Dissertations / Theses on the topic 'Meiofauna'

Bibliography: leaves 88-97.
Annual macrofaunal and meiofaunal standing stocks were estimated on an exposed rocky shore along the west coast of False Bay, South Africa, using comparable area based sampling techniques. While meiofaunal densities exceeded those of macrofauna in all zones, by an overall ratio of approximately 400:1, macrofaunal biomass exceeded that of meiofauna by an overall ratio of 10:1. The numbers of meiofauna were not evenly distributed across the shore but varied with the algal standing stocks in each zone and their sediment load. By incorporating turnover ratios from the literature, mean annual productivity ratios were calculated which suggested that meiofauna were responsible for 25 of total (excluding bacterial) secondary production. To follow this up, the impact of wave exposure on the meiofauna of one species of alga (viz. Gelidium pristoides) was examined on five shores around False Bay. Meiofaunal densities (dominated by animals between 63um-280um) were significantly greater on sheltered than exposed shores. As the minimum width of Gelidium fronds exceeds that of these permanent meiofauna, and tufts offer little resistance to wave action, only those individuals living in the dense, holdfast region of plants could escape the impact of waves on exposed shores. Total meiofaunal biomass per plant remained constant irrespective of shore type, due to the greater numbers of juvenile bivalves and amphipods on exposed shores. Algal and herbivore biomass were not significantly different between shore types around False Bay and therefore, the proportional contribution by meiofauna to total secondary production on sheltered shores was predicted to be greater than on exposed shores, where the biomass of macrofaunal filter feeders was very high. It has previously been argued that differences in meiofaunal communities between plant species are a result of differential surface area, number of habitats and refugia from predation. The possible fate of meiofaunal productivity as food for higher trophic levels (fish) and the mediating role played by algal complexity was investigated in a series of carefully designed laboratory and field experiments.

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:33:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-31. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:53Z : No. of bitstreams: 1 000831491_20151231.pdf: 96961 bytes, checksum: dd646a7a1ba1f4ea0c6981a53c7377c5 (MD5) Bitstreams deleted on 2016-01-04T10:26:21Z: 000831491_20151231.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-01-04T10:28:15Z : No. of bitstreams: 1 000831491.pdf: 305351 bytes, checksum: 576ca62d5439b4ab84c4684c9c0ca0a6 (MD5)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)
A estrutura e funcionamento das comunidades naturais são regulados pela disponibilidade de recursos (controle ascendente) e predação (controle descendente). Os caranguejos do gênero Uca são comuns em áreas entremarés tropicais e subtropicais. Neste estudo avaliamos experimentalmente o controle descendente de caranguejos chama-maré (U. burgersi) sobre a meiofauna, em particular os Nematoda, e o microfitobentos. O estudo foi realizado em microcosmos com exclusão de Uca, e com densidades de 5 e 10 caranguejos. O perfil de ácidos graxos de amostras do sedimento, hepatopâncreas e fezes do caranguejo foram avaliados para identificação de marcadores tróficos. O gênero Microlaimus sp foi o mais abundante. A densidade de Nematoda, avaliada no sedimento superficial (0,5 cm) foi maior em áreas de exclusão, assim como a riqueza de gêneros de Nematoda também foram maiores nos sedimentos disponíveis para o forrageamento, quando comparado aos pellets de alimentação. Não houve alteração da densidade dos Nematoda no estrato subsuperficial (5 cm). As concentrações de clorofila a no sedimento não foram alteradas pela presença dos caranguejos, e a biomassa microfitobêntica nos pellets de alimentação não diferiu da encontrada no sedimento. Foram encontrados ácidos graxos marcadores de diatomáceas (14:0 e 16:0), carnivoria (18:1n9) e plantas vasculares (18:2n6) no sedimento, no hepatopâncreas e nas fezes de chama-maré. A maior percentagem de indicador 18:1n9 em associação às densidades elevadas dos Nematoda em sedimento no tratamento de exclusão confirmam a predação e o controle descendente de U. burgersi sobre a meiofauna. Não foi registrada preferência por gênero de Nematoda consumido por chama-maré
FAPESP: 2013/14828-0

The main subject of my papers has been the phylum Tardigrada, with particular emphasis on the Antarctic fauna. While this is one of the ‘lesser known phyla’ the group forms an important element of Antarctic non-marine ecosystems. My work has centred on four interrelated themes: i) taxonomy, predominantly Tardigrada and with an Antarctic bias though including wider global species and high taxon groupings (I have also worked on other taxa such as Fungi-imperfecti and freshwater invertebrates); ii) biodiversity of tardigrades, particularly Antarctic habitats; iii) data-based studies based on the terrestrial Tardigrada and Antarctic freshwater crustaceans; and iv) biogeographic analysis of these databases. The thesis presented consists of papers published in major, peer-reviewed journals, along with book chapters published and in press. Several of my papers have been cited 10-30 times according to the ISI Web of Science citation system. Highlights of my work include being the first to publish a paper on the global terrestrial biogeography of a phylum and showing the extant limno-terrestrial tardigrade fauna reflect the early tectonic break-up of the Laurasia, West and East Gondwana super continents between 65 and 135 million years ago.

Orientador: Tânia Marcia Costa
Coorientador: Sérgio Antonio Netto
Banca: Thais Navajas Corbisier
Banca: Lucinana de Ávila Santos
Resumo: A estrutura e funcionamento das comunidades naturais são regulados pela disponibilidade de recursos (controle ascendente) e predação (controle descendente). Os caranguejos do gênero Uca são comuns em áreas entremarés tropicais e subtropicais. Neste estudo avaliamos experimentalmente o controle descendente de caranguejos chama-maré (U. burgersi) sobre a meiofauna, em particular os Nematoda, e o microfitobentos. O estudo foi realizado em microcosmos com exclusão de Uca, e com densidades de 5 e 10 caranguejos. O perfil de ácidos graxos de amostras do sedimento, hepatopâncreas e fezes do caranguejo foram avaliados para identificação de marcadores tróficos. O gênero Microlaimus sp foi o mais abundante. A densidade de Nematoda, avaliada no sedimento superficial (0,5 cm) foi maior em áreas de exclusão, assim como a riqueza de gêneros de Nematoda também foram maiores nos sedimentos disponíveis para o forrageamento, quando comparado aos pellets de alimentação. Não houve alteração da densidade dos Nematoda no estrato subsuperficial (5 cm). As concentrações de clorofila a no sedimento não foram alteradas pela presença dos caranguejos, e a biomassa microfitobêntica nos pellets de alimentação não diferiu da encontrada no sedimento. Foram encontrados ácidos graxos marcadores de diatomáceas (14:0 e 16:0), carnivoria (18:1n9) e plantas vasculares (18:2n6) no sedimento, no hepatopâncreas e nas fezes de chama-maré. A maior percentagem de indicador 18:1n9 em associação às densidades elevadas dos Nematoda em sedimento no tratamento de exclusão confirmam a predação e o controle descendente de U. burgersi sobre a meiofauna. Não foi registrada preferência por gênero de Nematoda consumido por chama-maré
Abstract: Not available
Mestre

The main subject of my papers has been the phylum Tardigrada, with particular emphasis on the Antarctic fauna. While this is one of the ‘lesser known phyla’ the group forms an important element of Antarctic non-marine ecosystems. My work has centred on four interrelated themes: i) taxonomy, predominantly Tardigrada and with an Antarctic bias though including wider global species and high taxon groupings (I have also worked on other taxa such as Fungi-imperfecti and freshwater invertebrates); ii) biodiversity of tardigrades, particularly Antarctic habitats; iii) data-based studies based on the terrestrial Tardigrada and Antarctic freshwater crustaceans; and iv) biogeographic analysis of these databases. The thesis presented consists of papers published in major, peer-reviewed journals, along with book chapters published and in press. Several of my papers have been cited 10-30 times according to the ISI Web of Science citation system. Highlights of my work include being the first to publish a paper on the global terrestrial biogeography of a phylum and showing the extant limno-terrestrial tardigrade fauna reflect the early tectonic break-up of the Laurasia, West and East Gondwana super continents between 65 and 135 million years ago.

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-10-09T19:28:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rodolfo Ferreira Martins do Nascimento.pdf: 1424442 bytes, checksum: b547042e60ca0f385c851cd73be379b8 (MD5)
Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-11-21T18:46:28Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rodolfo Ferreira Martins do Nascimento.pdf: 1424442 bytes, checksum: b547042e60ca0f385c851cd73be379b8 (MD5)
Made available in DSpace on 2018-11-21T18:46:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Rodolfo Ferreira Martins do Nascimento.pdf: 1424442 bytes, checksum: b547042e60ca0f385c851cd73be379b8 (MD5) Previous issue date: 2015-10-27
FACEPE
A partir do século XVIII, atividades humanas tais como as emissões de gases de efeito estufa têm se tornado um componente adicional que afeta o sistema climático. De acordo com o IPCC (Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas), a concentração atmosférica desses gases vai continuar a subir. Assim, é esperado um aumento da temperatura média entre 1,4 a 5,8°C até ao final do século 21. O aumento das concentrações de gases de efeito estufa, também podem causar um decréscimo no pH das águas da superfície oceânica de até 0,4 unidades em 2100. Essa alteração de pH, influencia na formação de recifes de corais, animais e algas calcificantes. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variação temporal na composição e abundância das famílias de Copepoda Harpacticoida em ambiente natural e em condição experimental de diminuição de pH e aumento de temperatura da água do mar, com as hipóteses de que o aumento da acidez e temperatura da água do mar modifica a estrutura da associação e reduz significativamente a riqueza e equitabilidade de Harpacticoida. Trinta e duas algas (Halimeda sp.) coletadas na Praia de Serrambi – PE foram mantidas em condições laboratoriais de controle e de Cenário de mudança climática, no último sendo alterados o pH e temperatura da água de acordo com previsões para 2100, utilizando aquários preparados para injeção de CO₂ e controle de temperatura. O experimento de laboratório teve duração de 30 dias, sendo realizadas coletas de algas na mesma praia ao início de final do experimento. As algas foram processadas para retirada e identificação dos Copepoda Harpacticoida assim como para análises de clorofila. Foram registradas 17 famílias de Copepoda Harpacticoida. A família Ameiridae foi identificada ao nível específico, sendo encontradas 18 espécies. Os resultados das análises das algas indicaram um efeito significativo do cenário de mudança climática sobre a proporção de clorofilas e aumento da calcificação de Halimeda sp.. Resultados estatísticos mostraram diferenças significativas na estrutura da comunidade de Copepoda Harpacticoida entre a situação controle e o cenário previsto para 2100. A associação de espécies de Ameiridae não apresentou alteração sob condições de mudança climática, um maior tempo de exposição dos animais a condições de acidificação, poderia mostrar resultado significativo para as espécies estudadas, aproximando a família Ameiridae ao resultado obtido para os Harpacticoida.
From the eighteenth century, human activities such as emissions of greenhouse gases have become an additional component that affects the climate system. According to the IPCC (Intergovernmental Panel on Climate Change), the atmospheric concentration of these gases will continue to rise. Thus, it is expected to increase the average temperature of 1.4 to 5.8 ° C by the end of the 21st century. The increase in greenhouse gas concentrations, can also cause a decrease in the pH of ocean surface waters of up to 0.4 units in 2100. This change of pH, influence the formation of coral reefs, animals and calcifying algae. The objective of this study was to evaluate the temporal variation in the composition and abundance of the families of Copepoda Harpacticoida natural environment and experimental condition of decreased pH and increased temperature of sea water, with the hypothesis that the increase in acidity and temperature seawater modifies the structure of the pool and significantly reduces the richness and evenness of Harpacticoida. Thirty-two algae (Halimeda sp.) Collected in Serrambi Beach - PE were kept in laboratory conditions control and climate change scenario, the latter being altered pH and temperature according to forecasts water to 2100, using prepared aquariums for injection of CO2 and temperature control. The laboratory experiment lasted 30 days, algae collections being held on the same beach at the beginning of the end of the experiment. The algae were removed and processed for identification of Copepoda Harpacticoida as well as of chlorophyll analysis. 17 families of Copepoda Harpacticoida were recorded. The Ameiridae family was identified to species level, and found 18 species. The results of the analysis of algae showed a significant effect of climate change scenario on the proportion of chlorophylls and increased calcification of Halimeda sp .. Statistical results showed significant differences in Copepoda Harpacticoida community structure between the control situation and the scenario for 2100. the combination of species Ameiridae showed no change under conditions of climate change, a longer exposure of animals acidification conditions, could show significant results for the species studied, approaching Ameiridae family to the result for Harpacticoida.

A variabilidade espacial de densidade e composição de comunidades subtidais de meiofauna e nemátodes de vida livre foi estudada em dois estuários portugueses, Mira (costa sudoeste) e Mondego (costa oeste), sujeitos a diferentes pressões antropogénicas, ao longo do gradiente de salinidade (de <0.5 até> 3Opsu). Em ambos os estuários, os taxa Nematoda, Copepoda e Polychaeta dominaram as comunidades de meiofauna. Os padrões espaciais de densidade e composição das comunidades de meiofauna e nematodes refletiram o gradiente de salinidade, sendo influenciados por este fator de stress natural. Para além da salinidade, as propriedades do sedimento também influenciaram as comunidades e a diferença entre as respostas das comunidades ao stress antropogénico e natural não foram distinguidas. No entanto, a diferente composição trófica das comunidades de nematodes do Mira e Mondego está relacionada com a diferente pressão antropogénica sentida neste dois sistemas, que se sobrepôs ao efeito da salinidade, tendo sido possível detetar o efeito do stress antropogénico nestes estuários. Abstract: The spatial variations in density and composition of subtidal meiofauna and free-living Nematoda communities were analysed in two Portuguese estuaries, Mira (southwestern coast) and Mondego (western coast), that are subjected to different anthropogenic pressures, along the salinity gradients (from <0.5 to >30psu). ln both estuaries, meiofauna communities were characterized by the dominance of the taxa Nematoda, Copepoda and Polychaeta. The spatial paflems of density and composition of both meiofauna and Nematoda communities reflected the salinity gradient, being these assemblages structured and influenced by this natural stressor. Besides salinity, sediment properties also influenced the communities and the responses of the communities to both anthropogenic and natural stress could not be easily differentiated. Nevertheless, different patterns of the trophic nematode structure assemblages between Mira and Mondego overlapped the salinity effects and the feeding guilds and their response could detect the anthropogenical-induced stress in these estuaries.

Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2017-05-03T16:18:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Final_Sarmento VC_2016.pdf: 2305672 bytes, checksum: c8bdf580eaac22dceb68d43fc6514d41 (MD5)
Made available in DSpace on 2017-05-03T16:18:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Final_Sarmento VC_2016.pdf: 2305672 bytes, checksum: c8bdf580eaac22dceb68d43fc6514d41 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26
FACEPE
Os efeitos do aumento da emissão de gases do efeito estufa, como modificações na temperatura e bioquímica dos oceanos, já podem ser observados e é esperado que se intensifiquem no futuro, causando impactos negativos nos ecossistemas marinhos. O presente estudo teve como principal objetivo investigar os efeitos de diferentes níveis de pH e de temperatura da água do mar sobre as comunidades de meiofauna e de Copepoda Harpacticoida. Para isso foram realizados três experimentos: um experimento para avaliar o efeito de diferentes níveis de pH da água do mar sobre a comunidade de meiofauna do recife de coral do Parque Municipal Marinho do Recife de Fora (Porto Seguro, Bahia); um experimento para avaliar o efeito de diferentes cenários de mudanças climáticas (alterações simultâneas de temperatura e pH da água do mar) sobre a comunidade de meiofauna e de Copepoda Harpacticoida do recife de coral da Praia de Serrambi (Ipojuca, Pernambuco); e um experimento para avaliar o efeito da interação de diferentes níveis de pH e temperatura da água do mar sobre a associação de Copepoda Harpacticoida do costão rochoso da praia de Mounlt Batten (Plymouth, Inglaterra). Foram observadas modificações na estrutura da comunidade de meiofauna e harpacticóides, especialmente quando expostos ao aumento simultâneo de temperatura e acidificação da água do mar. Diferentemente, nos harpacticóides de área temperada coletados em zona de entremaré, os impactos do aumento de temperatura e acidificação foram observados apenas nos tratamentos mais severos. Devido à sensibilidade que os organismos da meiofauna apresentaram aos aumentos de temperatura e acidificação, os resultados apresentados aqui demonstram que o funcionamento trófico dos sistemas bentônicos pode estar seriamente ameaçado pelas mudanças climáticas.
The increase in greenhouse gas emissions has led to unprecedented atmospheric carbon dioxide concentrations. Its impacts have been observed through changes in ocean temperature and biochemistry. However, intensifications of these changes are predicted for the future with serious consequences to marine ecosystems. This study aims to assess the potential effects of different levels of seawater pH and temperatures on meiofauna and harpacticoid copepods communities. For that, three experiments were performed: an experiment was done to assess the effect of different seawater pH on meiofauna community from the coral reefs of Recife de Fora Municipal Marine Park (Porto Seguro, Bahia, Brazil); an experiment was done to evaluate the effect of different climate change scenarios (simultaneous changes in seawater temperature and pH) on meiofauna and harpacticoid communities from the coral reefs of Serrambi beach (Ipojuca, Pernambuco, Brazil); and an experiment was done to evaluate the interactive effects of rising temperature and acidification on harpacticoid community from the rockyshore of Mount Batten beach (Plymouth, UK). Modifications on community structure of meiofauna and Copepod Harpacticoida were observed, especially when organisms were exposed to simultaneous increases in seawater temperature and acidification. Furthermore, harpacticoids from temperate region sampled at the intertidal zone, showed to be affected only at the most severe treatments. Due to the sensibility to ocean warming and acidification that meiofauna organisms exhibited, the results presented here highlights the risk that climate changes poses on the trophic functioning of benthic habitats.

Harbors are extreme examples of coastal urbanization. Artificial substrata in the Ravenna harbour are almost completely dominated by mussel beds. Mussel clumps provide substrata for small mobile fauna (meiofauna). The aim of the thesis is to study the meiofauna associated to the mussels attached to the harbour structures. Moreover, the thesis provides the basis for the construction of a local meiofaunal genetic database, with the final goal of time and cost reduction on meiofaunal assessment through a metabarcoding approach. Mussel beds and associated meiofauna were sampled in two locations of the port (North vs. South) in two types of artificial substrata (rock boulders vs. concrete seawalls) at two different times. Taxonomic assessment of the meiofauna was carried out. Mussel bed complexity was evaluated by means of different measures (e.g. weight, volume, length of valve). The main results are: 1) meiofauna assemblages are very different in the two substrata, but these differences were influenced by locations and by the sampling periods. The number of taxa and diversity index on the rock boulders, the more complex primary substratum, resulted higher than those on the seawalls. 2) Variables analysed altogether showed differences between substrata, locations and times. A weak correlation was found between the mussel bed descriptors and the associated meiofauna assemblages. The number of structural mussels and the mean size lengths resulted responsible for the relationship. These results suggest that other measures of mussel complexity are needed, and that meiofauna assemblages vary depending on different substrata and to abiotic conditions associated to the locations (e.g. marine currents, exposition-to-sun). The genetic research identified a lack of sequences of species from the Adriatic Sea, especially for the “permanent” meiofauna. Alignment of the available sequences identified in the V7 and V8 regions of the SSU_18S a good target for meiofaunal barcoding.

A Molecular Approach to Assessing Meiofauna Diversity in Marine Sediments Heather C. Hamilton Abstract The purpose of this study was to determine if a molecular approach could be applied to calculating the diversity of meiofauna in marine sediments from two sites in Tampa Bay, FL, similar to the approach of McCaig et al, 1999 in calculating the diversity of microbes in pastureland soils. The approach includes extracting total DNA directly from the sediment and amplifying the 18S rRNA gene by PCR. Clone libraries from the 18S gene would be created for each site and 300 sequences from each clone library would be obtained. These sequences would then be phylogenetically analyzed and assigned to an OTU, from which diversity indices can be calculated. The phylogenetic analysis of the sequences from the two sites revealed that of the 102 OTUs assigned from the sequences, only 7 OTUs included sequences from both sites, while 93 OTUs contained sequences from one site or from the other. Thus the sites were phylogenetically different from each other. Shannon diversity indices calculated for each site showed a difference between the two sites and paralleled diversity indices for macrofauna data for each site collected by the Hillsborough County Environmental Protection Commission. Sequences from 30 OTUs were completely sequenced and identified by phylogenetic comparison with a metazoan reference alignment. A discrepancy between the sequence data and data collected from preserved samples taken at each site was evident upon analysis: roughly 60% of each preserved sample consisted of nematodes and 10% consisted of copepods, while roughly 30% of the identified OTUs consisted of copepods and 10% consisted of nematodes. This discrepancy could be explained if the OTUs that were not identified consisted of nematode sequences or if a primer bias were present in the PCR amplification such that the regions flanking the primer site in the nematode sequences inhibited primer annealing.

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:03:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9485_1.pdf: 2203589 bytes, checksum: df85b08456be6ed28739e1289ca0d9ba (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
O objetivo do estudo é avaliar o efeito da engenharia de ecossistema causada pelos recifes de Sabellaria wilsoni (Polychaeta: Sabellariidae) na comunidade da meiofauna e na associação de Nematoda na Ilha de Algodoal, Amazônia, Brasil. Dois tipos de recifes arenosos (Cogumelo e Plataforma) bem como o sedimento arenoso circunvizinho de duas praias distintas (terraço de maré baixa e dissipativa) foram estudados. As coletas foram realizadas em junho (estação chuvosa) e dezembro (estação seca) de 2008 em dois perfis perpendiculares à linha de costa em cada local. As amostras obtidas utilizando-se um corer de 3,0cm de diâmetro enterrado até à profundidade de 10cm foram fixadas com formol a 4%, coradas com Rosa de Bengala e triadas em laboratório ao nível de grandes grupos e para o estudo taxonômico foram retirados os 30 primeiros indivíduos de cada réplica. A meiofauna esteve representada por 22 taxa: Acari, Amphipoda, Bivalvia, Cladocera, Copepoda, Cumacea, Gastropoda, Gastrotricha, Hydrozoa, Insecta, Isopoda, Kinorhyncha, Nematoda, Nemertea, Oligochaeta, Ostracoda, Polychaeta, Rotifera, Tanaidacea, Tardigrada, Tunicata e Turbellaria. A densidade média da meiofauna foi de 1774 ind/10cm², sendo Nematoda o táxon dominante em todas as estações e locais. A ANOVA mostrou que dos parâmetros univariados somente a riqueza apresentou diferença significativa entre os ambientes. A PERMANOVA indicou diferenças significativas para as interações entre os ambientes, bem como entre os tipos de recife e praia considerando os ambientes, e interações entre as estações considerando os diferentes tipos de recife e de praia. A associação de Nematoda esteve representada por 2 classes, 9 ordens, 30 famílias, 91 gêneros e 59 espécies. A densidade média da nematofauna foi de 1424 ind/10cm², sendo Daptonema o gênero dominante seguido por Viscosia e Sabatieria. A ANOVA mostrou que dos parâmetros univariados nenhum apresentou diferença significativa entre os ambientes. A PERMANOVA para a nematofauna também indicou diferenças significativas para as interações entre os ambientes, bem como entre os tipos de recife e praia considerando os ambientes, e interações entre as estações considerando os diferentes tipos de recife e de praia. O IndVal, indicou que os gêneros Bathylaimus, Halichoanolaimus, Linhomoeus, Sabatieria e Viscosia são indicadores do ambiente recifal enquanto que Daptonema, Odontophora, Omicronema, Prorhynchonema e Trichotheristus são gêneros indicadores do ambiente praial. Um conjunto de mudanças nos fatores estruturais e abióticos leva à alta diversidade dentro dos recifes indicando a importância de S. wilsoni enquanto engenheiro de ecossistema em ambiente de praia arenosa estuarina no litoral amazônico

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1944_1.pdf: 3721157 bytes, checksum: 3f1bdf78e70770243573eb8b8e8b2828 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2003
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Estuários são ambientes favoráveis ao desenvolvimento da meiofauna que se destaca pela sua importância na teia trófica, na regeneração de nutrientes e como indicadora de poluição. Estudos sobre a comunidade de meiofauna e diversidade de Copepoda Harpacticoida foram realizados no estuário do Rio Formoso em oito estações (# 1 a 8) de coleta, no mediolitoral (M) e infralitoral (I). A estrutura da comunidade foi associada com as variáveis: salinidade, temperatura, matéria orgânica, clorofila-a, feopigmentos e granulometria do sedimento. As amostras de meiofauna foram coletadas com tubo de PVC (2,8 cm2 e 4 cm de altura) e fixadas com formol salino a 4% e os animais extraídos com água corrente filtrada, sendo retidos entre 0,044 e 1,0 mm de abertura de malha. Os Harpacticoida foram separados em tubos de Eppendorf com álcool a 70%. Para a identificação foram feitas dissecações do corpo do animal, montagens em lâminas, e desenhos sob câmaraclara. A meiofauna esteve composta por 14 grandes grupos. Nematoda foi o grupo dominante com 58% seguido por Copepoda com 24% do total de indivíduos. A densidade variou de 1.461 ind.10cm-2 na # 8-I a 12.353 ind.10cm-2 na # 2-I, com valor médio no estuário de 5.003 ind.10cm-2. Foram identificadas 24 espécies de Harpacticoida das quais Schizopera spp., Nitocra sp. 3 e Robertsonia spp. foram as mais abundantes. A análise Bio-Env utilizando dados ao nível de grandes grupos associou feopigmentos e fração do sedimento (areia muito grossa e grossa) à variação espacial da comunidade. Para os dados de espécies os fatores que melhor se associaram com a variação da comunidade de Harpacticoida foram salinidade, matéria orgânica e fração do sedimento (areia muito grossa)

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:07:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3016_1.pdf: 1761139 bytes, checksum: b1721f66b653840de6818b8001fd9029 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
A estrutura da comunidade da meiofauna entre-marés numa praia arenosa (Ponta da Tulha, Ilhéus Bahia) foi estudada durante dois meses: julho de 2008 e janeiro de 2009. Estabeleceram-se quatro perfis perpendiculares à linha de praia, com dois pontos de coleta: um no mediolitoral superior (MS) e outro no mediolitoral inferior (MI). Em cada ponto foram coletadas amostras destinadas às analises biológicas e granulométricas. A meiofauna foi identificada em níveis taxonômicos altos, sendo os Tardigrada retirados para o refinamento taxonômico. Foram encontrados 17 grupos no presente estudo, dos quais Nematoda e Tardigrada foram os mais abundantes, representando quase 80% da meiofauna total. A análise de variância bi-fatorial mostrou diferenças significativas na densidade da meiofauna apenas em relação aos níveis do mediolitoral no mês de julho de 2008. A fauna de Tardigrada foi pouco diversa, com dois gêneros e três espécies: Raiarctus sp., Batillipes lesteri e Batillipes sp. nov., sendo amplamente dominada por esta última. As variações associadas ao grupo estiveram relacionadas, exclusivamente, ao fator temporal, com diferenças significativas observadas entre os meses. Este estudo propiciou a descrição de uma nova espécie de Tardigrada, assim como o primeiro registro da espécie Batillipes lesteri para o litoral brasileiro, referendando a importância da abordagem taxonômica dos Tardigrada para o conhecimento da biodiversidade meiofaunística no nosso país

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:05:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6823_1.pdf: 4586971 bytes, checksum: 716a611f2216f9036e2f438d6997d578 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005
A área estudada compreendeu as praias do Forte Orange, São Paulo, Forno da Cal, Pilar, Jaguaribe e Sossego, na Ilha de Itamaracá. O estudo objetivou conhecer as relações entre os agentes dinâmicos da praia e a fauna intersticial dos sedimentos. No período de novembro de 2003 a outubro de 2004 foram realizadas coletas mensais. As amostras da fauna intersticial foram coletadas no estirâncio, em um quadrado imaginário de 1m x 1m com cinco réplicas coletadas nas extremidades e no centro do quadrado, na baixamar, totalizando 360 amostras. As amostras de sedimentos foram mensais para cada praia e também coletadas no transecto, totalizando 72 coletas. Feituras de perfis de praia foram realizados e seus gráficos confeccionados segundo o referencial absoluto de cada um. A meiofauna esteve composta, segundo a ordem evolutiva por: Nematoda, Rotifera, Tardigrada, Polychaeta, Oligochaeta, Acari, Ostracoda, Copepoda e Mollusca, sendo Nematoda, Copepoda e Oligochaeta representantes da fauna dominante; Polychaeta e Ostracoda como abundante; Rotifera como comum e Tardigrada, Acari e Mollusca como raros. O estudo da distribuição dos sedimentos praiais revelaram a ocorrência do fácies de areias quartzosas fina à média. A morfologia evidencia as praias de São Paulo, Forno da Cal, Pilar, Jaguaribe e Sossego com tendências a processos erosivos e a praia do Forte Orange com tendência deposicional. A variação do balanço sedimentar das praias foi o fator determinante para a composição quantitativa da meiofauna em todo período

Submitted by Milena Dias (milena.dias@ufpe.br) on 2015-03-10T18:58:27Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Tatiana Alves.pdf: 1748447 bytes, checksum: c8e3f056f6b74473117874223beafe65 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5)
Made available in DSpace on 2015-03-10T18:58:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Tatiana Alves.pdf: 1748447 bytes, checksum: c8e3f056f6b74473117874223beafe65 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2009
Os Nematoda são os organismos mais abundantes da meiofauna, principalmente em estuários, apresentando uma organização variada e complexa. Esse grupo constitui o mais importante a níveis de densidade, diversidade e consumidor secundário. O trabalho teve como objetivos determinar a dominância de Nematoda em relação a dos demais grupos da meiofauna; os parâmetros da estrutura da comunidade de Nematoda: diversidade, densidade e abundância; correlacionar a distribuição espaço-temporal dos gêneros de Nematoda com os parâmetros bióticos/abióticos e dos gêneros mais abundantes identificar ao nível específico. As coletas foram realizadas no estuário do rio Carrapicho-PE em 4 estações, do infralitoral, em janeiro, fevereiro, junho e agosto/2004. Para a coleta da meiofauna utilizou-se seringa plástica de 2,0 cm de diâmetro interno e 5,0 cm de altura. Através da garrafa oceanográfica de Niskin foram coletadas amostras de água na superfície para análise da biomassa primária, temperatura, salinidade, oxigênio, pH. Amostras superficiais de sedimento foram coletadas para a análise granulométrica. Para a análise dos dados foi calculada a freqüência de ocorrência e abundância relativa dos grupos de meiofauna e gêneros de Nematoda; classificação trófica;índices de diversidade Shannon-Weaner, equitabilidade de Pielou e o de riqueza de Margalef; análise de ordenação não-métrica multidimensional (MDS); o ANOSIM bi-fatorial para as significâncias das similaridades relacionadas aos grupos de amostras dos fatores espacial e temporal; análise SIMPER para determinar quais os gêneros que mais contribuíram para as dissimilaridades entre as amostras e ánalise BIOENV para a relação entre as variáveis ambientais e a distribuição espaço-temporal de Nematoda. Os Nematoda dominaram a meiofauna em todos os meses, com até 99,6% dos organismos e classificados como grupo constante. A abundância dos Nematoda variou entre 97,5% em agosto a 99% em janeiro. Um total de 51 gêneros e 17 famílias foram listadas. Terschellingia e Spirinia ocorreram em maior abundância, sendo identificadas as espécies T. longicaudata, T. mora e S. parasitifera. Houve uma dominância dos grupos tróficos de hábito raspador, no período seco, e uma alternância, no chuvoso, entre raspadores e detritívoros não-seletivos. Tanto o período seco quanto o chuvoso apresentam oscilações quanto a diversidade. A maior riqueza de indivíduos ocorre em agosto. A equitabilidade entre as estações dos meses secos foram mais diversos, e no chuvoso houve uma maior uniformidade da distribuição dos indivíduos. O MDS apresentou uma maior similaridade entre amostras de janeiro, fevereiro e agosto. Na variação espacial o MDS indicou que as amostras da estação II estão próximas entre si, formando um grupo maior. A maioria das amostras da estação I, algumas da IV e da III estão se agrupando com as da estação II. O ANOSIM indicou haver diferenças espaço-temporal entre as amostras. Segundo o SIMPER Terschellingia e Spirinia foram os maiores responsáveis pelas dissimilaridades entre os meses e estações. O Bio-Env indicou a temperatura, oxigênio dissolvido, pluviometria, percentual de silte/argila como os fatores ambientais responsáveis que melhor explicaram a associação dos Nematoda na distribuição espacial e temporal com os fatores biológicos. Conclui-se que os Nematoda apresentaram uma variabilidade espaçotemporal aos níveis de densidade, diversidade e riqueza; os comedores de depósito não seletivos e os raspadores dominaram a comunidade e a comunidade de Nematoda do estuário do rio Carrapicho é semelhante a de outras comunidades de estuários brasileiros e mundiais.

Members of the meiobenthos have been used extensively to determine the effects of anthropogenic perturbation in marine systems (Coull & Chandler, 1992). Despite this, the meiofauna has been virtually excluded from freshwater pollution monitoring. This thesis aimed to address this research caveat, by evaluating the potential of stream meiofauna for monitoring metal-contamination. Meiofaunal communities were sampled from streams in SW England representing a gradient in metal contamination. Environmental variables in these streams were also measured to identify the important forcing agents structuring the stream benthos. Multivariate techniques demonstrated Cu, either alone or in combination with other environmental variables was of most importance in correlations with the composition of meiofaunal communities. Comparison with the macrofaunal data demonstrated that both components of the benthos responded in a similar way to metal contamination, although the meiofauna also highlighted other differences in water chemistry. The combination of meiofauna, macrofauna and temporary meiofauna in a combined metazoan community analysis gave the best discrimination of sites. Detection of metal-contamination was retained in meiofaunal data aggregated to the family level. The abundances of the harpacticoid copepod Bryocamptus zschokkei were consistently important in contributing to between-site differences in community structure. The harpacticoid, therefore was selected as an ecologically-relevant freshwater toxicity test for Cu. Laboratory experiments demonstrated that Cu had toxic effects on the survival and reproduction of Bryocamptus zschokkei. Although acute toxicity tests gave more rapid results, these effects on survival occurred at a higher Cu concentration than those in the chronic tests. Sub-lethal concentrations of Cu led to a reduction in the numbers of offspring per brood Animals with pre-exposure to chronic concentrations of Cu exhibited greater tolerance to this metal. In conclusion, more information may be gained by including the meiofauna, alongside the macrofauna, when monitoring the impact of contaminants on freshwater systems. To reduce the effort of processing samples it appears family level data could be used to detect metal-contamination. The novel use of B. zschokkei in laboratory tests, where it showed lethal and sub-lethal responses to Cu, demonstrated that this species may have much potential as an ecologically-relevant freshwater bioassay organism for this metal. The advantages of using meiofaunal species such as B. zschokkei as toxicity test organisms are discussed.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:05:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1818_1.pdf: 582542 bytes, checksum: d21a405953d1cbc4272190565b3ef449 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005
Uma das maiores ameaças ao ecossistema estuarino tem sido o rápido aumento na aqüicultura costeira, e em particular a criação de camarões. O efluente da carcinicultura pode ser a principal fonte de poluição nos estuários. Considerando a sensibilidade da meiofauna à entrada de material antrópico e o grupo Copepoda Harpacticoida como o mais sensível à poluentes, este trabalho teve como objetivo, avaliar a influência da carcinicultura no estuário do rio Botafogo (Itapissuma-PE) utilizando a meiofauna e o grupo Copepoda Harpacticoida como bioindicadores. As amostragens ocorreram em baixa-mar, em três estações no médiolitoral dos estuários dos rios Botafogo e Siri, nos meses de fevereiro, abril, agosto e outubro de 2003. Foram analisados além da meiofauna, parâmetros físico-químicos da água e também sedimentológicos. A meiofauna esteve composta por 10 grupos taxonômicos sendo Nematoda e Copepoda os mais abundantes. A densidade total variou de 11.429 ind.10cm-2 a 1.339 ind.10cm-2 e foi consideravelmente mais alta no rio Botafogo. Com relação à Copepoda Harpacticoida, ocorreram 9 espécies, sendo Robertsonia mourei a mais abundante nos estuários. A densidade total de Copepoda variou de 14,92 ind.10cm-2 à 746,26 ind.10cm-2 não havendo grande diferença entre os estuários. O BIOENV discriminou as concentrações de clorofila-a e feopigmentos (rs=0,363) no rio Botafogo e salinidade no rio Siri (rs=0,568), como melhores descritores da comunidade de meiofauna e as concentrações de feopigmentos e de nitrogênio (rs=0,603) no rio Botafogo e a concentração de feopigmentos (rs=0,224) no rio Siri, como descritores do grupo Copepoda. Segundo ANOSIM two way , houve diferenças significativas (p<0,05) entre os rios, meses e estações tanto na análise com os grandes grupos da meiofauna como com Copepoda Harpacticoida. Parâmetros da água e do sedimento evidenciaram o estado de eutrofização do rio Botafogo sugerindo que a aqüicultura vêm afetando este estuário negativamente, e a meiofauna parece responder a eutrofização confirmando ser útil nos estudos de biomonitoramento

Meiofauna are ubiquitous but poorly-studied components of soft-bottom marine communities around the world, including mangroves. However, information on the ecological role of the meiofauna in subtropical intertidal habitats is scarce compared to knowledge of the benthic macrofauna. The dynamic environmental conditions and heterogeneous sediments of mangroves present challenges to understanding the structure of mangrove meiofaunal assemblages at various spatial and temporal scales. This study was designed to elucidate the ecological role of the meiofauna in mangroves by studying their three main ecological elements: 1) assemblages structure; 2) top-down interaction with macrofauna; and 3) bottom-up interaction in terms of nutrient utilisation. Firstly, how meiofaunal assemblage respond to estuarine sediment conditions was described by analysing the assemblages associated with different mangrove species (Avicennia marina, Rhizophora stylosa and Aegiceras corniculatum) at three locations in sub-tropical Southeast Queensland, Australia. Secondly, the significance and nature of top-down control on the density of meiofauna based on their interactions with deposit- feeding crabs was investigated in a mangrove and the adjoining sandflat.
Thesis (PhD Doctorate)
Doctor of Philosophy (PhD)
Griffith School of Environment
Science, Environment, Engineering and Technology
Full Text

Análisis comunitario de la meiofauna metazoaria en sedimentos de la plataforma y el talud continentales frente a Perú El estudio de las comunidades bentónicas es crucial para la comprensión de la estructura y el funcionamiento del ecosistema marino. La meiofauna es un componente aún poco abordado desde la perspectiva de su aporte al metabolismo bentónico. Nosotros evaluamos los cambios comunitarios de la meiofauna metazoaria en ocho estaciones (plataforma y talud interceptados por una intensa zona de mínimo oxígeno) ubicadas a lo largo de un gradiente latitudinal (5º12’ – 16º48’ S) frente a Perú, agrupadas por sectores de la costa (Norte, Centro, Sur), mediante el análisis de testigos de sedimento (sección superficial, 0-1 cm) colectados entre los rangos discretos de 150 y 1000 m de profundidad, en el verano de 2007, durante la expedición danesa Galathea-3. A nivel espacial (cambios latitudinales y batimétricos), la comunidad meiofaunal está fuertemente dominada por los nemátodos (> 98 %) y minoritariamente repartida entre filos como Arthropoda, Cephalorhyncha o Turbellaria. Intraespecíficamente, la riqueza nematofaunal está dominada por familias como Chromadoridae, Desmodoridae y Oncholaimidae. El análisis de la varianza (Comparaciones Múltiples de Friedman) de las densidades muestra diferencias significativas a un nivel latitudinal (x2 = 12,19; (11); p < 0,01), corroborado con una disimilaridad comunitaria (SIMPER) promedio máxima de 42,5 % (Norte vs Sur), pero no fue así a nivel batimétrico (x2 = 2,36; (11); p = 0,31). Correlaciones de Spearman muestran que factores como el oxígeno (ρ = 0,62) o el alimento (ρ =0,48) no mostraron influencia significativa (p < 0,05) sobre los cambios poblacionales, pero sí la profundidad (ρ = 0,71) como variable explicativa del poblamiento de algunos componentes de la meiofauna como los nemátodos. Es claro que existe una covarianza de factores modulando los cambios comunitarios de la meiofauna. Nuestro análisis sugiere un fuerte poblamiento de nemátodos adaptados a sedimentos reducidos (i.e. deficientes de oxígeno), especialmente en hábitats bentónicos ubicados en el núcleo de la zona de mínimo oxígeno (O2 < 0,5 ml/l) y también pone en evidencia la capacidad de diversificación dentro de este grupo metazoario bajo condiciones extremas y las implicancias de su actividad biológica sobre varios procesos del ecosistema. Palabras clave: meiofauna, gradiente espacial, diversidad, Perú
--- Community analysis of metazoan meiofauna in slope and continental shelf sediments along Peruvian coast The study of benthic communities is a crucial step to understand the structure and functioning of marine ecosystems. The meiofauna is a benthic component still poorly studied from the perspective of the benthic metabolism. We assess the changes on the meiofauna metazoan community at eight stations (slope and continental shelf intercepted by an intense Oxygen Minimum Zone-OMZ) located along a latitudinal gradient (5º12’ – 16º48’ S) off Peru, by grouping them in Sectors (North, Central and South) and using sediment cores (0-1 cm), which were collected at discrete ranges between 150 and 1000 m depth, during the summer 2007, expedition Galathea-3. At a spatial level (latitudinal and bathymetric changes), meiofauna was strongly dominated by nematodes (>98%) and composed by less-commons Phyla such as Arthropoda, Cephalorhyncha or Turbellaria. Intra-specifically, nematode richness was dominated by the families Chromadoridae, Desmodoridae and Oncholaimidae. ANOVA results (Friedman’s Multiple Comparisons) applied at meiofauna densities showed that significant differences at latitudinal level exists (x2 = 12,19; (11); p < 0,01), corroborated with an average percent of community dissimilarity (SIMPER) of 42,5 % (North vs. South), but non at bathymetric level (x2 = 2,36; (11); p = 0,31). Spearman’s correlations showed that factors such as oxygen (ρ = 0,62) or food (ρ =0,48) do not shown significant differences (p < 0,05) on the population changes, but the depth was a positive factor (ρ = 0,71) affecting some integrant of meiofauna such as nematodes. It is clear that a co-variance of factors modulate the meiofauna community. Our analysis suggests a strong colonization of highly adapted nematodes to reduced sediments (i.e. oxygen deficient), especially in benthic habitats located in the OMZ’s core (O2 < 0,5 ml/l) and highlight other aspects such as the nematode’s diversification under extreme conditions and the implications of its biological activity on several ecosystem processes. Key words: meiofauna, spatial gradient, diversity, Peru
Tesis

Um importante componente dos ecossistemas marinhos bentônicos é a meiofauna, que apresenta altas densidades em sedimentos de plataforma continental e reflete rapidamente as condições ambientais prevalescentes. Dentre os organismos da meiofauna, o grupo mais abundante é Nematoda, altamente diverso e que pode ser utilizado, assim como a meiofauna, como ferramenta no monitoramento de impactos naturais e antropogênicos no ambiente. O presente trabalho está inserido no projeto institucional do Instituto Oceanográfico da USP denominado \"Dinâmica do Ecossistema de Plataforma da Região Oeste do Atlântico Sul\" (DEPROAS-PRONEX), que teve como objetivo geral o estudo dos mecanismos físicos que possibilitam a penetração sazonal da ACAS na plataforma continental e do impacto que essa penetração têm sobre os processos biológicos do ecossistema em duas áreas: ao largo de Cabo Frio e de Ubatuba. Os objetivos específicos deste estudo foram: Analisar a composição e estrutura da comunidade meiobentônica, em nível de grandes grupos, as associações das famílias e gêneros dos Nematoda nas plataformas interna e externa ao largo de Cabo Frio e Ubatuba, bem como suas relações com as variáveis ambientais, em especial com o tipo de sedimento, biomassa de fitopigmentos e características das massas d\'água. As coletas foram realizadas em duas profundidades (40 e 100 m), no verão e inverno de 2001 ao largo de Cabo Frio e inverno de 2001 e verão de 2002 em Ubatuba. Foi utilizado um amostrador tipo caixa, ou \"box-corer\", de 30 x 30 cm, em duplicata. Tubos amostradores de 4,9 cm2 de área superficial e 10 cm de altura foram utilizados para a coleta da meiofauna, em duplicata, por box-corer. A meiofauna foi triada e separada em grandes grupos e foram identificados cerca de 200 nematódeos por estação. As maiores densidades da meiofauna foram encontradas aos 40 m de Ubatuba no verão (2001,7±703,1) e aos 100 m de Cabo Frio no verão (1010,0±959,0), o que pode ter sido conseqüência do aumento da produção primária pelágica, devido à intrusão da ACAS, e sua sedimentação em Cabo Frio e Ubatuba, além do aporte terrígeno na plataforma interna de Ubatuba. A composição genérica dos Nematoda foi relacionada principalmente à granulometria. A plataforma interna de Cabo Frio, com sedimento arenoso e dinâmica constante, foi caracterizada pela dominância do gênero Daptonema (Xyalidae), enquanto que a externa no verão pelo gênero Aponema (Microlaimidae), associado aos fitodetritos e sedimentos finos, e no inverno Sabatieria (Comesomatidae) foi dominante. As estações de Ubatuba caracterizaram-se pelos gêneros Terschellingia (Linhomoeidae) e Sabatieria (Comesomatidae) na plataforma interna, no inverno e verão. Aos 100 m Desmoscolex (Desmoscolecidae) e Sabatieria (Comesomatidae) foram os gêneros mais abundantes no inverno e verão. As maiores diversidades de gêneros foram encontradas nas estações de Ubatuba, o que sugere que a diversidade esteja mais relacionada com sedimentos arenosos e heterogêneos. Quanto aos grupos tróficos, os depositívoros seletivos e não seletivos tiveram maior ocorrência nos locais de estudo. As análises multivariadas comprovaram que análise no nível de gêneros permitiu uma melhor caracterização ambiental das áreas de estudo, quando comparado às análises no nível de famílias ou grupos da meiofauna.
Meiofauna is an important component of the marine benthic ecosystem as its densities are usually high in continental shelf sediments and respond quickly to environmental changes. Nematoda is the dominant group among meiofauna organisms, is highly diverse and can be used, as well as meiofauna, as a tool for natural and anthropogenic impacts monitoring. This study is part of the institutional project \" Dynamic of the Continental Shelf Ecosystem of the South Atlantic West Region\". The objective of this project is to study the physics mechanisms that provide the South Atlantic Central Water (ACAS) penetration in the continental shelf and the impact that it causes on the biological processes in two locations: Cabo Frio and Ubatuba. The objectives of this study were: to analyze the composition and structure of the meiofauna community, the associations of families and genus of Nematoda on the inner and outer shelf of Cabo Frio and Ubatuba, as well as its relations to the environmental variables, especially with sediment grain size, phytopigments biomass and water masses characteristics. Samples were taken on two depths (40 and 100 m), in the summer and winter of 2001 in Cabo Frio and in the winter of 2001 and summer of 2002 in Ubatuba. Two 30 x 30 cm boxcorer were used, and from each one two samples were taken with a 4.9 cm2 superficial area and 10 cm height tube corer, for the meiofauna sampling. Meiofauna was separated in higher groups and 200 Nematoda were identified per station. The highest meiofauna densities were found on 40 m during summer in Ubatuba (2001.7±703.1) and on 100 m during summer in Cabo Frio (1010.0±959.0). These benthic responses could be a consequence of the increase of primary pelagic production, in consequence of the intrusion of SACW (South Atlantic Central Water), and its sedimentation in Cabo Frio and Ubatuba, as well as the terrigenous input on the Ubatuba inner shelf. The Nematoda genus composition was related mainly to sediment grain size. Cabo Frio inner shelf, with sandy sediments and constant dynamics was characterized by the dominance of the genera Daptonema (Xyalidae), while outer shelf in the summer in Cabo Frio by the genera Aponema (Microlaimidae), that was associated with phytodetritos and fine sediments. During winter Sabatieria (Comesomatidae) was dominant. Ubatuba stations were characterized by Terschellingia (Linhomoeidae) and Sabatieria (Comesomatidae) on the inner shelf, in summer and winter times. At 100 m depth Desmoscolex (Desmoscolecidae) and Sabatieria (Comesomatidae) were the most abundant genus during winter and summer. The highest genus diversities were observed in Ubatuba, which suggests that diversity may be related to sandy, heterogeneous sediments. Regarding the trophic groups, selective and non-selective deposit feeders were the most abundant on the study area. The multivariate analyses proved that analyses on a genus level allowed a better environmental characterization of the study area, when compared to analyses on the level of family or meiofauna groups.

Coastal saltmarshes are vital ecosystems because (a) they physically buffer the land against storms and flooding from the sea and (b) ecologically they are high-productivity systems in estuaries and marine coastlines that shelter and support fish and bird populations. Saltmarshes are highly sensitive to sea level change. Any saltmarshes are now threatened by rising sea level, but how they will respond and at what rate is unclear. Managing saltmarshes is therefore necessary, but requires a good understanding of their development in order to predict how they might respond to sea level change. Current management practice in the UK is mainly managed realignment landward and future scenarios are predicted with computer models. Both use the hypothesis of facilitation succession, whereby saltmarsh progrades seawards. An alternative hypothesis is saltmarsh development by transgression landward due to rising sea level. This thesis critically examines how saltmarshes have developed under different sea-level change regimes in order to gain an insight into how they are likely to be affected by future sea level rise. Using established micropalaeontological techniques, Foraminifera tests and Ostracoda shells were extracted from sediment cores taken from saltmarshes representing a range of sea level change histories during the Holocene. Sampling of modern environments allowed saltmarsh vegetation zones to be characterised by foraminiferal and ostracod assemblages which were then used to reconstruct the development of saltmarshes over time as preserved in the cores. Sediment layers in the cores were dated using three techniques: Optically Stimulated Luminescence (OSL), radio carbon (14C) and 137Cs / 210Pb. The latter hypothesis is supported in southern England where marine transgression caused saltmarshes to migrate landwards, in contradiction to the facilitation succession hypothesis. In Scotland saltmarshes advanced seawards but due to a marine regression. Future studies should explore the applicability of these findings to saltmarshes outside the British Isles.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1995_1.pdf: 1694971 bytes, checksum: ec931b1ef5cabc47ff697e28610e6ad5 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004
O presente estudo objetivou determinar a importância da meiofauna como fonte de alimento para os peixes das famílias Gerreidae (Diapterus rhombeus e Eucinostomus sp.) e Gobiidae (Bathygobius soporator e Gobionellus oceanicus). Considerando que os Nematoda constituem o grupo mais representativo da meiofauna no canal de Santa Cruz, Itamaracá PE, investigou-se se poderia existir uma seleção por parte dos predadores. As coletas se processaram em três meses de estiagem e três meses chuvosos em 1998/1999. Foram coletadas 4 réplicas na baixamar com um corer de 2,6 cm de diâmetro e 5,0 cm de comprimento. Os peixes juvenis cujo comprimento padrão do corpo variou de 1,7 a 5,5 cm, foram capturados com rede de arrasto de 1 mm de abertura. A meiofauna dos sedimentos e dos conteúdos gastro-intestinais foi separada através de peneiras com abertura de malhas de 0,044 a 0,5 mm. Cem Nematoda foram retirados das amostras sedimentológicas e todos os indivíduos dos conteúdos para identificação. Foram feitas análises de similaridade para o emprego das ANOSIM, MDS, e SIMPER. Onze táxons foram registrados, apresentando a densidade máxima em janeiro/99 (20.458 ind. 10 cm-2) e a menor em junho/99 (4.162 ind. 10 cm-2). Os táxons mais abundantes foram os Nematoda seguidos dos Copepoda. Os outros demais grupos apresentaram densidades que variaram temporalmente. Os índices de diversidade empregados para a meiofauna e Nematoda dos conteúdos não mostraram grande variabilidade sazonal. O MDS utilizado para correlacionar a meiofauna e aquela correspondente aos segmentos gastro-intestinais mostrou que, possivelmente, os peixes não se alimentam de todos os táxons determinados no ambiente, indicando uma seleção. O SIMPER mostrou que Copepoda e Nematoda são os táxons responsáveis pelo padrão de alimentação, sendo os primeiros os mais abundantes. Um total de 56 gêneros de Nematoda foram registrados no sedimento, sendo que, destes, três foram detectados somente no conteúdo gastro-intestnal dos peixes. Os mais abundantes foram Terschellingia longicaudata, Spirinia septentrionalis, Daptonema sp.1 e Theristus sp.2, tendo sido determinada uma espécie nova para o último gênero citado. A população nematofaunística esteve composta, principalmente por juvenis. A classificação trófica foi composta, principalmente, por comedores seletivos de depósito (1A) no período seco e por comedores de epistratos (2A) no período chuvoso. A ANOSIM indicou haver correlação significativa tanto para a nematofauna e os gerreídeos, como também para os gabiídeos. A equitabilidade acompanhou a diversidade, sendo mínimas em fevereiro. Os peixes estudados apresentaram uma preferência por Copepoda, enquanto os Nematoda, parecem ser um item negligenciado, não existindo preferência por qualquer gênero em particular. No entanto, foi possível concluir que a meiofauna representa um potencial considerável como alimento para níveis tróficos superiores, tendo em vista as altas densidades registradas. De acordo com a quantidade de indivíduos meiofaunísticos detectados no conteúdo gastro-intestinal dos peixes, a meiofauna deve ser compreendida como uma importante fonte energética para peixes juvenis estuarinos

In recent years there has been a desire to definitively catalogue the life on our planet. In light of the increasing extinction rates that are driven by human activities, it is unlikely that this will be achieved using traditional methods. Whilst most organisms which have a body size of more than 1cm have been described, the vast majority of animal life is smaller than this, collectively known as meiofauna, and is yet to be catalogued. Meiofaunal organisms present a range of problems for traditional taxonomy. Firstly they are microscopic, meaning that morphological features are often difficult to resolve. Secondly these creatures often exhibit cryptic diversity meaning that different species often look the same. Thirdly, it is often the case that the organisms are poorly described in the literature making it very difficult to confirm identification, assuming that someone has already described it. It is possible, however, to obtain DNA sequences from these organisms. DNA barcoding, the use of short sequences of DNA to identify individuals, is now commonly used in a wide range of applications. It has been proposed that a single target gene should be sufficient to describe all organisms this way. Barcodes can be acquired from individuals or from bulk extractions from environmental samples. In the latter case, many of the sequences obtained are novel and unlikely to ever have a type specimen associated with them. When this is the case, assessing the diversity of a sample becomes a computational exercise. However, as yet, there is no agreed standard method adopted for analyzing the barcodes produced. Indeed most methods currently employed lack objectivity. This thesis investigates the efficiency of a range of gene targets and analysis methods for DNA barcoding, with an emphasis on meiofaunal organisms (nematodes, tardigrades and thrips). DNA barcodes were generated for up to three genes for each specimen. Sequences for each gene were analysed using two programs, MOTU_define.pl and DOTUR. These programs use different methods to assign sequences to operational taxonomic units (OTU), which were then compared. An objective method for analysing sequences such as MOTU_define.pl, which relies on only the information contained in the sequences, was found to be most suitable for designating taxa. It does not attempt to apply evolutionary models to the data, and then infer taxa from the derived data. In addition to barcoding, some samples were pre-processed using video capture and editing (VCE). This creates a virtual slide of a specimen so that a sequence can be linked to a morphological identification. VCE proved to be an efficient method to preserve morphological data from specimens.

O objetivo deste estudo foi avaliar se a estrutura da comunidade da meiofauna, das famílias e dos gêneros de Nematoda apresentam alterações devido à atividade antrópica na área próxima a Estação Antártica Brasileira (CF), em comparação com um controle (BP). A densidade média (ind.10cm-²) da meiofauna total variou entre 7028 (? 1529) e 16245 (? 12282) nos 20-30 m e entre 1569 (? 928) e 7088 (? 10338) nos 50-60 m, corroborando os valores altos já descritos para a zona rasa antártica. Nematoda foi dominante (>90%), seguido de Nauplii e Copepoda. 65 gêneros e 3 subfamílias de Nematoda foram encontrados, pertencentes a 24 famílias. Daptonema, Halailamus, Dichromadora, Sabatieria, Aponema e Sphaerolaimus foram dominantes nas duas profundidades, mas tiveram densidades mais altas nos 20-30 m relacionadas à maior biomassa de clorofila a. Não foram identificadas alterações na estrutura da comunidade da meiofauna, das famílias ou gêneros de Nematoda que pudessem ter sido causados por impacto antrópico. Porém, a riqueza e a diversidade das famílias e dos gêneros de Nematoda foram menores em CF, o que sugere um possível impacto, sendo importante a continuidade do monitoramento e a inclusão de outras áreas de referência. O nível taxonômico de família foi o mais apropriado para um estudo de monitoramento da zona costeira rasa antártica, visando o melhor custo-benefício.
The aim of this study was to verify if meiofauna, Nematoda family and genera community structure show modification caused by human activities at the Brazilian Antarctic Station (CF), in relation to a reference area (BP). Mean meiofauna densities ( ind.10 cm-²) ranged from 7028 (? 1529) to 16245 (? 12282) at 20-30 m and from 1569 (? 928) and 7088 (? 10338) at 50-60 m, being high as already described for the Antarctic coastal zone. Higher densities at 20-30m were correlated to more chlorophyll a and sand. Nematoda were dominant (>90%) followed by Nauplii and Copepoda. 65 genera and 3 subfamilies of Nematoda were found, belonging to 24 families. Daptonema, Halailamus, Dichromadora, Sabatieria, Aponema and Sphaerolaimus were dominant at both depths, but had higher densities at 20-30 m, which were correlated to higher chlorophyll a biomasses. Analysis for all levels of taxonomic resolution, separated the samples between depths, but not between areas, so differences caused by human impact were not detected. Number of genera ranged from 12 to 34 and diversity from 1.57 to 4.22 bits/ind, both being higher at 50-60m at BP, suggesting that an impact might have occurred, so monitoring should continue and be extended to other control areas. Identification of Nematoda to family level would be enough to evaluate environmental impact of the coastal antarctic zone.

The meiofauna of a mangrove forest in the River Barwon estuary was studied by means of surveys and field experiments. Distinctive assemblages of meiofauna were described from the sediment and pneumatophores of the ecosystem. Fine resolution of phytal habitats was demonstrated, and particular assemblages of meiofauna were characteristic within habitat provided by dominant epibionts. Distribution of the meiofauna within leaf litter revealed high turnover rates of nematodes, and some factors controlling detrital assemblages were assessed. The vertical profile of sedimentary meiofauna was examined, and changes in abundance were related to the tychopelagic habit of many taxa at high tide. Dispersal within the water column was confirmed by pelagic trapping, and colonisation of mimic pneumatophores was investigated. The amount of algal cover, effects of grazing by gastropods, and rugosity of the colonised surface were shown to influence meiofauna colonisation of mimic pneumatophores. Establishment and persistence of patchy distributions of meiofauna at scales of less than 10 m in an intertidal environment was demonstrated, and it was concluded that this was due to the dynamic nature of assemblages rather than their integrity.

Estuaries are naturally stressed systems with a high degree of variability in their physical-chemical characteristics. The natural gradient of salinity, linked with other gradients (e.g. sediment type and dynamics, oxygen availability, temperature and current speed) are well documented as important factors in determining temporal and spatial variations in meiofauna communities. Among the estuarine biological components, meiobenthic communities are good indicators of environmental conditions and therefore changes in their density, diversity, structure and functioning indicate important alterations of the ecosystem. In fact, the phylum Nematoda are the ideal indicator group because they are the most diverse and abundant meiofaunal metazoans of aquatic habitats. The main aim of this study was to advance the general understanding of the spatial distribution patterns of the nematode assemblages along the Sado estuarine gradient. There were analysed structural components of nematode assemblages (abundance, species richness and diversity metrics) as well as functional attributes such as Maturity Index and Trophic Diversity Index. Additionally, multivariate analysis on community data was performed, together with Redundancy Analysis to understand which environmental factors explain the variations in the community. The results showed significant differences in the nematode structural assemblage patterns among the estuary sections. The abundance and diversity of nematodes were related with environmental variables including TOM (Total Organic Matter) concentration, the sediment grain size and the levels of dissolved oxygen. The sections with the highest TOM and lowest oxygen concentration were dominated by the opportunistic genera that were more resistant to unfavourable conditions and were responsible for low species richness. Functional attributes did not exhibit any significant differences among Estuary sections. As a conclusion, nematodes assemblages turned to be good bioindicators of heterogenous environmental conditions of this estuary, especially regarding the detection of sites with higher TOM concentration; Padrões de distribuição espacial das comunidades de nematodes bentónicos e das suas características funcionais no Estuário do Sado (Portugal). Resumo: Os estuários são sistemas naturalmente perturbados, com grande variabilidade nas suas características físicas e químicas. O gradiente natural de salinidade, associado a outros gradientes (por exemplo, granulometria, hidrodinamismo, oxigénio, temperatura e correntes das marés), estão bem documentados como sendo fatores determinantes para as variações temporais e espaciais das comunidades de meiofauna. Entre os diferentes componentes biológicos associados a um ambiente estuarino, as comunidades meiobentónicas são consideradas bons indicadores das condições ambientais. Isto porque, quando existem alterações na sua abundância, estrutura funcional pode ser resultado do efeito de alterações nos ecossistemas. Nematoda é o grupo taxonómico da meiofauna que em geral é mais abundante e é considerado um bom indicador ecológico. O principal objetivo deste estudo é analisar o padrão de distribuição espacial das comunidades de nematodes ao longo do gradiente estuarino do estuário do Sado. Foram analisadas variáveis ambientais consideradas determinantes para os padrões de distribuição da abundância e composição de géneros ao longo do estuário do Sado, assim como para a distribuição dos atributos funcionais das comunidades. Através da análise multivariável das abundância e diversidade comunidades foi possível determinar os fatores ambientais que melhor explicam as variações na comunidade. Também foi feita analise multivariada com base nos dados das comunidades tais como a Analise de Redundância para entender quais os fatores ambientais que melhor explicam as variações das comunidades. Os resultados mostram diferenças significativas na densidade e diversidade das comunidades de nematodes entre as várias secções do estuário. A densidade de nematodes apresentou relação com diferentes variáveis ambientais analisadas, tais como a concentração de TOM (matéria orgânica total), granulometrias e consequentemente os níveis de oxigénio dissolvido. Nas seções com maior TOM e menor concentração de oxigênio verificou-se que os géneros oportunistas eram mais abundantes, sendo estes mais resistentes a condições desfavoráveis e responsáveis pela baixa riqueza de espécies. As características funcionais não apresentaram diferenças significativas entre as seções do estuário. Pode concluir-se que as comunidades de nematodes se tornaram bons bioindicadores de condições ambientais heterogêneas deste estuário, principalmente quanto à deteção de sítios com maior concentração de TOM.

Tra i vari impatti causati dall’aumento costante di CO2 nell’atmosfera troviamo l’acidificazione oceanica. Le conseguenze di questo processo non sono interamente conosciute. Per questo è importante conoscere la risposta all’acidificazione degli organismi marini e degli ecosistemi. Lo scopo di questo lavoro è valutare le conseguenze dell’acidificazione su comunità meiofaunali epifite. Sono stati quindi condotti campionamenti in situ, in una zona acidificata in conseguenza della presenza di vents idrotermali presenti nell’isola di Ischia (Italia). La zona di studio indagata è stata suddivisa in due siti, differenti per esposizione al moto ondoso. All’interno di ciascuna esposizione sono stati individuate tre stazioni, differenti per il grado di acidificazione. Sono stati prelevati campioni di alghe lungo il gradiente di acidificazione con associata la meiofauna e sono stati considerati come substrato secondario. Le alghe sono state analizzate attraverso descrittori della loro complessità mentre gli organismi sono stati contati e classificati a livello di grandi taxa. I descrittori sintetici di ricchezza tassonomica e di abbondanza non presentano valori di correlazione alti con i descrittori di complessità algale. Invece, i risultati ottenuti considerando l’intera comunità mostrano una relazione significativa fra la struttura delle comunità meiofaunali e l’acidificazione e anche con la diversa esposizione al moto ondoso. Infine dalle analisi condotte mediante regressione multipla fra tutti i descrittori algali e la struttura di comunità si nota come i primi non giustificano da soli le variazioni dei popolamenti meiobentonici. In definitiva questi risultati sembrerebbero dimostrare che la struttura delle comunità meiofaunali venga influenzata sia dalla acidificazione che dall’esposizione al moto ondoso oltre che dalla struttura dell’habitat. È tuttavia difficile definire se le variazioni nella struttura di comunità sono dovute ad una azione parallela e sinergica dei fattori considerati (esposizione e gradiente) o se si tratta di un effetto a cascata dove l’acidità influenza le comunità algali che a loro volta strutturano le comunità bentoniche associate. In prospettiva di studi futuri sarebbe quindi interessante condurre uno studio simile prendendo in considerazione le possibili relazioni specie-specifiche intercorrenti tra la struttura delle comunità meiofaunali e le differenti specie algali.

Meiofauna are an ecologically significant component of marine benthic communities worldwide. Nematodes, in particular, are arguably the most abundant metazoans on Earth and often form highly diverse communities in marine sediments. The study of meiofauna, however, often lags behind that of macrofauna, probably due to the small size of meiofaunal organisms and the paucity of suitably-trained taxonomists or para-taxonomists. Our understanding of basic ecological questions, such as the role of meiofauna in the energetics of benthic communities, as well as the nature and extent of possible relationships between meiofauna and macrofauna in detritus-based communities, is still limited. The present study aimed to address these questions in the context of intertidal seagrass (Zostera muelleri) meadows and adjoining unvegetated sediments in Papanui Inlet, Otago Peninsula. The near absence of taxonomical and ecological studies on free-living marine nematode species in New Zealand also prompted the description of several new species and as well as a comparison of species assemblages from the study sites. Meiofaunal abundance (range: 1325-4979 ind. 10cm�) in the top 5cm of sediments was not significantly different inside and outside the seagrass meadow. Meiofaunal biomass and production estimates were small relative to macrofauna (approx. 1 and 5% of macrofaunal values, respectively), with little variation in both meiofaunal and macrofaunal values between vegetated and unvegetated habitats. Analysis of the isotopic and fatty acid composition of primary producers, sediment organic matter, and consumers at the study sites suggest that a significant proportion of secondary productivity in seagrass meadows is fuelled by macrophyte detritus. These data suggest that secondary productivity in the seagrass meadow was limited by the low palatability of macrophyte detritus compared with microalgal food sources, resulting in lower trophic transfer efficiency in vegetated sediments. These results contrast with previous findings showing a large contribution of meiofauna to the secondary productivity of vegetated sediments, as well as greater secondary productivity inside than outside seagrass meadows. The nature of the sediments (coarse particle size with low organic matter content) is likely to have led to low meiofauna biomass whilst favouring large suspension feeders. The low availability of high quality food sources (i.e. seston, benthic microalgae, and epiphytes) in vegetated sediments may have contributed to the lower than expected secondary productivity inside the seagrass meadow. Most of the dominant nematode species found at the study sites were new to science, and 6 new species were described. Significant differences were found in the nematode assemblages between sites and sediment depths. There was a trend of greater nematode diversity and abundance in vegetated sediments, but this was restricted to the uppermost 2cm of sediments. The effect of seagrass on nematode assemblages is likely to be mediated by the effect of blades on sediment characteristics and the presence of roots. The present study suggests that the presence of Zostera muelleri results in greater biodiversity of sheltered soft-shore communities on a local scale. The addition of ��C-labelled macroalgal detritus (Enteromorpha) to microcosms in a feeding experiment resulted in minimal labelling of harpacticoid copepods and nematodes. Lack of change in the fatty acid composition of the latter also suggests limited assimilation of detritus during the experiment. It is likely that consumers choose benthic microalgae over detritus when both food sources are available in the field. High content of highly unsaturated fatty acids (HUFAs) in nematodes from the field suggests, for the first time, that they are a high quality food source to higher trophic levels. A feeding experiment investigating the effect of bacterivorous nematodes on detritus assimilation rates by amphipods did not support the hypothesis that nematodes increase the trophic transfer efficiency between detritus and macrofaunal detritivores. It is unclear whether amphipods preferentially fed on detritus or whether nematodes escaped predation by burrowing deeper in the sediment. Data obtained in the present study, however, shows that marine bacterivorous nematodes can biosynthesise/accumulate HUFAs in high concentrations despite their low concentrations in their diet. Nematodes could, therefore, provide an important source of these essential nutrients to bulk deposit feeders living in otherwise HUFA-poor sediments.

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Este trabalho consistiu em estudar o povoamento do substrato pela meiofauna (com ênfase aos Nematoda livres) associada às macroalgas Sargassum furcatum, S. polyceratium, Hypnea musciformis, Padina gymnospora e à fanerógama marinha Halodule wrightii , sob a tese de que a estruturação das comunidades meiofaunísticas depende da arquitetura da planta e/ou do estrato ambiental em que esta se desenvolve. Para tanto, foram coletados durante os períodos seco e chuvoso do ano de 2001, exemplares dessas plantas nas praias de Pedra do Xaréu, Candeias e Coroa do Avião, em Pernambuco, e praia do Farol, no Rio de Janeiro. Foram medidas a temperatura e salinidade da água e o índice de precipitação pluviométrica na ocasião das coletas. Medidas de complexidade estrutural do substrato algal foram feitas em laboratório, após o que a meiofauna foi extraída através de técnicas de rotina. Lâminas permanentes foram confeccionadas para o estudo taxonômico e biológico dos Nematoda. Foi feita a estimativa total dos gêneros identificados. Foram realizadas análises de similaridade (ANOSIM) para comparação da estrutura das associações de meiofauna e gêneros de Nematoda entre as amostragens, utilizando-se o índice de similaridade de Bray-Curtis. Para identificar a correlação entre as variáveis ambientais e a estrutura das comunidades da meiofauna e da nematofauna aplicou-se a análise BIOENV. Os parâmetros ambientais considerados determinantes na estruturação das comunidades meiofaunísticas foram a precipitação pluviométrica e a salinidade, assim como a altura e o volume do substrato fital. Estatisticamente, quase todos os substratos fitais abordados diferiram significativamente entre si. A menor diversidade e também a menor densidade meiofaunística foram encontradas em Halodule wrightii. P. gymnospora, que apresentou as maiores densidades meiofaunísticas, e Hypnea musciformis foram consideradas semelhantes estatisticamente no que diz respeito à sua meiofauna associada. Sargassum furcatum e S. polyceratium se distinguiram das outras plantas tanto estruturalmente como em relação à meiofauna. Os grupos meiofaunísticos que mais se destacaram foram os Amphipoda e Copepoda Harpacticoida. Foram determinados 86 gêneros de Nematoda, com 9 novos registros para o Brasil. Destacaram-se os gêneros que apresentam cutículas pontilhadas, assim como os herbívoros. Mecanismos visuais foram praticamente ausentes na nematofauna fital como um todo. A maior diversidade foi observada em Sargassum polyceratium e S. furcatum, onde Hypodontolaimus, Euchromadora, Graphonema, Chromadora, Chromadorina e Oncholaimus dominaram, com gêneros de cutícula lisa ocupando preferencialmente o ápice da planta, ficando o meio e a base desta colonizados por aqueles de cutícula pontilhada. Chromadorina e Oncholaimus também dominaram em Halodule wrightii, acompanhados por Promonhystera. Hypnea musciformis. se destacou das outras plantas, abrigando como gêneros mais abundantes Euchromadora e Acanthoncus, e em Padina gymnospora dominaram Halalaimus, Chromadorina e Euchromadora. A nematofauna associada a todos os substratos fitais distinguiu-se da intersticial da mesma localidade. Estes resultados, quando considerados conjuntamente com aqueles obtidos para a meiofauna total, mostram-se decorrentes tanto da arquitetura como do estrato ambiental em que a planta substrato se desenvolve, vindo a confirmar a hipótese inicial do trabalho

Most estuarine primary consumers are found on the bottom of the estuary, where a rich benthic community is usually very abundant, and they are directly involved in most physical and chemical processes that occur in estuaries, such as interaction with sediments, the nutrient cycle and energy flux. The meiobenthos is an important benthic component in marine and estuarine sediments, and is composed of animals of sma11 body size, with a range between 31-1000 um. In estuarine sediments, meiofauna: (i) facilitate biomineralization of organic material and enhance nutrient regeneration, (ii) serve as food for a variety of higher trophic levels, and (iii) exhibit high sensitivity to environmental modification. The spatial, temporal and vertical distribution, abundance, species composition and fluctuations of the meiobenthic communities are deeply influenced by several biotic and abiotic factors: food resources, oxygen, salinity, temperature, turbidity, hydrodynamic regime, sediment grain size characteristics and topography, trophic relationships, biogenic structures, bioturbation, disturbance effects. In sediments, the most abundant taxon of meiofauna is usually nematodes, and copepods are typically second. In shallow estuaries there are often dense communities of monocotyledonous flowering plants, seagrass beds, which extend mainly by under-sediment rhizome systems. In temperate regions, the seagrass beds of Zostera are the most common of these plants, occurring in mud and sandy soft sediments. In recent years, there has been a surge of interest in the fauna) composition and ecology of the invertebrates inhabiting seagrass beds. The impetus for such research effort has largely been based upon a recognition of the role seagrass beds play in the energy flux of estuaries, either through their release of dissolved organic carbon directly into the water column, or, after defoliation and the fragmentation of leaves, by contributing to the detritus pool. There are several studies that have focused on the meiobenthic communities associated with seagrass beds; however, only two studies were identified concerning meiofauna associated with seagrass beds of Zostera noltii, which were studied in terms of density, biomass and seasonality based on major taxa. The meiobenthos studies in Portugal are documented by only three studies: Austen et al. (1989) studied the community structure of the macrobenthos and meiobenthos in the Ria Formosa; Rosado (1996) studied the meiofauna from different sediments of the Sado estuary and Franco (1999) studied the vertical distribution of meiofauna in the Tejo estuary. The current study essentially centres on the study of the meiofauna of the sediments associated with seagrass beds of Zostera noltii in the Mira estuary, through the study of the temporal variation of the meiofauna communities, focusing on the ecology of the free-living marine nematodes. lts aim is to relate the temporal and vertical variation patterns of meiobenthic composition communities to variations in the environmental factors, and to discuss how strong is the influence of the temporal changing environment on the structural characteristics of the meiofauna taxa, and the trophic and age composition of the nematodes. The study was carried out at two sampling sites to compare meiofauna composition, Nematoda assemblages and density temporal and vertical variation patterns, and to discuss structuring factors of meiofauna and Nematoda assemblages at both sampling sites. The higher abundances and composition of meiofauna and Nematoda assemblages observed throughout the study agree with the results of previous observations carried out in the vegetated intertidal muddy sediments of several estuaries. A total of 17 meiofauna taxa were registered, with Nematoda the dominant taxon (>87%). The higher relative densities of Nematoda taxon structured the temporal variations, and consequently the seasonality of meiofauna assemblages. The study of the temporal variation of the dominant genera, age and trophic composition and the several relationships with environmental factors allowed an explanation of the structuring factors of the temporal dynamics of meiofauna communities. /RESUMO/ A comunidade bentónica constitui a maioria dos consumidores primários nos sedimentos estuarinos e está envolvida na maioria dos processos físicos, biogeoquímicos e biológicos relacionados com os fluxos de matéria e energia nos ecossistemas estuarinos. A meiofauna bentónica (=meiobentos) é uma componente importante da fauna associada aos sedimentos marinhos e estuarinos, é constituída por pequenos organismos com representação filogenética em quase todos os phyla de invertebrados: Vinte três taxa dos trinta e três fila que constituem os metazoários têm representação na meiofauna, nomeadamente: Nematoda, Turbellaria, Oligochaeta, Polychaeta, Copepoda, Ostracoda, Mystacocarida, Halacaroidea, Hydrozoa, Nemertina, Entoprocta, Gastropoda, Aplacophora, Brachiopoda, Holothuroidea, Tunicata, Priapulida e Sipunculida. A definição metodológica de meiofauna tem como base a malha da rede dos crivos utilizados para a sua extracção, incliu todos os organismos metazoários bentónicos que atravessam uma rede de malha 1000 gm e ficam retidos numa malha de 31 gm. São organismos com cicios de vida curta, dias ou semanas e de reprodução contínua ao longo do ano. Em sedimentos estuarinos não perturbados o meiobentos apresenta densidades que podem atingir 10 6 ind m-2, com valores tendencialmente mais elevados nos sedimentos ricos em matéria orgânica e mais baixos nas areias limpas. Os nemátodes geralmente são o grupo taxonómico dominante, podendo atingir 60-90% das comunidades meiobentónicas estuarinas, e os copépodes o segundo grupo mais abundante, podendo ocasionalmente serem outros taxa os dominantes. A meiofauna não constitui um grupo ecológico homogéneo, a estrutura e composicão das comunidades são específicas de cada ecossistema. Assim, as comunidades existentes nas vasas, nas areias, nos diferentes ambientes epibenticos ou ao longo dos gradientes de salinidade de um estuário diferem significamente. A grande diversidade de estratégias alimentares destes organismos explica a sua presença numa grande diversidade habitats, inclui detritívoros de superfície, detritívoros escavadores, herbívoros, filtradores ou suspensívoros, omnívoros e predadores A distribuição, abundância, composição e variações temporais das comunidades meiobentónicas são controladas por factores físicos e biológicos. Os factores abióticos descritos como determinantes na estrutura e dinâmica das comunidades são: granulometria do sedimento, temperatura, salinidade, oxigênio, topografia dos sedimentos, regime hidrodinâmico e perturbações físicas e químicas de natureza antropogénica. Factores bióticos como as relações tróficas, disponibilidade de alimento, bioturbação e a presença de estruturas biogénicas são interacções biológicas condicionantes das comunidades. Os organismos meiobentónicos têm um papel importante nos processos de fluxo de energia através das comunidades bentónicas. São consumidos por organismos dos níveis tróficos superiores, tendo sido demonstrado sua importância como presa da macrofauna e outros invertebrados e ainda por juvenis de peixes; são também consumidores de microfitobentos e estão relacionados com os micro-organismos decompositores. As interacções da meiofauna com as populações bacterianas e os detritos coloca-a numa cadeia detrítica complexa, através do incremento da biomineralização da matéria orgânica e regeneração dos nutrientes: a fragmentação mecânica dos detritos vegetais acelera o seu processo de decaimento, o consumo de bactérias, produção de muco e excrecção de nutrientes que são consumidos directamente pelas populações bacterianas, mantêm o seu crescimento em Iog phase". A composição e abundância das comunidades variam geralmente de uma forma sazonal, ocorrendo um evidente padrão anual de abundância e de sucessão de espécies. Em diferentes ecossistemas os ciclos sazonais são muito variáveis, dependendo das condições ambientais e da composição de espécies. Nos climas temperados as populações atingem os valores máximos de abundância nos meses com temperaturas mais elevadas, apesar das espécies, individualmente, poderem atingir a máxima abundância noutros períodos. Os factores que regulam os padrões sazonais estão pouco descritos, sendo dificil separar os efeitos da temperatura, disponibilidade de alimento, tipo de sedimento e salinidade devido ao facto destas variáveis se encontrarem profundamente relacionadas. O oxigénio penetra apenas nas camadas superficiais dos sedimentos, condicionando fortemente a distribuição em profundidade da fauna, que fica restrita à superfície. Nas vasas, mais de 70% da meiofauna encontra-se nos primeiros 5 cm de profundidade, pois a maioria das espécies necessita de oxigénio para metabolizar. As interacções existentes entre factores físicos e biológicos são também determinantes na distribuição vertical da meiofauna, nomeadamente a granulometria do sedimento, temperatura, água insterticial, a presença de estruturas biogénicas, e.g. os rizomas das plantas intertidais, o padrão vertical de distribuição dos recursos alimentares e as interacções biológicas. Nos últimos anos tem sido crescente o interesse pelo estudo da composição e estrutura das comunidades dos sedimentos associados às plantas intertidais. As fanerogâmicas em geral e as Zosteráceas em particular são consideradas como uma das principais fontes de matéria orgânica nos ecossistemas costeiros de clima temperado. Estes povoamentos desempenham um papel importante nos processos de fluxo de energia na rede trófica dos ecossistemas estuarinos. A Zostera é um macrófito com rizomas que retira os nutrientes maioritariamente dos sedimentos, é responsável pela transferência de elevado teor de carbono orgânico para a coluna de água e através de elevada produção de detritos tem um contributo importante para cadeia detrítica. Tem influência directa na estrutura trófica dos vertebrados, nomeadamente de peixes que encontram aí uma zona de alimento, de "nursery" para estadíos juvenis de peixes e epibentos. Apesar do género Zostera estar presente em inúmeros estuários e rias da costa portuguesa os estudos realizados até à data são escassos e pontuais. Existem alguns estudos sobre as comunidades meiobentónicas associados às plantas intertidais das regiões temperadas e subtropicais Thalassia testudinum, Posidonia oceanica, Spartina e Zostera. No entanto, só se conhecem dois trabalhos relacionados com as comunidades meiobentónicas dos sedimentos associados aos povoamentos de Zostera noftá e foram realizados na baía de Arcachon, France. Teve como objectivo a identificação da variação da densidade e da sazonalidade dos grandes grupos taxonómicos da comunidade da meiofauna identificada. No sul do Japão foi estudado a variação temporal das comunidades meiobentónicas associadas aos povoamentos de Zostera marina, tendo sido focalizado na comunidade de nemátodes, identificada como mais abundante. Em Portugal os estudos relacionados com as comunidades de meiofauna são muito escassos, sendo apenas conhecidos três trabalhos que estudaram a composição das comunidades meiobentónicas, ao nível das grandes grupos taxonómicos, em diferentes tipos de sedimentos nos estuários do Tejo, Sado e Ria Formosa. Não existem estudos relacionados com as comunidades de meiobentos nos povoamentos de fanerogâmicas marinhas.

This thesis focuses on the study of the meiofaunal community in streams and rivers of the Mediterranean region. It approaches to a community level from a functional point of view, studying their response as a whole to different processes occurring in those systems. The thesis is divided into 5 chapters, in which we sampled various substrates in order to study the small-scale processes affecting them and the interactions with other organisms. We focused essentially on the main lotic ecosystem determinants: hydrology and nutrient inputs (organic and inorganic). In Chapter 1, we studied the meiofaunal community over 2 years. Its structure reflected high intra- and inter-annual variability, which coincided with the alternating periods of hydrological stability and disturbances. Since flow is a major abiotic determinant of invertebrate distribution patterns in streams and its impact on meiofauna is relatively well known (see Swan and Palmer, 2000 and references therein), the study addressed mainly the adaptive responses of organisms to spates and droughts in a Mediterranean context. These adaptations were measured in terms of advantageous traits (either structural or life strategies) that could confer resistance or resilience to organisms. Results from that study pointed out that the resilient response of meiofauna in downstream reaches of the study site had a slower recovery given that heavy rainfall events resulted in higher discharges (as a consequence of higher water run-off from catchments). In that system, previous hydrological history also appeared to modulate invertebrate response to floods, diminishing recovery response of the community in that reaches. In contrast, this effect was not observed in the most upstream reach which also showed a fast recovery after spates caused by higher habitat heterogeneity and complexity that served as a refuge to fauna. Organic matter input and its availability to consumers is one of the major processes in headwater streams. In Chapter 2, we analysed the colonisation pattern of experimentally disposed riparian leaves, including all organisms (bacteria, fungi, protozoa, meiofauna and macroinvertebrates) involved to trace the fate of carbon during the process. The experiment showed a clear energy transfer from bacterial to faunal compartments modulated by differences in temperature and discharge that naturally occurred in the stream. Eutrophication of lotic systems is one of the negative results of human activity. Therefore we paid special attention to the effects of nutrient availability to meiofauna because their small size and high turnover rates can provide information of interest about their rapid response to these kinds of disturbances. In Mediterranean systems scarcity can potentiate the negative effects of eutrophication. Therefore, we also explored the interaction of hydrology and nutrient inputs. In Chapter 3 we analysed the meiofaunal response to an experimental addition of nutrients in an almost pristine headwater stream. For this purpose, we focused on differences in community assemblages and secondary production of microcrustaceans, finding that hydrological stability and even water scarcity could potentiate the effects of the nutrient addition. In that system, hydrological disturbances were the “background noise”. In contrast, in Chapter 4 we explored a nematode community in a eutrophic system and we focused on the stability of substrate. We found a different pattern of fauna inhabiting the same biofilm depending on the mobility (attached vs. free-floating cyanobacterial mats). Nematodes were found to be an active part of this detachment though their activity and adapted their life strategies to those changes. In Chapter 5, using a laboratory experiment, we analysed the fast response of two nematode species to eutrophication and examined life strategies adopted to adapt to increased nutrient availability. We could observe a clear bottom-up effect in microcosms and also that small differences in behavioural attributes may shape the successional pattern of recolonisation after a disturbance.
L’objectiu principal d’aquesta tesi doctoral és caracteritzar la comunitat de la meiofauna en sistemes mediterranis i integrar-la com a baula dins dels processos funcionals d’ambients lòtics. Tot i que el coneixement sobre la meiofauna d’aigua dolça és encara escàs, aquesta tesi no ha pretès tenir un caire descriptiu de la comunitat des d’un punt de vista taxonòmic sinó emprar classificacions funcionals que permetin integrar la meiofauna en processos i contextos més amplis. La tesi esta articulada en 5 capítols i en cadascun s’ha mostrejat diferents substrats en funció de les interaccions entre organismes i les característiques dels processos a petita escala. En aquests experiments, s’han adreçat diferents qüestions depenent de l’hàbitat o de les característiques del lloc. Essencialment, aquesta tesi s’ha centrat en els processos lòtics més influents: la hidrologia i les entrades de nutrients (ja siguin orgànics com inorgànics). La resposta general de la meiofauna trobada al llarg d’aquesta tesi ha estat sempre molt vinculada als factors climàtics, ja fos analitzant l’efecte de les avingudes o de les sequeres sobre la comunitat de meiofauna o sobre processos de descomposició, o bé la variabilitat intranual sobre comunitats de cianobacteris i nematodes. Al llarg d’aquesta tesi doctoral, els trets adaptatius de la meiofauna en front a pertorbacions hidrològiques o d’entrada de nutrients han demostrat ser nombroses i merèixer una investigació mes exhaustiva en la recerca futura.

A fim de avaliar a influência do sistema estuarino de Santos sobre os Nematoda da plataforma continental adjacente, a densidade, composição genérica e diversidade desse grupo foram analisadas e relacionadas com o tipo de sedimento, teor de matéria orgânica e biomassa de fitopigmentos. Para isso, o sedimento foi coletado em seis estações, no inverno/2005 e verão/2006, com um amostrador do tipo box-corer, do qual foram retiradas amostras para a meiofauna com um tubo de 4,9 cm2 de área superficial e 10 cm de altura. Os Nematoda representaram mais de 95% da meiofauna, com densidades médias de 2472±1794 ind.10cm-2 no inverno/2005 e de 2606±2017 ind.10cm-2 no verão/2006. A influência do sistema estuarino de Santos restringiu-se às áreas na saída da baía de Santos e do canal de Bertioga e deu-se através do aporte de sedimentos finos e de matéria orgânica, que foi mais evidente no verão devido à maior pluviosidade. Nessas áreas foram observadas menores densidades e maior abundância de gêneros depositívoros, como Sabatieria e Terschellingia e da família Xyalidae. Nas outras estações rasas com sedimento arenoso, bem selecionado e com biomassa de clorofila-a relativamente alta, as densidades foram as mais altas e predominaram Chromadorita e Microlaimus, herbívoros/comedores de epistrato. Nas estações mais profundas, com sedimento mais finos, a densidade e diversidade foram menores e Sabatieria foi dominante. Portanto, além do sistema estuarino, a profundidade e o hidrodinamismo local, que determinam as condições sedimentares e tróficas, foram fatores importantes para as associações dos Nematoda.
To assess the influence of Santos estuarine system on the nematodes of the adjacent continental shelf, the density, composition and generic diversity of this group were analyzed and related to the sediment type, organic matter content and phytopigments biomass. The sediment was collected at six stations, in the winter of 2005 and summer of 2006, with a box-corer from which meiofauna samples were taken with a 4.9 cm2 superficial area and 10 cm height corer. Nematodes represented more than 95% of the total meiofauna, and their average densities were 2,472±1,794 ind.10cm-2 in the winter/2005 and 2,606±2,017 ind.10cm-2 in the summer/2006. The influence of Santos estuarine system was restricted to the closest areas to Santos bay and Bertioga channel and it was observed through the contribution of fine sediments and organic matter, which was more evident in the summer due to higher rainfall. In these areas, lower nematodes densities were found as higher abundance of deposit feeders genera, like Sabatieria and Terschellingia, and from the Xyalidae family. In the other shallow stations with well sorted sands and relatively high chlorophyll-a biomasses, densities were the highest and Chromadorita and Microlaimus, herbivorous/epistrate feeders, were predominant. In the deepest stations with finer sediments, the densities and diversities were the lowest and Sabatieria was dominant. Therefore, apart from the estuarine system, the depth and local hydrodynamics, which determines the sediment and trophic conditions, were important factors for the nematodes assemblages.