Dissertations / Theses on the topic 'Modèle de cultures'
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Bouhout, Sara. "Reconstruction d'un modèle vésical par génie tissulaire et caractérisation." Doctoral thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/28390.
Full textAbstract:
Le système urinaire a pour objectif l’élimination des produits du catabolisme sous forme d’urine. Cette fonction permet au sang d’être épuré en permanence et de maintenir ainsi l’équilibre de la composition sanguine (homéostasie). Plus précisément, la vessie est un réservoir extensible et étanche, responsable de l’emmagasinage de l’urine à basse pression, avant qu’elle soit évacuée hors de l’organisme. Diverses pathologies peuvent compromettre ces propriétés et endommager gravement le haut appareil urinaire. La confection d’une néovessie est alors essentielle pour assurer une collecte à basse pression de l’urine. La reconstruction vésicale par les techniques de chirurgie est associée à des complications cliniques significatives, causées principalement par l’absence de protection contre l’urine, normalement assurée par un épithélium hautement spécialisé : l’urothélium. Contrairement aux débuts de l’ingénierie tissulaire, pendant lesquels l’organisation cellulaire et moléculaire étaient relativement négligées, celles-ci sont aujourd’hui fortement prises en compte. C’est pourquoi cette technique fait appel à diverses matrices et aux cellules de l’hôte pour reproduire un substitut aussi conforme que possible au tissu natif. Toutefois, à ce jour, aucun modèle de substitution n’a été en mesure de pallier aux limites précédemment documentées. La complexité du remplacement vésical motive donc notre équipe à rechercher un substitut alternatif plus adapté cliniquement. L’objectif de ce projet de recherche était la mise au point de nouvelles méthodes pour parvenir à l’élaboration d’un substitut vésical comparable à la muqueuse d’une vessie native, puis la caractérisation de notre modèle aussi bien au plan structural que fonctionnel. Á partir de tissu porcin, plusieurs types cellulaires composant la paroi vésicale sont extraits simultanément puis caractérisés in vitro. Les cellules mésenchymateuses et urothéliales évoluent alors dans une culture tridimensionnelle pour former par génie tissulaire un tissu manipulable. La caractérisation de notre modèle vésical légitimise cette méthode qui semble très prometteuse pour répondre aux besoins dans le domaineThe purpose of the urinary tract is to ensure the evacuation of catabolic products in urine form. This function permits to preserve the equilibrium and consistency of the blood components (homeostasis). More precisely, the bladder is a watertight and compliant reservoir in charge of urine storage at low pressure, before its evacuation out of the organism. The bladder is subject to various pathologies, which could compromise its specific properties and damage the upper urinary tract. Therefore, the elaboration of a new reservoir is essential to collect the urine at low pressure. Surgical reconstruction is associated to significant complications, principally due to the lack of protection against urine, physiologically ensured by the highly specialized uro-eptithelium. Contrarily to the beginning of tissue engineering, cellular and molecular organizations are strongly considered nowadays. It is the reason why this discipline needs different matrices and host cells to reproduce a substitute conform to the original organ. But to date, no bioengineered models were able to completely overcome the limitations previously reported. The complexity of the vesical replacement remained a major challenge that led our team to research a more efficient bladder substitute. This project describes the approaches elaborated to achieve a vesical substitute comparable to the bladder mucosa. In addition, the structural and functional properties of our in vitro reconstructed models will be characterized with the use of different techniques. Based on our previous studies, several cellular types were isolated from the bladder wall, and then characterized in vitro. Using specific techniques of tissue-engineering, bladder mesenchymal and urothelial cells evolve in a three-dimensional culture to produce a tissue easy to handle. The maturation degree of our reconstructed models reached satisfactory characteristics to meet the need in the bladder regenerative field, and could led to better post-surgical results.
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Jean, Jessica. "Applications dermopharmaceutiques : développement d'un modèle de substituts cutanés psoriasiques par génie tissulaire." Doctoral thesis, Université Laval, 2010. http://hdl.handle.net/20.500.11794/22724.
Full textAbstract:
Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2010-2011La méthode d'auto-assemblage permet la production de substituts cutanés sans matériel exogène. L'objectif principal de notre travail a été de modifier cette méthode originale afin de produire un nouveau modèle de substituts cutanés pathologiques fabriqués à partir de cellules psoriasiques. Dans un premier temps, des substituts sains ont été cultivés en présence et en absence de sérum de veau foetal dans le but d'optimiser les conditions de culture. Puis, des analyses histologiques, immunohistochimiques, de perméabilité et des propriétés physico-chimiques ont été réalisées. Les résultats obtenus ont permis de conclure que le retrait du sérum à partir de la culture à l'interface air-liquide ne cause aucun problème majeur au niveau de la différenciation épidermique, de la jonction dermo-épidermique, du derme et de la perméabilité des substituts. De plus, des analyses par spectroscopic infrarouge à transformée de Fourier ont permis d'observer que le retrait du sérum améliore même l'organisation lipidique pour trois des cinq populations cellulaires testées. Parallèlement à cette étude, des substituts psoriasiques ont été produits à partir de cellules psoriasiques dans le but de vérifier si ces derniers allaient permettre la conservation de ce phénotype en culture. Des analyses histologiques et immunohistochimiques ont été effectuées et ont permis d'observer que le phénotype psoriasique (hyperprolifération et différenciation anormale des kératinocytes) est en partie conservé dans les substituts pathologiques. De plus, lors d'un traitement à l'acide rétinoïque, ceux-ci réagissent de façon similaire à ce qui est observé dans les peaux psoriasiques in vivo. Finalement, des substituts produits à partir de cellules non lésionnelles ont été reconstruits pour vérifier s'il existait une différence entre les cellules lésionnelles et non lésionnelles d'un même patient. Les résultats ont permis d'observer que les cellules non lésionnelles ne sont pas totalement «normales» et qu'elles conservent en partie les caractéristiques du psoriasis. En conclusion, ce nouveau modèle de substituts cutanés pathologiques pourrait devenir un puissant outil dermopharmaceutique permettant de tester de nouveaux traitements pour vaincre le psoriasis.
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Duque, Fernandez Alexandra. "Validation d'un modèle de substituts cutanés pathologiques pour des études dermopharmacologiques." Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25576/25576.pdf.
Full text
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Hagry, Catherine. "Approche d'un modèle expérimental d'étude pharmacologique : les cultures de cellules endothéliales humaines." Bordeaux 2, 1993. http://www.theses.fr/1993BOR2PE86.
Full text
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Khaledian, MohammedReza. "Evaluation de la technique du semis direct en culture irriguée en comparaison avec le système de culture conventionnel." Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20008.
Full text
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Chateau, Yannick. "Co-culture compartimentée de cellules épidermiques et cellules nerveuses : modèle d'étude des interactions neuro-cutanées." Brest, 2005. http://www.theses.fr/2005BRES3108.
Full textAbstract:
Le traitement de l’information sensorielle suite à un stimulus externe a comme point de départ l’activité d’une population variée de récepteurs cutanés et sous-cutanés. Les corps cellulaires de ces récepteurs se situent dans les ganglions des racines dorsales (GRD). Ils sont reliés à la moelle épinière (ME) par des neurites. Le challenge pour réaliser un modèle d’étude in vitro des interactions neuro-cutanées réside dans la reproduction de la suite physiologique (peau, neurones des GRD, neurones sensitifs de la ME) et dans la formation de connexions entre cellules épidermiques et neurites des neurones pseudo unipolaires en L. Ce modèle doit intégrer dans un même espace l’ensemble de ces constituants et permettre la mise en place de connexions entre cellules nerveuses et cellules épidermiques ce qui n’a pas encore été réalisé avec les “peaux reconstruites”. Nous avons développé un modèle, intégrant cellules nerveuses (neurones en T, cellules de la ME et cellules gliales) et cellules épidermique (kératinocytes, mélanocytes et cellules de Merkel CM). Les résultats obtenus sont une croissance spécifiquement orientée des neurites, des connexions, des terminaisons nerveuses avec les kératinocytes d’une part et les CM d’autre part. Cette co-culture permet la survie des CM et l’enregistrement d’une activité des neurones en T. L’originalité de ce modèle est donc de proposer in vitro une co-culture de cellules nerveuses et de cellules épidermiques permettant leurs connexions. Ces résultats ouvrent de larges perspectives qui proposent, pour la recherche fondamentale comme pour la recherche appliquée en dermatologie, une alternative à l’expérimentation animaleThe skin through its innervation is the support of the fifth sense : the touch. Exogenous stimuli are recognized at the nerve endings which represent avaried population of cutaneous receptors. Cellular bodies of those nerve endings are located in dorsal root ganglion (DRG) and connected at spinal cord by neurites The principal challenge to carry out a model for in vitro studies of the neuro-cutaneous interactions lies in the reproduction orme physiological continuation previously described (skin, neurons 0f the DRG, sensitive neurons of the spinal cord) and in the reconstruction of connections between epidermal cells and neurites of the pseudo-unipolar sensory neurons. This model must integrate in the same space all these components and allow the instatlation of connections between nervous cells and epidermal cells. This feature was not realised before with other “skin equivalent”. We have performed a model, integrating nervous cells (pseudo-unipolar sensory neurons, cells of the spinal cord and glial cells) and epidermal cells (keratinocytes, melanocytes and Merkel cells). We obtained a specifically directed growth of neurites, connections, synapse-like formation with both keratinocytes and Merkel cells. This co-culture allowed the survival of Merkel cells and the recording of an activity of the pseudo-unipolar sensory neurons. The originality of this model is thus to propose an in vitro co-culture of nervous oeIls md epidermal cells allowing their connections. These results open large perspectives from fundamental research to applied research in dermatology, as an alternative to the animal experimentation
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Tremblay, Marie. "Estimation des paramètres des modèles de culture : application au modèle STICS Tournesol." Toulouse 3, 2004. http://www.theses.fr/2004TOU30020.
Full text
8
Fritayre, Pascale. "Culture de cellules atriales de coquille Saint-Jacques, Pecten maximus : valeur et limites du modèle. Applications en toxicologie." Brest, 2004. http://www.theses.fr/2004BRES2015.
Full textAbstract:
Des cultures primaires de cellules atriales de coquilles St Jacques Pecten Maximus ont été établies au cours de ce travail. Ces cultures peuvent être obtenues à partir de cellules inoculées dès l'isolement ou après cryopréservation. Une monocouche cellulaire est observée après une semaine de culture. L'utilisation de facteurs matriciels d'origine marine permet de réduire ce temps en facilitant l'adhésion. Différentes méthodes analytiques appliquées aux cultures asynchrones ou à des cellules synchronisés en transition G1/S selon une méthodologie adaptée de la littérature, montrent qu'environ 15 % de cellules inoculées sont aptes à se diviser. La croissance peut être stimulée par addition de certains compléments au milieu sans toutefois permettre l'obtention d'un lignée. Parmi les cellules adhérentes, les cardiomyocytes, que nous avons caractérisés immunocytochimiquement et electrophysiologiquement (récepteurs de type B-adrénergique et cholinergiques de type muscarinique), sont spontanément contractiles in vitro dès huit jours et le restent durant un mois. Ces cellules s'avèrent intéressantes pour étudier la toxicité de xénobiotiques en utilisant en particulier le Patch-clamp comme méthode analytique. Un deuxième type de cellules adhérentes, qui présentent des analogies structurales avec les cellules des glandes péricardiques dont la littérature signale le rôle dans la détoxication, semble intervenir dans les processus de biotransformation de phase de type I et II. Une stimulation de certaines activités enzymatiques par des inducteurs de référence et par certains contaminants du milieu marin a en effet été notée. L'ensemble de ces résultats ouvre des perspectives d'utilisation du bioessai mis en place tant au plan fondamental qu'appliquéIn this study, atrial cells primary cuture of the scallop, Pecten maximus was established. A monolayer culture can already be observed one week following the initial plating of either fresh or cryopreserved cells. Cell attachment was improved and was obtained faster when the cells were plated on marine substrate. Combined analytical techniques, tested in asynchronous cells and synchronised cells in transition G1/S, showed that about 15 % of plated cells are able to proliferate. The growth can be stimulated by supplementation of the medium with various factors but no permanent cell line have been obtained. Among adherent cells, the cardiomyocytes, characterized by both immunocytochemical and electrophysiological features (beta-adrenergic and muscarinic receptors), were able to spontaneously contract in vitro by using especially patch-clamp technique. One another kind of adherent cells, having structural similitaries with pericardial gland cells described to be important in the dexintoxication function, seems to be involved in biotransformation activities of phase I and II. Indeed, we have actually been able to stimulate these enzymatic activities by reference inductors and by some marine contaminants. Taken together, our cellular model demonstrate its potential for fundamental and applied bioessay research studies
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Dubus, Isabelle. "Caractérisation d'un modèle de culture de myocytes cardiaques de rat adulte : effet trophique des catécholamines." Paris 5, 1992. http://www.theses.fr/1992PA05P061.
Full text
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Belhouchette, Hatem. "Evaluation de la durabilité de successions culturales à l'échelle d'un périmètre irrigué en Tunisie : utilisation conjointe d'un modèle de culture (CROPSYST), d'un SIG et d'un modèle bio-économique." Montpellier, ENSA, 2004. http://www.theses.fr/2004ENSA0002.
Full textAbstract:
Le périmètre de Cébalat a été aménagé dans le but de valoriser la réutilisation des eaux usées en agriculture céréalière. La méthodologie adoptée consiste à construire à l'aide de CropSyst, d'un GIS et d'un modèle bio-économique une base de données déterminant l'impact de l'irrigation et de la fertilisation azotée sur la marge brute de l'agriculteur, l'accumulation de sel dans le sol et la lixiviation de nitrate. Les résultats obtenus à l'échelle de la parcelle montrent que le modèle simule correctement l'évolution de la teneur en eau et de la salinité du sol et sont moins satisfaisants pour l'azote. A l'échelle des segments, le modèle simule correctement le rendement final des cultures, excepté celui de la luzerne. Le modèle économique l'application d'un taux d'actualisation économique idéal de 0% par rapport au taux réel de 10% a engendré des fractions de lessivage au moment de l'irrigation plus importantes et une accumulation du sel plus maîtrisée, donc un système durable à long terme sur ce critère. La comparaison des apports azotés sur blé et maïs entre modèle et agriculteurs donne une indication sur la non durabilité des pratiques actuelles des agriculteursThis thesis aims to study the sustainability of the farming systems in the Cebalat watershed. The methodology adopted in this thesis consists on building, by the use of CropSyst, a GIS, and a recursive stochastic model, a database that allows us to analyse the effects of cropping patterns on farm income, salt accumulation and nitrate lixiviation. At the field scale CropSyst seems to simulate weIl soil water content and the average salt concentration on the first meter depth. Nevertheless, simulated soil nitrate was less satisfactory. The CropSyst model simulates correctly the final yield at the sector scale for aIl crops except for alfalfa. Assuming a realistic discount rate, the bio-economic model established with two-decision period based on quantity of rainfall in each period, reproduces closely the real system and it allows predicting soil quality degradation due to long-term salinisation. This problem is related with the lack of water that should be applied with leaching purposes. The comparison of the amount of nitrogen supplied and leached for wheat and corn between model and farmers proves that the sustainability of the production system is not assured
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Sichel, François. "Galactosyltransferase et cancer de l'ovaire : analyse clinique et étude d'un modèle expérimental humain." Caen, 1992. http://www.theses.fr/1992CAEN4018.
Full text
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David, Valentin. "Effets des contraintes mécaniques dans un nouveau modèle de culture tissulaire d’os trabéculaire bovin et leur influence sur la relation ostéoblastes/adipocytes dans un modèle de culture de cellules mésenchymateuses multipotentes." Saint-Etienne, 2005. http://www.theses.fr/2005STET008T.
Full textAbstract:
L'influence des contraintes mécaniques sur l'os ainsi que sur la prolifération, la différenciation et l'activité des cellules osseuses est décrite depuis longtemps. Cependant, les recherches in vivo ou in vitro, effectuées jusqu'à présent ont d'une part peu étudié cette influence dans un environnement chimiquement et mécaniquement contrôlé, et d'autre part l'impact de la contrainte mécanique sur la différenciation ostéoblastique/adipocytaire n'a jamais été analysé. Dans ce travail nous avons réalisé la validation biologique d'un microtomographe (VivaCT20) permettant la mesure et l'analyse tridimensionnelle longitudinale in vivo, d'échantillons osseux. Par la suite nous nous sommes attachés à développer un nouveau modèle de culture tissulaire d'os trabéculaire, permettant la culture de cylindres osseux pendant 3 semaines. Ce modèle est associé à un appareillage destiné à l'application d'un régime mécanique de compression défini par le profil du signal, l'amplitude, la fréquence et nombre de cycles. Nous avons montré que l'application d'un signal mécanique mimant le "saut", à une fréquence de 1 Hz à raison de 300 cycles/jour pendant 21 jours avait des effets différents sur le tissu et les cellules en fonction de la microarchitecture osseuse. Ces effets sont dus à une augmentation de la formation osseuse et non à un changement du remodelage osseux. Nous avons également montré que la contrainte mécanique induisait une diminution de l'expression de PPARγ2 après 21 jours, cependant le temps de culture n'est pas suffisant pour pouvoir observer un effet sur le volume adipocytaire. Par ailleurs, dans un modèle d'exercice chez le rat, nous avons montré que l'activité physique induisait une diminution du volume adipocytaire médullaire au niveau du tibia proximal, après 5 semaines d'entraînement. Enfin, nous avons étudié les effets de la contrainte mécanique cyclique sur la différentiation adipocytaire et ostéoblastique en culture cellulaire. Un étirement appliqué à une amplitude de 5000-7000μdéf, à la fréquence de 1 Hz à raison de 600 cycles/jour, stimule l'ostéoblastogénèse aux dépens de l'adipogénèse des cellules mésenchymateuses pluripotentes de souris (C3H10T1/2) ou bovines (CSBS). L'inhibition de l'adipogénèse se traduit par une diminution de l'expression de PPARγ et des marqueurs de différenciation adipocytaire et par une augmentation de l'expression de Runx2. Par ailleurs, la contrainte mécanique compense partiellement l'augmentation de l'adipogénèse induite par le traitement avec un ligand synthétique de PPARγ (la rosiglitazone).
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Dumas, Estelle. "Les mini-réplicons comme modèle d'étude de la réplication du virus de l'hépatite C." Bordeaux 2, 2004. http://www.theses.fr/2004BOR21139.
Full textAbstract:
Bien que le virus de l'hépatite C ait été découvert en 1989, les mécanismes de sa réplication restent mal connus. Nous avons donc développé un modèle cellulaire pour l'étude de sa réplication. Les gènes codant pour les protéines non structurales du virus ont été intégrés dans génome de cellules HuH7. L'activité du complexe de réplication formé par ces protéines est mesurée à l'aide d'ARN rapporteur (mini-réplicons) dont l'expression est dépendante de leur réplication par ce complexe. Ces ARN possèdent le gène codant pour l'EGFP flanqué des régions 5' et 3' non traduites du virus. Lors de la mise en place de ce système, nous avons pu montrer l'existence de régions promotrices dans la séquence ADN correspondant au 5'UTR. D'autre part, nous avons pu mesurer des événements de réplication après 40 jours de culture. Ce système devrait constituer un modèle efficace pour étudier la réplication et tester de nouveaux inhibiteurs du VHCEven through the hepatitis C virus was discovered since 1989, its replication is still poorly known. Therefore, we established a cell based system to study its replication. Genes coding for HCV non structural proteins were integrated into the HuH7 cell genome in order to constitutively express the replication complex. To analyse its activity, RNA reporter (mini-replicons) were constructed. They contain at both ends HCV untranslated regions (5'UTR and 3'UTR). To quantify cells supporting RNA replication, we introduced EGFP coding genes between 5'UTR and 3'UTR. Only cells able to support mini-replicons replication will be fluorescent. During the development of this model, we demonstrated that DNA sequence corresponding to the HCV 5'UTR contains a promoter activity. Moreover, we could observe mini-replicons replication until 40 days of culture. This model will be useful to study HCV replication and effect of new drugs on HCV RNA synthesis
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Bernard, Yohann. "Stress oxydatif, inflammation vasculaire et métalloprotéinases : étude in vitro sur un modèle de coculture." Thesis, Nancy 1, 2008. http://www.theses.fr/2008NAN10067/document.
Full textAbstract:
Au cours de l’athérosclérose, l’invasion de la paroi vasculaire par les leucocytes conduit à l’inflammation de ce tissu et à l’établissement d’un stress oxydatif. Ce travail aborde les effets du stress oxydatif et les effets d’interactions potentielles entre un modèle de neutrophiles (?HL60) et des cellules endothéliales (HCAEC) ou musculaires lisses (HCSMC) de coronaires humaines sur les métalloprotéinases (MMPs) cellulaires et la mobilité des ?HL60. Au cours des passages, la lignée promyélocytaire HL60, différenciée en modèle de neutrophiles ?HL60, subit des variations d’expression et de production de MMP9 et de ses propriétés de mobilité. Les espèces réactives de l’oxygène (ERO) d’origine biochimique ou cellulaire ne modifient pas l’activité MMP2 ou MMP9 des HCAEC et HCSMC. Il n’y a pas modification des activités MMPs en coculture ?HL60/HCAEC mais stimulation de l’activité MMP9 en coculture ?HL60/HCSMC. Les HCSMC stimulent les capacités migratoires et favorisent la réponse invasive des ?HL60 au N-formyl-L-Méthionyl-L-Leucyl-L-Phénylalanine. Les enzymes antioxydantes ont peu d’effet sur la mobilité, stimulent expression et production de MMP9 des ?HL60 et semblent diminuer l’effet stimulant des HCSMC sur la production de MMP9 par ?HL60. Les HCSMC expriment et/ou sécrétent certains cytokines (IL8, IL6, IL1?, CCL2, CXCL12) impliquées dans l’athérosclérose. En conclusion, l’interaction ?HL60/HCSMC entraîne une augmentation de production de MMP9, modulée par les ERO, et une stimulation de mobilité des ?HL60. Les cytokines inflammatoires impliquées dans l’athérosclérose et exprimées par les HSCMC sont des acteurs potentiels dans la réponse sécrétoire et/ou migratoire des ?HL60During atherosclerosis leucocytes invade the vascular wall, inducing inflammation and production of oxidative stress by reactive oxygen species (ROS). We tested the effects of an oxidative stress and/or potential interactions between a neutrophil model (?HL60) and human coronary endothelial (HCAEC) or smooth muscle (HCSMC) cells, on ?HL60 mobility and production and activity of cellular metalloproteinases. Cell passaging of the promyelocytic HL60 cell line, differentiated by DMSO in a neutrophil model (?HL60), induces variations in cell mobility and production of MMP9. ROS from biochemical or cellular sources did not modify MMP2 or MMP9 activity in HCAEC or HCSMC. There is no modification of MMPs activities in ?HL60/HCAEC cocultures, but stimulation of ?HL60 MMP9 activity in ?HL60/HCSMC cocultures. Basal migration capacities and N-formyl-L-Methionyl-L-Leucyl-L-Phenylalanine -stimulated invasion abilities of ?HL60 increase in presence of HCSMC. Antioxidant enzymes barely change ?HL60 mobility, increase expression and production of ?HL60 MMP9 and seem to reduce the stimulating effect of HCSMC on ?HL60 MMP9 production. HCSMC also express and/or secrete some cytokines (IL8, IL6, IL1?, CCL2, CXCL12) implicated in atherosclerosis. In conclusion, interactions between ?HL60 and HCSMC induce an increase in MMP9 secretion, which is modulated by ROS, and a stimulation of ?HL60 mobility. Expression by HCSMC of inflammatory cytokines implicated in atherosclerosis allows to identify potential candidates responsible for the secretory and/or migratory response of ?HL60
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Tchamitchian, Marc. "Photosynthèse d'une culture de tomates sous serre : mise au point et validation d'un modèle analytique." Toulouse, INPT, 1990. http://www.theses.fr/1990INPT019A.
Full textAbstract:
Un modele probabiliste d'absorption lumineuse (sinoquet 1989) a ete modifie pour decrire la distribution de surface foliaire par rapport au rayonnement par incident. Cette distribution est utilisee par des fonctions de reponse photosynthetique foliaire, variant avec l'age des feuilles, pour donner une cartographie de l'activite des plantes, ainsi que sa photosynthese totale, calculee par integration des activites foliaires. Le module d'interception lumineuse a ete cale sur une culture de printemps de tomates de serre. Des relations statistiques entre les composantes du rayonnement, direct et diffus, dans la serre et a l'exterieur, ont ete etablies pour permettre les simulations. Sur cette meme culture, la photosynthese de plantes entieres a ete mesuree pour valider le modele de photosynthese. Mesures et simulations de la photosynthese totale sont en bon accord. La routine d'interception lumineuse et la cartographie de l'activite photosynthetique necessitent cependant une validation plus detaillee. La souplesse de ce modele permet de simuler les differents modes de conduites (densites, arrangements des rangs) existants sous serre
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Guyot, Christelle. "Caractérisation et activation des différentes cellules fibrogéniques hépatiques : utilisation du modèle "tranche de foie" en culture." Bordeaux 2, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR21344.
Full textAbstract:
La fibrose hépatique est caractérisée par l'accumulation de matrice extracellulaire synthétisée par les cellules fibrogéniques activées : les myofibroblastes. Nous avons développé un modèle de culture de tranches de foie de précision (TFP) permettant le maintien de l'architecture hépatique. Nous avons étudié l'effet d'acides biliaires sur les TFP et montré qu'ils présentent des effets individuels spécifiques sur l'activation, la survie et l'apoptose des cellules hépatiques. Nous avons étudié des tissus fibreux en culture de TFP et mis en évidence des différences dans le remodelage de ce tissu en fonction des cellules fibrogéniques impliquées : cellules étoilées du foie ou fibroblastes portaux. Nous avons montré via l'étude de l'expression de la smootheline que les cellules musculaires lisses pouvaient acquérir un phénotype myofibroblastique et particiuper à la fibrogenèse. Ces données renforcent le concept d'hétérogénéité des cellules myofibroblastiques impliquées dans la fibrogenèseHepatic fibrosis results from excessive extracellular matrix deposition by activated fibrogenic cells deriving from precursor cells, hepatic stellate cells (HSC) and portal fibroblasts (PF) which acquire a myofibroblastic phenotype. We have developed an organotypic model of precision cut liver slice (PCLS) culture in which cell-cell and cell-matrix interactions are maintained. We studied the effect of bile acids on PCLS and we shown that individual bile acids induce specific effects on activation, proliferation and apoptosis of hepatic cells. We studied fibrotic tissue remodeling in PCLS, and our data showed that fibrogenic cells behave differently in cultured PCLS depending on the fibrogenic cell type involved : HSC or PF. Finally, studying the expression of smoothelin, we showed that smooth muscle cells may also acquire a myofibroblastic phenotype and participate in fibrotic lesions. These data strengthen the concept of liver fibrogenic cell heterogeneity participating in fibrotic lesions
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Muller, Quentin. "Développement par génie tissulaire d'un modèle de peau humaine innervée, vascularisée et immunocompétente pour l'étude des réactions inflammatoires cutanées." Doctoral thesis, Université Laval, 2019. http://hdl.handle.net/20.500.11794/33983.
Full textAbstract:
"Thèse en cotutelle, Université Laval Québec, Canada Philosophiæ doctor (Ph. D.) et Université de Strasbourg Strasbourg, France"Les réactions immunitaires de la peau sont initiées par les cellules dendritiques cutanées (dendritic cells, DCs). L'effet potentiellement sensibilisateur d'un composé peut être prédit in vitro en utilisant des monocytes humains différenciés en DCs (MonoDCs). Cependant, ces modèles simplistes restent imprécis car l'activation des DCs cutanés par les sensibilisateurs peut être déclenchée ou modulée par des interactions microenvironnementales avec de multiples types de cellules non immunitaires. Notre objectif est de développer une peau immunocompétente qui combinera des MonoDCs avec tous les éléments structurels et fonctionnels de la peau, c'est-à-dire une barrière épidermique posée sur un derme contenant une pseudo-vascularisation et des neurones nociceptifs. Une matrice de collagène a été ensemencée avec des fibroblastes et des cellules endothéliales, puis avec des précurseurs de fibres nerveuses dérivées soit de l'iPSC humaine, soit de la DRG embryonnaire murins. Enfin, nous avons introduit les MonoDC et les kératinocytes. Nous avons observé que les neurones différenciés in situ innervent l'épiderme comme observé habituellement dans la peau humaine normale. De plus, les neurones dérivées d’iPSCs, expriment neuropeptides et canaux calcique spécifiques des fibres nociceptives. Enfin, les Mono-DC intégrés au modèle restent stable pendant toute la durée nécessaire à la formation de l’épiderme et peuvent être stimulé. Le modèle sera utilisé pour prédire le potentiel irritant des composés chimiques et l'impact de l’innervation nociceptive sur l'activation des DCs.
Immune reactions in the skin are initiated by the cutaneous dendritic cells (DCs). The potential sensitizing effect of a compound can be predicted in vitro using human monocytes differentiated into DCs (Mono-DCs). However, these simplistic models remain inaccurate because the activation of cutaneous DCs by sensitizers may be triggered or modulated by microenvironmental interactions with multiple types of nonimmune cells. Our goal is to develop an immunocompetent human tissue-engineered skin that will combine DCs with all structural and functional element of the skin, i.e. an epidermal barrier laid upon a dermis containing a pseudo-vascularization and nociceptive neurons. Collagen matrix was seeded with fibroblasts and endothelial cells, then with precursors of nerve fibers derived from either human iPSC or murine embryonic DRG. Finally, we introduced Mono-DCs and keratinocytes. We observed that in situ differentiated neurons grow axons towards the epidermis as usually observed in normal human skin. What's more, the neurons derive from iPSC, express neuropeptides and calcium channel as normal nociceptive fibers. Moreover, Mono-DCs settled as expected beneath the epidermis and remained sessile to stimulation for several weeks. The model will be used to predict the irritant potential of chemical compounds, and the impact of nerves on DC activation.
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Chaib, Yanis. "Mise au point par génie tissulaire d'un modèle de peau contenant des cellules immunitaires d'origine dermique : application à la cicatrisation cutanée." Master's thesis, Université Laval, 2020. http://hdl.handle.net/20.500.11794/69023.
Full textAbstract:
Les modèles de peau in vitro en trois dimensions sont des outils pour étudier des processus biologiques ou pathologiques. La majorité des modèles in vitro actuellement disponibles ne comporte pas de système immunitaire et de réseau vasculaire, tous deux présents dans la peau humaine. Nous avons développé un modèle de peau entièrement composé de cellules d'un même donneur (autologue) et contenant des cellules immunitaires et endothéliales. En nous basant sur le modèle d'auto-assemblage du LOEX, nous avons mis en culture durant quatre semaines des fibroblastes dermiques dans un milieu favorisant le dépôt de matrice extracellulaire. La résultante est un feuillet manipulable composé de cellules entourées de matrice. Un isolat dermique préalablement extrait du derme humain est ensemencé sur un premier feuillet de fibroblastes et les kératinocytes sur un second. L'isolat dermique contient l'ensemble des cellules présentes dans le derme du donneur. Les deux feuillets sont ensuite superposés et mis en culture pendant deux semaines à l'interface air-liquide pour stimuler la différenciation de l'épithélium. Une analyse histologique a mis en évidence un épithélium stratifié sur un derme composé de matrice et de cellules. Des immunomarquages ont également montré la présence de cellules immunitaires CD45+ viables et d'un réseau vasculaire CD31+ au niveau du derme. Une plaie a ensuite été créée au centre de ce modèle de peau et une analyse histologique a montré une migration des cellules épidermiques et dermiques dans la plaie. La création de ce modèle permettra d'avoir une meilleure compréhension de l'homéostasie de la peau et du phénomène de cicatrisation cutanée.In vitro three-dimensional human skin models provide a tool to investigate biological or pathological processes and to test drug effect or toxicity. In vitro models usually lack an immune system and vasculature, both characteristics of the human skin. We developed a skin model composed of cells from the same donor (autologous) and containing immune cells and endothelial cells. Based on the self-assembly method developed at the LOEX, dermal fibroblasts were first cultured during four weeks in a medium stimulating the production of an extracellular matrix. The result of this culture is a fibroblast sheet used for the development of our model. A dermal fraction enzymatically extracted from a human dermis was seeded onto a first sheet while the keratinocytes were seeded on a second one. The dermal fraction contained all the dermal cells from a donor. The two sheets were then superimposed and raised at the air-liquid interface during two weeks to stimulate epidermis differentiation. Histological studies of the 3D skin model highlighted a stratified epidermis on a dermis composed of matrix and cells. Immunofluorescence staining showed viable CD45+ immune cells and a CD31+ capillary network in the dermis. A wound was then produced at the center of the model and histological studies highlighted the migration of the epidermal and dermal cells into the wound. The creation of this first autologous 3D model containing immune cells paves the way to increase knowledge about skin homeostasis and the role of immune cells in the wound healing process.
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Gendreau, Isabelle. "Études dermopharmacologiques d'une nouvelle molécule destinée au traitement du psoriasis grâce à l'utilisation d'un modèle de substitut cutané pathologique optimisé." Master's thesis, Université Laval, 2015. http://hdl.handle.net/20.500.11794/27545.
Full textAbstract:
Le psoriasis est une maladie cutanée grave pour laquelle il n’existe encore aucun traitement curatif. Des modèles de peau psoriasique in vitro sont alors nécessaires afin de tester de nouveaux traitements. Cette étude visait, en premier lieu, à optimiser la production de substituts cutanés psoriasiques par la méthode d’auto-assemblage, pour ensuite les utiliser afin d’évaluer l’efficacité d’une nouvelle molécule potentiellement antipsoriasique, la tBEU. Dans un premier temps, des substituts sains et psoriasiques ont été produits par la méthode d’auto-assemblage partiellement modifiée en utilisant des plaques 6 puits et 12 puits. Ces expériences ont permis de démontrer que les plaques 6 puits étaient plus efficaces pour la production de substituts reproductibles et représentatifs d’une peau psoriasique in vivo. Ensuite, ces substituts ont été traités avec la tBEU, démontrant que cette molécule diminue la prolifération des kératinocytes et améliore leur différenciation. Ainsi, la tBEU pourrait éventuellement être utilisée comme un traitement efficace du psoriasis.Psoriasis is a serious cutaneous disease for which there is currently no cure. In vitro psoriatic skin models could become new tools to assess the potency of new drugs during the development of new therapies. First, this study aimed to optimize the production of psoriatic skin substitutes by the self-assembly method, and then use them to assess the effectiveness of a new potentially antipsoriatic molecule, tBEU. Initially, healthy and psoriatic substitutes have been produced by the self-assembly method partially modified, using 6-well and 12-well plates. These experiments demonstrated that the 6-well plates were more effective for the production of reproducible substitutes and representative of psoriatic skin in vivo than the 12-well plates. Then, these substitutes were treated with tBEU, showing that this molecule decreases significantly keratinocytes proliferation and improves their differentiation. Thus, tBEU may eventually be used as an effective topical treatment for psoriasis.
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Baydoun, Martha. "Développement d’un modèle de culture tridimensionnelle à partir d’explants entériques pour l’étude de la cryptosporidiose." Thesis, Lille, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL1I003.
Full textAbstract:
Plus de 20 % des cancers sont dus à une infection virale, bactérienne ou parasitaire. En effet, le parasite Cryptosporidium parvum (C. parvum) qui est capable d’induire, chez des souris immunodéprimées, le développement d'adénocarcinomes invasifs au niveau gastro-intestinal. Cependant, la compréhension de la pathogénicité de Cryptosporidium a été limitée par l'absence d'un système de culture en continu et à long terme. Il est donc indispensable d’améliorer les systèmes de culture in vitro en mimant le plus possible les conditions de l’in vivo. J’ai participé tout d’abord à la réalisation d’une étude épidémiologique sur des patients Libanais atteints ou non de néoplasies/adénocarcinomes digestifs. Le taux d’infection à Cryptosporidium était significativement plus élevé chez les patients atteints de cancers coliques comparativement aux autres groupes de patients. Offrant ainsi de nouveaux arguments en faveur d’un lien entre l’infection à Cryptosporidium et la pathologie cancéreuse chez l’homme. Ensuite, j’ai développé un modèle de culture tridimensionnelle (3D) à partir d’un côlon murin adulte. Ce système a permis le maintien de l’infection pendant 35 jours et il a mis en évidence le développement in vitro de lésions néoplasiques 27 jours post infection. Il s’agit, de la première description d'une induction de néoplasies intraépithéliales de bas grade dans un système de culture 3D, par un parasite. Afin d’automatiser ce système, j’y ai associé un dispositif de microfluidique. Ce dernier a permis le maintien de la culture pendant 8 jours. Il s’agit de la première description d'une culture tissulaire d’intestin sur un dispositif microfluidique viable pour 8 joursAlmost 20% of cancers are due to a viral, bacterial or parasitic infection. For instance, Cryptosporidium parvum (C. parvum) was found to induce the development of an invasive digestive adenocarcinomas in an experimental model of SCID mice.However, the understanding of the pathogenesis of Cryptosporidium has been limited by the lack of a long-term culture system. It is therefore essential to improve the in vitro culture systems by trying to mimic the in vivo conditions. Firstly, the association between Cryptosporidium infection and cancer development was investigated through an epidemiological study among cohorts of Lebanese patients with or without recent diagnosis of digestive cancer before any treatment. A high rate of Cryptosporidium was detected in biopsies from Lebanese patients with digestive neoplasia/adenocarcinoma. These results showed that Cryptosporidium is associated with human colon cancer being maybe a potential etiological agent of this disease. In the second part, a three dimensional (3D) Cryptosporidium culture model was developed from adult murine colon. This system allowed the reproduction of neoplasic lesions at 27 days post-infection, providing new evidence of the role of the parasite in the induction of carcinogenesis. This is the first description of a low-grade intraepithelial neoplasia induction after parasite infection in a 3D culture. Finally, in order to automatize the culture, a microfluidics device for explant culture was designed. An explant culture was maintained for almost 8 days using this microfluidic device. To our knowledge, this is the first description of a gut tissue culture on a microfluidic device that was viable for 8 days
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Bessou, Sandrine. "Épiderme reconstitué ex-vivo avec des mélanocytes : validation d'un nouveau modèle d'étude de la pigmentation." Bordeaux 2, 1997. http://www.theses.fr/1997BOR28460.
Full text
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Martine, Jean-François. "Modélisation de la production potentielle de la canne à sucre en zone tropicale, sous conditions thermiques et hydriques contrastées : applications du modèle." Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon, 2003. http://www.theses.fr/2003INAP0004.
Full text
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Martin, Jacques. "Apport de nouvelles technologies aux tests de diagnostic sérologique : de la molécule native à la molécule synthétique : validation par le modèle Chlamydia et le modèle rétroviral HIV." Tours, 1990. http://www.theses.fr/1990TOUR3805.
Full text
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Ulmann, Lauriane. "Etude des interactions fonctionnelles entre neurones sensoriels des ganglions rachidiens et kératinocytes de l'épiderme : mise au point d'un modèle de coculture." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2004. http://www.theses.fr/2004STR13213.
Full textAbstract:
Nous avons mis au point un modèle de coculture de kératinocytes et de neurones de ganglion rachidien de rat nouveau-né et entre leurs homologues de lignées cellulaires. Chaque type cellulaire cultivé seul a été caractérisé par immunocytochimie, microscopie électronique et imagerie du calcium. La coculture nécessite l'utilisation du milieu spécifique aux kératinocytes, contenant une faible concentration en calcium (MCDB 20). Dans ce milieu, les neurones cultivés seuls ne présentent pas de croissance axonale, alors qu'une poussée neuritique est observée dans ce milieu lorsque la concentration de calcium est augmentée à 2 mM. L'addition de kératinocytes (cocultures) permet une élongation axonale dans le milieu MCDB 20 et la poussée neuritique est comparable à celle observée en condition 2 mM de calcium. Cette observation suggère que les cellules cibles périphériques libèrent des molécules trophiques agissant sur la croissance axonale des neurones. Après avoir déterminé le phénotype des neurones en coculture, nous avons recherché les molécules impliquées dans l'effet trophique des kératinocytes. En présence de NGF, de BDNF, ou de DHEA, les neurones cultivés dans le milieu MCDB 20 émettent des prolongements de taille identique à celle mesurée avec les kératinocytes. La présence de récepteurs Trk et de BDNF dans les neurones, la diminution de la longueur axonale des neurones en coculture en présence soit de bloquants des récepteurs Trk ou du PBR, ou en présence d'inhibiteurs des enzymes de synthèse de DHEA, montre que les neurotrophines et la DHEA sont impliqués dans l'effet trophique des kératinocytes. Cependant, les contacts physiques observés en microscopie électronique ne présentent pas de différenciation morphologique particulière. Ce système de coculture permet d'étudier les effets des cellules cibles sur le développement neuronal, la nature des facteurs impliqués et la transmission du message sensoriel depuis la périphérieA coculture model between sensory neurons of dorsal root ganglion and keratinocytes of epidermis of newborn rats and corresponding cell lines has been developed. Each cell type has been characterized by immunocytochemistry, electron microscopy and calcium imagery. The coculture needs a specific medium for keratinocytes, with a low calcium concentration (MCDB 20). In this medium, axons of neurons cultivated without keratinocytes don't appear, but the axonal growth is observed when the calcium concentration is increased to 2 mM. The presence of keratinocytes (cocultures) allows an important neuritic extension similar to this observed in the 2 mM calcium medium. This observation suggests that the target cells release some trophic factors which induce the axonal growth. After determining the neuronal phenotype in coculture, we have looked for the molecules implied in the trophic effect. The addition of NGF, BDNF or DHEA induces an important axonal extension. The presence of Trk receptors and BDNF in neurons, the decrease of the axons gowth in coculture with the Trk or PBR blokers, or with the addition of the DHEA synthesis enzyme shows that neurotrophins and DHEA are imply in the trophic effect of keratinocytes. On the other hand, the physical contacts observed with electron microscopy don't show any specific morphological differentiation. This coculture system allows the study of the effects of target cells on the neuronal development, the nature of trophics factors and the transmission of the sensory signal since the periphery
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Bertheloot, Jessica. "Distribution de l'azote chez le blé (Triticum aesticum L. ) après la floraison : un modèle dynamique fondé sur une approche structure-fonction." Paris, AgroParisTech, 2009. http://pastel.paristech.org/5134/01/These_Jessica_Bertheloot_2009.pdf.
Full textAbstract:
L’azote est une ressource importante pour la croissance des plantes, et pour les pathogènes des cultures. L’objectif de cette thèse est de proposer une modélisation mécaniste des dynamiques d’azote dans une plante de blé en post-floraison. Pour cela, une approche structure-fonction a été mise en oeuvre. Des expérimentations ont permis de caractériser les dynamiques spatio-temporelles d’azote dans la tige feuillée. La masse d’azote surfacique des limbes et des gaines diminuait avec la distance depuis le sommet du couvert, mais elle était homogène le long d’un limbe ou d’une gaine. Les dynamiques temporelles étaient identiques pour les gaines et les limbes suggérant que ces deux entités répondent de la même manière à la lumière interceptée et à l’état azoté de la plante. De plus, les dynamiques étaient synchrones pour tous les phytomères et identiques à un facteur d’échelle près. En période d’absence d’absorption d’azote racinaire, ces dynamiques suivaient une cinétique d’ordre un. Ces résultats ont permis de développer un modèle structure-fonction des dynamiques d’azote au sein de la structure botanique d’une tige feuillée. Les principales hypothèses de ce modèle sont: (i) la teneur en azote d’un limbe est déterminée par le turnover des protéines de l’appareil photosynthétique; (ii) les différentes entités de la tige feuillée partagent un pool commun d’azote mobile. Ce modèle a été validé sur une gamme contrastée de conditions environnementales avec un jeu unique de six paramètres. Les relations azote-éclairement sont une propriété émergente des processus décrits à l’échelle locale. Ce travail ouvre des perspectives pour simuler la régulation des dynamiques d’azote dans des modèles individus-centrés de peuplements végétaux
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Denizot, Claire. "Validation de cultures de cellules endothéliales cérébrovasculaires comme modèle d'étude des conséquences oxydatives du métabolisme de xénobiotiques." Nancy 1, 1998. http://www.theses.fr/1998NAN10352.
Full text
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Cinquin, Cécile Françoise. "Développement et validation d'un nouveau modèle de fermentation colique in vitro avec cellules immobilisées." Thesis, Université Laval, 2005. http://www.theses.ulaval.ca/2005/22769/22769.pdf.
Full textAbstract:
Le microbiote intestinal est un écosystème complexe jouant un rôle très important dans la santé humaine. L’établissement du microbiote intestinal s’effectue dans la première année de vie. Afin de stimuler chez les enfants nourris avec des préparations infantiles les bifidobactéries et lactobacilles, les laits infantiles pourraient être supplémentés avec des probiotiques ou des prébiotiques. Cette supplémentation pourrait leur apporter une protection renforcée contre les troubles intestinaux, les infections et les risques allergiques. Les études in vivo chez les enfants étant difficiles à réaliser à cause de problèmes d’accessibilité et d’éthique, des outils permettant de faire des études in vitro ont été développés. Les systèmes de fermentation continu sont ceux qui se rapprochent le plus des conditions in vivo. Différents modèles ont été proposés, tous utilisent des bactéries fécales libres alors que la microflore bactérienne est présente à l’état planctonique et sessile dans le côlon. Peu de modèles in vitro ont été proposés pour simuler l’écosystème colique chez l’enfant. Le but de cette étude était donc de développer un nouveau modèle de fermentation colique avec cellules immobilisées pour simuler l’écosystème intestinal chez l’enfant. Nous avons montré qu’une microflore fécale pouvait être immobilisée et que sa diversité bactérienne était conservée au cours de la fermentation en continu. La composition et l’activité métabolique de la microflore bactérienne s’équilibraient en fonction des conditions de fermentation à des niveaux voisins de ceux observés in vivo chez l’enfant. Ensuite un modèle de fermentation en continu à trois réacteurs pour simuler le côlon proximal, distal et transverse chez l’enfant a été développé et validé. Ce nouveau modèle a ensuite permis de comparer les effets d’un prébiotique connu (fructooligosaccharide) et d’un exopolysaccharide produit par L. rhamnosus RW-9595M sur l’écosystème intestinal chez l’enfant. Le fructooligosaccharide testé influençait favorablement l’écosystème intestinal alors que l’exopolysaccharide n’était pas métabolisé par le microbiote intestinal chez les enfants. Ce nouveau modèle avec cellules immobilisées possède l’avantage d’obtenir une grande stabilité à la fois de la composition bactérienne et de l’activité métabolique de la microflore, faisant de ce nouveau modèle de fermentation colique un outil de travail pratique, fiable et facile à opérer.The intestinal microbiota is a complex ecosystem playing a key role in human health. The intestinal microbiota establishment occurred during the first year of life. To stimulate bifidobacteria and lactobacilli in formula fed infants, infant formula could be supplemented with probiotics or prebiotics, food ingredient able to improve human health. This supplementation could provide to them a better protection against gastro-intestinal disorders, infections and allergic risks. In vivo studies are difficult to carry out in infants due to accessibility and ethic problems, then in vitro studies become important. Continuous fermentation systems display the closest conditions to those encountered in vivo. Different fermentation systems have been proposed, all are using free-cell cultures whereas in vivo bacteria are present in colon at planktonic and sessile states. To our knowledge only one in vitro model has been proposed to simulate infant colonic fermentation. The aim of this study was to develop a new in vitro system with immobilized cells to simulate infant colonic ecosystem. First a feasibility study was done, we showed that a complex fecal microflora could be immobilized and the inoculum bacterial diversity was conserved in the ecosystem established in the fermentation system. The bacterial composition and metabolic activities of the microbiota reached an equilibrium specific to the fermentation conditions tested. These equilibriums were closed to those detected in vivo in infant colon. Then a three-stage chemostat using immobilized fecal bacteria was developed and validate to simulate simultaneously, proximal, transverse and distal infant colon conditions. This last in vitro colonic fermentation model was used to compared the effect of a well-known prebiotic (fructooligosaccharide) with an exopolysaccharide produced by L. rhamnosus RW-9595M on the infant colonic microbiota. The fructooligosaccharide used beneficially influenced the bacterial ecosystem whereas exopolysaccharide substrate did not seem to be metabolized by infant colonic microbiota. The main advantage of this system with immobilized cells is the great stability of the bacterial composition and metabolic activities of the microflora established in the model. For this, the in vitro colonic fermentation system with immobilized cells is a very efficient tool, easy to operate and reliable.
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Coulon, Valérie. "Mise au point d'un modèle de culture de macrophages à partir de moelle osseuse humaine : étude des propriétés fonctionnelles des cellules macrophagiques obtenues." Bordeaux 2, 1995. http://www.theses.fr/1995BOR28339.
Full text
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Thierry, Hugo. "Élaboration d'un modèle spatialisé pour favoriser le contrôle biologique de ravageurs de cultures par gestion du paysage agricole." Phd thesis, Toulouse, INPT, 2015. http://oatao.univ-toulouse.fr/14665/1/thierry.pdf.
Full textAbstract:
La gestion agroécologique durable des paysages agricoles constitue un très fort enjeu social, écologique et économique. Favoriser les différents services écosystémiques que fournissent ces systèmes complexes, caractérisés par une forte variabilité spatio-temporelle liée aux activités anthropiques, est désormais crucial. Le travail développé dans cette thèse s’est focalisé sur les services de régulation des populations de ravageurs, en développant des modèles spatialisés destinés à identifier les interactions entre paysage et populations dans l’optique d’une gestion intégrée du paysage agricole. L’approche conceptuelle utilisée s’est appuyée sur une réflexion sur les choix de niveaux d’organisation et d’échelles spatio-temporelles pertinentes qui a conduit au développement de deux modèles imbriqués : un simulateur de paysages agricoles (ATLAS) reproduisant la variabilité spatio-temporelle des habitats et un automate cellulaire décrivant les dynamiques pluriannuelles d’un puceron des céréales : Rhopalosiphum padi. Une analyse statistique des résultats a permis d’identifier l’effet des différents paramètres du paysage (composition et climat) sur les densités de pucerons à différentes échelles spatiales au cours des saisons. Ont également été évalués les effets potentiels de différents scénarios de gestion plausibles au sein du paysage agricole étudié. Parmi nos résultats, nous identifions que le remplacement du maïs par le sorgho dans le sud-ouest de la France pourrait conduire à une augmentation des densités de R.padi au sein du paysage au printemps, période particulièrement sensible aux infestations. Nous replaçons ce travail dans le cadre plus large de la favorisation des services écosystémiques et apportons des premiers éléments de réflexion pour une gestion durable du paysage agricole.
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Berg, Alexis. "Représentation des cultures tropicales dans le modèle de surface continentale ORCHIDEE : apport à l'étude des interactions climat/agriculture." Paris 6, 2011. http://www.theses.fr/2011PA066068.
Full textAbstract:
Dans cette thèse, on a introduit une représentation des zones cultivées tropicales au sein du modèle de surface de l’IPSL, ORCHIDEE, afin d’étudier les interactions climat/agriculture en région tropicale. La nouvelle version du modèle, appelée ORCHIDEE-mil, est validée à l’échelle locale et régionale sur l’Afrique de l’Ouest et l’Inde. L’analyse des rendements simulés par rapport aux données nationales montre que le modèle représente bien l’impact du climat sur la productivité agricole à grande échelle. Toutefois le modèle surestime de façon importante les rendements moyens observés, du fait de l’écart existant dans ces régions entre rendements climatiques potentiels, tels que simulés par le modèle, et rendements paysans. L’impact d’une meilleure représentation des zones cultivées tropicales sur la simulation des interactions surface/atmosphère et du climat est analysé à l’aide d’une expérience de couplage asynchrone. Cette simulation ne met en évidence qu'un impact limité de la modification des flux surface/atmosphère, induite par le changement de végétation, sur le climat simulé: les limitations en sont discutées. ORCHIDEE-mil est finalement utilisé pour projeter l’évolution de la productivité agricole potentielle d’ici la fin du siècle sur la zone Afrique/Inde dans le contexte du changement climatique, à l’aide des projections climatiques des modèles du GIEC. Il en ressort un impact en moyenne modérément négatif, entre -29 et +11% selon ces projections. Cet impact doit être mis en regard des possibilités d’adaptation des pratiques culturales et d’amélioration des rendements qui existent aujourd’hui dans ces régions
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Alexaline, Maïa. "Elaboration d’un épiderme de culture et évaluation non clinique sur un modèle de brûlure cutanée." Thesis, Paris 11, 2015. http://www.theses.fr/2015PA114816.
Full textAbstract:
Les brûlures cutanées graves dont les lésions profondes et étendues des tissus ne permettent pas d’envisager un traitement classique par autogreffes, bénéficient aujourd’hui de substituts épidermiques autologues pour leur recouvrement. En effet l’ingénierie tissulaire permet l’obtention d’épiderme de culture autologue (CEA) par l’amplification in vitro de kératinocytes à partir d’une petite biopsie de peau saine. Si ces CEAs ont permis la survie de nombreux patients depuis les années 1980, ils n’en restent pas moins largement perfectibles du point de vue de l’esthétique et de la fonctionnalité de l’épiderme et de la jonction dermo-épidermique régénérés mais aussi en termes de coûts et de prévention des zoonoses.Ainsi, ce travail de thèse s’inscrit dans le cadre d’une recherche translationnelle et porte sur l’élaboration d’un épiderme de culture par ingénierie tissulaire en vue d’une application clinique chez les grands brûlés, afin de favoriser la cicatrisation et la régénération épidermique. Ce travail porte également sur l’évaluation non clinique de notre substitut épidermique sur un modèle animal de brûlure cutanée.Après avoir développé un nouveau substitut épidermique sur fibrine de plasma humain (hPBES : human Plasma-Based Epidermal Substitute), nous avons procédé à l’évaluation détaillée de ses caractéristiques phénotypiques et fonctionnelles en comparaison au substitut épidermique de référence Epicel® (Genzyme, US). Nous avons montré des propriétés plus intéressantes en termes de clonogénicité et de caractère souche, de prévention de la différenciation, de prolifération, de potentiel de migration, et de conservation des protéines de la membrane basale avec notre produit par rapport à Epicel®.L’apport de la matrice de fibrine de plasma sur la culture des kératinocytes en comparaison à une matrice de fibrine issue de fibrinogène purifié et à une culture sans matrice a été étudié notamment sous l’angle des facteurs libérés par les matrices. Nous avons observé une amélioration des propriétés des substituts épidermiques par la fibrine : diminution de la différenciation terminale, augmentation du potentiel migratoire et sécrétion de facteurs pro-cicatrisants (GM-CSF et PDGF-BB). En outre, la fibrine de plasma améliore spécifiquement la morphogénèse épidermique, la prolifération kératinocytaire et la clonogénicité.Le procédé de culture de ce nouveau substitut a été adapté aux exigences réglementaires sans altération du potentiel régénératif: remplacement des cellules nourricières murines par des fibroblastes dermiques humains, adaptation du milieu de culture et sécurisation du plasma par traitement à l’amotosalen.Toutes les étapes d’un modèle de brûlure chez le rat nude reproduisant la technique chirurgicale employée pour la greffe de CEA ont été mises au point, mais un rejet du greffon épidermique n’a pas permis l’évaluation d’hPBES sur ce modèle. Nous avons donc évalué le substitut épidermique développé hPBES chez la souris NOD-SCID après greffe au fascia et mis en évidence une bonne prise de greffe épidermique permettant la régénération d’un épiderme humain aux caractéristiques proches d’une peau saine avec une réorganisation de la jonction dermo-épidermique des 2 semaines après greffeThe deep and large injuries caused by massive burns prevent the use of split-thickness skin autografts. Today, autologous epidermal substitutes constitute an alternative treatment for skin regeneration. In fact tissue engineering allows the production of Cultured Epithelial Autografts (CEA) by in vitro keratinocyte amplification from a small healthy skin biopsy. The clinical use of CEA since the 1980’s has allowed an increase in the survival rate of burnt patients. However, CEAs present numerous drawbacks, among them the high fragility of keratinocyte sheets, and the immaturity of the dermal-epidermal junction leading to heavy cosmetic and functional sequelae.This thesis focuses on the bioengineering of epidermal substitute for clinical burn treatment to enhance wound healing and skin regeneration, from a translational research point of view. This work also includes the development of an animal model of third degree burn for the evaluation of epidermal substitute.We first developed a new epidermal substitute cultured on a fibrin matrix from human plasma (hPBES: human Plasma-Based Epidermal Substitute). Then we characterized this new substitute with phenotypical and functional analyses, using as a reference the epidermal substitute Epicel® (Genzyme, US). We observed properties more favorable with hPBES than with Epicel® in terms of clonogenicity, stemness, differentiation level, proliferation, migration potential and basement membrane protein conservation.The influence of the plasma-based fibrin matrix on keratinocytes was studied in comparison with a culture on a fibrin from purified fibrinogen, and with a culture with no matrix. For this study we focused our analysis on the role of the released factors from fibrin matrices during epidermal substitute culture. Both fibrin matrices improved epidermal substitute properties: reduction of terminal differentiation, enhancement of migration potential, secretion of wound healing enhancing factors. Besides, plasma-based fibrin specifically promote epidermal morphogenesis, keratinocyte proliferation and clonogenicity.The culture process was adapted to European regulation requirements without diminishing its regenerative potential: substitution of murine feeder cells by human dermal fibroblasts, adaptation of culture medium and plasma viral inactivation using amotosalen treatment.A burn model including all the surgical steps used in clinics for CEA grating was developed on nude rats. However the evaluation of hPBES on this model could not be achieved due to graft rejection. Therefore we evaluated epidermal regeneration after hPBES graft on acute wounds on NOD-SCID mice. We showed a good graft rate, with the regeneration of a human epidermis close to healthy epidermis with a well-organized dermal-epidermal junction two weeks after hPBES grafting
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Flicoteaux, Muriel. "La construction des identités du Musée national de l'histoire et des cultures de l'immigration : vers un nouveau modèle muséal ?" Phd thesis, Université d'Avignon, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00743083.
Full textAbstract:
Le 10 octobre 2007, le premier musée de l'immigration en France ouvre enfin ses portes après moult années de militantisme de la part des associations et des universitaires et une prise de conscience progressive des pouvoirs publics. Cette nouvelle institution, qui bénéficie du rare statut juridique de musée national, intitulée musée national de l'histoire et des cultures de l'immigration s'insère dans le cadre d'une structure organisationnelle qui dépasse le simple cadre du musée, la Cité nationale de l'histoire de l'immigration, un établissement pluridisciplinaire sous la quadriple tutelle des ministères de la Culture, de l'Education, de la Recherche et de l'Intégration. L'objet de notre thèse consiste à déterminer comment s'opère la construction médiatique des identités du musée national de l'histoire et des cultures de l'immigration. Cette analyse commence par une interrogation sur les outils conceptuels intéressants pour ce sujet. A partir du postulat d'aborder le musée comme espace de communication symbolique (Davallon, Schiele, Lamizet, Dufrêne, Regourd), elle envisage les préalables épistémologiques des sciences humaines et sociales, l'identité comme construit (Claude Lévi-Strauss) et l'identité narrative (Paul Ricoeur), les fondements en muséologie (les modèles muséologiques) et en médiation culturelle (les notions de dispositif de médiation et d'espace public). Notre analyse se poursuit par une étude de la superposition des médiations selon les différentes temporalités du musée, celle du musée imaginé (les récits de l'utopie au travers des documents préparatoires) et celle du musée réalisée (médiation architecturale, muséographique, du site), ce qui nous amène à une interrogation sur les conflits des médiations à l'œuvre au sein du musée tant du point de vue de la forme que du fond : récit colonial et récit républicain, récits historiques, artistiques et anthropologiques, récits historiques et mémoriels, récit d'unité de la nation et récit de diversité du patrimoine des migrants. Le constat d'une polyphonie énonciative et d'une pluralité d'identités du musée national de l'histoire et des cultures de l'immigration nous conduit à sont tour à une réflexion sur le discours républicain à l'épreuve des mémoires et à l'émergence d'un nouveau modèle muséal : voit-on se dessiner un musée de l'innovation sociale à partir de la structure musée/réseau ? Dans quelle mesure la réflexion sur la diversité culturelle et l'interculturalité qui traverse l'espace public contemporain affecte t-elle le musée à l'heure de la mondialisation ? Peut-on parler de l'émergence d'un prototype muséal hybride entre musée républicain et musée de voisinage, universalisme et communautarisme ?
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Flicoteaux, Muriel. "La construction des identités du Musée national de l’histoire et des cultures de l’immigration : vers un nouveau modèle muséal ?" Thesis, Avignon, 2010. http://www.theses.fr/2010AVIG1098/document.
Full textAbstract:
Le 10 octobre 2007, le premier musée de l’immigration en France ouvre enfin ses portes après moult années de militantisme de la part des associations et des universitaires et une prise de conscience progressive des pouvoirs publics. Cette nouvelle institution, qui bénéficie du rare statut juridique de musée national, intitulée musée national de l’histoire et des cultures de l’immigration s’insère dans le cadre d’une structure organisationnelle qui dépasse le simple cadre du musée, la Cité nationale de l’histoire de l’immigration, un établissement pluridisciplinaire sous la quadriple tutelle des ministères de la Culture, de l’Education, de la Recherche et de l’Intégration. L’objet de notre thèse consiste à déterminer comment s’opère la construction médiatique des identités du musée national de l’histoire et des cultures de l’immigration. Cette analyse commence par une interrogation sur les outils conceptuels intéressants pour ce sujet. A partir du postulat d’aborder le musée comme espace de communication symbolique (Davallon, Schiele, Lamizet, Dufrêne, Regourd), elle envisage les préalables épistémologiques des sciences humaines et sociales, l’identité comme construit (Claude Lévi-Strauss) et l’identité narrative (Paul Ricoeur), les fondements en muséologie (les modèles muséologiques) et en médiation culturelle (les notions de dispositif de médiation et d’espace public). Notre analyse se poursuit par une étude de la superposition des médiations selon les différentes temporalités du musée, celle du musée imaginé (les récits de l’utopie au travers des documents préparatoires) et celle du musée réalisée (médiation architecturale, muséographique, du site), ce qui nous amène à une interrogation sur les conflits des médiations à l’œuvre au sein du musée tant du point de vue de la forme que du fond : récit colonial et récit républicain, récits historiques, artistiques et anthropologiques, récits historiques et mémoriels, récit d’unité de la nation et récit de diversité du patrimoine des migrants. Le constat d’une polyphonie énonciative et d’une pluralité d’identités du musée national de l’histoire et des cultures de l’immigration nous conduit à sont tour à une réflexion sur le discours républicain à l’épreuve des mémoires et à l’émergence d’un nouveau modèle muséal : voit-on se dessiner un musée de l’innovation sociale à partir de la structure musée/réseau ? Dans quelle mesure la réflexion sur la diversité culturelle et l’interculturalité qui traverse l’espace public contemporain affecte t-elle le musée à l’heure de la mondialisation ? Peut-on parler de l’émergence d’un prototype muséal hybride entre musée républicain et musée de voisinage, universalisme et communautarisme ?On 10th October 2007, France's first museum of immigration finally opens its doors after many years of lobbying by various organisations and academics and the rising awareness of public authorities. The new institution named Musée national de l’histoire et des cultures de l’immigration enjoys the legal status of national museum. It fits into an organizational structure which transcends the usual concept of a museum, the Cité nationale de l’histoire de l’immigration, a multidisciplinary quango in the quadriple guardianship of the ministries of Culture, Education, research and Integration.The purpose of our thesis is to determine the media construction of identities of the National Museum of History and Cultures of Immigration. Based on the approach that considers the museum as a space of symbolic communication (Davallon, Schiele, Lamizet, Dufrene, Regourd), it exposes as epistemological prerequisites two concepts of humanities, the social identity as constructed (Claude Levi-Strauss) and the narrative identity (Ricoeur). Then, it also refers to museology (museum models) and cultural mediation (mediation devices and public space) as main concepts.Our analysis continues with a study of the superposition of mediations according to the different temporalities of the museum, the imagined museum (stories of utopia through the preparatory documents), the completed museum (architectural mediation, museography and website). This brings us to the query of conflicting mediations inside the museum between colonial and republican narratives, historical, artistic and anthropological narratives, historical and memorial stories, narrative of unity of the nation and account of diversity of the heritage of migrants.The finding of an enunciative polyphony and the a plurality of identities of the National Museum of History and Cultures of Immigration leads us in turn to consider how the republican discourse deals with memories and how a new museum model emerges. Do we see the beginnings of a museum of social innovation from the museum structure/network? How far does the reflection on cultural diversity and multiculturalism that crosses the contemporary public space, affects the museum in the age of globalization? Can we speak of the emergence of a hybrid museum prototype between republican museum and neighbourhood museum, universalism and communitarianism?
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Doctobre, Jacky. "Dynamique des cultures professionnelles des sapeurs-pompiers français : sociogenèse du modèle mythifié du sapeur-pompier "Héros sportif", 1818-1966." Thesis, Lille 1, 2017. http://www.theses.fr/2017LIL12006/document.
Full textAbstract:
Cette recherche sociohistorique éclaire la constitution des groupes de sapeurs-pompiers français et de leur culture de métier depuis le début du 19e siècle. Il s’agit de comprendre comment s’est structuré ce groupe, comment se sont instituées des rites de consécration et s’est construite la représentation sociale de ce corps spécialisé, aujourd’hui perçu comme ayant des qualités athlétiques (sportives) et héroïques. À partir d’un travail préalable de rupture avec cette image sociale, l’analyse s’ancre sur la constitution et la formation d’usages corporels, de rites de consécration et de dispositifs d’entraînement, élaborés par cette corporation, au cours de la période 1818-1966. L’hypothèse centrale est que l’enjeu majeur pour chaque groupe est d’imposer ou de préserver sa conception légitime du « bon » pompier ainsi que son modèle d’organisation. L’univers professionnel est ainsi configuré (et reconfiguré au cours du temps) par des luttes symboliques internes mais aussi par des coopérations mettant en jeu des capitaux variés. Un de ces capitaux - particulièrement convoité et distinctif - est le capital corporel sportif. Il est l’enjeu des cultures professionnelles produites et diffusées au sein d’institutions de socialisation. Tout en traitant de plusieurs aspects de la culture et de l’organisation des sapeurs-pompiers, l’étude privilégie les moyens gymnastico-sportifs de formation, de hiérarchisation et de sélection des hommes, répartis dans des corps fortement différenciés. Les analyses intègrent les évolutions techniques et suivent les réagencement de l’organisation, sa complexification, les clivages, les conflits qui l’animent et la font évoluerThis social historical research brings a better view of the constitution of French firemen and their knowledge of the job since the beginning of the 19th century. The concept of understanding how this group is structured, how they were considered the rites of consecration and was built the social representation of this specialised body, today it is seen as having athletic qualities (on the sport field) and heroic. From a prior work of a social image rupture, the analysis anchors on the constitution and the training of personal care, consecration rites and devices for the practice, elaborated by this corporation during the 1818-1966 period. The main hypothesis is that the main challenge for each group have to impose or to preserve the legitimate concept of a good fireman and also his perfect way to organize himself. The professional world is then configured (and reconfigure through time) from symbolic internal conflicts but also with cooperations bringing diversed capitals. One of these capitals especially asked and different from the others-is the sport corporal capital. It is the main challenge for professional culture which is made and then later shown amongst the institutions of socialisation. By treating many cultural aspects and the organisation of the firemen, the study emphasizes the needs for the training of sports programmes, ranking and the men selection, categorise through strongly diversified bodies. The analysis has proved the technical evolutions and has followed the reorganization, its complexity, cleavages, the conflicts which animate and bring evolutions
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De, Martino Sylvie. "Etude in vitro et sur modèle murin de souches humaines du complexe Borrelia burgdorferi." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2007. http://www.theses.fr/2007STR13110.
Full textAbstract:
Cette étude, in vitro et sur modèle murin, de souches cliniques de Borrelia burgdorferi sensu lato (Bb sl) comporte une étape de mise au point d’un milieu de culture BSK solide permettant le clonage sur boîte de 29 souches de Bb sl, pré-requis pour l’étude de la pathogénicité bactérienne ; une étape de mise au point d’une technique d’identification moléculaire pour 11 espèces de Bb sl ; une étape d’étude sur modèle murin de 20 souches natives de Bb sl en fonction de leur espèce et de leur pathotype humain. Cette étude a révélé que le tropisme tissulaire et l’arthritogénicité murins ne sont pas liés à l’espèce de Bb sl infectante mais plutôt au pathotype humain initial de ces souches. L’étude des clones de 14 de ces souches a permis de réaliser une collection de clones dont le profil infectieux expérimental est variable par rapport à celui de la souche native homologue, base précieuse pour l’étude des facteurs de virulence de Bb slThis study of clinical strains of Borrelia burgdorferi sensu lato (Bb sl) have been performed in vitro and in mouse model. A solid BSK culture medium have been set to clone 29 Bb sl strains, prerequisite for bacterial virulence factors study. A molecular typing technique was performed to identify 11 species of Bb sl. An experimental study of 20 Bb sl clinical strains revealed that mouse organotropism and mouse arthritis was not linked to the species of Bb sl infecting strains, but to their human pathotype. Based on the study of clones from 14 of these strains in mouse model, a valuable clonal strains collection have been set, suitable for Bb sl virulence factors studies
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Coulomb, Bernard. "Reconstruction in vitro d'une peau humaine vivante : modèle d'étude de la physiologie, de la physiopathologie et de la pharmacologie cutanée : applications thérapeutiques." Paris 11, 1988. http://www.theses.fr/1988PA112022.
Full textAbstract:
Le développement d'une peau humaine vivante in vitro aboutit à un modèle d'étude original de la biologie cellulaire au niveau d'un tissu ou d'un organe dont les associations cellules-cellules, ou cellules-matrice sont définies. De plus, la reconstruction d'une peau humaine est d'un intérêt primordial pour la couverture des grands brûlés. La peau équivalente, réalisée avec des cellules humaines normales ou pathologiques, est reconstruite en deux temps: le premier conduit à un derme équivalent, le second consiste à recouvrir ce derme équivalent par un épiderme. Cette peau permet non seulement l'étude de chacun de ces deux tissus, mais aussi l'étude des interactions dermo-épidermiques. Le derme équivalent est déjà par lui-même un modèle d'étude original. En effet, les fibroblastes cultivés en trois dimensions dans une matrice de collagène ont une différenciation proche de celle qu'ils ont in vivo. De plus, il est possible d'évaluer quantitativement des fonctions cellulaires qui ne peuvent pas être abordées dans d'autres systèmes de culture (telle que la contraction des fibroblastes), et de moduler ces fonctions par des agents pharmacologiques. L'utilisation de petites biopsies cutanées comme source d'épidermisation des dermes équivalents permet d'obtenir un épiderme proche de celui existant in vivo, et d'évaluer quantitativement la croissance et la différenciation épidermique. Mais l'intérêt majeur de cette peau vivante reconstruite est d'être modulable, tant au niveau des constituants du derme et de l'épiderme, qu'au niveau des associations dermo-épidermiques qu'elle autorise. Ainsi nous avons pu identifier différentes fonctions des fibroblastes normaux qui conduisent à favoriser l'épidermisation, et démontrer que des fibroblastes psoriasiques sont capables de stimuler de façon excessive la croissance de kératinocytes normaux. Ce modèle permettant l'étude des interactions dermo-épidermiques est un outil important pour la pharmacologie, car il permet d'identifier l'influence d'un agent pharmacologique sur chacun des deux tissus. Cette peau équivalente vivante est greffable chez l'homme. Son principal avantage est d'apporter, en même temps qu'une couverture épidermique, un tissu conjonctif dont la présence semble indispensable pour les qualités de la greffe à long terme.
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Morille, Benjamin. "Elaboration d’un modèle du climat distribué à l’échelle de l’abri et de la plante en cultures ornementales sous serres : analyse des transferts de masse et de chaleur, bilans énergétiques." Rennes, Agrocampus Ouest, 2012. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00958617.
Full textAbstract:
L’objectif de cette thèse est de développer un modèle numérique instationnaire permettant de simuler l’évolution du climat distribué sous serre pour des conditions de nuit en présence de chauffage et pour des conditions diurnes où l’influence du rayonnement solaire est prépondérante. La thèse s’appuie sur des approches expérimentales et numériques qui ont pour ambition d’être appliquées à deux situations, hivernales et pré-estivales correspondant aux problématiques auxquelles les producteurs doivent faire face : gestion de la température et de l'humidité avec une préoccupation de réduction des consommations énergétiques. Des campagnes de mesures ont été menées au printemps 2010 et à l’hiver 2011 pour, d'une part, améliorer la compréhension des interactions entre les paramètres climatiques, et d'autre part, fournir des données d’entrée et de validation aux modèles numériques. Les campagnes de mesures de nuit (hiver 2011) en présence de chauffage ont mis en évidence les besoins plus importants en chauffage et les températures de toiture plus basses lors des nuits claires. Les campagnes de mesure menées au printemps 2010 ont permis mettre en évidence l’influence prépondérante du rayonnement solaire sur la température et la transpiration du végétal ainsi que le phénomène de stockage-restitution de chaleur dans le sol. Enfin, la forte sensibilité du taux d’humidité ainsi que la moindre dépendance de la température vis-à-vis de la « qualité » de la ventilation a été démontrée. Les données expérimentales sont exploitées afin de mettre en oeuvre les modèles de transpiration adaptés aux conditions de culture sous serre. Les bilans hydriques réalisés sur le végétal divisé en deux couches fournissent des informations précieuses sur la distribution de la transpiration et des contributions de chaque couche. Les simulations numériques sont réalisées en 2D instationnaire, en application sur une situation nocturne (nuit claire et nuit nuageuse) et une situation diurne (journée parfaitement ensoleillée). Elles intègrent deux éléments novateurs : la résolution de l'ETR dans le couvert végétal et l'utilisation d'une routine permettant de simuler la condensation. L'évolution des paramètres climatiques simulés est validée sur la base des données expérimentales. Il apparait cependant que les écarts de température et d'humidité entre l'air dans et au dessus du végétal sont sous estimés. Enfin, les modèles numériques sont exploités pour réaliser des bilans hydriques et énergétiquesThe objectives of this thesis are to develop a numerical tool which would be able to provide exhaustive information on the evolution of the distributed climate in a greenhouse. The thesis is based on experimental and numerical approaches and aims for giving information on the main concerns of the growers: the temperature and the humidity management with a special attention giving to the reduction of the energy consumptions. This is the reason why the study considers two situations in which these main concerns are the most pronounced. Experimental investigations on the climatic parameters have been led at the end of spring 2010 and at winter 2011 in order to increase the comprehension of the interaction between the physical mechanisms governing the climate and to provide data carry on the numerical part of this study. The higher heating needs and lower roof wall temperature during clear nights were evidence as well as most important role played by the solar radiation during days especially on temperature, the crop transpiration and the phenomenon of storage and restitution of heat in the ground. Then, the sensible ventilation efficiency impact on humidity and the lower on temperature are evidenced. Last, experimental data were also exploited through the application of transpiration models adapted to greenhouse conditions. Water balance on a crop divided into two layers provides supply information on the transpiration distribution. The unsteady 2D simulations consider night (clear, cloudy) and daytime (under clear sky conditions) situations. Innovative improvements are implemented into existing models : the RTE is solved in the canopy volume and provide the exact absorbed radiation in each crop layer all along the day and a condensation sub-routine is activated to simulate humidity rate evolution during the night. Models are validated against a large number of experimental climatic parameters. Simulations show good agreements with experimental data even if slight underestimations of humidity and temperature differences between above and inside crop air evidence the need of improvements on this point. Last, water and energy balances are obtained thanks to these models
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Perrin, Jeanne. "La méïose spermatocytaire : anomalies méiotiques chez les hommes infertiles et évaluation d'un modèle d'étude in vitro." Aix-Marseille 2, 2008. http://www.theses.fr/2008AIX20661.
Full textAbstract:
L’analyse cytogénétique des chromosomes méiotiques révèle chez les Hommes infertiles des anomalies de ségrégation chromosomique, corrélées à la sévérité de l’altération de la spermatogenèse. Notre travail évalue le taux d’asynapsis dans les spermatocytes au stade pachytène de la méiose, chez des patients présentant une infertilité d’origine obstructive (O) ou non obstructive (NO) et chez un patient porteur d’une microdélétion AZFb du chromosome Y. 41 patients et 13 témoins sont étudiés : au total, 2931 noyaux pachytène sont analysés (coloration au Giemsa, immunofluorescence). Le taux moyen de noyaux avec asynapsis dans le groupe NO (25. 4%) est significativement supérieur à celui du groupe O (9. 8%) et des témoins (10. 6%). La prédominance de sous stades précoces du pachytène chez tous les patients étudiés suggère la localisation du point de contrôle du pachytène au milieu de ce stade chez l’Homme. Certains niveaux élevés d’asynapsis étendus pourraient être liés à une anomalie primaire de la méiose. Ces anomalies pourraient aussi être liées à des facteurs environnementaux. Nous réalisons une co-culture in vitro de cellules de Sertoli et de cellules germinales de rat couplée au test des comètes sur les cellules germinales en différenciation, et comparons des spermatocytes irradiés (I) et non irradiés (NI). Dans les spermatocytes NI, le test des comètes montre des cassures de brins de l’ADN, suggérant la réparation des cassures liées aux phénomènes de recombinaison méiotique. Dans les spermatocytes I, l’évolution des cassures de brins est fortement modifiée. Nous proposons ce modèle comme outil pour l’étude in vitro de l’impact des génotoxiques sur les spermatocytesIn infertile men, cytogenetic analysis of meiotic chromosomes reveals abnormal chromosome behaviour, which is correlated to the severity of spermatogenic impairment. This study evaluated the rate of pairing failure in pachytene spermatocytes of patients presenting either an obstructive (O) or a non-obstructive (NO) infertility, and in a patient bearing AZFb microdeletion of the Y chromosome (AZFb-). 41 patients and 13 controls underwent testicular biopsy. In all, 2931 pachytene nuclei were analysed by Giemsa staining and immunochemistry. The mean rate of asynapsed nuclei from the NO group (25. 4%) was significantly higher than in the O group (9. 8%). There was no significant difference between the O group and the controls (10. 6%). High levels of extended asynapsis could arise from a primary meiotic defect, which may be responsible for 9% of the NO male infertilities at our centre. The prevalence of early pachytene substages in all patients and in the AZFb- patient suggests that the pachytene checkpoint is localized at the mid-pachytene stage in humans. Meiotic abnormalities could also be linked to environmental factors. We report the usefulness of in vitro cultures of rat spermatocytes and Sertoli cells, in conjunction with the Comet Assay to determine DNA damage in germ cells. We compared cultures of normal and irradiated germ cells. In normal spermatocytes, the Comet Assay revealed the presence of DNA strand-breaks, suggesting the involvement of DNA repair mechanisms related to the meiotic recombination. In irradiated cells, the evolution of DNA strand-breaks was strongly modified. We propose this model as an in vitro tool for the study of genotoxic injuries on spermatocytes
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Voisin, Pierre-Jean. "Les cultures de cellules cérébelleuses comme modèle d'étude cellulaire de la modulation de l'expression d'un récepteur : le récepteur béta-adrénergique." Bordeaux 2, 1987. http://www.theses.fr/1987BOR22018.
Full textAbstract:
Des etudes moleculaires de processus de regulation "in vitro" ont ete realisees sur des populations cellulaires (astrocytes ou neurones) a partir de cervelet. Les recepteurs beta adrenergiques du cervelet sont essentiellement portes par les astrocytes. L'expression des recepteurs a ete analysee a la fois sur des cellules intactes avec un antagoniste hydrophile et sur des preparations membranaires. Les variabilites d'accumulation amp cyclique et de l'activite adenylate cyclase apres stimulation des recepteurs suggerent une grande sensibilite de la reponse transduite a l'etat metabolique de la cellule. Le modele simplifie du systeme nerveux central a adapte l'etude de la regulation d'une reponse cellulaire a la stimulation de ce type de recepteur, a permis la caracterisation d'antigenes communs a des trypanosomes et a des cellules du systeme nerveux central
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Amsellem, Marie-Agnès. "Mise au point et applications d'un modèle de modifications oxydatives des lipoprotéines de basse densité (LDL) par les cellules endothéliales ombilicales en culture." Paris 11, 1993. http://www.theses.fr/1993PA114835.
Full text
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Diebolt, Myriam. "Effets pharmacologiques des polyphénols végétaux sur la vasomotricité et études des mécanismes dans un modèle de vaisseaux humains reconstitués par ingénierie tissulaire." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2003. http://www.theses.fr/2003STR13092.
Full textAbstract:
Les pathologies cardio-vasculaires restent a ce jour la premiere cause de mortalite dans les pays industrialises. De nombreuses etudes epidemiologiques ont decrit une correlation inverse entre la consommation de polyphenols vegetaux et l'incidence des maladies cardio-vasculaires. L'objectif de cette these etait de determiner les effets d'un traitement par des extraits polyphenoliques du vin chez le rat, sur les parametres hemodynamiques et la reactivite vasculaire, et de determiner les effets des polyphenols sur un equivalent vasculaire humain obtenu par ingenierie tissulaire. Le traitement par les polyphenols chez le rat provoque une baisse de la pression arterielle, associee a une amelioration de la fonction endotheliale, par un mecanisme dependant du monoxyde d'azote (no). Le traitement par les polyphenols ne modifie pas la reponse contractile de l'aorte de rat intacte. Cependant, il a ete observe un mecanisme de compensation entre la production d'un facteur contracturant endothelial et la production de no extra-endothelial, associe a une augmentation de l'expression de la cyclo-oxygenase 2 et de la no-synthase inductible dans la paroi vasculaire. Nous avons pu reconstruire une media humaine (mr), de forme tubulaire, qui presente les memes caracteristiques qu'un tissu d'origine. Le traitement par les polyphenols de mr veineuse entraine une potentialisation de la reponse contractile, par un mecanisme faisant intervenir la voie de la rho-kinase, et une augmentation de l'activite de la mlck. En revanche, sur les mr arterielles, les polyphenols diminuent la contraction induite par l'histamine, par un mecanisme sensible a la production d'anions superoxydes, associe a une inhibition de la voie rho-kinase, et a une diminution de l'expression de la mlck et de l'actine. Ces informations presentent un caractere indispensable dans le developpement de nouvelles therapeutiques dans le cadre de la prevention et le traitement des affections vasculairesCardiovascular diseases are the most important cause of mortality in industrial country. Several epidemiological studies have shown a relation between dietary polyphenols consumption and decrease in cardiovascular disease. The aim of this thesis was to study the effect of wine polyphenolics extracts treatment in rats on vasomotricity, and to determine vascular polyphenols effects in human tissue-engineered blood vessel. Polyphenols-treatment in rats decreases blood pressure and improves endothelium function, by a nitric oxide (no)-dependent mechanism. By contrast, polyphenols treatment does not alter contractility of intact rat aorta. However, it has been observed an increase in expression of cyclo-oxygenase 2 with subsequent increase release of endothelial thromboxane a2 which oppose the no-induced hyporeactivity of the aorta to norepinephrine, which is consequent to increased inos expression. We have produced a human tissue-engineered vascular media (tevm) from vein and artery smooth muscle cells, with the same characteristics than a native tissue. Venous tevm treatment by polyphenols induces a potentiation of contraction by a rho-kinase dependent mechanism and an increase in mlck activity. By contrast, polyphenols treatment in arterial tevm decreases histamine-induced contraction by a superoxydes anions sensitive mechanism and an inhibition of rho-kinase pathway. This effect was associated with a decrease in mlck and actin expression. These cardiovascular effects of polyphenols may contribute to develop new therapeutic in prevention and treatment of vascular disease
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Smith, Pascalle. "Modélisation des cultures européennes au sein de la biosphère : phénologie, productivité et flux de CO2." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066250.
Full textAbstract:
L'extension des surfaces cultivées et l'intensification de leur gestion, en réponse à la demande croissante en produits agricoles, transforment les propriétés des continents depuis plusieurs centaines d'années. Or les surfaces continentales sont un maillon des grands cycles hydrologique, énergétique et de carbone de la planète. Les cultures occupent actuellement 35% de la superficie de l'Europe de l'Ouest. Leur fonctionnement spécifique (sélection génétique, semis, irrigation, fertilisation, récolte. . . ) n'était jusqu'à récemment pas pris en compte dans les modèles de biosphère, mais leur effet sur ces cycles est important et incertain. Cette thèse vise à quantifier la contribution des cultures au bilan de carbone européen. On poursuit et évalue l'amélioration, à l’échelle de l’Europe, de la représentation des surfaces cultivées dans le modèle de biosphère ORCHIDEE associé au modèle de cultures STICS. La comparaison des simulations d’ORCHIDEE-STICS aux indices de végétation satellitaires montre que le cycle saisonnier des cultures est mieux simulé. Par conséquent on simule plus réalistement la productivité annuelle moyenne des cultures et sa variabilité inter-annuelle et spatiale observées dans les statistiques agricoles. La chute de productivité comme lors de l'été caniculaire de 2003 est à l'origine d'une source de carbone pour l'atmosphère qui a annulé une partie des bénéfices du puits biosphérique européen. La source estimée avec ORCHIDEE-STICS est en bon accord avec les estimations atmosphériques inverses et contribue à augmenter d'un quart les émissions de CO2 par les activités humaines en Europe. Ce travail montre l'importance et quantifie l'effet de mieux prendre en compte les cultures dans un modèle de biosphère sur les composantes du bilan carbone de la végétation, à l'échelle européenne. Il ouvre la voie à de nombreuses études de l'effet non seulement biogéochimique mais aussi biophysique des surfaces cultivées sur le système climatique.
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Bocqueho, Géraldine. "Risque, temps et adoption des cultures pérennes énergétiques : exemple du cas français." Phd thesis, AgroParisTech, 2012. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00966877.
Full textAbstract:
L'objectif de cette thèse est d'identifier les déterminants de l'adoption des cultures pérennes énergétiques par les agriculteurs en se concentrant sur les questions de risque et de temps. L'analyse s'appuie sur le cas du miscanthus (Miscanthus giganteus) et du panic érigé (Panicum virgatum) en France, mais est potentiellement généralisable à d'autres cultures pérennes. Lesdécisions publiques et privées pertinentes pour encourager le développement de ces cultures sontdiscutées. Dans le premier article, nous évaluons l'impact du risque et du temps sur la surface optimale de miscanthus et de panic érigé dans une exploitation de grandes cultures de la région Centre. Nous dépassons le calcul usuel de la valeur actuelle nette en tenant compte explicitement de l'aversion au risque et aux fluctuations intertemporelles à travers les cadres de l'utilité espérée et de l'utilité actualisée. Nos résultats montrent que les deux plantes pérennes sont en moyenne moins rentables que la rotation traditionnelle colza/blé/orge. Cependant, elles peuvent être très compétitives comme cultures de diversification lorsque des contrats de production adaptés sont proposés aux agriculteurs. Les deuxième, troisième et quatrième articles exploitent les données d'une enquête et d'une expérience réalisées auprès de 111 agriculteurs de Bourgogne ayant fait face au choix de cultiver ou non du miscanthus. Le deuxième article décrit la production de miscanthus en Bourgogne. Nous montrons d'une part que le miscanthus est implanté majoritairement sur des parcelles marginales peu rentables pour des usages traditionnels. Nous montrons d'autre part que, même en présence de contrats à long terme, les agriculteurs perçoivent le miscanthus comme globalement moins risqué que le blé, mais restent préoccupés par des risques spécifiques à issues peu probables mais extrêmement défavorables. Dans le troisième article, nous estimons les préférences des agriculteurs par rapport au risque à partir des données expérimentales. Nous appliquons une méthode d'estimation structurelle à un modèle de décision conforme à la théorie des perspectives. Nous passons ensuite en revue un certain nombre d'implications de ce cadre théorique pour les économistes agricoles. Nos estimations indiquent que la théorie des perspectives explique mieux nos données que la théorie standard de l'utilité espérée. Les agriculteurs sont en effet averses à la perte et déforment les probabilités de manière à donner un poids important aux événements extrêmes. Dans le quatrième article, nous examinons la relation entre l'adoption du miscanthus et les caractéristiques des agriculteurs et des exploitations, en particulier les préférences individuelles par rapport au risque et au temps. Ces dernières sont représentées par des mesures expérimentales obtenues dans le cadre de la théorie des perspectives et de l'actualisation hyperbolique respectivement. Nos résultats suggèrent que la probabilité d'adoption du miscanthus dépend du degré d'aversion à la perte des agriculteurs et de l'ampleur avec laquelle ils déforment les probabilités. Cependant, l'impact de ces deux facteurs varie avec le type de parcelle considéré et le point de référence des agriculteurs. Par ailleurs, la probabilité d'adoption est d'autant plus forte que la proportion sur l'exploitation de terres peu rentables est élevée, et que ces terres ne sont pas déjà valorisées par une activité d'élevage.
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Gagnon, Vicky. "Étude des interactions entre les nerfs sensoriels et les follicules pileux dans un modèle in vitro de peau reconstruite par génie tissulaire." Thesis, Université Laval, 2005. http://www.theses.ulaval.ca/2005/22895/22895.pdf.
Full textAbstract:
L’objectif du présent projet était d’optimiser le modèle de peau reconstruite par génie tissulaire déjà mis au point par notre équipe afin qu’il stimule le processus de régénération nerveuse après greffe pour améliorer la récupération tactile des grands brûlés. Nous avons utilisé des follicules pileux murins et des neurones sensoriels extraits des ganglions de la racine dorsale de fœtus de souris et avons posé comme hypothèse que les poils avaient une influence positive sur la migration axonale. Une élongation vigoureuse des neurites a été détectée à l’intérieur du derme reconstruit. En présence de cellules épithéliales, il y a eu une migration préférentielle des axones vers les follicules pileux immatures implantés dans le modèle, migration qui a été suivie d’une association étroite des axones et des follicules pileux. Nous avons donc développé avec succès un modèle nous permettant d’étudier les effets de l’épiderme et des follicules pileux sur la croissance des nerfs.
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Preterre, David. "Développement d'un modèle in vitro d'exposition chronique aux forces de cisaillement pariétal sur primocultures de cellules endothéliales coronaires de rat pour l'évaluation de la dysfonction endothéliale in vitro." Rouen, 2004. http://www.theses.fr/2004ROUES018.
Full textAbstract:
Le rôle de l'endothélium vasculaire dans les pathologies cardiovasculaires a gagné un intérêt croissant au cours des dernières années de recherche. Autrefois considéré comme un tissu inerte, celui-ci s'est peu à peu doté de propriétés d'interaction et de régulation qui sont à la base même de l'homéostasie du système cardiovasculaire. Les capacités d'interaction de l'endothélium avec son environnement direct ne facilitent pas son étude in vitro lorsque les cellules endothéliales sont cultivées hors de tout contexte physiologique. Le développement d'un modèle in vitro permettant de recréer et de moduler de façon indépendante les paramètres physico-chimiques du micro-environnement endothélial (forces de cisaillement pariétal, pression hydrostatique, pression partielle en oxygène) s'avère nécessaire afin d'évaluer finement les relations qui les lient. Le système des rollers permet d'évaluer de façon chronique et de façon indépendante des paramètres physiques (forces de cisaillement pariétal), chimiques (pression partielle en oxygène) et physiologiques (substances vasoactives). Les études récentes ayant mis l'accent sur le rôle primordial de la balance oxydo-réductrice de la cellule endothéliale dans la survenue ou non de phénomènes pathologiques, nous nous sommes intéressés aux réponses cellulaires pour différentes conditions micro-environnementales. Nos résultats montrent que l'augmentation des forces de cisaillement pariétal induisent un stress oxydant transitoire ainsi qu'une induction pérenne des systèmes de défense anti-oxydant alors qu'une diminution chronique semble provoquer un déséquilibre de la balance oxydo-réductrice cellulaire. L'hypoxie ne provoque pas la génération d'espèces radicalaires mais module le stress oxydant induit par le flux et augmente la biodisponibilité du monoxyde d'azote produit. L'étude de l'angiotensine II a montré un effet anti-oxydant prédominant de la voie des récepteurs AT2 sur les cellules endothéliales coronaires alors que les effets pro-inflammatoires et pro-oxydant du TNF alpha sont plus marquées sur les cellules ayant subi une diminution chronique de flux. Ainsi, il apparaît que le micro-environnement physico-chimique des cellules endothéliales module fortement leur physiologie et leurs réponses aux stress exogènes. Le rôle de l'hypoxie au niveau tissulaire ainsi que le type cellulaire impliqué dans l'oxyception restent à déterminer au moyen de systèmes de co-culture cardiomyocytes/cellules endothéliales. Par ailleurs, l'action prédominante de la voie AT2 au niveau de l'endothélium coronaire ouvre une voie de recherche supplémentaire pour le développement de stratégies thérapeutiques. En conclusion, le modèle développé permet d'évaluer finement et de façon chronique les interrelations qui existent entre l'endothélium et son environnement tant physico-chimique qu'humoral. Le concept de culture dynamique des cellules endothéliales apparaît alors primordial pour le développement d'études offrant une alternative à l'expérimentation animaleVascular endothelium role in cardiovascular diseases has gained more and more interest for a few years. Being considered just as a barrier, research gave it many properties which became the foundations of cardiovascular homeostasis. As endothelium may interact with its micro-environment, in vitro studies are not easy since endothelial cells are grown under non-physiological conditions. Development of an in vitro model which could simulate and modulate independently physical, chemical and physiological parameters of endothelium micro-environment appears to be necessary for the in vitro studies relevance. The "Roller" system allows study in a chronic and independent fashion those parameters. As recent studies pointed out the crucial role of oxidative status of endothelial cells into the outcome of physio-pathological events, we have been interested in endothelial oxidative status cellular responses when exposed to various micro-environmental conditions. Our results show that shear stress increase induces transient oxidative stress as well as long-term anti-oxidant enzymatic systems; chronic decrease in shear stress seems to induce an imbalance in endothelial cell oxidative state. Hypoxia did not induce reactive oxygen species production but modulates flow-induced oxidative stress and enhances NO bioavailability. Angiotensin II showed a dominant anti-oxidant effect mediated by AT2 receptors and pro-inflammatory and pro-oxidant TNF alpha effects were stronger when cells had undergone chronic flow decrease. Then, it appears that micro-environment strongly affects endothelial cell in culture and their response to exogenous stresses. Hypoxia role and mechanism at the tissue level remains to be assessed with co-culture systems (cardiomyocytes/endothelial cells). Furthermore, AT2 receptor presence at the coronary level could lead to novel research in terms of therapeutical strategies. To conclude, this model allows fine and chronic evaluation of endothelium interaction with its environment. Dynamic culture concept appears to be uncircumventable for development of studies which could offer an alternative to animal experimentation
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Martínez, von Dossow Carlos. "Modélisation, analyse et contrôle de la croissance microalgale en cultures à haute densité." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2019. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2019SORUS255.pdf.
Full textAbstract:
Les microalgues sont des microorganismes photosynthétiques avec un grand potentiel industriel. Néanmoins, contrôler les conditions optimales de cultures algales à grande échelle reste un défi difficile. L'objectif de cette thèse est de mieux comprendre ces systèmes à l'aide de modèles mathématiques basés sur des équations différentielles. Ces modèles décrivent la croissance microalgale dans des cultures à haute densité en fonction de différents facteurs comme la disponibilité en lumière et en nutriments. Dans une première partie, on étudie l'impact de la photoinhibition et de la turbidité du milieu sur la croissance microalgale limitée par la lumière. Ensuite, le comportement à long terme d'une population microalgale colimitée par un nutriment et la lumière est analysé. Des conditions pour éviter l'extinction de la population sont identifiées. En particulier, on montre que le fonctionnement en continu, avec entrées périodiques (concentrations dans l'alimentation et taux de dilution périodiques) sous variations périodiques de l'environnement (source de lumière et température), conduit la population à un état périodique. Dans une troisième partie, une stratégie est proposée pour maximiser la productivité microalgale en extérieur, en contrôlant l'ombrage. Par la suite, dans le contexte du traitement des eaux usées, on détermine numériquement la profondeur optimale pour une culture limitée par la lumière et par un substrat (à dépolluer). Dans une dernière partie, un modèle est proposé et validé pour rendre compte de la limitation par la lumière, l'azote et le phosphore, tout en incluant la dynamique de photoacclimatationMicroalgae are photosynthetic microorganisms with a high biotechnological potential. They have many industrial applications, including biofuel and wastewater treatment. Nevertheless, controlling optimal growth conditions for full-scale outdoor cultivation of microalgae is challenging. Mathematical models based on differential equations are of great help to better manage these nonlinear and dynamical systems. The aim of this thesis is to better understand how different factors such as the availability of light and nutrients affect microalgae growth in high density cultures. In a first part, we study the impacts of photo-inhibition and medium turbidity when microalgae growth is only limited by light. Then, we analyse the long-term behaviour of a microalgae population accounting both for nutrient and light limitations. We determine the conditions to avoid population extinction. In particular, we show that continuous periodic culture operation (periodic dilution rate and nutrient supply) under periodic fluctuations of environmental conditions (such as the light source or temperature) leads to a periodic behavior. In a third part, we show how to maximize microalgae productivity. We determine a strategy for shading outdoor cultures to protect microalgae from excess light. We also find the optimal incident light for photobioreactors operated at steady state. In the context of wastewater treatment, we determine numerically the optimal depth of a culture limited by light and nutrient. Finally, the last part of this work proposes and validates a mathematical model accounting for light, nitrogen, and phosphorus limitations, including photoacclimation dynamics
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Cuffley, Kristine. "Développement par génie tissulaire d'un modèle d'étude in vitro des voies de signalisation des cellules souches du follicule pileux." Thesis, Université Laval, 2005. http://www.theses.ulaval.ca/2005/23211/23211.pdf.
Full text
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Niehus, Sebastian. "Développement d’un modèle d’étude génétique des relations hôtes- parasites entre un parasite intracellulaire obligatoire, la microsporidie Tubulinosema ratisbonensis et l’organisme modèle Drosophila melanogaster." Thesis, Strasbourg, 2012. http://www.theses.fr/2012STRAJ137.
Full textAbstract:
Plus de 150 années de recherches sur les Microsporidies ont conduit à une connaissance relativement basique de divers aspect de leur biologie. Malgré cela, peut d’informations existent concernant la génétique et les mécanismes moléculaire des interactions hôte-pathogène qui gouvernent les infections aux Microsporidies.Dans un premier temps, je décris comment détecter, traiter et éradiquer les infections microsporidiales avec Tubulinosema ratisbonensis dans des lignées de Drosophila melanogaster. Jusqu’à présent, les connaissances concernant les défenses de l’hôte chez la drosophile contre les parasites intracellulaire obligatoires restent incomplète due au manque d’un bon modèle d’infection. De ce fait, j’ai développé des modèles d’infection de D. melanogaster par la microsporidie T.ratisbonensis, à la fois en culture cellulaire et drosophiles adultes. Mes travaux sur le modèle d’infection cellulaire englobent des approchent en transcriptomique et métabolomique qui analysent les deux cotées de cette relation hôte-pathogène. En fin, je présente les fonctions biologiques des glycosylphosphatidyl inositoles de Toxoplasma gondiiMore than 150 years of Microsporidia research led to a basic understanding of many aspects of microsporidial biology, yet little is known about the genetic basis and molecular mechanisms of the intimate host-parasite relationship that govern Microsporidia infections.Here, I first report on the detection, prophylaxis, and eradication measures against microsporidial infestations with Tubulinosema ratisbonensis, infecting cultures of Drosophila melanogaster. To date,knowledge about Drosophila host defense against obligate intracellular parasites remained incomplete for lack of good infection models.To this end, I have developed infection models of Drosophila by the microsporidian T. ratisbonensis,both in cell lines and in adults. The work on the cellular infection model encompasses transcriptomics and metabolomics approaches, which aim to attempt both sides of the host-pathogen equation. Finally, I report on the biological roles of glycosylphosphatidyl inositols of Toxoplasma gondii
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Ferrini, Jean-Bernard. "Caractérisation de l'expression des facteurs C/EBPs et rôle des régulateurs du cycle cellulaire au cours de la différenciation hépatique dans un modèle d'hépatocytes humains en culture primaire." Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20202.
Full textAbstract:
Dans ce travail, nous avons developpe un modele de culture primaire d'hepatocytes humains adultes dans lequel de nombreuses caracteristiques du phenotype hepatique telles que la secretion des proteines plasmatiques, l'expression, et l'activite des cytochromes p450 de la famille 1a, 2c et 3a sont maintenues pendant au moins un mois. Afin de mieux caracteriser le mecanisme de differenciation de l'hepatocyte humain, nous avons etudie dans ces cultures, et a partir de foies de differentes especes, l'expression et l'activite de fixation a l'adn des facteurs de transcriptions c/ebp et c/ebp. Alors que le niveau de messager et de proteine de c/ebp augmente rapidement apres ensemencement en culture, l'expression de l'arnm de c/ebp et l'accumulation de l'isoforme proteique 45 kda apparaissent plus tardivement. Parallelement, l'expression des nombreux isoformes c/ebp semble etre regulee differemment selon l'etat de differenciation et l'origine du tissu analyse. Enfin, les differences d'expression des facteurs c/ebp ont ete confirmees par l'analyse de leur complexe avec l'adn. Afin d'etudier les mecanismes d'arret de la proliferation durant le processus de differenciation, nous avons analyse le niveau proteique et l'activite des regulateurs du cycle cellulaire. Apres ensemencement, les complexes cyclines g1-cdks actifs s'accumulent dans les hepatocytes sans provoquer l'entree en phase s, parallelement a une forte augmentation des formes prb hypophosphoryles et p130 phosphoryles (forme 2), deux proteines connues pour jouer un role cle dans le processus d'arret de la proliferation lie a la differenciation. De plus, nous avons mis en evidence que le complexe cycline e-cdk2 est responsable de la phosphorylation de p130 au cours des etapes precoces de la differenciation. Enfin, durant les etapes tardives de la differenciation, l'inactivation des complexes cyclines g1-cdk resulte de leurs associations avec p27 k i p 1 et de la sequestration de cdk4/k6 par p16 i n k 4 a.
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Schaller, Noémie. "Modélisation des décisions d'assolement des agriculteurs et de l'organisation spatiale des cultures dans les territoires de polyculture-élevage." Phd thesis, AgroParisTech, 2011. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00781098.
Full textAbstract:
Face aux enjeux de conciliation entre production agricole et protection des écosystèmes, l'organisation spatiale et temporelle des cultures à l'échelle des paysages peut être un levier d'action privilégié. Les décisions d'assolement que prennent les agriculteurs au niveau de leurs exploitations individuelles sont un des moteurs de cette organisation. L'objectif général de cette thèse était d'étudier en quoi la modélisation des décisions d'assolement dans leurs dimensions spatiale et temporelle au niveau de l'exploitation permet de rendre compte de l'organisation spatiale des cultures au niveau du paysage. Dans la plaine de Niort (Poitou-Charentes), nous avons tout d'abord identifié (i) des régularités d'organisation des cultures au niveau paysage et (ii) des règles de décisions d'agriculteurs au niveau exploitation. La comparaison de ces deux éléments a confirmé que les régularités d'organisation spatiale et temporelle des cultures pouvaient relever de décisions qui étaient communes entre agriculteurs. A partir d'enquêtes dans 12 exploitations, nous avons ensuite construit le modèle DYSPALLOC. Ce modèle conceptuel permet de simuler l'organisation spatiale des cultures d'une année à l'autre à l'échelle de l'exploitation, via la représentation spatiale et temporelle des décisions de planification d'assolement. Applicable aux exploitations de grandes cultures et de polyculture-élevage, ce modèle a en outre permis d'expliciter les règles de délimitation des parcelles au sein des EA. Nous avons défini trois types de parcelles en fonction de leurs limites : îlots élémentaires, parcelles fixes et parcelles temporaires. L'évaluation du modèle a montré que l'allocation des cultures simulée était correcte dans 83% des parcelles. Une expérimentation virtuelle a de plus permis de valider les concepts de parcelles fixes et parcelles temporaires. Enfin, nous avons utilisé le modèle à l'échelle d'un paysage composé d'exploitations, avec des données d'entrée construites à partir de bases de données spatialisées. Nous avons montré que l'organisation spatiale des cultures simulée à partir de la prise en compte des décisions d'assolement était plus proche de l'organisation réelle observée, que ne l'était l'organisation simulée aléatoirement, même en intégrant des contraintes agronomiques. Ce travail pourrait donc contribuer à favoriser la coordination des décisions d'assolement individuelles des agriculteurs pour générer des organisations spatiales de cultures favorables au fonctionnement des écosystèmes à l'échelle des paysages agricoles.