Academic literature on the topic 'Cetartiodactyl'

Studying ontogeny in both extant and extinct species can unravel the mechanisms underlying mammal diversification and specialization. Among mammalian clades, Cetartiodactyla encompass species with a wide range of adaptations, and ontogenetic evidence could clarify longstanding debates on the origins of modern specialized families. Here, we study the evolution of dental eruption patterns in early diverging cetartiodactyls to assess the ecological and biological significance of this character and shed new light on phylogenetic issues. After investigation of the ontogenetic dental series of 63 extinct genera, our parsimony reconstructions of eruption state evolution suggest that the eruption of molars before permanent premolars represents a plesiomorphic condition within Cetartiodactyla. This result substantially differs from a previous study based on modern species only. As a result, the presence of this pattern in most ruminants might represent an ancestral condition contributing to their specialized herbivory, rather than an original adaptation. In contrast, the late eruption of molars in hippopotamoids is more likely related to biological aspects, such as increases in body mass and slower pace of life. Our study mainly shows that eruption sequences reliably characterize higher level cetartiodactyl taxa and could represent a new source of phylogenetic characters, especially to disentangle the origin of hippopotamoids and cetaceans.

Understanding the processes that give rise to genomic variability in extant species is an active area of research within evolutionary biology. With the availability of whole genome sequences, it is possible to quantify different forms of variability such as variation in gene copy number, which has been described as an important source of genetic variability and in consequence of phenotypic variability. Most of the research on this topic has been focused on understanding the biological significance of gene duplication, and less attention has been given to the evolutionary role of gene loss. Gremlin 2 is a member of the DAN gene family and plays a significant role in tooth development by blocking the ligand-signaling pathway of BMP2 and BMP4. The goal of this study was to investigate the evolutionary history of gremlin 2 in cetartiodactyl mammals, a group that possesses highly divergent teeth morphology. Results from our analyses indicate that gremlin 2 has experienced a mixture of gene loss, gene duplication, and rate acceleration. Although the last common ancestor of cetartiodactyls possessed a single gene copy, pigs and camels are the only cetartiodactyl groups that have retained gremlin 2. According to the phyletic distribution of this gene and synteny analyses, we propose that gremlin 2 was lost in the common ancestor of ruminants and cetaceans between 56.3 and 63.5 million years ago as a product of a chromosomal rearrangement. Our analyses also indicate that the rate of evolution of gremlin 2 has been accelerated in the two groups that have retained this gene. Additionally, the lack of this gene could explain the high diversity of teeth among cetartiodactyl mammals; specifically, the presence of this gene could act as a biological constraint. Thus, our results support the notions that gene loss is a way to increase phenotypic diversity and that gremlin 2 is a dispensable gene, at least in cetartiodactyl mammals.

The Drimolen Palaeocave System Main Quarry deposits (DMQ) are some of the most prolific hominin and primate-bearing deposits in the Fossil Hominids of South Africa UNESCO World Heritage Site. Discovered in the 1990s, excavations into the DMQ have yielded a demographically diverse sample ofParanthropus robustus(including DNH 7, the most complete cranium of the species recovered to date), earlyHomo,Papio hamadryas robinsoniandCercopithecoides williamsi. Alongside the hominin and primate sample is a diverse macromammalian assemblage, but prior publications have only provided a provisional species list and an analysis of the carnivores recovered prior to 2008. Here we present the first description and analysis of the non-primate macromammalian faunas from the DMQ, including all 826 taxonomically identifiable specimens catalogued from over two decades of excavation. We also provide a biochronological interpretation of the DMQ deposits and an initial discussion of local palaeoecology based on taxon representation.The current DMQ assemblage consists of the remains of minimally 147 individuals from 9 Orders and 14 Families of mammals. The carnivore assemblage described here is even more diverse than established in prior publications, including the identification ofMegantereon whitei,Lycyaenops silberbergi, and first evidence for the occurrence ofDinofeliscf.barlowiandDinofelisaff.piveteauiwithin a single South African site deposit. The cetartiodactyl assemblage is dominated by bovids, with the specimen composition unique in the high recovery of horn cores and dominance ofAntidorcas reckiremains. Other cetartiodactyl and perissodactyl taxa are represented by few specimens, as areHystrixandProcavia; the latter somewhat surprisingly so given their common occurrence at penecontemporaneous deposits in the region. Equally unusual (particularly given the size of the sample) is the identification of single specimens of giraffoid, elephantid and aardvark (Orycteropuscf.afer) that are rarely recovered from regional site deposits. Despite the diversity within the DMQ macromammalian faunas, there are few habitat- or biochronologically-sensitive species that provide specific ecologic or age boundaries for the deposits. Recovered species can only support the non-specific, mixed open-to-closed palaeohabitats around Drimolen that have been reconstructed for the other penecontemporaneous South African palaeokarst deposits. The identifiedEquus quaggassp. specimens recovered from the floor of the current excavation (∾−4.5–5 m below datum) suggests that most, if not all the DMQ specimens, were deposited after 2.33 Ma. Simultaneously, the carnivore specimens (D.cf.barlowi, L. silberbergi) suggest earlier Pleistocene (pre- 2.0–1.8 Ma) to maximally 1.6 Ma deposition (D.aff.piveteaui) for most of the DMQ fossil assemblage.

La microstructure de l'émail est étudiée depuis longtemps, mais ses modalités de formation sont encore floues. J'ai employé une approche multi-disciplinaire alliant paléontologie et biologie cellulaire dans une perspective évolution-développement afin de parvenir à une vision intégrée et en profondeur de la microstructure, de sa morphologie et de ses modes de formation. J'ai ainsi pu décrire en 2D l'évolution de la microstructure chez un grand groupe de mammifères fossiles et actuels, les cétartiodactyles, qui ont révélé que tous les caractères de l'émail ne se valent pas, et font état de différentes contraintes développementales les rendant plus ou moins labiles aux changements évolutifs. J'ai également travaillé au niveau cellulaire et en 3D avec des modèles actuels, en particulier des rongeurs, sur les rapports entre les prismes d'émail et leurs cellules sécrétrices, les améloblastes, révélant que l'agencement de ces derniers contribue en grande part à la morphologie de la microstructure. Enfin, j'ai réalisé une démarche de synthèse, en proposant un modèle de la microstructure de l'émail chez les mammifères sur la base de mes données 2D+3D. Il en est ressorti d'une part un nouveau logiciel de reconstruction virtuelle de la microstructure, Simulémail, et il a été mis en évidence différents moyens de générer la décussation chez les mammifères, ainsi que les probables mécanismes développementaux sous-jacents
I approached enamel microstructure's morphology and modes of formation with a dual angle, combining paleontological and cellular biology observations, in 2D and 3D. Studying microstructure of extinct and extant Cetartiodactyla in a phylogenetic context, I discovered that some enamel characters are more likely to evolve and change than others, which is linked to different developmental constrains. I also explored microstructure through the relationship between enamel prisms and ameloblasts, the enamel-secreting cells, showing that the arrangement of the cells is directly associated with the prisms'. Then, combining these data, I constructed a model of mammalian enamel microstructure based on 2D and 3D observations and suggested underlying cellular mechanisms, and created a new software dedicated to enamel reconstruction, Simulémail, based on this model. It helped to show that microstructure is not always created the same way for different mammals, and allowed to explore enamel characters efficiently

Delphinidae é a família de cetáceos mais diversa dentre os cetáceos atuais e o agrupamento dos gêneros em subfamílias foi inicialmente baseado na semelhança de caracteres morfológicos. Na primeira análise cladística para o clado Delphinidae, baseada em dados de citocromo b, quatro subfamílias foram propostas. Nesta primeira análise, sugeriu-se que os gêneros Delphinus, Tursiops, Stenella, Lagenodelphis e Sousa deveriam ser incluídos no clado Delphininae. Estudos subsequentes baseados em dados moleculares e morfológicos diferem nas relações propostas entre as espécies e na inclusão do gênero Sousa no clado Delphininae. Devido à incongruência entre as relações filogenéticas baseadas tanto na morfologia quanto em dados de DNA mitocondrial e nuclear, foi proposta a inclusão de todas as espécies pertencentes à subfamília para o gênero Delphinus, sob a justificativa de que a atual taxonomia não reflete a real história evolutiva do grupo. É consenso que a radiação de Delphininae foi um evento rápido e recente iniciado no Plioceno, no qual a divergência das espécies ocorreu ao longo do Pleistoceno. Para compreender os processos envolvidos na evolução de Delphininae, à luz da biogeografia histórica, foi utilizado o método da “Spatial Analysis of Vicariance”, cuja principal meta é identificar taxóns-irmãos com distribuições disjuntas. “Spatial Analysis of Vicariance” (SAV) foi conduzida no “Vicariance Inference Program” (VIP) a partir de duas hipóteses filogenéticas, uma construída a partir de dados moleculares e outra de dados morfológicos. A partir de revisão exaustiva da literatura, 2.637 registros de ocorrência de todos os taxa terminais pertencentes à Delphininae e grupos externos foram compilados. A busca por distribuições disjuntas entre grupos filogeneticamente relacionados foi conduzida através de 1.000 iterações. A grade de células utilizada foi 2°x2° com preenchimento máximo ajustado para 1. O custo atribuído para a remoção total da distribuição do terminal foi 1 e o custo de uma remoção parcial foi ajustado para 0,75. Não foi utilizado percentual de sobreposição. Em ambas análises de vicariância realizadas tanto com dados moleculares quanto morfológicos, foram recuperados eventos vicariantes e diferentes cenários biogeográficos foram hipotetizados. A separação entre Delphininae e Steninae parece estar relacionada ao soerguimento do Istmo do Panamá que ocorreu há 7 – 3,5 Ma e teve grande importância na fragmentação da biota marinha entre os oceanos Pacífico e o Atlântico. As disjunções encontradas em táxons terminais estão principalmente relacionadas à Corrente de Benguela e, também a Barreira do Pacífico Oriental. A corrente de Benguela é um importante sistema de ressurgência dos oceanos, sendo um dos mais produtivos ecossistemas do mundo, cuja oscilação da temperatura, a partir de 3 Ma atrás, promoveu a fragmentação da fauna marinha tropical durante períodos frios, mas permitiu o intercâmbio de faunas entre o Atlântico e o Índico durante períodos mais quentes. Os demais eventos vicariantes encontrados parecem estar relacionados à fragmentação do ambiente costeiro no Atlântico e Indo-Pacífico durante os períodos glaciais e interglaciais do Pleistoceno.

Submitted by Andreza Leão (andrezaflh@gmail.com) on 2018-08-31T17:32:01Z No. of bitstreams: 1 Tese_AcousticEcologyDolphins.pdf: 3257688 bytes, checksum: 4841865b7154c6248dc60c31219f8055 (MD5)
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CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Sistemas sensoriais são vitais para que os animais obtenham informações sobre seus arredores. A informação pode ser adquirida por vias visuais, químicas, elétricas, táteis e acústicas. Estes sinais são usados em diferentes contextos ecológicos incluindo forrageamento, competição, defesa, interações sociais (e.g. corte), e também podem indicar uma condição, e estado emocional ou reprodutivo, ou a identidade do emissor do sinal. Para os mamíferos aquáticos o som é o meio de comunicação mais importante. A luz atenua rapidamente com a profundidade em ambientes aquáticos, limitando a comunicação visual. Todavia, a atenuação do som na água é baixa e ele viaja cerca de cinco vezes mais rápido na água do que no ar, o que o torna um meio de comunicação extremamente eficiente em baixo da água. Logo, o som é um aspecto fundamental da biologia dos cetáceos, já que estes animais dependem do som para comunicação, navegação e localização de presas. O gênero Sotalia compreende duas espécies que vivem em hábitats contratantes. O botocinza (Sotalia guianensis) que habita águas costeiras da Nicarágua ao sul do Brasil, e o tucuxi (Sotalia fluviatilis) restrito aos principais tributários da Bacia Amazônica. Enquanto que golfinhos do gênero Inia – popularmente conhecidos como botos-vermelhos – são encontrados exclusivamente nas Bacias dos rios Amazonas, Orinoco e Tocantins. Com ambos os seus estados de conservação como dados deficientes há grande demanda de informações quanto a sua biologia. Como fator-chave da biologia dos cetáceos a acústica pode nos prover uma riqueza de informações e ser usada como ferramenta para adquirir dados quanto ao uso de hábitat, números populacionais e comportamento. Entretanto, para fazê-lo, primeiro é necessário conhecer o repertório vocal das espécies em detalhe de forma que possamos diferenciá-las usando métodos acústicos. Portanto apresentamos aqui a primeira análise englobando toda a distribuição de golfinhos do gênero Sotalia e padrões geográficos e de diversidade de seus assobios. Além disso, apresentamos a primeira descrição do repertório vocal e de Inia araguaiensis focando na diversidade de repertório e em sua estrutura. O repertório de assobios de ambas as espécies de Sotalia é altamente estruturado, com populações da espécie fluvial apresentando um repertório menos diverso do que as populações da espécie costeira. Esta estruturação se dá provavelmente devido a áreas de vida pequenas e ao baixo fluxo gênico entre populações. As diferenças na riqueza entre o repertório destas espécies parecem estar relacionadas a uma combinação de fatores socio-ecológicos e evolutivos. Também apresentamos a primeira descrição do comportamento acústico do boto-o Araguaia (Inia araguaiaensis) e mostramos que eles possuem um repertório rico composto por assobios e principalmente chamados pulsados. Assobios foram produzidos raramente, um tipo específico de chamado, chamados curtos com dois componentes, foram o tipo de sinal mais comum durante nosso estudo. Estes chamados são similares em estrutura a aqueles produzidos por orcas (Orcinus orca) e baleias-piloto (Globicephala sp.). Devido ao contexto no qual estes sinais foram produzidos, nós hipotetizamos que eles podem funcionar para a comunicação ente mãe e filhote. Sotalia e Inia podem ser distintos acusticamente baseados em seus sons sociais, já que o primeiro tem um repertório baseado em assobios e o último em chamados pulsados. A baixa emissão de assobios por Inia faz com que a chance de identificação errônea seja baixa. Logo, sons 14 de ambos os gêneros podem ser usados para distingui-los durante monitoramentos acústicos passivos e podem servir como ferramentas para determinar a presença destas espécies em estudos de distribuição, uso de hábitat e abundância.
Sensory systems are vital for animals to obtain information about their surroundings. Information can be gathered via visual, chemical, electrical, tactile and acoustic cues. These cues are used in several ecological contexts including foraging, competition, defense, social interactions (e.g. courtship behavior), and to indicate a condition, emotional or reproductive state or identity of the signal emitter. For aquatic mammals, sound is the most important mechanism of communication. Light attenuates rapidly with depth in aquatic environments limiting visual communication. In contrast, sound has low attenuation in water and it travels about five times faster in water than in air, making a very efficient way to communicate underwater. Therefore, sound is a fundamental aspect of cetacean biology, as these animals rely on acoustic signals for communication, navigation and location of prey. The genus Sotalia consist of two species that inhabit contrasting habitats. The Guiana dolphin (Sotalia guianensis) inhabits the coastal waters from Nicaragua to Southern Brazil, and the tucuxi (Sotalia fluviatilis) is confined to the main tributaries of the Amazon Basin. Meanwhile, river dolphins of the genus Inia - commonly known as botos - are found exclusively in the Amazon, Orinoco, and Tocantins River Basins. With their conservation status of both genera as data deficient there is great demand for information on their biology. As a key factor on cetacean biology acoustics can provide us with a richness of information and used as a tool to acquire data on habitat use, population numbers and behavior. However, in order to do so, first one needs to know the species vocal repertoire in detail and be able to differentiate those using acoustic methods. Thus, here we present the first distributionwide analysis of the vocal repertoire of Sotalia dolphins and diversity and geographical patterns of their whistles. In addition, we present the first description of the vocal repertoire of Inia araguaiaensis focusing on repertoire diversity and structure. The whistle repertoire of both Sotalia species is highly structured, with populations of the riverine species showing a less diverse whistle repertoire than the populations of the coastal species. The highly structured repertoire is likely due to the small home ranges and low gene flow among populations. Differences in the richness of the acoustic repertoire between both species, may be due to a combination of socioecological and evolutionary factors. We also provide the first description of the Araguaian boto (Inia araguaiensis) acoustic behavior and showed that they have a rich acoustic repertoire consisting of whistles and primarily pulsed calls. While whistles were produced rarely, a specific type of call, the short two-component calls were the most common signal emitted during the study. These calls were similar in acoustic structure to those produced by orcas (Orcinus orca) and pilot whales (Globicephala sp.). Because of the context at which these signals were produced, we hypothesize that they possibly play a role in mother-calf communication. Sotalia and Inia can be acoustically distinguished based on their social sounds, as the former has a repertoire based on whistles and the latter based on pulsative calls. With the low emission rate of whistles by Inia, so chances of misidentification are low. Thus, sounds of both genera can be used to distinguish them from one another during passive acoustic monitoring and serve as proxies for species presence in studies of distribution, habitat use, and abundance.

Comparative neuroanatomy studies have helped us see the major structures and similarities between mammals, and allowed for the confirmations of hypotheses via direct observation. Variety in brain specialization can be seen in Cetartiodactyla, between the terrestrial artiodactyls and aquatic cetaceans. Compared to the primate brain, adapted to grasp using articulated fingers with opposable thumbs, the pure quadrupedal locomotion of ungulates and the absence of articulated movements in the limbs of cetaceans most certainly shows variations in the related brain areas. From this principle, the study of the brain of the swine, bovine, sheep or any other cetartiodactyl can help understand the basic organization coding the brain of mammals. Some species have been used more than others among cetartiodactyls. The sheep Ovis aries has been the subject of a fair amount of cytoarchitectural studies and functional investigations of the cortex, but also the hypothalamus. Other more exotic terrestrial species like the giraffe Giraffa camelopardalis, have much more rarely had their brain thoroughly studied and published. For this reason we studied the cortical folding of the giraffe brain, its brain weight and encephalization quotient (EQ), and we reviewed the literature concerning its encephalon as far as 1839. This showed that, although a relatively very small absolute number of specimen have been collected over the years, the giraffe brain was quite typical of ungulates, with a deep gyrification, and an absolute weight of 720 g. The brain of the swine Sus scrofa received comparatively little attention, regarding even basic data. To provide weighed data on the brain of the pig, we weighted the brain of 48 animals to reach a robust value for the average brain weight of the domestic swine a different age categories. The average adult brain weight was 135 g, which was compared to the literature, as well as published EQs. The relatively low EQ (0.38) could be related to the domestication and heavy breeding that meat production necessitated to improve body weight. One of the findings of the cyctochemical exploration of the mammalian brain is the existence of sexually dimorphic structures. Groups of cells were found to be much larger in volume or cell number in the brain of males or females. Although their precise function is still unknown, most of them are directly involved in reproduction behaviors. Hormones have a crucial role in shaping the developing brain, and in particular androgens. The effects of male and female steroids on the development of the brain and its sexual differentiation can be put in perspective in the study of intersex freemartin bovines. During twin pregnancy of a bovine with a male and a female fetus, male sexual hormones circulating during intrauterine development in the female fetus can masculinize its genital apparatus and alter its phenotype, resulting in an intersex animal. We investigated the hypothalamus cytoarchitecture of freemartin heifers and compared them to male and female hypothalami. We found sex differences between male and female suprachiasmatic (SCN) and vasopressin-oxytocin containing (VON) nuclei. Moreover, the freemartin hypothalamus showed differences more complex than a simple masculinized female brain. While the VON was in size and cell count between male and female values, the SCN of freemartins was larger than both males and females. Using modern multivariate statistical methods, we also investigated the cytoarchitecture of male, female and freemartin cerebellar cortex. We found differences among cellular layers in size, regularity and density of the cells, across sex categories, showing that a multivariate multi-aspect approach can yield valuable results at the cellular level for large cohorts, and that a multi-disciplinary team can produce finer studies.
La neuroanatomia comparata consente di caratterizzare le strutture nervose mettendo in luce le somiglianze e le differenze tra i mammiferi. Un aspetto interessante di questo studio comparato riguarda il cervello dei Cetartiodattili sia terrestri (artiodattili) sia marini (cetacei) in cui la locomozione quadrupedale degli ungulati e l'assenza di movimenti articolati nell’arto dei cetacei mostrano variazioni morfologiche rispetto ai primati nelle aree cerebrali correlate i quali presentano un arto specializzato con dita articolate e pollici opponibili capaci di afferrare oggetti molto piccoli con precisione. Da questo punto di vista uno studio neuroanatomico dell’encefalo di artiodattili come il suino, il bovino e la pecora può aiutarci a comprendere l'organizzazione della citoarchitettura nei diversi mammiferi. La pecora Ovis aries come modello animale è stata oggetto di una discreta quantità di studi anatomici e indagini funzionali sul ruolo della corteccia cerebrale e dell'ipotalamo. Altre specie di artiodattili terrestri come la giraffa Giraffa camelopardalis, sono state meno studiate e sono rare le pubblicazioni che ne hanno studiato il cervello. Per questo motivo, uno degli obiettivi di questa tesi è stato quello di caratterizzare le circonvoluzioni corticali dell’encefalo della giraffa, valutare il suo peso ed il suo quoziente di encefalizzazione (EQ). I risultati hanno permesso di affermare che il cervello della giraffa presenta caratteristiche comuni a quelle degli altri ungulati con una notevole girificazione e un peso medio di 720 g. Un altro obiettivo è stato quello di analizzare l’encefalo del suino Sus scrofa. Per ottenere risultati significativi, abbiamo pesato il cervello di 48 animali appartenenti a diverse categorie di età. Il peso medio del cervello adulto è risultato di 135 g. L'EQ relativamente basso (0,38) ottenuto da questo mammifero potrebbe essere spiegato con le esigenze di produzione spinta che l'allevamento intensivo comporta, incrementando la selezione di animali sempre più pesanti. Uno degli aspetti molto studiati in questi ultimi anni da un punto di vista neuroanatomia riguarda la caratterizzazione delle aree sessualmente dimorfiche nell’encefalo dei mammiferi. Il bovino Bos taurus rappresenta un modello interessante per lo studio dei dimorfismi cereberali perché questo mammifero possiede un cervello grande, altamente convoluto, una gravidanza di 9 mesi. Inoltre in questa specie si manifesta la sindrome del freemartinismo. Tale sindrome si presenta perchè durante la gravidanza gemellare di un feto maschile e uno femminile, gli ormoni maschili del maschio a causa della anastomosi plaecentare circolano nel feto femminile mascolinizzando. Così il feto femmina è un individuo intersesso interessante perché il suo cervello femminile si è sviluppato naturalmente in un ambiente ormonale maschile. L’obiettivo che ci siamo posti è stato quello di studiare la citoarchitettura dell'ipotalamo di giovenche freemartin e confrontare i dati ottenuti con quelli analizzati nell’ipotalamo di bovini maschi e femmine. Questo studio ci ha permesso di caratterizzare i dimorfismi sessuali tra maschili e femminili presenti nel nucleo suprachiasmatico (SCN) e nel nucleo contenete vasopressina-ossitocina (VON). L’ipotalamo dei freemartin mostrava per quanti riguarda il nucleo VON valori intermedi in termini di dimensioni e numero di cellule tra i valori maschili e femminili. Il SCN dei freemartins è risultato più grande rispetto a quello dei bovini maschi e femmine. Un ulteriore obiettivo è stato quello di studiare la morfologia della citoarchitettura della corteccia cerebellare tra bovini maschi, femmine e freemartin. Applicando un metodo statistico multivariato e multi-aspetto, abbiamo caratterizzato le differenze di genere tra gli strati del cervelletto in termini di dimensioni, regolarità e densità delle cellule.

La sous-famille des Suinae est largement répandue en Afrique au Plio-Pléistocène et a été abondamment utilisée pour corréler biochronologiquement les sites à hominidés en se basant sur l'évolution morphologique rapide des troisièmes molaires dans différentes lignées. À partir d'un échantillon important de suinés africains actuels, les schémas de variation morphologique crânio-mandibulaire et dentaire sont quantifiés par morphométrie géométrique. Ce référentiel actuel sert à estimer la variabilité morphologique dans le registre fossile. La révision de la paléobiodiversité du genre Kolpochoerus (le suiné plio-pléistocène le plus abondant) dans les bassins du Turkana et de l'Awash s'appuie sur l'étude anatomique et morphométrique de matériels publié et inédit découverts dans la basse vallée de l'Omo (formation de Shungura) et dans la vallée moyenne de l'Awash en Éthiopie. Une nouvelle espèce fossile est décrite, les trajectoires évolutives au sein de chaque espèce sont quantifiées, et les interprétations biostratigraphiques sont révisées. Les liens de parenté au sein du genre Kolpochoerus sont décrits grâce à l'analyse cladistique. L'étude de la paléoécologie des suinés africains est basée sur l'anatomie comparée et la biogéochimie des isotopes stables (carbone et oxygène). Les suinés fossiles présentent une gamme de taille importante, ainsi que des régimes alimentaires et des habitats variés. Les nouvelles connaissances acquises sur leur biodiversité, leur phylogénie, et leur écologie permettent de proposer une histoire paléobiogéographique des Suinae en Afrique
The subfamily Suinae is widespread in Plio-Pleistocene deposits in Africa, and was heavily used as a biochronological tool to correlate hominid-bearing sites based on the rapid morphological evolution of third molars in different lineages. A large sample of extant African suines enables to quantify patterns of variation in cranio-mandibular and dental morphology using geometric morphometrics. This modern referential is used to estimate the morphological variability in the fossil record. Revision of the paleobiodiversity of the genus Kolpochoerus (the most abundant Plio-Pleistocene suine) in Turkana and Awash basins is based on anatomical and morphometric studies of published and unpublished material discovered in the Lower Omo Valley (Shungura Formation) and in the Middle Awash Valley in Ethiopia. A new fossil species is described, evolutionary trajectories within each species are quantified, and biostratigraphic interpretations are revised. Phylogenetic relationships within the genus Kolpochoerus are described by the cladistic analysis. Paleoecological study of African suines is based on comparative anatomy and stable isotopic biogeochemistry (carbon and oxygen). Fossil suines display a wide range of body size, as well as various diets and habitats. The new results produced regarding their biodiversity, phylogeny, and ecology, enable to reconstruct a paleobiogeographic history of Suinae in Africa

Os golfinhos do gênero Tursiops distribuem-se em zonas tropicais e temperadas de todos os oceanos. No Oceano Atlântico Sul Ocidental (ASO) distribuem-se do estado do Pará, Brasil até a Província de Chubut, Argentina. Historicamente, o status taxonômico do gênero é bastante confuso e de difícil resolução. Muitas espécies para o gênero Tursiops já foram descritas, porém, atualmente existem três espécies reconhecidas: Tursiops aduncus, Tursiops australis e Tursiops truncatus. Estudos recentes sugerem a existência da espécie Tursiops gephyreus Lahille 1908 para o Atlântico Sul. Neste estudo, apresentamos a caracterização morfológica dos complexos tímpano-periótico de espécimes do gênero Tursiops ocorrentes no Sul do Brasil, Uruguai e Argentina.

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As infecções parasitárias são muito comuns em mamíferos marinhos e o estudo da helmintofauna em cetáceos tem sido utilizado como uma ferramenta para determinar aspectos biológicos e ecológicos dos hospedeiros, entre eles a definição de nichos, rotas de dispersão, hábitos alimentares e diferenciação de estoques populacionais. A toninha, Pontoporia blainvillei, pequeno cetáceo endêmico do Atlântico Sul Ocidental tem como principal causa de mortalidade em toda sua área de distribuição a captura acidental. O trato gastrointestinal de 87 toninhas, coletados de carcaças provenientes de captura acidental ou encalhe, no período de 2005 a 2017, no litoral de São Paulo foram analisados para identificar as espécies componentes da fauna parasitária gastrointestinal e avaliar variações nos níveis de infecção conforme o sexo, fase de desenvolvimento, sazonalidade e área de distribuição dos hospedeiros. Foram coletados 4.171 espécimes de helmintos, classificadas em cinco espécies: Anisakis sp. (Nematoda: Anisakidae); Andracantha sp., Bolbosoma turbinella, Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae), e Synthesium pontoporiae (Trematoda: Brachycladiidae). Os helmintos C. cetaceum, exclusivo do estômago e S. pontoporiae, encontrado tanto no estômago quanto no intestino apresentaram os maiores índices parasitológicos, enquanto as outras três espécies foram consideradas raras devido aos baixos índices parasitários. Houve diferença significativa na carga parasitária apenas para as fases de desenvolvimento, na qual indivíduos adultos e juvenis apresentaram maiores índices parasitológicos do que indivíduos filhotes. Os índices parasitológicos não variaram significativamente entre os sexos, sazonalidade ou área de distribuição dos hospedeiros. A comunidade parasitária componente do trato gastrointestinal de P. blainvillei no litoral de São Paulo difere parcialmente daquela descrita anteriormente, compreendendo duas espécies: Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae) e Synthesium pontoporiae (Digenea: Brachycladiidae). As espécies Anisakis sp., Bolbosoma turbinella e Andracantha sp. consistem em infecção acidental por ingestão de presa infectada e, portanto, não fazem parte da fauna parasitária do hospedeiro nesta área de estudo. Foram observadas variações de comprimento e forma em 18% (n= 377) dos helmintos Synthesium pontoporiae coletados, tratando-se de espécimes sexualmente maduros com tamanho inferior e superior ao descrito para a espécie. São necessários estudos moleculares para complementar a investigação sobre as causas da diferenciação de Synthesium pontoporiae em três morfotipos distintos no litoral de São Paulo, Brasil.
Parasitic infections are very common in marine mammals and the study of helminthfauna in cetaceans has been used as a tool to determine biological and ecological aspects of the hosts, as the definition of niches, dispersal routes, feeding habits and differentiation of population stocks. The franciscana dolphin, Pontoporia blainvillei, is a small cetacean endemic to the Western South Atlantic, beeing the bycath events the main cause of mortality throughout its distribution area. The gastrointestinal tract of 87 franciscanas, collected from carcasses from bycatch or stranding, from 2005 to 2017, in the coast of São Paulo were analyzed to identify the component species of parasitic gastrointestinal fauna and to evaluate variations in levels of infection according to sex, stage of development, seasonality and range of the hosts. A total of 4,171 specimens of helminths were collected and classified into five species: Anisakis sp. (Nematoda: Anisakidae); Andracantha sp., Bolbosoma turbinella, Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae), and Synthesium pontoporiae (Trematoda: Brachycladiidae). The helminths C. cetaceum, exclusive to the stomach and S. pontoporiae, found in both, stomach and intestine, presented the highest parasitological indexes, while the other three species were considered rare due to the low parasitic indexes. There was a significant difference in parasite load only for the developmental stages, in which adult and juvenile individuals had higher parasitological indexes than calves. Parasitological indices did not vary significantly between the sexes, seasonality or range of the hosts. The parasite community component of the gastrointestinal tract of P. blainvillei on the São Paulo coast differs partially from that described previously, comprising two species: Corynosoma cetaceum (Acanthocephala: Polymorphidae) and Synthesium pontoporiae (Digenea: Brachycladiidae). The species Anisakis sp., Bolbosoma turbinella and Andracantha sp. consists of accidental infection by ingestion of infected prey and, therefore, are not part of the host parasitic fauna in this area of study. Length and shape variations were observed in 18% (n= 377) of the collected Synthesium pontoporiae parasites, being sexually mature specimens with inferior and superior sizes to those described for the species. Molecular studies are needed to complement the research on the causes of the differentiation of Synthesium pontoporiae in three distinct morphotypes in the coast of São Paulo.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-08-24T14:52:05Z No. of bitstreams: 2 9 Dissertação Lucas Lara.pdf: 3578142 bytes, checksum: 6760f20c378431913428d900249ae51e (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5)
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Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES
Despite the large number of bone changes for cetaceans, there are few records about Inia spp. genre. When evaluating skull bone changes several osteological changes were observed in 63.8% of the total sample analyzed. Among the morphological changes we observed the presence of the third condyle; deviation of the rostrum; prognatism and bragnatism. Traumatic changes were also observed. Pathological changes, although less frequent, were also observed, cases of osteomyelitis; osteolysis; bone degeneration in the mandibular condyle; osteoarthritis; osteoarthroses and hyperostosis were observed. When examining teeth, there was a variation of 22 to 35 teeth per branch. The heterodontia was observed, having 2 types of teeth: cone type and molariform type. Were found fractured teeth and teeth with dental wear. Dentres dental pathological changes were found dental calculus (DC), similar caries lesions (SCL) and dental corrosion. Among the development changes were found ossification of the alveoli, pearl enamel, double root, pairs of adjacent teeth and supernumerary teeth. In assessing the relationship between the deviation of the rostrum and medium tooth wear, by the geometric morphometric three-dimensional, where after the analysis performed, there was no statistically significant relationship between the two factors, demonstrating that the diversion of the rostrum and the average wear of the teeth Inia spp. gender show a weak relationship in this study.
Apesar do grande número de relatos de alterações ósseas para cetáceos, há poucos registros acerca do gênero Inia spp. Ao avaliar as alterações ósseas sincranianas foram observadas diversas alterações osteológicas em 63,8% do total analisado. Dentre as alterações morfológicas observadas estavam a presença do terceiro côndilo; desvio do rostro; prognatismo e bragnatismo. Alterações traumáticas também foram observadas. Alterações patológicas, embora menos frequentes, também foram observadas, sendo encontrados casos de osteomielite; osteólise; degenerações ósseas no côndilo mandibular; osteoartrite; osteoartrose e hiperostose. Ao analisar os dentes, houve uma variação de de 22 a 35 dentes por ramo. A heterodontia foi observada, possuindo dentes do tipo cone e do tipo molariforme, sendo encontrado dentes fraturados, com desgastes dentários. Dentres as alterações patológicas dentárias, foram encontradas cálculo dentário (CD), lesões semelhantes à cárie (LSC) e corrosões dentárias. Dentre as alterações de desenvolvimento das arcadas, foram encontradas ossificação do alvéolo e nos dentes pérola de esmalte, raiz dupla, pares de dentes adjacentes e dentes supranumerários. Na avaliação da relação entre o desvio de rostro e desgaste dentário médio utilizou-se a morfometria geométrica tridimensional, onde após as análises realizadas, não foi observada relação estatisticamente significante entre os dois fatores, demonstrando que o desvio de rostro e o desgaste médio dos dentes nos exemplares do gênero Inia spp. analisados neste estudo apresentam uma fraca relação.

Os golfinhos do gênero Tursiops distribuem-se em zonas tropicais e temperadas de todos os oceanos. No Oceano Atlântico Sul Ocidental (ASO) distribuem-se do estado do Pará (0,604⁰S; 47,540⁰W), Brasil até a Província de Chubut (43,330⁰S; 65,050⁰W), Argentina. Historicamente, o status taxonômico do gênero é bastante confuso e de difícil resolução. No passado, novas espécies eram comumente definidas com base em pequenas variações morfológicas ou até mesmo estruturas incompletas, sem considerar possíveis variações individuais e ontogenéticas. Assim, mais de 20 espécies nominais foram descritas até o inicio do século XX para Tursiops. Embora estudos recentes sugiram o reconhecimento de mais uma espécie no Sul/Sudeste da Austrália, T. australis, a comunidade científica vem tratado com resistência esta questão e atualmente somente duas são correntemente aceitas (T. truncatus e T. aduncus). Para o ASO foram propostas duas subespécies: T. truncatus truncatus e T. truncatus gephyreus, as quais foram posteriormente sugeridas como espécies plenas: T. cf. truncatus e T. gephyreus. Neste estudo, apresentamos a redescrição morfológica dos espécimes ocorrentes no Sul do Brasil, Uruguai e Argentina, sugerimos a revalidação de Tursiops gephyreus Lahille 1908, outrora sinonimizada a T. truncatus para esta região e confirmamos a ocorrência de duas espécies de Tursiops no ASO.

There has never been any dispute that the family Suidae, being even-toed ungulates, belong to the Artiodactyla but their position within this order has undergone some revision over the past 10 years. The standard taxonomic arrangement is that of Simpson (1945). Though Simpson’s taxonomic philosophy was explicitly not based on phylogeny, his classification of the Artiodactyla has nonetheless been interpreted as reflecting the general outlines of artiodactyl evolution. This general schema is shown in Fig. 1.1, which is based largely on Thenius (1979), except that Thenius went against the general view by aligning the Tragulidae with the Cervidae. Since the 1970s, there has been a growing consensus that taxonomy should reflect phylogeny as far as possible, and in this context the revolution in the understanding of artiodactyl evolution that took place during the 1990s (summarized by Waddell et al. 1999) has left the taxonomy of the Artiodactyla in some disarray, particularly because it is now clear that the Cetacea (whales and dolphins) are nested deep within it, as a sister group to the hippos. The new phylogenetic understanding is shown in Fig. 1.2, and a new classification is proposed in Table 1.2. Some comments on this new classification follow: • Waddell et al. (1999), in combining the Cetacea with the Artiodactyla, call the combined order Cetartiodactyla. Helgen (2003), however, has argued that, since the Cetacea are actually nested within the artiodactyls, rather than being their sister-group, it is appropriate to continue to use the name Artiodactyla for the order. The pigs therefore continue to be artiodactyls, not cetartiodactyls. • The new names introduced by Waddell et al. (1999) are given no taxonomic rank, and I have given them ranks here. But under the Whippomorpha I have left the two subdivisions, Ancodonta and Cetacea, unranked rather than introduce parvorders and the like. • In Fig. 1.2 I have followed the phylogeny of Hassanin & Douzery (2003), but I have not given names and ranks to all their clades. Even given the turmoil into which the taxonomy of the Artiodactyla has been thrown, still no one disputes that the closest living relatives of the pigs are the peccaries (family Tayassuidae).

Introdução: O gênero Stenella possui cinco espécies descritas habitando áreas tropicais, subtropicais e temperadas dos oceanos Atlântico, Pacífico e Índico, com exceção de duas, endêmicas do Oceano Atlântico. Desses, o Atlântico Sul destaca-se com menos estudos, sendo o litoral amazônico um exemplo dessa situação, com nenhum trabalho realizado para o gênero, apenas registros. Objetivos: Mapear e caracterizar a distribuição do gênero no litoral amazônico em relação às variáveis ambientais locais, além de investigar a distribuição potencial de Stenella frontalis. Material e métodos: Foram realizadas 12 expedições oceanográficas entre fevereiro de 2018 e fevereiro de 2019 na plataforma continental amazônica em todas as estações. Eram totalizadas 8 horas de observações diárias, sempre durante o dia e com saída da cidade de São Luís (MA) e chegada em Vigia (PA). As variáveis ambientais foram obtidas no formato raster de dois bancos de dados públicos: Bio-ORACLE, com resolução de 9 km de célula por grade e MARSPEC, com dados em resolução de 1 km. As medianas das variáveis obtidas foram comparadas entre as três espécies registradas através do teste não paramétrico de Kruskal-Wallis. A modelagem de nicho ecológico foi realizada para S. frontalis no litoral amazônico, com auxílio do programa R v. 4.0.4, utilizando o algoritmo da Máxima Entropia – maxent. Resultados: A partir das expedições, 28 registros foram obtidos na região: S. frontalis (n=19), S. attenuata (n=7) e S. longirostris (n=2), indicando distribuição em pontos próximos à costa (até 1000 m) e possibilitando a elaboração de um mapa de distribuição para a plataforma continental amazônica. O teste de Kruskal-Wallis apontou para a inexistência de diferenças significativas entre as medianas das variáveis analisadas para as espécies. O modelo indicou áreas de maior adequabilidade para S. frontalis próximas à costa e ligeiramente a leste da foz dos rios Amazonas e Pará. Conclusão: A partir dos dados inéditos obtidos foi possível descrever a ocorrência do gênero para o litoral norte, que demonstrou distribuição principalmente localizada em áreas de alta produtividade. Este estudo é o primeiro para essas espécies na plataforma amazônica, contribuindo, significativamente, para o conhecimento do gênero Stenella no Atlântico Sul.