Dissertations / Theses on the topic 'Invertébrés d'eau douce – Habitat'
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Moreau, Axelle. "Relation entre les invertébrés d’eau douce et le Canard souchet Spatula clypeata en halte prénuptiale dans deux zones humides de Vendée (France)." Electronic Thesis or Diss., La Rochelle, 2023. http://www.theses.fr/2023LAROS004.
Full textAbstract:
« Reproducteur sur revenu », le Canard souchet Spatula clypeata réalise plusieurs haltes migratoires entre son site d’hivernage et de reproduction afin de reconstituer ses réserves et d’achever sa migration prénuptiale. Les invertébrés d’eau douce constituent les principales proies du Canard souchet et sont capturés principalement par filtration. Ce projet de recherche s’est articulé autour de trois grands axes qui étaient : (1) de comprendre l'abondance, la diversité et l'habitat des invertébrés d'eau douce dans deux zones humides réputées pour leur abondance élevée en Canard souchet, le Marais breton et le Marais poitevin ; (2) d'étudier les caractéristiques environnementales et nutritives des habitats utilisés par le Canard souchet en halte prénuptiale ; (3) de définir des mesures de gestion de l’habitat en faveur de l’ensemble des cortèges d’espèces étudiées. Cette étude a montré que les plans d’eau étudiés étaient abondants en invertébrés d’eau douce. L'étude a permis de définir quatre typologies d’habitat en fonction des variables environnementales et de la présence de certains taxons clés d'invertébrés. En halte migratoire, le Canard souchet utilisait différents habitats en suivant un rythme nycthéméral. Les sites diurnes étaient des habitats profonds, peu végétalisés et dominés par les microcrustacés, tandis que les sites nocturnes étaient des habitats peu profonds, végétalisés et présentant une grande diversité taxonomique en invertébrés. La taille des domaines vitaux ne différait pas entre les deux zones humides, entre les sexes ou entre les classes d'âge (juvéniles et adultes). Enfin, cette étude a révélé qu’en halte prénuptiale, le Canard souchet se nourrissait principalement de Cladocera, Copepoda, larves de Chironomidae, Pleidae et de Matière Organique Particulaire. Les résultats de ce travail pourront aider à définir des mesures de gestion et de conservation de l’habitat en faveur de l’ensemble des cortèges d’espèces étudiées"Income breeder", the Northern shoveler Spatula clypeata makes several stopovers between its wintering and breeding site in order to replenish its reserves and complete its pre-breeding migration. Freshwater invertebrates are the main prey of the Northern shoveler and are captured mainly by filtration. This research project had three main objectives: (1) to understand the abundance, diversity, and habitat of freshwater invertebrates in two wetlands known for their high abundance of Northern shoveler, the Marais breton, and the Marais poitevin; (2) to study the environmental and nutrient characteristics of the habitats used by the Northern shoveler during its prenuptial stopover; (3) to define habitat management measures in favour of all of the species groups studied. This study showed that the ponds studied were abundant in freshwater invertebrates. The study defined four habitat typologies based on environmental variables and the presence of some key invertebrate taxa. During migratory stopover, the Northern shoveler used different habitats with a nychthemeral rhythm. Daytime sites were deep and sparsely vegetated habitats dominated by microcrustaceans, while nighttime sites were shallow and vegetated habitats with high invertebrate taxonomic diversity. Home range sizes did not differ between the two wetlands, between sexes or between age classes (juveniles and adults). Finally, this study revealed that during the prenuptial stopover, the Northern shoveler fed mainly on Cladocera, Copepoda, Chironomidae larvae, Pleidae and Particulate Organic Matter. The results of this work could help to define management and habitat conservation measures for all the species studied
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Trouilhé, Marie-Cécile. "Etude biotique et abiotique de l'habitat préférentiel de l'écrevisse à pattes blanches (Austropotamobius pallipes) dans l'ouest de la France : implications pour sa gestion et sa conservation." Poitiers, 2006. http://www.theses.fr/2006POIT2289.
Full textAbstract:
De novembre 2002 à décembre 2005, l'habitat préférentiel de l'écrevisse indigène à pattes blanches (Austropotamobius pallipes) a été défini dans le " pays de Gâtine " (Deux-Sèvres, France). Pour cette étude, huit cours d'eau, répartis dans quatre bassins hydrographiques différents, ont été sélectionnés. Sur chaque ruisseau, deux points de prélèvement ont été choisis : le premier, le plus en amont, était situé au niveau de la population d'A. Pallipes et le second, 2 à 3 km en aval, était dépourvu d'écrevisse à pattes blanches. Vingt-trois paramètres physico-chimiques, concernant les composantes minérale et organique de l'eau, ont été très régulièrement mesurés et quatre prélèvements de la faune de macroinvertébrés benthiques ont été réalisés. Ce suivi a permis d'acquérir une importante base de données pour caractériser les tolérances d'A. Pallipes vis-à-vis de certains paramètres ce qui nous a conduit à discuter son statut de bioindicateur de la qualité des eaux. L'utilisation d'analyses multivariées (Analyse en Composantes Principales majoritairement) a montré (i) que la matière organique serait un des facteurs discriminants dans la présence/absence d'A. Pallipes et (ii) que, précisément, la présence d'A. Pallipes est associée à celle de familles de macroinvertébrés les plus sensibles aux pollutions organiques. L'ACP a aussi permis de réduire considérablement le nombre de paramètres abiotiques et biotiques informatifs. De plus, l'utilisation de ces paramètres sélectionnés pour modéliser par Réseaux de Neurones Artificiels (RNA) la présence/absence d'A. Pallipes a fourni des résultats satisfaisants et prometteurs en terme de gestion et de conservation de cette espèce menacéeFrom November 2002 to December 2005, the preferential habitat of the indigenous white-clawed crayfish (Austropotamobius pallipes) was determined in the “Pays de Gâtine” (Deux-Sèvres, France). For this study, eight brooks, from four different catchments, were selected. Two sampling sites were monitored per brook; the first being where the population was present and the second 2 to 3 km downstream of the population. Twenty-three physico-chemical parameters, concerning both mineral and organic water components, were regularly measured as well as four samplings of benthic macroinvertebrate fauna. This study made it possible to build up a large data base characterizing the tolerance levels of A. Pallipes with respect to certain parameters, which led us to discuss its status as a bioindicator of water quality. The use of multivariate analysis (mainly Principal Component Analysis) showed (i) that organic matter seems to discriminate A. Pallipes presence/absence and (ii) that A. Pallipes presence is closely associated with the occurrence of some families of macroinvertebrates which are very sensitive to organic pollution. PCA also permitted us to considerably reduce the number of abiotic and biotic parameters considered. In addition, the use of these selected parameters to model A. Pallipes presence/absence with Artificial Neural Networks (ANN) showed interesting and promising results for the management and the conservation of this threatened species
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Doledec, Sylvain. "Les peuplements de macroinvertébrés benthiques du cours inférieur de l'Ardèche : dynamique spatio-temporelle." Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO19003.
Full textAbstract:
Principales caracteristiques physico-chimiques des eaux de l'ardeche et leurs variations saisonnieres. Nature des peuplements de macroinvertebres benthiques, succession temporelle, distribution spatiale des organismes
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Tabacchi, Eric. "Variabilité des peuplements riverains de l'Adour. Influence de la dynamique fluviale à differentes échelles d'espace et de temps." Toulouse 3, 1992. http://www.theses.fr/1992TOU30002.
Full textAbstract:
Les mecanismes d'occupation des interfaces terre/eau de deux stations de l'adour par les organismes ont ete etudies a diverses echelles de temps et d'espace. La vegetation a decrit la dynamique du corridor riverain, la faune interstitielle, la dynamique de colonisation de la zone de marnage d'une graviere. L'impact des crues catastrophiques sur la structure du corridor vegetal de bernede sur 40 ans est moindre que celui des crues mineures. L'evolution globale du paysage est reguliere alors qu'une forte heterogeneite apparait a l'echelle locale, suggerant un controle par des niveaux hierarchiques inferieurs. La richesse de la mosaique resultante (702 especes, 45 communautes) est renforcee par les relations de proximite. Sous le controle de la dynamique fluviale, la distribution des especes s'organise selon l'evolution de series et l'hygrometrie locale. Vulnerables aux invasions, les interfaces terre/eau participent a la restauration des milieux perturbes et a l'orientation des series evolutives et controlent les transferts d'organismes entre milieux voisins. Les especes en place montrent une forte plasticite dans leur strategie de colonisation. Leur reponse rapide aux changements interannuels en font des marqueurs des modifications hydroclimatiques. La forte heterogeneite du peuplement animal interstitiel d'aureillan induit une richesse exceptionnelle (480 especes sur une saison) qui exprime la vigueur des migrations entre milieux adjacents etudiees entre +20 et 80 cm dans le substrat. Participent aussi a la mise en place de strategies migratoires variees: cycles biologiques, competitions inter-et intraspecifique, capacites physiologiques, sous la dependance des probabilites de realisations des evenements contraignants. Les processus hydrologiques sont largement impliques dans la structuration, la dynamique et les echanges des peuplements riverains. Periodiques ou stochastiques, ils contribuent a diversifier les strategies d'occupation de l'espace depuis l'element de paysage jusqu'a l'individu
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Maasri, Alain. "Impact de l'enrichissement des eaux sur le peuplement d'invertébrés benthiques : approche multi-échelles des relations trophiques structurant la communauté de chironomidae (diptera : nematocera) rhéophiles." Aix-Marseille 3, 2007. http://www.theses.fr/2007AIX30031.
Full textAbstract:
L'étude des biocénoses aquatiques de l'Arc, rivière méditerranéenne soumise à de forts taux d'enrichissement, a permis de qualifier l'impact que peut avoir ce dernier sur la structure et le fonctionnement trophique de tels écosystèmes. Les communautés d'algues, de l'ensemble des macroinvertébrés benthiques et de Chironomidae ont été étudiées à différentes échelles spatiales. Une première étude des macroinvertébrés à l'échelle du bassin versant a permis d'évaluer le potentiel des affluents dans la préservation de la biodiversité des macroinvertébrés. Ensuite, une étude menée sur les exuvies de Chironomidae le long d'un gradient d'enrichissement a montré l'effet de l'enrichissement sur la structure taxinomique et trophique des communautés de Chironomidae. Plus localement, l'étude de l'assemblage de Chironomidae rhéophiles et de l'épilithon a permis de mettre en relation les changements survenus au niveau de l'assemblage d'algues avec les changements au niveau des communautés larvaires de Chironomidae racleurs. En dernier, l'étude du régime alimentaire d'Eukiefferiella claripennis (taxon dominant dans cette étude) a apporté des informations complémentaires sur le comportement alimentaire d'un taxon opportuniste. Ainsi, le couplage de toutes ces approches a permis de construire la cascade d'impacts de l'enrichissement sur les réseaux trophiques, depuis les producteurs autotrophes jusqu'aux communautés d'invertébrés benthiquesThe aquatic biocenoses of the Arc stream, a coastal Mediterranean stream, were investigated to assess the impact of the water enrichment on the communities'trophic and taxonomic structures. The benthic macroinvertebrates communities, the chironomid communities and the epilithon were studied for this purpose. At first, the acroinvertebrates communities were studied in the main stem and in different pristine tributaries to consider the role of these tributaries in the maintenance of the macroinvertebrates biodiversity at the catchment scale. Then the chironomid communities were investigated using the pupal exuviae assemblages to assess changes in the chironomid communities' trophic and taxonomic structures along a water enrichment gradient. At the riffle scale, correlations were found between the epilithic algal structure and the chironomid larvae distribution; and the guts content analysis of Eukiefferiella claripennis revealed the foraging behaviour of such opportunistic taxa and helped to understand how this taxa spread under such conditions. All these approaches allowed us to assemble clues for understanding changes occurring in such enriched streams at different scales, going from the epilithic algae to the whole macroinvertebrate community
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Fruget, Jean-François. "L'aménagement du bas-Rhône : évolution du fleuve et influence sur les peuplements de macroinvertébrés benthiques." Lyon 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LYO10206.
Full textAbstract:
Une revue de l'influence de l'amenagement du bas-rhone, sur les differentes composantes de l'hydrosysteme, de lyon a beaucaire-tarascon, a ete realisee. L'analyse de cartes dressees a differentes epoques et l'examen des paysages fluviaux actuels permettent de retracer leur evolution morphologique et dynamique. L'examen de divers parametres physico-chimiques laisse apparaitre une evolution inverse au cours du temps des apports organiques et mineraux, les premiers diminuant tandis que les seconds augmentent (en particulier les formes de l'azote et les phosphates). L'amenagement a toutefois induit des variations significatives du regime thermique du fleuve, variables selon l'echelle consideree: intra-amenagement, inter-amenagement, intra-ensemble fonctionnel. Les peuplements macrobenthiques du chenal des differentes unites fonctionnelles apparaissent composes d'especes potamo-lenitiques, ainsi que d'especes plus eurytopes et polluotolerantes. Le bas-rhone a ainsi derive vers un type potamique lent a la suite de l'uniformisation des conditions mesologiques des differents briefs, de facon similaire a de nombreux grands cours d'eau medio-europeens en particulier. Les variations de la composition faunistique des differents secteurs revelent des modifications locales, mais pas de maniere suffisante pour mettre en evidence un changement structurel longitudinal de grande ampleur. Ce sont surtout des modifications de proportions des especes qui sont enregistrees. L'etude temporelle d'un amenagement precis a revele l'existence de trois periodes biologiques distinctes
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Compin, Arthur. "Distribution spatiale des invertébrés benthiques du réseau hydrographique Adour-Garonne : modélisation et impact de l'anthropisation." Toulouse 3, 2006. http://thesesups.ups-tlse.fr/3257/.
Full textAbstract:
L'analyse d'un grand nombre de travaux publiés décrivant la biodiversité à une échelle locale nous a permis de recenser 1093 espèces d'invertébrés benthiques provenant de 631 stations d'échantillonnage réparties dans l'ensemble du réseau hydrographique Adour-Garonne (sud-ouest de la France). La distribution spatiale de ces taxa dans le bassin donne lieu à des assemblages d'espèces à partir desquels nous proposons une biotypologie des cours d'eau. Cette classification révèle des différences longitudinales et géographiques de la composition des communautés à l'échelle régionale. Elle rend compte des différentes situations géomorphologiques rencontrées par les cours d'eau et fournit un cadre de référence utile à l'étude écologique comme à la gestion des cours d'eau d'un grand réseau hydrographique. L'eau douce constitue aussi une ressource pour les activités humaines. Les communautés d'invertébrés benthiques sont sensibles aux perturbation des cours d'eau et de leur environnement proche (utilisation des sols) qui modifient les gradients naturels de diversités spécifique et fonctionnelle. La directive européenne adoptée en 2000 définit un cadre pour la gestion, la préservation et la restauration des ressources en eau. Le grand réseau hydrographique y est clairement défini comme l'échelle d'étude adaptée. Ce travail montre qu'à cette échelle, la compréhension des écosystèmes aquatiques s'appuie nécessairement sur l'analyse d'un grand nombre d'études locales. Il souligne également l'intérêt des systèmes d'information géographique pour compiler et organiser les données écologiques et les rendre exploitables au moyen de techniques d'analyse multivariées adaptéesThe analysis of a large number of published works describing biodiversity at local scales allowed us to identify 1093 species of benthic invertebrates from 631 sampling sites in the Adour-Garonne stream system (South-Western France). Macroinvertebrate distribution revealed spatial patterns in species assemblages from which we derived stream classifications. These classifications showed altitudinal and geographic differences in the specific composition of invertebrate communities reflecting the various physiographical situations encountered by streams at a regional scale. They also provide a useful framework for studying and managing streams in large geographic areas. In an economically developed area, water is a useful resource for many human activities. Macroinvertebrate communities are very sensitive to human modifications on streams and the surrounding land. These modifications induce changes in "natural" spatial patterns of specific and functional diversity. The EU Water framework directive adopted in 2000 (2000/60/EC) defines goals for management and protection of European surface waters in the next years. It clearly states that the best model for a single system of water management is management by river basin. Our work suggest that the understanding of aquatic ecosystems at a river basin scale necessarily relies on the analysis of a large number of local studies, the origin of which is generally diverse. It also emphasized the significance of geographic information systems to compile and organize biotic and abiotic data and make them exploitable through adapted multivariate analysis techniques
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Lagauzère, Sandra. "Influence de la bioturbation des macro-invertébrés benthiques sur le comportement biogéochimique de l'uranium au sein des sédiments d'eau douce." Aix-Marseille 2, 2008. http://theses.univ-amu.fr.lama.univ-amu.fr/2008AIX22059.pdf.
Full textAbstract:
Dans les écosystèmes aquatiques continentaux, les sédiments représentent un compartiment d’accumulation pour les polluants métalliques comme l’uranium. Secondairement, ils peuvent également se comporter comme des sources endogènes de contamination, par remise en suspension (e. G. Crues, bioturbation) ou par évolution de la spéciation des métaux, laquelle va également jouer sur leur biodisponibilité. En effet, les composés métalliques peuvent être transformés en composés plus ou moins toxiques ou inertes sous l’effet de modifications des conditions physico-chimiques (pH, conditions rédox, force ionique) et microbiologiques du sédiment. Ces conditions sont elles-mêmes sous le contrôle de l’activité des macro-invertébrés benthiques via les processus de bioturbation. L’objectif principal de ce doctorat a été de déterminer l’influence de la bioturbation de deux espèces de macro-invertébrés benthiques (Chironomus riparius et Tubifex tubifex) sur la répartition et les transferts de l’uranium dans le sédiment des écosystèmes aquatiques continentaux. Pour cela, des expériences en laboratoire avec des dispositifs de type microcosmes, ont été réalisées pour (i) évaluer les effets de l’uranium sur les macro-invertébrés benthiques, plus particulièrement sur leur activité de bioturbation, (ii) déterminer l’influence de ces organismes sur le comportement de l’uranium grâce à des mesures physico-chimiques à haute résolution (e. G. Optodes à oxygène, gels DET), et (iii) appréhender les conséquences de ces interactions sur un organisme de la colonne d’eau, Xenopus laevis, via des mesures de génotoxicité (essai micronoyaux) et de biomarqueurs moléculaires (taux d'expression d'un certain nombre de gènes codant pour des protéines induites lors de stress environnementaux). Les principaux résultats obtenus montrent que l’intensité de la bioturbation des macro-invertébrés peut être diminuée dans un sédiment contaminé par de l’uranium, mais que les espèces étudiées dans cette étude présentent une bonne tolérance. Pour des concentrations en uranium élevées (>100 fois le bruit de fond géochimique naturel), les vers T. Tubifex sont capables de maintenir une activité de bioturbation suffisante pour entraîner une forte remobilisation de l’uranium initialement associé au sédiment vers la colonne d’eau. Ceci représente donc un risque potentiel pour le reste de la biocénose aquatique. Cependant, en voulant tester cette hypothèse, il a été constaté de façon surprenante que le comportement des vers pouvait être modifié en présence d’un autre organisme dans la colonne d’eau et qu’ainsi il n’entraînait plus de relargage d’uranium vers la colonne. Toutefois, l’uranium associé au sédiment, sans l’effet de la bioturbation, induit des effets négatifs sur cet organisme. Au final, ce travail de thèse a permis de décrire les interactions pouvant exister entre les organismes aquatiques, la biogéochimie du sédiment et un polluant métallique comme l’uranium. Les informations apportées sont originales et permettent d’envisager de façon plus précise les conséquences d’une pollution à l’uranium dans l’environnement aquatique. Plus globalement, les travaux de recherche entrepris dans le cadre de cette thèse contribueront à améliorer les connaissances actuelles en vue d’une meilleure évaluation des risques écologiques des écosystèmes aquatiques contaminés par des polluantsIn freshwater ecosystems, sediments act as an accumulation compartment for metallic pollutants as uranium. Secondary, there can also represent endogenous sources of contamination by resuspension (e. G. Flood, bioturbation) or changes of metal speciation that acts upon their bioavailability. Indeed, metallic compounds can be transformed in more or less toxic or inert compounds through physico-chemical (e. G. PH, redox conditions, ionic force) and microbiological variations. These conditions are themselves under the effects of benthic macro-invertebrate activities via bioturbation processes. The main objective of this PhD was to determinate the influence of two benthic macroinvertebrate species (Chironomus riparius and Tubifex tubifex) on the distribution and the transfers of uranium within freshwater sediments. To reach this goal, laboratory experiments were performed in order to (i) assess the effects of uranium on benthic macroinvertebrates, more particularly on their bioturbation activity, (ii) determine the influence of these organisms on uranium behaviour through high resolution physico-chemical measurements (e. G. Oxygen optodes, DET gel probes), and (iii) estimate the consequences of these interactions on pelagic organisms via genotoxicity measurements (micronuclei assay and molecular biomarkers analysis on Xenopus laevis). The results demonstrate that bioturbation intensity of macroinvertebrates can be affected in uranium-contaminated sediments, but the two species studied in this work show a relative tolerance. For high uranium concentrations (>100 times the geochemical background level), corresponding however to realistic concentrations in highly contaminated sites, T. Tubifex worms are able to maintain a sufficient bioturbation activity that induces a high remobilization of uranium initially associated with sediments to the overlying water (factor 2 to 10). That represents therefore a potential risk for the remaining aquatic biocenosis. However, by testing this assumption on X. Laevis, it was surprisingly noticed that the worms’ behaviour can be modified in presence of this organism in the water column. The effect of bioturbation on uranium release from the sediments was thus altered conducing to lower uranium concentrations in the water column. Nevertheless, sediment-associated uranium, without the effect of bioturbation, induces negative effects on this pelagic organism. Finally, this PhD work illustrates the interactions that can exist between aquatic organisms, sediment biogeochemistry and a metallic pollutant as uranium. The novel results obtained permit to view more precisely the consequences of uranium pollution in aquatic environment. More globally, this work will contribute to a better assessment of ecological risks in polluted aquatic ecosystems
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Dedieu, Nicolas. "Mise au point d'un outil d'évaluation de la qualité biologique des petites rivières de Guyane sur la base des invertébrés benthiques." Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/2559/.
Full textAbstract:
La Directive Cadre Européenne sur l'Eau (DCE) a imposé à chaque état membre l'objectif d'obtenir une amélioration de la qualité des eaux de surface, pour d'atteindre le bon état écologique à l'horizon 2015. Cette directive implique non seulement d'évaluer le degré de pollution mais aussi de définir l'état écologique des milieux par rapport à un référentiel (se rapprochant de l'état " naturel "). Cela a conduit à définir une typologie des rivières basées sur les "conditions de référence". Bien que géographiquement éloignés du continent, les DOM font partie intégrante de l'Union européenne et sont soumis aux mêmes objectifs et obligations en termes de politiques environnementales. La Guyane française (GF) est une région d'outre-mer de la France située sur la côte nord-est de l'Amérique du Sud. La forêt primaire guyanaise reste l'une des moins touchés du monde, cependant, les exploitations aurifères et sylvicoles ont de fortes répercussions sur les milieux aquatiques. Les petits cours d'eau (profondeur inférieur à 1 m et da largeur inférieur à 10 m) représentent 70-80% du réseau hydrographique de la GF. La plupart des petits cours d'eau sont situés dans les zones boisées et présentent haute qualité écologique et certains, sinon la plupart d'entre eux, n'ont jamais été touchés par une activité humaine. L'objectif principal de cette thèse était de concevoir un indice capable d'évaluer la qualité écologique des petits cours d'eau de la GF. Nous avons d'abord analysé l'effet des perturbations humaines sur la qualité physicochimique des écosystèmes. Puis, nous avons établi la première typologie de la structure des communautés benthiques en fonction des conditions environnementales. L'identification de ces sous-régions écologique et des conditions de références nous a permis de construire un indice multimétrique. Enfin, une approche fonctionnelle basée sur les Ephémères a été utilisée afin de fournir de nouvelles informations sur l'écologie de cet ordre. Nous avons démontré que les variables physiques relatives au fond des cours d'eau et les matières en suspension différencient les sites orpaillés, tandis que les concentrations en nutriments ne sont pas significativement modifiées par les impacts humains. La biotypologie a montré que les sites caractérisés par des communautés d'invertébrés sont regroupées en deux sous-régions principales: la plaine alluviale côtière et le plateau des Guyanes. Les changements dans la composition de la communauté, et à un degré moindre la richesse taxonomique au sein de chaque sousrégion ont révélé des impacts écologiques liés à l'exploitation aurifère et forestière. Parmi les mesures décrivant la structure des communautés (métriques) calculées à partir des deux sous-ensembles de sites de références et impactés, nous avons sélectionné les paramètres présentant le meilleur compromis entre forte efficacité de la discrimination, faible spécificité, faible redondance et une grande stabilité dans les conditions de référence. L'IBMG est composé de deux métriques taxonomiques de richesse, deux métriques basées sur l'abondance, une métrique relative au trait biologique et un indice de diversité. Les résultats sur les communautés d'Ephémère ont mis en évidence le rôle important de cet ordre pour la bioévaluation de petits cours d'eau soumis à l'exploitation aurifère. Des recherches futures fondamentales sur la taxonomie et l'écologie de cet ordre pourront permettre d'améliorer l'outil d'évaluation biologique actuel. Enfin, ce travail à souligné le fait que les petites masses d'eaux de tête de bassin de Guyane abritent potentiellement une faune riche et spécifiqueThe European Water Framework Directive (WFD) aims to achieve a rapid improvement of the water quality, in each member state, and to achieve good ecological status of rivers by 2015. This new directive implies not only to assess the degree of pollution but also to define an ecological state of the environment in relation to a reference condition. This has prompted a large amount of works which yielded characterizations of both reference physical-chemical environments and biological communities in continental Europe, as well as practical tools (e. G. , biological indices) to evaluate water quality. Although geographically distant the continent, DOMs are an integral part of the European Union and are subject to the same objectives and obligations in terms of environmental policies. French Guiana (FG) is an overseas region of France located on the north-eastern coast of South America. The Guianese primary forest remains one of the least impacted of the World, however, gold mining and timber have strong localized impacts upon river ecosystems. Small streams (from headwaters to rivers with depth inferior to 1 meter and width inferior to10 meters) represent 70-80% of all running waters in FG. Most small streams are located in forested areas and exhibit high ecological quality; some if not most of them have never been impacted by any human activity. The main objective of this thesis was to design a biotic index to assess the ecological quality of small streams of FG. We first analysed the effects of disturbance on the physical-chemical quality of ecosystems. Then, we brought out the first typology of community structure in relation to environmental conditions. The identification of the sub-ecological regions and the references conditions allowed us to build a first multi-metric. Finally, a functional approach based on Ephemeroptera was used in order to provide new information on the ecology of this important order of macroinvertebrates. We first demonstrated that physical variables describing the river bottom, and suspended solids discriminate gold-mined from reference sites, while, whatever the type of impact encountered, nutrient concentrations do not prove relevant to measure human impacts. The bio-typology showed that sites characterized by invertebrate communities clustered into two major subsets: the coastal alluvial plain and the Guiana Shield. Changes in community composition, and to a lesser extent taxonomic richness within each sub region revealed ecological impacts of gold mining and logging. Among the biological metrics calculated from the hydro-ecoregions subsets of reference and impaired sites, we selected metrics exhibiting the best trade-off between high discrimination efficiency, low specificity, low redundancy and high stability under reference conditions. The IBMG is composed of two taxonomic richness-based metrics, two abundance-based metrics, one trait-related metric and a diversity index. Results on Ephemeroptera communities put in light the important role of this order for the bio-evaluation of small streams submitted to gold-mining. Future fundamental research on the ecology and the taxonomy of this order should thus improve the current bioassessment tool. Finally, this work highlighted the fact that headwater stream small of FG potentially harbor a rich and specific fauna
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Capra, Hervé. "Amélioration des modèles prédictifs d'habitat de la truite Fario : échelles d'échantillonnage : intégration des chroniques hydrologiques." Lyon 1, 1995. http://www.theses.fr/1995LYO10306.
Full textAbstract:
Notre objectif, en vue d'accroître la pertinence des simulations des relations habitat/poisson, était : de mettre au point un nouveau type de modèle biologique ; de corréler la variabilité temporelle de l'habitat et la dynamique des populations de poisson. Modélisation des relations habitat-truite à l'échelle locale. Nous avons choisi d'échantillonner l'ambiance hydraulique utilisée par un ou plusieurs poissons pour réaliser une fonction vitale. Cette nouvelle échelle spatiale, l'ambiance, est intermédiaire entre le micro habitat et le facies morphodynamique dans la hiérarchie des échelles d'habitat. 1 le protocole d'échantillonnage par ambiance fournit des données dont la représentativité est aussi bonne que les méthodes les mieux adaptées pour l'échantillonnage des conditions physiques (mesures aléatoires) ou des populations de truite (pêche avec plusieurs passages successifs). 2 en ce qui concerne le pouvoir prédictif, il s'est avère que l'analyse multivariée des données obtenues par ambiance était la méthode la mieux transférable d'un site a l'autre. Une analyse plus poussée a démontré qu'une régression multiple avec conservation de la variabilité des paramètres physiques mesures permettait une prédiction stable et robuste de la densité de truite par ambiance. Prise en compte de la dimension temporelle de l'habitat. L'objectif principal de cette étude était de rechercher les phases limitantes de l'habitat physique pour différents stades de développement de la truite. Il résulte en fait de la nécessite de passer de prédictions statiques à des prédictions dynamiques de la capacité d'accueil d'un cours d'eau, en leur insufflant une dimension temporelle, pour rechercher des corrélations entre des variations de l'habitat disponible et la dynamique des populations de poisson. 1 l'outil principal développé permet d'extraire d'une chronique d'habitat des durées continues (en jour) pendant lesquelles la quantité d'habitat favorable disponible dans le cours d'eau est inférieure à un seuil défini empiriquement. De ce fait, ces durées ont été baptisées: durées continues d'habitat limitant (DCHL). 2 des DCHL longues (> 50 jours) pendant les étiages estivaux limitent l'effectif des truites adultes, et que des conditions d'habitat défavorables pendant la période de post-émergence limitent l'effectif des jeunes de l'année. Ces deux stades de développement et par conséquent les deux périodes correspondantes du cycle de développement sont les plus sensibles aux conditions d'habitat défavorables. Cette étude permet d'ajouter à la définition de seuils de débit, des durées relatives à ces seuils, qui déterminent la structure des populations de truite. De plus les périodes les plus sensibles du cycle de développement étant distinctes dans le temps, la notion de régime réserve devrait maintenant se substituer à celle de débit réserve. Dans cette optique, l'étude de cours d'eau de référence apparaît incontournable pour pouvoir mesurer l'impact réel d'une dégradation du milieu, car ils représentent des situations repères correspondant aux potentialités intrinsèques des différents types de milieu
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Gayet, Guillaume. "Colonisation d'un écosystème d'eau douce hétérogène, par un oiseau d'eau herbivore : le cygne tuberculé (Cygnus olor) dans les étangs piscicoles de Dombes." Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20119.
Full textAbstract:
Dans certains cas, la colonisation des zones humides par les espèces animales et végétales peut être une menace majeure pour la biodiversité. Il est donc primordial de mieux connaître l'écologie des espèces colonisatrices pour définir leurs relations avec le reste de l'écosystème. Nous avons étudié les conséquences de la colonisation relativement récente des étangs piscicoles français par le cygne tuberculé (Cygnus olor). Nous nous sommes intéressés à l'expression de cette colonisation dans l'espace par l'étude des processus de sélection de l'habitat. Nos résultats montrent que dans un paysage d'étangs, la répartition des cygnes tuberculés dépend à la fois de la configuration spatiale des étangs (aire isolement), des ressources disponibles et du statut de reproduction des cygnes tuberculés. Nous avons ensuite étudié les interactions entre le cygne tuberculé et les communautés animales et végétales des étangs. Sur les sites de cantonnement des couples, nous n'avons pas montré d'effet de la présence des cygnes tuberculés sur l'abondance des oiseaux d'eau, et aucune forme d'exclusion spatiale à l'échelle de l'étang. En revanche, les cygnes tuberculés peuvent générer une déplétion significative des herbiers de macrophytes aquatiques, suggérant des effets en cascade sur les autres communautés des étangs piscicoles. Comme toute perturbation générée par une espèce colonisatrice, celle associée à l'arrivée des cygnes doit néanmoins être replacée dans le contexte plus large des régimes de perturbations à l'oeuvre sur l'écosystème, ce qui importe particulièrement dans le cas d'écosystèmes aussi dépendants de l'activité humaine que les étangs piscicolesIn some cases, wetland colonization by animals and plants may be a major threat to biodiversity. It is therefore crucial to better understand the ecology of colonizing species to assess their relationships with the other elements of ecosystems. We studied the consequences of the relatively recent colonization of French fishponds by mute swan (Cygnus olor). We especially considered how such colonization now translates into space, through the analysis of habitat selection processes. Our results show that swan distribution within a fishpond landscape depends on fishpond spatial configuration (area isolation), available resources as well as mute swan breeding status. We then analysed the relationships between mute swan and fishpond animal and plant communities. Where swan pair settle, we do not demonstrate any effect of swan presence on the abundance of other waterbirds, nor any spatial exclusion within fishponds. Conversely, mute swans can signif icantly deplete aquatic macrophyte beds, suggesting cascade effects on other fishpond communities are possible. Like any perturbation caused by a colonizing species, that associated with swan arrival however has to be considered in the broader context of perturbation regimes onto the ecosystem. This is especially crucial in ecosystems like fishponds, that are so much dependent upon human activity
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Devantery, Paul. "Action des courants sur la faune d'une mousse immergée : Platyhypnidium riparioides (Bryophyta)." Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO10012.
Full text
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Charvet, Stéphane. "Intégration des acquis théoriques récents dans le diagnostic de la qualité écologique des cours d'eau à l'aide des bioindicateurs invertébrés." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10069.
Full textAbstract:
Depuis longtemps les organismes aquatiques ont ete utilises afin d'evaluer l'etat de sante des hydrosystemes. Toutefois les indices biologiques classiques ne permettent pas de diagnostiquer les types de pollution, et integrent mal les variations naturelles, temporelles ou spatiales, des communautes. Le but de cette these est donc d'utiliser les traits biologiques des organismes afin de tester leur pertinence dans un diagnostic de qualite ecologique. Ce document presente la base de donnees invertebres qui a toujours servi de support de travail pour toutes nos interrogations. Cette base de donnees permet de stocker et d'interroger des dizaines de milliers de donnees reparties sur un tiers du territoire national. Elle constitue un outil indispensable. Le document decrit ensuite le premier test des traits biologiques sur un cas concret de pollution par effluent de station d'epuration. Cette etude a montre que les traits biologiques etaient robustes face a la variabilite saisonniere des communautes et face a l'effort d'echantillonnage, et que parallelement ils etaient tres sensibles au facteur pollution. De plus la discrimination des sites etait meilleure que celle donnee par l'analyse des abondances taxonomiques seules. La confirmation de cette sensibilite nous a ensuite conduit a rechercher les structures fonctionnelles de reference pour des stations exemptes de pollution. Ainsi, l'etude de 124 echantillons repartis sur la france a montre que presque tous les traits biologiques et ecologiques etaient stables face a la variabilite spatiale naturelle des communautes. Ceci nous a permis d'obtenir des distributions frequentielles de reference pour l'ensemble des traits. Enfin, nous avons applique les traits biologiques et ecologiques a des stations polluees, et nous avons compare les resultats obtenus aux stations de reference precedentes. Ceci a demontre que les traits biologiques etaient capables de separer entre eux les grands types de pollution. Donc, les traits biologiques representent un outil extremement interessant pour la bioindication qui est a la fois robuste temporellement et spatialement, et sensible aux pollutions. C'est un outil general relie a des concepts theoriques qui est tres largement applicable, et ceci bien au-dela de nos frontieres.
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Bady, Pierre. "Modélisation de la relation entre la variabilité de l'habitat et la diversité fonctionnelle : application aux peuplements de macroinvertébrés des grands cours d'eau européens." Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10053.
Full textAbstract:
Ce travail concerne l'organisation fonctionnelle des peuplements de macroinvertébrés benthiques et reposent sur la quantification par codage flou des traits biologiques pour intégrer la plasticité des caractéristiques biologiques des organismes. Tout d'abord, l'étude fonctionnelle des peuplements de macroinvertébrés est envisagée à travers différentes approches : (1) les méthodes en analyse multivariée (ACF floues, méthodes multitableaux) et (2) l'indice de diversité quadratique basée sur les traits biologiques. Dans une troisième prtie, les modèles polytomiques ont permis de modéliser les profils biologiques de 67 relevés de références répartis sur 8 grands cours d'eau européens. Enfin, il a été montré que plusieurs traits répondent aux modifications chimiques et physiques de l'habitat soulignant l'altération fonctionnelle des peuplements liée aux activités humaines. Ces résultats permettent de définir les principes de la construction d'un outil de bio-évaluation basé sur les traits biologiques
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Myskowiak, Jean-Bernard. "Etude des communautés d'invertébrés acquatiques et de la dynamique de colonisation d'un cadavre pendant sa phase immergée en vue d'estimer le delai de submersion." Paris 5, 2005. http://www.theses.fr/2005PA05S003.
Full textAbstract:
L'utilisation des invertebrés colonisant les cadavres en eau douce est peu exploitée en médecine légale. Ce travail, situé à l'interface entre la recherche fondamentale et les développements appliqués, fournit une approche de la colonisation d'un corps immergé au cours du temps afin de concevoir un outil d'estimation du délai post-mortem. Deux expériences utilisant un modèle animal et une confrontation des résulatts obtenus avec des données réelles de terrain sont exposées. Les varaibles pouvant être significatives (vêtements, type de milieu, physicochimie etc. . . ) sont étudiées. Les colonisations par les invertébrés sont confrontées avec les stades post-mortem et des spectres de taxons informatifs sont mis en évidence. Sur ces bases , un protocole pratique est mis en place. La faune aquatique est à même maintenant de constituer un outil pertinent utilisable pour l'estimation du temps de submersionFrom the pathology point of view , invertebrates colonising cadavers in freshwater have been rarely used. This work, standing between fundamental and applied research, gives an insight of the colonisation of immersed body against time, in order to design a tool assessing the post-mortem day. Two experiments applying an animalmodel, and cross examination of the results are presented. Parameters that could be of significance (clothes, environment, physico-chemistry etc. . . ) are studied. Colonisations by invertebrates are examined against post-mortem stages and bio-indicators spectra are highlighted. In the afore mentioned basis, a working protocol is set up. Aquatic fauna is now able to constitute a relevant tool that can be used for assessing submersion delay
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Hutagalung, Rory Anthony. "Évolution du peuplement piscicole de la Garonne à Toulouse dans un environnement anthropise : analyses biologique et écologique." Toulouse, INPT, 1998. http://www.theses.fr/1998INPT018A.
Full textAbstract:
L'étude de la variabilité physico-chimique et de la typologie ichtyenne a été réalisée dans les deux bras de la Garonne à Toulouse de 1994 à 1997. Ces deux bras sont soumis aux contraintes de l'endiguement, des barrages, et aux rejets industriels pour le bras inférieur. Ces perturbations créent une singularité au niveau du peuplement piscicole, qui apparaît différent du peuplement à l'amont et à l'aval. Les rejets industriels ont eu pour effet de rendre le bras inférieur abiotique jusqu'en 1985, mais une diminution de ces mêmes rejets depuis 1992 a conduit à la recolonisation de ces rejets depuis 1992 a conduit à la recolonisation de ce bras par une communauté piscicole aussi diversifiée que celle du bras supérieur. Les investigations écotoxicologiques et écologiques montrent peu de différences entre les deux bras. Paradoxalement, la densité de poissons est plus importante dans le bras pollué. Cependant, l'étude de la biologie permet de mieux démontrer l'effet de perturbations anthropiques, notamment sur la croissance. En effet, celle-ci apparaît moins rapide dans le bras pollué que dans le bras non pollué. Le peuplement de l'ensemble des deux bras est constitué de 30 espèces, et très largement dominé par les cyprinidés. Un tel peuplement est caractéristique des zones situées plus en aval, et se retrouve sur la Garonne à 100 km de Toulouse. Ainsi, lorsque l'on considère l'évolution du peuplement de poissons de la Garonne à Toulouse d'un point de vue spatio-temporel, celui-ci apparaît comme une discontinuité dans le continuum fluvial, et présente une différence entre les communautés piscicoles des deux bras. De plus, il a été également mis en évidence que ce peuplement change en fonction des saisons et selon le type d'habitat considéré.
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Tixier, Guillaume. "L' acidification anthropique des eaux de surface : effets sur les communautés de macro invertébrés benthiques : Autoécologie et réponses d'espèces caractéristiques des ruisseaux de tête de bassin des Vosges." Metz, 2004. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/2004/Tixier.Guillaume.SMZ0433.pdf.
Full textAbstract:
Malgré les récentes réductions des émissions des SO2 et des NOx dans l'atmosphère, l'acidification anthropique des écosystèmes d'eau douce est encore considérée comme un problème écologique majeur dans de nombreux pays de l'hémisphère Nord. Dans le massif des Vosges en tout cas, elle constitue la première cause de dégradation des écosystèmes aquatiques de tête de bassin. L'une de ses conséquences les plus marquantes réside dans l'érosion très importante de la biodiversité animale. Dans cette voie, de nombreuses études se sont focalisées sur les effets délétères de l'acidification notamment sur le compartiment des poissons et de la macrofaune benthique. Afin d'expliquer la modification des communautés de macro invertébrés, trois hypothèses ont été avancées. 1) un effet léthal ou subléthal direct de la toxicité des eaux acides ([H+], [Al] élevées). 2) un effet indirect à travers le changement des ressources nutritives 3) un effet indirect provenant de la modification des phénomènes de compétition et de prédation. Si la première hypothèse a été très bien documentée, en revanche, les effets indirects et les répercussions sur le fonctionnement de l'écosystème ont été bien moins appréhendés. Dans ce sens, les études in situ à un niveau de détermination élevée ainsi que l'autoécologie des espèces, indispensables à la compréhension de ces processus, sont demeurées rares. Ce travail montre que les réponses des macro invertébrés à l'acidification est plus complexe que préalablement évoquée. Il met en évidence notamment l'existence de taxons " acido-bénéficiaires " qui confirme en autre l'importance des effets indirects de compétition et de prédation dans la modification des communautés en milieu acidifié. En outre, ce travail apporte des connaissances fondamentales sur l'autoécologie des espèces par la détermination de leur cycle de vie et de leur rôle dans l'organisation trophique de l'écosystème acide et non acide. Il souligne alors leur nécessité dans la compréhension des processus écologiques, en général, et particulièrement dans le cadre de l'acidification, de leur rôle déterminant dans les processus de recolonisation des écosystèmes auxquels on peut s'attendre si la réhabilitation des milieux s'effectueDespite the recent reduction of SO2 and NOx emissions, anthropogenic acidification of freshwater ecosystems remains a major ecological problem in several countries. In the Vosges Mountains, it still represents the first cause of headwater stream perturbation. Many researches have focused on the effects of acidification on the composition and structure of macroinvertebrate communities. In this way, it has been shown that the biodiversity (richness) of most invertebrate taxonomic groups has been severely impoverished in acidified ecosystems. To explain the modification of invertebrate assemblages, different types of response (not exclusive) have been proposed. 1) direct lethal and sublethal effects of acidification (i. E. High [H+] and [Al] and low [Ca]) leading to the disruption of important physiological functions (e. G. Ion-regulation, respiration), 2) indirect effects through changes in the quality and quantity of aquatic food resources. 3) indirect effects resulting from change in biotic interactions such as competition and/or predation. If the first hypothesis has been well studied, indirect effects and their consequences on ecosystem functioning have received little interest. In fact, studies performed on the field and using high level of taxon determination as well as autoecological aspects which are essential to understand these processes remain scarce. Our study accounts for more complex responses of macro invertebrates to acidification than previously reported. In particular, it reveals that some given taxa could be “acid-benefiting”. In this way, it confirms the major importance of indirect effects such as competition and predation leading to the modification of macro-invertebrate assemblages in acidic ecosystems. Moreover, it provides important informations on several autoecological traits, especially concerning their life history and feeding habits in pristine and acidified ecosystems. Our study emphasizes the crucial need of such fundamental aspects in understanding ecological processes, in particular when assessing the effects of freshwater acidification, and in the future the possible recovery of running water ecosystems from acidification
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Richert, Caroline. "Comparaison de marqueurs biochimiques chez les poissons (induction de l'activité éthoxyrésorufine-O-deéthylase et inhibition de l'activité acétylcholinestérase) et d'indicateurs écologiques (peuplement de macroinvertébrés) pour le diagnostic in situ de la pollution toxique dans les cours d'eau." Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10356.
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Fontvieille, Dominique. "La circulation du carbone organique dans les écosystèmes lotiques : cas du phénomène d'autoépuration." Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO10047.
Full textAbstract:
Le phenomene d'autoepuration est considere ici dans le seul cas des composes polluants a caractere trophique apportes a des cours d'eau de faible dimension. Les resultats exposes ont ete obtenus plus particulierement sur l'albenche (savoie)
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Doumenq, Erika. "Typologie des biohydrosystèmes malgaches et bioindicateurs dulçaquicoles de modifications environnementales." Montpellier 3, 2004. http://www.theses.fr/2004MON30020.
Full textAbstract:
L'étude des peuplements invertébrés lotiques de 220 stations réparties sur plusieurs bassins hydrographiques malgaches a permis de mettre en évidence pour l'ensemble des taxons : une structure cénotique basique sur le versant occidental ; une structure plus complexe sur le versant oriental ; toutes deux dépendantes des paramètres altitude et végétation. Néanmoins, ces structures générales ne sont qu'apparentes et sont modelées par des paramètres différents selon les familles étudiées : Leptoceridae, Hydropsychidae et Baetidae. La comparaison entre les structures faunistiques des cours principaux et des affluents a aussi été réalisée et la définition de " vicarions " a permis la comparaison entre les structures des peuplements des bassins contenant des espèces microendémiques. Enfin, un indice permettant d'évaluer les effets de la déforestation a été construit, en attribuant un poids aux différents genres d'Hydropsychidae ; poids fonction de la sensibilité à la nature du couvert végétalThe study of lotic invertebrate communities in 220 stations spread over several malagasy hydrological basins has permitted to reveal for the whole group of taxons the presence of : a basic cenotic structure on the Western side, a more complex structure on the Eastern side. Both depending on altitude and plant parameters. Nevertheless, these general structures are only surface similarities and can be influenced by various parameters according to the families observed : Leptoceridae, Hydropsychidae and Baetidae. We have also compared the wildlife structures in the main watercourses with those in the tributaries, and the discovery of vicarions enabled us to make a comparison between the structures of the different communities in the basins composed of microendemic species. Finally, we have determined an index to assess the effects of deforestation by giving a weight of the various kinds of Hydropsychidae- the weight depending then on their sensitivity to the type of plant cover
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Madéore-Le, Pichon Céline. "Une approche "Paysage aquatique" pour une meilleure connaissance du fonctionnement des écosystèmes fluviaux et l'amélioration de la conservation des peuplements de poissons." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066538.
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Cellot, Bernard. "Dérive et flux du matériel organique, notamment des macroinvertébrés, dans une grande rivière européenne." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10002.
Full textAbstract:
Ce travail, presente sur publications, fait le bilan de 15 annees de recherche sur la structure et le fonctionnement d'une grande riviere medio-europeenne dans le cadre des theories ecologiques modernes appliquees aux eaux courantes. La prise en compte des matieres organiques en suspension (dissoutes et particulaires) et de la derive des organismes vivants (notamment des macroinvertebres benthiques) a permis d'obtenir des resultats originaux. Ceux-ci concernent: (i) la variabilite spatiale et temporelle des ecosystemes lotiques, (ii) la relation entre derive et benthos en place, ainsi que (iii) la connectivite et les flux dans le cours principal du rhone. L'etude de la variabilite spatio-temporelle a ete effectuee a deux echelles. La relation entre la derive et le benthos a ete etudiee pour 3 elements differents. L'hypothese de connectivites fonctionnelles a ete testee sur la derive et les flux du materiel organique. Dans le cadre du river continuum concept (rcc), le rhone s'inscrit en definitive dans un fonctionnement controle en priorite par l'amont, avec une relative independance des connectivites laterales, ses plaines d'inondation ne constituant pas apparemment une source de matieres organiques a l'echelle de nos mesures. Les flux de derive demontrent neanmoins, dans le contexte du patch dynamics concept (pdc), le role fonctionnel des rives dans l'organisation des communautes et des populations de macro-invertebres benthiques des ecosystemes lotiques de grands fleuves
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Guilmet, Martine. "Impact des rejets urbains et industriels de la région Toulouse-sud sur l'écosystème aquatique de la Saudrune." Toulouse, INPT, 1988. http://www.theses.fr/1988INPT001A.
Full textAbstract:
Notre travail, avec pour but la préoccupation de la protection du milieu aquatique, nous a conduit à étudier différents aspects successifs du problème : 1. Qualité physico-chimique des eaux : les données sur l'eau, malgré leur part d'incertitude sont nécessaires et représentent une base essentielle car en relation directe avec les données de rejets sur lesquelles peuvent s'exercer les actions de dépollution. 2. Etude de la micropollution métallique dans les sédiments : ils représentent un des éléments intégrateurs du milieu et permettent de faire face à certains problèmes liés à l'étude de la physico-chimie des eaux. 3. Tests écotoxicologiques : l'intérêt de ces test pour l'évaluation globale de la toxicité est manifeste. La pollution chimique est formée, pour le site qui nous préoccupe, d'un ensemble très complexe de molécules difficiles à identifier complètement. De plus, les différentes actions entre les substances rendent la prévision d'effets toxiques, impossible par l'analyse chimique. 4. Etudes des populations benthiques et piscicoles : ils représentent les autres éléments intégrateurs du milieu et sont la réponse biologique, indispensable à connaître, des différentes atteintes du milieu.
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Bouzidi, Abdelhamid. "Recherches hydrobiologiques sur les cours d'eau des massifs du Haut-Atlas (Maroc) : bio-écologie des macroinvertébrés et distribution spatiale des peuplements." Aix-Marseille 3, 1989. http://www.theses.fr/1989AIX30022.
Full textAbstract:
La comparaison de la richesse taxonomique des peuplements lotiques du haut-atlas avec celle des autres reseaux europeens montre que la diversite specifique est faible, que l'habitat preferentiel est souvent deplace vers les secteurs amont des reseaux, que les especes, en l'absence de concurrentes congeneres, presentent un spectre ecologique plus etendu et que les formes stenothermes d'eau froide sont cantonnees dans les sources sur le versant sud, alors qu'elles occupent un habitat plus large sur le versant nord. L'etude biocenotique met en evidence une succession de quatre groupements faunistiques caracteristiques de quatre zones ecologiques distinctes
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Mathuriau, Catherine. "Les macroinvertébrés des cours d'eau andins du Sud-Ouest de la Colombie : écologie et bioindication." Toulouse 3, 2002. http://www.theses.fr/2002TOU30237.
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Greulich, Sabine. "Compétition, perturbations et productivité potentielle dans la définition de l'habitat d'espèces rares : étude expérimentale du macrophyte aquatique Luronium natans (L) Rafin." Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10077.
Full textAbstract:
Luronium natans est une espece heterophylle (rosette sempervirente submergee et feuilles flottantes estivales), colonisant des habitats peu productifs ou perturbes. Les modeles des strategies vegetales de grime (1979) et de l'organisation centrifuge des communautes de keddy (1989) relient ce patron de repartition a une faible aptitude competitive. En effet, ces modeles supposent que l'intensite de competition est faible dans des habitats perturbes ou pauvres en nutriments. L'aptitude competitive quant a elle, est supposee peu variable sur les gradients environnementaux. L'objectif de ce travail est de tester la validite de ces modeles pour le cas de l. Natans. Dans ce but a ete realise une transplantation de l'espece dans des ecosystemes perifluviaux repartis sur des gradients de perturbation (crues, exondation) et de productivite potentielle (richesse nutritionnelle du sediment), et un suivi des patrons de croissance a petite echelle. Les resultats obtenus demontrent que l'aptitude competitive de luronium est en effet limitee. En absence de competition, il est capable de s'implanter dans une large gamme d'habitats. Dans des conditions de productivite moyenne, luronium se caracterise par une croissance relativement lente et une strategie intermediaire entre celles d'especes plus competitives et celles d'especes plus ruderales. Son maintien dans les habitats de transplantation semble possible a long terme sur une grande partie du gradient de productivite, sous condition d'un niveau de perturbation approprie. Ce besoin de perturbation ne croit cependant pas de maniere continue avec la productivite potentielle de l'habitat : l'espece presente une aptitude competitive potentielle plus elevee dans les sites les plus riches en nutriments, en developpant, grace a son heterophyllie, une canopee dense de feuilles flottantes. En conclusion, l'aptitude competitive dans la phase etablie n'explique pas a elle seule la rarete de luronium. En meme temps, cette etude revele l'existence d'habitats potentiels non occupes, suggerant d'autres causes de rarete liees a l'etablissement, a la regeneration ou a la dispersabilite de l'espece.
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Berlioz-Barbier, Alexandra. "Développement de méthodologies innovantes basées sur la nanochromatographie couplée à la spectrométrie de masse pour l'étude de la bioaccumulation et de la biotransformation de polluants émergents chez des invertébrés aquatiques d'eau douce." Thesis, Lyon 1, 2015. http://www.theses.fr/2015LYO10339.
Full textAbstract:
L'écosystème aquatique est le résultat d'un équilibre entre l'environnement naturel et les organismes qui s'y développent. Cet équilibre peut être modifié par l'introduction de substances chimiques dues aux activités humaines. Aujourd'hui, l'impact de cette micropollution est encore mal connu, particulièrement pour les organismes constituant les premiers maillons des chaînes trophiques qui requièrent des efforts analytiques importants en raison de leur faible taille. L'objectif de ces travaux est centré sur le développement, la validation et l'application d'outils analytiques permettant d'étudier la bioaccumulation et la biotransformation de polluants émergents chez des invertébrés benthiques. Cette étude s'est focalisée sur 3 organismes aquatiques d'eau douce : C. riparius, G. fossarum et P. antipodarum. Une méthode analytique pour la quantification de 35 polluants émergents chez les 3 espèces sélectionnées a ainsi été développée. Elle permet d'accéder aux premières données de bioaccumulation des substances d'intérêts à l'échelle d'un individu grâce à la mise en oeuvre d'une stratégie analytique entièrement miniaturisée, incluant une extraction MicroQuEChERS suivie d'une analyse par nanochromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem. Afin de mieux comprendre l'impact d'une telle pollution sur les espèces sélectionnées et d'obtenir une vue globale des capacités de biotransformation de celles-ci, une approche métabolomique a été mise en place. Enfin, un nouveau mode de quantification par MRM3 a été utilisé pour dépasser la complexité de telles matrices, et fournir une évaluation fiable des cinétiques de bioaccumulation de potentiels traceurs de pollution anthropiqueThe aquatic ecosystem is the result of a balance between the natural environment and the organisms that inhabit it. This balance can be modified by the input of excessive amount of substances generated from human activities. Nowadays, the impact of this pollution is still little known, especially regarding the risk of bioaccumulation in the first trophic levels. This lack of data could be partially explained by the lack of suitable analytical method for small organisms. In this context, the aim of this study is to establish the development, the validation and the application of analytical tools for the assessment of bioaccumulation and biotransformation of emerging pollutants in freshwater invertebrates. Three benthic invertebrates are chosen for this project: C. riparius, G. fossarum and P. antipodarum. Analytical method has been developed for the quantification of 35 emerging pollutants in the selected species. This method provides the first bioaccumulation data of targeted substances in individual scale through the implementation of miniaturized analytical strategy, including an extraction step based on MicroQuEChERS followed by nanoliquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry analysis. To better understand the impact of such pollution and to obtain a global view of the biotransformation capacities of the selected organisms, metabolomics approach has been put in place. Finally, a new quantification mode based on MRM3 was used to overcome biotic matrix complexity and assess the bioaccumulation kinetics of potential tracers of anthropic pollution
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Piscart, Christophe. "Rôle de la salinité dans la dynamique et la régulation de la biodiversité des communautés de macroinvertébrés dulçaquicoles." Metz, 2004. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/UPV-M/Theses/2004/Piscart.Christophe.SMZ0427.pdf.
Full textAbstract:
Un intérêt croissant est porté aux conséquences des modifications du climat et de la température sur les milieux aquatiques continentaux. Une augmentation de la salinité des eaux est envisagée dans un contexte de changements globaux, due en particulier à l'augmentation de l'évaporation, la remonté du niveau marin et des aquifères souterraines, les changements d'occupation des sols et les processus d'érosion des bassins versants. Malgré cette perspective, le rôle de la salinité dans les écosystèmes d'eaux douces est mal connu, en particulier au niveau d'écosystèmes situés en climat tempéré. L'objectif principal de ce travail doctoral est de contribuer à une meilleure connaissance du rôle et des conséquences de l'augmentation de la salinité sur la faune des eaux. Des spécificités régionales ont permis d'étudier in situ, le rôle de la salinité dans la régulation de la biodiversité des communautés de macroinvertébrés d'une rivière, la Meurthe, présentant sur une faible distance géographique (environ 19 Km) un important gradient de salinité (0,2 à 2,6 g. L-1). La première partie de ce travail documente nos connaissances sur l'évolution des communautés de macroinvertébrés le long du gradient de salinité en terme de biodiversité et de structure mais aussi en termes de caractéristiques bio/écologiques des peuplements macrobenthiques. L'impact de la salinité a été mis en évidence à partir d'une concentration en sels supérieure à 1,4 g. L-1 avec, notament, l'installation d'espèces exotiques. Dans une seconde partie, des études aux niveaux populationnel et individuel ont permis d'expliquer les changements observés à l'échelle communautaire, notamment par l'intermédiaire de tests de tolérance à la salinité réalisés en conditions contrôlées sur 60 taxons appartenant à l'ensemble des groupes faunistiques. Plusieurs outils diagnostiques tels que l'utilisation d'habitats sentinelles et de substrats artificiels adaptés à l'étude de la salinisation ont été développés au cours de ce travail. Des investigations originales ont également été réalisées sur la possibilité d'utiliser des mesures d'asymétrie fluctuante en tant qu'indicateur d'instabilité de développement des populations naturelles soumises à un stress salinOne of the consequences of the climat changes and rising temperatures on continental aquatic environments will be an increase their salinity levels. This salinization process is due to multiple factors such as an increase of evaporation, a rise of the sea level and the subterranean aquifers or a change of land use and erosonial process of drainage basins. In spite of its importance, the role of the salinity in freshwater ecosystems is poorly known, in particular in temperate ecosystems. The main objective of this sudy is to improve our knowledge of the role and consequences of a rising salinity on the freshwater biota. A particular section of the Meurthe River allowed us to study on the field the role played by the salinity in the regulation of biodiversity of the macroinvertebrate community. This section of 19 Km presents a salinity gradient ranging from 0. 21 to 2. 60 g. L-1. The first part of this study document our knowledge on the change of macroinvertebrate communities along a salinity gradient in term of biodiversity and structure but also in terms of bio/ecological characteristics of macroinvertebrate assemblages. In the second part, the study is focused on the populationnal and individual scales to explain the observed changes in community scale, especially by using some laboratory tests of the salinity tolerance of 60 taxa belonging to all faunistic groups. From a practical point of view, we explored several bioassessment tools adapted to the study of salinization process such as the bused of sentinel substrate and artificial substrates. Some inovative investigations have also been realized on the use of fluctuating asymmetry to highlight developmental instabilities in natural population submitted to a salinity stress
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Touron, Poncet Heliott. "Biodiversité des communautés d'invertébrés benthiques des rivières de la Guadeloupe et réponses aux perturbations anthropiques." Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/2292/.
Full textAbstract:
"Les communautés aquatiques (algues, invertébrés, poissons) sont utilisées depuis plusieurs décennies pour évaluer la qualité biologique des cours d'eau. Des méthodes pratiques pour calculer des indices biotiques ont été conçues (ex. Indices basés sur la diversité des macroinvertébrés), et adaptées pour être appliquées en routine par les gestionnaires des milieux aquatiques. Ces méthodes standardisées ne tenaient pas compte d'un référentiel correspondant à l'état "normal" des communautés concernées. Les approches récentes basées sur le concept de l'intégrité de l'écosystème et sur la biodiversité semblent plus prometteuses pour la gestion intégrée de l'eau. Au cours de la dernière décennie, la Directive Cadre Européenne sur l'eau 2000/60/CE (DCE) a ainsi suscité un nombre important de travaux qui ont conduit à une redéfinition d'outils de bioindication prenant en compte la notion d'écart à la référence. Les méthodes de diagnostic écologique à présent en vigueur en Europe continentale ne sont cependant pas directement transférables aux Départements et Territoires d'Outre Mer, où les contextes biogéographiques et climatiques d'une part, et le manque de connaissance de la faune d'autre part, ne permettent pas d'appliquer les protocoles prescrits. Nous avons développé un indice de bioindication DCE-compatible adapté aux rivières de la Guadeloupe. Le développement de cet indice a nécessité plusieurs étapes au préalable, il a fallu approfondir la connaissance de la faune, pour ensuite définir une biotypologie sur la Basse-terre de la Guadeloupe. Nos résultats mettent en évidence l'importance de l'occupation du sol et la géomorphologie dans la définition de trois sous-régions écologiques (clusters) pour les invertébrés benthique. A partir de ce travail, il a été possible de créer un indice multi-métrique (IBMA-971) pour évaluer la qualité écologique des rivières. Parmi 411 métriques (transformées en ratio de qualité écologique), nous avons selectionné les métriques présentant une forte efficacité de discrimination, une faible spécificité et une forte stabilité en condition de référence. Cet indice se compose de 6 métriques issues de la diversité taxonomique, de la richesse, de l'abondance et de la préference pour un substrat. A partir d'un jeu de donnée test, nous avons trouvé que l'IBMA-971 était sensible à un large panel d'impacts anthropiques. Cet indice montre qu'il est applicable aux îles voisines dans la même région biogéographique. En parallèle, une étude de prélèvement alternative des macroinvertébrés a été testée avec cet indice pour la première fois dans les Antilles. Nos résultats mettent en évidence que les substrats artificiels peuvent permettre d'accéder rapidement à la qualité écologique d'une rivière, ce qui peut être une méthode prospective pour des études pilotes. "Aquatic communities (algae, invertebrates, fish) have been used for decades to assess the biological quality of rivers. Practical methods to calculate biotic indices have been designed (e. G. , based on macroinvertebrate diversity indices) to be applied routinely by managers of aquatic environments. These standardized methods did not reflect a repository corresponding to the "reference" state of the communities to be expected under natural conditions. . During the last decade, the European Water Framework Directive 2000/60/EC (WFD) has prompted a large number of works that have led to a redefinition of biomonitoring tools. One of the newer approaches to assessing the ecological quality of rivers within the Framework is the Reference Condition Approach (RCA), where ecological health is defined in terms of similarity to an undisturbed ("reference") state. Although new, RCA-based bioassessment tools are now implemented in continental Europe, these methods are not directly transferable to EU's Overseas Territories, where biogeographic and climatic conditions on the one hand, and lack of knowledge of the fauna on the other hand do not allow to apply current EU standards. We designed a WFD-compliant biomonitoring index adapted to rivers of Guadeloupe (French Lesser Antilles). The development of this index required to deepen our knowledge of the fauna, and then to define a biotypology of rivers. Our results highlight the importance of land use and geomorphology in the definition of three ecological sub-regions (clusters) for benthic invertebrates. Based on this work, it was possible to create a multi-metric index (IBMA-971) to evaluate the ecological quality of rivers. Among 411 metrics (transformed into ecological quality ratio), we selected metrics with a high efficiency of discrimination, poor specificity and high stability under reference conditions. This index consists of 6 metrics derived from taxonomic diversity, richness, abundance and preference for substratum types. From a set of test data, we found that the IBMA-971 was sensitive to a wide range of anthropogenic impacts. This index proved applicable to islands from the same biogeographical region. In addition, an alternative (cost-effective and less time consuming) sampling method for the calculation of the IBMA was tested. Our results demonstrate that artificial substrates allow a quick assessment of ecological quality in Guadeloupe
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Lacaze, Emilie. "Un biomarqueur de génotoxicité chez Gammarus fossarum : développement, signification fonctionnelle et application au milieu naturel." Thesis, Metz, 2011. http://www.theses.fr/2011METZ007S/document.
Full textAbstract:
Les substances génotoxiques ont la capacité d'altérer l'intégrité de l'ADN, support biochimique de l'hérédité et présentent un risque mutagène et tumorigène avéré pour de nombreuses espèces. Dans le milieu aquatique, les invertébrés sont d'une importance capitale pour le bon fonctionnement de l'écosystème, mais très peu d'outils sont disponibles pour évaluer la génotoxicité chez ces espèces. Pourtant, les nouvelles obligations réglementaires telles que la Directive Cadre Européenne acceptée en 2000, vont de pair avec le développement d'outils sensibles, fiables et précoces à même de proposer un diagnostic robuste de la qualité biologique des écosystèmes. Dans ce contexte, ce travail de thèse a porté sur le développement, la validation, l'interprétation et l'application au milieu naturel d'un biomarqueur de génotoxicité chez une espèce sentinelle du milieu dulçaquicole, le gammarus fossarum. Ces travaux sont à notre connaissance la première évaluation de la génotoxicité chez un crustacé d'eau douce d'intérêt écologique, par le test Comet. L'aspect novateur de ce travail repose sur la mise en évidence d'une relation entre endommagement de l'ADN des spermatozoïdes et succès reproducteur. En s'appuyant sur un protocole standard, nous avons établi une valeur de référence tenant compte de la variabilité spatio-temporelle de la réponse du biomarqueur, ainsi qu'un seuil de dommages à l'ADN au delà duquel des effets significatifs sur la descendance sont observés. Suite aux résultats obtenus sur le terrain par des méthodes d'encagement, l'intérêt d'utiliser ce biomarqueur à vocation écologique dans un cadre d'évaluation du risque environnemental est confirméGenotoxicants can induce deleterious changes in DNA, the biochemical carrier of inheritance. However, aquatic invertebrates such as crustaceans still lack genotoxicity biomarkers although these species play an essential role in ecosystems. The European Water Directive Policy (2000) is aimed at a holistic approach to towards integrated water protection, in order to improve the status of aquatic ecosystems. To this end, one approach is to develop and validate biomarkers in ecologically relevant species. In this perspective, the objectives of the present work were to develop, to validate, to study the ecological significance of a genotoxicity biomarker in the freshwater species gammarus fossarum and finally to assess it in the field. This is to our knowledge the first genotoxicity assessment in an ecologically relevant freshwater crustacean, using the comet assay. The novelty of our approach was to evaluate the consequences of the sperm DNA damage on reproduction, a crucial biological function. Taking into account biotic and abiotic factors, a robust reference value in gammarus fossarum spermatozoa DNA damage has been established. Then, a relationship bridging the biomarker response measured in spermatozoa and its consequences on reproduction has been shown enabling the establishment of a DNA damage threshold level leading to significant consequences for the reproduction and possibly subsequent population dynamics. Our work clearly demonstrated that DNZ damage in gammarus fossarum spermatozoa is an accurate and relevant biomarker for environmental risk assessment
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Carteron, Michel. "Contribution à l'étude des ballastières de l'est de la France (région Franche-Comté) : influence de quelques paramètres sur les peuplements d'invertébrés benthiques." Lyon 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LYO11671.
Full textAbstract:
La structure des peuplements caracterisant les zones profondes les zones littorales avec et sans vegetation aquatique, est analysee pour chaque ballastiere au moyen des modeles de distribution d'abondance de preston et motomira. Les bassins en cours d'exploitation montre des communautes fortement hierachisees. Les conclusions pratiques degagees soulagent l'interet d'adopter un schema d'exploitation et de gestion integrant a la fois la qualite des eaux et la duree de vie des milieux en fonction de l'objectif d'amenagement retenu
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Franquet, Evelyne. "Occupation d'un espace fluvial par les diptères chironomidés à l'aval du Rhône : répartition des espèces selon la nature du substrat et les conditions de débit." Lyon 1, 1996. http://www.theses.fr/1996LYO10142.
Full textAbstract:
En amont d'arles, les milieux aquatiques du bas-rhone comprennent un chenal principal ainsi que des milieux annexes d'origine naturelle (les lones) ou artificielle (les caissons girardon). L'echantillonnage, par traits de filet, par derive et par pieges a emergence, des exuvies nymphales de dipteres chironomides flottant a la surface de l'eau a permis d'identifier 95 especes peuplant l'ensemble de ces milieux. Parmi celles-ci, 16 n'etaient pas citees dans le dernier inventaire francais datant de 1991. La prise en compte des autres especes macroinvertebrees existant dans ce secteur montre que les chironomides representent plus de la moitie de la richesse specifique totale. Le peuplement d'un caisson, etudie sur une periode de stabilite du niveau d'eau et de la temperature apparait fortement structure a l'echelle du microhabitat. Les resultats font apparaitre une relation entre la structure faunistique, d'une part et le grain moyen, la porosite et l'heterogeneite du substrat, d'autre part. L'etude de la taille des larves, de leurs modes de vie et d'alimentation ainsi que de leur resistance au manque d'oxygene montre que la relation faune-substrat s'explique par les potentialites biologiques des genres recenses. A une echelle superieure, les peuplements caracteristiques des stations - le chenal, deux caissons et une lone - sont differents, aussi bien en terme d'especes que de potentialites biologiques. La position geographique de chaque station par rapport au chenal principal explique ces differences. Elle induit une dynamique hydrosedimentaire conduisant a la mise en place de substrats caracteristiques stables a l'echelle de l'annee, de plus elle entraine des phenomenes de connexions, influant sur le courant, le renouvellement de la masse d'eau et donc sur la temperature et la teneur en oxygene au niveau de l'interface eau-substrat
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Ruaux, Brigitte. "Les plantes envahissantes des corridors fluviaux : traits biologiques, impacts de Ludwigia péploides et L.grandiflora en Loire moyenne et implications pour la gestion." Thesis, Tours, 2008. http://www.theses.fr/2008TOUR4040/document.
Full textAbstract:
Dans le bassin de la Loire, et plus particulièrement en Loire moyenne, deux espèces de Jussies (Ludwigia peploides (Kunth) Raven subsp. montevidensis (Spreng.) Raven, L. grandiflora (Michx.) Greuter & Burdet subsp. hexapetala (Hook. & Arn.) Nesom & Kartesz) amphiphytes exotiques invasives colonisent principalement les annexes hydrauliques et les grèves du lit endigué. Cette thèse étudie la biologie (reproduction, implantation, dissémination, …) de ces deux taxons, leurs impacts sur les communautés végétales et animales (macroinvertébrés aquatiques) afin de mieux adapter leur gestion. Les résultats des suivis de terrain et des expérimentations in situ et ex situ démontrent en particulier : (i) des différences entre les deux espèces concernant leurs traits reproductifs et leur développement sur les annexes hydrauliques et les grèves, (ii) la possibilité d’un cycle de reproduction sexuée complet sous le climat ligérien, (iii) un impact nul sur les communautés végétales d’hydrophytes mais négatif sur les communautés riveraines étudiées, (iv) peu de différences entre la diversité et la structuration des communautés d’invertébrés dans les herbiers de macrophytes autochtones et exotiques. A partir de ces résultats, nous proposons de mettre en oeuvre un protocole de veille et de gestion des Jussies dans les deux types d’habitats (annexes hydrauliques et grèves), en intégrant tout particulièrement la nouvelle donnée de forte probabilité de reproduction sexuéeIn the Loire catchment, and particularly in the middle Loire River, two species of water primroses (Ludwigia peploides (Kunth) Raven subsp. montevidensis (Spreng.) Raven and L. grandiflora (Michx.) Greuter & Burdet subsp. hexapetala (Hook. & Arn.) Nesom & Kartesz) which are invading exotic amphiphytes. They, mainly colonize former channels and river banks in the in between-dykes floodplain. This thesis studies the biology (reproduction, establishment, dispersal, …) of those two taxa, their effects on plant and animal communities (aquatic macro-invertebrates) in order to optimize their management. The results of the field surveys as well as in situ and ex situ experimentations show in particular: (i) differences between the two species concerning their reproduction features and their development in former channels and river banks, (ii) the possibility of a complete sexual reproduction cycle in the climatic conditions of the middle Loire River, (iii) the absence of effetcs on hydrophyte communities but a negative one on riparian communities, (iv) few differences between the diversity and the structure of invertebrate communities in stands of both native macrophytes and exotic ones. From those results we suggest a survey and management protocol for water primroses in the two types of habitats (former channels and river banks), including in particular the new piece of data on high probability of sexual reproduction
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Villeneuve, Bertrand. "Modèles multi-stress et multi-échelles de l’état écologique : vers une analyse du risque d’altération des cours d’eau et des bassins versants." Thesis, Université de Lorraine, 2016. http://www.theses.fr/2016LORR0229/document.
Full textAbstract:
Les cours d’eau et leurs bassins versants sont des systèmes complexes et en équilibre dynamique. Si l’on connait qualitativement assez bien la plupart des processus dont ils sont le siège (ex. transport de matière organique et de sédiments, transformation des litières, etc…), il est beaucoup plus difficile d’en avoir une représentation pertinente à la bonne maille compte tenu de l’emboitement d’échelles des processus, des déterminants terrestres agissant sur les milieux aquatiques et surtout des différents facteurs de stress qui s’y combinent. Nous avons mené une exploration dont le but était de rechercher les causes souvent multiples de dégradation de l’état écologique, d’en connaître l’étendue spatiale et la gravité, pour être en mesure de recommander des actions efficaces de restauration. Dans la première partie de cette thèse, nous avons développé des modèles explicatifs de l’état écologique à large échelle capables de donner des réponses applicables aux échelles de décision et de gestion, à savoir européenne, nationale et régionale avec comme objectif principal de comparer les relations entre les pressions combinées représentées par l’occupation du sol et l'état écologique des cours d’eau de quatre pays européens: la France, la Slovaquie, l'Estonie, et le Royaume-Uni (Angleterre et Pays de Galles). Cette étude a permis (i) d’établir une hiérarchie des catégories d’occupation du sol influant sur l'état écologique, en particulier l'agriculture et l'urbanisation, (ii) d’identifier des tendances régionales dans ces relations pression-impact et (iii) d’évaluer le poids relatif de la pression à l‘échelle du bassin et du corridor rivulaire, et l’effet tampon des zones rivulaires suivant la nature de leur couverture. Dans une deuxième partie, nous avons construit un corpus de modèles capables d’expliquer d’une part la variabilité des indices biologiques utilisés dans les réseaux et de prédire d’autre part l’état écologique des masses d’eau françaises non suivies par le réseau de contrôle et de surveillance (RCS). Cette étude a permis de montrer que : (i) le facteur le plus impactant pour l’état biologique qu’il soit mesuré à partir des macroinvertébrés, des poissons ou des diatomées était la physico-chimie, suivie de l’occupation du sol et de l’hydromorphologie et (ii) l’utilisation de ces trois types de pressions permettait de développer des modèles prédictifs de l’état biologique robustes et fiables. Dans une troisième partie, nous avons voulu tester si les relations entre les pressions à l'échelle locale et l'état écologique étaient hiérarchiquement influencées par la typologie régionale (basée sur les caractéristiques géographiques naturelles et les forces motrices). Ceci nous a permis de montrer que la prise en compte d’une typologie basée sur les forces motrices des bassins versants ne remettait pas en cause la hiérarchie des effets des pressions sur la biologie. Enfin, dans une quatrième et dernière partie, nous avons développé une approche nouvelle qui propose de prendre en compte les connaissances sur l’organisation des échelles et sur les liens entre pressions et état écologique, en construisant et en analysant un modèle structurel qui a permis de relier entre elles des variables latentes correspondant aux pressions d’occupation du sol, hydromorphologiques et physico-chimiques et d’analyser in fine leur effet sur l’état écologique mesuré ici à travers l’I2M2. Le développement de ce modèle a montré : (i) l’effet important de l’occupation du sol sur l’hydromorphologie et sur la physico-chimie et l’effet indirect qui en découle sur les macroinvertébrés, (ii) l’effet de l’hydromorphologie sur la mosaïque de substrats, la dynamique des nutriments et de la matière organique, impliquant un effet indirect majeur sur les macroinvertébrésThe rivers and their watersheds are complex systems in dynamic balance. If processes acting in stream are relatively well known (organic matter and sediment transport, litter degradation, etc ...), it is much more difficult to have a relevant representation of this functioning considering the hierarchy of scales, land determinants affecting aquatic environments and combined multiple stressors. We conducted an exploration whose purpose was to seek the multiple causes of degradation of the ecological status, to know the spatial extent and severity and to be able to recommend effective restoration actions. In the first part of the thesis, we developed large-scale models, based on existing data, to give answers applicable to the decision and management scales, i.e. European, national and regional. The main was to compare the relationships between the combined pressures represented by land cover and the ecological status of running waters in four European countries: France, Slovakia, Estonia, and UK (England and Wales). This first study allowed us i) to establish the hierarchy of the major influences that impact ecological status, particularly agriculture and urbanisation, ii) to identify regional patterns in these pressure-impact relationships and iii) to evaluate the relative weight of the pressures acting at the basin and riparian corridor scales, and the possible buffering effect of riparian land cover. In the second part of the thesis, we built a corpus of models capable of explaining the variability of the biological indices used in the survey network and also predict the ecological status of non-monitored water bodies in France. This permits to demonstrate that : (i) the parameters characterizing the load of nutrients and organic matter had a predominant effect on the three compartments, followed by land use and hydromorphology, (ii) it is possible to build models capable of predicting ecological status that are efficient and easily transferable, using data of different scales that influence the functioning of hydrosystems. In the third part, we tested if the relationships between local scale pressures and ecological status are hierarchically influenced by regional patterns (such as natural physiographic and/or driving forces). Introducing hierarchical factors in multi-stress models can lead to slight variations in responses of organisms to pressures according to their natural characteristics and their driving forces acting at catchment scale. And in the last part, the purpose of our approach was to take into account the nested scale organisation and the links between anthropogenic pressures and river ecological status by building - and analysing the results of - a model based on the PLS path modelling method. This method can be used to simultaneously analyse the effects of latent variables corresponding to land-use, hydromorphological and physico-chemical pressures on the ecological status of rivers, synthetically measured in this study by the macroinvertebrate-based French biotic index for wadeable rivers (I2M2). The development of this model should allow us to demonstrate : (i) the importance of land use effect exerted on both hydromorphology and physico-chemistry and their translation as an indirect effect on biological condition of streams, (ii) that hydromorphological alterations had an effect on substrates structure and nutrients and organic matter concentrations implying that hydromorphology has a major indirect effect on macroinverteb
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Ivol-Rigaut, Jeanne-Marie. "Hydro-écorégions et variabilité des communautés du macrobenthos sur le bassin de la Loire : essai de typologie régionale et référentiel faunistique." Lyon 1, 1998. http://www.theses.fr/1998LYO10065.
Full textAbstract:
Les hydro-écorégions du bassin de la Loire (France) sont établies à partir du relief, du climat de la géologie et de l'hydrogéologie (Wasson et al. , 1993). Elles impliquent des variations des paramètres abiotiques et du macrobenthos. Trente sites naturels (têtes de bassins) ont été sélectionnés comme stations de référence dans six regions-test différentes. Deux composantes chimiques permettent d'établir un gradient régional : la dureté et la contamination par les nitrates. Les stations du Massif Central restent préservées en opposition aux stations des plaines calcaires et du granitique armoricain marquées par l'agriculture intensive et l'élevage. Les stations à forte pente, avec radiers, à fort courant et à substrat grossier sont situées dans le Massif Central tandis que les stations à pente faible, avec mouilles, à faible courant et à substrat fin sont situées en plaine. Le gradient de courant explique en partie les différences régionales faunistiques ; cependant, l'effet régional est dominant sur l'effet pente. Le niveau taxonomique de la famille implique des conséquences en bioindication : seules les stations du Massif Central comportent les taxons polluosensibles (perloidea) systématiquement. Ils sont absents ou rares dans les autres régions du fait de l'impact agricole et de l'environnement physique. Le niveau générique permet d'établir des stratégies écologiques régionales à l'aide des traits. Les communautés algales montrent que la biomasse épilithique est supérieure dans les tables calcaires, environnement plus productif. Les relations trophiques (algues, macrophytes, matières organiques) ne montrent pas de différences régionales et tous les essais sur les groupes fonctionnels alimentaires conduisent à un schema de fonctionnement global sur l'ensemble des régions-test. Les racleurs sont dominants en calcaire. Ces résultats valident pour partie la variabilité naturelle des hydro-écorégions et fournissent des éléments pour la gestion
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Kengne, Fotsing Joséphine. "Bio-évaluation des cours d’eau de la région Ouest du Cameroun à l’aide des macroinvertébrés benthiques et construction d’un indice multimétrique régional." Thesis, Lille 1, 2018. http://www.theses.fr/2018LIL1R067/document.
Full textAbstract:
Les macroinvertébrés benthiques sont depuis toujours reconnus comme d’excellents outils de bio-évaluation de la qualité des eaux, que ce soit dans les milieux tropicaux que tempérés. L’objectif principal de cette thèse était de faire un état de lieu de la qualité des eaux de la région Ouest du Cameroun, sans cesse dégradée par des activités anthropiques diverses et multiples. En s’appuyant sur les communautés benthiques présentes et leurs préférences écologiques à l’échelle du mésohabitat, nous avons abouti à la construction d'un indice régional de bio-évaluation de la qualité écologique des cours d'eau. A partir des analyses multivariées, une biotypologie des cours d’eau a été dégagée au sein des stations échantillonnées, aboutissant à différents patrons de distribution avec d’une part les stations de référence et d’autre part les stations impactées, sur la base du niveau d’urbanisation et la nature des effluents dans les différents sous-bassins versants. Un indice multimétrique (IMMOC), mesurant l'écart à la référence, a pu être créé à partir de ces lots de stations. Parmi les 18 métriques candidates (transformées en Ratio de Qualité Écologique), nous avons sélectionné les métriques présentant une forte efficacité de discrimination et un faible coefficient de variation en condition de référence. L’indice le plus performant se compose de 2 métriques à savoir l’indice de Shannon et la métrique 1–GOLD. A partir d’un jeu de données test indépendant du jeu de données d’apprentissage, nous avons vérifié que l’IMMOC était stable en condition de référence et sensible à la gamme de pressions anthropiques présentes dans cette région, confirmant ainsi son caractère généralisteBenthic macroinvertebrates have always been recognized as better tools for bio-assessment of the ecological quality of streams in both tropical and temperate areas. The main objective of this work was to evaluate the water quality of the Western region of Cameroon most degraded by various and multiple anthropogenic activities. From these communities of macroinvertebrates benthic and their ecological preferences at the mesohabitat scale, we resulted to the construction of a bio-assessment index of the ecological quality of streams adapted to this region. From multivariate analyzes, a stream biotypology into the sampled sites, allowed us to identify different distribution patterns, with on the one hand reference sites or non-impacted and the other hand, impacted sites based on the level of urbanization and the nature of the effluents in the different sub-watersheds. A multimetric index of biological quality (MMIWC), measuring the deviation from the reference, could be created, thanks to these two groups of stations. Among the 18 candidate metrics (transformed into Ecological Quality Ratio), we selected metrics with high discrimination efficiency and a low coefficient of variation in the reference conditions. The best performing index include two metrics derived to the taxonomic diversity (Shannon index) and taxonomic composition (1-GOLD). From a test dataset different to learning dataset, we were able to verify that MMIWC was stable in the reference conditions and sensitive to the full range of anthropogenic pressures present in this region, thus confirming its generalist character
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Pallotini, Matteo. "Qualité biologique des eaux douces et impact des métaux lourds sur les populations et communautés de macroinvertébrés." Thesis, Toulouse 3, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU30383/document.
Full textAbstract:
Nous avons étudié les réponses biologiques des individus, populations et communautés d'invertébrés de rivières à la contamination des sédiments par les métaux lourds. Nous avons examiné les malformations du mentum des larves de Chironomus riparius (Insecta-Diptera) pour évaluer l'effet toxique de la contamination d'un cours d'eau, Le Genna (Italie Centrale). L'aire d'étude est soumise à une activité zootechnique intense qui accroit la pollution métallique de la rivière, notamment par le cuivre, le zinc, le cadmium, le chrome et le nickel. La fréquence des malformations larvaires (56%) a été directement liée aux contaminations, ce qui montre quel es malformations du mentum constituent un proxy pertinent des effets toxiques sur les écosystèmes. Nous avons également analysé, dans une aire industrielle d'Italie Centrale, la bioaccumulation de métaux lourds dans les tissus de Procambarus clarkii (Crustacea-Decapoda), une écrevisse allochtone utilisée comme bioindicateur de la santé écologique des eaux douces. L'hépatopancréas, tissus de détoxification, a montré les concentrations de métaux les plus élevées, en comparaison aux muscles abdominaux (tissus non détoxifiant). Ce ratio de concentration entre les deux types de tissus représente un marqueur pertinent du niveau de stress bio-écologique. Le rapport décroit comme suit : Cd (11,7) > Cu (5,5) > Pb (3,6) > Cr (1,5) > Zn (1,0), Ni (1,0). La comparaison des bioaccumulations avec un site de référence non impacté confirme quel es métaux qui s'accumulent de façon significative dans l'hépatopancréas sont le cadmium et le cuivre. A l'échelle des communautés, nous avons étudié les relations entre combinaison de traits fonctionnels des invertébrés et conditions environnementales (24 variables physico-chimiques) à l'échelle du réseau hydrogaphique (bassin du Nestore, Italie Centrale). Les stations de bonne qualité physico-chimique ont montré une plus forte variabilité dans la composition en traits fonctionnels que dans les conditions physico-chimiques. Un résultat inverse a été observé aux sites pollués, où les traits biologiques sont peu diversifiés et stables dans l'espace et dans le temps, en relation avec la chute de diversité taxonomique liée aux perturbations anthropiques. Enfin, les traits fonctionnels se sont avérés plus efficaces quel es analyses physico chimiques pour détecter des changements de fonctionnement écologique lors que les concentrations en polluants sont faibles. Les cartes auto-organisatrices de Kohonen (SOM, réseaux de neurones) ont permis de modéliser plus en détailla distribution spatio-temporelle des divers taxons en relation avec la variabilité environnementale naturelle et le niveau de pollution chimique (nutriments et métaux lourds). Nous avons enfin développé et validé un indice multimétrique basé sur les communautés d'invertébrés, pour évaluer la santé écologique des cours d'eau d'Italie Centrale en terme d'écart à la référence. Sur 71 métriques biologiques testées, nous n'avons retenues que celles qui présent le meilleurs compromis en terme d'efficacité de discrimination, de faible spécificité et de faible redondance, et montrant une grande stabilité en conditions de référence. Ces métriques, qui renseignent sur la diversité, l'abondance, le rôle fonctionnel et la tolérance des organismes sont : l'indice de Margalef, le score "Biological Monitoring Water Pollution", le nombre de familles et la richesse relative des déchiqueteurs. Cet indice, qui satisfait les pré requis de la Directive Cadre sur l'Eau de l'Union Européenne, répond de façon significative à la pollution des eaux douces et à la contamination des sédiments par les métaux lourdsWe studied the biological responses of individuals, populations and invertebrate communities to river sediment contamination by heavy metals. We examined the deformities of the mentum of Chironomus riparius larvae (Insecta, Diptera) to assess toxic effect of contamination of streams, the Genna (Central Italy). The study area is subjected to intense livestock activity that increases the metal pollution of the river, including copper, zinc, cadmium, chromium and nickel. The frequency of larval malformations (56%) was directly related to contamination, which shows that malformations of the mentum form a relevant proxy of toxic effects upon ecosystems. We also analyzed, in an industrial area of Central Italy, the bioaccumulation of heavy metals in the tissues of Procambarus clarkii (Crustacea-Decapoda), a non-native crayfish used as a bio-indicator of the ecological health of freshwaters. The hepatopancreas, a detoxifying tissue, showed the highest metal concentrations compared to the abdominal muscles (non detoxifying tissue). This concentration ratio between the two types of tissues is a relevant marker of bio-ecological stress. The ratio decreased as follows: Cd (11.7) > Cu (5.5) > Pb (3.6) > Cr (1,5) > Zn (1.0), Ni (1.0). Comparison of bioaccumulations with a non-impacted reference site confirms that those metals that significantly accumulate in the hepatopancreas are cadmium and copper. At the community level, we studied the relationships between the combination of invertebrate functional traits and environmental conditions (24 physical-chemical variables) across the stream system (Nestore Basin, Central Italy). Stations with a good physical-chemical status showed higher variability in their composition of functional traits than in their physical-chemical variables. An opposite trend was observed in the polluted sites, where biological traits are poorly diversified and stable in space and in time, in relation to the decrease in taxonomic diversity linked to human disturbance. Finally, functional traits have proven more effective than physical-chemical analyzes in detecting changes in ecological functioning of streams when contaminant concentrations are low. The self-organizing map algorithm (SOM neural networks) was used to further model the spatial and temporal distribution of the various taxa in relation to the natural environmental variability and the level of chemical pollution (nutrients and heavy metals). Finally we have developed and validated a multimetric index based on invertebrate communities, to assess the ecological health of rivers of Central Italy in terms of deviation from a reference state. Out of 71 tested biological metrics, we retained those metrics that showed the best compromise in terms of discrimination efficiency, low specificity and low redundancy, and higher stability under reference conditions. These metrics, which provide information on the diversity, abundance, functional role and tolerance of organisms are: the Margalef index, the "Biological Monitoring Water Pollution" score, the number of families and the relative richness of shredders. This index, which complies with the prerequisites of the Water Framework Directive of the European Union responds significantly to freshwater pollution and sediment contamination by heavy metals
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Persat, Henri. "De la biologie des populations de l'ombre commun Thymallus thymallus (L. 1758) à la dynamique des communautés dans un hydrosystème fluvial aménagé, le Haut-Rhône français : éléments pour un changement d'échelles." Lyon 1, 1988. http://www.theses.fr/1988LYO10025.
Full text
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Vervier, Philippe. "Hydrologie et dynamique des peuplements aquatiques souterrains : comparaison de deux systèmes karstiques des gorges de l'Ardèche." Lyon 1, 1988. http://www.theses.fr/1988LYO10095.
Full text
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Almohamad, Mohamad. "Etude écotoxicologique de l’impact de polluants provenant d’agrosystèmes sur des organismes animaux aquatiques non cibles : les oligochètes tubificidés Tubifex tubifex." Thesis, Reims, 2012. http://www.theses.fr/2012REIMS013.
Full textAbstract:
Les travaux décrits dans ce mémoire ont été conduits dans le but de tester l'utilisation potentielle de l'autotomie d'un invertébré d'eau douce Tubifex tubifex (Annélide, Oligochète) comme biomarqueur de la qualité sanitaire et environnementale des milieux aquatiques et apporter notre contribution à l'étude de la toxicité létale et sublétale de divers contaminants (le paraquat sous forme de Gramoxone® ; le fludioxonil sous forme Géoxe® ; l'isoproturon et le fenhexamide) couramment utilisés dans le vignoble champardennais. Nous avons réalisé des expérimentations au laboratoire et au niveau d'un site comportant plusieurs bassins de recueil des eaux de ruissellement du vignoble et présentant des taux de contamination différents et contrastés. Nous avons constaté une forte induction de l'autotomie pendant l'exposition aux contaminants. L'isoproturon et le Géoxe® s'accumulent de façon contrastée selon les régions morphologiques du ver. Des perturbations histopathologiques et biochimiques ont été observées chez les vers exposé aux contaminants. La sévérité des atteintes histopathologiques a été moins importante chez les vers autotomisés que les vers entiers. Les systèmes de défenses antioxydants et le métabolisme de phase II (catalase, glutathion-S-transférase) montrent des perturbations variables selon le contaminant et la région du ver sans qu'un schéma général de réponse n'apparaisse. L'approche expérimentale montre que les eaux des bassins provoquent rapidement une autotomie et un stress chez les vers. Le taux d'autotomie est corrélé avec la durée d'exposition et la concentration en toxique. De même une bonne corrélation existe « in situ » entre ce taux d'autotomie et la qualité sanitaire des bassins. Cette réponse morphologique originale constitue donc un biomarqueur potentiel de contamination et peut être compris comme une réponse adaptative du vers à la présence d'un ou plusieurs contaminantsThe work described in this thesis was conducted in order to test the potential use of autotomy of a freshwater invertebrate Tubifex tubifex (Annelida, Oligochaeta) as a biomarker of the sanitary and environnemental quality of aquatic environments and make our contribution to the study of lethal and sublethal toxicity of various contaminants (paraquat as Gramoxone® ; fludioxonil form Géoxe®; isoproturon and fenhexamid) commonly used in the vineyard Champagne-Ardenne. We conducted experiments in the laboratory and at a site with several ponds collecting vineyard runoff and presenting contrasted contamination rates. We found a significant induction of autotomy during exposure to contaminants. The isoproturon and Géoxe® accumulate in the worm with contrasted pattern according to morphological worm regions. Histopathological and biochemical disturbances were observed in worms exposed to contaminants. Rates of histopathology alterations were less important in worms autotomized than in entire worms. The antioxidant defense systems and phase II metabolism (catalase, glutathione-S-transferase) varied in different way depending on the parameter tested but not general pattern of the biochemical responses occured. The experimental approach showed that the pond water rapidly induced autotomy and stressed worms. The autotomy rate was correlated with the exposure time and toxicant concentration. Similarly a good correlation existed "in situ" between autotomy rates and the sanitary quality of ponds. Thus the autotomy is an original morphological response that might be a potential biomarker of contamination and might be understood as an adaptive response to the presence of contamination
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Flüeler, Marie-Josèphe. "Etude des macroinvertébrés -surtout des diptères- pour trois ruisseaux de plaine." Grenoble 1, 1986. http://www.theses.fr/1986GRE10045.
Full textAbstract:
Pour 3 ruisseaux lents de plaine dans le departement de l'isere, les caracteres du milieu et la composition de la faune sont indiques. Les principaux facteurs qui determinent la repartition des especes sont examines
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Dehédin, Arnaud. "Changements globaux et assèchement des zones humides fluviales : conséquences sur les processus biogéochimiques et les communautés d'invertébrés." Phd thesis, Université Claude Bernard - Lyon I, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00976026.
Full textAbstract:
Les zones humides (ZH) alluviales constituent des secteurs à forte valeur écologique etpatrimoniale. Pour comprendre et prédire l'évolution à long terme de ces zones, en particulierface aux changements globaux, il apparaît primordial de traduire les perturbationshydrologiques attendues en termes de perturbations biologiques, afin d'estimer lesconséquences potentielles de ces changements pour la biodiversité et le fonctionnement globalde ces écosystèmes. Cette thèse s'articule donc autour de deux objectifs: proposer un modèleconceptuel de fonctionnement écologique des ZH soumises à des assèchements saisonniers etestimer la vulnérabilité écologique de communautés faunistiques vivant dans ces ZH, enconsidérant conjointement les peuplements benthiques et interstitiels (principalementCrustacés).Nos résultats démontrent que la morphologie des ZH (eau relativement courante, eaustagnante, apports phréatique) et leurs modes d'assèchement (formation de mouilles isoléesou assec complet) sont essentiels dans la structuration des communautés microbiennes etd'invertébrés et dans la réponse saisonnière de la biodiversité et des processus écologiques.L'intensification probable des étiages et des assèchements augmentera l'hétérogénéité spatialeet temporelle des habitats et leur richesse spécifique mais réduira la biodiversité globale desplaines alluviales (disparition des espèces rares). Ces étiages plus sévères modifieront lesprocessus écologiques, diminuant le recyclage de la matière organique et la qualité des eauxsuperficielles. Les recherches futures devraient s'orientées vers des stratégies et des moyensefficaces pour garantir la durabilité écologique des ZH.
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Plichard, Laura. "Modélisation multi-échelles de la sélection de l’habitat hydraulique des poissons de rivière." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSE1284/document.
Full textAbstract:
Le concept d’habitat, qui définit le lieu de vie des organismes par des conditions abiotiques et biotiques, est déterminant pour étudier les relations entre les organismes et leur environnement. La sélection d’habitat est le processus à travers lequel l’organisme va choisir l’habitat où il se trouve en fonction des différents habitats disponibles autour de lui. Cette sélection va dépendre d’un choix individuel, qui est propre à l’organisme (ex. son comportement), et d’un choix commun, qui est observable chez des organismes qui partagent des traits communs (ex. les individus d’une même espèce). Les modèles spécifiques de sélection d’habitat cherchent à expliquer et prédire ce choix commun, et sont notamment utilisés pour les cours d’eau dans les outils d'aide à la définition de débits écologiques. Pour les poissons de rivière, la plupart des modèles spécifiques à l’échelle du microhabitat sont peu transférables à d’autres rivières. En effet, ils sont construits à partir de données d’abondance échantillonnées dans le même site pendant quelques campagnes. Afin d’améliorer la qualité prédictive de ces modèles, j’ai développé une approche prometteuse de modélisation multi-sites et multi-campagnes permettant à la fois de considérer la réponse non linéaire de la sélection et la surdispersion des données d’abondance. A partir de suivis individuels par télémétrie, j’ai montré la pertinence des modèles de sélection spécifiques malgré la forte variabilité individuelle observée. Finalement, la sélection d’habitat étant dépendante de processus structurant les communautés et agissant à l’échelle du paysage, telle que la dispersion des individus, j’ai mis en évidence l’intérêt d’utiliser des techniques légères d’échantillonnage comme les observations par plongée pour caractériser les structures des communautés et leurs répartitions spatiales. Ces techniques permettront alors d’étudier l’influence des processus du paysage sur les modèles de sélection d’habitatThe habitat concept, which defines the place where organisms live, is composed by abiotic and biotic conditions and differs for examples between species or activities. The habitat selection is the process where organisms choose the habitat to live in function of all habitats available around them. This habitat selection depends on an individual choice related to the organism, for example its behavior and a common choice related to organisms sharing common traits as individuals from the same species. Specific habitat selection models are developed to understand and represent this common choice and used to build ecological flow tools. For freshwater fish, most of specific habitat selection models have low transferability between reaches and rivers. Indeed, they are built from abundance data and sampled in the same study reach during few numbers of surveys. In order to improve predictive quality of models, I developed an attractive modelling approach, both multi-reach and multi-survey, involving the non-linear response of habitat selection and abundance data overdispersion. Then, despite the high individual variability of habitat selection, I showed, from telemetry data, the relevance of developing specific habitat selection models. Finally, as the habitat selection is also depending on processes which influence community structures at the landscape scale (e.g. dispersal), I demonstrate the benefits of sampling methods such as snorkeling to characterize community structures and their longitudinal distributions at a large spatial scale. These techniques will allow studying the influence of landscape processes on habitat selection models
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Silva, Renato Henriques da. "Elements of the metacommunity structure : comparison across multiple metacommunities." Mémoire, 2011. http://www.archipel.uqam.ca/3947/1/M11952.pdf.
Full textAbstract:
Les « Éléments de la Structure des Metacommunautés » (EMS) est un outil analytique puissant pour l'évaluation des patrons de distributions d'espèces dans l'espace géographique ou environnementale; par contre, cette technique est encore sous-utilisée parmi les études écologiques. L'objectif de cette étude est d'évaluer les mécanismes structurants les patrons de distributions d'espèces de poissons de lacs boréaux à des multiples échelles en appliquant la technique EMS sur la Ontario Fish Distribution Database, une base de données contenant des informations sur la présence-absence des espèces de poissons de plus de 9000 lacs de l'Ontario ainsi que leurs positions géographiques. Pour chaque lac, l'information sur les variables environnementales on été obtenue grâce au Lake lnventory Database (LINY) et des indices spatiaux, comme la connectivité entre les lacs et leur distance aux refuges postglaciaires, ont été calculés à partir d'informations géographiques. Puis, la relation phylogénétique des espèces et leurs niches B on été estimés pour comprendre le rôle des espèces dans l'assemblage des communautés et formation des metacommunautés. Dans le premier chapitre, la technique EMS a indiqué que nestedness et Clementsian gradients sont les patrons de distributions les plus courants parmi les bassins versants. La pluparts des patrons nestedness se situent dans des bassins de faible énergie contenant des grands lacs et localisés dans de hautes latitudes tandis que les patrons Clementsian gradients sont rencontrés dans des conditions opposés. À l'échelle des bassins, les variables environnementales expliquent en moyenne 9.1% de la variation dans la distribution des espèces pour les deux type de patrons contre moins de 3.5% pour les variables spatiales. À l'échelle provinciale, la variation dans la distribution des espèces est expliquée principalement par les variables environnementales structurées spatialement (29,26%) suivit des variables environnementales indépendantes de l'espace (10.80%). Des tests statistiques suggèrent que le taux de changement dans la composition des communautés, la caractéristique qui mieux distingue les deux patrons, augmente du nord vers le sud, influencé principalement par la latitude et les variables associées (e.g., température). Dans le second chapitre, les résultats indiquent que, à l'échelle du bassin versant, la sous-dispersion phylogénétique prédomine tandis que la sur-dispersion phylogénétique est plus observée à l'échelle locale. La structure phylogénétique et de niche des communautés sont principalement influencés par la taille des lacs, les variables liées à l'énergie (e.g., température, degré-jour de croissance) et la latitude. Dans les régions du Nord, il y a des taux élevés de chevauchement des niches et de plus grande distance phylogénétique entre les espèces qui cohabitent alors que dans les bassins versants du Sud on rencontre le patron inverse.
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MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : EMS, analyse de correspondance, Clementsian gradients, distribution d'espèces, nestedness, species turnover, structure phylogénétique, niche, gradient environnemental