Dissertationen: „Taxonomical“

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Mata, Casanova Noel. „Taxonomical revision of subfamily Anacharitinae (Hymenoptera: Cynipoidea: Figitidae)“. Doctoral thesis, Universitat de Barcelona, 2018. http://hdl.handle.net/10803/586079.

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Superfamily Cynipoidea (Hymenoptera: Apocrita) includes two very different groups of organismes. Macrocynipoids is a paraphyletic group of parasitoids of wood-bearing beetle larvae, characterized by its big size, and with a very low biodiversity. Microcynipoids, on the other hand, are a monophyletic group of smaller wasps (up to 3mm) with two distinct ways of life: while Cynipidae are gall-makers, Figitidae are parasitoids of endopterygot insects. Family Figitidae (Hymenoptera: Cynipodea) includes twelve subfamilies of parasitic wasps. Anacharitinae is one of those, characterized by being parasitoids of the aphid-feeding larvae of Hemerobiidae (Neuroptera). This subfamily included eight genera – Acanthaegilips Ashmead, 1897; Aegilips Haliday, 1835; Anacharis Dalman, 1823; Calofigites Kieffer, 1909; Hexacharis Kieffer, 1907; Proanacharis, 1996; Solenofigites Díaz, 1979 and Xyalaspis Hartig, 1843 – with most of its biodiversity located in the Neotropical and Palaearctic regions. The knowledge of the subfamily was scarce and outdated, and except for Acanthaegilips, there were no recent revisions on the taxonomical status of Anacharitinae species. The diversity of the subfamily in some of the most biodivresity-rich bioregions had not been studied. Thus, a revision was needed. The present Thesis has prosecuted three main objectives: i) studying the Anacharitinae global biodiversity, ii) studying the biology and relationships of its members and their hosts, iii) make the results accessible to the scientific community. These objectives have been accomplished through exmining all the type material of the previously described species, along with large series of unidentified material, deposited in scientific institutions all around the world. The results have been synthetized in identification keys fully illustrated and published in scientific journals with impact factor. The study of Anacharitinae material has led to the following taxonomical changes have been made: - Two new genera have been described: Acanthaegilopsis Pujade-Villar, 2013 and Cornaegilips Mata-Casanova & Pujade-Villar, 2017, the first with teo known species and the former with just one species. - Genera Calofigites, Hexacharis, Proanacharis and Solenofigites do not present changes regarding their taxonomical status. Calofigites comprises two species, while the other three remain as monotypic genera. - Regarding genus Anacharis, 12 species are considered still valid, while 10 are not considered valid anymore: 6 are synonyms, 2 have been designated as incertae sedis, and 2 have been moved to other genera (Aegilips and Figites Latreille, 1802). 8 new species have been described. - Regarding genus Xyalaspis, 8 species are considered still valid, while 5 are not considered valid anymore: 4 are synonyms, and 1 has been moved to other genera (Aegilips). 14 new species have been described. The study of Anacharitinae material has led to the following changes in the known distribution areas of the subfamily: - For the Afrotropical region, 4 genera and 11 species are known to be found there., with one endemic genus: Acanthaegilopsis. - For Asia (includying both the Eastern Palaearctic and the Indomalayan regions), 4 genera and 13 species are known to be found there, 5 of them being found in the Indomalayan region, which holded no previous Anacharitinae records. - For the Australasian region, 3 genera and 4 species are known to be found there. - For the Nearctic region, 4 genera and 17 species are found there, with one endemic genus: Hexacharis. - For the Neotropical region, 7 genera and 39 species are known to be found there. 4 genera are endemic of the region: Acanthaegilips, Calofigites, Cornaegilips and Solenofigites.
La present tesi representa una revisió taxonòmica i faunística complerta a nivell mundial de la subfamília Anacharitinae (Hymenoptera: Cynipoidea: Figitidae), un grup d’insectes endoparasitoids cenobionts de la larves afidòfagues d’Hemerobiidae (Neuroptera). Abans de la realització de la tesi, aquesta subfamília incloïa vuit gèneres: Acanthaegilips Ashmead, 1897; Aegilips Haliday, 1835; AnacharisDalman, 1823; Calofigites Kieffer, 1909; Hexacharis Kieffer, 1907; Proanacharis, 1996; Solenofigites Díaz, 1979 i XyalaspisHartig, 1843. El coneixement del grup era força fragmentari i obsolet per a la majoria d’aquests gèneres. La tesi s’ha centrat en tres objectius principals: i) l’estudi de la biodiversitat global de la subfamília; ii) l’estudi de la biologia i relacions internes dels seus membres; iii) donar a conèixer aquests resultats a la comunitat científica. Aquests han estat aconseguint mitjançant l’estudi del material tipus pertanyent a la subfamília així com llargues sèries de material sense identificar depositat a institucions científiques. Els resultats obtinguts han estat els següents: - La descripció de 2 nous gèneres (Acanthaegilopsis Pujade-Villar, 2013 i Cornaegilips Mata- Casanova & Pujade-Villar, 2017). - La descripció de 35 noves espècies. - La revisió de l’estatus taxonòmic de 26 espècies prèviament descrites: 16 han estat - L’ampliació del registre i l’àrea de distribució de les espècies d’Anacharitinae a les regions Afrotropical, Australàsica, Neàrtica, Neotropical i Paleàrtica. - La citació per primer cop de la subfamília a la regió Indomalaya.

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Misaka, Tadashi. „Taxonomical revision and molecular phylogenetics of the genus Euzonus (Polychaeta:Opheliidae)“. Kyoto University, 2006. http://hdl.handle.net/2433/144105.

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Kyoto University (京都大学)
0048
新制・課程博士
博士(農学)
甲第12371号
農博第1552号
新制||農||925(附属図書館)
学位論文||H18||N4129(農学部図書室)
24207
UT51-2006-J363
京都大学大学院農学研究科応用生物科学専攻
(主査)助教授豊原治彦, 教授田中克, 教授中坊徹次
学位規則第4条第1項該当

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ZINNI, MATTEO. „Taxonomical characterization of Posidonia oceanica banquettes and driftwoods-related fauna“. Doctoral thesis, Università degli studi di Genova, 2019. http://hdl.handle.net/11567/944839.

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The proposed work provide a multilevel approach for two beach-related allocthonous inputs: P. oceanica banquettes and driftwoods. Since beaches are commonly perceived as true deserts, their biological values and their ecological importance are often underestimated leading even more inadequate management strategies. Banquettes - more related to seasonal cycles of P. oceanica - have been studied through coil sampling and Berlese-Tullgren extraction, focusing mainly on the infaunal arthropods. Fauna associated to driftwoods has been surveyed through pitfall trapping, aiming to study more surface related organisms. The taxonomical characterization has been followed by estimation of species richness according to the most recent frameworks, to provide an insight to these high-diverse biocenosis inferring meaningful differences within and between sampled sites. The observed diversity has been characterized through a qualitative as well as quantitative approach. Three widely used ecological index, as well as Collembola lifeforms have been applied to study the composition and the structure of beach related fauna. Moreover, as shoreline environments undergo increasing anthropocentric pressure resulting from demographic growth and recreational-only oriented management, the response of the studied fauna to several environmental factors has been analysed through linear models and community composition analysis. The number of observed species is not directly related to the individual abundance recorded for each site.The observed - and often underestimated - taxonomical richness is determined by socalled rare species, which carry most of the diversity information. Nevertheless the composition of the observed communities change in time and space under the combined effects of several enviromental variables.

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Lama, Dorjay. „Taxonomical, distributional and ecological studies of Acer L. (aceraceae) in the Darjeeling-Sikkim Himalayas“. Thesis, University of North Bengal, 2004. http://hdl.handle.net/123456789/917.

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Ordynets, Oleksandr [Verfasser]. „Diversity of aphyllophoroid fungi from taxonomical and biogeographical perspectives / Oleksandr Ordynets“. Kassel : Universitätsbibliothek Kassel, 2018. http://d-nb.info/1174701366/34.

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Persinger, Ben P. „Application of a taxonomical structure to measure worker productivity for performance evaluation“. Thesis, Monterey, Calif. : Springfield, Va. : Naval Postgraduate School ; Available from National Technical Information Service, 1994. http://handle.dtic.mil/100.2/ADA284178.

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Wang, Rundong. „A taxonomical study of agility strategies and supporting supply chain management practices“. Thesis, University of Exeter, 2011. http://hdl.handle.net/10036/3151.

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Since the turn of the century, manufacturing industry has witnessed significant structural changes. Agility, which aims to provide companies with competitive capabilities so that they can prosper from dynamic and continuous changes in the business environment, has become a prevailing manufacturing strategy. However, how to develop a manufacturing strategy based on agility, and how to design and manage global supply chain networks effectively to implement these strategy, are not fully understood. This thesis presents survey based research that was carried out on a number of U.K. manufacturing companies. The research revisited the taxonomy of agility strategies for manufacturing industry developed by Zhang and Sharifi (2007) and investigated the methods of supply chain management employed by different strategic groups. The findings show that whilst the three broad types of agility strategies discovered in previous work (Zhang and Sharifi, 2007) have remained two sub types of agility strategies have been identified. They are named Responsive players, Quick operators, Quick innovators, Proactive players 1 and Proactive players 2. Responsive players placed a high emphasis on supplier selection related practices; Quick operators placed a high emphasis on sourcing management related practices; Quick innovators placed a high emphasis on relationship management related practices; and Proactive players 1 and 2 placed high emphases on almost all practices. This research has made contributions to the theory development of agility strategy and has provides a managerial guide with companies to improve the implementation of agility strategies in supply chains.

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Allen, Scott Thomas. „A taxonomical structure for classifying the services procured by the Federal Government“. Thesis, Monterey, California: U.S. Naval Postgraduate School, 1991. http://hdl.handle.net/10945/34994.

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This thesis was an attempt to develop a taxonomical scheme that practitioners may employ in classifying services that are procured by the Federal Government along a continuum from procurements that are strategically complex. A secondary research objective was to determine what characteristics are appropriate for classifying services on a strategic basis. A literature review, expert interviews, and survey using 20 heterogeneous sample services were conducted to determine the relationship between characteristics and services. Cluster analysis was used to group services into categories with similar compositions of selected characteristics. A taxonomical structure was developed for classifying services into five categories. Potential benefits may arise via application to staffing and directing of procurement functions and refinement of procurement policy. Is is recommended that the taxonomical model resulting from this research be validated and refined through further use.

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Wenger, Brian L. „A taxonomical structure for classifying the goods purchased by the Federal Government“. Thesis, Monterey, California. Naval Postgraduate School, 1990. http://hdl.handle.net/10945/30627.

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Approved for public release, distribution unlimited
This thesis is an attempt to develop a taxonomical structure to use in the classification of the goods purchased by the Federal Government. The primary objective was to develop a usable scheme that practitioners could employ in classifying goods along a continuum from simple to complex. A secondary objective of this thesis was to determine the characteristics of the goods, other than their obvious physical differences, to utilize in classifying. Using 21 randomly selected heterogeneous goods and a scaling process, a survey was conducted to determine the relationship between these goods and the chosen characteristics. Cluster analysis was then utilized to group the goods into categories that exhibited similar characteristics. As a result of the research, a taxonomical structure for classifying the population of Government goods into five categories was developed. The potential benefits from using such a scheme could arise in the staffing and directing of procurement functions, training and education of the acquisition workforce, and refinement of procurement policy. It is recommended that the taxonomical model resulting from this research be validated and refined through further use.

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Prendergast, John Joseph Lamm David V. „Application of a taxonomical structure for classifying goods procured by the Federal Government /“. Monterey, Calif. : Springfield, Va. : Naval Postgraduate School; Available from the National Technical Information Service, 1991. http://edocs.nps.edu/npspubs/scholarly/theses/1991/Dec/91Dec_Prendergast.pdf.

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Prendergast, John Joseph. „Application of a taxonomical structure for classifying goods procured by the Federal Government“. Thesis, Monterey, California. Naval Postgraduate School, 1991. http://hdl.handle.net/10945/26387.

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Approved for public release; distribution is unlimited.
The concept of contracting as a science has been explored in depth in procurement research over the past several years. One of the most intriguing research efforts involved the development of a model for the classification of goods. This thesis describes the application and validation of the previously developed scheme for classifying goods procured by the Federal Government. Three distinct homogeneous groups of goods (food service equipment, ship and marine equipment, and items unique to the P-3 ORION aircraft) were identified and classified using data collected from the buyers of these goods. The primary objective of the research effort was to actually classify goods by using taxonomic methods, and in doing so, validate the scheme for the classification of Government goods. Secondary objectives were to identify any improvements to be made to the scheme, and to propose potential applications for the model. The researcher was able to successfully apply the model to a diverse set of goods using the taxonomic methods outlined in the scheme, and provided some suggestions for improvement

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Borges, Vinicius Ruela Pereira. „A computer-assisted approach to supporting taxonomical classification of freshwater green microalga images“. Universidade de São Paulo, 2016. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/55/55134/tde-07022017-163412/.

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The taxonomical identification of freshwater green microalgae is highly relevant problem in Phycology. In particular, the taxonomical identification of samples from the Selenastraceae family of algae is considered particularly problematic with many known inconsistencies. Biologists manually inspect and analyze microscope images of alga strains, and typically carry out several complex and time-consuming procedures that demand considerable expert knowledge. Such practical limitations motivated this investigation on the applicability of image processing, pattern recognition and visual data mining techniques to support the biologists in tasks of species identification. This thesis describes methodologies for the classification of green alga images, considering both traditional automated classification processes and also a user-assisted incremental classification process supported by Neighbor Joining tree visualizations. In this process, users can interact with the visualizations to introduce their knowledge into the classification process, e.g. by selecting suitable training sets and evaluate the results, thus steering the classification process. In order for visualization and classification to be feasible, accurate features must be obtained from the images capable of distinguishing between the different species of algae. As morphological shape properties are a fundamental property in identifying species, suitable segmentation and shape feature extraction strategies have been developed. This was particularly challenging, as different alga species share common morphological characteristics. Two segmentation methodologies are introduced, in which one relies on the level set method and the other is based on the region growing principle. Although the contour-based approach is capable of handling the uneven conditions of green alga images, its computation is time-consuming and not suitable for real time applications. A specialized formulation of the region-based methodology is proposed that considers the specific characteristics of the green alga images handled. This second formulation was shown to be more efficient than the level set approach and generates highly accurate segmentations. Once accurate alga segmentation is achieved, two descriptors are proposed that capture alga shape properties, and also an effective general shape descriptor that computes quantitative measures from two signatures associated to the shape properties. Experimental results are described that indicate that the proposed solutions can be useful to biologists conducting alga identification tasks once it reduces their effort and attains satisfactory discrimination among species.
A identificação taxonômica de algas verdes de água doce é um problema de extrema relevância na Ficologia. Identificar espécies de algas da família Selenastraceae é uma tarefa complexa devido às inconsistências existentes em sua taxonomia, reconhecida como problemática. Os biólogos analisam manualmente imagens de microscópio de cepas de algas e realizam diversos procedimentos demorados que necessitamde conhecimento sólido. Tais limitaçõesmotivaramo estudo da aplicabilidade de técnicas de processamento de imagens, reconhecimento de padrões e mineração visual de dados para apoiar os biólogos em tarefas de identificação de espécies de algas. Esta tese descreve metodologias computacionais para a classificação de imagens de algas verdes, nas abordagens tradicional e baseada em classificação visual incremental com participação do usuário. Nesta última, os usuários interagem com visualizações baseadas em árvores filogenéticas para utilizar seu conhecimento no processo de classificação, como por exemplo, na seleção de instâncias relevantes para o conjunto de treinamento de um classificador, como também na avaliação dos resultados. De forma a viabilizar o uso de classificadores e técnicas de visualização, vetores de características devem ser obtidos das imagens de algas verdes. Neste trabalho, utiliza-se extração de características de forma, uma vez que a taxonomia da família Selenastraceae considera primordialmente as características morfológicas na identificação das espécies. No entanto, a obtenção de características representativas requer que as algas sejam precisamente segmentadas das imagens. Esta é, de fato, uma tarefa altamente desafiadora considerando a baixa qualidade das imagens e a maneira pelas quais as algas se organizam nas imagens. Duas metodologias de segmentação foram introduzidas: uma baseada no método Level Set e outra baseada no algoritmo de crescimento de regiões. A primeira se mostrou robusta e consegue identificar com alta precisão as algas nas imagens, mas seu tempo de execução é alto. A outra apresenta maior precisão e é mais rápida, uma vez que as técnicas de pré-processamento são especializadas para as imagens de algas verdes. Uma vez segmentadas as algas, dois descritores para caracterizar as imagens foram propostos: um baseado em características geométricas básicas e outro que utiliza medidas quantitativas calculadas a partir das assinaturas de forma. Resultados experimentais indicaram que as soluções propostas têm um bom potencial para serem utilizadas em tarefas de identificação taxonômica de algas verdes, uma vez que reduz o esforço nos procedimentos manuais e obtém-se classificações satisfatórias.

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Whitner, Richard B. „A taxonomical review of software verification techniques: an illustration using discrete-event simulation“. Thesis, Virginia Tech, 1988. http://hdl.handle.net/10919/45931.

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The use of simulation and modeling as a technique for solving today's complex problems is ever-increasing. Correspondingly, the demands placed on the software which serves as a computer-executable representation of the simulation model are increasing. With the increased complexity of simulation models comes a greater need for model verification, particularly programmed model verification. Unfortunately, current model verification technology is lacking in techniques which satisfy the verification needs. Specifically, there are few guidelines for performing programmed model verification. There is, however, an abundance of software verification techniques which are applicable for simulation model verification. An extensive review of techniques applicable for simulation programmed model verification is presented using the simulation and modeling terminology. A taxonomy for programmed model verification methods is developed. The usefulness of the taxonomy is twofold: (1) the taxonomy provides an approach for applying software verification techniques to the problem of programmed model verification, and (2) the breadth of the taxonomy provides a broad spectrum of perspectives from which to assess the credibility of simulation results. A simulation case study demonstrates the usefulness of the taxonomy and some of the verification techniques.

By referencing this work, one can determine what, and when, techniques can be used throughout the development life cycle. He will know how to perform each technique, how difficult each will be to apply, and how effective the technique will be. The simulation modeler - as well as the software engineer â will find the taxonomy and techniques valuable tools for guiding verification efforts.

Master of Science

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Samanta, Achintya. „Taxonomical and phytosociological studies on the angiospermic climbers of Darjeeling and Sikkim Himalayas“. Thesis, University of North Bengal, 1998. http://hdl.handle.net/123456789/877.

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Ranasinghe, Purnika Damindi. „Use of next generation sequencing for analysing taxonomical and functional composition of bacteria in an insect gut microbiome“. Thesis, Queensland University of Technology, 2018. https://eprints.qut.edu.au/116377/1/Purnika%20Damindi_Ranasinghe_Thesis.pdf.

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This thesis describes the difference between the baseline composition of Diamondback moth (Plutella xylostella L.) insect colonies' gut microbiomes collected from field- and laboratory-reared populations. Results indicates that variation of gut bacterial community composition between individual insect influences baseline microbiome composition estimates at the population scale. The gut bacteria diversity and functional composition change in response to external challenges, and those changes reflect on insect development. This explains the need to discover the specific symbiotic gut bacteria that respond to environmental variables - such findings will be essential for controlling insect hosts, and this knowledge can be applied to develop insect pest management and control.

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Cavallari, Daniel Caracanhas. „Taxonomical study on the Vetigastropoda (Mollusca) from Canopus Bank, NE Brazil, with further remarks on their distribution along the Western Atlantic“. Universidade de São Paulo, 2017. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/38/38131/tde-20062017-112432/.

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A taxonomic revision of 29 species distributed in 12 vetigastropod families collected in a 60-260 m depth range at Canopus Bank, a seamount off NE Brazil, is performed based on detailed shell morphology. Their distribution and bathymetric ranges are re-examined based on specimens from Canopus and the MZSP collection. Three possibly new species are revealed and tentatively described: Arene aff. brareus can be distinguished by a large shell for the genus; sculpture consisting of spiral cords ornamented by large, semi-hollow, scale-like spines; cords separated by equally wide, deep interspaces and thin axial growth lines more visible in the interspaces; protoconch sculptured by small, subsutural axial lamellae; and color ranging from white to intense reddish, darker on spiral cords, and lighter at the base, with a yellow apex. Parviturbo aff. tuberculosus can be told apart from local congeners by its slightly taller than wide shell, which is profusely sculptured by a reticulate pattern of equally strong axial ribs and spiral cords, with angular nodules at the intersections. Calliostoma sp.1 shows no close affinities with any other local congener and is characterized by a small shells with convex whorls and a large, rounded apex; ivory white ground color with honey yellow apex and spiral cords; sculpture consisting of 4-6 narrow, nodulous spiral cords per whorl; suture marked by a suprasutural cord; inflated and mostly smooth base; narrow, shallow, and axially sculptured umbilicus. Moreover, three species have their distributions expanded northward from SE to NE Brazilian waters: Emarginula suspira Simone & Cunha, 2014, Hemimarginula hemitoma Simone & Cunha, 2014, and Homalopoma boffi Marini, 1975. Three species have their northern range limit expanded from Bahia state to Ceará state: Arene flexispina Leal & Coelho, 1985 and Turbo heisei Prado, 1999; a single NE Brazilian species is newly reported from northern waters: Haplocochlias risoneideneryae Barros, Santos, Santos, Cabral & Acioli, 2002; and another species, previously known only from Pernambuco state, is newly reported from Ceará state, also in NE Brazil: Solariella quinni Barros & Pereira, 2008. Two Caribbean species are firstly reported in the SW Atlantic: Dentistyla dentifera (Dall, 1889) and Gaza cf. fischeri (Dall, 1889); and a species previously reported from the Venezuelan shelf is firstly recorded in Brazilian waters: Parviturbo annejoffeae Rubio, Rolán & Lee, 2015. The bathymetric ranges of 11 species are expanded. High-resolution photographs of the type specimens, SEM images, and comparisons with local congeners are also provided
Uma revisão taxonômica de 29 espécies distribuídas em 12 famílias de vetigastrópodes coletadas a 60-260 m de profundidade no Banco de Canopus, uma montanha submarina do Nordeste do Brasil, é fornecida com base na morfologia detalhada da concha. Sua distribuição e intervalos batimétricos são reexaminados com base em espécimes de Canopus e da coleção do MZSP. Três espécies possivelmente novas são reveladas e tentativamente descritas: Arene aff. briareus pode ser distinguido por uma concha grande para o gênero; escultura constituída por cordas espirais ornamentadas por espinhos grandes, semi-ocos e escalares; cordas separadas por intervalos igualmente amplos e profundos e linhas de crescimento axiais finas mais visíveis nos inter-espaços; protoconcha esculturada por pequenas lamelas axiais subsuturais; e cor variando de branco a avermelhado intenso, mais escura nas costelas espirais, e mais clara na base, com um ápice amarelo. Parviturbo aff. tuberculosus pode ser distinguida dos congéneres locais pela sua concha mais alta do que larga, profusamente esculturada por um padrão reticulado de costelas axiais igualmente fortes e cordas espirais, com nódulos angulares nas intersecções. Calliostoma sp.1 não apresenta estreitas afinidades com qualquer outro congênere local e é caracterizado por uma concha pequena com voltas convexas e um grande ápice arredondado; cor branco-marfim com ápice e cordas espirais amarelo mel; escultura de 4-6 cordas espirais estreitas e nodulosas por volta; sutura marcada por um cordão suprasutural; base inflada e lisa; umbílico estreito, raso e axialmente esculturado. Três espécies têm suas distribuições expandidas para o norte, de águas do SE para o NE do Brasil: Emarginula suspira Simone & Cunha, 2014, Hemimarginula hemitoma Simone & Cunha, 2014, e Homalopoma boffi Marini, 1975. Três espécies têm seu limite de extensão norte expandido da Bahia para o Ceará: Arene flexispina Leal & Coelho, 1985 e Turbo heisei Prado, 1999; Uma única espécie brasileira do NE é relatada para águas do Norte: Haplocochlias risoneideneryae Barros, Santos, Santos, Cabral & Acioli, 2002; E uma outra espécie, anteriormente conhecida apenas do estado de Pernambuco, é reportada para o estado do Ceará: Solariella quinni Barros & Pereira, 2008. Duas espécies caribenhas são registradas pela primeira vez no Atlântico sudoeste: Dentistyla dentifera (Dall, 1889) e Gaza cf. fischeri (Dall, 1889); e uma espécie reportada previamente para a plataforma venezuelana é registrada pela primeira vez no Brasil: Parviturbo annejoffeae Rubio, Rolán & Lee, 2015. As distribuições batimétricas de 11 espécies são expandidas. Fotografias dos espécimes tipo, imagens MEV e comparações com congêneres locais são fornecidas

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Feulner, Martin [Verfasser], und Sigrid [Akademischer Betreuer] Liede-Schumann. „Taxonomical use of floral scent data in apomictic taxa of Hieracium and Sorbus derived from hybridization / Martin Feulner. Betreuer: Sigrid Liede-Schumann“. Bayreuth : Universität Bayreuth, 2013. http://d-nb.info/1059352567/34.

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Coco, Joseph. „PARSES: A Pipeline for Analysis of RNA-Sequencing Exogenous Sequences“. ScholarWorks@UNO, 2011. http://scholarworks.uno.edu/td/1297.

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RNA-Sequencing (RNA-Seq) has become one of the most widely used techniques to interrogate the transcriptome of an organism since the advent of next generation sequencing technologies [1]. A plethora of tools have been developed to analyze and visualize the transcriptome data from RNA-Seq experiments, solving the problem of mapping reads back to the host organism's genome [2] [3]. This allows for analysis of most reads produced by the experiments, but these tools typically discard reads that do not match well with the reference genome. This additional information could reveal important insight into the experiment and possible contributing factors to the condition under consideration. We introduce PARSES, a pipeline constructed from existing sequence analysis tools, which allows the user to interrogate RNA-Sequencing experiments for possible biological contamination or the presence of exogenous sequences that may shed light on other factors influencing an organism's condition.

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Tamashiro, Jorge Yoshio 1949. „Estudos taxonomicos e morfologicos do genero Piptadenia sensu Dentham no sudoeste do Brasil : avaliação das modificações taxonomicas recentemente propostas“. [s.n.], 1989. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315106.

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Orientador : Hermogenes de Freitas Leitão Filho
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-17T13:39:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tamashiro_JorgeYoshio_M.pdf: 8636620 bytes, checksum: 21c10d72ed032e6ba8772407338fadda (MD5) Previous issue date: 1989
Resumo: O gênero Piptadeinia Benth. S. l. possui distribuição pantropical. BRENAN (1995) propôs a divisão deste gênero em outros 8 no Brasil ocorrem 6: Goldmania, Newtonia, Anadenanthera, Piptadenia, Parapiptadenia e Pseudopiptadenia e destes paneas o primeiro não foi constatado no presente trabalho. Foram estudadas 18 espécies na região Sul-Sudeste. O estudo da arquitetura foliar mostrou-se eficiente para as espécies observadas. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: The genus Piptadenia Benth. S. l. has paantropical distribution. Brenan (1955) proposed division of this genera into others 8 and in Brazil occur 6: Goldmania, Newtonia, Anadenanthera, Piptadenia, Parapiptadenia and Pseudopiptadenia and of this only the first ween1t report in this work 18 species were studied from South-Southeast. The study of foliar architecture showed efficient for the species observed. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Mestrado
Mestre em Ciências Biológicas

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OLIVEIRA, Ewerton Pereira de. „Associação entre variáveis taxonômicas e ambientais com a forma de otólitos“. Universidade Federal Rural de Pernambuco, 2015. http://www.tede2.ufrpe.br:8080/tede2/handle/tede2/4859.

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Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-06-28T12:14:06Z No. of bitstreams: 1 Ewerton Pereira de Oliveira.pdf: 3097383 bytes, checksum: 9fa977ae687b83d00d6da838bc685cb5 (MD5)
Made available in DSpace on 2016-06-28T12:14:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ewerton Pereira de Oliveira.pdf: 3097383 bytes, checksum: 9fa977ae687b83d00d6da838bc685cb5 (MD5) Previous issue date: 2015-07-30
Sagital otoliths were analyzed trying to identify possible relationships among shape groups and environmental, biological and taxonomical variables of fishes. Five hundred otoliths images of different species were obtained. Cluster analysis by Ward's criterion was used in order to form similar otolith groups based on their shapes. This method was applied at two different times: 1) using a matrix of normalized Fourier coefficients, obtained by Fourier Elliptical analysis and Euclidean distance as similarity measure; and 2) using a similarity matrix produced by "TO distance ". Thirteen otolith morphotypes, validated by the silhouette graph, were obtained from both procedures. However, "TO distance" was more efficient, getting more heterogeneous shapes among groups and homogeneous shapes within them. Based on the groups obtained from “TO Distance”, simple correlation analysis was carried out to investigate the relationship among otolith shapes and fish variables. Results showed that the variables related to sulcus acusticus, such as position, depth and shape, were the most significant, getting a percentage of explanation of 100% of the total variability among shape groups. It follows that the results presented here can help to explain how otolith shape varies in function of fish species characteristics.
Otólitos sagita foram analisados buscando identificar possíveis relações entre os grupos de forma do mesmo com as características ambientais, biológicas e taxonômicas de peixes. Quinhentas imagens de otólitos sagita de espécies diferentes foram obtidas sendo estas imagens associadas a um arquivo com informações biológicas, ambientais e taxonômicas dos otólitos. A análise de agrupamento, através do critério de Ward, foi utilizada com o objetivo de formar grupos de otólitos semelhantes quanto a sua forma. Este método foi aplicado em dois momentos distintos, o primeiro utilizando a matriz dos coeficientes de Fourier normalizados, obtidos pela análise de Fourier Elíptica, tendo a distância Euclidiana como indicador de similaridade entre os otólitos e o segundo momento utilizando uma matriz de similaridade produzida pelo “TO distance”, onde foram estabelecidos 13 morfotipos de otólitos quanto a sua forma, estes validados por meio do gráfico da silhueta. Foi possível identificar que o “TO distance” mostrou ser uma medida de similaridade eficiente na separação das imagens, obtendo morfotipos mais heterogêneos entre os grupos e mais homogêneos dentro deles. A análise de correspondência simples mostrou que as variáveis relacionadas aos sulcos acústicos, como posição, profundidade e forma da cauda foram as que mais se destacaram, obtendo um percentual de explicação de 100% da variabilidade total dos dados para as duas dimensões juntas. Os resultados obtidos pelos métodos multivariados facilitaram a interpretação das inter-relações entre os treze grupos e as categorias das variáveis, mostrando como a forma dos otólitos e suas características podem influenciar na vida das espécies.

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Pires, Thiago Augusto 1984. „Phylogenetic, taxonomical and functional diversity and the structure of anurans communities in coastal plains of São Paulo state, southeastern Brazil = Diversidade filogenética, taxonômica e funcional e a estrutura de comunidades de anuros nas planícies costeiras do estado de São Paulo, sudeste do Brasil“. [s.n.], 2014. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/316217.

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Orientador: Ricardo Jannini Sawaya
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-25T23:18:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Pires_ThiagoAugusto_M.pdf: 2411650 bytes, checksum: 8eb94586d77742cae5062b5aec5233a8 (MD5) Previous issue date: 2014
Resumo: Em termos gerais, comunidades biológicas podem ser estruturadas por elementos que ocorrem em escalas espaciais diversas, que incluem fatores bióticos (e.g., competição e predação); fatores abióticos (e.g., heterogeneidade ambiental), históricos (e.g., eventos de extinção e colonização; e dinâmicas neutras (e.g., dispersões e extinções locais e aleatórias). Uma das formas mais interessantes de se estudar a estrutura de comunidades é a partir da investigação de como diferentes processos e mecanismos influenciam diferentes escalas ou componentes da biodiversidade. Por exemplo, o componente da diversidadebeta, uma medida de dissimilaridade entre comunidades, primariamente avaliada através da presença e ausência das espécies em cada comunidade. Outra forma utilizada por ecólogos para compreender a estrutura de comunidades é avaliar a estrutura filogenética das comunidades. Através da avaliação dessas propriedades e quais possíveis fatores a influenciam, se torna possível compreender as regras de montagem e manutenção de comunidades. Nesse contexto, nossos objetivos gerais nessa dissertação foram: estimar a diversidade beta de anuros das planícies costeiras paulistas em seus diferentes componentes: funcional, taxonômico e filogenético; examinar quais preditores espaciais e ambientais melhor explicam a variação nos três componentes da diversidade avaliadas; avaliar a estrutura filogenética e funcional das comunidades de anuros; testar a conservação filogenética de atributos nos girinos para melhor compreensão da estrutura filogenética e funcional; e analisar quais preditores ambientais explicam melhor a variação na estrutura filogenética e funcional dos anuros. Encontramos que os preditores que mais explicam a variação nas diferentes faces da diversidade beta estudadas aqui (i.e. taxonômica, funcional e filogenética) são as variáveis espaciais. Esse resultado demostra a existência de uma clara x estrutura espacial nas diferentes faces diversidade beta de anuros nas planícies costeiras da mata atlântica no estado de São Paulo. Embora bem menos importante, as variáveis ambientais selecionadas (e.g. condutividade da água, pH e estrutura vegetal) também explicam uma fração importante da variação dos diferentes componentes da diversidade beta de anuros. As variações da diversidade beta taxonômica, funcional e filogenética dos girinos apresentam uma estrutura semelhante espacial assim como ambiental. Esse resultado pode estar revelando que processos, espaciais ou ecológicos, semelhantes, podem estar estruturando a diversidade beta de anuros nas planícies costeiras. Outro resultado interessante é que encontramos foi que das 33 comunidades avaliadas, 17 apresentam uma clara estrutura filogenética (agrupamento filogenético) e 12 apresentaram uma estrutura funcional agregada. A diversidade de atributos dos girinos é significantemente concentrada em poucos nós e próximos da raiz da filogenia, demostrando que girinos apresentam conservação filogenética de atributos na região estudada. Uma significante parte da variação na estrutura filogenética das comunidades é explicada por seis variáveis ambientais selecionadas, tais como a presença de potenciais predadores, diversidade de vegetação externa, cobertura de dossel, variáveis importantes, dentre as cinco selecionadas, para a estrutura funcional. Todas essas variáveis são importantes para o desenvolvimento, sobrevivência e consequentemente a ocorrência de anuros. Assim, estes resultados demonstram o importante papel dos processos ecológicos (filtros ambientais) e evolutivos (conservação filogenética de atributos) na estrutura funcional, refletida até mesmo na estrutura filogenética de anuros em planícies costeiras
Abstract: Generally, biological communities can be structured by elements that occurring in different spatial scales, which include biotic factors (e.g., competition and predation); abiotic factors (e.g., environmental heterogeneity); historical (e.g., colonization and extinction events); and neutral dynamics (e.g., local and random dispersal and extinctions). One of the most interesting approaches to study the structure of communities is based on the investigation of how different processes and mechanisms influence different scales or components of biodiversity. Such as the beta diversity component, a measure of dissimilarity between communities primarily assessed through the presence and absence of species in each community. Another method used by ecologists to understand the structure of communities is the evaluation of the phylogenetic and functional structure of the community. Through the assessment of these properties and the possible factors that may influencing it, is possible to comprehend the rules for assembly and maintenance of communities. In this context, our general objectives in this dissertation were: estimate the tadpoles¿ beta diversity from coastal plains of São Paulo states, in its different components: functional, taxonomic and phylogenetic; examine spatial and environmental predictors that best explain the variation in the three evaluated components of the beta diversity; assess the phylogenetic and functional structure of tadpoles¿ communities; test the traits phylogenetic conservation of tadpoles to better understand the phylogenetic and functional structure; and investigate the environmental predictors that better explain the variance in phylogenetic and functional structure of tadpoles¿ communities. We found that the spatial predictors explain more variation in the different faces of beta diversity studied here. This result demonstrates the existence of a clear spatial structure in different components of tadpoles¿ beta diversity in the coastal plains of the Atlantic Forest in the state of São Paulo. Although much less important, the selected environmental variables (e.g., water conductivity, pH and vegetation structure) also explain an important fraction of the variation in the different components of beta diversity. The variance of taxonomic, functional and phylogenetic tadpoles¿ beta diversity showed a similar spatial structure as well as environmental structure. This result could be revealing that processes similar (spatial or ecological) may be structuring beta diversity of anuran in the coastal plains. Another interesting result is that out of 33 communities assessed, 18 showed phylogenetic structure (phylogenetic clustering) and 12 displayed an aggregated functional structure. Furthermore, the diversity of tadpoles¿ traits is significantly concentrated in a few nodes and close to the root of the phylogeny, showing that tadpoles present traits phylogenetic conservation in the study area. A significant part of the variation in the phylogenetic structure of communities is explained by six environmental variables selected, such as presence of potential predators, external vegetation structure diversity and canopy cover, variables also significant to the functional structure, among the five selected. All variables are significant for development and survival of tadpoles. Thus, these results demonstrate the important role of ecological (environmental filters) and evolutionary processes (phylogenetic conservatism of traits) in functional structure, reflected even in phylogenetic structure of anurans in coastal plains
Mestrado
Ecologia
Mestre em Ecologia

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Coutinho, Ana Paula Savassi. „Revisão taxonômica e estudos filogenéticos de Mimosa L. sect. Calothamnos Barneby (Leguminosae-Mimosoideae)“. Universidade de São Paulo, 2009. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/41/41132/tde-06042010-150705/.

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REVISÃO TAXONÔMICA E ESTUDOS FILOGENÉTICOS DE Mimosa L. sect. Calothamnos Barneby (Leguminosae-Mimosoideae). Mimosa é o segundo maior gênero de Mimosoideae, depois de Acacia s.l., com cerca de 530 espécies distribuídas principalmente nos Neotrópicos e ocupando diferentes tipos de ambientes, desde florestas até desertos. Tradicionalmente o gênero foi dividido em cinco seções: Mimosa sect. Mimadenia, Mimosa sect. Batocaulon, Mimosa sect. Habbasia, Mimosa sect. Mimosa e Mimosa sect. Calothamnos, baseado principalmente na presença ou ausência de nectários extraflorais, nos tipos de tricomas e em características florais. Mimosa sect. Calothamnos é caracterizada pela ausência de nectários extraflorais, pela presença de diferentes tipos de tricomas ramificados recobrindo as estruturas vegetativas e reprodutivas (exceto cálice e androceu) e pelas flores tetrâmeras, isotêmones e com filetes geralmente amarelos (alvos ou róseos em algumas espécies). Este grupo, rico em endemismos, encontra-se distribuído principalmente nas regiões sudeste (sobretudo na Cadeia do Espinhaço em Minas Gerais) e sul do Brasil, com algumas espécies se estendendo até países limítrofes (Argentina, Bolívia, Paraguai e Uruguai), geralmente associadas à ambientes mais abertos como os Campos Rupestres ou as Estepes, mas com algumas espécies ocorrendo em Floresta Ombrófila Mista. O objetivo do presente trabalho foi realizar a revisão taxonômica e o estudo filogenético de Mimosa sect. Calothamnos a fim de responder as seguintes questões: 1) O número de espécies reconhecido para Mimosa sect. Calothamnos é subestimado? 2) Mimosa sect. Calothamnos, na forma como tradicionalmente circunscrita, é monofilética; 3) Os tricomas ramificados e os filetes amarelos seriam sinapomorfias da seção? A revisão taxonômica foi realizada a partir de levantamento bibliográfico, da análise de cerca de 2000 espécimes depositados nos principais herbários brasileiros e do exterior e em expedições de coleta. A reconstrução filogenética foi feita a partir de análises de parcimônia e bayesiana, baseadas em marcadores moleculares do cloroplasto (trnH-psbA e rps16), do núcleo (ITS) e em dados morfológicos. Algumas modificações foram propostas em relação à classificação tradicional como rearranjos infra-específicos, sinonimizações, adequações nomenclaturais e, além disso, sete lectótipos foram designados e três espécies novas foram descritas, resultando no aumento no número de espécies de 26 (34táxons) para 32 (35 táxons). Nas análises filogenéticas com os dados combinados, Mimosa sect. Calothamnos é fortemente sustentada como monofilética e apresentando como sinapomorfias morfológicas os tricomas estrelado-sésseis recobrindo a face abaxial dos folíolos, a corola e os frutos.
TAXONOMIC REVISION AND PHYLOGENETIC STUDIES OF Mimosa L. sect. Calothamnos Barneby (Leguminosae-Mimosoideae). Mimosa is the second largest genus of Mimosoideae, after Acacia s.l., with about 530 species, mainly distributed in the Neotropics in diferent types of vegetations, from forests to deserts. Traditionally, the genus was divided into five sections: Mimosa sect. Mimadenia, Mimosa sect. Batocaulon, Mimosa sect. Habbasia, Mimosa sect. Mimosa e Mimosa sect. Calothamnos, mainly based on the presence or absence of petiolar nectaries, on the kind of trichomes and on floral characteristics. Mimosa sect. Calothamnos is caracterized by the absence of petiolar nectaries, the presence of different types of branched trichomes covering vegetative and reproductive structures (except calyx and androecium) and by the tetramerous and isostemonous flowers with often yellow filaments (white or pink in some species). This group, with a high degree of endemism, is distributed mainly in the Southeastern (generally in Espinhaço Range, Minas Gerais) and South Brazilian regions, with some species extending into bordering countries, usually associated with open areas such as Campos Rupestres or Estepes, but with some species in Floresta Ombrófila Mista. The aims of the present study were to carry out a taxonomic revision and a phylogenetic approach of Mimosa sect. Calothamnos, in order to asnwer the following questions: 1) Is the number of taxa recognized in the section an overestimate?; 2) Is Mimosa sect. Calothamnos, as traditionally circunscribed, a monophyletic group? and 3) Are yellow stamen filaments and branched trichomes synapomorphic characthers of the section? The taxonomic revision was based on bibliographical survey, examination of about 2000 specimens from the Brazilian and foreign herbaria and on field expeditions. The phylogenetic reconstruction was carried out by parsinomy and bayesian analyses, based on molecular markers from cloroplast (trnH-psbA and rps16), nuclear (ITS) and morphological characters. Some modifications related to the traditional classification were proposed, such as infraspecific rearrangements, synonimizations and nomenclatural adequation. Besides this, seven lectotypes were designated and three new species were described, resulting in a larger number of the species, from 26 (34 taxons) to 32 (35 taxons). In the phylogenetics analyses based on combined data, Mimosa sect. Calothamnos is highly supported as monophyletic, with some morphological synapomorphies such as the presence of sessile stellate trichomes in the lower surface of the leaflets, corolla and fruits.

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Medeiros, José Wanderley. „Taxonomia navegacional facetada“. reponame:Repositório Institucional da UFSC, 2013. https://repositorio.ufsc.br/xmlui/handle/123456789/122840.

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Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Educação, Programa de Pós-Graduação em Ciência da Informação, Florianópolis, 2013.
Made available in DSpace on 2014-08-06T17:27:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 321643.pdf: 1899377 bytes, checksum: 86e9be1c478adb78ae3fbfd3d7ef6518 (MD5) Previous issue date: 2013
A presente pesquisa objetiva verificar se os princípios teóricos da classificação facetada encontram-se presentes nas taxonomias navegacionais facetadas de sítios de lojas virtuais e se esses princípios podem contribuir para a elaboração dessas taxonomias. Trata-se de uma pesquisa exploratória que parte de levantamento bibliográfico sobre os seguintes temas relevantes para embasamento teórico da pesquisa: sistemas de organização do conhecimento, classificações, classificações facetadas, taxonomias e taxonomias navegacionais facetadas. Define critérios para análise de taxonomias facetadas, compostos por três itens: princípios da classificação facetada, pontuação e índice de aderência. Os principios adotados para análise tem por base o modelo de Spiteri (1998), fazem parte do plano das ideias definidos por Ranganathan e orientam a ordem de citação das facetas e focos. Tais princípios foram analisados em taxonomias de cinco lojas virtuais melhores classificadas no segmento de Informática pelo site E-bit. Após a análise dos princípios nas taxonomias selecionadas foi atribuída pontuação a cada taxonomia. O total de pontos é levado em conta para a aferição do índice de aderência que tem escala de baixo a alto, segundo o total de princípios presente nas taxonomias selecionadas. Levando em conta o índice de aderência, duas taxonomias obtiveram alto índice de aderência, duas alcançaram índice médio de aderência e apenas uma ficou com índice de aderência baixo. Após análise dos resultados observou-se que as taxonomias apresentam maior aderência aos princípios no tocante à disponibilização dos produtos do que em relação aos princípios de escolha e ordem de citação das facetas. Ao concluir nossa pesquisa, identificamos que a maioria dos princípios está presente nas taxonomias analisadas, sobretudo aqueles relacionados à escolha e ordem das facetas. Verificamos, ainda, a importância dos princípios da classificação facetada para a devida organização da taxonomia, pois, a ausência desses princípios acarreta desordem na disposição dos produtos na loja virtual, que acabam expostos de maneira confusa, o que pode tomar mais tempo do usuário para localizar aquilo que deseja. Finalizamos a pesquisa apresentando um conjunto de recomendações para elaboração de taxonomias navegacionais facetadas com base nos princípios da classificação facetada.

Abstract : This research aims to verify whether the theoretical principles of faceted classificationare present in faceted taxonomies navigational of sites stores and if these principlescan contribute to the development of these taxonomies. This is an exploratoryresearch literature that addresses the following topics relevant to theoreticalresearch: knowledge organization systems, ratings, ratings faceted taxonomies andfaceted navigational taxonomies. Define criteria for analyzing faceted taxonomies,composed of three items: the principles of faceted classification, score and gripindex. The principles adopted for analysis is based on the model Spiteri (1998), partof the plan of ideas defined by Ranganathan and guide the citation order of facetsand foci. These principles were analyzed considering taxonomies of five stores bestclassified in the field of Informatics at site E-bit. After analyzing the principles inselected taxonomies score was assigned to each taxonomy. The total score is takeninto account in measuring the rate of adherence that has scale from low to high,according to the total principles present in selected taxonomies. Taking into accountthe rate of adherence, two taxonomies obtained high levels of grip, two achievedaverage rate of adherence and just one got grip index down. After analyzing theresults it was observed that taxonomies have greater adherence to the principlesregarding the availability of products than on the principles of choice and citationorder of facets. Upon completion of our study, we found that most of the principlesdiscussed is present in the taxonomies, especially those related to the choice andorder of facets. We also observed the importance of the principles of facetedclassification for the proper organization of the taxonomy, therefore, the absence ofthese principles leads to disorder in the arrangement of products in store, thatexposed just so confused, which can take more time to the user find what he wants.We completed the survey presenting a set of recommendations for developingnavigational faceted taxonomies based on the principles of faceted classification.

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Semir, João 1937. „Revisão taxonomica de Lychnophora Mart. (Vernoniaeae: compositae)“. [s.n.], 1991. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315120.

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Orientador : Hermogenes de Freitas Leitão Filho
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
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Resumo: o gênero Lychnophora, como circunscrito no presente trabalho, consta de 68 espécies, em oposição aos 11 táxons registrados na última revisão. Destas, 27 espécies são novas para a ciência. Das demais, algumas espécies representam novas combinações, bem como táxons excluídos ou sinonimizados na última revisão. Não foi reconhecida nenhuma categoria infraespecífica, e as anteriormente descritas foram sinonimizadas. As espécies L. damazoi, L. itatiaiae, L. unicaulis e L. vanisschoti foram excluídas do gênero. Foi aceita a inclusão dos gêneros Lychnocephalus e Lychnophoriopsis em Lychnophora, como em trabalhos anteriores. Os gêneros Chronopappus, Haplostephium, Paralychnophora e Episcothamnus foram considerados como sinônimos, com suas espécies combinadas em Lychnophora. Parte das espécies de Piptolepis e duas espécies de Eremanthus (R. leucodendron e R.veadeiroensis) foram também combinadas no presente gênero. O gênero foi subdividido em seis seções: Lychnophora, Lychnophoriopsis, Lychnophorioides, Lychnocephaliopsis, Sphaeranthus e Chronopappus. Com base nas observações de campo e estudo de amplo material examinado de Herbários, foram propostas novas terminologias referentes aos hábitos, folhas e inflorescências. Além disto, novos caracteres morfológicos foram observados, sendo aqui referidos pela primeira vez. Desta forma, os caracteres distintivos de Lychnophora foram ampliados, bem como a sua variabilidade, para uma melhor circunscrição do gênero e seu real limite em relação aos demais gêneros da tribo Vernonieae. Lychnophora é considerado um gênero endêmico do Brasil, tendo as suas espécies uma distribuição restrita aos complexos rupestres de quartzito da Bahia, Goiás e Minas Gerais. As espécies apresentaram cinco padrões de distribuição, podendo ser encontradas: nas formações rupestres dos três Estados (L. salicifolia); em Minas Gerais e Goiás (L. ericoides); em Minas Gerais e Bahia (L. granmogolense, L. passerina e L. rosmarinifolia). As demais espécies ocorrem nos complexos rupestres de um determinado Estado ou são microendêmicas de uma localidade. Excluindo aquelas de distribuição restrita as espécies de Lychnophora geralmente apresentam populações disjuntas em várias localidades. As espécies de distribuição ampla revelaram-se mais polimórficas e as de distribuição restrita mais uniformes na sua macromorfologia. Foram relacionados os ambientes onde ocorre Lychnophora e são descritas as suas adaptações à seca, ao fogo e às geadas, que podem ocorrer nestes habitats. Considerações sobre as populações de Lychnophora bem como dados sobre a dispersão de aquênios são discutidos
Abstract: The genus Lychnophora, as here circumscribed, comprises 68 species, in contrast to the 11 taxa recognized in the last revision. There are 27 species new to science and some others represent new combinations and excluded or synonymized taxa from the previous revision. Infraspecific taxa were not recognized and those previously described were synonymized here. L. damazoi, L. itatiaiae, L. unicaulis and L. vanisschoti were excluded from the genus. The inclusion of the genera Lychnocephalus and Lychnophoriopsis in Lychnophora was accepted in agreement with previous studies. Beside these, Chronopappua, Haplostephium, Paralychnophora and Episcothamnus were also placed under Lychnophora. Some species of Piptolepsia and two species of Eremanthus (E.leucodendron e E.veadeiroenais) were also transfered to Lychnophora. Six sections are recognized: Lychnophora, Lychnophoriopsis, Lychnophorioides, Lychnocephaliopsis, Sphaeranthus and Chronopappus. On the basis of field observations and extensive studies of herbarium material, a new terminology is proposed for habit, leaf and inflorescence morphology. Moreover, new macromorphological characters were studied and are described here for the first time. Based on this new evidence, the generic circumscription of Lychnophora was widened and its boundaries redefined in relation to other genera of the tribe Vernonieae, making the genus a more natural assemblage. Lychnophora is a brazilian endemic genus and its species have a restricted distribution in the inland quartzite "rupestre" complex from Bahia, Goiás and Minas Geraie states. Five distribution patterns were recognized: species distributed in alI three states (L. salicifolia); species from Minas Gerais and Goiás (L. ericoides); species from Minas Gerais and Bahia (L. granmogolenae, L. passerina e L. rosmarinifolia); species that are restricted to one of the states and species microendemic to a given locality. The more widely distributed species usually have disjunct populations occurring in many localities. The more widely distributed species showed a broader range of macromorphological polymorphism whereas species with more restricted distributions had a more uniform morphological pattern. The environments where Lychnophora species occur and adaptation of these species to drought, fire and frost are discussed. The nature of Lychnophora species populations and achene dispersion are also discussed.
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutor em Ciências Biológicas

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Macias, Leila de Fatima Nogueira. „Revisão taxonomica do genero Posoqueria Aubl. (Rubiaceae)“. [s.n.], 1988. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315268.

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Orientador : Luiza Sumiko Kinoschita-Gouvea
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-15T15:21:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Macias_LeiladeFatimaNogueira_M.pdf: 14831292 bytes, checksum: ef591aefd994fe1428d178bc7f84d09a (MD5) Previous issue date: 1988
Resumo: O gênero Posoqueria Aubl. pertence à subtribo Eugardenieae DC., tribo Gardenieae A. Rich. e à família Rubiaceae Juss.; P. longiflora Aubl. é a espécie tipo. É um gênero tipicamente neotropical. Em seu limite norte não ultrapassa o Trópico de Câncer, porém, ocupa todo o sul do México. No limite sul, transpõe o Trópico de Capricórnio, até o litoral norte do Rio Grande do Sul, no Brasil. Inicialmente, o gênero constituía-se, de acordo com dados de literatura, de 13 espécies, 6 subespécies e uma forma. Nesta revisão, o gênero é reavaliado e mudanças taxonômicas são propostas. Consideram-se como válidas 14 espécies e 4 subespécies: P. platysiphonia Rusby, P. grandiflora Standl., P. acutifolia Mart., P. gracilis (Rudge) Roem. & Schult., P. trinitatis DC., P. latifolia (Rudge) Roem. & Schult., P. velutina Standl., P. macropus Mart., P. palustris Mart., P. williamsii Steyerm., P. maxima Standl., P. coriacea Mart. & Gal. subsp. coriacea e subsp. formosa (Karst.) Steyerm., P.longiflora Aubl. subsp. longiflora e subsp. grandiflora (Karst.) L. Macias uma combinação nova e P. bahiensis L. Macias que é reconhecida como espécie nova. A identificação das espécies baseou-se, essencialmente, em características morfológicas, depois de detalhada análise em exsicatas, provenientes de 32 herbários nacionais e estrangeiros. Nenhum caráter morfológico isolado é suficiente para separar as espécies, mas terá sempre de ser conjugado a outros para, em conjunto, possibilitar êxito na identificação das espécies... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: The genus Posoqueria Aub1., belongs to the subtribe Eugardenieae DC, tribe Gardenieae A. Rich. of the Rubiaceae Juss.; P. Longiflora Aubl. is the type species. The genus is typically neotropica1. His north limit of distribution is the Tropic of Cancer, and it occurs in all southern Mexico. In the south, the genus occurs below the Tropic of Capricorn until the north coast of Rio Grande do Sul, in Brazil. Inicial1y, as it is recorded in the literature, the genus was composed by 13 species, 6 subspecies and 1 forma. In this revision the genus is evaluated and taxonomic changes are proposed. 14 species and 4 subspecies are considered valid: P. platysiphonia Rusby, P. grandiflora Standl., P. acutifolia Mart., P. gracilis (Rudge) Roem. & Schult., P. trinitatis DC., P. latifolia (Rudge) Roem. & Schult., P. velutina Standl., P. macropus Mart., P. palustris Mart., P. williamsii Steyerm., P. maxima Standl., P. coriacea Mart. & Gal. subsp. coriacea e subsp. formosa (Karst.) Steyerm., P.longiflora Aubl. subsp. longiflora e subsp. grandiflora (Karst.) L. Macias a new combination and P. bahiensis L. Macias which is recognized as a new species. The species identifications were based essencially on morphologica1 characteristics, after detailed exsiccatae ana1ysis proceded from 32 national and foreing herbaria. No morphological character alone is enough to separate the species by itself. Many characters have to be considered for a successfu1 identification of the species¿ Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Mestrado
Biologia Vegetal
Mestre em Ciências Biológicas

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Martins, Angela Borges 1943. „Revisão taxonomica do genero Marcetia DC -(melastomataceae)“. [s.n.], 1989. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315112.

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Orientador : Hermogenes de Freitas Leitão Filho
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-16T14:00:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martins_AngelaBorges_D.pdf: 29180889 bytes, checksum: f95ce9f38bc8718ad05a1e9627c3a97f (MD5) Previous issue date: 1989
Resumo: É apresentada uma revisão taxonômica do gênero Marcetia DC. Melastomataceae) com chave dicotômica para todos os taxa, descrições das espécie sp ilustrações sp sinonímia; mapas de distribuição, relação de material examinado e observações sobre distribuição geográfica e ecologia. Com base no estudo de cerca de 3.000 exsicatas provenientes de 19 herbários nacionais e 14 do exterior, juntamente com algumas observações de campo e estudos em microscopia eletrônica de varredura de características da testa das sementes, 27 espécies são reconhecidas, das quais seis são novas. Uma nova combinação também está sendo proposta. Um nome específico, M. heterophylla, é considerado duvidoso e deverá ser excluído de Marcetia. O gênero é mantido na tribo Tibouchineae e a classificação infragenérica não é aceita. O gênero Marcetia pode ser distinguido de outros da tribo Tibouchineae principalmente pela combinação de suas flores tetrâmeras, folhas sem pontuações glandulares e anteras com conectivos sem prolongamentos basais ou apêndices ventrais. Com apenas uma exceção, o gênero é endêmico no Brasil, onde a maioria das espécies tem distribuição muito restrita em campos rupestres na Serra do Espinhaço, Minas Gerais, e na Chapada Diamantina, Bahia. Algumas delas, como M. canescens e M. ericoides, ocorrem tanto nas serras quanto em áreas litorâneas, enquanto M. shepherdli é endêmica na restinga. Apenas uma espécie, H. taxifolia, apresenta uma distribuição ampla e disjunta entre o leste e nordeste do Brasil e o norte da América do Sul. Este taxon variável tratado por autores anteriores como compreendendo diversos taxa distintos é aqui considerado como uma única espécie
Abstract: A taxonomic revision of the genus Marcetia DC. Melastomataceae)is presented with a dichotomous key to all taxa, species descriptions, illustrations, synonymy, distribution maps, observation on distribution and ecology and citation of specimens. Based on a study of some 3,000 exsiccata from 19 national and 14 overseas herbaria together with some field observations and scanning electronic microscope studies of seed testa characters, 27 species are recognized, six of which are new, and one new combination. One specific name M. heterophylla, is treated as doubtful. The genus is maintained in the tribe Tibouchineaer and the infrageneric classification is not accepted. The genus Marcetia can be distinguished within the Tibouchineae principally by the combination of tetramerous flowers, eglandular leaves, and simple anthers which lack both basally prolonged conectives and ventral appendages. With one exception the genus is endemic to Brazil, where most species are of very limited distribut ion in areas of campo rupestre in the Serra do Espinhaço, Minas Gerais and the Chapada Diamantina, Bahia. A few species such as M. canescens and Mericoides have a wider distribution to both montainous and littoral areas, whilst M. shepherdii is endemic to restinga. Only one species M. taxifolia, is wide-ranging with a disjunct distribution (E-NE Brazil to northern South America). This variable taxon, which has been treated by previous author, as comprising several distinct taxa, is here treated as a single species
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutor em Ciências Biológicas

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Zickel, Carmen Silvia. „Revisão taxonomica do genero Lamanonia Vell. (cunoniaceae)“. [s.n.], 1989. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315097.

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Orientador: Hermogenes de Freitas Leitão Filho
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-16T15:54:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Zickel_CarmenSilvia_M.pdf: 8332051 bytes, checksum: 3e38a8b87df07033addd37e87064f390 (MD5) Previous issue date: 1989
Resumo: A família Cunoniaceae compreende cerca de 20 a 26 generos e aproximadamente 350 especies, distribuindo-se preferencialmente no hemisferio sul. Lamanonia é um genero exclusivamente sulamericano, ocorrendo no Brasil, Paraguai e Argentina. Dentro da família, o genero é caracterizado principalmente por possuir flores com apenas calice e um numero grande de estames¿Observação: O resumo, na íntegra poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: Cunoniaceae family includes around 20 to 26 genera and 350 species with a preferential distribution in the Southern Hemisphere. Lamonia is an exclusively South American genus which occurs in Brasil, Argentina and Paraguai. Within the family, this genus is distinctive due to the unique characteristic of its flowers composed by the calyx and numerous stamens...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Mestrado
Biologia Vegetal
Mestre em Ciências Biológicas

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Martins, Eneida. „Revisão taxonomica do genero Trembleya DC. (Melastomataceae)“. [s.n.], 1997. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314839.

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Orientador: Angela Borges Martins
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-22T07:23:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martins_Eneida_D.pdf: 15301807 bytes, checksum: c0f913beba4c274cc6a81c33b3a4680e (MD5) Previous issue date: 1997
Resumo: Este estudo apresenta a revisão taxonômica do gênero Trembleya DC. (Microlicieae Melastomataceae), com tipificações, sinonimías, descrições, ilustrações, relação de material examinado, comentários e distribuição geográfica de todos os taxa, além de chave dicotômica de identificação para as espécies do gênero. Após análise de cerca de 2000 exsicatas provenientes de 24 herbários nacionais e internacionais e observações realizadas em viagens de coleta aos principais locais de ocorrência das espécies, foram reconhecidas em Trembleya 18 espécies, incluindo 7 que estão sendo aqui propostas pela primeira vez. Os seguintes nomes não foram aceitos: Trembleya canescens, T. rynanthera e T. pradosiana, tratados como duvidosos; Trembleya selloana e T. stenophylla, sinonimizados; Trembleya warmingii, excluído. Classificações infragenéricas e infraespecíficas não foram admitidas. As espécies do gênero Trembleya se distinguem por apresentar flores pentâmeras bracteoladas em dicásios perfeitos ou reduzidos, nervuras secundárias evidentes, estames dimorfos com conectivos prolongados e formando apêndices ventrais, ovário livre, glabro, 3-5 locular. O gênero é endêmico no Brasil e suas espécies ocorrem especialmente nos campos rupestres da Cadeia do Espinhaço e Serra dos Pireneus. Apenas duas espécies apresentam distribuição ampla: Trembleya phlogiformis e T. parviflora
Abstract: ln the present work a taxonomic revision of Trembleya DC. (Microlicieae Melastomataceae) was conducted, comprising typifications, synonymy, species descriptions, illustrations, list of examined specimens, comments and distribution maps. A dichotomus key of all species is also included. As a result of a morphological study of about 2000 specimens from 8 national and 16 overseas herbaria, together with field observations and collections realized, 18 species are recognized, seven ofwhich are new to science and proposed here for the first time. T. warmingii was exc1uded from Trembleya; T. pradosiana, T. canescens and T. rynanthera are treated as doubtfull. Two others validly published names, were considered as synonyms: T. selloana (= T. phlogiformis) and T. stenophylla (= T. calycina). The infrageneric and infraspecific classifications by COGNIAUX (1883-1888) are not accepted. The species in this genus can be recognized by their pentamerous bracteolate flowers disposed in simple or reduced dichasia, conspicuous leaf venation, dimorphic stamens with basally prolonged connectives and ventral appendages, and a free glabrous, 3-5-locular ovary. The genus is endemic to Brazil, occuring especially in areas of "campo rupestre" in the Serra do Espinhaço, Minas Gerais State and Serra dos Pirineus in Goyas. Only two species are widely distributed, T. hlogiformis and T. parviflora
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutor em Ciências

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Augustová, Kamila. „Taxonomické zařazení kvasinek rodu Saccharomyces“. Master's thesis, Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická, 2011. http://www.nusl.cz/ntk/nusl-216792.

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The theoretical part discusses the yeasts and their taxonomic classification using traditional methods and using modern methods. Detail the work is concerned with descriptions of modern molecular-biology methods. The practical part was analyzed DNA by PCR-fingerprinting (rep-PCR) type of yeasts, which we received from the CCY and subsequent analysis of yeast samples obtained from grape musts. One of the grape must was obtained in 2009 (white grape variety) and the second in 2010 (red grape variety). Both grape musts come as integrated vineyards and organic. Grape musts samples were obtained from the winery Holánek from Ivaň. The cross-comparison of images PCR-fingerprint type yeasts and yeasts PCR-fingerprint samples using BioNumerics was to evaluate the results and conclude that the diversity of yeast flora in grape must.

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COSTA, Fábio Correia. „Revisão taxonômica e análise filogenética do subgênero Malagoniella (Malagoniella) Martínez, 1961 (Coleoptera: Scarabeidae: Scarabeinae)“. Universidade Federal de Pernambuco, 2015. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/16122.

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Submitted by Haroudo Xavier Filho (haroudo.xavierfo@ufpe.br) on 2016-03-23T17:53:25Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertacao_Fabio Correia Costa.pdf: 5363839 bytes, checksum: 5a61b945fc8ff2be76123636ab5e5fff (MD5)
Made available in DSpace on 2016-03-23T17:53:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Dissertacao_Fabio Correia Costa.pdf: 5363839 bytes, checksum: 5a61b945fc8ff2be76123636ab5e5fff (MD5) Previous issue date: 2015-02-19
CNPq
O presente trabalho tem como objetivo revisar o subgênero Malagoniella e buscar uma hipótese da monofilia do grupo, assim como do relacionamento filogenético entre suas espécies. O primeiro capítulo aborda a análise filogenética do subgênero, para a qual foi utilizado o programa TNT, versão 1.1. Dichotomius bicuspis foi o grupo externo terminal utilizado para o enraizamento das análises. Para a árvore gerada (min. length = 0) foram calculados os valores de índice de consistência (IC) e índice de retenção (IR), e, para verificar o apoio dos clados, uma análise de “Bremer”, e “Bootstrap” como indicador de conflito entre os caracteres foram realizados. O subgênero Malagoniella foi considerado monofilético, sustentado por duas sinapomorfias e consta, a partir dos resultados alcançados, de 11 espécies e subespécies. O segundo capítulo inclui a revisão do subgênero, incluindo as redescrições em Malagoniella (Malagoniella) e novo status taxonômico para este, assim, como para as espécies/subespécies. Além de dados de distribuição geográfica e descrição de um novo táxon, que até o momento, é endêmico para o território brasileiro. Ainda, foram incluídas chave de identificação e a designação de neótipo e novo status taxonômico para as subespécies de M. astyanax.
This study presents aims to review the subgenus Malagoniella (Malagoniella) and search a hypothesis about the monophyly of the group, as well as the phylogenetic relationships between yours species. The Chapter one explains about the phylogenetic analyze of subgenus, that was performed on TNT program version 1.1. Dichotomius bicuspis was the terminals outgroup used to rootedness the analyzes. The generated tree (min. length = 0), were calculated consistency index (CI) and retention index (RI). In order to verify the support of the clades, analysis of “Bremer”, and “Bootstrap”, as conflict indicator between characters were done. The subgenus Malagoniella was considered monophyletic, supported by two synapomorphies and included 11 species and subspecies from the results achieved. The Chapter two, includes a review the subgenus, including redescriptions of Malagoniella (Malagoniella) and new taxonomic status to species and subspecies. Furthermore, geographic distribution data and a description of new taxon. Until this moment, this taxon is endemic at Brazilian territory. Moreover, it was included a key to identification and neotype designation to M. astyanax.

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Barban, Jussara Ramos. „Revisão taxonomica do genero macrosiphonia Muell.-Arg. (apocynaceae)“. [s.n.], 1985. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315267.

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Orientadora : Luiza Sumiko Kinoshita Gouvea
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-14T03:37:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Barban_JussaraRamos_M.pdf: 7128101 bytes, checksum: b49fde234e40b5433995096d4fdc6382 (MD5) Previous issue date: 1985
Resumo: Neste trabalho, foi realizada uma revisão taxonômica do gênero Macrosiphonia Muell.- Arg., com uma discussão dos caracteres morfológicos de importância taxonômica e chave de identificação das espécies. Para cada espécie, foi apresentada sinonímia completa, descrição atualizada, ilustrações e dados sobre a distribuição geográfica, além de comentários a respeito de fenologia, sempre que possível. O estudo morfológico foi baseado no exame de exicatas provenientes dos principais herbários nacionais estrangeiros. As características morfológicas importantes na separação das espécies encontram-se na folha, indumento, número de flores na inflorescência, comprimento do tubo da corola e forma do fruto. Das 13 espécies constatadas pela literatura, foram reconhecidas 10 espécies, distribuídas em dois subgêneros: 1. Macrosiphonia, com as espécies : M. martii Muell.- Arg.; M. longiflora (Desf.) Muell.- Arg.; M. virescens (St.Hil.) Muell.- Arg.; M. petraea (St.Hil.) K. Schum. e M. velame (St.Hil.) Muell.- Arg.; 2. Telosiphonia Woodson: M. lanuginosa (Mart. & Gal.) Hems1.; M. brachysiphon (Torr.) A. Gray; M. woodsoniana Standl., M. hypoleuoa (Benth.) Muell.- Arg. e M. hesperia I. M. Johnston. Foram consideradas para o Brasil todas as espécies do subgênero Maorosiphonia. Foram constatadas duas subespécies para M. petraea (St. Hil.) K. Schum.: M. petraea (St. Hl.) K. Schum. subsp. petraea e M. petraea subsp. pinifolia (St. Hil.) J.R.Barban. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: The present study consists of a taxonomic revision of the genus Macrosiphonia Muell.- Arg. including a discussion of taxonomically important morphological characters and a key for identification of species. A complete synonimy, description, illustration and distribution map are provided for each species. Additionally comments concerning phenology were supplied Whenever possible. The study of morfology was based on analysis of exsicata from the main national and foreign herbaria. Taxonomically importat characters for species distinction are: leaves, indument, number of flowers per inflorescence, corolla tube length and fruit shape. Of the 13 species recorded in literature, 10 were considered as valid, and these are segregated into two subgenera: 1. Subgenus Macrosiphonia : M. martii Muell.- Arg.; M. longiflora (Desf.) Muell.- Arg.; M. virescens ( St.Hil.) Muell.- Arg.; M. petraea (St.Hil.) K. Schum; and M. velame (St. Hil.) Muell.'- Arg.; 2. Subgenus Telosiphonia Woodson: M. lanuginosa (Mart. & Gal.) Hemsl.; M. brachysiphon (Torr.) A. Gray; M. woodsoniana Standl.; M. hypoleuca (Benth.) Muell.- Arg.; and M. hesperia I.M. Johnston. AlI species of the subgenus Macrosiphonia occur in Brasil. Two subspecies were recognised under the species M. petraea (St. Hil.) K. Schum.: M. petraea (St. Hil.) K. Schum. subsp. petraea and M. petraea subsp. pinifolia (St. Hi1.) I.R.Barban. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Mestrado
Biologia Vegetal
Mestre em Ciências Biológicas

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Koschnitzke, Cristiana. „Revisão taxonomica do genero Chaetostoma DC. (Microlicieae-Melastomataceae)“. [s.n.], 1997. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314841.

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Orientador: Angela Borges Martins
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-24T00:41:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Koschnitzke_Cristiana_D.pdf: 21714667 bytes, checksum: 363d791c99c20f9fdd5b8d8b1de41ef1 (MD5) Previous issue date: 1997
Resumo: Esta revisão taxonômica de Chaetostoma DC. (Microlicieae: Melastomataceae) está baseada em estudos morfológicos de exemplares de herbário e observações de campo. O gênero Chaetostoma apresenta o seguinte conjunto de características diagnós6cas: folhas carenadas a subcarenadas, imbricadas, pungentes, coroa de tricomas no ápice externo do hipanto, ausência de pontoações glandulares, cápsula madura excedendo o comprimento do hipanto e semente reniforme com testa reticulada. Com estas características Chaetostoma pode ser distinguido do gênero mais próximo Microlicia bem como de outros gêneros da tribo Microlicieae. As espécies de Chaetostoma que não apresentavam as características diagnósticas acima e estão sendo transferidas para Microlicia são: Chaetostoma acuminatum, C castratum, C gardneri, C luetzelburgii, C microlicioides, C oxyantherum e C parvlllllm. Onze espécies são reconhecidas: Chaetostoma albiflorum, stat. Nov.. ( = C pungens varo albiflora = C pungens var. pallidiflora); C cupressinum, comb. Nov. (= Microlicia cupressina = C luteum = C joannae = C. trauninense); C fastigiatum; C flaVum, sp. nov.; C glaziovii ( = C. glaziovii varo rubella = C glaziovii var. pallida = C petronianum); C inerme; C pungens ( = C longiflorum = C armatum = C pllngens var. brachycarpa); C riedelianum; C selagineum, comb. Nov. ( = Microlicia selaginea); C scoparium ( = Microlicia clavillosa); C stenocladon, comb. nov.( = Microlicia stenocladon = M. amaroi). As espécies de Chaetostoma são subarbustos, endêmicos ou restritos a determinadas áreas de campo rupestre ou de altitude, da Bahia, Minas Gerais, Goiás, Mato Grosso, Rio de Janeiro, São Paulo e Paraná (Brasil). Chaetostoma pungens é a espécie que tem a maior distribuição e a maior variação morfológica
Abstract: This taxonomic revision of Chaetostoma DC. (Microlicieae: Melastomataceae) is based on a detailed study of morphological characters of herbaria'specimens and field observations. The genus Chaetostoma can be distinguished within the Microlicieae by the combination of the following diagnostic features: careenats, imbricats and pungents leaves; a crown of basally adnates and appressed hairs around the outward apex of the hypanthium; mature capsule longer than the hypanthium and angular seeds with reticulate testa cells. Seven species were exclued from Chaetostoma: Chaetostoma acuminatum, C castratum, C gardneri, C luetzelburgii, C microlicioides, C oxyantherum and C parvulum. Eleven species are recognized: Chaetostoma albiflorum, stat. nov . ( = C pungens val:. albiflora = C pungens var. pallidiflora); C cupressinum, comb. nov . ( = Microlicia cupressina = C luteum = C joannae = C trauninense); C fastigiatum; C flavum, sp. nov.; C glaziovii ( = C glaziovii var. rubella = C glaziovii varo pallida = C petronianum); C. inerme; C pungens ( = C longiflorum = C armatum = C pungens var. brachycarpa); C riedelianum; C se lagine um, comb. nov . ( = Microlicia selaginea); C scoparium ( = Microlicia clavillosa); C stenocladon, comb. nov. ( = Microlicia stenocladon = M amaroi). The Chaetostoma species are subschrubs, endemic or restricted to particular areas in the states of Bahia, Minas Gerais, Goiás, Mato Grosso, Rio de Janeiro, São Paulo and Paraná (Brazil). Chaetostoma pungens is the species with the widest distribution and the widest morphological variation
Doutorado
Doutor em Biologia Vegetal

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Aranha, Filho João Luiz Mazza 1978. „Revisão taxonômica das espécies sul-americanas Symplocos Jacq. seção Hopea (L.) A. DC. (Symplocaceae)“. [s.n.], 2011. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314848.

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Orientadores: Angela Borges Martins, Peter Warren Fritsch, Frank Almeda
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-18T20:09:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AranhaFilho_JoaoLuizMazza_D.pdf: 23081315 bytes, checksum: a40a92f4f2f08a68c7f851a3edd989ff (MD5) Previous issue date: 2011
Resumo: O presente estudo consiste de uma revisão taxonômica das espécies sul-americanas de Symplocos seção Hopea, um grupo reconhecido principalmente por apresentar flores unissexuadas (espécies dioicas) e estames e estaminódios arranjados em grupos mais ou menos alternos aos lobos da corola. No total foram reconhecidas 27 espécies da seção para o continente, sendo que destas espécies quatro já foram publicadas como novas para a ciência e outras seis foram propostas como novas. O nome Symplocos pentandra, amplamente utilizado em trabalhos florísticos, foi validado; uma espécie anteriormente considerada sinônimo de S. itatiaiae foi restabelecida (S. dasyphylla); quatro nomes com prioridade (S. arbutifolia, S. revoluta, S. estrellensis e S. oblongifolia) foram restabelecidos; novas sinonimizações foram realizadas; vários nomes foram lectotipificados; S. rizzinii, anteriormente excluída de Symplocaceae, foi considerada como pertencente à família; e o nome Symplocos sect. Hopea foi restabelecido (não Symplocos sect. Barberina). Além disso, descrições, fotos, ilustrações, comentários, chave de identificação, lista de materiais examinados, dados de distribuição, fenológicos e ecológicos foram fornecidos
Abstract: This study concerns a taxonomic revision of the South American species of Symplocos section Hopea, which can be recognized mainly by its unisexual flowers and stamens and staminodes somewhat arranged in clusters alternate with the corolla lobes. A total of 27 species of the section were recognized for the continent, four of them were already published as new to sciences and other six were proposed as new. The name Symplocos pentandra, largely used in floristic surveys, was validated; one species previously considered synonym of S. itatiaiae was re-established; four names with priority (S. arbutifolia, S. revoluta, S. estrellensis and S. oblongifolia) were re-established; new synonyms were proposed; several names were lectotypified; S. rizzinii, excluded from Symplocaceae in previous treatment, was considered as a Symplocaceae member; and the name Symplocos sect. Hopea was re-established (not Symplocos sect. Barberina). In addition, descriptions, photos, illustrations, comments, identification key, specimens studied, distribution, phenological, and ecological data were provided
Doutorado
Biologia Vegetal
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Rodrigues, Karina Fidanza. „Estudos taxonomicos em Cambessedesia DC. (Melastomataceae)“. [s.n.], 2009. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/314835.

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Orientador: Angela Borges Martins
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-15T02:27:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigues_KarinaFidanza_D.pdf: 4546379 bytes, checksum: b708c32708ae62962fda2a676096bee2 (MD5) Previous issue date: 2009
Resumo: Este trabalho trata da re-avaliação taxonômica do gênero Cambessedesia DC., com chave de identificação para todos os táxons, descrições, sinonímias, relação do material examinado, comentários sobre as afinidades taxonômicas baseados em caracteres morfológicos, a distribuição geográfica, acompanhados de ilustrações e mapas de distribuição para as espécies. Com base no estudo de cerca de 3.000 exsicatas provenientes de 17 herbários nacionais e 17 estrangeiros, associado a diversas observações de campo e a estudos inéditos para o grupo tais como a análise das sementes, tricomas, emergências e estames sob microscopia eletrônica de varredura, 27 espécies são reconhecidas, das quais três são novas. Foram efetuadas as seguintes alterações infragenéricas e infra-específicas: sinonimização de Cambessedesia sect. Cambessedesia e Cambessedesia sect. Pyramia; o epíteto de C. hilariana foi substituído pelo epíteto específico fasciculata, por ser prioritário; C. arenaria e C. tiradentensis foram consideradas sinônimos de C. corymbosa e, C. espora subsp. ilicifolia, sinônimo de C. espora; C. longifolia e C. bahiana foram elevadas ao status específico. Foram designados 13 lectótipos e quatro neótipos. O gênero Cambessedesia é caracterizado por apresentar espécies com folhas frequentemente adicionais axilares reduzidas e dispostas em braquiblastos (algumas vezes assumindo forma de fascículos) ou verticiladas apenas em C. weddellii, flores 5-(6-) meras, pétalas bicolores (predominantemente vermelho-alaranjadas com base amarela), ou monocromáticas (amarelas ou branco-amareladas), estames 10 (-12), (5 apenas em C. semidecandra); anteras com conectivo espessado dorsalmente e eventualmente com pequeno cálcar na base, sem apêndices ventrais; cápsulas com sementes depresso-ovais, densamente ou esparsamente tuberculadas, antirafe na maioria das vezes mais desenvolvida que a rafe. Este gênero é endêmico no Brasil, onde foram detectados três padrões gerais de distribuição geográfica de suas espécies: amplo, endêmico (endêmico na Serra do Espinhaço-MG, endêmico na Chapada Diamantina-BA, endêmico na Chapada dos Veadeiros-GO) e disjunto. Dentre as 27 espécies deste gênero apenas C. fasciculata e C. espora apresentam distribuição geográfica mais ampla. Os dados apresentados no presente trabalho poderão futuramente contribuir para outros estudos filogenéticos em Cambessedesia.
Abstract: A taxonomic re-evaluation of the genus Cambessedesia DC. is conducted, including identification key for all taxa, descriptions, synonymies, list of examined materials, comments about taxonomic affinities based on morphological traits, observations on habitat and distribution, as well as illustrations and distribution maps for all analyzed species. The studies were based on the analysis of 3.000 exsiccatae from 17 national herbaria and 17 herbaria of foreign countries, which was associated with diverse field observations and with inedited scanning electron microscopy examinations of seeds, trichomes, emergencies and stamens. A total of 27 species were identified and two of them were recognized as new The following infrageneric and infraspecific modifications were derived from the taxonomic re-evaluation: Cambessedesia sect. Cambessedesia and Cambessedesia sect. Pyramia are considered synonymies; the epithet C. hilariana was replaced by the epithet fasciculata, because of its priority; C. arenaria and C. tiradentensis were considered synonym of C. corymbosa and C. espora subsp. ilicifolia synonym of C. espora; C. longifolia and C. bahiana were elevated to the specific status. A total of 13 lectotypes and four neotypes were designated. The genus Cambessedesia is characterized by species with opposite leaves, frequently with additional axillary leaves that are small and arranged in brachiblasts, occasionally fasciculate, or verticillate in C. weddellii only. The flowers are 5-(6-) merous with bicolor petals that are red-orange colored and have a yellow base, or that are monochromatic yellow or white-yellowish; stamens 10(-12), 5 in C. semidecandra, and the anther connective is dorsally thickened, often with a calcar at the base, without ventral appendages. The capsules contain oval-depressed seeds that are densely or sparsely tuberculate and, almost always, the anti-raphe is more developed than the raphe. Cambessedesia is endemic to Brazil, where three general patterns of geographic distribution were identified for its species: widely distributed, endemic (Espinhaço Mountains (MG), Chapada Diamantina (BA) and Chapada dos Veadeiros (GO) and disjunct Among the 27 identified species, only C. fasciculata and C. espora are widely distributed. The data in the present work contributes to further understand the systematic of Cambessedesia and are potentially useful for future phylogenetic in this genus.
Doutorado
Biologia Vegetal
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Kungu, Elizabeth M. „Taxonomic revision of African Entodontaceae“. Thesis, University of Reading, 2003. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.408339.

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Kaji, Denise Akiko. „Taxonomia molecular de Bacillus entomopatogenicos“. [s.n.], 1993. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/255729.

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Orientador : Vanderlei Perez Canhos
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
Made available in DSpace on 2018-07-18T15:49:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kaji_DeniseAkiko_D.pdf: 5928225 bytes, checksum: 2d2fec6671a89cddc1769763cf34ecc3 (MD5) Previous issue date: 1993
Resumo: Foi efetuado um estudo taxômico de 15 isolados entomopatogênicos de mostras de solos e insetos do Brasil com características de bactérias aeróbias, formadoras de endosporos e presença de cristal. Treze isolados acarretaram 100 % de mortalidade a larvas de Aedes fluviatilis em leituras observadas a 24 h. Os resultados dos testes de caracterização morfológica, bioquímica e fisiológica indicaram que 14 isolados pertencem a espécie Bacillus thuringiensis (B.t.) enquanto que o 15° foi determinado como Bacillus sphaericus (B.s.). Através dos perfis eletroforéticos de proteínas totais 11 B.t. isolados foram identificados como subespécie israelensis (sorotipo H-14, incluindo duas linhagens não sorotipadas), 1 como kurstaki (soro tipo H3a, 3b) e 1 como morT!isoni (sorotipo H8a, 8b). As linhagens de B. thuringiensis subsp. israelensis (B.t.i.) formaram um grupo homogêneo distinto das linhagens de referências tóxicas. a lepidópteros e coleópteros. O isolado identificado como B. sphaericus demonstrou alta similaridade com a linhagem 2362 através de testes de atividade larVicida; fagotipagem (fagotipo 3) e sorologia (H5). Os 11 isolados identificados como B.t.i. pela sorologia e/ou perfIS eletroforéticos de proteínas totais não apresentaram polimorflsmo quanto aos fragmentos de restrição, quando foram utilizadas sondas do gene 16S rRNA e do cristal de B.t.i.. A sonda do gene toxigêniro de B.t.i. demonstrou ser bastante específica para a subespécie israelensis, não apresentando hibridizaçóes Com outras subespécies. O gene do cristal de B.t.i. de referência IPS82 e isolados identificados como B.t.i. foram amplificados através da reação em cadeia da polimerase (PCR), digeridos com Sau3AI e separados por eletroforese. Os perfis de restrição destes fragmentos foram idênticos. Esses resultados indicam que os B.t.i. isolados no Brasil formam uni grupo. homogêneo e de organização genética bastante conservada. Outras 28 linhagens de referência representando 12 subespécies de B.t. com 9 sorotipos diferentes, 4 B. cereus e 4 B. anthracis foram incluídas na análise do perfil de hibridização com o gene 16S rRNA Os dados obtidos mostraram correspondência com os testes de sorologia (DE BARJAC & FRACHON, 1990) e a taxonomia numérica (PRIEST et ai., 1988)
Abstract: Fifteen bacterial isolates from Brazilian soil and insects with aerobic, endospores and crystal characteristics were taxonomically analysed. Thirteen strains were shown to be pathogenic to Aedes fluviatilis larvae causing 100 % mortality in 24 hours and two strains were non-pathogenic. The results of morphological, biochemical and physiological tests indicated that 14 strains belong B. thuringiensis (8.t.) while the remaining strain was identified as B. sphaericus. Electrophoresis ofwhole celI protein patterns helped in the identification of eleven isolates as israelensis (serotype H-14, including two non-serotypable strains), 1 as kurstaki (serotype H3a, 3b) and 1 as morrisoni (serotype H8a, 8b). Moreover, it was shown that alI B. thuringiensis subsp. israelensis (8.t.i.) strains. formed a homogenous group distinct from reference strains toxic for Lepidoptera or Coleoptera. The isolate identified as B. sphaericus presented high similarity with strain 2362 by larvicidal tests, phagotyping (group 3) and serotyping (H5). The is.olates identified as subspecies israelensis by serology and/or electrophoresis of whole cell proteins patterns showed the same patterns using restriction fragments length polymorphisms (RFLPs) analysis with the 16S rRNA and the crystal gene of B.t.i. as probes. The crystal gene of B.t.i. used as the probe was specific only to the subspecies israelensis. The crystal gene of B.t.i. reference (IPS82) and isolated strains of B.t.i. were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR), digested with Sau3AI and electrophoresed in agarose gel. The restriction fragment patterns obtained were identical. It confirmed as stated above that the B.t.i. isolates used in this study are a highly homogenous group with a conserva tive. genetic organization. Furthermore, 28B.t. reference strains representing 12 subspecies (with 9 different serotypes), 4 B. cereus and 4. B. anthracis were compared with regard to their ribosomal RNA gene restriction patterns. The results obtained match the serological tests (DEBARJAC & FRACHON, 1990) and numerical taxonomy studies (PRIEST et al., 1988). The results in this study suggest that the techniques could be an altemative to serological tests
Doutorado
Doutor em Ciência de Alimentos

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Nayak, Rajendra M. „Nāḍōr Kannada a taxonomic analysis /“. Dharwad : Shobha Publishers, 2001. http://catalog.hathitrust.org/api/volumes/oclc/55680004.html.

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Prado, Anajde Lemes do. „Revisão taxonomica do genero tocoyena aubl. (rubiaceae) no Brasil“. [s.n.], 1987. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315265.

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Orientador: Luiza Sumiko Kinoshita Gouvea
Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-17T14:19:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Prado_AnajdeLemesdo_M.pdf: 14297856 bytes, checksum: 1fe00c2fe04212e1d0abdcdd62ba2863 (MD5) Previous issue date: 1987
Resumo: Este estudo constitui uma revisão taxônomica do gênero Tocoyena Aubl. no Brasil. A identificação das espécies e as inter-ralações entre as mesmas basearam-se fundamentalmente em características morfológicas. Das 24 espécies constadadas pela literatura, foram reconhecidas 12 espécies para o Brasil. Uma espécie, originalmente descrita com Posoqueri Aubl., foi incluída: T. speciosa (Krause) A. L. Prado. Duas espécies constituem citações novas para o país: T neglcta e T. williamsii. Com base na forma dos lobos da corola e ápice do botão, foi proposto o agrupamento das espécies em duas seções, Tocoyena e Acutiflorae (Schum.) A. L. Prado. Quanto a esses caracteres, todas as espécies foram examinadas, incluindo aquelas que não ocorrem no Brasil. T. amazônica não pôde ser incluída em nenhuma das seções por ter sido baseada em coleta sem flor. Na seção Tocoyena estão incluídas: T. bullata, T. costanensis, T. formosa, T. longiflora, T. mollis., T. obliquinervia, T. pendulina, T. pittieri, T. sllowiana, T. tabascensis, T. vescidula T. williamsii. A seção Acutiflorae está composta de: T. cubensis, T. foetida, T. guianensis, T. hispidula., T. neglecta, T. orinocensis e T. speciosa. De duas espécies, T. formosa é a que apresenta distribuição geográfica mais ampla com grande variaçãofenotípica. Foi realizada uma análise mais detalhada nas coleções, resultando em 2 subespécies: T. formosa subsp. formosa e T. formosa subsp. tomentosa. Outras espécies, tais como T. bullata, T. guianensis e T. sellowiana, também apresentaram uma grande variação nos caracteres ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital
Abstract: A taxonomic revision of the genus Tocoyena Aubl. in Brazil was made. The identification of the species and the interelationships amongst them were based on morphological features. Of the twenty-four species related in the literature, 12 were considered as valid for Brazil. A species previously described as Posoqueria Aubl. was included as T. speciosa (Krause) A. L. Prado. The species T. neglecta and T. willamsii are described for the first time as occuring in Brazil. Two sections were proposed, based on the forms of the corolla lobes and of the flower bud tips: Tocoyena and Acutiflorae (Schum.) A. L. Prado. All species were studied in relation to these morphological features, even those not found in Brazil. Only one species ¿ T. amazonica ¿ could not be included in any of the sections because it was based on a non-flowering collection. The section Tocoyena includes: T. bullata, T. costanensis, T. formosa, T. longiflora, T mollis, T. obliquinervia, T. pendulina, T. pittieri, T. sellowiana, T. tabascensis, T. viscidula and T. williamsii. The section Acutiflorae is composed of: T. cubensis, T. foetida, T. guianensis, T. hispidula, T. neglecta, T. orinocensis, and T. speciosa. T. formosa has the widest geographical distribuition, with a large of phenotypic variation. A more detailed analysis of this species was made, resulting in two different subspecies: T. formosa subsp. formosa and T. formosa subsp. tomentosa ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations
Mestrado
Biologia Vegetal
Mestre em Ciências Biológicas

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Santos, Miriam Teresinha dos. „Seleção e caracterização taxonomica de leveduras produtoras de inulinases“. [s.n.], 1997. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/255731.

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Orientador: Vanderlei Perez Canhos
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos
Made available in DSpace on 2018-07-22T16:28:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_MiriamTeresinhados_D.pdf: 4853465 bytes, checksum: 6946889f82c0985f945cf4c90309a069 (MD5) Previous issue date: 1997
Resumo: Com o objetivo de obter leveduras produtoras de inulinases com propriedades biotecnológicas interessantes fez-se o isolamento de leveduras a partir de suco da planta Agave e resíduos da indústria de si sal (substratos ricos em inulina). Para a seleção de linhagens tolerantes a pH baixo e altas temperaturas, utilizou-se o sistema "Microtiter Reader" automatizado para reduzir tempo, custo e mão-de-obra. A caracterização taxonômica incluiu técnicas convencionais, quimiotaxonômica e taxonomia numérica. Foram isoladas 79 leveduras a partir de 4 locais de coleta em condição seletiva (meio de cultura contendo inulina em diferentes temperaturas). A caracterização morfológica e bioquímica, junto com a determinação do tipo de coenzima-Q (quinona) foram utilizadas na identificação de 73 leveduras ascomicéticas compreendendo os estados anamórficos: 42 linhagens de Candida kefyr (estado teleomórfico Kluyveromyces marxianus); 11 linhagens de Candida lusitaniae (estado teleomórfico Clavispora lusitaniae) e 6 linhagens de Candida guilhermondii (estado teleomórfico Pichia guilhermondii); 14 isolados semelhantes à espécie Pichia strasburgensis, que não apresentaram reprodução sexuada; e 6 leveduras deuterornicéticas identificadas como pertencentes à espécie Rhodotorula rubra. Na análise por taxonomia numérica, utilizou-se 58 características fenotípicas para o cálculo da similaridade entre as leveduras (coeficientes "simple matching" e Jaccard) e foram construídos dendogramas através dos programas computacionais X e NTSYS. As leveduras foram agrupadas em sete "clusters". Três "clusters" Q6, Q7 e QIO apresentaram boa definição e incluíram 18 linhagens de Candida kefyr, 10 linhagens de Pichia strasburgensis e os 6 representantes da espécie Rhodotorula rubra, respectivamente. Um "cluster", denominado Major, apresentou-se heterogêneo reunindo linhagens das espécies C. kefyr (24), C. lusitaniae (8), C. guilhermondii (3) e Pichia strasburgensis (2) confirmando a semelhança em relação às características morfológicas e bioquímicas observada na taxonomia convencional, na ausência das características relacionadas à reprodução sexuada. A estratégia de seleção utilizada comprendeu o teste do crescimento dos isolados em meios mínimo (YNB) e complexo (YEP) acrescidos de inulina em diferentes condições de pH e temperatura. Os dados de cinética de crescimento foram comparados e foram selecionadas 20 linhagens de Candida kefyr com constante específica de crescimento (?máx)?0,50 em meio mínimo (YNB) pH 4,0 e a temperatura de 50°C. Onze linhagens apresentaram atividade enzimática superior à obtida para a cultura referência Kluyveromyces marxianus CBS 6556 no menor tempo testado (12 horas). A linhagem Candida kefyr A54a mostrou atividade inulolítica de 2,31 U a 12 horas de produção comparável à linhagem referência (2,64 U) em 18 horas de produção
Abstract: Aiming to obtain inulinase-producing yeasts with interesting biotechnological properties the isolation of yeasts from Agave juice and from sisal industry residues (substrates rich in inulin) was carried on. For the screening of low pH and high temperature tolerant strains an automated microtiter reader system was utilized to reduce time, cost and work. The taxonomic characterization was performed using conventional and chemotaxonomic and numerical approaches. Were isolated 79 yeast strains from four sampling places on selective condition (culture medium with inulin at high temperatures). The morphological and biochemical characterization together with the coenzyme-Q type determination were utilized for the identification of 73 ascomycetous yeasts in anamorph state that include: 42 strains of Candida ke.fyr (sexual state Kluyveromyces marxianus); 11 strains of Candida lusitaniae (sexual state Clavispora lusitaniae); 6 strains of Candida guilhermondii (sexual state Pichia guilhermondii) and 14 isolates analogous to Pichia strasburgensis that did not show sexual reproduction and 6 deuteromycetous yeasts identified as Rhodotorula rubra. In the numerical analysis 58 phenotypic characters were utilized to ca1culated the similarity between isolates (simple matching and Jaccard coefficients) and c1ustering using X and NTSYS softwares. The yeasts were c1ustered on seven groups. The clusters Q6, Q7 e QlO presented a good definition and grouped 18 strains of C. ke.fyr, 10 strains of P. strasburgensis-lik.e and 6 strains of Rhodotorula rubra, respectively. One c1uster, defined Major, formed an heterogeneous group, c1ustering strains of C. ke.fyr (24), C. lusitaniae (8), C. guilhermondii (3) e P. strasburgensis (2) that confirms the similarity of these species based on the morphological and biochemical characteristics as shown by conventional taxonomy on absence of sexual reproduction. The screening strategy used included growth test at minimal medium YNB and complex medium YEP with inulin 1 % at different pH and temperature conditions. Kinetics data were compared and twenty strains were selected that presented specific growth constant (?máx)?0,50 h-1 at YNB pH 4,0 50°C condition. Of these, eleven strains of Candida kefyr showed inulolitic activity greater than reference culture (K. marxianus CBS 6556) with 12 hours of production. The strain C. ke.fyr A54a showed AE = 2,31 U (?moles of fructose per minute) at 12 hours of production, this value was comparable to strain K. marxianus CBS 6556 at 18 hours (2,64 U)
Doutorado
Doutor em Ciência de Alimentos

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Crespo, Sonia Regina de Melo. „Revisão taxonomica do genero Curtia Cham. & Schetdl (Gentianaceae)“. [s.n.], 2003. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315606.

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Orientador: Washington Marcondes-Ferreira
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-08-03T17:40:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Crespo_SoniaReginadeMelo_D.pdf: 32914265 bytes, checksum: 30f487d6a4a7a2262980300826204791 (MD5) Previous issue date: 2003
Resumo: É apresentada a revisão do gênero Curtia Cham. & Schltdl. (Gentianaceae), a qual inclui chave dicotômica, descrições, ilustrações, sinônimos e mapas de distribuição geográfica das espécies. Curtia é um gênero exclusivamente neotropical, tendo o Brasil como seu centro de diversidade. Duas de suas espécies têm ampla distribuição geográfica, ocorrendo nas Américas Central e do Sul (C . patula (Mart.) Knbobl. e C. tenella (Mart.) Cham.), enquanto C. obtusifolia (Spruce ex Benth.) Knobl. e C. quadrifolia Maguire concentram-se na região Amazônica.A presente revisão reconheceu 8 espécies para o gênero, as quais são: C. conferta (Mart.) Knobl., C. diffusa (Mart.) Cham., C. montana comb. nov., C. obtusifolia, C. patula, C. quadrifolia, C. tenella e C. verticillaris (Sprengel) Knobl.; uma nova combinação é proposta: o gênero monotípico Hockdnia Gardner é incluído em Curtia. A heterostilia foi confirmada em C. montana, C. obtusifolia e C. patula e, um estudo palinológico das espécies homostílicas e heterostílicas é apresentado. Os grãos de pólen foram analisados pelo método ACLAC, medidos, descritos e ilustrados em microscopia de luz e em microscopia eletrônica de varredura, sendo as formas heterostílicas analisadas separadamente
Abstract: A taxonomic revision of the genus Curtia Cham. & Schltdl. (Gentianaceae) is presented, with a dichotomous key for the species, descriptions, illustrations, synonymy and geographic distribution maps. The genus is exclusively neotropical and its center of diversity is in Brazil. Two species have wide geographic distribution, occurring in Central and South America, (C. patula (Mart.) Knobl. e C. tene/la); and two, C. obtusifolia (Spruce ex Benth.) Knobl. e C. quadrifolia Maguire, are concentrated in the Amazonian region. The present revision established that genus has 8 valid species, which are: C. conferta (Mart.) Knobl., C. diffusa (Mart.) Cham., C. montana comb. nov., C. obtusifolia, C. patula, C. quadrifolia, C. tenella (Mart.) Cham. e C. verticillaris (Sprengel) Knobl.; a new combination is proposed: the monotypic genus Hockdnia Gardner is included in Curtia. The heterostyly was confirmed in C. montana, C. obtusifolia e C. patula, and a palynological study of the homostylous and heterostylous species is presented. The pollen grains were ana1yzed by ACLAC method, measured, described and illustrated by light microscopy and scanning electronic microscopy, the pollen material of the every heterostylous forms was ana1ysed separately
Doutorado
Doutor em Biologia Vegetal

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Ludke, Raquel. „A família Polygalaceae na Região Sul do Brasil“. reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRGS, 2008. http://hdl.handle.net/10183/17465.

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Atualmente representada por aproximadamente 19 gêneros e cerca de 1300 espécies, Polygalaceae é uma família cosmopolita concentrada em regiões tropicais e temperadas, estando ausente na Nova Zelândia e nas zonas Antártica e Ártica. No território brasileiro, a família está representada pelos gêneros Barnhartia Gleason, Bredemeyera Willd., Diclidanthera Mart., Monnina Ruiz & Pav., Moutabea Aublet, Polygala L. e Securidaca L., somando cerca de 240 espécies. O presente estudo trata da revisão taxonômica da família Polygalaceae na Região Sul do Brasil que inclui os Estados do Paraná, Santa Catarina e Rio Grande do Sul. Embora inúmeros trabalhos de revisão taxonômica e trabalhos regionais envolvendo a família Polygalaceae tenham sido realizados em grande parte do território brasileiro durante os últimos 30 anos, a carência de coletas na Região Sul bem como a necessidade de um estudo mais detalhado da família nestes Estados são os principais objetivos que levaram ao desenvolvimento deste estudo. A tese consiste de três capítulos: 1) Revisão taxonômica da família Polygalaceae na Região Sul do Brasil. Foram confirmados quatro gêneros para os Estados sulinos: Bredemeyera, Monnina, Polygala e Securidaca. Houve um predomínio absoluto do gênero Polygala na Região Sul do Brasil, com 40 espécies, sendo seguido por Monnina (nove), Securidaca (três) e finalmente, Bredemeyera com apenas uma espécie. Neste capítulo são apresentados três artigos que tratam dos gêneros de Polygalaceae confirmados para a Região Sul, incluíndo descrições dos táxons, ilustrações, chaves analíticas bem como dados sobre floração e frutificação, hábitat e distribuição geográfica. 2) Novas espécies de Polygala L. para a Região Sul do Brasil. Neste capítulo são apresentados dois artigos de espécies novas de Polygala descritas durante a elaboração da presente tese. 3) Estudo molecular com espécies de Polygala L. da Região Sul do Brasil. O uso de marcadores ISSR auxiliou na delimitação de algumas espécies bem como deu suporte para a descrição de uma nova espécie de Polygala para o Rio Grande do Sul e Santa Catarina. Neste capítulo é apresentado o artigo intitulado: Use of ISSR to characterize species of Polygala L. (Polygalaceae) from Southern Brazil.
Nowadays represented by approximately 19 genera and 1300 species, Polygalaceae is a cosmopolitan family concentrated specially in the tropical and temperate regions, being absent in New Zealand and in the Artic and Antartic zones. In the Brazilian territory, the family is represented by the genera Barnhartia Gleason, Bredemeyera Willd., Diclidanthera Mart., Monnina Ruiz & Pav., Moutabea Aublet, Polygala L. e Securidaca L., totalizing approximately 240 species. The present work treats about the taxonomic survey of the Polygalaceae family in Southern Brazil which includes Paraná, Santa Catarina and Rio Grande do Sul states. Despite several taxonomic revisions and regional floras with Polygalaceae were realized in the Brazilian territory in the last 30 years, the necessity of more collections and the need of a detail study with the family in the Southern Brazil were the objectives who lead to the development of this thesis. The present thesis consists of three chapters: 1) Taxonomic revision of the Polygalaceae in Southern Brazil. Were confirmed four genera for the Southern Brazil: Bredemeyera, Monnina, Polygala e Securidaca. Has being notice a predominance of the genus Polygala in the Southern Brazil, with 40 species, being followed by Monnina (nine species), Securidaca (three species) and finally, Bredemeyera with only one species. In this chapter are presented three articles who treats the genus of Polygalaceae confirmed for the Southern Brazil, including morphological descriptions, illustrations, analytical keys and also data about flowering and fruiting time, habitat and geographical distribution. 2) New species of Polygala L. from Southern Brazil. Two articles about new species of Polygala described during this thesis are being presented in this chapter. 3) Molecular studies with Polygala species from Southern Brazil. The use of ISSR markers was helpful in the delimitation of some species, thus, supported to the description of a new species of Polygala to the Rio Grande do Sul and Santa Catarina states. In this chapter are presented the article entitled: Use of ISSR to characterize species of Polygala L. (Polygalaceae) from Southern Brazil.

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Marcondes-Ferreira, Neto Washington. „Aspidosperma Mart., nom. cons. (Apocynaceae) : estudos taxonomicos“. [s.n.], 1988. http://repositorio.unicamp.br/jspui/handle/REPOSIP/315705.

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Orientador: Luiza Sumiko Kinoshita Gouvea
Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia
Made available in DSpace on 2018-07-17T05:14:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcondes-FerreiraNeto_Washington_D.pdf: 7690099 bytes, checksum: 1d7442f28973968aa3d79a2b36ce65cc (MD5) Previous issue date: 1988
Resumo: Não informado
Abstract: Not informed
Doutorado
Biologia Vegetal
Doutor em Ciências

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Villa, Tatiana Alejandra Sepúlveda. „Taxonomia de Neriidae (Diptera) da Colômbia“. reponame:Repositório Institucional da UFPR, 2013. http://hdl.handle.net/1884/30431.

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Resumo: A família Neriidae compreende um pequeno grupo de moscas acaliptradas com 110 espécies descritas, que são facilmente reconhecidas devido a sua aparência característica: possuem as pernas bastante alongadas, antenas projetadas para frente com arista dorso-apical ou apical e fêmures, na face ventral, com cerdas em forma de espinho. Por anos, a classificação de Neriidae foi confusa e espécies foram descritas com base em caracteres instáveis, que levaram a um número elevado de sinonímias e questionar a validade de vários gêneros. Não existem estudos recentes (~50 anos) dessa família na Região Neotropical e o material tipo não tem sido revisado por nenhum dos autores na maioria das publicações conhecidas. Neste trabalho são descritas as informações obtidas a partir de visitas às mais importantes coleções entomológicas da Colômbia, bem como duas importantes coleções entomológicas do Brasil, uma da Argentina e uma dos Estados Unidos. Os resultados são apresentados em inglês, com o intuito de aumentar o acesso à informação nele contida e facilitar o processo de divulgação em revistas indexadas especializadas em taxonomia. Esta dissertação contem cinco capítulos, abrangendo os seis gêneros encontrados na Colômbia: Cerantichir Enderlein, Eoneria Aczél, Glyphidops Enderlein, Longina Wiedemann, Loxozus Enderlein e Nerius Fabricius. A organização geral dos capítulos deste manuscrito pretende partir do conhecimento mais geral e concreto, para finalmente tratar os gêneros com menos informação e/ou número de espécies disponíveis. Com este objetivo, é apresentado um primeiro capítulo, o qual contém a informação geral sobre os géneros tratados. É fornecida uma chave dicotômica para identificação dos gêneros com uma diagnose e uma lista de espécies atualmente ocorrentes na Colômbia. O capítulo 2 é uma revisão de Eoneria. Este gênero faz parte de um pequeno grupo basal de Neriidae, o grupo-Eoneria, e antes deste trabalho, havia registro apenas para a Argentina. Nesse capítulo, o gênero é delimitado, novas características são acrescidas à descrição e informações de distribuição geográfica são fornecidas. São descritos os machos previamente não conhecidos das espécies já descritas e uma nova espécie é descrita para a Colômbia, é apresentada uma revisão da diagnose para o gênero e uma chave de identificação. O capítulo 3 é uma revisão de Gliphidops, o gênero com as maiores áreas de distribuição das espécies na Região Neotropical. Esta revisão inclui redescrições das espécies conhecidas, fotografias e figuras, comentários sobre o material tipo, sinonímias e descrições de três novas espécies, e também novos registros para Costa Rica, Colômbia, Venezuela, Guiana, Equador e Brasil. O capítulo 4 aborda o gênero Cerantichir, que compreende duas espécies: C. enderleini Hennig e C. peruana (Hennig) e ocorre no Neotrópico, da Guatemala ao Centro-Oeste do Brasil. Este gênero é morfologicamente semelhante a Longina (revisado recentemente), para os que é sugerido um possível clado Longina+Cerantichir. Deste modo, para promover uma avaliação crítica, as espécies de Cerantichir foram examinadas detalhadamente. Uma nova diagnose do gênero é proposta, duas espécies são redescritas e são adicionados novos registros de distribuição geográfica juntamente com uma chave de identificação para essas espécies. O gênero monoespecífico Loxozus e Nerius, são incluídos num único capítulo final. Loxozus foi descrito através de uma única fêmea dos planaltos da Colômbia e nenhum novo material do gênero foi encontrado nas coleções examinadas para este trabalho, sendo a falta de material e as insuficientes descrições os principais obstáculos para seu melhor conhecimento. Nesse capítulo são apresentadas a redescrição de L.clavicornis Enderlein, nova diagnose e figuras. Aczél refere-se a Nerius como o mais caótico gênero neotropical, com um alto número de espécies insuficientemente descritas. O mesmo autor sugeriu várias sinonímias, apontando que, possivelmente, muitas outras espécies de Nerius são problemáticas. Nem todas as espécies de Nerius foram consideradas neste trabalho, pois não foi encontrado material nas coleções examinadas.

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Ochoa, Diana Lucia Grisales. „Taxonomia de fanniidae (diptera) da Colômbia“. reponame:Repositório Institucional da UFPR, 2010. http://hdl.handle.net/1884/23550.

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Humphries, Jill. „Ray, the father of taxonomic method“. Thesis, University of Oxford, 1996. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.337711.

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Anwar, Nadia. „Support for taxonomic data in systematics“. Thesis, University of Glasgow, 2008. http://theses.gla.ac.uk/471/.

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The Systematics community works to increase our understanding of biological diversity through identifying and classifying organisms and using phylogenies to understand the relationships between those organisms. It has made great progress in the building of phylogenies and in the development of algorithms. However, it has insuﬃcient provision for the preservation of research outcomes and making those widely accessible and queriable, and this is where database technologies can help. This thesis makes a contribution in the area of database usability, by addressing the query needs present in the community, as supported by the analysis of query logs. It formulates clearly the user requirements in the area of phylogeny and classiﬁcation queries. It then reports on the use of warehousing techniques in the integration of data from many sources, to satisfy those requirements. It shows how to perform query expansion with synonyms and vernacular names, and how to implement hierarchical query expansion eﬀectively. A detailed analysis of the improvements oﬀered by those query expansion techniques is presented. This is supported by the exposition of the database techniques underlying this development, and of the user and programming interfaces (web services) which make this novel development available to both end-users and programs.

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Rahman, M. A. „Taxonomic studies in the family Asclepiadaceae“. Thesis, University of Aberdeen, 1990. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.290235.

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1. The taxonomic history and currently accepted classification of the family Asclepiadaceae is presented and discussed. The evolutionary relationship with nearest families, overall geographical distribution and a brief note on economic importance of asclepiads are provided in a general account of the family. 2. A complete taxonomic account of the family for the Flora of Bangladesh is prepared for the first time after a comprehensive survey of the existing taxa. 56 species and 4 varieties from 25 genera are recognized from the area. A dichotomous key to the genera, based on field characters, is provided, and suprageneric, infrageneric and infraspecific classifications are given. A nomenclatural and typification note is provided with a proposal for 16 lectotypes and 3 topotypes according to ICBN. A few nomenclatural changes in some species are made and a full attention is paid to synonymy which results in a number of reductions. Wallich's asclepiad material from Bangladesh held at K-W and other major herbaria have been examined critically, and an index has been prepared with nomenclatural notes and current taxonomic status. There are 7 species and 2 varieties recorded new to the flora of Bangladesh. 2 new varieties, Gymnema acuminatum var. glabrum and Tylophora indica var. intermedia, have been described from Bangladesh. Some investigations on pollinaria, seed morphology and leaf flavonoids have been done. A comparative account of the morphology of the pollinaria of 50 species from 25 genera is prepared with a dichotomous key for the Flora of Bangladesh. Seed morphology under SEM for 14 species from 11 genera provides diagnostic features which may prove useful for supra- and infra-generic classifications. Flavonoid distribution in asclepiads is not taxonomically useful at any level of the taxonomic hierarchy. 3. Two genera, Calotropis and Pentasacme, have been revised for the first time with notes on their taxonomic history, distribution, ecology and synonymy. 3 species of Calotropis and 4 in Pentasacme are recognized. C. procera ssp. hamiltonii (Wight) Ali is reduced to C. procera (Aiton) R. Br. Two sections in the genus Pentasacme are recognized: sect. Pentasacme and sect. Wallichiana (sect. nov.). Pentasacme championii Benth. is considered as a synonym of P. caudatum Wall. ex Wight.

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Craighead, Anthea N. „Taxonomic variation of plant potassium concentrations“. Thesis, University of Cambridge, 2005. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.444740.

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Bissiengou, Pulcherie. „Taxonomic assessment of O. furcillata (Oxalidaceae)“. Thesis, Stellenbosch : University of Stellenbosch, 2005. http://hdl.handle.net/10019.1/3339.

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Thesis (MSc (Botany and Zoology))--University of Stellenbosch, 2005.
The family Oxalidaceae has a worldwide distribution, but is most common in tropical and subtropical regions. Oxalis L. is the largest genus of the family comprising ca. 800 of the 900 species. Oxalis species are annual or perennial herbs or rarely subshrubs or trees. The current study assesses on the taxonomic placement of O. furcillata Salter. Currently this species, comprising two varieties, O. furcillata var. furcillata and O. furcillata var. caulescens Salter, is placed in section Foveolatae. Members of this section have endospermous seeds and fleshy leaflets. However, both in terms of leaf morphological and seed characters the two varieties of this species appear to be misplaced within this section. In addition O. furcillata var. caulescens has a unique pollen type, different from both the typical variety and the rest of the section. Both lines of evidence thus suggest that O. furcillata var. caulescens may be misplaced within this section. The present study thus sets out to assess the placement of O. furcillata in general, and the placement of O. furcillata var. caulescens in particular. A multi-disciplinary approach was followed, which included analyses of macro-morphological (including LM and SEM analyses), biogeographical and palynological characters. The variability of quantitative characters was assessed using the STATISTICA 6.0 software package. Leaf dimensions, plant height, bulb length, petiole length and palynology showed sufficient differences between the two taxa to confirm the separate identity of these two varieties as separate species. O. furcillata var. caulescens was thus raised to specific status as O. caulescens (Salter) Bissiengou. The results suggest two different options in terms of the taxonomic placement of the species O. furcillata and O. caulescens. They can either remain in section Foveolatae, best placed near O. senecta and O. densa or may moved to the highly variable section Latifoliolatae. But retaining them within the section Foveolatae appeared to be the better alternative. The correct position will be established both through further morphological analyses and correlation to the trnL-F and ITS sequence-based phylogeny of the southern African members of Oxalis.

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SILVA, JÚNIOR Fernando Cezar Sebastião. „Taxonomia de Gymnopilus (Agaricales) no Brasil“. Universidade Federal de Pernambuco, 2015. https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/26601.

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O gênero Gymnopilus foi descrito por P. Karsten (1980), posteriormente foi incluído na família Strophariaceae por suas espécies serem lignícolas e por apresentar estirilpironas, mais recentemente esse pigmento também foi encontrado em Pholiota P. Kumm em estudos de Biologia molecular. Singer (1986) incluiu este gênero em Cortinariaceae por conta da ornamentação do esporo. As espécies do gênero possuem como características píleos coloridos, himenóforo lamelado e cor marrom–ferrugínea, estipe amarelo, os esporos são ferrugíneo–méleos sob microscópio, com parede dupla e ornamentados, trama da lamela regular e geralmente apresentando queilocistídios. A ‘Lista de Espécies da Flora do Brasil’ cita a ocorrência de apenas 11 espécies do gênero no país. O objetivo deste trabalho é ampliar o conhecimento do gênero Gymnopilus para região Nordeste do Brasil, sua distribuição e riqueza. As coletas foram realizadas em seis áreas da região Nordeste do Brasil. O checklist das espécies encontradas no Brasil foi feito a partir de artigos e livros contendo registros de coleta do gênero. Foi encontrada uma nova espécie para o gênero, Gymnopilus purpureograminicola, em João Pessoa–PB. Novos registros de Gymnopilus sp.1 são apresentados na RPPN Fazenda Almas, e Gymnopilus aff. dilepis na Área de Proteção Ambiental da Serra de Ibiapaba–Ceará e Gymnopilus sp.2 para Recife–PE. O trabalho traz ainda um checklist contendo as 24 espécies do gênero encontradas no Brasil, com breve descrição e estados onde foram coletadas.
The Gymnopilus genus was described by P. Karsten (1980). Which was included in the Strophariaceae family, their species are lignicolous and presents styrylpyrones, more recently this pigment was also found in Pholiota P. Kumm in molecular biology studies. Singer (1986) included this genus under Cortinariaceae due to the spore ornamentation. The Cortinariaceae belonging to the family was later proposed its inclusion in Strophariaceae to present styrylpyrones and proximity to Pholiota in molecular biology studies. The species of the genus have as characteristics colored pileus, lamellar hymenium in rusty-brown and stipe yellow color, the spores are rufous-meleos under microscope, double and ornate wall, plot regular slide and generally presenting cheilocystidia. The 'Flora Species List of Brazil' mentions the occurrence of only 11 species of the genus in the country. The objective of this study is to increase knowledge of Gymnopilus genus to northeastern Brazil, its distribution and wealth. Samples were collected in six areas of the Northeast region of Brazil. The checklist of the species found was made from articles and books containing the genus collection records. A new species have been found for the genus, Gymnopilus purpureograminicola in João Pessoa-PB. New records of Gymnopilus sp.1 are presented in RPPN Fazenda Almas, and Gymnopilus aff. dilepis in the Área de Proteção Ambiental of Serra de Ibiapaba-Ceará and Gymnopilus sp.2 to Recife-PE. The work also contains a checklist incorporate 24 species of the genus found in Brazil, with a brief description and states where they were collected.

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