Academic literature on the topic 'Grippe équine'

L'objet de cette enquête était d'examiner l'incidence des virus de la grippe équine dans une population d'équidés d'Afrique tropicale où des foyers de grippe équine ont été récemment reportés pour la première fois. Une enquête sérologique à partir de sérums de chevaux et d'ânes de plusieurs régions du Nigéria, prélevés de 1990 à 1993, a été effectuée et les résultats obtenus ont été comparés avec des sérums provenant d'Irlande. La présence des anticorps a été testée à la fois par le test d'inhibition de l'hémagglutination et par le test ELISA en utilisant un anticorps monoclonal au prototype H3 du virus de la grippe équine, Aequine/Miami/1/63. Les résultats ont montré que la grippe équine était présente chez les chevaux et les ânes de toutes les régions du Nigéria.

L’enquête a été réalisée dans les zones de Sayes, Fangasso, Tominian et San, situées dans la région de Ségou, dans la partie sahélienne du Mali, et a porté sur 384 sérums asins et équins. Parmi les 95 sérums positifs (24,73 p. 100), 92 l’ont été au test d’inhibition de l’hémagglutination et trois à la réaction de fixation du complément. Les taux d’infection aux sous-types 1 et 2 du virus de la grippe équine ont été établis dans les différentes zones visitées : 7,37 p. 100 pour le sous-type 1, 69,47 p. 100 pour le sous-type 2 et 23,16 p. 100 pour les cas d’infection mixte associant les sous-types 1 et 2. L’enquête a aussi permis d’établir que le taux d’infection pour la maladie a varié selon l’espèce animale : il a été plus important chez les asins (35,02 p. 100).

Dans le cadre d'une enquête épidémiologique nationale, les auteurs ont recherché, par le test d'inhibition de l'hémagglutination et par le test de Coggins (immunodiffusion double en gélose), les titres en anticorps envers le virus de la grippe équine (2 sous-types: A/equi/1/Prague 56 et A/equi/2/Miami 63) et l'anémie infectieuse, sur 433 et 533 équidés respectivement, vivant dans le nord-est de la Tunisie. 13,6 % des sérums des équidés sont positifs envers la grippe équine, alors que tous les sérums sont négatifs pour l'anémie infectieuse des équidés. Ces résultats sont discutés en les rapprochant de ceux déjà obtenus par d'autres auteurs en Tunisie et dans des pays voisins.

Des globules rouges de mouton stabilisés par traitement à la glutaraldéhyde ont été employés avec succès dans les tests d'hémagglutination par le virus de la maladie de Newcastle et celui de la grippe équine. La fixation a permis de conserver les globules rouges pendant 21 jours, sans perte de leur pouvoir agglutinant. La meilleure stabilité était obtenue lorsque les cellules étaient congelées à -114°C dans la phase gazeuse de l'azote liquide.

Contexte : Les changements climatiques jouent un rôle important dans l’établissement et l’expansion géographiques des zoonoses. Il est donc essentiel de connaître les populations à risque de contracter ces maladies pour ensuite orienter les politiques et les pratiques en santé publique. Au Québec, 14 zoonoses ont été identifiées importantes pour la santé publique afin de guider les efforts d’adaptation aux changements climatiques des décideurs et des chercheurs. Cette étude vise donc à dresser un portrait des professions et des secteurs d’activité économique à risque pour ces zoonoses. Méthode : Un examen rapide de la littérature scientifique a été réalisé. Des recherches ont été effectuées dans les bases de données des plateformes de recherche Ovid et EBSCO afin de repérer des articles publiés entre 1995 et 2018, en anglais et en français, sur 14 zoonoses (campylobactériose, cryptosporidiose, Escherichia coli vérocytotoxinogène, giardiase, listériose, salmonellose, encéphalite équine de l’Est, maladie de Lyme, virus du Nil occidental, botulisme d’origine alimentaire, fièvre Q, grippe aviaire et porcine, rage, syndrome pulmonaire à hantavirus) et la santé au travail. La recherche documentaire a permis de repérer 12 558 articles et, après élimination des doublons, 6 838 articles ont été évalués en fonction du titre et du résumé. Les articles admissibles devaient aborder les deux concepts de base de la recherche (zoonoses priorisées et santé des travailleurs). Parmi les 621 articles jugés admissibles, 110 ont été retenus à la suite de leur lecture intégrale. Résultats : Parmi les zoonoses à l’étude, les zoonoses entériques ont été les plus fréquemment rapportées. L’agriculture, qui inclut les services vétérinaires, les services de l’administration publique, de même que les services médicaux et sociaux, ont été les secteurs les plus fréquemment identifiés dans la littérature. Conclusion : Les résultats de notre étude aideront les autorités de la santé publique et les décideurs à cibler les secteurs et les professions qui sont particulièrement à risque pour l’acquisition de zoonoses. Ils permettront également d’optimiser les pratiques de santé publique des acteurs responsables de la santé des travailleurs.

Cet article s’intéresse aux facteurs de succès des reprises d’entreprises par une équipe de salariés en SCOP. En mobilisant 6 études de cas, réalisées à travers 46 entretiens semi-directifs avec les membres des équipes de reprises et les experts qui les ont accompagnés, il met en exergue l’importance d’un facteur jusqu’ici ignoré par les chercheurs : « la maturité équirepreneuriale » de l’équipe de reprise. Au-delà de cet apport théorique, cet article aboutit à des contributions managériales qui s’adressent tant aux équipes de reprises qu’aux institutions qui les accompagnent, notamment grâce à l’élaboration d’une grille d’évaluation de cette maturité.

Résumé L’étude examine les interactions de 16 élèves de 5e année du primaire formant quatre équipes placés en situation d’apprentissage coopératif soutenu par ordinateur, et leurs performances à l’écrit. L’analyse distingue aussi les interactions d’apprentissage selon les étapes du processus d’écriture. La performance à l’écrit est évaluée selon la grille du ministère de l’Éducation du Québec de 1993. Les résultats indiquent que les messages portent surtout sur la dimension sociale et émotive, et sur la première étape du processus d’écriture. Dans une équipe, la performance à l’écrit est restée stable tandis que dans les trois autres, il s’est produit une fluctuation menant à une baisse de la performance. La discussion identifie des facteurs susceptibles d’expliquer ces résultats.

L’interprofessionnalité en santé est dans l’air du temps. Demandez autour de vous, on vous répondra : « c’est l’avenir ! » À tel point que ce terme est devenu un mot éponge, que tout le monde utilise sans en connaître ni le sens ni les implications. Son absence de référencement dans les dictionnaires les plus couramment utilisés n’aide pas. Selon l’Organisation mondiale de la santé, l’interprofessionnalité correspond à « une activité qui se concrétise lorsque des spécialistes issus d’au moins deux professions travaillent conjointement et apprennent les uns des autres au sens d’une collaboration effective qui améliore les résultats en matière de santé » dans la mesure où « aucune profession ne peut fournir à elle seule une gamme complète de soins ». Ainsi, l’interprofessionnalité est plus que la simple juxtaposition des différentes professions, mais le résultat d’une co-construction autour d’un projet commun, fidèle à la maxime attribuée à Aristote « Le tout est plus que la somme des parties. » Les ingrédients nécessaires à cet aboutissement ne sont pas clairement décrits. Cela nécessite évidemment une interconnaissance ; mais si celle-ci est nécessaire, elle n’est pas suffisante. La proximité des acteurs est aussi nécessaire, mais insuffisante. La répétition des contacts dès la formation initiale, le respect mutuel obéissent à ce même principe. On pourrait enchaîner longtemps cette liste de critères nécessaires mais non suffisants. Finalement, il est nécessaire de développer une dynamique de groupe, qui ne peut s’installer que progressivement, en travaillant, en se formant, et en évoluant ensemble sur un territoire, avec ses possibilités, contraintes, ressources et besoins propres. Où en est-on aujourd’hui ? Une certaine ébauche de structuration interprofessionnelle existe, mais elle se heurte à l’inorganisation du système de santé et à des atavismes d’un autre âge : logiciels métier verrouillés et difficilement inter-opérants ; logiciels théoriquement labélisés « pluriprofessionnels » mais n’incluant que quelques professions de santé ; financements centrés sur une partie des professionnels et guidés par une grille qui ne tient compte que de critères administratifs ayant essentiellement l’avantage d’être aisément dénombrables ; changements périodiques des modes de rémunération afin d’apporter à chaque fois « plus de pérennité », dont la temporalité n’est pas celle de la construction d’une équipe, etc. À l’heure actuelle, en France, l’interprofessionnalité en santé en est à ses balbutiements. Le parallèle avec l’écologie peut être fait, car là aussi « c’est l’avenir ! »… Personne n’est contre, tout le monde veut en être, mais sans réellement changer de fonctionnement. Pour aller au-delà de l’affichage et que l’interprofessionnalité ne soit pas qu’un mot clé, elle doit se construire. Or, cette construction ne peut se faire qu’à l’échelle d’un territoire, et par ses acteurs. Les équipes souhaitant investir ce champ doivent se constituer de façon fonctionnelle et non par rapport à une grille d’objectifs, centrée sur une partie des acteurs. Cette construction ne peut se faire que dans un système de soins organisé autour de différents niveaux de soins complémentaires. Pour continuer le parallèle avec l’écologie, on ne peut espérer l’établissement d’une biodiversité pérenne en retournant la terre tous les six mois. Une équipe interprofessionnelle doit gagner en maturité pour passer d’une somme d’individualités bienveillantes à un collectif synergique et fonctionnel centré sur le patient et au service du patient.

Le virus influenza équin (EIV) appartient à la famille des Orthomyxoviridae et est l’un des pathogènes respiratoires les plus importants des équidés notamment en raison des pertes économiques considérables que ces épizooties peuvent entrainer. Chez le cheval, l’infection par le virus grippal entraîne une morbidité importante et de rare cas de mortalité sont décrits, le plus souvent dus à une infection secondaire par des bactéries. Bien qu’il existe des vaccins depuis les années soixante, des épidémies, causées par le sous-type H3N8, sont enregistrées un peu partout dans le monde, Suède, Japon, Australie et France. Parmi les problématiques actuelles liées au virus de la grippe équine, ce travail de thèse s’intéresse, d’une part, au virus lui-même en étudiant la diversité moléculaire des souches et un éventuel lien avec la virulence et, d’autre part, à l’hôte en étudiant l’absence de réponse vaccinale optimale chez certains chevaux. La problématique des faibles répondeurs est un phénomène admis mais mal connu chez les chevaux. Le premier point a permis de renforcer la surveillance des souches d’EIV circulant en France et d’apporter de nouvelles notions sur les mécanismes de virulence. Lors du second point, un suivi, par la réalisation de tests SRH, de la réponse immunitaire humorale stimulée au cours de la primo-vaccination contre la grippe équine a été réalisé chez 202 poulains. Celui-ci a permis de définir, la fréquence des individus n’ayant pas développé une réponse immunitaire adéquate et d’identifier deux facteurs indépendants jouant un rôle majeur dans l’établissement de cette réponse : l’âge du poulain et la présence d’anticorps maternels ; L’évaluation, au cours d’une étude préliminaire, des niveaux d’expression (ARNm) des cytokines induites après immunisation contre l’EIV n’a pas permis d’identifier de facteurs intrinsèques qui seraient associés à la faible réponse vaccinale
The equine influenza virus (EIV) belongs to the family Orthomyxoviridae and is one of the most important equine respiratory pathogens, especially due to the economic losses associated with outbreaks. In horses, infection with the influenza virus causes significant morbidity. Mortality is uncommon and mostly associated with complications, such as secondary bacterial infections. Although there are vaccines since the 60’s, outbreaks, caused by the H3N8 subtype, are recorded around the world, including Sweden, Japan, Australia and France. Among the current issues related to EIV, this thesis focuses on both the pathogen and the host. , The molecular diversity of EIV strains and a possible link with virulence was investigated. This work involved a monitoring of EIV strains circulating in France and brought new notions about virulence mechanisms. The problem of low responder is a phenomenon accepted but not well understood in horses. The second aspect of this thesis was to study sub-optimal response to immunisation observed in some horses. The humoral immune response monitored, through the performance of SRH tests, in 202 foals during the primary course of vaccination against equine influenza. Results allowed to define the frequency of individuals that did not develop an adequate immune response and to highlight two independent factors playing a major role in the establishment of this sub-optimal response: the age of the foal and the presence of maternal antibodies at the time of first immunisation. In a preliminary study, evaluation of mRNA cytokines expression levels induced after EI immunization did not allow identification of intrinsic factors associated with low vaccination response

Les virus influenza équin (EIV) et herpèsvirus équin-1 (EHV-1) sont fréquemment décrits dans de nombreux pays et sont deux pathogènes endémiques au sein de la population équine française. Ces maladies infectieuses ont d’importantes conséquences aussi bien au niveau santé et bien-être animal qu’en terme d’impact économique. La lutte contre ces virus repose essentiellement sur la mise en place de mesures préventives telles que la vaccination. Malgré cela, les épizooties d’EIV et d’EHV-1 sont régulièrement observées en France et dans le monde. Les anticorps neutralisants, synthétisés en réponse à l’infection ou après immunisation, représentent une ligne de défense majeure. L’amélioration des vaccins et l’enrichissement du panel d’outils de mesure des anticorps neutralisants peuvent constituer un apport stratégique dans la lutte contre ces virus. Afin d’améliorer l’efficacité de la réponse vaccinale en amplitude et dans le temps, l’utilisation d’adjuvants constitue une des voies de recherche prometteuse. Ce travail de thèse a consisté, dans un premier temps, à établir la preuve de concept de l’utilisation de l’iPPVO en tant qu’adjuvant innovant in vivo chez le cheval dans le cadre de la vaccination contre l’EIV. Pour cela, les anticorps ont été mesurés par SRH, méthode pour laquelle des corrélats de protection sont associés au taux d’anticorps mesuré. L’ajout d’iPPVO lors de la vaccination a permis d’augmenter significativement le niveau d’anticorps contre l’EIV ainsi que le niveau de protection des chevaux jusqu’à 6 mois après l’immunisation. Dans un second temps, une méthode de mesure des anticorps anti-EIV faisant appel à l’impédancemétrie a été développée afin d’enrichir les méthodes actuelles et faciliter l’analyse à haut débit. Cette méthode de séroneutralisation a présenté une bonne corrélation avec les valeurs de titres SRH. Une seconde étude a testé, le potentiel adjuvant de l’iPPVO in vivo chez le cheval dans un modèle de vaccination contre l’EHV-1,4. La réponse en anticorps mesurée par séroneutralisation a été augmentée jusqu’à 5 mois suivant l’immunisation. Enfin, des résultats préliminaires sur le mécanisme d’action de l’iPPVO sur les cellules mononucléées du sang périphérique a permis de mettre en évidence l’importance de la réponse interféron
Equine influenza virus (EIV) and equine herpesvirus-1 (EHV-1) are frequently described in many countries and are two endemic pathogens in the French equine population. These infectious diseases have important consequences both in terms of animal health and welfare and in terms of economic impact. The fight against these viruses is essentially based on the implementation of preventive measures such as vaccination. Despite this epizootics of EIV and EHV-1 are regularly declared in France and throughout the world. Neutralising antibodies, synthesised in response to infection or after immunisation, represent the main line of defence against these viruses. Improved vaccines and a wider range of tools to measure neutralising antibodies can be a valuable strategy in the fight against these viruses. In order to improve the efficacy of the vaccine response, both in magnitude and duration, the use of adjuvants is one way to improve immunogenicity. This thesis consisted, in the first instance, in establishing the proof of concept of the use of iPPVO as an innovative adjuvant in vivo in horses in the context of vaccination against EIV. For this purpose, antibodies were measured by SRH, a method for which the correlates of protection are well defined. The addition of iPPVO at vaccination significantly increased the antibody level to EIV and protection in horses up to 6 months after immunisation. In a second step, a new method for measuring EIV antibodies in serum based on impedancemetry was developed to improve on current methods and facilitate high throughput analysis. This neutralisation test correlated well with SRH test. Another study was performed, which demonstrated the adjuvant potential of iPPVO in horses during vaccination against EHV-1,4. The antibody response measured by serum neutralisation increased up to 5 months after immunisation. Finally, preliminary results on the mechanism of action of iPPVO on peripheral blood mononuclear cells demonstrated the importance of the interferon

Les virus influenza sont des virus enveloppés, à ARN négatif segmenté en 8 segments génomiques. Ils sont classés dans la famille des Orthomyxoviridae. Ce sont les agents étiologiques de la grippe, une maladie respiratoire qui touche de nombreuses espèces mammifères et aviaires. La grippe équine est causée par les sous-types H3N8 et H7N7 du virus influenza de type A, ce dernier s'étant éteint depuis les années 1970. Malgré l'existence d'un vaccin, la France a connu plusieurs épidémies de H3N8 depuis les années 2000. Pour réduire l'impact économique important de ces épidémies pour l'industrie équine, il est nécessaire d'établir des tests de diagnostic rapides, robustes et applicables sur le terrain pour limiter au plus la circulation du virus et en identifier les déterminants de virulence et caractériser la dérive antigénique.Nous avons étudié les potentialités de la technique de séquençage dite « long read » développée par Oxford Nanopore Technologies. Nous avons réalisé une caractérisation du génome complet de deux virus H3N8 équins ayant circulé en France en 2009 et 2018 (A/équine/Paris/1/2018 et A/équine/Beuvron-en-Auge/2/2009, deux virus de la clade 1 Florida) ainsi que des deux souches du vaccin couramment utilisé en France.Nos résultats ont démontré la fiabilité de cette technique de séquençage à partir d'amplicons des huit segments génomiques des quatre virus analysés ainsi que la capacité à réaliser des lectures fiables à partir du séquençage direct des ARN viraux (résultats présentés dans une première partie). L'analyse de la séquence en acides aminés de l'hémagglutinine HA des souches circulantes ont mis en évidence une très légère dérive antigénique par rapport aux souches vaccinales avec des substitutions spécifiques comme T161I dans A/equine/Paris/1/2018 and N188T dans les souches post-2015, deux substitutions localisées dans le site antigénique B. Le site antigénique E montre également des modifications dans les souches post-2018, avec la substitution N63D.Le segment génomique 2 code pour une des trois sous-unités de l'ARN-polymérase virale, PB1 ainsi que pour une protéine accessoire, PB1-F2, d'un cadre de lecture alternatif. PB1-F2 est reconnu comme un déterminant de virulence. Alors que la souche A/équine/Paris/1/2018 code pour un variant de 90 acides aminés de long, de nombreuses souches, dont A/équine/Beuvron-en-Auge/2/2009, code pour un variant de seulement 81 résidus. Des essais biologiques et de biochimie ont été réalisés pour caractériser les propriétés de chacune de ces deux formes de PB1-F2. Dans un essai où la forme longue de PB1-F2 est exprimée en cellules eucaryotes sans autre constituant viraux, elle abolit le potentiel membranaire de la mitochondrie cellulaire. Mise en présence de vésicules synthétiques mimant la membrane externe de la mitochondrie, la forme longue de PB1-F2 les perméabilise plus efficacement que la forme courte. Les analyses de séquence en acides aminés des protéines virales (de HA et PB1-F2 essentiellement) sont présentées dans une deuxième partie.Afin de valider l'impact de PB1-F2 sur la virulence en contexte infection, nous avons cherché à établir un système de génétique inverse pour le virus A/équine/Paris/1/2018 (troisième partie). Pour se faire, les 8 segments génomiques ont été clonés dans le plasmide pRF483 permettant d'assurer la synthèse des brins d'ARN génomiques et l'expression des protéines virales. La séquence des inserts de chacun des plasmides a été validée. Pour valider le fonctionnement du complexe réplicatif codé par 4 des 8 segments viraux clonés dans pRF483 (PA, PB1, PB2 et NP), ces plasmides ont été transfectés avec un plasmide codant pour le segment génomique NA dans lequel son cadre de lecture a été substitué par un gène reporter, la luciférase. Dans ces conditions expérimentales, une activité du complexe ARN-polymérase a été détectée. Ces essais seront prolongés pour la production de virus recombinants par transfection des 8 plasmides construits
Influenza viruses are enveloped, their genome being segmented into 8 negative RNA segments. They are classified in the Orthomyxoviridae family. They are the etiological agents of the flu, a respiratory disease that affects many mammalian and avian species. Equine influenza is caused by the H3N8 and H7N7 subtypes of the type A influenza virus, the latter being extinct since the 1970s. Despite the existence of a vaccine, France has experienced several H3N8 epidemics since the 2000s. To reduce the significant economic impact of these epidemics for the equine industry, it is necessary to establish rapid, robust, and on-terrain applicable diagnostic tests to limit the circulation of the virus as much as possible and identify its virulence determinants as well as characterize antigenic drift.We studied the potential of the so-called “long read” sequencing technique developed by Oxford Nanopore Technologies. We carried out a characterization of the complete genome of two equine H3N8 viruses that circulated in France in 2009 and 2018 (A/equine/Paris/1/2018 and A/equine/Beuvron-en-Auge/2/2009, two viruses of clade 1 Florida) as well as the two strains of the vaccine commonly used in France.Our results demonstrated the reliability of this sequencing technique using amplicons of the eight genomic segments of the four viruses analyzed as well as the ability to produce reliable readings from direct sequencing of viral RNA (results presented in the first part). Analysis of the amino acid sequence of hemagglutinin HA of circulating strains demonstrated a very slight antigenic drift compared to vaccine strains with specific substitutions such as T161I in A/equine/Paris/1/2018 and N188T in the post-2015 strains, two substitutions located in the antigenic site B. The antigenic site E also shows modifications in the post-2018 strains, with the N63D substitution.Genomic segment 2 encodes one of the three subunits of the viral RNA polymerase, PB1, as well as an accessory protein, PB1-F2, of an alternative reading frame. PB1-F2 is recognized as a virulence determinant. While the A/equine/Paris/1/2018 strain encodes a variant 90 amino acids long, many strains, including A/equine/Beuvron-en-Auge/2/2009, encode a variant only 81 residues. Biological and biochemical tests were carried out to characterize the properties of each of these two forms of PB1-F2. In an assay where the long form of PB1-F2 is expressed in eukaryotic cells without other viral constituents, it abolishes the membrane potential of the cellular mitochondria. Placed in the presence of synthetic vesicles mimicking the mitochondrial outer membrane, the long form of PB1-F2 permeabilizes them more effectively than the short form. Amino acid sequence analyzes of the viral proteins (mainly HA and PB1-F2) are presented in a second part.In order to validate the impact of PB1-F2 on virulence in an infectious context, we sought to establish a reverse genetics system for the A/equine/Paris/1/2018 virus (third part). To do this, the 8 genomic segments were cloned into the pRF483 plasmid to ensure the synthesis of genomic RNA strands and the expression of viral proteins. The sequence of the inserts of each of the plasmids was validated. To validate the functioning of the replicative complex encoded by 4 of the 8 viral segments cloned in pRF483 (PA, PB1, PB2 and NP), these plasmids were transfected with a plasmid coding for the NA genomic segment in which its reading frame was substituted. by a reporter gene, luciferase. Under these experimental conditions, activity of the RNA-polymerase complex was detected. These tests will be extended for the production of recombinant viruses by transfection of the 8 constructed plasmids

L’Institut National des Produits Chimiques de l’Académie des Sciences du Vietnam (INPC) développe depuis plusieurs années une activité autour de la recherche de nouveaux médicaments issus de la biodiversité. Le développement d’un nouveau médicament prend de l’ordre d’une dizaine d’années et passe par plusieurs phases. Dans la phase de découverte, l’activité des composés chimiques sur une cible biologique est mesurée afin de mettre en évidence une action inhibitrice. Le développement d’approches in silico pour le criblage virtuel des composés chimiques est une alternative aux approches classiques in vitro beaucoup plus coûteuses à mettre en œuvre. L’utilisation de la grille a été identifiée comme une voie économiquement prometteuse pour accompagner la recherche de nouveaux médicaments au Vietnam. En effet, le développement de nouvelles stratégies basées sur l’utilisation de plates-formes de soumission de tâches (DIRAC, HTCaaS) a permis d’améliorer considérablement le taux de succès et le confort des utilisateurs, ouvrant la voie à une démocratisation de la grille.Dans ce contexte, l’objectif poursuivi dans le cadre de cette thèse est d’étudier dans quelle mesure des plates-formes multidisciplinaires pouvaient répondre aux besoins des chimistes de l’INPC. Le travail s’est concentré sur les modalités d’un partage équitable d’une plate-forme de soumission de tâches sur la grille par une ou plusieurs communautés d’utilisateurs. L’ordonnancement des tâches sur un serveur commun doit permettre que les différents groupes aient une expérience positive et comparable. Sur les infrastructures de grille EGEE et EGI en Europe , on peut distinguer deux grandes catégories d’utilisateurs : les utilisateurs « normaux » qui vont solliciter les ressources pour des tâches requérant typiquement de quelques dizaines à quelques centaines d’heures de calcul, et les « gros » utilisateurs qui vont lancer des grandes productions nécessitant le traitement de plusieurs milliers de tâches pendant des dizaines, voire des centaines de milliers d’heures de calcul. Les stratégies d’ordonnancement déployées aujourd’hui sur les plates-formes comme DIRAC ou HTCaaS ne permettent pas de servir de façon optimale et simultanée ces deux familles d’utilisateurs.Le manuscrit présente une évaluation par simulation des performances de plusieurs stratégies d’ordonnancement des tâches d’une plate-forme soumettant des jobs pilotes. L’outil SimGrid a permis de simuler l’infrastructure de grille régionale déployée en Auvergne à partir de traces archivées de son utilisation. Après évaluation des performances de plusieurs politiques d’ordonnancement tirées de la littérature, une nouvelle politique a été proposée dans laquelle les utilisateurs normaux et les très gros utilisateurs sont gérés de façon indépendante. Grâce à cette politique, le ralentissement expérimenté par les très gros utilisateurs est réduit significativement sans pénaliser excessivement les utilisateurs normaux. L’étude a été étendue à une fédération de clouds utilisant les mêmes ressources et arrive aux mêmes conclusions. Les performances des politiques d’ordonnancement ont ensuite été évaluées sur des environnements de production, à savoir l’infrastructure de grille européenne EGI et l’infrastructure nationale de supercalculateurs de la Corée du Sud. Un serveur DIRAC a été adossé aux ressources de l’organisation virtuelle biomédicale d’EGI pour étudier les ralentissements observés par les utilisateurs de ce serveur. Pareillement, les ralentissements expérimentés par les utilisateurs de la plate-forme HTCaaS au KISTI ont été observés en excellent accord avec les résultats de simulation avec SimGrid.Ces travaux confirment la faisabilité et l’intérêt d’une plate-forme unique au Vietnam au service des communautés scientifiques consommatrices des ressources académiques de grille et de cloud, notamment pour la recherche de nouveaux médicaments
Virtual Screening (VS) is a computational technique used in the drug discovery process to select the most promising candidate drugs for in vitro testing from millions of chemical compounds. This method can offer an efficient alternative to reduce the cost of drug discovery and platform. The Natural Products Chemistry Institute of the Academy of Sciences of Vietnam (INPC) collects samples from local biodiversity and determines the 3D structure of single molecules. Their challenge is to set up a virtual screening platform on grid computing for their chemists to process their data. However, as the number of users who might have a wide range of virtual screening applications (in terms of the number of tasks and execution time) increases with limited available computing resources, it becomes crucial to devise an effective scheduling policy that can ensure a certain degree of fairness, user satisfaction and overall system throughput. In this context, the thesis focuses on an effective scheduling policy for the virtual screening workflow where multiple users with varying numbers of tasks are actively sharing a common system infrastructure. We have researched in theory and proposed some candidate policies. With the simulation results and the experimentation results in real system, we proposed the best policy for the fairness between users, which can be applied to INPC virtual screening platform

Les TIC et plus globalement le numérique sont le plus souvent saisis dans leur immédiateté. Comme si le numérique était voué à ce que F. Hartog a nommé le « présentisme ». Il semblerait que ces technologies soient toujours nouvelles, comme extraites de la dynamique historique, ce qui participe de L’impensé numérique. Or, elles possèdent également leurs propres dimensions temporelles, au pluriel, pour ne pas sacrifier la complexité de leur rapport au temps. Ce livre en deux tomes voudrait, sur le mode des sciences sociales et non de la philosophie, réinvestir cette question des temporalités numériques. Ce premier tome propose ainsi une histoire problématisée des TIC, comme archéologie du numérique, qui lie histoire et concepts au lieu de les séparer. Parce qu’il faut historiciser les concepts pour mieux en tester la pertinence et voir s’ils tiennent dans le temps. Parce qu’il faut équiper de concepts cette histoire qui ne peut pas être restituée sans que les enjeux politiques des TIC et du numérique ne soient clairement discernés. D’où cette Dynamique des TIC qui présente une véritable grille de lecture pédagogique de l’histoire des TIC et du numérique depuis la fin du XVIIIe siècle. Elle en dégage les grandes lignes de force (la tension entre l’état et le marché, la montée en puissance du grand nombre, la multiplication de l’espace, la densification et l’accélération temporelle, l’omniprésence de la logistique informationnelle) et les trois grandes phases (de lubrification, d’installation et de domination). Histoire mondiale. Histoire politique. Histoire économico-gestionnaire aussi. Histoire, en définitive, du processus que j’ai nommé la « gestionnarisation » de la société. Le livre qu’on va lire a été rédigé pour l’essentiel voilà 25 ans. Victime de l’impensé à l’époque, il n’était pas question de le réécrire, ce qui l’aurait fait disparaître. Une postface revient en détail sur la manière dont son système conceptuel permet d’éclairer encore aujourd’hui, avec efficacité, l’actualité économique et politique du numérique. Et c’est bien tel qu’il est, synthèse historique et témoin d’une histoire tout à la fois, qu’il peut oeuvrer à lutter contre cet impensé en participant à l’installation d’une culture historique des enjeux politiques et économico-gestionnaires du numérique.

Des membres de la communauté scientifique de l’Obvia ont élaboré une grille de réflexivité portant sur les enjeux éthiques des systèmes d’intelligence artificielle (SIA) et construite à partir des 10 principes qui composent la Déclaration de Montréal pour un développement responsable de l’intelligence artificielle. Se présentant sous la forme d’un questionnaire avec réponses ouvertes, cette grille a été conçue pour accompagner les membres des équipes qui font la conception, l’opérationnalisation et la gestion de SIA dans la prise en compte des enjeux éthiques découlant du développement et de l’utilisation de ces nouvelles technologies. S’inscrivant dans une perspective de recherche participative et visant le développement d’outils éthiques utiles aux praticiennes et praticiens, cette grille se veut en évolution constante à la lumière des besoins et de l’expérience des acteurs et des actrices susceptibles de l’utiliser.