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Dissertations / Theses on the topic 'Microorganismes – Modèles mathématiques'

Author: Grafiati
Published: 25 May 2024
Last updated: 31 July 2025

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Lobry, Jean R. "Ré-évaluation du modèle de croissance de Monod : effet des antibiotiques sur l'énergie de maintenance." Lyon 1, 1991. http://www.theses.fr/1991LYO10134.

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Abstract:
Le contexte experimental et les hypotheses biologiques sous-jacentes du modele de croissance monod sont presentees. L'importance de ce modele, ses principaux champs d'application, la variabilite de la valeur de ses parametres, ainsi que la dynamique de la croissance de son impact sont exposes. Ce modele etait suppose se justifier de facon analogue au modele de michaelis et menten, mais cette approche souleve plusieurs difficultes. Nous montrons comment le modele de monod peut etre obtenu a partir du modele de croissance logistique, avec pour corollaire la prediction inattendue d'une augmentati
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2

André, Jean-Baptiste. "Niveaux de sélection chez les microparasites : virulence, coopération, mutation." Montpellier 2, 2003. http://www.theses.fr/2003MON20172.

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3

Fothi, Abdellah. "Effets induits de la turbulence benthique sur les mécanismes de croissance du périphyton." Toulouse, INPT, 2002. http://www.theses.fr/2002INPT027H.

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Abstract:
Ce travail concerne l'étude, en canal de laboratoire, des interactions " hydrodynamique-périphyton ". La communauté périphytique a un intérêt majeur en hydro-écologie car elle constitue une source de nourriture pour les invertébrés et les poissons et aussi parce qu'elle joue un rôle très important dans la transformation et l'élimination de la matière organique dans les cours d'eau. Mais, le périphyton est un élément qui fait évoluer, au gré des conditions environnementales, la rugosité des substrats qu'il colonise. Sa quantité et sa composition sont donc, par contrecoup, des facteurs non négli
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4

Cannavo, Patrice. "Variations saisonnières des activités respiratoire aérobie et dénitrifiante dans la zone non saturée du sol : expérimentation sur une parcelle agricole du Comtat Venaissin et modélisation." Avignon, 2003. http://www.theses.fr/2003AVIG0030.

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Abstract:
La contamination des nappes par le nitrate (NO3-), ainsi que les émissions de gaz à effet de serre tels que le dioxyde de carbone (CO2) et l'oxyde nitreux (N2O) sont des problèmes environnementaux et agronomiques cruciaux pour un développement durable. L'objectif de ce travail était de caractériser durant 7 mois la dynamique des éléments carbone et azote couplée aux activités microbiennes dans la zone non saturée du sol et de souligner, entre autre, l'intérêt de ne pas négliger les processus biologiques existants dans la zone non saturée profonde. Pour cela, un profil de sol situé dans une par
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Bensaker, Bachir. "Contribution à la modélisation et à l'identification d'un processus de croissance de micro-organismes marins (Dinophysis acuminata)." Le Havre, 1988. http://www.theses.fr/1988LEHA0002.

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Abstract:
Ce travail présente une contribution à la modélisation et à l'identification d'un processus biologique complexe à l'évolution mal connue. Le processus considéré est l'apparition et le développement des micro-organismes marins toxiques Dionophysis acuminata, ce qui implique d'importantes conséquences économiques et sanitaires. Un premier modèle du type "boîte noire" est construit à partir de l'exploitation de données physiques, chimiques et biologiques prélevées périodiquement sur site. Ce modèle nous a permis de mettre en évidence les principaux facteurs influençant le phénomène et permettra,
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Voelker, François. "Étude des réversions d'auxotrophie chez une souche de Corynebacterium glutamicum productrice de L-lysine : effets de l'environnement sur les cinétiques de production de révertants et de L-lysine et essai de modélisation." Compiègne, 1996. http://www.theses.fr/1996COMPD868.

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Abstract:
La production de lysine chez les bactéries du genre Corynebacterium peut être réalisée par une dérégulation de la voie de synthèse de cette acide aminé, obtenue soit par des mutations de régulation, soit par des mutations d'auxotrophie. Ainsi, la souche Corynebacterium glutamicum MG productrice de lysine, utilisée dans ce travail, porte deux mutations d'auxotrophie, pour l'homosérine et pour la leucine. L'étude des caractéristiques de la réversion montre que la souche est sujette à la réversion pour les deux mutations d'auxotrophie et que les profils d'accumulation des révertants sur milieux s
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Favier, Lidia. "Etude cinétique et stoechiométrique de la croissance de Rhodospirillum rubrum en photobioréacteur." Clermont-Ferrand 2, 2004. http://www.theses.fr/2004CLF22538.

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Abstract:
Une étude expérimentale de la croissance de la bactérie pourpre non sulfureuse Rhodospirillum rubrum en mode continu dans un photobioréacteur cylindrique radialement éclairé fonctionnant en photohétérotrophie a été réalisée afin de comprendre sa réponse métabolique en condition de limitation par la lumière. Un ensemble de données cinétiques et stoechiométriques ont été recueillies. Une étude du métabolisme de R. Rubrum par une approche flux métabolique a été ensuite réalisée afin de comprendre à l'échelle cellulaire le couplage entre la lumière et les cinétiques de croissance. Ceci a permis de
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Colombié, Vincent. "Description de la production de spiramycine par Streptomyces ambofaciens : modélisation métabolique, simulation et capteur logiciel." Toulouse, INSA, 2005. http://www.theses.fr/2005ISAT0043.

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Abstract:
L'objectif de cette étude est le développement d'un outil mathématique permettant de décrire la dynamique de croissance et de production de métabolites secondaires par une bactérie filamenteuse. Avec le support biologique retenu, le modèle devrait décrire la production d'un antibiotique associée à la description du métabolisme central du microorganisme. Dans ce cas de figure, la voie de production correspond à un flux de matière minoritaire par rapport au flux de carbone total mais fait intervenir plusieurs précurseurs issus de voies très différentes du métabolisme central. La finalité est de
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Aldarf, Mazen. "Culture sur milieux solides modèles de la croissance de Geotrichum candidum et de Penicillium camembertii : application à la maîtrise de l'affinage du camembert." Rennes 1, 2003. http://www.theses.fr/2003REN10056.

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Abstract:
L'affinage des fromages de type camembert est sous le contrôle de la croissance et de l'équilibre de deux populations fongiques, Geotrichum candidum et Penicillium camembertii. Les cinétiques de croissance, de consommation des substrats, de production de métabolites et de transfert de protons sont décrites et discutées. De là, la cinétique de croissance est reconstruite par des moyens indirects. Dans l'étude des mécanismes diffusionnels proposée, une loi d'association partielle entre croissance et consommation ou production est considérée, avec un terme supplémentaire rendant compte des limita
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Durot, Maxime. "Elucidation du métabolisme des microorganismes par la modélisation et l'interprétation des données d'essentialités de gènes : application au métabolisme de la bactérie Acinetobacter baylyi ADP1." Thesis, Evry-Val d'Essonne, 2009. http://www.theses.fr/2009EVRY0017/document.

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Abstract:
Le métabolisme des microorganismes est traditionnellement étudié à deux échelles: d’une part, à l’échelle locale, la description des réactions métaboliques et d’autre part, à l’échelle globale, l’étude de la physiologie de la cellule. Malgré des progrès technologiques récents facilitant les études à ces deux échelles, leur exploitation conjointe demeure complexe car le comportement physiologique de la cellule résulte de l’action coordonnée de nombreuses réactions. Les modèles mathématiques globaux du métabolisme ont toutefois récemment permis de relier ces deux échelles. Dans cette thèse, nous
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Cazelles, Bernard. "Modélisation d'un écosystème lotique : dynamique du carbone organique dissous et des microorganismes benthiques dans un cours d'eau cours." Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO10068.

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12

Adour, Lydia. "Cultures pures en bioréacteur de deux microorganismes d'affinage du camembert, penicillium camembertii et géotrichum candidum." Rennes 1, 2003. http://www.theses.fr/2003REN10041.

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Abstract:
L'affinage du camembert est régulé par deux populations fongiques, Geotrichum candidum et Penicillium camembertii. Pour éviter le problème de la mesure de la biomasse à la surface d'un milieu solide, la culture liquide a été préférée. Pour les deux microorganismes, les relations entre cinétique de croissance et cinétiques de consommation ou de production ont été examinées. Les cultures sur milieux à base de peptones ou de glutamate ont montré que le lactate ne convient pas à G. Candidum comme source de carbone, il n'est en effet assimilé que comme source d'énergie pour le maintien cellulaire d
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Normand, Raoul. "Modèles déterministes et aléatoires d'agrégation limitée et phénomène de gélification." Phd thesis, Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2011. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00631419.

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Abstract:
Dans cette thèse, nous étudions des modèles d'agrégation limitée, qui modélisent la coalescence de particules ayant des "bras", c'est-à-dire un nombre fixé de liens potentiels. Une particule ne peut donc créer plus de liens que son nombre de bras. On s'intéresse en particulier à une variante de l'équation de Smoluchowski introduite par Jean Bertoin. Ce document comprend, outre l'introduction, trois chapitres. Le premier est dévolu à l'étude d'un modèle sexué de coagulation, où les particules ont des bras mâles et femelles et seuls des bras de sexes opposés peuvent se joindre. Ce modèle général
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Berling, Marie. "Durabilité du contrôle du carpocapse des pommes et des poires (Cydia pomonella) avec le virus de la granulose (CpGV) : Résistance versus Virulence." Pau, 2009. http://www.theses.fr/2009PAUU3016.

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Abstract:
Le Cydia pomonella granulovirus (CpGV) a été utilisé pendant plus de quinze ans pour le contrôle du carpocapse des pommes et des poires (C. Pomonella). En 2004, une population résistante à l’isolat viral CpGV-M utilisé au champ a été détectée pour la première fois dans un verger biologique du sud de la France. Le facteur de résistance de cette population a été estimé à 13 000 fois. Une colonie de laboratoire (RGV) a été établie à partir de ces insectes résistants, suivi d���une introgression du caractère de résistance au sein d’une colonie sensible de référence, Sv. La caractérisation génétiqu
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Quedeville, Vincent. "Mathematical analysis, modelling and simulation of microbial population dynamics." Thesis, Toulouse, INPT, 2020. http://www.theses.fr/2020INPT0033.

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Abstract:
La physiologie d’organismes unicellulaires est la conséquence d’un métabolisme central dont le bilan entrée-sortie témoigne à la fois de la richesse du milieu de culture des cellules et de leur état propre. Lorsque des bactéries sont cultivées dans un fermenteur biologique alimenté en un point, transportées dans un écoulement turbulent, elles doivent composer avec des gradients de concentration tout au long de leur séjour dans le réacteur. Simuler cette physique dans une démarche de modélisation multi-échelle nécessite de prendre en compte les lois, bien connues, de l’hydrodynamique, mais auss
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Lecomte, Maxime. "Approche hybride de modélisation explicable du métabolisme des écosystèmes microbiens." Electronic Thesis or Diss., Bordeaux, 2024. http://www.theses.fr/2024BORD0094.

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Abstract:
Les communautés microbiennes sont des systèmes complexes composés de diverses espèces de micro-organismes interagissant entre elles et avec leur environnement. La biologie des systèmes offre un cadre pour leur étude, alliant expérimentation, génération de données à haut-débit et leur intégration dans des modèles informatiques. La compréhension de ces communautés passe notamment par celle de leur métabolisme et des échanges de molécules entre espèces susceptibles d’impacter positivement ou négativement chacun des membres. Le métabolisme est un ensemble de réactions biochimiques et peut s’abstra
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Chaix, Estelle. "Caractérisation et modélisation des transferts de gaz (O2/CO2) dans le système emballage/aliment en lien avec les réactions de croissance microbienne (microbiologie prévisionnelle)." Thesis, Montpellier 2, 2014. http://www.theses.fr/2014MON20159/document.

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Abstract:
Un des rôles de l'emballage est de limiter les réactions de dégradation des aliments : pour cela, il contrôle les transferts de gaz (O2, CO2, N2) entre l'atmosphère extérieure et l'espace de tête. Dans le cas des Emballages sous Atmosphère Modifiée (EAM), la composition gazeuse est judicieusement choisie afin de limiter la croissance microbienne (en général faible teneur en O2 et forte concentration en CO2). L'objectif de ce travail est d'étudier et modéliser l'impact des transferts de gaz (O2/CO2/N2) dans le système EAM sur la croissance microbienne. Des modèles existants de microbiologie pré
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Duret, Marie-Pierre. "Les modèles en phytopathologie : étude du champignon Sclerotinia sclerotiorum sur colza (Brassica napus)." Lyon 1, 1992. http://www.theses.fr/1992LYO10120.

Full text
Abstract:
Le travail se situe au carrefour de plusieurs disciplines qui sont la biologie des populations, l'epidemiologie d'une maladie sur plantes, la modelisation, l'agronomie et la biometrie. La synthese bibliographique s'attache a une litterature specifique du domaine d'etude envisage, la phytopathologie. Sont presentes les modeles les plus couramment employes pour decrire et predire le developpement des maladies sur plantes, pour estimer les pertes de rendement qu'elles entrainent. Les problemes rencontres lors de l'acquisition des donnees indispensables a leur elaboration et leur mise en place sur
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Ziti, Chérif. "Analyse et simulation numérique d'un système hyperbolique modélisant le comportement d'une population bactérienne." Saint-Etienne, 1987. http://www.theses.fr/1987STET4004.

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Caulet, Philippe. "Caractérisation hydrodynamique d'un bioréacteur pulsé pneumatiquement." Toulouse, INSA, 1992. http://www.theses.fr/1992ISAT0036.

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Abstract:
Les travaux concernent la caracterisation d'un bioreacteur a plateaux, muni d'un systeme d'agitation pulse pneumatiquement. Par une etude anemometrique des champs de vitesses relatifs a un ensemble de jets monophasiques generes a l'aval d'un plateau perfore, une zone fortement turbulente suivie d'une zone d'homogeneisation des vitesses sont distinguees et la transition correspondante est assuree par le recoupement de jets adjacents. L'instationnarite de l'ecoulement liee a la pulsation modifie l'epanouissement des jets et allonge la zone de turbulence. L'extension qualitative des resultats aux
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Boiran. "Nitrification des effluents très chargés en azote et en matières organiques par un réacteur d'infiltration-percolation aéré." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1996. http://www.theses.fr/1996INPL036N.

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Abstract:
Après une étude bibliographique sur les méthodes d'épuration des lisiers, le fonctionnement des biomasses microbiennes fixées et des microflores nitrifiantes, le travail expérimental décrit l'implantation et le fonctionnement des microflores nitrifiantes dans des réacteurs d'infiltration-percolation aérés constitués de graviers calcaires ou siliceux et recevant des effluents très chargés en matière organique et en azote. La modification des rythmes d'aération a montré qu'une aération réduite altère d'abord le fonctionnement de la nitrification avant de favoriser la dénitrification. L’augmentat
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Cascallo, Anne. "Conception, contrôle et fonctionnement d'un photobioréacteur pour la culture en mode continu de la cyanobactérie Spirulina platensis." Compiègne, 2000. http://www.theses.fr/2000COMP1268.

Full text
Abstract:
La culture de cyanobactéries en photobioréacteur est régie par des limitations physiques (distribution de l'énergie lumineuse, transfert du Co 2) et biologiques (concentration limitante des différents nutriments). Dans le cadre de la réalisation d'un celss (controlled ecological life support system), la modélisation de ces limitations est particulièrement importante, ainsi que son intégration dans un système de contrôle afin d'obtenir un fonctionnement robuste et stable du systeme et l'obtention de la biomasse souhaitée. Cette étude a permis d'optimiser le fonctionnement du compartiment photau
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Dallagi, Heni. "Numerical and experimental investigations of the rheological behavior of foam flow : application to the cleaning of surfaces contaminated by microorganisms in the food industries." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2022. http://www.theses.fr/2022ULILR003.

Full text
Abstract:
La caractérisation expérimentale et numérique du comportement rhéologique d'une mousse aqueuse s'écoulant à l'intérieur d'un tuyau horizontal avec et sans singularités (demi-expansion soudaine, et chicane) a été étudiée. Différentes conditions d'écoulement ont été étudiées en faisant varier les qualités de mousse (55-85%), et trois nombres de Reynolds (32, 65, et 97). Les mesures de la pression, de la répartition de la vitesse locale et de la contrariante et de l'épaisseur des films liquides au niveau de la paroi à l'aide respectivement de capteurs de pression, de la PIV, de la polarographie e
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Ardeshiri, Hamidreza. "Dynamique des copépodes dans les écoulements turbulents." Thesis, Lille 1, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL10080/document.

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Abstract:
La famille la plus commune des organismes dans le zooplancton est un groupe connu intitulé copépodes. Les copépodes ont un rôle majeur dans l’écosystème marin, car ils sont les producteurs secondaires dans la chaîne alimentaire écologique reliant les cellules de phytoplancton à des larves de poissons et même aux grands mammifères comme les baleines. Le comportement de nage de copépodes présente des sauts puissants et rapides. Une telle aptitude est utilisée pour échapper à des régions de cisaillement élevées, qui peuvent être causés soit par des perturbations d’écoulement, soit par un grand pr
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Baccar, Rim. "Plasticité de l'architecture du blé d'hiver modulée par la densité et la date de semis et son effet sur les épidémies de Septoria tritici." Phd thesis, AgroParisTech, 2011. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00741439.

Full text
Abstract:
Les pratiques culturales modifient l'architecture des couverts de manière à augmenter ou diminuer le développement des épidémies mais les processus mis en jeu sont complexes ; des modèles mécanistes simulant l'interaction entre plante et pathogène devraient aider à les clarifier. Les modèles de Plantes Virtuelles, qui permettent de décrire explicitement la structure tridimensionnelle de la plante, semblent particulièrement prometteurs pour exprimer les effets de l'architecture de la plante sur le développement des épidémies. L'objectif de cette étude est d'examiner la possibilité de simuler l'
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