Dissertations / Theses: 'Métabolisme de la proline'

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Le, Dinh Thien. "Métabolisme de la proline chez les mammifères." Paris 5, 1988. http://www.theses.fr/1988PA05P216.

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Olivares, Orianne. "Etude de la reprogrammation métabolique de l' adénocarcinome canalaire pancréatique." Thesis, Aix-Marseille, 2015. http://www.theses.fr/2015AIXM4000.

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Abstract:

L'adénocarcinome canalaire pancréatique (ADKp) possède une architecture compacte, où les cellules tumorales forment des glandes emprisonnées dans un bouclier fibrotique, composé à 50% de collagènes. Ce bouclier empêche la vascularisation, limite l'apport en nutriments et oxygène. Beaucoup de cellules meurent, mais certaines survivent, en reprogrammant en particulier leur métabolisme. Ula plus étudiée est l'utilisation constitutive de la glycolyse, indépendamment de la présence d'oxygène (Effet Warburg). Nous montrons que la population hypoxique de l'ADKp dépend aussi de la dégradation de la glutamine, et que l'activité concomitante de la glycolyse et de la glutaminolyse entraîne la réactivation de la biosynthèse des hexosamines. Ces composés participent à la prolifération tumorale en stabilisant les transporteurs au glucose, ou des oncogènes. L'activité glycolytique intense des cellules hypoxiques permet la synthèse de lactate qui sert de ressource nutritive aux cellules oxygénées adjacentes aux cellules hypoxiques. Nous montrons que certaines cellules oxygénées sont capables de survivre au stress nutritif en dégradant le collagène (écophagie), en utilisant la proline qu'il contient. Les cellules tumorales captent et dégradent les fragments de collagènes pour survivre. Des traçages isotopiques de collagène marqué permettent d'appuyer que la proline internalisée provient du collagène matriciel. Cette proline est transformée en glutamate et fournit le cycle de Krebs pour favoriser la survie tumorale. Ces travaux montrent l'importance de l'étude de la reprogrammation métabolique dans l'ADKp, et le rôle de l'hypoxie ou du collagène dans la progression tumorale
Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has a compact architecture wherein the tumor cells are organized in glands and trapped in a fibrotic shield (stroma) made of up to 50% of collagen. This shield prevents blood supply, limits nutrients and oxygen intake. Many cells die, but some survive, and proliferate particularly by reprogramming their metabolism. The most studied metabolic reprogramming remains tumor cells addiction to glucose and the constitutive use of glycolysis, regardless of the presence of oxygen (Warburg effect). We show that the hypoxic population of PDAC also depends on glutamine degradation, and the concomitant activity of both glycolysis and glutaminolysis reactivates the hexosamine biosynthetic pathway. These compounds contribute to tumor proliferation by stabilizing glucose transporters, or oncogenes. The intense glycolytic activity of hypoxic cells allows the synthesis of lactate. Excreted in the microenvironment, it serves as a nutritive resource to oxygenic cells adjacent to the hypoxic population and enables their proliferation. We show that some oxygenated cells are also able to survive under nutrient stress by degrading collagen (ecophagy) and use proline it contains. Tumor cells intake and degrade collagen fragments to survive. Isotopic tracer experiments using labeled collagen support the idea that proline comes from the extracellular collagen. This proline is degraded and converted into glutamate, fueling the Krebs cycle for anaplerosis and promotes tumor survival. These studies therefore show the importance to study the metabolic reprogramming of PDAC, and the role of hypoxia or collagen matrix in tumor progression

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Dourmap, Corentin. "Étude des interactions entre le catabolisme de la proline et le métabolisme de l'azote dans le développement de la graine chez Arabidopsis thaliana." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2022. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2022SORUS312.pdf.

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Abstract:

La proline est un acide aminé protéinogène qui a aussi de nombreuses fonctions à l’état libre chez les plantes notamment dans leur adaptation aux stress et leur développement. Son métabolisme est bien décrit à ce jour mais certains de ses rôles physiologiques restent encore énigmatiques. Synthétisée dans le cytosol à partir de glutamate, la proline est catabolisée dans la mitochondrie par l’action séquentielle de deux enzymes : la proline déshydrogénase (ProDH) et la pyrroline-5-carboxylate déshydrogénase (P5CDH). Des expériences préliminaires ont montré un très faible taux de germination des graines du mutant p5cdh ainsi qu’une faible remobilisation de l’azote au cours de la senescence. Les objectifs de cette thèse étaient de caractériser ce défaut de remobilisation de l’azote ainsi que son impact sur le développement de la graine. Nous avons pu montrer que le mutant p5cdh présentait un défaut de remobilisation de l’azote mais aussi du carbone, notamment lorsqu’il était cultivé avec un apport non limitant en azote. Les graines produites par ce mutant sont déformées et plus légères. Des analyses en imagerie ont montré que le développement embryonnaire du mutant p5cdh est bloqué à la transition entre les phases d’embryogenèse et de maturation lorsqu’il est exposé à de fortes concentrations en nitrates. L’embryon est alors bloqué dans son développement au stade torpille et est entouré d’albumen. Lors de la phase de déshydratation de la graine, l’embryon meurt. Afin d’identifier le rôle de P5CDH dans le développement de la graine, des études développementales, métabolomiques et protéomiques ont été entreprises sur des graines en cours de maturation et de déshydratation. Ces études ont montré qu’au cours du développement de la graine, le premier signe de perturbation chez le mutant p5cdh se manifeste au début de la phase de maturation par une phase de verdissement peu marquée et plus courte que chez le sauvage, suivie une accumulation limitée de lipides et de protéines de réserve. En revanche une accumulation très importante de proline est mesurée. Ces études ont également révélé dans les graines du mutant p5cdh une accumulation d’acides aminés libres ainsi qu’une perturbation marquée du métabolisme carboné. De nombreux marqueurs du métabolisme énergétique anaérobie sont induits probablement liés à la perte des capacités photosynthétiques de l’embryon. La teneur réduite en protéines HSP et LEA ainsi que de plusieurs sucres non-réducteurs chez le mutant p5cdh renforce le fait que la graine n’est pas préparée à cette phase de déshydratation. Les processus de maturation et de déshydratation étant fortement métaboliquement énergivores, l’arrêt du développement de la graine du mutant p5cdh pourrait être lié à une insuffisance énergétique. Ce déficit énergétique semble également toucher également le développement du gamétophyte mâle, puisque 50% des grains de pollen p5cdh meurent lors de leur maturation. Cette étude montre que le catabolisme de la proline est essentiel au développement de la graine et du pollen, notamment après la phase d’embryogénèse, en fournissant du pouvoir réducteur et de l’ATP. Elle vient confirmer de nombreuses hypothèses quant à l’importance de la proline et de son catabolisme pour la production d’énergie notamment lors de la reprise de la croissance après un stress mais également dans les organes à croissance rapide tels quel le tube pollinique, les pointes racinaires ou les cellules cancéreuses chez les modèles animaux
Proline is a proteinogenic amino acid with numerous functions in plants especially in stress adaptations and development. Its metabolism is now well described but some of its physiological roles remained enigmatic. Synthesized in the cytosol from glutamate, proline is catabolized in the mitochondrion by the sequential action of two enzymes: proline dehydrogenase (ProDH) and Pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase (P5CDH). Preliminary experiments showed weak germination rates for p5cdh mutants and weak nitrogen remobilization rate during senescence. The objectives of this thesis were to charaterize this remobilization defect and its impact on seed development. We have shown that p5cdh mutant presented a remobilization defect for nitrogen and carbon, especially when plants were grown under non limiting concentration of nitrates. Seeds produced by this mutant are out of shape and lighter. Imagery analysis have shown that embryo development of p5cdh mutant is blocked at the transition between embryogenesis and maturation phase when it is grown under high concentrations of nitrates. Embryo is blocked in its develoment in torpedo stage et is surrounded by endosperm. During the dehydration phase, embryo dies. In order to identify the role of P5CDH in seed development, developmental, metabolomics and proteomics studies were performed on maturing and dehydrating seeds. These studies have shown that during seed development, the first sign of disturbance in p5cdh mutant is visible at the beginning of the maturation phase with a weak and shorter greening phase compared to the wild-type. It is followed by a limited lipids accumulation and storage proteins. But an important accumulation of free proline were measured. These studies have also revealed an accumulation of free amino acids in p5cdh mutant's seeds and a marked disturbance of carbon metabolism. Numerous markers of anaerobic energy metabolism are induced probably linked to the loss of photosynthetic capacities of the embryo. The lower content in HSP and LEA proteins and in non-reducting sugars in p5cdh mutant reinforce the idea that the seed is not prepared to be dehydrated. Since the processes of maturation and dehydration are strongly energy demanding processes, the arrest of seed development in p5cdh mutant could be linked to a lack of energy. This lack of energy seems affect also the development of the male gametophyte since 50% of p5cdh pollen grain die during its maturation. This study shows that proline catabolism is essential to seed and pollen development, especially after the embryogenesis by provinding reduced power and ATP. It confirms the numerous hypothesis about the importance of proline and its catabolism in energy production during growth recovery after a stress but also in fast growth organs like pollen tube, root tip or cancer cells in animal models

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Demange, Luc. "Etude de l'isomérisation cis-trans de la liaison aminoacyl-proline : conception de nouveaux inhibiteurs de la cyclophiline hCyp-18." Paris 11, 2001. http://www.theses.fr/2001PA112318.

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Abstract:

Les travaux décrits dans ce manuscrit onr été réalisés au CEA/Saclay au sein du Département d'Ingénierie et d'Etudes des Protéines (DIEP). Ils se situent à l'interface entre la chimie et les sciences du vivant. Leur objet était de parvenir à mieux comprendre le mécanisme d'une enzyme, afin de développer par la suite des inhibiteurs potentiels de type analogue à l'état de transition. La protéine choisie pour cette étude est la cyclophiline humaine hCyp-18, une enzyme cytosolique et ubiquitaire. Elle catalyse l'interconversion cis-trans des liaisons amionacyl-proline, l'une des étapes lentes et limitantes du repliement des peptides et des protéines. HCyp-18 est ainsi impliquée dans de nombreux mécanismes cellulaires et joue un rôle dans l'une des voies de l'immunosuppression. Enfin, son implication dans l'infection de l'organisme par le virus HIV-1 en a fait une nouvelle cible thérapeutique de choix pour la lutte contre le SIDA. Dans un premier temps, à l'aide de petits peptides modifiés, nous avons évalué les phénomènes moléculaires responsables des interactions entre hCyp-18 et ses substrats. .
The study reported in this manuscript was carried out in the "Département d'Ingénierie et d'Etudes des Protéines" (DIEP) of the CEA/Saclay. This work deals with a study of an enzyme catalytic mechanism and with the development of new transition-state based inhibitors : the subject was at the interface of chemistry and biology. We choosed to study the cytosolic and ubiquitous human cyclophilin hCyp-18. This enzyme catalyses the cis-trans interconversion of the aminoacyl-proline peptide bond, one of the very slow and rate-limiting steps of protein folding ; hCyp-18 is involved in many cellular functions. This enzyme is implicated in one of the numerous way of immunosuppression, and it plays a critical role during infection by HIV-1 viruses. Therefore, hCyp-18 is an interesting new therapeutic target to fight AIDS. This work began with a study of the molecular interactions between hCyp-18 and its substrates. Using small modified peptides, we found that the active site of this enzyme is divided in two functionnaly independent subsites. .

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El, Moukhtari Ahmed. "Étude de l’effet d’apports exogènes de silicium et / ou de proline dans l’amélioration de la tolérance de la symbiose Medicago - Ensifer meliloti aux contraintes salines." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2022. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2022SORUS234.pdf.

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Abstract:

Les effets du silicium (Si) et/ou de la proline sur l’amélioration de la tolérance à la contrainte saline ont été étudiés chez deux espèces de luzerne, Medicago sativa L. et M. truncatula Gaertn. Deux variétés marocaines de M. sativa L., Oued Lmalah (OL) et Demnate 201 (Dm) et une variété européenne NS Mediana ZMS V (NS Med) originaire de la Serbie ont été utilisées. Les expériences ont été menées aux différents stades de développement sous conditions contrôlées. Les résultats ont montré que la salinité réduit le taux de germination et la viabilité de l’embryon et inhibe la mobilisation des réserves des embryons en particulier chez la variété NS Med. Cette restriction de la germination est concomitante à un stress oxydant reflété par des fortes accumulations en malonyldialdehyde (MDA) et en peroxyde d’hydrogène (H2O2) et une toxicité ionique manifestée par un rapport K+/Na+ très réduit. Cependant, le traitement des graines par le Si induit une forte accumulation de la proline et améliore la germination, la viabilité des embryons et la mobilisation des réserves. Le Si induit également une forte activité de la catalase (CAT) et du superoxyde dismutase (SOD) et réduit la teneur en MDA et en H2O2. Au stade plante, la salinité réduit la croissance des plantes et la nodulation chez toutes les variétés étudiées. Cette restriction de la croissance est associée à une diminution significative de la teneur des feuilles en chlorophylles, de la fluorescence chlorophyllienne (Fv/Fm) et de la conductance stomatique. La salinité réduit la teneur des plantes en azote et en K+ et augmente celle en Na+. La comparaison entre les trois variétés ciblées montre que la variété européenne NS Med est significativement la plus affectée. L’apport exogène de Si ou de proline induit une accumulation significative des solutés compatibles telles que la proline, la glycine betaïne et les sucres solubles et améliore l’activité antioxydante de la SOD, la CAT, l’ascorbate peroxydase et la glutathionne réductase. Par rapport aux plantes non traitées, le Si améliore aussi la teneur relative en eau, réduit le niveau de stress oxydant et rétablit par conséquent la croissance ainsi que l’activité photosynthétique des plantes stressées. De même, chez la plante modèle M. truncatula, l’application de la proline et de Si module l’expression des gènes codant des enzymes du métabolisme de la proline telles que la Pyroline-5-carboxylate synthétase 1 (P5CS1), la P5CS2, l’Ornithine aminotransférase, la Proline déshydrogénase 1 et la P5C déshydrogénase ainsi que le gène Low silicon 2 codant un transporteur du Si. L’apport exogène de Si et/ou de proline montre des effets améliorateurs plus importants quand ces deux molécules sont appliquées séparément chez M. sativa, alors que l’application combinée des deux molécules est plus bénéfique pour M. truncatula. Nos résultats démontrent que l’apport exogène de proline et/ou du Si présente un intérêt évident pour le développement d’une agriculture durable. Le développement de fertilisants enrichis en proline ou Si est fortement recommandé pour améliorer la productivité des cultures sous contraintes environnementales
The effects of silicon (Si) and/or proline on the tolerance to salt stress were investigated in alfalfa Medicago sativa L. and Medicago truncatula Gaertn. Two Moroccan M. sativa varieties, Oued Lmalah (OL) and Demnate 201 (Dm), and a European M. sativa variety NS Mediana ZMS V (NS Med) originating from Serbia were used. Experiments were carried out at different stages of development. Results showed that salt stress reduced seed germination and embryo viability and inhibited reserve mobilization, particularly in the NS Med variety. The restricted germination is concomitant with an oxidative stress reflected by high levels of malonyldialdehyde (MDA) and hydrogen peroxide (H2O2) and ionic toxicity indicated by lower K+/Na+ ratio. However, Si supply induces a significant accumulation of proline and improves seed germination, embryo viability and reserve mobilization. Si also triggers high catalase (CAT) and superoxide dismutase (SOD) activities and reduces MDA and H2O2 contents. During plant growth, salinity reduces plant growth and nodulation in all of the varieties. Growth restriction is accompanied by a significant decrease in leaf chlorophyll content, chlorophyll fluorescence (Fv/Fm) and stomatal conductance. Salinity also reduces plant nitrogen and K+ and increases Na+. Among the three alfalfa varieties, the European variety NS Med is the most affected. Exogenous supply of Si and proline results in a considerable accumulation of some compatible solutes, such as proline, glycine betaine and soluble sugars together with an enhanced antioxidant enzyme activity, such as SOD, CAT, ascorbate peroxidase and glutathione reductase. This improved leaf relative water content, reduced oxidative stress and therefore restores growth and photosynthetic activity of salt-stressed plants. Similarly, using the model legume M. truncatula, the application of proline and Si modulates the expression of genes encoding enzymes of proline metabolism, such as Pyroline-5-carboxylate synthetase 1 (P5CS1), P5CS2, Ornithine aminotransferase, Proline dehydrogenase 1, and P5C dehydrogenase as well as Low silicon 2 gene encoding a silicon transporter. In conclusion, separate application of proline and Si is more beneficial for improving M. sativa salt tolerance while the combined application of the two molecules is beneficial for M. truncatula

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Ben, Rejeb Kilani. "Implication des espèces réactives de l'oxygène (ero) dans la régulation de la capacité antioxydante et du métabolisme de la proline chez Arabidopsis Thaliana sous contraintes hydriques." Thesis, Paris 6, 2015. http://www.theses.fr/2015PA066307/document.

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Abstract:

La caractérisation de la réponse au sel d'un mutant d'A.thaliana déficient dans la synthèse de la proline (p5cs1-4) a montré que la salinité affecte de la même manière les relations hydriques et l'homéostasie ionique chez les deux génotypes. La pulvérisation foliaire de proline sous contrainte saline améliore la capacité antioxydante chez le mutant p5cs1-4 et rétablit sa croissance ainsi que son activité photosynthétique. L'analyse des relations entre la production précoce de H2O2 par la NADPH oxydase et la défense antioxydante chez A. thaliana soumise à la salinité a montré que l'exposition des plantes sauvages à 200 mM NaCl pendant 24 h conduit à une accumulation transitoire de H2O2, suivie d'une augmentation des activités des enzymes Catalases, Ascorbate peroxydases et Glutathione reductases. En présence de sel, le prétraitement des plantes par le DMTU, un chélateur de H2O2, ou le DPI et l'imidazole, deux inhibiteurs des NADPH oxydases, conduit à de faibles activités des enzymes antioxydantes. Le double mutant affiche également des activités faibles de ses enzymes antioxydantes. La meilleure performance des plantes sauvages par rapport aux mutants se traduisant par une meilleure aptitude de protéger ces tissus contre le stress oxydatif. En outre, l'accumulation de la proline est précédée par des niveaux élevés de H2O2 et l'utilisation de DMTU supprime l'accumulation de la proline chez les plantes soumises aux contraintes osmotiques. Les résultats ont montré également que de DPI, ainsi que des mutants knock-out conduisent à une inhibition de l'activité de l'enzyme-clé de la synthèse de la proline
Characterization of salt stress response in A. thaliana p5cs1-4 mutant defective in proline biosynthesis showed that no significant difference was observed in the leaf water status and Na+/K+ ratio between salt-treated WT and p5cs1-4 seedlings, suggesting that the salt hypersensitivity of the mutant was not due to the disruption of water uptake or Na+/K+ homeostasis. Foliar application of proline under salt stress increased the antioxidant activity in the p5cs1-4 mutant and restored its photosynthetic activity. The analysis of the relationship between the early production of H2O2 by the NADPH oxidase and the antioxidant defense in A. thaliana subjected to salinity showed that short-term salt exposure led to a transient and significant increase of H2O2 concentration, followed by a marked increase in Catalase, Ascorbate peroxidase and Glutathion reductase activities, pre-treatment with either dimethylthiourea, a chemical trap for H2O2, or two NADPH oxidase inhibitors such as imidazol and diphenylene iodonium, significantly decreased the above-mentioned enzyme activities under salinity. atrbohd/f double mutant plants failed to induce the antioxidant response under the culture conditions. The better performance of the WT was related to the plant ability to deal with the salt-induced oxidative stress as compared to atrbohd/f. In addition NaCl or mannitol stress resulted in a transient increase in H2O2 content followed by an accumulation of proline upon stress. In contrast DMTU and DPI were found to significantly inhibit proline accumulation. Expression level of the key enzyme involved in the biosynthesis of proline was observed to be diminished by DPI and in atrboh mutants

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Thiery, Laurent. "Etude de la régulation du métabolisme de la proline au cours d'un stress hyperosmotique chez Arabidopsis thaliana : rôle du calcium et des phospholipases D." Paris 6, 2003. http://www.theses.fr/2003PA066320.

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Parre, Elodie. "La signalisation lipidique et le métabolisme de la proline en réponse à des contraintes hydriques : rôles des phospholipases C et D chez Arabidopsis thaliana." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066213.

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Abstract:

Parmi les stratégies adaptatives que les plantes ont développées pour faire face aux contraintes hydriques, l’accumulation de proline est une réponse physiologique fréquemment observée chez un grand nombre d’espèces. Alors que le métabolisme de ce soluté compatible a été relativement bien caractérisé, les voies de signalisation impliquées dans sa régulation restent en grande partie inconnues. Par une approche pharmacologique, nous avons mis en évidence l’existence d’un contrôle positif de la biosynthèse de la proline par les phospholipases C – et la synthèse d’ IP3 – en réponse au NaCl et non au mannitol. D’autre part, nos données montrent l’importance du niveau de calcium intracellulaire et non de la signature calcique lors de la réponse prolinique. Au cours de ces dernières années, nous avons montré que la biosynthèse de la proline était régulée négativement par une activité PLD en conditions de croissance favorable. À la lumière de ces résultats, nous avons concentré nos efforts sur les PLD1 et PLD2 qui, parmi les douze isoformes de PLD végétales, sont les seules présentant une activité calcium-indépendante. Par une approche de génétique inverse, nous avons obtenu et caractérisé des mutants d’insertion pour les gènes PLD1 et PLD2. Bien que les niveaux de proline chez ces mutants ne soient pas affectés, ils présentent néanmoins des phénotypes très intéressants au niveau de la capacité de germination et de croissance racinaire en conditions de stress hydrique. Enfin, ce travail nous a permis de montrer que les plantes sont capables de discerner un stress salin d’un stress hyperosmotique par des voies de signalisation spécifiques.

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Zheng, Yao. "Identification of interacting mitochondrial enzymes involved in pyrroline-5-carboxylate metabolism in Arabidopsis thaliana." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2021. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2021SORUS269.pdf.

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Abstract:

La proline, acide aminé protéinogène, joue un rôle crucial dans le métabolisme cellulaire. Dans les mitochondries, la proline est oxydée en glutamate par l'action séquentielle de la proline déshydrogénase (ProDH) et de la pyrroline-5-carboxylate (P5C) déshydrogénase (P5CDH). L'ornithine-δ-aminotransférase (δOAT) participe également à la formation de P5C via la conversion de l'ornithine et de l’α -cétoglutarate en glutamate et P5C. L’utilisation de mutants et d’approches biochimiques a révélé que ProDH1, P5CDH et δOAT sont impliquées dans la sénescence des feuilles induite à l'obscurité (DIS) chez Arabidopsis thaliana. Une accumulation importante de P5C et de proline est observée chez le mutant p5cdh et, dans une moindre mesure chez le mutant prodh1prodh2, suggérant un cycle proline-P5C. Les mutants prodh1prodh2 et p5cdh ont un profil métabolomique similaire qui diffère de celui du WT et de oat, démontrant ainsi le rôle de l'oxydation de la proline au cours de la sénescence. Nous avons montré que ProDH1 est essentiellement associée à la membrane mitochondriale, tandis que P5CDH et δOAT sont plus uniformément réparties entre la matrice et la membrane. L’oligomérisation de ProDH1, P5CDH et δOAT a été révélée à l'aide d’une analyse de complémentation bimoléculaire de fluorescence (BiFC). Les interactions entre ces enzymes du métabolisme du P5C ont été confirmées par des approches de protéomique couplée à la MS en condition de sénescence chez A. thaliana. Ces trois enzymes forment un(des) complexe(s) impliqué(s) dans l'oxydation de la proline pour alimenter la chaîne de transfert d'électrons mitochondriale afin de pourvoir aux besoins énergétiques des cellules sénescentes
The proteinogenic amino acid proline plays a crucial role for cellular metabolism in living organisms. In mitochondria, proline is oxidized to glutamate by the sequential action of proline dehydrogenase (ProDH) and pyrroline-5-carboxylate (P5C) dehydrogenase (P5CDH). In addition, ornithine δ-aminotransferase (δOAT) also participates in P5C formation through the conversion of ornithine and α-ketoglutarate into glutamate and P5C. Using mutants and biochemical approaches, ProDH1, P5CDH and δOAT were shown to be involved during dark-induced leaf senescence (DIS) in Arabidopsis thaliana. Striking accumulation of P5C and proline was observed in p5cdh mutant and to a lesser extent in prodh1prodh2 mutant, suggesting a putative proline-P5C cycle. Metabolomic analysis indicated that prodh1prodh2 and p5cdh have a similar metabolomic profile, but significantly different from wild-type and oat mutant, demonstrating the role of proline oxidation during DIS. ProDH1 was shown to be preferentially associated to the mitochondrial membrane fraction, while P5CDH and δOAT are more evenly distributed between matrix and membrane fractions. Homo- and hetero-oligomerizations of ProDH1, P5CDH, and δOAT were revealed using Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) assay of infiltrated tobacco leaves. Interactions between P5C metabolism enzymes were further highlighted in DIS leaves using proteomics approaches coupled with mass spectrometry. Our work demonstrates that these three enzymes form P5C metabolic complex(es) involved in the oxidation of proline to fuel mitochondrial electron transfer chain to support the energy needs of senescent cells

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Gouirand, Victoire. "Etude de la reprogrammation des voies métaboliques des acides aminés au cours de la carcinogenèse pancréatique." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0673.

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Abstract:

La progression maligne de l’adénocarcinome canalaire pancréatique (ADKP) s'accompagne d'une profonde réaction desmoplasique, limitant la vascularisation de la tumeur et de fait privant les cellules tumorales en nutriments, forçant les cellules tumorales à adapter leur métabolisme. L’objectif de thèse était de définir les changements métaboliques relatifs à l’ADKP. Par une analyse transcriptomique des tumeurs pancréatiques développées de manière spontanée chez les souris, nous avons établi le profil métabolique des ADKPs lié aux acides aminés au cours de leur progression. Ainsi, nous avons montré que les voies métaboliques de la proline et des acides aminés à chaînes branchées, en particulier le catabolisme de la leucine, sont celles étant les plus dérégulées dans l’ADKP. Concernant le métabolisme de la proline, nous avons montré que les cellules tumorales privées en nutriments capturent et utilisent le collagène, produit par les fibroblastes du stroma tumoral grâce à la macropinocytose, de façon le dégrader en proline. Aussi, l’inhibition de la dégradation de la proline entraine une diminution de la prolifération tumorale in vitro et in vivo. Concernant la leucine, nous montrons que l’élément clé de ce métabolisme est un de ces produits de dégradation finaux à savoir le β-hydroxybutyrate (βOHB) dont la production repose sur une enzyme cruciale : HMGCL. Dans nos travaux, nous démontrons que la suppression d’HMGCL dans les cellules d’ADKP humains entrave leurs capacités oncogéniques et métastatiques in vitro et in vivo. De plus, nous montrons in vivo que le βOHB augmente la croissance tumorale ainsi que la formation de métastases
The malignant progression of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is accompanied by a profound desmoplasia, depriving tumor cells from oxygen and nutrients, which forces tumor cells to adapt their metabolism to proliferate. The thesis purpose is to define the metabolic changes related to ADKP. Using a transcriptomic analysis of PDAC from mice model, we established the PDAC metabolic profile. Focusing on amino acid metabolic pathways, we identified the metabolic pathways of proline and the branched-chain amino acid, especially the leucine catabolism, as the most deregulated in ADKP compared to the normal pancreas. We demonstrated that tumor cells take up collagen-derived fibroblasts, thanks macropinocytosis, when they are nutrient deprived. Once collagen is internalized, its subsequent digestion supplies TCA with proline. Also, inhibition of proline degradation leads to a decrease in tumor proliferation in vitro and in vivo. We have shown leucine catabolism is specific to tumor cells and the final degradation products: the β-hydroxybutyrate (βOHB) appears as a key element of this metabolism. To produce βOHB, tumor cells use HMGCL, a crucial enzyme involved in leucine degradation. In our work we demonstrated that HMGCL suppression in PDAC cells decreases their oncogenic and metastatic capacities in vitro and in vivo. In addition, we have demonstrated in vivo that βOHB increases tumor growth and metastasis formation. Thus, our works show 1/ the metabolic plasticity of cells, 2/the influence of microenvironment on tumor cell metabolism, 3/ the importance to study tumor metabolism for the finding of new therapeutic targets

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Thivolle-Cazat, Alain. "Dynamique de l'azote dans les jeunes plants d'épicea commun (Picea Abies (L. ) Karsten)." Nancy 1, 1992. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_1992_0014_THIVOLLE_CAZAT.pdf.

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Abstract:

L'absorption, la répartition, la remobilisation et la redistribution de l'azote a été étudiée sur de jeunes plants d'épicéa commun de 1 à 3 ans issus de boutures. Tout au long de la saison de végétation, quatre périodes ont été caractérisées. - au printemps, les 5 semaines qui suivent le débourrement, l'absorption de l'azote est très faible. Une grande proportion de l'azote des organes anciens est remobilisée pour la formation des nouveaux organes de la partie aérienne. - au début de l'été, de la 6eme à la 10eme semaine après le débourrement, la remobilisation de l'azote ancien cesse sauf dans les racines dont la croissance est très active. L'importante absorption d'azote permet la croissance des jeunes organes (tiges, feuilles et racines). En plein été (juillet, aout, septembre), l'absorption de l'azote est très intense au profit des racines, des tiges et de la pousse d'aout. En automne, l'absorption de l'azote diminue de nouveau mais la remobilisation de l'azote dans les feuilles permet la croissance des racines et des tiges. Le suivi de l'évolution des acides aminés dans l'azote soluble permet de voir que la plante passe d'une alimentation basée sur des réserves en automne et en hiver (arginine et proline) à une alimentation basée sur l'azote absorbé dans le sol (glutamine et asparagine).

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Ben, Rejeb Kilani. "Implication des espèces réactives de l'oxygène (ero) dans la régulation de la capacité antioxydante et du métabolisme de la proline chez Arabidopsis Thaliana sous contraintes hydriques." Electronic Thesis or Diss., Paris 6, 2015. https://accesdistant.sorbonne-universite.fr/login?url=https://theses-intra.sorbonne-universite.fr/2015PA066307.pdf.

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Abstract:

La caractérisation de la réponse au sel d'un mutant d'A.thaliana déficient dans la synthèse de la proline (p5cs1-4) a montré que la salinité affecte de la même manière les relations hydriques et l'homéostasie ionique chez les deux génotypes. La pulvérisation foliaire de proline sous contrainte saline améliore la capacité antioxydante chez le mutant p5cs1-4 et rétablit sa croissance ainsi que son activité photosynthétique. L'analyse des relations entre la production précoce de H2O2 par la NADPH oxydase et la défense antioxydante chez A. thaliana soumise à la salinité a montré que l'exposition des plantes sauvages à 200 mM NaCl pendant 24 h conduit à une accumulation transitoire de H2O2, suivie d'une augmentation des activités des enzymes Catalases, Ascorbate peroxydases et Glutathione reductases. En présence de sel, le prétraitement des plantes par le DMTU, un chélateur de H2O2, ou le DPI et l'imidazole, deux inhibiteurs des NADPH oxydases, conduit à de faibles activités des enzymes antioxydantes. Le double mutant affiche également des activités faibles de ses enzymes antioxydantes. La meilleure performance des plantes sauvages par rapport aux mutants se traduisant par une meilleure aptitude de protéger ces tissus contre le stress oxydatif. En outre, l'accumulation de la proline est précédée par des niveaux élevés de H2O2 et l'utilisation de DMTU supprime l'accumulation de la proline chez les plantes soumises aux contraintes osmotiques. Les résultats ont montré également que de DPI, ainsi que des mutants knock-out conduisent à une inhibition de l'activité de l'enzyme-clé de la synthèse de la proline
Characterization of salt stress response in A. thaliana p5cs1-4 mutant defective in proline biosynthesis showed that no significant difference was observed in the leaf water status and Na+/K+ ratio between salt-treated WT and p5cs1-4 seedlings, suggesting that the salt hypersensitivity of the mutant was not due to the disruption of water uptake or Na+/K+ homeostasis. Foliar application of proline under salt stress increased the antioxidant activity in the p5cs1-4 mutant and restored its photosynthetic activity. The analysis of the relationship between the early production of H2O2 by the NADPH oxidase and the antioxidant defense in A. thaliana subjected to salinity showed that short-term salt exposure led to a transient and significant increase of H2O2 concentration, followed by a marked increase in Catalase, Ascorbate peroxidase and Glutathion reductase activities, pre-treatment with either dimethylthiourea, a chemical trap for H2O2, or two NADPH oxidase inhibitors such as imidazol and diphenylene iodonium, significantly decreased the above-mentioned enzyme activities under salinity. atrbohd/f double mutant plants failed to induce the antioxidant response under the culture conditions. The better performance of the WT was related to the plant ability to deal with the salt-induced oxidative stress as compared to atrbohd/f. In addition NaCl or mannitol stress resulted in a transient increase in H2O2 content followed by an accumulation of proline upon stress. In contrast DMTU and DPI were found to significantly inhibit proline accumulation. Expression level of the key enzyme involved in the biosynthesis of proline was observed to be diminished by DPI and in atrboh mutants

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Paulhe, Frédérique. "Régulation différentielle du métabolisme des phosphoinositides par les intégrines αvβ3 et αvβ5 lors de la migration des cellules musculaires lisses." Paris 7, 2002. http://www.theses.fr/2002PA077140.

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Ghars, Mohamed Ali. "Étude de la variabilité physiologique de la réponse au sel et caractérisation de voies de signalisation impliquées dans la régulation du métabolisme de la proline en réponse à des contraintes hydriques chez Thellungiella halophila et Arabidopsis thaliana." Paris 6, 2008. http://www.theses.fr/2008PA066157.

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Abstract:

En réponse à des contraintes saline ou hyperosmotique, la plupart des plantes accumulent des osmolytes, tels que la proline, qui joue un rôle dans l’adaptation de la plante. Le métabolisme de la proline est relativement bien caractérisé au niveau moléculaire mais les mécanismes de transduction du signal stress hydrique conduisant à la synthèse de la proline restent encore peu décrits. L’objectif de ce travail a été d’identifier et de caractériser les voies de signalisation impliquées dans la régulation du métabolisme de la proline en réponse à des contraintes hydriques. Nous avons ciblé notre travail sur deux modèles végétaux, Arabidopsis thaliana, une plante glycophyte, et Thellungiella halophila, une plante halophyte. Dans un premier temps, nous nous sommes intéressés à l’étude de la variabilité de la réponse éco-physiologique chez deux espèces cultivées sur sable inerte, irrigué d’une solution comportant des concentrations croissantes en NaCl. Les résultats obtenus montrent que T. Halophila est l’espèce la plus tolérante au sel tandis que le mutant d’A. Thaliana eskimo1 est le plus sensible malgré la suraccumulation de proline. Ceci démontre que cet acide aminé a lui seul est insuffisant pour conférer à ce mutant une tolérance à la contrainte. La tolérance de T. Halophila est due à plusieurs processus adaptatifs qui reposent sur une forte accumulation de la proline et une haute sélectivité d’absorption racinaire de K+ par rapport à Na+. Dans la seconde partie de ce travail, nous avons étudié les voies de signalisation lipidiques impliquées dans la régulation du métabolisme de la proline. A cet effet, de jeunes plantes d'A. Thaliana et de T. Halophila ont été soumises à des inhibiteurs spécifiques des voies de signalisation médiées par les phospholipases D (PLDs) et les phospholipases C (PLCs). Chez A. Thaliana quand l’activité des PLDs est détournée, les plantes montrent un niveau plus élevé en proline. En revanche, les PLDs n'ont aucun effet sur l'accumulation de la proline dans les conditions de non-stress chez T. Halophila. Lors de contrainte hydrique, les PLDs n’ont aucun effet sur le métabolisme de la proline chez A. Thaliana alors que les niveaux de proline sont diminués chez T. Halophila. Les résultats montrent que les phospholipases D sont des régulateurs négatifs du métabolisme de la proline en l’absence de stress chez A. Thaliana et régulent positivement la biosynthèse de cet acide aminé en condition de stress chez T. Halophila. D'autre part, nous avons pu montrer que les PLCs exercent un contrôle positif chez A. Thaliana en présence de 200 mM NaCl ainsi que chez T. Halophila en présence de 400 mM NaCl ou de mannitol. En absence de stress ou en présence d’un stress salin modéré, les PLCs exercent un contrôle négatif sur la voie de biosynthèse de la proline chez T. Halophila. En conclusion, nos données suggèrent l'implication des PLCs et des PLDs dans la régulation du métabolisme de la proline chez A. Thaliana et T. Halophila, mais d'une façon opposée. Ce travail nous permet de présenter un modèle original de régulation du métabolisme de la proline chez ces deux plantes modèles.

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Hsueh, Li-Ching. "Studies on proline hydroxylases." Thesis, University of Oxford, 2000. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.365805.

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KuÌˆllchen, Felix B. "Studies on proline 3-hydroxylase." Thesis, University of Oxford, 2002. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.269221.

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Schulz, Daniel [Verfasser]. "L-Proline and Glutamatergic Neurotransmission : Clarifying the Modulatory Role of Neuronal L-Proline Transporter / Daniel Schulz." Bonn : Universitäts- und Landesbibliothek Bonn, 2012. http://d-nb.info/1044971096/34.

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Lawrence, Christopher C. "Studies on bacterial proline 4-hydroxylase." Thesis, University of Oxford, 1993. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.358610.

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Hu, Chien-an Andy. "Osmoregulation and proline biosynthesis in plants /." The Ohio State University, 1993. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1487843688956923.

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Townsend, David E. Wilkinson Brian J. "Proline transport and biosynthesis in Staphylococcus aureus." Normal, Ill. Illinois State University, 1992. http://wwwlib.umi.com/cr/ilstu/fullcit?p9311291.

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Abstract:

Thesis (Ph. D.)--Illinois State University, 1992.
Title from title page screen, viewed February 6, 2006. Dissertation Committee: Brian J. Wilkinson (chair), Radheshyam Jayaswal, Herman E. Brockman, Robert L. Preston, Philip D. Morse. Includes bibliographical references (leaves 107-112) and abstract. Also available in print.

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Habibi-Najafi, Mohammad B. (Mohammad Bagher). "Proline-specific peptidases from Lactobacillus casei subspecies." Thesis, McGill University, 1994. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=28455.

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Abstract:

The objectives of this study were (l) to screen out active proline-specific peptidases from Lactobacillus casei subspecies, (2) to study growth kinetic and enzyme production from enriched medium (MRS) and cheese whey medium, (3) to purify and characterize two active proline-specific enzymes, and (4) to investigate the action of purified enzyme on bitter tryptic digests of $ beta$-casein as well as bitter enzyme-modified cheese. Lactobacillus casei subsp. casei LLG and Lactobacillus casei subsp. rhamnosus S93 were examined for extra- and intra-cellular proline-specific peptidase activities. Both strains showed strong activity for x-prolyl dipeptidyl peptidase and proline iminopeptidase but had weak activities for prolidase, prolinase, and post proline endopeptidase. Histochemical staining of crude enzyme extract from Lactobacillus casei ssp. casei LLG with different substrates revealed a distinct protein band for x-prolyl dipeptidyl peptidase as well as for proline iminopeptidase. The growth kinetics showed that the intracellular proline-specific peptidases increased gradually at the beginning of the exponential phase and reached a maximum at the beginning of stationary phase.
Storage stability of x-prolyl dipeptidyl peptidase and proline iminopeptidase in crude extract, with and without stabilizers showed no significant loss in activity of these two enzymes at 4$ sp circ$C for 9 days without adding any stabilizers. The levels of x-prolyl dipeptidyl peptidase, proline iminopeptidase, and post proline endopeptidase activities of cells grown in whey did not vary markedly from cells grown in MRS broth. X-prolyl dipeptidyl peptidase and proline iminopeptidase were purified from crude cell-free extract of Lactobacillus casei ssp. casei LLG by Fast Protein Liquid Chromatography (FPLC) equipped with ion-exchange and gel-filtration columns. X-prolyl dipeptidyl peptidase was found to be a serine-dependent enzyme with molecular mass of 79 kDa. The pH and the temperature optima by the purified enzyme were 7.0 and 50$ sp circ$C, respectively. Proline iminopeptidase was sulfhydryl enzyme with molecular mass of 46 kDa. The maximum enzyme activity was observed at pH 7.5 and 40$ sp circ$C. This is the first report describing the purification and characterization of x-prolyl dipeptidyl peptidase and proline iminopeptidase from Lactobacillus casei to homogeneity.
The debittering of tryptic digests from $ beta$-casein by x-prolyl dipeptidyl peptidase was studied by reversed phase high performance liquid chromatography (RP-HPLC) and liquid chromatography/mass spectrometry. The results showed that two bitter peptides (f53-97 and f03-209) containing X-Pro-Y-Pro in their amino acid residues were completely hydrolyzed and many other peptides with high hydrophobicity were decreased in peak area. The addition of purified x-prolyl dipeptidyl peptidase on bitter enzyme-modified cheese (EMC) also showed that at least one bitter peptide with X-Pro-Y derived from $ alpha$-casein hydrolysis was removed.

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Walters, Nicola Jane. "Arginine and proline catabolism in Schizosaccharomyces pombe." Thesis, University of Cambridge, 1988. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.257192.

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Robinson, Kenneth J. "Bio-organic studies on proline 4-hydroxylase." Thesis, University of Oxford, 1996. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.320660.

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Jones, Iwan Gwynedd. "Desymmetrization of meso-anhydrides by proline esters." Thesis, Bangor University, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.265515.

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Daly, D. J. "Post-proline cleaving enzymes in skeletal muscle." Thesis, University of Newcastle Upon Tyne, 1985. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.304040.

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D'Rozario, Robert S. G. "Conformational dynamics of proline-containing transmembrane helices." Thesis, University of Oxford, 2006. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.670181.

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Pike, Claire Victoria Sarah. "The proline isomerase FKBP25 as a chromatin modifier." Thesis, University of Cambridge, 2010. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/252175.

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Verbruggen, Nathalie. "Proline accumulation after salt-stress in arabidopsis thaliana." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1992. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/212895.

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Dikic, Inga. "Signal Transduction by Proline-Rich Tyrosine Kinase Pyk2." Doctoral thesis, Uppsala : Acta Universitatis Upsaliensis : Univ.-bibl. [distributör], 2002. http://publications.uu.se/theses/91-554-5316-3/.

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Norris, Simon Richard. "Studies towards the synthesis of useful proline derivatives." Thesis, University of Southampton, 1992. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.315897.

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Bess, Kirstin. "Transcriptional repression by the proline rich homeodomain protein." Thesis, University of Bristol, 2001. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.390994.

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Omar, Muhiadin. "Biotransformations of proline by 2-oxoglutarate-dependent hydroxylases." Thesis, University of York, 2017. http://etheses.whiterose.ac.uk/19532/.

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Abstract:

Hydroxylases introduce hydroxyl groups with excellent regio- and enantioselectivity making them of significant interest for use in the production of pharmaceutical intermediates and drug metabolites. 2-oxoglutarate dependent oxygenases (2OGDOs) are non-haem dependent Fe(II) containing enzymes that catalyse various oxidation reactions, including the hydroxylation of free amino acids. Unlike the more studied cytochromes P450, these enzymes only require molecular oxygen, Fe(II) and 2-oxoglutarate for catalysis, circumventing the need for a costly cofactor regeneration system. The targets of this work were three proline hydroxylases: a trans-4-proline hydroxylase from Dactylsporangium sp. RH1 (DOGDH), a cis-3-proline-hydoxylase from Streptomyces sp. (StP3H) and a cis-4-proline-hydroxylase from Mesorhizobium loti (MlC4H). Genes encoding all three were cloned into the pET-YSBLIC3C (and pET22b for DOGDH) expression vectors, expressed in Escherichia coli, and produced and purified by chromatography for use in crystallisation studies and enzymatic transformations. Extensive crystallisation trials were attempted for DOGDH including enzymatic, chemical and mutagenic modification with little success. A homology model was therefore constructed in order to identify catalytic residues within the active site that could be manipulated for enhancing the function of DOGDH. A precolumn derivatisation assay using FMOC-Cl was developed for the analysis of proline and its hydroxylated equivalents by HPLC and LC-MS. Biotransformations were performed with L-proline using the three hydroxylases with whole cell reaction conditions deemed optimal due to the multi-component nature of the enzymes, with the cell providing machinery for the recycling of cofactors. Reactions were scaled from shake flasks to stirred tank vessels with the flow of air into the vessel and stirring rate deemed key parameters for optimal function. Finally, a high-throughput substrate screening method using a BioLecter micro-bioreactor was successfully developed and trialled with the three hydroxylases with a panel of substrates providing a platform for future investigations.

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Shibasaki, Takeshi. "SCREENING AND APPLIED STUDIES OF MICROBIAL PROLINE HYDROXYLASES." Kyoto University, 2001. http://hdl.handle.net/2433/150792.

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White, Tommi Anna. "Structural and functional studies of proline catabolic enzymes." Diss., Columbia, Mo. : University of Missouri-Columbia, 2007. http://hdl.handle.net/10355/4760.

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Abstract:

Thesis (Ph.D.)--University of Missouri-Columbia, 2007.
The entire dissertation/thesis text is included in the research.pdf file; the official abstract appears in the short.pdf file (which also appears in the research.pdf); a non-technical general description, or public abstract, appears in the public.pdf file. Title from title screen of research.pdf file (viewed on March 24, 2009) Vita. Includes bibliographical references.

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UEDA, Akihiro, Weiming SHI, Takiko SHIMADA, Hiroshi MIYAKE, and Tetsuko TAKABE. "Altered expression of barley proline transporter causes different growth responses in Arabidopsis." Springer, 2007. http://hdl.handle.net/2237/8780.

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Eriksen, Heidi Sofie. "The synthesis and use of polymer supported Î² amino sulfur containing catalysts." Thesis, University of Strathclyde, 2000. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.248596.

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Nguyen, Thi-Huong. "Synthèse de nouveaux catalyseurs chiraux à base de la L-proline. Applications en catalyse asymétrique." Thesis, Paris 11, 2014. http://www.theses.fr/2014PA112382.

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Abstract:

Depuis de nombreuses années, les phosphines chirales multifonctionnelles se sont révélées être des outils synthétiques puissants en organocatalyse asymétrique. Ces catalyseurs qui contiennent un site de base de Lewis et un site d'acide de Bronsted, ont reçu une attention particulière en raison de leur efficacité pour créer des liaisons C-C avec de très bonnes énantiosélectivités. A notre connaissance, la synthèse d'organocatalyseurs de type thiourée-phosphine dérivés de la (L)-proline n'a jamais été décrite dans la littérature. Ce sujet de thèse concerne la synthèse d'une nouvelle famille d'organocatalyseur chiral de type thiourée-phosphine dérivée de (L)-proline, un produit naturel, disponible et peu coûteux. Nous avons mis au point plusieurs méthodes de synthèse efficaces qui nous ont permis de préparer trois familles de phosphines-thiourées à partir de la (L)- proline. Ainsi, sept nouveaux composés énantiopurs ont été préparés au cours de ce travail. Ces composés ont été utilisés comme catalyseurs dans des réactions asymétriques catalysées par des phosphines. Ces réactions incluent la cyclisation [3+2], la réaction de Baylis-Hillman, la réaction de Friedel-Crafts, la réaction de substitution nucléophile
For many years, multifunctional chiral phosphines have proven to be powerful synthetic tools in asymmetric organocatalysis. These catalysts, containing Lewis basic and Brnsted acidic sites, have received considerable attention owing to their highly efficiency to create C-C bond by asymmetric organocatalysis. To our knowledge, the synthesis of organocatalysts type thiourea-phosphine derivatives (L) -proline have never been described in the literature. In this work, we wish to report the synthesis of new family of bifunctional chiral thiourea-phosphine organocatalyst derived from L-proline, a natural available product. We developed efficient methods to prepare three families of phosphine thiourea derived from L-proline. Thus, Seven new enantiopure compounds were synthesized in this study. They were used as catalyst asymmetric reaction catalyzed by phosphines: [3+2] cyclisation, Baylis-Hillman reaction, Friedel-Crafts reaction and nucleophilic substitution

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Picard, François J. "Genetics of arginine and proline biosynthesis in Neisseria gonorrhoeae." Thesis, University of Ottawa (Canada), 1991. http://hdl.handle.net/10393/7669.

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Abstract:

The carAB operon from E. coli hybridized with the gonococcal clones carrying carA or carB genes under conditions of high stringency (i.e. detecting approximately 80% or greater similarity) suggesting that the nucleotide sequence of the carbamoylphosphate synthetase genes is very similar in these two organisms. Under these conditions for hybridization, the gonococcal clones carrying argB or argF genes did not hybridize with plasmids containing the corresponding E. coli gene. Hybridizations performed under conditions of lower stringency indicate that the nucleotide sequence of the argB gene is less conserved than that of argF in E. coli and N. gonorrhoeae. Co-complementation experiments established gene linkage only between carA and carB and between proA and proB gonococcal genes. Clones complementing a gene defect in argE were also able to complement an argA mutation. This suggests that the enzyme ornithine acetyltransferase from N. gonorrhoeae (encoded by argJ) may be able to complement both argA and argE mutations in E. coli. The prevalence of specific arginine biosynthesis gene defects was studied for 319 arginine-requiring clinical isolates of Neisseria gonorrhoeae by using the ability of the strains to utilize intermediates of arginine biosynthesis. Nearly 99% of the strains were defective either in the conversion of acetylornithine to ornithine (174 strains) or in the conversion of ornithine to citrulline (141 strains). Based on a nutritional requirement for carbamoyl phosphate, only 11% of the uracil-requiring strains defective in the carbamylation of ornithine to yield citrulline were apparently defective in carAB. Three argininosuccinate-requiring strains (i.e. probably defective in argG) of auxotype PAU were identified. A high polymorphism was observed in hybridization patterns of restricted genomic DNA from N. gonorrhoeae strains having the same auxotype and serotype with a gonococcal CPSase gene-specific probe suggesting that this probe may provide a useful epidemiological marker for N. gonorrhoeae. Some of the arginine auxotrophs of N. gonorrhoeae defective in carAB, argJ, argF or argG were complemented by genetic transformation with DNA from recombinant bacteriophages carrying characterized gonococcal arginine biosynthesis genes. Gene defects in proA (5 strains) and in proB (6 strains) were identified by gonococcal transformation assays with recombinant bacteriophages or plasmids carrying proline biosynthesis genes from N. gonorrhoeae. None of the eleven proline-requiring strains tested appears to be defective in proC. Polymerase chain reaction (PCR) amplifications using oligonucleotides specific to conserved areas of the E. coli carAB operon yielded amplified copies of various portions of the N. gonorrhoeae CPSase genes. Amplifications using primers specific to the duplicated region of the E. coli carB gene suggest that the gonococcal carB gene contains a similar duplication. (Abstract shortened by UMI.)

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Digennaro, Angela [Verfasser]. "Proline-Quaterthiophene hybrids: Synthesis and self-assembly / Angela Digennaro." Ulm : Universität Ulm, 2017. http://d-nb.info/112490249X/34.

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Wood, Nicholas James. "The role of proline in osmoregulation by a streptomycete." Thesis, University of Warwick, 1996. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.319812.

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Murray, Nicola Jane. "NMR studies of salivary proline-rich proteins and tannins." Thesis, University of Sheffield, 1994. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.284595.

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Swingler, Tracey. "Transcriptional repression by the proline rich homeodomain protein (PRH)." Thesis, University of Bristol, 2005. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.419215.

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Roosens, Nancy. "Proline biosynthesis related to salt stress in higher plants." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1999. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211926.

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Obayashi, Yoko. "Novel physiological function of proline and mTOR regulator tuberin." Kyoto University, 2018. http://hdl.handle.net/2433/232154.

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Aillard, Boris. "Small molecule mimics of trans-proline : synthesis and applications." Thesis, University of Southampton, 2014. https://eprints.soton.ac.uk/367097/.

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Abstract:

Herein we detail the synthesis and application of small molecules of trans-proline mimics. A general introduction to the field of peptidomimetics and their uses in specific biological examples is provided; followed by a detailed review of the background and objectives of the project. The synthesis of trans-proline mimics using (–)-cytisine as a building block is disclosed. Its application is demonstrated by incorporation of (–)-cytisine derivatives in a specific anti-cancer peptide PRGPRP and determination of its anti-cancer activity. The synthesis and conformational analysis of a pyroglutamate based mimic, a trans-proline mimic designed to adopt a polyproline type II (PPII) helical conformation, is described. Incorporation of this mimic in the anti-cancer peptide PRGPRP and determination of its anti-cancer activity displays a useful application. To investigate the conformation of the pyroglutamic based mimic, synthesis and conformational analysis of its oligomers is detailed. Using circular dichroism (CD) spectroscopy, NMR and X-ray crystallographic structures, the PPII conformation of these oligomers are compared to the ideal PPII helices and known PPII mimics. A specific protein-ligand interaction (SH3-peptide ligand) is discussed. Incorporation of the pyroglutamic based mimic in the peptide sequence and its binding properties are disclosed. As a result of these studies, a second generation pyroglutamate based mimic is currently under development in the group to further investigate conformational analysis and binding properties with SH3.

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Voss, Emelyne. "Synthèse d’Analogues Bis-azotés de la Proline et Applications." Thesis, Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2011. http://www.theses.fr/2011INPL059N/document.

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Abstract:

La liaison peptidique au sein d’un peptide ou d’une protéine est d’ordinaire plane et en conformation trans pour la majorité des acides aminés. La situation est un peu différente en amont d’une proline : la barrière thermodynamique qui s’oppose à la rotation de la liaison amide est plus faible et la tendance de la liaison à rester plane est un peu moins grande. Cette liaison AA-Pro peut donc adopter une conformation cis, entraînant la formation d’un coude prononcé dans une chaîne peptidique à son niveau. Ce travail décrit la synthèse et la réactivité chimique de nouveaux analogues bis-azotés de la proline en solution permettant de favoriser la conformation cis d’une liaison AA-ΨPro. L’impact conformationnel que peut engendrer ces résidus au sein de pseudopeptides est également exposé. Dans un premier temps, une nouvelle voie d’accès à la α-azaproline énantiomériquement pure et orthogonalement protégée a été mise au point en exploitant des travaux antérieurs concernant la synthèse d’α-hydrazinoesters et de N-aminodipeptides. L’étude de la réactivité de cette pseudoproline a permis de définir les meilleures conditions de formations de pseudotripeptides de formule P1-AA1-δ-azaPro-AA3-P3. Elle a également orienté les travaux, dans un second temps, vers la synthèse de pseudopeptides incorporant un motif acide pyrazolique. Enfin, la structure des composés préparés a été analysée par RMN, IR et par modélisation moléculaire. L’examen des P1-AA1-δ-azaPro(Boc)-AA3-P3 a révélé la formation par liaison hydrogène d’un pseudocycle en C7, favorisant la conformation trans de la liaison AA1-δ-azaPro, alors que l’absence de la fonction Boc favorise la conformation cis de cette liaison
The peptidic bond in a peptide or a protein is usually flat and in trans conformation for the majority of amino acids. The situation is a little bit different upstream the proline: the thermodynamic barrier which opposes the rotation of the amide bond is weaker and the tendency of the bond to remain flat is lesser. So, this AA-Pro bond can adopt a cis conformation, leading to the formation of a turn in the peptidic chain. This work describes the synthesis and the chemical reactivity of new bis-nitrogen analogous of proline in solution to facilitate the cis conformation of a AA-PΨPro bond. The conformational impact that these residues may generate in pseudopeptides is also exposed.Initially, a new access road to the orthogonally protected and enantiomerically pure δ-azaproline has been developed by exploiting previous work on the synthesis of α- hydrazinoesters and N-aminodipeptides. The study of the reactivity of this pseudoproline helped define the best conditions for forming pseudotripeptides of formula P1-AA1--δ-azaPro-AA3-P3. It also guided the work, in a second step, towards the synthesis of pseudopeptide incorporating a pyrazole acid motif. Finally, the structure of the prepared compounds was analyzed by NMR, IR and molecular modeling. Examination of the P1-AA1-δ-azaPro(Boc)-AA3-P3 revealed the formation of a pseudocycle C7 by a Hydrogen bond, favoring the trans conformation of the AA1-δ-azaPro bond, while the absence of Boc function seems to favor the cis conformation of this bond

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Voinchet, Anne. "Métabolisme du cristallin." Paris 5, 1990. http://www.theses.fr/1990PA05P053.

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Zhang, Min. "Crystallographic studies of the E. coli puta proline dehydrogenase domain /." free to MU campus, to others for purchase, 2004. http://wwwlib.umi.com/cr/mo/fullcit?p1426119.

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Lilley, Ian Andrew. "Synthetic studies using chiral stabilised azomethine ylids." Thesis, University of Oxford, 1995. https://ora.ox.ac.uk/objects/uuid:64d5745b-e6ef-4a77-8abe-b01f1c627e8f.

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Abstract:

The work described herein is concerned with the [3+2] dipolar cycloaddition of amino acid derived azomethine ylids. Such cycloadditions are a highly efficient technique for the construction of proline derivatives, and may potentially be employed in other areas of asymmetric synthesis. Chapter 1 commences with a brief review of natural and synthetic, proline containing, molecules. Approaches to the synthesis of the proline moiety are described, focusing on previously developed methods for performing the [3+2] dipolar cycloaddition in a chiral manner. The methodology employed in this thesis is subsequently detailed, along with a brief description of the aims of the work. This is followed by a review of Î±-amino acid synthesis via chiral template technology. The potential application of chiral [3+2] dipolar cycloadditions to such syntheses is introduced. Chapter 2 describes the cycloaddition of carboxylate substituted chiral azomethine ylids with a range of dipolarophiles under both thermal and Lewis acid catalysed conditions. The effect on the stereoselectivity and yield caused by changing the conditions is discussed. Subsequent removal of the chiral template allows the synthesis of some tetra-substituted proline derivatives. Chapter 3 details the intramolecular variant of the cycloaddition. Further functionalisation of the cycloadducts via insertion of alternative chain links and sulfone alkylation was attempted. The Pummerer rearrangement of the related sulfoxide was shown to proceed smoothly and with total regio- and stereocontrol. Application of the methodology to the synthesis of a simple proline derivative and a symmetric pyrrolidine is described. Chapter 4 reports the attempted application of [3+2] dipolar cycloadditions to the synthesis of α-amino acids. The synthesis and subsequent cycloaddition of a new, α-amino acid derived, chiral template is described. Subsequent deprotection of the cycloadducts generated allows the synthesis of some Î±-phenyl substituted prolines. Unsuccessful attempts to incorporate additional substituents and perform the cycloaddition in an intramolecular manner are described. Chapter 5 contains a description of the techniques employed, together with spectroscopic data for the compounds described in this thesis.

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Touchal, Samira. "Synthèse de nouveaux matériaux polymères hydrosolubles : application à la séparation de mélanges de solvants organiques de type alcool / éther par pervaporation." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2003. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL_T_2003_TOUCHAL_S.pdf.

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Abstract:

Ce mémoire concerne la conception et la synthèse de films réticulés d’homo et de copolymères de N-vinylpyrrolidinone et de méthyl sulfate de N-[3-(N,N,N-triméthyl ammonium) méthacrylamide, films destinés à l’étude de la séparation par pervaporation de mélanges de liquides de type alcool/éther. Les homopolymères et les copolymères obtenus ont de fortes masses molaires. Les rapports de réactivité, calculés en tenant compte de l’avancement de la réaction, montrent une dérive très rapide de la composition initiale du mélange : inversement à la NVP, le monomère acrylamide a une forte tendance à homopolymériser. Le degré de miscibilité des homopolymères s’est revélé satisfaisant pour permettre la préparation de films transparents ayant des propriétés mécaniques et physico-chimiques satisfaisantes pour les études de sorption isotherme et de pervaporation. En faisant varier la structure et la composition des films, à base d’homopolymères ou de copolymère, les fortes affinités des matériaux pour les alcools ont été mises en lumière. De façon générale, pour un film donné, l’activité de l’alcool détermine l’amplitude des phénomènes observés et corrélativement la sorption d’éther est fortement dépendante de l’activité de l’alcool, ce qui correspond à un phénomène de synergie de sorption. Par ailleurs, il a été montré que les motifs acrylamides quaternisés limitaient fortement l’amplitude des phénomènes de sorption isotherme en phase vapeur comme en phase liquide ; des résultats concordant ont été obtenus en pervaporation. Pour les systèmes binaires, les meilleures modélisations des isothermes de sorption sont réalisées par les modèles ENSIC et UNIQUAC ; il a aussi été possible de modéliser la sorption du système ternaire éhtanol-tertiobutyl éthyl éhter. Dans le film formé à partir du copolymère statistique, comparativement aux films de mélanges d’homopolymères, une capacité de sorption d’éthanol plus forte a été notée en relation avec l’augmentant de la polarité moyenne de la structure. Enfin en faisant varier la nature des alcools et des éthers, il apparaît que le taux d’alcool sorbé est plus bas en présence d’éther peu polaire. Comparativement aux résultats de la littérature, les perfomances du transport pervaporatif sont comparables ou supérieures.

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Dissertations / Theses on the topic 'Métabolisme de la proline'

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