Academic literature on the topic 'Déclin des herbiers'

Un herbier réalisé dans les années 1920/1930 par un élève de l’Institution agricole de Vals près Le Puy est décrit. Ce petit herbier de 43 planches rassemble des plantes collectées autour de l’institution et montre ce qu’un élève devait connaître en floristique lors de ses études. Ces petites collections, souvent négligées, sont des témoins de la flore banale du début du 20ème siècle en Haute-Loire et du matériel biologique qui pourra être utilisés pour l’avenir.

Contexte et objectifs – Lors de la révision taxonomique du genre Cynorkis (Orchidaceae) aux Mascareignes, un nouveau taxon collecté à La Réunion a été découvert et est officiellement décrit ici.Matériel et méthodes – Une comparaison de 312 spécimens (conservés dans les herbiers de P, MAU et REU) des Mascareignes avec les types nomenclaturaux a été entreprise afin de confirmer le statut taxonomique du nouveau taxon. Son état de conservation a été évalué selon les Catégories et Critères de la Liste Rouge de l’UICN.Principaux résultats – Cynorkis borbonica Pailler sp. nov. est décrit et illustré. Il est endémique de La Réunion où il se trouve dans les écosystèmes naturels à plus de 1900 m au-dessus du niveau de la mer. Son habitat est principalement le maquis dominé par Erica borbonica où il se rencontre sur le sol dans un tapis de bryophyte. Cynorkis trilinguis est la seule espèce proche et en diffère morphologiquement par la forme de son éperon et par la forme des feuilles. D’un point de vue de la distribution altitudinale, C. borbonica se développe à des altitudes supérieures à C. trilinguis. L’espèce est considérée comme En Danger selon les catégories et critères de l’UICN. A new Cynorkis (Orchidaceae) for the flora of the Mascarene Islands Background and aims – While conducting a taxonomic revision of the genus Cynorkis (Orchidaceae) in the Mascarenes, a new species collected in La Réunion was discovered and it is formally described here.Material and methods – A comparison of about 312 specimens (housed at P, MAU, and REU herbaria) from Mascarenes with nomenclatural types was undertaken in order to confirm the taxonomical status of the new species. Its conservation status was assessed using the IUCN Red List Categories and Criteria. Key results – Cynorkis borbonica Pailler sp. nov. is here described and illustrated. It is endemic to La Réunion where it is found in natural ecosystems at an elevation of more than 1900 m a.s.l. Its habitat is mainly shrubland dominated by Erica reunionensis where it grows on the ground in bryophyte mats. The only morphologically close species is Cynorkis trilinguis but it differs from the latter by its spur and leaf, as well as growing at a higher elevation. The species is considered as Endangered according to the IUCN Red List Categories and Criteria.

Introduction : Le but de la présente étude est de formuler et fabriquer des suppositoires antipaludiques à base des matières premières locales (poudre de feuilles et de tiges de Artemisia annua comme principe actif et beurre de karité amélioré utilisé comme excipient) afin d’améliorer la prise en charge du paludisme chez les enfants de moins de 5 ans. Méthodologie : Les plantules d’Artemisia annua utilisées ont été identifiées à l’HNC (Herbier National du Cameroun) sous le numéro Voucher 67472/HNC. Après transformation du matériel végétal (feuilles et tiges) en poudre, une série de contrôles a été effectué et exploité dans la suite. L’essai organoleptique consiste en la détermination du caractère macroscopique de la poudre des feuilles et tiges d’Artemisia annua. La mesure du volume en fonction du tassement a été effectuée à l’aide d’un voluménomètre. La compressibilité de la poudre a été évaluée à partir de divers indices tels que l’indice de Carr (ICarr), l’indice de Hausner (IHausner) et la quantité V10-V500. Le dosage de l’artémisinine s’est fait par la chromatographie sur couche mince (CCM)-densitométrie. En vue de la formulation galénique, connaissant le facteur de déplacement et la quantité de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua par suppositoire, la masse exacte d’excipient à utiliser a été déterminé. M(g) de beurre de karité +4% de silice colloïdale et S(g) de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua, quantités majorées à 10% pour couvrir les pertes, ont été utilisé pour préparer 6 suppositoires pesant chacun 2g selon le mode opératoire décrit dans la pharmacopée. Un contrôle de la qualité des suppositoires obtenus a également été effectués selon les prescriptions de la pharmacopée. Résultats : La poudre des feuilles et tiges d’Artemisia annua utilisée est de couleur grisâtre, de saveur amère et très odorante. L’humidité résiduelle moyenne de la poudre d’Artemisia annua est 12,69 % par séchage à l’infrarouge. Le chromatogramme de l’extrait d’Artemisia annua correspondant à six dépôts de concentration croissante. Le calcul du Rf de l’Artémisinine a donné la valeur de 0,35. Afin d’apprécier les résultats obtenus et par conséquent de valider la technique de dosage, nous avons procédé tour à tour à la vérification de la linéarité, de la répétabilité et à la détermination de la limite de détection et de quantification selon qu’indiqué dans le mode opératoire. Compte tenu des caractéristiques de la substance active (artemisinine), le beurre de karité additionné de 4% de silice colloïdale anhydre a été utilisé comme excipient. La formule obtenue pour un suppositoire consiste à additionner X mg de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua à Y mg de beurre de karité. Le contrôle de la qualité des suppositoires obtenus a montré des résultats (organoleptiques, masse, point de fusion, temps de désagrégation, dosage principe actif) satisfaisants en accord avec la pharmacopée Européenne 11 e Edition. Conclusion : L’analyse granulométrique a montré que la poudre de feuilles et tiges d’Artémisia annua a une granulométrie allant de très fine à fine et un taux d’artemisinine conforme. La formule retenue dans le cadre de cette étude a consisté à additionner X mg de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua à Y mg de beurre de karité additionné de 4% de silice colloïdale anhydre pour un suppositoire de 2 g. La forme galénique issue de cette formule pourrait présenter d’énormes avantages pour la qualité de prise en charge des enfants atteints de paludisme. Toutefois, des essais cliniques sont nécessaires en vue de déterminer la toxicité liée à leur utilisation

Introduction : Le but de la présente étude est de formuler et fabriquer des suppositoires antipaludiques à base des matières premières locales (poudre de feuilles et de tiges de Artemisia annua comme principe actif et beurre de karité amélioré utilisé comme excipient) afin d’améliorer la prise en charge du paludisme chez les enfants de moins de 5 ans. Méthodologie : Les plantules d’Artemisia annua utilisées ont été identifiées à l’HNC (Herbier National du Cameroun) sous le numéro Voucher 67472/HNC. Après transformation du matériel végétal (feuilles et tiges) en poudre, une série de contrôles a été effectué et exploité dans la suite. L’essai organoleptique consiste en la détermination du caractère macroscopique de la poudre des feuilles et tiges d’Artemisia annua. Il s’agit essentiellement d’apprécier la couleur, la texture, la saveur et l’odeur de la poudre obtenue après avoir séché et écrasé au moulin Pour ce qui est du taux d’humidité, nous avons utilisé la méthode indiquée dans la pharmacopée .La mesure du volume en fonction du tassement a été effectuée à l’aide d’un voluménomètre La compressibilité de la poudre a été évaluée à partir de divers indices tels que l’indice de Carr (ICarr) , l’indice de Hausner (IHausner) et la quantité V10-V500 .Le dosage de l’artémisinine s’est fait par la chromatographie sur couche mince (CCM)-densitométrie. En vue de la formulation galénique, connaissant le facteur de déplacement et la quantité de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua par suppositoire, la masse exacte d’excipient à utiliser a été déterminé. M(g) de beurre de karité +4% de silice colloïdale et S(g) de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua, quantités majorées à 10% pour couvrir les pertes, ont été utilisé pour préparer 6 suppositoires pesant chacun 2g selon le mode opératoire décrit dans la pharmacopée. Un contrôle de la qualité des suppositoires obtenus a également été effectués selon les prescription de la pharmacopée. Résultats : La poudre des feuilles et tiges d’Artemisia annua utilisée est de couleur grisâtre, de saveur amère et très odorante. L’humidité résiduelle moyenne de la poudre d’Artemisia annua est 12,69 % par séchage à l’infrarouge. Le chromatogramme de l’extrait d’Artemisia annua correspondant à six dépôts de concentration croissante. Le calcul du Rf de l’Artémisinine a donné la valeur de 0,35. Afin d’apprécier les résultats obtenus et par conséquent de valider la technique de dosage, nous avons procédé tour à tour à la vérification de la linéarité, de la répétabilité et à la détermination de la limite de détection et de quantification selon qu’indiqué dans le mode opératoire. Compte tenu des caractéristiques de la substance active (artemisinine), le beurre de karité additionné de 4% de silice colloïdale anhydre a été utilisé comme excipient. La formule obtenue pour un suppositoire consiste à additionner X mg de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua à Y mg de beurre de karité. Le contrôle de la qualité des suppositoires obtenus a montré des résultats (organoleptiques, masse, point de fusion, temps de désagrégation, dosage principe actif) satisfaisants en accord avec la pharmacopée Européenne 11 e Edition. Conclusion : L’analyse granulométrique a montré que la poudre de feuilles et tiges d’Artémisia annua a une granulométrie allant de très fine à fine et un taux d’artemisinine conforme. La formule retenue dans le cadre de cette étude a consisté à additionner X mg de poudre de feuilles et tiges d’Artemisia annua à Y mg de beurre de karité additionné de 4% de silice colloïdale anhydre pour un suppositoire de 2 g. La forme galénique issue de cette formule pourrait présenter d’énormes avantages pour la qualité de prise en charge des enfants atteints de paludisme. Toutefois, des essais cliniques sont nécessaires en vue de déterminer la toxicité liée à leur utilisation.

Les phanérogames marines constituent un compartiment biologique fondamental et fournissent de nombreux services écosystémiques. Comprendre leur évolution et les interactions avec leur environnement physique est un enjeu scientifique majeur à l’échelle mondiale. Dans le bassin d’Arcachon, des herbiers de Zostera noltei (le plus grand d’Europe) et de Zostera marina ont vu leur surfaces régresser fortement ces deux dernières décennies. La régression s’est accompagnée d’une augmentation des concentrations en sédiments en suspension et de modifications morphologiques significatives. Dans ce contexte, et à travers cet exemple régional, les objectifs de la thèse sont de mieux comprendre les causes physiques de la régression des herbiers de zostères et de démêler et de quantifier les conséquences physiques de la régression et les effets de rétrocontrôle.Un monitoring exhaustif des herbiers (suivi des paramètres biologiques, chimiques et physiques sur neuf sites durant une année) a montré d’une part l’extrême variabilité des conditions environnementales auxquelles sont soumis les herbiers de zostères naines du Bassin et d’autre part d’importantes différences démographiques, morphologiques et biochimiques entre les plantes des différents sites. Certaines de ces différences reflètent leur capacité d’adaptation à l’intensité d’un forçage. Un modèle logistique croissance a montré qu’outre la lumière, les paramètres principaux qui contrôlent le développement de Z. noltei à l’échelle du Bassin sont les forçages hydrodynamiques. Toutefois à l’échelle locale, d’autres facteurs tels que la teneur en matière organique ou la microtopographie s’avèrent prépondérants.Dans un second temps, une analyse associant des données historiques et des scénarios de modélisation hydrodynamique a montré que la profondeur maximale colonisée par les deux espèces de zostères avait fortement diminué entre 1989 et 2016, suggérant un effet du manque de lumière sur l’évolution de la distribution des deux espèces. Par ailleurs, il s’est avéré que la régression des zostères naines avait débuté au niveau des zones les plus pentues des estrans, qui correspondent aux rebords des chenaux et sont donc soumises aux courants les plus intenses, suggérant là encore un effet de l’intensité des courants sur la distribution de Z. noltei.Les résultats des simulations numériques ont montré que la régression des deux espèces induit une augmentation importante de l’énergie hydrodynamique, non seulement localement dans les zones où les herbiers ont régressé, mais également à distance, au niveau des chenaux principaux et jusqu’à près de l’embouchure.De plus, les effets hydrodynamiques induits par la régression initiale de Z. marina (1989-2007) ont contribué à la première phase du déclin des herbiers de Z. noltei. Ces résultats confirment en partie l’hypothèse que des processus de rétrocontrôle entre hydrodynamique et régression des herbiers de zostères sont intervenus au cours de la première phase du déclin des zostères. Par ailleurs, les conséquences hydrodynamiques directes de la première phase de régression des deux espèces (1989-2007) expliquent plus de 75 % de la seconde phase de régression de Z. noltei (2007-2012). Ces résultats confirment pleinement l’existence des processus de rétrocontrôle et met en évidence leur rôle prépondérant sur la dynamique des herbiers de Z. noltei.En ce qui concerne Z. marina, il apparaît enfin que les conditions actuelles ne permettent pas sa reconquête des zones d’où elle a disparu. Au contraire, du fait de sa position intertidale la rendant moins sensible aux fortes turbidités, Z. noltei pourrait recoloniser un certain nombre d’estrans qui leur sont favorables sur le plan hydrodynamique. Ce processus de recolonisation, conduisant à une réduction de l’énergie hydrodynamique et à l’amélioration locale des conditions lumineuses, pourrait s’auto-amplifier de proche en proche et favoriser la reprise de Z. marina dans les chenaux
Seagrass meadows are a fundamental biological component and provide many ecosystem services in coastal areas. Understanding their evolution and interactions with their physical environment is a major scientific issue. In Arcachon Bay, seagrass meadows of Zostera notlei (the largest in Europe) and Zostera marina have sharply regressed over the last two decades. In the meantime, an increase in suspended sediment concentrations and significant morphological changes were observed. Based on this regional case study, the objectives of this thesis are to better underestand the physical causes of seagrass bed regression, and also to quantify the physical consequences of the egression and possible feedback processes.An extensive monitoring of biological, chemical and physical parameters at nine sites during one year showed the extreme variability of the environmental conditions to which the Z. noltei beds are subject in Arcachon Bay, the important demographic, morphological and biochemical differences between plants of different sites. Some of these differences reflect their ability to adapt to the intensity of a forcing. A logistic growth model has shown that in addition to light, the main parameters that control the development of Z. noltei at the scale of the bay are hydrodynamic forcing. However, at the local scale, other factors such as organic matter content or microtopography may be predominant.In a second step, an analysis combining historical data and hydrodynamic modelling scenarios showed that the maximum depth colonized by the two species of seagrass strongly declined between 1989 and 2016. This analysis suggests that lack of light had an effect on the evolution of the distribution of the two species. In addition, it was found that the regression of Z. noltei began on the steepest areas of the tidal flat, which correspond to the edges of the channels and were therefore subject to the most intense currents, suggesting again an effect of intensity of currents on the distribution of Z. noltei.The results of numerical simulations showed that the regression of both species induces a significant increase in hydrodynamic energy, not only locally in areas where the seagrass have declined, but also remotely, at the level of main channels and up to near the mouth.In addition, the hydrodynamic effects induced by the initial regression of Z. Marina (1989-2007) contributed to the first phase of the decline of Z. noltei meadows. These results partially confirm the hypothesis that feedback processes between hydrodynamics and regression of seagrass beds occurred during the first stage of seagrass decline. Furthermore, the direct hydrodynamic consequences of the first regression phase of the two species (1989-2007) accounted for more than 75% of the second regression phase of Z. noltei (2007-2012). These results fully confirm the existence of feedback processes and highlight their predominant role in the dynamics of Z. noltei meadows.As far as Z. marina is concerned, it finally appears that the current conditions do not allow colonization of the areas from which it disappeared. On the contrary, due to its intertidal position making it less susceptible to high turbidity, Z. noltei could recolonize some tidal flats that present favourable hydrodynamic conditions. This process of recolonization, leading to a reduction of the hydrodynamic energy and to the local improvement of the light conditions, could self-amplify by adjaceting to each other and then promote the recovery of Z. marina in the channels

Les phanérogames marines sont un compartiment biologique fondamental au bon maintien des environnements côtiers grâce aux nombreux services écosystémiques qu’elles fournissent. Au cours des dernières décennies, leur surface a été considérablement réduite à l’échelle mondiale, entraînant la perte de leurs fonctions régulatrices, notamment des conditions hydrodynamiques et des flux sédimentaires. Dans ce contexte, cette thèse s’attache à mieux comprendre la réponse des processus hydro-sédimentaires des lagunes côtières peu profondes au déclin d’espèces intertidales, à travers l’étude régionale de l’effet de la régression des herbiers de zostères (Zostera noltei et Zostera marina) du Bassin d’Arcachon. Cette analyse a été menée grâce à de la modélisation numérique, qui a nécessité de développer et mettre en place une plateforme de modélisation bio-hydro-sédimentaire, constituée de quatre modèles couplés (modèle hydrodynamique, modèle de vagues, modèle de transport sédimentaire et modèle de croissance des zostères), prenant tous en compte l’influence de la végétation. Une attention particulière a été portée à l’implémentation de la végétation dans le modèle de vague et le modèle de transport, en utilisant des approches combinant expériences en laboratoire, de terrain et de la modélisation numérique. Dans un premier temps, l’influence de la régression des herbiers de zostères a été étudiée sur les conditions hydrodynamiques et a révélé d’importantes modifications de l’hydrodynamique tidale et des conditions de vagues, notamment l’intensification des vitesses sur le fond de l’ordre de 100 % et de la hauteur de vagues de 50 % sur les estrans où les herbiers ont le plus décliné. Ensuite, la contribution de la régression des herbiers sur la modification de l’hydrodynamique tidale a été comparée à celle induite par la reconfiguration des Passes, montrant que le déclin des herbiers a été le principal responsable de la modification des vitesses sur les estrans et chenaux à l’intérieur du Bassin. En réponse au déclin de Zostera spp., ainsi qu’à l’intensification des conditions hydrodynamiques qui en a résulté, cet environnement a subi d’importantes modifications de la dynamique sédimentaire. Les flux d’érosion et de dépôt ont été particulièrement impactés par le déclin, générant des concentrations en matières en suspension de 2 à 6 fois plus importantes. La régression des herbiers a également perturbé les échanges sédimentaires entre la lagune et l’océan ouvert, ainsi qu’entre les différentes zones du Bassin, donnant lieu à une redistribution des différentes classes sédimentaires et à la modification de la composition du sédiment superficiel. Les estrans situés le long des côtes ont eu tendance à s’accréter et à s’envaser, alors que les estrans plus centraux ont eu tendance à s’éroder et devenir plus sableux. En particulier, nous avons montré que la régression des herbiers est le principal responsable des évolutions bathymétriques observées à l’intérieur du Bassin. Enfin, l’évolution potentielle des herbiers de zostères a été étudiée à travers différentes conséquences du changement climatique que sont la hausse du niveau marin et l’évolution des températures de l’air et de l’eau. Une attention particulière a été portée à la génération de forçages environnementaux futurs, reproduisant les éventuelles températures et le niveau marin à l’horizon 2050. La biomasse des herbiers a témoigné de réponses contrastées à ces deux processus, très dépendantes de plusieurs facteurs environnementaux (profondeur, exposition à l’hydrodynamique, temps de renouvellement). Nous avons également montré que, plus que l’augmentation des températures moyennes, c’est l’augmentation de la fréquence et de l’intensité des événements extrêmes de température qui devrait être le principal facteur de contrôle des évolutions de biomasse dans le Bassin d’Arcachon
Seagrass meadows provide numerous ecosystem services and constitute a fundamental biological component for the sustainability of coastal environments. Over the past decades, the surface colonized by seagrasses has drastically declined globally, reducing their capacity to regulate hydrodynamic conditions and sediment fluxes. In this context, this work aims to better understand the response of hydro-sedimentary processes to the decline of intertidal seagrass in a shallow coastal lagoon. For this purpose, the Arcachon lagoon (France), extensively colonized by seagrass meadows (Zostera noltei and Zostera marina), was used as a study area. This analysis was conducted through a numerical modeling approach that required the preliminary development and implementation of a hydro-bio-sedimentary modeling platform, consisting of four coupled models (flow model, wave model, sediment transport model, and seagrass growth model), all accounting for the effect of vegetation. Specific attention was paid to the implementation of vegetation in the wave and sediment models, utilizing combined numerical, field, and laboratory experiments. The impact of seagrass decline was first studied on hydrodynamics, revealing significant changes in tidal hydrodynamics and the wave regime, especially an intensification in bottom current velocities by 100% and wave height by 50% on the tidal flats. Further investigation into the relative influence of seagrass decline and morphological evolutions of the inlet on tidal hydrodynamics showed that vegetation loss was the main factor influencing the modification of current velocities inside the lagoon. In response to the decline of Zostera spp. and the subsequent intensification of hydrodynamic conditions, this environment underwent significant changes in sediment dynamics. Modification of erosion and deposition fluxes resulted in suspended sediment concentrations 3 to 6 times higher in the areas where vegetation decreased the most. Seagrass decline also impacted sediment transport between the lagoon and the open ocean, as well as among different areas of the lagoon, leading to the redistribution of the different sediment classes and altering the composition of the seabed sediment. The tidal flats located along the coastlines accreted and became siltier, while those in the center of the lagoon eroded and became sandier. In particular, our results demonstrated that seagrass decline was the primary contributor to the observed bathymetric changes in the lagoon. Finally, potential evolutions of marine phanerogams were investigated, considering various consequences of climate change such as sea level rise and increase of temperature. For this analysis, special consideration was given to generating environmental forcing that reproduces potential temperature and water level conditions by 2050. Seagrass biomass exhibited contrasting responses to these processes, clearly dependent on multiple environmental factors (depth, hydrodynamic exposure, renewal time). We also showed that, beyond global warming, it is the increase in frequency and intensity of extreme temperature events that are expected to induce the most significant changes in seagrass biomass