Dissertations / Theses on the topic 'Alternated Cycle'

Os campos elétricos alternados de frequência intermediária (10 KHz a 1MHz) e baixa intensidade têm efeitos inibitórios sobre o crescimento de várias linhagens celulares de tumores humanos e murinos. O objetivo geral do presente trabalho é conhecer os efeitos biológicos da aplicação externa de Campos Elétricos Alternados de intensidades de 10 V e 5 V nas frequências de 200kHz, 1Mhz e 2Mhz; em culturas de células de melanoma murino (B16F10) e fibroblastos humanos normais (FN1), durante 24 horas. Foram estudados os efeitos biológicos antiproliferativos e pró-apoptóticos através das seguintes análises: Citometria de Fluxo para identificar a distribuição das populações celulares nas fases do ciclo celular, Colorimétrico MTT para avaliar a viabilidade celular e Peroxidação Lipídica para avaliar a produção de radicais livres lipídicos poliinsaturados. Os resultados mostraram que em fibroblastos humanos normais o campo elétrico alternado induziu efeito antiproliferativo, indutor de necrose e apoptose, porém em menor efeito tóxico quando comparado às células de melanoma (B16F10), principalmente na frequência de 200 kHz. Por outro lado, na frequência de 2MHz e intensidade 10V, as células de melanoma presentes no sobrenadante e aderentes expressaram diferencialmente número de células mortas por apoptose (Anexina-V) e caspase-3 fosforilada. Os diferentes efeitos produzidos entre as duas linhagens estudadas atentam para o fato de que a compreensão dos mecanismos biofísicos da regulação do reparo e da proliferação celular envolve fenômenos celulares e vias de sinalização altamente complexas.
Electric fields of alternating intermediate frequency and low intensity have inhibitory effects on the growth of various tumor cell lines. The objective of this study was to evaluate the biological effects of external application of external alternating electric field (CEAE) intensities of 10 V and 5 V in the frequency 200kHz, 1MHz and 2MHz; in cultured murine melanoma cells (B16F10) and human fibroblasts normal (FN1). We studied the antiproliferative and pro-apoptotic by flow cytometry to identify the distribution of cell populations in the phases of the cell cycle, Colorimetric MTT to evaluate cell viability and lipid peroxidation to evaluate the production of free radicals lipid acids. The results showed that in fibroblasts (FN 1) the normal CEAE induced antiproliferative effect, inducing apoptosis and necrosis, but at a lower cytotoxic potential when applied to melanoma cells (B16F10), mainly in the frequency of 200 kHz. Moreover, the frequency of 2MHz and intensity 10V, the melanoma cells in supernatant and the members expressed differentially number of dead cells by apoptosis and caspase-3 phosphorylated. The different effects between the two strains studied to undermine the fact that understanding the biophysical mechanisms of regulation of repair and cell proliferation involves cellular phenomena and signaling pathways highly specific and complex.

Dans ce travail de thèse nous nous sommes intéressés à la dynamique de l’aimantation des nanoparticules magnétiques monodomaines en présence d’un champ magnétique alternatif (ac) d’amplitude et d’orientation arbitraire, en tenant compte de l’effet de l’agitation thermique, dans le contexte du modèle de Brown de rotation cohérente de l’aimantation. En particulier, nous nous sommes intéressés aux effets non-linéaires dus aux excitations d’un champ ac fort, dans la dynamique de l’aimantation des nanoparticules individuelles et les assemblées de nanoparticules sans interactions, dans une gamme de fréquence large (jusqu’à 10 GHz). Notre étude porte sur les nanoparticules avec une anisotropie uniaxiale et biaxiale. Nous avons calculé les grandeurs physiques pertinentes pour modéliser cette dynamique, telles que la susceptibilité dynamique non-linéaire, le temps de retournement de l’aimantation, et le cycle d’hystérésis dynamique (DMH). Les résultats obtenus montrent une forte dépendance de la réponse non-linéaire et de la DMH vis-à-vis de l’anisotropie, de la constante de biaxialité, de la température, ainsi que de l’amplitude et de l’orientation des champs dc et ac. De plus, contrairement aux particules uniaxiales, la réponse stationnaire non-linéaire et la DMH dépendent fortement de la direction azimutale du champ ac, et pas seulement de l’angle polaire entre l’axe facile et le champ externe. Ce travail de thèse apparait comme une nouvelle approche théorique des études de la dynamique de l’aimantation des nanoparticules magnétiques, sous l’action d’un champ ac fort, ouvrant la voie vers la solution d’autres problèmes non-linéaires
In the present work, the dynamics of the magnetization of single domain magnetic nanoparticles assisted by an external alternative current (ac) magnetic field of arbitrary strength and orientation, in presence of the thermal agitation, is treated in the context of the Brown’s model of coherent rotation of the magnetization. Our main objective was to treat nonlinear effects due to strong ac magnetic excitations in the dynamics of the magnetization of an individual nanoparticle and an assembly of non-interacting nanoparticles across a wide frequency range (up to 10 GHz). Our study has been focused on the nanoparticles both with a uniaxial and biaxial anisotropy. We have calculated the relevant physical quantities such as nonlinear dynamical susceptibility, magnetization reversal time, and dynamic magnetic hysteresis (DMH). The results show a strong dependence of nonlinear response and the DMH on the anisotropy constant, biaxiality constant, temperature, amplitudes and orientations of the dc and ac fields. Furthermore, in contrast to uniaxial particles, the nonlinear ac stationary response and DMH strongly depend on the azimuthal direction of the ac field and not only the polar angle between the easy axis and the external field vector. In the present work, we have developed a theoretical approach to treat the dynamics of the magnetization of the magnetic nanoparticles subjected to a strong ac field, opening a new way to the solution of other nonlinear problems

Life cycle assessment of soil remediation options:Study of options at Norrbyskär - which alternative has the least climate impact?  The purpose of this report was to make a life cycle assessment (LCA) to compare four suggested options for soil remediation at Norrbyskär, Umeå. The question formulation was to find out which option that had the least climate impact depending on the aim of the remediation. Main focus of the study was emissions of CO2 from transportation and machine work for each remediation option. The LCA was a screening and presented a good overview for the results. What sets the four remediation options apart is the amount of soil that is processed for each option. The LCA was performed according to the standards ISO 14040:2006 and ISO 14044:2006. Calculations in the report was performed with the LCA-software SimaPro and general data from EcoInvent. The results showed that the total emissions from each soil remediation option varied between 310 and 590 tonnes carbon dioxide equivalents (CO2e). The option that only included covering of the contaminated area with new soil had the least emissions and the option that included excavation and filling with new soil had the highest emissions. Both options do not fulfill the same goals in the end, though. One conclusion is that the more extensive remediation is the greater is the climate impact.

Thesis (S.M.)--Massachusetts Institute of Technology, Dept. of Nuclear Science and Engineering, 2008.
Cataloged from PDF version of thesis.
Includes bibliographical references.
The Department of Energy recently submitted a license application for the Yucca Mountain repository to the Nuclear Regulatory Commission, yet even the most optimistic timetable projects that the repository will not now open until at least 2020. The Office of Civilian Radioactive Waste Management recently revised the official undiscounted total life cycle cost of the waste management system upward by $22B (2000$), an increase of nearly 40% over the previous estimate, published in 2001. In this thesis a waste management tool, named SNuFManager (Spent Nuclear Fuel Manager), has been developed which deterministically simulates the stocks and flows of spent fuel in the United States and estimates annual expenditures based on the system's behavior. The tool allows policy makers to quickly and cheaply estimate the economic consequences of various decision alternatives under an array of scenarios in order to make quantitatively informed decisions and identify ways to mitigate or reverse recent increases in life cycle costs. The results are expressed in 2000 dollars, enabling a convenient comparison with the government's 2001 total system life cycle cost analysis. For each year of delay beyond 2020 in opening the repository and transferring ownership of spent fuel to the federal government, the total waste management system life cycle cost is estimated to increase by another $330M (2000$). The model also estimates that switching from the current mined geologic repository approach to a deep borehole disposal strategy would reduce the undiscounted total system life cycle cost by $19.4B, or 32%.
(cont.) Assuming a 10% discount rate, the net present cost of the deep borehole strategy is 18% less than that of the mined geologic repository approach. Finally, the model illustrates the economic benefits of opening a centralized interim storage facility of significant capacity as soon as possible. For example, if a 40,000 metric tonne facility, comparable in scale to the proposed Private Fuel Storage Facility in Utah, was opened by 2020, and the mined repository was opened in the same year, the total life cycle cost would be reduced by $1.5B relative to the case with no interim storage. If, moreover, the opening date of the mined geologic repository were delayed until 2040 or 2060, the savings provided by interim storage increase dramatically, to $4.9 and $8.1B, respectively. The thesis concludes with a discussion of the political and strategic consequences of several key policy choices.
by Taylor Allen Moulton.
S.M.

Le manuscrit présente la conversion du dioxyde de carbone en sucres C3 et C4 à l'aide de réactions en cascade chimio-enzymatiques stéréocontrôlées. Le processus repose sur une stratégie en deux étapes avec (i) la réduction catalytique et sélective à 4 électrons du CO2 en un dérivé bis(boryl)acétal suivi (ii) de couplage enzymatique C-C stéréocontrôlé du dérivé bis(boryl)acétal en sucres C3 et C4. La stratégie développée est sans précédent et représente une nouvelle approche pour l'utilisation du CO2 comme source Cn pour la synthèse de biomolécules énantiomériquement pures importantes sur le plan industriel. Le premier chapitre est une étude bibliographique décrivant (i) une introduction à la chimie des sucres avec un focus particulier dédié à la production de sucres à partir de CO2 et de formaldéhyde comme sources C1 et (ii) la réduction sélective et catalytique à quatre électrons du CO2 à l'aide d'hydroborane et d'hydrosilane utilisés comme réducteur pour la formation de dérivés bis(boryl)acétal et bis(silyl)acétal ainsi que leur utilisation comme sources de formaldéhyde ou substituts de formaldéhyde pour la synthèse de produits à haute valeur ajoutée. Le deuxième chapitre présente la synthèse et la réactivité des dérivés bis(boryl)acétal et bis(silyl)acétal. Notamment, un nouveau dérivé bis(boryl)acétal a été synthétisé avec succès et isolé à l'échelle du gramme. Le troisième chapitre décrit la bioconversion stéréocontrôlée du dérivé bis(boryl)acétal synthétisé à partir du CO2 en sucres. Notamment, une réaction enzymatique en cascade a été réalisée pour la production d'un sucre C4 énantiomériquement pur en utilisant le CO2 comme seule source de carbone
The manuscript presents the conversion of carbon dioxide into C3 and C4 carbohydrates using stereocontrolled chemo-enzymatic cascade reactions. The process relies on a two-step strategy with (i) the catalytic and selective 4-electron reduction of CO2 into a bis(boryl)acetal derivative followed by (ii) the stereocontrolled bio-catalyzed C-C coupling of the bis(boryl)acetal derivative into carbohydrates. The strategy developed is unprecedented and represents a new exciting approach for the use of CO2 as a Cn source for the synthesis of valuable industrially relevant enantiomerically pure biomolecules. The first chapter is a bibliographic study describing (i) an introduction to carbohydrate chemistry with a special focus dedicated to the production of carbohydrates from CO2 and formaldehyde as C1 sources and (ii) the selective and catalytic four-electron reduction of CO2 using hydroborane and hydrosilane as reductants for the formation of bis(boryl)acetal and bis(silyl)acetal derivatives and their use as formaldehyde sources or formaldehyde surrogates for the synthesis of value-added product. The second chapter presents the synthesis and reactivity of bis(boryl)acetal and bis(silyl)acetal derivatives. Notably, a new isolable bis(boryl)acetal derivative was successfully synthesized and isolated on a gram scale. The third chapter describes the stereocontrolled bioconversion of the bis(boryl)acetal derivative synthetized from CO2 into carbohydrates. Notably, an enzymatic cascade reaction was performed for the production of an enantiomerically pure C4 carbohydrate using CO2 as the only carbon source

Les phosphatases CDC25 sont des acteurs majeurs de l'activation des complexes CDK-Cycline dans les cellules eucaryotes, et constituent une cible essentielle des points de contrôle du cycle cellulaire. (i) Nous avons examiné le rôle des CDC25 humaines au cours du cycle cellulaire et lors de l'activation des points de contrôle, en remplaçant le gène cdc25 unique de la levure S. Pombe par les séquences d'ADN codant différentes phosphatases CDC25 humaines. (ii) Ensuite nous avons caractérisé la phosphorylation in vitro de CDC25B par les kinases p38 et MK-2, deux acteurs de la réponse cellulaire aux radiations ultraviolettes. (iii) CDC25 est phosphorylée et inhibée par la kinase Cds1/CHK2 lors de l'activation des points de contrôle, et nous avons montré l'existence d'un variant d'épissage de cette kinase, conservé de la levure à l'homme. (iv) Enfin nous présentons des travaux suggérant la participation de Cdc25 à des complexes de haut poids moléculaire dans la levure S. Pombe
CDC25 phosphatases are key players in the activation of CDK-Cyclin complexes in eukaryotic cells, and as such, are major targets of the cell cycle checkpoint pathways. (i) We have examined and compared the role of human CDC25 phosphatases during the cell cycle and in response to checkpoint activation, by generating fission yeast strains expressing the human CDC25 isoforms in place of endogenous Cdc25. (ii) We have studied the in vitro phosphorylation of CDC25B by MK-2 and p38, two kinases implicated in the UV-induced DNA damage response. (iii) CDC25 is phosphorylated and inhibited by the Cds1/CHK2 kinase during checkpoint activation, and we have discovered the existence of an evolutionarily conserved splice variant of this kinase. (iv) We also present some data suggesting that Cdc25 is associated with high density complexes in the fission yeast S. Pombe

Les protéines du complexe exon-jonction (WC) régulent l'épissage alternatif du transcrit Bc1-x, ainsi que d'autres transcrits reliés au contrôle de l'apoptose et du cycle cellulaire. L'épissage alternatif du transcrit 8c1-x constitue un événement déterminant pour les choix de vie ou de mort cellulaire en réponse aux stimuli internes ou externes. Les décisions d'épissage s'opérant sur BcI-x aboutissent à la production de deux transcrits majeurs, par utilisation de sites d'épissage 5' en compétition définissant l'exon 2. L'isoforme la plus longue, Bc1-x,, possède une activité anti-apopotique, alors que BcI-xs, amputé des 189 derniers nucléotides de cet exon, présente un potentiel pro-apoptotique. La fonction capitale de ces isoformes antagonistes justifie l'étroite régulation conditionnant leur expression. L'objectif premier de ces travaux de thèse a consisté à identifier des régulateurs protéiques de l'épissage alternatif de BcI-x, afin d'étoffer notre compréhension de cette régulation. L'utilisation d'un criblage à l'ARN interférence a mené à l'implication de plusieurs protéines du complexe exon-jonction (EJC) dans la régulation de cet événement d'épissage. Leur déplétion favorise l'épissage vers une production accrue de l'isoforme pro-apoptotique, corrélée à l'enclenchement de la mort cellulaire programmée. A la différence de leur fonction première au sein de l'EJC, les protéines formant le coeur de l'EJC, soit eIF4A3, 1114 et Magoh, ainsi que les composants s'y associant (RNP51, SAP18 et Acinus), influencent les décisions d'épissage prises sur le pré-ARNm BcI-x, indépendamment des fonctions d'export ou d'initiation du nonsense-mediated decay (NMD) communément associées à l'EJC. Une interaction sur le transcrit est d'ailleurs retrouvée pour la majorité de ces protéines, dans des extraits cellulaires totaux ainsi qu'in vitro. L'investigation des mécanismes moléculaires à l'origine de cette régulation révèlent que les éléments cis impliqués sont distincts, la fonction et la liaison des protéines e1F4A3, Y14 et Magoh étant assurée par un élément 82E, situé en aval du site d'épissage xs, alors que la protéine RNPS1 agirait en liant la portion centrale de l'élément SB1, en amont du site d'épissage xs. Par ailleurs, l'analyse en RT-PCR conduite à moyen débit sur des cellules ayant subi une déplétion de ces facteurs de l'EJC met en évidence des altérations de profils d'épissage concernant une dizaine de transcrits dont la fonction est associée au processus apoptotique. Le premier chapitre de cette thèse relate l'ensemble de ces observations et propose que certains facteurs de l'EJC assureraient une fonction régulatrice sur l'épissage de transcrits participant à l'échafaudage de l'apoptose. La deuxième partie de ces travaux relate les perturbations du cycle cellulaire engendrées par la déplétion de l'ARN hélicase eIF4A3, se traduisant notamment par une accumulation de dommage à l'ADN, ainsi que des défauts de formation de fuseau mitotique. L'analyse en RT-PCR du profil d'épissage de 192 transcrits dont l'ontologie est reliée à la progression du cycle cellulaire met en évidence des variations de l'expression des isoformes produites à partir de plusieurs de ces transcrits, incluant en particulier CDC25B, encodant une phosphatase dont l'activité est cruciale durant la transition G2/M. Les altérations de profil d'épissage retrouvées pour I-IDAC3, une histone déacétylase, et FOXM1, un facteur de transcription régulant de nombreux gènes du cycle cellulaire, pourraient expliquer en partie comment des dommages à l'ADN induisent potentiellement un blocage subséquent en mitose, menant à un processus connu sous le terme de catastrophe mitotique. Mes travaux de thèse suggèrent que plusieurs composants de l'EJC incluant particulièrement la protéine eIF4A3 auraient diversifié leur fonction vers la régulation d'événements d'épissage assurant la coordination entre la progression du cycle cellulaire et la survie. De ce fait, une diminution du niveau intracellulaire de ces facteurs enclenche des perturbations aboutissant ultimement à un arrêt de croissance et la mort cellulaire. [symboles non conformes]

Une méthode d'évaluation environnementale de tronçons routiers, modulaire, basée sur l'Analyse de Cycle de Vie et développée au LCPC, a été étendue aux calculs d'impacts et aux matériaux alternatifs. L'objet de cette thèse était de comparer des variantes d'autoroutes interurbaines utilisant des matériaux naturels et alternatifs et d'étendre l'outil associé au milieu urbain, tout en menant une réflexion sur l'accessibilité de l'outil par des non-spécialistes de l'environnement. Les spécificités de conception urbaine ont été implémentées sur une base de dimensionnement classique. L'extension aux matériaux alternatifs a été traitée pour des laitiers de hauts fourneaux. Plusieurs applications à des cas types de chaussées ainsi que des études d'ouvrages sont présentées. Une enquête sous forme d'entretiens et de questionnaires a été réalisée auprès de différents acteurs de la profession, permettant de dégager la place des critères environnementaux au sein du processus décisionnel.

La DMFSH est associée à une contraction de l’allèle D4Z4 localisé sur le chromosome 4q35 et à une dérégulation de la transcription des gènes situés en proximité, parmi lesquels FRG1 et ANT1. Nous avons analysé les propriétés biologiques de myoblastes obtenus à partir de muscles non dystrophiques et dystrophiques de patients atteints de DMFSH et sujets contrôles, ainsi que l’expression des gènes et protéines ANT1 et FRG1 et l’épissage des certains pre-ARNms spécifiques par ces cellules. A la différence des myoblastes provenant des muscles non dystrophiques, ceux provenant des muscles dystrophiques montrent une morphologie altérée et un défaut dans la prolifération et la différenciation myogénique. Le défaut de prolifération est associé à un blocage du cycle cellulaire en G0/G1 et à un processus de sénescence cellulaire précoce. De façon intéressante, le degré de dystrophie des muscles de patients atteints de DMFSH corrèle d’une part avec l’importance des anomalies biologiques détectées dans les cultures cellulaires correspondantes et d’autre part avec la surexpression de FRG1 et ANT1. De plus, la surexpression de la protéine FRG1 est associée avec la dérégulation de l’épissage des pre-ARNms spécifiques. Nos résultats suggèrent que dans la DMFSH, l’hétérogénéité de l’atteinte musculaire dépend de la susceptibilité différentielle des myoblastes à la contraction du locus D4Z4, qui se traduit par une dérégulation spécifique de l’expression de ANT1 et FRG1 et par des altérations de la biogenèse de ARNm. Ces résultats nous ont permis d’envisager un essai clinique de phase I/II de transfert autologue des myoblastes chez des patients atteints de DMFSH. Les résultats préliminaires de cet essai sont présentés et discutés
FSHD is associated to contraction of D4Z4 allele on chromosome 4q35 inducing a deregulation in expression of some proximal genes, including ANT1 and FRG1. We analyzed the biological properties of myoblasts cultured from dystrophic and non dystrophic muscles of FSHD patients and matched controls, together with the gene and protein expression of FRG1 and ANT1, and the splicing pattern of specific pre-RNAs. In contrast with myoblasts derived from non dystrophic territories, myoblasts derived from dystrophic muscles display altered morphology, proliferation and differentiation abilities in vitro and in vivo. Proliferation defect is related to a cell cycle arrest at G0/G1 and to premature cell senescence. Interestingly, the degree of dystrophic changes in FSHD muscles correlates with the extent of the abnormalities detected in corresponding cell cultures and with FRG1 and ANT1 gene and protein over-expression. Moreover FRG1 overexpression is associated with aberrant splicing patterns of specific pre-RNAs. Based upon these results we speculate that, in FSHD, heterogeneity of muscle wasting might be related to different susceptibilities of myoblasts to D4Z4 contraction, resulting in differential ANT1 and FRG1 overexpression and aberrant splicing of specific pre-mRNAs. Moreover, a phase I/II clinical trial of autologous myoblast transfer was set up in our Department. The preliminary results will be presented and discussed

La levure Yarrowia lipolytica est une levure oléagineuse capable de croître sur les substrats hydrophobes et les composés en C2 comme seul source de carbonne. La première partie de notre étude a permis de déterminer la localisation des protéines Lro1p et Dga1p impliquées dans la dernière étape de la synthèse des triglycérides. Ces protéines sont localisées dans la membrane cytoplasmique et à la surface des corps lipidique pour Lro1p et à la surface des corps lipidique pour Lro1p et à la surface des corps lipidiques pour dga1p. La deuxième partie de cette étude a permis d'avoir une idée plus précise du fonctionnement du cycle du glyoxylate chez la levure Y. lipolytica. Le premier objectif de cette deuxième partie de notre étude était de comprendre le fonctionnement du gène de la malate déshydrogénase chez cette levure. Contrairement à la levure S. cerevisiae qui possède trois gènes codant pour une malate déshydrogénaze, Y. lipolytica ne possède que deux gènes. Le premier gène YALI0D16753g code une malate déshydrogénase mitochondriale et le second gène YALI0E14190g présente une particularité d'épissage alternatif. En effet, le gène YALI0E14190g, en fonction de l'épissage, code une malate déshydrogénase cytoplasmique (séquence C-terminale PAN) ou une malate déshydrogénase adressée aux peroxysomes (séquence C-terminale AKI). Dans une troisième partie, nous nous sommes intéressés aux autres gènes du cycle du glyoxylate. La disruption du gène ICL1 a entrainé une incapacité de croissance du mutant sur acide oléique et sur les composés en C2 (éthanol, acétate). Néanmoins la suppression MLS et CIT2 n'a pas eu d'impact lors de la croissance sur les milieux nécessitant l'implication cycle du glyoxylate.

Det finns en oro kring konsekvenserna av ökade växthusgasutsläpp. Därför har bland annat EU:s medlemsländer tecknat avtal om att minska utsläppen. I Sverige har det lett till krav att från och med 2022 redovisa byggmaterials miljöpåverkan genom klimatdeklarationer. Byggsektorn har potential att minska klimatpåverkan. Byggnadsmaterial ger olika utsläpp av växthusgaser och valet av material är viktigt. Isoleringsmaterial med naturlig härkomst anses orsaka mindre utsläpp än konventionell isolering. Hampa är ett exempel på ett naturligt material som kan användas i småhusbebyggelse. Hampan kan bli en kolsänka då biomaterial binder kol. Tyvärr finns det idag mycket begränsad forskning på just hampfiberisolering i svenskt klimat.  Syftet med studien är att bidra med ökad kunskap inför valet av isoleringsmaterial i ett småhus, av modellen Eneryda av Rörvikshus, placerat i Växjö. I arbetet jämförs klimatpåverkan och kostnader för isoleringsmaterialen hamp-, cellulosa- och glasullsisolering genom en livscykelanalys (LCA) och en livscykelkostnad (LCC) i en vald husmodell. I studien undersöks skedena A-D, d.v.s. från vagga till grav. Resultatet visar att byggnaden isolerad med hampfiber orsakar det lägsta nettoutsläppet på 124 följt av cellulosa 132 och glasull 139 CO₂e/m². Kostnaden för byggnaden med isolering av hampfiber är 5467, cellulosa 4830 och glasull 4861 SEK/m²BOA. Genom att välja hampfiberisolering istället för glasull kan utsläppen för husmodellen Eneryda minskas med 12 % samtidigt som kostnaden ökar med 20 %. Att välja cellulosaisolering i stället för glasullsisolering ger en minskning av nettoutsläppen med 5 % och kostnaderna förblir detsamma.  Studiens känslighetsanalyser visar effekten av indata. Om råvaran till cellulosa byts ut från oanvänt papper till återvunnen råvara orsakar det att nettoutsläppen för byggnaden Eneryda minskar med 13 %. Det innebär att småhuset Eneryda isolerad med cellulosa från återvunnen produkt orsakar 15 % lägre utsläpp än glasullshuset - utan att påverka priset. Största påverkan på nettoutsläppen hade Enerydas värmesystem. Att använda bergvärme istället för Veab:s fjärrvärme ökade nettoutsläppen med 56 – 63 %. Slutligen ledde resultatet av studien till en diskussion om avsaknaden av en entydig definition och metod för användandet av biogent kol i klimatdeklarationer. Att exkludera biogent kol leder till att hampfiberisoleringen bidrar med högst utsläpp tätt följt av cellulosan och sist glasullsisoleringen som släpper ut minst. Studiens resultat påvisar vikten av vaksamhet och att Boverket borde blir tydligare kring det biogena kolet i klimatberäkningar. Enheten bör utvecklas mer av institut för standarder. Av resultaten framgår också vikten av att ta tidsaspekten av biomaterialets förnyelsetid i beaktande vid beräkningarna för att material som hampfiber binder kol snabbare än exempelvis trä.
The concern of climate change has influenced the building sector in Sweden to become more climate neutral. The choice of building materials affect the emissions of carbon dioxide equivalents [CO₂e]. The purpose of the study is to provide more basis for the choice of insulation material looking into the climate- and cost implication of hemp fibre, cellulose and stone wool insulation.  The study includes an accounting-LCA from cradle to grave (A – D) and an LCC. The study looks at the climate shell of a one-story single-family house, model Eneryda from Rörvikshus, in Växjö over the lifetime 50 years.  The result shows that Eneryda net emissions for hemp fiber insulation is 124 CO₂e/m²BOA and the cost is 5467 SEK/m2 BOA. The result of emissions for the hempfiber-model is 12% less and the cost is 20% higher than the glass wool-model. Cellulose insulation results in net emissions of 132 CO₂e/m² and a cost of 4830 SEK/m2 BOA. Cellulose results in 5% less emissions and nearly the same cost as the glass wool building.

La phosphatase CDC25B est un des acteurs clé des mécanismes de contrôle du cycle cellulaire. Elle est surexprimée dans un grand nombre de tumeurs et son ciblage pourrait présenter un intérêt thérapeutique en cancérologie. De nombreux aspects de la régulation de CDC25B restent encore mal compris, en particulier le rôle que pourraient jouer ses isoformes (CDC25B1, B2 et B3) issues d'un épissage alternatif. Pour aborder cette question, nous avons mis au point des outils nous permettant de suivre in cellulo et en temps réel l'expression des différentes isoformes de CDC25B par une approche de vidéomicroscopie. Nous avons ainsi mis en évidence une dégradation différentielle des isoformes de CDC25B au cours de la mitose. Nous avons également visualisé l'existence d'une navette nucléo-cytoplasmique des différentes CDC25B à la transition G2/M. Enfin, nous avons obtenu des résultats préliminaires sur la régulation de CDC25B après domages à l'ADN induits par un agent génotoxique
CDC25B is one of the three dual specificity phosphatases that control entry into mitosis through the dephosphorylation and subsequent activation of CDK1-CyclinB1 complexes. CDC25B has been reported to be overexpressed in a number of human tumours. In many cases, CDC25B upregulation is associated with more aggressive phenotypes thus making CDC25B an ideal target for cancer therapy. Regulation of CDC25B is still unclear. In particular, the specific functions of the three major splice variants of this phosphatase (CDC25B1, B2 and B3) remained to be clarified. In order to address this issue, we have constructed vectors that allows us to examine the expression and the localisation of the different isoforms in living cells by real time videomicroscopy. We have demonstrated that CDC25B isoforms have different mitotic stabilities. We have also observed a nucleo-cytoplasmic shuttling of the CDC25B phosphatases at the G2/M transition

Clostridium difficile est un bacille à gram-positif anaérobie strict et sporulant. Cet entéropathogène est responsable de diarrhées post-antibiotiques et de colites pseudomembraneuses. Après germination des spores dans le petit intestin, les cellules végétatives de C. difficile vont être soumises à de nombreux stress comme des peptides antimicrobiens, des variations d’osmolarité et de pH ainsi qu’une faible tension d’O2 à proximité des cellules épithéliales du colon. De plus, la production des toxines va favoriser une forte inflammation responsable de la production de nombreux composés oxydants tels que les espèces réactives de l’oxygène (ERO), du NO et des espèces réactives de l’azote (ERN). La présence de ces différents stress suggère que C. difficile possède des mécanismes de détection, de protection et de détoxification. Chez les firmicutes, plusieurs de ces mécanismes sont contrôlés par le facteur sigma alternatif impliqué dans la réponse générale aux stress, SigB. De manière intéressante des gènes codant SigB et ses régulateurs (RsbV et RsbW) sont présents dans le génome de C. difficile, cependant aucunes données concernant l’existence ou le rôle d’une réponse générale aux stress ne sont présentes chez cette bactérie. Nous avons dans un premier temps construit un mutant sigB et nous avons montré que cette inactivation n’entraînait pas de défaut de croissance. Via une analyse globale de l’expression des gènes, nous avons montré que SigB contrôle 20% des gènes de C. difficile à l’entrée en phase stationnaire. SigB contrôle négativement la sporulation. SigB contrôle positivement plusieurs gènes codant des protéines associées à la surface et pouvant intervenir dans le processus d’adhésion aux cellules de l’hôte. SigB joue également un rôle crucial dans l’adaptation aux stress rencontrés lors de l’infection dans le tube digestif et dans la colonisation. En effet, un mutant sigB est plus sensible aux pH légèrement acides, à certains peptides antimicrobiens, aux ERO, à différents composés générant du NO ainsi qu’aux faibles tolérances en O2. L’étude de la voie de signalisation aboutissant à l’activation de SigB a également été étudiée au cours de ce projet de thèse. Le gène sigB est le dernier gène d’un opéron constitué de CD0007 et CD0008, codant des protéines aux fonctions inconnues, ainsi que de rsbV et rsbW, codant respectivement le facteur anti-anti-sigma et le facteur anti-sigma. De manière intéressante, l’expression de sigB ne semble pas autorégulée chez C. difficile, à l’inverse des autres firmicutes. Les interactions entre RsbV et RsbW ainsi que RsbW et SigB, impliquées dans l’activation de SigB sont présentes chez C. difficile. La délétion du gène rsbV entraîne une augmentation de la sensibilité aux composés générant du NO et une diminution de la tolérance à l’O2. Ces résultats sont en accord avec la diminution de l’expression des gènes cibles de SigB chez le mutant rsbV. La phosphatase impliquée dans le processus d’activation de SigB, en déphosphorylant vraisemblablement RsbV, a également été identifiée et inactivée. La délétion du gène codant cette phosphatase, CD2685 conduit à l’augmentation de la sensibilité aux composés générant du NO ainsi qu’à la diminution de la tolérance à l’O2, en accord avec son implication dans la voie d’activation deσB. L’activité de SigB augmente suite à une carence nutritive. En effet, l’expression des gènes cibles de SigB est induite de manière dépendante de SigB et de RsZ à l’entrée en phase stationnaire ou après exposition au CCCP, un composé réduisant le niveau intracellulaire d’ATP. Ces travaux de thèse permettent d’établir un rôle prépondérant de SigB et de sa voie d’activation au cours de l’infection notamment dans la protection et la détoxification de stress majeurs que C. difficile est susceptible de rencontrer dans le tube digestif
Clostridium difficile is a tram-positive, anaerobic, spore-forcing bacterium. This enteropathogen is a major cause of antibiotic-associated diarrhea and of pseudomembranous colitis, a potentially lethal disease. After germination, vegetative cells encounter different stresses such as pH variations and hyperosmolarity as well as antimicrobial peptides. Moreover, the production of toxins triggers an important inflammation process leading to the production of several antimicrobial compounds such as reactive oxygen species (ROS), nitric oxide (NO) and reactive nitrogen species. The presence of these different stresses suggests that C. difficile has developed some mechanisms of detection, protection and detoxification. In the firmicutes, several of these mechanisms are controlled by the alternative sigma factor involved in the general stress response, SigB. Interestingly, genes encoding SigB and its regulators (RsbV and RsbW) are present in the genome of C. difficile, however less is known about the role of a general stress response in this bacterium. We constructed a sigB mutant and we showed that sigB inactivation does not lead to a growth defect. Using a transcriptomic analysis, we showed that SigB controls around 20% of the genes of C. difficile at the onset of the stationary phase. SigB negatively controls the sporulation process. SigB positively controls several genes encoding surface associated proteins likely involved in the adhesion to the host cells. SigB plays a crucial role in the stress management including several stresses C. difficile likely encounter during its infectious cycle. Indeed, the sigB mutant is more sentsitive to low pH, to some antimicrobial compounds, to ROS, to several NO-donor compounds as well as to low oxygen tension. The signaling pathway involved in the activation of SigB has been studied in the PhD project. The sigB gene is the last gene of an operon in which belong CD0007 and CD0008, encoding town unknown function proteins, as well as rsbV and rsbW, encoding the anti-anti-sigma factor and the anti-sigma factor of SigB, respectively. Interestingly, contrary to the other firmicutes, the expression of sigB does not seem to be auto-regulated. Protein interactions between RsbV and RsbW as well as RsbW and SigB, involved in the activation of SigB, are present in C. difficile. The disruption of rsbV leads to a higher sensitivity to NO-donor compounds as well as low oxygen tension. These results are in agreement with the decreased expression of several SigB target genes in the rsbV mutant. The phosphatase involved in the activation of SigB, likely by dephosphorylating RsbV, has been identified and disrupted. The disruption of CD2685, encoding this phosphatase, leads to a higher sensitivity to NO-donor compounds as well as a lower tolerance to low oxygen tension, in agreement with its involvement in the SigB activation pathway. The activity of SigB increased after an energetic starvation. Indeed, the expression of SigB target genes are increased in a SigB and CD2685 dependent manner at the onset of the stationary phase or after CCCP exposure, a compound decreasing the intracellular level of ATP. This work allows to show a crucial role of SigB and its activation pathway during the infection notably in the protection and the detoxification of the major stresses C. difficile is likely to encounter in the gut

Le gene de la calcitonine est un modele d'epissage alternatif codant pour deux peptides: la calcitonine (ct) et le calcitonin gene related peptide (cgrp). Chez les mammiferes, le role physiologique de la calcitonine est etabli dans la regulation du metabolisme phosphocalcique en tant que facteur hypocalcemiant et hypophosphatemiant. Chez les vertebres non mammaliens, le role physiologique de la calcitonine est encore tres controverse. Nous avons etudie l'expression de ce gene au cours du cycle de reproduction de la truite salmo gairdneri et du saumon oncorhynchus gorbuscha. Nous avons observe des variations importantes des taux de calcitonine plasmatique chez la femelle, demontrant un dimorphisme sexuel affectant les taux circulants de l'hormone. L'etude des variations des arn messagers specifiques de la calcitonine extraits du corps ultimobranchial de saumon nous a permis de confirmer cette difference entre les sexes et de suggerer un role de la calcitonine dans le cycle de reproduction des poissons. De plus, nous avons demontre l'existence de l'utilisation d'un deuxieme site de polyadenylation produisant un deuxieme arn messager plus court codant pour la calcitonine de saumon. D'autre part, nous avons montre l'existence d'arn messagers cgrp matures et leur expression dans le plasma et differents tissus du saumon. La presence simultannee des deux arn messagers ct et cgrp dans cette espece indique que comme chez les vertebres superieurs, les deux peptides font partie de la meme unite de transcription et sont produits par epissage alternatif du gene de la calcitonine. Le role physiologique du cgrp est totalement inconnu chez les vertebres non mammaliens. Les variations du cgrp plasmatique observees durant la migration suggerent que ce peptide pourrait lui aussi jouer un role au moment de la reproduction, cette periode etant associee a des modifications des hormones sexuelles mais aussi du milieu exterieur

Avec l'épuisement des ressources naturelles, notamment les sources d’énergies fossiles, les énergies renouvelables sont à nouveau considérées comme une alternative réelle pour la transition énergétique des pays industrialisés.Les moteurs à apport de chaleur externe comme le Stirling et son « cousin » le moteur Ericsson peuvent valoriser de multiples sources -renouvelables ou non- d'énergie thermique. Le moteur Ericsson est ainsi particulièrement bien adapté pour la conversion de l’énergie solaire ou de la biomasse en électricité dans des applications de microcogénération.Cette thèse s’inscrit dans la continuation des travaux théoriques et expérimentaux sur le moteur Ericsson réalisés au LaTEP de l'Université de Pau et des Pays de l'Adour. Dans ce travail, nous nous sommes principalement intéressés auxtransferts thermiques entre le fluide de travail et les parois des cylindres de compression et de détente du moteur. Un premier modèle, global, a permis de déterminer dans quelles conditions ces transferts thermiques peuvent améliorer les performances du système énergétique considéré. Un second modèle, ‘intracycle’, a permis d’évaluer les transfertsthermiques instantanés dans les cylindres à partir des corrélations habituellement utilisées dans les moteurs à combustion interne. Le prototype de moteur Ericsson a alors été équipé de différents capteurs de pression et de températures, ces derniers étant constitués de micro-thermocouples. Les relevés de température instantanée dans lecylindre de compression sont présentés commentés et comparés aux résultats obtenus par le modèle « intracycle »
With exhaustion of natural resources, in particular the fossil energy sources, renewable energies are again regarded as a real alternative for the needed energy transition of the industrialized countries. The "hot air engines" like the Stirling engine and his “cousin” the Ericsson engine, can use multiple thermal sources - renewable or not -. The Ericsson engine is thus particularly well adapted for solar or biomass energy conversion in electricity or for microcogeneration purposes. This thesis is a continuation of the theoretical and experimental work on the Ericsson engine realized in the LaTEP of theUniversity of Pau (France). In this work, we are mainly interested in the - in-cylinder - heat transfer between the working gas and the walls of the compression and expansion cylinders of the Ericsson engine. A first original model made possible to determine under which conditions these heat transfers can improve the performances of the energy system considered. A second model, “intracycle”, allowed to evaluate the instantaneous heat transfers in the cylinders starting from the correlations usually used in the internal combustion engines, reciprocating compressors and pneumatic springs. The Ericsson prototype was then equipped with various pressure and temperature gauges, the latter consisting of K-type microthermocouples of 25 and 12,5μm wires. The results of instantaneous temperature measurements in the compression cylinder are presented, commented and compared with the results obtained by the “intracycle” model

Les phenomenes lies a l'ancrage des lignes de flux (vortex), constituent des problemes de grande importance pour les applications futures des supraconducteurs a haute temperature critique; un fort piegeage etant associe a des densites de courant critique elevees. Le travail que nous presentons sur la dynamique de vortex est en etroite relation avec ces mecanismes de piegeage. Nous etudierons dans ce memoire, les differents modeles regissant la dynamique de vortex qui peuvent intervenir dans des monocristaux d'ybacuo et de bisrcacuo ainsi que dans une ceramique ysmbacuo. Le trace de cycles d'hysteresis sous champ alternatif en fonction de la frequence et l'amplitude du champ va constituer le support experimental de notre etude. L'analyse de ces cycles etablira que les modeles de relaxation d'aimantation thermiquement activee expliquent correctement les resultats obtenus sur les cristaux d'ybacuo, permettant de mesurer des energies d'ancrage. Par contre, du fait d'une anisotropie plus prononcee et d'une chute de la densite de courant critique a haute temperature, nous mettrons en evidence dans les composes bisrcacuo, une dynamique de vortex gouvernee principalement par des forces de viscosite

Klimatförändringarna blir allt mer omfattande i takt med att jordens befolkning ökar. Den negativa miljöpåverkan bottnar till stor del i användandet av råvaror och energiförbrukning vid skapandet av materiella ting. Enligt energimyndigheten (2015) står byggsektorn för ca 40 % av Sveriges totala energianvändning. För att minska energianvändningen har mål både på nationell och internationell nivå skapats. Målen är tänkta att skapa större förståelse av ett mer energieffektivt byggt samhälle för samtliga aktörer inom byggbranschen. En hållbar utveckling av husbyggandet kräver förutom att värna om miljön en beaktning av de ekonomiska och sociala aspekterna.   I det här examensarbetet har det undersökts om två specifika standardhus från en småhusleverantör kan utvecklas till passivhus med bevarad arkitektonisk karaktär. Studien syftar delvis till att undersöka om begreppet passivhus kan fungera som ett hållbart koncept för byggandet av enfamiljshus. Begreppet hållbar utveckling har begränsats och en förenkling har applicerats i arbetet. Den ekologiska aspekten representeras av energiberäkningar och eventuella åtgärder för att standardhusen ska uppnå kraven för passivhus. Den ekonomiska aspekten representeras av en livscykelkostnadsanalys med hjälp av nuvärdesmetoden och återbetalningsmetoden. Den sociala aspekten representeras av en utvärdering av förändring i boendekvaliteter vid utveckling från ett standardhus till passivhus. Studien presenterar även en alternativ utformning av ett passivhus med avsikt att främja positiva boendekvaliteterna.   Standardhusen tillhör en småhusproducent, Intressanta hus, som har sitt huvudsäte i Västerås. Husen utgörs av en villa på 147 m2 i ett plan med pulpettak samt en villa på 151 m2 i två plan med sadeltak. Med anledning av Intressanta hus geografiska läge har Västerås klimat använts som utgångspunkt vid energiberäkningarna. För att addera ytterligare en utmaning har även möjligheter för utveckling till passivhus undersökts för standardhusen i ett subarktiskt klimat i Kiruna. Västerås representerar därmed klimatzon III och Kiruna klimatzon I.   Resultaten avslöjade att det är möjligt att utveckla standardhuset i två plan med sadeltak till passivhus och samtidigt bevara den arkitektoniska karaktären i de båda klimatzonerna. Standardhuset med ett plan och pulpettak är endast möjligt att anpassa till passivhus i klimatzon III med bevarad arkitektonisk karaktär. Livscykelkostnadsanalysen visar med hjälp av nuvärdesmetoden att det är ekonomiskt fördelaktigt att investera i passivhus som ett koncept för en kalkylperiod på 50 år. Den boendekvalitet som främst förändras är bostadens ljusinsläpp och för passivhuset i ett plan är skillnaden av ljusinsläpp markant i klimatzon I.   Studiens slutsats är att konceptet passivhus är en metod av husbyggnation som främjar den hållarbara utvecklingen i förenklad form. Resultaten är framförallt positiva för klimatzon III men om byggnaden har låg formfaktor kan konceptet fungera bra även i kallare klimat som återfinns i klimatzon I.
The climate changes increases as the population increases. The negative environmental impact is mostly based on the use of raw materials and energy consumption in the production of various products. According to Energimyndigheten (2015), the building sector is the cause of about 40 % of Sweden's total energy use. In order to reduce the energy use goals have been created at both national and international levels. The goals are intended to create a greater understanding of a more energy efficient society for all actors within the construction industry. In addition to create a sustainable development of the building sector one needs to also take in account the social and economic aspects.   This master thesis examined whether two specific standard houses from a small house producer can be adapted to passive houses with a preserved architectural character. The purpose of the study is partly to investigate whether the concept of passive houses can serve as a sustainable concept of building single family houses. The concept of sustainable development has been simplified. The ecological aspect is represented by the energy calculations and possible actions that the standard houses need to achieve in order to meet the requirements for passive houses. The economic aspect is represented by a life cycle cost analysis using the Net Present Value method and the Simple Payback method. The social aspect is represented by an evaluation of changes in living qualities as the standard houses develops to passive houses. The study also presents an alternative design of a passive house with the purpose of improving the accommodation qualities.   The standard houses belong to a small-house-producer, Intressanta hus, who has their main market in Västerås. The houses is represented by a 147m2 villa with one floor and a pulpit roof and a 151m2 villa with two floors and a pitched roof. Due to Intressanta hus geographic location, the typical climate for Västerås has been used in the energy calculations. To add another dimension, opportunities for developing the standard houses to passive houses have also been investigated for the typical climate in Kiruna. Therefore Västerås represents climate zone III and Kiruna represents climate zone I.   The results revealed that it is possible to adapt the standard house with two floors and a pitched roof to a passive house while preserving the architectural character in both climate zones. The standard house with one floor and a pulpit roof is only possible to adjust to a passive house in climate zone III with a preserved architectural character. The life cycle cost analysis using the Net Present Value showed that it is an economical advantage to invest in a passive house in a period of 50 years. The accommodation quality that changes the most is the incident light in the houses and for the passive house with one floor the difference of light is remarkably high in climate zone I.

Une méthode d'évaluation environnementale de tronçons routiers, modulaire, basée sur l'Analyse de Cycle de Vie et développée au LCPC, a été étendue aux calculs d'impacts et aux matériaux alternatifs. L'objet de cette thèse était de comparer des variantes d'autoroutes interurbaines utilisant des matériaux naturels et alternatifs et d'étendre l'outil associé au milieu urbain, tout en menant une réflexion sur l'accessibilité de l'outil par des non-spécialistes de l'environnement. Les spécificités de conception urbaine ont été implémentées sur une base de dimensionnement classique. L'extension aux matériaux alternatifs a été traitée pour des laitiers de hauts fourneaux. Plusieurs applications à des cas types de chaussées ainsi que des études d'ouvrages sont présentées. Une enquête sous forme d'entretiens et de questionnaires a été réalisée auprès de différents acteurs de la profession, permettant de dégager la place des critères environnementaux au sein du processus décisionnel.

Le lac de Tonlé Sap (TSL), Cambodge, est un écosystème lac-rivière de forêt alluviale au régime d'écoulement alternatif. Le lac est un déversoir lors de l'inondation saisonnière du Mékong et sert de réservoir en période de basses eaux. La superficie du lac pendant la saison sèche (février à mai), est d'environ 2 700 km2 pour une profondeur d'environ 1 mètre. Cette superficie est pratiquement multipliée par six quand arrive la saison des pluies, pour atteindre près de 16 000 km2 et une profondeur de 9 mètres, noyant rizières et forêts. C'est le plus grand lac d'eau douce d'Asie du Sud-Est. C'est aussi l'une des zones de pêche d'eau douce les plus importantes et productives du monde avec près de 75% du volume annuel de pêche en eau douce du Cambodge, ce qui permet la survie de près de 2,5 millions de personnes. Les changements saisonniers du cycle hydrologique ont une influence sur la structuration des communautés de poissons à l'échelle temporelle et spatiale, mais aussi sur les comportements trophiques des principales espèces qui n'exploitent alors pas les mêmes habitats. Toutefois, le bassin versant du Mékong est en changement constant avec un développement important des infrastructures en lien avec l'eau : production d'hydro-électricité, besoins important en irrigation, maitrise des inondations, eau potable, ... Les changements climatiques accélèrent les modifications du cycle hydrologique annuel. Il est alors supposé que ces modifications ont des effets forts sur les habitats et les proies disponibles et finalement sur la biodiversité, notamment de l'ichtyofaune et sur l'abondance des poissons disponibles pour les pêcheries.Dans un premier temps, nous avons caractérisé les variations spatio-temporelles de la composition taxonomique des poissons et mis en lumière quels sont les déterminants de ces variations. À cette fin, nous avons estimé la diversité bêta comme la variance totale de la matrice site par communauté d'espèce et l'avons divisée en contribution locale à la diversité bêta (LCBD) et contribution des espèces à la diversité bêta (SCBD). Nous avons ensuite effectué plusieurs régressions linéaires pour déterminer si la richesse taxonomique, l'abondance des espèces et le niveau de l'eau expliquaient la variation temporelle de la contribution du site et de l'espèce à la diversité bêta. Nos résultats indiquent une forte variation temporelle de la diversité bêta due aux contributions différentielles des sites et des espèces à la variation spatiale de la composition taxonomique des poissons. Nous avons également constaté que la direction, la forme et l'effet relatif de la richesse spécifique, de l'abondance et du niveau de l'eau sur la variation temporelle des valeurs LCBD et SCBD varient grandement selon les sites. Ces résultats suggèrent ainsi une variation spatiale des processus conduisant à une variation temporelle de la composition de la communauté. Dans l'ensemble, nos résultats suggèrent que la composition taxonomique des poissons n'est pas distribuée de manière homogène dans l'espace et dans le temps et risque d'être affectée à l'avenir si la dynamique saisonnière d'écoulement du système est altérée par les activités humaines et/ou les changements climatiques. Dans un second temps, nous avons cherché à étudier le modèle d'évolution temporel des principales espèces en terme d'occurrence et d'abondance à travers le cycle saisonnier hydrologique
The Tonle Sap Lake (TSL), Cambodia, is a flood-pulse system. It is the largest natural lake in South- East Asia and constitutes one of the largest fisheries over the world, supporting the livelihood 2.5 million peoples. Seasonal change in annual hydrological cycle appears to have influence on fish community structure, both spatial and temporal variation, particularly on feeding behavior of TSL's fishes. Nonetheless, the Mekong River Basin is changing rapidly due to accelerating water infrastructure development (hydropower, irrigation, flood control, and water supply) and climate change, bringing considerable modifications to the annual flood-pulse of the TSL. Such modifications are expected to have strong impacts on fish biodiversity, abundance, reduced habitat and food availability within the lake. To invest how TSL's fish community structure responds to the seasonal change, how they shift their diet across hydrological cycles and feeding competing for food resource: First, we aim to characterize the spatio-temporal variations of fish taxonomic composition and to highlights the underlying determinants of these variations. For this purpose, we estimated beta diversity as the total variance of the site-by-species community matrix and partitioned it into Local Contribution to Beta Diversity (LCBD) and Species Contribution to Beta Diversity (SCBD). We then performed multiple linear regressions to determine whether species richness, species abundances and water level explained the temporal variation in the contribution of site and species to beta diversity. Our results indicate strong temporal variation of beta diversity due to differential contributions of sites and species to the spatial variation of fish taxonomic composition. We further found that the direction, the shape and the relative effect of species richness, abundances and water level on temporal variation in LCBD and SCBD values greatly varied among sites, thus suggesting spatial variation in the processes leading to temporal variation in community composition. Overall, our results suggest that fish taxonomic composition is not homogeneously distributed over space and time and is likely to be impacted in the future if the flood-pulse dynamic of the system is altered by human activities. Second, we aim to investigate the temporal pattern of the most occurrence and abundance species and how their co-occurrence pattern across hydrological cycles. We found that occurrence and abundance patterns were temporally varied at all water level seasons. Strong temporal variation in species occurrence was occurred with visiting species such as Labiobarbus leptocheilus and Poropuntius deauratus while water level starts to fill into the TSL. We further observed that the abundance of 17 species was strongly varied while other 22 species (mainly TSL's residential species) were stable within the year. Positive species co-occurrence pattern was generally higher than negative species co-occurrence at all water level seasons. Highest positive co-occurrence patterns were found during the period of decrease and low water level seasons while fishes are migrating from flooded areas, competing for resource and habitats during low water season. Study on temporal distribution and species co-occurrence of fish and how community responds to the seasonal change in hydrological cycles provides critical information for fisheries management and conservation in the Tonle Sap Lake (TSL) as well as maintaining fish biodiversity in the Mekong system. Third, the implications of seasonality on food web structure have been notoriously understudied in empirical ecology, particularly in TSL's system. The current study, we focus on seasonal changes in one key attribute of a food web, vertical trophic position of consumers

Le contexte des dernières décennies se caractérise par la forte croissance des mobilités et le rôle central qu'elles occupent dans l'insertion sociale et professionnelle des individus. La société contemporaine produit de nouveaux impératifs de déplacement qui modifient en profondeur notre rapport à l'espace et au temps. Pour autant, nous ne disposons pas tous de capacités identiques pour faire face à ces exigences changeantes et complexes. Les inégalités observées en matière de mobilité méritent donc une attention particulière dans la mesure où elles participent à la production et à la reproduction des inégalités socio-économiques. Partant de ce constat, cette thèse tente de mieux cerner le lien entre inégalités de revenu et mobilités, en intégrant les différentes facettes des mobilités dites « réversibles », en désagrégeant l'analyse par groupe de cycle de vie et en faisant explicitement apparaître l'influence de l'accès à l'automobile. Nous proposons ainsi d'identifier, de mesurer et d'interpréter les inégalités de mobilités grâce à des indicateurs simples permettant, sinon de recomposer la complexité du phénomène, tout au moins d'en présenter les différentes dimensions. Nous présentons une analyse méthodique de l'impact du revenu sur les pratiques de mobilité de semaine, de week-end et de longue distance à partir des données disponibles grâce aux enquêtes statistiques classiques sur la mobilité (Enquête Ménages Déplacements de Lyon 1995, Enquête Nationale Transport 1994). Les résultats obtenus montrent que les effets du revenu sont très hétérogènes selon le type de mobilité observé. Notre approche apporte ainsi des éléments de compréhension et d'éclaircissement sur les inégalités économiques de mobilités. Des pistes de réflexion sont également formulées pour une meilleure prise en compte des préoccupations en matière d'équité sociale dans la gestion durable des mobilités.

Les alternances calcaire-marne d'âge crétacé inférieur des sites océaniques DSDP 534 (Atlantique CentraI) et 535 (golfe du Mexique) et du bassin vocontien (Sud-Est de la France), représentant de beaux exemples de cycles de productivité du carbonate de calcium, ont été choisies comme cadre d'étude pour démontrer: - le lien entre les variations cycliques de la teneur en CaC03 et les paramètres orbitaux (Crétacé inférieur vocontien) ; - le lien entre les variations relatives des" flux de matière" et les fluctuations du niveau marin relatif (Crétacé inférieur des sites DSDP et du bassin vocontien). Pour mener à bien ce travail, deux techniques d'étude: l'analyse spectrale et le traitement d'images, ont été utilisées. L'analyse spectrale des fluctuations de la teneur en CaC03 pour l'intervalle Berriasien-Barrémien de la série d'Angles-Vergons (bassin vocontien) a permis de mettre en évidence : la présence de cycles carbonatés significatifs dont les périodicités sont situées en majorité dans la bande de fréquence de Milankovitch ; le signal Ie plus clairement enregistré est le cycle de l'obliquité; une caractérisation du passage des alternances à dominante calcaire aux alternances à dominante marneuse par, une augmentation du taux de sédimentation et un changement dans l'enregistrement du signal astronomique apparent: le signal de la précession est prépondérant dans les formations à dominante calcaire alors que celui de l'obliquité ressort le plus nettement dans les formations à dominante marneuse. L'analyse d'images, appliquée aux photographies en noir et blanc de sédiments carottés alternants et montrant une bonne différenciation lithologique, comme ceux des sites DSDP 534 et 535, est une méthode rapide permettant d'exprimer les flux linéaires ct leurs variations relatives avec une résolution temporelle de 300 000 à 500 000 ans (temps moyen de dépôt d'une carotte DSDP). Cette méthode n'est par contre pas applicable aux sédiments de la série vocontienne à l'affleurement. L'étude comparée des variations relatives des flux linéaires de matière dans les sites océaniques ne permet pas d'isoler un signal eustatique global continu mais est à même de faciliter la lecture de messages variés (eustatisme, climat, tectonique) enregistrés par les dépôts profonds dans les différents sites.

This thesis presents a critical appraisal of several differing approaches to the design and testing of fault detection (FD) algorithms monitoring the instrumentation used in the alternated aerobic/anoxic cycles (AC) process for nitrogen removal. Several features are selected as the basis of the FD, involving the slope and the timing of the process measurements of the various nitrogen compounds. Two separate FD algorithms have been developed for the anoxic and the aerobic phases, requiring a separate tuning but sharing the same principles: first some low-level checks are performed on the raw signals, discriminating gross malfunctions like missing data and spikes, then more sophisticated methods are used to investigate the presence of more subtle anomalies that were not detected by the previous screening. The FD problem is treated either in terms of classification problem, testing different algorithms such as binary trees, support vector machines (SVM) and principal component analysis (PCA), or as a forecasting one, using the Bayesian theory to predict the faulty or normal state of the process based on the previous records. An operational data set obtained from a municipal plant was used to first train the algorithm. However, due to the fairly limited information which could be extracted, a more comprehensive data set was created building an AC model based on the standard Benchmark simulation model with improved nitrogen kinetics and seasonal temperature variations. Detailed sensor models were also included, so that the occurrence of faults could be totally controlled, both in kind and timing. The performances of the various methods on either the operational and the synthetic datasets have been assessed comparing the anomalies detected by the methods with those actually observed. While the great majority of the gross faults is successfully detected by the preliminary screening, differing performances of the subsequent finer detection are obtained, depending on both the quality of data set and the detection method used: poorer results are observed using the plant data, in part due to an insufficient characterization of the fault events and in part due to the limited number of signals monitored. The higher availability of measurements provided by the numerical model, instead, enhances the discrimination capabilities of the tested methods, especially the nonlinear SVM, while the PCA-based approach and the Bayesian predictor results less affected by a change in the combination of diagnostic parameters used.

碩士
國立中山大學
資訊工程學系研究所
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In this thesis, a 10-bit resolution analog-to-digital converter with 100MHz sampling frequency is proposed. In terms of design, in order to improve the conversion speed, the 2b/cycle conversion is adapted in the conversion of the upper bits. Since three comparators are required to perform the 2b/cycle conversion, it may cause the increase of the error probability. Therefore, the proposed architecture adapts the non-binary correction technique in the upper bits to tolerate fault error and hence correct the error. In the lower bit conversion, a 1b/cycle conversion is implmented to increase the accuracy. Moreover, the architecture also adopted the alternate technique in lower bit conversion to improve the conversion efficiency. This technique not only uses the comparators more efficiently, but also relaxing the issue of the longer comparison time in the lower bit conversions. At last, a redundant bit is added in the lower bits to increase the fault tolerance capability of the lower bits. This thesis implements a 10-bit analog-to-digital converter with 100MHz sampling frequency by using the TSMC 90nm process technology. For the static analysis, the DNL and INL are +1.248 / -0.750 LSB and +1.679 / -1.677 LSB, respectively. For the dynamic analysis, the SFDR and SNDR at the Nyquist rate are 62.76 dB and 56.099 dB. The ENOB is 9.026 bit, the power consumption is 2.397 mW and FoM is 45.98 fJ / conv.-step.

The chimeric Alb-uPA SCID mouse that has been transplanted with human hepatocytes is a model to facilitate in vivo study of HCV. We explored further development of the model by using repopulation with immortalized human hepatocytes (IHH) in place of primary human hepatocyte (PHH) transplantation to support HCV infection. In vitro HCV studies typically utilize a human hepatoma cell line (Huh7) and rely on transfection with transcribed genomic RNA derived from a unique HCV strain (JFH1). Unfortunately, this system has not been successful in support of infection with serum-derived HCV (HCVser). IHH may offer an alternative since their differentiation status remains close to that of PHH. IHH transfected with HCV RNA (H77 or JFH1) or infected with HCVser showed stable intracellular and supernatant HCV RNA by real-time RT-PCR. IHH showed intracellular HCV NS3 proteins. HCV transfected or infected IHH secrete infectious HCVcc for in vivo and vitro.
Experimental Surgery

Ste2p and Ste3p are well-characterized yeast pheromone G-protein Coupled Receptors (GPCR) those are involved in the signaling of mating responses that lead to cell fusion. Their signaling–associated interactions with G-protein/MAPK signal transduction machinery are well established, homologous to those in mammalian systems, and serve as a simplified model system in GPCR research. While the arrestin- mediated biased signaling mechanism of mammalian GPCR has not been discovered for the pheromone receptors, a recent demonstration of α-arrestins being involved in the internalization of the pheromone GPCR, Ste2p was reported. The present study was designed to reevaluate and extend the alternate functionality for pheromone receptors and to determine the role of yeast arrestins in the yeast mating. Specific residues in the TM6 of Ste2p exhibiting strong mating and constitutive MAPK signaling were combined and investigated in terms of their effect on MAPK signal transduction leading to cell cycle arrest as well as their impact on downstream mating projection formation and zygote formation events. Our findings indicate that Ste2p possess as specific residues that govern its relative bias for mediating MAPK signaling or mating events. Relative dose response experiments accounting for systemic and observation bias for these mutations yielded evidence of mutational-derived functional biases for Ste2p and further validated the alternate pheromone dependent functionalities for Ste2p. Further, arrestin knockout and knock-in studies showed that Art1 (Ldb19) is selectively involved in the regulation of zygote formation but not MAPK signal transduction following the binding of ligand to Ste2p receptors. In addition, ligand stimulated selective localization of Art1 (Ldb19) to the mating projection, implicating it in the regulation of downstream mating functionalities. Overall, while leaving the full mechanism of alternate/biased Ste2p signaling to be elucidated, these results highlight the possibility of continued relevance of the yeast pheromone-mating pathway as a simplified model for GPCR research in the context of arrestin-mediated biased GPCR signaling.