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Dissertations / Theses on the topic 'Activité antimicrobiennes'
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Thiebault, Nicolas. "Propriétés antimicrobiennes et anti-inflammatoires de saccharides : étude structure / activité." Amiens, 2008. http://www.theses.fr/2008AMIE0100.
Full textAbstract:
L’objectif de ce travail était de synthétiser et de caractériser des saccharides modifiés en position anomère ou modifiés régiosélectivement en position primaire. Dans un premier temps, une disubstitution régiosélective du maltotriose (DP3) a été réalisée et optimisée en une seule étape donnant un intermédiaire clef permettant l’accès à des dérivés dialkylmaltotriosides. Ensuite, nous avons réalisé la synthèse de S-alkylglycosides et de O-alkylglycosides modifiés en position anomère, avec de bons rendements, afin de mener une étude structure / activité. Dans un second temps, nous avons évalué les propriétés antimicrobiennes de tous ces composés. Nous avons observé que les dérivés S-alkylglycosides ne présentaient peu ou pas d’activité alors que les composés O-alkylmaltodextrines seuls ou en mélange montraient des activités antimicrobiennes intéressantes. Dans un troisième temps, une évaluation de l’activité anti-inflammatoire de tous ces composés a été menée. Encore une fois, les dérivés S-alkylglycosides ont présenté peu ou pas d’activité, tandis que les dérivés O-alkylmaltodextrines seuls ont montré des activités anti-inflammatoires fortes mais surtout les mélanges de ces derniers ont conduit à une synergie d’action sur l’inhibition d’IL8 encore jamais décrit dans la littératureThe aim of this work was to synthesize and characterize the carbohydrates derivatives modified in anomeric position or in primary position regioselectively. In the first time, a regioselective disubstitution of maltotriose (DP3) was carried out and optimized in only one step giving a key intermediary to the accesses of dialkylmaltotriosides derivatives. Then, we carried out the synthesis of S-alkylglycosides and O-alkylglycosides modified in anomeric position, with good yields, in order to undertake a study structure/activity. In the second time, we evaluated the antimicrobial properties of all these compounds. We observed that the S-alkylglycosides derivatives exhibit weak or no activity whereas the O-alkylmaltodextrines compounds alone or in mixture showed interesting antimicrobial activities. In the third time, an evaluation of the anti-inflammatory drug activity of all these compounds was carried out. Once again, the S-alkylglycosides derivatives presented weak or no activity, while the O-alkylmaltodextrines derivatives alone showed significative anti-inflammatory drug activities. Moreover, mixtures of the latter led to a synergy of action on the inhibition of IL8 never yet described in the literature
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Andraud-Dieu, Amandine. "Recherche de molécules antimicrobiennes d'origine lichénique : Etude phytochimique de trois lichens & approche synthétique de deux composés actifs." Thesis, Limoges, 2015. http://www.theses.fr/2015LIMO0029/document.
Full textAbstract:
L’étude physicochimique de trois lichens récoltés en Limousin, Usnea florida, Flavoparmelia caperata et Cladonia incrassata, a permis d’isoler et de caractériser 16 composés issus du métabolisme secondaire. Dans un premier temps, ces lichens ont été sélectionnés lors d’un criblage analytique préliminaire réalisé sur 17 espèces. L’activité antimicrobienne des extraits acétoniques a été évaluée, puis leur fractionnement bioguidé a été mis en œuvre. Les deux isomères de l’acide usnique, 3 dibenzofuranes, 4 depsides, 3 depsidones, un acide aliphatique, un phtalide et un stérol ont été isolés. Une xanthone trichlorée, la cladoxanthone A, a été extraite et identifiée pour la première fois à partir d’une source naturelle. L’effet de tous les composés a été évalué sur Staphyloccocus aureus par bioautographie. Pour les produits isolés en quantité suffisante, des tests de dilution en milieu liquide ont permis de déterminer leurs CMI, en comparaison avec le Phénonip®, conservateur couramment utilisé dans l’industrie cosmétique. Les acides didymique et condidymique en particulier s’avèrent être de bons candidats pour une utilisation en tant que conservateurs. Dans un second temps, compte tenu de leur potentielle application industrielle, nous avons exploré des voies de synthèse de l’acide usnique et de la cladoxanthone A. Ainsi, la préparation de l’intermédiaire clé pour l’accès à l’acide usnique a été optimisée et les premiers essais de couplage en présence d’une porphyrine sont encourageants. De même, les voies de synthèse proposées et mises en œuvre pour la cladoxanthone A sont prometteusesPhytochemical study of three lichens collected in Limousin, Usnea florida, Flavoparmelia caperata and Cladonia incrassata, led to the isolation and the structural identification of 16 secondary metabolites. First, these lichens were chosen after a preliminary screening performed on 17 species. Antimicrobial activity of acetone extracts was evaluated and bioassay-guided fractionation was performed. The two isomers of usnic acid, 3 dibenzofurans, 4 depsides, 3 depsidones, one aliphatic acid and one sterol were isolated. A trichlorinated xanthone, named cladoxanthone A, was extracted and identified for the first time in a natural source. A bioautographic protocol was used to evaluate antibacterial activities of these compounds on Staphylococcus aureus. MICs of the products obtained in sufficient amounts were determined by a broth microdilution method in parallel with Phenonip®, a preservative commonly used in cosmetic industry. Didymic and condidymic acids were found to be good candidates for use as preservatives. Secondly, owing to their potential industrial application, we explored synthetic routes for usnic acid and cladoxanthone A. Thus, the preparation of the key intermediate for access to usnic acid was optimized and the first coupling tests in the presence of a porphyrin were encouraging. Similarly, the proposed synthetic routes for cladoxanthone A are promising
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Abbassi, Feten. "Caractérisation structurale et fonctionnelle des temporines-SH : de nouveaux peptides antimicrobiens isolés chez l'espèce de grenouille nord-africaine Pelophylax saharica." Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066702.
Full textAbstract:
Durant cette thèse, nous avons étudié le répertoire peptidique antimicrobien de la grenouille Pelophylax saharica. Nous avons identifié trois nouvelles temporines : Temp-SHa, -SHb et -SHc. Les temporines sont de petits peptides antimicrobiens (13-14 résidus) surtout actifs contre les bactéries Gram+. Seule la Temp-SHa s’est révélée très active, particulièrement contre les bactéries Gram- et contre le parasite Leishmania infantum. Parmi les temporines (13 résidus, charge nette +2), la Temp-SHa présente la meilleure activité et le plus large spectre antimicrobien. L’analogue [K3]Temp-SHa plus cationique que le peptide parent est, quant à lui, beaucoup plus antimicrobien. Il perturbe plus efficacement et sélectivement les modèles membranaires anioniques et perméabilise la membrane de bactéries Gram- (E. Coli). La petite taille de l’analogue [K3]Temp-SHa, son fort pouvoir antimicrobien et son large spectre d’action en font un bon candidat pour une utilisation potentielle en thérapeutique
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Al, Hallak Mohamad. "Etude de la contamination fongique de l'air et des matériaux et de l'aérosolisation pour l'amélioration de la qualité de l'air intérieur." Electronic Thesis or Diss., Université de Toulouse (2023-....), 2024. http://www.theses.fr/2024TLSES011.
Full textAbstract:
La pollution de l'air intérieur est une cause importante de divers problèmes de santé pour les occupants tels que des maladies respiratoires, des symptômes allergiques... De nos jours, les gens passent 80 à 90 % de leur temps à l'intérieur, d'où l'importance de comprendre les principales causes de la pollution de l'air intérieur et de trouver des solutions appropriées pour améliorer la qualité de l'air intérieur (QAI). L'Organisation Mondiale de la Santé (OMS) a signalé en 2009 que la pollution biologique était l'une des principales causes de la dégradation de la QAI. Sous certaines conditions (humidité élevée), les fungi peuvent se développer sur presque tous les matériaux de construction. Ils produisent alors des particules telles que des spores, des toxines ou des composés organiques volatils (COV) et d'autres métabolites pouvant être aérosolisés. La libération de particules par les surfaces dépend de différents facteurs, notamment du type et de l'âge des micro-organismes, des propriétés des matériaux et des conditions environnementales (température, humidité, vitesse de l'air). En fonction de leur taille et de leur disponibilité dans l'air intérieur, elles peuvent être inhalées par les occupants, ce qui entraîne de graves risques pour la santé car elles peuvent pénétrer plus ou moins profondément dans le système respiratoire. Pour répondre à cette problématique, ce travail visait à étudier les relations qui peuvent éventuellement exister entre les micro-organismes, en particulier les fungi, présents sur les surfaces et les particules en suspension dans l'air qui contaminent l'air intérieur (in situ et en laboratoire). L'objectif étant d'avoir une vision plus claire de la contamination fongique dans l'environnement intérieur, permettant ainsi une meilleure gestion des risques pour la santé des personnes exposées. En outre, une étude sur les performances de photocatalyseurs et d'esters de glycérol en tant que produits antimicrobiens pour les matériaux de construction ont été réalisées. Dans un premier temps, une campagne d'échantillonnage in situ a été réalisée dans une maison avec présence fongique visible dans le sud de la France. Des échantillons de surface et d'air intérieur ont été prélevés et analysé pour identification des organismes présents. L'objectif de cette partie était de vérifier la relation, s'il y en a une, entre la contamination fongique sur les surfaces et la contamination aérienne. Ensuite, des expériences sur les activités antimicrobiennes de produits photocatalytiques et d'esters de glycérol ont été réalisées dans différentes conditions expérimentales. L'objectif de cette partie était de tester leur efficacité en tant que produits antimicrobiens pouvant être utilisés comme additifs dans les peintures ou les revêtements. Les tests effectués dans cette partie étaient des tests préliminaires en solutions aqueuses et l'impact des différentes conditions sur l'efficacité de chaque produit a été évalué. L'efficacité de trois photocatalyseurs (TiO2, ZnO, AuZnO) en tant que produits antimicrobiens a été évaluée à des intensités lumineuses proches des conditions intérieures réelles. L'efficacité de l'Acide Undécylénique (AU) et de trois esters de glycérol en tant que produits antifongiques a également été évaluée. La dernière partie de cette étude visait à étudier la relation entre la prolifération sur matériaux et la concentration en spore dans l'air dans des conditions contrôlées (principalement le flux d'air et l'humidité relative). Un dispositif expérimental innovant a été développé. La conception et la validation d'un protocole expérimental permettant d'observer des corrélations quantitatives entre la prolifération sur matériaux et la contamination de l'air ont été effectuées. L'impact de différents paramètres sur l'aérosolisation des particules a été évalué. La validation de ce banc expérimental est encourageante et permettra de poursuivre différents essais dans un avenir procheIndoor air pollution is an important cause of diverse health problems for occupants including respiratory diseases, allergic symptoms, cancers, and cardiovascular problems. People spend 80-90% of their time indoors emphasizing the importance of understanding the main causes of indoor air pollution and finding suitable solutions to improve indoor air quality. The World Health Organization (WHO) reported in 2009 that biological pollution is one of the main causes of the degradation of indoor quality. In humid indoor environments, fungi can grow and develop on almost all building materials. Upon their development on surfaces, they produce particles such as spores, toxins or volatile organic compounds, and other metabolites that can be aerosolized. The release of particles from surfaces as well as their characteristics is dependent on different factors including the type and age of microorganisms on the surface, material properties, and environmental conditions (temperature, humidity, air velocity). Based on their sizes and their duration of availability in the indoor air, they can be inhaled by occupants, leading to serious health risks as they may penetrate different depths in the respiratory system. To respond to these issues, this work aimed to investigate the relations that may exist between microorganisms, especially fungi, present on surfaces and airborne particles contaminating the indoor air (In situ and in the lab). It would provide a clearer vision of fungal contamination in the indoor environment and would be helpful during investigating methods for controlling the growth of fungi indoors. In addition, investigations on the performances of selected photocatalysts and glycerol esters as antimicrobial products for reducing microbial contamination on surfaces in the laboratory were achieved. Initially, an In situ sampling campaign was held in a visibly contaminated house in Southern France. Surface sampling from contaminated materials and indoor airborne sampling were carried out. Then, DNA analysis for samples was carried out by Toulouse Biotechnology Institute (TBI). This part aimed to check the relationship, if any, between fungal contamination on surfaces and airborne contamination. Then, experiments on the antifungal and antibacterial activities of photocatalytic products and the antifungal activity of glycerol esters were carried out under different experimental conditions. This part aimed to test their efficiency as antibacterial/antifungal products that may be applied as additives in paints or coatings. The tests carried out in this part were preliminary tests in aqueous solutions and the impact of different conditions on the efficiency of each product was evaluated. The efficiency of three photocatalysts (TiO2, ZnO, Au-decorated ZnO) as antimicrobial products under light intensities close to real-life indoor conditions. The efficiencies of Undecylenic Acid (UA) and of three glycerol esters, formed upon esterification of Glycerols with UA, as antifungal products were evaluated. The last part of this study aimed to investigate the relationship between surface contamination and airborne contamination under controlled conditions (mainly airflow and relative humidity). A new experimental device was settled, design and validation of an experiment protocol that permit to determine the quantitative correlation between surface contamination and airborne contamination were carried out. The impact of different experimental parameters on the aerosolization of particles from contaminated surfaces into air was evaluated. The validation of this experimental protocol was important and brought attention to different tests that will be investigated in the near future
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BOUCHIKHI, TOURIA. "Activite antimicrobienne de quelques huiles essentielles." Clermont-Ferrand 2, 1994. http://www.theses.fr/1994CLF21670.
Full textAbstract:
Ce travail a pour but d'ameliorer la methode de determination de l'activite antimicrobienne des he et d'etudier leur mode d'action sur les parois et les membranes des cellules microbiennes. La premiere partie est une mise au point d'une nouvelle methode de dispersion des he dans une solution d'agar 0,2% en echange des detergents et des solvants. Les he d'origan, de thym et de girofle ont montre une activite bacteriostatique et bactericide plus elevee quand elles sont dispersees dans l'agar qu'en presence des autres agents de dispersion (ethanol, tween et triton). Ceci montre que les detergents et les solvants exercent un effet inhibiteur sur l'activite antimicrobienne. La deuxieme et la troisieme partie montrent par des methodes biochimiques et microscopiques que les he de girofle et d'origan agissent principalement grace a leurs constituants majoritaires phenoliques (eugenol et thymol) en provoquant des alterations des parois et des membranes de trois types de microorganismes (e. Coli, b. Subtilis et s. Cerevisiae). En effet, les he et leurs constituants majoritaires aux concentrations bactericides et levuricides provoquent l'alteration de la surface cellulaire observee par microscopie electronique a balayage et de la permeabilite conduisant a la liberation du contenu cellulaire absorbant a 260 nm des trois souches etudiees. Cette activite lytique des he et de leurs constituants a ete utilisee pour la lyse et l'extraction rapide des acides nucleiques
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Boughougal, Amina. "Synthèse et caractérisation de composés de coordination antimicrobiens." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSE1260.
Full textAbstract:
Le développement de composés de coordination biologiquement actifs (antimicrobiens, les anti-inflammatoires, les antifongiques, les anti-oxydants et les anticancéreux) est un domaine de la chimie inorganique en évolution rapide, susceptible d'avoir un impact direct sur l'amélioration de la qualité de la vie. Les complexes métallo-antibiotique tirent parti de l'effet synergique pour aboutir à une activité pharmacologique améliorée. La reconnaissance du rôle des ions métalliques dans les systèmes biologiques et dans le traitement de diverses maladies attire l'attention sur les avantages d'étudier l'interaction des ions métalliques avec les molécules de médicaments organiques. Dans la continuité avec les travaux précédents de l’équipe, nous nous intéressons à la synthèse de nouvelles familles de complexes métaux-antibiotiques associant l’activité antiseptique d’un ion métallique à un ou deux types de molécules bioactives. Leurs actions additives doivent avoir un effet synergique et conduire à des traitements plus efficaces et devraient fortement minimiser les risques d'apparition de bactéries mutantes. Au cours de ce travail, nous avons réussi à synthétiser le premier complexe métal-antibiotique associant deux types d'antibiotiques différents comme ligands du Zn(II). Des études comparatives montrent qu'il a une meilleure activité antibactérienne contre E. Coli, E. Aureus, E. Feacalis que les antibiotiques parents et les complexes ne contenant qu'un seul de ces antibiotiques. Cela ouvre un nouveau concept appelé « Assemblage de Biomolécules Multi-actifs, ABM ». De plus, nous décrivons la synthèse et la caractérisation de nouveaux ligands antimicrobiens trifluorométhylésDevelopment of novel coordination complexes with diverse biological activities (antimicrobial, anti-inflammatory, antifungal, antioxidant and anticancer) is a rapidly evolving field of inorganic chemistry with potential direct impact on quality of life. Metal–drug complexes are of increasing interest in bioinorganic chemistry, leveraging the synergistic effect to lead to compounds with improved pharmacological activity. The recognition of the role of metal ions in biological systems and in treatment of various diseases calls attention to the benefits of studying the interaction of metal ions with organic drug molecules. In continuation with previous works of team, we focus here on the synthesis of new families of metal-antibiotic complexes associating, on one single-molecule, the antiseptic activity of a metal ion with the bioactivity of one or two type of bioactive molecules. Their additive actions have a synergetic effect and lead to more effective and shorter treatments and should strongly minimize the risks for appearance of bacteria mutants. In this work, we succeeded to synthesis the first metal-antibiotic complex associating two types of different antibiotic as ligands with Zn(II). The structure in the solid state of this new complex was established together with the studies of the chemical-physical properties. Comparative studies show it has a better antibacterial activity against (E.Coli, E,Aureus, E.Feacalis ) than parent antibiotics and complexes with only one of the antibiotic. This open a new concept named as Multi-Active Biomolecule Assembly. Moreover, the synthesis and characterisation of new trifluorométhylated antimicrobial ligands are described
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Laurencin, Mathieu. "Peptides et pseudopeptides auto-assembleurs à activité antimicrobienne." Rennes 1, 2008. http://www.theses.fr/2008REN1S142.
Full textAbstract:
La résistance des pathogènes contre les antibiotiques conventionnels augmente à un taux qui excède de loin l'allure du développement de nouveaux médicaments. Les peptides antimicrobiens, tant synthétiques que provenant de sources naturelles, se profilent comme étant des candidats avec lesquels il faudra compter. L’utilisation des peptides est cependant limitée par une élimination rapide en milieu biologique liée à leur dégradation par les protéases. L'objet de cette thèse concerne la synthèse de monomères aza-β3-aminoacides dans l'optique de les incorporer dans des séquences peptidiques antimicrobiennes. Les aza-β3-aminoacides sont des analogues des α-aminoacides qui diffèrent des β3-aminoacides par la présence d'un atome d'azote supplémentaire chiral à configuration non fixée qui porte la chaîne latérale. L'introduction de ces unités monomériques au sein de peptides antimicrobiens donne accès à des pseudopeptides antimicrobiens dont la durée de vie et l'activité est améliorée. La modification d'un neuropeptide de seiche présentant des activités antibactériennes nous a permis d'obtenir un analogue peptidique et deux analogues pseudopeptidiques plus actifs que le peptide naturel. D'un autre côté, nous avons développé un peptide et une série de cyclopseudopeptides hybrides de novo qui possèdent des activités comparables à certains antibiotiques usuels. Nous avons tenté d'expliquer le mécanisme d'action de nos peptides et pseudopeptides qui agissent sur les membranes microbiennes. Les résultats obtenus par dichroïsme circulaire, diffusion de la lumière et RMN mettent en évidence un phénomène d'auto-association qui jouerait un rôle primordial dans l'activité biologiqueAntibiotic resistance of pathogens against conventional antibiotics increases at a rate which exceeds by far the speed of the development of new drugs. The antimicrobial peptides, both synthetic and from natural sources, have raised interest as potential useful drugs in the future. The use of peptides is however limited by a fast elimination in biological environment connected to their rapid degradation by proteases. The object of this work concerns the synthesis of no proteinogenic monomers, the aza-β3-aminoacids, in the goal to incorporate them into antimicrobial peptidic sequences. Aza-β3-aminoacid are analogues of α-aminoacids, which differ from β3-aminoacids by the presence of an extra nitrogen atom, with a non-fixed configuration, which carries the side chain. The introduction of these monomeric units within antimicrobial peptides gives access to antimicrobial pseudopeptides with an extended life cycle. The modification of a cuttlefish neuropeptide presenting antibacterial activities allowed us to obtain a peptidic analogue and two pseudopeptidic analogues more active than the natural peptide. On the other hand, we developed a peptide and a series of cyclopseudopeptides hybrids de novo which possess comparable activities to some common antibiotics. Now, we try to explain the mechanism of action of our peptides and pseudopeptides which act on the microbial membranes. The results, obtained by circular dichroism, light scattering and NMR, bring to light a phenomenon of auto-association which would play an essential role in the biological activity
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Defer, Diane, Professeur Nathalie Bourgougnon, and Mcf Yannick Fleury. "Recherche d'activités antimicrobiennes chez des mollusques marins. Purification et caractérisation partielle de peptides antimicrobiens isolés à partir de l'hémolymphe de Crassostrea gigas et de bactéries associées." Phd thesis, Université de Bretagne Sud, 2009. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00485008.
Full textAbstract:
Les systèmes de communication chimique constituent un élément indispensable dans l'établissement des relations intra- ou inter-espèces en milieu marin, tissant un réseau de relations entre individus, au sein d'un écosystème. Les invertébrés dépourvus de système immunitaire à mémoire et au mode de vie sessile produisent des métabolites bioactifs jouant un rôle essentiel dans la réponse aux pressions environnementales telles que la prédation et la défense vis-à-vis d'autres organismes potentiellement pathogènes. L'objectif de ces travaux a été d'identifier la présence de peptides antimicrobiens chez des mollusques bivalves et des gastéropodes d'importance commerciale. Ainsi, la recherche de molécules de défense antimicrobiennes de nature peptidique a été conduite dans des extraits acides des mollusques bivalves, Cerastoderma edule, Ruditapes philippinarum, Ostrea edulis et gastéropodes, Buccinum undatum, Littorina littorea et Crepidula fornicata, ainsi qu'à partir de l'hémolymphe de Crassostrea gigas. Les extraits ont été pré-purifiés par extraction sur phase solide C18 (SPE) et l'élution a été réalisée par 3 paliers successifs de 10%, 40% et 80% d'ACN-0,1% TFA. L'activité antibactérienne a été évaluée via la détermination de la CMI sur un ensemble de bactéries à Gram+ et à Gram- ; et l'activité antivirale a été déterminée in vitro sur le modèle virus Herpes simplex type 1/cellules Vero via la viabilité cellulaire. Les espèces C. edule, L. littorea et C. gigas se sont révélées être les espèces les plus efficaces et non cytotoxiques. Une caractérisation partielle de l'activité détectée chez ces espèces a permis de déterminer la nature peptidique des molécules actives. La purification des peptides antimicrobiens a été conduite sur l'hémolymphe de C. gigas et a permis l'identification d'un peptide dont la structure de type lantibiotique laisse présager une origine bactérienne. L'hypothèse d'une association entre C. gigas et des bactéries nous a conduit, à partir de cultures d'huîtres non axéniques, à rechercher des bactéries antagonistes dans l'hémolymphe et a permis d'isoler 2 Vibrio spp. et 3 Pseudoalteromonas spp. A partir de la bactérie Pseudoalteromonas spp. souche hCg 5, un composé actif a été partiellement caractérisé. L'ensemble de ces résultats suggère que les bactéries associées au système immunitaire pourraient jouer un rôle essentiel dans la défense des bivalves.
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Khoury, Madona. "Préparation, analyse et activités antimicrobiennes d'huiles essentielles de plantes libanaises." Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2015. http://www.theses.fr/2015MNHN0024.
Full textAbstract:
Inspirés par les mécanismes de défense des plantes, nous avons entrepris d'évaluer la diversité chimique et activité antimicrobienne d’huiles essentielles (HE) issues de plantes libanaises. Suivant une approche métabolomique nous avons pu mettre en évidence la diversité chimique des 32 HEs étudiées et également comparer les chémotypes d'une même espèce végétale. Le criblage effectué a permis d’identifier de nombreuses HEs présentant des activités antimicrobiennes intéressantes. L’HE d’Hirtellina lobelii DC. , seule ou en combinaison avec des médicaments antimicrobiens, était parmi les huiles les plus actives. Cette huile a démontré un potentiel antifongique remarquable en perturbant la membrane des champignons dermatophytes induisant par la suite une lyse cellulaire. Dans l’ensemble, ces résultats, nous portent à croire que l'arsenal de défense des plantes peut inspirer des approches alternatives pour aborder la menace sociétale que représentent les infections multi-résistantes@Inspired by plant defenses, we undertook to evaluate the chemical diversity and antimicrobial activities of essential oils (EOs) from Lebanese plants. Following a metabolomic approach we were able to highlight the chemical diversity among the 32 studied oils and between the chemotypes of the same plant species. The screening led to the identification of several EOs with interesting antimicrobial activities. Hirtellina lobelii DC. EO was among the most active ones, alone or in combination with antimicrobial drugs. This oil holds remarkable antifungal potential against dermatophytic fungi by disrupting fungal membrane and ultimately leasing cells. We hypothesized that H. Lobelii EO should increase cell penetration of antifungal drugs and may also act through a specific mode of action. Altogether, these results lead us to believe that plant defense arsenal can inspire alternative ways of addressing the societal issue of multidrug resistant infections
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Ngezahayo, Jeremie. "Plantes médicinales du Burundi et maladies infectieuses: enquête ethnobotanique et activités antibactériennes directe et indirecte de composés isolés de Platostoma rotundifolium (Briq.) A. J. Paton (Lamiaceae)." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2016. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/241022.
Full textAbstract:
Les pathologies infectieuses, maladies causées par certains micro-organismes pathogènes parmi les bactéries, les virus, les champignons et les protozoaires, sont à l’origine des taux de mortalité et de morbidité élevés enregistrés surtout dans les pays en voie de développement où la majorité de la population n’a pas les moyens d'accéder aux soins de santé. Les résistances des micro-organismes aux antimicrobiens, observées actuellement dans la pratique médicale moderne, constituent un autre grand problème lié au traitement de ces maladies. Elles constituent l’une des menaces de santé les plus sérieuses et peuvent frapper n’importe qui dans le monde. Face à ces fléaux, il est urgent de découvrir de nouveaux agents antimicrobiens qui pourraient, éventuellement, présenter de nouveaux mécanismes d'action. Une bonne part des plantes utilisées en médecines traditionnelles contiennent des composants antimicrobiens utiles contre les infections et qui peuvent aider dans la lutte contre les maladies infectieuses liées à l’antibiorésistance. C’est dans cette optique que nous avons mené une enquête ethnobotanique sur les plantes médicinales utilisées contre les infections microbiennes en médecine traditionnelle Burundaise. Nous en avons inventorié 155 et sélectionné 5 d'entre elles (Justicia subsessilis Oliv. (Acanthaceae); Platostoma rotundifolium (Briq.) A. J. Paton (Lamiaceae), Virectaria major (Schum.) Verdc. (Rubiaceae), Pavetta ternifolia (Oliv.) Hiern (Rubiaceae), et Stomatanthes africanus (Oliv. & Hiern) R. M. King & H. Rob. (Asteraceae)) pour en étudier la composition phytochimique et les propriétés biologiques. Les extraits de ces plantes ont été évalués notamment pour leurs effets antibactériens direct (bactéricide ou bactériostatique) et indirect (modulation des mécanismes de résistance qui augmente ou restaure l’activité des antibiotiques sur des souches résistantes). Les cinq plantes retenues ont montré une activité antibactérienne, justifiant ainsi leur usage contre les infections microbiennes en médecine traditionnelle Burundaise et, plus particulièrement, l’espèce Platostoma rotundifolium, dont les extraits ont montré des effets antibactériens directs et indirects sur des souches sensibles et résistantes. Les extraits de Platostoma rotundifolium ont également présenté des effets sur l’expression de gènes (lasB et rhlA) impliqués dans le quorum sensing, et sur la formation du biofilm de Pseudomonas aeruginosa PAO1. En vue d’isoler et identifier les molécules responsables de ces différentes activités, l’extrait acétate d’éthyle (le plus actif) de Platostoma rotundifolium a été soumis à un fractionnement bioguidé. Celui-ci a permis d’isoler neuf composés qui ont été identifiés comme étant les acides ursolique, corosolique, tormentique, hyptadiénique, et 2α, 3α, 19β-trihydroxyurs-12-èn-28-oïque (isolé pour la première fois lors de ce travail et auquel nous avons donné le nom d’acide jérémique), le squalène, le cassipourol, le β-sitostérol et l’α-amyrine. Toutes ces molécules sont isolées pour la première fois de Platostoma rotundifolium. Les trois premiers composés ont présenté un effet bactéricide sur les souches bactériennes sensibles et résistantes, tandis que les trois derniers ont montré une action inhibitrice significative de l’expression de gènes (lasB et rhlA) impliqués dans le quorum sensing et de la formation de biofilm de Pseudomonas aeruginosa PAO1. Toutes ces molécules actives peuvent constituer une voie dans la lutte contre les maladies infectieuses et l’antibiorésistance; nous pouvons conclure que les données issues d’une enquête ethnobotanique sur les savoirs et les savoir-faire des guérisseurs traditionnels sont très importantes, surtout lorsqu’elles sont exploitées jusqu’à la détermination des principes actifs responsables d'une activité pharmacologique donnée.Infectious pathologies are diseases caused by the transmission of some pathogenic microorganisms among bacteria, viruses, fungi and protozoa. They drive the high mortality and morbidity rates recorded especially in developing countries, where the majority of the population cannot afford to access health care. The antimicrobial resistances currently observed in modern medical practice represent another major problem in the treatment of these diseases. These resistances are one of the most serious population health threats and can strike anyone in the world. It has thus become urgent to discover new antimicrobial agents that could possibly have novel mechanisms of action.Many plants used in traditional medicines against infections harbor useful antimicrobial components that can help in the fight against infectious diseases and antibiotic resistances. In this context, we conducted an ethnobotanical survey of medicinal plants used in Burundian traditional medicine to treat microbial infections. We inventoried 155 herbs from which 5 (Justicia subsessilis Oliv. (Acanthaceae); Platostoma rotundifolium (Briq.) A. J. Paton (Lamiaceae), Virectaria major (Schum.) Verdc. (Rubiaceae), Pavetta ternifolia (Oliv.) Hiern (Rubiaceae), and Stomatanthes africanus (Oliv. & Hiern) R. M. King & H. Rob. (Asteraceae) were selected for phytochemical screening and biological assays. The extracts of these plants were evaluated for their antibacterial effects, direct (bacteriostatic or bactericidal) and indirect (inhibition of resistance mechanisms by increasing or restoring the activity of antibiotics against resistant strains). All the selected plants species have shown antibacterial activity, justifying their use against microbial infections in Burundian traditional medicine, and more particularly Platostoma rotundifolium, whose extracts showed direct and indirect antibacterial effects on susceptible and resistant (MRSA) strains. The extracts from Platostoma rotundifolium also presented inhibitory effects on the expression of genes involved in quorum sensing, lasB and rhlA, as well as on biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa PAO1.In order to isolate and identify the molecules responsible for these activities, the ethyl acetate extract (most active) from Platostoma rotundifolium was submitted to bioguided fractionation. This led to the isolation of nine compounds that were identified as ursolic acid, corosolic acid, tormentic acid, hyptadienic acid and 2α, 3α, 19β-trihydroxyurs-12-en-28-oic acid (isolated for the first time during this work and that was named jeremic acid), squalene, cassipourol, β-sitosterol and α-amyrin. All these molecules were isolated for the first time from Platostoma rotundifolium. The first three compounds showed a bactericidal effect on sensitive and resistant strains of bacteria, while the last three showed significant inhibitory effects on the expression of two QS genes (lasB and rhlA), and on biofilm formation by Pseudomonas aeruginosa PAO1. All these active molecules can be a lead in the fight against antibiotic resistance; and we can conclude that the data from an ethnobotanical survey of the knowledge and skills of traditional healers are very important, especially when they are exploited until the determination of the active ingredients responsible for a specific pharmacological activity.
Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques (Pharmacie)
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Hamdouna, Lama. "Caractérisation RMN et activité antimicrobienne de complexes organométalliques préparés par mécanosynthèse." Electronic Thesis or Diss., Université de Lille (2022-....), 2023. https://pepite-depot.univ-lille.fr/ToutIDP/EDSMRE/2023/2023ULILR048.pdf.
Full textAbstract:
L'utilisation de solvants dans les méthodes de synthèse chimique modernes pose un problème économique et environnemental. Pour répondre à ces préoccupations, il est crucial de réduire leur utilisation et d'adopter des méthodes de synthèse respectueuses de l'environnement. Une solution prometteuse à ces défis est la synthèse mécanochimique, qui utilise des forces mécaniques pour déclencher des réactions chimiques sans recourir aux solvants traditionnels. Cependant, de nombreux aspects des mécanismes de réaction impliqués en mécanochimie restent mal compris. La spectroscopie de résonance magnétique nucléaire à l'état solide (RMN des solides), capable de fournir une résolution au niveau atomique, présente un potentiel considérable pour élucider les mécanismes des réactions mécanochimiques. Dans ce manuscrit, nous avons utilisé la RMN des solides pour étudier la synthèse mécanochimique de complexes de métal de transition avec des carbène N-hétérocyclique (NHC) via l'approche à base faible. Ces complexes, tels que [Cu(Cl)(NHC)], [Ag(Cl)(NHC)], et [Rh(acac)(CO)(NHC)], ont des applications en catalyse et en tant que revêtements anti-infectieux pour les dispositifs médicaux. Notre étude se concentre principalement sur l'exploration de l'impact de divers protocoles de post-traitement utilisés lors de la préparation de ces complexes. Pour explorer ces processus, nous avons mené une série d'expériences par RMN des solides multinucléaires, impliquant des noyaux de spin 1/2 (1H, 13C, 15N, 109Ag) et quadripolaires (35Cl, 63Cu), à des intensités de champ magnétique statique de 9,4, 18,8 et 28,2 T. Cette approche nous a permis de suivre la consommation des réactifs et la formation des produits intermédiaires et finaux à travers différentes voies de synthèse et divers protocoles de post-traitement. Nous avons exploité les avantages offertes par un aimant RMN de 1,2 GHz pour observer les isotopes soumis à des interactions quadripolaires substantielles, comme le 35Cl et le 63Cu. L'attribution des signaux dans les spectres RMN a été réalisée grâce à des techniques de corrélation hétéronucléaire 2D combinées avec des calculs de paramètres RMN en théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT). Nous avons complété nos études en RMN des solides par des techniques telles que la diffraction des rayons X (XRD) sur poudre et la spectroscopie vibrationnelle. En outre, nous avons étendu nos recherches à la synthèse mécanochimique de dérivés de dérivés chalcogène-NHC, en particulier les thiourées (NHC=S) et les sélénourées (NHC=Se), connues pour leurs propriétés électroniques uniques et leur activité biologique. À l'aide d'expériences de RMN des solides multinucléaire, incluant des noyaux de spin 1/2 (1H, 13C, 15N, 77Se) et quadripolaires (33S) à des champs magnétiques statiques de 9,4 et 18,8T, ainsi que des calculs DFT des paramètres RMN, nous avons mis en évidence les mécanismes sous-jacents à ces transformations. Nos résultats confirment sans équivoque que les complexes et dérivés chalcogène-NHC étudiés se forment effectivement à l'état solide lors un broyage à billes. Cependant, cette affirmation ne s'applique pas aux complexes [Rh(acac)(CO)(NHC)], pour lesquels les forces mécaniques exercées pendant le broyage à billes ont facilité la réaction, mais ont nécessité la présence de solvants pour l'achever. De plus, notre étude a permis d'identifier des composés intermédiaires, des réactifs n'ayant pas réagi et des sous-produits, permettant ainsi une meilleure compréhension des résultats. En conclusion, notre recherche fournit des informations précieuses sur les mécanismes des processus mécanochimiques et met en évidence le potentiel de la spectroscopie RMN des solides pour l'étude et l'optimisation de voies de synthèse durables. Ce travail contribue au développement de méthodes de synthèses chimique respectueuses de l'environnement et économiquement viables, répondant aux défis posés par l'utilisation de solvants dans la chimie moderneThe extensive use of solvents in modern chemical synthesis has posed significant economic and environmental challenges. To address these concerns, it is crucial to reduce solvent usage and embrace eco-friendly synthesis methods. One promising solution to these challenges is mechanochemical synthesis, which employs mechanical forces to drive chemical reactions without traditional solvents. However, many aspects of the reaction mechanisms involved in mechanochemistry remain poorly understood. Solid-state nuclear magnetic resonance (ssNMR) spectroscopy, capable of providing atomic-level resolution, holds great promise in unraveling the mechanisms of mechanochemical reactions. In this dissertation, we applied ssNMR spectroscopy to investigate the mechanochemical synthesis of transition metal-N-heterocyclic carbene (NHC) complexes through the weak base approach. These complexes, such as [Cu(Cl)(NHC)], [Ag(Cl)(NHC)], and [Rh(acac)(CO)(NHC)], have applications in catalysis and as anti-infective coatings for medical devices. Our research primarily focuses on exploring the impact of different workup protocols used during the preparation of these complexes. To explore these processes, we conducted a series of multinuclear ssNMR experiments, involving spin-1/2 (1H, 13C, 15N, 109Ag) and quadrupolar (35Cl, 63Cu) nuclei, at static magnetic field strengths of 9.4, 18.8, and 28.2 T. This approach allowed us to monitor the consumption of reactants and the formation of intermediate and final products across various synthetic routes and workup protocols. We leveraged the high resolution and sensitivity offered by a 1.2 GHz NMR magnet to observe isotopes subject to substantial quadrupolar interactions, such as 35Cl and 63Cu. Signal assignment in the NMR spectra was achieved through 2D heteronuclear correlation techniques in conjunction with Density Functional Theory (DFT) calculations of NMR parameters. Additionally, we complemented our ssNMR studies with techniques such as powder X-ray diffraction (XRD) and vibrational spectroscopy. Moreover, we extended our investigation to the mechanochemical synthesis of chalcogen-NHC derivatives, specifically thioureas (NHC=S) and selenoureas (NHC=Se), known for their unique electronic properties and biological activities. Using multinuclear ssNMR experiments, including spin-1/2 (1H, 13C, 15N, 77Se) and quadrupolar (33S) nuclei at static magnetic fields of 9.4 and 18.8T, along with DFT calculations of NMR parameters, we unveiled the mechanisms underlying these transformations. Our findings unequivocally confirm that the studied transition metal-NHC complexes and chalcogen-NHC derivatives are indeed formed in the solid state during ball milling, dispelling any doubts regarding solvent-driven reactions during subsequent workup or characterization. However, this assertion does not apply to the [Rh(acac)(CO)(NHC)] complexes, where mechanical forces during ball milling facilitated the reaction but necessitated the presence of solvents to complete it. Additionally, our study identified intermediate compounds, unreacted reagents, and by-products, providing a comprehensive understanding of the reaction outcomes. In conclusion, our research provides valuable insights into the mechanisms of mechanochemical processes and highlights the potential of ssNMR spectroscopy as a powerful technique for investigating and optimizing sustainable synthesis routes. This work contributes to the development of environmentally friendly and economically viable methods for chemical synthesis, addressing the pressing challenges posed by solvent usage in modern chemistry
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Fassi, Fehri Lina. "Activité antimicrobienne de peptides membranotropes et mécanisme de résistance chez mycoplasma pulmonis." Rennes 1, 2005. http://www.theses.fr/2005REN1S061.
Full textAbstract:
La résistance bactérienne aux antibiotiques est un problème de santé publique. Notre objectif est de mieux connaître les facteurs qui affectent l'efficacité antibactérienne des peptides antimicrobiens qui constituent des antibiotiques prometteurs. Nous avons étudié les interactions entre le mollicute Mycoplasma pulmonis et dix peptides différents. L'activité de ces peptides, à l'exception de la globomycine, est indépendante de la densité bactérienne mais est sensible à la concentration sérique du milieu de culture. Les combinaisons de peptides et d'antibiotiques ont montré des effets antibactériens additifs. Chez des clones sélectionnés pour leur résistance à la gramicidine D et à la mellitine, une surexpression de protéines de stress a été attribuée à des mutations dans le gène hrcA. La complémentation avec le gène hrcA sauvage restaure la sensibilité aux deux peptides démontrant que la résistance résulte d'une réponse au stress impliquant les gènes régulés par la protéine HrcA.
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Demers, Mathieu Véronique. "Activité antimicrobienne d'un extrait peptidique issus d'un hydrolysat trypsique de protéines de lactosérum." Thesis, Université Laval, 2011. http://www.theses.ulaval.ca/2011/28671/28671.pdf.
Full text
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Fabre, Françoise. "Activité antimicrobienne d'huiles essentielles : comparaison de méthodes, détermination de l'activité de nouvelles huiles." Clermont-Ferrand 1, 1991. http://www.theses.fr/1991CLF15004.
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Molero, Bondia Andrea. "Synthèse et activité antimicrobienne d’assemblages moléculaires basés sur les dendrimères greffés de lysine." Thesis, Montpellier 2, 2013. http://www.theses.fr/2013MON20019.
Full textAbstract:
Les dendrimères greffés de L-lysine (DGL) ont des applications potentielles variées (agents antibactériens, antifongiques…). Ces dendrimères greffés sont obtenus selon un procédé original, mis au point au laboratoire, basé sur la polymérisation des N-carboxyanhydrides (NCA) de L-lysine. Les travaux de recherche décrits dans ce mémoire ont pour objectif d'évaluer (i) la faisabilité des différents modes de modification des DGL et (ii) l'activité antibactérienne des nouveaux conjugués synthétisés.Le manuscrit resitue d'abord les DGL parmi les différentes catégories de polymères dendritiques décrites dans la littérature. Il développe également les applications des oligo- et poly-ethylène glycols (OEG et PEG) comme agents pour la fonctionnalisation de molécules bioactives et la synthèse de bioconjugués. L'approche expérimentale de greffage d'oligo-homoarginines (Har)n à un DGL de troisième génération (DGL-G3) est ensuite abordée. Ces entités, ont été synthétisées de manière rapide et économique en introduisant les fonctions guanidinium à partir d'un DGL de première génération (DGL-G1) par une méthode innovante. La première partie de travail est consacrée à la synthèse de ces oligomères. La possibilité de greffage ultérieure de ces derniers nécessite la synthèse préalable de bras d'espacement bifonctionnels porteurs d'une fonction amine à une des extrémités et d'une fonction aldéhyde masquée à l'autre. L'amine de cet intermédiaire est destinée à amorcer la polymérisation du Lys(Tfa)-NCA, alors que l'aldéhyde sera utilisé pour l'ancrage covalent à la plateforme DGL-G3. La seconde partie de ce travail est consacrée à la conjugaison de l'oligomère (Har)n sur la plateforme DGL selon une réaction d'amination réductrice qui a été optimisée et à la synthèse de nouveaux conjugués portant des chaînes hydrophobes. Parmi tous les conjugués DGL synthétisés, seuls les ceux portant les chaînes hydrophobes ont amélioré l'activité antibactérienneL-Lysine dendrigrafts (DGLs) have various potential applications (antibacterial agents, antifungal agents…). These dendrigrafts are obtained according to an original procedure elaborated in our laboratory based on the polymerization of L-lysine N-carboxyanhydrides (Lys-NCA). The investigations carried out in the present dissertation are aimed at assessing (i) the feasibility of the different ways of modification of DGLs and (ii) the antibacterial activity of the synthesized conjugates. The manuscript begins by locating DGLs among the different categories of dendritic polymers reported in the literature. It also develops the applications of oligo- and poly-ethylene (OEG and PEG) as agents for the functionalization of bioactive molecules and for bioconjugate synthesis. An approach consisting in grafting third generation DGL (DGL-G3) with oligo-homoarginines (Har)n is then described. These entities have been synthesized from a first generation DGL (DGL-G1) using an innovative strategy for the elaboration of guanidinium-rich peptides in a straightforward and cheap strategy. The first part of this work is dedicated to the oligomer synthesis. The possibility of further grafting of the latter is conditioned by the preceding access to bifunctional spacers bearing an amino group on the one end and a masked aldehyde function on the other end. The amine will enable the initiation of Lys(Tfa)-NCA polymerization, whereas the aldehyde will serve for the covalent grafting to the DGL-G3 scaffold. The second part of this work is devoted to the DGL-G3 functionalization by the (Har)n oligomer through a reductive amination strategy that has been optimized and to the synthesis of new conjugates with hydrophobic side-chains. Among all the conjugates prepared, only those having hydrophobic chains lead to an increase in antibacterial activity
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El-Ghaish, Shady Nabil Rashed. "Usage des bactéries lactiques issues de produits laitiers fermentés ou de fromages locaux obtenus en Egypte dans la protéolyse des protéines du lait afin de diminuer leurs propriétés allergéniques et dans l'obtention de produits antimicrobiens." Nantes, 2011. http://archive.bu.univ-nantes.fr/pollux/show.action?id=b7546415-6795-4be6-8ea9-b7fbd47c219e.
Full textAbstract:
Les souches utilisées dans cette étude ont été identifiées par amplification et séqençage de l'ADN 16S comme étant : Lactobacillus fermentum IF03956, Lactobacillus rhamnosus LMS2, Lactobacillus plantarum JDM1, Enterococcus faecium DO623, Enteroccocus faecium E1162, Enterococcus faecium C68, Enterococcus faecalis HH22, et Enterococcus faecalis T8. Toutes ces souches montraient une forte activité protéolytique. Les souches Lactobacillus fermentum IF03956, et Lactobacillus plantarum JDM1 renferment le gène de la protéase PrtP, tandis que la souche Lactobacillus rhamnosus LMS2 contient le gène de la protéase PrtR. . . Les protéases produites par Lactobacillus fermentum IF03956, Lactobacillus rhamnosus LMS2 et Lactobacillus plantarum JDM1 appartiennent au groupe P III puisqu'elles sont capables d'hydrolyser les caséines s1 ,s2 et . Lactobacillus fermentum IF03956, Lactobacillus rhamnosus LMS2 et Lactobacillus plantarum JDM1 pourraient être utilisés pour réduire la reconnaissance par les IgE des caséines s1 et . Les souches actives (Enterococcus faecium TX1330 et Enterococcus faecium E980) isolées à partir de produits laitiers égyptiens se sont révélé capables de produire plusieurs bactériocines (ent A, nt B, ent P et ent L50A) présentant une activité considérable contre Listeria monocytogenes. L'analyse des souches Enterrococcus faecium TX1330 et Enterococcus faecium E980 par les méthodes de biologie moléculaire a révélé l'absence de gènes de facteurs de virulence asll, cyl A et cyl B, ace, efaAfs et espfm quand on les comparait avec la souche Enterococcus faecalis MM4594 présentant ces facteurs. L'ensemble de ces résultats montre que ces deux souches (Enterococcus faecium TX1330 et Enterococcus faecium E980) productrices d'entérocines, dépourvues de facteurs de virulence et surtout sensibles aux antibiotiques, peuvent être utilisées comme levain ou en co-culture dans les processus de fabrication alimentaireThe strains used in this study were identified by 16s rDNA amplification and sequencing as : Lactobacillus fermentum IFO3956, Lactobacillus rhamnosus LMS2, Lactobacillus plantarum JDM1, Enterococcus faecium DO623, Enterococcus faecium E1162, Enterococcus faecium C68, Enterococcus faecalis HH22 and Enterococcus faecalis T8. All these strains showed a strong proteolytic activity. The strains Lactobacillus fermentum IFO3956 and Lactobacillus plantarum JDM1 included PrtP protease, while the strain Lactobacillus rhamnosus LMS2 contain PrtR protease. No presence of genes encoding proteases PrtB and PrtH has been detected in all strains tested. Proteases produces by Lactobacillus fermentum IFO3956, Lactobacillus rhamnosus LMS2 and Lactobacillus plantarum JDM1 may be classified as P III type, since they proteolysed s1-, s2 and -caseins. Depending on the reduced recognition and binding by IgE of s1-, and -caseins hydrolyzed by Lb. Fermentum IFO3956, Lactobacillus rhamnosus LMS2 and Lactobacilus plantarum JDM1 these straine may be used for the production of milk products with reduced s1-and - caseins immuno-reactivity. The active strains (Enterococcus faecium TX1330 and Enterococcus faecium E980) isolated from Egyptian dairy products were proved capable of producing a variety of bacteriocins (ent A, ent B, ent P and ent L50A) with considerable activity against Listeria monocytogenes. Analysis of Enterococcus faecium TX1330 and Enterococcus faecium E980 by the methods of molecular biology has revealed the absence of the virulence factor genes (asal, cyl A and cyl B, ace, efaAfs, and espfm) as compared with a positive strain (Enterococcus faecalis MM4594). Based on the obtained results showing that the two studied strains producers of enterocins were devoid of virulence factors and mostly sensitive to antibiotics, Enterococcus faecium TX1330 and Enterococcus faecium E980 may be used as safe and useful starter cultures or co-cultures
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Salmi, Chanaz. "Conception et évaluation des activités antimicrobiennes de nouveaux dérivés aminostéroïdiens analogues de la squalamine." Aix-Marseille 3, 2007. http://www.theses.fr/2007AIX30028.
Full textAbstract:
L'augmentation des infections nosocomiales causées par les multirésistances microbiennes soulève un problème de santé publique nécessitant la recherche de nouvelles classes d’antibiotiques. Récemment, un nouveau polyaminostérol cationique non cytotoxique appelé squalamine, possèdant des activités antimicrobiennes contre un large spectre de microorganismes, a été isolé des tissus du requin Squalus acanthias. La synthèse d’analogues amino- et polyaminostéroïdiens plus simples de la squalamine constituait un défi que nous avons pu relever en nous appuyant sur une réaction d'amination réductrice au titane développée au laboratoire. L’évaluation biologique de ces composés a été réalisée in vitro et certains d’entre eux démontrent des activités antimicrobiennes comparables à celles de la squalamine. Une étude systématique des relations structures-activités de ces dérivés a également démontré l'importance des groupements fonctionnels polyamine, hydroxyle et sulfate dans les propriétés antibiotiques de la molécule naturelle et de ses dérivésExtensive use of antibiotics has raised a serious public health problem due to infections caused by multidrug-resistant bacterial pathogens. Consequently, there is a pressing need to develop new antibiotics to keep pace with bacterial resistance. Recently, a new cationic sterol, squalamine has been isolated from tissues of the dogfish shark Squalus Acanthias exhibiting potent antimicrobial activities. The synthesis of numerous squalamine analogues has been realized involving a diastereoselective titatium reductive amination reaction developed in our laboratory. A structure–activity relationships study has been conduced in order to determine the influence of polyamino, hydroxyl and sulfate moieties on the encountered antimicrobial activities
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Okusa, Ndjolo Philippe. "Etude phytochimique et activité antimicrobienne directe et indirecte de Cordia gilletii De Wild, Boraginaceae." Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2012. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/209642.
Full textAbstract:
Les maladies infectieuses constituent un sérieux problème de santé publique aussi bien dans les pays en développement où elles sont la principale cause de taux de mortalité élevés, que dans les pays industrialisés où les résistances aux antibiotiques existants se développent de façon alarmante. Cette situation engendre un besoin sans cesse croissant de trouver de nouveaux composés antimicrobiens et/ou inhibiteurs de mécanismes de résistances aux antibiotiques. Les plantes médicinales, notamment celles utilisées de façon traditionnelle dans les pays en développement, constituent une source potentielle de ce type de composés. C’est dans ce cadre que l’espèce Cordia gilletii De Wild (Boraginaceae), une plante dont les écorces de racines et les feuilles sont traditionnellement utilisées en République Démocratique du Congo pour combattre les maladies infectieuses, a été étudiée sur le plan tant de ses activités biologiques que de sa composition chimique. Les extraits obtenus à partir des écorces de racines de cette plante ont montré d’intéressantes activités biologiques, (i) un effet antimicrobien direct (bactéricide pour les bactéries gram positif et bactériostatique pour les gram négatif) et indirect (augmentation ou restauration de l’activité des antibiotiques vis-à-vis des souches résistantes); (ii) un effet inhibiteur sur deux des gènes impliqués dans le quorum sensing de Pseudomonas aeruginosa, lasB and rhlA; (iii) un effet antiplasmodial sur une souche chloroquino-sensible de Plasmodium falciparum; (iv) un effet antioxydant mis en évidence par réaction avec le radical libre DPPH. Pour les extraits de feuilles, seule l’activité antiplasmodiale a été observée. Les extraits d’écorces de racines, doués d’activité antimicrobienne directe (extrait méthanolique) et indirecte (extrait n-hexanique) ont été soumis à une série de fractionnements dans le but d’isoler et d’identifier les composés actifs. Pour suivre l’activité lors des fractionnements, le milieu de culture utilisé pour la détection des composés actifs sur une plaque chromatographique (CCM-bioautographie) a été optimisé. Le composé férulaldéhyde, isolé de l’extrait méthanolique, a montré des propriétés antimicrobiennes, antioxydantes et antiplasmodiales. De l’extrait n-hexanique ont été isolés deux composés, l’un actif, le lupéol et l’autre inactif, la friedéline. Le lupéol a montré un effet antimicrobien indirect en réduisant la CMI de certains antibiotiques vis-à-vis d’une souche de MRSA. Ces trois composés, s’ils ont déjà été identifiés dans d’autres plantes, sont décrits pour la première fois dans l’espèce Cordia gilletii ;et ce travail constitue le premier rapport de l’effet antimicrobien indirect du lupéol.
Dans le but de s’assurer de l’innocuité des extraits de C. gilletii, une recherche d’alcaloïdes pyrrolizidiniques (APs) a été réalisée par GC-MS. Ces alcaloïdes présentent en effet un réel danger pour la santé humaine et la famille des Boraginaceae, à laquelle appartient l’espèce C. gilletii, est connue comme une des principales sources de ces composés. Aucun AP n’a pu être mis en évidence dans les extraits d’écorces de racines et de feuilles de cette plante jusqu’à une limite de détection de 2 ppm, suggérant ainsi une absence de risque toxicologique en relation avec ces alcaloïdes. Ces résultats rassurants restent à confirmer sur d'autres échantillons obtenus dans des lieux de récolte différents.
Le présent travail montre que C. gilletii peut agir contre les microorganismes pathogènes par :(i) son action antimicrobienne directe (due entre autre au férulaldéhyde); (ii) son effet antimicrobien indirect (dû au lupéol), effet permettant d’augmenter ou de restaurer l’activité des antibiotiques vis-à-vis des souches résistantes ;et (iii) son effet inhibiteur de l’expression des gènes du quorum sensing, effet permettant d’atténuer la virulence d’agents infectieux. Ces actions peuvent permettent de faire face aux infections dues notamment à des microorganismes résistants.
Infectious diseases remain a serious public health problem both in developing countries, where they are the main cause of the high mortality rates recorded, and in industrialized countries where there is an alarming incidence of antibiotic resistance. There is thus an increasing need for new compounds that can act by a direct antimicrobial effect or by an indirect effect, inhibiting resistance mechanisms of microorganisms. Medicinal plants, particularly those traditionally used against infectious diseases in developing countries, are a probable source for these types of compounds. In this context, Cordia gilletii De Wild (Boraginaceae), a medicinal plant from which root barks and leaves are traditionally used against infectious diseases in Democratic Republic of Congo, was investigated for biological activities and phytochemical composition. Root bark extracts showed interesting biological activities: (i) antimicrobial properties, acting directly (bactericid and bacteriostatic effects against gram positive and gram negative bacteria, respectively) or indirectly (enhancement or restoration of antibiotic activity on resistant strains); (ii) inhibitory effect on the expression of two Pseudomonas aeruginosa QS genes, lasB and rhlA; (iii) antiplasmodial effect against a chloroquine sensitive strain of Plasmodium falciparum; (iv) antioxidant effect determined by the free radical DPPH quenching. Leaves extracts showed only antiplasmodial activity.
Root barks extracts with the highest direct (methanol extract) and indirect (n-hexane extract) antimicrobial properties were fractionated to isolate and to identify the active compounds. To bio-guide the fractionation, the culture medium for the detection of active compounds on chromatographic plates (TLC-bioautography) was optimized. The compound ferulaldehyde, isolated from the methanol extract, showed antimicrobial, antioxidant and antiplasmodial properties. From the n-hexane extract two compounds were isolated, lupeol and friedelin. Lupeol showed indirect antimicrobial effect by decreasing the MIC of some antibiotics against MRSA; whereas friedelin was inactive. Although these three compounds have already been described in other plant species, this is the first report of their occurence in Cordia gilletii; the indirect antimicrobial effect of lupeol is described for the first time in this work.
As it belongs to the family of Boraginaceae, a family well known as one of the most important sources of pyrrolizidine alkaloids (PAs), Cordia gilletii is susceptible to contain these toxic compounds that were consequently researched. A GC-MS analysis did not reveal the presence of PAs (detection limit, 2 ppm) in root barks and leaves extracts of C. gilletii, suggesting a lack of PA-related toxicity of this plant. This reassuring finding needs to be confirmed with samples harvested at different locations.
This work reveals that C. gilletii may act against pathogenic microorganisms by: (i) a direct antimicrobial effect (partly due to férulaldéhyde); (ii) the enhancement or restoration of antibiotic activity against resistant strains (effect of lupeol); and (iii) an inhibitory effect on the expression of quorum sensing regulator genes, decreasing the virulence of microorganisms. These actions could help to fight infections caused by resistant strains.
Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques
info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Hatoum, Rima. "Levure laitières à activité antimicrobienne : une nouvelle génération de cultures protectrices et de probiotiques." Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/30013/30013.pdf.
Full textAbstract:
L'objectif général de cette thèse était d'isoler et d'identifier de nouvelles souches de levures ayant une activité antagoniste contre des pathogènes alimentaires tel que Listeria sp. à partir des produits laitiers du terroir québécois. L'utilisation potentielle de ces souches comme agent naturel pour la biopréservation des aliments a également été explorée. Au total, 95 levures isolées de lait et de fromage du terroir québécois ont été criblés pour leur activité inhibitrice notamment contre Listeria monocytoenes. Parmi celles-ci, quatre levures, à savoir Candida tropicalis LMA-693, Debaryomyces hansenii LMA-916, Pichia fermentans LMA-256 et Wickerhamomyces anomalus LMA-827 ont montré une activité inhibitrice liée à la production de substances extracellulaires hydrophobes facilement extraites à partir du surnageant de culture. Les extraits concentrés réalisés à partir de surnageant de ces souches ont montré une forte inhibition contre Listeria ivanovii HPB28 avec des réductions de compte microbiens de 97, 92, 84 et 78 % pour les souches LMA-693, LMA-916, LMA-256 et LMA-827, respectivement. Des essais visant à purifier et à caractériser des peptides antilisteria produits par W. anomalus LMA-827 ont été effectués à partir des surnageants de culture. Deux pics HPLC ayant démontré une inhibition significative de L. ivanovii HPB28 ont été alors identifiés et purifiés. Dans la deuxième partie de la thèse, l'effet protecteur contre L. monocytogenes LMA-1045 des souches D. hansenii LMA-916 et de W. anomalus LMA-827 a été évaluée dans un caillé modèle de type Camembert, en co-culture et en utilisant les extraits acétone concentrés provenant de ces souches. Les analyses microbiologiques des différents caillés modèles ont révélé une inhibition significative de L. monocytoenges LMA-1045 par les extraits acétone à partir du premier jour de maturation jusqu'au cinquième. Les observations en microscopie électronique ont révélé une forte proportion de cellules en processus de lyse ainsi que la formation de pores. Finalement, la survie de D. hansenii LMA-916 aux gastro-intestinales a été étudiée grâce à un simulateur dynamique in vitro du tube digestif (TIM-1). Cette souche a montré une tolérance au stress digestif et un taux de survie (nombre de UFC de l'extrant / nombre de UFC de l'intrant du TIM-1 multiplié par 100) de 2,08 % en comparant avec 1,85 % de Saccharomyces boulardii.The overall objective of this thesis was to isolate and identify new yeast strains from Quebec dairy products with antagonistic activity against food-borne pathogens such as Listeria sp. It also aims to evaluate the potential of these strains to be used as a natural food biopreservation. A total of 95 isolates of yeasts isolated from milk and cheese of Quebec were screened. Four yeasts, in particular, namely Candida tropicalis LMA-693, Debaryomyces hansenii LMA-916, Pichia fermentans LMA-256, and Wickerhamomyces anomalus LMA-827 selected for their inhibitory activity against Listeria monocytogenes. The inhibitory activity of these strains appears to be related to the production of an extracellular hydrophobic substances extracted from the culture supernatant. The evaluation of the inhibitory activity of these strains showed a strong inhibition against L. ivanovii HPB28 with microbial reduction of 97, 92, 84 and 78 %, respectively. Attempts to purify and characterize peptides produced by W. anomalus were conducted from the culture supernatant. Two protein HPLC peaks have demonstrated significant inhibition of L. ivanovii HPB28 were then identified and purified. In the second part of the thesis, the protective effect of D. hansenii LMA-916 and W. anomalus LMA-827 was analyzed as well as their acetone extracts concentrated against L. monocytogenes LMA-1045 in Camembert cheese model curd. Microbiological analyzes of different curds models showed significant inhibition of L. monocytogenes LMA-1045 in Camembert curd models containing the acetone extracts from the first day of ripening up to the fifth and ninth days. The electron microscopy observations revealed an extensive cell lysis, with the formation of pores. Finally, the survival of D. hansenii LMA-916 in a Camembert curd model under the gastrointestinal stress was studied using dynamic simulator in vitro gastrointestinal tract (TIM-1). The behavior of this strain showed a digestive stress tolerance and survival rate (number of CFU in the effluent from the TIM-1 / number of CFU input to the TIM-1 multiplied by 100) 2.08 % comparing with 1.85 % for Saccharomyces boulardii.
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Manuel, Christian. "Les neuroleptiques phénothiaziniques peuvent-ils induire une activité antimicrobienne circulante chez des patients traités ?" Paris 5, 1994. http://www.theses.fr/1994PA05P227.
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Allain, Philippe. "L'huile essentielle de Teucrium puechiae Greuter et Burdet : aspect botanique, composition chimique, activité antimicrobienne." Montpellier 1, 1991. http://www.theses.fr/1991MON13521.
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Hatoum, Rima. "Levures laitières à activité antimicrobienne : une nouvelle génération de cultures protectrices et de probiotiques." Doctoral thesis, Université Laval, 2013. http://hdl.handle.net/20.500.11794/24261.
Full textAbstract:
L'objectif général de cette thèse était d'isoler et d'identifier de nouvelles souches de levures ayant une activité antagoniste contre des pathogènes alimentaires tel que Listeria sp. à partir des produits laitiers du terroir québécois. L'utilisation potentielle de ces souches comme agent naturel pour la biopréservation des aliments a également été explorée. Au total, 95 levures isolées de lait et de fromage du terroir québécois ont été criblés pour leur activité inhibitrice notamment contre Listeria monocytoenes. Parmi celles-ci, quatre levures, à savoir Candida tropicalis LMA-693, Debaryomyces hansenii LMA-916, Pichia fermentans LMA-256 et Wickerhamomyces anomalus LMA-827 ont montré une activité inhibitrice liée à la production de substances extracellulaires hydrophobes facilement extraites à partir du surnageant de culture. Les extraits concentrés réalisés à partir de surnageant de ces souches ont montré une forte inhibition contre Listeria ivanovii HPB28 avec des réductions de compte microbiens de 97, 92, 84 et 78 % pour les souches LMA-693, LMA-916, LMA-256 et LMA-827, respectivement. Des essais visant à purifier et à caractériser des peptides antilisteria produits par W. anomalus LMA-827 ont été effectués à partir des surnageants de culture. Deux pics HPLC ayant démontré une inhibition significative de L. ivanovii HPB28 ont été alors identifiés et purifiés. Dans la deuxième partie de la thèse, l'effet protecteur contre L. monocytogenes LMA-1045 des souches D. hansenii LMA-916 et de W. anomalus LMA-827 a été évaluée dans un caillé modèle de type Camembert, en co-culture et en utilisant les extraits acétone concentrés provenant de ces souches. Les analyses microbiologiques des différents caillés modèles ont révélé une inhibition significative de L. monocytoenges LMA-1045 par les extraits acétone à partir du premier jour de maturation jusqu'au cinquième. Les observations en microscopie électronique ont révélé une forte proportion de cellules en processus de lyse ainsi que la formation de pores. Finalement, la survie de D. hansenii LMA-916 aux gastro-intestinales a été étudiée grâce à un simulateur dynamique in vitro du tube digestif (TIM-1). Cette souche a montré une tolérance au stress digestif et un taux de survie (nombre de UFC de l'extrant / nombre de UFC de l'intrant du TIM-1 multiplié par 100) de 2,08 % en comparant avec 1,85 % de Saccharomyces boulardii.The overall objective of this thesis was to isolate and identify new yeast strains from Quebec dairy products with antagonistic activity against food-borne pathogens such as Listeria sp. It also aims to evaluate the potential of these strains to be used as a natural food biopreservation. A total of 95 isolates of yeasts isolated from milk and cheese of Quebec were screened. Four yeasts, in particular, namely Candida tropicalis LMA-693, Debaryomyces hansenii LMA-916, Pichia fermentans LMA-256, and Wickerhamomyces anomalus LMA-827 selected for their inhibitory activity against Listeria monocytogenes. The inhibitory activity of these strains appears to be related to the production of an extracellular hydrophobic substances extracted from the culture supernatant. The evaluation of the inhibitory activity of these strains showed a strong inhibition against L. ivanovii HPB28 with microbial reduction of 97, 92, 84 and 78 %, respectively. Attempts to purify and characterize peptides produced by W. anomalus were conducted from the culture supernatant. Two protein HPLC peaks have demonstrated significant inhibition of L. ivanovii HPB28 were then identified and purified. In the second part of the thesis, the protective effect of D. hansenii LMA-916 and W. anomalus LMA-827 was analyzed as well as their acetone extracts concentrated against L. monocytogenes LMA-1045 in Camembert cheese model curd. Microbiological analyzes of different curds models showed significant inhibition of L. monocytogenes LMA-1045 in Camembert curd models containing the acetone extracts from the first day of ripening up to the fifth and ninth days. The electron microscopy observations revealed an extensive cell lysis, with the formation of pores. Finally, the survival of D. hansenii LMA-916 in a Camembert curd model under the gastrointestinal stress was studied using dynamic simulator in vitro gastrointestinal tract (TIM-1). The behavior of this strain showed a digestive stress tolerance and survival rate (number of CFU in the effluent from the TIM-1 / number of CFU input to the TIM-1 multiplied by 100) 2.08 % comparing with 1.85 % for Saccharomyces boulardii.
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Barreteau, Hélène. "Recherche de molécules à activité antimicrobienne dans des coproduits végétaux issus des industries agroalimentaires." Amiens, 2004. http://www.theses.fr/2004AMIE0417.
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Rémy, Benjamin. "Développement d'une nouvelle génération de pansements antimicrobiens à base d'enzyme à activité lactonase." Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0391.
Full textAbstract:
Des bactéries utilisent un système de communication, quorum sensing (QS), qui leur permet de synchroniser leur comportement proportionnellement à la densité de population. Des bactéries pathogènes utilisent le QS pour coordonner leur virulence et la formation de biofilm. Bloquer le QS, quorum quenching (QQ), constitue donc une piste pour étendre l'arsenal thérapeutique antibactérien. Durant cette thèse, SsoPox, une lactonase hyperstable hydrolysant les acyl homosérine lactones (AHL) impliquées dans le QS de bactéries à Gram négative pathogènes comme P. aeruginosa, a été étudiée. Son utilisation dans des pansements contre les infections à P. aeruginosa a été évaluée. La résistance aux contraintes industrielles liées aux procédés de fabrication des pansements a été évaluée. SsoPox s'est montrée résistante à la chaleur, aux solvants organiques, au stockage à température ambiante et à la stérilisation. L’efficacité de l’enzyme a été montrée sur 2 souches modèles et 51 isolats cliniques de P. aeruginosa. SsoPox a été plus efficace que 2 inhibiteurs du QS. L’efficacité de l’enzyme est aussi conservée après immobilisation. Une étude phénotypique et moléculaire du QQ enzymatique de P. aeruginosa a été réalisée entre SsoPox et une autre lactonase GcL ayant un spectre d'action distinct sur les AHL. In vitro, il a été mis en évidence des impacts différents entre les 2 enzymes sur les facteurs de virulence et le biofilm. In vivo, il a été montré que seul SsoPox réduit la virulence de P. aeruginosa. L’expression des gènes du QS et le protéome ont confirmé des différences entre GcL et SsoPox. Ainsi SsoPox semble constituer un bon candidat pour le développement de pansements innovantsBacteria use a communication system, or quorum sensing (QS), to synchronize group behaviors according to population density. Some pathogens use QS to coordinate virulence and biofilm formation. Interfering with QS, or quorum quenching, represents a target to extent antibacterial drug resources. Along this PhD project, SsoPox, a hyperstable lactonase, hydrolyzing acyl homoserine lactones (AHL) involved in the QS of Gram-negative pathogen bacteria like Pseudomonas aeruginosa was studied. SsoPox was studied and characterized for its use in wound dressing against P. aeruginosa infection. The enzyme resistance to industrial constraints encountered during wound dressings manufacturing processes was estimated. SsoPox demonstrated a high tolerance to heat, organic solvents, ambient temperature storage and to sterilization processes. The enzyme efficiency was shown on 2 model strains and 51 clinical isolates of P. aeruginosa. SsoPox was also more efficient than 2 well characterized QS inhibitors. The enzyme kept its efficiency even when immobilized. A last part was dedicated to phenotypical and molecular study of enzymatic QQ of P. aeruginosa. SsoPox and another lactonase GcL, having distinct AHL specificities, were compared. In vitro experiments highlighted different impacts between the enzymes on virulence factors and biofilm. An in vivo study showed that SsoPox, unlike GcL, was able to reduce P. aeruginosa virulence. QS gene expression and proteome study confirmed distinct impacts between each enzyme treatment s. Thus, SsoPox seems to be a prime candidate for development of innovative medical devices
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Ahmadova, Aynur. "L' activité protéolytique et antimicrobienne des bactéries lactiques isolées de produits laitiers fermentés traditionnels d'Azerbaïdjan." Nantes, 2012. http://www.theses.fr/2012NANT2026.
Full textAbstract:
Ce travail a été consacré à la recherche des activités protéolytiques et antibactériennes de bactéries lactiques isolées de produits laitiers fermentés traditionnels d’Azerbaïdjan. Les souches étudiées ont été isolées de 46 échantillons de produits laitiers fermentés, obtenus dans différentes régions d’Azerbaïdjan. Huit souches ayant une activité protéolytique notable ont été purifiées et identifiées par amplification et par séquençage de l’ADN 16S comme étant Lactobacillus helveticus (1 souche), Lactobacillus paracasei subsp. Paracasei (1 souche), Enterococcus faecalis (6 souches). Deux souches (1 Lactobacillus curvatus et 1 Enterococcus faecium) ayant une activité antibactérienne ont été purifiées et caractérisées. Les activités protéolytiques de ces souches ont été étudiées dans 2 systèmes: croissance dans du lait UHT et système cellulaire non prolifératif. Ces souches hydrolysent toutes les fractions de caséines ce qui démontre leur similarité avec les protéases de type PIII de Lactococcus. Les optima de température et de pH d’activité protéolytique sont de 37-45 °C et de pH neutre. Les effets de différents inhibiteurs sur les activités protéolytiques indiquent que les souches étudiées produisent des métallo-, sérine- et cystéine-protéases. Ces résultats ont été confirmés par l’analyse des souches par PCR gène spécifique avec des amorces de protéases de bactéries lactiques. L'immuno réactivité des caséines β et αS1 mesurée par interaction avec les IgE peut être considérablement réduite par hydrolyse avec Lactobacillus helveticus A75 et Enterococcus faecalis AN1 à la suite de la destruction des épitopes linéaires des IgE. Les souches productrices de bactériocines étudiées dans ce travail inhibent la croissance des souches de bactéries lactiques étroitement liées et aussi des souches pathogènes comme Listeria monocytogenes et Bacillus cereus. La souche Lactobacillus curvatus A61 a également une activité antifongique. Le mode d’action de leurs bactériocines dépendant de l’organisme test utilisé était bactériostatique ou bactéricide. Enterococcus faecium AQ71 possède les gènes codant pour les enterocines P, L50A/B et A ; la souche Lactobacillus curvatus A61 présente un gène de curvacine. Les substances produites par les souches de LAB azerbaïdjanaises sont stables à la chaleur et actives dans une large gamme de pH. L'analyse des souches par des méthodes de biologie moléculaire a révélé l'absence de gènes de facteurs de virulence. Les souches étudiées ne présentaient pas de multi-résistance aux antibiotiques. Par ailleurs, les souches de LAB azerbaïdjanaises étudiées dans ce travail sont résistantes aux concentrations physiologiques de sels biliaires, ce qui est l’une des caractéristiques principales des probiotiques. L’ensemble de ces résultats montre que les souches de LAB azerbaïdjanaises sélectionnées, productrices de bactériocines et de protéases, peuvent être utilisées sans risque majeur comme levains ou en co-culture dans les processus de fabrication alimentaireThis thesis was devoted for the study of proteolytic and antimicrobial activities of LAB isolated from traditional Azerbaijani fermented dairy products. LAB isolation was done from 46 samples of traditional fermented dairy products obtained from different regions of Azerbaijan. As a result of the screening 10 new LAB strains were isolated, from which 8 were proteolytic and belong to the species Lactobacillus helveticus (1 strain), Lactobacillus paracasei subsp. рaracasei (1 strain) and Enterococcus faecalis (6 strains). Two strains were producers of bacteriocins and belong to species Enterococcus faecium and Lactobacillus curvatus. Specificity of proteolytic activities of studied LAB strains depended on the substrate cleaved and on bacterial growth phase. Found proteolytic activities were mainly directed against caseins. The optimal hydrolysis of substrates by studied strains was observed at 37-45 ºС and at neutral pH range. The studied strains produced several proteases, mainly metallo- and serine- proteases. The proteolysis of caseins by strains Lactobacillus helveticus А75 and Enterococcus faecalis AN1 decreased their immunoreactivity as a result of lytic destruction of IgE binding linear epitopes. The studied bacteriocinogenic strains inhibited the growth of closely related LAB strains and also pathogens such as Listeria monocytogenes, Bacillus cereus. Lactobacillus curvatus A61 also displayed antifungal activity. The mode of action of found bacteriocins was dependent on the test-organism used and was bacteriostatic or bactericidal. Enterococcus faecium AQ71 possesses genes coding enterocins Р, L50A/B and A. Lactobacillus curvatus A61 possesses the structural gene of curvacin A. Antimicrobial substances produced by the studied LAB strains are heat stable and active in broad pH range. The studied Azerbaijani LAB do not possess the virulence factors and multi-resistance to antibiotics. Thus they are safe for industrial application. Moreover, the studied Azerbaijani LAB strains are resistant to physiological concentrations of bile salts, what is one of the main characteristics of probiotic strains. All these results suggest that the studied bacteriocinogenic and proteolytic strains could be used safely as starter and co-cultures for the food industry
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Myint, Aung. "Criblage de souches d'actinomycètes productrices d'antifongiques nonpolyéniques : production, extraction, purification et caractérisation des composés antimicrobiens biosynthétisés." Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1997. http://www.theses.fr/1997INPL049N.
Full textAbstract:
L’objectif de ce travail est la recherche de nouveaux antifongiques nonpolyéniques produits par des actinomycètes, en vue d'applications dans les domaines agricoles, agro-alimentaires et médicaux. Un criblage de souches d'actinomycètes isolés du sol, produisant des activités inhibant la croissance de levures et de moisissures a été effectué. Les souches productrices d'antifongiques polyéniques ont été écartées. Deux souches, A217 et A221, ont été retenues, et identifiées. Elles appartiennent au genre Streptomyces. Des milieux de culture liquides ont été mis au point pour permettre une production satisfaisante des activités antilevuriennes et antifongiques. Ils n'ont pas été autrement optimisés. Des méthodes d'extraction par solvants, de séparation et de purification des composés actifs par chromatographie sur gel de silice, chromatographie sur colonne d'acide silicique et chromatographie liquide à haute performance ont été mises au point. Les spectres d'activités antimicrobiennes des composés obtenus ont été établis : activités contre des bactéries Gram (-) et Gram (+), contre des levures, contre des moisissures. Les composés purifiés obtenus ont été caractérisés par leurs propriétés de solubilité dans différents solvants, leurs spectres d'absorption dans l'ultraviolet et le visible, et par diverses réactions chromogéniques. Les études spectroscopiques en infrarouge, ainsi que l'analyse par spectrométrie de masse et de RMN (1H et 13C), de deux des composés obtenus, A217-B et A221-A, ont été réalisées. Ces spectres, ainsi que la composition élémentaire de ces composés ont permis de déterminer leurs structures. Le composé A217-B appartient à la classe des antibiotiques ionophores et au groupe des macrotétrolides. Le composé A221-A s'est révélé être l'acide phénylacétique.
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Djouhri, Bouktab Lamia. "Synthèse et évaluation des activités antimicrobiennes de nouveaux dérivés 3,20-bis (pollyaminostéroïdiens). Applications en thérapeutique humaine." Thesis, Aix-Marseille 2, 2011. http://www.theses.fr/2011AIX22957/document.
Full textAbstract:
Les dérivés aminostéroïdiens analogues de la squalamine ont été largement étudiés pour leur large spectre d’activité sur les bactéries et les champignons multirésistants. Nous avons réalisé la synthèse de nouveaux dérivés aminostéroïdiens et présentant de nombreuses charges positives liées à la présence de groupements azotés, les 3,20-bis(polyaminostéroïdes) analogues de la squalamine. Une étude de la relation structure-activité a démontré l’importance des charges positives induites par la présence d’atomes d’azote dans les chaines carbonées portées par le motif cholestane. Nous avons mis en évidence les mécanismes d’action mis en oeuvre vis-à-vis des bactéries Gram positive et Gram négative. L’étude des activités antifongiques démontre que la squalamine et le dérivé aminostéroïdien DAS-1 possèdent de bonnes activités sur diverses souches de levures impliquées dans de nombreuses fongémies, avec des CMIs variant de 1 à 16 μg/mL. Nous avons étudié les applications potentielles de ces dérivés et démontré que ces dérivés en formulation de pommades à 1% de squalamine et de dérivé 3.20-bis(polyaminostéroïdien) étaient capables de réduire efficacement la colonisation cutanée à S. aureus sur un modèle animal. Il a été démontré que ces dérivés bis(polyaminostéroïdiens) sont également très actifs vis-à-vis de bactérie et de champignons multirésistants isolés des patients mucoviscidosiques. Nous avons testé leur activité en tant qu’agent désinfectant de matériel médical et plus particulièrement les nébuliseurs. La formation de cachets hydrosolubles à base de squalamine, nous a permis de développer un modèle de désinfection simple, rapide et peu onéreux des nébuliseurs contaminésAminosterol derivatives analogues of squalamine possess a broad spectrum activity against multidrug resistant bacteria and fungi. We synthesized a new series of 3,20-bis(polyaminosteroïd) analogues involving a titanium reductive amination possessing numerous positives charges due to the presence of nitrogen groups. The study of relation structure-activity demonstrates that the nature of the amino group attached to the sterol plays a crucial role on antimicrobial activity of these compounds. We had also determined the mechanism of action of bis(polyaminosteroïd) on Gram negative and Gram positive bacteria. The study of antifungal activity of squalamine and aminosterol derivative ASD-1 show a good activity against various yeast responsible of fungal infections, minimal inhibitrice concentration ranging from 1 to 16 μg/mL. We studied a potential application of these compounds in human therapeutic. We evaluated squalamine and related parent-derived ointments (1%) as potential new compounds for S. aureus decolonization in a new mouse model. Using this model we found that squalamine ointment (1%) was able to reduce efficiently S. aureus colonization. Squalamine and bis(polyaminosteroïd) derivatives were actives against multidrug resistant bacteria and fungi isolated from cystic fibrosis patients. We investigated the potential use of squalamine compound in vitro in a nebulizer disinfection model. A formulation of squalamine disinfecting soluble tablets at 2.5 % (W/W) was developed and successfully applied for rapid nebulizer disinfection
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Kieffer, Anne-Estelle. "Implication de l'ubiquitine dans l'immunité innée : Activité antimicrobienne des fragments N-et C-terminaux de l'ubiquitine." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 2003. http://www.theses.fr/2003STR13146.
Full textAbstract:
L'ubiquitine (Ub) est une protéine multifonctionnelle très conservée, impliquée dans la dégradation des protéines. Nos résultats l'intègrent dans le concept de la Neuroimmunité. Stockée dans les granules de sécrétion des cellules chromaffines, l'Ub est libérée dans la circulation, lors d'un stress avec les catécholamines et des peptides antimicrobiens dérivés des chromogranines et de la proenképhaline A. Le fragment C-terminal Ub65-76 possède une puissante activité antifongique, traverse le mur cellulaire fongique et inhibe la calcineurine, une enzyme calmoduline-dépendante nécessaire à la croissance fongique. L'Ub65-76 et le fragment N-terminal Ub1-34 qui pourraient être générés suite à une infection par S. Aureus, agissent en synergie pour tuer les champignons et ne montrent pas de toxicité vis-à-vis des cellules mammaliennes. La partie C-terminale de l'Ub (65-76) pourrait être utilisée en clinique en combinaison avec le peptide N-terminal (1-34) et des peptides antimicrobiens issus des chromograninesUbiquitin (Ub) is a multifunctionnal highly converved protein, which is implicated in protein degradation. Our results integrate Ub into the concept of Neuroimmunity. Ub is stored in secretory granules of chromaffin cells and released during stress into the circulation with catecholamines and antimicrobial peptides derived from chromogranins and proenkephalin-A during stress. The C-terminal fragment Ub65-76 displays a potent antifungal activity, crosses the cell wall of fungi and inhibits calmodulin-dependent calcineurin, an enzyme crucial for fungal growth. Ub65-76 and the N-terminal peptide (residues 1-34) could be generated during an infection with S. Aureus and act synergistically to kill fungi. Furthermore, they don't display any toxicity towards mammalian cells. The Ub C-terminal-derived peptide (Ub65-76) could be used with the N-terminal peptide (Ub1-34) and antimicrobial peptides derived from chromogranins as new antifungal agents
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Kondracki, Marie-Lise. "Étude chimique et biologique de quinones sesquiterpéniques isolées de l'éponge Sménospongia sp." Paris 11, 1988. http://www.theses.fr/1988PA112008.
Full textAbstract:
Le travail présenté consiste en l'isolement, l'analyse structurale et l'étude biologique de substances synthétisées par l'éponge Smenospongia sp. , espèce nouvelle, récoltée dans le golfe d'Aden, dont l'extrait présentait une activité antimicrobienne et cytotoxique. Des chromatographies réalisées sur différents supports, guidées par un test antibactérien, ont permis l'isolement des substances actives. L'élucidation des structures a été effectuée principalement par les méthodes d'analyses spectrales : UV, IR, MS, RMN 1 et 13C avec utilisation des techniques 2D COSY, NOE différence et NOESY pour l'étude de la stéréochimie au niveau de la partie terpénique. Des spectres de dichroïsme circulaire ont permis d'accéder à la configuration absolue des molécules étudiées. Des méthodes chimiques ont permis d'établir des corrélations entre les différentes structures et de différencier les ortho-quinones des para-quinones. En plus de l'ilimaquinone, sept substances de structure originale, dont des amino-quinones, ont pu être ainsi isolées. Toutes possèdent le même squelette drimane substitué par un noyau quinonique ou hydroquinonique. Elles présentent toutes une activité antibactérienne significative et certaines sont actives sur les Pseudomonas. Leur activité a été appréciée vis-à-vis des lignées cellulaires tumorales murines L 1210 et humaines U 937 et HL 60, ainsi que sur des lymphocytes normaux murins et humains. Leur effet sur les synthèses macromoléculaires : ADN et protéines a été également évalué. Le mécanisme de la cytotoxicité a été exploré vis-à-vis de l'ADN et de la tubuline par analyses spectrographiques UV.
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El, khawand Toni. "Extraction et hémisynthèse de stilbènes de la vigne et du vin pour une application en santé humaine et végétale." Thesis, Bordeaux, 2019. http://www.theses.fr/2019BORD0402.
Full textAbstract:
Les stilbènes sont des molécules de défense que produit la vigne pour lutter contre les agents pathogènes. Retrouvés dans le vin, ils acquièrent une valeur ajoutée pour leurs effets bénéfiques avérés en santé humaine. Sachant que l’efficacité des stilbènes contre certains oomycètes et champignons qui infectent la vigne augmente avec leur degré d’oligomérisation, cette thèse avait pour premier objectif d’optimiser et de procéder à des réactions de couplage oxydatif du resvératrol et de l’ɛ-viniférine extraits de sarments de vigne, en présence de sels de métaux, pour la production d’oligomères. Ces réactions d’hémisynthèse ont conduit d’une part à la formation de stilbènes à haut poids moléculaire, et à la production d’extraits à forte activité antifongique contre deux agents pathogènes majeurs de la vigne, Plasmopara viticola et Botrytis cinerea. D’autre part, ces réactions de couplage oxydatif appliquées au vin ont permis d’y étudier les mécanismes de la transformation oxydative du resvératrol, d’identifier les oligomères qui en découlent et de déterminer les conditions favorisant leur formation. Enfin, les effets potentiels de ces oligomères sur la santé humaine ont été étudiés, en évaluant leur niveau d’activité anti-inflammatoire in vitroStilbenes are a group of defence molecules produced by grapevine to fight against pathogens. They are consequently found in wine, where they acquire an added value through their proven positive effects on human health. Knowing that the efficacy of stilbenes against some oomycetes and fungus pathogens that attack grapevine increases with their oligomerization degree, the first objective of this thesis was to optimize and proceed to oxidative coupling reactions of resveratrol and ɛ-viniférine extracted from grapevine canes, in the presence of metal salts, in order to produce stilbene oligomers. On the one hand, these hemisynthesis reactions led to the formation of stilbenes with high molecular weight, and to the production of extracts with high antifungal activity against two major grapevine pathogens, Plasmopara viticola and Botrytis cinerea. On the other hand, these oxidative coupling reactions carried out on wine helped study the mechanisms of the oxidative transformation of resveratrol in wine, identify the resulting oligomers and determine the conditions conducive to their formation. Finally, the potential effects of these oligomers on human health were studied, by evaluating the level of their anti-inflammatory activity
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Benabdelkader, Tarek. "Biodiversité, bioactivité et biosynthèse des composés terpéniques volatils des lavandes ailées, Lavandula stoechas sensu lato, un complexe d'espèces méditerranéennes d'intérêt pharmacologique." Phd thesis, Université Jean Monnet - Saint-Etienne, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00952695.
Full textAbstract:
Dans ce travail nous avons réalisé une évaluation de la composition et des activités biologiques des HEs extraites de L. stoechas récoltées sur 11 sites dans le nord de l'Algérie. Les HEs ont été analysées par GC/FID et GC/MS, où un total de 121 composés ont été identifiés, représentant de 69.88 à 91.2% du contenu total de l'huile. Les principaux constituants étaient le fenchone (11.27-37.48%), le camphre (1.94-21.8%), le 1,8-cinéol (0.16-8.71%) et le viridiflorol (2.89-7.38%). Les activités biologiques in vitro ont démontré que les activités de piégeage du radical DPPH et l'oxydation des lipides du couple β- carotène/acide linoléique différaient d'un facteur 8 et étaient liées à différents ensembles de molécules. Nos 11 HEs ont présenté de bonnes activités antimicrobiennes envers la plupart des 16 souches pathogènes testées à des valeurs de concentration minimale inhibitrice (CMI) allant de 0.16 à 3.5 mg/ml. A l'aide d'amorces dégénérées nous avons isolé trois ADNc en pleine longueur, LpFENS, LpPINS et LpGEAS, de feuilles de L. pedunculata. Six ADNc homologues en pleine longueur, LSFENS, LsPINS, LsGEAS, LvFENS, LvPINS et LvGEAS, ont été également isolés des feuilles de L. stoechas et L. viridis en utilisant des amorces spécifiques aux trois premiers ADNc clonés. L'expression hétérologue dans E. coli et l'analyse de l'activité catalytique par GC/MS des enzymes natives recombinantes purifiées de ces TPSs ont permis leur caractérisation fonctionnelle en tant que, α-fenchol synthases (LpFENS, LsFENS et LvFENS), α-pinène synthases (LpPINS, LsPINS et LvPINS) et germacrène A synthase (LpGEAS, LsGEAS et LvGEAS)
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Birck, Cécile. "Conception et caractérisation de films antimicrobiens à base de poly(alcool vinylique) pour l’emballage à contact alimentaire." Thesis, Lille 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LIL10074/document.
Full textAbstract:
L’objectif de ce travail était de développer des films antimicrobiens à base de poly(alcool vinylique)(PVOH) réticulés par de l’acide citrique (CTR). La démarche choisie a consisté à incorporer dans le polymère du benzoate de sodium (NaBz), seul ou sous forme de complexe avec l’hydroxypropyl-β-cyclodextrine (HPβCD). La combinaison des fonctions résiduelles du CTR greffé sur le polymère et du NaBz libre permet d’envisager des effets antimicrobiens par contact et par diffusion. Les films ont été réalisés par casting à partir de solutions aqueuses et réticulés par un traitement thermique. La réaction de réticulation a été mise en évidence et suivie à travers l’étude des composés résiduels, l’évolution de la Tg et des fonctions COOH résiduelles en fonction du temps de réticulation. L’étude de différentes compositions a permis de sélectionner les concentrations de 20 et 30 wt% en CTR pour un compromis entre réticulation suffisante et ductilité du film préservée. Le temps nécessaire pour lier l’ensemble des réactifs diminue avec l’augmentation de la température ou de la quantité de CTR. La réaction de réticulation n’est pas modifiée par la présence d’HPβCD. Avec l’ajout de CTR ou d’HPβCD et la réticulation, les films restent faiblement perméables à O2 et fortement perméables à la vapeur d’eau. Concernant la libération du NaBz dans l’eau, la cinétique est ralentie à partir de 360 min de réticulation et de 20 wt% de CTR. L’HPβCD n’a pas d’influence sur la cinétique de libération mais a permis de doubler la quantité libérée. L’activité antimicrobienne par contact et par diffusion a été mise en évidence pour la majorité des films contre l’ensemble des microorganismes étudiésThe aim of this work was to develop antimicrobial films based on polyvinyl alcohol (PVOH) crosslinked by citric acid (CTR). In our approach, sodium benzoate (NaBz) was introduced in polymer, alone or in complex form with hydroxypropyl-β-cyclodextrin (HPβCD). Both CTR residual functions grafted on polymer and free NaBz are expected to provide antimicrobial effects by contact and diffusion. Films were elaborated by casting from aqueous solutions and crosslinked by heat treatment. Crosslinking reaction has been highlighted and followed through the study of residual reagents, the evolution of Tg and residual COOH functions according to crosslinking time. From this investigation, a compromise between sufficient crosslinking and preserved film ductility has been found for a CTR concentration between 20 and 30 wt%. The time required to bind all of the reagents decreases with the increase of temperature or amount of CTR. The crosslinking reaction was not modified by the presence of HPβCD. With the addition of CTR or HPβCD and the crosslinking step, the films remain slightly permeable to O2 and highly permeable to water vapor. Considering the NaBz release in water, kinetics is slowed from 360 min of crosslinking and 20 wt% CTR. HPβCD has no major influence on the kinetics of release but allow to double released amount. Antimicrobial activity by contact and diffusion has been demonstrated for the majority of films against all studied microorganisms
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Naimi, Sabrine. "Stabilité gastro-intestinale, activité antimicrobienne et impact sur le microbiote colique de la microcine J25 : approches métagénomiques et métabolomiques." Doctoral thesis, Université Laval, 2018. http://hdl.handle.net/20.500.11794/30724.
Full textAbstract:
Les antibiotiques ont longtemps été utilisés dans les pratiques d'élevage comme additifs alimentaires pour améliorer la croissance des animaux, comme les porcelets en post-sevrage, ainsi que pour traiter les infections bactériennes, notamment celles causées par Escherichia coli et Salmonella. Cependant, cette pratique a largement contribué à l'émergence de la résistance aux antibiotiques chez les bactéries commensales et pathogènes, ce qui a conduit à un réel problème de santé publique. Face à l’incidence accrue des infections causées par les bactéries pathogènes résistantes aux antibiotiques, la recherche de solutions alternatives est devenue une urgence et les peptides antimicrobiens naturels (AMPs) et plus particulièrement les bactériocines apparaissent parmi les alternatives prometteuses qui ont été proposées. La microcine J25 (MccJ25) est un peptide antimicrobien produit par Escherichia coli connu pour exercer une puissante activité inhibitrice contre les Enterobacteriaceae, y compris Salmonella. Grâce à sa structure en lasso, la MccJ25 présente une faible sensibilité aux protéases et aux conditions dénaturantes et pourrait ainsi avoir une plus grande stabilité durant un tractus gastrointestinal (GI). Toutes caractéristiques font de la MccJ25 une molécule à fort potentiel d’utilisation comme alternative aux antibiotiques dans le domaine vétérinaire. L’objectif général de cette thèse était d’évaluer le potentiel de MccJ25 comme alternative aux antibiotiques pour l’inhibition de Salmonella dans les conditions physiologiques du tube digestif du porc. Dans la première partie de cette étude, la stabilité et l’activité inhibitrice de la MccJ25 ont été évaluées dans les différents compartiments du tractus GI en utilisant le simulateur dynamique in vitro TIM-1. La MccJ25 a démontré une plus grande stabilité au niveau de l'estomac, tandis qu'une dégradation modérée a été observée dans le compartiment duodénal. Les formes de dégradation de la MccJ25 ont été analysées par LC-MS/MS et selon l’approche des réseaux moléculaires utilisant les outils de la plateforme GNPS, et en présence d'enzymes protéolytiques simulant les conditions duodénales. Les principales enzymes responsables de la dégradation de la MccJ25 ont ainsi pu être identifiées. Dans un deuxième temps, les concentrations minimales inhibitrices (CMI) et bactéricides (CMB) de la MccJ25 ont été déterminées in vitro contre Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport ATCC6962 dans le milieu LB ainsi que dans le milieu Macfarlane qui simule les conditions coliques du porc. Cette activité inhibitrice a été également comparée à celle de deux autres antimicrobiens, la réutérine et la rifampicine. Enfin, dans un troisième temps, l’activité de la MccJ25 contre Salmonella Newport et son impact sur la composition et l’activité métabolique du microbiote colique du porc ont été évalués en utilisant le modèle in vitro de fermentation en continu PolyFermS qui simule les conditions du côlon proximal porcin. L’activité inhibitrice contre Salmonella Newport a été évaluée par la méthode de de diffusion sur gélose, tandis que l’impact sur les différents groupes bactériens du microbiote colique porcin a été quantifié par la méthode de qPCR-PMA et par séquençage Illumina MiSeq. De façon remarquable, la MccJ25 n'a pas induit de modification significative de la composition du microbiote colique, alors qu'elle a fortement inhibé la croissance de Salmonella Newport, contrairement à la réutérine ou la rifampicine. Par ailleurs, l’analyse de l’activité métabolique du microbiote colique à l’aide du logiciel R et effectuée à partir des données de LC-MS, a démontré un effet significatif de la MccJ25 sur le métabolome intracellulaire alors qu’aucun effet significatif n’a été observé sur le métabolome extracellulaire. En conclusion, l’application d’approches microbiologiques, métagénomiques et métabolomiques très originales, variées et complémentaires nous a permis de confirmer le potentiel de la MccJ25 quant à la possibilité de son utilisation comme une alternative aux antibiotiques dans les pratiques d’élevage. Sa stabilité dans les premières étapes de digestion, sa spécificité à l'égard de Salmonella et le fait que son introduction dans le microbiote intestinal n'entraîne pas de dysbiose, la désignent comme un bon candidat dans la lutte contre la salmonellose. Des études complémentaires seront cependant nécessaires afin de confirmer ces résultats in vivo en conditions réelles d’élevage.Antibiotics have long been used in animal husbandry practices as feed additives to improve animal growth as well as to treat bacterial infections, including those caused by Escherichia coli and Salmonella. However, this practice has largely contributed to the emergence of antibiotic resistance in commensal and pathogenic bacteria, which has led to a real public health problem. The increased incidence of infections caused by antibiotic-resistant pathogenic bacteria, has promoted the search for new alternatives and natural antimicrobial peptides (AMPs), including bacteriocins are among the promising alternatives that have been proposed. Microcin J25 (MccJ25) is an antimicrobial peptide produced by Escherichia coli and known to exert a potent inhibitory activity against Enterobacteriaceae, including Salmonella. Thanks to its lasso structure, MccJ25 has a low sensitivity to proteases and to denaturing conditions suggesting a higher stability in the gastrointestinal tract (GI) conditions. These characteristics make MccJ25 a molecule with high potential for use as an alternative to antibiotics in the veterinary field. The general objective of this thesis was to evaluate the potential of MccJ25 as an alternative to antibiotics for the inhibition of Salmonella in the physiological conditions of the digestive tract of piglet. In the first part of this study, the stability and the inhibitory activity of MccJ25 were evaluated in the different compartments of the GI tract using the dynamic simulator TIM-1. MccJ25 demonstrated higher stability in the stomach compartment; however, a moderate degradation was observed when the peptide entered the duodenum. Degradation products of MccJ25 in duodenal conditions and in the presence of different proteolytic enzymes were further analyzed using LC-MS/MS and subsequent molecular networking analysis using the Global Natural Product Social Molecular Networking platform (GNPS). Thus, the enzymes responsible for the degradation of MccJ25 have been identified. In the second part of the present study, the minimal inhibitory (MIC) and bactericidal (MBC) concentrations of MccJ25 were determined in vitro against Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport ATCC6962 in LB medium as well as in MacFarlane medium that simulates the swine colonic conditions. This inhibitory activity was also compared to that of two other antimicrobials namely reuterin and rifampicin. Finally, the activity of MccJ25 against Salmonella Newport and its impact on the composition and the metabolic activity of the swine colonic microbiota were evaluated using the in vitro continuous fermentation model PolyFermS that simulates the swine proximal colon conditions. The inhibitory activity against Salmonella Newport was evaluated using the agar diffusion assay, while the impact on the different bacterial groups of the swine colonic microbiota was quantified by qPCRPMA method and Illumina MiSeq sequencing. Interestly, MccJ25 did not induce any significant modification of the composition of the colonic microbiota, whereas it strongly inhibited the growth of Salmonella Newport, unlike reuterin and rifampicin. However, the analysis of the metabolic activity of the colonic microbiota using the R software and the LC-MS data, demonstrated a significant effect of MccJ25 on the intracellular metabolome. No significant effect was obtained with extracellular metabolome. In conclusion, the application of very original, varied and complementary microbiological, metagenomic and metabolomic approaches allowed us to confirm the potential of MccJ25 for use as an alternative to antibiotics in the veterinary sector. Its stability in the early stages of digestion, its specificity with regard to Salmonella and the fact that its addition into the intestinal microbiota does not cause any dysbiosis, suggested it as a good candidate as an anti-Salmonella. However, additional studies remain necessary to confirm these results in vivo under real animal use conditions.
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El, Omari Khaled. "Etude de l’activité antimicrobienne et antioxidante des huiles essentielles extraites de plantes Libanaises." Thesis, Lille 1, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL10233.
Full textAbstract:
La résistance aux antibiotiques est devenue une véritable préoccupation. Ainsi, la recherche de composés antimicrobiens est plus que jamais d’actualité. Les plantes constituent une source potentielle de ces composés. La thèse présente une étude détaillée de la composition chimique et décrit l’activité antimicrobienne d’huiles essentielles issues de trois plantes : Micromeria barbata, Eucalyptus spp. et Juniperus excelsa. L’influence de plusieurs paramètres tels que le type d’organe, l’altitude de croissance de la plante, la durée de l’extraction, la méthode de séchage sur la qualité et l’activité de l’huile est abordée. Les résultats montrent, dans le cas de M. barbata non fleurie, que le pourcentage maximal (99.54 %) de l’huile est obtenu à la plus haute altitude (1700 m). Cependant, le pourcentage du Pulgeone, le composé principal de l’huile essentielle, diminue graduellement lorsque l’altitude augmente. Par ailleurs, l’activité des huiles essentielles extraites des plantes aux trois différentes altitudes est équivalente pour les différentes souches testées.L’activité antibactérienne et antifongique de l’huile essentielle de M. barbata est également mise en évidence contre différentes espèces bactériennes, y compris celles qui résistent aux carbapénèmes, pour les champignons opportunistes et les dermatophytes L’activité antimicrobienne de ces trois huiles essentielles est évaluée vis-à-vis de deux souches de Mycobacterium tuberculosis (dont une XDR), deux espèces atypiques : Mycobacterium kansasii et Mycobacterium gordonae ainsi que sur Paenibacillus larvae. Les résultats montrent que les trois huiles possèdent une activité notoireAntibiotic resistance has become a real concern. Thus, the research of antimicrobial compounds is more relevant than ever. The aromatic plants are a potential source of these compounds. The thesis presents an advanced study of the chemical composition and describes the antimicrobial activity of essential oils from three plants: Micromeria barbata (M.barbata), Eucalyptus spp. and Juniperus excelsa (J.excelca). The influence of several parameters such as organ type, elevation of plant growth,duration of extraction, and drying method has been discussed .The results reveal that non – flowering of M..barbata has the maximum percentage (99.54%) of the oil is collected at the altitude (1700 m). However, the percentage of Pulgeone, the main component of the essential oil gradually decreases with increasing altitude. Furthermore, the activity of essential oils extracted from plants in three different altitudes is similar for the different microbial strains tested.The essential antibacterial and antifungal oil M. barbata is also highlighted against different bacterial species, including those resistant to carbapenems, for opportunistic fungi and dermatophytesThe antimicrobial activity of three essential oils is evaluated against two strains of Mycobacterium tuberculosis (including XDR), two atypical species: Mycobacterium kansasii and Mycobacterium gordonae well as Paenibacillus larvae ,the causative agent of American foulbrood disease that infect the honey bees larvae . Results show that three oils have a significant anti-mycobacterial activity
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El, Omari Khaled. "Etude de l’activité antimicrobienne et antioxidante des huiles essentielles extraites de plantes Libanaises." Electronic Thesis or Diss., Lille 1, 2016. http://www.theses.fr/2016LIL10233.
Full textAbstract:
La résistance aux antibiotiques est devenue une véritable préoccupation. Ainsi, la recherche de composés antimicrobiens est plus que jamais d’actualité. Les plantes constituent une source potentielle de ces composés. La thèse présente une étude détaillée de la composition chimique et décrit l’activité antimicrobienne d’huiles essentielles issues de trois plantes : Micromeria barbata, Eucalyptus spp. et Juniperus excelsa. L’influence de plusieurs paramètres tels que le type d’organe, l’altitude de croissance de la plante, la durée de l’extraction, la méthode de séchage sur la qualité et l’activité de l’huile est abordée. Les résultats montrent, dans le cas de M. barbata non fleurie, que le pourcentage maximal (99.54 %) de l’huile est obtenu à la plus haute altitude (1700 m). Cependant, le pourcentage du Pulgeone, le composé principal de l’huile essentielle, diminue graduellement lorsque l’altitude augmente. Par ailleurs, l’activité des huiles essentielles extraites des plantes aux trois différentes altitudes est équivalente pour les différentes souches testées.L’activité antibactérienne et antifongique de l’huile essentielle de M. barbata est également mise en évidence contre différentes espèces bactériennes, y compris celles qui résistent aux carbapénèmes, pour les champignons opportunistes et les dermatophytes L’activité antimicrobienne de ces trois huiles essentielles est évaluée vis-à-vis de deux souches de Mycobacterium tuberculosis (dont une XDR), deux espèces atypiques : Mycobacterium kansasii et Mycobacterium gordonae ainsi que sur Paenibacillus larvae. Les résultats montrent que les trois huiles possèdent une activité notoireAntibiotic resistance has become a real concern. Thus, the research of antimicrobial compounds is more relevant than ever. The aromatic plants are a potential source of these compounds. The thesis presents an advanced study of the chemical composition and describes the antimicrobial activity of essential oils from three plants: Micromeria barbata (M.barbata), Eucalyptus spp. and Juniperus excelsa (J.excelca). The influence of several parameters such as organ type, elevation of plant growth,duration of extraction, and drying method has been discussed .The results reveal that non – flowering of M..barbata has the maximum percentage (99.54%) of the oil is collected at the altitude (1700 m). However, the percentage of Pulgeone, the main component of the essential oil gradually decreases with increasing altitude. Furthermore, the activity of essential oils extracted from plants in three different altitudes is similar for the different microbial strains tested.The essential antibacterial and antifungal oil M. barbata is also highlighted against different bacterial species, including those resistant to carbapenems, for opportunistic fungi and dermatophytesThe antimicrobial activity of three essential oils is evaluated against two strains of Mycobacterium tuberculosis (including XDR), two atypical species: Mycobacterium kansasii and Mycobacterium gordonae well as Paenibacillus larvae ,the causative agent of American foulbrood disease that infect the honey bees larvae . Results show that three oils have a significant anti-mycobacterial activity
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Blond, Alain. "Les microcines C51 et J25, peptides antimicrobiens d'Entérobactéries : études structurales par RMN et modélisation moléculaire : relations structure/activité." Paris 6, 2002. http://www.theses.fr/2002PA066040.
Full text
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Mnayer, Dima. "Eco-Extraction des huiles essentielles et des arômes alimentaires en vue d'une application comme agents antioxydants et antimicrobiens." Thesis, Avignon, 2014. http://www.theses.fr/2014AVIG0257/document.
Full textAbstract:
Les huiles essentielles et les arômes des plantes constituent un réel potentiel pour l’industrie dans le but de substituer aux composés synthétiques ayant des effets néfastes sur la santé et l’environnement. Afin de contribuer aux principes de la chimie verte, cette étude porte sur l’éco-extraction et la valorisation des extraits naturels des plantes et le développement d’une nouvelle technologie «verte» pour l’extraction des composés aromatiques naturels. La première partie de ce manuscrit mets en évidence les propriétés biologiques des huiles essentielles et des arômes et l’importance de leurs applications dans différents domaines surtout le domaine agroalimentaire. Dans la deuxième partie, les études sur les propriétés biologiques des huiles essentielles des plantes des Alliacées montrent leurs bonnes activités antioxydantes et antimicrobiennes. Ces résultats encourageants ont permis dans la troisième partie de valoriser les sous-produits d’oignon issus de la turbo hydrodistillation et qui sont considérés normalement comme déchets. La technique offre une bonne extraction des composés phénoliques et des flavonoïdes utilisant l’eau comme solvant naturel. La quatrième et la dernière partie de ce travail s’est orientée vers l’optimisation et le développement d’une technologie « verte» utilisant les ultrasons et l’huile de tournesol comme solvant naturel pour l’extraction des composés aromatiques du thym. Cette nouvelle approche écologique permet l’extraction des absolues dépourvues de cire et des résidus de solvants pétroliers, contenant la teneur la plus élevée en thymol et exerçant la plus forte activité antioxydantePlant essential oils and aromas are a real potential for the industry to substitute the synthetic compounds that might have harmful effects on the human health and the environment. In order to contribute to the green chemistry principles, this study focuses on the “eco-extraction” and valorization of natural plant extracts and the development of a new «green» technology for the extraction of aromatic compounds. The first part of this manuscript highlights the biological properties of the essential oils and aromas and the importance of their applications in various sectors especially in the food industry. In the second part, studies on the biological properties of the essential oils from plants of the Alliaceae family show their good antioxidant and antimicrobial activities. These encouraging results have allowed in the third part to evaluate the onion by-products resulting from the turbo hydrodistillation, which are normally considered as waste. The technique offers a good extraction of flavonoids and phenols using water as natural solvent. The fourth and final part of this work deals with the optimization and the development of a «green» technology using ultrasound and sunflower oil as a natural solvent for the extraction of aromatic compounds from thyme. This new ecological approach allows the extraction of absolutes free from waxes and petroleum solvent residues, having the highest content in thymol and exerting the strongest antioxidant activity
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Ephrem, Elissa. "Évaluation de l’efficacité des antimicrobiens naturels libres et encapsulés contre la colonisation du jus d’orange par des bactéries lactiques : comparaison entre quatre systèmes d'encapsulation." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSE1328.
Full textAbstract:
Le jus d'orange frais est largement apprécié par les consommateurs en raison de son goût agréable et sa haute valeur nutritionnelle. La qualité du jus d'orange frais est rapidement altérée, notamment par les microorganismes. L'addition des antimicrobiens d'origine végétale au jus d'orange pourrait augmenter la durée de vie de ce jus durant le stockage à 4 °C. Parmi ces antimicrobiens naturels, plusieurs sont sensibles aux facteurs environnementaux qui diminuent leur efficacité dans les produits alimentaires, ce qui nécessite leur incorporation dans des systèmes d'encapsulation. Bien que ce domaine soit promettant, l'évaluation de l'activité des molécules antimicrobiennes encapsulées dans des jus de fruits reste limitée. Nous avons recherché une molécule naturelle active contre Lactobacillus fermentum, une bactérie impliquée dans la détérioration du jus 'orange, dans le milieu de culture. Le nérolidol (Ner), un sesquiterpène alcool, a été sélectionné parmi 28 molécules naturelles (terpènes et phénols) criblées et a montré une puissante activité contre L. fermentum (concentration minimale inhibitrice (CMI) = 25 μM et concentration minimale bactéricide (CMB)= 50 μM) dans le milieu de culture à 37 °C. Dans la suite du travail, le Ner a été incorporé dans le complexe d'inclusion hydroxypropyl-β-cyclodextrin (HP-β-CD)/Ner, les liposomes conventionnels (LCs), les liposomes contenant le complexe d'inclusion (DCL) et les bicelles. Les analyses HPLC ont montré que les complexes d'inclusion, les LCs et le système DCL contenaient 40, 30 et 15 μg Ner/mg poudre, respectivement. En outre, les systèmes ont été caractérisés en termes de morphologie, de taille, d'homogénéité et de potentiel zêta. Le Ner a été incorporé dans les bicelles à un rapport molaire phospholipides:Ner de 100:1 sans altération de la structure du système (taille, homogénéité, potentiel zêta, morphologie). Cette formulation a montré une efficacité d'encapsulation du Ner et un taux d'incorporation des phospholipides élevés et un pourcentage de Ner dans les bicelles de 0,86%. A des concentrations plus élevées, le Ner a altéré les caractéristiques physiques (taille, homogénéité, morphologie) et thermodynamiques de la membrane des bicelles et a augmenté le désordre au niveau membranaire. Le complexe d'inclusion HP-β-CD/Ner (CMI = 100 μM et CMB= 200 μM) a montré une bonne efficacité contre L. fermentum dans le milieu de culture à 37 °C. L'efficacité du Ner libre et du complexe d'inclusion HP-β-CD/Ner a énormément diminué dans le jus d'orange réfrigéré, vu qu'un effet bactéricide total a été obtenu après 8 et 17 jours d'incubation, respectivement, à 2000 μM en Ner. Alors que les liposomes ont bloqué cette activité pour au moins 20 jours et ont altéré l'aspect du jus. A 4000 μM en Ner libre ou incorporé dans le complexe d'inclusion, une mort bactérienne totale a été observée après 5 et 6 jours, respectivement. En outre, la présence du complexe d'inclusion n'a pas modifié le pH et l'acidité titrable du jus, alors qu'une faible augmentation du degré de Brix a été observée. Des études ultérieures sur l'activité antibactérienne des bicelles incorporant le Ner peuvent être envisagées pour déterminer l'efficacité du système préparé. Ce système pourrait être aussi caractérisé en termes de cinétique de libération, de protection du NerFresh orange juice is widely appreciated by consumers due to its pleasant taste and high nutritional value. Fresh orange juice is rapidly altered during storage, especially by microorganisms. The addition of plant-derived antimicrobials to orange juice may increase its shelf life during storage at 4 °C. Many of these natural antimicrobials are sensitive to environmental factors which reduce their effectiveness in food products. Therefore, their incorporation into encapsulation systems is required. Although this strategy is promising, the evaluation of the activity of encapsulated antimicrobials in fruit juices remains limited. In this study, we searched for a natural molecule active against Lactobacillus fermentum, a bacterium involved in the deterioration of orange juice, in the culture medium. Nerolidol (Ner), a sesquiterpene alcohol, was selected among 28 natural molecules (terpenes and phenols) and showed a potent activity against L. fermentum (minimum inhibitory concentration (MIC) = 25 μM and minimal bactericidal concentration (CMB) = 50 μM) in culture medium at 37 °C. Ner was incorporated into hydroxypropyl-β-cyclodextrin (HP-β-CD) inclusion complex, conventional liposomes (CLs), dug-in-cyclodextrin-in liposome (DCL) and bicelles. HPLC analysis showed a Ner content of 40, 30 and 15 μg per mg powder of HP-β-CD/Ner inclusion complex, LCs, and DCL system, respectively. In addition, the systems were characterized in terms of morphology, size, homogeneity, and zeta potential. Ner was incorporated in bicelles at a phospholipids to Ner molar ratio of 100:1 without altering the structural characteristics of the system (size, homogeneity, zeta potential, morphology). This formulation showed a high encapsulation efficiency of Ner, a high phospholipid incorporation rate, and a molar percentage of Ner in bicelles of 0.86%. At higher concentrations, Ner altered the physical (size, homogeneity, morphology) and the thermodynamic parameters of the bicelles membrane in addition to the increase in membrane fluidity. The HP-β-CD/Ner inclusion complex (MIC = 100 μM and CMB = 200 μM) showed good efficacy against L. fermentum in the culture medium at 37 C. The efficacy of free Ner and HP-β-CD/Ner inclusion complex was greatly reduced in refrigerated orange juice, as a total bactericidal activity was observed after 8 and 17 days of incubation, respectively, at a Ner concentration of 2000 μM. Whereas, liposomes blocked this activity for at least 20 days and altered the appearance of the juice. At 4000 μMof free Ner or Ner incorporated into the inclusion complex, a total bacterial death was observed after 5 and 6 days, respectively. In addition, the presence of the inclusion complex did not alter the pH and the titratable acidity of the juice, while a slight increase in the Brix degree value was observed. Subsequent studies on the antibacterial activity of bicelles incorporating Ner may be considered to determine the effectiveness of the prepared system. This system could also be characterized in terms of release rate and Ner stability
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Beaugendre, Camille. "Caractérisation des résines de Calophyllum inophyllum L. : approches déréplicatives pour la recherche de composés antimicrobiens." Thesis, Université Paris Cité, 2019. http://www.theses.fr/2019UNIP5067.
Full text
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Navarri, Marion. "Métabolites secondaires de champignons de sédiments marins profonds : criblages génétique et fonctionnel et caractérisation structurale de molécules antimicrobiennes." Thesis, Brest, 2016. http://www.theses.fr/2016BRES0127/document.
Full textAbstract:
La propagation des micro-organismes résistants aux antibiotiques menace le système mondial de santé publique. Pour lutter contre ce phénomène, le renouvellement des molécules utilisées en antibiothérapie est devenu une priorité mondiale. Les antibiotiques étant principalement d’origine microbienne, l’étude des micro-organismes et de leurs métabolites s’est donc renforcée et s’oriente vers des écosystèmes peu explorés comme les biotopes marins.Nous avons exploré les activités antimicrobiennes d’une collection de 183 champignons isoles de sédiments marins profonds et collectés entre 4 et 1884 mètres sous le plancher océanique. Le potentiel de production de métabolites de cette collection a été révélé par un criblage génétique ciblant les PolyKetide synthase (PKS), les Non-Ribosomal Peptide Synthetase (NPRS), les TerPene Synthase (TPS) et les hybrides PKS-NRPS. Après avoir regroupé les isolats en fonction de leur profil MSP PCR, 110 ont été sélectionnés pour un criblage fonctionnel, montrant une forte proportion de champignons filamenteux antimicrobiens (32%).Après extraction et fractionnement, les composés bioactifs de 3 souches ont été caractérisés aux niveaux structural et fonctionnel. Ainsi, O. griseum UBOCC-A-114129 produit la fuscine, la dihydrofuscine, la secofuscine et la dihydrosecofuscine, P. bialowiezense UBOCC-A-114097 produit l’acide mycophénolique et Penicillium sp. produit UBOCC-A-114109 la rugulosine.Parallèlement, des analyses en LC-HRMS, réalisées sur des extraits fongiques, ont révélé un grand nombre de métabolites non décrits dans les bases de données. Les champignons des sédiments marins constituent donc un réservoir de structures originales à explorerThe spreading of antimicrobial resistant microorganisms jeopardizes global health caresystem. To counteract this threat the renewal of antibiotic molecules is a global priority. Antibioticcompounds are mainly originated from microorganisms, so microorganisms and their secondarymetabolites received an increasing interest. The search for new natural antimicrobial compoundsfrom microorganisms gained untapped ecosystems as marine biosphere.We investigated the antimicrobial properties of a fungal collection. The 183 fungal isolateswere collected from deep subseafloor sediment and isolated between 4 and 1,884 meters belowthe seafloor. Secondary metabolites production potential was studied for all isolates in thecollection by screening genes coding PolyKetide Synthase (PKS), Non-Ribosomal Peptide Synthetase(NRPS), TerPene Synthase (TPS) and hybrid PKS-NRPS. After isolates dereplication according to theirMSP-PCR fingerprinting, an antimicrobial screening was performed for 110 isolates, highlighting ahigh proportion of filamentous fungi with antimicrobial properties (32%).After extraction and bio-guided fractionation bioactive metabolites isolated from 3 strains,were characterized in a structural and functional manner: O. griseum UBOCC-A-114129 producedfuscin, dihydrofuscin, secofuscin and dihydrosecofuscine, P. bialowiezense UBOCC-A-114097synthetized mycophenolic acid and Penicillium sp. UBOCC-A-114109 produced rugulosin.In the meantime, LC-HRMS analysis, performed on fungal extracts, showed a great proportionof metabolites not detected in interrogated databases. So, deep subseafloor fungi, represent anuntapped reservoir of original structures to explore
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Claveau, David. "Activités antimicrobiennes de différentes préparations de ZnO, CaO et MgO et leur potentiel comme agents de conservation dans les jus de fruit." Thesis, Université Laval, 2009. http://www.theses.ulaval.ca/2009/26675/26675.pdf.
Full text
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Birck, Cécile. "Conception et caractérisation de films antimicrobiens à base de poly(alcool vinylique) pour l’emballage à contact alimentaire." Electronic Thesis or Diss., Lille 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LIL10074.
Full textAbstract:
L’objectif de ce travail était de développer des films antimicrobiens à base de poly(alcool vinylique)(PVOH) réticulés par de l’acide citrique (CTR). La démarche choisie a consisté à incorporer dans le polymère du benzoate de sodium (NaBz), seul ou sous forme de complexe avec l’hydroxypropyl-β-cyclodextrine (HPβCD). La combinaison des fonctions résiduelles du CTR greffé sur le polymère et du NaBz libre permet d’envisager des effets antimicrobiens par contact et par diffusion. Les films ont été réalisés par casting à partir de solutions aqueuses et réticulés par un traitement thermique. La réaction de réticulation a été mise en évidence et suivie à travers l’étude des composés résiduels, l’évolution de la Tg et des fonctions COOH résiduelles en fonction du temps de réticulation. L’étude de différentes compositions a permis de sélectionner les concentrations de 20 et 30 wt% en CTR pour un compromis entre réticulation suffisante et ductilité du film préservée. Le temps nécessaire pour lier l’ensemble des réactifs diminue avec l’augmentation de la température ou de la quantité de CTR. La réaction de réticulation n’est pas modifiée par la présence d’HPβCD. Avec l’ajout de CTR ou d’HPβCD et la réticulation, les films restent faiblement perméables à O2 et fortement perméables à la vapeur d’eau. Concernant la libération du NaBz dans l’eau, la cinétique est ralentie à partir de 360 min de réticulation et de 20 wt% de CTR. L’HPβCD n’a pas d’influence sur la cinétique de libération mais a permis de doubler la quantité libérée. L’activité antimicrobienne par contact et par diffusion a été mise en évidence pour la majorité des films contre l’ensemble des microorganismes étudiésThe aim of this work was to develop antimicrobial films based on polyvinyl alcohol (PVOH) crosslinked by citric acid (CTR). In our approach, sodium benzoate (NaBz) was introduced in polymer, alone or in complex form with hydroxypropyl-β-cyclodextrin (HPβCD). Both CTR residual functions grafted on polymer and free NaBz are expected to provide antimicrobial effects by contact and diffusion. Films were elaborated by casting from aqueous solutions and crosslinked by heat treatment. Crosslinking reaction has been highlighted and followed through the study of residual reagents, the evolution of Tg and residual COOH functions according to crosslinking time. From this investigation, a compromise between sufficient crosslinking and preserved film ductility has been found for a CTR concentration between 20 and 30 wt%. The time required to bind all of the reagents decreases with the increase of temperature or amount of CTR. The crosslinking reaction was not modified by the presence of HPβCD. With the addition of CTR or HPβCD and the crosslinking step, the films remain slightly permeable to O2 and highly permeable to water vapor. Considering the NaBz release in water, kinetics is slowed from 360 min of crosslinking and 20 wt% CTR. HPβCD has no major influence on the kinetics of release but allow to double released amount. Antimicrobial activity by contact and diffusion has been demonstrated for the majority of films against all studied microorganisms
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Hammami, Riadh. "Approches biochimiques et bioinformatiques pour l'étude de la relation structure/fonction des peptides antimicrobiens d'origine végétale." Electronic Thesis or Diss., Lille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LIL10044.
Full textAbstract:
Des approches différentes mais complémentaires de bioinformatique et de biochimie ont été utilisées lors de cette étude dans le but d’identifier, d’étudier et de caractériser de nouveaux peptides antimicrobiens d’origine végétale. Dans un premier temps, et compte tenu de la grande diversité des peptides antimicrobiens mis au jour jusqu’à présent, nous nous somme fixé comme premier objectif de développer une plateforme informatique complète comprenant un logiciel, Scientific DataBase Maker (SciDBMaker) et une base de données baptisée PhytAMP. Cette plateforme permet l'extraction, l’analyse et le triage de données sur les protéines à partir de la base de données Swiss-Prot. Elle permet également de rassembler des informations taxonomiques, microbiologiques et physico-chimiques importantes sur les peptides antimicrobiens des plantes. Ainsi la constitution de cette plateforme ouvre de nouvelles perspectives informatives, en particulier celles relatives à la prédiction des relations structure / fonction en relation avec les organismes cibles et donc leur mode d’action. Dans un deuxième temps, une approche expérimentale a été utilisée afin d’évaluer le potentiel antimicrobien de quelques plantes spontanées issues des régions arides de la Tunisie. Ainsi, l’activité antimicrobienne d’Oudneya africana R. Br. (Brassicaceae), de Juniperus phoenicea L. (Cupressaceae) et de Pistacia atlantica Desf. (Anacardiaceae), trois espèces de plantes spontanées utilisées à des fins médicinales dans les zones arides de la Tunisie, de même que leurs propriétés physico-chimiques ont été évaluées. Les résultats obtenus ont montré la présence d’une activité antimicrobienne dans les trois plantes étudiées. Cette étude comparative a établi clairement le potentiel des plantes médicinales spontanées des régions arides de la Tunisie comme source d’agents antimicrobiens. Une étude poussée réalisée sur un extrait actif de l’une des trois plantes, Oudneya africana, a montré la présence de molécule peptidique de faible masse moléculaire ayant un très large spectre d’action antimicrobien. L’étude de cet extrait a été effectuée et a permis de mettre en évidence le potentiel d’exploitation aussi bien dans le secteur agroalimentaire que pharmaceutique de ces molécules bioactives naturelles. Notre travail constitue une contribution importante à l’étude des peptides antimicrobiens d’origine végétale. Des informations scientifiques très originales ont été générées tout au long de notre étude. Les connaissances fondamentales et appliquées générées ouvrent des perspectives multiples pour une exploration plus poussée de ce champ d’activité encore très peu exploitéDifferent approaches but complementary in bioinformatics and biochemistry have been used during this study to identify, investigate and characterize new plant antimicrobial peptides. At first, and given the wide diversity of antimicrobial peptides uncovered so far, we have set the first goal to develop a platform that includes software, Scientific DataBase Maker (SciDBMaker) and a database PhytAMP. This platform allows the extraction, analysis and sorting of data on proteins from the Swiss-Prot database. It can also gather taxonomic, microbiological and physicochemical information on plant antimicrobial peptides. Thus the development of this platform opens up new informative prospects, particularly those relating to the prediction of structure / function in relation to the target organisms and thus their mode of action. In a second time, an experimental approach was used to evaluate the antimicrobial potential of some spontaneous plants from arid regions of Tunisia. Thus, the antimicrobial activity of Oudneya africana R. Br (Brassicaceae), Juniperus phoenicea L. (Cupressaceae) and Pistacia atlantica Desf. (Anacardiaceae), three spontaneous plant species used for medicinal purposes in the arid areas of Tunisia, as well as their physicochemical properties have been evaluated. The results showed the presence of antimicrobial activity in the three studied plants. This study has clearly established the potential of medicinal plants growing wild in arid regions of Tunisia as a source of antimicrobial agents. A study conducted on an active extract of one of three plants, Oudneya africana, showed the presence of peptide molecule of low molecular weight with a very broad spectrum antimicrobial action. The study of the extract was performed and revealed the potential of such bioactive natural molecules for exploitation in both the food and pharmaceutical industries. Our work is an important contribution to the study of plant antimicrobial peptides. Very original scientific informations have been generated throughout our study. The generated fundamental and applied knowledge open multiple perspectives for further exploration of this field of activity which still untapped
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Bouarab, Lynda. "Évaluation du potentiel et de voies innovantes de mise en oeuvre de composés phénoliques antimicrobiens d’origine végétale pour la conservation des aliments." Thesis, Lyon, 2018. http://www.theses.fr/2018LYSE1084.
Full textAbstract:
Le règne végétal est une ressource renouvelable d'une large gamme de métabolites secondaires biologiquement actifs. Ces travaux de thèse proposent une stratégie multidisciplinaire d'évaluation du potentiel de composés phénoliques antimicrobiens d'origine végétale pour la conservation des aliments. Un criblage de l'activité antimicrobienne in vitro vis-à-vis de 8 souches de la flore pathogène et d'altération des aliments d'une centaine de molécules pures et une soixantaine d'extraits végétaux a d'abord permis de sélectionner les plus actifs. Différents mécanismes d'action vis-à-vis de S. aureus ont pu être mis en évidence par cytométrie de flux couplée à l'utilisation de marqueurs de l'état physiologique des bactéries pour quelques uns des composés actifs sélectionnés. En vue d'une application à de la viande bovine, l'activité antibactérienne des composés phénoliques ou extraits végétaux les plus actifs a été réévaluée dans des milieux de culture plus complexes mimant leur teneur en protéines et en matières grasses. Les résultats de ce criblage et un suivi microbiologique de viande hachée de bœuf avec 1% (m/m) d'extrait ajouté ont permis d'observer que les pertes d'activité antibactérienne observées étaient notamment corrélées aux interactions des composés phénoliques avec les protéines ou les matières grasses. L'incorporation des composés phénoliques ou extraits végétaux dans des matériaux d'emballage en contact alimentaire a constitué la seconde voie de mise en œuvre envisagée. Des films plastiques conservant une activité antibactérienne ont ainsi pu être élaborés par voie fondueThe plant kingdom is a renewable resource of a wide range of biologically active secondary metabolites. This thesis proposes a multidisciplinary strategy for evaluating the potential of plant-derived antimicrobial phenolic compounds for food preservation. A screening of the antimicrobial activity in vitro against 8 strains of foodborne pathogenic and spoilage microorganisms of a hundred pure molecules and about sixty plant extracts allowed to select the most active. Different mechanisms of action with respect to S. aureus could be demonstrated by flow cytometry coupled with the use of probes of the physiological state of the bacteria for some of the selected active compounds. For application to beef, the antibacterial activity of the most active phenolic compounds or plant extracts has been re-evaluated in more complex culture media mimicking their protein and fat content. The results of this screening and a microbiological monitoring of minced beef with 1% (m / m) of added extract made it possible to observe that the observed losses of antibacterial activity were in particular correlated with the interactions of the phenolic compounds with the proteins or fat. Incorporation of phenolic compounds or plant extracts into packaging materials in contact with food constituted was the second proposed route of implementation. Plastic films that retain antibacterial activity have thus been able to be prepared by melting
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Chessa, Céline. "Activités antivirales et immunomodulatrices des peptides antimicrobiens au cours de l'infection de kératinocytes primaires humains par le virus West Nile." Thesis, Poitiers, 2022. http://www.theses.fr/2022POIT1401.
Full textAbstract:
Le Virus West Nile (WNV) est un flavivirus neurotrope émergent contre lequel il n’existe ni traitement ni vaccin. Transmis à l’Homme lors du repas sanguin du moustique vecteur, le virus est inoculé dans la peau où il infecte les kératinocytes de l’épiderme. L’arsenal défensif du kératinocyte humain inclut la synthèse de 9 peptides antimicrobiens dont l’activité contre le WNV n’a jusqu’ici jamais été étudiée. Au cours de ce travail, nous avons évalué les propriétés antivirales et immunomodulatrices de la cathélicidine humaine LL-37, de la bêta-défensine humaine de type 3 (hBD-3) et de deux peptides de la famille S100, la psoriasine S100A7 et la calprotectine S100A8/A9. Nos résultats ont montré une activité antivirale directe de la LL-37, à forte concentration (10 µg/mL), se traduisant par une réduction de la charge virale dans le surnageant des kératinocytes infectés et du titre infectieux d'un inoculum viral incubé en présence du peptide. En revanche, le traitement par hBD-3 n’a pas eu d’impact significatif sur l'infection par le WNV aux concentrations testées. Par ailleurs, une augmentation significative de l’expression de plusieurs marqueurs inflammatoires aux niveaux transcriptomique et protéique a été observée en présence de chacun des deux peptides par rapport aux cellules stimulées par un ARN bicaténaire de synthèse, le poly (I:C), ou infectées par le WNV en leur absence. Dans la seconde partie de ce travail, les expérimentations menées avec les peptides S100A7 et S100A8/A9 se sont révélées décevantes. L’apport exogène des peptides au cours de l’infection de kératinocytes ou le recours à des cellules génétiquement modifiées pour surexprimer les peptides d’intérêt n’a montré aucun impact significatif sur la réplication du WNV. En complément, aucun effet virucide des peptides S100 à la concentration de 10 µg/mL ni immunomodulateur n’a été observé. En conclusion, ces résultats suggèrent un effet antiviral indirect de la LL-37 et d’hBD-3 par potentialisation de la réponse immunitaire innée du kératinocyte à l’infection. Ces propriétés immunomodulatrices viendraient s’ajouter, pour la LL-37, à une action directe par altération de la particule virale. En revanche, les peptides de la famille S100 ne semblent pas avoir de rôle antiviral majeur dans la réponse antivirale du kératinocyte à l’infection par le WNV. De façon générale, ce travail souligne les potentialités antivirales, encore méconnues, des molécules produites par la peau et les kératinocytes à la porte d'entrée et au site initial de réplication du WNV et des arbovirus dans l'organismeWest Nile Virus (WNV) is an emerging neurotropic flavivirus for which there is no treatment nor vaccine. Transmitted to humans during the blood meal of the vector mosquito, the virus is inoculated into the skin where it infects the keratinocytes of the epidermis. The defensive arsenal of the human keratinocyte includes the synthesis of 9 antimicrobial peptides whose activity against WNV has never been studied so far. In this work, we evaluated the antiviral and immunomodulatory properties of human cathelicidin LL-37, human beta-defensin type 3 (hBD-3), and two S100 family peptides, psoriasin S100A7 and calprotectin S100A8/A9. Our results showed a direct antiviral activity of LL-37, at high concentration (10 µg/mL), resulting in a reduction of the viral load in the supernatant of the infected keratinocytes and of the infectious titer of a viral inoculum incubated in presence of the peptide. In contrast, hBD-3 treatment did not have a significant impact on WNV infection at the concentrations tested. In addition, a significant increase in the expression of several inflammatory markers at the transcriptomic and protein levels was observed in the presence of each of the two peptides compared to cells stimulated by a synthetic double-stranded RNA, poly (I:C), or infected with WNV in their absence. In the second part of this work, the experiments carried out with the S100A7 and S100A8/A9 peptides proved to be disappointing. Addition of the peptides during the infection of keratinocytes or the use of genetically modified cells to overexpress the peptides of interest showed no significant impact on the replication of WNV. Moreover, no virucidal effect of S100 peptides at a concentration of 10 µg/mL nor immunomodulatory properties was observed. In conclusion, these results suggest an indirect antiviral effect of LL-37 and hBD-3 by potentiation of the innate immune response of the keratinocyte to infection. These immunomodulatory properties would be added, for LL-37, to a direct action by altering the viral particle. In contrast, S100 family peptides do not appear to have a major antiviral role in the keratinocyte antiviral response to WNV infection. In general, this work underlines the still little-known antiviral potential of molecules produced by the skin and keratinocytes at the entry point and initial site of replication of WNV and arboviruses in the organism
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Hammami, Riadh. "Approches biochimiques et bioinformatiques pour l'étude de la relation structure/fonction des peptides antimicrobiens d'origine végétale." Thesis, Lille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009LIL10044/document.
Full textAbstract:
Des approches différentes mais complémentaires de bioinformatique et de biochimie ont été utilisées lors de cette étude dans le but d’identifier, d’étudier et de caractériser de nouveaux peptides antimicrobiens d’origine végétale. Dans un premier temps, et compte tenu de la grande diversité des peptides antimicrobiens mis au jour jusqu’à présent, nous nous somme fixé comme premier objectif de développer une plateforme informatique complète comprenant un logiciel, Scientific DataBase Maker (SciDBMaker) et une base de données baptisée PhytAMP. Cette plateforme permet l'extraction, l’analyse et le triage de données sur les protéines à partir de la base de données Swiss-Prot. Elle permet également de rassembler des informations taxonomiques, microbiologiques et physico-chimiques importantes sur les peptides antimicrobiens des plantes. Ainsi la constitution de cette plateforme ouvre de nouvelles perspectives informatives, en particulier celles relatives à la prédiction des relations structure / fonction en relation avec les organismes cibles et donc leur mode d’action. Dans un deuxième temps, une approche expérimentale a été utilisée afin d’évaluer le potentiel antimicrobien de quelques plantes spontanées issues des régions arides de la Tunisie. Ainsi, l’activité antimicrobienne d’Oudneya africana R. Br. (Brassicaceae), de Juniperus phoenicea L. (Cupressaceae) et de Pistacia atlantica Desf. (Anacardiaceae), trois espèces de plantes spontanées utilisées à des fins médicinales dans les zones arides de la Tunisie, de même que leurs propriétés physico-chimiques ont été évaluées. Les résultats obtenus ont montré la présence d’une activité antimicrobienne dans les trois plantes étudiées. Cette étude comparative a établi clairement le potentiel des plantes médicinales spontanées des régions arides de la Tunisie comme source d’agents antimicrobiens. Une étude poussée réalisée sur un extrait actif de l’une des trois plantes, Oudneya africana, a montré la présence de molécule peptidique de faible masse moléculaire ayant un très large spectre d’action antimicrobien. L’étude de cet extrait a été effectuée et a permis de mettre en évidence le potentiel d’exploitation aussi bien dans le secteur agroalimentaire que pharmaceutique de ces molécules bioactives naturelles. Notre travail constitue une contribution importante à l’étude des peptides antimicrobiens d’origine végétale. Des informations scientifiques très originales ont été générées tout au long de notre étude. Les connaissances fondamentales et appliquées générées ouvrent des perspectives multiples pour une exploration plus poussée de ce champ d’activité encore très peu exploitéDifferent approaches but complementary in bioinformatics and biochemistry have been used during this study to identify, investigate and characterize new plant antimicrobial peptides. At first, and given the wide diversity of antimicrobial peptides uncovered so far, we have set the first goal to develop a platform that includes software, Scientific DataBase Maker (SciDBMaker) and a database PhytAMP. This platform allows the extraction, analysis and sorting of data on proteins from the Swiss-Prot database. It can also gather taxonomic, microbiological and physicochemical information on plant antimicrobial peptides. Thus the development of this platform opens up new informative prospects, particularly those relating to the prediction of structure / function in relation to the target organisms and thus their mode of action. In a second time, an experimental approach was used to evaluate the antimicrobial potential of some spontaneous plants from arid regions of Tunisia. Thus, the antimicrobial activity of Oudneya africana R. Br (Brassicaceae), Juniperus phoenicea L. (Cupressaceae) and Pistacia atlantica Desf. (Anacardiaceae), three spontaneous plant species used for medicinal purposes in the arid areas of Tunisia, as well as their physicochemical properties have been evaluated. The results showed the presence of antimicrobial activity in the three studied plants. This study has clearly established the potential of medicinal plants growing wild in arid regions of Tunisia as a source of antimicrobial agents. A study conducted on an active extract of one of three plants, Oudneya africana, showed the presence of peptide molecule of low molecular weight with a very broad spectrum antimicrobial action. The study of the extract was performed and revealed the potential of such bioactive natural molecules for exploitation in both the food and pharmaceutical industries. Our work is an important contribution to the study of plant antimicrobial peptides. Very original scientific informations have been generated throughout our study. The generated fundamental and applied knowledge open multiple perspectives for further exploration of this field of activity which still untapped
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Nyegue, Maximilienne Ascension. "Propriétés chimiques et biologiques des huiles essentielles de quelques plantes aromatiques et/ou médicinales du Cameroun : évaluation de leurs activités antiradiculaires, anti-inflammatoires et antimicrobiennes." Montpellier 2, 2006. http://www.theses.fr/2006MON20010.
Full text
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Dhouioui, Mouna. "Contribution à l’étude phytochimique d’espèces végétales de la flore tunisienne (Aristolochia longa L. et Bryonia dioïca Jacq.) : évaluation des activités antioxydante et antimicrobienne." Thesis, Lyon, 2016. http://www.theses.fr/2016LYSE1212.
Full textAbstract:
La diversité moléculaire des huiles essentielles obtenues à partir des racines d'A. longa est répartie essentiellement en sesquiterpènes oxygénés (50,2 - 81,1%) suivie de monoterpènes oxygénés (5,9 - 28,0%), sesquiterpènes hydrocarbonés (0,7 - 18,4%) et monoterpènes hydrocarbonés (0,0 - 0,8%). Mais, l'huile essentielle des parties aériennes est caractérisé par le pin-2-en-8-ol (29,0 - 17,7%) et le 8-acetoxy-pin-2-ene (15,0 - 25,6%). L'ensemble des acides gras identifiés dans les différents organes d'A. longa et de Bryonia dioïca ont été classés en acide gras polyinsaturés (A.G.P.I) variant de 20,1 à 45,4%, en acide gras mono insaturés variant de 10,1 à 41,2%, et en acide gras saturés (A.G.S) variant de 26,7 à 52,2%. Les valeurs pour les deux paramètres (A.G.P.I)/(A.G.S) et (ω-6)/(ω-3) dans les parties aériennes des deux espèces sont de même ordre de grandeur que d'autres espèces comestibles. Par conséquent, les parties aériennes des deux espèces peuvent être considérées comme une source importante et saine d' (ω-6) et (ω-3). L'activité antibactérienne et antifongique des huiles essentielles a été évaluée qualitativement par la méthode de diffusion de disque sur les différentes souches Gram(+), Gram(-) et un champignon (C. albicans). On constate que les souches de Gram(+) sont plus sensibles aux différentes huiles que les souches de Gram(-) et le champignon. Le pouvoir antibactérien des fractions lipidiques d'A. longa et de B. dioïca a été évalué qualitativement quantitativement par la détermination des concentrations minimales inhibitrices (CMI) et des concentrations minimales bactéricides (CMB). Dans la présente étude les résultats des CMI et des CMB montrent que les souches de bactéries testées présentent une sensibilité distincte aux différentes fractions lipidiques. De plus, l'activité antioxydante des extraits a été estimée en appliquant un plan d'expériences de type Plackett-Burman. Les résultats trouvés ont conduit au classement des antioxydants testés par ordre décroissant d'activité, indépendamment de la concentration initiale des radicaux libres en milieu tamponné : l'acide férulique est plus actif que l'extrait de B. dioica, ce dernier est plus puissant que l'extrait d'A. longaComposition of essential oil is known to depend on intrinsic and extrinsic factors. Experiments were conducted to study the variation in the essential oil composition of Aristolochia longa (Aristolacheae) harvested at different period (August, 2009; September, 2011; March, 2012; and April, 2013). The essential oil composition was assessed by GC–FID and GC–MS analyses. Hence, oxygenated sesquiterpenes (50.2–81.1%) and oxygenated monoterpenes (5.9–28.0%) are the major chemical groups. The antimicrobial properties of essential oils were evaluated against six microorganisms by the disc diffusion method. Increasingly, the essential oil isolated from roots collected in September (2011), exhibited the highest antimicrobial activity against Streptococcus agalactiae (G+) and Enterococcus faecium (G+). The composition of the fatty acids of the roots and aerial parts of A. longa and Bryonia dioïca (Cucurbutaceae) was analyzed by GC-FID and GC-MS. The oils extracted from the aerial parts of both species were rich in polyunsaturated fatty acids with the essential linolenic and linoleic acids being the most prominent compounds. Oleic and linoleic acids were the majors fatty acids in the roots of both species. The antibacterial activity, minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration (MBC) of the lipid extracts were determined against a panel of five bacterial strains. The antibacterial activity of the root lipid extracts was particularly important against Enterococcus feacium (G+) (CMI value of 125 μg/mL; CMB values > 250 μg/mL) and Streptococcus agalactiae (G+) (CMI value of 125 μg/mL; CMB values 250 μg/mL for A. longa roots). These results indicate that A. longa and B. dioïca could be considered as good sources of essential fatty acids which can act as natural antibacterial agents. An experimental design is an experimental set-up to simultaneously evaluate several factors at given numbers of levels in a predefined number of experiments, and also to provide maximum chemical information by analysing chemical data. So, Plackett–Burman (PB) experimental was used to appreciate the stability of DPPH and to estimate antioxidant activity of ferulic acid and the plant extracts. Hence, to increase DPPH absorbance at 190μM the buffer type, pH medium, solvent type and reaction time should be maintained at its lower level while buffer concentration, temperature, buffer ratio should be kept at its high level. While, to increase DPPH absorbance at 50 μM is obtained with buffer acetate, lower temperature and short reaction time. Further, the radical scavenging activity of the plant extracts and ferulic acid as a pure compound is examined in the selected conditions by PB design
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Darpentigny, Clémentine. "Fonctionnalisation de structures de nanocellulose en fluide supercritique pour des applications de pansements antimicrobiens Ice-templated freeze-dried cryogels from tunicate cellulose nanocrystals with high specific surface area and anisotropic morphological and mechanical properties Highly Absorbent Cellulose Nanofibrils Aerogels Prepared by Supercritical Drying." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019GREAV052.
Full textAbstract:
Dans un contexte où la demande en matériaux médicaux innovants augmente et où la question environnementale devient une préoccupation majeure, l’objectif du projet a été de préparer des pansements antimicrobiens par la voie la plus verte possible. Pour cela, les nanocelluloses ont été retenues comme briques de base biosourcées et biocompatibles pour le design d’architectures poreuses et leur fonctionnalisation par des agents antimicrobiens a été ensuite entreprise en milieu CO2 supercritique (CO2sc) utilisé comme alternative aux solvants organiques en tirant profit de ses spécificités telles qu’une diffusivité élevée, une élimination aisée du solvant et des réactifs résiduels et une compatibilité avec les matériaux fragiles. Ainsi, des structures 2D et 3D, nanopapiers, cryogels et aérogels, ont été préparées à partir de nanofibrilles (NFC) et de nanocristaux (NCC) de cellulose et présentent des propriétés variées en termes de porosité, morphologie et surface spécifique. Dans le but d’introduire une fonction antibactérienne, les cryogels préparés à partir de nanocelluloses de chimie de surface variées ont été dans un premier temps imprégnés en CO2sc d’un antibiotique synthétique, la ciprofloxacine. Les cryogels imprégnés présentent une activité antibactérienne contre les bactéries Gram-positive et Gram-négative. Ensuite, quatre matériaux de surface spécifique croissante tous préparés à partir de NFC ont été imprégnés avec une molécule issue d’huiles essentielles, le thymol. Les résultats montrent un contrôle direct de la quantité imprégnée avec la surface spécifique qui conduit dans le cas des cryo- et aérogels à de bonnes propriétés antimicrobiennes contre deux types de bactéries et une levure. La seconde stratégie de fonctionnalisation a porté sur le greffage covalent d’un silane aminé antimicrobien en CO2sc. Des méthodes d’analyse de surface (spectrométrie photoélectronique X, angle de contact et potentiel zêta de surface) ont permis de confirmer le succès du greffage sur les nanopapiers. Les propriétés antibactériennes par contact des nanopapiers et cryogels greffés ont été confirmées. Ces résultats sont prometteurs pour l’élaboration en conditions supercritiques de dispositifs médicaux antimicrobiens bio-sourcés et biocompatiblesIn a context where the need for innovative medical devices is increasing and the environmental issue is becoming a major concern, the objective of the project the aim of the project was to prepare antimicrobial wound dressings using the greenest possible way. For this purpose, nanocelluloses have been chosen as bio-based and biocompatible building blocks for the design of porous architectures and their functionalization with antimicrobial agents was then undertaken in supercritical CO2 medium (CO2sc) used as an alternative to organic solvents and by taking advantage of its specificities such as high diffusivity, easy removal of solvent and residual reagents and compatibility with fragile materials. Thus, 2D and 3D structures, nanopapers, cryogels and aerogels, were prepared from cellulose nanofibrils (CNFs) and nanocrystals (CNCs), and exhibited various properties in terms of morphology, porosity and specific surface area. In order to introduce antibacterial functionality, cryogels prepared from nanocellulose with varied surface chemistries were impregnated in scCO2 with a synthetic antibiotic, ciprofloxacin. Impregnated cryogels exhibited antibacterial activity against both gram-negative and gram-positive bacterial strains. Then, four materials of increasing specific surface area, all prepared from CNFs, were impregnated with an essential oil molecule, thymol. Results show a direct relationship between of the amount of impregnated molecules and the specific surface that leads in the case of cryo- and aerogels to good antimicrobial properties against two types of bacteria and yeast. In a second strategy, covalent grafting of CNFs structures in supercritical CO2 was investigated with a novel antibacterial aminosilane. Surface analysis characterizations methods (X-ray photoelectron spectroscopy, contact angle and surface zeta potential analysis) confirmed the successful grafting on nanopapers. The contact active properties of grafted nanopapers and cryogels were assessed. These results are very promising for the design of antimicrobial bio-based and biocompatible medical devices using supercritical conditions
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Shyam, Radhe. "Cationic amphipathic peptoid oligomers as antimicrobial peptide mimics." Thesis, Université Clermont Auvergne (2017-2020), 2018. http://www.theses.fr/2018CLFAC048/document.
Full textAbstract:
Les organismes vivants produisent des peptides antimicrobiens (PAMs) pour se protéger contre les microbes. La résistance croissante aux antibiotiques nécessite le développement de nouvelles stratégies thérapeutiques et les PAMs sont des candidats prometteurs pour résoudre ce problème. Ils possèdent une activité à large spectre et leur principal mécanisme d'action par perméation de la membrane engendre peu de phénomènes de résistance. Néanmoins, leur faible biodisponibilité empêche leur utilisation. Certaines limitations peuvent être surmontées en développant des mîmes de PAMs qui conservent leur activité mais avec un potentiel thérapeutique accru. Les peptoïdes (oligomères de N-alkylglycine) structurés en hélice cationique amphiphile sont de bons mimes de PAMs. Les peptoïdes sont plus flexibles que les peptides en raison de l'isomérie cis/trans des amides N,N-disubstitués ; cependant la conformation des amides peut être contrôlée par un choix judicieux des chaînes latérales. Le but de cette thèse est d'étudier l'influence de chaînes latérales(hydrophobes ou cationiques) bloquant la conformation des amides en cis et induisant une structure hélicoïdale de type PolyProline I (PPI) robuste, sur l’activité antibactérienne et la sélectivité de peptoïdes. La conception, la synthèse et l’étude conformationnelle de nouveaux oligomères peptoïdes cationiques portant des chaînes latérales de type tert-butyle et/ou triazolium ont été réalisées. Dans un premier temps, la synthèse en solution d'oligomères à base de tert-butyle a été développée puis une stratégie de synthèse en phase solide a été mise en place pour accéder aux oligomères à base de 1,2,3-triazolium. Ensuite, ces nouveaux oligomères ont été évalués pour leur activité vis à vis d’un panel de bactéries Gram-positive et Gram-négative, leur l'activité antibiofilm et leur sélectivité cellulaire. Enfin, pour visualiser les effets des peptoïdes amphiphiles sur les bactéries, une étude de microscopie a été réaliséeLiving organisms produce antimicrobial peptides (AMPs) to protect themselves against microbes.The growing problem of antimicrobial resistance calls for new therapeutic strategies and the natural AMPs have shown ground-breaking potential to address that issue. They show broad-spectrum activity and their main mechanism of action by bacterial cell membrane disruption implies low emergence of resistance which makes them potent candidates for replacing conventional antibiotics. Nevertheless, few hurdles are impeding their use, notably poor bioavailability profile. Some of these limitations can be overcome by developing peptidomimetics of AMPs which exhibit antibacterial activities together with enhanced therapeutic potential. Peptoids (i.e. N-alkyl glycine oligomers) adopting cationic amphipathic helical structures are mostly competent AMP mimetics. From a conformational point of view, peptoids are fundamentally more flexible than peptides primarily due to the cis/trans isomerism of N,N-disubstituted amides but studies in this area have shown that cis amide conformation can be controlled by careful choice of side-chain to set a PolyProline I-type helical structure of peptoids. In this thesis, the genesis of novel amphipathic cationic peptoids carrying cis-directing tert-butyl and/or triazolium-type side-chains and their untapped potential to act against bacteria will be discussed comprehensively. First, the solutionphase synthesis of tert-butyl-based oligomers was developed. Second, novel method of solid-phase submonomer synthesis was optimised to access 1,2,3-triazolium-based oligomers. Then, the synthesised cationic oligomers were evaluated for their antibacterial potential, followed by antibiofilm activity and cell selectivity assays. In the end, to have insights on the mode of action of amphipathic peptoids, microscopy was carried out