le sujet de cette thèse. Les POCPs sont des généralisations des problèmes d'optimisation combinatoires classiques dont les formulations contiennent explicitement des éléments probabilistes. Plusieurs motivations ont provoqué cette étude. Deux d'entre elles sont particulièrement importantes. La première correspond au désir de formuler et d'analyser des modèles qui sont plus appropriés pour des problèmes pratiques pour lesquels l'aléatoire est une source constante de préoccupations, les modèles de nature probabiliste sont plus particulièrement attractifs comme abstraction mathématique des systèmes réels. La seconde motivation est d'analyser la stabilité des solutions optimales des problèmes déterministes lorsque les exemplaires sont perturbés : les perturbations sont simulées par la présence ou l'absence de sous-ensembles des données. Notre étude s'appuie sur certains de ces problèmes et en particulier : problème du voyageur de commerce; problème d'ordonnancement des travaux probabiliste et le problème du bin-packing probabiliste. Les questions soulevées et les résultats obtenus sont dans les domaines suivants : complexités des problèmes et analyse d'heuristiques pour les POCPs ; analyse du comportement asymptotique des problèmes lorsque les exemplaires correspondent à des problèmes de grandes tailles ; dégager une méthodologie générale d'étude de la stabilité des solutions des problèmes d'optimisation combinatoires classiques.
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Beaucorps, Pierre de. "Planification de trajectoire dans un environnement peu contraint et fortement dynamique." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2019. http://www.theses.fr/2019SORUS082.
Full textAbstract:
Cette thèse a pour objet la planification de trajectoire d’un véhicule robotisé en présence d’obstacles très dynamiques dans un environnement sans contraintes fortes (marquage au sol, voies de circulation…). Le problème est envisagé avec deux stratégies différentes : calculer le profil de vitesse du véhicule sur un chemin prédéfini, ou bien rechercher un chemin admissible à partir d’une hypothèse sur la vitesse du véhicule. Premièrement, nous proposons une approche permettant d’adapter la vitesse d’un véhicule robotisé circulant dans un environnement « semi-contraint » en présence d’autres véhicules. L’approche utilise un ensemble de profils de vitesse de référence compatibles avec les capacités du véhicule et le confort de ses passagers. Des validations quantitatives en simulation ainsi que qualitatives sur un véhicule automatisé ont été menées, démontrant l’intérêt de l’approche. En second lieu, nous introduisons les « Reachable Interaction Sets » (RIS) comme nouveau cadre de travail permettant d’effectuer la planification de chemin parmi des obstacles se déplaçant plus rapidement que le robot. L'approche supprime l’aspect temporel du problème en émettant une hypothèse a priori sur la vitesse du robot, ramenant la planification à une recherche de chemin duale. Des évaluations quantitatives comparent cette approche à l'état de l'art existant, et démontrent l’intérêt des RISThis thesis studies the trajectory planning of an automated vehicle surrounded by fast moving obstacles in an unconstrained environment (i.e. with no clear lane markings). Two main approaches are proposed: compute a speed profile on a given path, or find a valid path starting from a hypothesis on the speed of the vehicle. The first approach consists of a dynamic adaptation of the speed of an automated vehicle driving in a semi-constrained environment and in the presence of other vehicles. A set of speed profile references is used. They must be compatible with the dynamics of the vehicle and also comfortable for the passengers. Quantitative validations have been conducted in simulation together with qualitative validations on an automated vehicle, which demonstrate the benefits of this planning strategy. In the second approach, the « Reachable Interaction Sets » (RIS) are introduced as a new framework that allows to plan the trajectory of a vehicle surrounded by dynamic obstacles which move faster. The approach removes the temporal aspect of the problem by using a hypothesis about the speed of the vehicle. The remaining problem can be solved out by a static path finding algorithm. Quantitative validations show the advantage of planning approachs based on this framework compared to other state-of-the-art planning strategies
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Giusti, Delphine. "Pemphigoïde bulleuse et réaction inflammatoire : étude des polynucléaires éosinophiles et des pièges d'ADN extracellulaire Biomarkers related to bullous pemphigoid activity and outcome Eosinophil Cationic Protein (ECP), a predictive marker of bullous pemphigoid severity and outcome." Thesis, Reims, 2019. http://www.theses.fr/2019REIMS044.
Full textAbstract:
La pemphigoïde bulleuse (PB) est une maladie bulleuse auto-immune dont le devenir est difficilement prédictible. Sans pathogénicité clairement établie, les éosinophiles sont les cellules les plus représentées au niveau des lésions. Ces cellules peuvent libérer des protéines cationiques par dégranulation, ou lors d’un phénomène d’expulsion de pièges d’ADN extracellulaire (traps) commun aux éosinophiles et neutrophiles, dénommé ETose. L’objectif de ce travail était d’étudier l’implication des éosinophiles, (i) en analysant leurs produits de dégranulation au regard de l’activité et de l’évolution de la maladie ; (ii) en investiguant la présence et les conditions de formation de traps au niveau des lésions. Les concentrations élevées des protéines spécifiques des éosinophiles ont confirmé leur état activé dans le sang et au niveau lésionnel. De plus, la persistance de concentrations élevées en Eosinophil Cationic Protein est liée à un risque de rechute. Au niveau lésionnel, les traps sont préférentiellement formés par les neutrophiles malgré une prépondérance des éosinophiles. Si leur présence à la limite de séparation derme-épiderme ne semble pas liée aux caractéristiques cliniques de la PB, nous avons néanmoins montré ex vivo une relation entre la capacité des sérums de patients à induire la formation de traps et l’activité de la PB. Enfin nous avons identifié des rôles différentiels de l’IL-17 et de l’IL-23 dans l’induction de ce mécanisme en fonction du micro-environnement. Ces résultats soulignent l’importance d’établir un « inflammascore » pour stratifier les patients en fonction de leur environnement inflammatoire afin de leur proposer des thérapies adaptéesBullous pemphigoid (BP) is a rare autoimmune subepidermal blistering disease which outcome cannot be predicted clinically. Eosinophils are the most represented cells in the inflammatory infiltrate, although their pathogenicity remains to be elucidated. These cells can release basic granule proteins either by degranulation or by ETosis, a phenomenon common to eosinophils and neutrophils during which cells form extracellular DNA traps. The objectives of this work were to investigate eosinophils involvement in BP pathogenesis, (i) by measuring serum and blister fluid levels of specific granule proteins regarding BP activity and outcome, and (ii) by analyzing extracellular DNA traps presence and conditions for their formation in BP environment. Elevated concentrations of eosinophil granule proteins in blood and skin lesions confirmed their activated state. Furthermore, we highlighted a relationship between the persistence of high eosinophil cationic protein (ECP) concentrations and the risk of relapse. At the lesional level, DNA traps were formed in situ preferentially by neutrophils despite eosinophil predominance. Although their presence at the edge of dermal-epidermal separation could not be related to clinical characteristics, we nevertheless showed ex vivo a link between serum ability to induce NET formation and disease activity. Finally, we identified differential roles of IL-17 and IL-23 in the induction of NET formation according to micro-environment. Therefore, our results stress the importance to establish an “inflammascore” to stratify patients according to their inflammatory environment in order to offer an adapted therapy
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Contié, Sylvain. "La périostine, un nouveau biomarqueur des métastases osseuses : développement d’un immunodosage et évaluation préclinique." Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10253/document.
Full textAbstract:
La périostine est une protéine matricellulaire préférentiellement exprimée aux sites de contraintes mécaniques, notamment le périoste, et dans le stroma associé à de nombreux types de cancers. En premier lieu, nous nous sommes attachés à évaluer la pertinence de cette protéine en tant que biomarqueur du métabolisme osseux et de la réaction stromale dans les métastases osseuses. Nous avons développé le premier dosage ELISA de la périostine circulante chez la souris présentant des caractéristiques analytiques (spécificité, précision) conformes aux exigences réglementaires. Ce dosage nous a permis de préciser l’implication de la périostine dans le métabolisme osseux et les métastases osseuses de cancer du sein. Nos données in vitro et in vivo suggèrent que la périostine n’est pas un indice direct du remodelage osseux, contrairement aux marqueurs biologiques conventionnels, mais une composante de l’ossification primaire. Nous avons aussi montré dans les métastases osseuses d’origine mammaire que la périostine est surexprimée par les cellules stromales de la métastase, comme cela a pu être observé au niveau des tumeurs primaires. Enfin, nous avons confirmé par une approche bioinformatique la relation étroite entre périostine et réaction stromale dans la plupart des tumeurs chez l’Homme. La périostine et d’autres protéines conjointement exprimées pourraient donc constituer un panel de marqueurs biologiques de la progression tumorale, certains pouvant se révéler comme nouvelles cibles thérapeutiques en oncologiePeriostin is a matricellular protein preferentially expressed at sites subjected to mechanical constraints, including the periosteum, and in the stroma associated to several tumor types. We first aimed to evaluate the relevance of periostin as a biomarker of bone metabolism or stromal reaction in bone metastases. We developed the first ELISA for serum periostin in mouse with analytical characteristics (specificity, precision) that are in accordance with regulatory standards. This ELISA allowed us to specify further the involvement of periostin in bone metabolism and breast cancer bone metastases. Our in vitro and in vivo data suggested that periostin is a component of primary ossification rather than a direct index of bone remodeling, unlike conventional bone markers. In breast cancer bone metastases, we also showed that periostin is overexpressed by stromal cells associated with bone metastasis, in agreement with its localization in the stroma of primary tumors. Finally, using bioinformatics analyses of large datasets from various tumors in human, we confirmed the close relationship between periostin and the stromal reaction. Periostin and other co-expressed proteins could therefore constitute a set of biological markers of cancer progression, and/or appear as potential therapeutic targets
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Mariaule, Gaëlle. "Accès original aux hétérocycles par la catalyse organométallique : développement de nouveaux inhibiteurs de kinases." Thesis, Paris 5, 2014. http://www.theses.fr/2014PA05P612/document.
Full textAbstract:
Cette thèse est composée de deux parties distinctes ayant comme thématique commune, la synthèse d’hétérocycles via la catalyse organométallique.Nous nous sommes intéressés, dans un premier temps, à une voie de synthèse permettant un accès rapide au squelette tétrahydrocyclopenta[c]acridine. Ces composés polyfonctionnalisés sont obtenus très efficacement en seulement trois étapes dans des conditions particulièrement douces. L’étape clé de cette synthèse est une réaction de Pauson-Khand intramoléculaire catalysée au cobalt. Certains composés issus de la famille des tétrahydrocyclopenta[c]acridines présentent une activité d’inhibition sélective envers les kinases dépendantes des cyclines (CDKs), et plus particulièrement la CDK2. Un composé chef de file est identifié, puis grâce aux données de co-Cristallisation avec CDK2 et de modélisation moléculaire, suivi de l’étude des relations structure-Activité, la conception rationnelle d’une deuxième génération de molécules est rendue possible. Le composé le plus avancé présente une CI50 de 300 nM envers CDK2/cyclin A et un excellent profil de stabilité métabolique.Dans un deuxième temps, nous avons étudié et développé une réaction tandem d’addition/cyclisation catalysée par l’argent, avec des nucléophiles carbonés sur des substrats ortho-Alcynylbenzaldéhydes. La stratégie de synthèse conduit à des dérivés 1H-Isochromènes par création de deux nouvelles liaisons (C-C et C-O). Une étude approfondie de la réaction tandem nous a permis d’obtenir une large gamme de dérivés d’isochromènes en mettant en évidence l’influence de différents substituants, portés par le groupement alcyne ou le substrat, ainsi que l’utilisation de différents nucléophiles carbonés (alcynes, aromatiques, hétéroaromatiques). Les limitations de la réaction tandem ont également pu être identifiéesMy thesis proJect is organized around two main topics having in common organometallic chemistry and the synthesis of heterocycles.Firstly, we were interested in a methodology for the synthesis of tetrahydrocyclopenta[c]acridines. These compounds are synthesized in three steps from various quinolines. The key step is a cobalt-Catalyzed intramolecular Pauson-Khand reaction. Some compounds of this family exhibit selective Cyclin Dependent Kinases (CDKs) inhibition, particulary against CDK2, in the submicromolar range. A hit compound has been identified, and then using data from co-Crystallization with CDK2 and molecular modeling, followed by the study of structure-Activity relationships, the rational design of a second generation of molecules has been investigated. The most advanced compound has an IC50 of 300 nM against CDK2/cyclin A with an excellent metabolic profile. In the second axis of research, we have studied and developed a new silver-Catalyzed tandem addition/cyclization reaction with carbon nucleophiles. The systems studied are (hetero)aromatics compounds having an aldehyde group and in ortho-Position an alkynyl group. The synthetic strategy leads to 1H-Isochromene derivatives by creating two new bonds. A thorough study of the tandem reaction allowed us to obtain a wide range of isochromene derivatives, highlighting the influence of different substituents carried by the alkyne group or on the (hetero)aromatic substrates; and also to investigate the use of different carbon nucleophiles (alkynes, aromatics and heteroaromatics). The limitations of the tandem reaction have also been identified
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Plas, Aurélie. "Synthèse stéréosélective de bispidines : vers la conception de nouvelles molécules antalgiques." Phd thesis, Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand II, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00683624.
Full textAbstract:
Les bispidines sont des diamines polycycliques chirales régulièrement utilisées comme ligand pour réaliser de l'induction asymétrique. La bispidine HZ2 est connue pour être agoniste et sélective des récepteurs κ-opioïdes, récepteurs impliqués dans le mécanisme douloureux. Ce travail décrit la mise au point d'une méthode générale de synthèse asymétrique et flexible du squelette bispidine, permettant des modifications structurales, afin d'évaluer le potentiel pharmacologique des analogues synthétisés. Tout d'abord, nous avons synthétisé des pipéridines 2,3,6-trisubstituées grâce à une réaction de Mannich intramoléculaire stéréospécifique entre un β,β'-diaminocétal et divers aldéhydes. Les pipéridones possédant une fonction amino-éthyle en position 3, ainsi obtenues ont été engagées dans une deuxième réaction de Mannich, pour l'obtention de bispidines bicycliques. Ensuite, nous avons souhaité accéder à des bispidines de géométrie plus contrainte. Pour cela, la condensation de divers anhydrides sur les pipéridones possédant une fonction amino-éthyle en position 3, a permis la formation des imides correspondants, précurseurs d'ions N-acyliminium. Les bispidines tricycliques et tétracycliques, sont obtenues par cyclisation en milieu acide en présence des éthers d'énols. Une étude de détermination structurale par RMN a permis de mettre en évidence les différentes conformations adoptées par les bispidines synthétisées (chaise-chaise, chaise-bateau, chaise-twist). Enfin, les composés synthétisés ont fait l'objet de tests in vivo afin d'évaluer leur potentiel antalgique. Ils ont montré une activité modérée. Cependant, l'introduction de groupements aromatiques en α de l'atome d'azote devrait accroître l'efficacité de nos composés, selon les modèles décrits dans la littérature.
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Barbosa, Maria vanice Lacerda de Melo. "Modalização e polifonia no gênero resenha acadêmica:um olhar apreciativo sobre a voz da ciência." Universidade Federal da Paraíba, 2015. http://tede.biblioteca.ufpb.br:8080/handle/tede/8410.
Full textAbstract:
Submitted by Maike Costa (maiksebas@gmail.com) on 2016-07-20T11:32:37Z
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In order to building a spoken or written text, regardless of gender that it is being carried out, the speaker uses linguistic features such as semantic-argumentative strategies intending to guide the interlocutor to certain conclusions. The modalization and polyphony, accordingly, are phenomena that allow the speaker to leave printed his subjectivity in the content of the statements, while acting according to his interlocutor. Focusing in these discussions, this investigation aims to show that modalization and polyphony reveal, linguistically, subjectivity in the digest genre, acting therefore as argumentation features. It is a qualitative research, descriptive and interpretative, which adopts the theoretical and methodological principles of Argumentative Semantics. The corpus consists of ten digests collected in six editions of the Jornal de Resenhas, of the Discurso Editorial, ISSN 1984-6282, published in 2009, 2010 and 2012. The theoretical discussions concerning the Argumentation Theory of Language have based in Ducrot (1994, 1987, 1988), Espíndola (2004), Nascimento (2005, 2009), Koch (2006a, 2006b) and others arguing about the theory approach. The modalization is discussed under the postulates of Castilho and Castilho (1993), Koch (2006b), Cervoni (1989), Nascimento (2009), Neves (2011a), Palmer (2011) and García Negroni (2011). Besides, it was used as theoretical basis, Foucault (2011), Bakhtin (2010a, 2010b), Marcuschi (2008) and others to the formulations about the digest genre. The analysis reveals that digesters use modalization and the polyphony of speakers as phenomena that ultimately report the speakers‟ subjectivity in relation to the view of the voices of other speakers, that is, as a discursive strategy that guides the way the text of the digest should be read. Thus, the gender digest is defined as a place of interaction of voices and subjective impressions through which the speaker summarizes praises, criticizes and evaluates the most diverse academic intellectual productions.
Pour construire un texte parlé ou écrit, indépendamment du genre qui réalise, le locuteur utilise des fonctionnalités linguistiques comme les stratégies sémantiques argumentatif afin de guider les appelants à certaines conclusions. La modalisation et la polyphonie, en conséquence, sont des phénomènes qui permettent au locuteur laisser imprimé sa subjectivité dans le contenu des déclarations, tout en agissant en fonction de son interlocuteur. Avec l'accent dans ces discussions, cette recherche vise à ètidier les annonceurs de modalité et de la polyphonie, comme des phénomènes qui révèlent, linguistiquement, la subjectivité dans le genre compte-rendu, s‟agissant, de cette manière, comme des marques d'argumentation. Il est une recherche qualitative, descriptive et interprétative, qui adopte les principes théoriques et méthodologiques de la sémantique argumentative. Le corpus se compose de dix comptes-rendus dans six éditions du Jornal de Resenhas, imprimés par Discurso Editorial, ISSN 1984-6282, publiés en 2009, 2010 et 2012. Pour les discussions théoriques en concernant a la Théorie de L'argumentation de la Langue, nous fundamentons-nous en Ducrot (1994, 1987, 1988), Espíndola (2004), Nascimento (2005, 2009), Koch (2006a, 2006b) et d'autres qui discutent à propos de l'approche de la théorie. La modalisation est discuté sous les postulats de Castilho et Castilho (1993), Koch (2006b), Cervoni (1989), Nascimeto (2009), Neves (2011a), Palmer (2011) et García Negroni (2011). Et on utilise encore comme une base théorique, Foucault (2011), Bakhtin (2010a, 2010b), Marcuschi (2008) et d'autres pour les formulations sur la révision de genre. L'analyse révèle que les examinateurs utilisent la modalisation et la polyphonie des haut-parleurs comme des phénomènes qui relèvent finalement la subjectivité des intervenants des examens par rapport à la vue de la voix des autres orateurs, qui est, comme une stratégie qui guide discoursivement le chemin du texte de comme l'avis doit être lu. Le genre compte-rendu, dans cette recherche est considérée comme un lieu d'interaction des voix et impressions subjectives ainsi à travers laquelle l'orateur résume louanges, critique et évalue plus diverses productions intellectuelles academiques.
Ao construir um texto falado ou escrito, independente do gênero que o realize, o locutor se utiliza de recursos linguísticos como estratégias semântico-argumentativas com a finalidade de orientar o interlocutor para determinadas conclusões. A modalização e a polifonia, nesse sentido, são fenômenos que possibilitam ao locutor deixar impressa a sua subjetividade no conteúdo dos enunciados, ao mesmo tempo em que age em função de seu interlocutor. Com o foco nessa discussão, esta pesquisa objetiva investigar a modalização e a polifonia de locutores como fenômenos que revelam, linguisticamente, a subjetividade no gênero resenha acadêmico-científica, funcionando, portanto, como marcas de argumentação. Trata-se de uma investigação qualitativa, de caráter descritivo e interpretativista, que adota os princípios teórico-metodológicos da Semântica Argumentativa. O corpus é constituído de dez resenhas, coletadas em seis edições do Jornal de Resenhas, da Discurso Editorial, ISSN 1984-6282, publicadas nos anos de 2009, 2010 e 2012. Para as discussões teóricas concernentes à Teoria da Argumentação na Língua, embasamo-nos em Ducrot (1994, 1987, 1988), Espíndola (2004), Nascimento (2005, 2009), Koch (2006a, 2006b) entre outros que discutem a respeito da teoria em abordagem. A modalização é discutida sob os postulados de Castilho e Castilho (1993), Koch (2006b), Cervoni (1989), Nascimento (2009), Neves (2011a), Palmer (2011) e García Negroni (2011). Ainda servem de embasamento teórico, Foucault (2011), Bakhtin (2010a, 2010b), Marcuschi (2008) e outros, para as formulações acerca do gênero textual resenha. As análises revelam que os resenhistas utilizam a modalização e a polifonia de locutores como fenômenos que acabam por denunciar a subjetividade dos locutores das resenhas em relação ao ponto de vista das vozes de outros locutores, ou seja, como uma estratégia que orienta discursivamente a forma como o texto da resenha deve ser lido. O gênero resenha, nesta investigação, é visto como um lugar de interação de vozes e, portanto, de impressões subjetivas, através do qual o locutor resume, elogia, critica e avalia as mais diversas produções intelectuais acadêmicas.
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Shakour, Marc. "Conception et implémentation d'un algorithme de planification de chemin dans un jeu vidéo comportant un environnement triangularisé." Mémoire, 2012. http://www.archipel.uqam.ca/5060/1/M12641.pdf.
Full textAbstract:
La planification de chemin est un domaine de l'intelligence artificielle permettant à un personnage, un objet, une unité de se déplacer automatiquement, dans un environnement, en évitant les obstacles et sans intervention humaine. Ce déplacement s'effectue entre une configuration de départ et une configuration d'arrivée. Lors de ce déplacement, à aucun moment le personnage ne doit se retrouver dans une configuration invalide. Dans le contexte des jeux vidéo commerciaux actuels, cette technique est malheureusement encore peu utilisée correctement. De plus, peu de publications concernent la planification de chemin lorsqu'effectuée dans un environnement triangularisé. Lorsqu'utilisé dans un jeu vidéo, il est nécessaire que le calcul du chemin soit effectué très rapidement afin de fournir un temps de réaction presque immédiat au joueur. La solution calculée n'est alors pas forcément optimale mais propose un bon compromis si l'on souhaite mettre l'accent sur la vitesse de réponse. Nous expliquons d'abord le principe de la planification de chemin en détail et ensuite certaines des techniques les plus connues tels que Dijkstra, A*, Breadth First Search, Depth First Search, etc. Nous détaillons les avantages et inconvénients des environnements triangularisés par rapport aux autres techniques de maillage. Nous exposons aussi dans ce mémoire le fruit de nos recherches et expérimentations sur l'environnement de recherche Mammoth en comparant l'évolution de la planification de chemin dans ce contexte précis. Nous utilisons également les techniques existantes pour parcourir les cartes du jeu et discutons des problèmes rencontrés et des évolutions possibles. De nos jours, lorsque la planification de chemin est effectuée dans un environnement triangularisé, on parle souvent de A* pour la sélection des triangles et ensuite de parcours par les milieux des côtés des triangles ou bien par leur centre. Or, cela est loin d'être optimal et bien que rapide, propose un déplacement nettement plus long dans ce cas. Pour répondre à cette problématique, nous utilisons en particulier trois algorithmes spécifiques : Triangulation A* et Triangulation Reduction A* afin de sélectionner les triangles par lesquels le personnage va passer et l'algorithme funnel modifié pour le déplacement à l'intérieur de ces triangles. Pour conclure, nous comparons ces différentes techniques de planification de chemin dans ce contexte en comparant la vitesse d' exécution, le nombre de nœuds explorés et la distance parcourue notamment afin d'en déduire la technique la plus appropriée pour Mammoth.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Planification de chemin, pathfinding, triangulation, algorithmes, A*, funnel, TA*, TRA*
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Dayarian, Iman. "Tactical Vehicle Routing Planning with Application to Milk Collection and Distribution." Thèse, 2013. http://hdl.handle.net/1866/10802.
Full textAbstract:
De nombreux problèmes pratiques qui se posent dans dans le domaine de la logistique, peuvent être modélisés comme des problèmes de tournées de véhicules. De façon générale, cette famille de problèmes implique la conception de routes, débutant et se terminant à un dépôt, qui sont utilisées pour distribuer des biens à un nombre de clients géographiquement dispersé dans un contexte où les coûts associés aux routes sont minimisés. Selon le type de problème, un ou plusieurs dépôts peuvent-être présents. Les problèmes de tournées de véhicules sont parmi les problèmes combinatoires les plus difficiles à résoudre.
Dans cette thèse, nous étudions un problème d’optimisation combinatoire, appartenant aux classes des problèmes de tournées de véhicules, qui est liée au contexte des réseaux de transport. Nous introduisons un nouveau problème qui est principalement inspiré des activités de collecte de lait des fermes de production, et de la redistribution du produit collecté aux usines de transformation, pour la province de Québec. Deux variantes de ce problème sont considérées. La première, vise la conception d’un plan tactique de routage pour le problème de la collecte-redistribution de lait sur un horizon donné, en supposant que le niveau de la production au cours de l’horizon est fixé. La deuxième variante, vise à fournir un plan plus précis en tenant compte de la variation potentielle de niveau de production pouvant survenir au cours de l’horizon considéré.
Dans la première partie de cette thèse, nous décrivons un algorithme exact pour la première variante du problème qui se caractérise par la présence de fenêtres de temps, plusieurs dépôts, et une flotte hétérogène de véhicules, et dont l’objectif est de minimiser le coût de routage. À cette fin, le problème est modélisé comme un problème multi-attributs de tournées de véhicules. L’algorithme exact est basé sur la génération de colonnes impliquant un algorithme de plus court chemin élémentaire avec contraintes de ressources.
Dans la deuxième partie, nous concevons un algorithme exact pour résoudre la deuxième variante du problème. À cette fin, le problème est modélisé comme un problème de tournées de véhicules multi-périodes prenant en compte explicitement les variations potentielles du niveau de production sur un horizon donné. De nouvelles stratégies sont proposées pour résoudre le problème de plus court chemin élémentaire avec contraintes de ressources, impliquant dans ce cas une structure particulière étant donné la caractéristique multi-périodes du problème général. Pour résoudre des instances de taille réaliste dans des temps de calcul raisonnables, une approche de résolution de nature heuristique est requise. La troisième partie propose un algorithme de recherche adaptative à grands voisinages où de nombreuses nouvelles stratégies d’exploration et d’exploitation sont proposées pour améliorer la performances de l’algorithme proposé en termes de la qualité de la solution obtenue et du temps de calcul nécessaire.Many practical problems arising in real-world applications in the field of logistics can be modeled as vehicle routing problems (VRP). In broad terms, VRPs deal with designing optimal routes for delivering goods or services to a number of geographically scattered customers in a context in which, routing costs are minimized. Depending on the type of problem, one or several depots may be present. Routing problems are among the most difficult combinatorial optimization problems. In this dissertation we study a special combinatorial optimization problem, belonging to the class of the vehicle routing problem that is strongly linked to the context of the transportation networks. We introduce a new problem setting, which is mainly inspired by the activities of collecting milk from production farms and distributing the collected product to processing plants in Quebec. Two different variants of this problem setting are considered. The first variant seeks a tactical routing plan for the milk collection-distribution problem over a given planning horizon assuming that the production level over the considered horizon is fixed. The second variant aims to provide a more accurate plan by taking into account potential variations in terms of production level, which may occur during the course of a horizon. This thesis is cast into three main parts, as follows: In the first part, we describe an exact algorithm for the first variant of the problem, which is characterized by the presence of time windows, multiple depots, and a heterogeneous fleet of vehicles, where the objective is to minimize the routing cost. To this end, the problem is modeled as a multi-attribute vehicle routing problem. The exact algorithm proposed is based on the column generation approach, coupled with an elementary shortest path algorithm with resource constraints. In the second part, we design an exact framework to address the second variant of the problem. To this end, the problem is modeled as a multi-period vehicle routing problem, which explicitly takes into account potential production level variations over a horizon. New strategies are proposed to tackle the particular structure of the multi-period elementary shortest path algorithm with resource constraints. To solve realistic instances of the second variant of the problem in reasonable computation times, a heuristic approach is required. In the third part of this thesis, we propose an adaptive large neighborhood search, where various new exploration and exploitation strategies are proposed to improve the performance of the algorithm in terms of solution quality and computational efficiency.