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Dissertations / Theses

Academic literature on the topic 'Cryo-EM structures'

Author: Grafiati

Published: 6 September 2023

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Dissertations / Theses on the topic "Cryo-EM structures"

1

Wilkes, Martin [Verfasser], Christine [Akademischer Betreuer] [Gutachter] Ziegler, and Clemens [Gutachter] Glaubitz. "Single-particle cryo-EM structures of oligomeric membrane protein complexes / Martin Wilkes ; Gutachter: Clemens Glaubitz, Christine Ziegler ; Betreuer: Christine Ziegler." Frankfurt am Main : Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg, 2016. http://d-nb.info/1120493412/34.

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2

Preis, Anne [Verfasser], and Roland [Akademischer Betreuer] Beckmann. "Cryo-EM structures of eukaryotic translation termination and ribosome recycling complexes containing eRF1, eRF3 and ABCE1 / Anne Preis ; Betreuer: Roland Beckmann." München : Universitätsbibliothek der Ludwig-Maximilians-Universität, 2020. http://d-nb.info/1213658837/34.

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3

Zhou, Yu. "Structural study of eIF2B by electron microscopy." Thesis, University of Manchester, 2016. https://www.research.manchester.ac.uk/portal/en/theses/structural-study-of-eif2b-by-electron-microscopy(feacd470-3139-4648-9812-c152168c930d).html.

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Abstract:

In eukaryotic translation initiation, eIF2B, a 295 kDa multisubunit (from α to ε) complex,is the guanine nucleotide exchange factor (GEF) of eIF2, a GTP binding protein, and hasmultiple roles in regulating the level of active eIF2-GTP-Met-tRNAi ternary complexes inthe cytoplasm. Mutations in eIF2B subunits affect global protein synthesis and, in human,are responsible to cause a genetically inherited lethal childhood brain disease calledLeukoencephalopathy with Vanishing White Matter (VWM). Although the genetic aspectseIF2B have been widely studied over decades, detailed structural knowledge on

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4

Abdelkareem, Moamen. "Structural basis of transcription : RNA polymerase backtracking and its reactivation." Thesis, Strasbourg, 2019. http://www.theses.fr/2019STRAJ062.

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Abstract:

Ma thèse se focalise sur la compréhension d’un phénomène de transcription, appelé backtracking, qui inactive la RNAP et arrête la transcription. La réactivation des complexes RNAP arrêtés et la reprise de la transcription nécessitent un facteur protéique appelé GreB. L’objectif du projet était d’obtenir des informations structurelles sur: i) la façon dont le retour en arrière inactive la RNAP dans E. coli; et ii) comment GreB sauve la RNAP en marche arrière pour continuer la transcription. À l'aide de SP cryo-EM, j’ai capturé quatre instantanés de RNAP dans différents états. Mes résultats mont

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5

Brito, Querido Jailson Fernando. "Structural study of mRNA translation in kinetoplastids by Cryo-electron microscopy." Thesis, Strasbourg, 2017. http://www.theses.fr/2017STRAJ108.

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Abstract:

Les kinétoplastides sont un groupe de protozoaires, et qui menace plus de 400 millions de personnes dans le monde entier. Ils possèdent des segments d'expansion d'ARNr (SE) inhabituellement plus larges dans les sous-unités 40S. Ici, nous avons purifié à partir de lysats de cellules de T. cruzi des complexes d'initiation natifs (48S IC) et des sous-unités de 40S natives que nous avons ensuite analysées par cryo-ME. La structure des 48S IC révèle certains des aspects spécifiques de la traduction aux kinétoplastides, tels qu'un réseau d’interaction complexe entre eIF3 et SEs. En outre,

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6

Spikes, Tobias Edward. "Structural studies of the mitochondrial F-ATPase." Thesis, University of Cambridge, 2018. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/274349.

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Abstract:

The mitochondrial F-ATPases make about 90% of cellular ATP. They are multi-protein assemblies with a membrane extrinsic catalytic domain attached to a membrane embedded sector. They operate by a mechanical rotary mechanism powered by an electro-chemical gradient, generated across the inner mitochondrial membrane by respiration. A detailed molecular description has been provided by X-ray crystallographic studies and "single molecule" observations of the mechanism of the F1 catalytic domain. Details are known also of the architecture of the peripheral stalk of part of the stator and the membrane

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7

He, Shaoda. "Helical reconstruction in RELION." Thesis, University of Cambridge, 2018. https://www.repository.cam.ac.uk/handle/1810/284086.

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Abstract:

Helical assemblies of proteins are ubiquitous in nature and they perform vital functions in a wide range of organisms. The recent development of direct electron detectors and other imaging techniques in cryo-electron microscopy (cryo-EM) has opened new possibilities in solving helical structures at atomic resolution. Existing software packages for helical processing often require experience in tuning many ad hoc parameters to achieve optimal reconstruction results. REgularised LIkelihood OptimisatioN (RELION), an open-source single-particle analysis package, reduces the need for user expertise

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8

Nojima, Shingo. "Cryo-EM Structure of the Prostaglandin E Receptor EP4 Coupled to G Protein." Doctoral thesis, Kyoto University, 2021. http://hdl.handle.net/2433/263574.

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9

Torchy, Morgan. "Etude structure-fonction du complexe de remodelage de la chromatine NuRD." Thesis, Strasbourg, 2014. http://www.theses.fr/2014STRAJ113/document.

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Abstract:

Une approche de biologie structurale intégrative a été mise à profit pour l'étude de l’organisation structurale du complexe NuRD. Mon travail s'est focalisé essentiellement sur trois sous-unités du complexe: MBD3, RbAp46 et RbAp48. J'ai mis en place les protocoles de production et de purification de ces différentes sous-unités, et les ai caractérisé biophysiquement par diverses méthodes. Nous avons ensuite entrepris des études de liaisons sur des nucléosomes reconstitués au laboratoire. Pour MBD3, l'optimisation du complexe nous a permis d'obtenir des cristaux diffractant jusqu'à 7 A de résolu

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10

Guo, Xieyang. "Regulation of transcription : structural studies of an RNA polymerase elongation complex bound to transcription factor NusA." Thesis, Strasbourg, 2018. http://www.theses.fr/2018STRAJ071/document.

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Abstract:

La pause transcriptionnelle marquée par les ARN polymérases (RNAP) est un mécanisme clé pour réguler l'expression des gènes dans tous les règnes de la vie et est une condition préalable à la terminaison de la transcription. Le facteur de transcription bactérien essentiel NusA stimule à la fois la pause et la terminaison de la transcription, jouant ainsi un rôle central. Ici, je présente des reconstructions par cryo-microscopie électronique (cryo-EM) à une seule particule de NusA lié à des complexes d'élongation en présence et en absence d’ARN en épingle à cheveux dans le canal de sortie de l'A

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