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Relevant bibliographies by topics / Pathogen adaptation / Dissertations / Theses

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Dissertations / Theses on the topic 'Pathogen adaptation'

Author: Grafiati

Published: 22 June 2024

Last updated: 31 July 2025

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1

Bacigalupe, Rodrigo. "Population genomic analysis of bacterial pathogen niche adaptation." Thesis, University of Edinburgh, 2018. http://hdl.handle.net/1842/31266.

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Abstract:

Globally disseminated bacterial pathogens frequently cause epidemics that are of major importance in public health. Of particular significance is the capacity for some of these bacteria to switch into a new environment leading to the emergence of pathogenic clones. Understanding the evolution and epidemiology of such pathogens is essential for designing rational ways for prevention, diagnosis and treatment of the diseases they cause. Whole-genome sequencing of multiple isolates facilitating comparative genomics and phylogenomic analyses provides high-resolution insights, which are revolutioniz

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2

Amezaga, Herran Maria Rosario. "The adaptation of Listeria monocytogenes to osmotic stress." Thesis, University of Aberdeen, 1996. http://digitool.abdn.ac.uk/R?func=search-advanced-go&find_code1=WSN&request1=AAIU602297.

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Abstract:

The food-borne pathogen Listeria monocytogenes is more salt tolerant in the complex medium brain heart infusion (BHI, 2.0M NaCI upper limit for growth) than in a chemically-defined medium (DM, 1.0M NaCI upper limit for growth). The components in BHI responsible for the characteristic salt tolerance of L. monocytogenes are peptone and glycine betaine. At high osmolarity, the growth stimulation by peptone was higher than expected from nutritional supplementation, indicating that an osmoprotective mechanism was also at play. Peptone provided a higher level of osmotic protection than the compatibl

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3

Boixel, Anne-Lise. "Environmental heterogeneity, a driver of adaptation to temperature in foliar plant pathogen populations?" Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASA010.

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Abstract:

Les facteurs environnementaux, au premier rang desquels la température, ont un impact sur la biologie des micro-organismes foliaires. Ils peuvent aussi modifier significativement leurs dynamiques populationnelles, voire leurs trajectoires évolutives. Classiquement, les modèles épidémiologiques, utilisés pour mieux gérer les maladies des plantes, intègrent l’influence des conditions météorologiques. Ils s’intéressent surtout à des réponses et des effets moyennés, ne tenant compte ni des variations des réponses individuelles, ni de l’hétérogénéité des changements environnementaux aux échelles ré

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4

Guillemet, Martin. "The dynamics of viral adaptation : theoretical and experimental approaches." Electronic Thesis or Diss., Université de Montpellier (2022-....), 2023. http://www.theses.fr/2023UMONG020.

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Abstract:

La plupart des organismes vivants peuvent être infectés par des virus. Cette omniprésence est due à différents facteurs, notamment des taux de mutation élevés, des populations de grande taille et des temps de génération courts, qui permettent une adaptation rapide à des espèces hôtes très différentes. La dynamique de l'adaptation des populations virales résulte de l'interaction entre de multiples forces évolutives. Au cours de cette thèse, nous avons développé une combinaison d'approches théoriques et expérimentales pour démêler l'influence de certains de ces facteurs sur l'adaptation virale.T

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5

Kastora, Stavroula. "Novel regulators that control the adaptation of a major fungal pathogen to combinations of host signals." Thesis, University of Aberdeen, 2015. http://digitool.abdn.ac.uk:80/webclient/DeliveryManager?pid=228983.

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Abstract:

One of the major aims of this thesis was to identify novel regulators that drive C. albicans adaptation during growth under different nutrient and temperature conditions. The classical stress response cascades have been previously characterised under standardized, but physiologically irrelevant growth conditions (YPD at 30°C). In this study these pathways and other regulators were examined under more physiologically relevant inputs because metabolic plasticity and thermo-tolerance have been shown to affect stress adaptation (Arguelles et al., 1999; Brown et al., 2014; Cowen, 2009; Diezmann et

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6

Melnyk, Anita. "The Evolution of Antibiotic Resistance in Experimental Populations of Bacteria." Thesis, Université d'Ottawa / University of Ottawa, 2016. http://hdl.handle.net/10393/34556.

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Abstract:

Antibiotic resistance is a major threat to public health. Understanding how it evolves, and the genes that underlie resistance, is the main goal of my Ph.D. research. After a resistance mutation arises, it’s fate within a pathogen population will be etermined in part by its fitness: mutations that suffer little or no fitness cost are more likely to persist in the absence of antibiotic treatment. My research centers on understanding this process better by gaining knowledge about the spectrum of fitness effects associated with antibiotic resistance mutations. Using a meta-analysis framework I

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7

McDougald, S. Diane School of Microbiology &amp Immunology UNSW. "Regulation of starvation and nonculturability in the marine pathogen, Vibrio vulnificus." Awarded by:University of New South Wales. School of Microbiology and Immunology, 2000. http://handle.unsw.edu.au/1959.4/19118.

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Abstract:

Vibrio vulnificus is a model environmental organism exhibiting a classical starvation response during nutrient limitation as well as a non-culturable state when exposed to low temperatures. In addition to these classic global responses, this organism is an opportunistic pathogen that exhibits numerous virulence factors. This organism was chosen as the model organism for the identification of regulators of the viable but nonculturable response (VBNC) and the starvation-induced maintenance of culturability (SIMC) that occurs when cells are starved prior to low temperature incubation. In order

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8

Maikova, Anna. "The CRISPR-Cas system of human pathogen Clostridium difficile : function and regulation." Thesis, Université de Paris (2019-....), 2019. http://www.theses.fr/2019UNIP7091.

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Abstract:

Clostridium difficile (nouveau nom Clostridioides difficile) est une bactérie à Gram-positif, sporulante, anaérobie stricte, présente dans le sol et les environnements aquatiques, ainsi que dans le tractus intestinal des mammifères. C. difficile est l’un des principaux clostridies pathogènes. Cette bactérie est devenue un vrai problème de santé publique associé à l'antibiothérapie dans les pays industrialisés. La diarrhée associée à C. difficile est actuellement la diarrhée nosocomiale la plus fréquente en Europe et dans le monde. Depuis la dernière décennie, la proportion de formes d’infectio

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9

Thézé, Julien. "Diversification et adaptation génomique des virus entomopathogènes." Thesis, Tours, 2013. http://www.theses.fr/2013TOUR4006.

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Abstract:

À différentes échelles de temps, le but de ma thèse a été de comprendre l'évolution des virus entomopathogènes à travers l’étude de la diversification et de l’adaptation génomique de grands virus à ADN d’insectes. Dans un premier temps, j’ai pu estimer les âges de diversifications des baculovirus et des nudivirus, et proposer un scénario de coévolution à long terme entre ces virus et leurs hôtes insectes. Puis, me plaçant sur une échelle de temps moindre, j’ai montré que les hôtes insectes sont le facteur principal de la diversification des baculovirus, et de façon surprenante, j’ai également

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10

Pawlik, Marie-Christin [Verfasser], and Ulrich [Akademischer Betreuer] Vogel. "Gene expression in the human pathogen Neisseria meningitidis: Adaptation to serum exposure and zinc limitation / Marie-Christin Pawlik. Betreuer: Ulrich Vogel." Würzburg : Universitätsbibliothek der Universität Würzburg, 2013. http://d-nb.info/1036836509/34.

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11

Carnero-Montoro, Elena 1985. "Genomic and functional approaches to genetic adaptation." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2013. http://hdl.handle.net/10803/291115.

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Abstract:

The genetic basis of phenotypes that have contributed to the adaptation of species and organisms to new environments is a central question in evolutionary genetics. The recent accumulation of genetic variability data has allowed a genome-wide search for different signatures of positive selection which has led to the discovery of hundreds of putative candidate genes that may have played a role in adaptation. However, such hypothesis-free approaches do not reveal either causal variants or the actual biological mechanisms that have made each adaptation possible. Furthermore, the detection o

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Radhakrishnan, Balasubramaniam Vasanthakrishnan. "Understanding the role of virulence regulators in niche adaptability using the Listeria PrfA 'saprotroph to parasite' switch." Thesis, University of Edinburgh, 2014. http://hdl.handle.net/1842/17982.

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Abstract:

Listeria monocytogenes the causative agent of foodborne listeriosis is a facultative pathogen that lives as a saprophyte in soil and as an intracellular parasite in host tissues. A regulatory protein, the transcriptional activator PrfA, plays a key role in the “saprotroph to parasite” conversion of L. monocytogenes by selectively activating key virulence genes essential for infection when the bacteria enter host cells. Central to this conversion is the plastic ability of PrfA allosterically shift between two states, weakly active (“ON-OFF”, outside in the environment) and strongly active (“ON”

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13

DI, FEDE MARTINA. "Dissecting the role of Neisseria Heparin Binding Antigen cleavage during adaptation of Neisseria meningitidis to mucosal surface." Doctoral thesis, Università di Siena, 2017. http://hdl.handle.net/11365/1009815.

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Abstract:

Neisserial Heparin Binding Antigen (NHBA) is a surface-exposed lipoprotein specific for Neisseria and is one of the three main protein antigens of the Bexsero vaccine. Meningococcal and human proteases, including lactoferrin and kallikrein, cleave NHBA protein upstream or downstream a conserved Arg-rich motif, respectively. The cleavage results in the release of the C-terminal portion of the protein. C-terminal fragment originating from the processing of meningococcal proteases, referred as C2 fragment, exerts a toxic effect on endothelial cells altering their permeability. In this work, we re

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14

Paul-Pont, Ika. "Sensibilité et adaptation de populations de bivalves marins soumis à des stress multiples : infestation parasitaire, contamination microbienne et pollution métallique." Thesis, Bordeaux 1, 2010. http://www.theses.fr/2010BOR14008/document.

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Abstract:

Dans les écosystèmes littoraux, l‘activité anthropique, mais aussi le contexte naturel induisent chez les organismes aquatiques des situations de « multistress ». Parmi les sources potentielles de perturbation, trois d‘entre elles ont été étudiées : contamination métallique, infection bactérienne et infestation parasitaire. Une approche intégrée de leurs interactions sur la réponse génétique, protéique, cellulaire et populationnelle chez la coque Cerastoderma edule et la palourde japonaise Ruditapes philippinarum a été entreprise sur le terrain et en laboratoire. In situ, un suivi de deux ans

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Rakotonindraina, Toky Fanambinana. "Analyse et modélisation des effets des pratiques culturales sur les épidémies de mildiou de la pomme de terre. Adaptation du modèle SIPPOM (Simulator for Integrated Pathogen POpulation Management) au pathosystème." Thesis, Toulouse, INPT, 2012. http://www.theses.fr/2012INPT0147/document.

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Abstract:

Le mildiou de la pomme de terre, causé par l'agent pathogène Phytophthora infestans est l'une des maladies les plus préjudiciables de la culture. Jusqu'à présent, la lutte chimique reste le moyen de contrôle le plus utilisé pour la maîtriser, classant la pomme de terre au premier rang en termes d'Indices de Fréquence de Traitement en grande culture. Par ailleurs, l'utilisation de variétés résistantes, comportant notamment des gènes de résistances spécifiques, a également démontré son efficacité pour limiter les dégâts engendrés par cette maladie. Mais leur efficacité est peu durable avec une d

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Jallet, Arthur. "Effet de la sélection fluctuante sur le pathogène du blé Zymoseptoria tritici par une approche d'évolution expérimentale." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLS349.

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Abstract:

Un défi important en Biologie est de comprendre comment les organismes s’adaptent à des environnements fluctuants et de déterminer l’importance relative de la plasticité phénotypique et des mutations dans cette adaptation. Nous avons examiné la réponse d’un pathogène du blé (Zymoseptoria tritici) aux fluctuations de température grâce à des approches de transcriptomique, de phénotypage (fitness relative et pathogénie) et de génomique. Pour cela, une évolution expérimentale a été menée in vitro à partir de deux clones ayant évolué dans trois régimes thermiques : à 17°C, à 23°C et en température

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Laurent, Benoit. "Base génétique et potentiel d’évolution de la pathogénicité de Fusarium graminearum, bio-agresseur fongique des céréales." Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0317/document.

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Abstract:

Le champignon Fusarium graminearum est l'un des principaux agents responsables de la fusariose des épis, une maladie nécrosante des céréales associée à une contamination des grains et des aliments par des mycotoxines. De récentes observations suggèrent une évolution de l’agressivité des populations de ce pathogène, questionnant l’efficacité et la durabilité des moyens de luttes actuels. Mieux anticiper cette évolution nécessite une meilleure caractérisation de la diversité phénotypique et génotypique existante entre souches. Six nouveaux génomes de F. graminearum ont été séquencés et ont permi

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Lombard, Julien. "Dynamiques éco-évolutives des interactions hôte-parasite dans des environnements spatialement structurés." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2025. http://www.theses.fr/2025ULILS101.

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Abstract:

Pourquoi les parasitesfont-ils plus ou moins de de malà leurs hôtes? Qu'est-ce qui déterminele fait que certaines épidémiesdeviennent pandémiques,quand d'autres restent localisées?S'il est notoire que les parasiteset les maladies infectieuses constituentdes ennemis de longue datede l'Humanité, comprendre leurs dynamiquesd'émergence, de propagationet d'évolution constitue un levierimportant pour la gestion des épidémies(animales ou végétales) par despolitiques publiques. Parmis tous lesfacteurs environnementaux qui façonnentles dynamiques de propagationet d'évolution des parasites,la structure

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19

Pontremoli, C. "EVOLUTIONARY ANALYSES PROVIDE INSIGHT INTO HOST-PATHOGEN INTERACTIONS AND DIET-RELATED ADAPTATIONS." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano, 2017. http://hdl.handle.net/2434/470653.

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Abstract:

ABSTRACT INTRODUCTION Genetic diversity plays an important role in the survival and adaptability of all species. When a population environment (meaning, for instance, climatic conditions, pathogens, and food availability) changes, the population is subject to a selective pressure. Variation in the population gene pool provides variable traits which can be selected for, via natural selection, leading to an adaptive change to survive. Genetic diversity is generated by a combination of different evolutionary processes such as mutation, genetic drift, migration and natural selection. Natural s

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20

Chojnacki, Karen M. "Spatial variation in selection and multivariate estimates of local adaptation in a salamander-virus system." Pullman, Wash. : Washington State University, 2009. http://www.dissertations.wsu.edu/Thesis/Spring2009/K_Chojnacki_042409.pdf.

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Abstract:

Thesis (M.S. in zoology)--Washington State University, May 2009.<br>Title from PDF title page (viewed on May 22, 2009). "School of Biological Sciences." Includes bibliographical references (p. 18-25).

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Gillmaier, Nadine [Verfasser]. "Interaktion zwischen Metabolismus und Virulenz pathogener Bakterien - 13C-Isotopologstudien und Metabolitprofiling zur Aufklärung von Stoffwechselwegen in pathogenen Bakterien, deren Adaptation an und Beeinflussung von Wirtszellmetabolismen / Nadine Gillmaier." München : Verlag Dr. Hut, 2012. http://d-nb.info/1028786700/34.

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22

Talagrand, Emilie. "Diversité, complexité et adaptation au comportement pathogène au sein du genre Aeromonas." Thesis, Montpellier, 2017. http://www.theses.fr/2017MONTT123/document.

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Abstract:

Le genre Aeromonas regroupe des bactéries ubiquitaires vivant essentiellement dans les environnements hydriques. Ces pathogènes opportunistes de l’homme et de nombreux animaux possèdent un large répertoire de facteurs associés à la virulence. Bien que des pathotypes aient été proposés et que certaines espèces semblent plus fréquemment isolées en clinique humaine et vétérinaire, leur pouvoir pathogène demeure mal compris, notamment en raison du faible nombre d’études fonctionnelles et du manque d’investigations tenant compte de la diversité génétique et de la complexité des comportements biolog

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Mücke, Pierre-Alexander [Verfasser], Dörte [Gutachter] Becher, and Julia [Gutachter] Bandow. "Proteomic adaptation of bacterial pathogens to antimicrobial peptides / Pierre-Alexander Mücke ; Gutachter: Dörte Becher, Julia Bandow." Greifswald : Universität Greifswald, 2021. http://d-nb.info/1239249640/34.

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24

Mazurier, Mélanie. "Biodiversité et adaptation au pathogène racinaire Verticillium alfalfae chez Medicago truncatula : Importance de la micro-évolution." Thesis, Toulouse 3, 2018. http://www.theses.fr/2018TOU30057/document.

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Abstract:

Les légumineuses font parties des familles les plus cultivées à la fois pour l'alimentation humaine et pour l'alimentation animale. Une des maladies principales de la luzerne (Medicago sativa), plante fourragère la plus cultivée au monde, est la verticilliose causée par Verticillium alfalfae, un champignon du sol. Sans traitements phytosanitaires efficaces et pratiques pour les maladies causées par des pathogènes du sol, la protection des cultures passe par la sélection de variétés résistantes. Dans cette thèse, la légumineuse modèle Medicago truncatula a été utilisée afin d'identifier des gèn

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Izumitsu, Kosuke. "Studies on two-component signaling system in osmotic adaptation and fungicide sensitivity of plant pathogenic fungi." Kyoto University, 2010. http://hdl.handle.net/2433/120463.

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Abstract:

Kyoto University (京都大学)<br>0048<br>新制・課程博士<br>博士(農学)<br>甲第15420号<br>農博第1805号<br>新制||農||978(附属図書館)<br>学位論文||H22||N4519(農学部図書室)<br>27898<br>京都大学大学院農学研究科地域環境科学専攻<br>(主査)教授二井一禎, 教授舟川晋也, 教授渡邊隆司<br>学位規則第4条第1項該当

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Pandiani, Franck. "Mécanismes d’adaptation aux basses températures de croissance de la bactérie pathogène B. cereus : rôle des hélicases à ARN." Thesis, Avignon, 2010. http://www.theses.fr/2010AVIG0634/document.

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Abstract:

Bacillus cereus est une bactérie largement disséminée dans la nature, contaminant ainsi les aliments en contact avec le sol. En France, cette bactérie est considérée comme le quatrième agent de toxi infection alimentaire collective. Pour être pathogène, B. cereus doit être capable de se multiplier lors des différentes étapes de transformation et notamment au cours de la réfrigération. Le but de cette étude a été d'étudier les mécanismes moléculaires de la réponse adaptative au froid et en particulier le rôle des hélicases à ARN de B. cereus ATCC 14579. Le gène cshA, codant pour une hélicase à

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De, La Garza García Jorge. "Réponse de Brucella microti et Brucella suis au stress acide à pH 4.5 : Approches transcriptomiques et génétiques." Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTT067.

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Abstract:

Réponse de Brucella microti et Brucella suis au stress acide à pH 4.5 : Approches transcriptomiques et génétiquesL´espèce atypique Brucella microti, isolée de la faune sauvage et proche de l´espèce classique et zoonotique Brucella suis bv. 1 1330, diffère de celle-ci de par sa croissance rapide et sa létalité dans la souris. Ce couple de souches est un modèle d’étude pertinent pour la comparaison des espèces classiques et atypiques de Brucella. Malgré le haut degré d’homologie de leurs séquences génomiques (>99 % d´identité), ces espèces sont phénotypiquement différentes et ont développé de

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Bouhouch, Yassine. "Helminthosporiose chez l’orge : détection précoce, modélisation prédictive, deep learning et adaptation génomique de l'agent pathogène Pyrenophora teres." Electronic Thesis or Diss., Reims, 2024. http://www.theses.fr/2024REIMS030.

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Abstract:

Ce projet s'inscrit dans une démarche interdisciplinaire visant à résoudre les problématiques liées à l’helminthosporiose, une maladie cryptogamique causée par Pyrenophora teres, réduisant considérablement les rendements de l'orge (Hordeum vulgare L.).Dans ce travail, un modèle d'apprentissage profond combinant les architectures Cascade R-CNN et U-Net a été développé pour quantifier les symptômes de la maladie sur les feuilles d’orge. Le modèle a atteint une précision de 95 % dans la détection des lésions et s’est avéré particulièrement efficace pour identifier les petites lésions quatre jours

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Ferrer, i. Admetlla Anna. "Human genetic diversity in genes related to host-pathogen interactions." Doctoral thesis, Universitat Pompeu Fabra, 2009. http://hdl.handle.net/10803/7163.

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Abstract:

La tesi que teniu a les mans recull quatre treballs amb un objectiu comú; determinar si els patògens (virus, bacteris, paràsits.) han exercit pressions selectives sobre els genomes dels seus hostes (com per exemple els humans).<br/>Sabent que la detecció de l'empremta de la selecció permet identificar aquelles regions del genoma que han estat rellevants al llarg de l'evolució d'una espècie, ja que a nivell local és la variació funcional qui acaba essent objecte de la selecció, ens hem disposat a estudiar els possibles senyals de selecció en gens relacionats amb la interacció hoste-patògen. En

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Gillmaier, Nadine Verfasser], Eisenreich [Akademischer Betreuer] Wolfgang, Hubert [Akademischer Betreuer] [Hilbi, and Wolfgang [Akademischer Betreuer] Eisenreich. "Interaktion zwischen Metabolismus und Virulenz pathogener Bakterien : 13C-Isotopologstudien und Metabolitprofiling zur Aufklärung von Stoffwechselwegen in pathogenen Bakterien, deren Adaptation an und Beeinflussung von Wirtszellmetabolismen / Nadine Gillmaier. Gutachter: Hubert Hilbi ; Wolfgang Eisenreich. Betreuer: Eisenreich Wolfgang." München : Universitätsbibliothek der TU München, 2012. http://d-nb.info/103151404X/34.

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Poulicard, Nils. "Emergence et adaptation du Rice yellow mottle virus : relations entre histoire évolutive, contournement de résistance et interactions hôte/pathogène." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20121.

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Abstract:

Le Rice yellow mottle virus (RYMV) est un virus émergeant qui constitue actuellement une contrainte majeure à la riziculture sur le continent africain. Quelques rares variétés de riz, issues des espèces cultivées de riz africain et asiatique (respectivement Oryza glaberrima et O. sativa), ont récemment été identifiées comme hautement résistantes au RYMV. Ce phénotype de résistance est dû à un gène récessif RYMV1 codant le facteur d'initiation de la traduction eIF(iso)4G1 du riz.Les objectifs de cette thèse sont (i) d'étudier la durabilité de la résistance élevée du riz contre le RYMV avant son

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Rios, Rosa Elvira. "Characterisation of the physiological, chemical and pathogenic changes arising from the adaptation of Campylobacter jejuni to aerotolerant growth." Thesis, Manchester Metropolitan University, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.243715.

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Janakiraman, Vani. "Réponse immunitaire innée et adaptative pour des motifs moléculaire associés aux mycobactéries pathogènes (« PAMPs »)." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066291.

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Abstract:

La tuberculose causée par Mycobacterium tuberculosis est la plus mortelle des maladies infectieuses. Les mycobactéries sont des pathogènes intra-cellulaires qui ont développé des mécanismes d’évasion spécifiques pour survivre au sein de leur hôte. Une réponse immune anti-mycobatérienne efficace met en jeu l’activation des cellules T CD4+ Th1 ainsi que la génération d’IFN- microbicide. Cependant, des patients ayant une tuberculose active présentent une réponse immune de type Th2 durant les stades les plus tardifs de l’infection. L’association de ce pathogène avec le VIH chez les patients attei

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Mathisen, Peter. "Environmental factors selecting for predation resistant and potentially pathogenic bacteria in aquatic environments." Doctoral thesis, Umeå universitet, Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap, 2017. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-133338.

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Abstract:

The long history of co-existence of bacteria and their protozoan predators in aquatic environments has led to evolution of protozoa resistant bacteria (PRB). Many of these bacteria are also pathogenic to humans. However, the ecological drivers determining the occurrence of different types of PRB in aquatic environments, and the eco-evolutionary link between bacterial adaptation and the resulting implications for mammalian hosts are poorly known. This thesis examines the impact of nutrients and predation on PRB, as well as the ecological and evolutionary connection between their life in aquatic

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Diomande, Sara Esther. "Adaptation au froid de la bactérie pathogène Bacillus cereus : étude de mécanismes impliqués et exploitation de la diversité génétique." Thesis, Avignon, 2014. http://www.theses.fr/2014AVIG0666/document.

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Abstract:

Bacillus cereus sensu stricto (ss) est un pathogène alimentaire majeur représentant la 2e cause de toxiinfectionalimentaire en France en 2012. Cette espèce fait partie du groupe Bacillus cereus sensu lato (sl)constitué d’espèces ubiquitaires génétiquement très proches et incluant d’autres pathogènes comme B.anthracis, B. thuringensis et B. cytotoxicus. Les souches de B. cereus sl sont d’autre part réparties en septgroupes phylogénétiques présentant des gammes de température de croissance variées et caractérisés partrois thermotypes principaux: thermotolérants, mésophiles, psychrotolérants. L’a

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Nieth, Anita Katharina [Verfasser], and Winfried [Akademischer Betreuer] Römer. "Liposomes as versatile tools: adaptation of bacteriophage therapy against intracellular bacterial pathogens by liposomal vectorization and liposomal analysis of synthetic glycolipids as surface receptors." Freiburg : Universität, 2015. http://d-nb.info/1119327210/34.

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Schmitt, Paulina. "Diversité moléculaire des effecteurs antimicrobiens chez l'huître creuse Crassostrea gigas : mise en évidence et rôle dans la réponse antimicrobienne." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20158/document.

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Abstract:

Ce travail a contribué à la compréhension des bases moléculaires de l'immunité de l'huître creuse par la caractérisation la diversité de trois effecteurs antimicrobiens de C. gigas et par l'appréhension du rôle de cette diversité dans les mécanismes de défense. Des analyses phylogénétiques de deux peptides antimicrobiens (AMPs), Cg-Défensines (Cg-Defs) et Cg-Proline rich peptide (Cg-Prp), et d'une protéine de type Bactericidal Permeability Increasing protein, Cg-BPI, nous a permis montrer la grande diversité pour les 2 AMPs, qui est générée par plusieurs mécanismes génétiques et par des pressi

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Petersen, Henning [Verfasser]. "Comparative investigations on interspecies adaptation of low-pathogenic avian influenza viruses (AIV) and the impact of NS-reassortment of highly-pathogenic AIV on virus-host interactions in different poultry species / Henning Petersen." Hannover : Bibliothek der Tierärztlichen Hochschule Hannover, 2012. http://d-nb.info/1035195550/34.

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Richard, Damien. "Microévolution et adaptation à une pression de sélection anthropique chez Xanthomonas citri pv. citri, une bactérie pathogène des agrumes : dynamique du compartiment plasmidique." Thesis, La Réunion, 2019. http://www.theses.fr/2019LARE0001.

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Abstract:

Le cuivre, souvent utilisé pour gérer les bactérioses en agriculture, est largement utilisé dans la lutte contre Xanthomonas citri pv. citri (Xcc), agent responsable du chancre asiatique des agrumes. La récente détection d’un phénotype résistant au cuivre (CuR) chez Xcc dans deux territoires ultramarins français a motivé une étude génomique qui a révélé, dans les génomes de souches CuR, la présence d’un plasmide conjugatif portant un transposon adaptatif de type Tn3. Sa conservation chez plusieurs espèces de Xanthomonas phytopathogènes suggère le rôle des transferts horizontaux (HGT) dans l’ad

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Kurze, Christoph [Verfasser], Robin F. A. [Akademischer Betreuer] Moritz, Peter [Akademischer Betreuer] Neumann, and Dirk C. [Akademischer Betreuer] Graaf. "Reciprocal adaptations between the microsporidian gut pathogen Nosema ceranae and its honeybee host Apis mellifera : [kumulative Dissertation] / Christoph Kurze ; Robin F. A. Moritz, Peter Neumann, Dirk C. Graaf." Halle, 2016. http://d-nb.info/1116952343/34.

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Joubert, Aymeric. "Adaptation d'Alternaria brassicicola à son hôte : étude de composantes moléculaires impliquées dans la protection du champignon pathogène vis-à-vis des phytoalexines indoliques des Brassicaceae." Angers, 2011. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-01143830.

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Abstract:

Alternaria brassicicola est un champignon nécrotrophe responsable du "black spot" des Brassicaceae, causant d'importants dégâts culturaux. Lors de l'infection, les Brassicaceae synthétisent divers composés de défense tels que les phytoalexines indoliques camalexine et brassinine. Une étude préalable avait suggéré une action de ces molécules sur l'intégrité de la membrane fongique et la mise en place chez le champignon d'un mécanisme adaptatif de type compensatoire visant à renforcer son intégrité cellulaire. L'objectif de la thèse est d'identifier les composantes moléculaires régulant l'induct

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Go, Natacha. "Modélisation de la réponse immunitaire au virus du Syndrome Dysgénésique et Respiratoire Porcin." Thesis, Paris, AgroParisTech, 2014. http://www.theses.fr/2014AGPT0070/document.

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Abstract:

Le SDRPv est responsable de pertes économiques mondiales et son contrôle est un enjeu majeur pour la production porcine. La vaccination, principale mesure de contrôle, ne permet pas d'éradiquer l'infection et confère seulement une protection partielle de l'hôte. Ce manque d'efficacité est principalement due à grande variabilité de virulence des souches du SDRPv, induisant des dynamiques intra-hôte très variables. L'objectif de cette thèse est de mieux comprendre les interactions entre le virus et la réponse immunitaire, dans l'optique d'améliorer le contrôle de cette maladie. Pour cela, une ap

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Montarry, Josselin. "Réponse adaptative des populations de Phytophthora infestans, agent du mildiou de la pomme de terre, au déploiement en culture de son hôte Solanum tuberosum." Rennes, Agrocampus, 2007. http://www.theses.fr/2007NSARC090.

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Abstract:

Comprendre la sélection exercée par la plante hôte et ses conséquences sur la structure des populations pathogènes est essentiel pour gérer durablement les résistances des plantes aux maladies. Les objectifs de ce travail sont i) d’appréhender l’impact de la sélection imposée par des hôtes présentant différents niveaux de résistance, sur la structure phénotypique et génotypique d’une population locale de Phytophthora infestans, agent du mildiou de la pomme de terre ; ii) de déterminer si les pressions de sélection récurrentes exercées par les variétés dominant chaque bassin de production entra

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Paleari, L. "IN SILICO IDEOTYPING: DEFINITION AND EVALUATION OF RICE IDEOTYPES IMPROVED FOR RESISTANCE/TOLERANCE TRAITS TO BIOTIC AND ABIOTIC STRESSORS UNDER CLIMATE CHANGE SCENARIOS." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano, 2017. http://hdl.handle.net/2434/483333.

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Abstract:

The development of new cultivars better adapted to specific growing conditions is a key strategy to meet an ever-increasing growing global food demand and search for more sustainable cropping systems. This is even more crucial in the context of a changing climate. Ecophysiological models and advanced computational techniques (e.g., sensitivity analysis, SA) represent powerful tools to analyze genotype (G) by environment (E) interactions, thus supporting breeders in identifying key traits for specific agro-environmental contexts. However, limits for the effective use of mathematical models wit

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Andanson, Audrey. "Evolution de l'agressivité des champignons phytopathogènes, couplage des approches théorique et empirique." Thesis, Nancy 1, 2010. http://www.theses.fr/2010NAN10094/document.

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Abstract:

Les organismes vivants puisent leurs ressources de l'environnement pour les allouer aux différentes fonctions biologiques assurant leur développement (croissance, survie, reproduction). La quantité de ressources disponibles dans un environnement étant limitante, les individus doivent faire des compromis lors de l'allocation de ces ressources à leurs différentes fonctions biologiques. Ces compromis contraignent le développement des individus et entraînent d'autres compromis entre leurs traits d'histoire de vie (âge et taille à maturité, nombre de descendants), conditionnant ainsi leurs capacité

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Ripoll, Julie. "Effets de la contrainte hydrique, seule ou en interaction avec un pathogène, sur le fonctionnement de la plante et la qualité du fruit de Solanum lycopersicum L., en fonction du génotype." Thesis, Avignon, 2015. http://www.theses.fr/2015AVIG0670/document.

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Abstract:

En horticulture, les effets négatifs du déficit hydrique (WD) sur le rendement peuvent être en partie compensés par des effets positifs sur la qualité des fruits et la stimulation des défenses de la plante face à d’autres stress. L'objectif de la thèse était d'explorer un certain nombre de pistes permettant d'évaluer les effets positifs et négatifs du WD, et d'appréhender les facteurs de variations. Après avoir établi un état des connaissances actuelles des effets du WD sur la qualité des fruits, plusieurs questions ont été abordées: 1) quels sont les effets de WD appliqués à des stades précis

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Montarry, Josselin. "Réponse adaptative des populations de Phytophthora infestans, agent du mildiou de la pomme de terre, au déploiement en culture de son hôte Solanum tuberosum." Phd thesis, Agrocampus - Ecole nationale supérieure d'agronomie de rennes, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00133363.

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Abstract:

Comprendre la sélection exercée par la plante hôte et ses conséquences sur la structure des populations pathogènes est essentiel pour gérer durablement les résistances des plantes aux maladies. Les objectifs de ce travail sont i) d'appréhender l'impact de la sélection imposée par des hôtes présentant différents niveaux de résistance, sur la structure phénotypique et génotypique d'une population locale de Phytophthora infestans, agent du mildiou de la pomme de terre ; ii) de déterminer si les pressions de sélection récurrentes exercées par les variétés dominant chaque bassin de production entra

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Pandiani, Franck. "Mécanismes d'adaptation aux basses températures de croissance de la bactérie pathogène B. cereus : rôle des hélicases à ARN." Phd thesis, Université d'Avignon, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00765823.

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Abstract:

Bacillus cereus est une bactérie largement disséminée dans la nature, contaminant ainsi les aliments en contact avec le sol. En France, cette bactérie est considérée comme le quatrième agent de toxi infection alimentaire collective. Pour être pathogène, B. cereus doit être capable de se multiplier lors des différentes étapes de transformation et notamment au cours de la réfrigération. Le but de cette étude a été d'étudier les mécanismes moléculaires de la réponse adaptative au froid et en particulier le rôle des hélicases à ARN de B. cereus ATCC 14579. Le gène cshA, codant pour une hélicase à

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Lê, Van Amandine. "Potentiel évolutif du pouvoir pathogène de Venturia inaequalis en lien avec la domestication du pommier et l'utilisation de résistances quantitatives en amélioration variétale." Phd thesis, Université d'Angers, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00663827.

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Abstract:

Maîtriser l'impact des modifications liées à l'activité humaine sur les populations de pathogènes des cultures est un des grands enjeux actuels pour la mise en place d'une agriculture durable. L'objectif de cette thèse était d'évaluer l'impact de la domestication du pommier et de l'utilisation de résistances quantitatives dans les variétés en cours de sélection, sur le pouvoir pathogène du champignon Venturia inaequalis, responsable de la tavelure. Par des inoculations croisées sur pommiers sauvages et domestiques, nous avons comparé le pouvoir pathogène de souches isolées de milieux naturels

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Niemi, Lena. "Spatial patterns in the interaction between Salix triandra and associated parasites." Doctoral thesis, Umeå : Umeå University, Department of Ecology and Environmental Science, 2006. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-798.

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