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Dissertationen zum Thema „Troubles du métabolisme des acides aminés“
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Poittevin, Monique. „Mise au point d'une nouvelle méthode de dosage des acides aminés dans les liquides biologiques par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem : application en routine au diagnostic et au suivi des patients atteints d'aminoacidopathies“. Lyon 1, 2005. http://www.theses.fr/2005LYO10215.
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Le développement de la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) dans les laboratoires de biologie clinique a permis d'envisager le remplacement des analyseurs d'acides aiminés (AA) par une méthode MS/MS, plus sensible , plus spécifique et avec une cadence d'analyse améliorée. Le développement de cette méthode a comporté plusieurs étapes : [1] sélection des molécules à analyser, étude de leur fragmentation en MS/MS, optimisation [2] adaptation d'une technique de chromatographie liquide compatible avec la détection MS/MS (chromatographie à polarité de phases inversée avec appariement d'ions, l'agent d'appariement est l'acide tridécafluoroheptanoïque), [3] application à des échantillons (plasma, urine) de patients atteints de diverses aminoacidopathies (validation qualitative) [4] quantification en utilisant 16 AA marqués avec un isotope stable comme standard interne, [5] utilisation en routine pendant 2 ans. La validation quantitative a été obtenue pour de nombreux AA. La méthode est utilisée en routine depuis janvier 2004 en remplacement de l'analyseur d'AA. Elle a permis le diagnostic et le suivi thérapeutique de nombreuses aminoacidopathies
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Regnault, Bruno. „L'acidémie isovalérique : étude à propos d'un cas“. Caen, 1991. http://www.theses.fr/1991CAEN3037.
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Laaliaoui-Laffitte, Sylvie. „La cystinurie : à propos de 19 cas cliniques“. Bordeaux 2, 1990. http://www.theses.fr/1990BOR25279.
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Jacquet-Delmulle, Hélène. „Etude du déterminisme génétique de la schizophrenie“. Rouen, 2004. http://www.theses.fr/2004ROUES036.
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La schizophrénie est une psychose grave de l'adulte jeune qui est préoccupante en terme de santé publique puisqu'elle atteint près de 1% de la population générale. Dans la mesure où la schizophrénie recouvre une grande hétérogénéité clinique et un déterminisme multifactoriel, il a été difficile, jusqu'à ce jour, d'identifier un facteur de risque pour la maladie. L'observation d'une fréquence accrue de traits schizophrènes chez des patients 22q11DS, porteurs d'une délétion hétérozygote de la région 22q11, et d'une incidence élevée de la délétion chez des patients schizophrènes nous a conduit à rechercher des remaniements de la région 22q11 chez des patients schizophrènes. Un criblage exhaustif de cette région par QMPSF chez 63 patients schizophrènes DSMIII et 68 sujets témoins nous a permis de mettre en évidence une délétion hétérozygote sélective du gène PRODH chez deux apparentés schizophrènes. Le gène PRODH code une proline deshydrogenase impliquée dans la première étape de la conversion de la proline en glutamate. Le dosage de la prolinémie chez les patients a révélé une élévation modérée du taux de proline sanguin. Par la suite, le séquençage du gène chez les individus sans remaniements nous a permis d'identifier des mutations faux-sens hétérozygotes chez des patients, associées à des hyperprolinémies modérées. De façon très intéressante, nous avons retrouvé la même délétion et mutation faux-sens de PRODH, mais cette fois ci à l'état homozygote, chez des enfants souffrant d'une forme sévère hyperprolinémie de type I associée à des manifestations neurologiques (retard mental et épilepsie). Pour déterminer l'implication de l'hyperprolinémie dans les psychoses appartenant au spectre de la schizophrénie, nous avons entrepris une étude cas-témoin (incluant 320 patients et 114 témoins), basée sur des critères de diagnostic DSMIIIR permettant la distinction entre les patients schizophrènes, les patients présentant un trouble schizoaffectif et ceux présentant un trouble bipolaire. Cette étude nous a permis de mettre en évidence, d'une part, une association entre l'hyperprolinémie et les troubles schizoaffectifs, et d'autre part, d'associer 5 variations rares de PRODH à l'hyperprolinémie. Nos travaux montrent que l'hyperprolinémie sévère peut conduire à un retard mental souvent associé à une épilepsie, et que l'hyperprolinémie plus modérée semble constituer un facteur de risque pour certaines formes de psychosesSchizophrenia is a psychotic disorder of the young adult, which is a major proplem for public health because of its prevalence of 1% in the general population. Because schizophrenia presents a clinical heterogeneity and a multifactorial determinism, it is difficult to identify a risk factor for this disease. The comorbidity between schizophrenia and the 22q11 deletion syndrome (22q11DS) suggested a putative rearrangement of the 22q11 region in schizophrenic patients. Screening for genomic rearrangements of 23 genes within or at the boundaries of the deletion 22q11 in 63 unrelated schizophrenic patients DSMIII and 68 controls, using QMPSF, led us to identify, in a family including two schizophrenic subjects, a selective heterozygous deletion of the entire PRODH gene. PRODH gene encodes a proline dehydrogenase enzyme, which is involved in the first step of the conversion of proline to glutamate. The measure of prolinemia in the two patients revealed a moderate elevated plasma proline level. We then detected, by sequencing, in a subset of schizophrenic patients, without rearrangements, several heterozygous PRODH missense mutations, which were also associated with increased plasma proline levels. Interestingly, we subsequently found the same PRODH deletion or missense mutations, at the homozygous state, in children suffering from a severe form of type I hyperprolinemia associated with neurological manifestations (mental retardation and seizure). To determine the involvement of hyperprolinemia disorders in psychotic disease including in the schizophrenic spectrum, we conducted a case-control study (including 320 patients with 114 controls), based on DSMIIIR criteria to distinguish schizophrenic patients, patients with a schizoaffective disorder and patients with a bipolar disorder. We found that hyperprolinemia was a risk factor for schizoaffective disorder and that five rare PRODH alterations were associated with hyperprolinemia. Altogether these results show that the severe form of type I hyperprolinemia results into mental retardation whereas the moderate form may constitute a risk factor for certain forms of psychosis
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Blanchetier, Valérie. „Insulino-résistance et insuffisance rénale chronique : intérêt d'un régime restreint en protides et en phosphore et supplémenté en acides aminés essentiels et céto-analogues“. Bordeaux 2, 1995. http://www.theses.fr/1995BOR23086.
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Larrezet, Jacques. „Homocystinurie par déficience en cystathionine B synthase : à propos d'un cas clinique typique“. Bordeaux 2, 1994. http://www.theses.fr/1994BOR2M022.
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Mével, Marie. „Rôle de la kinase LKB1 dans les adénocarcinomes pulmonaires : régulations métaboliques et activité nucléaire, des mécanismes communs avec ses fonctions développementales“. Electronic Thesis or Diss., Université Grenoble Alpes, 2023. http://www.theses.fr/2023GRALV103.
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Les adénocarcinomes pulmonaires font partie des cancers bronchiques non à petites cellules qui représentent 85% des diagnostics de cancers pulmonaires. En fonction du stade du cancer déterminé, l’espérance de vie à 5 ans est autour de 68% pour les stades précoces et proche de 0% pour les stades les plus avancés. Ces cancers présentent diverses caractéristiques mutationnelles qui peuvent expliquer les différents degrés de gravité. La Liver Kinase B, connue sous l’acronyme LKB1, est mutée dans 8 à 21% des adénocarcinomes pulmonaires. Bien que n’étant pas initiatrice de la tumorigenèse pulmonaire, la perte de cette protéine entraine une aggravation notable du pronostic des patients.LKB1 est une sérine thréonine kinase codée par le gène STK11 qui joue un rôle clé au cours du développement et du maintien de nombreux organes. Notre équipe a mis en évidence des régulations métaboliques par LKB1 essentielles pour divers lignages d’une population particulière de cellules souches embryonnaires, les cellules de crêtes neurales (CCNs). Au cours de ma thèse, j’ai participé à l’exploration des contributions de LKB1 lors de la mise en place du système nerveux entérique, un réseau de ganglions qui contrôle la motricité digestive et dérive intégralement des CCNs. Nous avons montré le rôle crucial de LKB1 pour la différenciation des neurones entériques et le maintien des cellules gliales entériques via la limitation du stress oxydant et l’activité du facteur de transcription p53.Dans ce contexte, mes travaux de thèse ont également exploré si les régulations métaboliques exercées par LKB1 lors de la formation des CCNs contribueraient également à l’activité suppresseur de tumeur de LKB1. Par l’analyse in silico de données transcriptomiques de patients mutés pour LKB1 (en association avec les mutations oncogéniques KRAS) et porteurs d’adénocarcinomes pulmonaires, j’ai montré que la perte de fonction de LKB1 est associée à une modulation importante du métabolisme des acides aminés. En particulier, l’expression de nombreuses enzymes du métabolisme de l’alanine est augmentée en absence de LKB1 dans les adénocarcinomes pulmonaires. Cette augmentation est corrélée à des données obtenues en culture de cellules tumorales pulmonaires qui montrent des taux d’alanine plus importants en absence de Lkb1. De plus, les mutations de LKB1 s’associent avec une dérégulation de métabolites et enzymes de l’homéostasie rédox, ainsi qu’une stabilisation de p53 et des modifications d’expression de ces gènes cibles.Ainsi, mes résultats mettent en lumière des régulations communes entre l’activité développementale de LKB1 dans les CCNs et son activité suppresseur de tumeur dans les adénocarcinomes pulmonaires. Ces analyses obtenues chez les patients LUAD renforcent la contribution potentielle de la signalisation LKB1 dans des syndromes développementaux chez l’homme bien que des mutations de cette voie ne soient pas connues dans les neurocristopathies, les pathologies dues à une malformation des CCNs. Enfin, l’identification d’autres dérégulations dans les LUAD (régulation du stress oxydant par la voie NRF2-KEAP1, dérégulation du facteur de transcription et régulateur de la chromatine BRG1 par exemple) constituent une source d’inspiration réciproque pour mieux comprendre les fonctions de LKB1 développementales. Dans leur ensemble, ces données ouvrent un nouveau regard sur la recherche de pistes thérapeutiques des pathologies liées à une réduction de la signalisation LKB1Lung adenocarcinomas (LUAD) are a subset of non-small-cell lung cancers, comprising approximately 85% of diagnosed lung cancer cases. The 5-year survival rate varies depending on the tumor stage, with approximately 68% survival for early-stage cases and nearly 0% survival for the most advanced stages. These cancers exhibit a range of mutational characteristics that may account for the varying degrees of severity. Liver Kinase B, abbreviated as LKB1, is found to be mutated in 8 to 21% of LUAD cases. While it is not the initiating factor in lung tumorigenesis, the loss of this protein significantly worsens the prognosis for affected patients.LKB1 is a serine-threonine kinase encoded by the STK11 gene, and it plays a pivotal role in the development and maintenance of various organs. Our team has uncovered essential metabolic regulations governed by LKB1 in distinct lineages of a specific embryonic stem cell population known as neural crest cells (NCCs). During my PhD, I contributed to investigating the significance of LKB1 in the establishment of the enteric nervous system—a complex network of ganglia responsible for regulating digestive motility and entirely derived from NCCs. Our research demonstrated the critical role of LKB1 in the differentiation of enteric neurons and the maintenance of enteric glial cells by limiting oxidative stress and modulating the activity of the p53 transcription factor.In this context, my doctoral research also delved into whether the metabolic regulations governed by LKB1 during NCC formation could also contribute to LKB1's tumor-suppressive activity. By conducting in silico analysis of transcriptomic data from LUAD patients with LKB1 mutations (in conjunction with oncogenic KRAS mutations), I have demonstrated that the loss of LKB1 function is linked to significant alterations in amino acid metabolism. Specifically, the expression of numerous enzymes involved in alanine metabolism is increased in the absence of LKB1 in lung adenocarcinomas. This increase aligns with data obtained from lung tumor cell cultures, which indicate higher levels of alanine in the absence of LKB1. Furthermore, LKB1 mutations are associated with dysregulation of metabolites and enzymes related to redox homeostasis, global epigenetic changes, as well as the stabilization of p53 and alterations in the expression of its target genes.Hence, my findings underscore the shared regulatory mechanisms between LKB1's developmental role in NCCs and its tumor-suppressive function in lung adenocarcinomas. These analyses, conducted in LUAD patients, further underscore the potential significance of LKB1 signaling in human developmental syndromes, even though mutations in this pathway are not currently associated with neurocristopathies—pathologies stemming from NCC malformations. Additionally, the identification of other dysregulations in LUADs, such as the regulation of oxidative stress via the NRF2-KEAP1 pathway and the deregulation of the transcription factor and chromatin regulator BRG1, reciprocally inspire a deeper understanding of LKB1's developmental functions. Collectively, these findings pave the way for exploring novel therapeutic strategies for conditions linked to diminished LKB1 signaling
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Deveaux, Ambre. „Supplémentation nutritionnelle en arginine chez des sujets sains présentant des facteurs de risque liés au syndrome métabolique : métabolisme de l'arginine alimentaire et impact sur la fonction endothéliale“. Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLA001/document.
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La dysfonction endothéliale vasculaire, processus majeur initiant l’athérosclérose, est étroitement liée à l’altération de la synthèse et/ou biodisponibilité du monoxyde d’azote (NO), dont l’arginine est le précurseur. Elle apparait aussi dès la phase postprandiale après un repas gras et sucré. Chez des sujets avec des facteurs de risque cardiométabolique, une supplémentation orale en arginine a un effet bénéfique sur des fonctions associées au NO. Aucune donnée ne permet cependant de lier la mise à disposition de l’arginine et la synthèse de NO, en situation normale ou de risque cardiométabolique. De plus, peu d’études ont étudié l’effet d’une supplémentation en arginine, dans un contexte nutritionnel (faible dose et libération lente) chez des sujets avec des facteurs de risque cardiométabolique. Ce travail vise donc à évaluer l’effet d’une supplémentation nutritionnelle en arginine, sur le métabolisme de l’arginine et la fonction endothéliale (FE), chez des sujets sains présentant des facteurs de risque cardiométabolique. Dans une première étude clinique, nous avons ainsi comparé la biodisponibilité de l’arginine ingérée et son utilisation pour la synthèse de NO, selon la présence de facteurs de risque cardiométabolique, et selon qu’elle était consommée sous une forme à libération immédiate (LI) ou sous une forme à libération prolongée (LP), mimant la mise à disposition naturelle de l’arginine alimentaire. Puis, dans une deuxième étude clinique, nous avons étudié l’effet de la supplémentation en arginine LP sur la FE à jeun et sur son altération postprandiale, chez des sujets sains présentant des facteurs de risque cardiométabolique; et si cet effet pourrait varier selon leur argininémie basale. Ce travail de thèse a ainsi mis en évidence une utilisation de l’arginine ingérée plus élevée pour la synthèse de NO chez les sujets avec des facteurs de risque cardiométabolique, et plus élevée avec la forme LP qu’avec la forme LI, en particulier chez ces sujets à risque. La deuxième étude, quant à elle, a révélé que les effets de la supplémentation en arginine-LP variaient selon l’argininémie basale des sujets présentant des facteurs de risque cardiométabolique. Chez les sujets avec une argininémie basale relativement plus faible, l’arginine-LP a atténué la diminution postprandiale de la FE et a conduit à une FE significativement meilleure à la fin de la période postprandialeVascular endothelial dysfunction, the hallmark of early atherosclerosis, results from an impairment of the synthesis and/or bioavailability of nitric oxide (NO), the precursor of which is arginine. Endothelial dysfunction is also known to be induced transiently by a high-fat meal. In subject with cardiometabolic risk factors, oral arginine supplementation has a beneficial effect on NO-related physiological functions. However, no data relates the availability of arginine to the synthesis of NO in normal or cardiometabolic risk condition. In addition, few studies only have investigated the effect of arginine supplementation in a nutritional context (low dose and slow release) in subjects with cardiometabolic risk factors. This work aims to evaluate the effect of a nutritional arginine supplementation, on the arginine metabolism and endothelial function in healthy subjects with cardiometabolic risk factors. In a first clinical study, we have compared the bioavailability of oral arginine and its utilization for NO synthesis, as a function of the presence of cardiometabolic risk factors, and as a function of the form of release (immediate release, IR, as free arginine, or sustained release, SR, which mimics the slow release of dietary arginine). Then, in a second clinical study, we studied the effect of SR-arginine supplementation on fasting endothelial function and its postprandial alteration in healthy subjects with cardiometabolic factors. A further aim was to investigate whether this effect may vary according to the baseline arginine status of subjects. This thesis work has demonstrated a higher utilization of oral arginine for NO synthesis in subjects with cardiometabolic risk factors, and a higher utilization with the SR form, particularly in these subjects at risk. As to the second study, it showed that the SRarginine supplementation effects largely varied with baseline fasting arginine concentration of subjects with cardiometabolic risk factors. In subjects with a relatively lower baseline arginine concentration, SR-arginine attenuated the decrease in postprandial endothelial function and led to a significantly higher endothelial function at the end of the postprandial period
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Iraqui, Houssaini Ismaïl. „Métabolisme des acides aminés aromatiques chez la levure Saccharomyces cerevisiae“. Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 1999. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211859.
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Alleman, Fabien. „Etude du catabolisme des acides aminés chez deux lignées de poulets génétiquement maigres ou gras“. Tours, 1999. http://www.theses.fr/1999TOUR4028.
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La production avicole intensive est aujourd'hui montrée du doigt car elle est partiellement responsable des importants rejets azotes qui polluent notre environnement. Au cours de cette thèse, nous nous sommes efforcés, grâce à un modèle d'étude adapté (les poulets génétiquement maigres ou gras, connus pour présenter des différences d'excrétion azotée) de mieux comprendre les mécanismes biochimiques a l'origine de ces rejets. Ainsi, nous avons montre que chez les poulets génétiquement gras (ceux dont les rejets azotes sont plus importants), les activités de plusieurs enzymes impliquées dans les métabolismes énergétique et azote étaient augmentées. De plus nous montrons qu'il existe plusieurs isoformes de la gdh (glutamate déshydrogénase), une enzyme tres impliquées dans les transferts d'azote dans l'organisme et dont la répartition intracellulaire diffère entre les deux lignées étudiées. Enfin, ces deux lignées expérimentales nous ont permis de mieux comprendre l'origine des différences de besoins en acides amines observées entre animaux (notion indispensable pour pouvoir formuler un aliment non - polluant), en particulier le rôle très probable du potentiel métabolique de chacun (capacité à cataboliser un excédent de nutriments).
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Galindo, Carlos Eduardo. „Effet des acides aminés sur le métabolisme du glucose chez la vache laitière“. Thesis, Université Laval, 2010. http://www.theses.ulaval.ca/2010/27282/27282.pdf.
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Grisoni, Marie-Laure. „Rôle des acides aminés alimentaires dans la lipogénèse du poulet de chair“. Aix-Marseille 3, 1991. http://www.theses.fr/1991AIX30083.
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La croissance tres rapide du poulet de chair, s'accompagne dans les conditions de l'elevage industriel d'une lipogenese intense se traduisant par un fort depot de lipides dans la cavite abdominale. Sur le plan nutritionnel, plusieurs etudes ont montre que l'on peut reduire l'engraissement en augmentant l'apport alimentaire de proteines, mais les mecanismes mis en jeu n'ont pas ete encore elucides. Nous avons donc etudie la relation entre les acides amines alimentaires et la lipogenese. En faisant varier l'apport des proteines de 20 a 23%, nous enregistrons une reduction moyenne de 10% de la totalite des lipides corporels des animaux, l'effet variant selon le sexe. Une seconde etude concernant seulement les apports de methionine ou de lysine montre que la quantite minimum d'acides amines soufres ou de lysine pour un engraissement minimum est superieure a celle necessaire pour obtenir une efficacite alimentaire maximum, elle-meme insuffisante pour realiser le meilleur gain de poids. La methionine et la lysine, prises individuellement, reduisent l'engraissement en diminuant la lipogenese du poulet, des apports excedentaires ayant toutefois un faible effet. De plus, nous montrons que l'activite hepatique de l'enzyme malique varie parallelement a la proportion de gras abdominal. Pour etudier le role des proteines sur la lipogenese a partir des glucides alimentaires, nous distribuons des aliments isoenergetiques renfermant de 20 a 50% de proteines. Les individus consommant un aliment a fort taux de proteines degradent massivement les acides amines d'ou une uricemie tres elevee. Les chainons carbones produits ainsi que ceux d'origine glucidique ne sont utilises pour la synthese des acides gras qu'en faible quantite. Ils se retrouvent surtout sous forme de co#2. L'etude des variations de l'activite de la citrate synthase suggere que le transfert du citrate mitochondrial qui fournit l'acetyl coenzyme a, precurseur des lipides, est fortement ralenti alors que le fonctionnement du cycle de krebs n'est pas modifie. En definitive, le role des acides amines apparait comme un facteur de deviation du metabolisme des glucides vers l'oxydation au detriment de leur utilisation pour la lipogenese
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Eliard, Christine. „Contribution à l'étude de la croissance et du métabolisme énergétique d'une bactérie du genre Arthrobacter : influence de changements de salinité“. Lyon 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LYO11643.
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Novak, Levente. „Le reseau metabolique de lactococcus lactis ssp. Lactis ncdo 2118 : interactions entre metabolisme carbone et azote“. Toulouse, INSA, 1998. http://www.theses.fr/1998ISAT0015.
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La souche lactococcus lactis ncdo 2118 constitue, du fait de ses exigences nutritionnelles relativement simples, un modele d'etude ideal pour les recherches concernant le metabolisme des lactocoques. Le micro-organisme croit dans un milieu minimal ne contenant que du glucose, cinq vitamines, deux sels mineraux et six acides amines (glu, ser, met, val, ile et leu). L'omission du glutamate de ce milieu est possible mais il en resulte une latence d'environ 48 heures et un taux de croissance diminue, le 2-oxoglutarate permettant de substituer partiellement le glutamate. La supplementation du milieu en thiamine et eventuellement en threonine est necessaire pour permettre une croissance en l'absence des acides amines branches. La croissance est tres lente en remplacant la serine par de la glycine, mais un ajout de sulfate d'ammonium est suffisant pour ramener le taux de croissance a sa valeur normale. La culture de la bacterie sur plusieurs milieux chimiquement definis graduellement simplifies, et un de nature complexe, a permis de quantifier la consommation des substrats carbones et azotes et d'etablir les bilans stoechiometriques. La fermentation est homolactique et les bilans carbones et azotes sont toujours deficitaires, indiquant la formation de produits non encore identifies. Le rendement de la biomasse, le taux de croissance maximal, la vitesse specifique de consommation du glucose et le y#a#t#p augmentent avec la complexite du milieu. Une relation lineaire existe dans les milieux definis entre le taux de croissance et le taux de synthese d'atp, montrant un equilibre delicat entre l'anabolisme et le catabolisme. La determination de la composition macromoleculaire de la bacterie, puis sa culture dans du milieu minimal contenant des substrats marques au #1#4c suivie du comptage par scintillation des composes excretes dans le milieu de culture et des molecules cellulaires, a permis de determiner le reseau metabolique du micro-organisme, incluant les voies cataboliques et anaboliques issues du glucose et des acides amines. Les resultats mettent en cause la distinction couramment faite entre les substrats dits cataboliques et anaboliques, puisque dans un milieu minimal, le glucose fournit 60% du carbone de la biomasse tandis que les acides amines sont a l'origine de produits de fermentation excretes dans le milieu. Les flux carbones ont ete determines a partir des donnees obtenues et en connaissance des contraintes imposees par la regulation des voies metaboliques. La serine est partiellement desaminee en pyruvate et en ammonium, ce dernier etant partiellement reconsomme apres l'epuisement de la serine. Il a ete demontre que la forte desamination de la serine dans le milieu minimal par rapport aux milieux contenant 18 acides amines n'etait pas due a un niveau intracellulaire plus eleve de serine deshydratase ou au manque d'inhibition par la cysteine. La serine est un substrat requis pour l'initiation de la croissance dans le milieu minimal mais son epuisement en cours de fermentation n'arrete pas la multiplication cellulaire. La croissance dans la phase exempte de serine se fait aux depens d'un ou de plusieurs composes formes prealablement et excretes dans le milieu de culture.
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Ramond, Elodie. „Métabolisme des acides aminés dans l’échappement de Francisella tularensis du phagosome des macrophages infectés“. Thesis, Paris 5, 2014. http://www.theses.fr/2014PA05T026/document.
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Francisella tularensis, l’agent étiologique de la tularémie, est une bactérie à multiplication intracellulaire facultative capable d’infecter de nombreux types cellulaires avec un tropisme particulier pour les macrophages. Cette bactérie est responsable d’infections graves chez de nombreuses espèces animales mais aussi chez l'homme. En particulier, la sous-espèce F. tularensis ssp tularensis a été classée comme agent de bioterrorisme de type A du fait de son pouvoir pathogène extrêmement élevé avec une faible dose infectieuse. Des approches de mutagénèse aléatoire et de criblage de banques de mutants ont suggéré l’importance des gènes impliqués dans les fonctions métaboliques et nutritionnelles dans le cycle intracellulaire de Francisella. Parmi ces gènes, on retrouve de très nombreux systèmes de transport d’acides aminés dont la sous-famille de transporteurs amino-polyamine-organocation (APC). Dans un premier temps, nous nous sommes intéressés à un transporteur APC codé par le gène FTN_0571, que nous avons appelé GadC. Pour comprendre l’importance de GadC dans la virulence de F. tularensis, nous avons réalisé un mutant chromosomique, délété du gène gadC, chez la sous-espèce novicida. Nous avons démontré que GadC est un importeur de glutamate et qu’il est nécessaire à la multiplication intracellulaire et à la virulence de Francisella, en assurant une sortie normale de la bactérie du phagosome. Ce phénomène s’explique par l’implication de GadC dans la résistance au stress oxydant généré dans le phagosome. De façon remarquable, la multiplication du mutant gadC est restaurée dans un contexte gp91phox-/-, incapable de générer des espèces réactives de l’oxygène, aussi bien in vitro qu’in vivo. Enfin, nous avons montré que l’activité de GadC modifie la production de certains intermédiaires du cycle de Krebs, et la transcription de l’enzyme qui leur est associée, démontrant un lien étroit entre la résistance au stress oxydant, le métabolisme du glutamate et la virulence de F. tularensis. Ces résultats nous ont conduits à nous intéresser à un autre transporteur appartenant à la sous-famille APC, présentant une homologie de 33% avec GadC, et que nous avons nommé ArgP. Nous montrons qu’un mutant argP présente un défaut de multiplication intracellulaire et de virulence résultant d’un retard sévère de sortie du phagosome. Ce phénotype s’explique par un défaut d’import d’arginine. L’inactivation du gène argP dans la sous-espèce holarctica LVS provoque des défauts de multiplication intracellulaire similaires à ceux observés dans la sous-espèce novicida, suggérant un rôle conservé du transporteur ArgP dans les différentes sous-espèces de F. tularensis. Comme l’arginine constitue un acide aminé essentiel pour la bactérie, nous nous sommes posés la question de l’importance de cet acide aminé durant la phase phagosomale. Une analyse du protéome bactérien du mutant argP de F. novicida, dans des conditions mimant les conditions nutritionnelles phagosomales, révèle que l’arginine joue un rôle prépondérant dans la traduction des protéines en affectant la synthèse des protéines ribosomales. L’ensemble des travaux réalisés au cours de cette thèse constitue la première démonstration de l’importance de l’acquisition d’acides aminés durant la phase phagosomale du cycle intracellulaire de F. tularensisFrancisella tularensis, the etiologic agent of the zoonotic disease tularemia, is a facultative intracellular bacterium which can infect multiple cell types with specific tropism for macrophages. This bacterium is responsible for severe infections in numerous animal species and in humans. Of note, F. tularensis subsp. tularensis has been classified as a type A bioterrorism agent because of its high infectivity and very low infectious dose. Genome sequence analyses and genome-scale genetic studies have revealed the importance of genes involved in metabolic functions throughout the bacterial intracellular cycle. Among these genes, several amino acid transporter where found to belong to the amino-acid-polyamine organocation subfamily (APC), prompting us to address the role of these transporters in bacterial virulence. We first focused on the APC transporter encoded by gene FTN_0571 in F. tularensis subsp. novicida and named GadC. We showed that GadC was a genuine glutamate importer, necessary for Francisella intracellular multiplication and virulence. gadC inactivation completely blocked bacterial phagosomal escape. Remarkably, multiplication of a gadC mutant was restored in gp91phox-/- macrophages that are unable to generate reactive oxygen species. Altogether, our study revealed that glutamate uptake was critical in bacterial oxidative stress resistance in the phagosomal compartment and highlighted possible links between glutamate utilization and the tricarboxylic acid (TCA) cycle. These results prompted us to address the role of a second APC transporter sharing 33 % amino acid identity with GadC and named ArgP. argP inactivation severely delayed bacterial phagosomal escape, thus impairing intracellular multiplication and virulence. We demonstrated that ArgP was a high affinity arginine transporter, suggesting that impaired phagosomal escape might be directly linked to an arginine import defect. argP inactivation in the F. tularensis subsp. holarctica Live vaccine strain also leads to a severe intracellular multiplication defect, consistent with a conserved role among all F. tularensis subspecies. Arginine is an essential amino acid for F. tularensis. To understand the importance of this amino acid during the phagosomal phase of the Francisella intracellular life cycle, a proteomic analysis of the bacteria, in conditions of arginine limitation, was carried out. This analysis revealed that arginine limitation affected in the argP mutant the expression of a series of proteins and in particular of all the ribosomal proteins. One may imagine that intracellular bacteria could also sense nutrient limitations in the phagosome as a subcellular localization signal. Altogether, these studies constitute the first demonstration of the importance of amino acid acquisition during F. tularensis phagosomal escape
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Tassa, Amina. „Mécanismes de régulation de la protéolyse musculaire (autophagie) par une carence en acides aminés“. Clermont-Ferrand 1, 2003. http://www.theses.fr/2003CLF1MM06.
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Estecahandy, Pascale. „L'ochronose alcaptonurique : à propos d' un cas“. Bordeaux 2, 1989. http://www.theses.fr/1989BOR25138.
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Berti-Dupuis, Liliane. „Métabolisme de la L-méthionine et de son a-hydroxyanalogue dans différents tissus chez le poulet“. Aix-Marseille 3, 1989. http://www.theses.fr/1989AIX30081.
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La valeur nutritionnelle de l'hydroxyanalogue de la methionine (d,l-mha) mesuree par un test de croissance chez le poulet de chair est inferieure a celle de l'acide amine (d,l-met). L'oxydation supposee du d-mha par la d-2 hydroxyacide deshydrogenase mitochondriale (d-2 hadh) et celle du l-mha par la l-2 hydroxyacide oxydase peroxysomale (l-2 haox), en acide -ceto -methylthiobutanoique (cmb), est une etape indispensable a leur conversion metabolique en l-met. Notre propos est de caracteriser les enzymes impliquees dans cette transformation, chez le poulet. Une preparation enrichie en d-2 hadh a ete obtenue par precipitation de la membrane mitochondriale interne de cellules hepatiques par du sulfate d'ammonium. L'enzyme ainsi obtenue a une activite specifique de 13 u/mg de proteines (nanomoles de d-lactate oxyde par min) mais semble incapable d'oxyder le d-mha. La l-2 haox a a ete purifiee par precipitation au sulfate d'ammonium d'une fraction peroxysomale puis par chromatographies sur colonnes de deae-cellulose et d'hydroxyapatite. La l-2 haox a de foie de poulet peut oxyder le l-mha avec un km superieur et un vmax inferieur (1,7 mm et 285 u/mg de proteines) aux parametres respectivement mesures avec le glycolate (100 m et 1100 u/mg de proteines). Des resultats comparables ont ete obtenus avec la l-2 haox a de rein de poulet. La premiere etape de la transformation du d- et du l-mha en cmb semble etre limitante du fait de la faible activite oxydasique de la d-2 hadh et de la l-2 haox a vis-a-vis du d- et du l-mha
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Favé, Gaëlle. „Stratégies d'amélioration de la biodisponibilité des acides gras : approches physico-chimiques et enzymatiques“. Aix-Marseille 2, 2006. https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00689483.
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La biodisponibilité des nutriments lipidiques dépend d'un processus physico-chimique et enzymatique complexe : digestion par les lipases dans l'estomac puis l'intestin, absorption par les entérocytes et transport vers les cellules utilisatrices. L'altération physiologique (nouveau-né, personne âgée) ou pathologique (mucoviscidose, pancréatite) de ce processus réduit la biodisponibilité des acides gras essentiels, indispensables au développement et au fonctionnement des cellules de l'organisme. Ce mémoire présente des stratégies permettant d'améliorer la biodisponibilité des nutriments lipidiques chez l'insuffisant pancréatique, en utilisant les propriétés physico-chimiques des lipides. En effet, elles déterminent des caractéristiques primordiales de l'interface lipidique (superficie, composition), au niveau de laquelle se déroule l'hydrolyse enzymatique. Nos travaux montrent, in vitro dans des conditions proche de la physiologie, que le type de phospholipide entrant dans la composition d'une émulsion de trioléine, ou l'ajout d'un type donné d'acide gras libre dans le mélange lipidique avant l'émulsification, modifie la taille et le potentiel zêta des globules lipidiques, influence l'action des lipases gastrique, pancréatique et stimulée par les sels biliaires, et module l'absorption des acides gras par des cellules Caco-2. Un effet majeur est obtenu avec le lysophosphatidylinositol, rendant ce lipide potentiellement utilisable en nutrition clinique. Il présente un comportement interfacial étonnant (aire moléculaire, compressibilité) et son mécanisme d'action associe des effets indirects (modifications de l'interface lipidique) et directs (interactions avec les lipases).
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Chotechuang, Nattida. „Le rôle des acides aminés dans le métabolisme protéique du foie sous régime hyper protéique : identification du signal des acides aminés et des voies de transduction associées“. Phd thesis, AgroParisTech, 2010. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00610998.
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La consommation d'un régime hyper protéique (HP) améliore l'homéostasie glucidique, le gain de poids, l'adiposité, en réduisant le tissus adipeux blanc et la taille des adipocytes. Les adaptations métaboliques dues à l'augmentation de l'apport protéique sont au moins caractérisées, au niveau du foie, par la diminution de la lipogenèse et l'augmentation de la conversion des acides aminés (AA) en glycogène. Cependant, le rôle des acides aminés dans le contrôle de ces adaptations métaboliques et des voies de transduction responsables de la transmission du signal " acides aminés " n'ont pas encore été élucidés. L'objectif de notre étude a été de déterminer l'effet de l'augmentation de l'apport en acides aminés sur la traduction et la protéolyse, et d'identifier les voies de signalisation impliquées dans la détection des acides aminés ainsi que l'acide aminé ou le groupe d'acide aminés responsable de ces effets, en utilisant des approches in vivo et in vitro. Les extraits protéiques ont été analysés par western blots pour examiner l'état de phosphorylation des protéines impliquées dans les voies de signalisation qui participent à la détection des AAs et à la régulation de la traduction, à savoir les voies: " mammalian target of rapamycin " (mTOR), " adenosine monophosphate-activated protein kinase " (AMPK) et " general control non-depressible kinase 2 " (GCN2). Cette étude a montré que l'adaptation à un régime de HP est caractérisée par la stimulation de la traduction dans le foie, au moins au niveau de l'étape d'initiation. Cette activation requiert à la fois la présence de fortes concentrations en AA (au moins la leucine ou des AAs à chaîne branchée) et d'insuline, comme l'indique l'augmentation de la phosphorylation de mTOR, 4E-BP1 et S6 et la diminution de la phosphorylation de l'AMPK et GCN2. L'utilisation de l'AICAR (activateur de l'AMPK) et de la rapamycine (inhibiteur de mTOR) nous a permis de montrer qu'en présence de fortes concentrations en AA et d'insuline, mTOR n'est pas le seul régulateur de 4E-BP1 et de la S6K1 (cibles de mTOR) et que l'AMPK peut également jouer un rôle important dans la régulation de leur état de phosphorylation. En outre, l'augmentation de l'apport protéique provoque une inhibition de la dégradation des protéines dans le foie et une diminution de l'expression des gènes codant les principales protéines du système autophagie et de l'ubiquitine-protéasome. En conséquence, les protéines sont moins ubiquitinées, donc moins dégradées. Les AAs et l'insuline semblent être les principaux régulateurs de la voie de protéolyse ubiquitine-protéasome et les voies mTOR et AMPK seraient les médiateurs des effets acides aminés et de l'insuline. Ces résultats suggèrent que le contrôle des voies cataboliques et anaboliques du métabolisme des protéines sont régulées par les mêmes signaux et font intervenir les mêmes voies de signalisation.
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Beutheu, Youmba Stéphanie. „Étude des protéines de jonctions serrées au cours de l'inflammation intestinale : impact des acides aminés“. Rouen, 2011. http://www.theses.fr/2011ROUENR04.
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Intestinal barrier is regulated in part by tight junctions (Ds) which are multiprotein structures. Recent studies have suggested that an increased intestinal permeability is involved in the pathophysiology of several intestinal bowel diseases. We aimed to study underlying mechanisms involved in the regulation of three tight junction (Lis) proteins, claudin-1, occludin and ZO-1 in colonic biopsies of IBS patients and in experimental models of Methotrexate (MTX)-induced intestinal mucositis. In addition, we also evaluated the effects of amino acids on MTX-treated models. In colonic mucosa of patients with IBS, we have shown alterations of claudin-1, occludin II proteins in IBS patients with differences according to the IBS subsets and symptoms, specifically, in IBS patients with predominant diarrhea. This suggested that these changes may be involved in the pathophysiology of IBS. In a rodent model of mucositis, we observed that the increase of intestinal permeability induced by MTX, related in part to alteration of T. 's, ZO-1, occludin and claudin-1 proteins expression and cellular distribution. The in vitro data suggest that not only NF-KB, but also MEK1 &2 and INK pathways are involved in the gut barrier disruption induced by MTX. Glutamine supplementation limited the increase of chemotherapy-induced intestinal permeability and restored the expression of proteins of tight junctions probably via the erk and NF-x_13 pathways. Combined glutamine and arginine seemed associated with a stronger mortality. Further studies are needed to confirm the preventive andlor therapeutic interest of the glutamineLa fonction de barrière peut être régulée en partie par les jonctions serrées (JS). Les JS sont des structures mufti-protéiques qui jouent un rôle important dans la polarité, la prolifération et la différenciation cellulaire. Plusieurs études ont suggéré que l'augmentation de la perméabilité intestinale pourrait être impliquée dans la survenue de phénomènes inflammatoires tels qu'observés au cours du syndrome de l'intestin irritable (Sul), ou de la mucite induite par le méthotrexate (MTX). Cependant, les régulations et les mécanismes mis en jeu ne sont pas clairement définis. Les objectifs de notre travail étaient d'une part d'étudier la régulation des protéines de JS, claudine-1, occludine et zonula occludens-1 (Z0-1) dans deux modèles i. E. Sur des biopsies coliques de patients atteints du SII et dans des modèles expérimentaux de mucite induite par le MTX in vivo chez le rat et in vitro sur des cellules Caco-2, et d'autre part d'évaluer les effets d'acides aminés dans les modèles expérimentaux de mucite. Nous avons observé des différences dans les altérations des protéines de JS en fonction du phénotype et des symptômes chez les patients SII. Les patients SII diarrhéiques présentaient d'importantes altérations d'expression de l'occludine et de la claudine-1. Cette perte d'expression protéique était corrélée à la durée des symptômes et à l'intensité de la douleur, suggérant donc que ces modifications seraient impliquées dans l'initiation du SIL Dans les modèles expérimentaux de mucite, nous avons observé une augmentation de la perméabilité intestinale induite par le MTX qui serait associée à des altérations de l'expression et de la localisation des protéines claudine-1, occludine et ZO-1. De plus, nous avons pu déterminer que les voies NF-kB, MEK1&2 et JNK seraient impliquées au cours de la perte de la fonction de barrière. Dans le cadre de stratégies nutritionnelles pour moduler ces altérations, nous avons montré que la glutamine prévenait l'augmentation de la perméabilité et restaurait l'expression des protéines de JS via les voies erk. Et NF-kB. La combinaison glutamine plus arginine n'aurait pas d'effet protecteur au cours de la rupture de la barrière intestinale dans ce modèle et semblerait être associée à une mortalité importante. Ces données incitent à poursuivre cette étude pour confirmer les effets préventifs et/ou thérapeutiques de la glutamine au cours de la mucite induite par le MTX mais également au cours du SII
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Liadouze, Isabelle. „Etude du metabolisme azote d'Acyrthosiphon Pisum (Harris) (Homoptera : Aphididae), : intervention des bacteries symbiotiques“. Lyon, INSA, 1995. http://www.theses.fr/1995ISAL0067.
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Les pucerons sont des insectes hautement spécialisés se nourrissant de la sève des plantes dont la composition en acides aminés est très déséquilibrée. Pourtant sur ce. Milieu, le puceron croît et se reproduit rapidement. Cette réponse adaptative suppose que cet insecte présente un important métabolisme intermédiaire. Dans ce contexte, le pool d' acides aminés Libres du puceron du pois Acyrthosiphon pisum élevé sur plante hôte, Vicia faba, ou sur trois mil~eux artificiels de composition différente en acides aminés a été analysé. Quelle que soit la composition en acides aminés du milieu alimentaire (de composition équilibrée à très déséquilibrée), le pool d'acides aminés libres des pucerons. Présente un profil équilibré et remarquablement constant. Le rôle des symbiotes intracellulaires dans cette homéostasie a été étudié à l'aide de pucerons aposymbiotiques. Ces pucerons présentent une concentration totale en acides aminés libres plus importante que les pucerons témoins, et l'homéostasie du pool d'acides aminés libres n'est plus maintenue. Le métabolisme de seize acides aminés a été étudié chez A. Pisum sur deux de ces milieux, en utilisant des traceurs radioactifs (acides aminés marqués). La plupart des acides aminés présentent un important catabolisme mis en évidence par une forte production de 14C02. La synthèse de thréonine, d'isoleucine et de lysine, acides aminés essentiels, à partir des carbones d'acides aminés communs est montrée pour la première fois. Cette synthèse n'est observée que si les acides aminés sont préalablement convertis en glutamate et elle n'a lieu que chez les pucerons symbiotiques. Pour expliquer les interconversions entre acides aminés, un modèle de compartimentation avec intervention des symbiotes dans la synthèse des acides aminés essentiels est proposé. D'après nos résultats, le glutamate serait le seul acide aminé fourni par l'insecte à ses bactéries symbiotiques. Il servirait à la synthèse des acides aminés essentiels, ceux-ci seraient ensuite utilisés par le puceronAphids are highly specialized insects that feed on the phloem-sap of plants, the amino acid composition of which is unbalanced. Nevertheless, on such a diet, aphids complete bath high development rates and fast reproduction. This adaptive response suppose that aphids display an important amino acid metabolism. In this context, free amino acid pool was analyzed in Acyrthosiphon pisum reared on Vicia faba and on three artificial diets with different amino acid profiles: the two first diets (name "luzerne" and "fève diets) copying the unbalanced profiles of phloem saps of alfalfa and broad bean respectively, the last one, diet AP2, deriving from aphid carcass analysis. Whatever the food source was, the free amino acid pool of aphids displayed roughly similar patterns. The role played by the symbionts in this homeostasis was investigated with aposymbiotic aphids reared on the same diets. The treated aphids had significantly higher free amino acid content than control ones. In contrast to the symbiotic situation, the well balanced free amino acid pool were not maintained in aposymbiotic aphids. Then, the metabolism of sixteen amino acids was studied on diets AP2 and "luzerne" using metabolic radio-tracers in the pea aphid. The most amino acids were subject to substantial catabolism as measured by high 14C02 production. For the first time in an aphid, we directly demonstrated the synthesis of three essential amino-acids (threonine, isoleucine and lysine) from carbons of common amino acids. The synthesis of these three compounds was only observed from amino acids that were previously converted into glutamate. To explain the quantitative results of interconversion between amino acids, we propose a compartmentalization model with the intervention of bacterial endosymbiotes for the synthesis of essential amino-acids. According to our results, glutamate is the only amino acid provided by the insect to its symbiotic bacteria. It would be used for synthesis of the essential amino acids, they would then be used by the aphid
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Sentier, Luc. „Caractérisation d'une souche de saccharomyces cerevisiae génétiquement modifiée dans le métabolisme des acides amines aromatiques : étude cinétique et modélisation“. Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 1992. http://www.theses.fr/1992INPL020N.
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L'objectif du travail est d'établir un modèle physiologique du comportement d'une souche de saccharomyces cerevisiae génétiquement manipulée dans le métabolisme des acides aminés aromatiques. Pour réaliser un suivi simultané du tryptophane, de la tyrosine et de la phénylalanine un dosage par chromatographie sur couche mince est mis au point. Il comprend une séparation des acides aminés, une révélation à la ninhydrine et un dosage densitométrique des taches. Cette méthode permet de doser les acides aminés aromatiques à une concentration minimum de 10 mg/l par acide amine avec une précision supérieure à 90%. La souche mutante cultivée en batch sur milieu synthétique présente des caractéristiques particulières par rapport à la souche sauvage. La croissance s'arrête à un plateau plus bas et indépendant de la concentration initiale de glucose. A la fin de la fermentation le glucose et l'éthanol produit ne sont pas complètement consommés. Un ajout de phénylalanine restaure une croissance identique à celle de la souche sauvage et la source de carbone est complètement consommée. Cependant on n'observe plus d'excrétion de tryptophane. Un dosage de la phénylalanine dans le milieu de culture lors de fermentations fed-batch montre que la levure est capable de faire des réserves intracellulaires de phénylalanine et que le démarrage de la production de tryptophane est sous le contrôle d'une concentration intracellulaire de phénylalanine. Un modèle physiologique prenant en compte la concentration intracellulaire de phénylalanine a été réalisé. Il simule bien la croissance avec limitation par la phénylalanine et le moment du déclenchement de l'excrétion de tryptophane
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Duboc, Henri-Gérard. „Dysbiose et métabolisme des acides biliaires : implications au cours du syndrome de l’intestin irritable“. Paris 6, 2013. http://www.theses.fr/2013PA066218.
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Le syndrome de l'intestin irritable associe douleurs abdominales chroniques et troubles du transit. C'est une pathologie digestive fréquente, qui dans sa physiopathologie inclue le concept de dysbiose, i. E les perturbations du microbiote intestinal (l'ensemble des micro organismes contenus dans un intestin). La dysbiose sous entend des perturbations du dialogue hôte-microbiote conduisant à la maladie, concept essentiellement descriptif à ce jour. Les acides biliaires sont synthétisés par le foie, métabolisés par les bactéries puis réabsorbés par l'intestin - donc potentiellement acteurs de ce dialogue. D'autres axes physiopathologiques incluent motricité, perméabilité, et sécrétion intestinale, des fonctions également régulées par les acides biliaires, via le récepteur membranaire TGR5. Ce travail présente et discute, à travers deux publications scientifiques les liens entre syndrome de l'intestin irritable, dysbiose, et récepteur TGR5The irritable bowel syndrome associates chronic abdominal pain and altered bowel transit. This is a common digestive disorder, which in its pathophysiology include the concept of dysbiosis, i. E disruption of the intestinal microbiota (overall micro organisms in a gut). Dysbiosis implies alterations of the host-microbiota dialogue leading to disease, a mainly descriptive concept to date. Bile acids are synthesized by the liver and metabolized by bacteria then reabsorbed from the intestine - so potentially involved in this dialogue. Other pathophysiological axes include motor, permeability, and intestinal secretion, and theses are functions also regulated by bile acids, through the membrane receptor TGR5. This work presents and discusses, through two scientific publications, the links between irritable bowel syndrome, dysbiosis, and TGR5 receptor
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Vianey-Liaud, Christine. „Contribution à l'exploration biochimique des déficits héréditaires de la β-oxydation des acides gras“. Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO1W239.
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Moro, Joanna. „Impact de la déficience en acides aminés indispensables sur le métabolisme protéique et énergétique, et identification de signatures métaboliques“. Thesis, université Paris-Saclay, 2021. http://www.theses.fr/2021UPASB001.
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La disponibilité de sources de protéines pour l’alimentation humaine est une préoccupation majeure du fait des transitions démographiques, économiques et nutritionnelles mondiales. Les apports en protéines doivent couvrir les besoins en neuf acides aminés considérés comme indispensables (AAI). Il est important que leur besoin soit couvert pour éviter des situations de déséquilibre du métabolisme protéique et énergétique. Différentes études ont été développées afin de déterminer ce besoin : bilan azoté, méthode factorielle, et méthodes utilisant les isotopes stables. Cependant, ces méthodes sont lourdes et invasives et les valeurs de besoins obtenues présentes des différences importantes. Il est donc nécessaire de développer des approches plus précises et non invasives, telle que la métabolomique, recommandée par la FAO. Les objectifs de cette thèse sont d’évaluer l’impact de la déficience en protéines et en AAI (lysine et thréonine) sur le métabolisme protéique et énergétique et d’identifier des marqueurs de la déficience de ces deux acides aminés chez le rat en croissance. Des niveaux sévères de déficience (85% ; 75%) en protéines et en lysine et thréonine diminuent le poids et la masse maigre et augmentent la prise alimentaire. Ces effets sont associés à une diminution de la synthèse protéique. et à une augmentation du métabolisme énergétique pour les faibles apports en protéines. Ces effets semblent médiés par FGF21. Les analyses de métabolomiques dans les urines révèlent que des variations du pipecolate et de la taurine signent respectivement une déficience en lysine et en thréonineThe availability of protein sources for human nutri-tion is a major concern due to global demographics, economics and nutritional transitions. Protein intakes must cover the need for nine indispensable amino acids (IAA). It is important that this need is met in order to avoid situations of protein and energy me-tabolism imbalance. Various studies have been de-veloped to determine this need: nitrogen balance, the factorial method, and methods using stable iso-topes. However, these methods are difficult and invasive, and the obtained values of needs present significant differences. It is therefore necessary to develop more precise and non-invasive approaches, such as metabolomics, as recommended by the FAO.The objectives of this thesis are to assess the impact of protein and IAA (lysine and threonine) deficiency on protein and energy metabolism and to identify markers of deficiency for these two amino acids in the growing rat. Severe levels of deficiency (85%; 75%) in protein and lysine and threonine decrease weight and lean mass and increase food intake. These effects are associated with a decrease in protein synthesis and an increase in energy metabolism in low protein diets. These effects seems to be mediated by FGF21. Analyses of metabolomics in urine show that variations in pipecolate and taurine indicate lysine and threonine deficiencies, respectively
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Tavernier, Blanche. „Régulation de la voie de la cynurénine : influence de l'inhibition de synthèse de sérotonine sur les concentrations cérébrales d'acide cynurénique et d'acides aminés“. Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05P133.
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Gouzy, Alexandre. „Étude de l'utilisation des acides aminés aspartate et asparagine dans la virulence de mycobacterium tuberculosis“. Toulouse 3, 2013. http://thesesups.ups-tlse.fr/2144/.
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La tuberculose tue plus d'un million de personnes par an à travers le monde et constitue la première cause de mortalité humaine due à un agent bactérien unique. L'agent étiologique de la tuberculose est Mycobacterium tuberculosis, un pathogène intracellulaire se répliquant à l'intérieur des macrophages dans une vacuole appelée le phagosome où l'accessibilité en nutriments est restreinte. Une meilleure compréhension des mécanismes par lesquels le bacille acquiert et assimile les nutriments de son hôte pourrait aider à développer de nouvelles stratégies pour combattre la tuberculose. Nous avons pu mettre en évidence que M. Tuberulosis exploite les acides aminés aspartate et asparagine pour assurer sa croissance au cours de l'infection par l'utilisation des transporteurs AnsP1 et AnsP2 et de l'asparginase AnsA. Ce travail révèle, pour la première fois, que les acides aminés sont une source d'azote majeure utilisée par le bacille tuberculeux au cours de l'infection et ouvre la voie pour l'identification de nouveaux antituberculeux ciblant l'assimilation des acides aminés par ce pathogène au cours du cycle infectieuxTuberculosis causes about 2 million dead per year in the worldwide and constitutes the first cause of human death due to a single bacterial pathogen. The etiologic agent of tuberculosis is Mycobacterium tuberculosis, a facultative intracellular pathogen who replicates inside macrophages in a specialized membrane-bound vacuole, the phagosome, whose pH is slightly acidic and where access to nutrients is limited. Understanding how the bacillus extracts and incorporates nutrients from its host may help develop novel strategies to combat tuberculosis. Here, we could demonstrate that M. Tuberculosis exploits the amino acids aspartate and asparagine as a major nitrogen source to support growth during infection through the transporters AnsP1 and AnsP2 and the asparaginase AnsA. This work provide the evidence, for the first time, that amino acids are major nitrogen providers during host colonization and thus pave the way to identify new antituberculous compounds targeting assimilation of amino acids by the bacterium upon infection
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Gingras, Andrée-Anne. „Implication des acides gras oméga-3 à longue chaîne dans la régulation de la sensibilité musculaire à l'insuline des métabolismes du glucose et des acides aminés chez les bouvillons en croissance“. Thesis, Université Laval, 2008. http://www.theses.ulaval.ca/2008/25386/25386.pdf.
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Genet, Cédric. „Identification et développement de triterpènes comme agonistes TGR5 : étude de leurs effets sur le métabolisme“. Strasbourg, 2010. http://www.theses.fr/2010STRA6295.
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Les maladies métaboliques sont devenues un fléau ces dernières décennies préfigurant plusieurs maladies graves comme le diabète de type 2. Les disfonctionnements mitochondriaux sont caractéristiques des maladies métaboliques. Cependant, ils ne sont pas ciblés par les thérapies actuelles qui se concentrent plutôt sur les conséquences de ces maladies. Néanmoins, la capacité du récepteur couplé aux protéines G, TGR5 présent dans le tissu adipeux et musculaire à augmenter l’activité mitochondriale ouvre de nouvelles perspectives d’avenir pour prévenir les stades précoce des maladies métaboliques et pour traiter ces maladies. Pour explorer le potentiel de TGR5, notre principal défi était d’identifier des agonistes plus puissants et plus sélectifs que les acides biliaires. En effet, les acides biliaires seuls agonistes connus à ce jour sont aussi actifs sur d’autres récepteurs nucléaires. Dans ce but, nous avons criblé une collection de plantes antidiabétiques par bio-guidage sur TGR5, ce qui nous a permis d’isoler et d’identifier deux principes actifs de la famille des triterpènes, l’acide oléanolique et l’acide corosolique. In vivo, l’acide oléanolique possède une activité hypoglycémiante, améliore la tolérance au glucose et empêche la prise de poids. De plus, l’acide oléanolique augmente l’activité mitochondriale in vitro. Une étude de la relation structure à activité sur une collection plus large de triterpènes naturels nous a permis d’obtenir un chef de file, l’acide bétulinique dont l’hemi-synthèse d’analogues a fourni RG 239, un puissant agoniste TGR5 capable d’induire l’activité mitochondriale de façon TGR5-dépendante. Malgré cela, in vivo il n’a montré aucun effet probablement à cause d’une faible biodisponibilité. Bien que tous ces résultats confirment TGR5 comme une cible thérapeutique, nous nous sommes rendus à l’évidence que les triterpènes ne sont pas des molécules développables pour obtenir un médicament. En effet, leurs châssis hydrophobe et le faible degré de liberté qu’offre leurs fonctions chimiques pour des modifications structurales nous ont poussés à utiliser des outils chémoinformatiques pour découvrir une nouvelle famille d’agoniste TGR5. C’est pourquoi, le criblage des banques de données de produits commerciaux Zinc et Asinex a été réalisé par des recherches pharmacophoriques et topomériques dont les résultats sont en cours d’exploitationMitochondrial dysfunction, a hallmark feature in the early stage of metabolic diseases, is currently not targeted by the available therapies with preferentially focus on the consequence of the diseases. Nevertheless, an early discovered G coupled protein receptor named TGR5 was shown to lead to an increase in mitochondrial activity. This effect reveals TGR5 as an interesting target to prevent the early onset of metabolic diseases. To further explore TGR5 potential, our principal challenge was to identify more potent and more selective TGR5 agonists than the already known bile acids which act on other nuclear receptors. To this end we used a TGR5 activity assay to screen a plant library. Among the plant extracts tested, was have been able to isolated two active principles from the triterpene family, the oleanolic acid and the corosolic acid. In vivo, oleanolic acid showed antihyperglycemic activity, improved glucose tolerance and decrease weight gain. Furthermore, oleanolic acid enhanced mitochondrial activity in vitro. An SAR study based on natural triterpenes has led us to the discovery of betulinic acid used in hemi-synthesis and affords the synthesis of RG 239, a more potent TGR5 agonist which induce mitochondrial activity in a TGR5 dependant manner. Unfortunately, RG 239 was not active in vivo, probably because of poor bioavailability. Although, these results confirm TGR5 as therapeutical target, we have found that triterpenes were not drugable molecules. Indeed, triterpenes are hydrophobic molecules and the degree of liberty of their chemical function for structural modification is very low. That is the reason why we have decided to screen two databases of commercial products, Zinc and Asinex with a scaffold hoping method in order to find new TGR5 agonist family. The selected molecules by this approach are under investigation
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Guillet, Christelle. „Altérations de la réponse du métabolisme des protéines musculaires aux facteurs anaboliques au cours du vieillissement“. Clermont-Ferrand 1, 2003. http://www.theses.fr/2003CLF1MM21.
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Joulin, Yves. „Métabolisme, méthodes de dosages et intérêt de la mesure de la 3-méthylhistidine dans les liquides biologiques“. Paris 5, 1988. http://www.theses.fr/1988PA05P192.
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Bouras, Noureddine. „Régulation de la production d'antibiotiques dithiolopyrrolones chez saccharothrix algeriensis NRRL B-24137“. Phd thesis, Toulouse, INPT, 2005. http://oatao.univ-toulouse.fr/7063/1/bouras.pdf.
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Ce travail s'est donné pour objectif l'étude de l'effet de certains nutriments (acides aminés, acides organiques et acide humique) sur la production des antibiotiques dithiolopyrrolones, ainsi que l'induction de la production de nouvelles dithiolopyrrolones chez Saccharothrix algeriensis NRRL B-24137 (= DSM 44581) dans un milieu semi-synthétique. La cystine à une concentration comprise entre 0 et 5 mM favorise la production des dithiolopyrrolones en fournissant des précurseurs du noyau pyrrothine. Au-delà de cette concentration, la production des dithiolopyrrolones chute fortement. La présence de certains acides aminés comme L-proline, acide L-glutamique et DL-histidine et certains acides organiques comme 4-hydroxybenzoïque, benzentétracarboxylique, pantothénique et pivalique mène à une augmentation de la production des dithiolopyrrolones. En outre, les productions des dithiolopyrrolones sont fortement favorisées en présence de 0,25 g/L de l'acide humique. En revanche, la présence de certains acides aminés (cystéine, méthionine, éthionine, etc.) et acides organiques (pamoïque, benzensulfonique et syringique, etc.) a un effet inhibiteur sur la production des dithiolopyrrolones même à des concentrations peu élevées. Certains acides organiques s'incorporent directement au niveau de la chaîne latérale produisant ainsi l'antibiotique correspondant. Dans le milieu synthétique de base, Sa. algeriensis ne produit qu'un nombre limité de dithiolopyrrolones. L'induction de nouvelles dithiolopyrrolones a été réalisée par l'addition de certains acides aminés (cysteine et cystine) et acides organiques (benzoïque, cinnamique, 4-bromobenzoïque, etc.). Dans cette étude, dix huit principales nouvelles dithiolopyrrolones ont été obtenues. Les similarités des molécules nouvellement apparues observées dans les spectres UV -visible et les fragments de masse indiquent qu'on est en présence de molécules appartenant au même groupe des dithiolopyrrolones ou des précurseurs proches des dithiolopyrrolones. Les données ont révélés que la molécule PR 14,60 (PM = 276) est une déméthyl-benzoyl-pyrrothine, une nouvelle molécule jamais signalée. En revanche, la nouvelle dithiolopyrrolone PR 16,64 est une benzoyl-pyrrothine, une molécule produite en traces dans le milieu complexe. Des fermentations contrôlées dans des fermenteurs en batch ont été effectuées en présence de l'acide benzoïque, de l'acide tiglique, de l'acide méthacrylique et de l'acide humique (pris un à un) pour affiner les résultats obtenus en ErIenmeyers. D'après les résultats obtenus, la croissance de Sa. algeriensis dans toutes les fermentations est très rapide pendant les premières heures de culture. Les cellules de la culture témoin subissent une lyse cellulaire assez marquée alors que les cellules en présence des acides organiques se maintiennent bien. Les acides organiques en tant que source de carbone permettent la conservation de l'intégrité des cellules. Les dithiolopyrrolones ne sont produits que pendant l'idiophase. La biosynthèse de ces antibiotiques est soumise à la régulation par les acides organiques ajoutés. L'acide méthacrylique et l'acide tiglique, dans certaines conditions, augmentent la production de quelques dithiolopyrrolones. En outre, une diminution de la teneur de toutes les dithiolopyrrolones est observée après les 80 h de fermentation. Ces baisses constatées des titres sont à attribuer peut être à une dégradation ou transformation des dithiolopyrrolones. Les résultats obtenus en fermenteurs ne sont pas exactement les même que ceux obtenus en ErIenmeyers d'un point de vue qualitatif et quantitatif. En revanche, nous avons obtenu les deux nouvelles molécules induites par l'acide benzoïque (PR 14,60 et PR 16,64).
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Abdel, Sater Fadi. „Dissection fonctionnelle de la voie de signalisation activée par les acides aminés extracellulaires chez Saccharomyces cerevisiae“. Doctoral thesis, Universite Libre de Bruxelles, 2005. http://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/211024.
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Deglaire, Amélie. „Flux de protéines endogènes dans l'intestin et métabolisme postprandial des acides aminés alimentaires chez les mammifères monogastriques et chez l'homme“. Phd thesis, AgroParisTech, 2008. http://pastel.archives-ouvertes.fr/pastel-00004154.
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La qualité nutritionnelle des protéines alimentaires dépend de deux paramètres clés : la digestibilité iléale vraie et l'utilisation métabolique des acides aminés (AA) absorbés. Les objectifs de cette étude étaient de déterminer l'influence de deux facteurs alimentaires (facteurs antinutritionnels et peptides) sur les flux iléaux de protéines endogènes; de valider la technique d'intubation utilisée chez l'homme pour prélever des effluents iléaux; de comparer le métabolisme postprandial d'AA alimentaires suivant leur forme d'ingestion; d'évaluer la validité du modèle porc pour prédire la digestibilité protéique chez l'homme. Les investigations se sont déroulées chez le rat, le porc et l'homme. Les effluents iléaux étaient collectés chez le rat après euthanasie, chez le porc vivant équipé d'une canule en aval de la valve iléo-caecal et chez l'homme conscient équipé d'une sonde naso-iléale. L'azote (N) et les AA endogènes iléaux étaient déterminés suite à un repas protéiprive (PP), un repas contenant de la caséine, intacte (C) ou hydrolysée (HC), marquée avec l'isotope stable 15N ou un repas à base d'AA libres (A) mimant la composition de la caséine et privé de certains AA non essentiels afin de mesurer directement leur flux endogènes. De plus, la centrifugation et ultrafiltration des effluents HC permettaient de déterminer les protéines endogènes iléales et le recyclage d'N alimentaire (15N). Les facteurs antinutritionnels issus d'un extrait brut de haricots (Phaseolus vulgaris), ingérés au niveau habituel de consommation chez l'homme, augmentaient les flux iléaux de protéines endogènes (rat, repas PP). Après adaptation au repas, le bilan azoté corporel per se n'avait pas d'influence sur les flux iléaux de protéines endogènes (rat, repas PF et A) mais les peptides alimentaires (repas HC) augmentaient les flux iléaux d'AA et N endogènes par rapport au repas PP. Les peptides alimentaires (HC), comparés aux peptides libérés naturellement dans l'intestin au cours de la digestion (C), n'augmentaient pas les flux iléaux de protéines endogènes (rat, porc, homme). Le recyclage d'N alimentaire dans les protéines endogènes était maximal chez le rat nourri en continu, plus faible chez le porc nourri en aigu et minimum chez l'homme nourri en aigu (respectivement : 65, 21 et 11%). Par ailleurs, ces recherches ont montré que l'intubation naso-iléale utilisée pour prélever des effluents iléaux chez l'homme était une méthode juste et que le porc était un modèle valide pour prédire la digestibilité iléale vraie chez l'homme. Enfin, la forme d'ingestion des AA alimentaires (HC ou C) influençaient le devenir métabolique des AA alimentaires, en particulier par rapport aux cinétiques de catabolisme des AA. Cependant, la valeur nutritionnelle était, au final, similaire pour HC et C.
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Gouirand, Victoire. „Etude de la reprogrammation des voies métaboliques des acides aminés au cours de la carcinogenèse pancréatique“. Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0673.
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La progression maligne de l’adénocarcinome canalaire pancréatique (ADKP) s'accompagne d'une profonde réaction desmoplasique, limitant la vascularisation de la tumeur et de fait privant les cellules tumorales en nutriments, forçant les cellules tumorales à adapter leur métabolisme. L’objectif de thèse était de définir les changements métaboliques relatifs à l’ADKP. Par une analyse transcriptomique des tumeurs pancréatiques développées de manière spontanée chez les souris, nous avons établi le profil métabolique des ADKPs lié aux acides aminés au cours de leur progression. Ainsi, nous avons montré que les voies métaboliques de la proline et des acides aminés à chaînes branchées, en particulier le catabolisme de la leucine, sont celles étant les plus dérégulées dans l’ADKP. Concernant le métabolisme de la proline, nous avons montré que les cellules tumorales privées en nutriments capturent et utilisent le collagène, produit par les fibroblastes du stroma tumoral grâce à la macropinocytose, de façon le dégrader en proline. Aussi, l’inhibition de la dégradation de la proline entraine une diminution de la prolifération tumorale in vitro et in vivo. Concernant la leucine, nous montrons que l’élément clé de ce métabolisme est un de ces produits de dégradation finaux à savoir le β-hydroxybutyrate (βOHB) dont la production repose sur une enzyme cruciale : HMGCL. Dans nos travaux, nous démontrons que la suppression d’HMGCL dans les cellules d’ADKP humains entrave leurs capacités oncogéniques et métastatiques in vitro et in vivo. De plus, nous montrons in vivo que le βOHB augmente la croissance tumorale ainsi que la formation de métastasesThe malignant progression of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is accompanied by a profound desmoplasia, depriving tumor cells from oxygen and nutrients, which forces tumor cells to adapt their metabolism to proliferate. The thesis purpose is to define the metabolic changes related to ADKP. Using a transcriptomic analysis of PDAC from mice model, we established the PDAC metabolic profile. Focusing on amino acid metabolic pathways, we identified the metabolic pathways of proline and the branched-chain amino acid, especially the leucine catabolism, as the most deregulated in ADKP compared to the normal pancreas. We demonstrated that tumor cells take up collagen-derived fibroblasts, thanks macropinocytosis, when they are nutrient deprived. Once collagen is internalized, its subsequent digestion supplies TCA with proline. Also, inhibition of proline degradation leads to a decrease in tumor proliferation in vitro and in vivo. We have shown leucine catabolism is specific to tumor cells and the final degradation products: the β-hydroxybutyrate (βOHB) appears as a key element of this metabolism. To produce βOHB, tumor cells use HMGCL, a crucial enzyme involved in leucine degradation. In our work we demonstrated that HMGCL suppression in PDAC cells decreases their oncogenic and metastatic capacities in vitro and in vivo. In addition, we have demonstrated in vivo that βOHB increases tumor growth and metastasis formation. Thus, our works show 1/ the metabolic plasticity of cells, 2/the influence of microenvironment on tumor cell metabolism, 3/ the importance to study tumor metabolism for the finding of new therapeutic targets
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Bertrand, Catherine. „Purification de flavoprotéines d'origine mitochondriale et diagnostic des déficits héréditaires de l'oxydation mitochondriale des acides gras“. Lyon 1, 1993. http://www.theses.fr/1993LYO1T013.
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Chotechuang, Nattida. „The role of amino acids in liver protein metabolism under a high protein diet : identification of amino acids signal and associated transduction pathways“. AgroParisTech, 2010. http://pastel.archives-ouvertes.fr/docs/00/61/09/98/PDF/Thesis_Nattida_CHOTECHUANG_last_version.pdf.
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La consommation d'un régime hyper protéique (HP) améliore l'homéostasie glucidique, le gain de poids, l'adiposité, en réduisant le tissus adipeux blanc et la taille des adipocytes. Les adaptations métaboliques dues à l'augmentation de l'apport protéique sont au moins caractérisées, au niveau du foie, par la diminution de la lipogenèse et l'augmentation de la conversion des acides aminés (AA) en glycogène. Cependant, le rôle des acides aminés dans le contrôle de ces adaptations métaboliques et des voies de transduction responsables de la transmission du signal " acides aminés " n'ont pas encore été élucidés. L'objectif de notre étude a été de déterminer l'effet de l'augmentation de l'apport en acides aminés sur la traduction et la protéolyse, et d'identifier les voies de signalisation impliquées dans la détection des acides aminés ainsi que l'acide aminé ou le groupe d'acide aminés responsable de ces effets, en utilisant des approches in vivo et in vitro. Les extraits protéiques ont été analysés par western blots pour examiner l'état de phosphorylation des protéines impliquées dans les voies de signalisation qui participent à la détection des AAs et à la régulation de la traduction, à savoir les voies: " mammalian target of rapamycin " (mTOR), " adenosine monophosphate-activated protein kinase " (AMPK) et " general control non-depressible kinase 2 " (GCN2). Cette étude a montré que l'adaptation à un régime de HP est caractérisée par la stimulation de la traduction dans le foie, au moins au niveau de l'étape d'initiation. Cette activation requiert à la fois la présence de fortes concentrations en AA (au moins la leucine ou des AAs à chaîne branchée) et d'insuline, comme l'indique l'augmentation de la phosphorylation de mTOR, 4E-BP1 et S6 et la diminution de la phosphorylation de l'AMPK et GCN2. L'utilisation de l'AICAR (activateur de l'AMPK) et de la rapamycine (inhibiteur de mTOR) nous a permis de montrer qu'en présence de fortes concentrations en AA et d'insuline, mTOR n'est pas le seul régulateur de 4E-BP1 et de la S6K1 (cibles de mTOR) et que l'AMPK peut également jouer un rôle important dans la régulation de leur état de phosphorylation. En outre, l'augmentation de l'apport protéique provoque une inhibition de la dégradation des protéines dans le foie et une diminution de l'expression des gènes codant les principales protéines du système autophagie et de l'ubiquitine-protéasome. En conséquence, les protéines sont moins ubiquitinées, donc moins dégradées. Les AAs et l'insuline semblent être les principaux régulateurs de la voie de protéolyse ubiquitine-protéasome et les voies mTOR et AMPK seraient les médiateurs des effets acides aminés et de l'insuline. Ces résultats suggèrent que le contrôle des voies cataboliques et anaboliques du métabolisme des protéines sont régulées par les mêmes signaux et font intervenir les mêmes voies de signalisationHigh Protein (HP) intake improves glucose homeostasis and reduces weight gain, body fat mass, white adipose tissue and adipocyte size in rats. The metabolic adaptation is characterized by at least a decrease in hepatic lipogenesis and an increase in hepatic amino acid (AA) conversion into glycogen. However, the role of amino acids (AAs) in the control of these metabolic adaptations has not been studied, and the transduction pathways involved in the sensing of the increase in AA supply remain unclear. Therefore, the aim of our study was to understand the effect of AAs on translation and on proteolysis, to identify the transduction pathways involved in AA signaling and the AA or the groups of AAs involved in these effects, using both in vivo and in vitro approaches. Western blot analysis was performed on protein extracts to examine the phosphorylation state of the mammalian target of rapamycin (mTOR), adenosine monophosphate-activated protein kinase (AMPK) and general control non-depressible kinase 2 (GCN2) transduction pathways which may be involved in AA sensing and in the control of translation in liver. This study demonstrated that adaptation to HP diet was characterized by the stimulation of translation, at least for the initiation step in the liver. Using primary culture of hepatocytes, we showed that this activation required both high AA levels (at least for leucine alone or a branched-chain AA mixture) and insulin, as indicated by the increase of mTOR, 4E-BP1 and S6 phosphorylation and the decrease of AMPK and GCN2 phosphorylation. Using AICAR (AMPK activator) and rapamycin (mTOR inhibitor), we demonstrated that mTOR might not be the only regulator of 4E-BP1 and S6K1 (downstream targets of mTOR) in high AA conditions and that AMPK may also play an important role in their control. Moreover, the HP diet induced the inhibition of protein breakdown in the liver and these results were concomitant with a decrease of gene expression of the major components for both autophagy and the ubiquitin-proteasome system in liver. Subsequently, ubiquitinated protein in the liver was lower and both AAs and insulin were required for the down-regulation of ubiquitination. Indeed, mTOR and AMPK were also involved in the control of the ubiquitin proteasome system in the liver in response to the increase in AA and insulin concentrations. These results suggested that the control of the catabolic and anabolic pathways of protein metabolism was regulated by the same set of signals and mediated by the same transduction signaling pathways
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Ciapa, Brigitte. „Un modèle pour l'étude de l'activation cellulaire : la fécondation de l'œuf d'oursin“. Nice, 1987. http://www.theses.fr/1987NICE4132.
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Étude de l'origine du signal calcique et des modifications de pH intracellulaire ainsi que du rôle de ces deux évènements dans l'activation du métabolisme cellulaire au cours de la fécondation de l'œuf d'oursin
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Peyraud-Thomas, Caroline. „Étude fonctionnelle des complexes multiprotéiques impliqués dans la régulation transcriptionnelle des gènes de la voie de biosynthèse des acides aminés soufrés chez Saccharomyces cerevisiae“. Paris 6, 2001. http://www.theses.fr/2001PA066467.
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Faure-Ronzeau, Magali. „Etude de la régulation de l'expression de la transaminase mitochondriale des acides aminés à chaine ramifiée au cours du développement dans le muscle squelettique du mouton“. Aix-Marseille 3, 1998. http://www.theses.fr/1998AIX30112.
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La transaminase des acides amines a chaine ramifiee catalyse la premiere etape de degradation de ces acides amines. Les particularites de cette enzyme chez les ovins : faible activite par rapport a celle observee chez le rat, chute de son activite au cours du developpement, ont ete analysees. Parmi les deux isoenzymes exprimees chez le mouton, l'isoenzyme mitochondriale a ete purifiee, clonee et son gene localise sur le chromosome 14. Les differences d'activite de transamination observees entre especes ne sont pas dues a la proteine elle-meme, mais a son expression plus faible chez le mouton. Chez ce dernier, la transaminase mitochondriale est ubiquitaire comme chez les autres especes. La transaminase cytosolique est exprimee dans un grand nombre de tissus ovins alors que son expression est restreinte a peu de tissus chez les monogastriques. Ceci a des consequences physiologiques importantes en particulier dans le muscle squelettique. L'activite de la transaminase est fonction du type metabolique des muscles ovins. Cependant, la diminution de son activite au cours du developpement serait independante de l'evolution du type metabolique des muscles. La transaminase cytosolique est l'isoenzyme dont l'activite baisse le plus. La transaminase mitochondriale pourrait etre regulee au niveau traductionnel au cours du developpement. En conclusion, la transaminase mitochondriale ovine est probablement soumise a plusieurs mecanismes de regulation.
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Chalvon-Demersay, Tristan. „Rôle des acides aminés dans la limitation de l’adiposité sous régime hyperprotéique“. Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2016. http://www.theses.fr/2016SACLA018/document.
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Plusieurs études ont montré que certaines kinases situées dans le foie, « mammalian target of rapamycin » (mTOR), « adenosine monophosphate-activated protein kinase » (AMPK) et « general control non-depressible kinase 2 » (GCN2) répondent à la disponibilité en acides aminés.L’objectif de nos études a été de préciser le rôle de deux de ces voies, l’AMPK et GCN2, dans les adaptations du métabolisme énergétique et de la synthèse protéique en réponse aux variations en protéines du régime. Pour cela, des souris de type sauvage et des souris KO n’exprimant plus la voie AMPK ou GCN2 dans le foie ont été nourries pendant trois semaines avec un régime faible, normal ou fort en protéines. Les analyses ont montré que les souris KO-AMPK foie spécifique et nourries sous régime normoprotéique adaptent leur métabolisme hépatique notamment en sécrétant le facteur fibroblastique FGF21 ce qui leur permet de compenser l’absence d’AMPK et de présenter des profils d’oxydation normaux.Au contraire, les souris KO-AMPK foie spécifique nourries avec des régimes faibles ou forts en protéines présentent des altérations des profils d’oxydation des lipides et des glucides liées à une absence de modification du métabolisme hépatique.La délétion de GCN2 dans le foie, quant à elle, n’a d’effet que sous régime faible en protéines : les souris KO-GCN2 foie spécifique présentent une plus faible oxydation lipidique et une plus forte oxydation glucidique que les souris sauvages en période postprandiale dû à l’absence d’induction de la sécrétion de FGF21.Concernant le métabolisme des protéines, les kinases GCN2 et AMPK ne semblent pas impliquées dans l’intensité du flux de synthèse protéique dans le foie et en périphérie dans le muscle en période postprandiale.En conclusion, ces travaux montrent que les délétions de l’AMPK et de GCN2 hépatiques affectent le métabolisme énergétique mais pas le métabolisme protéique et que les conséquences dépendent de la composition du régimeSeveral studies have reported that some kinases located in the liver respond to the availability of amino acids. These kinases are mammalian target of rapamycin '(mTOR), "adenosine monophosphate-activated protein kinase" (AMPK) and "general control non-depressible kinase 2" (GCN2).The aim of our study was to clarify the role of two of these signaling pathways, AMPK and GCN2 in the adaptations of energy and protein metabolism in response to the modulation of dietary protein content. Wild-type and liver AMPK-deficient or liver GCN2-deficient mice were fed either a low, a normal or high protein diet during three weeks. Analyzes showed that liver AMPK-deficient mice fed under a normo-protein diet exhibit an adapatation of liver metabolism and secret FGF21 which enables them to have normal postprandial oxidation profiles.In contrast, liver AMPK-deficient mice fed a low or a high protein diet exhibit an alteration in postprandial oxidation profiles. The deletion of GCN2 in the liver only has an effect under low protein diet as liver GCN2 deficient mice have a lower lipid oxidation and a higher carbohydrate oxidation linked to the absence of FGF21 secretion. Concerning protein metabolism, AMPK and GCN2 do not seem to be involved in protein synthesis rate in the posrprandial period in the liver and periphery in the postprandial muscle. In conclusion, these studies show that hepatic AMPK and GCN2 deletions affect energy metabolism, but not protein metabolism and that the consequences depend on diet composition
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Famelart, Marie-Hélène. „Étude du comportement de Brevibacterium linens ATCC 9175 en fermenteur : influence des conditions de culture sur la croissance et le métabolisme du lactate et des acides aminés“. Paris 11, 1986. http://www.theses.fr/1986PA112002.
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L’étude du comportement de B. Linens en fermenteur est entreprise sur un milieu à base de L-lactate et d’une peptone caséique. La première partie présente la réalisation d’un plan d’expériences pour mettre en évidence l’effet de 3 facteurs, le pH (7,5-8,5), la température (20-30°C), et l’oxygène dissous (40-60% de la saturation), tous 3 régulés au cours de la culture, sur plusieurs paramètres de croissance et de métabolisme à des temps caractéristiques : temps de latence, temps de fin de phase exponentielle, temps de fin de phase de ralentissement et temps final. La valeur de ces temps, la densité optique (D. O. ) de la culture, la quantité de lactate et d’acides aminés demeurant présents, ainsi que l’ammoniac produis à ces temps sont analysés. Par ailleurs, la valeur du temps de génération est déduite de représentations graphiques. Un modèle logistique de croissance a été également utilisé pour une meilleure précision, et les paramètres suivants ont été déduits : temps pour attendre 2. 5, 35, et 80% de la D. O. Maximale, valeur ajustée de ce maxima, vitesse maximale et moyenne de croissance. Les données fournies par les régulations de pH et d’oxygène dissous ont été également analysées aux mêmes temps caractéristiques. Les résultats les plus satisfaisants sont obtenus par l’analyse de variance sur l’ensemble des conditions expérimentales et le paramètre temps de génération. Ils révèlent un important effet quadratique de l’oxygène, une liaison très importante entre les 3 facteurs, et des termes tous positifs. Le temps de génération diminue entre 40 et 50% d’oxygène et augmente au-delà. Les variations des autres paramètres sont moins bien expliquées, mais il ressort que la valeur maximale de la D. O. Est indépendante des niveaux des facteurs. La disparition des substrats n’indique pas d’effet de facteurs compte-tenu du manque de précision des mesures, sauf un effet linéaire, quadratique, et cubique de l’oxygène : ses niveaux 40 et 60% entraînent une consommation incomplète des substrats par comparaison au niveau 45-55% mais la croissance est-elle achevée dans ces cultures ? B. Linens produit de l’ammoniac, qu’il reconsomme, apparemment lorsque la concentration d’acides aminés présents diminue, ceci étant révélé par des régressions statistiques significatives. Il consomme préférentiellement certains acides aminés (arginine, tyrosine, phénylalaline) et produit dans certains cas de l’ornithine. Ses activités de production d’arômes sont mises en évidence qualitativement par des reniflages. L’utilisation d’un inoculum de cellules lyophilisées a entraîné l’allongement des temps de latence, et une consommation accrue en oxygène. Les quantités de neutralisant semblent dépendre plus des taux de croissance que des conditions de culture. Quelques expérimentations supplémentaires réalisées avec des milieux de concentrations différentes, et présentées en partie 2 ont indiqué que : - le lactate n’est pas limitant – certains acides aminés préférentiellement consommés doivent être limitants, et leur disparition entraîne la chute rapide des taux de croissance – l’ammoniac est produit lorsque la source azotée est présente en quantité supérieure à la source carbonée – les rendements faibles en biomasse dans les cas de milieux à forte concentration en lactate peuvent s’expliquer par un terme de maintenance. Quelques essais de modélisation de la production de biomasse et de disparition des substrats sont réalisés, mais la complexité des milieux employés empêche de conclureThis study presents the behaviour of Brevibacterium linens in a fermentor on a L-lactate and casamino acids medium. The first part consists of an experimental design used to point out the effect of 3 factors: the pH (7,5-8,5), the temperature (20-30°C) and the dissolved oxygen concentration (40-60% of the saturation), both of them controlled during the culture, on growth and metabolism parameters at different times: lag time, end of exponential growth, end of the falling back of growth and final time. The values of these times, the absorbance (D. O. ) of the culture, the concentration of lactate and amino acids, and produced ammonia at these times were analysed. The value of generation time was deduced from graphical response. The logistic law was used to improve growth data precision, and the following parameters were deduced: time to reach 2. 5, 35, and 80% of the maximal O. D. , value of this maximum, maximal and mean growth rate. Data obtained from the pH and dissolved oxygen controls at the same typical times were also analysed. The most important results were obtained from the variance analysis on the overall experimental conditions and on the generation time parameter: they showed an important quadratic effect of oxygen, an important interaction between the 3 factors, and positive effects. The generation time decreased between 40% and 50% of dissolved oxygen and increased beyond this level. The other parameters were less explained, but it appeared that the value of maximal growth is factors independent. The substrate consumption pointed out no factor effect, with the obtained precision, except a linear, quadratic and cubic effect of dissolved oxygen: tested at the levels 40 and 60%, this factor leads to incomplete substrate consumption, compared with the level 45-55%. But, is the maximal growth achieved in the case of these cultures? B. Linens produced ammonia which is absorbed with the amino acids, this fact pointed out by linear regressions statistically significant. A preferential consumption of a few amino acids (arginine, tyrosine and phenylalanine) has been detected, as ornithine production in some circumstances. His aroma production activities were pointed out qualitatively by sniffing. The freeze dryed suspension showed longer lag periods, and a greater oxygen consumption. The volumes of acid or alkali used to maintain the pH seemed to be more dependent on growth than on culture conditions. Some additional experiments presented in part 2, with mediums of different substrate concentrations showed that: - lactate is not limitant – some amino acids absorbed may be limitant, and decrease in growth rate may be explained by their removing – the low growth yields found in case of high lactate concentration medium may be explained by maintenances effects. Modelisation of biomass production and substrate consumption was tested, but the medium complexity prevented to do it
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Kraft, Guillaume. „Régulation nutritionnelle du métabolisme hépatique des acides aminés chez le ruminant en croissance : conséquences sur l'apport des nutriments azotés aux muscles“. Paris, AgroParisTech, 2009. http://www.theses.fr/2009AGPT0001.
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L’objectif de cette thèse était de déterminer dans quelle mesure l’équilibre en apports énergétiques et azotés dans la ration de ruminants en croissance (agneaux) pouvait avoir un impact sur l’efficacité d’utilisation de l’azote et en particulier des acides aminés (AA) chez ces animaux. Ce travail s’est particulièrement intéressé à l’utilisation des AA au niveau de l’aire splanchnique (tube digestif et foie) qui est utilisatrice importante d’AA et entre en compétition avec les muscles pour l’utilisation de ces AA. Les résultats montrent qu’une baisse des apports azotés seuls dans la ration relativement aux recommandations alimentaires ne se traduit pas nécessairement par une baisse de croissance, ce qui implique donc une meilleure efficacité d’utilisation de l’azote alimentaire. Ceci s’explique en partie par une diminution du prélèvement hépatique des AA (diminution du catabolisme des AA) et une meilleure efficacité d’utilisation des AA au niveau hépatique. A l’inverse, dans le cas d’une baisse des apports alimentaires en énergie seule dans le régime, la baisse de croissance et de rétention azotée est immédiate, associée à un catabolisme des AA et une uréogenèse intense chez les animaux. Ainsi, les recommandations en terme d’apports azotés chez les ruminants en croissance mériteraient d’être réévalués chez les ruminants afin de maximiser l’efficacité d’utilisation de l’azote dans la ration et limiter les rejets azotés dans l’environnement. A l’inverse, les recommandations énergétiques ne doivent pas être diminuées sous peine de pénaliser la croissance et l’accrétion protéique des animaux.
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Gilot, Martine. „Traitements thermiques du tryptophane libre ou résiduel : incidences nutritionnelles, recherche du pouvoir mutagène“. Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20205.
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Stepien, Magdalena. „Impact des régimes hyperprotéiques sur l'homéostasie énergétique“. AgroParisTech, 2010. http://www.theses.fr/2010AGPT0007.
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Omphalius, Cléo. „Variations de l’efficience d’utilisation des acides aminés d’intérêt en fonction des apports en énergie chez la vache laitière“. Thesis, Rennes, Agrocampus Ouest, 2019. http://www.theses.fr/2019NSARB325.
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En élevage laitier, augmenter l’efficience d’utilisation des protéines métabolisables (PM), c’est-à-dire le ratio entre les protéines excrétées et les PM apportées, est un enjeu environnemental et économique important. Cette efficience est conditionnée par le devenir métabolique des acides aminés (AA), nutriments issus de l’hydrolyse des PM lors de leur digestion. En effet, les AA absorbés sont, sur une base nette, soit utilisés pour synthétiser les différentes protéines exportées par l’animal, soit catabolisés en urée. Or l’utilisation des AA pour la synthèse protéique est un processus couteux en énergie. Ce travail de thèse visait à comprendre les variations d’efficiences d’utilisation des AA individuels en réponse aux apports d’énergie nette, de PM et d’AA. Pour cela, l’utilisation des AA dans les différents tissus a été analysée dans trois essais de métabolisme splanchnique ou/et mammaire. L’apport d’énergie nette était modulé en interaction soit avec l’apport total d’AA absorbésL’originalité de ce travail a été de coupler ces analyses de métabolisme des AA au calcul d’efficiences individuelles de chacun des AAI afin de mieux appréhender leur catabolisme par leur inefficience. L’efficience des PM a été calculée en considérant, non pas seulement les exportations de protéines du lait, mais l’ensemble des protéines exportées (INRA, 2018), dont en particulier les protéines endogènes fécales. Ce calcul a alors été appliqué aux AAI individuels en utilisant les profils en AAI de chaque fraction protéique (Lapierre et al., 2016). Ce travail a démontré que les variations d’expFor dairy nutritionists, increasing the efficiency of metabolizable proteins (MP, microbial proteins and dietary proteins escaped ruminal digestion), which is the ratio between the exported protein and MP supply, is an environmental and economic challenge. This efficiency depends of the metabolic fate of amino acids (AA), nutrients absorbed after the hydrolysis of MP, and consequently of the partition between the use of AA to synthesize the different proteins exported and their catabolism in urea. The use of AA is an energy-dependent process. This work aimed to understand the variations of the efficiency of use of individual AA in response to energy supply. Data from three splanchnic or/and mammary metabolism studies have been used to study the variations of AA use. The net energy supply was modulated in interaction with the supply of total AA or with those of the three most limiting essential AA (EAA, Lys, Met and His).The originality of this work was to combine measurements on metabolism to the calculation of individual EAA efficiencies to better understand their catabolism by their inefficiency. The efficiency of PM was calculated by considering, not only milk protein exports, but all exported proteins (INRA, 2018), including endogenous fecal proteins. This calculation was then applied to individual EAA using the EAA profiles of each protein fraction (Lapierre et al., 2016). The main conclusions were that variations in protein exports are explained by variations in net splanchnic and mammary fluxes and by changes in intramammary uses of AA according to nutritional situ
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Rouhier, Nicolas. „Aspects fonctionnels et structuraux des systèmes thiorédoxine et glutarédoxine de peuplier et de leurs enzymes cibles, les peroxyrédoxines et les méthionine sulfoxyde réductases de type A“. Nancy 1, 2003. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/SCD_T_2003_0104_ROUHIER.pdf.
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Le métabolisme cellulaire génère des espèces réactives oxygénées (ROS) qui endommagent les macromolécules, protéines et lipides notamment. En maintenant l'équilibre oxydo-réducteur, les systèmes thiorédoxines et glutarédoxines permettent de lutter contre les ROS. Deux thiorédoxines et une glutarédoxine, toutes bicystéiniques, ont été ainsi caractérisées et leur mécanisme catalytique détaillé. Notre intérêt s'est également porté sur deux types d'enzymes cibles des thiorédoxines et des glutarédoxines, des peroxyrédoxines qui sont des peroxydases fonctionnant sans groupe prosthétique mais avec des cystéines réactives, et des méthionine sulfoxyde réductases de type A, qui réduisent l'isomère S des méthionine sulfoxydes en méthionine. La caractérisation structurale et fonctionnelle de plusieurs isoformes de peroxyrédoxines et de méthionine sulfoxyde réductases de type A a permis d'identifier les acides aminés impliqués dans l'activité de ces protéines ainsi que ceux responsables des interactions protéine-protéineCellular metabolism leads to the production of reactive oxygen species (ROS) which are extremely damaging to macromolecules including proteins and lipids. By maintaining the redox equilibrium, the thioredoxin and glutaredoxin systems help fight the damages generated by the ROS. Two thioredoxins and one glutaredoxin, all bicysteinic, have been chracterized and their catalytic mechanism detailed. This work has also focused on two thioredoxin/ glutaredoxin target enzymes, peroxiredoxins which are peroxydases devoid of prosthetic group and type A methionine sulfoxide reductases, which reduce S methionine sulfoxide into methionine. The structural and functional characterization of several peroxiredoxin and type A methionine sulfoxide reductases has led to the identification of the active site amino acids as well as those necessary for the protein/protein interactions. The most original result is that glutaredoxin can serve as an alternative and preferential electron donor for a certain class of peroxiredoxins
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Huet-Velasco, Carine. „Mise en évidence du rôle des isoenzymes I et II de la pyruvate carboxylase dans le métabolisme central, chez la levure Saccharomyces cerevisiae“. Toulouse, INSA, 2001. http://www.theses.fr/2001ISAT0005.
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La pyruvate carboxylase est une enzyme clé du métabolisme central des eucaryotes. Elle catalyse la réaction de carboxylation du pyruvate en oxaloacétate, et constitue ainsi une voie anaplérotique essentielle du cycle du citrate. Chez la levure Saccharomyces cerevisiae il existe 2 isoenzymes cytosoliques de la pyruvate carboxylase, PC I et PC II, codées par deux gènes homologues, PYC1 et PYC2. Notre objectif est de trouver des conditions qui permettraient de différencier ces 2 isoformes afin de déterminer leur fonction respective. L'analyse des propriétés cinétiques montre que PC I est dépendante de l'acétyl-CoA alors que PC II est quasiment insensible à cet effecteur et l'affinité de PC I pour l'ATP est 10 fois inférieure à celle de PC II. PC I semble l'isoenzyme majeure sur glucose/ammonium car la délétion de PYC1 ralentit la croissance de la levure alors que la délétion de PYC2 n'a pas de phénotype et l'activité PC I dans un mutant delta pyc2 est 2 fois supérieure à l'activité PC II dans un mutant delta pyc1. Dans ce travail, nous montrons que PYC1 et PYC2 sont régulés de manière différentielle par la nature de la source d'azote du milieu de croissance. Des régions promotrices de PYC1 semblent impliquées dans le mécanisme de répression de PYC1 en présence d'aspartate et de glutamate. Les rapports de concentration entre l'alpha-cétoglutarate, la glutamine et le glutamate intracellulaires pourraient être des signaux du contrôle de PYC1 par la nature de la source d'azote. PC I, isoenzyme majoritaire régulée par la nature des nutriments, est requise pour les réactions de biosynthèses alors que PC II aurait une activité anaplérotique de relai pour que la cellule puisse toujours répondre à ses besoins en oxaloacétatePyruvate carboxylase is a key enzyme of the central metabolism in eucaryotes. It catalyzes the reaction of pyruvate carboxylation into oxaloacetate, an essential anaplerotic pathway of the citrate cycle. In the yeast Saccharomyces cerevisiae there are 2 pyruvate carboxylase cytosolic isoenzymes, PC I and PC II, encoded by 2 homologous genes, PYC1 and PYC2. We aim at finding conditions which could allow us to differentiate these 2 isoforms in order to determine their repective function. Analysis of kinetic properties shows that PC I is dependent on acetyl-CoA, whereas PC II is almost insensitive to this effector and the affinity of PC I for ATP is 10 times lower than that of PC II. PC I seems to be the major isoform on glucose/ammonium because the deletion of PYC1 slows down the growth of the yeast, whereas deletion of PYC2 has no phenotype and PC I activity in a delta pyc2 mutant is 2 times higher than PC II activity in a delta pyc1 mutant. In this study, we demonstrate that PYC1 and PYC2 are differentially regulated by the nature of the nitrogen source of the growth medium. Promoter regions of PYC1 seem to be concerned by the repression mecanism in the presence of aspartate and glutamate. The concentration ratios between intracellular alpha-cétoglutarate, glutamine and glutamate could be signals for control of PYC1 by the nature of nitrogen source. PC I, major isoenzyme regulated by the nature of nutrients, is required for biosynthesis pathways whereas PC II seems to have an auxiliary anaplerotic function to provide oxaloacetate to the cell, when needed
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Baudouin-Cornu, Peggy. „Composition élémentaire des protéines : métabolisme et analyses statistiques“. Paris 11, 2002. http://www.theses.fr/2002PA112142.
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Chez S. Cerevisiae, l'expression des gènes du métabolisme des acides aminés soufrés est soumise à une régulation négative spécifique: en milieu minimum contenant une forte concentration de méthionine, l'activateur transcriptionnel des gènes MET, Met4, est polyubiquitiné par le complexe ubiquitine-ligase SCF-Met30 et dégradé par le protéasome ; en milieu riche, l'oligo-ubiquitination de Met4 par le complexe SCF-Met30 empêche sa fixation sur les promoteurs des gènes MET. Dans ces deux conditions, les gènes MET ne sont pas transcrits. La première partie du mémoire présente une étude des mécanismes de régulation du complexe SCF-Met30. En particulier, nous montrons qu'en milieu riche comme en milieu minimum, l'exposition des cellules au cadmium déstabilise spécifiquement l'interaction entre Met30p et Skp1p, composants du complexe SCF-Met30, et inhibe l'ubiquitination de Met4p ; ceci a pour effet de rétablir la transcription des gènes MET. La deuxième partie du mémoire présente l'analyse statistique de la composition atomique de différentes populations de protéines. Elle montre l'existence de mécanismes spécifiques permettant aux organismes de faire face aux variations de disponibilité dans l'environnement des constituants élémentaires de leurs biopolymères. Ainsi, chez S. Cerevisiae et E. Coli, les protéines impliquées dans l'assimilation du soufre, carbone ou azote sont fabriquées avec moins de soufre, carbone ou azote respectivement. Par l'étude systématique des compositions atomiques des protéines de 46 organismes, nous avons ensuite observé que la composition en atomes de soufre et de carbone des protéines était spécifique des organismes. Ceci nous a amené à montrer l'existence d'une corrélation négative entre la température de croissance optimale des organismes thermophiles et la composition en atomes de soufre de leurs protéines et l'existence d'une corrélation forte entre le contenu en guanosine et cytosine des génomes et le contenu en carbone des protéinesLn S. Cerevisiae, genes involved in sulfur amino acids biosynthesis are subjected to a specific negative regulation. In minimal medium, the transcription of the MET genes is turned off in response to the presence of 1 mM methionine in the growth medium. This repression is due to the SCF-Met30-dependent polyubiquitylation of the transcriptional activator Met4 which is then degradated by the proteasome. In rich : medium, the ubiquitine ligase SCF-Met30 oligo-ubiquitylates Met4 thus preventing its tethering to the MET gene promoters. In the first part of the report, we describe our study on mechanisms involved in the regulation of the ubiquitine ligase complex SCF-Met30. In particular, we show that exposure to cadmium restores MET gene transcription in rich medium as in minimal media by inhibiting the SCF-Met30-dependant ubiquitylation of Met4. The modus operandi of cadmium is the dissociation the SCF-Met30 complex by the destabilisation of the interaction between Met30p and Skp1p. To grow, an organism has to find all the elementary constituents of its biopolymers in its environment. However, their abundance are likely to vary. In the second part of the report, we present a statistical study on the atomic composition of several sets of proteins and demonstrate the existence of specific mechanisms allowing organisms to cope with these fluctuations. Indeed, we show that in bath E. Coli and S. Cerevisiae, the sulfur, carbon and nitrogen assimilatory enzymes are depleted in sulfur, carbon and nitrogen respectively. By analysing systematically the atomic composition of the proteins of 46 organisms, we observe that the sulfur and carbon atomic compositions of proteins is specific to each organism. We then highlight a negative correlation between the optimal growth temperature of thermophilic organisms and the sulfur content of their proteins and we show that the carbon content of proteomes and the guanosine plus cytosine content of genomes are correlated