Dissertations / Theses: 'Fruits de tomate'

1

How, Kit Alexandre. "Contrôle épigénétique du développement et de la qualité des fruits de tomate." Thesis, Bordeaux 1, 2008. http://www.theses.fr/2008BOR13741/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L’étude du contrôle de l’expression des gènes a été, au cours de ces dernières années, révolutionnée par la découverte des régulations épigénétiques. Parmi les différents acteurs participant à ces régulations se trouvent les protéines du groupe Polycomb (PcG). Ces protéines, initialement découvertes chez la drosophile, sont responsables de la mise en place et du maintien de "marques épigénétiques" au niveau de gènes cibles, qui sont alors réprimés. Les protéines PcG agissent sous forment de trois complexes dinstincts chez les animaux nommés PRC1 (Polycomb Repressive Complex 1), PRC2 (Polycomb Repressive Complex 2) et PhoRC (Pleiohomeotic Repressive Complex); le PRC2 possédant une activité histone méthyltransférase de type H3 K9/27. Chez les plantes, seules trois classes de protéines PcG sont retrouvées: la classe des Enhancer of zeste E(z), des Extra Sex Combs (ESC) et des Supressor of zeste 12 (Su(z)12), formant le complexe PRC2. Leur rôle dans le développement des plantes a été mis en évidence chez Arabidopsis, au niveau du gamétophyte femelle et de la graine, du maintien de l’état végétatif, de l’identité florale et de la vernalisation. Cependant leur implication dans le développement du fruit reste inconnue. Mon travail a permis d'identifier et de caractériser deux gènes PcG de la classe des E(z) de tomate exprimés dans le fruit, nommés SlEZ1 et SlEZ2. Les proteines SlEZ1 et SlEZ2 présentent l’ensemble des domaines caractéristiques des protéines de cette classe et sont localisées dans les noyaux. Les expériences de double hybride révèlent que les protéines SlEZ1 et SlEZ2 sont capables de former des complexes de type PRC2 avec certaines autres protéines PcG de tomate (de type ESC et Su(z)12). Ceci suggère que SlEZ1 et SlEZ2 sont effectivement des protéines fonctionnelles. L’analyse de des profils d’expression des gènes SlEZ1 et SlEZ2 révèle une expression ubiquitaire dans la plante au niveau de l’appareil végétatif, de la fleur et dans le fruit. Cependant, dans la fleur, seul SlEZ1 présente une expression dans les étamines tandis que les ARNm de SlEZ2 sont présent de façon spécifique dans le tissu de transmission du style. Dans le fruit, SlEZ1 est exprimé de façon constante, tandis que SlEZ2 semble faiblement exprimé dans les fruits en cours de mûrissement. Afin d’identifier la fonction de SlEZ1 dans le développement du fruit, des plantes transgéniques sous-exprimant SlEZ1 de façon constitutive ont été générées. Elles présentent une morphologie altérée de la fleur: les étamines sont torsadées et ne forment pas de cône staminal fermé. De plus, une augmentation du nombre moyen de carpelles par fruit est observée
The control of gene expression has been challenged by the discovery of epigenetic regulation. Among the different factors involved in epigenetic regulations, the Polycomb (PcG) proteins are known to repress gene expression by setting epigenetic marks. The PcG protein, initially discovered in drosophila, act together in three distinct complexes named PRC1 (Polycomb Repressive Complex 1), PRC2 (Polycomb Repressive Complex 2) and PhoRC (Pleiohomeotic Repressive Complex). PRC2 complexes methylate histone H3 on lysines K9/27. In plants, only three classes of PcG protein has been found: the Enhancer of zeste (E(z)) class, the Extra Sex Combs (ESC) class and the Supressor of zeste 12 (Su(z)12) class, which belong to the PRC2. Their function in plant development has been brought to light in Arabidopsis thaliana. They control female gametophyte and seed development, maintain the vegetative development, and are involved in floral identity and vernalization. However, their function in fruit development is still unknown. My work was aimed to identify and characterize two PcG genes, named SlEZ1 and SlEZ2, encoding tomato E(z) class proteins. SlEZ1 and SlEZ2 proteins contain all the five E(z) characteristic domains and are both localized in the nucleus. Furthermore, as double-hybrid experiments reveal that both SlEZ1 and SlEZ2 proteins are able to form PRC2 complexes and interact with PcG proteins of other classes (ESC and Su(z)12 classes), it seems that these proteins are functional. Their expression profiles reveal ubiquitous expression during vegetative development (leaves, buds, stems) and reproductive development (flowers and fruits). However SlEZ1 is specifically expressed in the stamens whereas SlEZ2 shows specific expression in the transmitting tissue of the style. Moreover, their expression during fruit development shows some differences: if SlEZ1 expression is almost constant, SlEZ2 expression decreases during fruit development. In order to indentify SlEZ1 functions in fruit development, transgenic plants underexpressing constitutively SlEZ1 have been generated. These plants present altered flower morphology with twisted stamens and increased carpel number fruits

2

Chen, Yi. "Ethylene receptors modulate fruit development and ripening." Thesis, Toulouse, INPT, 2019. http://www.theses.fr/2019INPT0073.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L'éthylène est synthétisé et perçu par toutes les plantes. C'est l'une des phytohormones les plus importantes contrôlant la maturation des fruits. L'éthylène est perçu par les protéines localisées au niveau du réticulum endoplasmique (RE), appelées récepteurs éthylène (ETR), qui régulent le développement et la maturation des fruits, mais les mécanismes par lesquels ils fonctionnent ne sont pas encore tous connus. Premièrement, pour étudier si les ETRs régulent le mûrissement des fruits climactériques et non climactériques, nous avons comparé les ETRs et les protéines apparentées des deux catégories de fruits et en analysant à nouveau des données RNAseq déjà publiées. Nous avons constaté que les ETRs atteignaient leur maximum d’expression au début du mûrissement à la fois dans les fruits climactériques et non climactériques, mais dans ces derniers, les ETRs ont un pic d’expression plus précoce par rapport à l’accumulation de sucres. Dans cette étude, nous avons également comparé la structure des ETRs et des protéines apparentées dans les deux classes de fruits, établissant ainsi une base pour l'annotation de gènes liés à la perception de l'éthylène. Enfin, les résultats ont montré qu'il y avait un plus grand nombre de gènes ETRs dans les fruits climatériques que dans les fruits non climatériques. Deuxièmement, chez la tomate, qui est un modèle de maturation des fruits charnus, un septième ETR a été trouvé récemment, suite au séquençage du génome. La caractérisation de ce SlETR7 a été réalisée. Nous avons montré que l’éthylène se lie à la partie transmembranaire de SlETR7. L'expression de SlETR7 augmente dans le péricarpe lorsque les fruits mûrissent, comme pour d’autre ETRs. Les profils d’expression des 7 ETRs au cours de la maturation des fruits peuvent être divisés en 2 groupes: le groupe 1, ETR3, ETR4 et ETR6 qui sont exprimés plus tôt à Breaker + 2 jours que les ETRs du groupe 2, ETR1, ETR2, ETR5 et ETR7. Nous avons construit des lignées de tomates Knock Out (KO) et OverExpressed (OE) pour SlETR7, et nous avons observé certains changements de phénotypes prouvant que SlETR7 est un ETR fonctionnel. Alors que les plantes et les fruits KO ne présentaient qu'un faible changement phénotypique: production d'éthylène supérieure à Br et 2 jours comparée à Wild Type (WT), les lignées OE montraient une floraison précoce, des plantes plus courtes et des fruits plus petits que WT. Les analyses de l'expression de 7 ETRs dans les lignées KO et OE ont révélé que d'autres ETR sont régulées positivement chez les mutants de KO, ce qui peut expliquer l'absence de phénotype évident. Et cela suggère que SlETR7 n'est peut-être pas essentiel pour la maturation des fruits. Troisièmement, en ce qui concerne les études des 7 ETRs de tomate, l’absence de méthode fiable pour les quantifier, au niveau protéine, constitue un obstacle majeur. Une méthode protéomique ciblée a été développée, PRM pour Parallel Reaction Monitoring, et cela a permis l'identification et la quantification relative des sept ETRs de tomate. Ce développement appliqué à l’étude des tomates WT et des mutants Never Ripe (NR) montre qu’il existe une sur-accumulation de ETR3 mutée qui pourrait être la cause de l’inhibition de maturation des tomates NR, qui restent oranges. En effet cette protéine ETR3 mutée, gain-de-fonction, bloque la signalétique éthylène même en présence d’éthylène. Enfin, les ARNm et les protéines d'ETRs ont été analysés au sein des mêmes échantillons, ce qui nous a amenés à suggérer l'existence d'une corrélation positive entre les ARNm et les protéines d'ETR, controversée dans la littérature précédente
Ethylene is synthesized and perceived by all plants, and it is one of the most important phytohormone controlling fruit ripening. Ethylene is perceived by endoplasmic reticulum (ER)- localized proteins, called Ethylene Receptors (ETRs), which regulate fruit development and ripening, however the mechanisms by which ETRs regulate fruit ripening are not fully explained. Firstly, to study if ETRs regulate the ripening of climacteric and non-climacteric fruits, we compared ETRs and related protein members of both classes of fruit and by re-analyzing RNAseq data, already published, we found that ETRs were peaking at the inception of ripening in both climacteric and non- climacteric fruits, but in these data, the ETRs showed an earlier ETR expression peak relative to sugar accumulation. In this review, we also compared the structure of the ethylene receptors and related proteins in both classes of fruit, establishing a basis for the annotation of genes related to ethylene perception. Finally, the results show that there was a higher number of ETR genes in climacteric fruits than in non-climacteric fruits. Secondly, in tomato which is a fleshy fruit ripening model, a seventh ETR has been reported recently, following the genome sequencing. Characterization of this SlETR7 was carried out. We showed that ethylene binds to the transmembrane part of SlETR7. Like other ETR expression patterns during fruit ripening, SlETR7 expression in pericarp also goes up when fruit ripens. The profiles of the seven ETR expression during fruit ripening can be divided in 2 groups: group 1, ETR3, ETR4, and ETR6 are expressed earlier at Breaker+2 days than group 2, SlETR1, SlETR2, SlETR5, and SlETR7 that are expressed at a later stage of ripening. We constructed Knock Out (KO) and OverExpressed (OE) tomato lines for SlETR7, and we observed some phenotype changes proving that SlETR7 is a functional ETR. While there was only a small phenotype change in KO plants and fruits: more ethylene production at Br and Br+2days compared to Wild Type (WT). The OE lines showed early flowering, shorter plants, and smaller fruit than WT. The analyzes of the 7 ETR expression in KO and OE lines, revealed that other ETR expression is upregulated in KO mutants, which may explain the absence of obvious phenotype. and this suggest that SlETR7 maybe not critical in fruit ripening. Thirdly, regarding the studies of the seven tomato ETRs, one major bottleneck is the absence of reliable method to quantify them at the protein level. A targeted proteomic method was developed, PRM for Parallel Reaction Monitoring, and allow the identification and relative quantification of the seven tomato ETRs. This development applied to the study of the WT and Never Ripe mutant tomatoes showed that there is an over-accumulation of SlETR3, affected by a gain-of-function mutation in NR, while the NR tomatoes undergo ripening, which may be a cause of further ripening inhibition, as NR fruit stay orange. Finally, ETR mRNAs and proteins were analyzed within the same samples, and this led us to propose that there is a positive correlation between ETR mRNAs and proteins, which was controversial in the previous literature

3

D’Andrea, Lucio. "Molecular regulation of carotenoid biosynthesis in tomato fruits. New biotechnological strategies." Doctoral thesis, Universitat Autònoma de Barcelona, 2016. http://hdl.handle.net/10803/393988.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Los carotenoides son metabolitos isoprenoides de gran relevancia económica como pigmentos naturales y fitonutrientes. Durante la maduración del fruto de tomate (Solanum lycopersicum) se acumulan niveles elevados de carotenoides como β-caroteno (naranja) y licopeno (rojo) en un tipo de plasto especializado denominado cromoplasto. En la maduración se pueden distinguir tres estadios según el color del fruto: Verde Maduro (VM), Naranja (N) y Rojo (R). La transición de VM a N y por último a R, se caracteriza por una fuerte inducción en la acumulación de los niveles de carotenoides y, por ende, la diferenciación de cloroplastos en cromoplastos. La acumulación global de carotenoides depende de la actividad de enzimas biosintéticas como PSY. En el fruto de tomate, la actividad PSY procede fundamentalmente de la isoforma PSY1. Durante esta tesis se ha demostrado que el gen PSY1 es una diana directa de un factor de transcripción regulado por luz denominado PIF1a, que se une al promotor del gen para reprimir su expresión. En concordancia, frutos de tomate con niveles reducidos de PIF1a mostraron una mayor expresión de PSY1 y por tanto una mayor acumulación de carotenoides. Además, hemos establecido un mecanismo molecular basado en la regulación de la estabilidad por luz de PIF1a que permite ajustar la síntesis de carotenoides al estado real de maduración del fruto. En la segunda parte de la tesis se ha explorado la relevancia del complejo de la Clp proteasa plastídica en la regulación de los niveles de proteínas implicadas en el metabolismo de carotenoides y en el almacenamiento de estos pigmentos en el fruto de tomate. La disminución de dicha actividad proteolítica mediante silenciamiento génico, generó frutos transgénicos enriquecidos en β-caroteno (pro-vitamina A). Más aún, la caracterización de dichos frutos mediante TEM y microscopía Raman sirvió como plataforma para establecer la importancia de dicho complejo proteolítico durante la diferenciación de cloroplastos en cromoplastos. Finalmente, estudios en el campo de la proteómica cuantitativa ayudaron a la elucidación de posibles nuevas proteínas diana de dicha proteasa, incluyendo PSY1.
Carotenoids are isoprenoid metabolites of great economic importance as natural pigments and phytonutrients. Carotenoids such as lycopene (red) and β-carotene (orange) accumulate at high levels in a type of specialized plastid called chromoplast during tomato (Solanum lycopersicum) fruit ripening. Three different ripening stages can be distinguished according to the color of the fruit: Mature Green (MG), Orange (O) and Red/Ripe (R). The transition from MG to O, and finally to R, is characterized by a strong induction in the levels of carotenoids and therefore, the differentiation of chloroplasts into chromoplasts. The global accumulation of carotenoids depends on the activity of biosynthetic enzymes such as PSY. In tomato fruit, PSY activity is mainly provided by the PSY1 isoform. During this thesis it has been demonstrated that the PSY1 gene is a direct target of a light-regulated transcriptional factor named PIF1a, which binds to the gene promoter to repress its expression. In agreement, tomato fruits with reduced levels of PIF1a show higher PSY1 transcript levels and hence an enhanced accumulation of carotenoids. Additionally, we have established a molecular mechanism based on the regulation of PIF1a photostability, that allos to adjust carotenoid biosynthesis to the actual fruit ripening stage. In the second part of the thesis we have explored the revelance of the plastidial Clp protease complex for the regulation of the turnover of proteins involved in carotenoid metabolism and storage in tomato fruit. Successful reduction of Clp protease activity using gene silencing approaches generated transgenic fruits enriched in β-carotene (pro-vitamin A). In addition, the characterization of these fruits by TEM and Raman imaging helped us to establish the relevance of this proteolytic complex for chromoplast development. Finally, quantitative proteomic studies served to elucidate potential Clp protease targets in chromoplasts, including PSY1.

4

Gao, Yushuo. "Identification et caractérisation de SITCP12, un nouveau régulateur transcriptionnel associé à la maturation du fruit de tomate." Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2024. http://www.theses.fr/2024TLSEP003.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Les changements morphologiques et métaboliques liés à la maturation des fruits impliquent une reprogrammation de l’expression de nombreux gènes codant différents types d’effecteurs, laquelle est orchestrée par l’action simultanée de nombreux régulateurs. Cependant, les mécanismes moléculaires qui sous-tendent la transition de couleur restent mal compris.Dans le chapitre I, je présente une introduction bibliographique pour passer en revue l'état de l'art dans le domaine de la transition chloroplaste à chromoplaste et décrire les changements structurels, physiologiques et protéiques qui se produisent au cours de la transition; enfin, je présenterai les fonctions et donnée connues sur la famille SlTCP.Les chapitres II et III suivants constituent le contenu principal de notre article en préparation et à venir. Sur la base des données d'expression dans les tomates, j'ai découvert que SlTCP12, SlTCP15, SlTCP18 et SlTCP27 sont les seuls isoformes de TCP à expression élevée pendant la maturation. Nous avons initié notre étude sur SlTCP12. Nous avons vérifié que le facteur de transcription codé par SlTCP12 fonctionne comme un activateur de transcription et est exclusivement localisé dans le noyau. Le gène présente une augmentation substantielle de son expression à partir du stade vert mature, laquelle se poursuit dans les stades ultérieurs (Breaker, Orange, Red). Pour étudier le rôle de SlTCP12, j'ai construit des plantes TCP12-KO en utilisant des approches CRISPR/Cas9 et analysé son phénotype sur la génération homozygote. Mes résultats suggèrent que l'absence de SlTCP12 entraîne des altérations de la couleur du péricarpe du fruit, le mutant présentant un phénotype de Yellow Shoulder (coloration jaune au niveau de la base du fruit) qui demeure sensible à certains facteurs environnementaux. Afin d'obtenir un modèle des voies de régulation impliquant SlTCP12, nous avons combiné des approches de biochimie, de biologie cellulaire et moléculaire et montré que SlTCP12 n’agit pas directement sur la synthèse des chlorophylles, mais qu’il influence surtout la transition des chloroplastes en chromoplastes. Nous avons notamment démontré l’action directe de SlTCP12 sur les promoteurs des gènes SlPSY1/PSY2. Enfin, en amont, nous avons pu montrer, par analyse transcriptomique de différents mutants et par l’utilisation du système Dual-luciférase, l’existence d’une régulation de l’expression de SlTCP12 par les régulateurs SlGLK2 et RIN.Le chapitre (IV) s’intéresse à l’action simultanée, et potentiellement redondante des différents isoformes de TCP exprimés lors de la maturation. Sur la base des données d'expression chez la tomate, j'ai découvert que SlTCP12, SlTCP15 et SlTCP18 sont les seuls gènes à forte expression pendant la maturation. J'ai conçu et initié diverses constructions pour générer différentes plantes avec une expression altérée des trois gènes TCP12, TCP15 et TCP18, en utilisant des approches CRISPR/Cas9. Ainsi, des lignées de tomates portant le triple KO sur SlTCP12, SlTCP15 et SlTCP18 ont été obtenues, son phénotype étant analysé sur la génération T3. A partir des premiers résultats, le triple mutant SLTCP12/15/18 présente un phénotype semblable au simple mutant SlTCP12 (phénotype de yellow shoulder, concentrations plus élevées de chlorophylles et de sucres solubles), avec une sévérité très légèrement accrue, ce qui suggère une redondance très partielle entre les trois isoformes. De plus, de nombreux gènes liés à la maturation et aux modifications de coloration affectés dans le simple mutant SlTCP12 voient aussi leur expression altérée dans le triple mutant SlTCP12/15/18, c’est le cas notamment de FUL1, FUL2 et TAGL1, parfois à des niveaux importants ce qui suggère aussi des actions spécifiques de SlTCP15 et SlTCP18 dans la maturation du fruit de tomate.Dans l’ensemble, notre étude révèle le rôle important de SlTCP12 dans la régulation de la couleur des fruits et la sensibilité aux facteurs environnementaux
Fleshy fruits are major sources of necessary nutrients in many people’s diets around the world, and their ripening is a complex physiological and biochemical process that involves the coordinated regulation of numerous physiological and biochemical changes that determine flavor, color, texture, and aroma. These changes involve the up- or downregulation of numerous genes in various metabolic pathways. However, the molecular mechanisms underlying the color transition remain poorly understood.In Chapter I, I introduce of tomato, which is an important model species for fleshy fruit research and a reference species for the Solanaceae family. Then, I provide a bibliographic introduction to review the state of the art in the field of chloroplast to chromoplast transition, describing the structural, physiological, and protein structure changes that occur during this transition. Lastly, I introduce the functions of SlTCPs in plant and fruit development, which will be valorized with a submitted review.The following chapters II and III are the core content of our forthcoming article. Based on expression data in tomatoes, I found that SlTCP12, SlTCP15, SlTCP18 and SlTCP27 are the only genes with high expression during ripening. Notably, SlTCP12, functioning as a transcription activator and exclusively localized within the nucleus, displays a substantial increase in expression starting from the mature green stage and continuing beyond it. To investigate the role of SlTCP12, I constructed TCP12-KO plants using CRISPR/Cas9 approaches and analyzed their phenotype in the homozygous generation. My findings suggest that the absence of SlTCP12 leads to alterations in fruit pericarp color, with the mutant displaying a yellow shoulder phenotype that exhibits sensitivity to certain environmental factors. In order to uncover the regulatory pathway of SlTCP12 action, we employed a series of methods at the cellular, biochemical, and molecular levels, and demonstrated that SlTCP12 does not affect chlorophyll synthesis but rather influences chloroplast degradation and the conversion into chromoplasts, leading to the yellow shoulder phenotype. We also validated that SlTCP12 exerts its regulation by directly binding to SlPSY1/SlPSY2 promoter regions, thereby governing the development and transition of chloroplasts and chromoplasts in tomatoes. Furthermore, SlGLK2 and RIN can directly interact with the promoter region of SlTCP12, as suggested by transcriptome analyses of RIN-KO mutant and Dual-Luc assays.The last chapters IV aims at enlarging the work to SlTCP12 homologues. Based on expression data in tomato, I found that SlTCP12, SlTCP15, SlTCP18 are the only genes with high expression during ripening. I designed and initiated diverse constructs to generate different plants with SlTCP12, SlTCP15 and SlTCP18 altered expression using CRISPR/Cas9. Thus, tomato lines bearing the triple KO on SlTCP12, SlTCP15 and SlTCP18 have been obtained, and their phenotypes have been analyzed in the T3 generation. According to the first results, triple SlTCP12/15/18 mutant displays the phenotype similar to SlTCP12 single mutant (occurrence of yellow shoulder in DPH14 fruit and high level of chlorophyll and soluble sugar) with a mild increase in phenotype severity, suggesting a partial, but limited redundancy between the three TCP isoforms. In addition, in the triple SlTCP12/15/18 mutant, we observed modifications in the expression of several genes related to ripening and color changes, exhibiting alterations consistent with those observed in tcp12, such as FUL1, FUL2, and TAGL1. These changes were obviously more pronounced than in tcp12, suggesting that SlTCP15 and SlTCP18 may have special functions in tomato ripening.Taken together, our study reveals the important role of SlTCP12 in fruit color regulation and sensitivity to environmental factors

5

Bonato, Vanessa Caroline de Barros. "Interação etileno-auxina e sua influência na produção de compostos voláteis do aroma durante o amadurecimento do tomate (Solanum lycopersicum)." Universidade de São Paulo, 2015. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9131/tde-15122015-141611/.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

O amadurecimento é um processo complexo e geneticamente programado através do qual o fruto adquire características próprias (níveis de açúcar e acidez, cor, amaciamento, sabor e aroma, entre outras) que o torna atraente aos consumidores. O tomate (Solanum lycopersicum) tem sido largamente utilizado como modelo para os estudos sobre amadurecimento de frutos devido à sua importância nutricional e econômica e aos avanços no entendimento de sua genética e bioquímica. Neste fruto, um conjunto de 20 a 30 substâncias voláteis, entre álcoois, aldeídos, cetonas e ésteres, contribuem para o aroma, sendo elas derivadas principalmente de aminoácidos, ácidos graxos e carotenóides. O hormônio etileno está intimamente relacionado com as alterações metabólicas que ocorrem no amadurecimento, inclusive na geração desses compostos voláteis, através da ativação de fatores de transcrição que regulam genes codificadores de enzimas envolvidas nesse processo. Embora se saiba bastante a respeito da bioquímica que produz compostos de aroma e o envolvimento do etileno nesse processo, pouco se sabe sobre o mecanismo de sua regulação. Além disso, o etileno não é o único regulador do amadurecimento, pois há vários indícios de que as auxinas também estão envolvidas neste processo. Embora crescente, este campo ainda encontra-se pouco explorado quando comparado aos avanços obtidos sobre o papel do etileno no amadurecimento de frutos. Os dados são ainda mais escassos no que se refere a regulação das vias de biossíntese dos compostos voláteis. Assim, este trabalho visa avaliar como a interação entre o ácido indol-3-acético (AIA), a auxina mais abundante em plantas, e o etileno influencia a produção do aroma em frutos de tomateiro. Para tal, tomates da cultivar Micro-Tom foram tratados com AIA e etileno, isoladamente e em conjunto. Os resultados mostraram que os grupos de frutos caracterizaram-se por possuir diferentes perfis de compostos voláteis. Os tratamentos com AIA e etileno+AIA ocasionaram atraso no acúmulo de compostos voláteis derivados de isoprenóides, assim como na transcrição de genes envolvidos na síntese desses compostos: carotenoid cleavage dioxygenases 1A e 1B (S/CCD1A e S/CCD1B). A mudança da cor verde para a vermelha e o acúmulo de licopeno também foram atrasados em resposta a estes dois tratamentos. Foram também avaliados os níveis de transcritos de genes envolvidos na síntese de voláteis derivados de ácidos graxos, sendo eles lipoxigenases (S/LOX), hidroperóxido liases (S/HPL) e álcool desidrogenases (S/ADH), além dos níveis da produção de etileno, e AIA na forma livre e conjugados. Os resultados mostraram-se robustos em relação aos impactos nos perfis de compostos voláteis, causados pelos mesmos tratamentos hormonais, em frutos de tomateiro da variedade Grape. Os dados sugerem que a auxina possui importante papel na formação de compostos voláteis do aroma em frutos de tomateiro, regulando de forma negativa este metabolismo. Esse efeito modulador ocorre provavelmente por meio de interações com o etileno.
Fruit ripening is a complex and genetically programmed process through the fruit acquires characteristics (sweetness and acidity, color, softening, flavor and aroma, etc.) that make it attractive to consumers. The tomato fruit (Solanum lycopersicum) has been widely used as a model for studies on fruit ripening due to its nutritional and economic importance and advances in the understanding of its genetics and biochemistry. A set of 20 to 30 volatile substances, including alcohols, aldehydes, ketones and esters, which were derived from amino acids, fatty acids and carotenoids, contribute to the flavor. The hormone ethylene is closely related to the metabolic changes that occur in the maturation, including the generation of these volatile compounds, through the activation of transcription factors that regulate genes encoding proteins involved in this process. Although the knowledge about the biochemistry pathways that produces flavor compounds and the involvement of ethylene have advanced, little is known about the regulation of this process. In addition, ethylene is not the unique hormone that plays this role on fruit ripening. There is a growing body of evidence indicating the involvement of auxin in the maturation. The role of other hormonal classes is still little explored when compared to progress made on the role of ethylene in fruit ripening, especially regarding the regulation of the biosynthetic pathways of volatile compounds. This study aim to assess how the interaction between the indole-3-acetic acid (IAA), the most abundant auxin in plants, and ethylene influence the production of tomato fruit aroma. To do this, fruit from tomato cultivar Micro-Tom were treated with IAA and ethylene, separately and in combination. The results showed that the fruit groups characterized by having different profiles of volatile compounds. The treatment with IAA and IAA + ethylene caused delay in accumulation of volatile compounds derived from isoprenoid, as well as in the transcription of genes involved in the synthesis of these compounds: carotenoid cleavage dioxygenases 1A and 1B (S/CCD1A and S/CCD1B). The change from green to red and the accumulation of lycopene were also delayed in response to these two treatments. We also assessed the levels of transcripts of genes involved in the synthesis of volatile compounds derived from fatty acids (lipoxygenases [S/LOX], hydroperoxide lyases [S/HPL] and alcohol dehydrogenases [S/ADH]), besides the levels of ethylene production, and IAA in free and conjugated form. The results were robust with respect to impacts on volatile compounds profiles, caused by the same hormone treatments in tomato variety Grape. The data suggest that auxin plays an important role in the synthesis of volatile compounds in tomato fruit, negatively regulating this metabolism. This modulating effect likely occurs through crosstalks with ethylene.

6

Tourdot, Edouard. "Spatiotemporal distribution of ploidy levels and ploidy specific transcriptome during Tomato fruit development." Thesis, Bordeaux, 2021. http://www.theses.fr/2021BORD0121.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L’endoréduplication, qui est la source majeure d’endopolyploïdie chez les Plantes, est un processus cellulaire durant lequel la quantité d’ADN nucléaire (ploïdie) est augmentée par une succession de réplications du génome sans division cellulaire. L’endoréduplication est le résultat de la capacité des cellules à transformer le classique cycle cellulaire en un cycle cellulaire partiel, l’endocycle, où la synthèse de l’ADN intervient indépendamment de la mitose. Chez les plants, l’endoréduplication est présente dans de nombreux organes et types cellulaires et notamment ceux ayant un fort intérêt agronomique, comme la partie charnue (péricarpe) du fruit de Tomate dans lequel les niveaux de ploïdie sont important. A la fin du développement du fruit de tomate, le péricarpe est composé d’une population hétérogène de cellules dont les niveaux de ploïdie et la tailles varient. De plus, à ce stade, des gènes présentent des profils d’expression spécifiquement lié aux niveaux de ploïdie. Cependant, peu de données sont disponible à propos de l'engagement et la progression de l’endoreduplication dans les cellules durant le développement du fruit de tomate ou son effet sur l’expression des gènes. Afin d’expliquer pourquoi une population hétérogène de cellule co-existent dans le péricarpe et comme base de description des régulations transcriptionnelles par l’endoréduplication dans le péricarpe, la thèse a eu d’étudier cette population hétérogène de cellule afin d’établir les bases de détermination des programmes génétiques mis en place par l’endoreduplication. Donc, j’ai cartographié le dynamisme des niveaux de ploïdie et de l’expression des gènes en fonction des niveaux de ploïdie dans le péricarpe au cours du développement précoce du fruit, à 6-, 9- et 12 jours après anthèse. Les données ont montré qu’un doublement de l’expression était présent en relation avec le doublement de ploïdie et l’endoreduplication est déjà bien en place, organisée en gradient dans le péricarpe à 6DPA. En utilisant les données produites, une carte virtuelle des niveaux de ploïdie et de l’expression des gènes sera établie au cours de du développement du péricarpe du fruit de Tomate
Endoreduplication is a cellular process during which nuclear DNA content (ploidy) is increased through successive genome duplication without cell division. Endoreduplication plays pivotal functions throughout the plant life cycle such as morphogenesis or cell specification, and also in response to environmental stresses. Another potential role of endoreduplication is that, by increasing gene copy number, transcription could be increased. In Tomato, the fruit pericarp tissue (fleshy part) is composed of a heterogeneous population of cells displaying a large variation of ploidy levels reaching up to 256c (c = haploid genome quantity). In this tissue, these high ploidy levels are generally correlated with large cells. However, little is known about the onset and progression of endoreduplication during tomato fruit growth and its consequences on the regulation of cell size and gene expression. We therefore aim to determine the in situ distribution of gene expression based on the ploidy levels in the pericarp during fruit development.For that, ploidy distribution in the pericarp is first quantified in situ by Fluorescent in situ Hybridization (FisH). In parallel, cell size is measured to study the potential link between ploidy and cell growth. Second, RNA extracted from nuclei sorted based on their ploidy level are used for sequencing. From this transcriptome data, a search for potential markers of ploidy and/or genes having a ploidy specific expression will be done. These ploidy distribution and transcriptomics experiments are done by harvesting fruits at five stages from 6 to 12 days post anthesis (dpa) during fruit growth. Using this data a virtual map of ploidy distribution and gene expression will be done for early development of Tomato fruit pericarp

7

Gest, Noé. "MDHAR3 : une enzyme à l'interface de la défense antioxydante, du métabolisme carboné et de la qualité du fruit chez la tomate." Electronic Thesis or Diss., Avignon, 2012. http://www.theses.fr/2012AVIG0328.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Chez les plantes, l’étude des antioxydants et des métabolismes associés présente un triple intérêt, en raison (i) des vertus nutritionnelles des antioxydants (ii) de leur implication dans la tolérance au stress et (iii) de leur capacité à réguler des processus cellulaires essentiels. L’enzyme monodehydroascorbate reductase (MDHAR) participe à ce type de métabolisme car elle permet le recyclage de l’ascorbate, un antioxydant majeur, à partir de sa forme oxydée, le monodehydroascorbate. Ce travail de thèse, utilisant la tomate comme modèle d’étude, a consisté à étudier les conséquences d’une modification de l’activité d’une isoforme de MDHAR (MDHAR3) sur la teneur en ascorbate, le développement et la tolérance des fruits au froid. Nous avons identifie une régulation négative de la teneur en ascorbate par MDHAR3 : la sous-expression de cette enzyme augmente les teneurs en ascorbate d’environ 20%, et la surexpression produit un effet inverse, ces deux mécanismes n’apparaissant qu’en condition de forte intensité lumineuse. La sous-expression de MDHAR3 a également réveillé la capacité de cette enzyme à réguler le métabolisme carboné, produisant d’importantes modifications phénotypiques au niveau de la croissance précoce de la plante et de la taille du fruit. Ces résultats suggèrent pour MDHAR3 un rôle de médiateur entre le métabolisme antioxydant et le métabolisme central. Enfin, la caractérisation, en condition de stress au froid, de paramètres physiques et biochimiques de fruits de lignées d’introgression dont l’activité MDHAR3 est modifiée a révélé l’importance d’un système antioxydant efficace dans la tolérance à ce type de stress, en particulier immédiatement après la sortie des fruits du froid
Non fourni

8

How, Kit Alexandre Gallusci Philippe. "Contrôle épigénétique du développement et de la qualité des fruits de tomate." S. l. : Bordeaux 1, 2008. http://ori-oai.u-bordeaux1.fr/pdf/2008/HOW_KIT_ALEXANDRE_2008.pdf.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

9

Mounet, Fabien. "Développement précoce du fruit de tomate : analyse globale du caractère charnu et étude de la contribution du transport de l'auxine." Bordeaux 2, 2008. http://www.theses.fr/2008BOR21531.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Afin d'approfondir les mécanismes moléculaires impliqués dans l'acquisition du caractère charnu du fruit de tomate, deux stratégies ont été entreprises : l'analyse intégrée de la composition métabolique et des profils d'expression de gènes au sein des tissus du fruit, ainsi qu'une approche de génétique inverse ciblant un gène potentiellement impliqué dans le développement du fruit. Dans un premier temps, ne approche globale a permis d'analyser la composition métabolique et les profils d'expression de gènes au sein de différents tissus du fruit au cours de son développement. L'analyse de la composition de ces tissus par des outils statistiques a permis de mettre en évidence des métabolites spécifiques associés aux mécanismes d'expansion cellulaire et au dévelopement des graines. L'intégration des données obtenues à partir des analyses de métabolome et de transcriptome, réalisée sur le mésocarpe et le tissu loculaire, ont révélé plusieurs gènes candidats qui semblent intervenir dans le développement du fruit. Ces données ont également permis d'approfondir le rôle des régulations hormonales dans l'expansion des tissus charnus du fruit. Dans un second temps, cette étude s'est focalisée sur l'analyse d'un gène candidat codant pour une protéine de transport de l'auxine appelée S/PIN. Les analyses phénotypiques et moléculaires de lignées de tomates transgéniques sous exprimant le gène SIPIN ont montré une altération du développement de l'ovaire aboutissant à la formation de fruits parhénocarpiques. Les lignées transformées P35s : SIPINrnai ont permis d'étudier l'implication du transport de l'auxine dans la mise a fruit et la didfférenciation des tissus
In order to get new insights concerning the mechanisms involved in the acquisition of the fleshy trait in tomato fruit, two strategies were undertaken : an integrated analysis of fruit tissues metabolites and transcripts along development, and a reverse genetic approach targeting one gene potentially involved in fruit development. In a first step, a global approach was used to characterize changes in both transcriptome and metabolome in various tissues of the fruit during early fruit development. Tissue composition analyses using chemometric approaches pointed to specific metabolites associated with cell expansion in developing fruit with seed development. The integration of transcriptomic and metabolomic data, performed on mesocarp and locular tissue, highlighted several candidate genes that could be involved in fruit development. These data also allowed to analyse the role of hormonal regulations in expansion processes engaged in fleshy tissues. In a second step, this study was focalised on one candidate gene, encoding an auxin efflux transport protein called S/PIN. Phenotypic and molecular characterization of transgenic tomato plants silenced for SIPIN gene showed an alteration in ovary development resulting in the formation of parthenocarpic fruits in the most affected lines. P35s : SIPINrnai lines revealed that auxin transport was involved in fruit set and tissues differentiation

10

Magalhães, Hilton César Rodrigues. "Influência hormonal de Metil Jasmonato na biossíntese de compostos voláteis associados ao amadurecimento em tomate Grape (Solanum lycopersicum) e pimenta malagueta (Capsicum frutescens)." Universidade de São Paulo, 2017. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/9/9131/tde-07122017-163048/.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

O amadurecimento é um processo complexo formado por alterações metabólicas, que ocorrem após o fruto atingir a sua maturidade fisiológica. O tomate é um fruto climatérico, usado como modelo para estudo do papel do etileno durante o amadurecimento. A pimenta é um fruto não-climatérico, pertencente à mesma família que o tomate, e por conta disso, pode apresentar similaridades no desenvolvimento de diversos atributos de qualidade durante o amadurecimento, como o aroma. A maioria dos compostos voláteis em frutos deriva dos carboidratos, lipídeos e aminoácidos, sendo a via das lipoxigenases a responsável pela formação de voláteis C6. Devido a sua importância no processo de regulação do amadurecimento em frutos, o etileno possui um papel fundamental para a formação do aroma, no entanto, outros hormônios como o metil jasmonato (MeJA), também possuem um papel importante nesse processo. O presente trabalho visa avaliar os papéis dos hormônios etileno e MeJA na formação dos compostos voláteis do aroma em tomate Grape (Solanum lycopersicum) e pimenta malagueta (Capsicum frutescens) durante o amadurecimento. Os frutos foram tratados com MeJA, Etileno, 1MCP e MeJA+1MCP, com posteriores análises de voláteis e níveis dos transcritos de genes para as enzimas lipoxigenase (LOX), álcool desidrogenase (ADH) e hidroperóxido liase (HPL), que participam da formação dos voláteis derivados da via dos ácidos graxos. Os resultados mostraram que os tratamentos hormonais causaram mudanças claras na composição do aroma de pimenta e tomate, mas muitos desses resultados deixaram evidente a natureza climatérica e não-climatérica desses frutos. Diferentemente do que aconteceu em pimenta, foi possível visualizar uma íntima relação entre MeJA e etileno na formação do aroma em tomate, principalmente nos voláteis derivados da via dos carotenoides. Em tomate, foi possível observar que a expressão dos transcritos dos genes da via dos ácidos graxos, LOX, ADH e HPL, e da via dos carotenoides, CCD1A e CCD1B, foi diminuída pela ação de 1MCP, mesmo quando esteve associado à MeJA. O tratamento com MeJA aumentou voláteis C6 em pimenta e tomate. Particularmente em tomate, essa elevação foi associada ao aumento na expressão de LOXC e HPL, um dia após a aplicação do hormônio. Quando o tomate se tornou completamente maduro, não foram constatadas tantas diferenças em relação aos outros tratamentos, exceto pelo aumento evidente dos compostos derivados da via dos carotenoides, beta-ionona e 6-metil-5-hepten-2-ol. No primeiro dia de tratamento com MeJA em pimenta, verificou-se um aumento evidente nos níveis da maioria dos ésteres, inclusive os hexílicos de cadeia alifática, que são derivados dos voláteis C6 da via dos ácidos graxos. Além disso, também apresentaram aumento evidente, logo no primeiro dia após o tratamento com MeJA, os compostos 2-isobutil-3-metoxipirazina e 3-careno, sendo esses dois últimos os compostos que fornecem a nota aromática mais característica de pimenta. Quando as pimentas amadureceram completamente, constatou-se um aumento estatisticamente significativo, proporcionado por MeJA, nos voláteis C6 (E)-2-hexen-1-ol, 3-hexen-1-ol e hexanal, sendo esse último um dos grandes contribuidores para o aroma desse fruto.
Ripening is a complex process formed by metabolic changes that occur after fruit physiological maturity. Tomato is a climacteric fruit, used as a model to study the role of ethylene during ripening. Pepper is a non-climacteric fruit, belonging to the same family as the tomato, and because of this, may present similarities in the development of several attributes of quality during maturation, such as aroma. Most of volatile compounds in fruits derives from carbohydrates, lipids and amino acids, and lipoxygenases pathway is responsible for C6 volatiles production. Due to its importance in the fruit ripening regulation process, ethylene plays an important role in aroma production; however, other hormones, such as methyl jasmonate (MeJA), also play a significant role during fruit ripening. The present work aims to evaluate the roles of ethylene and MeJA hormones in the formation of aroma compounds in tomato Grape (Solanum lycopersicum) and chili pepper (Capsicum frutescens) during ripening. Fruits were treated with MeJA, Ethylene, 1MCP in MeJA+1MCP, followed by analysis of volatile compounds and levels of gene transcripts for the enzymes lipoxygenase (LOX), alcohol dehydrogenase (ADH) and hydroperoxide lyase (HPL), which participate of production of volatile compounds derived from the fatty acid pathway. The results showed that hormonal treatments caused changes in pepper and tomato aroma composition, but many of these results made evident the climacteric and non-climacteric nature of these fruits. Unlike what happened in pepper, it was possible to visualize an intimate relationship between MeJA and ethylene under the tomato aroma compounds, mainly in the formation of carotenoid-derived volatiles. In tomato, it was possible to observe that the expression of the fatty acid pathway gene transcripts, LOX, ADH and HPL, and carotenoid pathway, CCD1A and CCD1B, were reduced by 1MCP action, even when it was associated with MeJA. MeJA treatment increased C6 volatiles in pepper and tomato. Particularly in tomato, this elevation was associated with an increase in the LOXC and HPL expression, one day after the hormone treatment. When tomato became fully mature, there were not so many differences compared to the other treatments, except for the evident increase of the carotenoid-derived volatile compounds, beta-ionone and 6-methyl-5-hepten-2-ol. On the first day of treatment with MeJA in pepper, there was a clear increase in the levels of most esters, including the aliphatic chain hexils, which are derived from the C6 volatiles of the fatty acid pathway. In addition, 2-isobutyl-3-methoxypyrazine and 3-carene compounds also showed evident increase, the first two days after treatment with MeJA, the latter two being the compounds that provide the most characteristic aromatic note of pepper. When the peppers reach their complete maturation, there was an increase, under MeJA treatment, in the C6 volatiles (E)-2-hexen-1-ol, 3-hexen-1-ol and hexanal, which is one of the most important aroma compounds in peppers.

11

Bournonville, Celine. "Identification de gènes candidats impliqués dans la régulation de la teneur en acide ascorbique chez la tomate : impacts sur le potentiel antioxydant et la qualité post-récolte du fruit." Thesis, Bordeaux, 2015. http://www.theses.fr/2015BORD0039/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L’acide ascorbique (AsA) est un antioxydant essentiel à la fois pour l’homme et les végétaux. L’AsA provenant des plantes représente la source principale de vitamine C dans l’alimentation quotidienne. Au-delà de son impact nutritionnel, augmenter la teneur en AsA dans le fruit de tomate serait susceptible d’influencer la qualité des fruits après la récolte, en termes de conservation mais également de résistance à des pathogènes. Bien que le métabolisme de l’AsA soit bien caractérisé, les mécanismes impliqués dans sa régulation restent jusqu'à présent peu compris. Des études récentes menées sur des feuilles d’Arabisdopsis thaliana montrent que certaines protéines seraient capables de réguler la teneur en AsA, en agissant au niveau transcriptionnel ou post-transcriptionnel. A ce jour, ce type de régulation n’a pas été encore décrit chez les fruits. Dans ce but, une approche de génétique directe a été développée afin d’étudier les mécanismes impliqués dans la régulation de la teneur en AsA et ceci dans le fruit de tomate (Solanum lycopersicum). L’analyse d’une population de mutants EMS de tomate Micro-Tom a permis l’identification de lignées de mutants présentant des teneurs en AsA de 2,5 à 4 fois plus importantes que celles observées dans les fruits de tomate sauvage. La caractérisation de ces lignées a conduit à des résultats prometteurs pour l’étude de la qualité des fruits après la récolte. Une stratégie de NGS-mapping a permis l’identification des mutations causales responsables du phénotype AsA observé. Ainsi, le criblage de mutants EMS a permis la découverte de nouvelles protéines inattendues, permettant de confirmer au niveau moléculaire l’existence d’une interaction directe en la signalisation lumineuse et la régulation de la voie de biosynthèse de l’AsA
The ascorbic acid (AsA) is an essential antioxidant in both plants and humans. Plant-derived AsA is the major source of vitamin C in the human diet. In addition to its effect on tomato nutritional value, increasing tomato AsA content would likely affect postharvest storage and resistance to pathogens of the fruit. While AsA metabolism is well characterized, the mechanisms involved in its regulation remain poorly understood. Recent studies in Arabidopsis leaves indicate that few regulatory proteins can regulate this pathway at transcriptional and post-transcriptional levels. Still nothing equivalent has been described in fruits. In that aim, a forward genetic approach has been carried out to investigate the regulation of AsA in tomato (Solanum lycopersicum) fruit. The screening of an EMS tomato mutant population in the miniature cultivar Micro-Tom for identifying mutant lines with AsA-enriched fruits was done. Among the 500 M2 mutant families screened, four mutant lines with higher AsA content ranging from 2.5 to 4 fold were selected. These mutant lines have been characterized for postharvest traits quality and showed promising results. A method based on NGS-mapping allowed the identification of the putative AsA-enriched related gene. Thus, the screening of EMS mutants led to original findings such as the discovery of new unexpected proteins regulating AsA in plants, and particularly in fruits. Our work confirms at the molecular level the direct interaction between light signaling component and the regulation of the AsA biosynthesis pathway

12

Wang, Hua. "La régulation transcriptionnelle dépendante de l'auxine lors du développement du fruit : caractérisation fonctionnelle du gene DR4, un homologue d'aux/IAA chez la tomate (Lycopersicon esculentum, Mill)." Toulouse, INPT, 2004. http://www.theses.fr/2004INPT019A.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Le développement des fruits de l'anthèse à la maturation est un processus génétiquement programmé dont le déroulement se trouve sous un contrôle multihormonal. Alors que l'éthylène joue un rôle déterminant au cours de la maturation des fruits climactériques comme la tomate, les modalités d'intervention des autres hormones ne sont toujours pas connus. Une approche de criblage différentiel a permis d'isoler au laboratoire plusieurs gènes codant pour des régulateurs transcriptionnels impliqués dans la réponse à l'auxine et montrant un profil d'expression qui varie au cours de la maturation et en réponse à l'éthylène. Le travail présenté dans cette thèse est focalisé sur la caractérisation fonctionnelle dugène DR4 apparenté à la famille des Aux/IAA de la tomate dont le rôle en tant que médiateurs de la réponse des plantes à l'auxine est bien connu. Alors que de nombreux mutants "gain de fonction" touchant les gènes Aux/IAA ont été décrits chez Arabidopsis, de façon remarquable, aucun mutant "perte de fonction" n'a été caractérisé à ce jour. Le travail présenté ici montre que la sous-expression du gène DR4 chez la tomate affecte plusieurs processus de développement de l'auxine. [. . . ]

13

Savalle-Gloire, Noé. "Effet du microclimat lié à l'ombrage temporaire sur la physiologie et la croissance, le rendement et la qualité des fruits de la tomate (Solanum lycopersicum L. H. Karst)." Electronic Thesis or Diss., Avignon, 2024. http://www.theses.fr/2024AVIG0624.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L’augmentation des températures et des risques de sécheresses du fait des changements climatiques impose une adaptation rapide des pratiques culturales afin de protéger les cultures face à l’augmentation des stress thermiques et hydriques. De plus, limiter l’émission de gaz à effet de serre à l’origine de ces changements climatiques nécessite le développement d’énergies renouvelables, mais ce développement se heurte dans certains pays à des conflits d’usage, alors qu’une part importante du territoire est déjà dédiée à l’agriculture. L’agrivoltaïsme consiste à installer des panneaux photovoltaïques sur des terres cultivées, ce qui permet de produire une électricité renouvelable tout en protégeant les cultures face aux canicules et aux sécheresses, et ainsi de répondre à ces deux problématiques. Cette pratique pourrait être particulièrement utile pour les serres de tomate dans lesquelles l’ombrage est déjà utilisé pour protéger les plantes, et où une structure capable de supporter les panneaux est déjà en place. L’utilisation de panneaux mobiles (agrivoltaïsme dynamique) permet d’ajuster l’ombrage aux besoins de la plante. Cependant, cette pratique provoque un ombrage temporaire dont l’effet sur les cultures n’est pas encore suffisamment bien compris pour optimiser leur pilotage et maximiser les rendements et la qualité de la culture. Cette thèse examine l'impact de l'ombrage sur la croissance végétative, la physiologie, le rendement et la qualité des plants de tomates. Elle étudie les effets de l'ombrage appliqué à différentes échelles spatiales et temporelles, allant de l'organe à la plante et variant en intensité sur une base horaire ou saisonnière. Elle s’appuie sur deux expérimentations réalisées sous serre agrivoltaïque en 2021 et 2022 à Alénya (Pyrénées-Orientales, France). Différentes modalités d’ombrage ont été étudiées, selon le moment de la journée où l’ombrage a été appliqué sur les plantes (en fin de matinée, en début de matinée et en fin d’après-midi, et en début d’après-midi) et comparées à une modalité témoin réalisée dans une serre identique sans panneaux photovoltaïques. Les données expérimentales ont été utilisées pour adapter et calibrer un modèle structure-fonction de la tomate (FSPM) développé dans l’unité PSH, ce qui a permis d'analyser l’effet de l’ombrage à l’échelle de la plante entière
Due to climate change, farming practices must be adapted to protect crops from increased heat and water stress. Additionally, limiting greenhouse gas emissions requires the development of renewable energies. However, in some countries, conflicts of use arise when a large part of the land is already dedicated to agriculture. Agrivoltaics is the practice of installing photovoltaic panels on cultivated land to produce renewable electricity while also protecting crops from heatwaves and drought, and thus it addresses both these issues. This practice could be particularly useful for tomato greenhouses, where shading is already used to protect the plants and where a structure capable of supporting the panels is already in place. The use of mobile panels (dynamic agrivoltaics) makes it possible to adjust shading to the needs of the plant. However, this practice causes temporary shading, the effect of which on crops is not yet fully understood, making it difficult to optimise their stirring policy and maximise crop yields and quality. This thesis examines the impact of shading on the vegetative growth, physiology, yield, andquality of tomato plant. It studies the effects of shading applied at different spatial and temporal scales, ranging from the organ to the plant and varying in intensity on an hourly or seasonal basis. The experiments were conducted in an agrivoltaic greenhouse in Alénya (Pyrénées-Orientales, France) in 2021 and 2022. Various shading treatments were investigated, depending on the daily pattern of plant shading (late morning, early morning, late afternoon, and afternoon) compared to a control grown in a similar greenhouse without photovoltaic panels. The experimental data were used to adapt and calibrate a tomato structure-function model (FSPM) developed in the PSH laboratory, which made it possible to analyse the effect of shading at the whole plant level

14

Mertz, Christian. "Micro-constituants de la mûre andine et de la tomate d'arbre : caractérisation et impact du traitement thermique." Montpellier 2, 2009. http://www.theses.fr/2009MON20009.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Dans le cadre du projet Européen PAVUC (Producing Added Value from under-Utilized fruits Crops, 2006-2009), deux fruits tropicaux originaires d'Amérique Latine, la mûre Andine et la tomate d'arbre ont été étudiés afin de promouvoir le potentiel de ces fruits. Deux espèces de mûre (Rubus glaucus, Rubus adenotrichus) et deux variétés de tomate d'arbre (Solanum betaceum Cav. , jaune et rouge) ont été analysées. L'identification des polyphénols et caroténoïdes présents dans ces fruits a été réalisée par chromatographie liquide haute performance couplée à la spectrométrie de masse. Ellagitanins et anthocyanes constituent les polyphénols majoritaires de la mûre. La lambertianine C et la sanguiine H-6 ont été identifiées dans les deux espèces tandis que la cyanidine 3-O-rutinoside, uniquement présente dans l'espèce glaucus, permet de différencier les deux mûres. Des dérivés d'acide caféique ont été identifiés dans la chair des deux variétés de tomate d'arbre tandis que les anthocyanes (cyanidine, dephinidine et pelargonidine rutinoside) n'ont pas été détectés dans la variété jaune. A l'exception du β-carotène, les caroténoïdes sont présents dans la chair de tomate d'arbre sous formes estérifiées avec les acides myristique et palmitique. Ces esters représentent 80 % environ des caroténoïdes présents, les esters de β-cryptoxanthine étant les plus abondants (β 40 %). L'impact des traitements thermiques appliqués sur des nectars de tomate jaune a été étudié. La dégradation thermique des caroténoïdes ne semble pas influencée par la teneur initiale en oxygène dissous. Des réactions de cis isomérisation et de 5-8 époxidation ont été mises en évidence. Quelque soit le traitement thermique appliqué, aucune perte en acide ascorbique n'a été observée en milieu anaérobie tandis que sa dégradation est totale en milieu aérobie. L'influence du traitement thermique sur les polyphénols majoritaires de la mûre Andine a également été abordée. Ces travaux ont été valorisés par trois publications internationales de rang A ainsi qu'une présentation orale lors d'un congrès international
This work, supported by the European Project PAVUC (Producing Added Value from under-Utilized fruits Crops, 2006-2009), aims at the promotion of two tropical fruits: Andean Blackberry and Tomato Tree by performing a fine biochemical characterization. Two varieties of blackberries (Rubus glaucus, Rubus adenotrichus) and tomato tree (Solanum betaceum Cav. , yellow and red cultivars) were therefore specifically studied. Identification of polyphenolic compounds and carotenoids of these two fruits were performed by High Performance Liquid Chromatography coupled to Mass Spectrometry detector (HPLC-MSn). Ellagitanins and anthocyanins were the main phenolic compounds of both varieties of blackberry. Lambertianin C and sanguiin H-6 (two main ellagitanins) were identified in both species while cyanidin 3-O-rutinoside was only in glaucus specie from Ecuador allowing therefore a discrimination between the two species. Caffeic acids derivated were identified in tomato tree purees while anthocyanins (cyanidin, dephinidin and pelargonidin rutinoside) were not detected in yellow variety. Except β-carotene, all other carotenoids identified in tomato tree were esterified with palmitic and myristic acids. Esters form of xanthophylls represent ~80% of total carotenoids, most of them being β-cryptoxanthin esters (~40%). Impact of thermal treatments on blackberry and tomato tree nectars was thenafter studied. Behavior of carotenoids along thermal treatments seems not to be influenced by initial oxygen level of nectars. Cis-isomerisation and 5-8 epoxidation of carotenoids were traditionally evidenced after thermal treatment. Whatever the intensity of the thermal treatment, no loss was observed under anaerobic conditions while there was not any retention in aerobic conditions. At last, evolution of major polyphenolic compounds of blackberry along thermal treatment was discussed. This work was comforted by 3 publications in international scientific journals and an oral presentation at an international food congress

15

Liu, Ruie. "Functional analysis of active DNA demethylation in tomato." Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0273/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

La méthylation de l'ADN génomique est l'un des principaux mécanismes épigénétiques qui conduisent à des changements stables et héréditaires de l'expression des gènes sans que cela s’accompagne de la modification de la séquence d'ADN sous-jacente. Elle fait référence à l'addition d'un groupement méthyl sur le carbone 5 des cytosines (5meC). Ces dernières années, l’étude des mécanismes régulant la mise en place et le maintien de de cette méthylation est devenu un thème de recherche importante, en raison de son rôle essentiel dans la régulation du fonctionnement du génome des plantes et des mammifères. La distribution des 5meC sur l’ensemble du génome d’un organisme, encore appelé méthylome, peut être déterminée par différentes méthodes dont le séquençage de l’ADN génomique après traitement au bisulfite de sodium (WGBS ou méthyl C séq). Chez les végétaux, la méthylation de l’ADN peut se produire dans tous les contextes de séquence incluant les motifs symétriques CG et CHG et le contexte dissymétrique CHH (H pouvant être A, T ou C). En fonction du contexte de séquence, la méthylation des cytosines est mise en place et maintenue par trois types différents d'ADN méthyltransférase. [ ] Chez la plante-modèle Arabidopsis, la déméthylation active de l'ADN joue un rôle essentiel dans l'empreinte maternelle et la déméthylation l’ADN génomique lors du développement de l’albumen, mais elles ne semblent pas jouer de rôle essentiel pendant le développement de la plante chez cette espèce. La méthylation de l’ADN génomique peut aussi être perdue après la réplication de l’ADN, lorsque les mécanismes devant assurer son maintien ne sont pas actifs. On parle alors de déméthylation passive de l’ADN génomique. [ ] En conclusion, les observations présentées dans ce travail fournissent un cadre de travail permettant d’analyser les mécanismes moléculaires responsables de la déméthylation de l'ADN se produisant pendant la maturation des fruits de tomate. Ici, nous présentons une analyse complète des conséquences d’une réduction de l’expression du gène de SlDML2 sur le trancriptome et le métabolome des fruits, tout au long de leur développement. La corrélation entre les profils d’expression de gènes réalisées lors de ce travail ( variété WVA106) et les changements de la distribution de la méthylation de l’ADN telles que décrites chez la variété Ailsa craig montre qu’en plus d'un rôle général dans la régulation des gènes directement impliqués dans plusieurs voies métaboliques, plusieurs gènes codant pour des facteurs de transcription ainsi que des régulateurs épigénétiques sont également susceptibles d'être directement contrôlés par la méthylation de leur région promotrice. Cependant, nous ne pouvions pas établir une relation stricte entre la diminution de la méthylation de l'ADN et l'induction de l'expression des gènes, car de nombreux gènes présentant une diminution du niveau de méthylation de l'ADN dans leur région promotrice pendant la maturation des fruits sauvages correspondent à des gènes normalement réprimés. Ceci suggère que la méthylation active de l'ADN serait nécessaire à leur répression pendant le processus de maturation. Ainsi la relation entre la déméthylation de l'ADN et l'expression des gènes pourrait être plus complexe et ne se limiterait pas à la simple hypothèse de départ de ce travail: la déméthylation de l'ADN est nécessaire à l'expression de gènes induits au cours de la maturation. La déméthylation active de l'ADN pourrait également être nécessaire à la répression de gènes exprimés uniquement lors des phases précoces du développement des fruits et réprimés lors du murissement
DNA methylation is one of the epigenetic mechanisms that lead to stable and heritable changes in gene expression without alteration on DNA sequence. DNA methylation refers to the addition of a methyl group to the fifth position of the cytosine ring. In recent years, DNA methylation is becoming more and more widely studied, because of its importance in mammals and plants. Methylated cytosines distribution can be determined across the genome at single-nucleotide resolution, that is methylome, using whole genome bisulfite-sequencing (BS-seq) approaches. [ ] Solanum lycopersicum (tomato) is an important agronomic crop and the main model to study the development and ripening process of climacteric fleshy fruit. Recent studies have now shown that the development and ripening of fleshy fruits relies on the establishment and maintenance of differential transcription patterns and complex regulatory pathways that involve both genetic and hormonal controls are operating at these developmental phases. However, it appears that a full understanding of fruit development and ripening will not be achieved based only on genetic models as suggested by recent studies, which showing an important decrease in global methylation level and demethylation at specific promoters during fruit ripening. [ ] In conclusion, the observations presented in this work provide a framework for analysis of the molecular mechanism of DNA demethylation during fruit ripening of tomato. Here, we provide a comprehensive analysis of the knock down SlDML2 on the trancriptome, metaoblom and DNA methylation in the promoter analysis. The large transcriptional reprogramming that occured in mutant during fruit ripeing was correlated alterations in DNA methylation. Here we highlight the central role of active DNA demethylation during tomato fruit ripening. In addition to a general role in the regulation of genes directly involved in several metabolic pathways, we also found that several transcription factors as well as epigenetic regulators are also likely under direct methylation control. However, we could not establish a district relationship between DNA reduction of DNA methylation and induction of gene expression, as not all DEGs containing a type-a DMRs (decreased DNA methylation during fruit ripening) do not correspond to genes normally induced in WT and repressed in transgenic plants. Some were corresponding to an opposite situation and in a few cases more complex methylation pattern (several DMRs) were also found. Indeed these conclusions are based on methylation analysis obtained in another variety. They might however reflect the situation of WVA106 fruits, although some variations are expectable when the methylome of DML RNAi fruits will be analyzed. Hence the relationship between DNA demethylation and gene expression might be more complex than expected, and not limited to the starting hypothesis of this work: DNA demethylation is an absolute requirement for the expression of critical ripening induced genes. This is indeed clearly in this study, but the analysis presented here also suggest that DNA demethylation might also be necessary for the repression of several genes as well. In addition, from the rencent study in Arabidopsis, ROS1 were found preferentially targets transposable elements (TEs) which are closer to protein coding genes and intergenic regions, which suggesting that ROS1 may prevent DNA methylation spreading from TEs to nearby genes. While in tomato, as our analysis, we found the methylation level of promoter of a number of genes was altered during fruit ripening, therefore, through methylome analysis, we will also get the preference of DNA methylation on TE, this analysis will give us idea that demethylation in fleshy fruit may has other distinct function as it is in Arabidopsis

16

Jaimes, Miranda Fabiola Bouzayen Mondher. "La régulation transcriptionnelle dépendant de l'éthylène Caractérisation fonctionnelle d'un cofacteur transcriptionnel du type MBF1 et d'un facteur de transcription de la famille des ERF chez la tomate /." Toulouse : INP Toulouse, 2006. http://ethesis.inp-toulouse.fr/archive/00000242.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

17

Moïse, Adeline. "Mise en place et évolution de la paroi cellulaire du péricarpe du fruit de tomate au cours de son développement et de sa maturation." Nantes, 2009. http://www.theses.fr/2009NANT2008.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Les changements des propriétés de texture du fruit au cours de la maturation et de la sénescence sont associés à la dégradation de la paroi. Toutefois, les évènements à l’origine de ces changements ne sont pas clairement identifiés et pourraient se réaliser dès le développement précoce du fruit. Dans ce travail, nous nous sommes intéressés aux parois cellulaires du péricarpe externe depuis la mise en place des polysaccharides pariétaux lors du développement précoce jusqu’à leur dégradation au cours de la maturation du fruit. Une étude morphologique des cellules du péricarpe aux différents stades de développement du fruit a permis de préciser les différents phases de l’expansion cellulaire. L’analyse chimique des parois a montré un remaniement de leur composition tout au long du développement du fruit avec une synthèse importante de rhamnogalacturonanes de type I au début de la phase d’expansion cellulaire. L’analyse de la structure fine des xyloglucanes et des (galacto)glucomannanes a révélé un remodelage de ces polymères pendant la phase de maturation mais également durant la phase d’expansion cellulaire. L’immunocytochimie a apporté des éléments nouveaux sur la distribution des différents polysaccharides au sein de la paroi. Enfin, nous avons examiné l’influence des modalités de conservation sur la composition de la paroi de fruits issus de lignées présentant une texture contrastée au stade rouge. Nous avons montré que les conditions de conservation modulaient la dégradation des pectines et que les différences de composition des parois entre lignées s’atténuaient au cours de la période postrécolte
Fruit texture depends on histology and cell wall architecture, both under genetic and developmental controls. If ripening related cell wall modifications have been well documented with regard to softening, little is known about cell wall construction during early fruit development. Identification of key events and their kinetics with regard to tissue architecture and cell wall development can provide new insights on early phases of texture elaboration. Changes in the pericarp cellular structure during fruit development were first characterized. Cell expansion was shown to occur differently to the location within the pericarp. Analysis of cell wall composition and polysaccharide structure revealed that both are continuously modified during fruit development and not only during the ripening stage. During early stages, the relative high rhamnose content in cell walls indicates a high synthesis of rhamnogalacturonan I next to the one of homogalacturonans. Fine tuning of rhamnogalacturonan I side chains appears to occur from the cell expansion phase until prior the mature green stage. Cell wall polysaccharides remodelling also concerns xyloglucans and (galacto)glucomannans, the major hemicelluloses in tomato cell walls. In situ localization of cell wall polysaccharides in pericarp tissue brings new insights on cell wall construction and architecture. Then, the impact of post-harvest storage conditions on fruit texture from different genotypes was investigated in relation with cell wall changes. An effect of post-harvest conditions was found on pectins. Differences in cell wall composition between genotypes decreased on the course of storage

18

Rainieri, Massimo. "Caractérisation de la diversité épigénétique chez différentes espèces cultivées et sauvages de tomate." Thesis, Bordeaux 1, 2012. http://www.theses.fr/2012BOR14502/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

La tomate (Solanum lycopsersicum), qui forme un clade monophylétique restreint au sein de la large famille des Solanacées, est utilisée comme modèle pour l’analyse du génome, et le développement du fruit. A ce jour, de nombreux efforts ont été consacrés à l'analyse de la diversité génétique des espèces de tomate. Cependant peu de travaux ont porté sur l'analyse de la diversité épigénétique, alors qu’il est aujourd’hui admis que les processus épigénétiques jouent un rôle essentiel dans la diversité phénotypique. Dans un premier temps, le niveau de méthylation de l'ADN a été comparé dans les feuilles et les fruits de différentes variétés de tomates sauvages et cultivées. Puis la famille des gènes Enhancer of zeste (E (z)) a été analysée. Chez la tomate, cette famille comprend deux gènes fonctionnels ainsi qu’un pseudogène. Finalement la stabilité épigénétique reste un facteur majeur pouvant avoir un impact essentiel sur les stratégies de sélection végétales. En outre nous avons fait une caractérisation fine des différents aspects du développement du fruit et de la maturation
Tomato (Solanum lycopsersicum) which forms a small monophyletic clade within the large Solanaceae family has been chosen as a model system for studying the Solanaceae genome, fruit development and ripening. At that time, many efforts have been devoted to the analysis of the genetic diversity of tomato species, little work has focused on the analysis epigenetic diversity in this clade, although there is a general agreement that epigenetic processes play essential role in the phenotypic diversity in animal and plant system. As first step, DNA methylation level was analyzed in leaves and fruits of various wild and cultivated tomato species.Additionally, the Enhancer of zest (E(z)) gene family has been analyzed. In tomato, the E(z) family consists in two functional genes (SlEZ1, SlEZ2) and in a pseudogene (SlEZ3). In addition, the epigenetic stability is an important consideration that could have a significant on strategies for crop breading. Finally, we made a fine characterization of the different aspects of fruit development and ripening
All’interno della grande famiglia delle Solanacee è stato scelto il pomodoro (Solanum lycopsersicum) come sistema modello per studio dello sviluppo e maturazione del frutto. Molti sforzi sono stati fatti per analizzare la diversità genetica delle specie di pomodoro, pochi lavori invece riguardano l’analisi della diversità epigenetica, sebbene ci sia accordo sul fatto che processi epigenetici giochino un ruolo essenziale nella diversità fenotipica dei sistemi animali e vegetali. Inizialmente è stato analizzato il livello di metilazione del DNA in foglie e frutti delle diverse specie di pomodoro selvatico e coltivato. Inoltre, è stata analizzata la famiglia genica Enhancer of Zeste (E (z)). In pomodoro la famiglia E(z) consiste di 2 geni funzionali SlEZ1, SlEZ2 e di uno pseudogene SlEZ3. Inoltre la stabilità epigenetica è importante in quanto può avere un impatto sulle strategie di miglioramento genetico delle specie coltivate. Infine è stata condotta una attenta caratterizzazione dei meccanismi cellulari dello sviluppo del frutto e della sua maturazione

19

Albert, Elise. "Déterminants génétiques et génomiques de la réponse au déficit hydrique chez la tomate (Solanum lycopersicum) et impact sur la qualité des fruits." Thesis, Avignon, 2017. http://www.theses.fr/2017AVIG0688/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

A l’échelle du globe, la diminution des ressources en eau est devenue un des principaux facteurs limitants pour les productions agricoles. Jusqu’à présent, les approches génomiques à haut débit conduites chez les espèces modèles ont permis d’identifier des centaines de gènes potentiellement impliqués dans la survie des plantes en conditions de sécheresse,mais très peu ont des effets bénéfiques sur la qualité et le rendement des cultures.Néanmoins, l’application d’un déficit hydrique bien contrôlé peut permettre d’améliorer la qualité des fruits charnus par dilution et/ou accumulation de composés gustatifs majeurs.Dans ce contexte, la première partie du travail de thèse avait pour but de déchiffrer les déterminants génétiques de la réponse au déficit hydrique chez la tomate en explorant les interactions ‘génotype x niveau d’irrigation’ (G x I) et ‘QTL x niveau d’irrigation’ (QTL x I) dans deux populations. La première population consistait en un ensemble de lignées recombinantes (RIL) issues du croisement entre deux accessions cultivées, tandis que la seconde était composée de diverses accessions à petits fruits principalement originaires d'Amérique du Sud. Les plantes ont été phénotypées pour un ensemble de caractères agronomiques (vigueur des plantes et qualité des fruits) et génotypées pour des milliers de SNP. Les données ont été analysées en utilisant les méthodologies de la cartographie de liaison et d'association, permettant l'identification de QTL et gènes candidats putatifs pour la réponse de la tomate au déficit hydrique. La deuxième partie du travail de thèse avait pour objectif d'explorer la régulation des gènes dans les fruits et les feuilles de tomates en condition de déficit hydrique. Dans ce but, des données de séquençage du transcriptome ont été recueillies sur les deux génotypes parentaux de la population RIL et leur hybride F1. Les données ont été analysées pour identifier les gènes et les allèles exprimés de manière différentielle. Puis, l'expression de 200 gènes a été mesurée dans les fruits et les feuilles de l’ensemble des lignées de la population RIL par qPCR micro-fluidique à haut débit. Des eQTL et des interactions ‘eQTL x niveau d’irrigation’ ont été identifiés pour ces gènes par cartographie de liaison. Les colocalisations entre les QTL phénotypiques et les QTL d’expression ont été analysées. Les connaissances produites au cours de cette thèse contribuent à une meilleure compréhension des interactions des plantes de tomate avec leur environnement et fournissent des bases pour l'amélioration de la qualité des fruits en conditions d’irrigation limitée
Water scarcity will constitute a crucial constraint for agricultural productivity in a nearfuture. High throughput approaches in model species have identified hundreds of genespotentially involved in survival under drought conditions, but very few having beneficialeffects on quality and yield in crops plants. Nonetheless, controlled water deficits mayimprove fleshy fruit quality through weaker dilution and/or accumulation of nutritionalcompounds. In this context, the first part of the PhD was aimed at deciphering the geneticdeterminants of the phenotypic response to water deficit in tomato by exploring thegenotype by watering regime (G x W) and QTL by watering regime (QTL x W) interactions intwo populations. The first population consisted in recombinant inbreed lines (RIL) from across between two cultivated accessions and the second was composed of diverse small fruittomato accessions mostly native from South America. Plants were phenotyped for majorplant and fruit quality traits and genotyped for thousands of SNP. Data were analyzed withinthe linkage and association mapping frameworks allowing the identification of QTLs andputative candidate genes for response to water deficit in tomato. The second part of the PhDhad the objective to explore gene regulation in green fruit and leaves of tomato plantsstressed by water deficit. For this purpose, RNA-Seq data were collected on the two parentalgenotypes of the RIL population and their F1 hybrid. Data were analyzed to identifydifferentially expressed genes and allele specific expression (ASE). Then, the expression of200 genes was measured in leaves and fruits of the whole RIL population by high throughputmicrofluidic qPCR. eQTLs and eQTL by watering regime interactions were mapped for thosegenes using linkage mapping. Colocalisations with the phenotypic QTLs were analyzed. Theknowledge produced during this PhD will contribute to a better understanding of the tomatoplant interaction with their environment and provide bases for improvement of fruit qualityunder limited water supply

20

Devaux, Carine. "La carence en sucres chez la tomate (Lycopersicon esculentum Mill. ) : étude in vitro et application à des plantes en production." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR28798.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

21

Xu, Jiaxin. "Exploration du polymorphisme moléculaire et protéique de la tomate pour l’identification de QTL de qualité du fruit." Thesis, Avignon, 2012. http://www.theses.fr/2012AVIG0644/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L’amélioration de la qualité du fruit de tomate dépend largement de la variation génétique. A la suite de la domestication et de la sélection moderne, la diversité moléculaire chez la tomate a été profondément réduite, limitant les possibilités d’amélioration. De nouveaux marqueurs moléculaires révélant les polymorphismes nucléotidiques (SNP) constituent des outils précieux pour saturer les cartes génétiques et identifier des QTL (quantitative trait loci) et des associations chez une espèce peu polymorphe comme la tomate. Les objectifs de cette étude étaient de caractériser la diversité génétique de la tomate au niveau moléculaire et de tenter d’identifier des QTL, des gènes et des protéines responsables de la variation de caractères de qualité du fruit. Pour cela, trois études indépendantes ont conduit à (1) la découverte de nouveaux marqueurs SNP, (2) leur utilisation en génétique d’association et (3) l’analyse de la diversité du protéome en relation avec des caractères physiologiques du fruit.Dans la première étude, nous avons comparé deux plateformes de reséquençage pour reséquencer des zones ciblées couvrant environ 0.2% du génome de deux accessions contrastées. Plus de 3000 SNP sont été identifiés. Nous avons ensuite validé 64 SNPs en développant des marqueurs CAPS. Nous avons ainsi montré l’intérêt des techniques de reséquençage pour la découverte de SNP chez la tomate et produit des marqueurs simples qui peuvent être utiles pour caractériser de nouvelles ressources.Nous avons ensuite développé un ensemble de 192 SNPs et génotypé une collection de 188 accessions comportant des accessions cultivées, des types “cerise” et des formes sauvages apparentées et recherché des associations avec 10 caractères de qualité du fruit. Une quarantaine d’associations a été détectée dans des régions où des QTL avaient été préalablement identifiés. D’autres associations ont été identifiées dans de nouvelles régions. Nous avons ainsi confirmé le potentiel de la génétique d’association pour la découverte de QTL chez la tomate. Finalement une approche combinant l’analyse du protéome, du métabolome et de traits phénotypiques a été mise en oeuvre pour étudier la variabilité naturelle de la qualité du fruit de huit lignées contrastées et de quatre de leurs hybrides, à deux stades de développement (expansion cellulaire et orange-rouge). Nous avons identifié 424 spots protéiques variables en combinant électrophorèse bidimensionnelle et nano LC MS/MS et construit une carte de référence du protéome de fruit de tomate. En parallèle, nous avons mesuré la variation de teneurs en 34 métabolites, les activités de 26 enzymes et cinq caractères phénotypiques. La variabilité génétique et les modes d’hérédité ont été décrits. L’intégration des données a été réalisée par construction de réseaux de corrélations et régression sPLS. Plusieurs associations ont été détectées intra et inter niveau d’expression, permettant une meilleure compréhension de la variation de la qualité des fruits de tomate
Fruit quality in tomato is highly dependent on genetic variation. Following domestication and modernbreeding, molecular diversity of tomato has been strongly reduced, limiting the possibility to improvetraits of interest. New molecular markers such as single nucleotide polymorphisms (SNP) constituteprecious tools to saturate tomato genetic maps and identify quantitative trait loci (QTL) andassociations in a poorly polymorphic species like tomato. The objectives of this study were tocharacterize tomato genetic diversity at the molecular levels and to try to identify QTLs, genes andproteins responsible for fruit quality traits in tomato. For this purpose, three independent studies wereconducted leading to the discovery of new SNP markers, their use for association study and finally theanalysis of proteome diversity in relation to physiological phenotypes. We first used two nextgenrationsequencing platforms (GA2 Illumina and 454 Roche) to re-sequence targeted sequencescovering about 0.2% of the tomato genome from two contrasted accessions. More than 3000 SNPswere identified between the two accessions. We then validated 64 SNPs by developing CAPS markers.We thus showed the value of NGS for the discovery of SNPs in tomato and we produced low costCAPS markers which could be used to characterize other tomato collections. A SNPlexTM arraycarrying 192 SNPs was then developed and used to genotype a broad collection of 188 accessionsincluding cultivated, cherry type and wild tomato species and to associate these polymorphisms to tenfruit quality traits using association mapping approach. A total of 40 associations were detected andco-localized with previously mapped QTLs. Some other associations were identified in new regions.We showed the potential of using association genetics in tomato. Finally, a new analytical approachcombining proteome, metabolome and phenotypic profiling were applied to study natural geneticvariation of fruit quality traits in eight diverse accessions and their four corresponding F1s at cellexpansion and orange-red stages. We identified 424 variable spots by combining 2-DE and nano LCMS/MS and built the first comprehensive proteome reference map of the tomato fruit pericarp at twodevelopmental stages from the 12 genotypes. In parallel, we measured the variation of 34 metabolites,26 enzyme activities and five phenotypic traits. A large range of variability and several inheritancemodes were described in the four groups of traits. Data integration was achieved through sPLS andcorrelation networks. Many significant associations were detected within level and between levels ofexpression. This systems biology approach provides better understanding of networks of elements(proteins, enzymes, metabolites and phenotypic traits) in tomato fruits

22

Girardi, César Luis Pech Jean-Claude. "Caracterisation fonctionnelle d'un facteur d'élongation mitochondrial LeFT-Tsmt chez la tomate eapproches par transgénèse et protéomique /." Toulouse : INP Toulouse, 2006. http://ethesis.inp-toulouse.fr/archive/00000378.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

23

Telef, Nadège. "Influence de la nutrition carbonée sur la biosynthèse des caroténoïdes au cours de la maturation du fruit de tomate." Bordeaux 1, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR12688.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L’accumulation massive de caroténoïdes, qui s’opère au cours du mûrissement du fruit de tomate, est influencée par le développement, l’éthylène, la lumière et la température. Nous avons évalué l’influence des sucres sur cette biosynthèse des caroténoïdes. Pour moduler les teneurs en sucres des tissus, des disques de péricarpe ont été cultivés in vitro en absence et en présence de saccharose. La présence de saccharose accélère la coloration des disques, ce qui a été corrélé à une accumulation plus rapide de caroténoïdes. Après 10 jours de culture, le saccharose engendre une accumulation préférentielle de lycopène sans pour autant modifier les teneurs finales de pigments. Des caractérisations structurales et physiologiques suggèrent que les disques de péricarpe cultivés in vitro mûrissent partiellement. L’action du saccharose peut en partie s’expliquer par une accumulation plus rapide des transcrits PSY1 (phytoène synthase), isoforme spécifique des fleurs et des fruits mûrissants.

24

Rothan, Christophe. "Évolution de l'ACC, de l'émission d'éthylène et des activités péroxydasiques : AIA et ACC oxydasiques au cours de la maturation de la tomate (Lycopersicon esculentum Mill.)." Toulouse, INPT, 1987. http://www.theses.fr/1987INPT023A.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

La vegetation et l'evolution de l'acc (libre et conjugue), des formes solubles et ionique et des isoenzymes (acide et basique) de la peroxydase, ainsi que l'emission d'ethylene sont suivies au cours de la maturation (six stades de maturite) de 2 varietes de tomates, prealablement caracterisees par un ensemble de criteres physicochimiques classiques

25

Junglee, Sanders. "Implication de NO dans la régulation du recyclage de l’ascorbate dans les fruits de tomate (Solanum lycopersicum, cv micro-Tom) et en réponse à une contrainte environnementale." Thesis, Avignon, 2014. http://www.theses.fr/2014AVIG0660/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

A cours du développement du fruit, son statut oxydatif évolue entraînant une évolution concomitante des activités enzymatiques antioxydantes et ceci en interaction avec des hormones impliquées dans le développement et la maturation du fruit. Ces enzymes antioxydantes sont la superoxyde dismutase (SOD) et la Catalase (CAT) mais également de celles du cycle d’Haliwell-Asada (ascorbate peroxydase (APX), monodehydroascorbate reductase (MDHAR), dehydroascorbate reductase (DHAR) et gluthation reductase (GR) impliquées également dans le recyclage de l’ascorbate. L’objectif de la thèse est de comprendre les interactions existant entre le stress oxydatif induit par les stress environnementaux au niveau des organes végétatifs et le recyclage de l’ascorbate dans les fruits de tomate (cv Micro-Tom).Dans une première partie nous montrons qu’un déficit hydrique contrôlé et rapide induit une diminution du potentiel hydrique foliaire (Ψh) sans aucun symptôme de stress photo-oxydatif détectable au niveau du PSII après 24h et sans que le statut hydrique du fruit ne soit affecté. Dans ces conditions, on observe toutefois une augmentation du H2O2 dans les fruits et une augmentation de l’activité des enzymes antioxydantes et de celles impliquées de recyclage de l’ascorbate. Par ailleurs, nous montrons une production de NO et de ABA en réponse au stress dans la plante. La localisation de NO a été réalisée par microscopie à fluorescence en utilisant la nouvelle sonde NO, la NO550 (mise au point pendant le doctorat).Afin de déterminer si NO est responsable de la mise en place de la réponse antioxydante du fruits en interaction avec l’ABA et H2O2, une approche pharmacologique a été réalisée. Les résultats montrent une augmentation des activités de ces enzymes en présence de ces trois molécules, avec une plus forte augmentation en présence de NO à chaque fois. Par ailleurs, nous montrons que l'ABA induit la synthèse de NO dans le fruit et non l’inverse. On peut conclure de cette analyse que l’ABA induit par le déficit hydrique est responsable de la synthèse de NO dans les fruits et ce signal va induire l’activation des enzymes antioxydantes en association avec H2O2.Finalement, une approche transcriptomique a été réalisée pour étudier d’une part les gènes induits par NO et les gènes induits par le déficit hydrique au travers du NO. Les résultats suggèrent quele NO est à la croisée de la réponse au stress biotique et abiotiques et pourrait être utilisé pour acclimater les plantes au stress biotiques
Oxidative status alongside with antioxidant enzymes activities constantly evolve during fruit development. This evolution is closely related to hormones involved in fruit development and maturation. The antioxidant enzymes are superoxide dismutase (SOD) and Catalase (CAT) as well as those of Haliwell-Asada cycle (ascorbate peroxydase (APX), monodehydroascorbate reductase (MDHAR), dehydroascorbate reductase (DHAR) and gluthation reductase (GR) which are also implicated in ascorbate recycling. The objective of this work is to decipher the interactions between oxidative stress induced by environmental stress in vegetative organs and ascorbate recycling in tomato fruits (cv Micro-Tom).Results obtained show that a rapid and controlled water deficit result in a fall in water potential (LΨw) whereas other water parameters remained unaffected and without any photo-oxidative symptoms detected in PS II after 24 hours. However we observed alongside an increase in H2O2 and of the activity of antioxidant enzymes as well as those involved in ascorbate recycling. Furthermore an increase in NO and ABA production was also detected in the plants in response to the stress. NO localisation was realised using fluorescence microscopy using the newly synthesised NO probe NO550 (developed during the thesis).We used a pharmacological approach in order to determine if NO is responsible of the set up of the antioxidant response together with ABA and H2O2. Results show an increase in the activity of the enzymes in contact with the three molecules with every time a greater increase with NO. Furthermore, we show that ABA induces NO production. Those results made us conclude that ABA production induced by the water deficit is responsible of NO synthesis in fruits and may have the action of a signal with activates antioxidant enzymes with the collaboration of H2O2.A microarray analysis was also conducted in order to study the genes induced by NO and the genes induced by water deficit through NO. Results suggest that NO is at the cross road of the response towards biotic and abiotic stress and might be a useful tool to acclimatize plant to stressful conditions

26

Wang, Jiaojiao. "Study of starch metabolism in tomato fruit by using forward and reverse genetic approaches." Thesis, Bordeaux, 2020. http://www.theses.fr/2020BORD0213.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L’amidon joue un rôle central pendant le développement et la maturation des fruits. Sa dégradation fournit de l’énergie et des sucres aux fruits en maturation tandis que son accumulation répond aux stress environnementaux. La connaissance du métabolisme de l’amidon dans les feuilles s’est considérablement améliorée, principalement grâce à la caractérisation des mutants d’Arabidopsis (sans amidon ou excédentaire), mais on en sait très peu sur les fruits. Dans cette étude, nous avons utilisé des approches de génétique directe et inverse pour obtenir des mutants de tomate produisant des fruits avec un excès d’amidon.Pour mener la démarche de génétique directe, nous avons combiné l’utilisation d’une plateforme robotisée permettant le dosage d’amidon à haut-débit avec celle d’une importante population de mutants EMS, et réalisé un criblage en utilisant des fruits rouges de près de 3000 individus. Trois candidats avec un excès d’amidon ont été trouvés, dont un (P17C12) a ensuite été confirmé avec une mutation récessive. Une grande population BC1F2 a été phénotypée puis utilisée pour localiser la mutation en utilisant une approche de cartographie par séquençage. Les résultats de l’analyse ont montré que la localisation la plus probable de la mutation est à l’extrémité du chromosome 1, avec 1 mutation KO, 2 mutations « faux-sens » et de nombreuses mutations dans des régions non codantes. Nous avons décidé de tester la RecQ hélicase 4 (RECQ4, Solyc01g103960, KO), un membre de la famille des protéines de transport mitochondrial (MCF, Solyc01g095510, « faux-sens »), un transporteur de phospholipides à ATPase (PTA, Solyc01g096930, « faux-sens »), un ORF situé en 5’ d’une protéine de fonction inconnue (CPuORF, Solyc01g105700, 5’ UTR) et la Rubrédoxine (Solyc01g097910, 3’UTR). Nous avons créé des mutants homozygotes KO ou faux-sens en utilisant CRISPR/Cas9 pour les gènes candidats RECQ4, MCF et PTA, et des mutants homozygotes avec mutations d’insertion / suppression dans le 5’ UTR pour CPuORF, mais aucun n’a montré de phénotype avec excès d’amidon. Pour la Rubrédoxine, en plus de créer des mutants KO et des mutants avec des mutations similaires dans 3’ UTR avec CRISPR/Cas9, nous avons également produit des plantes surexprimant la Rubrédoxine car chez mutant PP17C12, l’ARNm de la Rubrédoxine était fortement exprimé dans le fruit vert des lignées BC1F1 et S2. Le développement du mutant KO pour la Rubrédoxine (homozygotes) ne va pas au-delà du stade cotylédon. Les mutants avec des mutations dans 3’ UTR, qui n’ont montré aucun changement dans la quantité d’amidon ou les niveaux d'ARNm de Rubrédoxine. Certaines plantes ont montré des expressions 100 fois plus élevées de Rubrédoxine dans les feuilles, mais aucune n’a montré d’augmentation significative de la quantité d'amidon dans les fruits. Finalement, nous n’avons trouvé le phénotype avec excès d’amidon dans les fruits pour aucun des cinq gènes candidats testés, ce qui implique que davantage d'investigations seront nécessaires pour affiner la cartographie et identifier la mutation responsable de ce phénotype.En utilisant une approche de génétique inverse, nous avons sélectionné une alpha-amylase (AMY3.2) et trois bêta-amylases (BAM1.2, BAM3.2 et BAM9), pour lesquelles nous avons créé des mutants KO par CRISPR/Cas9. Nous avons obtenu des mutants KO homozygotes pour AMY3.2 et BAM9, et des mutants KO hétérozygotes pour BAM1.2 et BAM3.2 dans la génération T1. L'absence de BAM9 a conduit à une mauvaise fertilisation menant à une réduction du nombre de graines et à une diminution de la taille des fruits chez la plupart des mutants. Chez ces mutants, la quantité d'amidon était remarquablement élevée dans les fruits âgés de 35 DAP. Ces résultats préliminaires suggèrent que BAM9 pourrait jouer un rôle important dans la viabilité du pollen et dans la dégradation de l’amidon des fruits pendant le mûrissement
Starch plays a central role during fruit development and ripening. Its degradation provides energy and sugars in ripening fruits whereas its accumulation responds to environmental stresses, which suggests a buffering role. Knowledge of starch metabolism in leaves has dramatically improved, mostly through the characterization of Arabidopsis mutants (starch-less or -excessive), but only very little is known in fruits. In this study, we used both forward and reverse genetic approaches to obtain tomato mutants with starch-excess fruits.For applying forward genetics, we took advantages of the robotic platform and the large EMS mutant population of tomato (Micro-Tom, an ideal model for starch research), and performed a screen by using red fruits of nearly 3,000 individuals. Three starch-excess candidates were found and one (P17C12) could be confirmed as a homozygous mutant with a recessive starch-excess phenotype with Mendelian inheritance analysis. A large BC1F2 population was phenotyped and the starch-excess phenotype was mapped-by-sequencing. The sequence data obtained from the two bulks revealed that the mutation was likely located at the end of chromosome 1, a region that harbours 1 KO and 2 missense mutations as well as numerous mutations in non-coding regions. We decided to work with the KO, missense mutations and mutations in 5’ UTR and 3’ UTR first, which were a RecQ helicase 4 gene (RECQ4, Solyc01g103960), a mitochondrial carrier protein family gene (MCF, Solyc01g095510), a phospholipid-transporting ATPase gene (PTA, Solyc01g096930), a conserved peptide upstream open reading frame (CPuORF, Solyc01g105700), and a rubredoxin protein family gene (Solyc01g097910), respectively.To evaluate those mutations, we utilised different bioengineering techniques adapted to each case. We created KO or missense homozygous mutants by using CRISPR/Cas9 for RECQ4, MCF and PTA candidate genes, and homozygous mutants with insertion/deletion mutations in the 5’ UTR for CPuORF, but none of them showed a starch-excess phenotype. For Rubredoxin, besides creating KO mutants and mutants with similar mutations in 3’ UTR with CRISPR/Cas9, we also overexpressed Rubredoxin under the control of the 35S promoter as we found a significant increase of Rubredoxin mRNA in the 12 DAP (days after pollination) fruit of BC1F1 and S2 (P17C12), compared to the WT. The homozygous KO mutants could not grow through cotyledon stage, indicating that the lack of Rubredoxin is lethal for phototrophic plants. The mutants with mutations in 3’ UTR showed no changes in starch amount or mRNA levels of rubredoxin. Then, among the transformants overexpressing Rubredoxin, some showed 100 times higher expressions levels of Rubredoxin in leaves, but showed no significant starch increase in 20DAP fruit. Finally, none of the five candidate genes checked here led to a starch-excess phenotype in fruits, implying that more investigations are required regarding fine-mapping and mining the possible candidate genes.We also attempted to obtain starch-excess mutants via reverse genetics. We selected one alpha-amylase (AMY3.2) and three beta-amylases (BAM1.2, BAM3.2 and BAM9) to create the corresponding KO mutants by CRISPR/Cas9 techniques. We obtained homozygous KO mutants of AMY3.2 and BAM9, and heterozygous KO mutants of BAM1.2 and BAM3.2 in T1 generation. The mutants of two transgenic lines lacking AMY3.2 showed lower starch content in 20 DAP fruits. While the loss of BAM9 led to poor fertilization, and reduced seed numbers and fruit size in most mutants. Furthermore, in those mutants, starch levels were remarkably high in the ripening 35 DAP fruit. Then, in the red ripe fruit, mutants contained significant more glucose than WT fruits. Those results lead us to speculate that BAM9 may play important roles both in pollen viability and starch degradation during fruit ripening

27

Bollier, Norbert. "Implication des protéines adaptatrices IMA et MIF2 dans le développement floral chez Solanum lycopersicum et Arabidopsis thaliana." Thesis, Bordeaux, 2016. http://www.theses.fr/2016BORD0181/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Les gènes IMA (Inhibitor of Meristem Activity) et MIF2 (MIni zinc Finger 2) codent des protéines de la famille des « MIni zinc Finger » impliquées dans le développement et la réponse hormonale. Leur fonction est intimement liée à leur capacité d’interaction avec des protéines partenaires au travers de leur unique domaine, un doigt de zinc non-canonique. La génération et la caractérisation de plantes gain- et perte-de-fonction pour ces gènes chez Solanum lycopersicum et Arabidopsis thaliana nous a permis de mettre en évidence leur homologie fonctionnelle dans le mécanisme d’arrêt de la prolifération des cellules souches méristématiques : la terminaison florale. Au cours du développement floral précoce, leur expression est induite par le facteur de transcription à MADS-BOX AGAMOUS. Les protéines codées sont capables d’intéragir avec le facteur de transcription à doigt de zinc C2H2 KNUCKLES (KNU) et de recruter le co-facteur TOPLESS (TPL) ainsi que l’HISTONE DEACETYLASE19 (HDA19) pour former un complexe multimérique impliqué dans le remodelage de la chromatine. Ce complexe intervient ensuite afin de réprimer l’expression du régulateur majeur de la prolifération des cellules souches méristématiques WUSCHEL. Les travaux qui ont suivi ont permis de montrer qu’au-delà de leur intervention dans ce processus, les protéines IMA et MIF2 sont impliquées d’une manière plus générale dans le développement floral et l’organogenèse. Leur fonction de protéine adaptatrice est sans doute permise par le désordre intrinsèque qui les caractérise et qui leur permettrait une spécificité d’interaction avec divers partenaires protéiques
IMA (Inhibitor of Meristem Activity) and MIF2 (MIni zinc Finger 2) are two members of the MIni zinc Finger family (MIF) involved in the regulation of floral development and hormonal signaling pathways. Their ability to control physiological events is linked to their unique domain, a non canonical zinc finger, which confers to MIF the capacity to interact with other proteins. The characterization of gain- and loss-of-function lines for these genes in Solanum lycopersicum and Arabidopsis thaliana allowed us to unravel their functional homology in the termination of floral stem cell maintenance. During early floral development, IMA and MIF2 gene expression is induced by the MADS-Box transcription factor AGAMOUS. Then, IMA and MIF2 proteins recruit the C2H2 zinc finger KNUCKLES (KNU), in a transcriptional repressor complex together with TOPLESS (TPL) and HISTONE DEACETYLASE19 (HDA19). This complex binds to the WUSCHEL (WUS) locus leading to WUS repression via a chromatin deacetylation mechanism. Further work allowed us to demonstrate that IMA and MIF2 play a wider role in floral development and organogenesis. Their function as adaptor protein is probably linked to their intrinsic disorder leading to structural flexibility and interaction specificity with a large range of partners

28

Girardi, César Luis. "Caracterisation fonctionnelle d'un facteur d'élongation mitochondrial LeFT-Tsmt chez la tomate : approches par transgénèse et protéomique." Toulouse, INPT, 2006. http://www.theses.fr/2006INPT009A.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Cette thèse est relative à l’étude fonctionnelle d’un gène codant pour un facteur d’élongation Le-EF-Tsmt chez la tomate ayant une très forte expression lors de la maturation du fruit et sous l’effet de l’éthylène et de divers stress. L’expression assez élevée dans des mutants de tomate insensibles à l’éthylène indique cependant une forte composante de régulation indépendante de l’éthylène. Des fruits transgéniques dans lesquels Le-EF-Tsmt a été sur- et sous-exprimé ne sont pas affectés pour la respiration et la synthèse d’éthylène. Toutefois, la sensibilité aux oxydatifs de feuilles et de cals de plantes antisens est réduite en relation avec une activité plus élevée des peroxydase et glutathion réductase. Une analyse du protéome mitochondrial a montré qu’une protéine «heat-shock» ayant un rôle possible de chaperonne accompagne les variations de Le-EF-Tsmt. Cette analyse fournit de plus des données nouvelles sur un ensemble de près de 500 protéines mitochondriales de tomate

29

Seleguini, Alexsander [UNESP]. "Híbridos de tomate industrial cultivados em ambiente protegido e campo, visando produção de frutos para mesa." Universidade Estadual Paulista (UNESP), 2005. http://hdl.handle.net/11449/98844.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-01-28Bitstream added on 2014-06-13T18:59:26Z : No. of bitstreams: 1 seleguini_a_me_ilha.pdf: 1295338 bytes, checksum: 303c34c1232191356fce99849d722ed2 (MD5)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Estudos voltados para identificação de cultivares de tomate que combinem alta produção, tipo de fruto adequado ao consumo “in natura”, com boa qualidade e aparência externa, associada ao hábito de crescimento rasteiro é de grande importância para o aproveitamento de áreas ou períodos adversos à cultura estaqueada ou onde se pretenda apenas baixar o custo de produção. Este trabalho teve como objetivo estudar o comportamento de cinco híbridos de tomate industrial (AP 529, AP 533, Malinta, Heinz 9992 e Rio Brazil), nas condições de ambiente protegido e campo, para produção de frutos para mesa. O experimento foi conduzido de março a agosto de 2004, na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia / UNESP, Câmpus de Ilha Solteira, SP. As parcelas foram compostas de uma linha com 20 plantas, no espaçamento de 1,0m entre fileiras e 0,3 m entre plantas. Adotou-se o delineamento em blocos casualizados, com 4 repetições por ambiente, e análise de variância para grupo de experimentos, modelo fixo. O abrigo para o cultivo protegido tinha orientação leste-oeste, com dimensões de 5,4 x 30,0m, e cobertura em arco com filme de polietileno transparente de 75 mm de espessura. Avaliou-se o crescimento de plantas, características agronômicas, qualidade de frutos, além do estudo da viabilidade econômica. Verificou-se que em ambiente protegido foi maior a sobrevivência de plantas, maior o número de frutos médios, pequenos e totais produzidos por área. A produtividade total não foi alterada quando se comparou os ambientes de cultivo, entretanto o cultivo no campo apresentou maior produção de frutos graúdos, além de maior massa média de frutos. Qualitativamente os tomates produzidos em estufa apresentaram um melhor padrão. Em relação aos híbridos, a produtividade variou de 80,6 a 101,8 t/ha, destacando-se os híbridos AP 529 e AP 533, com... .
Studies gone back to identification to cultivate of tomato that combine high production, type of appropriate fruit to the natural consumption, with good quality and external appearance, associate to the habit of low it is of great importance for the use of areas or adverse periods to the propped up culture or where it is just intended to lower the production cost. This work had as objective to study the behavior of five hybrids of industrial tomato (AP 529, AP 533, Malinta, Heinz 9992 and Rio Brazil), in the conditions of protecting environment and field, for production of fruits for table. The experiment was conducted between march and august 2004, at the Teaching, Research and Extension Farm (Ilha Solteira, São Paulo State, Brazil) of the College of Engineering of Ilha Solteira, UNESP. The parcels had been composed of a line with 20 plants, in the spacing of 1.0 m between rows and 0.3 m between plants. The experimental design consisted of randomized blocks, with 4 repetitions for ambient, and analysis of variance, in a fixed model. The shelter for the protecting culture had orientation east-west, with 5.4 x 30.0m of dimensions and covering in arc with transparent polyethylene film of 75mm of thickness. Evaluated the growth of plants, agronomical characteristics and quality of fruits, beyond the study of the economic viability. It was verified that in protecting environment the survival of plants was bigger, greater the number of average, small fruits e total produced by area. The total productivity was not modified when it compared culture environments, however the culture in the field presented greater production of big fruits, beyond bigger average mass of fruits. Qualitatively the tomatoes produced in greenhouse had presented one better standard. In relation to the hybrids, the productivity varied of 80.6 the 101.8 t/ha, being distinguished... (Complete abstract, click electronic address below).

30

Gonzalez, Nathalie. "Etude du rôle de la kinase WEE1 dans le contrôle du cycle cellulaire et de l'endoréduplication au cours de l'organogénèse du fruit de tomate (Solanum lycopersicum Mill. )." Bordeaux 2, 2005. http://www.theses.fr/2005BOR21267.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Nous avons étudié l'implication de WEE1 dans le contrôle du cycle cellulaire et de l'expansion associée à l'endoréduplication et sa contribution dans l'organogenèse et la taille du fruit, en utilisant la tomate comme modèle du développement précoce du fruit charnu. Le gène S1WEE1 a été isolé et caractérisé. S1WEE1 est exprimé dans les tissus en division et dans les tissus où se met en place le processus d'endoréduplication. L'inhibition de l'expression de S1WEE1 dans des plantes transgéniques induit une réduction de la taille des plantes et des fruits due à une diminution de la taille cellulaire qui est corrélée à une réduction du niveau de ploÏdie. S1WEE1 participe au contrôle de la taille des cellules en régulant la durée de la phase G2 du cycle cellulaire et/ou la transition vers l'endoreduplication qui conduit potentiellement à l'expansion cellulaire. Une analyse préliminaire du promoteur de S1WEE1 et de plantes surexprimant ce gène a également été réalisée
We investigated the involvement of the WEE1 gene in the control of the cell cycle and the cell expansion-associated endoreduplication and its contribution to fruit organogenesis and fruit size using Tomato as a model for fleshy fruit development. We have isolated and characterized the genomic clone containing the whole S1WEE1 gene sequence from tomato. S1WEE1 is expressed in young dividing tissues and those where endoreduplication takes place. Impairing the expression of S1WEE1 in transgenic tomato plants resulted in a reduction of plant and fruit size resulting from a reduction in cell size which could be correlated with a decrease of the DNA ploidy levels. We showed that S1WEE1 participates in the control of cell size through the length determination of the G2 phase of the cell cycle and/or the onset of the endoreduplication process putatively driving cell expansion. A preliminary study of the S1WEE1 promoter and overexpressing S1WEE1 plants has also been performed

31

Tournier, Barthélémy. "Contrôle transcriptionnel de l'expression génique dépendant de l'éthylène au cours de la maturation du fruit chez la tomate (Lycopersicon esculentum)." Toulouse, INPT, 2003. http://www.theses.fr/2003INPT008A.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

La phytohormone éthylène contrôle une partie du programme génétique du mûrissement des fruits climactériques. Mais l'éthylène participe aussi à la réponse aux stress biotiques et abiotiques, à la sénescence, à l'abscission, à la germination, au développement des racines L'acquisition de la compétence à mûrir du fruit de tomate correspond à une modification de le sensibilité à l'éthylène, qui peut alors induire l'expression de certain des gènes effecteurs des transformations du mûrissement. Dans ce travail, des facteurs de transcription, corrélés à ce changement, ont été caractérisés. D'une part, l'étude de quatre nouveaux LeERF (Lycopersicon esculentum Ethylene Response Factors) a montré que certain d'entre eux sont régulés au cours de la maturation du fruit, suggérant que les voies de signalisation dans lesquelles ils sont impliqués se modifient au cours du mûrissement. Néanmoins, des plantes transgéniques sur-exprimant LeERF2 ne montrent pas de phénotype sur les fruits, mais une résistance accrue au froid et une germination plus rapide. D'autre part nous présentons des données relatives à la caractérisation moléculaire, biochimique et physiologique de ER24, un homologue des coactivateurs transcriptionnels de type MBF1 (Multiprotein Bridging Factor) qui est spécifiquement exprimé au cours de la maturation du fruit.

32

Forges, Marine. "Les rayonnements UV-C : un moyen de lutte pour stimuler les défenses du fraisier et de la tomate en cours de culture et améliorer la qualité / conservation des fruits après récolte." Thesis, Avignon, 2018. http://www.theses.fr/2018AVIG0700/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Certains champignons sont très dommageables pour les plantes mais aussi pour la conservation après récolte des produits végétaux. Les restrictions réglementaires concernant l’utilisation des fongicides nécessitent de trouver des solutions alternatives. L'amélioration de la résistance des plantes en utilisant des méthodes physiques, comme les rayonnements UV, peut présenter une alternative prometteuse en association avec d’autres méthodes dans le cadre d’une protection intégrée des cultures. L'objectif de cette thèse a été d’étudier l’effet des rayonnements UV-C sur la sensibilité des plantes aux agents pathogènes. Les rayonnements UV-C ont été appliqués durant la culture, seuls ou en combinaison à des agents de biocontrôle, ou en post-récolte. Les expérimentations ont été menées sur deux espèces végétales : le fraisier et la tomate.Sur fraisier, des traitements UV-C à une dose de 1,70 kJ/m² entraînent une diminution systématique d'environ 20 % de la sensibilité des feuilles à Botrytis cinerea et diminuent jusqu’à 50 % le nombre de feuilles attaquées par Podosphaera aphanis, l’agent causal de l’oïdium. Chez la tomate, la protection des feuilles contre B. cinerea atteint 43 % avec une dose d’UV-C cumulée de 4,0 kJ/m². Ces mêmes traitements UV-C appliqués sur fruits réduisent la sensibilité des fraises vis-à-vis de Rhizopus de 75 % mais aucun effet n’est observé vis-à-vis de B. cinerea. Au contraire, sur fruits de tomate, la sensibilité est diminuée d'environ 63 % contre cet agent pathogène. Parallèlement, des tests biochimiques et gustatifs suggèrent que la qualité des fruits n’est pas significativement améliorée ni altérée par les expositions UV-C. Malgré un effet germicide marqué des rayonnements UV-C sur feuilles de fraisiers, aucun effet bénéfique de l’application de ces rayonnements sur le niveau d’efficacité d’agents de lutte biologique n’a été mis en évidence.Nos observations sont encourageantes pour envisager une utilisation de cette méthode dans un schéma de protection intégrée des cultures. Cependant, une compréhension claire de la façon dont les rayonnements UV-C sont perçus par les plantes et traduits en mécanismes de défense est nécessaire avant que leur utilisation ne soit recommandée sur le terrain
Some fungi are very damaging during plant cultivation and also in post-harvest storage of products. Regulatory restrictions on fungicide use require alternative solutions. Improving plant resistance using physical methods, such as aplication of UV radiation, can be a promising alternative in association with other methods as part of an integrated pest management strategy. The objective of the present thesis was to study the effect of UV-C aplication on the sensitivity of plants to fungal pathogens. UV-C radiation was applied during plant cultivation, alone or in combination with biocontrol agents, or in post-harvest. Experiments were conducted on two plant species: strawberry and tomato.On strawberry plants, UV-C treatments at 1.70 kJ/m² result in a systematic 20 % decrease in leaves sensitivity to Botrytis cinerea and in a reduction by up to 50 % of the number of leaves infected by Podosphaera aphanis, the causal agent of powdery mildew. In tomato, leaves protection against B. cinerea reaches 43 % with a cumulative dose of 4.0 kJ/m². UV-C treatments applied on fruits reduce the strawberry sensitivity to Rhizopus by 75 % but no effect is observed against B. cinerea. On the contrary, sensitivity against B. cinerea is reduced by 63 % on tomato fruit. Biochemical and taste tests suggest that fruit quality is not significantly improved or altered by UV-C treatment. Despite a marked germicidal effect of UV-C radiation on strawberry leaves, it has no significant effect on the protective efficacy of biocontrol agents.Our observations are encouraging to consider the use of this tool in an integrated crop protection scheme. However, a clear understanding of how UV-C radiations are perceived by plants and their translation into defense mechanisms is necessary before their use is recommended in the field

33

Al, Gehani Idress. "Effet des stades d'application et de l'intensité de stress hydriques répétés sur l'état hydrique et la croissance des plantes et des fruits de tomate." Avignon, 2005. http://www.theses.fr/2005AVIG0315.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Des stress hydriques répétés, modérés (Base compris entre –0,6 à –1,3 MPa) et intensifs (Base compris entre –1,4 à –2,0 MPa) ont été appliqués sur des plants de tomate (Lycopersicon esculentum Mill. Cv Raïssa) cultivés en serre, pendant le stade de floraison et pendant la phase de croissance de fruits et ce, durant trois années successives. Les stress hydriques appliqués seuls réduisent la croissance des parties aériennes et des fruits. Lorsque les stress sont répétés, l'alimentation en eau des plantes et l'alimentation en eau ainsi que l'accumulation en matière sèche des fruits est très fortement améliorée d'environ +100% comparativement aux fruits stressés une seule fois, ce qui se traduit par un doublement de l'efficience d'utilisation de l'eau. Les plantes stressées sont capables d'ajustement osmotique et ceci d'autant plus que le stress est de forte intensité. Chez les fruits, le stress se traduit par une diminution du potentiel osmotique des fruits et une augmentation des teneurs, rapportées à la matière sèche, des sucres (glucose, fructose) et des acides (malique et citrique) des fruits, et il réduit la perte de fermeté des fruits de petit calibre. La fermeté est très bien corrélée avec le potentiel hydrique, et peu et moyennement avec le potentiel osmotique et de turgescence
Repeated water stress treatments of moderate intensity (pre-dawn leaf water potential from –0. 6 to –1. 3 MPa) and high intensity (pre-dawn leaf water potential from –1. 4 to –2. 0 MPa) were applied on tomato (Lycopersicon esculentum Mill. Cv Raïssa) plants growing in a greenhouse during the flowering and fruit growth stages for three successive years. The growth of shoots and fruits reduced with only one cycle of water stress treatment applied. When water stress treatment to be repeated, the water supply of the plants is strongly improved as well as the water supply and the dry matter accumulation of the fruits about +100% compared to the fruits developed by plants with only one cycle of water stress treatment, which results in a doubling of the water use efficiency. The stressed plants are able to develop an osmotic adjustment strategy whenever the stress intensity is high. Fruit osmotic potential decreased and accompanied by higher contents of soluble sugars (glucose and fructose) and of some organic acids (malic and citric acid). Water stress also reduces the loss of firmness of small size fruits. The firmness correlated strongly with fruit water potential but poorly with osmotic and turgor potential

34

Junior, Carlos Alberto de Souza. "Quantificação de espécies metállicas em Abacate (Persea americana Mill), Mamão (Carica papaya L.) Tomate (Lycopersicum esculentum Mill), Cupuaçu (Theobroma grandiflorum Schum), Dão (Ziziphus mauritiana Lam), Ingá (Inga edulis Mart), Tamarindo (Tamarindus indica L..), solo e água." Universidade Federal de Roraima, 2013. http://www.bdtd.ufrr.br/tde_busca/arquivo.php?codArquivo=246.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
As espécies metálicas são de grande importância para se conhecer a concentração de metais em diversas matrizes verificando sua disponibilidade no solo, água e nas polpas das frutas estudadas, e podendo assim identificar o seu potencial de armazenamento de nutrientes relacionados ao meio que se encontram as matrizes estudadas. Foi aplicado um método de tratamento de amostras, calcinação (CA), para a quantificação de K, Na e Li por Fotometria de Chama (FOC) e Ca, Cu, Fe, Mn, Ni e Zn por Espectrometria de Absorção Atômica por Chama (FAAS), em amostras de abacate (Persea americana Mill), mamão (Carica papaya L.), tomate (Lycopersicum esculentum Mill), cupuaçu (Theobroma grandiflorum Schum), dão (Ziziphus mauritiana Lam), ingá (Inga edulis Mart), tamarindo (Tamarindus indica L), e o solo e a água dessas regiões onde se encontravam essas matrizes em diferentes períodos denominados de seco e chuvoso. O método de CA mostrou-se eficiente, preciso, simples e exato para todas as espécies metálicas nas amostras sob estudo, com desvios padrões relativos abaixo de 10 % e recuperações na faixa de 90 a 110 %. Os teores de K, Na, Li, Ca, Cu, Fe, Mn, Ni e Zn, demonstram limites de quantificação (LOQs) ideais ou aceitáveis, no método de (CA) para todas as amostras abordadas neste estudo. Os testes estatísticos, F e t emparelhado (95 % de confiança) aplicados aos resultados do método de (CA) mostram na maioria das comparações, que não existem diferenças significativas entre as suas precisões e concentrações em todas as espécies, bem como entre as amostras estudadas nos diferentes períodos denominados de seco e chuvoso. Diante disto, fezse necessário aplicar as análises estatísticas PCA e HCA, para avaliar mais precisamente os resultados obtidos ao longo do trabalho. Diante disto, pode-se verificar que há uma similaridade entre as amostras através da visualização gráfica. O método de CA apresentou-se eficaz quando verificado a quantidade de reagente utilizado, etapas de manipulação e contaminação da amostra. A quantidade de água proveniente das épocas seca e chuvosa, interferem diretamente na concentração das espécies metálicas estudadas nas diversas matrizes, contudo o fato de se ter elevado teor de uma espécie metálica na água, não necessariamente interfere na concentração dessa espécie no solo e frutas dessa região.
The metallic species are of great importance in order to know the concentration of metals in various matrices checking its availability in soil, water and fruit pulps studied and can therefore identify their potential of storage nutrients in areas related to matrices which are here studied . It was applied a method of treatment of samples, calcination (CA) for quantification of K, Na and Li by flame photometry (FOC) and Ca, Cu, Fe, Mn, Ni and Zn Absorption by Atomic Spectrometry flame (FAAS), in samples of avocado (Persea americana Mill), papaya (Carica papaya L.), tomato (Lycopersicum esculentum Mill), cupuaçu (Theobroma grandiflorum Schum), (Ziziphus mauritiana Lam), Inga (Inga edulis Mart) , tamarindo (Tamarindus indica L), and soil and water in those regions where there were these matrices in different periods called dry and rainy. The method of CA proved to be efficient, accurate, simple and accurate for all metal species in the sample under study with relative standard deviations below 10%, and recoveries in the range of 90 to 110%. The levels of K, Na , Li , Ca, Cu, Fe, Mn, Ni and Zn show limits of quantification (LOQs) optimal or acceptable in the method of (CA) for all samples discussed in this study. Statistical tests, F e t paired (95 % confidence) applied to the results of the method (CA) show mostly comparisons that there are significant differences between their accuracy and concentrations in all species, as well as between samples studied in different periods called dry and rainy. Given this, it was necessary to apply statistical analysis PCA and HCA, in order to more accurately assess the statistical results obtained throughout the work. Given this, we can have a conclusion that there is a similarity between the samples through the graphical visualization. The method of CA was found to be effective when checked the quantity of reagent used, manipulation steps and sample contamination. The amount of water from the dry and wet, directly affect the concentration of metal species studied in various matrices, but the fact that a species having a high concentration metal species in the water, not necessarily interferes with the concentration of that species in soil and fruits of this region.

35

Larrigaudière, Christian. "Effets du traitement ionisant sur le métabolisme de l'acide 1 - aminocyclopropane - 1 - carboxylique chez des fruits climactériques : analyse de la réponse de stress et implications dans la maturation." Toulouse, INPT, 1989. http://www.theses.fr/1989INPT019A.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Ce travail constitue une contribution a l'etude de l'impact de l'ionisation sur la biosynthese de l'ethylene des fruits. L'ionisation apparait etre, dans ce cadre, un facteur de stres. L'augmentation de la production d'ethylene est associee a l'activation de l'acc synthetase. Elle est la consequence d'une synthese de novo de l'enzyme et eventuellement d'une traduction tres rapide (15 mn) des arnm quand ils sont presents dans le fruit. Les modifications du declenchement de la maturation observees a plus long terme sont la resultante de deux effets contradictoires, (i): l'activation generale du metabolisme de l'acc a court terme, et (ii): l'impact de l'ionisation sur le genome et le ralentissement des etapes transcriptionnelles. Ces deux effets varient en fonction de la dose d'irradiation. Ils provoquent chez la tomate cerise, une avance de la crise climacterique et une synchronisation du processus de maturation. La reponse aux stress (ionisation et cucl#2), a aussi ete analysee sur des suspensions cellulaires de fruits. Les resultats varient ici en fonction de la nature du stress, du vegetal et de son etat physiologique. Ils confirment l'activation de la synthese d'acc observee apres ionisation dans le cadre de systemes non senescents

36

Joubès, Jérôme. "Contribution à l'étude du développement précoce du fruit de tomate Lycopersicon esculentum Mill : rôle des gènes du cycle cellulaire dans le contrôle de l'organogé̀nèse du fruit." Bordeaux 2, 1999. http://www.theses.fr/1999BOR28705.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

37

Seleguini, Alexsander. "Híbridos de tomate industrial cultivados em ambiente protegido e campo, visando produção de frutos para mesa /." Ilha Solteira : [s.n.], 2005. http://hdl.handle.net/11449/98844.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Orientador: Shizuo Seno
Banca: José Luis Susumu Sasaki
Banca: João Carlos Athanazio
Resumo: Estudos voltados para identificação de cultivares de tomate que combinem alta produção, tipo de fruto adequado ao consumo "in natura", com boa qualidade e aparência externa, associada ao hábito de crescimento rasteiro é de grande importância para o aproveitamento de áreas ou períodos adversos à cultura estaqueada ou onde se pretenda apenas baixar o custo de produção. Este trabalho teve como objetivo estudar o comportamento de cinco híbridos de tomate industrial (AP 529, AP 533, Malinta, Heinz 9992 e Rio Brazil), nas condições de ambiente protegido e campo, para produção de frutos para mesa. O experimento foi conduzido de março a agosto de 2004, na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia / UNESP, Câmpus de Ilha Solteira, SP. As parcelas foram compostas de uma linha com 20 plantas, no espaçamento de 1,0m entre fileiras e 0,3 m entre plantas. Adotou-se o delineamento em blocos casualizados, com 4 repetições por ambiente, e análise de variância para grupo de experimentos, modelo fixo. O abrigo para o cultivo protegido tinha orientação leste-oeste, com dimensões de 5,4 x 30,0m, e cobertura em arco com filme de polietileno transparente de 75 mm de espessura. Avaliou-se o crescimento de plantas, características agronômicas, qualidade de frutos, além do estudo da viabilidade econômica. Verificou-se que em ambiente protegido foi maior a sobrevivência de plantas, maior o número de frutos médios, pequenos e totais produzidos por área. A produtividade total não foi alterada quando se comparou os ambientes de cultivo, entretanto o cultivo no campo apresentou maior produção de frutos graúdos, além de maior massa média de frutos. Qualitativamente os tomates produzidos em estufa apresentaram um melhor padrão. Em relação aos híbridos, a produtividade variou de 80,6 a 101,8 t/ha, destacando-se os híbridos AP 529 e AP 533, com... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo).
Abstract: Studies gone back to identification to cultivate of tomato that combine high production, type of appropriate fruit to the natural consumption, with good quality and external appearance, associate to the habit of low it is of great importance for the use of areas or adverse periods to the propped up culture or where it is just intended to lower the production cost. This work had as objective to study the behavior of five hybrids of industrial tomato (AP 529, AP 533, Malinta, Heinz 9992 and Rio Brazil), in the conditions of protecting environment and field, for production of fruits for table. The experiment was conducted between march and august 2004, at the Teaching, Research and Extension Farm (Ilha Solteira, São Paulo State, Brazil) of the College of Engineering of Ilha Solteira, UNESP. The parcels had been composed of a line with 20 plants, in the spacing of 1.0 m between rows and 0.3 m between plants. The experimental design consisted of randomized blocks, with 4 repetitions for ambient, and analysis of variance, in a fixed model. The shelter for the protecting culture had orientation east-west, with 5.4 x 30.0m of dimensions and covering in arc with transparent polyethylene film of 75mm of thickness. Evaluated the growth of plants, agronomical characteristics and quality of fruits, beyond the study of the economic viability. It was verified that in protecting environment the survival of plants was bigger, greater the number of average, small fruits e total produced by area. The total productivity was not modified when it compared culture environments, however the culture in the field presented greater production of big fruits, beyond bigger average mass of fruits. Qualitatively the tomatoes produced in greenhouse had presented one better standard. In relation to the hybrids, the productivity varied of 80.6 the 101.8 t/ha, being distinguished... (Complete abstract, click electronic address below).
Mestre

38

Ranc, Nicolas. "Analyse du polymorphisme moléculaire de gènes de composantes de la qualité des fruits dans les ressources génétiques sauvages et cultivées de tomate : recherche d'associations gènes/QTL." Thesis, Montpellier, SupAgro, 2010. http://www.theses.fr/2010NSAM0001/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Chez la tomate, l'amélioration pour la qualité du fruit est rendue difficile par la multiplicité et la complexité des caractères. La cartographie de QTL a permis la caractérisation génétique de ces caractères. L'objectif est maintenant d'identifier les gènes sous-jacents aux QTL. Nous avons utilisé la cartographie par déséquilibre de liaison (DL) dans ce but. Pour éviter les fausses associations entre caractères et polymorphismes moléculaires, la structure génétique a été prise en compte dans l'analyse. La tomate cultivée montre un faible niveau de diversité génétique, ce qui réduit la résolution de cartographie. Le génome de la tomate de type cerise est décrit comme une mosaïque entre celui de la tomate cultivée et de l'ancêtre sauvage. Ce mélange devrait augmenter la résolution des études d'association. Nous avons utilisé une « core collection » focalisée sur des accessions de type cerise pour valider la région génomique contenant un QTL pour le nombre de loges. Deux mutations sont associées avec le caractère. Ces deux SNP ont évolué différemment du reste du chromosome 2, en subissant une sélection balancée qui témoigne de l'augmentation de la diversité morphologique lors de la domestication. L'étude, focalisée sur le chromosome 2, a permis d'analyser l'étendue du DL en fonction de la distance génétique et physique. Des associations, entre polymorphismes et phénotypes étudiés, ont été détectés avec des méthodes prenant en compte la structure génétique. Nous avons montré l'intérêt d'utiliser la structure en mosaïque du génome des accessions de type cerise pour surmonter les limitations de résolution dans les analyses d'associations chez une espèce cultivée autogame
In Tomato (Solanum lycopersicum), breeding for fruit quality is difficult due to the multiplicity and complexity of the traits. QTL mapping has allowed the genetic characterization of these traits. One of the challenges is now to identify the genes underlying these QTLs. Following this aim, we used linkage-disequilibrium (LD) mapping. To avoid hazardous associations between traits and polymorphisms, the genetic structure has to be taken into account for LD mapping. Cultivated tomato showed low genetic diversity reducing mapping resolution. Cherry type tomato genome is described to be admixture between cultivated tomato and its wild ancestor. Such admixture may increase resolution of association mapping. We used a core collection focused on cherry type accessions to validate a candidate gene for a fruit locule-number QTL. We found that two single nucleotide polymorphisms (SNP) were highly associated with the trait. These two SNP evolved differently from the rest of the chromosome 2. They underwent a balanced selection which testifies a selection for fruit morphology diversity by human. Association mapping, focused on whole chromosome 2, allowed us to assess the extent of linkage disequilibrium over genetic and physical distances. Associations of polymorphisms with phenotypes were detected with structured association methods. We thus showed efficiency of genome admixture to overcome the low-resolution limitation of association mapping for an inbred crop. We validated previously identified QTLs and found associations with new QTLs and new candidate genes. An evolutionary model including bottleneck and gene flow between wild and domesticated forms is also presented

39

Hommel, Marie. "La régulation transcriptionnelle de l'expression génique dans le fruit de tomate : caractérisation fonctionnelle de promoteurs fruit-spécifiques et d'un co-facteur de la transcription de type MBF1." Phd thesis, Toulouse, INPT, 2007. http://oatao.univ-toulouse.fr/7697/1/hommel.pdf.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Les travaux présentés dans ce manuscrit s'intéressent à la régulation transcriptionnelle de l'expression des gènes au cours du développement du fruit de tomate à travers l'étude des cis-régulations et des trans-régulations. Dans un premier temps, une tentative de caractérisation de promoteur dirigeant l'expression génique spécifiquement dans le fruit a été menée. Pour cela, nous nous sommes focalisés sur l'étude de régions promotrices d'un gène codant une expansine et d'un autre codant une alcool acyl transférase. Ces études ont été menées en évaluant la capacité de ces régions promotrices à diriger l'expression du gène rapporteur codant pour la β-glucuronidase dans des plants de tomate et d'Arabidopsis. Néanmoins, ces approches fonctionnelles n'ont pas permis de dégager un motif consensus capable à lui seul de conférer une expression fruit-spécifique. C'est pourquoi, les travaux de thèse se sont orientés vers la caractérisation d'un co-activateur de transcription de type MBF1 (Multiprotein Bridging Factor1), SlER24 de tomate. Nous avons montré qu'une fusion de SlER24 à un motif répresseur EAR (Ethylene-responsive element-binding associated Amphiphilic Repression) est capable, dans un système cellulaire, de réduire l'expression du gène rapporteur GFP dirigée par un promoteur synthétique de réponse à l'éthylène. Cette validation fonctionnelle par une méthode transitoire, nous a conduit à surexprimer cette construction, de façon stable, dans la tomate MicroTom. Cette surexpression de la construction chimérique SlER24-EAR, induit un retard de germination mais n'a pas d'effet notable sur le développement de la plante. Une fusion similaire de son orthologue AtMBF1c au motif EAR entraîne chez Arabidopsis thaliana une réduction du pourcentage de germination et un nanisme de la plante. Au-delà de l'information sur le rôle des gènes MBF1 dans le développement des plantes, cette étude démontre que la stratégie utilisant le domaine répresseur EAR n'est pas seulement efficace pour l'étude des facteurs de transcription comme cela a été démontré jusque là, mais également pour les co-activateurs ne se liant pas directement à l'ADN.

40

Mathieu-Rivet, Elodie. "Etude du rôle de l'activateur de l'APC/C CCS52 dans la transition du cycle mitotique vers l'endocycle au cours du développement du fruit de tomate (Solanum lycopersicum Mill.)." Thesis, Bordeaux 2, 2009. http://www.theses.fr/2009BOR21654/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Au cours de cette étude, nous avons isolé 4 ADNc codant pour des protéines activatrices putatives de l'APC/C de tomate : SlCCS52A, SlCCS52B, SlCDC20-1, et SlCDC20-2. Des données obtenues par RT-qPCR et par hybridation in situ révèlent des profils d'expression différents au niveau tissulaire mais également au cours du développement du fruit de tomate, suggérant que différentes protéines activatrices pourraient assurer la modulation spatio-temporelle de l'activité de l'APC/C chez la tomate. De plus, les transcrits du gène SlCCS52A s'accumulent plus particulièrement dans le fruit durant la phase d'expansion cellulaire, tandis que les transcrits du gène SlCCS52B sont plutôt présents durant les premiers stades de développement, caractérisés par une forte activité de division cellulaire. Afin de préciser le rôle de SlCCS52A et SlCCS52B dans le contrôle du cycle cellulaire et de l'endocycle chez la tomate, ces gènes ont fait l'objet d'une étude fonctionnelle. La réduction de l'expression de SlCCS52A entraîne une réduction de la taille des fruits et de la taille cellulaire, qui s'accompagne d'une diminution du niveau de ploïdie. La surexpression de ce gène modifie la cinétique de développement des fruits. La mise en place de l'endocycle est retardée, mais l'augmentation de la ploïdie est plus rapide et la croissance relative du fruit est alors plus importante. Enfin, la réduction de l'expression de SlCCS52B entraîne une augmentation de l'expression de SlCCS52A au niveau des fruits, suggérant l'existence de mécanismes compensatoires. L'ensemble de ces résultats montrent que SlCCS52A est impliqué dans la mise en place de l'endoréduplication chez la tomate, et participe au contrôle de l'expansion cellulaire
In this study, we have isolated 4 cDNAs encoding putative proteins activating the APC/C in tomato: SlCCS52A, SlCCS52B, SlCDC20-1, and SlCDC20-2. Data obtained by RT-qPCR and in situ hybridization revealed different expression profiles in tissues but also during the development of tomato fruit, suggesting that different activator proteins could provide the spatio-temporal modulation of the APC/C activity in tomato. In addition, the SlCCS52A transcripts accumulate especially in the fruit during the cell expansion phase, while transcripts of the SlCCS52B gene are rather present during the early stages of development, characterized by a high activity of cell divisions. To clarify the role of SlCCS52A and SlCCS52B in cell cycle control and endocycle in tomato, we performed a functional analysis of these genes. Reducing the expression of SlCCS52A leads to reduced fruit size and cell size, accompanied by a decrease in the level of ploidy. The overexpression of this gene alters the kinetics of fruit development. The establishment of endocycle is delayed, but the increase in ploidy is faster and the relative growth of the fruit is much more important then. Finally, the reduced expression of SlCCS52B leads to an increased expression of SlCCS52A in fruit, suggesting the existence of compensatory mechanisms. All these results show that SlCCS52A is involved in the establishment of endoreduplication in tomato, and participates in the control of cell expansion

41

Khoja, Hyder Ali. "Caractérisation de deux gènes codant pour des petites protéi͏̈nes de type Rab liant le GTP, LeRab6 et LeER43, chez la tomate (Lycopersicon esculentum, Mill)." Toulouse, INPT, 2003. http://www.theses.fr/2003INPT006A.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Considérant que la maturation des fruits, comme d'autres processus de développement implique un transport intracellulaire de protéines, plus spécialement le transfert vers la paroi d'enzymes capables de dégrader les polymères pariétaux, nous avons isolé deux gènes LeRab6 et LeER43 codant des protéines de petite taille de type Rab liant le GTP, respectivement à partir d'une banque de ADNc de tomate (Lycopersicon esculentum, Mill) et de DDRT-PCR (Differential Display Reverse Transcription-PCR). Les profils d'expression par Northern blot et RT-PCR montrent une faible abondance de mRNA de LeRab6 au cours du développement du fruit de tomates Micro-Tom par comparaison avec les autres organes de la plante. Des études de ciblage cellulaire ont été réalisées en utilisant des constructions GFP (Green Fluorescent Protein)-LeRab6 et -LeER43 exprimées transitoirement dans des protoplastes de tabac. Les images de microscopie confocale ont montré une localisation cytoplasmique des deux types de protéines en accord avec leur rôle putatif dans le trafic vésiculaire. Des plantes de tomates ont été transformées via Agrobacterium tumefaciens avec une construction antisens de ces gènes. Les plantes transgéniques sous-exprimant LeRab6 présentent une dominance apicale réduite, un port buissonnant, un nanisme, une croissance déterminée, une inflorescence compacte et une ramification anormale. Un tel phénotype suggère que la balance hormonale impliquée dans la croissance et le développement est fortement affectée. En effet, l'application in vitro de différents rapports auxine/cytokinine montrent que les plantes antisens LeRab6 présentent une sensibilité réduite aux auxines lors de la rhizogenèse. Quant aux plantes antisens LeER43, le seul phénotype notable concerne la fermeté plus élevée des fruits antisens par rapport aux fruits témoins. Nous proposons que l'inhibition de l'expression de LeER43 empêche le transfert dans la paroi d'enzymes de dégradation de la paroi.

42

GOUBLE, BARBARA, and Daniel Côme. "Etude de l'action du protoxyde d'azote sur la biosynthese d'ethylene et la maturation de fruits de type climacterique : tomate (lycopersicon esculentum mill.) et avocat (persea americana mill.). analyse comparee du comportement du fruit entier et des disques de pericarpe de tomate." Paris 6, 1993. http://www.theses.fr/1993PA066758.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L'action anti-ethylene du protoxyde d'azote est demontree pour la premiere fois au cours de la maturation et de la senescence de fruits de type climacterique, tomate et avocat. Les traitements gazeux continus a base de protoxyde d'azote ont des effets inhibiteurs prononces sur la production d'ethylene des deux especes etudiees, bien que les niveaux de leur biosynthese d'ethylene different fortement. Le protoxyde d'azote retarde le debut de la maturation des fruits traites au stade preclimacterique et limite aussi l'intensite de la production d'ethylene dans le cas des tomates. Le protoxyde d'azote inhibe la crise d'emission autocatalytique d'ethylene des fruits traites au stade climacterique, ainsi que lorsque cette emission est artificiellement stimulee par de l'ethylene exogene. Pour les fruits postclimacteriques une seconde crise a ete mise en evidence ; le protoxyde d'azote inhibe ou retarde egalement cette production d'ethylene de senescence. L'utilisation de disques de pericarpe de tomate comme modele experimental et l'analyse approfondie des activites enzymatiques impliquees dans la biosynthese d'ethylene (acc synthetase et acc oxydase) ont confirme le mode d'action antagoniste du protoxyde d'azote qui, au contraire d'un autre inhibiteur comme le gaz carbonique, n'est pas toxique

43

Prudent, Marion. "Analyse des variations de poids et de teneurs en sucres du fruit de tomate par une approche intégrative combinant des études écophysiologique, génétique et moléculaire." Phd thesis, Université d'Avignon, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00600410.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Le poids et la teneur en sucres du fruit sont deux caractères complexes, importants pour la qualité de la tomate. L'objectif de cette thèse est de disséquer ces deux caractères par une démarche pluridisciplinaire, impliquant des approches écophysiologiques, génétiques et moléculaires. Une population de 20 lignées d'introgression de Solanum chmielewskii dans le fonds génétique de S. lycopersicum a été cultivée en 2006 et en 2007 sous deux conditions de charges en fruits afin de moduler sa disponibilité en carbone : une forte charge où tous les fruits sont conservés sur les bouquets, et une faible charge constituée par un unique fruit par bouquet. Des indicateurs de processus écophysiologiques impliqués dans le poids et la teneur en sucres du fruit ont été mesurés ou estimés. Ils ont permis de caractériser les principaux processus écophysiologiques sous-jacents aux QTL de qualité, notamment la division et l'expansion cellulaire, la transpiration du fruit, et l'allocation carbonée pour la synthèse de composés structuraux. Un fort effet de la charge en fruits a été mis en évidence sur l'expression des QTL pour la plupart des caractères observés, indiquant l'occurrence d'interactions génotype x charge en fruits. L'utilisation d'un modèle écophysiologique prédisant la teneur en sucres d'un fruit de tomate à maturité, combiné à une détection de QTL, a permis d'identifier des colocalisations entre QTL de qualité et QTL de variables de fonctionnement du fruit telles que la fourniture du fruit en assimilats, la transformation métabolique des sucres en d'autres composés, ou la dilution des composés par l'entrée d'eau dans le fruit. Enfin, une lignée d'introgression portant des QTL de poids frais et de sucres avec des allèles aux effets opposés ainsi que la lignée conférant le fonds génétique ont été étudiées au niveau moléculaire par une analyse du transcriptome en phase d'expansion cellulaire. Des gènes candidats dont le niveau d'expression serait associé aux variations de poids et de teneurs en sucres du fruit, engendrées par une modification de la charge en fruits ont été identifiés. L'analyse en cinétique de l'expression de quelques gènes candidats a permis de mettre en évidence des liens entre variables écophysiologiques et moléculaires.

44

Murshed, Ramzi. "Etude de l'expression des gènes impliqués dans le recyclage de la vitamine C dans les fruits de tomate en réponse à divers stress abiotiques." Avignon, 2009. http://www.theses.fr/2009AVIG0615.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Les plantes sont constamment exposées aux stress environnementaux qui perturbent leur fonctionnement. Parmi les stress abiotiques, le déficit hydrique limite les rendements plus sévèrement que tout autre facteur environnemental. Le déficit hydrique est principalement causé par deux types de stress abiotiques : la sécheresse et la salinité. Les effets de différents niveaux de stress hydrique et de NaCl sur les paramètres oxydatifs (H2O2 et MDA), l'ascorbate, les activités des enzymes antioxydants : la superoxyde dismutase (SOD) et la catalase (CAT), ainsi que les activités et les niveaux d'accumulation relatifs des transcrits de gènes codant pour les enzymes de cycle ascorbate-glutathion : l'ascorbate peroxidate (APX), le monodehydroascorbate réductase (MDHAR), la dehydroascorbate réductase (DHAR) et la glutathion réductase (GR), ont été étudiés dans les fruits de tomate (Solanum lycopersicum L. Cv. Micro-Tom). Les changements des contenus en H2O2 et MDA indiquent que les différents stress ont induit un stress oxydatif dans les fruits. Les concentrations d'ascorbate (AsA) et de dehydroascorbate (DHA), ont généralement changé avec le stress. En outre, les activités de la SOD de la CAT et les activités et les niveaux d'accumulation relatifs des transcrits de la DHAR, la MDHAR, l'APX et la GR sont modifiés par le stade de développement du fruit et l'intensité et la durée de stress. Ces résultats suggèrent que la réponse des systèmes antioxydants des fruits de tomate au stress oxydatif, est différente selon le stade du développement du fruit. L'utilisation de mercure pour provoquer un déficit hydrique rapide met en évidence l'existence d'un signal provenant des feuilles et contrôlant la régulation des enzymes du cycle ascorbate-glatathion. Les résultats obtenus sur des fruits détachés suggèrent que l'H2O2 et NO sont fortement impliqués dans cette signalisation
Plants are constantly exposed to variety of environmental stresses that reduces their functioning. Among the abiotic stresses, water deficit limits yield more severely than any other environmental factor. The water deficit is mainly caused by three types of abiotic stress : drought, salinity and mercury. The effects of different levels of water stress and NaCl on oxidative parameters (H2O2 and MDA), the total pool sizes of ascorbate and the activities of antioxidant enzymes : superoxide dismutase (SOD) and catalase (CAT) as well as the activities and relative transcript levels of the enzymes of ascorbate-glutathione cycle : ascorbate peroxidase (APX), monodehydroascorbate reductase (MDHAR), dehydroascorbate reductase (DHAR) and glutathione reductase (GR) were studied in the fruits of tomato (Solanum lycopersicum L. Cv. Micro-Tom). Changes in H2O2 and MDA contents indicate that different abiotic stresses induced oxidative stress in the fruit. The concentrations of ascorbate (AsA) and dehydroascorbate (DHA) were generally modified by stress. In addition, changes in the activities of SOD and CAT and the activities and relative transcript levels of DHAR, MDHAR, APX and GR were depending on the development stage of fruit and the intensity and duration of stress. These results suggest that the response of antioxidant systems of tomato fruits to oxidative stress was different depending on the development stage of fruit. A rapid water deficit, caused by mercury, highlights the existence of a signal coming from the leaves and controlling the regulation of the ascorbate-glutathione cycle enzymes. The results obtained using detached fruits suggest that H2O2 and NO are strongly involved in this signalling

45

Lebedenco, Anatoli. "Eficiência de métodos de controle de pragas do tomateiro (Lycopersicon esculentum Mill.), na região de Presidente Prudente - SP." Universidade do Oeste Paulista, 2006. http://bdtd.unoeste.br:8080/tede/handle/tede/412.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Made available in DSpace on 2016-01-26T18:56:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_AGRONOMIA_ AnatoliL_mar07.pdf: 471165 bytes, checksum: 5d2837d12d1418bc7070a2a9cc694841 (MD5) Previous issue date: 2006-03-07
This research aimed to evaluate five methods for the control of the pests that infest the culture of tomato: a) Conventional method for the application of phytosanitary products commonly, used by farmers; b) Integrated pest management method (IPM) using the control levels (CL) of each insect-pest determined by the research; c) IPM with the use of extract of Azadirachta indica at 5% (v/v) concentration of solution (Neem); d) Sacking the tomato bunches right after flowering. e) Control plants, without any treatment against pests. Both the conventional and IPM methods were both efficient in controlling the pests of the tomato and resulted in reduced number of viral infected plants, and as a consequence, increasing in productivity of the culture by 156% and 165%, respectively. The number of pulverizations was reduced in 66.7% with the IPM method compared to the conventional. The IPM-Neem method showed low control of the sucker insects and lepidopterous and did not differ significantly from the control. The practice of sacking the bunches of tomato fruits represents a promising alternative in the production of fruits without the employment of pesticides, however, it is necessary a protection against sucker insects transmitters of viral illnesses and demands the utilization of protecting materials with better efficiency.
Este trabalho teve o objetivo de avaliar cinco métodos de controle das pragas que infestam a cultura do tomateiro: a) Método convencional de aplicação de produtos fitossanitários, utilizado pelos agricultores; b) Manejo integrado de pragas (MIP) utilizando os níveis de controle (NC) de cada inseto-praga determinados pela pesquisa; c) MIP com o emprego de extrato de Azadirachta indica a 5% (Nim); d) Ensacamento das pencas de tomate logo após a floração e) Testemunha. O método convencional e o método MIP foram eficientes no controle das pragas do tomateiro, reduzindo o número de plantas viróticas e lepidópteros broqueadores, e em conseqüência, aumentando a produtividade da cultura em 156% e 165% respectivamente. O número de pulverizações foi reduzido em até 66,7% com o método MIP comparado ao convencional. O MIP-Nim apresentou baixo controle aos insetos sugadores e lepidópteros e não diferiu significativamente da testemunha. O ensacamento das pencas de tomate consistiu em uma alternativa promissora na produção de frutos sem a presença de inseticidas; no entanto, há a necessidade de proteção contra sugadores transmissores de vírus e utilização de material protetor de melhor eficiência

46

Xu, Jiaxin. "Exploration du polymorphisme moléculaire et protéique de la tomate pour l'identification de QTL de qualité du fruit." Phd thesis, Université d'Avignon, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00927514.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

L'amélioration de la qualité du fruit de tomate dépend largement de la variation génétique. A la suite de la domestication et de la sélection moderne, la diversité moléculaire chez la tomate a été profondément réduite, limitant les possibilités d'amélioration. De nouveaux marqueurs moléculaires révélant les polymorphismes nucléotidiques (SNP) constituent des outils précieux pour saturer les cartes génétiques et identifier des QTL (quantitative trait loci) et des associations chez une espèce peu polymorphe comme la tomate. Les objectifs de cette étude étaient de caractériser la diversité génétique de la tomate au niveau moléculaire et de tenter d'identifier des QTL, des gènes et des protéines responsables de la variation de caractères de qualité du fruit. Pour cela, trois études indépendantes ont conduit à (1) la découverte de nouveaux marqueurs SNP, (2) leur utilisation en génétique d'association et (3) l'analyse de la diversité du protéome en relation avec des caractères physiologiques du fruit.Dans la première étude, nous avons comparé deux plateformes de reséquençage pour reséquencer des zones ciblées couvrant environ 0.2% du génome de deux accessions contrastées. Plus de 3000 SNP sont été identifiés. Nous avons ensuite validé 64 SNPs en développant des marqueurs CAPS. Nous avons ainsi montré l'intérêt des techniques de reséquençage pour la découverte de SNP chez la tomate et produit des marqueurs simples qui peuvent être utiles pour caractériser de nouvelles ressources.Nous avons ensuite développé un ensemble de 192 SNPs et génotypé une collection de 188 accessions comportant des accessions cultivées, des types "cerise" et des formes sauvages apparentées et recherché des associations avec 10 caractères de qualité du fruit. Une quarantaine d'associations a été détectée dans des régions où des QTL avaient été préalablement identifiés. D'autres associations ont été identifiées dans de nouvelles régions. Nous avons ainsi confirmé le potentiel de la génétique d'association pour la découverte de QTL chez la tomate. Finalement une approche combinant l'analyse du protéome, du métabolome et de traits phénotypiques a été mise en oeuvre pour étudier la variabilité naturelle de la qualité du fruit de huit lignées contrastées et de quatre de leurs hybrides, à deux stades de développement (expansion cellulaire et orange-rouge). Nous avons identifié 424 spots protéiques variables en combinant électrophorèse bidimensionnelle et nano LC MS/MS et construit une carte de référence du protéome de fruit de tomate. En parallèle, nous avons mesuré la variation de teneurs en 34 métabolites, les activités de 26 enzymes et cinq caractères phénotypiques. La variabilité génétique et les modes d'hérédité ont été décrits. L'intégration des données a été réalisée par construction de réseaux de corrélations et régression sPLS. Plusieurs associations ont été détectées intra et inter niveau d'expression, permettant une meilleure compréhension de la variation de la qualité des fruits de tomate

47

Jaimes, Miranda Fabiola. "La régulation transcriptionnelle dépendant de l'éthylène : Caractérisation fonctionnelle d'un cofacteur transcriptionnel du type MBF1 et d'un facteur de transcription de la famille des ERF chez la tomate." Toulouse, INPT, 2006. http://ethesis.inp-toulouse.fr/archive/00000242/.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

La phytohormone éthylène contrôle des étapes importantes de la vie de la plante comme la germination, la maturation des fruits et la réponse aux stress biotiques et abiotiques. L'éthylène exerce ses effets physiologiques en modulant l'expression de gènes cibles par l'intermédiaire des facteurs de transcription. De ce fait, la caractérisation des facteurs de transcription associés à la réponse à l'éthylène est une étape fondamentale pour la compréhension des processus régulés physiologiques régulés par cette hormone. Ce travail décrit l'isolement et la caractérisation fonctionnelle de la famille de coactivateurs transcriptionnels de type MBF1 (Multiproteine Bridging Factor 1) et d'un facteur de transcription de la famille des ERF (Ethylene Response Factor) chez la tomate. Notre étude montre que la famille des MBF1 chez la tomate comprend quatre gènes (LeMBF1a, LeMBF1b, LeMBF1c et LeMBF1/ER24) qui sont tous capables de complémenter un mutant de la levure indiquant qu'il y a une parfaite conservation fonctionnelle de ces gènes de la levure aux plantes supérieures. Les études d'expression révèlent un profil spécifique pour ER24 qui est fortement exprimé en réponse à l'éthylène, au cours de la maturation des fruits et en réponse à différents stress abiotiques. Le criblage par double-hybride de la levure a permis d'identifier plusieurs partenaires des protéines MBF1 chez la tomate parmi lesquels des protéines associées à la maturation et aux stress abiotiques. La surexpression du gène LeMBF1/ER24 chez Arabidopsis confère une tolérance au stress thermique. Par ailleurs, nous avons isolé et caractérisé le gène LeERF2 de la tomate qui appartient à la grande famille des ERF (Ethylene Response Factor) codant pour des facteurs de transcription spécifiques aux plantes. L'expression du gène LeERF2 est induite durant la maturation des fruits et en réponse à la blessure. La surexpression de ce gène dans la tomate induit une germination précoce des graines et affecte la formation du crochet apical, un processus de développement régulé par l'éthylène. L'expression du gène de la mannanse2, un marqueur de la germination, est fortement induite dans les graines transgéniques sur-exprimant le gène LeERF2 suggèrant que LeERF2 stimule la germination à travers l'induction de ce gène. Ce travail a permis d'identifier de nouveaux acteurs de la régulation transcriptionnelle associée à l'action de l'éthylène et d'apporter un nouvel éclairage sur le mode d'action de cette hormone.

48

Errami, Mohamed. "Devenir atmosphérique de bupirimate et transfert de ses métabolites (les diazines) dans l’atmosphère, sa dissipation dans les fruits de tomate et sa dégradation électrochimique." Thesis, Reims, 2012. http://www.theses.fr/2012REIMS018/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Cette thèse est centrée sur le bupirimate, utilisé dans la région de Souss Massa comme fongicide dans la culture de tomates et propose l'étude de différents aspects liés à son utilisation comme son élimination par voie électrochimique des effluents aqueux d'origine agricole et son impact environnemental dans l'atmosphère. L'étude de surveillance des résidus de pesticides sur les fruits de tomates dans cette région du Maroc proposée dans cette thèse montre que sur les 194 échantillons analysés, il y a présence de bupirimate (10%), endosulfan (7%), bifenthrine (4%), L. cyhalothrine (3%), iprodione (3%), procymidone (3%), deltamethrine (2%), tetradifon (2%), cypermethrine (1%), chlorothalonil (1%), tau-Fluvalinate (1%) et de composés dont les concentrations sont inférieures à la limite de détection (63%). Le bupirimate fortement utilisé, est donc susceptible de se retrouver dans les effluents de lavage agricole, d'où l'intérêt de l'étude de sa dégradation électrochimique en phase aqueuse. Nous avons ainsi mis en évidence que la cinétique de dégradation et les rendements de minéralisation de ce pesticide peuvent être significativement augmentés, par variation des différents paramètres expérimentaux (concentration de l'électrolyte, valeur du courant imposé, et température). Nous avons également déterminé au cours de ce travail que la constante cinétique d'oxydation du pesticide est de l'ordre de 109.10-4 min-1. Les analyses de DCO ont démontré que le taux de minéralisation par électrooxydation dépasse 70 %. Les résultats de l'étude de la minéralisation par la CPG montrent que la vitesse de l'électro-Dégradation du bupirimate est plus élevée que celle obtenue par la DCO. Le rendement d'élimination est de l'ordre de 86%. Ce résultat est confirmé par l'analyse UV. La réactivité hétérogène de bupirimate vis-À-Vis de l'ozone, en phase hétérogène, est également étudiée. Les résultats obtenus montrent que la valeur de la constante cinétique est de 3.07x10-18 cm3.molécules-1.s-1 vis-À-Vis de l'ozone. Cette valeur implique une durée de vie atmosphérique de l'ordre de quelques jours. Les spectres UV et la réactivité homogène vis-À-Vis des radicaux OH du 4-Méthylpyrimidine, de la pyrimidine, du pyrrole, et de la pyridine (produits gazeux attendus de la dégradation des pesticides), ont été déterminés. Les études cinétiques ont été réalisées dans plusieurs chambres atmosphériques. Les résultats obtenus montrent que pour les composés possédant des hétérocycles à 6 atomes, avec 1 ou 2 atomes d'azote, les constantes de vitesse avec le radical OH sont du même ordre de grandeur. La présence des atomes dans le cycle aromatique a un effet désactivant sur la réactivité de ces composés avec les radicaux OH. Par ailleurs, le composé hétérocyclique aromatique à 5 atomes est hautement plus réactif vis-À-Vis les radicaux OH. Les durées de vie atmosphériques de ces composés, déduites de nos mesures cinétiques et spectroscopiques montrent que ces espèces ont tendance à s'éliminer rapidement par les différentes voies photochimiques
The research study discussed in this thesis concerns the determination of the kinetic rate constants of the electrochemical and heterogeneous degradations of bupirimate. In this study we report the atmospheric fate of four compound heterocyclique by ozone and OH-Radicals using the technique of a simulation chamber coupled to a different analytical system.194 samples tomato samples from an agricultural region of the souss (Agadir, Morrocco) were analyzed for bupirimate (10%) endosulfan (7%), bifenthrine (4%), L. cyhalothrine (3%), iprodione (3%), procymidone (3%), deltamethrine (2%), tetradifon (2%), cypermethrine (1%), chlorothalonil (1%), tau-Fluvalinate (1%) and the concentration of author compounds is less of limits of detection (63%).The electrochemical oxidation of bupirimate is examined by bulk electrolyses at boron doped diamond (BDD) electrode. The influence of operating conditions on the reaction trend is investigated and suitable conditions for oxidative demolition of Bupirimate are individuated. The study also presents the results from bupirimate oxidation at BDD and SnO2 anodes. The COD of bupirimate solution was observed to fall with the first-Order kinetics. We also determined during this work that the constant kinetics of pesticide is about 109.10-4 min-1. In this study, we highlighted that the kinetics of degradation and the outputs of mineralization of bupirimate could be significantly increased, by variation of the various experimental parameters (concentration of electrolyte, value of the imposed current, and concentration of pesticide). The results of mineralization showed that the speed of degradation of the bupirimate by proceeds electrochemical is higher, one has obtains an output of elimination of 84% by the analyses of chromatography.UV spectra and the homogeneous reactivity vis-À-Vis the OH group of 4-Methylpyrimidine, pyrimidine, pyrrole, and pyridine (gaseous products of expected degradation of pesticides), were determined. Kinetic studies were carried out in several atmospheric chambers. The results show that for compounds 6 atoms aromatic ring, with 1 or 2 nitrogen atoms, the rate constants with OH radicals are of the same order of magnitude. The presence of atoms in the aromatic ring has a deactivating effect on the reactivity of these compounds with OH radicals. Moreover, the heterocyclic aromatic having 5 atoms is more highly reactive with OH radicals. The atmospheric lifetimes of these compounds, derived from our spectroscopic and kinetic measurements show that these species tend to be eliminated rapidly by different photochemical ways

49

Ying, Shiyu. "Régulation et rôle des facteurs de transcription de type ERF de la sous-classe E (ERF-E) dans la maturation des fruits climactériques." Electronic Thesis or Diss., Toulouse, INPT, 2023. http://www.theses.fr/2023INPT0141.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Le mûrissement des tomates est un processus finement régulé avec de nombreux changements dynamiques qui concernent les voies du métabolisme primaire et secondaire, la respiration ou encore la signalisation hormonale. Comme les autres fruits climactérique, la tomate connait une transition développementale du stade « pré-maturation » à la phase de maturation qui est associée à une augmentation de la respiration au début de la maturation et à une augmentation de la production autocatalytique d'éthylène. Les facteur de réponse à l'éthylène, de la sous-clade E (ERF.E), ont un profil d'expression fortement associé au mûrissement du fruits de tomate. Les protéines ERF.E de la tomate sont notamment caractérisées par la présence d'un motif N-terminal conservé, qui a été identifié comme cible de la voie N-end rule en condition d’hypoxie chez leurs orthologues d'Arabidopsis. Cette étude dévoile pour la première le rôle positif de ERF.E1 dans la maturation des fruits de la tomate. La surexpression d'ERF.E1 favorise l'initiation du mûrissement, et est accompagnée d'une production avancée d'éthylène et d'une déplétion précoce de l'oxygène dans le gel, par rapport aux lignées WT et KO-erf.e1. ERF.E1 régule positivement les activités promotrices des gènes clés de la maturation, RIN et NOR, ainsi que les gènes de biosynthèse de l'éthylène du système 2. De plus, les résultats ont montré qu’en condition d’hypoxie, ERF.E1 est régulé aux niveaux transcriptionnel et post-traductionnel. En effet, les conditions hypoxiques induisent l’expression d’ERF.E1 et stabilise la protéine ERF.E1. Cette thèse se concentre principalement sur le rôle d'ERF.E1 dans l'initiation de la maturation, grâce à la caractérisation des lignées altéré dans l’expression de ERF.E1 et à l’étude des réseaux d'interaction protéiques potentiels d'ERF.E1
Tomato fruit ripening is a finely regulated process with many well-known dynamic changes, from metabolites, color, and respiration rate to hormone level. As a climacteric fruit, tomato fruit experiences a developmental transition characterized by a burst of respiration at the onset of ripening and a rise in autocatalytic ethylene production. Ethylene Response Factors (ERFs) are end mediators of ethylene responses and members of subclade E (ERF.E) of this transcription factor family display remarkable ripening-associated expression patterns in tomato fruit. Notably, tomato ERF.E proteins are characterized by the presence of a consensus N-terminal motif, which has been identified in their Arabidopsis orthologs as the target of the N-end rule pathway under hypoxia. The first outcome of our study is to reveal that initiation of tomato fruit ripening is preceded by a dramatic drop in oxygen levels in locular gel, thus giving a solid physiological marker of ripening initiation. The study also unveils the function of ERF.E1 in tomato fruit ripening showing that overexpression of ERF.E1 promotes the initiation of ripening, by advancing both ethylene production and oxygen depletion event in the gel, compared with the WT and KO-erf.e1 lines. ERF.E1 positively regulates the promoter activities of key ripening genes, RIN and NOR, as well as the ethylene biosynthesis genes involved in System 2 ethylene production. In addition, the data show that ERF.E1 is regulated by hypoxia at both transcriptional and post-translational levels. Hypoxia conditions induce transcription of ERF.E1 and promote ERF.E1 protein stability. Overall, while the study unraveled the role of ERF.E1 in ripening initiation based on the analysis of ERF.E1 impaired lines are altered at the early ripening stages it also uncovered potential proteins interacting with the ERF.E1 network components

50

Liu, Mingchun. "Functional characterization of Sl-ERF.B3, a member of the large multi-gene family of Ethylene Response Factor in tomato (Solanum lycopersicum)." Thesis, Toulouse, INPT, 2013. http://www.theses.fr/2013INPT0089/document.

Full text

APA, Harvard, Vancouver, ISO, and other styles

Abstract:

Les derniers acteurs de la voie de signalisation à l’éthylène sont des facteurs de transcription appelés ERF (Ethylene Response Factors). La connaissance de leur rôle spécifique dans la régulation des processus développementaux dépendant de l’éthylène reste limitée. Les travaux présentés dans la thèse concernent la caractérisation fonctionnelle du gène Sl-ERF.B3, un membre de cette grande famille de régulateurs transcriptonnels dans la tomate (Solanum lycopersicum). Utilisant une stratégie répresseur dominant ; il est montré en particulier que ce gène intervient dans la mise en place de la réponse à l’éthylène et dans le contrôle de la maturation du fruit. L’expression d’une construction ERF.B3-SRDX, une version chimérique de Sl-ERF.B3 fusionné à un domaine répresseur de type EAR, entraine des phénotypes pléotropiques aussi bien dans la signalisation de l’éthylène que dans le développement des parties végétatives et des organes reproducteurs. Ainsi, une altération de la triple réponse à l’éthylène est constatée chez les lignées transgéniques et au stade adulte, les plantes présentent des phénotypes d’épinastie des feuilles, de sénescence prématurée des fleurs et d’abscission accélérée des fruits. L’ensemble de ces observations est corrélée avec une modification de l’expression de gènes impliqués dans la biosynthèse et la réponse à l’éthylène. Ces données suggèrent que ERF.B3 intervient dans un mécanisme de rétro-control de la réponse à l’éthylène en agissant à la fois sur les gènes de biosynthèse et de signalisation de l’hormone. Au niveau du fruit, la sur-expression d’ERF.B3-SRDX entraine une modification du processus de maturation avec un retard notable de l’avènement de l’acquisition de la compétence à murir. Cependant, une fois la maturation initiée, elle s’accompagne d’une forte production d’éthylène et d’une accélération du ramollissement du fruit. A l’inverse, l’accumulation de pigment est inhibée par altération de la voie de biosynthèse des caroténoïdes. Ces données phénotypiques sont corrélées avec le niveau d’expression des gènes clés impliqués dans ces processus. Les résultats indiquent que dans les lignées transgéniques, il y a découplage de certaines caractéristiques de la maturation du fruit et permettent de mettre en lumière le rôle d’ERF.B3 dans la régulation des processus de développement dépendant de l’éthylène chez la tomate
Ethylene Response Factors (ERFs) are known to be the last transcription factors of the ethylene transduction pathway. Their specific role in ethylene-dependent developmental processes remains poorly understood. This work demonstrated a specific role of Sl- ERF.B3, a member of the ERF gene family in tomato (Solanum lycopersicum), in mediating ethylene response and fruit ripening through a dominant repressor strategy. ERF.B3-SRDX dominant repressor etiolated seedlings displayed partial constitutive ethylene-response in the absence of ethylene and adult plants exhibited typical ethylenerelated alterations such as leaf epinasty, premature flower senescence and accelerated fruit abscission. The multiple symptoms related to enhanced ethylene sensitivity correlate with the altered expression of ethylene biosynthesis and signaling genes, suggesting the involvement of Sl-ERF.B3 in a feedback mechanism regulating components of ethylene production and response. In addition, over-expression of ERF.B3-SRDX in tomato results in alterations in both fruit morphology and ripening process. The attainment of competence to ripen is dramatically delayed in ERF.B3-SRDX fruits but once ripening proceeds it is associated with high climacteric ethylene production and enhanced fruit softening while pigment accumulation is strongly reduced. Moreover, a number of genes involved in the fruit ripening process showed expression pattern deviating from that of wild type. These data suggest a putative role of Sl-ERF.B3 in the transcriptional network underlying the ripening process and uncover a mean for uncoupling some of the main features of fruit ripening such as fruit softening and pigment accumulation. Overall, the study highlighted the importance of an ERF gene in ethylene-mediated developmental processes such as plant growth and fruit ripening

Dissertations / Theses on the topic 'Fruits de tomate'

Create a spot-on reference in APA, MLA, Chicago, Harvard, and other styles