Academic literature on the topic 'Madagascar parasite'

Abstract. Intestinal parasites impact host health, survival and reproductive success and therefore exert selective pressures on hosts' ecology and behavior. Thus, characterizing and comparing the parasitic fauna of different wildlife hosts sharing the same habitat can provide insights into the mechanisms underlying variation in parasitism, as well as the role of parasites as possible conservation threats. Several host traits have been proposed to generate differences in parasite diversity among different host species, including phylogeny, host body mass, host longevity, diet, and differences in ranging and social behavior. Here, we provide an overview of intestinal helminths and protozoa detected by fecal microscopy in six sympatric lemur species in Kirindy Forest, western Madagascar. The described patterns indicate that host phylogeny and diet may play an important role in shaping intestinal parasite assemblages in this system, as the closely related, omnivorous cheirogaleids showed the strongest overlap in parasite communities. No indication was found for an effect of body mass or longevity on parasite species richness. Regarding the effect of sociality, the two group-living lemur species, Propithecus verreauxi and Eulemur rufifrons, harbored directly transmitted parasites at higher prevalence than solitary foragers, but not at higher diversity. Effects of season and sex on parasite prevalence confirm the results of previous studies, with higher prevalence in the energetically demanding dry season and a male bias in parasitism. We highlight the opportunities of exploring the parasitic fauna of wildlife from a community ecology and evolutionary perspective, and identify prospects for future research on lemur parasitism.

Madagascar hosts a great diversity of bird species. This study focuses on the description of the diversity and prevalence of blood parasites (Haemosporida, trypanosomes and filarioid nematodes) in 131 blood samples of 14 species of Corvoidea, namely vangas (Vangidae), Coracina cinerea (Campephagidae), Dicrurus forficatus (Dicruridae) and Terpsiphone mutata (Monarchidae) found in primary rainforests on Madagascar. Blood parasites were detected using both molecular and microscopic methods. Multiplex PCR was used to detect mixed haemosporidian infections and nested PCR was used to describe a 479 bp fragment of the haemosporidian cytochrome b (cytb) gene. Furthermore, a 770 bp SSU rRNA fragment of trypanosomes, and, for microfilariae, a 690 bp fragment of 28S rRNA, as well as a 770bp fragment of 28S rRNA, were amplified for identification using nested PCRs. Phylogenetic analyses were carried out for all sequences obtained from all blood parasite taxa. Over half of the samples (54.2%; n = 71) were infected with Haemosporida, whereas only 21.4% (n = 28) were infected with Trypanosoma and 5.3% (n = 7) contained filarioid nematode DNA. Fourteen of 56 blood smears contained some of the above-mentioned parasite taxa. The results corroborate the great diversity of blood parasites in the different bird species studied, especially in vangas. Vangas had the greatest diversity of parasites found, as well as the highest number of multiple infections, which may be due to their morphological diversity and resulting habitat use. Fifteen haemosporidian lineages, seven Trypanosoma and five filarioid nematode isolates were newly discovered in the avian species studied, particularly in the vangas. Members of the other Corvoidea families on Madagascar showed a lower susceptibility for avian haemosporidian parasites than vangas, which could be attributed to possible resistance against those parasites. The study confirmed the host specificity of some Haemosporida and microfilariae; however, it demonstrated that this was not the case for Trypanosoma.

Polystomatid flatworms are parasites of high host specificity, which mainly infect amphibian hosts. Only one polystome species has so far been recorded from Madagascar despite the high species richness and endemicity of amphibians on this island. Out of the 86 screened Malagasy frog species, we recovered polystomes from 25 in the families Ptychadenidae and Mantellidae. Molecular phylogenetic analysis uncovered an unexpected diversity of polystome species belonging to two separate clades: one forming a lineage within the genus Metapolystoma , with one species in Ptychadena and several species in the mantellid host genera Aglyptodactylus and Boophis ; and the second corresponding to an undescribed genus that was found in the species of the subfamily Mantellinae in the family Mantellidae. The phylogenetic position of the undescribed genus along with molecular dating suggests that it may have colonized Madagascar in the Late Mesozoic or Early Cainozoic. By contrast, the more recent origin of Metapolystoma in Madagascar at ca 14–2 Myr ago strongly suggests that the ancestors of Ptychadena mascareniensis colonized Madagascar naturally by overseas dispersal, carrying their Metapolystoma parasites. Our findings provide a striking example of how parasite data can supply novel insights into the biogeographic history of their hosts.

AbstractBimiracidial infections of Lymnaea truncatula with three isolates of Fasciola gigantica, originating from China, Egypt and Madagascar, were carried out to determine the effect of geographic origin of the parasite on the larval productivity of redial generations. The prevalences of experimental infections in snails exposed to strains from Madagascar, China and Egypt were 20.8%, 60.0% and 80.0%, respectively. At day 49 post-exposure (p.e.), the total number of free rediae in snails infected with the Egyptian isolate was significantly higher than that recorded in the Madagascan group. On the other hand, at day 49 p.e., the majority of cercariae in the Chinese and Egyptian groups were produced by R2a rediae (70.6% and 66.6% of cercariae produced by all live rediae), while, in the Madagascan group, the cercariae were produced mainly by the first redial generation. Snails infected with the Egyptian isolate of miracidia developed more live rediae and, consequently, could produce a higher number of cercariae. As a result, L. truncatula snails were highly adapted to infections with the Egyptian and Chinese isolates of F. gigantica.

ABSTRACT The aim of this study was to provide the first comprehensive spatiotemporal picture of Plasmodium falciparum resistance in various geographic areas in Madagascar. Additional data about the antimalarial resistance in the neighboring islands of the Comoros archipelago were also collected. We assessed the prevalence of pfcrt, pfmdr-1, pfdhfr, and pfdhps mutations and the pfmdr-1 gene copy number in 1,596 P. falciparum isolates collected in 26 health centers (20 in Madagascar and 6 in the Comoros Islands) from 2006 to 2008. The in vitro responses to a panel of drugs by 373 of the parasite isolates were determined. The results showed (i) unusual profiles of chloroquine susceptibility in Madagascar, (ii) a rapid rise in the frequency of parasites with both the pfdhfr and the pfdhps mutations, (iii) the alarming emergence of the single pfdhfr 164L genotype, and (iv) the progressive loss of the most susceptible isolates to artemisinin derivatives. In the context of the implementation of the new national policy for the fight against malaria, continued surveillance for the detection of P. falciparum resistance in the future is required.

Until recently, the study of major histocompability complex (MHC) mediated immunity has focused on the direct link between MHC diversity and susceptibility to parasite infection. However, MHC genes can also influence host health indirectly through the sculpting of the bacterial community that in turn shape immune responses. We investigated the links between MHC class I and II gene diversity gut microbiome diversity and micro- (adenovirus, AdV) and macro- (helminth) parasite infection probabilities in a wild population of non-human primates, mouse lemurs of Madagascar. This setup encompasses a plethora of underlying interactions between parasites, microbes and adaptive immunity in natural populations. Both MHC classes explained shifts in microbiome composition and the effect was driven by a few select microbial taxa. Among them were three taxa (Odoribacter, Campylobacter and Prevotellaceae-UCG-001) which were in turn linked to AdV and helminth infection status, correlative evidence of the indirect effect of the MHC via the microbiome. Our study provides support for the coupled role of MHC diversity and microbial flora as contributing factors of parasite infection.

Dans le contexte très actuel de sauvegarde de la biodiversité, les acteurs de la conservation se doivent de rassembler un maximum d’informations sur la biologie et l’écologie des espèces menacées d’extinction. Ces données n’étant malheureusement pas toujours accessibles, même à partir d’études poussées sur les espèces d’intérêt, les objectifs des gestionnaires des espaces naturels n’en sont que plus difficiles à atteindre. Dans le cadre de cette thèse, nous nous sommes penchés sur un groupe d’organismes peu étudiés dans un contexte de conservation, à savoir les parasites. En effet, parce qu’hôtes et parasites sont souvent de vieux ennemis qui ont coévolué pendant de longues périodes temporelles, les parasites peuvent enregistrer un très grand nombre d’informations sur leurs hôtes qui, une fois décodées, peuvent servir à l’aménagement de plans de gestions mieux adaptés. L’association polystomes (Monogènes) - amphibiens anoures, plus particulièrement les couples Madapolystoma - Mantellidae et Metapolystoma – Ptychadenidae/Mantellidae, ont donc été étudiés afin d’explorer à Madagascar, hotspot de biodiversité menacé par la destruction des habitats, l’histoire écologique et évolutive d’hôtes endémiques. A partir d’approches morphométrique et moléculaire, une diversité insoupçonnée de polystomes a pu être mise en évidence, qui a fait l’objet de deux nouvelles descriptions, Madapolystoma ramilijaonae et M. Cryptica. Ces résultats replacés dans un contexte de systématique des hôtes suggèrent l’existence de complexes d’espèces cryptiques chez deux espèces d’amphibiens malgaches, à savoir Guibemantis liber et Ptychadena mascareniensis. A travers des approches phylogénétiques et de datation moléculaire, des patrons de colonisation ont été également déterminés, suggérant différentes origines des polystomes malgaches. En conclusion de ce travail, les informations véhiculées par les polystomes pourraient permettre, dès à présent, d’agir sur certaines espèces d’amphibiens. En effet, la description de complexes d’espèces cryptiques tend à augmenter le nombre, déjà très élevé, d’espèces microendémiques. De ce fait, parce que les aires de répartition de certaines entités taxonomiques sont beaucoup plus réduites que celles préalablement évaluées, il s’avère nécessaire de repenser rapidement les aires à protéger
In the very current context of biodiversity, conservation stakeholders will need to gather as much information on the biology and ecology of endangered species. Unfortunately, those data being not always available, even from extensive studies on the species of interest, the objectives of the managers of natural areas are all the more difficult to achieve. As part of this thesis, we focused on a poorly studied group of organisms in the context of conservation, namely parasites. Indeed, because hosts and parasites are often old enemies who have co-evolved over long time periods, the parasites can save a great deal of information on their hosts that, when decoded, can be used for the development of best suited management plans. The association polystomes (Monogenea) - anuran amphibians, particularly couples Madapolystoma - Mantellidae and Metapolystoma - Ptychadenidae / Mantellidae, have been studied to explore Madagascar, biodiversity hotspot threatened by habitat destruction, environmental history and scalable guest endemic. From morphometric and molecular approaches, a variety of unsuspected polystomes could be detected, which was the subject of two new descriptions, Madapolystoma ramilijaonae and M. Cryptica. These results placed in a context of systematic hosts suggest the existence of complexes of cryptic species in two species of Malagasy amphibians, namely Guibemantis liber and Ptychadena mascareniensis. Through phylogenetic approaches and molecular dating, settlement patterns were also identified, suggesting different origins of the Malagasy polystomes. In conclusion of this work, the information conveyed by polystomes could afford, now, to act on certain species of amphibians. Indeed, the description of complexes of cryptic species tends to increase the already very high, microendemic species. Thus, because the ranges of taxonomic entities are much smaller than previously estimated, it is necessary to quickly rethink the areas to be protected

Les Rhabdias (Rhabdiasidae) constituent un groupe parasitaire primitif de Nématodes (clade IV) caractérisé par la persistance d’une phase libre adulte hétérogonique qui produit des larves infectantes, toutes de sexe femelle. Chez l’hôte, ces larves atteignent les poumons et deviennent des adultes qui pondent des larves de stade 1, expulsées à l’extérieur par la voie digestive. Le spectre d’hôtes est limité aux Vertébrés terrestres à sang froid, Lissamphibia et quelques groupes d'Ophidia et Sauria (Squamata) ; l’aire de répartition comprend l’ensemble des régions tropicales et tempérées. L’étude est centrée sur les Rhabdias de Chamaeleonidae, avec les deux questions principales suivantes: 1. Quelle est l’ampleur de la diversité spécifique? 2. Le groupe monophylétique des Chamaeleonidae a-t-il une seule acquisition historique de Rhabdias, suivie d’une évolution uniquement au sein de cette famille? Matériel et méthodes. Les matériels proviennent de collectes de terrain, de saisies douanières et des collections du MNHN. Les régions géographiques concernées sont principalement des "hotspots"de biodiversité: chaîne volcanique du Cameroun (Projet Biodiversité: Iles Forestières Africaines; ANR), Burundi, Tanzanie et Madagascar ; des matériels du Sénégal et du Togo sont aussi examinés. Les analyses ont été morphologiques, biologiques (coprocultures pour obtenir la phase libre du cycle ; examen du contenu des ovaires et oviductes des femelles parasites) et moléculaires (séquençage des gènes coxI, 12S ADNr et 28S ADNr). Les données acquises et leurs analyses. 1. En 2004, pour plus de 150 espèces de Chamaeleonidae, deux espèces de Rhabdias étaient décrites, respectivement en 1916 et 1961 : R. Chamaeleonis en Afrique de l’Est et R. Gemellipara à Madagascar. Actuellement, douze espèces supplémentaires ont été décrites, cinq en Afrique de l’Est, trois au Cameroun, et cinq à Madagascar. Il est montré qu’une des espèces est parthénogénétique alors que chez les autres, une zone particulière des ovaires, située à 250-1200 μm de l’apex, produit des spermatozoïdes durant tout le stade adulte mais de façon intermittente et non synchrone pour les deux ovaires. Les hôtes sont les Caméléons du genre Trioceros et les Caméléons nains des genres Rhampholeon et Rieppeleon, en Afrique équatoriale, les Calumma et le genre primitif Brookesia à Madagascar. Aucun Rhabdias n'est à présent connu chez Chamaeleo spp. , qui vit dans des régions moins humides, peu favorable à la survie des larves infectantes. Les caractères morphologiques diagnostics se révèlent nombreux, papilles sensorielles de la tête, bouche, capsule buccale (sa taille varie à peine durant la croissance de l’adulte), oesophage, vésicule cuticulaire du corps, etc. Les analyses moléculaires, réalisées sur quatre espèces africaines et une malgache, confirment les identifications morphologiques. On constate ainsi que (i) le même Rhabdias peut être hébergé par deux espèces sympatriques de Caméléons; (ii) une espèce de Caméléon peut être parasitée par deux espèces congénères de Rhabdias; (iii) quatre espèces semblent être vicariantes deux à deux entre le Burundi et le Cameroun et deux perforent les poumons; (iv) un cas d’espèce cryptique est discuté. 2. Une clé d’identification des Rhabdias de Chamaeleonidae est établie. 3. Aux deux espèces parasites d’Anoures qui étaient connues en région éthiopienne, trois parasites de Bufonidae et Arthroleptidae sont ajoutés pour l’Afrique, et un de Mantellidae pour Madagascar. Ces espèces se distinguent des parasites des Chamaeleonidae par les petits diamètres de leur bouche et de la capsule buccale et, en outre, par la larve infectante: extrémité caudale pointue et simple (état plésiomorphe) ou arrondie et avec petites perles chez les Chamaeleonidae (état dérivé). 4. Une analyse cladistique est faite avec 15 espèces de Rhabdias d’Ophidiens, Anoures et Chamaeleonidae et trois autres Rhabdiasidae, Pneumonema, Chabirenia et Entomelas, un Strongyloides étant l’extra-groupe; les Rhabdias de Chamaeleonidae sont groupés. Les analyses moléculaires donnent des résultats plus complexes, avec une ou deux espèces parasites de Chamaeleonidae placées parmi des parasites d’Anoures
Rhabdias (Rhabdiasidae) are a primitive parasitic group of nematodes (clade IV) characterized with the persistency of a free-living adult heterogonic phase which produces infective larvae. In the host, these larvae develop into female morphotypes which reach lungs and lay first stage larvae, eventually expulsed in faeces. The host-range is limited to coldblooded terrestrial vertebrates, Lissamphibia and a few groups of Ophidia and Sauria (Squamata) ; the distribution area comprises tropical and temperate regions. The study focusses on the Rhabdias from Chamaeleonidae, with two main questions: 1. How important is the specific diversity? 2. Did the present species derive from a unique historical acquisition of Rhabdias in the monophyletic group of Chamaeleonidae and an evolution inside this host family? Material and methods. Material were recovered during missions, or sized by customs or taken from the MNHN collections. They originated mainly from "hot-spots" of biodiversity: the Vulcanic Chain of Cameroon (Project ANR Biodiversity: Iles Forestières Africaines), Burundi, Tanzania and Madagascar ; material from Senegal and Togo were also examined. Morphological and biological (coprocultures for obtaining the free-living phases ; examination of the ovary and oviduct of parasitic females to determien the mode of reproduction) were performed, as well as molecular analyses (sequencing of coxI, 12S rDNA and 28S rDNA genes). Results. 1. In 2004, for more than 150 species of Chamaeleonidae, two species of Rhabdias were reported, in 1916 and 1961 respectively : R. Chamaeleonis from east Africa and R. Gemellipara from Madagascar. At this date, twelve more species have been described, five in east Africa, three in Cameroon, and five in Madagascar. It is shown that one species is parthenognetic whereas in the others, a particular area in the ovaries, 250- 1200 μm from apex, produces spermatozoa during the adult phase, intermittently and not synchroneously in both ovaries. Rhabdias are found in Trioceros, the leaf chameleons Rhampholeon and Rieppeleon, from equatorial Africa, in Calumma and the primitive Brookesia from Madagascar. Rhabdias is not known in Chamaeleo spp. , which live in less humid regions, not propicious to infective larvae survival. Morphological diagnostic characters appear numerous, head papillae, mouth, buccal capsule (its size varies very little during adult growth), oesophagus, cuticular body vesicle, etc. The molecular analyses, made with four African and one Malagasy species confirm the morphological identifications. It is noted that (i) a given Rhabdias species may infect two sympatric species of chameleons; (ii) a specimen host may shelter two Rhabdias species; (iii) two pairs of vicariant species are suggested between Burundi and Cameroun, one preforating the lung wall; (iv) a case of cryptic species is discussed. 2. A key of identification of Rhabdias from Chamaeleonidae is presented. 3. Three species from Bufonidae and Arthroleptidae are described in Africa, and one from Mantellidae in Madagascar, elevating to five the number of species presently known from anurans in Ethiopian region. These species are distinct from those parasitic in chameleons with the small diameter of the mouth and buccal capsule, and also by the infective larva: their caudal extremity is pointed and simple (plesiomorphic character) whereas it is rounded and ornated with buds in the Chamaeleonidae (derived character). 4. A cladistic analysis is made which includes 15 Rhabdias species from ophidians, anourans and Chamaeleonidae and three rhabdiasid genera, Pneumonema, Chabirenia and Entomelas, with a Strongyloides species as out-group; the Rhabdias from Chamaeleonidae are grouped. The molecular analyses give more complex results, with one or two species from Chamaeleonidae situated among the parasites from anurans

La leptospirose est considérée comme la zoonose la plus répandue au monde mais les incidences sont les plus élevées dans les régions tropicales et en particulier sur les îles. Les îles du Sud-Ouest de l'Océan Indien ne dérogent pas à la règle puisque la maladie y représente un problème de santé humaine majeur sur plusieurs îles, notamment aux Seychelles qui enregistrent un des plus fort taux d'incidence humaine au monde. Sur la base des données disponibles, l'épidémiologie humaine apparait contrastée à l'échelle de la région : les cas cliniques sur Mayotte résultent d'infections par quatre espèces de leptospires distinctes alors qu'à La Réunion ou aux Seychelles, une seule espèce est à l'origine de la grande majorité des cas cliniques. L'objectif général de cette thèse est d'identifier certains des déterminants de cette épidémiologie singulière. Nous avons dans un premier temps complété les informations humaines en investiguant la leptospirose en Union des Comores, pays n'ayant jamais rapporté de transmission autochtone. Nos résultats indiquent que les populations humaines y sont exposées à des antigènes de leptospires comparables à ceux retrouvés sur l'île voisine de Mayotte. Ce résultat suggére que l'absence de leptospirose sur certaines îles est le résultat d'un déficit de surveillance. Nous avons ensuite caractérisé la diversité génétique des leptospires au sein de la faune de certaines îles, caractérisées par des niveaux d'endémisme élevés à même d'être en partie à l'origine de cette épidémiologie contrastée. Nous décrivons d'une part une importante diversité des leptospires pathogènes chez les chauves-souris (Chiroptères) malgaches. Nous montrons d'autre part que cette diversité de leptospires n'est pas structurée géographiquement mais présente au contraire une importante spécificité d'hôte, résultant de différents processus évolutifs incluant co-spéciation et host-switch. Nous avons exploité cette spécificité d'hôte pour éclairer l'épidémiologie de la leptospirose à Mayotte, où nous montrons que l'importante diversité bactérienne impliquée dans les cas cliniques résulte de la présence de nombreux réservoirs, dont certains originaires de Madagascar. Ainsi, il apparaît que l'épidémiologie humaine de la leptospirose dans le SOOI est le reflet d'assemblages distincts de leptospires cosmopolites et autochtones/endémiques maintenus et excrétés par des réservoirs animaux particuliers
Leptospirosis is considered as the most widespread zoonosis worldwide but the incidence levels are higher in tropical regions and particularly on islands. The South-Western Indian Ocean islands are no exception and the disease is of major medical concern in several islands notably in Seychelles, displaying some of the highest human incidence ever reported. Based on available data, the human epidemiology appears contrasted in the region: on Mayotte, human cases result from the infection with four distinct Leptospira species whereas on Reunion Island or Seychelles, a single species causes the majority of clinical cases. The main objective of this thesis is to identify some of the drivers of this singular epidemiology. We first completed the information available on this human disease in the region by investigating the leptospirosis situation in the Union of the Comoros, a country where no autochthonous transmission has been reported so far. Our results indicate that Comorian populations are exposed to Leptospira, which are antigenically comparable to those detected in the neighbouring island of Mayotte. This finding suggests that the apparent absence of leptospirosis in some islands rather reflects a lack of surveillance. We then investigated the genetic diversity of Leptospira on distinct islands home to distinct endemic animal species that may shed distinct Leptospira lineages and thus at least in part explain the contrasted epidemiology of leptospirosis in the region. Specifically, we describe a high diversity of pathogenic Leptospira within Malagasy bats (Chiroptera) and further show that Leptospira diversity is not structured by geography. Instead, we show that these Leptospira display a strong specificity towards their hosts, which may result from different evolutionary processes including co-speciation and host switching. Using this tight host specificity, we investigated the leptospirosis epidemiology on Mayotte, where we show that the important bacterial diversity reported in clinical cases is due of the presence of several distinct animal species acting as reservoirs, some of which introduced from the neighbouring Madagascar. Altogether, results presented herein combined to data produced by our lab suggest that the epidemiology of leptospirosis in the SWOI results from distinct assemblages of cosmopolitan and autochthonous/endemic Leptospira. Keywords : Leptospirosis, Leptospira, Chiroptera, small mammals, hosts-parasites associations, MAT, MLST, co-phylogeny, Madagascar, Mayotte, Union of Comoros, South-Western Indian Ocean

La cysticercose, parasitose tropicale négligée due à Taenia solium et dont le cycle concerne l’Homme et le porc, est responsable de 50 000 décès chaque année, principalement dans les pays du Sud. Notre travail de thèse a tenté d’explorer la situation épidémiologique de cette maladie dans la population porcine de Madagascar et de comprendre les déterminants expliquant sa prévalence dans le contexte épidémiologique et économique du pays. Dans un premier temps, nos enquêtes de prévalence en abattoir ont permis d’estimer une prévalence apparente de 4.6% [4.2-5.0%] au niveau national et une prévalence corrigée de 21.03% [19.18-22.87%] en tenant en compte de la sensibilité de la méthode (inspection vétérinaire par observation macroscopique). Dans un second temps nous avons modélisé le lien environnement-animal-homme dans le contexte des Hautes-Terres de Madagascar où l’élevage porcin est semi-intensifié mais où la cysticercose porcine reste endémique. Notre modèle multi-agents, développé sous Cormas, nous a permis de modéliser les comportements simplifiés des acteurs humains et animaux ainsi que les processus sanitaires et environnementaux. Une analyse de sensibilité multivariée nous a aidé à mieux comprendre les réactions du modèle vis-à-vis des paramètres d’entrée employés. Il s’est révélé sensible principalement à des paramètres décrivant (i) l’exposition des animaux à des aliments contaminés par des œufs de T. solium, notamment par la distribution d’aliments non contrôlés par l’éleveur et l’accès à un environnement contaminé, et (ii) la capacité infectante des œufs de T. solium, leur excrétion et leur survie dans l’environnement. Cette démarche exploratoire nous a permis ainsi d’identifier les paramètres d’importance mettant en lumière les besoins de recherche à mener pour renforcer la vraisemblance des résultats du modèle et nous aider à tester l’impact des scénarios de lutte contre la cysticercose dans des bassins de production porcine représentatifs de la réalité du pays
Porcine cysticercosis, a neglected tropical parasitic disease due to Taenia solium, with a cycle involving humans and pigs, is responsible for 50,000 deaths each year, mainly in the developing countries. Our PhD work has tried to explore the epidemiological situation of this disease in the swine population of Madagascar and to understand the determinants explaining its prevalence in the epidemiological and economic context of the country. As a first step, abattoir surveys estimated an apparent prevalence of 4.6% [4.2-5.0%] at the national level and a corrected prevalence of 21.03% [19.18-22.87%] taking into account the sensitivity of the method (veterinary inspection by macroscopic observation). In a second step, we modeled the environment-animal-human link in the context of Malagasy highlands where pig farming is semi-intensified but porcine cysticercosis remains endemic. Our multi-agent model, developed under Cormas, allowed us to model the simplified behaviors of human and animal actors as well as health and environmental processes. A multivariate sensitivity analysis helped us better understand the model's responses to the input parameters used. It was sensitive primarily to parameters describing (i) the exposure of animals to food contaminated with T. solium eggs, including the distribution of non-farmer-controlled feed and access to contaminated environment, and (ii) the infectious capacity of T. solium eggs, their excretion and survival in the environment. This exploratory approach allowed us to identify the important parameters, highlighting the research needs to be carried out to reinforce the likelihood of the model results and help us to test the impact of the control scenarios against cysticercosis in pig production areas characteristic of the country's situation

Les abeilles et les parasitoi͏̈des de pucerons courent le risque d'exposition à des insecticides qui ne leur sont pas destinés. Nos objectifs consistent à évaluer ce risque sur le terrain et à contribuer à mettre au point des tests de toxicité létale et sublétale en laboratoire pour les deux types d'insectes. A Madagascar, nous avons mené une enquête pour déterminer l'impact de pratiques paysannes en matière de protection de cultures d'agrumes sur les abeilles, et une expérimentation en parcelle de choux pour évaluer les effets de traitements insecticides sur les Hyménoptères parasites de pucerons. En France, nous avons déterminé en laboratoire les toxicités aigue͏̈s de la deltaméthrine, de la lambda cyhalothrine, du chlorpyriphos éthyle et du pyrimicarbe, pour les abeilles et le parasitoi͏̈de de pucerons, Aphidius ervi. Nous avons analysé, chez l'abeille, certaines causes de variabilité des doses létales à 50%. Nous avons également déterminé les effets d'insecticides sur le comportement d'orientation olfactive en olfactomètre chez l'abeille et A. Ervi. A Madagascar, le traitement pendant la floraison existe et les apiculteurs constatent des effets négatifs sur leurs ruches. L'expérimentation en parcelle de chou montre que le traitement insecticide contribue à retarder l'action des Hyménoptères parasites de pucerons. En laboratoire, la toxicité varie en fonction du mode de pénétration et de la nature des matières actives. Chez l'abeille, les toxicités par ingestion collective et individuelle ne sont pas toujours comparables. L'importance du phénomène de trophallaxie dans cette différence a été précisée. Ainsi, la valeur de DL50 exprimée en ng/abeille dépend des conditions expérimentales. Les abeilles et A. Ervi ayant survécu aux traitements insecticides et testés en olfactomètre, ne montrent pas ou peu de changement de comportement d'orientation vis-à-vis de l'odeur utilisée. Par contre, les abeilles recevant des DL20 et DL50 de deltaméthrine ont une capacité locomotrice réduite. Cette perturbation pourrait avoir des effets non négligeables sur les insectes auxiliaires dans un environnement pollué par les insecticides
Honeybees and aphid parasitoids may suffer from side effects of insecticides during their beneficial activity. Our objective was the risk assessment of pesticides towards these non target insects in the field and a contribution to the setting up of lethal and sublethal toxicity tests in the laboratory. In Madagascar, we conducted an investigation to define the impact of crop protection farmers' practices on honeybees, and we conducted an experimentation to estimate the effects of a treatment on aphid parasitoids. In France, we determined the acute toxicity of deltamethrin, lambda cyhalothrin, chlorpyrifos ethyl and pirimicarb, on the honeybee and on an aphid parasitoid, Aphidius ervi. We analyzed some parameters responsible for the variability of lethal dose 50 (LD50) values. We also investigated the effects of the insecticides on orientation responses of the honeybee and A. Ervi, using a common behavioral test, the four-armed olfactometer. In Madagascar, insecticide treatment can occur during blooming and the farmers have observed negative effects on honeybee colonies. With regard to Hymenopterous parasitoids, we found out that the insecticide treatment contributes to delay their action in experimental cabbage field plots. In laboratory conditions, the toxicity varies according to the exposure route and to the active ingredient. The honeybee oral toxicity differed between collective and individual administration. The role of trophallactic interactions in the distribution of the active ingredient was evaluated. Thus, value of LD50 expressed in ng/bees varies according to the experimental conditions. The honeybees and A. Ervi surviving the insecticide treatments showed no or little effect in their attraction responses in the four-armed olfactometer. On the other hand, in honeybees, LD20 and LD50 of deltamethrin decreased their capability to move. These perturbations might have an important effect on beneficials insects in an environment contaminated by pesticides

Les abeilles et les parasitoïdes de pucerons courent le risque d'exposition à des insecticides qui ne leur sont pas destinés. Nos objectifs consistent à évaluer ce risque sur le terrain et à contribuer à mettre au point des tests de toxicité létale et sublétale en laboratoire pour les deux types d'insectes.
A Madagascar, nous avons mené une enquête pour déterminer l'impact de pratiques paysannes en matière de protection de cultures d'agrumes sur les abeilles, et une expérimentation en parcelle de choux pour évaluer les effets de traitements insecticides sur les Hyménoptères parasites de pucerons. En France, nous avons déterminé en laboratoire les toxicités aiguës de la deltaméthrine, de la lambda cyhalothrine, du chlorpyriphos éthyle et du pyrimicarbe, pour les abeilles et le parasitoïde de pucerons, Aphidius ervi. Nous avons analysé, chez l'abeille, certaines causes de variabilité des doses létales à 50%. Nous avons également déterminé les effets d'insecticides sur le comportement d'orientation olfactive en olfactomètre chez l'abeille et A. ervi.
A Madagascar, le traitement pendant la floraison existe et les apiculteurs constatent des effets négatifs sur leurs ruches. L'expérimentation en parcelle de chou montre que le traitement insecticide contribue à retarder l'action des Hyménoptères parasites de pucerons.
En laboratoire, la toxicité varie en fonction du mode de pénétration et de la nature des matières actives. Chez l'abeille, les toxicités par ingestion collective et individuelle ne sont pas toujours comparables. L'importance du phénomène de trophallaxie dans cette différence a été précisée. Ainsi, la valeur de DL50 exprimée en ng/abeille dépend des conditions expérimentales. Les abeilles et A. ervi ayant survécu aux traitements insecticides et testés en olfactomètre, ne montrent pas ou peu de changement de comportement d'orientation vis-à-vis de l'odeur utilisée. Par contre, les abeilles recevant des DL20 et DL50 de deltaméthrine ont une capacité locomotrice réduite. Cette perturbation pourrait avoir des effets non négligeables sur les insectes auxiliaires dans un environnement pollué par les insecticides

Abstract In Madagascar, cereal yields remain insufficient due to various biotic and abiotic constraints, including Striga asiatica, a parasitic weed that has contributed to decreased maize yield up to 100%. This work aims to assess the impact of the practice of two cropping systems on the maize crop infested by S. asiatica. PLATA maize seed of the putative tolerant mutant line from the M5 generation after gamma irradiation at 100, 200 and 300 Gy and of the sensitive parent variety were grown in fields naturally infested or artificially inoculated with one pinch of around 3000 ready-to-germinate seeds of S. asiatica. The cropping system (SCV) is a community of plants that is managed by a farm unit to achieve various human goals. The residue of Stylosanthes sp. legumes was used as mulch SCVm and the legume cowpea was planted with the host plant for the intercropping system SCVv. Results have shown that the use of mulch, either residue SCVm or green mulch SCVv, minimizes S. asiatica infestation on maize plants. The SCV reduces significantly the number of emerging Striga plants with an emergence of 1.33 ± 0.36 for SCVm, 4.33 ± 0.27 for SCVv and 15.00 ± 1.08 for the control. Moreover, M5 lines have shown significant differences in plant survival rate of 50.57 ± 1.25% to 80.00 ± 0.91%, versus 13.50 ± 0.47% for the parent variety. Yields of the parent and M5 lines on SCVm are, respectively, 3.46 ± 0.02 t/ha and 4.64 ± 0.01 t/ha, and 2.30 ± 0.04 t/ha and 3.61 ± 0.05 t/ha for SCVv, while that of the control plot remains low, varying from 0.50 ± 0.04 t/ha to 2.29 ± 0.01 t/ha. Cover increases soil humidity and delays the development of S. asiatica and infection of the host plant, thus improving host plant yield. These results demonstrate the benefit of the integrated approach of mutation breeding and cultural practice to ensure more durable crop production under heavy Striga infestation.