Academic literature on the topic 'Monogastriques'

La maîtrise des rejets de phosphore (P) dans les déjections animales passe par une meilleure connaissance des besoins des animaux et de l’utilisation de l’apport alimentaire de P. Les méthodes d’étude sont un peu différentes chez les animaux monogastriques (porcs et volailles) ou les ruminants. En règle générale, la détermination des besoins repose sur une démarche factorielle (estimation des dépenses d’entretien et de production) ; toutefois, une méthode plus globale peut être appliquée chez les monogastriques (optimisation de la minéralisation osseuse). L’intégration des connaissances a permis de préciser les systèmes, l’expression des besoins (et des apports) passant de P total à P digestible apparent (porcs) ou absorbé réel (ruminants). L’évaluation de l’efficacité digestive de l’apport alimentaire de P nécessite, chez le monogastrique, la prise en compte de l’utilisation du phosphore phytique. Cette dernière peut être très différente selon l’activité phytasique propre des constituants du régime, l’utilisation de phytases microbiennes et l’éventuelle dénaturation des phytases lors de la granulation des aliments. Pour ces raisons, deux valeurs de P digestible apparent (activité phytasique intacte ou dénaturée) figurent dans les tables INRA-AFZ ; de plus des équations sont proposées pour tenir compte de l’incorporation de phytase microbienne. Pour les ruminants, la compilation des données de la littérature a permis d’établir un coefficient d’absorption réelle de P pour les grandes catégories d’aliments (phosphates concentrés et fourrages). Ces démarches, en permettant une meilleure adéquation des apports aux besoins doivent se traduire par une réduction substantielle des rejets de phosphore dans les effluents d’élevage.

Le phosphore des végétaux constitue la majeure partie (2/3 à 3/4) des apports de phosphore chez les monogastriques. Il est pour l’essentiel (2/3 à 3/4) sous forme d’acide phytique ou de phytates (de Na, K, ...). L’utilisation digestive de cette forme de P par l’animal dépend pour beaucoup de l’addition ou de la présence naturelle de phytase et varie de moins de 20% pour les régimes dépourvus à plus de 60% pour ceux enrichis en phytase microbienne (=1000 unités d’enzyme/kg d’aliment). Cette enzyme, en hydrolysant le phosphore phytique, réputé peu disponible et ayant de nombreuses propriétés antinutritionnelles vis-à-vis de certains cations, permet d’économiser partiellement, voire totalement (porcs), sur les phosphates minéraux ajoutés et de réduire considérablement (jusqu’à 50%) les teneurs en P des lisiers. Le principal frein à l’utilisation généralisée des phytases, qu’elles soient ajoutées ou naturellement présentes dans certaines céréales comme le blé ou le seigle et leurs sous-produits, reste le problème de leur conservation au cours de la fabrication des aliments : un trop fort échauffement au cours de la granulation (70-80°C) conduisant à des pertes importantes (30 à 50%, près de 100% au-delà de 80°C) de l’activité phytasique. Enfin, l’étude systématique des correspondances entre activité phytasique des céréales et digestibilités de P de celles-ci reste à faire.

Cet article présente les connaissances actuelles sur le déroulement de la digestion des protéines chez les monogastriques, essentiellement les porcs et les volailles. Le pois, qui est un protéagineux important en Europe, a été choisi comme exemple compte tenu des variabilités importantes de digestibilité des protéines qu’il présente. Après un rappel de la composition protéique de cette matière première et des digestibilités chez les monogastriques, les différents composants pouvant intervenir pour expliquer les résultats observés sont présentés. Ainsi plusieurs facteurs antinutritionnels contenus dans ce protéagineux peuvent avoir une influence négative. D’autres consituants du pois ou de l’aliment, tels que les glucides ou les lipides, peuvent aussi être impliqués. De plus, la structure même des protéines entraîne une sensibilité variable à l’hydrolyse. Ainsi certaines caractéristiques telles qu’une hydrophobie importante, une forte glycosylation, une structure secondaire riche en feuillets β, une structure tertiaire compacte et la présence de ponts disulfure semblent avoir une influence négative sur l’hydrolyse des protéines. Les traitements technologiques appliqués aux aliments peuvent aussi avoir dans certains cas un effet sur la digestion des protéines. Ainsi, le broyage peut dans certaines conditions améliorer la digestion. De même des traitements thermiques tels que la granulation ou l’extrusion, dans la mesure où les conditions utilisées ne sont pas extrêmes, peuvent améliorer la digestion des protéines. Les quantités de rejets azotés issus de la digestion dépendent ainsi de nombreux facteurs. Ils sont constitués de protéines mais aussi de fortes proportions de peptides dont l’origine reste à déterminer (alimentaire et/ou endogène) pour proposer des solutions afin de les réduire.

Chez les mammifères, les phénomènes radicalaires sont impliqués dans la multiplication, la différenciation, la croissance et le fonctionnement des différents types de cellules. Ils jouent un rôle très important pendant la gestation. L’intensité du métabolisme utéro-placentaire et embryonnaire, favorisée par la sécrétion des oestrogènes, stimule en effet la production de radicaux libres oxygénés à différents niveaux de la cellule (notamment dans les mitochondries). Ceux-ci interviennent dans la fusion des membranes, permettant la nidation de l’oeuf fécondé et le remodelage des tissus utérins, placentaires et embryonnaires, la mise en place des vaisseaux sanguins propres à la gestation, la mise en place des cotylédons et la perméabilisation des membranes qui autorise l’afflux intense de nutriments en direction du foetus. Un déséquilibre entre la production des radicaux libres oxygénés et leur élimination (stress oxydant) peut conduire à l’altération de l’organisme de la mère et de l’embryon. Pour éviter un tel cas de figure, la femelle reproductrice puise dans ses réserves de vitamines et de minéraux. Une partie des vitamines est détruite lorsqu’elles participent à l’élimination des radicaux libres et une partie des minéraux est perdue lorsque les enzymes auxquelles ils servent de cofacteur sont inactivées par les radicaux libres. Les besoins des femelles reproductrices sont donc accrus. L’adaptation des apports alimentaires doit tenir compte, en plus de cet accroissement des besoins propre à la gestation, des augmentations occasionnées par l’exposition des animaux à de nombreux stress, notamment ceux causés par les facteurs climatiques. Des séquences climatiques défavorables exercent, en particulier, des effets négatifs sur la teneur en cobalt des fourrages, et en conséquence, diminuent la synthèse dans le rumen des deux vitamines B12 et B9 (acide folique) qui jouent un rôle critique pour le fonctionnement de l’organisme maternel, pour le développement foetal et pour le déroulement de la gestation. L’élargissement des connaissances sur ces aspects peu explorés est nécessaire à la promotion d’une agriculture durable.

Depuis des décennies, les filières agroalimentaires génèrent des coproduits de première ou de deuxième transformation qui représentent en France un gisement important (12 millions de tonnes de matière sèche), dont plus de la moitié est issue des filières de la trituration (29 %), de la sucrerie (14 %) et de l'amidonnerie-féculerie (13 %). Les trois-quarts de ces ressources sont valorisés en alimentation animale, pour 80 % environ via les aliments composés et 20 % directement en élevage. De ce fait, les coproduits, que les réglementations européenne et française distinguent clairement de la catégorie « déchets », sont des matières premières de l'alimentation animale à part entière et doivent en respecter la réglementation. La disponibilité de ces coproduits peut fortement varier dans le temps avec une saisonnalité marquée pour certaines filières, ou dans l'espace selon la répartition des usines agroalimentaires sur le territoire et la superposition avec les zones d'élevage. Les procédés technologiques générateurs de ces coproduits peuvent différer d'une filière à l'autre. La nature et la composition chimique des coproduits dépendent du procédé mis œuvre qui peut évoluer dans le temps, mais également d'une usine à l'autre au sein d'une même agro-industrie. Leur bonne valorisation en alimentation animale est largement conditionnée par une connaissance précise de la qualité des différentes fractions organiques (parois végétales et protéines, notamment) ou minérales accumulées dans les coproduits, et de l'efficacité de leur utilisation qui peut varier fortement selon l'espèce animale destinataire (ruminants ou monogastriques) et selon les types de process appliqués. Un certain nombre de recommandations alimentaires et sanitaires doivent être appliquées pour garantir une utilisation optimale des coproduits par les animaux sans pénaliser leurs performances zootechniques. Ces coproduits présentent de ce fait une réelle valeur économique qu'il est possible de déterminer, même pour les ruminants, au moyen des outils de formulation à moindre coût par programmation linéaire couramment utilisés chez les monogastriques.

Le terme fibres alimentaires regroupe l’ensemble des polysaccharides non amylacés qui résistent à l’hydrolyse par les enzymes digestives des animaux monogastriques. Elles correspondent principalement aux constituants des parois cellulaires des végétaux associés ou non à la lignine. L’introduction de fibres dans les aliments des porcs diminue leur valeur nutritive mais peut aussi avoir des conséquences non-nutritives intéressantes dans le contexte actuel de la production porcine. Ainsi, les fibres interagissent avec le bon fonctionnement du tube digestif et donc sa santé, le bien-être de l’animal en situation de restriction alimentaire. Cette revue présente les mécanismes associés, fournissant ainsi des bases de réflexion pour l’introduction de fibres dans les formules pour porcelets, truie et porc charcutier.

Le chlordécone est un pesticide organochloré, qui a été utilisé dans les Antilles françaises pour lutter contre le charançon du bananier Cosmopolites sordidus. Ce pesticide a été interdit en 1993 en raison de sa toxicité et de sa persistance dans l'environnement. Cependant des études ont montré que la population antillaise continue d'être exposée (lait maternel et sang contaminés, transfert de chlordécone mère-jeune, retard du développement cognitif, risque de cancer de la prostate) en particulier via l'alimentation. Depuis 2008, la réglementation européenne n°396/2005 est appliquée sur le territoire antillais (limite maximale fixée à 10 et 20 µg chlordécone /kg poids frais repsectivement dans le foie et l'oeuf et de 100 µg/kg de matière grasse dans le gras). Il s'avère que la contamination des denrées au chlordécone est due au fait que les sols d'anciennes bananeraies autrefois traités au chlordécone (principalement des andosols, des nitisols et des ferrisols) demeurent contaminés. L'andosol contient de l'argile allophane, structure qui confère une microporosité élevée par l'enchevêtrement de motifs particulaires répétés à plusieurs échelles. Le chlordécone de l'andosol a été potentiellement piégé par ce réseau de micropores et est supposé être fortement retenu. Au contraire, le nitisol contient de l'argile halloysite, dont la structure correspond à une superposition de couches et ménage une faible porosité. Notre hypothèse est que le chlordécone est moins retenu par le nitisol que par l'andosol. Les animaux monogastriques élevés en plein air (porcin, volaille) sont susceptibles d'ingérer du sol de manière involontaire. Chez la poule pondeuse, les niveaux d'ingestion de sol peuvent atteindre 25 % de la ration alimentaire journalière dans le cas d'une réduction du couvert végétal et/ou d'un rationnement alimentaire. L'ingestion de sol pour le porcin a été peu étudiée. Nous avons cherché à déterminer les aptitudes d'un andosol et d'un nitisol à retenir le chlordécone durant le processus digestif. Pour cela nous avons évalué la biodisponibilité relative du chlordécone d'un andosol et d'un nitisol chez l'animal monogastrique. La détermination de la biodisponibilité relative repose sur la comparaison des pentes entre la réponse (concentration de chlordécone dans les matrices animales) obtenue lors des doses croissantes de chlordécone ingérées via la matrice testée (l'andosol ou le nitisol) à la réponse obtenue lors des mêmes doses de chlordécone ingérées via une matrice de référence (huile). Les résultats obtenus chez la poule pondeuse et le porcelet ont indiqué que l'andosol et le nitisol n'affectent pas la biodisponibilité du chlordécone. Ainsi, la biodisponibilité relative du chlordécone des sols étudiés a été identique et considérée égale à 100% aussi bien chez la poule que chez le porcelet. Le chlordécone du sol a donc été extrait durant le processus digestif et absorbé par l'animal monogastrique à l'identique du chlordécone dissous dans de l'huile. Le chlordécone du sol est donc assimilable par l'animal d'élevage. Ainsi, les sols contaminés en chlordécone présentent un réel risque pour la filière animale. Les teneurs en chlordécone des produits (foie, gras, oeuf) ont dépassé les limites maximales acceptables dès lors que les animaux monogastriques ont ingéré 6,8 µg chlordécone /jour/kg de poids vif. Sachant que 10% des sols cultivables contiennent au moins 1 mg chlordécone /kg, dès lors qu'un animal monogastrique (poule pondeuse ou porcelet) ingère 17 % de sol dans sa ration alimentaire quotidienne, les teneurs en chlordécone des produits dépasseront les limites maximales et seront « impropres » à la consommation. Il convient ainsi d'identifier les pratiques d'élevage à risques pour préconiser des mesures limitant la contamination des produits animaux au chlordécone
Chlordecone (CLD) is an organochlorine pesticide used in the French West Indies against black weevil Cosmopolites sordidus. This pesticide was banned in 1993, because of the toxicity and persistence of this compound in the environment. However, several studies indicated that the population is already exposed to chlordecone (contaminated blood and maternal milk, chlordecone transfer to the mother from the child, memory delay in child and risk to the prostate cancer) particularly by food ingestion. Since 2008, European Regulation °396/2005 is applied in French West Indies (maximal limit fixed at 10 and 20 µg chlordecone/kg of fresh weight in liver and egg and at 100 µg chlordecone /kg of fat in fat). Soils of banana crops previously treated by chlordecone (mainly andosols, nitisols, ferrisols) are still contaminated and are the major source of contamination of food products. Andosol contains allophane clay structure which allows a high microporosity with the formation of particle aggregates in a pattern repeated at different scales. chlordecone would be strongly trapped by this micropores structure and supposed to be strongly retained. Nitisol contains halloysite clayed structure composed to the clay layers superposition with a low porosity. Our hypothesis is that chlordécone is less retained by nitisol than by andosol. Monogastric animals reared outside (pig, poultry) may involuntary ingest soil. It has been shown that hen can ingest soil amounts corresponding to 25 % of the daily ration in the case of vegetation reduction and of nutritional imbalance. Soil ingestion by pig was less studied. In the frame of this research work, we determined andosol and nitisol capacities to retain chlordecone during the digestive process. The relative bioavailability of soil-bound chlordecone in monogastric farm animals (laying hen and juvenile swine) was established. The relative bioavailability determination consists to the slope comparison between the response (concentrations of chlordecone in animal matrices) obtained with increasing chlordecone doses via andosol or nitisol and the response obtained with the same chlordecone ingestion doses via a reference matrix (oil). Results showed that andosol and nitisol did not reduce the chlordecone bioavailability. Thus, relative bioavailability of soil-bound chlordecone was considered to be equal to 100% in laying hen and in juvenile swine. chlordecone was extracted during the digestive process and was absorbed by the monogastric animals. Thus, soil-bound chlordecone is directly assimilated by monogastric farm animals. Concentrations of chlordecone in animal products (liver, fat, egg) exceeded maximal limits for a chlordecone ingestion at least equal to 6.8 µg chlordecone/day/kg of body weight. Since 10% of agricultural soils are contaminated with at least 1 mg/kg, the ingestion of 17% of soil in the daily food ration will result in animal products not acceptable for human consumption. Therefore, it is important to characterize the risk livestock farming practices in order to limit the contamination of food products

La qualité nutritionnelle des protéines alimentaires dépend de deux paramètres clés : la digestibilité iléale vraie et l'utilisation métabolique des acides aminés (AA) absorbés. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer l'influence de deux facteurs alimentaires (facteurs antinutritionnels et peptides) sur les flux iléaux de protéines endogènes; de valider la technique d'intubation utilisée chez l'homme pour prélever des effluents iléaux; de comparer le métabolisme postprandial d'AA alimentaires suivant leur forme d'ingestion; d'évaluer la validité du modèle porc pour prédire la digestibilité protéique chez l'homme. Les investigations se sont déroulées chez le rat, le porc et l'homme. Les effluents iléaux étaient collectés chez le rat après euthanasie, chez le porc vivant équipé d'une canule en aval de la valve iléo-caecal et chez l'homme conscient équipé d'une sonde naso-iléale. L'azote (N) et les AA endogènes iléaux étaient déterminés suite à un repas protéiprive (PP), un repas contenant de la caséine, intacte (C) ou hydrolysée (HC), marquée avec l'isotope stable 15N ou un repas à base d'AA libres (A) mimant la composition de la caséine et privé de certains AA non essentiels afin de mesurer directement leur flux endogènes. De plus, la centrifugation et ultrafiltration des effluents HC permettaient de déterminer les protéines endogènes iléales et le recyclage d'N alimentaire (15N). Les facteurs antinutritionnels issus d'un extrait brut de haricots (Phaseolus vulgaris), ingérés au niveau habituel de consommation chez l'homme, augmentaient les flux iléaux de protéines endogènes (rat, repas PP). Après adaptation au repas, le bilan azoté corporel per se n'avait pas d'influence sur les flux iléaux de protéines endogènes (rat, repas PF et A) mais les peptides alimentaires (repas HC) augmentaient les flux iléaux d'AA et N endogènes par rapport au repas PP. Les peptides alimentaires (HC), comparés aux peptides libérés naturellement dans l'intestin au cours de la digestion (C), n'augmentaient pas les flux iléaux de protéines endogènes (rat, porc, homme). Le recyclage d'N alimentaire dans les protéines endogènes était maximal chez le rat nourri en continu, plus faible chez le porc nourri en aigu et minimum chez l'homme nourri en aigu (respectivement : 65, 21 et 11%). Par ailleurs, ces recherches ont montré que l'intubation naso-iléale utilisée pour prélever des effluents iléaux chez l'homme était une méthode juste et que le porc était un modèle valide pour prédire la digestibilité iléale vraie chez l'homme. Enfin, la forme d'ingestion des AA alimentaires (HC ou C) influençaient le devenir métabolique des AA alimentaires, en particulier par rapport aux cinétiques de catabolisme des AA. Cependant, la valeur nutritionnelle était, au final, similaire pour HC et C.

Les pertes d'acides amines d'origine endogene ont ete evaluees chez des rats ,sans gros intestin, des coqs intacts ou caecectomises et des porcs a anastomose ileo-rectale, apres distribution d'un regime proteiprive ou mise a jeun

Le zinc est un élément essentiel, un métal polluant et une ressource non renouvelable. Les phytates sont identifiés comme facteur alimentaire principal qui limite la biodisponibilité du Zn chez le monogastrique. Le Zn sous forme organique (DZNO) est supposé moins interagir avec les phytates que celui de forme inorganique (DZNI). La biodisponibilité du Zn alimentaire a été étudiée en fonction des phytates chez le rat, le poulet et le porcelet pour mieux comprendre les mécanismes liés à cette interaction. Les expériences in vivo et les méta-analyses ont permis de mettre en évidence que : 1) L'absorption de DZNO est améliorée par rapport à DZNI, en présence de phytate de sodium qui suggère une protection, de DZNO contre cet antagoniste. 2) La biodisponibilité de DZNO n'est pas améliorée par rapport à DZNI chez le poulet et le porc nourri avec des aliments contenant des phytates d'origine végétale. L'antagonisme des phytates végétales agit sur le Zn natif seulement. 3) L'antagonisme des phytates végétales sur la biodisponibilité du Zn est plus prononcé chez le porc que chez le poulet. Contrairement au porc, le pH gastrique faible chez le poulet serait capable de valoriser le Zn natif, initialement lié aux phytates. 4) Pour une supplémentation optimale du Zn chez le porc, nous suggérons, en plus de la teneur en Zn native, la prise en compte d'une nouvelle variable " P phytique non hydrolysé ". Celle-ci tient compte de l'activité phytasique végétale et microbienne de l'aliment. La supplémentation en Zn peut ainsi être adaptée en fonction du potentiel antagoniste des phytates non hydrolysées. La capacité naturelle du poulet à valoriser le zinc natif limite la marge de progrès.

Des souches de bactéries lactiques ont été isolées à partir de sous-produits d'abattage de volailles, et définies par des caractéristiques phénoltypiques, physico-chimiques et génotypiques. Deux souches présentant des activités inhibitrices intéressantes vis à vis de nombreux germes pathogènes (Salmonella, Listeria, Clostridium, E. Coli) ont été étudiées. Ces souches sont capables de se développer dans des milieux standardisés (MRS) ou complexes (sous-produits d'abattage). L'ensemencement de sous-produits d'abattage par souches lactiques sélectionnées pert la stabilisation des sous-produits par fermentation lactique. Les conditions optimales de fermentation sont atteintes quand la température est maintenue à 24 - 25° C, et quand l'inoculum lactique liquide et des glucides fermentscibles sont ajourtés aux taux de 7 log10 UFC/g et 10 % respectivement. Ces conditions de fermentation ont été adaptées avec succès à l'échelle semi-industrielle, en traitant des quantités de sous-produits de volailles de 3 à 10 tonnes. Les sous-produits fermentés ont été étudiés en tant que constituant de l'aliment chez le porc et la volaille. L'addition des sous-produits fermentés conduit à une amélioration du gain de poids moyen quotidien ainsi qu'à une augmentation de la digestibilité des matières grasses. Une des souches sélectionnées appartient à l'espèce Lactobacillus plantarum. Pour détecter cette souche, nous avons mis au point une sonde nucléotidique spécifique. Deux amorces de 18 pb choisies à l'intérieur de cette sonde nucléotidique, sont utilisés au cours d'une réaction PCR pour amplifier un fragment de 253 bp spécifique de l'espèce Lactobacillus plantarum. Aucune extraction d'ADN n'est nécessaire, la réaction PCR est réalisée directement sur les colonies. Ce moyen permet de détecter et de suivre la souche sélectionnée, d'une façon rapide, spécifique et simple à mettre en oeuvre, au cours de la fermentation d'un milieu aussi complexe que celui constitué par les sous-produits d'abattage
Lactic acid bacteria were isolated from poultry by-products, and their phenotypic, physico-chemical and genotypic characteristics determined. Two strains were shown to inhibit the growth of some pathogenic bacteria (such as Salmonella, Clostridium, listeria, E. Coli) anq were further studied. These strains were able to grown in culture media such as standard medium (MRS) or complex medium (poultry by-products); Inoculation of the selected strains in the poulty by-products prevailed on their stabilisation by lactic acid fermentation. The optimun conditions were archieved when the temperature is maintained at 24-25 ° C ans when the lactic acid bacteria ans carbohydrates are added at the rate of 7 log10 CFU/g and 10 %, respectively. This fermentation condtitions were adapted successfully to a semi-industrial scale, trating batches of 3 or 10 tonnes of poultry by-products. Thefermented poultry by-products were tested in pork ans poultry nutrition. Thids led to the GMQ improvement and to an increase of the fat matter digestibility. One of the selected strains was shown to belong to the Lactobacillus plantarum species. To detect the strain, a specific nucleotidic probe was identified. Two 18 bp primers chosen within the nucleotidic probe were used in a PCR reaction sequence, to amplify a 253 bp fragment specific for Lactobacillus plantarum spécies. No DNA extractions were required since PCR was carried out on colony. This time-consuming and easy method will allow the detection of the selectd strains into the complex ecological system represented by the poultry by-products

Des souches de bactéries lactiques ont été isolées à partir de sous-produits d'abattage de volailles, et définies par des caractéristiques phénoltypiques, physico-chimiques et génotypiques. Deux souches présentant des activités inhibitrices intéressantes vis à vis de nombreux germes pathogènes (Salmonella, Listeria, Clostridium, E. Coli) ont été étudiées. Ces souches sont capables de se développer dans des milieux standardisés (MRS) ou complexes (sous-produits d'abattage). L'ensemencement de sous-produits d'abattage par souches lactiques sélectionnées pert la stabilisation des sous-produits par fermentation lactique. Les conditions optimales de fermentation sont atteintes quand la température est maintenue à 24 - 25° C, et quand l'inoculum lactique liquide et des glucides fermentscibles sont ajourtés aux taux de 7 log10 UFC/g et 10 % respectivement. Ces conditions de fermentation ont été adaptées avec succès à l'échelle semi-industrielle, en traitant des quantités de sous-produits de volailles de 3 à 10 tonnes. Les sous-produits fermentés ont été étudiés en tant que constituant de l'aliment chez le porc et la volaille. L'addition des sous-produits fermentés conduit à une amélioration du gain de poids moyen quotidien ainsi qu'à une augmentation de la digestibilité des matières grasses. Une des souches sélectionnées appartient à l'espèce Lactobacillus plantarum. Pour détecter cette souche, nous avons mis au point une sonde nucléotidique spécifique. Deux amorces de 18 pb choisies à l'intérieur de cette sonde nucléotidique, sont utilisés au cours d'une réaction PCR pour amplifier un fragment de 253 bp spécifique de l'espèce Lactobacillus plantarum. Aucune extraction d'ADN n'est nécessaire, la réaction PCR est réalisée directement sur les colonies. Ce moyen permet de détecter et de suivre la souche sélectionnée, d'une façon rapide, spécifique et simple à mettre en oeuvre, au cours de la fermentation d'un milieu aussi complexe que celui constitué par les sous-produits d'abattage
Lactic acid bacteria were isolated from poultry by-products, and their phenotypic, physico-chemical and genotypic characteristics determined. Two strains were shown to inhibit the growth of some pathogenic bacteria (such as Salmonella, Clostridium, listeria, E. Coli) anq were further studied. These strains were able to grown in culture media such as standard medium (MRS) or complex medium (poultry by-products); Inoculation of the selected strains in the poulty by-products prevailed on their stabilisation by lactic acid fermentation. The optimun conditions were archieved when the temperature is maintained at 24-25 ° C ans when the lactic acid bacteria ans carbohydrates are added at the rate of 7 log10 CFU/g and 10 %, respectively. This fermentation condtitions were adapted successfully to a semi-industrial scale, trating batches of 3 or 10 tonnes of poultry by-products. Thefermented poultry by-products were tested in pork ans poultry nutrition. Thids led to the GMQ improvement and to an increase of the fat matter digestibility. One of the selected strains was shown to belong to the Lactobacillus plantarum species. To detect the strain, a specific nucleotidic probe was identified. Two 18 bp primers chosen within the nucleotidic probe were used in a PCR reaction sequence, to amplify a 253 bp fragment specific for Lactobacillus plantarum spécies. No DNA extractions were required since PCR was carried out on colony. This time-consuming and easy method will allow the detection of the selectd strains into the complex ecological system represented by the poultry by-products

La mixité animale, c’est-à-dire l’association d’au moins deux espèces animales sur une exploitation, est annoncée comme susceptible d’améliorer sa capacité productive, tout en limitant l’utilisation d’intrants d’origine exogène. Clairement positionnés suivant les principes de l’agroécologie, ces systèmes se développent en agriculture biologique, où leurs bénéfices semblent dépendre du type de mixité (espèces associées) et des pratiques mises en œuvre. Ce travail de thèse vise à décrire et à comprendre le fonctionnement des systèmes d’élevage mixtes en agriculture biologique et de mettre en regard leur multi-performance, technique, économique, environnementale et sociale. Nous avons utilisé deux méthodes pour décrire le fonctionnement de ces systèmes : i) les réseaux écologiques qui caractérisent les interactions entre ateliers par des flux et qui ont été ici utilisés pour la première fois dans des systèmes d’élevage en zone tempérée, et ii) un jeu d’indicateurs que nous proposons pour représenter le niveau d’intégration des différentes composantes du système au travers de leurs interactions biotechniques, mais aussi de l’organisation du travail et des circuits de commercialisation. Ces deux méthodes sont mises en œuvre dans 17 exploitations associant des bovins allaitants à des ovins, des porcs ou des volailles, en Auvergne et en Occitanie. Nous mobilisons ensuite un réseau plus large de 96 exploitations mixtes d’élevage, couvrant une large gamme d’associations dans six pays européens, pour étudier l’efficience productive de ces systèmes, à trois niveaux : (i) utilisation d’intrants, (ii) utilisation d’aliments concentrés, (iii) compétition entre l’alimentation animale et l’alimentation humaine. Nous montrons que le fonctionnement et les performances d’un système d’élevage mixte sont non seulement dépendants du type d’espèces animales, mais aussi de leur proportion respective, ainsi que de l’orientation générale du système herbager ou en polyculture-élevage. L’organisation du travail et des circuits de commercialisation sont étroitement liées. L’efficience productive de ces systèmes est d’abord limitée par la consommation d’aliments concentrés mais aussi par le niveau d’interactions biotechniques entre ateliers. Le facteur humain est un autre déterminant de l’efficience au travers de la composition et de la polyvalence du collectif de travail. Sur un plan méthodologique, nous proposons d’utiliser des indicateurs d’efficience relative aux ateliers de production animale, afin de mettre en évidence des déterminants de l’efficience des systèmes mixtes qui soient liés à leur fonctionnement et non aux différences de productivité entre ateliers. Enfin, nos résultats soulignent l’antagonisme qui peut apparaître entre l’intégration culture-élevage et la compétition entre alimentation animale et humaine, dès lors que les animaux sont alimentés avec un excès de céréales produites sur l’exploitation aux dépens d’une bonne valorisation de l’herbe. Ceci questionne les stratégies d’alimentation des animaux d’élevage qui soient compatibles avec des systèmes alimentaires durables
Résumé en anglais : Mixed livestock farming systems, i.e. where two or more animal species are kept on the same farm simultaneously, could potentially enhance system productivity, while limiting the use of external inputs. In lines with the agroecological principles, these farming systems are being developed in organic farming, where benefits come from both species combination and implemented practices. This work aims at describing and understanding farm operation of multi-species livestock systems in organic farming as well as analyzing their multi-performance, i.e., technical, economic, environmental and social performance. Two methodologies have been used to describe the farm operation: i) ecological network analysis that characterize interactions between farm components through fluxes. This method has been applied here for the first time on temperate livestock farms; and (ii) a set of indicators that we proposed to represent the integration level of the different components of the system through agronomic interaction, but also through work organization and sales management. These two methods were implemented on 17 farms, each associating beef cattle with either sheep, pig or poultry in two different regions: Auvergne and Occitanie. Then we used a larger farm network of 96 mixed organic farming systems from six European countries that covered a broader diversity in term of animal combination in order to study farm productive efficiency at three different levels: (i) use of inputs, (ii) use of concentrates, (iii) animal feed vs. human food competition. Farm operation and performance of multi-species livestock system depend not only on the animal species that are being combined, but also on species ratio, as well as on the farming system i.e. grassland-based or integrated crop-livestock. Work organization and sales management were shown to be closely related. Systems productive efficiency is primarily limited by animal concentrate consumption but also by the level of interaction between agricultural productions. Systems efficiency is also related to human related factors explained by the composition and versatility of the working collective. On the methodology side, we suggest to use relative efficiency indicators linked solely to the type of animal production in order to highlight factors of efficient mixed systems resulting from their operation and not from differences in productivity between productions. Finally, results show antagonism that can arise between crop-livestock integration and competition between animal feed and human food, when animals are fed with an excess of cereal produced on-farm at the expense of a good management of pastures. This raises questions about feeding strategies for livestock that are compatible with sustainable food systems

Le technétium-99 est un radioélément à 1/2 vie longue (212 000 ans) produit principalement lors du retraitement du combustible nucléaire. L'ion pertechnétate (TCO4-), forme probable de rejet du 99Tc dans l'environnement, est très mobile dans les sols aérés et les eaux bien oxygénées, et peut être prélevé par les plantes et les animaux terrestres. L'objectif de ce travail est d'évaluer les risques de transfert du 99Tc chez des animaux, ruminants et monogastriques, lors d'une exposition chronique par voie orale et à faibles doses (5 Bq. G-1 de poids vif). Chez le ruminant, une très faible part du 99Tc apporté par l'eau de boisson est absorbée au niveau du tractus gastro-intestinal (digestibilité < 0,04). Les quantités retenues par les tissus, reins et foie) représentent moins de 2% de l'apport. Par contre, chez le monogastrique, on mesure une digestibilité maximale de 0,90. Après absorption, le 99Tc est principalement excrété par voie urinaire (>70% de l'apport) mais aussi par voie fécale (-5% de l'apport). Dans les tissus, le 99Tc prélevé se localise surtout dans les poils, mais aussi dans les reins, le foie et la thyroi͏̈de. Alors que dans les reins et le foie, on observe un seuil de rétention (à 6-9 semaines), dans les poils et la thyroi͏̈de, les teneurs en 99Tc augmentent toujours plus de 3 mois après le début des apports. L'interruption des apports induit une élimination importante du 99Tc présent dans l'organisme. Les teneurs en 99Tc deviennent négligeables après 37 jours et 44 jours dans le foie et les reins. La thyroi͏̈de (1/2 vie d'élimination de 46 jours) demeure fortement contaminée. La chute des poils durant la période de post exposition (42 jours) ne permet pas qu'une très faible diminution de l'activité mesurée. Quand le 99Tc est apporté au monogastrique, par des produits issus d'animaux contaminés (lactosérum et foie de chèvre) et végétaux cultivés sur des sols contaminés (Ray-grass), on observe une diminution plus ou moins importante de la part de 99Tc absorbée (digestibilité de 0,21 pour le lactosérum, 0,13 pour le Ray-grass, et 0,07 pour le foie). Ces variations montrent l'importance de la forme du 99Tc dans le processus de digestion chez les animaux.