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Cheung, Kwan-lok. "Analysis of lacZ gene expression patterns of a Hoxb3[lacZ] mouse mutant during early development /." View the Table of Contents & Abstract, 2005. http://sunzi.lib.hku.hk/hkuto/record/B3508571X.
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Cheung, Kwan-lok, and 張君樂. "Analysis of lacZ gene expression patterns of a Hoxb3[lacZ] mouse mutant during early development." Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2005. http://hub.hku.hk/bib/B45010596.
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COHEN-TANNOUDJI, MICHEL. "Etude de l'expression des genes de fusion h-2k/lacz et beta2-microglobuline/lacz dans les souris transgeniques et par recombinaison homologue." Paris 6, 1992. http://www.theses.fr/1992PA066095.
Full textAbstract:
L'etude du profil d'expression du gene lacz dans les souris transgeniques h-2k/lacz indique que le transgene est tres sensible aux effets de position, bien que les sequences regulatrices h-2k sont suffisantes pour permettre l'expression specifique d'autres genes rapporteurs. Nous avons observe un comportement analogue du transgene beta2-microglobuline/lacz. Nous avons egalement introduit le gene lacz dans le locus de la beta2-microglobuline par recombinaison homologue dans les cellules es. L'analyse preliminaire de l'expression du gene rapporteur dans les chimeres indique que celui-ci est exprime de facon qualitativement identique a la beta2-microglobuline endogene. L'expression du transgene dans le cortex des souris transgeniques h-2z 1 est limitee au cortex somatosensoriel. Utilisant des greffes corticales heterotopiques, nous avons montre qu'a partir du quinzieme jour embryonnaire le territoire presomptif du cortex somatosensoriel est determine
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Bianchi, Allison A. "Characterization and application of Escherichia coli stress promoter-lacZ fusions /." Thesis, Connect to this title online; UW restricted, 1999. http://hdl.handle.net/1773/8072.
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5
Ford, Kelsey L. "Knockout of the lacZ gene in Enterobacter sp. YSU." Youngstown State University / OhioLINK, 2018. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=ysu1534337870735813.
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6
Abdul, Razak Shaharudin. "Reporter gene expression in transgenic tilapia, Oreochromis niloticus (L.)." Thesis, University of Southampton, 1999. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.313124.
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Cruz, Munoz William A. "Somatic mutations in rapidly and non-dividing tissues of the lacZ transgenic mice." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1999. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/ftp01/MQ43375.pdf.
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8
McCarter, John D. "Deoxy and deoxyfluoro glycosides as mechanistic probes of Escherichia coli (lacZ) B-galactosidase." Thesis, University of British Columbia, 1991. http://hdl.handle.net/2429/30083.
Full textAbstract:
The mechanism of galactoside hydrolysis by Escherichia coli (lacZ) β-galactosidase was probed with a series of 2',4' dinitrophenyl deoxy and deoxyfluoro glycopyranosides. A two-step mechanism has been proposed previously for this process:
1) cleavage of the glycosidic bond and formation of a covalent galactosyl-enzyme intermediate ("galactosylation");
2) hydrolysis of the mtermediate to give free enzyme and galactose ("degalactyosylation").
A series of deoxy and deoxyfluoro analogs of 2',4'-dinitrophenyl-β,-D-
galactopyranoside was prepared for this study. The 2-deoxyfluoro derivative was found to be an effective mechanism-based inactivator of E. coli (lacZ) β-galactosidase. This
compound thus joins a class of 2-deoxy-2-fluoro glycosides which inactivate glycosidases of this type by the accumulation of a stable glycosyl-enzyme intermediate. The active site-directed nature of this inhibitor was shown by protection against inactivation by a competitive ligand and the near 1:1 stoichiometry of dinitrophenolate release with enzyme inactivation. Furthermore, when freed from excess inactivator the 2-deoxy-2-fluorogalactosyl enzyme intermediate turned over slowly in buffer (t₁⃓₂ = 69 h at 25°C) and exhibited enhanced rates of reactivation in the presence of the acceptors methanol or glucose, providing strong evidence that the intermediate is catalytically competent
The other deoxy and deoxyfluoro analogs synthesized were substrates for the enzyme although the rates of enzymic hydrolysis were two to four orders of magnitude slower than have been measured for the parent compound. These large rate reductions are thought to result primarily from the loss of important transition state binding interactions due to the substitution of a hydrogen or a fluorine for a hydroxyl at a given position on the galactopyranose ring. These results strongly suggest that much of the catalytic power of the enzyme is derived from non-covalent interactions between the enzyme active site and the galactopyranose ring of the substrate.
A linear free energy relationship (r = 0.80) was shown to exist between the logarithm of kcat/Km for the enzyme-catalyzed reaction and the logarithm of the first order rate constant for the spontaneous hydrolysis of the same series of deoxy and deoxyfluoro glycopyranosides. Since the spontaneous process has considerable oxocarbonium ion character at the transition state, these data suggest that the enzymic mechanism involves a similar electron deficient transition state.<br>Science, Faculty of<br>Chemistry, Department of<br>Graduate
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Chauhan, Baresh Kumar. "Investigation of baculovirus gene function using two different selectable markers : lacZ and SUP4-o." Thesis, University of Oxford, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.268241.
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10
Scotti, Lorenzini Borges Campos Lia. "Lmo1-lacZ transgene expression in the mouse brain : a marker for a subpopulation of astrocytes." Thesis, University of Cambridge, 1998. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.624808.
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VEZIERS, JOELLE. "Etude de la regeneration du nerf sciatique chez les souris nfh-lacz deficientes en neurofilaments axonaux." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1999. http://www.theses.fr/1999STR13034.
Full textAbstract:
Le cytosquelette est compose de microtubules, de microfilaments et de filaments intermediaires. Au role dynamique des deux premiers s'oppose un role plus statique des filaments intermediaires, essentiellement representes par les neurofilaments dans les neurones peripheriques. La generation de souris nfh-lacz, caracterisees par une desorganisation du cytosquelette neuronal (eyer & peterson, 1994), a notamment permis de confirmer la participation des neurofilaments dans le controle du calibre axonal. En effet, chez ces souris, l'expression d'une proteine de fusion nfh-galactosidase provoque l'agregation des filaments intermediaires dans le soma des neurones et leur deficience dans les axones. Il en resulte une diminution du diametre axonal associee a une surmyelinisation ainsi qu'a un ralentissement de la vitesse de l'influx nerveux. Mon travail de these a consiste a etudier l'influence de la desorganisation du cytosquelette sur les capacites de regeneration du nerf sciatique. Cette etude a revele que les souris transgeniques retrouvent un usage partiel de leur patte dans des delais post-lesionnels comparables a ceux des souris sauvages (12-15 jours). Par ailleurs, le nombre identique d'axones en partie distale de la lesion au cours de la regeneration a permis de conclure a une vitesse de repousse axonale similaire chez les souris nfh-lacz et sauvages. De meme, des analyses par immuno-transfert ont montre que l'expression et le transport de la gap-43 et de la p75, deux proteines de la regeneration, ne sont pas affectes par l'absence de neurofilaments. En revanche, nous avons constate de maniere fort interessante une reapparition plus precoce de l'influx nerveux dans les nerfs sciatiques leses des souris nfh-lacz. Ce travail suggere que l'absence de neurofilaments n'altere pas les capacites de regeneration des axones peripheriques et qu'elle pourrait meme conferer a ces axones des proprietes electriques leur permettant d'etre plus rapidement conducteurs au cours du processus de regeneration.
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Casas, Atala Mariana Victoria. "Caractérisation de modèles animaux pour l' étude des différents types de motoneurones." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2006PA066014.
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Macleod, Sonia Alice. "Expression analysis and developmental functions of the D3 dopamine receptor in a tau-LacZ knock-in mouse." Thesis, University of Cambridge, 2006. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.613743.
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Hung, Siu-chun. "Analysis of abnormal branchial arch structures of a Hoxb3 transgenic mouse mutant using a lacZ Reporter mouse line." Click to view the E-thesis via HKUTO, 2004. http://sunzi.lib.hku.hk/hkuto/record/B31971830.
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Hung, Siu-chun, and 洪少俊. "Analysis of abnormal branchial arch structures of a Hoxb3 transgenic mouse mutant using a lacZ Reporter mouse line." Thesis, The University of Hong Kong (Pokfulam, Hong Kong), 2004. http://hub.hku.hk/bib/B31971830.
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RIO, TOMBOLAN FRANCOISE. "Etude de la mutagenese hepatique induite par le 5,9-dimethyldibenzocarbazole chez la souris transgenique lacz muta tm mouse." Paris 5, 1999. http://www.theses.fr/1999PA05N038.
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Campbell, Robert M. (Robert McLean). "Investigation of an hsp68-lacZ transgene inserted at the dystonia musculorum locus and expressed in the neural tube floor plate." Thesis, McGill University, 1992. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=41344.
Full textAbstract:
Experiments involving the random insertion of foreign DNA constructs into the genome have frequently had unanticipated but informative consequences. In the Tg4 line of transgenic mice, an hsp68-lacZ transgene caused an insertional mutation of the dystonia musculorum (dt) locus. In the same line, the transgene gained an ectopic expression pattern in the neural tube floor plate. The co-occurence of these events suggested that the dt phenotype of postnatal sensory neuropathy might arise from a primary defect expressed in floor plate cells. To test this hypothesis, the cellular target of the dt mutation was determined by analyzing $dt/dt leftrightarrow +/+$ chimeras, in which wild type neurons and their axons were identified by their expression of a human neurofilament transgene. In these chimeras, axonal pathology was confined to the axons of mutant neurons, thus defining an intrinsic neuronal dt defect, and ruling out an extrinsic influence of floor plate cells. The expression of $ beta$-galactosidase in the Tg4 line was further used to examine, using histochemical staining, the morphology of floor plate cells, which play a role in the guidance of commissural axons. Floor plate cells were found to possess a number of morphological specializations which appeared to establish a high degree of membrane apposition with commissural axons. Unexpectedly, $ beta$-galactosidase activity was also detected adjacent to stained floor plate cells in profiles that could not be distinguished from midline axon segments, suggesting that a process of macromolecular transfer may normally operate between floor plate cells and commissural axons.
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Bagnis, Claude. "Le transfert de gènes par infection rétrovirale dans l'analyse de la différenciation hématopoïétique aviaire : développement et utilisation du marqueur LacZ." Lyon 1, 1991. http://www.theses.fr/1991LYO19001.
Full textAbstract:
En biologie cellulaire, une prospective majeure est le marquage des cellules avant la reimplantation dans un receveur afin de definir leur comportement in vivo. Dans cette optique, nous avons developpe l'utilisation des retrovirus capables de transferer le gene lacz ou nlslacz dans les cellules de la lignee hematopoietique aviaire. Afin d'eviter les infections secondaires, nous avons produit les particules virales lacz avec la lignee transcomplementante isolde qui synthetise uniquement les particules defectives en absence de virions helper. Nous presentons l'analyse du comportement de deux clones cellulaires transformes par amv qui different par leur potentiel leucemogene: le clone bm2/c3a (non leucemogene) et le clone bm2l/a2b5 (leucemogene). Les cellules ont ete injectees a des embryons de poules. Nos donnees suggerent que les cellules non-leucemiques ont conserve leur capacite de se differencier en macrophages dans le microenvironnement de la moelle osseuse et que c'est la parte de cette capacite qui explique la leucemogenicite des cellules leucemiques
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Iost, Isabelle. "Couplages entre la synthese, la traduction et la degradation des arn messagers chez escherichia coli : exemple de l'arn messager lacz." Paris 6, 1995. http://www.theses.fr/1995PA066797.
Full textAbstract:
Du fait de l'absence de membrane nucleaire, la synthese et la traduction des arn messagers (arnm) bacteriens sont simultanees. De plus, ces deux processus sont synchrones: l'arn polymerase et les ribosomes se deplacent sensiblement a la meme vitesse. Pour etudier le role de cette synchronisation sur l'expression genetique chez escherichia coli, nous avons exploite les proprietes de l'arn polymerase du bacteriophage t7. Nous avons en effet montre que, chez e. Coli, la vitesse d'elongation de cette enzyme est huit fois celle de l'arn polymerase de l'hote ou celle des ribosomes qui traduisent le message. Ainsi, cette enzyme desynchronise la transcription de la traduction. Nous avons constate que dans cette situation, le message lacz est beaucoup moins stable que le meme message synthetise de facon synchrone par l'arn polymerase de e. Coli, ce qui reduit d'autant le rendement proteique par transcrit. L'inactivation de la rnase e - principale endonuclease controlant la degradation des arnm chez e. Coli - ou encore la surexpression de proteines a boite dead - arn helicases potentielles - augmentent considerablement ce mediocre rendement, en stabilisant l'arnm lacz. Nous avons propose le modele suivant: de par sa rapidite d'elongation, l'arn polymerase de t7 synthetise un arnm naissant depourvu de ribosome sur une partie de sa longueur. Des sites de coupure de la rnase e, normalement proteges par les ribosomes lorsque l'arn polymerase de e. Coli est utilisee, sont demasques, et l'arnm destabilise. Les proteines dead protegent vraisemblablement ces transcrits nus en se fixant aux sites de coupure de la rnase e. Ces resultats montrent l'importance de la synchronisation de la transcription et de la traduction sur la stabilite de l'arnm et revelent une nouvelle propriete des proteines dead, qui n'avaient pas ete jusque la impliquees dans la degradation des arnm
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Isensee, Jörg. "Deciphering the function of G protein-coupled receptor 30." Doctoral thesis, Humboldt-Universität zu Berlin, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät I, 2009. http://dx.doi.org/10.18452/15964.
Full textAbstract:
Der G Protein-gekoppelte Rezeptor 30 (GPR30) wurde vornehmlich im Kontext von schnellen Östrogeneffekten auf zelluläre Signaltransduktionskaskaden untersucht und stellt möglicherweise einen neuen Östrogenrezeptor dar. Die physiologische Funktion von GPR30 in vivo konnte jedoch bisher nicht ermittelt werden. Daher wurde in dieser Arbeit ein Gpr30-defizientes Mausmodell charakterisiert, bei dem ein Teil der kodierenden Sequenz durch einen LacZ-Reporter ersetzt wurde (Gpr30-lacZ). Die Integration des Konstruktes in den Gpr30-Locus wurde mittels Southern blotting und Real-time PCR verifiziert. Gpr30-positive Zelltypen wurden durch Kolokalisation von LacZ mit zelltyp-spezifischen Markerproteinen identifiziert. Weitere Versuche dienten der Aufklärung des Phänotyps von Gpr30-lacZ Mäusen. Zur Identifizierung von Proteinen des GPR30-Signalkomplexes wurden Yeast-Two-Hybrid Analysen mit der N- bzw. C-terminalen Domäne des Rezeptors durchgeführt. Die wesentlichen LacZ-positiven Zellpopulationen waren (i) Endothelzellen in kleinen arteriellen Gefäßen, (ii) glatte Muskelzellen, Perizyten und neuronale Subpopulationen im Gehirn, (iii) Hauptzellen in der Magenschleimhaut, (iv) Zellpopulationen in der Adenohypophyse und dem Hypophysenzwischenlappen sowie (vi) chromaffine Zellen im Nebennierenmark. Während der Phenotypisierung des Mausmodells wurde eine Reduktion der CD62L+ T-Zellen von ca. 50% im peripheren Blut festgestellt. Mittels Yeast Two-Hybrid Analyse wurden Pals1-associated tight junction protein (PATJ) und FUN14 domain-containing 2 (FUNDC2) als mögliche Interaktionspartner identifiziert. Zusammenfassend wurde in dieser Arbeit eine zelluläre Basis für die Funktion von Gpr30 in vivo ermittelt. Der Phänotyp in Gpr30-lacZ Mäusen ist wahrscheinlich durch eine verringerte Produktion von naiven T-Zellen im Thymus bedingt. PATJ bindet die C-terminalen Aminosäuren von GPR30 mit einer PDZ-Domäne und könnte ein Gerüst-protein des GPR30-Signal¬komplexes darstellen.<br>The orphan G protein coupled receptor 30 (GPR30) was predominantly analyzed in the context of membrane-initiated estrogen signaling suggesting that GPR30 represents a novel estrogen receptor. However, the physiological function of GPR30 in vivo remained unknown. To unravel the physiological role of murine Gpr30 in vivo, a Gpr30-deficient mouse model was analyzed that harbors a LacZ reporter (Gpr30-lacZ) within the Gpr30 locus. The targeting of Gpr30 was verified by Southern blotting and real-time PCR. Gpr30-expressing cell types were identified by colocalization of LacZ along with cell type-specific markers. Further experiments aimed to decipher the phenotype of Gpr30-lacZ mice. To gain information about the signaling complex of human GPR30, yeast two-hybrid screenings were performed with the N- and C-terminal domains as bait. The main LacZ-positive cell populations were (i) endothelial cells in small arterial vessels of various tissues, (ii) smooth muscle cells, pericytes, and neuronal subpopulations in the brain, (iii) gastric chief cells in the stomach, (iv) cells in the intermediate and anterior pituitary, and (v) chromaffin cells in the adrenal glands. Extensive phenotype screening at the German Mouse Clinic revealed reduced numbers of T cells in the peripheral blood of Gpr30-lacZ mice. Especially the proportion of CD62L+ cells was decreased by approx. 50%. Yeast two-hybrid screening led to the identification of Pals1-associated tight junction protein (PATJ) and FUN14 domain-containing 2 (FUNDC2). In conclusion, this study provides a cellular basis for the function of Gpr30 in vivo. Since CD62L+ cells represent the naive T cell compartment, the phenotype of Gpr30-lacZ mice suggests an impaired production of T cells in the thymus. PATJ likely binds the C-terminus of GPR30 with one of its PDZ domains and may represent a scaffolding protein of the GPR30 signaling complex.
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Marshall, Ker Ross. "The pathogenesis, including neural latency, of equine herpesvirus type 1 in a murine infection model studied by means of lacZ, insertion mutants." Thesis, University of Cambridge, 1996. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.627614.
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JACQUES, NATHALIE. "L'efficacite de traduction d'arnm hybrides lacz d'e. Coli est couplee a leur synthese et a leur degradation, et est modulee par les conditions metaboliques." Paris 7, 1992. http://www.theses.fr/1992PA077090.
Full textAbstract:
Pour examiner l'influence possible des conditions de croissance sur la traduction des arnm de e. Coli et l'existence eventuelle d'un couplage entre traduction et degradation et entre traduction et synthese des arnm, nous avons construit une collection de genes chimeriques lamb-lacz et gale-lacz ne differant entre eux que par des mutations ponctuelles affectant l'efficacite de traduction. Nos resultats indiquent que selon l'efficacite de traduction des arnm hybrides lacz, il se produit soit un couplage entre traduction et synthese, soit un couplage entre traduction et degradation dans lequel l'endonuclease rnase e est impliquee. Nous proposons un modele mecanistique pour le role de la rnase e et nous nous interrogeons sur la generalite et le role physiologique d'un couplage traduction-degradation-synthese des arnm. Nous montrons egalement que les efficacites relatives de traduction des arnm hybrides lacz peuvent etre largement modulees par les conditions de croissance. Selon leur reponse a un changement des conditions de croissance, nous classons les arnm en deux categories. Le changement des conditions de croissance modifie de nombreux parametres cellulaires. Nous testons donc l'effet des variations de differents parametres sur les efficacites de traduction des arnm hybrides lacz et discutons de l'eventuelle generalite de ce phenomene
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Lavoie, Monique V. "Characterisation of a conserved motif found within the Dlx cis-regulatory element URE2 and its effect on mouse URE2-lacZ activity in transgenic mice." Thesis, University of Ottawa (Canada), 2010. http://hdl.handle.net/10393/28433.
Full textAbstract:
The Distal-less-like genes, commonly referred to as Dlx genes, encode homeodomain transcription factors essential for the establishment of GABAergic interneurons in the ventral forebrain as well as their migration to the cortex. The cis-regulatory element URE2 (enhancer) is located upstream of Dlx1 and is thought to regulate the transcription of Dlx1 and/or Dlx2. The objective of this study was to examine a short conserved sequence within the URE2 element, corresponding to nucleotides 699-719, and to evaluate its contribution to URE2 activity in transgenic mouse forebrain. My results showed that a mutant version of the URE2 element, in which nucleotides 699-719 were modified, was active in the cortex and the ventricular zone of forebrain of the transgenic mice produced with the mutant enhancer, where Dlx1/Dlx2 are not usually expressed. This indicated a loss of binding by a protein with a transcriptional repressor function. Previous analyses suggested that mURE2nt699-719 would be a good candidate for a REST repressor binding site. However, we were not able to observe any transcriptional regulation by REST in co-transfection experiments performed in cultured cells. This, as well as revised bioinformatical information, led us to identify four new candidates possibly using mURE2nt699-719 as a binding site, namely the Nuclear- Factor-1 proteins: NFIA, NFIB, NFIC and NFIX. These genes are associated with transcriptional regulation, being repressors and/or activators of gene expression in the brain. We showed that NFIC was able to utilize the mURE2nt699-719 sequence to reduce the luciferase reporter expression in neuronal cells, which would explain the loss of repression in our transgenic mice at embryonic days E11.5 and E13.5. These preliminary results also allowed us to suggest that a heterodimer between NFIC/NFIB and NFIC/NFIX binds to the mURE2699-719 sequence at embryonic day E15.5 and postnatal day 0 (P0) of the transgenic mice since the mutated enhancer's activity seems to indicate a loss of an activator at those stages. These results suggest that these factors could possibly be required for the regulation of the Dlx genes by URE2. These results will also help clarify the role of URE2 by identifying transcription factors that contribute to the genetic program involved in the cellular organization of the developing forebrain in vertebrates.
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Leroy, Prune. "Erreurs de processivité lors de la synthèse protéique chez Escherichia coli." Paris 6, 2005. http://www.theses.fr/2005PA066324.
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Al, Moustafa Mohamed Ala-Eddin. "Oncogènes viraux chez l'embryon d'oiseau. : Transformation et coopération in vivo. : Expression étudiée à l'aide du gêne reporter lacZ. : Isolement et caractérisation de lignées hématopoiétiques transformées." Paris 13, 1992. http://www.theses.fr/1992PA132001.
Full textAbstract:
Nous avons établi que l'oncogène nucléaire v-myc de mc29 transforme les myoblastes cardiaques chez l'embryon d'oiseau, et les cellules épidermiques quand l'injection est réalisée entre e1 et e5. Nous avons également étudié l'effet de l'association de v-myc à d'autres oncogenes; de telles combinaisons oncogéniques ont permis de déceler de nouvelles cibles de la transformation. Ainsi le virus mh2 qui comporte les oncogènes v-myc et v-mil et code pour la protéine nucléaire myc, et une serine thréonine kinase cytoplasmique, provoque chez l'embryon de caille et de poulet, en plus des rhabdomyomes cardiaques, des tumeurs endothéliales quand il est injecte a e3. En induisant la formation de tumeurs secondaires, mh2 est responsable in vivo d'un phénomène de coopération entre un oncogène nucléaire et un autre cytoplasmique. Un autre type de coopération a été démontré grâce à une construction rétrovirale nommée MHE226 et qui associe trois oncogènes nucléaires v-myc de MH2, v-myb et v-ets de E26. Lorsqu'elle est injectée à E3, cette construction induit des rhabdomyomes cardiaques et des tumeurs hématopoiétiques solides qui n'apparaissent que chez le poulet et qui sont également induites lorsque la construction est injectée à E5. Nous montrons aussi que des virus ou des constructions rétrovirales qui comportent l'oncogène v-myc provoquent, malgré des LTR différents, les deux phénotypes tumoraux classiques, à savoir des rhabdomyomes cardiaques et des anomalies cutanées. Des données importantes ont été obtenues en utilisant des vecteurs porteurs du gêne lacZ. Grâce à ces vecteurs nous avons montré une expression très forte de ce gêne dans le cou à E3. Des foyers d'expression lacZ sont observés dans la peau et préférentiellement au niveau du cou et de la tête après injection à E5.
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Wallace, David Brian. "An evaluation of the vaccine-vector potential of thymidine kinase-disrupted recombinants of lumpy skin disease virus (South African vaccine." Thesis, Pretoria : [s.n.], 2006. http://upetd.up.ac.za/thesis/available/etd-09062006-125038.
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Christian, Maren Wiebke [Verfasser]. "Zelltypspezifische Interaktion zwischen Endothelin und dem NO-System: Verteilungsmuster der ET-1-Expression in mit L-NAME behandelten Nieren von präpro-ET-1-LacZ-transgenen Mäusen / Maren Wiebke Christian." Berlin : Medizinische Fakultät Charité - Universitätsmedizin Berlin, 2008. http://d-nb.info/1027306225/34.
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Amarh, Vincent. "Visualization of replication-dependent DNA double-strand break repair in Escherichia coli." Thesis, University of Edinburgh, 2017. http://hdl.handle.net/1842/29596.
Full textAbstract:
Chromosomal replication is a source of spontaneous DNA double-strand breaks (DSBs). In E. coli, DSBs are repaired by homologous recombination using an undamaged sister template. During repair, the RecA protein polymerizes on single-stranded DNA generated at the site of the DSB and catalyses the search for sequence homologies on the undamaged sister template. This study utilized fluorescence microscopy to investigate the spatial and temporal dynamics of the RecA protein at the site of a replication-dependent DSB generated at the lacZ locus of the E. coli chromosome. The DSB was generated by SbcCD-mediated cleavage of a hairpin DNA structure formed on the lagging strand template of the replication fork by a long palindromic sequence. The tandem insertion of a recA-mCherry gene with the endogenous recA gene at the natural chromosomal locus produced no detectable effect on cell viability in the presence of DSB formation. During repair, the fluorescently-labelled RecA protein formed a transient focus, which was inferred to be the RecA nucleoprotein filament at the site of the replication-dependent DSB. The duration of the RecA focus at the site of the DSB was modestly reduced in a ΔdinI mutant and modestly increased in a ΔuvrD or ΔrecX mutant. Most cells underwent a period of extended cohesion of the sister lacZ loci after disappearance of the RecA focus. Segregation of the sister lacZ loci was followed by cell division, with each daughter cell obtaining a copy of the fluorescently-labelled lacZ locus. The RecA focus at the site of the DSB was observed predominantly between the mid-cell and the 1⁄4 position. In the absence of DSB formation, the lacZ locus exhibited dynamic movement between the mid-cell and the 1⁄4 position until the onset of segregation. Formation of the DSB and initiation of repair occurred at the spatial localization for replication of the lacZ locus while the downstream repair events occurred very close to the mid-cell. Genomic analysis of RecA-DNA interactions by ChIP-seq was used to demonstrate that the RecA focus at the lacZ locus was generated by the repair of the palindrome-induced DSB and not the repair of one-ended DSBs emanating from stalled replication forks at the repressor-bound operator arrays. This study has shown that the repair of a replication-dependent DSB occurs exclusively during the period of cohesion of the sister loci and the repair is efficiently completed prior to segregation of the two sister loci.
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Tran, khac Viet. "Le rôle des facteurs environnementaux sur la concentration des métaux-tracesdans les lacs urbains -Lac de Pampulha, Lac de Créteil et 49 lacs péri-urbains d’Ile de France." Thesis, Paris Est, 2016. http://www.theses.fr/2016PESC1160/document.
Full textAbstract:
Les lacs jouent un rôle particulier dans le cycle de l’eau dans les bassins versants urbains. La stratification thermique et le temps de séjour de l’eau élevé favorisent le développement phytoplanctonique. La plupart des métaux sont naturellement présents dans l’environnement à l’état de traces. Ils sont essentiels pour les organismes vivants. Néanmoins, certains métaux sont connus pour leurs effets toxiques sur les animaux et les humains. La concentration totale des métaux ne reflète pas leur toxicité. Elle dépend de leurs propriétés et de leur spéciation (fractions particulaires, dissoutes: labiles ou biodisponibles et inertes). Dans les systèmes aquatiques, les métaux peuvent être absorbés par des ligands organiques ou minéraux. Leur capacité à se complexer avec la matière organique dissoute (MOD), particulièrement les substances humiques, a été largement étudiée. Dans les lacs, le développement phytoplanctonique peut produire de la MOD non-humique, connue pour sa capacité complexante des métaux. Pourtant, peu de recherche sur la spéciation des métaux dans la colonne d’eau des lacs urbains a été réalisée jusqu’à présent.Les objectifs principaux de cette thèse sont (1) d’obtenir une base de données fiables des concentrations en métaux traces dans la colonne d’eau de lacs urbains représentatifs; (2) d’évaluer leur biodisponibilité via une technique de spéciation adéquate ; (3) d’analyser leur évolution saisonnière et spatiale et leur spéciation; (4) d’étudier l’impact des variables environnementales, en particulier de la MOD autochtone sur leur biodisponibilité; (5) de lier la concentration des métaux au mode d’occupation du sol du bassin versant.Notre méthodologie est basée sur un suivi in-situ des lacs en complément d’analyses spécifiques en laboratoire. L’étude a été conduite sur trois sites: le lac de Créteil (France), le lac de Pampulha (Brésil) et 49 lacs péri-urbains (Ile de France). Sur le lac de Créteil, plusieurs dispositifs de mesure en continu nous ont fourni une partie de la base de données limnologiques. Dans le bassin versant du lac de Pampulha, la pression anthropique est très importante. Le climat et le régime hydrologique des 2 lacs sont très différents. Les 49 lacs de la région d’Ile de France ont été échantillonnés une fois pendant trois étés successifs (2011-2013). Ces lacs nous ont fourni une base de données synoptique, représentative de la contamination métallique à l’échelle d’une région fortement anthropisée.Afin d’expliquer le rôle des variables environnementales sur la concentration métallique, le modèle Random Forest a été appliqué sur les bases de données du lac de Pampulha et des 49 lacs urbains avec 2 objectifs spécifiques: (1) dans le lac de Pampulha, comprendre le rôle des variables environnementales sur la fraction labile des métaux traces, potentiellement biodisponible et (2) dans les 49 lacs, comprendre la relation des variables environnementales, particulièrement au niveau du bassin versant, sur la concentration dissoute des métaux. L’analyse des relations entre métaux et variables environnementales constitue l’un des principaux résultats de cette thèse. Dans le lac de Pampulha, environ 80% de la variance du cobalt labile est expliqué par des variables limnologiques: Chla, O2, pH et P total. Pour les autres métaux, le modèle n’a pas réussi à expliquer plus de 50 % de la relation entre fraction labile et variables limnologiques. Dans les 49 lacs, le modèle Random Forest a donné un bon résultat pour le cobalt (60% de la variance expliquée) et un très bon résultat pour le nickel (86% de la variance expliquée). Pour Ni les variables explicatives sont liées au mode d’occupation du sol : « Activités » (Equipements pour l’eau et l’assainissement, entrepôts logistiques, bureaux…) et « Décharge ». Ce résultat est en accord avec le cas du lac de Créteil où la concentration en Ni dissous est très élevée et où les catégories d’occupation du sol « Activités » et « Décharges » sont dominantes<br>Lakes have a particular influence on the water cycle in urban catchments. Thermal stratification and a longer water residence time in the lake boost the phytoplankton production. Most metals are naturally found in the environment in trace amounts. Trace metals are essential to growth and reproduction of organisms. However, some are also well known for their toxic effects on animals and humans. Total metal concentrations do not reflect their ecotoxicity that depends on their properties and speciation (particulate, dissolved: labile or bioavailable and inert fractions). Trace metals can be adsorbed to various components in aquatic systems including inorganic and organic ligands. The ability of metal binding to dissolved organic matter (DOM), in particular humic substances, has been largely studied. In urban lakes, the phytoplankton development can produce autochthonous DOM, non humic substances that can have the ability of metal binding.. But there are few studies about trace metal speciation in lake water column.The main objectives of this thesis are (1) to obtain a consistent database of trace metal concentrations in the water column of representative urban lakes; (2) to access their bioavailability through an adapted speciation technique; (3) to analyze the seasonal and spatial evolution of the metals and their speciation; (4) to study the potential impact of environmental variables, particularly of dissolved organic matter related to phytoplankton production on metal bioavailability and (5) to link the metal concentrations to the land use in the lake watershed.Our methodology is based on a dense field survey of the water bodies in addition to specific laboratory analysis. The research has been conducted on three study sites: Lake Créteil (France), Lake Pampulha (Brazil) and a panel of 49 peri-urban lakes (Ile de France). Lake Créteil is an urban lake impacted by anthropogenic pollution. It benefits of a large number of monitoring equipment, which allowed us to collect a part of the data set. In Lake Pampulha catchment, the anthropogenic pressure is high. Lake Pampulha has to face with many pollution point and non-point sources. The climate and limnological characteristics of the lakes are also very different. The panel of 49 lakes of Ile de France was sampled once during three successive summers (2011-2013); they provided us with a synoptic, representative data set of the regional metal contamination in a densely anthropized region.In order to explain the role of the environmental variables on the metal concentrations, we applied the Random Forest model on the Lake Pampulha dataset and on the 49 urban lake dataset with 2 specific objectives: (1) in Lake Pampulha, understanding the role of environmental variables on the trace metal labile concentration, considered as potentially bioavailable and (2) in the 49 lakes, understanding the relationship of the environmental variables, more particularly the watershed variables, on the dissolved metal concentrations. The analysis of the relationships between the trace metal speciation and the environmental variables provided the following key results of this thesis.In Lake Pampulha, around 80% of the variance of the labile cobalt is explained by some limnological variables: Chl a, O2, pH, and total phosphorus. For the other metals, the RF model did not succeed in explaining more than 50% of the relationships between the metals and the limnological variables.In the 49 urban lakes in Ile de France, the RF model gave a good result for Co (66% of explained variance) and very satisfying for Ni (86% of explained variance). For Ni, the best explanatory variables are landuse variables such as “activities” (facilities for water, sanitation and energy, logistical warehouses, shops, office…) and “landfill”. This result fits with Lake Creteil where dissolved Ni concentration is particularly high and where the “activities” and “landfill” landuse categories are the highest
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Raponi, Mitch Biochemistry & Molecular Genetics UNSW. "Antisense RNA-mediated gene silencing in fission yeast." Awarded by:University of New South Wales. Biochemistry and Molecular Genetics, 2001. http://handle.unsw.edu.au/1959.4/18277.
Full textAbstract:
The major aims of this thesis were to investigate the influence of i) antisense gene location relative to the target gene locus (?????location effect?????), ii) double-stranded RNA (dsRNA) formation, and iii) over-expression of host-encoded proteins on antisense RNA-mediated gene regulation. To test the location effect hypothesis, strains were generated which contained the target lacZ gene at a fixed location and the antisense lacZ gene at various genomic locations including all arms of the three fission yeast chomosomes and in close proximity to the target gene locus. A long inverse-PCR protocol was developed to rapidly identify the precise site of antisense gene integration in the fission yeast transformants. No significant difference in lacZ suppression was observed when the antisense gene was integrated in close proximity to the target gene locus, compared with other genomic locations, indicating that target and antisense gene co-localisation is not a critical factor for efficient antisense RNA-mediated gene suppression in vivo. Instead, increased lacZ down-regulation correlated with an increase in the steady-state level of antisense RNA, which was dependent on genomic position effects and transgene copy number. In contrast, convergent transcription of an overlapping antisense lacZ gene was found to be very effective at inhibiting lacZ gene expression. DsRNA was also found to be a central component of antisense RNA-mediated gene silencing in fission yeast. It was shown that gene suppression could be enhanced by increasing the intracellular concentration of non-coding lacZ RNA, while expression of a lacZ panhandle RNA also inhibited beta-galactosidase activity. In addition, over-expression of the ATP-dependent RNA-helicase, ded1, was found to specifically enhance antisense RNA-mediated gene silencing. Through a unique overexpression screen, four novel factors were identified which specifically enhanced antisense RNA-mediated gene silencing by up to an additional 50%. The products of these antisense enhancing sequences (aes factors), all have natural associations with nucleic acids which is consistent with other proteins which have previously been identified to be involved in posttranscriptional gene silencing.
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Jokela, T. (Tiina). "Analyses of kidney organogenesis through in vitro and in vivo approaches:generation of conditional Wnt4 mouse models and a method for applying inducible Cre-recombination for kidney organ culture." Doctoral thesis, Oulun yliopisto, 2013. http://urn.fi/urn:isbn:9789526201559.
Full textAbstract:
Abstract In mice, gene targeting has become a useful tool for resolving the functions of proteins and for creating new animal models. Cre/loxP technology has been used broadly for generation of genetically modified mice. The Cre recombinase recognizes a specific DNA sequence, called loxP, and removes any DNA fragment between two loxP-sites. The activity of the Cre recombinase can be controlled spatially and temporally with cell- or tissue-specific promoters and synthetic inducing agents, such as tamoxifen or tetracycline. In this thesis, we employed tamoxifen-induced Cre recombination in vitro. Cre-ERTM mice were crossed to ROSA26LacZ reporters and Cre-recombination induced by 4OH-TM was monitored by LacZ staining. 0.5 μM 4OH-TM treatment was competent for tamoxifen-induced Cre-mediated activation of LacZ both in kidney cultures and in experimentally induced kidney mesenchymes. Wnt4 is a secreted signaling molecule, which is necessary for the development of several organs including kidney, ovary, adrenal gland, mammary and pituitary glands. Wnt4 is crucial for kidney development and conventional Wnt4-/- mice die soon after birth, likely due to renal failure. In this thesis, two different Wnt4 alleles, Wnt4EGFPCre and floxed Wnt4, were generated and analyzed to learn more about the Wnt4 functions and to apply these mouse lines to renal functional genomics. In the Wnt4EGFPCre, the EGFPCre fusion cDNA was targeted into exon I of the Wnt4 locus. EGFP-derived fluorescence was observed in the pretubular aggregates from E12.5 embryonic kidney onwards. Further characterization by crossing with the floxed ROSA26LacZ and yellow fluorescent protein (YFP) reporter lines demonstrated that in addition to the kidney, reporter expression was observed in the gonad, spinal cord, lung and the adrenal gland. The expression pattern of the Cre activity recapitulates well the known pattern of the Wnt4 gene. Time-lapse analysis in organ culture settings showed that the Wnt4 expressing cells contributed to the nephrons, some cells near the stalk of the developing ureter, as well as a number of positive supposed medullary stromal cells. In the conditional Wnt4 knock-out, loxP sites were placed to flank exons 3 to 5. The Wnt4 gene was specifically inactivated with CAGCre and Wnt4EGFPCre lines. In both of these crosses deletion of Wnt4 gene function led to impaired kidney development. In conclusion, we identified the culture conditions that can be used for the tamoxifen-induced conditional mutagenesis in tissue cultures. In addition, the created Wnt4 mouse lines serve as new useful tools for addressing the roles of Wnt4 function in diverse tissues and in different stages of development<br>Tiivistelmä Hiirillä geenikohdennuksesta on muodostunut hyödyllinen väline proteiinien tehtävien selvittämisessä ja uusien eläinmallien luomisessa. Cre/loxP -tekniikkaa on käytetty laajasti muuntogeenisten hiirien tuottamisessa. Cre-rekombinaasi tunnistaa spesifisen DNA-jakson, niin kutsutun loxP:n, ja poistaa kaikki DNA-jaksot kahden loxP-sekvenssin väliltä. Cre-rekombinaasin aktiivisuutta voidaan säädellä paikallisesti ja ajallisesti solu- tai kudosspesifisillä promoottoreilla ja synteettisillä indusoivilla kemikaaleilla, kuten tamoksifeenillä tai tetrasykliinillä. Tässä väitöskirjassa hyödynsimme tamoksifeenin aiheuttamaa Cre-rekombinaatiota in vitro -kudosviljelmissä. Cre-ERTM-hiirilinja risteytettiin ROSA26LacZ-reportterilinjan kanssa, ja 4-hydroksitamoksifeenin indusoima Cre-rekombinaasin aktiivisuutta monitoroitiin LacZ–värjäyksellä. 0.5 µM:n 4OH-TM konsentraatiolla LacZ-reportterigeeni saatiin aktivoitua tehokkaasti Cre-rekombinaasin avulla sekä munuaisviljelmissä että munuaismesenkyymiviljelmissä. Wnt4 on erittyvä signalointimolekyyli, jolla on keskeinen rooli useiden elinten, kuten munuaisen, munasarjan, lisämunuaisen, rintarauhasen ja aivolisäkkeen kehittymisessä. Wnt4-geenillä on ratkaisevan tärkeä rooli munuaisen kehityksessä, ja poistogeeninen Wnt4-/-hiiri kuolee pian syntymän jälkeen, todennäköisesti munuaisen vajaatoimintaan. Tässä väitöskirjatyössä tuotettiin kaksi eri Wnt4 alleelia, Wnt4EGFPCre ja konditionaalinen Wnt4. Nämä hiirilinjat analysoitiin, jotta saisimme lisää tietoa Wnt4-geenin toiminnasta ja pystyisimme soveltamaan kyseisiä hiirikantoja munuaisten toiminnan selvittämisessä. Wnt4EGFPCre-alleelissa EGFPCre-fuusio -cDNA kohdennettiin osaksi endogeenisen Wnt4-geenin ykköseksonia. Vihreän fluoresoivan proteiinin (EGFP) aktiivisuus havaittiin varhaisen munuaisen kehityksen aikana. Wnt4EGFPCre-alleelin lisäkarakterisointi reportterilinjoilla (Rosa26LacZ ja Rosa26YFP) osoitti, että Wnt4-geenin ilmentyminen havaittiin munuaisen lisäksi sukurauhasissa, selkäytimessä, keuhkoissa sekä lisämunuaisessa. Wnt4EGFPCre-alleeli ilmentyi niissä kudoksissa, joissa endogeenisen Wnt4-geenin tiedetään olevan aktiivinen. Time-lapse -analyysin avulla osoitettiin, että Wnt4-geeniä ilmentävät solut muodostavat tiettyjä rakenteita munuaisen kehityksen aikana. Wnt4-geeni ilmentyi nefroneissa, kehittyvän virtsajohtimen soluissa sekä useissa medullaarisissa stroomasoluissa. Konditionaalisessa (ehdollisessa) Wnt4 knock-out-hiirilinjassa loxP-sekvenssit sijoitettiin eksonien kolme sekä viisi ympärille. Wnt4-geenin toiminta inaktivoitiin CAGCre- ja Wnt4EGFPCre-hiirilinjojen avulla. Näissä molemmissa tapauksissa Wnt4-geenin toiminnan poistaminen johti munuaisen kehityshäiriöön. Yhteenvetona voimme todeta, että olemme tunnistaneet ne kasvatusolosuhteet, joita voidaan hyödyntää, kun halutaan aktivoida reportterigeenejä tai kehityksen kannalta tärkeitä geenejä tamoksifeenin aiheuttamaa Cre/loxP -rekombinaatiota hyväksikäyttäen kudosviljelmissä. Samoja olosuhteita ja menetelmää käyttäen voidaan myös poistaa jonkun kehityksen kannalta tärkeän geenin toiminta ja tutkia sitä kudosviljelmässä. Tuotetut Wnt4-hiirikannat ovat lisäksi uusia hyödyllisiä työkaluja, kun halutaan tutkia Wnt4-geenin toimintaa erilaisissa kudoksissa ja eri kehitysvaiheiden aikana
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Wang, Shenqiu. "Grainy head target genes in epithelial morphogenesis and wound healing." Doctoral thesis, Stockholm : The Wenner-Gren Institute, Stockholm University, 2010. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:su:diva-38377.
Full text
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Benech, Vincent, and Jacques Quensière. "Dynamique des peuplements ichtyologiques de la région du lac Tchad (1966-78) : influence de la sécheresse sahélienne." Lille 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LIL10173.
Full textAbstract:
Avec la régression lacustre d'un Tchad normal de haut niveau à un petit Tchad partiellement asséché et marécageux, les peuplements subissent de profondes transformations attribuées aux perturbations des migrations fluvio-lacustres et aux modifications des conditions lacustres dominées par l'invasion des macrophytes et les hypoxies récurrentes. L'influence de ces facteurs est analysée d'une part sur la résistance à l'hypoxie des espèces qui ont subi de fortes variations d'abondance et d'autre part sur les modalités de la reproduction et des phénomènes migratoires qui s'y rattachent. La dernière partie est un essai de caractérisation de cet écosystème et de compréhension de son ichtyofaune au niveau évolutif en comparant avec plusieurs autres lacs plats africain
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Maleval, Véronique. "Le Lac de Saint-Pardoux et l'évolution morphologique des lacs de barrage artificiel." Limoges, 2002. http://www.theses.fr/2002LIMO2007.
Full textAbstract:
L'inondation d'un modelé alvéolaire granitique du Haut-Limousin a formé une retenue d'eau aux contours tortueux : le lac de Saint-Pardoux composé de cinq bassins digités séparés par des détroits. Les dimensions moyenne de ce lac (324,21 ha, volume de 21,97 mm3, 16,70 m de profondeur maximale) en font un laboratoire naturel, un modèle pour des expérimentations de géographie limnologique. Un protocole de mesures, fondé sur des observations, des mesures et des prélèvements ponctuels mais aussi sur l'utilisation de matériels divers tels les séditomentomètres, donne de solides données sur l'évolution morphologique du lac, autant en termes de quantification qu'en terme de bilan. Les études sur l'érosion amènent à dire que 61,3% du littoral reculent à une vitesse moyenne comprise entre 0,2 et 27 cm par an. La période d'érosion la plus active se situe dans les dix premières années de vie du lac. Le volume de sédiments érodés a été estimé à 4270 m3, soit 0,019 % du volume d'eau. Au sein de la cuvette lacustre, l'étude de la sédimentation a montré qu'il existe un gradient de sédimentation, amont-aval décroissant. Il résulte de différents paramètres qui sont le fonctionnement hydrodynamique, la superficie et la morphologie du lac. Les sédiments composés de débris phytoplanctoniques représentent l'essentiel du volume des dépôts. La vitesse moyenne de sédimentation du lac est de 2,9 mm. An, ce qui classe Saint-Pardoux dans la norme mondiale des lacs oligotrophes. Depuis la création du lac (1976), le volume de sédiments a été évalué à 357000 m3, soit 1,62 % du volume d'eau. Dans des conditions environnementales semblables, ce lac peut vivre encore 1573 ans. Cette étude a permis d'établir le premier véritable bilan sédimentaire qui conclut, en quantité, à la supériorité des apports autochtones (72,4 %) face aux apports allochtones. Le Lac producteur de sédiments, existe en tant que tel et ne doit plus être considéré comme un élément pertubarteur d'un réseau hydrographique.
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Lejolivet, Catherine. "Contribution à l'étude du recrutement des poissons du réservoir de Pareloup (Aveyron) : élevage et étude de la phase planctonophage des brochetons (Esox lucius L.) : régime alimentaire, croissance, répartition spatio-temporelle de la communauté alevinique en zonelittorale." Toulouse, INPT, 1988. http://www.theses.fr/1988INPT012A.
Full textAbstract:
Faisant suite à divers travaux sur les peuplements piscicoles des retenues artificelles de la région Midi-Pyrénées et entrant dans le cadre d'un projet pluridisciplinaire, ce travail aborde les problèmes de reproduction des principales espèces et de nutrition des jeunes de l'année de la retenue de Pareloup (Aveyron). Après un recensement des données disponibles sur ce site et en particulier sur les populations de poisson, une première étape a consisté à faire fonctionner une écloserie à brochet, in situ. Dans une deuxième étape, les brochetons ont été élevées en cages dans les conditions physico-chimiques du lac pour analyser et estimer les besoins nutritionnels pendant leur phase planctonophage. Dans la dernière partie de ce mémoire, les relations intra et interspécifiques sont mises en évidence par l'étude du régime alimentaire, de la croissance et de la répartition spatio-temporelle des jeunes au sein d'une frayère. L'ensemble des résultats obtenus permet de suggérer des aménagements, visant à améliorer le recrutement et la qualité des ressources piscicoles du réservoir de Pareloup, mais également d'autres retenues artificielles.
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O'Reilly, Guzene. "Assessment of the physico-chemical and microbiological quality of household water in the Vaalharts irrigation scheme, South Africa / G. O'Reilly." Thesis, North-West University, 2012. http://hdl.handle.net/10394/9190.
Full textAbstract:
Water quality in the Vaalharts region in the Northern Cape Province, South Africa, decreased over the past few years and there was a need for the microbiological and physico-chemical assessment. This problem was identified through discussions with Vaalharts Water (Vaalharts Water User Association) in 2010 when the issue of the impact of deteriorating water quality on drinking water production was raised. It was thus important to investigate concerns of the water users association pertaining to water quality issues. The aim of this study was to assess the physico-chemical and microbiological quality of household water in the Vaalharts irrigation scheme. The main residential areas were Hartswater, Pampierstad, Jan Kempdorp and Warrenton. Faecal coliforms were detected in the raw water of all the drinking water distribution systems during 2011 and 2012. No faecal coliforms were detected in the household water during 2011. This was a very positive result, because not only did the household water comply with the SANS 241 (2011) standard (0 CFU/100ml), but the purification processes were successful by removing all the E. coli’s from the raw water. However, during March 2012 faecal coliforms were detected in the household water of Jan Kempdorp (191CFU/100ml). This could be due to point pollution and possible breakage of faecal coliforms in the distribution system. Low amounts of total coliforms were detected in the raw water of some of the drinking water distribution systems. This could be due to high amounts of other colonies (pink and purple) growing on the m-Endo agar which suppress the growth of the metallic green sheen (total coliform) colonies. The total coliform numbers complied with the SANS 241 (2011) standard of ≤10 CFU/100ml at most of the distribution systems, except for Hartswater during July 2011 (14CFU/100ml) and Warrenton during March 2012 (256 CFU/100ml). Heterotrophic plate count bacteria were very high in the household water of some of the distribution systems during 2011 and 2012 which exceeded the SANS 241 (2011) standard of ≤1000 CFU/ml. A large number of pigmented (yellow, orange, pink) and non-pigmented (white) colonies were isolated on R2A agar. This can be an indication of some failure in treatment processes. Other microbiological parameters that were tested such as faceal streptococci, Clostridia, Pseudomonas aeruginosa and fungi did not indicate any danger, but there were high levels of total anaerobic bacteria in the raw water during 2011 and 2012. A high level of anaerobic bacteria was detected in the household water of Hartswater during July 2011. Clostridia were also present in the household water of some of the distribution systems during 2011 and 2012. Sequencing results of the mdh, lacZ and uidA genes indicated that one of the isolates was identified as Enterobacter cloacae and the other isolates were E. coli. Four of the isolates were identified as Escherichia coli O104:H4. This is a pathogenic strain and raised concern. The physicochemical parameters that were measured complied with the SANS 241 (2011) standards during 2011 and 2012, but some of the parameters increased gradually from 2011 to 2012. Statistical analysis indicated that physico-chemical parameters had an influence on microbiological parameters and that deteriorating raw water may have an impact on drinking water quality. Another concern currently is that there is no SANS 241 (2011) for faecal streptococci, Clostridia, Pseudomonas aeruginosa, fungi and anaerobic bacteria. These are all opportunistic pathogenic bacteria and consuming water with high levels of these bacteria may cause health problems. This study indicated good progress in the treatment processes of the distribution systems over the two years. This may be due to the feedback given to Vaalharts Water during this study regarding the water quality of the residential areas. The physico-chemical and microbiological results of the present study indicated possible biofilm formation in the distribution systems. This may have impacts on the drinking water quality of the distribution systems. It was also evident that deteriorating raw water sources may have an impact on drinking water production.<br>Thesis (MSc (Environmental Sciences))--North-West University, Potchefstroom Campus, 2013.
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Goto, Akira. "Co-evolution of simian foamy viruses (SFVs) with primates: comparative functional analyses of miRNAs expressed from SFVs." Kyoto University, 2020. http://hdl.handle.net/2433/253169.
Full text
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Forasacco, Elena. "Ecology and morphofunctional adaptations in some species of genus Simocephalus." Chambéry, 2005. http://www.theses.fr/2005CHAMS016.
Full textAbstract:
Le mémoire concerne l'écologie du genre Simocephalus considérant ses relations avec les paramètres environnementaux et les ressources alimentaires. La recherche a été effectuée sur des échantillons des lacs du Bourget (F) et d'Iseo (1), deux bassins dont les caractéristiques morphologiques et trophiques sont différentes. La recherche traite de 4 points : 1) les relations du genre Simocephalus avec les paramètres environnementaux: le lac du Bourget présente une plus grande diversité d'espèces par rapport au lac Iseo, corrélée à la conductivité et à l'alcalinité, comme l'ont montré des études précédentes ; 2) l'analyse des préférences du point de vue des particules alimentaires: effets significatifs ont été trouvés sur les bactéries et on a aussi montré que la classe de taille préférée par S. Vetulus est 1. 2-10 mm, que correspondait aux flagellés ; 3) la variabilité phénotypique des appendices de filtration de S. Velu/us à travers les relations entre les dimensions des pattes filtrantes et les concentrations des particules alimentaires: la distance intersétiale des individus du lac Bourget est corrélée avec les 3 classes de taille de particules définies alors que seules les particules moyennes sont corrélées aux individus du lac Iseo. La - corrélation entre la surface de filtration et la concentration totale des particules n'est pas , significative car, lorsque la concentration en particules varie, les individus changent leur taux de filtration ; 4) la variabilité génétique intra-specifique de S. Vetulus à travers la technique AFLP (Amplified - Fragment Length Polymorphism): l'analyse de clusters a permis d'identifier les clones présents, certains généralistes et d'autres spécialisés. De façon globale, les résultats montrent que l'importance de ce crustacé dans les écosystèmes de la zone littorale est grande grâce à ses stratégies d'adaptation (développement de clones) et à sa capacité à utiliser plusieurs ressources alimentaires (plasticité phénotypique des pattes filtrantes<br>The aim of the study was to analyse the genus Simocephalus from an ecological standpoint especially with regard to environmental parameters and food resources. Samples were taken in lake Bourget (F) and Iseo (1), two basins characterized by different morphology and different trophic status. The research dealt in 4 topics : 1) relationships of genus Simocephalus with environmental parameters: species diversity in Lake Bourget was higher than in lake Iseo, probably depended on conductivity and al. Ka1inity, as shown in previous studies ; 2) investigation on particles size classes preferentially fed by the animal: significant effects were clear for bacteria and for the 1. 2-10 mm particle size class, corresponding to flagellates, which was preferred by S. Vetulus ; 3) phenotypical. Variability of filtering limbs by studying relationships between filter screen dimensions and food particle concentrations: intersetal distance was correlated to three size classes of particles in individuals from lake Bourget, while medium-sized particles only were correlated with S. Velu/us in lake Iseo. We did not find significant correlations between filter screen area and total particle concentration: our hypothesis is that, when particle concentration changes, individuals change their filtration rate ; 4) intra-specific genetic variations of S. Vetulus by the AFLP (Amplified Fragment Length ~ Polymorphism) technique: a cluster analysis allowed clone identification in the two lakes, some generalistic and other specialist. Our results show the importance of the crustacean in littoral areas was evident, due to several adaptation strategies (development of clones) and to its ability in gathering different size classes of food resources (phenotypic plasticity of filter screens)
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Passinring, Kedeu. "Milieux naturels et paysages du bassin-versant des lacs de Léré : Département du lac Léré, Tchad." Aix-Marseille 1, 2006. http://www.theses.fr/2006AIX10013.
Full textAbstract:
Cette étude a été menée selon une approche descriptive qui établit les relations entre les éléments du milieu naturel, la structure des paysages et l'homme. Elle comporte cinq chapîtres réparties en deux parties. La première consacrée aux paysages lacustres et des lits fluviaux met en lumière dans le chapitre 1, la position des lacs dans un demi graden et l'influence climatique sur leur régime suivi au chapitre 2 et 3, respectivement, de l'étude des paysages végétaux des rivages lacustres et le rôle des structures géologiques dans la mise en place des vallées. La deuxième partie comprend deux chapitres qui traitent des principaux affleurements géologiques, leur rôle dans les modelés de plateaux et collines ; et les paysages végétaux sous influences anthropiques. Comme le climat, le rôle de l'homme a été étudié de façon transversale sur l'ensemble des aspects du bassin versant.
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Lanz, Rainer. "Ritterideal und Kriegsrealität im Spätmittelalter: das Herzogtum Burgund und Frankreich /." Zürich : [s.n.], 2005. http://www.dissertationen.unizh.ch/2006/lanz/diss.pdf.
Full text
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Bichet, Vincent. "Impact des contraintes environnementales sur la production sédimentaire d'un bassin versant jurassien au cours du postglaciaire. Le système limnologique de Chaillexon (Doubs - France)." Phd thesis, Université de Bourgogne, 1997. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00376301.
Full textAbstract:
LE LAC DE CHAILLEXON (DOUBS - FRANCE) EST UN LAC DE BARRAGE NATUREL CREE PAR UN ECROULEMEMENT ROCHEUX DURANT LA SECONDE MOITIE DU BLLING (12300 B.P.). LE COMBLEMENT SEDIMENTAIRE DU PIEGE LACUSTRE PRESENTE UN ENREGISTREMENT CONTINU DU TARDIGLACIAIRE ET DE L'HOLOCENE. CE TRAVAIL PROPOSE UNE APPROCHE DU FONCTIONNEMENT GLOBAL DU SYSTEME LIMNOLOGIQUE (BASSIN VERSANT PRODUCTEUR ET PIEGE LACUSTRE RECEPTEUR). A PARTIR DE L'ANALYSE DU SYSTEME ACTUEL (PRODUCTION, FLUX, STOCKS) ET DES ENSEIGNEMENTS QUI S'EN DEGAGENT, IL EST PROPOSE UNE INTERPRETATION QUANTITATIVE ET QUALITATIVE DES STOCKAGES ANCIENS ET DE LA PRODUCTION SEDIMENTAIRE DU BASSIN VERSANT, SOUS L'INFLUENCE DES CONTRAINTES ENVIRONNEMENTALES.
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Guillard, Jean. "Etude des stocks pisciaires lacustres par échointégration : problèmes méthodologiques." Lyon 1, 1991. http://www.theses.fr/1991LYO10092.
Full textAbstract:
L'echosondage et l'echointegration sont de plus en plus utilises pour reperer, decrire et estimer les stocks pisciaires. Trois disciplines a priori tres distantes, l'acoustique, la statistique et la biologie, convergent ainsi en un ensemble interdependant dans la mise en uvre et pour la reussite des operations. Par suite de la complexite des techniques utilisees dans le recueil et dans l'exploitation des resultats, la methode est d'emploi delicat et susceptible d'engendrer de nombreuses erreurs. L'objet de cette these est de presenter les problemes techniques et methodologiques rencontres lors de l'echosondage en lac, de proposer des solutions et d'en demontrer le resultat dans le cas concret d'un suivi sur quatre annees du stock pisciaire d'un lac alpin. Dans une premiere partie sont rappeles les grands principes des methodes utilisees. Dans la deuxieme partie les differents problemes rencontres lors de l'etablissement des plans d'echantillonnage d'une campagne d'echointegration en lac, en fonction des repartitions spatio-temporelles des peuplements piscicoles, des differences jour-nuit, sont developpes ainsi que la maniere dont nous les avons resolus. La modelisation des structures des peuplements de poisson par l'intermediaire des variogrammes est analysee en fonction des contraintes dues a la particularite des peuplements lacustres. En troisieme partie, le bilan de quatre annees consecutives de campagnes sur le lac d'annecy est presente; il permet d'etudier un cas concret et de comparer les methodes geostatistiques avec une approche statistique parametrique. Les conclusions portent sur l'interet de cette convergence de disciplines dans la methode etudiee pour la gestion piscicole des lacs et pour des etudes plus ponctuelles sur les ecosystemes lacustres
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Gonzague, Bernadette de. "Traditional and market food use among adults in two Ojibwe communities." Thesis, McGill University, 1997. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=27305.
Full textAbstract:
Food frequency questionnaires and twenty-four hour recalls were conducted with a random sample of 104 Ojibwe adults in Mille Lacs, Minnesota and Lac Courte Oreilles, Wisconsin to assess traditional and market food use. Sociocultural questionnaires were used to assess the cultural significance of traditional food. The importance of the traditional food system was evident, with at least 50% of people engaging in hunting and fishing practices. Traditional food was among the top ten food sources of protein, zinc, iron and folate. The cultural significance of traditional food was apparent. Obesity is prevalent, with almost 50% of the population studied over the 85$ rm sp{th}$ percentile for Body Mass Index (BMI). Nutrient densities were lower than those in the NHANES III sample, in particular for calcium, vitamin A, vitamin C, and folate. Mean intakes of fat, saturated fat, and sucrose exceeded American Heart Association and World Health Organization recommendations. Areas of focus for education and future research needs are suggested in order to reduce risks for nutrition-related chronic disease such as diabetes and heart disease.
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Delalande, Manuëlla. "HYDROLOGIE ET GEOCHIMIE ISOTOPIQUE DU LAC MASOKO ET DE LACS VOLCANIQUES DE LA PROVINCE ACTIVE DU RUNGWE (SUD-OUEST TANZANIE)." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00403009.
Full textAbstract:
Les lacs sont des réservoirs naturels potentiels d'eau douce. Réceptacles d'eaux météoriques ils ne sont plus systématiquement considérés aujourd'hui comme de simple pluviomètre. Véritables lieux de régulation et d'échanges, ils peuvent former des lieux de concentration, accumulateur et véhiculeur de pollutions ou à l'opposé, des milieux de décantation et de dilution favorables à la préservation de la ressource en eau. Cette thèse se focalise sur les aspects quantitatifs et qualitatifs de la réserve en eau douce potentielle du lac Masoko et d'autres lacs volcaniques du Sud Ouest tanzanien pour la plupart peu ou jamais étudiés. Ces travaux ont mis en évidence que, les niveaux et bilans de ces systèmes fermés, sont notamment régis par des échanges avec l'atmosphère positifs dont résultent d'importants flux souterrains et que ces lacs endoréiques, constituent des lieux de dilution. Ces hydro-systèmes présentent également divers degrés et types de minéralisation qui semblent en premier lieu, contrôlés par la contribution d'apports hydrothermaux aux lacs et secondairement par les temps de résidence des eaux lacustres. L'étude des fonctionnements hydrologique et géochimique des lacs du Sud-Ouest tanzanien, sous les conditions hydroclimatiques régionales actuelles (P-E >0), a permis de montrer que le degré de minéralisation des systèmes présentés pourrait s'accroître sous l'influence d'une augmentation de la pluviométrie. Des augmentations de la minéralisation lacustre seraient dans cette région, reliées à des conditions climatiques humides au YD et au LGM, alors qu'elles donnent préférentiellement lieu à des interprétations contraires.
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Delalande, Manuëlla. "Hydrologie et géochimie isotopique du lac Masoko et de lacs volcaniques de la province active du Rungwe (Sud-Ouest Tanzanie)." Paris 11, 2008. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00403009.
Full textAbstract:
Les lacs sont des réservoirs naturels potentiels d'eau douce. Réceptacles d'eaux météoriques ils ne sont plus systématiquement considérés aujourd'hui comme de simple pluviomètre. Véritables lieux de régulation et d'échanges, ils peuvent former des lieux de concentration, accumulateur et véhiculeur de pollutions ou à l'opposé, des milieux de décantation et de dilution favorables à la préservation de la ressource en eau. Cette thèse se focalise sur les aspects quantitatifs et qualitatifs de la réserve en eau douce potentielle du lac Masoko et d'autres lacs volcaniques du Sud Ouest tanzanien pour la plupart peu ou jamais étudiés. Ces travaux ont mis en évidence que, les niveaux et bilans de ces systèmes fermés, sont notamment régis par des échanges avec l'atmosphère positifs dont résultent d'importants flux souterrains et que ces lacs endoréiques, constituent des lieux de dilution. Ces hydro-systèmes présentent également divers degrés et types de minéralisation qui semblent en premier lieu, contrôlés par la contribution d'apports hydrothermaux aux lacs et secondairement par les temps de résidence des eaux lacustres. L'étude des fonctionnements hydrologique et géochimique des lacs du Sud-Ouest tanzanien, sous les conditions hydroclimatiques régionales actuelles (P-E >0), a permis de montrer que le degré de minéralisation des systèmes présentés pourrait s'accroître sous l'influence d'une augmentation de la pluviométrie. Des augmentations de la minéralisation lacustre seraient dans cette région, reliées à des conditions climatiques humides au YD et au LGM, alors qu'elles donnent préférentiellement lieu à des interprétations contraires<br>Lakes constitute potential and natural freshwater reservoir which are today not systematically considered anymore as simple pluviometer. Exchange and regulation places, lakes can be places of concentration where polluants accumulate or opposite places of dilution, which are favourable to the preservation of water ressources. This thesis focus on quantitative and qualitative aspects of the potential freswater reserve of Lake Masoko and others volcanic lakes of South West tanzanian few or never studied. This work gives evidence that the lake-levels and the balances of these systems are controlled by positive exchanges with atmosphere from which, result important groundwater fluxes. It was also shown that these mostly closed lakes constitute dilution places. These hydro-systems show also mineralisation degree and type, which appear control by first, the contribution of hydrothermal inflows to the lakes and secondly, by the lake water residence times. This hydrological and geochemical study of South West tanzanian lakes, under actual regional hydroclimatic conditions, allows to show that the mineralization degree of studied systems could rise under increase of precipitation rates or, decrease of evaporation rates; both in favour of the contribution of inflows to the lakes. Lake mineralization increases would be, in this region, linked to wet climatic conditions at YD and LGM whereas opposite interpretations are usually considered
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Personnic, Sébastien. "Dynamique des communautés microbiennes et impacts des virus sur les bactéries auto- et hétérotrophes en milieu lacustre." Chambéry, 2007. http://www.theses.fr/2007CHAMS023.
Full textAbstract:
L'analyse écosystémique pluriannuelle menée dans les eaux de surface des lacs Léman, du Bourget et d'Annecy nous a permis d'étudier la dynamique des particules virales et des communautés procaryotiques (bactéries hétérotrophes et picocyanobactéries). Ce suivi, opéré de juillet 2002 à décembre 2006 dans la strate 0-50 m a permis de mettre en évidence (I) une forte reproductibilité interannuelle des dynamiques bactériennes, picocyanobactériennes et virales (II), l’importance du forçage saisonnier (i. E. La température) et de la prfondeur (épi- vs hypolimnion) (III) des abondances et des dynamiques sensiblement différentes entre les lacs mésotrophes (Léman et Bourget) et le lac d’Annecy, oligotrophe et enfin (IV) la faible part explicative prise par les variables biotiques, à l’échelle pluriannuelle dans la dynamique des communautés microbiennes. Une seconde approche, basée sur des expériences de dilution, a été utilisée afin de quantifier la régulation exercée par les virus et les prédateurs flagellés (< 10 µm) sur la mortalité procaryotique, entre 2005 et 2006. Aucun processus de mortalité n’était détecté en période hivernale, alors que cette régulation atteignait plus de 71 % dans l’explication de la mortalité des bactéries hétérotrophes, dans le lac Léman, en été. En automne, la lyse virale et la prédation expliquaient 42 et 18 % de la mortalité des bactéries hétérotrophes dans le lac Léman et du Bourget respectivement. Pour les les picocyanobactéries, les virus expliquaient à eux seuls 9,8 % et 7,6 % de la mortalité dans les deux lacs mésotrophes, contribuant probablement à la terminaison du bloom automnal des picocyanobactéries. En revanche, dans le lac oligotrophe d’Annecy les virus et les prédateurs ne semblaient pas jouer un rôle majeur dans le contrôle de l’abondance des communautés bactériennes. Les résultats obtenus au cours de ces travaux ont donc permis de préciser le rôle régulateur très variable mais, potentiellement très important exercé par les virus dans le contrôle de l’abondance procaryotique. Ce travail a également permis de souligner la nécessité de progresser dans la connaissance des différentes stratégies virales et des facteurs influençant la mise ne place de ces stratégies<br>A pluri-annual study was conducted, from July 2002 to December 2006, in the three peri-alpine lakes : Annecy, Bourget and Geneva. It allowed us to observe spatial and temporal variations for the abundances of viruses, auto- and heterotrophic bacteria, flagellates, ciliates and small-pigmented eukaryotes between 0 and 50 m depth. We could observe that (I) the dynamics of these micro organisms was relatively well reproducible from one year to the other (II) abiotic parameters (e. G. Temperature) and water column layers (i. E. Epi- vs. Hypolimnion) were significantly involved in the variability of microorganism abundance (III) some differences were observed according to the trophic status of lakes (the mesotrophic Geneva and Bourget vs. The oligotrophic lake Annecy), (IV) at a pluri-annual scale, the variation of abundance of grazers and viruses explained only a low fraction of bacterial abundance variability. A second approach (based on a modified dilution method) was used to quantify simultaneously the impact of viruses and flagellated predators (< 10 µm) as mortality agents of heterotrophic bacteria and picocyanobacteria. Lysis and predation pressure exerted on heterotrophic bacteria was undetectable in winter, whereas in summer they could be responsible for up to 71 % of the heterotrophic bacterial mortality in Lake Geneva. Also, in autumn, lysis and predation reached 42 and 18 % in Lake Geneva and Bourget, respectively. At the same period, viruses could explain 9,8 % and 7,6 % of the picocyanobacterial mortality in the two mesotrophic lakes, suggesting that they could play a key role in fall bloom termination. In contrast, for the oligotrophic Lake Annecy, viruses and predators did not seem to impact strongly and thus control bacterial community abundance. All together, the results obtained during this PhD work allowed us to verify and specify the variability and potential importance of viruses and predators to regulate the procaryotic abundance in large peri-alpine lakes. This work also highlighted the necessity to go further in the knowledge of the different viral life strategies and determine which factors are involved in the control of these strategies
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Caranhac, Fanny. "Modélisation de la dynamique de populations piscicoles exploitées intégrant la variabilité individuelle de croissance : application aux corégones (Coregonus lavaretus) du lac d'Annecy." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10046.
Full textAbstract:
Les coregones du lac d'annecy, caracterises par une forte variabilite individuelle de croissance, sont exploites par des pecheurs amateurs et professionnels utilisant des engins de peche ayant une selectivite, suivant la longueur des poissons, differente. Cette double exploitation confronte les gestionnaires aux problemes de partage de la ressource. L'objectif de cette these est de modeliser la dynamique de cette population exploitee afin de pouvoir simuler differents scenarios de gestion. Un modele matriciel base sur l'age et sur la longueur des poissons, integrant la variabilite individuelle de croissance avec un pas de temps de 1 mois, est realise afin de representer precisement les differences de selectivite des engins de peche. Plusieurs modeles de croissance ont ete compares. Finalement, un modele calculant des matrices de croissance a partir de simulations individus-centrees a ete retenu. Il permet de modeliser la deformation progressive de la repartition en longueur d'une cohorte due a une mortalite selective. Les parametres de croissance du modele sont estimes a partir des longueurs retrocalculees sur les ecailles des captures 5+ de la peche professionnelle. Un modele individus-centre a ete elabore afin de verifier l'absence de biais, dans ces estimations, lie a l'echantillonnage. La mortalite naturelle est determinee a partir d'une equation empirique. Les estimations des mortalites par peche proviennent de l'analyse des cohortes suivant la longueur. Des simulations de scenarios de gestion ont ete effectuees selon le principe de l'analyse des rendements par recrue. Une analyse de sensibilite a montre que les resultats etaient essentiellement sensibles a la longueur asymptotique moyenne et la mortalite naturelle. Finalement, la generalisation a un modele multi-cohortes a permis de montrer que la part des captures ponderales des professionnels, avec la gestion actuelle, varie entre 44% et 66% lorsque la force des cohortes fluctue d'un facteur 1 a 5.
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Munyandorero, Joseph. "La pêche dans les lacs du parc national de l'Akagera : biologie de Clarias gariepinus et exploitation des stocks dans le lac Ihema." Toulouse, INPT, 1993. http://www.theses.fr/1993INPT021A.
Full textAbstract:
Depuis aout 1980, l'entreprise pecherie du lac ihema a ete creee pour organiser et gerer les activites de peche dans les lacs du parc national de l'akagera. La peche a ete d'abord developpee dans le lac ihema de 1980 a 1984, puis aussi dans les autres lacs du parc. Les variations des captures, de sa production en valeur financiere, des efforts de peche nominal et effectif et des p. U. E. * ont ete analysees. La part prise dans la production par les lacs du parc autres que le lac ihema est devenue importante depuis 1988. C. Gariepinus, une des especes exploitees dans le lac ihema, a fait l'objet d'une etude de la reproduction, de la fecondite, de la croissance et de l'estimation des parametres demographiques. Les modeles generalises de production ont ete proposes pour la gestion des stocks des tilapia spp. Et c. Gariepinus dans le lac ihema: le diagnostic est celui d'une surexploitation. Pour la peche des tilapia spp. , il faudrait reduire l'effort actuel de 55%; pour la peche de c. Gariepinus, il conviendrait d'encourager sa peche car ses p. U. E. Ne sont pas un indice representatif de son abondance. Un modele de fonctionnement de l'ecosysteme du lac ihema a ete aussi propose: il prevoit la diminution des biomasses des taxons precedents si l'effort augmente; cette augmentation de l'effort n'aurait pas de consequences importantes sur la biomasse des autres compartiments
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Vinçon-Leite, Brigitte. "Contribution de la modelisation mathematique a l'etude de la qualite de l'eau dans les lacs sub-alpins : le lac du bourget (savoie)." Marne-la-vallée, ENPC, 1991. http://www.theses.fr/1991ENPC9122.
Full textAbstract:
Cette these se situe a l'interface entre trois domaines: la limnologie, la modelisation mathematique, la gestion des milieux aquatiques naturels et poursuit les objectifs suivants: (1) mettre en evidence les principaux mecanismes physiques, chimiques et biologiques survenant dans les lacs sub-alpins profonds et influant sur la qualite de l'eau, (2) obtenir une representation formelle coherente de l'interaction de ces mecanismes par l'intermediaire d'un modele mathematique, (3) verifier, notamment en conditions non-stationnaires, les principales hypotheses sur lesquelles se base le modele afin de permettre son utilisation ulterieure pour la gestion. Le site choisi est celui du lac du bourget (savoie) dont l'eutrophisation a ete enrayee en 1980 par la mise en service d'ouvrages d'interception des eaux usees des principales agglomerations riveraines. Les apports au lac en azote et phosphore total ont ete reduits respectivement de 70 et 50% entrainant une modification sensible de l'equilibre trophique du lac. La demarche suivie presente deux volets complementaires: (1) une campagne de mesures in situ destinee a apprehender le fonctionnement actuel du lac et a caracteriser son evolution depuis 1980; (2) le developpement d'un modele mathematique deterministe. La validation du modele a ete realisee sur une periode particulierement longue (9 annees de 1981 a 1989). Sur le plan de la comprehension de l'ecosysteme, la modelisation du lac du bourget a egalement permis de mettre en evidence tres clairement certains aspects importants du fonctionnement du lac, jusqu'a present meconnus sur ce site
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Stroffek, Stéphane. "Les transferts verticaux de matière et leur modification par les bactéries hétérotrophes fixées sur particules en sédimentation dans les eaux de surface de deux grands lacs alpins (lac Léman, lac du Bourget, France)." Lyon 1, 1990. http://www.theses.fr/1990LYO10221.
Full textAbstract:
Les variations des flux de sedimentation dans les eaux de surface et l'impact des bacteries heterotrophes fixees sur les particules en sedimentation dans le controle des flux ont ete etudies dans le lac leman et le lac du bourget (france). Les flux de sedimentation, compris entre 3 et 8 g de matiere seche/m#2/j selon la profondeur, ont ete estimes a l'aide de trappes. La fraction organique est de 20 dans le leman et de 12% dans le bourget. Les rapports c/n augmentent avec la profondeur et les particules s'enrichissent en phosphore total. Les flux de chlorophylles sont forts au printemps, les pigments etant alors largement degrades. Le carbone organique particulaire (cop) quittant la zone trophogene par sedimentation par jour ne represente que 5 a 6 des stocks de cop en suspension, pour atteindre 1% a l'approche du fond. Les flux verticaux augmentent avec la profondeur, particulierement au printemps ceci impliquant l'intervention de processus actifs et discontinus le long de la colonne d'eau pour alimenter la sedimentation. La degradation des particules par les bacteries est la plus rapide dans les 10 premiers metres, la ou les bacteries peuvent mineraliser en moyenne 19 et 16% des flux de cop en sedimentation dans le leman et le bourget. Cette mineralisation tombe a 16% et 7% a partir de 20 et 30 m. La valeur de l'efficience de croissance des bacteries est discutee. La composition des particules est favorable a la mineralisation nette du materiel organique. Au niveau de la thermocline, le minimum d'oxygene n'est pas imputable a l'activite bacterienne. Sauf peut etre pour le phosphore, celle-ci ne controle pas seule la sedimentation