Academic literature on the topic 'Perturbations écologiques – Méditerranée (région)'

Avec leurs 23500 ha, les Monts de Daïa-Saïda ont un relief accidenté, situées à environ 25 km à l'ouest de la ville de Saïda (chef-lieu de la wilaya). La végétation forestière est très représentative des groupements thermophiles de l'ouest algérien, dominés par le pin d'Alep et le thuya de Berbérie mais avec un remarquable sous-bois buissonnant. Les facteurs de perturbations sont multiples, certains connus et communs de toute l’Algérie voir la méditerranée comme les incendies, défrichement, érosion, pacage et coupes illicite mais un autre facteur de dégradation spécifique a cette région est peu connue et moins étudier qui est le préaménagement forestier, qui a causé des dégâts considérables aux formations forestières de la région. Cette étude a mis l’accent sur l’impact négatif de ces travaux sur les formations forestières de cet espace. L’étude de la dynamique des formations forestières des Monts de Daïa-Saïda à travers le traitement et l'interprétation de deux images satellites LandSat (1987 et 2015) avec l'élaboration de la carte de changement, est le but de cet article. Les résultats obtenus permettent d'affirmer la dynamique régressive de la forêt dans cette zone avec l'augmentation des matorrals et des zones dénudées combinée avec une régression remarquable des forêts. La partie nord du massif est la plus touchée par ce phénomène avec une très grande surface dénudée due aux incendies répétés qui l'ont affectée.

Abstract: Cockpit Country is a globally important area for Jamaica’s threatened and endangered bird species. But habitat disturbance and degradation due to lumber and yam stick extraction, small-scale agriculture, and bauxite mining threaten to disrupt the sensitive ecological processes that maintain both the species and the habitat. Analysis of anthropogenic forest disturbance and point count survey data for birds suggests an association between forest disturbance and bird distribution pat­terns in Cockpit Country. Threatened and endangered birds such as Plain Pigeon (Patagioenas inornata exigua), Crested Quail- Dove (Geotrygon versicolor), and Jamaican Blackbird (Nesopsar nigerrimus) had greater association with undisturbed forest than species of least conservation concern such as Common Ground-Dove (Columbina passerina) and Gray Kingbird (Tyrannus dominicensis). Although the observed distribution patterns revealed a suite of bird species that could be utilized for monitoring forest disturbance, the approach used in this study needs to be better developed before implementation in Cockpit Country. The results also have implications for the persistence of threatened and endangered bird species given the lack of clarity about boundaries, proper forest management and enforcement, and ongoing efforts to mine bauxite in the area. Keywords: birds, Cockpit Country, endangered, forest disturbance, threatened Resumen: El disturbio forestal tiene consecuencias negativas para la subsistencia de las aves amenazadas y en peligro de Jamaica en Cockpit Country—Cockpit Country es un área de importancia mundial para las especies de aves amenazadas y en peligro de Jamaica. Sin embargo, la degradación y el disturbio de hábitat producto de la tala y la extracción de ñame, la agricul­tura a pequeña escala y la explotación de bauxita amenazan con interrumpir los sensibles procesos ecológicos que mantienen tanto a las especies como al hábitat. El análisis de los disturbios forestales por causas antropogénicas y los datos de muestreos de puntos de conteo de aves sugiere una asociación entre el disturbio forestal y los patrones de distribución de aves en Coc­kpit Country. Especies amenazadas y en peligro como Patagioenas inornata exigua, Geotrygon versicolor y Nesopsar nigerrimus tuvieron una mayor asociación con bosques no perturbados que especies de menor preocupación como Columbina passerina y Tyrannus dominicensis. Aunque los patrones de distribución observados revelan que podría utilizarse un grupo de aves para el monitoreo del disturbio forestal, el enfoque empleado en este estudio necesita ser desarrollado mejor antes de su implementa­ción en Cockpit Country. Los resultados también tienen implicaciones para la subsistencia de especies de aves amenazadas y en peligro dada la falta de claridad sobre los límites, la aplicación de la ley la presencia de un manejo forestal adecuado, así como los esfuerzos en curso para la extracción de bauxita en el área. Palabras clave: amenazadas, aves, Cockpit Country, disturbio forestal, en peligro Résumé: Conséquences négatives des perturbations des forêts pour le maintien des espèces d’oiseaux menacées et en danger à Cockpit Country en Jamaïque—Cockpit Country est une aire d’importance mondiale pour les espèces d’oiseaux menacées et en danger de la Jamaïque. Toutefois, la perturbation et la dégradation des habitats en raison de l’exploitation du bois et de l’igname, l’agriculture à petite échelle et les mines de bauxite menacent de modifier les processus écologiques sensibles qui maintiennent les espèces et les habitats. L’analyse des perturbations d’origine anthropique de la forêt et des comptages des oiseaux par points suggère l’existence d’un lien entre la perturbation de la forêt et les modèles de répartition des oiseaux à Cockpit Country. Les oiseaux menacés et en danger comme le Pigeon simple (Patagioenas inornata exigua), la Colombe ver­sicolore (Geotrygon versicolor), et le Carouge de la Jamaïque (Nesopsar nigerrimus) sont plus fortement associés à la forêt non perturbée que les espèces dont la conservation est moins préoccupante telles que la Colombe à queue noire (Columbina pas­serina) et le Tyran gris (Tyrannus dominicensis). Bien que les schémas de répartition observés aient mis en évidence une série d’espèces d’oiseaux qui permettrait de suivre les per­turbations forestières, l’approche utilisée dans cette étude doit être développée davantage avant une mise en oeuvre à Cockpit Country. Les résultats ont également des implications pour le maintien des espèces d’oiseaux menacées et en danger, compte tenu du manque de clarté quant aux limites, à la bonne gestion des forêts, et à l’application des lois, ainsi qu’aux efforts actuels d’extraction de la bauxite dans la région. Mots clés: Cockpit Country, espèces en danger, espèces menacées, oiseaux, perturbation des forêts

Des échantillons d’Omphiscola glabra provenant d’une région calcaire (La Brenne, département de l’Indre) ont été introduits dans de nouveaux sites en Haute-Vienne pour étudier l’évolution de ces mollusques étrangers sur des sols acides et suivre leur infestation naturelle par Fasciola hepatica ou Paramphistomum daubneyi. L’opération inverse a été effectuée avec des limnées de la Haute-Vienne transférées dans la Brenne tandis que des mollusques de chaque région, implantés localement ont servi de témoins. Chez les O. glabra vivant en Brenne comme chez les limnées locales implantées en Haute-Vienne, le nombre d’adultes par population et la superficie de leurs habitats passent par des pics au cours de la troisième année ou de la quatrième année post-introduction (p.i.). Chez les limnées de la Brenne introduites en Haute-Vienne, on assiste à une diminution progressive des valeurs pour les deux paramètres précités à partir de la deuxième année p.i. Des mollusques parasités naturellement ont été retrouvés dans toutes les populations d’O. glabra. Chez les limnées de la Brenne introduites en Haute-Vienne comme chez celles qui vivent en Brenne, la prévalence et l’intensité de leur infestation naturelle par l’un ou l’autre des Digènes s’accroissent progressivement à partir de la deuxième année p.i. ou de la troisième. Par contre, les valeurs de ces paramètres chez les limnées de la Haute-Vienne implantées localement ne présentent pas de variation significative au cours des années. En 2009, la prévalence de l’infestation par F. hepatica est significativement plus élevée chez les O. glabra de la Haute-Vienne implantées localement ou dans la Brenne que chez une autre limnée (Galba truncatula) vivant dans les mêmes prairies. Les variations observées pour les effectifs d’O. glabra et la superficie de ses habitats peuvent s’expliquer par la concentration en calcium présente dans le sol de chaque région. L’accroissement de la prévalence ou de l’intensité de leur infestation naturelle peut s’interpréter comme une adaptation progressive de cette limnée à une pression parasitaire différente lorsque cette espèce est introduite dans un nouveau milieu.

L'existence d'une diversite specifique elevee dans certaines communautes vegetales souleve la question des mecanismes permettant la coexistence d'especes ayant des niches trophiques similaires. Dans des friches mediterraneennes d'ages successionnels differents, j'ai suivi la recolonisation de microperturbations experimentales, generees a differentes saisons (automne, hiver, printemps). Les resultats ont permis d'expliquer comment, dans ces communautes, riches en especes, avec une forte heterogeneite spatiale, et ou les contraintes climatiques sont determinantes pour l'installation des plantes, les perturbations a plusieurs echelles spatio-temporelles permettent: 1) l'expression de differences entre especes dans la maniere dont elles occupent l'espace vital dans l'espace et dans le temps; 2) le remplacement aleatoire d'especes equivalentes a ce titre. Conjointement, a ete developpe un modele spatialement explicite de la dynamique de populations de plantes annuelles avec, comme sur le terrain, trois niveaux de structure (echantillon, communaute successionnelle, et paysage). Des simulations de comportements a l'echelle individuelle ont contribue a ameliorer la comprehension des effets, au niveau du paysage dans son ensemble, de la structure spatiale, de la dissemination des graines, de la bangue de graines, et du regime de perturbations. Ces resultats m'ont amenee a proposer un modele interpretatif original des mecanismes de maintien de la diversite dans des paysages de friches mediterraneennes. Le jeu entre perturbations, caracteristiques biologique relatives a l'occupation de l'espace. Structuration spatiale, et hasard, permet un equilibre dynamique entre des communautes a des stades successionnels divers, connectees par des flux de graines. Les mecanismes proposes s'inscrivent dans la perspective de la theorie de la dynamique des taches, et dans l'optique de l'ecologie des paysages. Les theories de la niche de regeneration, de la loterie competitive offrent des elements pertinents

La riche biodiversité observée dans les régions du bassin méditerranéen souligne l'importance des pratiques agricoles traditionnelles dans la gestion des paysages et le fonctionnement des écosystèmes. La déprise agricole dans les zones rurales ont conduit à l'expansion des garrigues. Cette fermeture des milieux met en péril le bon fonctionnement des écosystèmes méditerranéens de plaine, génère des pertes en espèces de milieux ouverts et fragilise de nombreux services écosystémiques, culturels et patrimoniaux. Ces dernières décennies, les gestionnaires à des fins cynégétiques souhaitent restaurer des zones favorables aux espèces de petit gibier, ces dernières étant en régression partout en Europe. Or, les effets de ces actions sur la biodiversité restent méconnus. Ce travail de thèse a pour objet d'évaluer le potentiel écologique de stratégies de gestion de l'habitat pour le petit gibier sur la conservation de la biodiversité. Si les avantages de la garrigue aménagée pour le petit gibier ont été relevés pour les passereaux, des études supplémentaires sont nécessaires pour préciser l'impact de ces stratégies sur la conservation des chauves-souris, des petits mammifères terrestres et des macro-arthropodes, les résultats actuels demeurent préliminaires voire ambivalents. L'activité saisonnière des chauves-souris est influencée par d'autres facteurs que les aménagements eux-mêmes. Les communautés de petits mammifères terrestres présentent une diversité naturellement limitée dans les garrigues, rendant difficile l'évaluation de l'impact des aménagements sur celles-ci. Enfin, l'organisation et l'enrichissement des communautés de macro-arthropodes terrestres dans les garrigues sont influencés par divers descripteurs spatiaux du paysage à l'échelle locale. Dans ce manuscrit il est proposé (1) quatre études comparatives des zones garrigues aménagées pour la petite faune gibier, par rapport à des zones non aménagées, afin d'évaluer l'impact de la gestion de l'habitat sur la conservation d'espèces non ciblées ; (2) des méthodes d'inventaire développées et adaptées aux environnements contraints d'accès, caractérisés par de denses végétations à feuilles persistantes et épineuses ; (3) des pistes de réflexion pour orienter les futurs travaux de recherche dans l'élaboration d'un itinéraire technique simplifié pour les chasseurs désireux de s'investir dans l'aménagement des territoires, en faveur d'une chasse durable et soucieuse de la biodiversité
The high biodiversity seen in the Mediterranean basin underlines the importance of traditional agricultural practices in landscape management and ecosystem functioning. Agricultural abandonment in rural areas has led to the spread of scrubland. This closure of environments is jeopardizing the proper functioning of Mediterranean lowland ecosystems, generating losses of species in open environments and undermining a large number of ecosystem, cultural and heritage services. Nowadays, hunting managers have been keen to restore areas suitable for small game species, which are in decline throughout Europe. However, the effects of these actions on biodiversity remain poorly understood. The aim of this doctoral thesis was to assess the ecological value of habitat management actions for small game in relation to biodiversity conservation. While the benefits of habitat management actions for small game species have been highlighted for passerines, further studies are needed to assess the impact of these actions on the conservation of bats, small terrestrial mammals and macro-arthropods, as current results remain preliminary, if not mixed. Seasonal bat activity is impacted by factors other than the habitat management itself. The diversity of small terrestrial mammal communities is naturally restricted in scrublands, making it difficult to assess the impact of habitat management on them. Moreover, the structure and enrichment of terrestrial macro-arthropod communities in scrublands are affected by various spatial descriptors of the local landscape. This manuscript proposes (1) four comparative studies of scrubland areas managed for small game fauna, compared with unmanaged areas, in order to assess the impact of habitat management on the conservation of non-target species; (2) inventory methods designed and suited to environments with restricted access, featuring dense evergreen and thorny vegetation ; (3) ideas to guide future research into the design of a simplified technical itinerary for hunters wishing to become involved in land-use planning, in support of sustainable, biodiversity-friendly hunting

Cette recherche a pris comme exemple des milieux peu ou fortement perturbes par les activites humaines anciennes, actuelles et les grands amenagements lies au developpement de nouvelles formes d'utilisation des espaces. Ces phytocenoses mediterraneennes sont soumises a des conditions de stress climatique et de contraintes edaphiques qui justifient par leur specificite la mise en jeu de scenarios appropries d'amenagement pour repondre aux objectifs de la diversite. Par contre, pour la grande faune les processus enregistres sont comparables a ceux constates par ailleurs sur des axes autoroutiers. Ce zonage ecologique etabli a permis de caracteriser en fonction des potentialites des ecocomplexes, des reponses differentes du materiel biologique. En fonction des types de perturbations, il a ete montre que la vegetation repond a des periodicites variables, longues ou courtes et quelquefois par la mise en jeu d'effets de rupture. Les lineaires des abords routiers incendies subissent les effets d'entretiens reguliers et ceux plus aleatoires lies aux incendies. La cumulation des mecanismes pejore les consequences ecologiques comme la perte de diversite, les invasions et les nouveaux types de peuplements. Les corridors et couloirs fluviaux ou la dynamique de l'eau est l'element majeur, repondent sur de courtes periodicites aux perturbations cumulatives. Les amenagements peuvent avoir des effets contrastes, voie opposes comme l'acceleration de la dynamique vegetale vers les forets de bois dur a l'abri des amenagements lineaires et donc des crues. A l'inverse, dans des secteus proches, les milieux sont soumis a une aggravaton des contraines dans le lit vif tres expose aux inondatins et a l'entretien du chenal d'essartement

Le present travail en phytoecologie et phytochimie, porte sur 27 especes representatives des formations arbustives et arborescentes mediterraneennes, reparties en 15 familles dont une gymnosperme (cupressacees), une angiosperme (liliacees) monocotyledone et 13 autres sont des dicotyledones (fagacees, cistacees, anacardiacees, araliacees, buxacees, caprifoliacees, ericacees, fabacees, myrtacees, oleacees, rhamnacees, santhalacees et thymeleacees). Environ 550 specimens de ces especes ont ete recoltes. Lignine, cellulose, hemicellulose, cendres brutes residuelles, phosphore et calcium, ont ete doses pour certaines especes. Une attention plus particuliere a ete portee aux tanins et aux leucoanthocyanes (y compris leucodelphinidine et leucocyanidine) ainsi qu'a l'azote total (protides totaux). Systematiquement: la distribution des leucoanthocyanes, en particulier la leucodelphinidine, montre pour le chene vert par exemple, une grande variabilite inter-individuelle (polymorphisme chimique) au sein de l'aire de repartition geographique (sud de la france). Il en est de meme pour le genevrier oxycedre mais d'une facon beaucoup moins nette. Ecologiquement: le profil biochimique des vegetaux mediterraneens etudies presente des variations significatives, liees a la fois aux types de substrat, a la densite du peuplement, a l'age de l'organe traite et au stade phenologique. Ce profil a ete etudie en relation avec la pression des herbivores. En bon accord avec la theorie generale des tactiques phytochimiques et malgre la presence assez importante des tanins, la frequence des molecules toxiques est faible chez plusieurs vegetaux etudies. Par ailleurs, la frequence de ces molecules se situe significativement en dessous de celle connue pour les ligneux temperes. On a clairement mis en evidence dans ce travail les effets d'une concurrence anabolique entre tanins et lignine, la sclerophyllie etant l'une des adaptations caracteristiques de la vegetation mediterraneenne face a la secheresse estivale et au paturage. Enfin, les strategies de survie de ces vegetaux, dans un contexte ecologique complexe et contraignant, sont assurees par une juxtaposition de diverses tactiques phytochimiques apparentees, depuis celle dite hyper t de certains ligneux medio-europeens, jusqu'au type t

Ce travail constitue la première étude hydrobiologique menée sur la végétation aquatique de six fleuves côtiers typiques de la région méditerranéenne du sud-est de la France. De nouvelles méthodes d’études des macrophytes ont du être créées pour l’investigation de ces cours d’eau. Un inventaire spécifique a été dressé et les biomasses calculées. L’analyse réalisée en fonction des descripteurs environnementaux et de la variation spatio-temporelle, de la composition et de la structure de ces phytocénoses a permis de réaliser une cartographie précise des secteurs prospectés durant deux ans. Les réponses spécifiques aux perturbations naturelles et d’origine anthropique ont été intégrées dans le contexte des grands concepts écologiques en termes écosystémiques avec la prise en compte des algues et des macroinvertébrés. L’application des différents indices, physico-chimique (SEQ-EAU) et biologiques (IBD, IBMR, IBGN) créés pour l’évaluation de la qualité des eaux en rivière a permis de discuter des limites de leurs applications respectives
This is the first study on this topic focusing on the aquatic plants growing in six coastal rivers of the Provence-Alpes-Côte d’Azur area. These rivers were selected because of their morphological and hydrological characteristics are typical of most of Mediterranean coastal rivers. Owing to the size and the specific characteristics of these rivers, it was necessary to find a method of analysis of macrophyte. A macrophyte inventory of the species was drawn up and biomass evaluated. The responses of the macrophytic communities subjected to different types of disturbances (anthropic and natural) were both analysed in terms of intra - and inter ecosystemic functioning and of great ecological concepts. The water quality was calculated by various indices used in France (SEQ-EAU, IBD, IBMR, IBGN) and the different values discussed

Les plantes vasculaires produisent des terpènes volatils (isoprène, C5 ; monoterpènes, C10 ; sesquiterpènes, C15), notamment au niveau des feuilles. Ces composés sont des hydrocarbures non azotés, très réactifs et avec une durée de vie très courte. Ils font partie des métabolites secondaires des plantes, et plus particulièrement des Composés Organiques Volatils Biogènes (COVB) en raison de leur faible poids moléculaire. En tant que métabolites secondaires, ils (i) présentent une diversité chimique très importante (ii) permettent à la plante de se défendre face aux facteurs de stress biotiques et abiotiques, (iii) constituent des signaux chimiques à travers lesquels la plante communique avec son environnement (plantes ou autres organismes) (iv) n'ont pas une fonction universelle et (v) sont différemment représentés dans les différentes familles, genres et espèces. Ces terpènes volatils produits par les plantes sont émis dans l'atmosphère où ils constituent des gaz traces qui peuvent participer à la formation de polluants secondaires, tels que l'O3 troposphérique ou les aérosols, lorsqu'ils sont en contact avec des polluants primaires (e. G. NOx : d'origine anthropique fondamentalement). Le premier point est d'un grand intérêt en région méditerranéenne car les taux d'O3 atteignent les concentrations les plus élevées d'Europe et de nombreuses espèces végétales libèrent des quantités importantes de terpènes. Mis à part l'intérêt des COVB au niveau de l'atmosphère, il pourrait être important de considérer ces composés parmi les facteurs naturels qui modifient les caractéristiques des feux de forêt. En effet, il s'agit de composés qui présentent un point flash faible et une LII (limite inférieure d'inflammabilité) basse. C'est pourquoi, sous des températures relativement faibles ils s'enflamment en présence d'une étincelle, lorsque leur concentration est relativement faible. L'étude des COVB est donc en partie nécessaire afin de mieux comprendre et prévoir les phénomènes de pollution atmosphérique via notamment, la création d'inventaires et la modélisation des COVB des végétaux. Actuellement les inventaires disponibles dans la région Méditerranéenne européenne (i) montrent, pour certaines espèces arborées, des taux d'émission provenant de sources bibliographiques Nord Américaines (ii) n'intègrent pas de taux d'émission pour les espèces arbustives. De plus les modèles existant ne prennent en compte que la température et la lumière, comme facteurs influençant les émissions biogènes. Or, les émissions des végétaux dépendent de nombreux facteurs abiotiques et biotiques. Afin d'améliorer les estimations des émissions de COVB issues de tels modèles, la prise en compte de nouveaux facteurs et d'un taux d'émission moyen pour des espèces typiques sont donc nécessaires. L'objectif de cette thèse a donc été d'étudier les COVB émis et/ou stockés par des espèces méditerranéennes typiques (Rosmarinus officinalis L. , Pinus halepensis Mill. , Cistus albidus L. Et Quercus coccifera L. ) en fonction de nouveaux facteurs ou de facteurs peu explorés : l'architecture (ouverte ou fermée) du milieu, la nature (calcaire ou siliceuse) du sol et du substrat, le déficit hydrique et la compétition (intra et interspécifique) entre les végétaux. Les monoterpènes et les sesquiterpènes ont été étudiés car seuls ces terpènes peuvent être à la fois stockés et émis par le végétal, à la différence de l'isoprène (absent des structures de stockage) et des diterpènes (peu volatils). Cette étude démontre la difficulté de comprendre l'impact des différents facteurs sur le métabolisme des terpènes, étant donné que les variations observées sont souvent différentes pour des espèces, des composés et des conditions environnementales non identiques

Comprendre et prédire les futurs possibles des systèmes écologiques est un des objectifs des écologues, dans un contexte de changements planétaires. L'hypothèse majeure de cette thèse est que les concepts et méthodes de la prospective pourraient permettre d'élargir les connaissances en écologie. La construction de prédictions modélisées est en effet la méthode principale utilisée par les écologues pour étudier les futurs, alors que les prospectivistes utilisent aussi des méthodes qualitatives. Pour analyser les causes de cette limitation, nous avons réalisé des entretiens avec des chercheurs en écologie en adoptant une posture réflexive. Ceux-ci utilisent majoritairement une démarche réductionniste face à des systèmes écologiques complexes. C'est une des principales raisons de l'utilisation majoritaire de la prédiction en écologie. La construction de conjectures fondées sur des récits pour étudier les futurs possibles d'un paysage méditerranéen montre par ailleurs que les futurs écologiques peuvent être multiples. L'incomplétude des connaissances, le caractère aléatoire de certains évènements et la multiplicité des théories existantes, sont la source de paysages futurs diversifiés. Nous illustrons de plus, à l'aide de simulations numériques des changements futurs possibles de ce paysage, la complémentarité entre prédiction et narration. Ce travail ouvre des perspectives intéressantes pour (i) l'écologie, lorsque nous mettons en évidence l'importance des interactions et de la contingence pour comprendre les futurs possibles (ii) la prospective, en approfondissant les concepts de problématique conjecturale et de proférance et (iii) l'interaction entre ces deux disciplines
Studying and predicting possible futures for ecological systems has become an objective of ecological research, particularly because of a growing awareness of the consequences of global changes. We propose here that the methods and concepts developed by the academic field of futures studies could be useful to enlarge ecological knowledge. Building model predictions has been the main method used by ecologists to study futures, whereas more qualitative methods are common in futures studies. We therefore adopted a reflexive viewpoint and conducted detailed interviews with ecologists to analyse the reasons for their limited application to ecological problems. The use of a reductionist approach to deal with complex systems and the lack of acknowledgement of futures' specificities appear as the major reasons for the continued preference for predictive approaches. We built conjectures based mainly on narratives to study possible futures for a Mediterranean landscape and showed that one can imagine several ecological futures. Incomplete knowledge, contingent events and the coexistence of several theories, play an important role in understanding possible future dynamics. By using numerical simulations of possible future changes in this Mediterranean landscape, we also illustrated the complementarities between prediction and narration. This study opens interesting perspectives for (i) ecological research, here we underline the importance of interactions and contingency to understand possible futures, (ii) futures studies, by going further in our understanding of the concepts of ‘conjectural problematic', and ‘diachronisation' and (iii) the link between these two disciplines

La prise de conscience des risques liés à la dégradation de la qualité des milieux lagunaires vis-à-vis de l’eutrophisation a abouti à la mise en œuvre d’actions de gestion visant à réduire les apports en nutriments. Certaines lagunes sont aujourd’hui en phase de restauration, avec une amélioration notable de la qualité de l’eau liée notamment à la réduction des biomasses phytoplanctoniques. En revanche, la réponse des macrophytes benthiques semble plus complexe et non linéaire. A travers une approche complémentaire basée sur l’analyse statistique des données d’observations acquises de 1998 à 2015 et sur des mesures in situ, cette thèse vise à identifier la dynamique temporelle et spatiale des macrophytes ainsi que leur rôle fonctionnel au cours du processus d'oligotrophisation. Au sein des lagunes méditerranéennes, la salinité et les teneurs en nutriments dans la colonne d'eau sont les principaux paramètres qui structurent la distribution des macrophytes benthiques. L’analyse statistique menée sur 21 lagunes polyhalines et euhalines a permis d'illustrer les premières étapes de restauration. La réduction des apports externes a conduit à un basculement rapide (3-4 ans) d’un système totalement dominé par le phytoplancton vers un système dominé par les macroalgues opportunistes et notamment les ulves. La réduction de la disponibilité en azote dans la colonne d'eau liée au développement des ulves favoriserait le développement des gracilaires (algue rouge) et des chaetomorphes (algue verte filamenteuse). Bien plus que la seule conséquence de la restauration, la présence d'espèces clés jouerait ainsi un rôle central dans la restauration en régulant les flux d'azote et de phosphore au sein du système et en créant les conditions favorables à l'apparition d'autres espèces plus pérennes. Bien que notre théorie décrive une tendance vers le retour des macrophytes pérennes pour les trajectoires de re-oligotrophisation, nous n’avons pas encore pu documenter ce retour dans les lagunes après une longue période d’absence. Ceci, montre l’importance de prendre en compte, entre autres, l’importance des sources internes d’éléments nutritifs et de la connectivité pour la recolonisation des angiospermes dans les lagunes
The growing awareness of the negative impacts of the degradation of the water quality in coastal lagoons because of eutrophication has resulted in public action aiming at the reduction of the nutrient loadings into these lagoons. Hence, some of these coastal lagoons are currently undergoing ecological restoration and have shown a clear improvement of their water quality linked to decreasing phytoplankton biomass in the last 10 years. However, the response of the benthic macrophytes appears more complex, particularly by showing non-linear behaviour. By using complementary approaches including statistical analyses of long-term observations (1998-2015) and in situ measurements, this thesis aims to describe the dynamics of the macrophytes in space and time and to study their functional role during the oligotrophication process. Salinity, depth and nutrient concentrations in the water column represent the main factors that statistically explain the distribution of the benthic macrophyte communities in Mediterranean coastal lagoons. The first steps of the ecological restoration in eutrophied polyhaline and euhaline lagoons has been inferred from the statistical analysis of time series in 21 coastal lagoons. The reduction of the external nutrient loading results in a rapid regime shift (3-4 years) from a phytoplankton-dominated system to a macroalgae-dominated system, with particularly Ulva species. The decreasing inorganic nitrogen concentrations due to uptake by Ulva spp. in the water column appears to facilitate the development of Gracillaria spp. (red algae) and Chaetomorpha spp. (green filamentous algae). While the appearance of these macroalgal species is the result of the ecological restoration, these species also play a central role in this process by regulating the biogeochemical element fluxes. This way these species create more favourable conditions for perennial species. Although for re-oligotrophication trajectories in coastal lagoons our theory describes a tendency towards the return of perennial species, so far, we have not been able to document their return after a long period of absence. This shows, that among other factors, the internal nutrient loading and ecological connectivity are important factors to take into account for the recolonization of angiosperms in coastal lagoons

Suite a l'explosion demegraphique des annees 60, le Liban a connu un developpement massif de carrieres calcaires exploitees pour le gravier et les pierres de taille. Ce travail s'inscrit, avec une perspective appliquee dans le domaine scientifique de l'ecologie de la restauration. Il vise a caracteriser et comprendre les dynamiques vegetales spontanees qui s'operent sur ces ecosystemes neoformes en comparaison a des ecosystemes de reference. Les resultats des analyses phyto ecologiques montrent que l'organisation des communautes vegetales colonisant les carrieres est regie a la fois par des facteurs regionnaux (pluviometrie/etage de vegetation) et locaux (site d'echantillonnage, situation, substrat et pente). Sur chacun des biotopes caracterises, falaises, remblais et plateforme, les dynamiques de succession s'observent au niveau des groupements specifiques mais egalement au niveau des traits de vie (type biologique, mode de dissemination, strategies adaptatives). Elles permettent de mettre en evidence differentes categories d'especes (majeures et rares) (generalistes et indicatrices) qui serviront de base en ecologie de la restauration. Sur les remblais, la succession caraterisee est un modele de tolerance initial suivi de processus de facilitation le long de la chrono sequence. Sur les falaises, le taux de remplacement des especes laisse suggerer un turn over rapide du aux conditions stressantes et sur les plateformes les dynamiques sont celles de modele de facilitation sur des pas de temps tres longs. En terme de strategie de restoration, sur les falaises, qui abritent des especes endemiques ou rares, la restauration doit etre orientee et moderre. La remise en etat de plateforme est couteuse et releve du domaine de l ingenieurie avec des interventions sur le substrat (decompactage ou apport de sol). Enfin sur les remblais, la strategie consiste a court circuiter les phases dominees par des annuelles et assurer un couvert vegetal permanent par des herbacees perennes et des chamephytes. Des especes telles que Salvia triloba, Ptilostemon chamaepeuce, Putoria calabrica, Stachys distans, Phagnalon rupestre, ou Hypparhenia hirta semblent particulierement adaptees a de telles fins.

L’objectif de ce travail est d’améliorer notre compréhension des mécanismes et d’évaluer les facteurs agro-écologiques impliqués dans la dynamique spatio-temporelle des populations naturelles de Sahlbergella singularis. Le calcul des tables de vie sur une population d’élevage a révélé que S. Singularis est une espèce à croissance lente. Ceci expliquerait le fait que le ravageur est généralement présent à de faibles densités dans les plantations. L’étude des paramètres démographiques de la population d’élevage a montré que la fécondité est un paramètre-clé des fluctuations saisonnières des populations naturelles. Leur croissance serait liée à la présence de jeunes cabosses sur les cacaoyers fournissant aux femelles une ressource alimentaire favorable à la reproduction. L’étude de l’influence des facteurs agro-écologiques sur les densités de populations de S. Singularis en plantation a révélé que les densités dépendent des conditions parcellaires de culture du cacaoyer. Parmi les pratiques culturales, les traitements insecticides, l’ombrage et le recours aux variétés hybrides sont des facteurs déterminants. En outre, les populations du ravageur sont fortement agrégées dans les zones des plantations bénéficiant d’un ensoleillement maximal. Enfin, l’ombrage fourni par les arbres forestiers s’est avéré plus homogène que l’ombrage d’arbres fruitiers et par conséquent moins propice au développement des poches à mirides. Les recommandations de lutte préconisées par la recherche agronomique sont rarement appliquées par les planteurs. Aussi, nos résultats ont-ils été discutés dans l’optique d’adapter ces recommandations au contexte de culture du cacaoyer qui prévaut actuellement au Cameroun
This work aims at better understanding the mecanisms and agro-ecological factors involved in the Sahlbergella singularis population dynamics in farm. Life table analysis conducted on a rearing population showed that S. Singularis is a slow growing species. This result could explain the low densities of S. Singularis populations in cocoa farms. The study of S. Singularis demographic parameters showed that fecundity is a key-parameter of the seasonal variations of natural populations. Indeed, the high reproductive potential of females, due to optimal food supply and climatic conditions, may largely explain the growth of natural populations. Our work revealed that the density of S. Singularis populations in farms depends on agro-ecological conditions of cocoa production. Among cultural practices, spraying of insecticides, shade management and resort to hybrid varieties were the main factors influencing mirid density. The study of the impact of shade on mirid spatial distribution showed that mirids were aggregated in those areas where sunlight was highest. The infested areas, identified as mirid pockets, could be an infestation source for the surrounding farms. Our results also showed that large forest trees had a tendency to homogenize exposure to sunlight in plots and then to limit the development of mirid pockets. Overall, our study revealed that chemical control and shade management recommendations for cocoa mirids were seldom applied by farmers. Therefore, we discussed our results to fit recommendations to current cocoa production context in Cameroon