Dissertations / Theses: 'Facteurs de dépendance à l'hôte'

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Couderc, Élodie. "Discovery of mosquito molecular factors modulating arbovirus infection in Aedes aegypti." Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2024. http://www.theses.fr/2024SORUS199.

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Abstract:

Les virus transmis par les arthropodes (arbovirus) impactent significativement la santé humaine à l'échelle mondiale, causant des maladies avec une morbidité et une mortalité élevées. Les flavivirus transmis par les moustiques, notamment les virus de la dengue (DENV) et Zika (ZIKV), sont particulièrement préoccupants. Ces virus sont principalement transmis par le moustique Aedes aegypti, dont la répartition géographique s'étend en raison des changements globaux. Actuellement, il n'existe pas de vaccins approuvés à grande échelle ni d'antiviraux spécifiques pour ces virus, et les méthodes traditionnelles de contrôle des vecteurs sont entravées par la résistance aux insecticides. Face à ces défis, des stratégies alternatives ont été développées pour manipuler la biologie des vecteurs afin de réduire leur compétence vectorielle, c'est-à-dire leur aptitude à être infectés et à transmettre des pathogènes. Une stratégie potentielle est de relâcher de moustiques modifiés incapables de transmettre des agents pathogènes. Il est donc crucial d'identifier des cibles optimales pour ces modifications, et les facteurs moléculaires des moustiques qui modulent la transmission des arbovirus sont des candidats prometteurs. Cependant, une grande partie des connaissances actuelles sur la compétence vectorielle des moustiques provient d'études sur l'insecte modèle Drosophila melanogaster, qui ne reproduit pas entièrement les réponses des moustiques. Des approches spécifiques aux moustiques sont donc essentielles pour étudier les facteurs intrinsèques de leur compétence vectorielle.Cette thèse de doctorat présente trois approches in vivo pour étudier les facteurs moléculaires influençant l'infection, la dissémination et la transmission des flavivirus chez Aedes aegypti. Le premier chapitre traite de la caractérisation fonctionnelle in vivo d'un gène Vago-like, VLG-1, chez Ae. aegypti dans le contexte de l'infection par les flavivirus. De façon surprenante, une lignée mutante de VLG-1 générée par CRISPR/Cas9 a montré que chez Ae. aegypti, VLG-1 favorise la dissémination de DENV et ZIKV dans le moustique, remettant en question le dogme affirmant que les gènes Vago-like sont des facteurs antiviraux conservés chez les arthropodes. Une analyse transcriptomique organe-spécifique a révélé que VLG-1 affecte des processus biologiques potentiellement liés à la réplication virale, tels que la réponse au stress oxydatif. Le deuxième chapitre rapporte la découverte d'un nouveau facteur antiviral non canonique, le cytochrome P450 4g15, associé à une résistance naturelle à DENV dans une population d'Ae. aegypti. L'induction de ce gène dans le tube digestif après un repas sanguin entrave l'infection par DENV. Des polymorphismes dans la séquence promotrice de ce gène contrôlent son expression et la probabilité d'infection par DENV. Cette étude est la première à démontrer l'impact de variants naturels d'un gène sur la résistance d'Ae. aegypti à DENV. Le troisième chapitre décrit la caractérisation in vivo de potentiels récepteurs de DENV chez Ae. aegypti, en particulier prohibitin-2. Malgré un effet proviral de prohibitin-2 sur la réplication de DENV dans le corps du moustique, ce gène n'a pas montré de rôle significatif dans l'entrée de DENV dans le tube digestif du moustique in vivo. Ces résultats indiquent que l'identification in vitro de récepteurs viraux ne garantit pas la confirmation in vivo de leur rôle dans l'entrée virale. En résumé, cette thèse de doctorat contribue à faire avancer notre compréhension des interactions moustiques-virus, à identifier de nouvelles cibles pour le contrôle des vecteurs et à mettre en lumière la complexité des mécanismes moléculaires de la compétence vectorielle. Elle met en avant la nécessité de la recherche in vivo et l'importance d'exploiter la diversité génétique naturelle des populations de moustiques pour développer des stratégies innovantes de contrôle des maladies transmises par les moustiques
Arthropod-borne viruses (arboviruses) significantly impact global health, causing diseases with high morbidity and mortality. Mosquito-borne flaviviruses, notably dengue (DENV) and Zika (ZIKV) viruses, are of particular concern. These viruses are primarily transmitted by the Aedes aegypti mosquito, which is expanding its range due to global changes. Currently, there are no globally approved vaccines or specific antivirals for these viruses, and traditional vector control methods are hindered by insecticide resistance. Concerns about the future of vector control have led to alternative strategies aimed at manipulating the biology of vectors to reduce their vector competence, i.e., the ability of mosquitoes to become infected and transmit pathogens. The release of modified mosquitoes that cannot transmit pathogens is a potential strategy to reduce the incidence of human disease. Thus, there is a growing need to identify optimal targets for modification, and mosquito molecular factors that modulate arbovirus transmission are promising candidates.However, much of the knowledge on mosquito vector competence derives from studies in the insect model Drosophila melanogaster and does not fully recapitulate mosquito responses. Therefore, implementation of mosquito-specific approaches is essential to investigate intrinsic factors underlying vector competence. In this context, this PhD thesis presents three in vivo approaches to investigate molecular factors that influence flavivirus infection, dissemination, and transmission in Aedes aegypti.The first chapter is dedicated to the functional characterization of a Vago-like gene, VLG-1, in Ae. aegypti in the context of flavivirus infection. Arthropod Vago genes are often described as analogs of mammalian cytokines with antiviral functions. Strikingly, a VLG-1 mutant line generated by CRISPR/Cas9-mediated gene editing revealed that in Ae. aegypti, VLG-1 promotes DENV and ZIKV dissemination within the mosquito, challenging the idea that Vago-like genes are conserved antiviral factors. Tissue-specific transcriptome analysis indicated that VLG-1 affects biological processes potentially linked to viral replication, such as oxidative stress response. The second chapter focuses on the discovery of a novel non-canonical antiviral factor, cytochrome P450 4g15, associated with a natural DENV resistance phenotype in a field-derived Ae. aegypti population. Induction of cytochrome P450 4g15 in the midgut after bloodmeal ingestion hinders DENV infection. Polymorphisms in this gene's promoter sequence control its expression level and the probability of successful DENV infection, marking the first report of natural gene variants impacting DENV resistance in Ae. aegypti.The third chapter examines candidate DENV receptors in Ae. aegypti, with a specific emphasis on prohibitin-2. This study demonstrated a proviral effect of prohibitin-2 on DENV replication in mosquito bodies. Nevertheless, despite employing a range of experimental techniques, prohibitin-2 did not exhibit a substantial role in DENV entry into mosquito midguts in vivo. These findings indicate that in vitro identification of viral receptors may not necessarily translate to in vivo confirmation of their role in viral entry.Overall, this PhD thesis contributes to advancing our understanding of mosquito-virus interactions, identifying new targets for vector control strategies, and highlighting the complexity of the molecular mechanisms underlying vector competence. This work emphasizes the necessity for in vivo research and underscores the value of exploiting the natural genetic diversity of field-derived mosquito populations to gain insights into the complex mechanisms governing mosquito vector competence for flaviviruses and to develop innovative strategies for controlling mosquito-borne diseases

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Cohen, Caroline. "Facteurs pharmacologiques de la dépendance à l'égard du tabac." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112005.

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Abstract:

Régulation par les fumeurs de la quantité de fumée aspirée en fonction de la teneur en nicotine de la cigarette
To better understand the tobacco dependence mechanism, the influence of pharmaco-logical factors, and the relative effect of nicotine among smoke components, two kinds of experiments were done. I- In 94 smokers, physiological measurements before and after smoking a cigarette from their own brand has shown that : - biological concentrations of tobacco products are not related to cigarette yields; - alveolar carbon monoxide level is not related to the smoke pH (6. 45-7. 55). II- Behavioral and psychomotor indexes obtained while smoking cigarettes of different composition showed that : - smokers submitted to a pharmacological deficit when smoking a cigarette free from active components increased their smoke intake and cigarette combustion of their next cigarette. While smoking a cigarette free from active components but enriched with nicotine, subjects reduced their smoke intake and increased the smoke intake from their next normal cigarette; - subjects smoking a low nicotine cigarette regulated their smoking behavior by increasing smoke intake from the next cigarette only. While smoking a high nicotine cigarette they compensated immediatly. These results show that smokers are able to regulate the amount of nicotine intake by their smoking behavior but that others pharmacological factors seems to be looked for by smokers

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Pommier, Janine. "Etude de facteurs influençant la susceptibilité de l'hôte au paludisme : Effet de facteurs génétiques et de l' état inflammatoire." Thesis, Aix-Marseille, 2014. http://www.theses.fr/2014AIXM4003.

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Abstract:

Mon travail de thèse a porté sur l'étude des facteurs influençant le devenir de l'infection palustre. Une étude de liaison génétique basée sur des marqueurs répartis sur l'ensemble du génome nous a permis de mettre en évidence la liaison génétique de la région chromosomique 17p11-p13 avec la parasitémie. Nous avons étudié les variations génétiques des gènes HS3ST3A1 et HS3ST3B1 du chromosome 17p12 humain car ces gènes pourraient influencer l'infection de cellules humaines par le Plasmodium. Nous avons ainsi observé la liaison génétique de certain SNP de ces gènes avec la parasitémie. Les anticorps IgG dirigés contre le parasite P. falciparum sont connus pour jouer un rôle important dans la réponse immunitaire. Certain gènes associés à la résistance au paludisme pourraient également être associés au niveau de production d'IgG. Nous avons montré que certains polymorphismes situés dans les gènes HBB, FcRIIA, et du TNF influencent le niveau de production de différentes sous classes IgG. Ces résultats nous permettent de mieux comprendre le contrôle génétique de la réponse humorale contre la malaria.J'ai aussi caractérisé l'inflammation non infectieuse dans un modèle murin afin de tester l'influence de l'état inflammatoire lors de l'infection par le plasmodium. L'étude transcriptomique de trois organes réalisée sur un modèle de souris injectée avec de l'acide oléique, nous a permis de mettre en évidence une réponse inflammatoire principalement au niveau des poumons et du cerveau. Ces résultats vont nous permettre de tester l'hypothèse qu'une réponse inflammatoire pré-existante favoriserait la survenue de forme sévère du paludisme chez des souris infectées par Plasmodium
My thesis focused on the study of factors influencing the future of malaria infection. A genetic linkage study based on markers distributed throughout the genome has allowed us to highlight the linkage of 17p11 - p13 chromosome region with parasitaemia. We investigated the genetic variation of genes and HS3ST3A1 HS3ST3B1 human chromosome 17p12 because these genes may influence the infection of human cells by Plasmodium . We observed genetic linkage of some SNPs in these genes with parasitaemia.IgG antibodies against the parasite P. falciparum are known to play an important role in the immune response . Certain genes associated with resistance to malaria could also be associated with the level of IgG production . We have shown that some polymorphisms located in genes HBB , Fc  RIIA , and TNF influence the level of production of different IgG subclasses . These results allow us to better understand the genetic control of humoral response against malaria.I also characterized non- infectious inflammation in a mouse model to test the influence of the inflammatory condition during infection by Plasmodium . The transcriptomic study performed on three organs mouse model injected with oleic acid , has allowed us to demonstrate an inflammatory response mainly in the lungs and brain. These results will allow us to test the hypothesis that pre-existing inflammatory response favor the occurrence of severe malaria in mice infected with Plasmodium

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Da, Costa Daniel. "Etude des facteurs cellulaires de l'hôte impliqués dans le tropisme du virus de l'hépatite C." Phd thesis, Université de Strasbourg, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00804227.

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Abstract:

Le virus de l'hépatite C (HCV) est un problème majeur de santé publique. Le développement de nouveaux traitements pour lutter contre le HCV a été ralenti par l'absence de modèles d'études in vitro et in vivo convenables. Le but de mon travail de thèse a été, dans un premier temps, de caractériser les facteurs déterminant le tropisme hépatique du HCV. En exprimant des facteurs clés dans une lignée cellulaire humaine non-hépatocytaire, nous avons reconstitué in fine l'ensemble du cycle viral dans ces cellules. L'entrée du virus dans la cellule hôte fait intervenir différents récepteurs d'entrée dont CD81, occludin (OCLN), claudin-1 (CLDN1) et scavenger receptor class B type I (SR-BI). L'expression de ces quatre récepteurs sur cette lignée la rend hautement permissive à l'entrée du virus, mais ne permet pas de rétablir la réplication du virus. L'expression du micro-ARN 122, un micro-RNA important pour l'infection du HCV, dans les cellules exprimant les quatre récepteurs, restaure une forte réplication de l'ARN viral mais ne permet pas de détecter une production de particules infectieuses. L'expression de l'apolipoprotein E (apoE), jouant un rôle primordial dans l'assemblage et la sécrétion, rétablis cette dernière étape du cycle viral du HCV dans la lignée cellulaire humaine non-hépatocytaire. Dans un second temps, j'ai utilisé la stratégie, précédemment établie, pour étudier la spécificité d'espèce de l'infection du HCV dans plusieurs lignées hépatocytaires murines. Nous avons pu rendre ces cellules permissives à l'entrée du HCV et pu détecter une très faible réplication. L'ensemble de mes travaux apportent de nouvelles informations sur la compréhension des facteurs clés nécessaire au cycle viral du HCV dans des cellules murines et humaines.

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Bodin, Aurélie. "Modulation du comportement de recherche de l'hôte chez les insectes hématophages : importance des facteurs endogènes." Thesis, Tours, 2008. http://www.theses.fr/2008TOUR4019/document.

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Abstract:

Les animaux ont développé des stratégies d’optimisation de recherche de nourriture afin de minimiser les risques d’exposition aux prédateurs. Chez les insectes hématophages, l’attraction pour leurs hôtes, qui sont également leurs prédateurs, est dirigée par la chaleur et des facteurs chimiques. Cette thèse caractérise les facteurs endogènes modulant le comportement de recherche de l’hôte chez Rhodnius prolixus. Il existe une modulation spécifique de la réponse comportementale à différentes odeurs au cours de la journée. De plus, la recherche de l’hôte est modulée par l’état physiologique des individus (état de développement et état nutritif). Des mécanismes physiologiques et comportementaux ont donc été sélectionnés, inhibant le comportement de recherche de l’hôte à des moments de la vie de l’insecte où il n’est pas nécessaire de s’exposer aux hôtes
Animals have evolved different optimal strategies to minimize predation risks while searching for food. In haematophagous insects, host-seeking is guided by different host stimuli. An important modulation of the perception systems associated to host localization has been observed as function of behaviour and activity rhythms of the host which can be a prey or a predator. We characterize the endogenous factors which could modulate the host-seeking behaviour in the haematophagous bug Rhodnius prolixus. There is a specific modulation of the behavioural response to different odours as function of daytime. Furthermore, host-seeking could be modulated by the physiological state of the bugs (developmental and nutritional state). Physiological and behavioural mechanisms have been selected to inhibit the host-seeking when it is not necessary for the bugs to be exposed to hosts

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Dafei, Farid. "Etude et comparaison des facteurs de dépendance en moyen et long séjour." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR2M038.

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Dupuy, Charlotte. "La prévention de la dépendance : facteurs associés à l'observance d'une intervention multidomaine." Thesis, Toulouse 3, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU30351.

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Abstract:

Entre 2000 et 2040, la population âgée fragile sera multipliée par 2,5 et touchera 10 millions de sujets âgés de 65 ans et plus. Les études épidémiologiques récentes ont illustré que la dépendance est fréquente et multidimensionnelle (impliquant des déficits fonctionnels, cognitifs et sensoriels). Récemment, des éléments tels que l'effet protecteur de l'activité physique ou encore de la nutrition (en action isolée) sur le déclin cognitif et fonctionnel sont bien connus cependant peu d'études se sont intéressées à l'impact d'une intervention multidomaine. L'efficacité de ces interventions est actuellement en cours d'étude dans des études randomisées et contrôlées (MAPT, Do-health, Mid-frail, Finger, preVida). Ainsi, il semble important d'étudier l'observance et les facteurs prédicteurs (la motivation et les obstacles pour ces personnes âgées fragiles) de la participation à un programme de prévention à long terme. Pour déterminer la population cible à risque de perte d'autonomie chez les personnes âgées, l'étude de la définition la plus pertinente de la sarcopénie est nécessaire. La conception des essais liés à des facteurs nutritionnels pertinents (la vitamine D et les compléments nutritionnels oraux(CNO)) est également discutée actuellement
Between 2000 and 2040, the elderly frail population will be multiplied by 2,5 to affect 10 million people aged 65 years and over. Previous epidemiologic studies have highlighted that functional limitations are frequent and multidimensional (associated with functional, cognitive and sensorial decline). Currently, the evidence for the protective role of physical activity or nutrition (action isolated) on cognitive and functional decline are well known but few studies have examined the impact of multidomain interventions. The effectiveness of such interventions must be demonstrated in the current randomized trials. It seems important to study rates of adherence and attrition factors (motivation and barriers for these frail elderly) to participate in a prevention program of long-term. To determine the target population to prevent disability in elderly, consideration of the most relevant definition of sarcopenia is necessary. The design of trials related to the relevant nutritional factors (vitamin D and the Oral Nutritional Supplement (ONS)) is also currently discussed

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Maroteaux, Matthieu. "Implication du facteur de transcription Zif268 dans les apprentissages guidés par la récompense." Paris 6, 2010. http://www.theses.fr/2010PA066305.

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Abstract:

Les drogues détournent les circuits neuronaux de la récompense et y provoquent des altérations responsables des comportements d’addiction. Ces circuits impliquent les ganglions de la base (GB), qui s’organisent en boucles fonctionnelles formées par les voies directe et indirecte qui contrôlent l’activité de ses structures de sortie. Le point d’entrée des GB est le striatum (STR) qui recoit des afférences glutamatergiques du cortex, et des projections des neurones dopaminergiques. Une activation des récepteurs NMDA et D1 de la dopamine (D1R), déclenche la cascade de signalisation des ERK1/2 dans les neurones striataux de la voie directe et recrute ses cibles, dont le facteur de transcription Zif268 et active la DARPP-32. Tous deux ont des rôles cruciaux dans les effets des drogues. Nous avons cherché à comprendre les rôles de la DARPP-32 et de Zif268 dans les mécanismes d’apprentissage par la nourriture. Nous avons pour cela caractérisé l’expression de Zif268 après des séances d’apprentissage opérant pour de la nourriture dans les deux voies des GB grâce à des souris exprimant la GFP sous la dépendance du promoteur du D1R. Nous avons ensuite mis en évidence une motivation réduite pour ce comportement opérant chez des souris portant une DARPP-32 mutée, ainsi que chez des souris où Zif268 a été invalidé. De plus nous montrons que la surexpression de Zif268 dans le STR dorso-médian est corrélée avec la réponse opérante au début de l’apprentissage opérant. Nous montrons que la DARPP-32 et Zif268 sont des acteurs majeurs dans le système de la récompense. A l’avenir leur étude permettra de mieux comprendre la mise en place de comportements tels que l’addiction ou l’obésité.

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Gibold-Lyonne, Lucie. "Impact des facteurs micro-environnementaux de l'hôte sur la colonisation instestinale des Escherichia Coli adhérents et invasifs." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2016. http://www.theses.fr/2016CLF1MM22/document.

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Abstract:

La maladie de Crohn (MC) est une affection inflammatoire chronique du tube digestif dont l’étiologie est multifactorielle. Les lésions intestinales des patients atteints de MC sont anormalement colonisées par des souches pathogènes d’Escherichia coli appartenant au pathovar AIEC pour «Adherent-Invasive Escherichia coli ». Ces souches sont capables d’adhérer et d’envahir les cellules épithéliales intestinales, et ont la capacité de survivre et de se multiplier en macrophages en induisant une synthèse intense de cytokines pro-inflammatoires. Les AIEC pourraient ainsi être impliquées dans l’induction et/ou l’entretien de l’état inflammatoire de la muqueuse intestinale.L’objectif de ce travail est d’identifier les déterminants bactériens des AIEC qui vont intervenir dans les étapes précoces de l’implantation des AIEC au niveau intestinal et de définir quel est le rôle des facteurs micro-environnementaux de l’hôte dans cette implantation.Nous montrons que l’AIEC LF82 possède une activité mucinolytique qui est portée par le gène vat-AIEC et qui favorise la traversée du mucus et la colonisation intestinale. Nous avons retrouvé ce gène chez 42% des souches AIEC isolées de patients atteints de MC, et chez 97% des souches AIEC appartenant au phylogroupe B2. Par ailleurs, nous avons montré que les sels biliaires augmentent l’expression de cette mucinase.Nous avons ensuite étudié l’influence des sels biliaires sur l’expression globale des gènes de la souche LF82. Les sels biliaires modifient profondément le métabolisme de la souche, induisant une diminution globale des voies de biosynthèse (protéines, lipides) et une augmentation des voies de dégradation (alcools, acides carboxyliques, polyamines, …). L’étude du catabolisme de l’éthanolamine et du propanediol indique que les AIEC pourraient se servir de ces substrats pour s’implanter au sein de la flore iléale. De plus, les analyses transcriptomiques révèlent que les sels biliaires augmentent l’expression de gènes codant des facteurs de virulence comme l’invasine IbeA, les systèmes de sécrétion de type VI et la yersiniabactine. Nous montrons également qu’ils favorisent la formation de biofilm chez les souches AIEC.Ces données indiquent que les sels biliaires constituent un signal permettant à la souche AIEC LF82 de mettre en place différentes voies métaboliques et déterminants bactériens nécessaires à son implantation au niveau intestinal.Mots-clé : Escherichia coli, maladie de Crohn, mucines, serine protéase, mucinase, AIEC
The etiology of Crohn's disease (CD) involves disorders in host genetic factors and intestinal microbiota. Ileal mucosa of CD patients is often abnormally colonized by adherent-invasive Escherichia coli (AIEC). These strains isolated from the intestinal mucosa of CD patients are able to adhere to intestinal epithelial cells (IECs). This adhesion to IECs promotes the invasion of cells by the bacteria. Furthermore, the invasive ability of AIEC strains allows bacteria to translocate across the human intestinal epithelium, move into the deep tissues and activate immune cells continuously upon arrival. Thus AIEC could be involved in the inflammatory state of the intestinal mucous membrane. The aim of this study was to identify components of AIEC virulence, which might favor their implantation in the gut of CD patients and to define the role of several chemical factors from the ileal environment. Here, we reported a protease called Vat-AIEC from AIEC which favors the penetration of AIEC through the mucus layer and enhances gut colonization. The screening of E. coli strains isolated from CD patients revealed a preferential vat-AIEC association with AIEC strains belonging to the B2 phylogroup. Besides, Vat-AIEC transcription was increased with bile salts from the ileum environment. Then a global RNA sequencing (RNA-seq) of E. coli LF82 has been used to observe the impact of bile salts on the expression of bacterial genes. The results demonstrate the explosive effect of bile salts with a dysregulation of about 40% of the genome, with a global upregulation of genes involved in degradation and downregulation of those implicated in several biosynthesis. Our results show that LF82 use ethanolamine as a nitrogen source and propane diol as a carbon source, which can favor their colonization in the gut compared to the other bacteria. We also studied virulence genes expression in the presence of bile salts. They increase the expression of several virulence factors like the IbeA invasion, the type 6 secretion systems and the yersiniabactin. Furthermore, we noticed an increased expression of genes implicated in biofilm formation. These results improve the understanding of the global regulatory network in the presence of bile salts and thus of AIEC implantation in the human gut of CD patients

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Verret, Catherine. "Dépendance des personnes âgées au domicile : définition de la dépendance partielle et facteurs pronostiques de son évolution sur 8 ans : cohorte PAQUID, 1988-1998." Bordeaux 2, 2000. http://www.theses.fr/2000BOR23005.

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Ballon, Nicolas. "Epidémiologie, phénotypes cliniques et facteurs de vulnérabilité génétique pour la toxicomanie au crack / cocaïne dans lîle de la Martinique." Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066144.

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Abstract:

Nous avons observé, dans un échantillon de 900 personnes, une prévalence de la dépendance aux substances illicites de 0,8%. Certaines études génétiques montrent une association entre addictions et système DA avec cependant des résultats contradictoires, en partie dus à l’hétérogénéité phénotypique. Dans une population de 142 hommes, cocaïnomanes, afrocaraïbéens, dont 45 schizophrènes, les dimensions d’impulsivité, de recherche de sensation, et les antécédents de THADA sont significativement plus élevés que chez 88 témoins sains appariés et nous avons montré une association entre le polymorphisme (AAT)n du gène codant pour le CNR1 (modulateur de la DA) et la dépendance à la cocaïne, mais pas avec le Taq1 du D2, le Bal1 du D3, l’Exon III du D4 et le SLC6A3 du DAT. Par contre, l’analyse des sous-populations de cocaïnomanes, en fonction des 3 dimensions explorées, montre une association entre chacune des dimensions et le Taq1 du D2 et les allèles longs du gène codant pour le D4.

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Botelho-Nevers, Elisabeth. "Les facteurs de risque de sévérité liés à l'hôte et au traitement au cours de la fièvre boutonneuse méditerranéenne." Thesis, Aix-Marseille 2, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX20691/document.

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Abstract:

La fièvre boutonneuse Méditerranéenne (FBM) est due à Rickettsia conorii subsp. conorii, bactérie intracellulaire stricte. Cette maladie, initialement décrite comme bénigne, présente actuellement un taux de sévérité de l’ordre de 10% avec une augmentation de cette sévérité décrite dernièrement. Au cours d’une étude clinique rétrospective portant sur 161 cas de FBM, nous avons observé que le traitement par fluoroquinolones était associé à une évolution défavorable, ce qui à ce jour n’avait jamais été rapporté, alors que la doxycycline semble être protectrice. Nous avons également observé cet effet délétère des fluoroquinolones sur un modèle in vitro d’infection cellulaire à R. conorii, effet qui n’a pas été observé avec la doxycycline. Une des hypothèses pouvant expliquer cet effet est l’induction du module toxine-antitoxine par les fluoroquinolones. Ainsi nous avons montré que la ciprofloxacine modulait l’expression des gènes du couple toxine-antitoxine. Nous avons également montré que les statines pouvaient avoir un effet prophylactique au cours de l’infection par R. conorii. Enfin nous avons étudié la réponse de l’hôte au sein de l’escarre d’inoculation par une approche transcriptomique.Cette thèse a mis en évidence que les traitements reçus au cours de la FBM peuvent modifier le pronostic de cette maladie. Le choix des antibiotiques est donc crucial et doit faire l’objet d’études complémentaires
Mediterranean spotted fever (MSF) is caused by Rickettsia conorii subsp. conorii, a strict intracellular bacterium. The disease initially described as benign presents currently rates of severity around 10% with an increase described recently. In a retrospective clinical study of 161 cases of MSF, we observed that treatment with fluoroquinolones was associated with an unfavourable outcome whereas doxycycline appeared to be protective. We also observed this deleterious effect of fluoroquinolones in vitro in a cellular model of R. conorii infection, which was not observed with doxycycline. One hypothesis that could explain this effect is the induction of toxin-antitoxin module by fluoroquinolones. Thus we have shown that ciprofloxacin modulates the gene expression of toxin-antitoxin module. We have also shown that statins may have a prophylactic effect during infection by R. conorii. Finally, we have studied the host response within the inoculation eschar by a transcriptomic approach. This thesis has shown that the treatment received during the MSF can change the prognosis of this disease. The choice of antibiotics is crucial, and should be subject to further studies

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Bouscaren, Nathalie. "Facteurs de risque de la dépendance chez des femmes âgées françaises : étude sur la cohorte E3N." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2018. http://www.theses.fr/2018SACLS508/document.

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Abstract:

Avec le vieillissement démographique, le nombre de personnes âgées dépendantes augmente et les proches (ou "tierces personnes") sont de plus en plus sollicités à leur côté. Dans une visée de santé publique, il importe d'étudier la place des tierces personnes dans le vieillissement et la relation entre dépendance et accumulation de facteurs de risque accessibles à la prévention.Le premier axe de cette thèse s'intéresse à l'intervention des tierces personnes dans les études de cohorte avançant en âge. Le deuxième axe consiste à analyser l'association entre la dépendance et l'accumulation de déficits sensoriels ou de comportements de santé.Cette thèse se base sur les données des femmes de la cohorte E3Nnées entre 1925 et 1930 : celles auto-rapportées et celles recueillies auprès d'une tierce personne. La dépendance est définie comme la présence d'une limitation dans au moins une des huit activités de l'échelle des activités instrumentales de la vie quotidienne (IADL).Les tierces personnes corroborent globalement la perception des personnes âgées concernant leur capacité à réaliser les IADL, étayant ainsi l'intérêt de leur implication dans les études épidémiologiques portant sur le vieillissement. Nous montrons également qu'un double déficit sensoriel est associé à un risque accru de survenue de la dépendance à court terme. De plus, le non-respect des recommandations concernant cinq comportements de santé était associé à une augmentation du risque de dépendance une dizaine d'année plus tard, selon un schéma cumulatif.Cette thèse contribue à valoriser la place des tierces personnes dans les études épidémiologiques et à améliorer les connaissances sur les facteurs de risque modifiables de la dépendance. Elle ouvre des pistes d'actions ciblées permettant d'améliorer la qualité de vie des personnes âgées tout en augmentant leur durée de vie sans incapacité
The number of people living with disabilities is rising with the ageing of the population, leading to an increased need in proxy' help (or from "third partie"). Preventive approaches to delay disability or increase disability-free life expectancy are needed. In that respect, it is essential to study proxies'role in ageing, to identify risk factors of disability, and to analyze the effect of combinations of risk factors on risk of disability.The first aim of this PhD thesis was to study the contribution of proxies in cohorts of older people. The second aim was to analyze the association between disability and cumulative sensory impairments or health behaviours.The study population consisted in a subpopulation of the E3N cohort of women born between 1925 and 1930. Data were self-reported and/or reported by a proxy. Disability was defined as a limitation in at least one of the eight instrumental activities of daily living (IADL) scale.Results supported the interest of proxy involvement in epidemiological studies, particularly in those dealing with ageing. Indeed, most proxies corroborated the perception of the elderly women about their ability to perform IADL. In the study of risk factors of disability, having a dual sensory impairment was associated with higher short-term incidence of disability. Moreover, not adhering to the recommendations in the five studied health behaviours was associated with an increased risk of disability ten years later, in a dose-dependent manner.This work contributes to highlight the usefulness of proxies in large epidemiological studies, and to enhance knowledge about risk factors of disability. It suggests tracks of targeted actions to improve the quality of life of older people, and to increase their disability-free life duration

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Lu, Yang. "Analyse de survie bivariée à facteurs latents : théorie et applications à la mortalité et à la dépendance." Thesis, Paris 9, 2015. http://www.theses.fr/2015PA090020/document.

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Abstract:

Cette thèse étudie quelques problèmes d’identification et d’estimation dans les modèles de survie bivariée, avec présence d’hétérogénéité individuelle et des facteurs communs stochastiques.Chapitre I introduit le cadre général.Chapitre II propose un modèle pour la mortalité des deux époux dans un couple. Il permet de distinguer deux types de dépendance : l’effet de deuil et l’effet lié au facteur de risque commun des deux époux. Une analyse de leurs effets respectifs sur les primes d’assurance écrites sur deux têtes est proposée.Chapitre III montre que, sous certaines hypothèses raisonnables, on peut identifier l’évolution jointe du risque d’entrer en dépendance et du risque de mortalité, à partir des données de mortalité par cohortes. Une application à la population française est proposée.Chapitre IV étudie la queue de distribution dans les modèles de survie bivariée. Sous certaines hypothèses, la loi jointe des deux durées résiduelles converge, après une normalisation adéquate. Cela peut être utilisé pour analyser le risque parmi les survivants aux âges élevés. Parallèlement, la distribution d’hétérogénéité parmi les survivants converge vers une distribution semi-paramétrique
This thesis comprises three essays on identification and estimation problems in bivariate survival models with individual and common frailties.The first essay proposes a model to capture the mortality dependence of the two spouses in a couple. It allows to disentangle two types of dependencies : the broken heart syndrome and the dependence induced by common risk factors. An analysis of their respective effects on joint insurance premia is also proposed.The second essay shows that, under reasonable model specifications that take into account the longevity effect, we can identify the joint distribution of the long-term care and mortality risks from the observation of cohort mortality data only. A numerical application to the French population data is proposed.The third essay conducts an analysis of the tail of the joint distribution for general bivariate survival models with proportional frailty. We show that under appropriate assumptions, the distribution of the joint residual lifetimes converges to a limit distribution, upon normalization. This can be used to analyze the mortality and long-term care risks at advanced ages. In parallel, the heterogeneity distribution among survivors converges also to a semi-parametric limit distribution. Properties of the limit distributions, their identifiability from the data, as well as their implications are discussed

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Eichholz, Karsten. "Influence de protéin[e]s de l'hôte sur la réponse immunitaire innée face aux adénovirus humains dans les phagocytes humains." Thesis, Montpellier, 2015. http://www.theses.fr/2015MONTS059.

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Abstract:

Les adénovirus humains (HAdV) provoquent un large spectre de maladies cliniques chez les patients immunodéprimés et immunocompétents et sont également des outils polyvalents pour le transfert de gènes et la vaccination. L’immunité humorale acquise peut être en partie responsable des réactions indésirables envers les vecteurs AdV révélées dans plusieurs essais cliniques de vaccination. De plus, plusieurs protéines de l'hôte comme le facteur X de coagulation de la souris (FX) ou les immunoglobulines de type G se lient aux HAdV et exacerbent la réponse pro-inflammatoire. L’évaluation des risques précliniques se fait souvent chez la souris, même s’il existe plusieurs différences entre les humains et les souris dans l'interaction avec les HAdV. La liaison de FX aux HAdV active une réponse pro-inflammatoire chez la souris par l'intermédiaire des récepteurs Toll-like 4. Dans un autre scénario clinique pertinent, le complexe immun HAdV (IC-HAdV-C5) induit une activation plus forte de l’inflammasome dans les phagocytes humains que l’HAdV-C5 non complexé, mais par un mécanisme inconnu. Dans ce contexte, j’ai participé à deux études. Premièrement, nous avons étudié le rôle potentiel de FX et de TLR4 dans la réponse innée à l ‘HAdV-C5 en utilisant uniquement des cellules et des protéines d’origine humaine. Nous avons constaté qu'il n'y a pas d’activation de la voie de signalisation via TLR4 chez l’homme en présence de FX-HAdV. De plus, le FX n'a pas affecté la forte réponse immunitaire innée induite par IC-HAdV-C5 dans les phagocytes humains. Deuxièmement, nous avons abordé le mécanisme sous-jacent de l'inflammation induite par IC-HAdV-C5. Nous avons démontré que l‘IC-HAdV-C5 induit la formation de l’inflammasome dans les cellules dendritiques dérivées de monocytes et cela dépend de l’échappement endosomal dépendant de la protéine VI et de l'activation des récepteurs cytosoliques de l’inflammasome. Nos résultats nous aident à mieux comprendre les différences entre les tests précliniques réalisés chez la souris et les essais cliniques réalisés chez l'homme. De plus, cela nous permet de mieux comprendre comment l’immunité préexistante façonne la réponse immunitaire innée face aux HAdV, afin d’améliorer le traitement des maladies liées aux HAdV ainsi que l’efficacité des vecteurs HAdV
Human adenoviruses (HAdV) cause a broad spectrum of clinical diseases in immunocompromised and –competent patients and are also versatile tools for gene transfer and vaccination. Pre-existing humoral immunity may be in part responsible for the adverse responses towards AdV vectors seen in several clinical vaccine trials. Furthermore, a variety of host proteins like mouse coagulation factor X (FX) or immunoglobulin G bind HAdV exacerbate the pro-inflammatory response. Pre-clinical risk assessment is often done in mice, albeit there are multiple differences between human and mice in the interaction with HAdV. The binding of FX to HAdV activates a pro-inflammatory response in mouse via Toll-like receptor 4. In another clinical relevant scenario, immune complexed-HAdV (IC-HAdV-C5) induces more inflammasome activation in human phagocytes than HAdV-C5 alone but by unknown mechanism. In this regard, I participated in two studies. First, we investigated a potential role of FX and TLR4 in the innate response to HAdV-C5 by using only human components. We found that there is no detectable FX-HAdV-TLR4 axis in human and FX did not affect the innate immune response elevated by IC-HAdV-C5 in human phagocytes.Second, we addressed the underlying mechanism of IC-HAdV-C5-induced inflammation. We found that IC-HAdV-C5 induces inflammasome formation in monocyte-derived dendritic cells and this is dependent on pVI-mediated endosomal escape and activation of cytosolic inflammasome sensors. Our findings help us to better understand the differences in preclinical testing in mice and clinical use in humans and how pre-existing immunity shapes the innate immune response to HAdV to improve treatment for HAdV diseases and HAdV vector effectiveness

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Liraud, Florence. "Addiction aux substances psychoactives dans les troubles psychotiques et les troubles de l'humeur : facteurs de risque, conséquences pronostiques, et implications thérapeutiques." Bordeaux 2, 2002. http://www.theses.fr/2002BOR20944.

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Abstract:

Dans la 1ère partie de cette thèse nous présentons les travaux ayant évalué la prévalence de l'addiction aux substances psychoactives en population générale et chez les patients souffrant de troubles psychiatriques, en particulier chez les patients présentant un trouble pychotique et/ou de l'humeur. Nous présentons ensuite une revue des différentes hypothèses explicatives de la comorbidité addictive ainsi que les caractéristiques cliniques et pronostiques qui y sont associées. Dans la 2ème partie nous présentons quatre études personnelles. La 1ère porte sur la question de la prévalence des conduites addictives chez des patients hospitalisés en psychiatrie pour un diagnostic autre que celui d'addiction et sur les caractéristiques cliniques et pronostiques associées à cet abus/dépendance comorbide. Cette étude permet de constater que 25,2% des patients hospitalisés en psychiatrie présentent un abus/dépendance à l'alcool sur la vie entière, 22,8% au cannabis et 2,4% à une autre substance. Elle indique également que l'addiction à l'alcool et au cannabis ont des effets délétères distincts sur le plan clinique et social. L'addiction à l'alcool est associée à un nombre supérieur d'hospitalisations en psychiatrie et à des antécédents de tentatives de suicide plus fréquents. L'addiction au cannabis est associée à une mauvaise observance médicamenteuse et à des problèmes pénaux plus fréquents. La seconde porte sur l'impact de l'abus/dépendance aux substances psychoactives sur les capacités neuropsychologiques, en particulier sur les performances mnésiques et d'abstraction. Dans le cadre de cette étude et des 2 suivantes nous nous sommes centrés sur une population de patients présentant spécifiquement un trouble psychotique et/ou de l'humeur. Les résultats indiquent que la comorbidité addictive a des effets délétères limités sur les capacités cognitives. La 3ème étude aborde la question des caractéristiques tempéramentales associées à l'abus/dépendance aux substances. Cette étude permet de constater que la recherche de sensation et l'impulsivité sont deux caractéristiques tempéramentales associées à l'addiction aux substances et pourraient faire partie des facteurs susceptibles d'en favoriser la survenue. Enfin, la 4ème étude porte sur l'association entre caractéristiques tempéramentales et facteurs pronostiques. Cette étude permet de constater que des caractéristiques tempéramentales telles que la recherche de sensation et l'impulsivité sont associées à un risque supérieur de présenter une mauvaise adhérence au traitement, une désinsertion professionnelle et des problèmes pénaux. Dans la 3ème partie de cette thèse nous présentons une synthèse de nos différents résultats et abordons pour finir la question de la prise en charge thérapeutique des patients présentant une comorbidité addictive. Une revue de la littérature nous permet de retracer les différentes démarches thérapeutiques ayant été mises en place auprès de patients présentant un trouble pychotique et/ou de l'humeur et de dégager les stratégies qui semblent les plus pertinentes dans le cadre de tels troubles
In the 1st part of this thesis are reviewed studies assessing the prevalence of substance use disorders in patients with psychiatric disorders, particularly in patients presenting with psychotic and/or mood disorder, as well as the clinical and prognostic characteristics associated with a dual diagnosis. The various hypotheses regarding the mechanisms underlying the comorbid association are reviewed. In the 2nd part are presented 4 original studies. The 1rst one was focused on the prevalence of substance use disorders in patients hospitalised in psychiatry, and on the associated clinical and prognostic characteristics. The 2nd study was focused on the neuropsychologic impact of substance use disorders in patients presenting with psychotic and/or mood disorder. The 3rd study was focused on the temperamental characteristics associated with substance misuse in patients presenting with psychotic and/or mood disorder. The 4th was focused on the association between temperamental characteristics and prognostic characteristics. In the 3rd part of this thesis we present a synthesis of the results obtained in our studies, and on the implications of these finding regarding the treatment for patients presenting with comorbid disorders. The different therapeutic approaches for patients with dual diagnosis are compared, in order to identify the most effective ones

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Fatseas, Mélina. "Étude des motivations à l'usage des substances addictives : liens avec les propriétés renforçantes de la substance de choix et facteurs associés." Bordeaux 2, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR21409.

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Abstract:

Introduction : Différentes motivations à l'usage de substances se dégagent de la littérature : une dimension positive de recherche d'euphorie et une dimension négative visant un apaisement des affects douloureux. Objectif : Notre objectif était de décrire les différentes motivations à l'usage des substances, puis d'examiner leurs relations avec, d'une part les propriétés pharmacologiques de la substance de choix, d'autre part les caractéristiques individuelles psychopathologiques. Notre travail a porté sur l'étude des motivations à l'usage des benzodiazépines (première étude), et des différentes substances addictives (seconde étude) chez des sujets dépendants, en traitement. Méthode : Les sujets répondaient à un auto-questionnaire évaluant les motivations à l'usage, à des entretiens avec l'Addiction Severity Index (ASI) et avec le Mini International Neuropsychiatric Interview (MINI). Pour la seconde étude, des évaluations psychopathologiques et de personnalité étaient réalisées. Résultats : La première étude sur les benzodiazépines a porté sur un échantillon de 92 sujets, dépendants des opiacés. La situation la plus représentée était l'existence des deux motivations, hédonique et auto-thérapeutique (53 %), suivie d'une motivation auto-thérapeutique exclusive (32 %), et d'une motivation hédonique exclusive (15 %). Les comportements de consommation apparaissaient différents selon la motivation. La seconde étude a porté sur un échantillon de 240 sujets. La motivation hédonique était associée à un choix plus fréquent pour les substances les plus renforçantes (héroïne, cocaïne, tabac). Certains facteurs psychopathologiques étaient associés aux motivations. Discussion : Nos résultats indiquent pour certains sujets la possibilité de percevoir deux dimensions de motivations, et pour d'autres de ne percevoir qu'une dimension exclusive de motivation. Ce phénomène pourrait concerner l'usage de l'ensemble des substances addictives. De plus, notre seconde étude est la première étude qui établit un lien entre les différentes motivations, les propriétés renforçantes des substances d'une part, et les caractéristiques individuelles psychopathologiques d'autre part
Introduction : There are various motivations for the use of potentially addictive substances in the literature : a positive dimension for a search for euphoria, and a negative dimension involving a relief of pain. Objective : Our objective was to describe the different motivations for the use of addictive substances, then to examine their relationships with the reinforcing character of the substance of choice and, the individual psychopathological characteristics. Our work was based on the motivations for benzodiazepines use (first study) and for the different addictive substances (second study) in a sample of dependent subjects undergoing treatment. Methods : Participants had to answer a self-administered questionnaire evaluating the self-perceived motivations for use of different substances, and were interviewed with the Addiction Sverity Index (ASI), and with the Mini International Neuropsychiatric Interview MINI). For the second study, psychopathological and personality evaluations were realized. Results : For the first study, the sample consisted of 92 opiate-dependent subjects. The most common situation was the presence of two motivations, hedonic and self-therapeutic (53 %), followed by an exclusively self-therapeutic motivation (32 %), and an exclusively hedonic motivation (15 %). Behavior appeared to be different according to motivation. The second study was carried out on a sample of 240 subjects dependent on at least one substance. The hedonic motivation was associated with a more frequent choice of the most reinforcing substances (heroin, cocaine, tobacco). Some psychopathological factors were associated to the motivations. Discussion : Our results indicate the possibility for certain subjects to perceive and report both dimensions of motivation, whereas other subjects identify an exclusive motivation. This phenomenon could involve the use of all addictive substances. Moreover, the present study is the first assessing specifically the relationship between motivation for use and the reinforcing properties of addictive substances, as well as the link with individual psychopathological factors

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Silva, Rosa da Luz Brenda. "Caractérisation des vésicules extracellulaires dérivées de staphylococcus aureus et leur impact sur la réponse de l'hôte." Electronic Thesis or Diss., Rennes, Agrocampus Ouest, 2022. http://www.theses.fr/2022NSARB361.

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Abstract:

Les vésicules extracellulaires (VEs) sont des bio-particules dérivant de la membrane bactérienne et transportant des molécules impliquées dans les interactions avec l’hôte. Le pathogène Staphylococcus aureus (SA) libère des VEs encore largement inexplorées. Cette thèse fournit le premier travail de caractérisation approfondie de la composition en ARN et en protéines des VEs de SA et de ses cellules productrices. Les VEs contiennent toutes les classes d’ARN sous formes intactes ou fragmentées, dont des petits ARN régulateurs. Le contenu en protéines des VEs comprend des facteurs de virulence, des régulateurs transcriptionnels et des enzymes de voies métaboliques variées. Des différences de composition entre les VEs et les cellules productrices ont été détectées, suggérant des processus d’empaquetage sélectif de leur contenu. Au niveau de leurs fonctions biologiques, nous avons montré que l'ajout de VEs à des cultures bactériennes de SA améliorait leur croissance en conditions carencéeDans le cadre des interactions hôte-pathogène, la réponse cellulaire induite par les VEs différait de celle induite par les bactéries vivantes, indiquant que les VEs pourraient avoir d'autres fonctions physiologiques en lien avec l’infection que celles des bactéries. Dans l'ensemble, nous démontrons que les VEs de SA contienent de nouveaux éléments et modulent la réponse de l'hôte avec différentes intensités, temps d'exposition et par des voies différentes de celles des bactéries vivantes. Cette étude apporte des connaissances sur les rôles fonctionnels potentiels des VEs dans le contexte de la physiologie bactérienne et des infections staphylococciques
Bacterial extracellular vesicles (EVs) are nanoparticles carrying macromolecules that can influence host-pathogen interactions. The pathogen Staphylococcus aureus (SA) releases EVs whose characteristics are still largely explored. This thesis’s project provides the first work extensively characterizing the RNA and protein content of profile of SA clinical HG003 strain and its producing cells. We found that EVs comprised all RNA classes including small regulatory RNA. The protein content of EVs was also diverse with various important elements such as virulence factors, transcriptional regulators, and metabolic enzymes. Interestingly, the protein and RNA content of EVs differed from that of its producing cells, suggesting that selective cargo packing exists. The intra- and interspecies role of EVs was also investigated.We found that the addition of HG003 EVs to bacterial cultures improved their growth in restrictive media. In the context of host-pathogen interactions, the cellular response induced by EVs differed from that induced by the living bacteria in both human and bovine models, indicating that EVs could display other physiological functions than those of bacteria which may be important to the infection process. Overall, our data evidence that SA EVs carry important newly discovered elements, and modulate the host response with different intensities, exposure periods, and by different routes from that of live bacteria. This study brings new knowledge about SA EVs potential functional roles in the context of bacterial physiology and staphylococcal infections

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Lafittau, Magalie. "Rôle des facteurs biopsychosociaux dans l'évolution de personnes dépendantes aux opiacés débutant un traitement de substitution par méthadone : étude semi-prospective d'une cohorte de 50 patients." Bordeaux 2, 2006. http://www.theses.fr/2006BOR21323.

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Abstract:

Cette étude semi-prospective avait pour premier objectif d'étudier l'évolution de patients dépendants aux opiacés au cours des trois premiers mois de leur prise en charge dans un traitement de substitution par méthadone. Dans un deuxième temps, nous avons évalué les antécédents (socio-démographiques, biomédicaux, de personnalité) et les variables transactionnelles (stress perçu, croyances et stratégies de coping) pouvant prédire l'ajustement au traitement en termes d'abstinence, de qualité de vie et de détresse émotionnelle. Dans un dernier temps, nous avons souhaité mettre en évidence les variables permettant de discriminer des patients abstinents des patients ayant rechuté. Les ANOVAs sur mesures répétées ont révélé des différences significatives sur certaines variables biopsychosociales entre les quatre évaluations de notre étude. Les analyses en régressions linéaires multiples ont notamment révélé l'impact positif des stratégies émotionnelles et des croyances vis-à-vis de la méthadone sur l'abstinence et la qualité de vie des individus. Ces résultats soulignent le rôle important des croyances et des stratégies d'adaptation mises en place au cours du traitement, dans l'abstinence aux substances opiacées et le bien être des patients. Ils indiquent également la pertinence d'un modèle multifactoriel dans la compréhension des phénomènes de dépendance et de rechute. Les résultats sont discutés pour leur implication dans la prise en charge de patients en démarche d'arrêt des consommations de substances
This semi-forward-looking study had for first objective to study the evolution of dependent patients in opiates during the first three months of their coverage in a treatment of substitution by méthadone. In the second time, we estimated antecedents (socio-demographic, biomedical, of personality) and the transactional variables (perceived stress, beliefs and coping strategies) being able to predict the adjustment for the treatment in terms of abstinence, quality of life and emotional distress. In a last time, we wished to put in evidence variables allowing to discriminate between abstinent patients of the patients having relapsed. The measure repeated ANOVAs revealed significant differences on certain biopsychosocial variables between four evaluations of our study. Analyses in multiple linear regressions notably revealed the positive impact of the emotional strategies and the beliefs about méthadone on the abstinence and the quality of life of subjects. These findings underscore the important role of the beliefs and the strategies of adaptation organized during the treatment, in the abstinence in opioid substances and the well being of patients. They also indicate the relevance of a multifactorial model in the understanding of the phenomena of dependence and relapse. These results are discussed relative to their implication in patients' coverage in initiative of ruling of the consumptions of substances

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Do, Van Phuc. "Contribution au développement et à l'étude de facteurs d'importance fiabilistes pour les systèmes markoviens." Phd thesis, Université de Technologie de Troyes, 2008. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00636258.

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Abstract:

Les facteurs d'importance fiabilistes permettant de fournir des informations sur l'importance des composants vis-à-vis des performances fiabilistes d'un système. Ces facteurs d'importance sont un outil efficace pour la prise de décision dans les études de fiabilité, d'analyse de risques, en maintenance, en exploitation ou en conception. Les facteurs d'importance fiabilistes ont été classiquement définis dans le cadre des modèles booléens de fiabilité et, sous leur forme classique (et avec les méthodes d'évaluation actuelles), ces facteurs ne sont souvent utilisables que sous l'hypothèse de composants binaires et indépendants, et pour une architecture de système " statique ". L'utilisation de ces facteurs d'importance pour l'aide à la décision sur des systèmes réels impose pourtant souvent la prise en compte d'hypothèses plus réalistes. Cette thèse propose un nouveau facteur d'importance fiabiliste, la " sensibilité multi-directionnelle ", qui permet d'évaluer l'importance fiabiliste d'un composant ou d'un groupe de composants d'un système markovien à composants dépendants et, plus généralement, l'importance fiabiliste d'un ensemble de caractéristiques du système. On développe également des méthodes efficaces d'évaluation de ce nouveau facteur d'importance par calcul analytique ou par estimation à partir d'une seule trajectoire observée en utilisant des techniques d'analyse par perturbation. L'extension aux ordres supérieurs et l'utilisation pour des systèmes markoviens d'un facteur importance introduit récemment (DIM) sont également abordés.

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Friguet, Chloé. "Impact de la dépendance dans les procédures de tests multiples en grande dimension." Phd thesis, Agrocampus - Ecole nationale supérieure d'agronomie de rennes, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00539741.

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Abstract:

Motivé par des applications dans le domaine de l'analyse de données génomiques, ce travail de thèse porte sur l'étude de l'impact de la dépendance sur les propriétés des procédures de tests multiples en grande dimension. Notre proposition consiste à considérer un modèle d'Analyse en Facteurs pour la structure de dépendance entre les variables. Un algorithme de type EM est présenté pour estimer les paramètres du modèle ainsi qu'une méthode ad hoc pour déterminer le nombre optimal de facteurs à inclure dans le modèle. De plus, ce modèle définit un cadre général pour la prise en compte de la dépendance dans les procédures de tests multiples. L'estimation du taux de faux-positifs (FDR) et de la proportion d'hypothèses nulles, paramètre important qui intervient dans le contrôle des taux d'erreurs, sont étudiés plus particulièrement. Ainsi, on montre que la dépendance entre tests entraîne une instabilité des procédures d'inférence simultanée. Une nouvelle approche est présentée : l'objectif est de réduire cette dépendance, procurant à la fois une augmentation de la puissance des tests et une diminution de la variabilité des taux d'erreurs. Enfin, ces résultats méthodologiques sont illustrés à partir de données génomiques et la procédure est implémentée dans le logiciel libre R au sein du package FAMT.

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Friguet, Chloé. "Impact de la dépendance dans les procédures de tests multiples en grande dimension." Phd thesis, Rennes, Agrocampus Ouest, 2010. http://www.theses.fr/2008NSARG007.

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Abstract:

Motivé par des applications dans le domaine de l'analyse de données génomiques, ce travail de thèse porte sur l'étude de l'impact de la dépendance sur les propriétés des procédures de tests multiples en grande dimension. Notre proposition consiste à considérer un modèle d'Analyse en Facteurs pour la structure de dépendance entre les variables. Un algorithme de type EM est présenté pour estimer les paramètres du modèle ainsi qu'une méthode ad hoc pour déterminer le nombre optimal de facteurs à inclure dans le modèle. De plus, ce modèle définit un cadre général pour la prise en compte de la dépendance dans les procédures de tests multiples. L'estimation du taux de faux-positifs (FDR) et de la proportion d'hypothèses nulles (_0), paramètre important qui intervient dans le contrôle des taux d'erreurs, sont étudiés plus particulièrement. Ainsi, on montre que la dépendance entre tests entraîne une instabilité des procédures d'inférence simultanée. Une nouvelle approche est présentée : l'objectif est de réduire cette dépendance, procurant à la fois une augmentation de la puissance des tests et une diminution de la variabilité des taux d'erreurs. Efin, ces résultats méthodologiques sont illustrés à partir de données génomiques et la procédure est implémentée dans le logiciel libre R au sein du package FAMT
Motivated by issues raised by the analysis of gene expressions data, this thesis focuses on the impact of dependence on the properties of multiple testing procedures for high-dimensional data. We propose a methodology based on a Factor Analysis model for the correlation structure. Model parameters are estimated thanks to an EM algorithm and an ad hoc methodology allowing to determine the model that fits best the covariance structure is defined. Moreover, the factor structure provides a general framework to deal with dependence in multiple testing. Two main issues are more particularly considered : the estimation of _0, the proportion of true null hypotheses, and the control of error rates. The proposed framework leads to less variability in the estimation of both _0 and the number of false-positives. Consequently, it shows large improvements of power and stability of simultaneous inference with respect to existing multiple testing procedures. These results are illustrated by real data from microarray experiments and the proposed methodology is implemented in a R package called FAMT

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Billaud, Mélanie. "Étude de l'impact du réchauffement des océans sur l'expression des facteurs de virulence de Vibrio parahaemolyticus et réponse de l'hôte Exaiptasia pallida à l'infection." Electronic Thesis or Diss., Université Côte d'Azur, 2023. http://www.theses.fr/2023COAZ6042.

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Abstract:

L'augmentation de la température des océans entraîne l'émergence de bactéries pathogènes, notamment du genre Vibrio spp. Parmi celles-ci, Vibrio parahaemolyticus (V. parahaemolyticus) se trouve être à la fois pathogène pour l'Homme et les organismes marins. Cette bactérie, répandue mondialement, est responsable de graves cas de gastro-entérites liées à la consommation de fruits de mer infectés insuffisamment ou non cuits. Parallèlement, un problème majeur émerge pour la santé publique : la contamination des océans par les microplastiques, qui deviennent de nouveaux vecteurs pathogènes. Il devient crucial d'étudier l'impact de l'augmentation des températures sur l'adhésion et la formation de biofilms par V. parahaemolyticus sur des surfaces abiotiques (plastique) et biotiques (crustacé, etc) ainsi que la réponse des organismes marins à l'infection.Le premier chapitre de cette thèse traite de la virulence de V. parahaemolyticus en eau de mer à trois températures différentes : 21°C (moyenne méditerranéenne), 27°C (température des eaux tropicales) et 31°C (prédiction pour 2050 selon l'IPCC).Les mécanismes de virulence de V. parahaemolyticus sont bien décrits. Nous avons étudié l'étape initiale d'infection étant l'adhésion aux hôtes ou aux substrats via des adhésines (comme MAM7 et GbpA), et la production de biofilms grâce à des pili de type 4 (tels que PilA ou MSHA), suivi de la sécrétion de la toxine TDH. Nos résultats indiquent que l'augmentation des températures favorise l'adhésion des bactéries aux plastiques par le biais des adhésines, stimule la formation de biofilms grâce aux pili de type 4 et augmente la sécrétion de toxines tel que la TDH.Dans la seconde partie de cette thèse, nous avons étudié l'impact du réchauffement sur le processus de l'infection par V. parahaemolyticus d'un organisme marin. Nous avons choisi Exaiptasia pallida (E. pallida), une anémone faisant partie des Cnidaires, modèle émergent, dotée d'un système immunitaire inné similaire à celui de l'Homme et représentatif pour l'étude des relations hôte-pathogènes. Deux méthodes d'infection ont été employées : l'infection par filtration (simulant un processus naturel) et l'injection directe dans le cœlentéron de l'animal, montrant des réponses similaires. Les réponses morphologiques d'E. pallida à l'infection sont semblables à celles de l'Homme, avec une dégradation des tissus et une augmentation de la sécrétion de mucus après l'infection.Afin de localiser les Vibrio dans les différents tissus de l'anémone, nous avons optimisé une technique de transparisation (AnemoClear) qui nous a permis de localiser les bactéries dans les mésentères. Ce résultat a été confirmé par imagerie in vivo et imagerie confocale sur tissus fixé.Les filaments mésentériques sont connus dans la littérature comme impliqué dans la réponse immunitaire chez les Cnidaires. Nous avons focalisé la suite de nos recherches sur l'identification des cellules infectés par V. parahaemolyticus (qui exprime de manière constitutive la GFP (Vp-GFP)) dans ces filaments mésentériques isolés après dissection. Ne disposant pas d'anticorps dirigé contre des marqueurs spécifique de l'anémone, nous avons utilisé son autofluorescence détectée à l'aide de techniques de cytométrie spectrale. Nous avons identifié une population cellulaire grâce à son spectre d'autofluorescence similaire à celui des monocytes humains. Cette population montre une intense double positivité avec le spectre de Vp-GFP qui, a 27°C, sont regroupées dans des vacuoles, alors qu'à 31°C, celles-ci sont éparses.Ainsi, les travaux menés ont permis d'étudier la réponse d'E. pallida infecté par V. parahaemolyticus à différentes températures en eau de montrant un impact du réchauffement sur le maintien des structures lors de l'infection. Nous avons mis en évidence des cellules similaires aux cellules immunitaires humaines impliquées dans la phagocytose bactérienne
Rising ocean temperatures lead to the emergence of pathogenic bacteria, particularly of the genus Vibrio spp. Among these, Vibrio parahaemolyticus (V. parahaemolyticus) is a pathogen of both humans and marine organisms. This bacterium, which is widespread throughout the world, is responsible for severe cases of gastroenteritis resulting from the consumption of undercooked infected seafood. At the same time, a major public health problem is emerging: ocean pollution from microplastics, which are becoming a new vector for pathogens. It is becoming increasingly important to study the effects of rising temperatures on adhesion and biofilm formation by V. parahaemolyticus on abiotic (plastic) and biotic (shellfish, etc.) surfaces, as well as the response of marine organisms to infection.The first chapter of this thesis focuses on the virulence of V. parahaemolyticus in seawater at three different temperatures: 21°C (average temperature in the Mediterranean Sea), 27°C (tropical water temperature), and 31°C (predicted for 2050 according to IPCC).The virulence mechanisms of V. parahaemolyticus are well described. We studied the initial stage of infection, adhesion to hosts or substrates via adhesins (such as MAM7 and GbpA) and biofilm production via type 4 pili (such as PilA or MSHA), followed by secretion of the toxin TDH. Our results suggest that elevated temperatures promote adhesion of bacteria to plastics via adhesins, stimulate biofilm formation via type 4 pili, and increase secretion of toxins such as TDH.In the second part of this work, we wanted to investigate the effects of global warming on the process of V. parahaemolyticus infection in a marine organism. We chose Exaiptasia pallida (E. pallida), an anemone belonging to the cnidarians, an emerging model with an innate immune system similar to that of humans and representative for the study of host-pathogen relationships. Two infection methods were used: infection by filtration (simulating a natural process) and direct injection into the animal's coelenteron, which showed similar responses. The morphological responses of E. pallida to infection were similar to those of humans, with tissue degradation and increased mucus secretion after infection.To localise Vibrio in the different tissues of the anemone, we optimised a transparentization technique (AnemoClear) that allowed us to localise the bacteria in the mesenteries. This result was confirmed by in vivo imaging and confocal imaging on fixed tissue.Mesenteric filaments are known in the literature to be involved in the immune response in Cnidaria. We focused our subsequent studies on the identification of cells infected with V. parahaemolyticus (which constitutively expresses GFP (Vp-GFP)) in these mesenteric filaments isolated after dissection. In the absence of antibodies directed against anemone-specific markers, we used their autofluorescence detected by spectral cytometry techniques. We identified a population of cells with an autofluorescence spectrum similar to that of human monocytes. This population showed intense double positivity with the spectrum of Vp-GFP grouped into vacuoles at 27°C, whereas they were scattered at 31°C.The work performed allowed us to study the response of E. pallida infected with V. parahaemolyticus at different water temperatures and to show the effects of heating on the maintenance of structures during infection. We identified cells resembling human immune cells involved in bacterial phagocytosis

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Akgun, Oguzhan. "Dépendance inter-individuelle sur panels hétérogènes : estimation, inférence et prévision." Thesis, Paris 2, 2019. http://www.theses.fr/2019PA020008.

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La disponibilité de données de panel ayant des dimensions temporelle et individuelle comparables et importantes augmente rapidement. Cette structure offre de nouvelles perspectives pour appréhender et caractériser les dépendances inter-individuelles. Cette thèse, tout en s'appuyant sur la littérature récente liée aux panels hétérogènes de grande taille en présence de dépendances inter-individuelles, en propose trois prolongements. Le premier chapitre traite des problèmes d'estimation, d'inférence et de prévision, en se concentrant sur la comparaison d'estimateurs hétérogènes, homogènes et partiellement homogènes en présence de dépendances inter-individuelles. Ces dernières renvoient à des structures de dépendance spatiale sur les perturbations et à la présence de facteurs communs. Le deuxième chapitre se focalise sur l'élaboration de tests robustes à différentes structures de dépendance inter-individuelle afin d'évaluer la qualité prédictive de plusieurs panels. Enfin, le troisième chapitre se concentre sur les prévisions, obtenues sur la base d'approches itérée et directe, et l'introduction de termes spécifiques liés aux dépendances inter-individuelles dans les prédicteurs. La comparaison des prévisions de taux d'inflation sur un panel de pays de l'OCDE révèle notamment l'importance de la prise en compte des facteurs communs
The availability of panel data sets with comparable and large time and individual dimensions is rapidly increasing. This structure offers new possibilities to understand and characterize cross-sectional dependence. This thesis makes three contributions to the recent literature dealing with large heterogeneous panel data sets with cross-sectional dependence. The first chapter deals with estimation, inference and forecasting issues focusing on the comparison of heterogeneous, homogeneous and partially homogeneous panel data estimators in presence of cross-sectional dependence modeled by spatial error dependence and common factors. In the second chapter novel tests for equal predictive ability in panels of forecasts are proposed, allowing for different types and strength of cross-sectional dependence across units. Finally, the third chapter focuses on forecasts obtained using iterated and direct methods. A special emphasis is put on the predictors which contain terms related to interactions between panel units. Inflation forecasts for the OECD countries are compared empirically. The results show the importance of taking common factors into account to predict inflation

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Lepelletier, Didier. "Rôle de l'antibiothérapie et des facteurs liés à l'hôte et à l'hospitalisation sur le risque de colonisation et d'infection par des bactéries résistantes aux antibiotiques." Nantes, 2006. https://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show/show?id=73871b95-bdbc-4921-80d5-d80b82d39f41.

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Abstract:

L'émergence de bactéries résistantes aux antibiotiques est devenue un problème majeur de santé publique, notamment en milieu hospitalier. De nombreuses données épidémiologiques établissent un lien entre antibiothérapie et infections causées par des bactéries résistantes aux antibiotiques. Dans ce contexte, nous avons initialement réalisé deux études épidémiologiques sur des souches cliniques d’ Escherichia coli dans le but de préciser le rôle de l’antibiothérapie mais aussi des facteurs liés à l’hôte et à l’hospitalisation. Ces études ont permis de montrer une association significative entre l’exposition à un antibiotique et l’immunodépression et l’isolement d’une souche résistante. En particulier, l’exposition à une β-lactamine était associée à la résistance à l’amoxicilline et aux céphalosporines de 3ème génération (C3G) et l’exposition aux fluoroquinolones et au cotrimoxazole était respectivement associée à la résistance à ces molécules. Dans un deuxième temps, nous avons réalisé une étude prospective de la flore digestive de 933 patients hospitalisés dans cinq services différents du CHU de Nantes, incluant des services de médecine, chirurgie et de réanimation dans le cadre d’un Programme Hospitalier de Recherche Clinique national. Aucun entérocoque résistant à la vancomycine n’a été détecté, 585 patients étaient colonisés par une entérobactérie résistante à l’amoxicilline, parmi lesquelles 9,4% étaient résistantes aux C3G et 4,8% résistantes à l’ofloxacine. Cent quatre vingt quinze patients étaient colonisés par Pseudomonas aeruginosa, dont 23% à l’admission. L’exposition aux antibiotiques était impliquée dans chacune des résistances observées. L’antécédent d’hospitalisation ou l’hospitalisation dans certains services étaient également des facteurs de risque associés à l’isolement de souches résistantes. Les études de flore sont de réalisation et d’interprétation délicates mais s’avèrent intéressantes dans des situations épidémiques ou dans des contextes de surveillance épidémiologique ciblée
Antimicrobial resistance is a major heath problem, especially in hospital-acquired infections. Many epidemiological data showed an association between antibiotic use and infection caused by antibiotic-resistant bacteria. To assess the impact of antibiotic use and other factors, we performed two epidemiological studies on clinical Escherichia coli strains isolated from hospital patients. We showed a significant association between antibiotic use and immunosuppression and infection caused by resistant E. Coli. Previous use of β-lactamine was associated with amoxicillin- and third generation cephalosporin resistance, and previous use of fluoroquinolones and cotrimoxazole was associated with strains resistant to those antibiotics. In a second time, we performed a prospective study of the gut flora of 933 patients hospitalised in five different wards, including medicine and surgery wards and intensive-care units. No vancomycin-resistant Enterococci was isolated. 585 patients were colonised by an amoxicillin-resistant Enterobacteriaceae, with third generation cephalosporin- and ofloxacin resistance rates of 9. 4% and 4. 8%, respectively. One hundred and ninety five patients were colonized by Pseudomonas aeruginosa (23% on admission). Antibiotic use was implicated in all observed resistances. Previous hospital stay and hospitalisation in specific wards were also associated with antibiotic resistance. Studies of intestinal microflora are difficult to perform but are useful in epidemic situations and in target resistance surveillance programs

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Acheli, Rafik. "Dépendance aux opiacés et stress post-traumatique : études empiriques des facteurs de risques post-traumatiques auprès de patients héroïnodépendants sous traitement de substitution." Thesis, Nantes, 2019. http://www.theses.fr/2019NANT2047.

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Abstract:

La dépendance aux opiacés est un véritable problème de santé publique et les études sur ses facteurs de risque sont nécessaires. Les travaux scientifiques abordant les liens entre héroïnodépendance sous l’angle de l’impact des événements traumatiques et des conséquences post-traumatiques, facteurs de risque souvent apparents dans la clinique, se sont davantage portés sur des populations spécifiques des pays anglo-saxons, et plus rarement en France. Cette thèse s’est donc attachée à étudier les facteurs de risque post-traumatiques auprès de patients héroïnodépendants sous traitement de substitution à travers 2 études transversales. Les deux études ont concerné un ensemble de 100 patients héroïnodépendants sous TSO durant leur traitement dans des CSAPA de la région francilienne (Étude 1 n=30, Étude 2 n=70). Nous avons posé l’hypothèse que la dépendance aux opiacés est corrélée aux événements traumatiques, à des troubles psychiatriques et à des déterminants sociodémographiques. Les patients ont répondu à des entretiens structurés et à un dossier de questionnaires validés pour évaluer les caractéristiques sociodémographiques, le vécu traumatique et ses conséquences psychopathologiques. La première étude montre que la dépendance aux opiacés est positivement corrélée à la situation sociale, aux symptômes dissociatifs actuels et d’hyperréactivité du TSPT. La seconde recherche souligne des corrélations positives entre la dépendance aux opiacés et la situation sociale, les symptômes du Trouble panique vie entière, trouble dissociation péri-traumatique et du TSPT. En conclusion, notre thèse a apporté des éléments de compréhension des liens entre TSPT et dépendance aux opiacés, contribuant ainsi à la recherche française dans le domaine des addictions. Nos études mettent en lumière la nécessité d’investiguer rigoureusement la présence d’événements traumatiques et d’inclure une intervention psychothérapeutique TCC visant le TSPT dans le traitement de l’héroïnodépendance
Opioid addiction is a real public health problem and studies on its risk factors are needed. Scientific work addressing the links between heroin dependence in terms of the impact of traumatic events and post-traumatic consequences, risk factors that are often visible in hospital settings, has focused more on specific populations in USA, and more rarely in France. This Ph.D. thesis therefore focused on studying post-traumatic risk factors in heroin-dependent patients under substitution treatment (ST) through 2 cross-sectional studies. The two studies involved a total of 100 heroin-dependent patients on ST during their treatment in hospital settings in the Ile-de-France region (Study 1 n=30, Study 2 n=70). We hypothesized that opioid dependence is correlated with traumatic events, psychiatric disorders and socio-demographic determinants. Patients responded to structured interviews and a set of validated questionnaires to assess socio-demographic characteristics, traumatic experiences and their psychopathological consequences. The first study shows that opioid dependence is positively correlated with social status, current dissociative and hyper-arousal symptoms of PTSD. The second research highlights positive correlations between opioid dependence and social situation, symptoms of whole Life Panic Disorder, Peri-Traumatic Dissociation Disorder and PTSD. In conclusion, our studies provided elements for understanding the links between PTSD and opiate dependence, thus contributing to French research in the field of addiction. Our studies highlight the need to rigorously investigate the presence of traumatic events and to include CBT intervention for PTSD in the treatment of heroin addiction

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Le, Samedy Mathieu. "Déterminants psychologiques des processus de dépendance alcoolique et cannabique à l'adolescence : étude des interactions des facteurs de personnalité, d'estime de soi et de difficultés interpersonnelles." Thesis, Tours, 2013. http://www.theses.fr/2013TOUR2032/document.

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Abstract:

S’il est actuellement reconnu qu’un ensemble de facteurs vulnérabilisant et protecteurs interagissent dans les processus d’instauration des conduites de dépendance alcoolique et cannabique à l’adolescence, les connaissances sont encore peu avancées concernant la manière dont ils s’articulent. Parmi ces facteurs, certains traits de personnalité, l’estime de soi et les difficultés interpersonnelles, sont considérés comme majeurs. L’introduction théorique de notre travail tente de mettre en évidence l’intérêt de retenir la théorie des Big Five (Goldberg, 1993; John & Srivastava, 1999) dans l’étude de ces conduites, car elle est considérée actuellement comme une taxonomie rigoureuse, connaissant un large consensus dans le domaine de la psychologie de la personnalité (McAdams & Pals, 2006). Dans cette même partie, nous soulignons l’intérêt de s’appuyer sur une conception multi-dimensionnelle de l’estime de soi, afin de l’inscrire dans une approche globale. Enfin, nous y distinguons différents domaines liés aux difficultés interpersonnelles à l’adolescence, tels que l’affirmation de soi, les relations familiales, les relations aux pairs, les relations amicales et les relations sentimentales
Even though it is now commonly acknowldged that a set of destabilising and protecting factors are at play in the appearance of alcohol and cannabis dependence in adolescents, there is as of yet little knowledge of how these factors actually interact. Amongst the latter, certain personality traits, self-esteem and interpersonal difficulties are considered key. The theoretical introduction to our work aims at underlining the importance of the theory of the Big Five (Goldberg, 1993; John & Srivastava, 1999) in this field, this model being currently considered a rigorous taxonomy that gathers a large consensus in the field of personality psychology (McAdams & Pals, 2006). In the introduction as well, we stress the relevance of a multi-dimensional conception of self-esteem, so as to frame it as part of a wider approach. Finally, we establish different areas related to interpersonal difficulties in adolescents, such as self-assertion, family relations, relations with peers, love relationships and friendship

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Buisson, Anthony. "Etude du comportement des macrophages vis-à-vis des Escherichia Coli adhérents et invasifs islés de patients atteints de maladie de Crohn en fonction des facteurs de susceptibilité de l'hôte." Thesis, Clermont-Ferrand 1, 2016. http://www.theses.fr/2016CLF1MM16.

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Abstract:

La maladie de Crohn (MC) est une maladie inflammatoire chronique de l’intestin (MICI), dont la physiopathologie résulterait d’une interaction anormale entre le microbiote intestinal et le système immunitaire de l’hôte sous l’influence de facteurs génétiques et environnementaux. Au sein de ce microbiote, les E. coli adhérents et invasifs (AIEC) colonisent la muqueuse iléale des patients atteints de la MC et sont capables de survivre et se multiplier à l’intérieur des macrophages. Par ailleurs, les objectifs thérapeutiques de la MC et notamment la cicatrisation muqueuse endoscopique nécessitent des endoscopies répétées, peu acceptables du point de vue des patients. Parmi les moyens alternatifs, la calprotectine fécale est le marqueur fécal de référence même si ses performances semblent diminuées dans certaines situations comme la maladie iléale pure. Le premier objectif de ces travaux étaient de comparer la capacité des macrophages dérivés de monocytes (MDM) issus de patients atteints de MC, de rectocolite hémorragique (RCH) ou de sujets sains à contrôler l’infection par les AIEC et d’identifier les facteurs associés à cette multiplication des AIEC et notamment le rôle des polymorphismes génétiques associés à la MC en lien avec l’autophagie. Les AIEC se multipliaient de manière plus importante que la souche non pathogène K12 dans les macrophages quel que soit leur origine. L’entrée des AIEC (1h post- infection) ne variait pas en fonction de la provenance des macrophages. La survie des AIEC était augmentée dans les MDM issus de patients MC comparés à ceux issus de RCH ou de sujets contrôles. En analyse multivariée, cette survie était positivement corrélée à la sécrétion d’IL1β mais était diminuée en présence des variants à risque pour ULK1 (p=0,046) et XBP1 (p=0,014). Les MDM issus de patients MC étaient incapable de contrôler la multiplication des AIEC contrairement à ceux issus de RCH ou de sujets contrôles d’autant plus en présence du variant à risque pour IRGM (p=0,045). L’infection des MDM de patients MC par les bactéries AIEC induit un profil de sécrétion cytokinique pro-inflammatoire. La deuxième partie de ces travaux avait pour but de comparer les performances de la chitinase 3-like 1 fécale (CHI3L1), une protéine de l’hôte interagissant avec un facteur de virulence des AIEC, et la métalloprotéase matricielle 9 (MMP-9) pour détecter l’activité inflammatoire endoscopique de la MC en comparaison du marqueur fécal de référence, la calprotectine. Les taux de CHI3L1, de MMP-9 et de calprotectine fécales étaient corrélés au ‘Crohn’s Disease Endoscopic Index of Severity’ (CDEIS) et étaient significativement augmentés en présence d’ulcérations endoscopiques. En cas d’atteinte iléale pure, la CHI3L1 fécale semblait mieux corrélée au CDEIS que la calprotectine fécale. Le seuil de CHI3L1 fécale de 15 ng/g présentait de meilleures performances que la calprotectine fécale pour détecter la présence d’ulcérations endoscopiques. La MMP-9 étaient un marqueur performant pour détecter la présence de lésions endoscopiques dans les MICI. En conclusion, nous avons montré qu’il existe un défaut des macrophages à contrôler l’infection par les bactéries AIEC chez les patients atteints de MC en rapport avec les variants à risque impliqués dans l’autophagie conduisant à un phénotype de macrophages pro-inflammatoires. La CHI3L1 fécale, connue comme une protéine de l’hôte interagissant avec un facteur de virulence des AIEC, tout comme la MMP-9 semblent être de bons marqueurs d’activité endoscopique dans les MICI
Crohn's disease (CD) is a chronic inflammatory bowel disease (IBD) whose pathophysiology results from an abnormal interaction between the gut microbiota and the host's immune system under the influence of genetic and environmental factors. . Within this microbiota, adherent and invasive E. coli (AIEC) colonize the ileal mucosa of patients with CD and are able to survive and multiply within macrophages. Moreover, the therapeutic objectives of CD, and especially endoscopic mucosal healing, require repeated endoscopies, which are not acceptable from the patients' point of view. Among alternative means, fecal calprotectin is the fecal marker of reference even if its performance seems to be diminished in certain situations like pure ileal disease. The primary objective of this work was to compare the ability of monocyte-derived macrophages (MDM) from patients with CD, ulcerative colitis (UC) or healthy subjects to control AIEC infection and to identify associated with this multiplication of AIEC and in particular the role of genetic polymorphisms associated with CD in connection with autophagy. AIEC multiplied more than non-pathogenic strain K12 in macrophages irrespective of their origin. The entry of the AIEC (1h post-infection) did not vary according to the origin of the macrophages. The survival of AIEC was increased in MDM from MC patients compared to those from HCR or control subjects. In multivariate analysis, this survival was positively correlated with the secretion of IL1β but was decreased in the presence of the variants at risk for ULK1 (p = 0.046) and XBP1 (p = 0.014). MDM from MC patients were unable to control the multiplication of AIEC, unlike those from HCR or control subjects, especially in the presence of the variant at risk for IRGM (p = 0.045). Infection of MDM from MC patients by AIEC bacteria induces a pro-inflammatory cytokine secretion pattern. The second part of this work aimed to compare the performance of faecal chitinase 3-like 1 (CHI3L1), a host protein interacting with AIEC virulence factor, and matrix metalloprotease 9 (MMP-9). to detect the endoscopic inflammatory activity of MC in comparison with the standard fecal marker, calprotectin. Fecal CHI3L1, MMP-9 and calprotectin levels were correlated with Crohn's Disease Endoscopic Index of Severity (CDEIS) and were significantly increased in the presence of endoscopic ulcerations. In case of pure ileal involvement, fecal CHI3L1 seemed better correlated with CDEIS than fecal calprotectin. The fecal CHI3L1 threshold of 15 ng / g showed better performance than faecal calprotectin in detecting the presence of endoscopic ulcerations. MMP-9 was a powerful marker for detecting the presence of endoscopic lesions in IBD. In conclusion, we have shown that there is a macrophage defect to control infection by AIEC bacteria in patients with CD related to atopic risk variants involved in autophagy leading to a pro-inflammatory macrophage phenotype . Fecal CHI3L1, known as a host protein interacting with AIEC virulence factor, as well as MMP-9 appear to be good markers of endoscopic activity in IBD

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Costa, Lionel. "Facteur de transcription USF1 et systèmes de réparation des dommages à l'ADN au cours de la réponse de l'hôte à l'infection par Helicobacter pylori." Thesis, Sorbonne Paris Cité, 2017. http://www.theses.fr/2017USPCC150/document.

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Abstract:

Helicobacter pylori est un pathogène gastrique qui infecte 50% de la population mondiale. Actuellement, H. pylori est la seule bactérie reconnue comme agent carcinogène de classe I et représente le facteur de risque majeur dans le développement du cancer gastrique. L’activité génotoxique de H. pylori joue un rôle essentiel dans la promotion de la cancérogenèse gastrique. De plus, H. pylori favorise la dégradation protéasomale de p53, un régulateur central de la réponse aux dommages de l'ADN. H. pylori induit aussi une hyperméthylation de l'ADN dans la région promotrice des gènes codant pour les facteurs de transcription «upstream stimulating factors», USF1 et USF2, inhibant ainsi leur expression. USF1 régule les niveaux de p53 et des composants du système de réparation des lésions à l'ADN par excision de nucléotides (NER). De plus, en réponse à un stress génotoxique USF1 se fixe à la protéine p53, et inhibe sa dégradation protéasomale. Mon projet de thèse est ciblé sur l’analyse des mécanismes à l’origine de la relation entre l’infection par H. pylori et le développement du cancer gastrique. Il vise à étudier les conséquences de la déplétion du facteur USF1 au cours de l’infection par H. pylori, i) sur la protéine p53 et ses isoformes ainsi que sur la réponse aux dommages à l’ADN et leur réparation, ii) sur le processus de cancérogenèse gastrique. Des approches complémentaires in vitro sur cellules épithéliales gastriques ainsi que dans le modèle souris USF1-/- ont été développées. Mes résultats montrent une diminution concomitante des niveaux nucléaires de USF1 et p53, ainsi qu’une délocalisation cytoplasmique de USF1 dans les cellules infectées par H. pylori. Cette dérégulation s’accompagne d’une inhibition de l’expression des gènes cibles de USF1 et de p53 impliqués dans la réponse aux dommages de l’ADN et leur réparation. Des expériences de « Proximity Ligation Assay » (PLA) montrent que H. pylori altère la réponse des cellules à un stress génotoxique en inhibant l’intéraction USF1-p53 dans les noyaux suite à un traitement à la campthotécine. H. pylori aussi induit la transcription d’isoformes de p53. Mes résultats démontrent que USF1 serait un régulateur transcriptionnel négatif de l’expression de ces isoformes. In vivo, l’absence de USF1 dans les souris USF1-/- exacerbe l’inflammation et accélère la sévérité des lésions gastriques avec la présence de dysplasies dès 9 mois d’infection. Ces résultats sont en accord avec les faibles niveaux d’expression de USF1 observés chez des patients atteints de cancer gastrique et associés à un plus mauvais pronostic. En conclusion, les résultats obtenus montrent le rôle essentiel joué par USF1 au cours de l’infection par H. pylori, dans le maintien du suppresseur de tumeur p53 et de la stabilité génétique des cellules de l’hôte. Ils confirment USF1 dans sa fonction de suppresseur tumoral. Ainsi la réalisation de ce projet met en évidence non seulement une nouvelle stratégie de H. pylori favorisant la cancérogenèse gastrique, mais peut aussi avoir des retombées en clinique faisant de USF1 un candidat biomarqueur potentiel du cancer gastrique
Helicobacter pylori is a gastric pathogen that infects 50% of the worlds population. H. pylori is the only bacterium known to be a class 1 carcinogenic agent, and represents the major risk factor in the development of gastric cancer. The genotoxic activity of H. pylori plays an essential role in the promotion of gastric cancer. Furthermore, H. pylori favours the proteasomal degradation of p53, a central regulator of the DNA damage response. H. pylori induces DNA hypermethylation in the promoter region of two genes encoding transcription factors, Upstream Stimulating Factors USF1 and USF2, inhibiting their expression. USF1 regulates the level of p53 and the components of the nucleotide excision DNA repair (NER) system. Moreover, in response to genotoxic stress, USF1 binds to p53 and inhibits its proteasomal degradation. My thesis project aims to elucidate the mechanisms leading to the development of gastric cancer due to H. pylori infection. This work will address the consequences of USF1 depletion during this infection, focusing on the impact on i) p53, its isoforms, and the DNA damage and repair response, and ii) the gastric carcinogenesis process. To facilitate this investigation, I have developed complementary approaches, using epithelial gastric cells for in vitro studies, and a USF1-/- mouse model for in vivo analyses. My results show a concomitant decrease in the nuclear levels of USF1 and p53, combined with a cytoplasmic delocalisation of USF1 in cells infected by H. pylori. This deregulation is accompanied by the inhibited expression of genes targeted by USF1 and p53, implicated in the DNA damage and repair response. Proximity Ligation Assay (PLA) experiments show that H. pylori alters the response of cells to genotoxic stress by inhibiting the interaction between USF1 and p53 in the nucleus following treatment with camptothecin. In parallel, H. pylori also induces the transcription of p53 isoforms. My results suggest that USF1 is a negative transcriptional regulator of the expression of these isoforms. In vivo, the absence of USF1 in USF1-/- mice exacerbates inflammation and accelerates the severity of the gastric lesions, leading to the presence of dysplasia at 9 months post-infection. These results are in agreement with the weak USF1 expression levels observed in patients with gastric cancer, which is associated with worse prognoses. In conclusion, the results obtained show the essential role played by USF1 during H. pylori infection, in the maintenance of the tumour suppressor p53 and the genetic stability of host cells. They confirm USF1 as a tumour suppressor. Finally, these findings describe not only the novel strategy by which H. pylori infection favours gastric cancerogenesis, but could also be of clinical significance, as USF1 is promising as a candidate biomarker of gastric cancer

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Chassagne, Jean. "Mieux comprendre, étudier et prendre en charge la consommation de cannabis : apports méthodologiques et facteurs de risques." Electronic Thesis or Diss., Toulouse 2, 2023. https://dante.univ-tlse2.fr/s/fr/item/35793.

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Abstract:

Le cannabis est la substance psychoactive la plus couramment utilisée par les étudiants en Europe et aux États-Unis. Associée à divers troubles psychopathologiques, la nature et l'intensité de ces interactions restent toutefois discutées. Dans un contexte où de nombreux pays se positionnent en faveur de sa légalisation, nous devons disposer d’outils et de connaissances adéquates pour mieux appréhender ses effets psychologiques. La littérature actuelle reste pourtant souvent limitée à la fréquence de consommation ou au trouble d'usage problématique du cannabis (UPC), défini selon ses critères diagnostiques. Nous avons donc étudié un plus large éventail de variables pour mieux saisir le lien entre l’usage et les psychopathologies. Une attention a aussi été portée à la méthodologie, en s'interrogeant sur les manières d’obtenir des données les plus fiables possibles. Chacune de nos trois études visait ainsi à répondre à une question ou combler un manque identifié lors de nos recherches préliminaires. Pour définir de nouvelles variables d’intérêt, la première étude a examiné l'influence du contexte de consommation sur la prévalence des symptômes d’UPC et dépressifs, et la seconde l’influence des formes, méthodes et moments d’ingestion sur la prévalence des symptômes d’UPC, dépressifs et anxieux. Sur le plan méthodologique, la troisième étude a exploré le lien entre les biais d'auto-duperie (inconscients, pour protéger l'estime de soi) et les biais d’hétéro-duperie (délibérés, pour donner une impression favorable) par rapport à la consommation de cannabis auto-déclarée. Au travers de ce travail, nous cherchons à éclairer la complexité du rapport entre la consommation de cannabis et différentes psychopathologies, en mettant en évidence des nuances et des biais souvent négligés. L'objectif est de fournir des perspectives méthodologiques plus exhaustives et fiables, afin de contribuer à l’amélioration et la spécification des programmes de prévention et de prise en charge
Cannabis is the most commonly used psychoactive substance among students in Europe and the United States. While associated with various psychopathological disorders, the nature and intensity of these interactions remain debated. While many countries are leaning towards its legalization (for either medical or recreational purposes), it's crucial to have the proper tools and knowledge to understand its psychological effects. However, current literature often focuses narrowly on consumption frequency or cannabis use disorders (CUD), as defined by its diagnostic criteria, underscoring the need for broader exploration. Therefore, we studied a wider range of variables to better understand the relationship between cannabis use and psychopathologies. Emphasis was also placed on methodology, considering ways to obtain the most reliable data. Each of our three studies aimed to address a question or fill a gap identified in our preliminary research. To identify new relevant variables, the first study examined how consumption context, primarily smoking mostly alone, affects the prevalence of CUD and depressive symptoms. The second looked into the influence of consumption forms, methods and timings of use on the prevalence of CUD, depressive, and anxiety symptoms. Concerning the method, the third study investigated the link between self-deception biases (unconscious response distortion to protect self-esteem) and other-deception biases (deliberate response distortion to present oneself favorably) in relation to self-reported cannabis consumption. Through this work, we seek to shed light on the intricate relationship between cannabis use and various psychopathologies, highlighting often overlooked nuances and biases. Our goal is to provide more exhaustive and reliable methodological perspectives, in order to contribute to the improvement and specification of prevention and intervention programs

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Pinard, Fabrice. "Le mildiou des mils pénicillaires (Pennisetum americanum (L. ) Leeke) dû à Sclerospora graminicola (Sacc. ) Schroet : éléments de biologie : étiologie de l'infection, facteurs de résistance foliaire de l'hôte, étude in vitro de la virescence." Paris 11, 1989. http://www.theses.fr/1989PA112211.

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Abstract:

La dissémination des spores asexuées de S. Graminicola est à l'origine de l'extension épidémique de la maladie. L'étude de différents sites sur la plante montre que le cône verticillaire à l'apex des tiges est le lieu privilégié où le parasite pénètre dans la plante. Celui-ci se développe ensuite dans les différents organes où il ne colonise que les tissus faiblement différenciés. Un méristème infecté alors qu'il est en phase de fonctionnement végétatif y demeure, alors qu'un méristème contaminé pendant la phase de différenciation des fleurs évolue vers une inflorescence virescente. Cette inflorescence placée en conditions de culture in vitro, montre des phénomènes de dédifférenciation et de réversion des boutons floraux vers des organes végétatifs. Après traitement curatif, la régénération complète de mils sains et fertiles est obtenue d'autant plus facilement que l'inflorescence est de grande taille. Le développement du parasite est arrêté dans les tissus foliaires matures de cultivars résistants. Ceux-ci manifestent une réaction hypersensible qui se traduit par la nécrose des cellules au point de pénétration du parasite et par l'accumulation de callose sur les hyphes intracellulaires dans l'épiderme et sur les haustoria. Ces mécanismes sont d'autant plus efficaces et précoces que le cultivar est résistant et leur expression est modulée selon la concentration en inoculum utilisée. Par ailleurs, ils sont fortement atténués dans les tissus foliaires immatures.

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Pérès, Karine. "Approche épidémiologique du processus d'évolution vers l'incapacité chez le sujet âgé : description et déterminants." Bordeaux 2, 2003. http://www.theses.fr/2003BOR21079.

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Le vieillissment de la population française pose des problèmes de prise en charge des conséquences des maladies chroniques démesurées en terme d'incapacité. L'objectif de cette thèse était de décrire l'́atteinte des différents domaines de l'incapacité chez les sujets âgés, son évolution en terme de progression, de régression ou de décès et ses déterminants. Les données proviennent de la cohorte PAQUID, qui a suivi un échantillon de 3777 sujets âgés de 65 ans et plus, et de l'étude des Trois Cités. Des modèles de Markov multi-états ont été utilisés pour produire des estimations d'espérances de vie sans incapacité et pour étudier le rôle des maladies (démence, diabète, dyspnée, obésité), mais aussi de facteurs individuels et environnementaux (sexe, éducation, dépression, prise en charge médico-sociale), sur le processus d'évolution vers l'incapacité. Enfin, une importante diminution de la prévalence de l'incapacité a été observée en l'espace de dix ans entre deux générations de sujets âgés
The ageing of the French population raises the problem of the management of the consequences of chronic diseases, expressed in terms of disability. The objective of this dissertation was to describe the different domains of disability affected in elderly people, the evolution of the disablement process in terms of progression, regression or death, and its determinants. The analyses were conducted on the PAQUID cohort, where 3777 subjects aged 65 years and over were followed-up and the Three-City study. Multi-state Markov models were used to estimate disability-free life expectancies and to study the role of diseases (dementia, diabetes, dyspnoea, obesity), but also that of individual and environmental factors (sex, education, depression, medi-social care) on the disablement process. Finally, an important decline of the prevalence of disability was observed over ten years between two generations of elderly people

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Muller, Mandy. "Comparative mapping of E2-host interactions unravels new roles of E2 in human papillomavirus-induced pathogenesis." Paris 7, 2013. http://www.theses.fr/2013PA077137.

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Les HPV sont les agents d'infections latentes, d'hyperplasies bénignes ou encore de cancer. Afin de mieux comprendre leur pathogenèse, nous avons cartographié les réseaux d'interactions de protéines de régulation virale E2 pour 12 génotypes HPV. Par double hybride, nous avons procédé à l'identification des interacteurs des protéines E2 suivi par une validation en cellule de mammifère par une méthode basée sur la reconstitution d'une luciferase. Le regroupement des profils d'interaction montre une corrélation avec la phylogénie, étabissant ainsi la contribution de E2 dans la pathogénie associée aux HPV. L'étude des réseaux d'interaction a révélé le ciblage préférentiel de protéines cellulaires hautement conncectées, impliquées dans 5 catégories fonctionnelles récapitulant les principales fonctions de E2 mais aussi ouvrant de nouvelles perspectives quant au rôle de E2 de cette protéine virale dans les mécanismes d'infection. Dans un deuxième temps, ce travail s'est focalisé sur l'étude d'une interaction impliquant spécifiquement la protéine E2 d'HPV16, le virus le plus représenté dans les cancers cervicaux, et une protéine cellulaire, CCHCR1. En identifiant la surface d'interaction de CCHCR1 sur E2, il s'est avéré qu'elle induisait une compétition avec BRD4, un interacteur majeur de E2, se traduisant par une diminution des capacités transcriptionnelles de E2. De même, nous avons montré que CCHCR1 induisait la délocalisation de E2 du noyau vers le cytoplasme. Enfin, nos résultats indiquent qu'en présence de CCHCR1, HPV16 E2 est moins apte à induire la différentiation précoce des kératinocytes, ce qui pourrait potentiellement avoir un effet important sur le cycle viral
HPV are associated with latent infections, benign hyperplasia or even cancer. To better understand HPV pathogenesis, we comparatively mapped the interaction networks of the regulatory protein E2 from 12 HPV genotypes. By yeast two-hybrid, we identified E2's potential interactors. This was followed by a validation sep in mammalian cells by a method based on luciferase complementation. Clustering of interaction profiles showed a correlation with HPV phylogeny, demonstrating E2's contribution to the HPV-associated pathogenesis. Analysis of E2's interaction network revealed a preferential targeting of cellular hub proteins involved in 5 main functional families, reflecting E2's primary functions but also unraveling potential new roles of E2 in viral infection. The second part of this work was dedicated to the study of a specific interaction between E2 from HPV16, the most represented HPV in cervical cancer, and a cellular protein, CCHCR1. We showed that CCHCR1 interferes with the binding of BRD4 to E2, resulting in a decrease in E2-dependent transcription. CCHCR1 also induces a relocalization of E2 into the cytoplasm instead of the nucleus. Finally, our results indicate that in presence of CCHR1, E2 is a less potent activator of keratinocyte differentiation, which could potentially impact the HPV life cycle

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Maneuvrier, Hervieu Arthur. "Le sentiment de présence en réalité virtuelle : rôle modérateur des facteurs humains sur la performance." Thesis, Normandie, 2020. http://www.theses.fr/2020NORMC035.

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Abstract:

La réalité virtuelle s’est imposée comme un nouveau paradigme de la recherche et des applications scientifiques. La capacité de cette technologie à simuler des situations complexes sur mesure offre aux chercheurs la possibilité d’étudier des comportements possédant contrôle méthodologique et dimension écologique. Cette dernière est rendue possible par l’émergence du sentiment de présence, la sensation « d’être là », phénomène au cœur des études in virtuo. Le présent travail s’inscrit dans un cadre méthodologique et fondamental visant à faire avancer l’émergence d’un corps de connaissances sur la réalité virtuelle et son sentiment de présence. En effet, la compréhension globale de ce dernier demeure très limitée, notamment au regard de ses liens avec la performance en réalité virtuelle. Que ce soit dans un but de diagnostic ou d’investigation du comportement humain, la question de la relation entre sentiment de présence et performance est pourtant cruciale : si la présence favorise la performance, par exemple la performance à un test neuropsychologique, celle-ci devient un biais systématique inhérent à l’outil qu’il est nécessaire de contrôler pour toute expérimentation rigoureuse. Si cette question demeure peu étudiée dans la littérature c’est parce qu’elle est largement complexifiée par les interactions entre tout un ensemble de variables adjacentes – genre, cybermalaises, style cognitif, expérience des jeux vidéo –, mais aussi parce que la performance peut prendre des myriades de formes différentes et qu’il est ainsi particulièrement ardu d’inférer une causalité directionnelle. Afin d’explorer cette question, le présent travail propose trois expérimentations sur trois différents types d’évaluation : fonctions exécutives, cognition spatiale, apprentissage sémantique. Les données ainsi recueillies font également l’objet d’analyses transversales destinées à comparer les expérimentations. Ensemble, ces résultats semblent distinguer l’existence de deux composants de la réalité virtuelle. Le premier, le profil cognitif, est constitué par les facteurs humains individuels interagissant avec les facteurs systèmes – notamment le degré d’intégration de la tâche – pour moduler le deuxième, l’expérience utilisateur. De cette expérience utilisateur dépendent le sentiment de présence, la performance, mais aussi leur relation. Ce modèle, présenté en conclusion, est discuté au regard d’approches théoriques différentes de la cognition et permet de dresser une liste de recommandations et de perspectives pour les utilisateurs de la réalité virtuelle, notamment les possibilités d’estimer a priori l’expérience utilisateur d’un individu
Virtual reality has emerged as a new paradigm for research and scientific applications. The ability of this technology to simulate complex custom-made situations offers researchers the opportunity to study behaviours with a laboratory methodological control and an ecological dimensions. The latter is made possible by the emergence of the feeling (or “sense”) of presence, the sensation of "being there", a phenomenon at the heart of in virtuo studies. The present work is part of a meth-odological and fundamental framework aimed at advancing the emergence of a body of knowledge on virtual reality and its sense of presence. The global understanding of the sense of presence remains very limited, especially with regard to its links with performance in virtual reality. Whether it is for diagnostic purposes or for the investigation of human behaviour, the question of the relationship between the sense of presence and performance is crucial: if presence promotes performance, for example by increasing scores during a neuropsychological test, it becomes a systematic bias inherent to the tool that must be controlled in any rigorous experiment. This ques-tion remains little studied in the literature, mostly because it is complexified by the interactions between a whole set of adjacent variables – gender, cybersickness, cognitive style, video game experience – but also because performance can take many different forms, making it particularly difficult to infer directional causality. In order to explore this question, the present work proposes three experiments on three different types of evaluation: executive functions, spatial cognition, semantic learning. The data collected in this way is also the object of transversal analyses de-signed to compare the experiments. Together, these results seem to suggest the existence of two components of virtual reality. The first, the cognitive profile, is made up of individual human factors interacting with system factors – notably the degree of integration of the task into the virtual envi-ronment – to build the second, the user experience. The sense of presence and performance, but also their relationship depends on the user experience. This model, presented in conclusion, is discussed with regard to different theoretical approaches to cognition, notably the ecological and computational theories. This discussion makes it possible to draw up a list of recommendations and perspectives for virtual reality users, including the possibilities of estimating a priori the user experience of an individual immersed in virtual reality

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Laurens, Élodie. "Internet : de l'usage à l'addiction : étude des facteurs de risque et des différentes modalités d'utilisation selon le genre." Thesis, Aix-Marseille 1, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX10080.

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Abstract:

Cette recherche de thèse porte sur les liens entre addiction à internet, facteurs prédisposant, et modalités d’utilisation d’internet. Sur la base d’une approche transactionnelle du stress, elle a pour objectif d’étudier la question de la gestion des émotions dans le rapport addictif des participants à ce média, ainsi que les liens entre l’addiction à internet et les différentes modalités d’utilisation d’internet selon le genre. Avec une approche quantitative, nos hypothèses visent tout d’abord à mettre en évidence que l’alexithymie, l’anhédonie, l’empathie, la dépression et anxiété, certains styles de coping, le stress, et les stresseurs sont des facteurs prédictifs de l’addiction à internet ; mais également que certaines modalités d’utilisation d’internet sont plus particulièrement associées à un usage addictif, et ce, différemment selon le genre. Dans une approche plus qualitative (approche des mondes lexicaux), nous étudierons ensuite les représentations que les sujets ont d’internet et du virtuel, selon qu’ils soient addictés à internet, non addictés, ou usagers à risque. La population étudiée est représentée par deux échantillons d’étudiants en première année d’université: un premier échantillon de 244 sujets (m=24.09 ans), et un second échantillon de 515 sujets (m=20 ans).Nos résultats montrent d’une part que l’alexithymie, l’empathie, la dépression, le coping « évitement avec pensée positive » et « autoaccusation », et le stress, sont des facteurs prédictifs de l’addiction à internet ; et d’autre part que si le chat, les sites sociaux, et le webmastering sont plus spécifiquement associés à l’addiction à internet, ces modalités d’utilisation diffèrent selon le genre
The current study examines the association between internet addiction, predictive factors, and types of internet activities. Adopting transactional stress theory, our objectives are to study the question of emotions management in the participants’ addictive relationship to Internet, as well as links between internet addiction and the various modalities of internet use according to gender. With a quantitative approach, hypothesis aim first of all at bringing to light that alexithymia, anhédonia, empathy, depression and anxiety, some of coping styles, stress, and stressors are predictive factors of internet addiction ; but either than some of the internet use modalities are more particularly associated with an addictif usage, and this, differently according to gender. In a more qualitative approach (approach of the lexical worlds), we shall study then the subjects’ representations of internet and virtual, as they are internet addicts, non addicts, or potential addicts. The studied population is represented by two first-year university students' samples: the first sample is represented by 244 students (m=24.09 years old), and the second by 515 students (m=20 years old).Results support on one hand that alexithymia, empathy, depression, avoidant coping styles, and stress, are predictive factors of internet addiction ; and on the other hand that if chatting, networking sites, and webmastering are more specifically associated to the internet addiction, these modalities of use differ according to the gender

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Larrieu, Sophie. "Comportements alimentaires, statut nutritionnel et état de santé des personnes agées : de l'expérience acquise dans PAQUID à la mise en place d'une étude nutritionnelle dans 3C." Bordeaux 2, 2004. http://www.theses.fr/2004BOR21163.

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Abstract:

Les objectifs de cette thèse étaient de décrire les comportements alimentaires des personnes âgées de 65 ans et plus, et d'étudier les associations entre ces comportements alimentaires, le statut nutritionnel, et l'état de santé. Les données proviennent de deux études longitudinales : PAQUID, cohorte prospective de 3777 sujets de 65 ans et plus vivant en Gironde et en Dordogne, et l'étude des 3 Cités, constituée de 9294 sujets recrutés à Bordeaux, Dijon et Montpellier. Les résultats montrent que les habitudes alimentaires sont influencées par de nombreux facteurs sociodémographiques et sont associées à l'état de santé et à son évolution. L'ensemble de ces travaux confirme que des habitudes alimentaires saines et le maintien d'un statut nutritionnel normal peuvent aider à conserver une bonne qualité de vie chez les personnes âgées
The aims of this work were to describe dietary habits of elderly people according to sociodemographic factors, and to investigate the relationships between these habits, nutritional status and health parameters. The data come from two longitudinal cohorts : PAQUID, a prospective cohort of 3777 community dwellers aged 65 and over ; and the 3 city study, composed of 9294 subjects recruited in Bordeaux, Dijon and Montpellier. Dietary habits are influenced by several sociodemographic factors and were highly associated with health status and its evolution. This work confirms that having healthy nutritional habits and maintaining a BMI in the normal range could help to increase quality of life in ageing, and suggest the necessity of a nutritional follow-up of subjects at high risk of poor dietary habits

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Aouridi, Laoridi. "La relation d'aide : d'une typologie à l'analyse des facteurs psychopathologiques modulant la prise en soins du sujet "fragile" à domicile." Thesis, Montpellier 3, 2013. http://www.theses.fr/2013MON30103/document.

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Abstract:

Cette thèse a pour objectif d’éprouver la mise en actes du dispositif de prise en soins dans la relation d’aides ausujet fragile à domicile. Ce travail est envisagé par une étude multidimensionnelle des caractéristiquespsychologiques liées à l’acte d'aide à domicile et celles de leurs conséquences en termes de psychopathologies etde qualité de vie. Selon les données de notre étude, le profil du dispositif de prendre soin à domicile s’ancre dansun axe très médicalisé. Un axe qui va à l’encontre des besoins et attentes des sujets fragiles comme de leursaidants qui soulignent une nécessité fondamentale de lien social. Parallèlement, nous constatons que lesdispositifs de prendre soins à domicile, aujourd'hui mis en place, ne sont pas de « vraies réponses » et restentencore largement sous-utilisés. L’Aidant-Expert n’est pas soutenu dans la construction de ses proprescompétences à savoir-faire et savoir-être. Il est dans l’incapacité de venir dire quelque chose de sa réalité du vécude l’aide ou de souligner la complexité des situations de prise en soins investies. Les résultats de ces travauxsoulignent, par ailleurs, un risque élevé d’accidents à domicile renforçant un sentiment de vigilance extrême. Cesdonnées vont dans le sens de l’analyse plus fine des réels besoins et attentes des acteurs de l’aide. In fine, cettethèse permet de mettre en exergue des recommandations à envisager pour une prise en soins adaptée du sujetfragile et de son entourage à domicile. En effet, la prise en considération de l’expérience collective del’environnement d’exercice de l’aide permettra de venir contrebalancer les effets délétères de cette prise en soinspermettant alors une mise en actes au plus juste du dispositif à domicile
Our work aims at enhancing the quality of home caregiving for vulnerable patients. This objective is assessedvia a multidimensional study evaluating psychological characteristics of home caregiving, and also theconsequences of these acts on mental health and quality of life.Our data show that the structure of home caregiving is mainly of medical significance. A significance thatresponds to expectations of patients and their caregivers, and also the social interactions between both caregivingactors. We hence conclude that the actual structure of home caregiving does not refers to “right answers” andstill widely underused. Furthermore, the expert caregivers are likely to lack structuring of their competencies, asrelated to their know-how and life skills. These professionals show great difficulties expressing 1) the nature oftheir professional experience and 2) the complexity of some of their tasks. Another finding of our work is relatedto a high risk of home accidents which induces an important level of alertness. This outcome fits with a detailedanalysis of caregivers’ needs. Finally, our work highlights some recommendations for a better home caregivingfor vulnerable populations and their families. It seems that taking into account the collective experience of thecaregiving environment would address the deleterious effects of home caregiving, which may enhance thequality and efficiency of such intervention

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Deschamps, Valérie. "Le statut nutritionnel et les comportements alimentaires de la personne âgée et ses relations avec l'état de santé : bilan et perspectives de l'enquête PAQUID." Bordeaux 2, 2001. http://www.theses.fr/2001BOR28876.

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Abstract:

L'alimentation est un facteur environnemental majeur qui conditionne l'état de santé de la personne tout àu long de sa vie. Le stress oxydatif impliqué dans le vieillissement pourrait être modifié par certains aliments anti-oxydants. Objectif : décrire le comportement alimentaire des personnes âgées et étudier la liaison entre l'alimentation, l'évolution des performances cognitives et le risque de survenue ultérieure d'une démence, ainsi qu'avec le risque de dépendance et de mortalité. Méthodes : Le statut nutritionnel a été investigué par l'IMC, des valeurs biologiques HDL-cholesterol, vitamiines E, A et MDA, au sein de la cohorte PAQUID. Une enquête nutritionnelle détaillée et un fréquentiel abrégé ont été réalisés. Les sujets ont été suivis entre 2 et 8 ans. Résultats : Les comportements alimentaires et le statut nutritionnel des personnes âgées varient selon le sexe, l'âge, le niveau d'étude, le statut marital et les notions d'appétit et de plaisir de manger. Des "aliments plaisir" (café, thé, chocolat, fruits secs) marquent l'importance de la dimension sociale de l'alimentation de par leur association avec un meilleur état de santé du moment et une prédiction de persistance de l'autonomie à 5 ans. La consommation d'au moins un plat de poisson par semaine est associée à un risque moindre de survenue de démence 7 ans après mais également de mortalité. Les sujets qui présentent des niveaux bas de vitamine E et A et des niveaux élevés de MDA ont un risque accru de développer une démence. Un taux de HDL-cholesterol élevé est associé à un moindre risque de démence. Ces résultats confortent la théorie du stress oxydatif dans le vieillissement cérébral. Nos résultats sont en faveur d'une relation causale de la démence sur la perte de poids. Conclusion : Des interventions nutritionnelles et d'éducation pour la santé pourraient être proposées à des personnes à risque identifiées sur la base de facteurs nutritionnels, psychosociaux et peut-être génétiques
Diet is a major environmental factor, which conditions health of the person throughout her life. Certain nutrients could modify oxidative stress implied in ageing. Objective : To describe the nutritional behavior of the old people, to give a progress report on the factors of risk can generate a food imbalance in this population and thereafter to study relation between diet and evolution of the cognitive performances and the risk of dementia, disability and mortality. Methods : Data provided from PAQUID study. BMI and biological parameters like blood cholesterol, plasmatic vitamins E, A and MDA was used to asses nutritional status. A 3 days record questionnaire and a brief food frequency questionnaire were also used. Subjects were followed between 2 and 8 years. Results : The nutritional behaviors and the nutritional status of the old people vary according to sex, education level, marital statute, appetite and pleasure of eating. The "Food pleasure" (as coffee, tea, chocolate of fruits dry) marks the social aspect of diet because they were associated with a better health at the moment. This relation persists with disability 5 years later. Consumers of tea had better cognitive performances. People who eat fish or seafood at least once a week had a significant decrease of the risk becoming demented or died in the 7 subsequent years. Subjects with low plasmatic level of vitamin E and vitamin A and those with high levels of MDA had an increased risk to develop a dementia. A low HDL-cholesterol rate was associated with a decreased risk of dementia. Our results are in agreement with the theory of oxidative stress in cerebral ageing. This work showed that weight loss could be a consequence of Alzheimer disease process. Conclusion : Diet had an important social role and also can provide anti-oxidant nutrients. Nutritional education and health program seem to be target on high-risk population in terms of nutritional, psychosocial and perhaps genetic factors

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Rossat, Arnaud. "Politique de prévention des chutes chez les plus de 65 ans : ciblage de la population, efficacité et efficience des interventions et contribution spécifique des Centres d’Examen de Santé de l’Assurance Maladie (C.E.S.)." Thesis, Lyon 1, 2010. http://www.theses.fr/2010LYO10218/document.

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Abstract:

Le vieillissement de la population nécessite une politique de prévention des chutes efficace chez les personnes âgées. Les chutes ont des conséquences importantes aussi bien en termes de baisse de qualité de vie et de perte d’autonomie, que financiers, occasionnés par leurs soins et leur prise en charge. Cependant, la complexité du mécanisme de la chute et son caractère multifactoriel, rendent le diagnostic et l’évaluation du risque de chute encore difficile, notamment parmi la population des personnes dites « en bonne santé ». Conjointement, bien que les programmes multi-interventionnels commencent à montrer leur efficacité, ces derniers restent peu, sinon mal, évalués. Par ailleurs, la mise en place d’une politique de prévention adaptée et efficace, doit être centrée sur la qualité du soin et la satisfaction du patient. Celles-ci nécessitent le passage vers un mode d’organisation du travail coopératif, en réseau. Toutefois, ce changement conduit à des modifications dans les pratiques et identités professionnelles. Cette thèse a pour objectif d’étudier les conditions de réussite d’une action de prévention, structurée et coordonnée, en santé publique. Nous présentons et proposons tout d’abord les conditions et outils permettant une homogénéisation et une standardisation des pratiques incontournables pour la mutualisation des efforts individuels et permettre ainsi une plus grande efficacité. Nous étudions également les impacts d’une telle intervention, en termes financiers et de risque de chute. Nous analysons ensuite comment conduire le changement pour permettre une évolution et une adaptation des mentalités mais aussi des modes d’organisation de l’activité
The prevention of falls amongst the elderly population is a major public health concern. Since the elderly live longer and longer, it is crucial to think of efficient measures in order to prevent such falls. Falls amongst the elderly can have dramatic consequences such as a decrease in quality of life, a loss of autonomy as will cause financial difficulty due to high cost of rehabilitation. However, depending upon the complexity of the fall and its multiple determinants, diagnosing and evaluating the risk of a fall remains complicated, particularly amongst those in "good health". While multi interventional programs may exist such as equilibrium coordination and muscular reinforcement, these programs are rarely proved to be efficient in fall prevention. An adapted and efficient method of prevention must be centered on quality and satisfaction of the patient in the offered care. Such method would imply replacement of an older organization with a system defined in a network activity. However, this method would go hand in hand with the modifications in professional practices and identities. In this thesis I will examine the success rate to implement a structured method of health care prevention against falls. To achieve this prevention, we must first present the necessary conditions and tools which will homogenize and standardize these success rates. Next, I will analyze the characteristics of current methods to prevent falls in order to modernize and rationalize the process. In order to be successful, this process needs to be targeted towards a network strategy

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Saillant, Vincent. "Comprendre le mécanisme du système senseur d’hème des bactéries pathogènes, une cible antibiotique innovante A novel Enterococcus faecalis heme transport regulator (FhtR) is a heme sensor in the gastrointestinal tract." Thesis, université Paris-Saclay, 2020. http://www.theses.fr/2020UPASB023.

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Abstract:

L’hème, une structure porphyrique contenant un atome de fer, est un cofacteur essentiel à de nombreuses fonctions bactériennes. Cependant, le fer de l’hème génère des radicaux libres, ce qui explique sa toxicité. Un des mécanismes principaux de détoxification de l’hème est l’expression, par les bactéries à Gram positif, d’un transporteur d’efflux de la famille ABC, HrtBA. La régulation de ce transporteur a été étudiée chez deux bactéries pathogènes opportunistes Enterococcus faecalis et Staphylococcus aureus, responsables d’infection nosocomiales multirésistantes. Chez E. faecalis, un nouveau régulateur de la famille TetR, FhtR, a été identifié et caractérisé. L’inhibition de la transcription de hrtBA par FhtR est levée par sa liaison à l’hème. FhtR a aussi un impact important sur l’activité de la catalase à hème, KatA. FhtR a donc un rôle majeur dans l’homéostasie intracellulaire de l’hème. Dans un modèle de transit intestinal chez la souris, HrtBA est induit, suggérant que ce mécanisme est important pour E. faecalis, une bactérie commensale de l’intestin, dans cet environnement. Chez S. aureus, la transcription de hrtBA est régulée par un système à deux composants HssRS. L’étude du mécanisme du senseur membranaire HssS a révélé que la partie cytoplasmique de l’histidine kinase était impliquée dans la liaison et la transduction du signal hème pour l’expression de HrtBA. L’ensemble de ces résultats démontrent que, bien que HrtBA soit conservée, plusieurs systèmes distincts régulent son expression, suggérant une adaptation complexe de la réponse bactérienne à l’hème de l’hôte et son importance dans la relation hôte-pathogène. Bloquer HrtBA ou la transduction du signal hème par ces deux senseurs d’hème pourrait constituer une cible pour la recherche antibiotique chez ces deux pathogènes
Heme, a porphyrin containing an iron atom, is an essential cofactor of several bacterial functions. Heme is also toxic because of the reactivity of the iron generating reactive oxygen species. One of the main mechanisms of heme detoxification, in Gram-positive bacteria, relies on the expression of a heme efflux ABC transporter, HrtBA. The regulation of this transporter has been investigated in two opportunistic pathogens, Enterococcus faecalis and Staphylococcus aureus, two bacteria responsible for multiresistant nosocomial infections. In E. faecalis, a new TetR family regulator, FhtR, has been identified and characterized. The FhtR dependent transcriptional inhibition of hrtBA is lifted by its binding to heme. FhtR controls the intracellular heme pools as showed par the activity of the endogenous heme dependent catalase, KatA. FhtR is thus a master regulator of heme intracellular homeostasis in E. faecalis. In a mouse model of intestinal transit, HrtBA is expressed, demonstrating the relevance of this system in the gastrointestinal tract where E. faecalis is a commensal resident. In S. aureus, hrtBA transcription is controled by the two-component system, HssRS. The study of the mechanism of the membrane heme sensor HssS showed that the intracytoplasmic of the histidine kinase was responsible of the binding and heme signal transduction for HrtBA expression. Alltogether, these results demonstrate that while HrtBA is conserved among Gram positive bacteria, the regulating mechanisms leading to its expression are varied. This suggests that the host heme response is dependent of the bacteria lifestyle and underlies the importance of this cofactor in the host-pathogen relationship. Inhibiting heme effux by HrtBA or the heme sensing mechanisms could lead to new antibiotic strategies

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Leroy, Caroline. "Le pacte d'actionnaires dans l'environnement sociétaire." Phd thesis, Université Paris-Est, 2010. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00675666.

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Abstract:

Le pacte d'actionnaires se place dans une forme de dépendance unilatérale au contrat de société qui n'est pas sans rappeler le rapport juridique d'accessoire à principal.En effet, s'il est fondamentalement distinct du contrat de société qu'il complète, tout pacte conclu par certains actionnaires, en dehors des statuts, afin d'organiser leurs relations interindividuelles d'actionnaires, trouve nécessairement sa matière et puise sa raison d'être dans le pacte social. Ainsi, la dépendance du pacte au contrat de société se manifeste-t-elle, de la manière la plus évidente, par la caducité qu'entraîne pour le pacte l'arrivée du terme du contrat de société ou la perte de la qualité d'actionnaire d'un partenaire.Dès lors, par analogie avec la règle selon laquelle l'accessoire a vocation à suivre le sort du principal, cette dimension d'accessoire du contrat de société justifie que le pacte subisse l'influence du cadre juridique auquel le contrat de société est lui-même soumis, à savoir le droit des sociétés et, en particulier, l'ordre public sociétaire.Cette dépendance au contrat de société, par essence commune à tous les pactes d'actionnaires en raison de leur objet matériel et de leur cause, est à géométrie variable. Elle repose en effet sur divers facteurs de rattachement au contrat de société que sont l'exercice du droit de vote, la détention des actions ou la qualité d'actionnaire des partenaires, lesquels impriment, selon qu'ils s'immiscent plus ou moins profondément dans le fondement, la structure ou encore le fonctionnement de la société, différents degrés de dépendance dans la relation pacte - contrat de société.Malgré l'hétérogénéité du régime des pactes d'actionnaires, il est alors possible de dégager,à l'aune de cette dimension d'accessoire, une tendance fondamentale qui anime, en droit positif, la jurisprudence relative aux pactes. Cette ligne directrice réside dans la variabilité du degré d'emprise des règles qui encadrent le contrat de société sur le régime des pactes d'actionnaires.La jurisprudence se révèle être, en effet, d'une manière générale et par-delà la casuistique, en cohérence avec cette influence proportionnelle de l'environnement sociétaire à l'intensité du degré de dépendance que présente chaque type de pacte en fonction du facteur qui le rattache au contrat de société. Les pactes caractérisés par une dépendance marquée au contrat de société bénéficient ainsi d'une marge de liberté à la mesure de celle dont bénéficie le contrat de société pour l'aménagement de l'exercice du droit de vote ou de la perte de la qualité d'actionnaire. Au contraire, les pactes caractérisés par une dépendance modérée au contrat de société, qui organisent des cessions ou des acquisitions d'actions,sont plus largement libérés des contraintes auxquelles est soumis le contrat de société au regard du principe de libre négociabilité des actions. Quant à l'influence sur les pactes de certains autres principes d'ordre public sociétaire, tels que la prohibition des clauses léonines ou l'expertise de l'article 1843-4 du Code civil, elle demeure incertaine en droit positif. Toutefois, la jurisprudence tend à reconnaître le particularisme de ces règles et à leur retirer, en conséquence, tout caractère impératif en dehors du cadre des relations entretenues collectivement par les actionnaires avec la société.

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Finzi, Andrés. "Étude du trafic intracellulaire de la protéine Gag du VIH-1 : rôle des facteurs de l'hôte." Thèse, 2007. http://hdl.handle.net/1866/15820.

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Filion, Antoine. "L'identité de l'hôte à un effet plus important que les facteurs abiotiques sur la transmission de parasites dans les lacs du Bouclier laurentien." Thèse, 2018. http://depot-e.uqtr.ca/8445/1/032072421.pdf.

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Dissertations / Theses on the topic 'Facteurs de dépendance à l'hôte'

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