Academic literature on the topic 'Molécules – Informatique'
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Journal articles on the topic "Molécules – Informatique":
Vayer, Philippe, Alban Arrault, Brigitte Lesur, Marc Bertrand, and Bernard Walther. "Apports de la chémo-informatique dans la recherche et l’optimisation des molécules d’intérêt thérapeutique." médecine/sciences 25, no. 10 (October 2009): 871–77. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/20092510871.
Bauduin, Gérard, Yves Piétrasanta, and Mohamed Belbachir. "A priori calculation of chemical shifts in 19F NMR spectroscopy. 3. Data treatment for saturated molecules Calcul a priori des déplacements chimiques en RMN du 19F. 3. Traitement informatique pour les molécules saturées." Journal of Fluorine Chemistry 63, no. 1-2 (July 1993): 31–41. http://dx.doi.org/10.1016/s0022-1139(00)80395-4.
David, Arthur, Jade Chaker, Luc Multigner, and Vincent Bessonneau. "Exposome chimique et approches « non ciblées »." médecine/sciences 37, no. 10 (October 2021): 895–901. http://dx.doi.org/10.1051/medsci/2021088.
Matondo, Aristote, Jean-Paul Ngbolua, and Pius T. Mpiana. "Evaluation in silico du profil toxicologique de quelques molécules isolées de Aloe vera et de la pastèque (Citrullus lanatus) utilisées dans la formulation des crèmes solaires." Revue Congolaise des Sciences & Technologies 3, no. 2 (June 30, 2024): 130–38. http://dx.doi.org/10.59228/rcst.024.v3.i2.76.
Sidibé, Jonathan, Xavier Domingo-Almenara, Ivanisevic Julijana, Marc Augsburger, and Aurélien Thomas. "XCMS-MRM et METLIN-MRM : outils bio-informatiques pour l’analyse ciblée de petites molécules appliqués à la toxicologie." Toxicologie Analytique et Clinique 32, no. 4 (December 2020): S42—S43. http://dx.doi.org/10.1016/j.toxac.2020.09.008.
Masengo, Colette, and Jean-Paul Ngbolua. "Evaluation in silico de l’activité anti-drépanocytaire de quelques composés de l’huile essentielle de Lippia multiflora Moldenke (Verbenaceae)." Revue Congolaise des Sciences & Technologies 2, no. 3 (February 1, 2022): 424–29. http://dx.doi.org/10.59228/rcst.023.v2.i3.47.
Garcia, Sonia Maria da Silva, Michelle Félix de Andrade, Ivo Diego de Lima Silva, Iane Bezerra Vasconcelos Alves, Ednaldo Cavalcante de Araújo, Severino Alves Júnior, Yêda Medeiros Bastos de Almeida, and Glória Maria Vinhas. "Chitosan, zinc oxide and pink pepper essential oil: potential properties and applications." Revista de Enfermagem UFPE on line 12, no. 4 (April 4, 2018): 1122. http://dx.doi.org/10.5205/1981-8963-v12i4a235949p1122-1126-2018.
Dissertations / Theses on the topic "Molécules – Informatique":
Verlan, Serghei. "Systèmes de Head et applications à la bio-informatique." Metz, 2004. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/2004/Verlan.Serghei.SMZ0404.pdf.
This work is situated in the heart of a recent domain: (bio)molecular computing, which is a domain where biology and computer science meet. This domain investigates models of computing having biological inspiration. Head splicing systems, based on the splicing operation, as well as their extensions are one of the most important models of computing in this domain. We concentrated on the study of different extensions of Head systems by showing often optimal universality results with respect to main parameters of these systems what permitted us to establish several frontiers between decidability and undecidability for these extensions. Moreover, we found several common features of these systems and we designed a generic method that permits to prove easily equivalences with classical models of computing. We also considered membrane systems that are inspired by the structure and the functioning of a living cell. We were particularly interested in the combination of these models and Head systems: splicing membrane systems and we solved a number of open problems for these systems. This work manipulates fundamental notions of the theory of computing and of the molecular computing. It gives solutions to certain important open problems of the last domain and it poses at the same time several interesting questions
Sperandio, Olivier. "Applications et développements informatiques de protocoles de drug design et criblage virtuel." Paris 5, 2007. http://www.theses.fr/2007PA05P612.
This thesis in structural bioinformatics and chemoinformatics concentrates on the optimization of the therapeutics compounds identification process. It relies on the three main components of the chemical compounds virtual screening: preparation of a computational version of the chemical library to be screened; identification of novel active compounds using chemical similarity with respect to known active molecules (LBVS); and identification of novel active compounds using the 3D structure of the target binding site (SBVS). This work implied: to develop a computer program (MED-3DMC) that generates conformation ensembles of small molecules ; then to create a LBVS program (MED-SuMoLig) that can screen thousands of chemical compounds using their pharmaco-topological profile; and finally to use a hierarchical SBVS procedure to identify novel inhibitors for protein-membrane interaction using the coagulation factor Va as a proof of concept
Qin, Zhengran. "Nanoréseaux auto-organisés de molécules électroactives : propriétés des nanodomaines moléculaires." Paris 7, 2012. http://www.theses.fr/2012PA077119.
We have developed molecular functionalized nanodomains and studied their properties which depend on their sizes and chemical environment. Two ways based on the self-assembly of monolayers SAMs have been followed to build these nanodomains: by self-exchange at grain boundaries of the alkylthiol SAM and by replication of a nanostructured inorganic template growing by self organization on Au(lll). The electroactive molecules are functionalized alkyl thiols by the "semiconductor" group tertiophene (3T) or by the electroactive juglone (Jug) function. The electronic properties of 3TCnSH domains were studied by STM. The electrochemical properties and infrared spectroscopic of the juglonethiol domain (JugS(CH₂)₄SH) were analyzed through modeling, and correlated with the size of domains. The later System nano2D showed an enhanced biodetection for ODN hybridation and could be replicated in 3D network
Fathallah, Mohamed. "Calcul et localisation de l'énergie d'une molécule : programmation informatique et applications en mécanique moléculaire, et essai de décomposition atomique en mécanique quantique." Aix-Marseille 3, 1991. http://www.theses.fr/1991AIX30025.
Gaüzère, Benoit. "Application des méthodes à noyaux sur graphes pour la prédiction des propriétés des molécules." Phd thesis, Université de Caen, 2013. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00933187.
Gaüzère, Benoît. "Application des méthodes à noyaux sur graphes pour la prédiction des propriétés des molécules." Caen, 2013. http://www.theses.fr/2013CAEN2043.
This work deals with the application of graph kernel methods to the prediction of molecular properties. In this document, we first present a state of the art of graph kernels used in chemoinformatics and particurlarly those which are based on bags of patterns. Within this framework, we introduce the treelet kernel based on a set of trees which allows to encode most of the structural information encoded in molecular graphs. We also propose a combination of this kernel with multiple kernel learning methods in order to extract a subset of relevant patterns. This kernel is then extended by including cyclic information using two molecular representations defined by the relevant cycle graph and the relevant cycle hypergraph. Relevant cycle graph allows to encode the cyclic system of a molecule
Hiblot, Nicolas. "Informatique instrumentale (logiciels et matériels) d’un spectromètre de Résonance Quadrupolaire Nucléaire : Nouvelle méthode de détection des molécules azotées." Thesis, Nancy 1, 2008. http://www.theses.fr/2008NAN10010/document.
In spite of a renewed interest in NQR (NQR), especially of nitrogen-14 (for instance, for the detection and characterization of explosives), a full NQR instrument, ready to use in the laboratory, is not commercially available. This thesis is devoted to the design of an entirely homemade spectrometer, reasonably transportable, including the transmit-receive system, frequency generation, data acquisition, probes and a specialized software for driving the instrument and for data processing. The essential contribution of this thesis is the software for managing the whole instrument and controlling various experiences. Moreover, a new method is proposed for improving NQR sensitivity. It is based on a particular processing of the NQR signal
Wieczorek, Samuel. "Une mesure d'inclusion entre objets structurés : application à la classification de molécules." Phd thesis, Grenoble 1, 2009. http://www.theses.fr/2009GRE10121.
The identification of bioactive molecules is a major problem in biology and medicinal chemistry. The discovery of such molecules is mainly based on the screening of large chemical libraries, that are small regarding the size of the chemical space. In this context, scientists need automatic tools to analyze and design rational chemical libraries. The subject of this thesis is to provide a tool that is able to compare molecules or, more generally, structured objects. We propose a generic algorithm which identifies several common substructures between two structured objects (such as graphs or logical formulae), and evaluates an inclusion index between theses objects. This inclusion index corresponds to a real value subsumption test, and should complete the theta subsumption test which is classically used in relational learning algorithms. In the field of chemistry, a molecular similarity measure, defined with two inclusion indexes, allows to classify compounds with respect to their structures. The algorithm is more efficient than the molecular similarity measures or the kernel functions it was compared to. The algorithm may be used to predict the bioactivity of chemical compounds
Wieczorek, Samuel. "Une mesure d'inclusion entre objets structurés : application à la classification de molécules." Phd thesis, Université Joseph Fourier (Grenoble), 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00406361.
L'objectif de cette thèse est de fournir un outil de comparaison des molécules et plus généralement d'objets structurés. Nous proposons dans ce travail un algorithme générique qui identifie plusieurs sous-structures communes à entre deux objets, représentés par des graphes ou des formules logiques et évalue un degré d'inclusion entre ces objets.
Ce degré d'inclusion correspond à un test de subsomption à valeur réelle entre formules logiques qui pourrait compléter le test de theta-subsomption classique dans les algorithmes d'apprentissage relationnel. Dans le domaine de la chimie, une mesure de similarité moléculaire a été définie à partir de deux degrés d'inclusion pour classer des molécules. L'algorithme se révèle être plus performant que les mesures de similarité et fonctions noyau auxquelles il a été comparé. Il pourra être envisagé de l'utiliser dans des problèmes de prédiction de bio-activité.
Douguet, Dominique. "Etude des interactions protéine-protéine et protéine-ligand par bio- et chimie-informatique structurale : Identification de petites molécules bio-actives." Habilitation à diriger des recherches, Université de Nice Sophia-Antipolis, 2007. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00320089.
La modélisation par homologie permet d'obtenir un modèle tridimensionnel d'une protéine lorsque sa structure n'a pas été déterminée expérimentalement. Ma contribution dans ce domaine fut la réalisation du serveur @TOME avec le soutien de la GENOPOLE Languedoc-Roussillon (accessible à l'adresse http://bioserver.cbs.cnrs.fr). Ce serveur était le premier de ce type à avoir été développé en France. Le serveur @TOME rassemble et traite d'une manière automatique toutes les étapes nécessaires à la construction d'un modèle 3D d'une protéine. Cela inclut la reconnaissance du repliement, la construction des modèles protéiques et leur évaluation. Les résultats du CASP5 en 2005 (session internationale d'évaluation des méthodes de prédiction de la structure des protéines ; http://predictioncenter.llnl.gov/) ont montré que notre serveur utilisé en mode automatique propose des modèles très proches de la structure expérimentale lorsque l'identité de séquence avec la structure support est supérieure à 30%. Le serveur a été classé 26ième sur 187 groupes inscrits.
Dans un second temps, mes recherches m'ont permis de réaliser une base de données de complexes protéiques co-cristallisés, base fondatrice du projet DOCKGROUND. Ce projet de grande envergure, soutenu par le NIH depuis 2005, vise à établir un système intégré et dynamique de bases de données dédié à l'étude et à la prédiction des interactions entre protéines et permettre ainsi d'améliorer nos connaissances des interactions et de développer des outils de prédiction plus fiables. Ce travail a été effectué au sein de l'équipe du Pr. Ilya Vakser à l'Université de Stony Brook, NY, USA. Dans la réalisation de cette première base de données, un ensemble de programmes collectent, classent et annotent les complexes protéiques qui ont été co-cristallisés (données sur la séquence, la fonction, le repliement 3D, les particularités telles qu'une fixation à de l'ADN, ...). Ensuite, j'ai mis en œuvre une sélection dynamique des représentants des complexes contenus dans cette base. Les représentants sont essentiels pour éviter une surreprésentation de certaines familles de protéines. Cette base de donnée est accessible par Internet et est régulièrement mise à jour (http://dockground.bioinformatics.ku.edu). Le projet DOCKGROUND va être poursuivi par la réalisation de 3 autres bases de données qui s'ancreront sur la présente appelée ‘Bound-Bound'.
L'objectif principal de mes travaux est d'identifier de nouveaux composés bio-actifs afin de comprendre le fonctionnement de leur cible dans un contexte biologique. Les méthodes que j'utilise se basent sur la chémoinformatique, le criblage virtuel et le de novo ‘drug design'. Dans le cadre de ce dernier, j'ai mis au point un programme propriétaire LEA3D (‘Ligand by Evolutionary Algorithm' 3D). Le programme génère des petites molécules à partir de la combinaison de fragments moléculaires issus de drogues et de molécules ‘bio' (substrats ou produits de réactions enzymatiques). Le criblage virtuel basé sur la structure protéique et le de novo ‘drug design' par LEA3D, ont été appliqués avec succès à la thymidine monophosphate kinase (TMPK) de Mycobacterium tuberculosis dans le cadre d'une collaboration avec une équipe de chimistes et de biologistes de l'Institut Pasteur. De nouvelles familles d'inhibiteurs ont été identifiées dont un inhibiteur synthétique trois fois plus affin que le substrat naturel. Plusieurs publications et une demande de brevet couvrent les résultats de ces recherches. Dans la continuité de ces travaux, je m'intéresse maintenant, plus particulièrement, à développer des stratégies de criblages de fragments (molécules de petit poids moléculaire). Il a été montré que de petites chimiothèques contenant des petites molécules polaires sont plus efficaces pour identifier des touches. Ce travail doit être réalisé conjointement avec des criblages structuraux expérimentaux comme la RMN ou la diffraction des rayons X. Ces derniers se posent comme une alternative aux tests in vitro avec pour avantage de donner une information détaillée, au niveau atomique, des interactions entre le ligand et sa cible. S'ensuit une étape d'optimisation/maturation des touches en ligands plus élaborés et plus affins par l'utilisation d'outils de chémoinformatique.
Books on the topic "Molécules – Informatique":
Caffery, Mary L., Paul A. Dobosh, and Diane M. Richardson. Laboratory Exercises Using Hyperchem. Hypercube Inc, 1998.
Goodman, Jonathan. Chemical Applications of Molecular Modeling (Rsc Papaperbacks). Royal Society of Chemistry, 1998.
Zhou, Ruhong. Molecular Modeling at the Atomic Scale. Taylor & Francis Group, 2020.
Zhou, Ruhong. Molecular Modeling at the Atomic Scale: Methods and Applications in Quantitative Biology. Taylor & Francis Group, 2014.
Conference papers on the topic "Molécules – Informatique":
MAGNOL, Laetitia, Magali SAGE, Karine VUILLIER, Anne DRUILHE, and Séverine NADAUD. "L’utilisation des animaux en sciences : pourquoi et comment ?" In Les journées de l'interdisciplinarité 2022. Limoges: Université de Limoges, 2022. http://dx.doi.org/10.25965/lji.213.