Dissertationen zum Thema „Qualité-diversité“

L'objet de cette thèse est de mettre en évidence les différences qu'introduisent entre les unités urbaines françaises de plus de 50 000 habitants, les conditions qu' elles offrent du point de vue de la qualité de la vie. Deux approches dominent l'appréciation de la qualité de la vie. La première se situe dans le domaine de la perception subjective, on parle alors de bien-être. La deuxième approche passe par l'existence d'un certain nombre de caractères objectifs du cadre de vie, de la situation économique, des projets possibles. Ces conditions d'ensemble observables sont celles qui sont offertes à un individu, a un groupe pour définir, améliorer, déterminer sa qualité de la vie. Notre thèse se rattache à cette seconde voie. Dans une première partie nous analysons l'ancienneté de la notion et l'émergence contemporaine du concept de qualité de la vie, dont nous proposons une définition. Dans une deuxième partie, nous recherchons quelles sont les composantes des différences, sensibles entre les villes françaises, en matière de qualité de vie, à partir de trois champs distincts qui sont : le cadre de vie, les niveaux de vie et les modes de vie. A partir de l'analyse de quelques centaines de variables décrivant chacune des 111 plus grandes villes françaises, nous discutons des indicateurs aujourd'hui pertinents pour évaluer la qualité de la vie urbaine. Dans une troisième partie nous nous attachons à montrer comment localement, la recherche de la qualité de la vie est définie et mise en œuvre. Cette recherche repose à la fois sur une enquête approfondie, réalisée dans 4 grandes villes et sur l'analyse des réponses a un questionnaire
Many authors had the quality of life as subject of their studies. Now and then it is necessary to take stock on this question and to try to propose a new definition of the concept. We have done such work in the first part of our research, trying to explain or to found a clear difference between life quality and well-being. In the second part, using for the most part, the economic studies and statistic national institute data, we have tried to create some materials and socials indicators of French urban life quality. We have find that is impossible to establish a single classification of the biggest French cities (more than 50 000 inhabitants) on a single basis of life quality. We have proposed a few classifications after different quantitative and qualitative analysis. The third part of this research is based on a local view of life quality that propose different municipalities to theirs inhabitants. The local council of four big cities have been inquired and, besides, we have done a prospective work on the analysis of the answers to a questionnaire of a biggest sample of municipalities

La diversité génétique est un élément essentiel au maintien et à l'adaptation des populations en milieu naturel. Or, l'expansion actuelle de la population humaine et de ses activités entraîne de nombreux changements globaux susceptibles d'affecter les populations naturelles. Les perturbations de l'habitat peuvent notamment être responsables d'une réduction de la diversité génétique au sein des populations et des individus, diminuant le potentiel adaptatif et augmentant les risques d'extinction des populations. Dans ce contexte, il est crucial de comprendre l'influence des variables écologiques sur la variabilité génétique des populations en milieu naturel. L'objectif de ma maîtrise est de déterminer, à l'aide d'une approche de génétique du paysage, la structure de population et l'effet de la qualité de l'habitat sur la diversité génétique de l'Hirondelle bicolore (Tachycineta bicolor), le long d'un gradient d'intensification agricole au sud du Québec. J'ai déterminé la présence d'une seule population au sein de l'aire d'étude ainsi qu'une légère association positive entre l'apparentement des individus et la distance géographique, suggérant un méchanisme [i.e. mécanisme] d'évitement de la consanguinité. Ensuite, j'ai montré que, dans notre système d'étude, la diversité génétique individuelle de l'Hirondelle bicolore est négativement reliée à la qualité de l'habitat. Ce résultat contre-intuitif s'explique probablement par la configuration du paysage dans cette région: suite à la migration, l'Hirondelle bicolore entre dans notre système d'étude via le fleuve Saint-Laurent, près duquel se trouvent les habitats de qualité inférieure; les premiers habitats disponibles rencontrés sont donc de moins bonne qualité. Or, les individus génétiquement plus diversifiés arrivent plus tôt dans le système d'étude et s'établissent dans les premiers habitats disponibles, générant cette relation négative entre qualité génétique individuelle et qualité de l'habitat. Cette étude souligne l'importance des paramètres liés à la qualité de l'habitat et au comportement sur la diversité génétique en milieu naturel, en plus de constituer l'une des premières quantifications de l'effet de facteurs écologiques sur les niveaux et la distribution de la diversité génétique mesurée au niveau individuel.

Sur le raisin coexiste, dans un système organisé, une grande variété de microorganismes, dont une partie comprend les principales espèces utiles à la vinification. Après le foulage, les interactions assurent les fermentations alcoolique et malolactique et, après le sulfitage, les suivis des espèces résiduelles suggèrent que ces interactions persistent. La compréhension de ces évolutions implique une vision globale de la diversité microbienne. Chaque opération technologique et chaque processus fermentaire influence cette diversité. Globalement, le système se simplifie car le vin devient de plus en plus carencé et toxiques pour les micro-organismes. O. Oeni et B. Bruxellensis sont les espèces les plus résistantes. Des collections de ces espèces isolées de vin ont été étudiées. La diversité intraspécifique est révélée par des études phénotypiques et génétiques pour la première. La variabilité dans la production des phénols volatils, qui altèrent le vin est démontrée chez la seconde
On the grape, a large variety of micro-organisms coexist in an organized system including the principal species useful for winemaking. After pressing, interactions ensure alcoholic fermentation and fermentations. After sulphiting, the evolution of residual species suggests that interactions persist. Their understanding is necessary and needs a global view of the microbial diversity. Each technological operation and fermentative process influences this diversity. The system is gradually simplified because the wine becomes more and more deprived and toxic. Among the most resistant species, there are O. Oeni and B. Bruxellensis. Strains collections have been constituted for these species. The instraspecific diversity is shown by phenotypic and genetics studies in the first one. The variability in volatile phenols production, which spoils wine, is shown in the second

Les prairies permanentes sont reconnues pour les nombreux services agronomiques et environnementaux qu’elles fournissent. Cependant, elles sont aujourd’hui encore retournées ou menacées de l’être au profit de productions plus rentables, ou abandonnées dans le cas des prairies humides où les conditions d’exploitation sont soumises à de nombreuses contraintes. Concilier objectifs de production et environnementaux afin de maintenir une activité agricole extensive au sein des prairies temporaires s’avère alors indispensable. Dans ce contexte, des études multi-services ont été réalisées au sein des prairies humides du Parc Naturel Régional (PNR) des marais du Cotentin et du Bessin (Normandie) ainsi que dans des prairies mésophilesaux conditions pédoclimatiques contrastées situées en Normandie, en Lorraine et en Auvergne. L’étude s’est focalisée sur 3 catégories de services écosystémiques (SE) telles que définis par le Millenium Ecosystem Assessment: la diversité floristique et fonctionnelle comme services de support, la qualité et la production du fourrage comme services d’approvisionnement et les stocks de carbone organique et les teneurs en carbone soluble du sol comme services de régulation. Afin de mettre en évidence la part du fonctionnement des communautés végétales dans le déterminisme des SE, la mesure de traits fonctionnels foliaires a été réalisée à l’échelle de l’espèce et/ou de la communauté végétale. Une partie de ces travaux se focalise sur les relations entre le fonctionnement des communautés végétales et la qualité du fourrage ainsi que l’impact des conditions hydriques du solsur les teneurs en micronutriments des espèces dans les prairies humides.Les résultats ont mis en évidence, qu’en fonction du groupe fonctionnel considéré, le SLA ou le LDMC étaient de bons proxies de la digestibilité des fourrages des prairieshumides. Les dicotylédones ont des teneurs en micronutriments plus élevées que les monocotylédones. Nos résultats montrent que l’inondation influence plus la composition élémentaire des espèces intolérantes aux inondations que les espèces adaptées et qu’elle n’a pas incidence sur la production de biomasse. De manière générale, le fonctionnement des communautés végétales n’explique pas à lui seul les relations entre les SE. La qualité du fourrage est liée au fonctionnement des communautés végétales ainsi qu’à la diversité floristique et fonctionnelle mais seulement en prairies humides. En prairies mésophiles, l’historique de la gestion ou la structure du paysage pourrait être déterminants. Par ailleurs, nos résultats montrent que les stocks de C organique dans le sol des prairies mésophiles et humides sont étroitement liés à sa nature.Les indicateurs des SE combinent les prairies humides en 4 groupes distincts en selon la nature du sol et la gestion (fauche ou pâturage). Globalement, les bouquets de services rendus par les prairies humides sont mieux équilibrés que ceux rendus par les prairies mésophiles, ces derniers ne se distinguant pas les uns des autres selon la localisation géographique des prairies mésophiles. Les prairies gérées de manière extensive fournissent de meilleurs services environnementaux que des prairies gérées de manière intensive et une qualité fourragère équivalente
Permanent grasslands are recognized for the many agronomic and environmental services they provide. However, they are still plowed or threatened to be in favor of more productive cultures, or abandoned in the case of wet grasslands, where the conditions of exploitation are subjected to many constraints. Reconciling production and environmental objectives in order to maintain extensive agricultural activities is therefore essential in permanent grasslands. In this context, multi-service studies have been carried out in the wet grasslands of the Regional Natural Park (PNR) of the Cotentin and Bessin marshes (Normandy, France) as well as in a set of mesophilous grasslandsofcontrasting pedoclimatic conditions located in Normandy, Lorraine and Auvergne. The study focused on 3 categories of Ecosystem Services (ES) as defined by the Millennium Ecosystem Assessment: floristic and functional diversity as support services, quality and forage production as supply services and stocks of organic carbon and soluble carbon soil contents as regulatory services. In order to analyzethe role of plant community functioning in the ES determinism, the measurement of leaf functional traits was carried out at the species and/or the plant community scales. Part of this work focuses particularly on the relationships between plant communities functioning and forage quality, and soil moisture conditions impact on micronutrient contents of species in wet grasslands. The results showed that, depending on the functional group, SLA or LDMC were good proxies for the digestibility of wet grassland forages. Dicots have higher micronutrient contents than Monocots. Our results show that flooding influences the elemental composition of flood-intolerant species more than adapted species and does not affect biomass production. In general, the plant community functioning does not explain all the relationship between ESs. Forage quality is linked to the plant community functioning as well as thefloristic and functional diversity but only forwet grasslands. In mesophilic grasslands, the history of management or the landscape structure could be important drivers. In addition, our results show that organic C stocks in the soil of wet and mesophilic grasslands are closely related to soil nature. ESs indicators have brought together 4 distinct groups of wet grasslands according to soil nature and management practices (mowing or grazing). Overall, the ESs packages offered by wet grasslands are better balanced than those provided by mesophilic grasslands, the latter being indistinguishable from another according to the geographical location. Extensively managed grasslands provide better environmental services than intensively managed grasslands and equivalent forage quality

En octobre 2001, l'Association française pour la normalisation publie un fascicule de documentation intitulé: «Démarche qualité en recherche - Principes généraux et recommandations». Jusqu'à présent, les démarches Qualité au sens de celles promues par les organismes de normalisation et encadrées par des normes avaient été mises en oeuvre dans les entreprises à caractère industriel ou de service. Dans cette thèse, nous avons étudié les processus par lesquels la question de la Qualité a été introduite dans le domaine de la recherche française et nous avons tenté de savoir pourquoi les institutions politiques ont été amenées à compléter, par une norme de management, les dispositifs de régulation mis en place par la communauté scientifique elle-même. Ces interrogations ont semblé d'autant plus pertinentes que cette communauté s'est précisément structurée historiquement autour de «normes» explicites ou implicites supposées régir ses pratiques.

Les équipes internationales de projet sont aux prises avec des situations complexes tant au plan technique qu’au plan organisationnel. Les projets se démarquent de la production ordinaire par le caractère unique du résultat et d’inévitables imprévus qui exigent la résolution de problèmes émergents chemin faisant. La recherche de solutions débouche sur la mise en œuvre d’innovations. Le contexte international des projets ajoute à la diversité de métiers et de profils des membres une diversité culturelle qui implique que les acteurs ne partagent pas les mêmes références pour donner du sens aux situations qu’ils vivent. Pour certains chercheurs, la diversité culturelle dans une équipe favorise la créativité et l’innovation. Pour d’autres, la diversité soulève des difficultés pour diffuser et concrétiser des innovations, elle est instrumentalisée pour construire des frontières artificielles et stratégiques qui servent les intérêts des acteurs. Cette recherche doctorale ne vise pas à trancher entre les différentes thèses mais elle propose, sur la base d’un travail empirique dans un contexte international, des éléments d’explication sur les relations entre les différences des cultures d’une part et la capacité à produire et diffuser une innovation organisationnelle d’autre part. Cette recherche s’appuie sur une étude de cas unique, un Plan de Contrôle Qualité dans un projet international d’infrastructure de transport réalisé par un consortium constitué de firmes algérienne, française et italienne. Notre étude révèle que l’examen des constructions culturelles en lien avec les rapports de pouvoir, et de l’articulation des cultures nationales avec les cultures professionnelles, est essentiel pour comprendre les mécanismes expliquant les liens entre diversité culturelle et innovation organisationnelle. Ni les cultures en présence, ni les rapports de pouvoir en œuvre ne sont suffisants pour expliquer la dynamique d’un processus d’innovation organisationnelle ; c’est bien l’articulation de ces dimensions qui joue dans les interactions. Notre contribution managériale s’accentue sur la prise en compte des contextes socioculturels des projets internationaux, et le renforcement du cadre formel et légal dans ces rapprochements inter-organisationnels
International project development teams confront complex technical and organizational situations. The objective of the projects differs from the ordinary production by the uniqueness of the outcome and the inevitable unexpected events which require the resolution of emerging problems during the realization process. The search for solutions leads to innovations. The international context of projects adds cultural diversity to the diversity of the professions and profiles of the members, which means that the actors do not share the same references to give meaning to the situations they live in. For some researchers, cultural diversity within a team promotes creativity and innovation. For others, diversity raises difficulties that slow down the diffusion and realization of innovations. It is only the instrument to construct strategic artificial borders that protect the profits of the actors. This doctoral research is not intended to decide between the various theses but proposes, on the basis of an empirical work in an international context, elements of explanation to the relations between the differences of cultures on one hand, and the ability to generate and spread an organizational innovation on the other hand. This research is based on a single multicultural case study “the Quality Control Plan” in an international transport infrastructure project carried out by a consortium made up of Algerian, French and Italian firms. Our study reveals that examining cultural constructs in relation to power relations, and the articulation of national cultures with professional cultures, is crucial to understand the mechanisms explaining the links between cultural diversity and organizational innovation. Neither the cultures in presence, nor the power relationships are sufficient to explain the dynamics of an organizational innovation process; it is the articulation of these dimensions that plays into the interactions. Our managerial contribution is accentuated by taking into account the socio-cultural contexts of international projects, and reinforcing the formal and legal framework in these inter-organizational linkages

Alors que la superficie des forêts de plantation continue d'augmenter dans le monde, leurcontribution à la conservation de la biodiversité reste controversée. L’objectif de cette thèse estd'identifier les facteurs clés, à la fois au niveau de l'habitat local et à celui du paysage, qui influent surla diversité des papillons de jour dans les paysages en mosaïque dominés par des plantations de pins.Les communautés de papillons ont été échantillonnées en lisière et à l’intérieur de plantations de pinmaritime, pare-feux, ripisylves et fragments de forêts de feuillus variant par la taille et le degréd’isolement spatial. Les traits biologiques et écologiques des papillons ont été liés auxcaractéristiques de l’habitat et aux variables paysagères.Les éléments les plus importants pour la conservation des papillons dans les paysages dominés parles plantations de pins sont les habitats semi-naturels: forêts de feuillus, pare-feux et lisières. Lesripisylves se révèlent être les plus riches en papillons forestiers, abritant des espèces spécialisées. Lespare-feux hébergent deux fois plus d'espèces que les autres types d'habitats et sont importants pourla conservation de plusieurs espèces menacées. Toutefois les plantations de pin ne sont pas vide depapillons. La qualité de l'habitat, notamment la présence de plantes hôtes, est le facteur le plusdéterminant de la composition des communautés de rhopalocères. La composition et laconfiguration du paysage ont également une influence importante sur la diversité des papillons. Denombreuses espèces de papillons ont été observées dans plusieurs types d'habitat suggérant que lacomplémentation et supplémentation des ressources soient des processus clés pour maintenir ladiversité des papillons dans les paysages forestiers hétérogènes
While the area of plantation forests continues to increase worldwide, their contribution to theconservation of biodiversity is still controversial. The aim of this thesis is to identify key habitat andlandscape factors that drive butterfly diversity in mosaic landscapes dominated by pine plantations.Butterfly communities were sampled at edges and interiors of five successional stages of pine stands,in firebreaks, riparian forests and in deciduous woodlands varying in fragment size and isolation.Biological and ecological traits of butterflies were related to habitat patch attributes and tolandscape composition and configuration.The results highlighted the critical importance of semi-natural habitats for butterfly conservation inpine plantation mosaics, i.e. deciduous woodlands, firebreaks and edges. Riparian forests wereespecially rich in forest butterfly species, harboring specialized species with both narrow habitat andthermal ranges. Firebreaks had twice as many species as other habitat types and were ofconservation value for several threatened butterfly species. Our results also showed that pine standswere not ‘free of butterflies'. Habitat quality, particularly the presence of host plants, was the mostimportant driver of butterfly community composition. Landscape composition and configuration alsoinfluenced butterfly diversity. Many species used more than one distinct habitat type, suggestingthat resource complementation and supplementation are important mechanisms of butterflydiversity persistence in pine plantation mosaics

Face à la pollution généralisée des masses d’eau souterraines par les nitrates et les pesticides, l’agriculture biologique (AB) est présentée comme un outil pertinent pour la reconquête de la qualité des eaux sur les aires d’alimentation de captage (AAC). Ce travail vise à mieux définir l’opportunité d’un développement de l’AB sur des zones à enjeu eau. L’objectif de la thèse est d’évaluer conjointement la faisabilité des conversions sur les exploitations de l’AAC et l’efficacité de ces conversions par rapport aux enjeux de reconquête de la qualité de l’eau.Etudier l’opportunité d’un développement de l’AB à l’échelle territoriale suppose d’instruire la diversité des exploitations et des profils d’agriculteurs sur la zone à enjeu eau. Pour être en mesure de tester l’opportunité des conversions, une méthode typologique permettant d’analyser conjointement la variabilité actuelle des pressions sur les zones à enjeu eau et la propension des agriculteurs conventionnels à la conversion est nécessaire.Pour produire cette typologie, nous avons développé une méthode innovante d’analyse compréhensive des pratiques, centrée sur les principes d’action à l’origine des systèmes de culture. Les principes d’action correspondent à des méta-raisonnements à l’origine de l’organisation concrète des pratiques agricoles sur le territoire d’exploitation. Par l’analyse conjointe du discours des agriculteurs et de la variabilité des règles de décision, nous avons élaboré des typologies basées sur les postures techniques des agriculteurs pour i) identifier des principes d’action associés aux pratiques à risque et ii) dégager des proximités éventuelles entre agriculteurs biologiques et agriculteurs conventionnels. La méthode a été testée sur deux territoires à enjeu eau en Rhône-Alpes, sur lesquels des entretiens semi-directifs ont été réalisés auprès d’exploitants conventionnels et biologiques.Cinq principes d’action génériques à l’origine de l’organisation de l’assolement et cinq principes d’action génériques à l’origine des pratiques culturales ont été dégagés. A partir des différents principes d’action, des typologies des postures techniques ont été produites sur les deux terrains. Les pressions à l’origine de la lixiviation des nitrates et des pesticides ont été évaluées et spatialisées via le recours à des indicateurs agro-environnementaux. Nous avons démontré que la variabilité forte des indicateurs et leur distribution spatiale sur les AAC étaient liées à la diversité des postures techniques entre agriculteurs.Nous avons comparé les principes d’action mobilisés par les agriculteurs conventionnels et les agriculteurs biologiques « références » présents sur les zones à enjeu eau. Par l’étude des spécificités des postures techniques en AB, trois critères de propension à la conversion ont été identifiés. Plusieurs degrés de propension à la conversion ont été dégagés parmi les agriculteurs conventionnels des deux territoires.L’analyse croisée des degrés de propension à la conversion et des différentiels de pressions entre systèmes conventionnels et biologiques nous a permis d’évaluer l’opportunité d’un développement de l’AB sur les deux territoires. Nos résultats ont mis en évidence des niveaux de pression limités quant à la lixiviation des nitrates sur les systèmes biologiques : un développement exhaustif de l’AB à l’échelle des deux AAC entrainerait potentiellement une réduction forte de la lixiviation des nitrates. Néanmoins, l’opportunité d’un tel développement doit être relativisée. Les agriculteurs présentant une propension réelle ou forte à la conversion sont minoritaires sur les AAC. Ensuite, le différentiel des pressions entre systèmes conventionnels et systèmes biologiques diminue à mesure que la propension à la conversion augmente. Pour envisager une diminution forte des pressions sur les zones à enjeu eau, la conversion devrait concerner des exploitants pour lesquels cette conversion est difficilement envisageable à moyen terme
Many problems with nitrate and pesticide contamination from agriculture exist in European drinking water catchments. In France, a new mitigation approach aims at preventing water quality degradation in explicitly targeting agricultural non-point source pollutions associated with leaching of nitrates and pesticides. This work aims at assessing the opportunity to develop organic farming in water catchment areas in order to reduce nitrate and pesticide leaching from root zone. The objective was to analyze both i) feasibility of conversions to organic farming on farms concerned by water preservation and ii) the potential impacts of these conversions in terms of nitrate and pesticide leaching reduction.To explore the potential contribution of organic farming in water catchment areas, we develop an innovative typology approach to characterize farmers’ conceptions and strategies related to cropping systems’ organization on the farm territory. Our method was tested in two French water catchment areas characterized by diversified production systems, where semi-structured interviews were carried out with conventional and organic farmers. Resulting typologies of farmers were used to assess leaching risks variability related with current cropping systems and to identify potential similarities between conventional and organic farmers’ conceptions. Nitrate and pesticide leaching risks for cropping systems were assessed and spatialized by using four agro-environmental indicators. Our results show major variations for all indicators at both study sites, for example N-surpluses which range from -105 to 192 kg N ha-1 year-1. These variations are deeply related with diversity of farmers’ conceptions summarized in typologies. To assess proximity of conventional farmers to organic farming, we used typologies to compare conceptions related to organization of cropping systems between conventional and organic farmers. By analyzing specificities of organic farmers’ conceptions, we determined three main criteria of proximity to organic farming; these criteria were then used to identify various degrees of proximity to organic farming among conventional farmers in the catchment areas.To assess potential contribution of organic farming to water preservation in catchment areas, we firstly compared nitrate leaching risks between conventional and organic cropping systems. Our results reveal low leaching risks from organic systems, characterized by reduced N-surpluses and lower bare soils frequencies in autumn. According to these results, massive development of organic farming should decrease nitrate leaching in our two water catchment areas. However, analysis of similarities between conventional and organic farmers’ conceptions shows that a majority of farmers are characterized by a low level of proximity to organic farming. Moreover, the farmers who show strongest similarities with organic farmers’ conceptions are already those with low leaching risks cropping systems. To significantly lower nitrate leaching risks, conversions should concern conventional farmers with low degree of proximity to organic farming

La problématique de cette thèse repose sur la caractérisation de la qualité des abricots et leur aptitude à la transformation industrielle. Trois axes principaux ont guidé cette étude. Le premier consistait au départ à une caractérisation morphométrique globale des pieds clones des abricots marocains transplantés vers une station expérimentale de l’INRA Marrakech puis suivie par l’analyse de la diversité génétique. 92 accessions, issus de différentes régions géographiques, ont été génotypés en utilisant 21 marqueurs microsatellites. En effet, la collection analysée a été caractérisée par un polymorphisme élevé et une diversité génétique réduite. Au total, 120 allèles ont été identifiés avec une moyenne de 5,71 allèles par locus.Toutes les preuves statistiques (analyse hiérarchique, ACP et analyse de structure) montrent que la structure génétique de l’abricot marocain peut être subdivisée en deux populations :une majeure population constituée de la plupart des accessions de groupes génétiques(population authentique liée notamment à la variété Delpatriarca) et une seconde population moins diversifiée et liée à toutes les variétés de références, y compris la variété Canino. La variabilité observée entre les 92 génotypes pourrait être un atout pour améliorer la culture de l’abricot et permettre un développement durable dans l’espace et dans le temps du fruit par la sélection de nouveaux génotypes d’abricots. Finalement, la variabilité génétique observée a été utilisée dans le choix et la sélection de nouveaux clones d’abricots pour une analyse phénotypique. Le deuxième axe s’est intéressé à l’étude des marqueurs biochimiques qui permettent de comprendre et d’évaluer la qualité des abricots sélectionnés, à savoir : le changement des acides organiques et des sucres solubles en relation avec la qualité sensorielle, le développement des pigments et le changement de la couleur, l’’évolution des composés phénoliques en relation avec l’activité antioxydante et la perte de la texture en relation avec la biochimie de la paroi cellulaire. En effet, de bonnes propriétés physicochimiques et biochimiques ont été rapportées pour les dix clones choisis (Valeurs maximales rapportées pour certains composés bioactifs : Vitamine C = 0,15 g/kg ; β-carotène= 149,251 μg/kg ; provitamine A = 0,028 mg/kg), ainsi que des caractères qualitatifs associés à la saison de maturation et au génotype, cela représente certainement une source génétique précieuse pour prolonger la saison des abricots et alimenter les étalages et l’industrie.Le troisième axe était sur l’implication de la texture du fruit dans la transformation industrielle de l’abricot. Nous avons analysé l’aptitude variétale des abricots à la transformation industrielle, par l’analyse de leurs propriétés texturales, avant et après la transformation. Et pour mieux comprendre la variabilité de la texture de l'abricot, nous avons étudié l'impact du traitement thermique en fonction du stade de récolte des fruits sur une large gamme de cultivars français. Au final, cinq variétés d’abricots ont été choisies les plus appropriés pour le processus industriel
The problematic of this thesis is based on the characterization of the quality of apricotsand their aptitude for industrial processing. Three main axes guided this study. The first oneconsisted initially of a global morphometric characterization of Moroccan apricot clonesmaintened in experimental station of INRA of Marrakech and followed by the analysis ofgenetic diversity. 92 accessions, from different geographical regions, were genotyped using21 microsatellite markers. Indeed, the analyzed collection was characterized by a highpolymorphism and a reduced genetic diversity. A total of 120 alleles were identified with anaverage of 5.71 alleles per locus. All the statistical evidence (hierarchical analysis, PCA andstructural analysis) show that the genetic structure of Moroccan apricot can be subdivided intotwo populations : a major population made up of most accessions of genetic groups (authenticpopulation linked in particular to the Delpatriarca variety) and a second less diversifiedpopulation related to all reference varieties, including the Canino variety. The observedvariability between the 92 genotypes could be an asset to improve the apricot cultivation andto allow a sustainable development in the space and the time of the fruit by the selection ofnew genotypes of apricots. Finally, the observed genetic variability was used in the selectionof new apricot clones for phenotypic analysis. The second axis focused on the study ofbiochemical markers that allow to understand and evaluate the quality of selected apricots,namely : the change of organic acids and soluble sugars in relation to the sensory quality, thedevelopment of pigments and color change, the evolution of phenolic compounds in relationto antioxidant activity and loss of texture according to the cell wall biochemistry. Indeed,good physicochemical and biochemical properties have been reported for the ten chosenclones (Maximum values reported for some bioactif compounds : Vitamin C = 0.15 g / kg, β-carotene = 149.251 μg / kg, provitamin A = 0.028 mg / kg), as well as the qualitative traitsassociated with the maturation season and the genotype, is certainly a valuable genetic sourceto extend the apricot season and to supply stalls and industry. The third axis was on theimplication of the texture of the fruit in the industrial processing of apricot. We analyzed thevarietal ability of apricots for industrial processing by analyzing their textural propertiesbefore and after processing. And to better understand the variability of apricot texture, westudied the impact of heat treatment depending on the stage of fruit harvesting on a widerange of French cultivars. In the end, five apricots varieties were chosen as the mostappropriate for the industrial process

Les marais littoraux de Charente Maritime représentent des systèmes hydrauliques sur lesquels les données existantes sur la qualité de l'eau sont limitées. Ce déficit d'information représente un frein à la bonne gestion de ces écosystèmes. Leur situation intermédiaire entre continent et océan leur confère un rôle prépondérant au sein de ces entités. Par ailleurs, les marais représentent un patrimoine écologique majeur où le suivi du compartiment aquatique est indispensable en vue d'améliorer la connaissance et d'apprécier l'évolution de ces milieux.Dans ce cadre, un réseau de suivi de la qualité des eaux des marais a été mis en place sur la base du SEQ-Eau (système d'évaluation de la qualité des cours d'eaux) en 2003 par l'UNIMA (Union des Marais de Charente-Maritime) dans le but de créer un référentiel " marais "répondant aux exigences de la DCE (Directive Cadre sur l'Eau européenne). Mais avant d'apprécier la qualité des eaux des marais, il est nécessaire de comprendre leur fonctionnement. Les objectifs de la thèse sont de trois ordres. Le premier était de dégager une typologie de nature d'eau des marais en valorisant les données issues du suivi patrimonial de l'UNIMA. Dans un deuxième temps, le suivi analytique des eaux et du fonctionnement a été approfondi (ajout de paramètre chimique, biologique et géographique) sur un nombre restreint de stations.Une typologie, basée sur une méthode statistique permettant d'appréhender à la fois les variabilités spatiale et temporelle dans le classement des stations en groupes, est composé de 7 groupes en marais doux et de 5 en marais salés. Le suivi des marais pendant prés de 1,5ans par les paramètres de la matière organique, de l'ensemble des compartiments planctoniques constituant les réseaux trophiques planctoniques et la diversité fonctionnelle du phyto- et du méso-zooplancton, ont permis de confirmer un certain nombre d'hypothèses sur le fonctionnement des marais et sur la typologie de nature d'eau, concernant notamment : (i)le rôle écologique des marais, (ii) l'influence des écosystèmes adjacents du méta-écosystème Pertuis-charentais et (iii) leur capacité de résilience.Le fonctionnement des marais salés semble contrôlé par un double mécanisme : la marée et le type d'activité anthropique dans les bassins déterminant le taux de renouvellement des eaux qui conditionne le type de réseaux trophiques en place et leur succession. Dans les marais doux, un schéma 'classique' de la succession des réseaux trophiques planctoniques aété dégagé. La dominance du phytoplancton et des réseaux trophiques herbivores et multivores, semblerait cohérent avec les fonctions écologiques d'épuration et d'habitat/nourricerie caractéristiques des zones humides. Ce fonctionnement classique peut être altéré par différents mécanismes : le renouvellement de l'eau ou le développement des macrophytes. D'une part, le faible renouvellement d'eau de certains marais peut conduire à l''emballement' du système et provoquer des phénomènes d'eutrophisation, altérant les propriétés de l'écosystème (injection d'azote atmosphérique ou efficacité écotrophique). Enfin, les macrophytes sont plus compétitrices que le phytoplancton dans les milieux peu profond tel que les canaux de marais. Leur capacité a utilisé les nutriments des sédiments permette leur développement et empêche celui du phytoplancton (limitation par la lumière). La dégradation importante de la biomasse macrophytique par les bactéries en période estivale peut engendrer de fortes hypoxies.Quelques indicateurs basés sur des paramètres simples sont proposés pour suivre l'état trophique du système (chlorophylle par classe de taille, biomasse bactérienne), ou bien de repérer un état susceptible de virer sur une eutrophisation (espèces de rotifère spécifiques des périodes pré-eutrophisation).

La plupart des sols du monde sont aujourd’hui modifiés par les activités humaines. Ainsi, pour de nombreux sols agricoles, les pratiques culturales intensives et l’apport chronique d’intrants chimiques ont conduit à une diminution de la fertilité de ces sols. Pourtant, alors même que ces sols sont en danger, il n’existe que peu d’outils d’évaluation pertinents de leur état. La composante biologique a longtemps été négligée, or le sol héberge une très forte diversité d’organismes impliquée dans les cycles biogéochimique dont les microorganismes susceptibles alors de constituer des bioindicateurs potentiels de l’état du sol. L'objectif de ce travail consiste donc à identifer des variables descriptives de la diversité bactérienne, sensibles à l’état du sol. La structure des communautés bactériennes (abondance, diversité génétique et fonctionnelle) a été appréhendée dans son ensemble mais également au travers de l’analyse des populations de Pseudomonas, genre bactérien largement représenté dans les sols et particulièrement sensible à ses perturbations. L’approche expérimentale, de la parcelle au microcosme, a consisté en l’évaluation comparée de l’effet (1) d’un apport de cuivre (dose agronomique x100) (2), de perturbations naturelles (spatiale, climatique), et (3) de perturbations anthropiques (pratiques culturales) sur les communautés bactériennes. La première partie de ce travail a été réalisée in situ sur sols de Prairie et de Grande culture afin de définir les bornes naturelles de la variation spatiale et temporelle de différents descripteurs bactériens de sols limoneux caractéristiques de Haute Normandie. Par ailleurs, cette partie a également permis d’appréhender les sensibilités relatives des différentes variables descriptives mesurées et de valider en conséquence les approches méthodologiques mises en oeuvre. Ainsi les variables mesurées peuvent être classées en deux catégories : les variables dont la mesure repose sur la culture des microorganismes reflèteraient les perturbations récentes du sol tandis que les variables basées sur une approche moléculaire reflèteraient l’historique cultural des parcelles. La seconde partie de ce travail a permis d’étudier en microcosmes l’impact d’une contamination métallique par le cuivre sur les descripteurs étudiés dans la première partie. Les résultats obtenus montrent que les variations de la structure des communautés bactériennes causées par une contamination cuprique ponctuelle, comparées à celles liées à la saison ou aux pratiques culturales, sont mineures. Parallèlement une analyse comparative des données obtenues en cosmes tamisés et non tamisés révèle que l'état du sol peut influencer la réponse des communautés bactériennes à une contamination métallique ; en effet la perturbation physique du sol par le tamisage a induit une réponse transitoire des communautés à la contamination métallique. Ce travail a permis (1) la constitution d’un référentiel de données microbiologiques de sols agricoles limoneux, intégrant les fluctuations spatiales et temporelles des variables mesurées, (2) de déterminer la sensibilité de variables descriptives aux effets naturels et anthropiques et d’identifier les limites et complémentarités des approches cellulaires et moléculaires, (3) de hierarchiser des facteurs déterminant la structure génétique et fonctionnelle des communautés bactériennes, (4) de valider la pertinence de l’utilisation des bactéries du genre Pseudomonas dans l’évaluation de l’impact du cuivre sur les sols
Most soils worlwide undergo modifications caused by human activities. For numerous agricultural soils, the intensive practices, as well as the chronical spreading of chemical inputs, lead to a decrease in these soils fertilkity. Yet, while these soils are in danger, only a few relevant soil status evaluation tools exist. The biological component has been neglected for a long time, though soil accomodates a high diversity level of organisms involved in biogeochemical cycles. Among these organisms, microorganisms are likely to be potential bioindicators of soil status. Thus, the aim of this work consists in identifying biological variables describing bacterial diversity that would be sensitive to soil status. Bacterial community structure (abundance, genetic and functionnal diversity) was assessed as a whole, but also through the analysis of Pseudomonas populations, a bacterial genus widely found in soils and sensitive to environmental disturbances. The experimental approach, from the field plot level to the microcosm level, consisted in the confrontation of the impacts of (1) soil copper contamination (agronomical dose x100), (2) natural disturbances (spatial and climatic), and (3) human caused disturbances (agricultural practices) on bacterial communities. The first part of this work was performed in situ on typical silty Haute-Normandie soils managed as grasslands and cultures, in order to define the natural spatial and temporal variation limits of different bacterial descriptors. Besides, this first part enabled the understanding each variable's sensitivity, and validated the different methodological approaches. Thus, the measured variables can be organized in two categories: those which rely on microorganisms cultivation would reflect recent soil disturbances, while those based on molecular approaches would reflect the agricultural history of field plots. In the second part, the impact of a copper contamination on the previously described variables was studied in microcosms. Results showed that variations in the bacterial community structure caused by a single copper contamination were minor, when compared with variations caused by season or agricultural practices. In the same time, a comparative analysis was performed between sieved soil and intact soil microcosms. This revealed that soil status can influence bacterial communities response to a copper contamination; indeed, soil physical disturbance (sieving) induced a transient response of bacterial communities to the copper contamination. This work lead to (1) building, for an agricultural silty soil, a microbiological reference system, which includes spatial and temporal fluctuations of the measured variables, (2) determining for each variable its sensitivity to natural and human impacts, and identifying the limits and complementarities of the cellular and molecular approaches, (3) organizing into a herarchy factors determining the genetic and functionnal sructure of bacterial communities, (4) validating the relevance of using the Pseudomonas genus in the evaluation of the impact of copper on soils

Cette thèse propose d'étudier dans quelle mesure la diversité du genre au conseil d'administration influence la qualité des états financiers. Plus précisément, cette thèse explore la relation entre la diversité du genre au conseil d'administration et la qualité des états financiers en soulignant l'influence des attributs des femmes administrateurs sur la qualité des états financiers.Cette thèse repose sur un large échantillon d'entreprises françaises appartenant à l'indice CAC All-shares d'Euronext Paris entre 2001 et 2010. Après avoir contrôlé l'endogénéité et d'autres facteurs spécifiques au conseil d'administration, à l'entreprise et à l'industrie, nos résultats montrent que la diversité du genre au conseil d‟administration est positivement associée à la qualité des états financiers. De plus, nos résultats mettent en lumière une influence significative des attributs des femmes administrateurs sur la relation entre la diversité du genre dans les conseils d'administration et la qualité des états financiers. En ce qui concerne plus particulièrement les attributs, nous avons trouvé que l'appartenance au comité d‟audit, l'expertise comptable et financière et l'expérience des femmes ont un impact positif et significatif sur la qualité des états financiers. L'ensemble de ces résultats témoigne de l'importance des compétences dans les conseils d'administration diversifiés en termes de genre et révèlent la pertinence des attributs des femmes administrateurs pour assurer la qualité des états financiers
This thesis proposes to study to what extent board gender diversity influence the quality of financial statements. Specifically, this thesis explores the relation between gender-diverse boards and financial statements quality by highlighting the value relevance of female directors‟ attributes for enhancing the quality of financial statements.This thesis focuses on a large sample of French firms belonging to the CAC-All shares index listed on Euronext Paris over the period 2001 to 2010. We find, after controlling for endogeneity and other board, firm and industry specific factors, that board gender diversityis positively associated with the quality of financial statements. Further, our findings provide evidence of significant influence of female directors‟ attributes on the relation between gender-diverse boards and financial statements quality. With regard to female directors‟ attributes, we find concrete evidence to suggest that audit committee memberships, financial expertise and experience of women have substantial impact on the quality of financial statements. Taken together, these results testify the effective monitoring skills of gender-diverse boards and the value relevance of female directors‟ attributes for ensuring the quality of financial statements. Finally, an important implication of thesis is that the decision to appoint women on corporate boards should be more based on their statutory and demographic attributes than blind implementation of gender quotas

Chez la tomate, l'amélioration pour la qualité du fruit est rendue difficile par la multiplicité et la complexité des caractères. La cartographie de QTL a permis la caractérisation génétique de ces caractères. L'objectif est maintenant d'identifier les gènes sous-jacents aux QTL. Nous avons utilisé la cartographie par déséquilibre de liaison (DL) dans ce but. Pour éviter les fausses associations entre caractères et polymorphismes moléculaires, la structure génétique a été prise en compte dans l'analyse. La tomate cultivée montre un faible niveau de diversité génétique, ce qui réduit la résolution de cartographie. Le génome de la tomate de type cerise est décrit comme une mosaïque entre celui de la tomate cultivée et de l'ancêtre sauvage. Ce mélange devrait augmenter la résolution des études d'association. Nous avons utilisé une « core collection » focalisée sur des accessions de type cerise pour valider la région génomique contenant un QTL pour le nombre de loges. Deux mutations sont associées avec le caractère. Ces deux SNP ont évolué différemment du reste du chromosome 2, en subissant une sélection balancée qui témoigne de l'augmentation de la diversité morphologique lors de la domestication. L'étude, focalisée sur le chromosome 2, a permis d'analyser l'étendue du DL en fonction de la distance génétique et physique. Des associations, entre polymorphismes et phénotypes étudiés, ont été détectés avec des méthodes prenant en compte la structure génétique. Nous avons montré l'intérêt d'utiliser la structure en mosaïque du génome des accessions de type cerise pour surmonter les limitations de résolution dans les analyses d'associations chez une espèce cultivée autogame
In Tomato (Solanum lycopersicum), breeding for fruit quality is difficult due to the multiplicity and complexity of the traits. QTL mapping has allowed the genetic characterization of these traits. One of the challenges is now to identify the genes underlying these QTLs. Following this aim, we used linkage-disequilibrium (LD) mapping. To avoid hazardous associations between traits and polymorphisms, the genetic structure has to be taken into account for LD mapping. Cultivated tomato showed low genetic diversity reducing mapping resolution. Cherry type tomato genome is described to be admixture between cultivated tomato and its wild ancestor. Such admixture may increase resolution of association mapping. We used a core collection focused on cherry type accessions to validate a candidate gene for a fruit locule-number QTL. We found that two single nucleotide polymorphisms (SNP) were highly associated with the trait. These two SNP evolved differently from the rest of the chromosome 2. They underwent a balanced selection which testifies a selection for fruit morphology diversity by human. Association mapping, focused on whole chromosome 2, allowed us to assess the extent of linkage disequilibrium over genetic and physical distances. Associations of polymorphisms with phenotypes were detected with structured association methods. We thus showed efficiency of genome admixture to overcome the low-resolution limitation of association mapping for an inbred crop. We validated previously identified QTLs and found associations with new QTLs and new candidate genes. An evolutionary model including bottleneck and gene flow between wild and domesticated forms is also presented

Au cours des quarante dernières années, l’optimisation des méthodes sylvicoles et l’introduction de variétés améliorées ont permis d’accroître considérablement la productivité du pin maritime. Pour permettre à la filière bois de disposer d’une matière première de qualité sur ce matériel amélioré, un programme de recherches multidisciplinaire a été développé afin d’étudier le déterminisme génétique de la qualité du bois. Neuf facteurs de transcription potentiellement impliqués dans la xylogenèse et l’adaptation des arbres à leur milieu, ont tout d’abord été séquencés dans la population Aquitaine, et leurs patrons de diversité nucléotidique ont été étudiés. Ces patrons ont été comparés à l’attendu de modèles neutres d’évolution et s’en écartent par un niveau élevé de déséquilibre de liaison et l’excès de mutations en fréquences intermédiaires détectés pour trois de ces gènes (HDZ31, LIM2 et MYB1). Ces résultats suggèrent des changements de taille de population affectant l’ensemble du génome, et l’action de sélection balancée sur l’un d’entre eux (MYB1). Les géniteurs de la population d’amélioration Aquitaine ont ensuite été génotypés pour 384 marqueurs moléculaires et évalués pour la croissance et les propriétés chimiques du bois. Ces données moléculaires et phénotypiques ont permis de mettre en évidence des associations significatives entre la variation pour le diamètre du tronc ou la teneur en cellulose du bois et deux marqueurs situés respectivement dans un facteur de transcription HD-Zip (HDZ31) et dans un gène encodant une fascicline. La cohérence des résultats de génétique évolutive et de génétique d’association ouvre ainsi des perspectives encourageantes pour la compréhension de l’architecture génétique de la formation du bois chez cette espèce. Cependant, le faible nombre d’associations significatives pose de nombreux problèmes théoriques et méthodologiques qui sont discutés en vue d’améliorations pour de nouveaux designs expérimentaux
During the last four decades, the optimization of silvicultural and tree breeding methods has contributed to improve growth and wood homogeneity of maritime pine. In order to provide the different actors of the forestry wood-chain with high quality raw material, the genetic determinism and chemical components of wood quality are being studied in the frame of a multidisciplinary research program. First, nine transcription factors putatively involved in wood formation have been sequenced in the Aquitaine population, and their nucleotide diversity pattern studied. Since these genes potentially play important roles in the adaptation of trees to their environment, their patterns have been compared to those expected under neutral evolution. Strong departures from neutrality were observed, with high levels of linkage disequilibrium and an excess of intermediate frequency variants for three of them (HDZ31, LIM2 and MYB1), which could be linked to population size changes that affected the whole genome, and to balancing selection effects at one of them (MYB1). Secondly, the genitors of the Aquitaine breeding population were genotyped for 384 markers and evaluated for growth and wood chemical properties. Significant associations were detected for two markers, one in a HD-Zip transcription factor (HDZ31) with growth, and the other in a gene coding for a fasciclin protein with cellulose content. The consistency of evolutionary and molecular genetics opens encouraging perspectives for understanding the genetic architecture of wood formation in this species. However, the low number of associations detected raises several theoretical and methodological issues which are discussed for the perspective of improving future experimental designs

La présente étude traite des enjeux de la participation sociale liés au contexte de mixité sociale. L'objectif général est de décrire et de découvrir les facteurs et obstacles qui favorisent ou freinent la participation sociale des personnes vivant dans une habitation collective de mixité sociale. La stratégie de recherche est qualitative et l'étude de cas a été choisie pour tenir compte des concepts de participation sociale et de mixité sociale. Ainsi, la recherche a été réalisée auprès de l'organisme à but non lucratif (OBNL) Habitations Vivre Chez Soi. Les données du projet ont été recueillies auprès de huit personnes lors d'entrevues semi-dirigées, deux périodes d'observation participante ainsi que l'analyse de vingt documents écrits. Le portrait ainsi obtenu de la participation sociale a démontré que les facteurs et les obstacles sont à la fois de l'ordre individuel, interpersonnel, organisationnel et environnemental. De plus, l'analyse des résultats indique que certaines caractéristiques propres au phénomène de la mixité sociale ont un impact sur l'engagement des participants. À partir des constats empiriques mis en parallèle avec la théorie, le chercheur a identifié quelques pistes d'action pour les organisateurs communautaires ainsi que pour les décideurs qui gèrent ou aménagent un milieu d'habitation en mixité sociale afin de mobiliser et de maintenir la participation.
La présente étude traite des enjeux de la participation sociale liés au contexte de mixité sociale. L'objectif général est de décrire et de découvrir les facteurs et obstacles qui favorisent ou freinent la participation sociale des personnes vivant dans une habitation collective de mixité sociale. La stratégie de recherche est qualitative et l'étude de cas a été choisie pour tenir compte des concepts de participation sociale et de mixité sociale. Ainsi, la recherche a été réalisée auprès de l'organisme à but non lucratif (OBNL) Habitations Vivre Chez Soi. Les données du projet ont été recueillies auprès de huit personnes lors d'entrevues semi-dirigées, deux périodes d'observation participante ainsi que l'analyse de vingt documents écrits. Le portrait ainsi obtenu de la participation sociale a démontré que les facteurs et les obstacles sont à la fois de l'ordre individuel, interpersonnel, organisationnel et environnemental. De plus, l'analyse des résultats indique que certaines caractéristiques propres au phénomène de la mixité sociale ont un impact sur l'engagement des participants. À partir des constats empiriques mis en parallèle avec la théorie, le chercheur a identifié quelques pistes d'action pour les organisateurs communautaires ainsi que pour les décideurs qui gèrent ou aménagent un milieu d'habitation en mixité sociale afin de mobiliser et de maintenir la participation.

Les agents incarnés, qu'ils soient naturels ou artificiels, peuvent apprendre à interagir avec l'environnement dans lequel ils se trouvent par un processus d'essais et d'erreurs. Ce processus peut être formalisé dans le cadre de l'apprentissage par renforcement, dans lequel l'agent effectue une action dans l'environnement et observe son résultat par le biais d'une observation et d'un signal de récompense. C'est le signal de récompense qui indique à l'agent la qualité de l'action effectuée par rapport à la tâche. Cela signifie que plus une récompense est donnée, plus il est facile d'améliorer la solution actuelle. Lorsque ce n'est pas le cas, et que la récompense est donnée avec parcimonie, l'agent se retrouve dans une situation de récompenses éparses. Cela nécessite de se concentrer sur l'exploration, c'est-à-dire de tester différentes choses, afin de découvrir quelle action ou quel ensemble d'actions mène à la récompense. Les agents RL ont généralement du mal à le faire. L'exploration est le point central des méthodes de Qualité-Diversité, une famille d'algorithmes évolutionnaires qui recherche un ensemble de politiques dont les comportements sont aussi différents que possible, tout en améliorant leurs performances. Dans cette thèse, nous abordons le problème des récompenses éparses avec ces algorithmes, et en particulier avec Novelty Search. Il s'agit d'une méthode qui, contrairement à de nombreuses autres approches Qualité-Diversité, n'améliore pas les performances des récompenses découvertes, mais uniquement leur diversité. Grâce à cela, elle peut explorer rapidement tout l'espace des comportements possibles des politiques. La première partie de la thèse se concentre sur l'apprentissage autonome d'une représentation de l'espace de recherche dans lequel l'algorithme évalue les politiques découvertes. A cet égard, nous proposons l'algorithme Task Agnostic eXploration of Outcome spaces through Novelty and Surprise (TAXONS). Cette méthode apprend une représentation à faible dimension de l'espace de recherche dans des situations où il n'est pas facile de concevoir manuellement cette représentation. TAXONS s'est avéré efficace dans trois environnements différents mais nécessite encore des informations sur le moment où il faut saisir l'observation utilisée pour apprendre l'espace de recherche. Cette limitation est abordée en réalisant une étude sur les multiples façons d'encoder dans l'espace de recherche des informations sur la trajectoire complète des observations générées pendant une évaluation de politique. Parmi les méthodes étudiées, nous analysons en particulier la transformation mathématique appelée signature et sa pertinence pour construire des représentations au niveau de la trajectoire. Le manuscrit se poursuit par l'étude d'un problème complémentaire à celui abordé par TAXONS : comment se concentrer sur les parties les plus intéressantes de l'espace de recherche. Novelty Search est limitée par le fait que toute information sur une récompense découverte au cours du processus d'exploration est ignorée. Dans notre deuxième contribution, nous présentons l'algorithme Sparse Reward Exploration via Novelty Search and Emitters (SERENE). Cette méthode sépare l'exploration de l'espace de recherche de l'exploitation de la récompense par une approche en deux étapes alternées. L'exploration est effectuée par Novelty Search, mais lorsqu'une récompense est découverte, elle est exploitée par des instances de méthodes basées sur la récompense - appelées émetteurs - qui effectuent une optimisation locale de la récompense. Des expériences sur différents environnements montrent comment SERENE peut obtenir rapidement des solutions à forte récompense sans nuire aux performances d'exploration de la méthode. Dans notre troisième et dernière contribution, nous combinons les deux idées présentées avec TAXONS et SERENE en une seule approche :TAXONS augmentés par SERENE (STAX). Cet algorithme peut apprendre de manière autonome [...]
Embodied agents, both natural and artificial, can learn to interact with the environment they are in through a process of trial and error. This process can be formalized through the Reinforcement Learning framework, in which the agent performs an action in the environment and observes its outcome through an observation and a reward signal. It is the reward signal that tells the agent how good the performed action is with respect to the task. This means that the more often a reward is given, the easier it is to improve on the current solution. When this is not the case, and the reward is given sparingly, the agent finds itself in a situation of sparse rewards. This requires a big focus on exploration, that is on testing different things, in order to discover which action, or set of actions leads to the reward. RL agents usually struggle with this. Exploration is the focus of Quality-Diversity methods, a family of evolutionary algorithms that searches for a set of policies whose behaviors are as different as possible, while also improving on their performances. In this thesis, we approach the problem of sparse rewards with these algorithms, and in particular with Novelty Search. This is a method that, contrary to many other Quality-Diversity approaches, does not improve on the performances of the discovered rewards, but only on their diversity. Thanks to this it can quickly explore the whole space of possible policies behaviors. The first part of the thesis focuses on autonomously learning a representation of the search space in which the algorithm evaluates the discovered policies. In this regard, we propose the Task Agnostic eXploration of Outcome spaces through Novelty and Surprise (TAXONS) algorithm. This method learns a low-dimensional representation of the search space in situations in which it is not easy to hand-design said representation. TAXONS has proven effective in three different environments but still requires information on when to capture the observation used to learn the search space. This limitation is addressed by performing a study on multiple ways to encode into the search space information about the whole trajectory of observations generated during a policy evaluation. Among the studied methods, we analyze in particular the mathematical transform called signature and its relevance to build trajectory-level representations. The manuscript continues with the study of a complementary problem to the one addressed by TAXONS: how to focus on the most interesting parts of the search space. Novelty Search is limited by the fact that all information about any reward discovered during the exploration process is ignored. In our second contribution, we introduce the Sparse Reward Exploration via Novelty Search and Emitters (SERENE) algorithm. This method separates the exploration of the search space from the exploitation of the reward through a two-alternating-steps approach. The exploration is performed through Novelty Search, but whenever a reward is discovered, it is exploited by instances of reward-based methods - called emitters - that perform local optimization of the reward. Experiments on different environments show how SERENE can quickly obtain high rewarding solutions without hindering the exploration performances of the method. In our third and final contribution, we combine the two ideas presented with TAXONS and SERENE into a single approach: SERENE augmented TAXONS (STAX). This algorithm can autonomously learn a low-dimensional representation of the search space while quickly optimizing any discovered reward through emitters. Experiments conducted on various environments show how the method can i) learn a representation allowing the discovery of all rewards and ii) quickly [...]

L'optimisation de la biomasse produite par les taillis à courte rotation de peupliers représente un enjeu majeur pour la production de biocarburants de deuxième génération. Dans ce contexte, ce travail vise à faciliter le développement à court terme de nouvelles variétés clonales de peuplier permettant la production d'une ressource de qualité en s'intéressant plus particulièrement à l'architecture génétique de la résistance à la rouille foliaire et de la qualité du bois chez le peuplier noir (Populus nigra), espèce parente des hybrides cultivés. Des marqueurs SNP ont été développés à partir du séquençage de 665 fragments de gènes dans un panel de 21 individus. Ces derniers ont été associés à des marqueurs SSR et AFLP pour construire de nouvelles cartes génétiques sur une famille de 324 plein-frères clonés. Une technique de phénotypage à haut débit basée sur la spectrométrie à proche infrarouge a été développée pour prédire les teneurs en composés chimiques du bois ainsi que le rendement en saccharification. La mise en évidence d'une variabilité génétique importante pour l'ensemble des caractères a permis de cartographier les régions génomiques impliquées dans leur variation. Parmi les 11 QTL détectés pour la résistance, un QTL à effet majeur co-localise avec un QTL majeur associé à la résistance à la rouille foliaire du saule. Pour la qualité du bois, 15 QTL à effet faible à moyen ont été détectés, dont un cartographié sur le chromosome XIII qui colocalise avec des QTL précédemment identifiés chez le peuplier pour les teneurs en sucres et en lignines. Ce travail de thèse ouvre des perspectives d'identification de gènes sous-jacents aux QTL par génétique d'association.

L’amélioration génétique de la luzerne (Medicago sativa), une légumineuse fourragère autotétraploïde, pourrait bénéficier de l’allele mining. Cette méthode consiste à rechercher, dans la diversité naturelle, des allèles ayant potentiellement un effet sur le phénotype. Pour évaluer l’intérêt de cette stratégie qui exploite la diversité naturelle, cinq gènes impliqués dans des caractères sélectionnés ont été retenus : CAD1 et CCoaOMT (digestibilité), CONSTANS-like (rendement fourrager), NHX1 (tolérance à la salinité) et WXP1 (tolérance à la sécheresse). La diversité de ces gènes a été étudiée en séquençant 387 génotypes cultivés et 20 génotypes sauvages. L’analyse des données confirme la présence d’un goulot d’étranglement durant la domestication et la sélection de la luzerne. CONSTANS-like et WXP1 révèlent de nombreux variants alors que CAD1, CCoaOMT et NHX1 sont très peu variables. Des variants ayant un effet potentiel sur le phénotype ont été identifiés dans les zones de la séquence protéique qui sont conservées au sein des Faboideae. L’impact sur le phénotype de deux variants du gène CONSTANS-like a été étudié : Constans-634, à l’origine d’un codon stop prématuré et Constans-4111, situé dans une région conservée du gène. Pour cela des croisements ont été réalisés afin d’obtenir une descendance avec toutes les doses possibles (AAAA, AAAB, AABB, ABBB and BBBB) pour chaque mutation étudiée. Des marqueurs KASPar ont été développés afin de déterminer les doses de mutations chez les descendants. Aucun génotype homozygote muté pour Constans-634 n’a été détecté parmi les 1505 descendants. Ce variant a induit une floraison plus précoce de trois jours pour les génotypes portant trois doses d’allèle muté. Le variant Constans-4111 a induit un effet additif sur la hauteur de tige. Les génotypes homozygotes de type sauvage étaient en moyenne 11,8 cm plus petits que les génotypes homozygotes portant trois ou quatre doses du variant. L’intégration de la stratégie allele mining dans les schémas de sélection des espèces végétales autotétraploïdes hétérozygotes a été discutée
Lucerne (Medicago sativa) is an autotetraploid forage legume, whose breeding could beneficiate from allele mining. This strategy is based on the natural diversity and consists in seeking alleles with a potential effect on the phenotype. The interest of this approach was evaluated by studying five genes of agronomic interest: CAD1 and CCoaOMT (digestibility), CONSTANS-like (forage yield), NHX1 (salt tolerance) and WXP1 (drought tolerance). The diversity of these five genes was evaluated by sequencing 387 genotypes of cultivated accessions and 20 genotypes of wild accessions. The results confirmed a bottleneck during lucerne domestication and selection. CONSTANS-like and WXP1 were very variable whereas CAD1, CCoaOMT and NHX1 contained very few variants. Variants with a potential strong impact on the phenotype were identified in conserved parts of protein sequence within the Faboideae. The impact on phenotype was studied for two mutations of the CONSTANS-like gene: constans-634, causing a premature stop codon and constans-4111, located in a conserved region of the gene. Genotypes carrying one to three doses of the mutations (AAAB, AABB and ABBB) were polycrossed in order to obtain offsprings with every allele combination (AAAA, AAAB, AABB, ABBB and BBBB). KASPar markers were developed to determine the mutation doses in offspring progeny. No homozygous genotype was found for constans-634 in the 1505 offspring progeny. This mutation induced a premature flowering of three days for the genotypes carrying three doses of the mutation. The mutation constans-4111 induced an additive effect on stem height and the homozygous genotypes without the variant where on average 11.8 cm shorter than homozygous genotypes carrying three or four doses of the variant. The application of allele mining strategy in plant schemes of heterozygous autotetraploid species was discussed

La gestion des déchets constitue un problème majeur au niveau mondial. En agriculture, le retour au sol des résidus de culture est une pratique courante et constitue une opportunité intéressante pour maintenir la fertilité du sol et/ou pour stocker du carbone. La décomposition des matières végétales dans le sol est influencée par plusieurs facteurs (tels que la composition microbienne, la nature et qualité des matières végétales), et a pour acteurs principaux les microorganismes telluriques. Au-delà du retour au sol, d’autres voies de valorisation de la matière végétale non récoltée peuvent être envisagées, telle que sa transformation pour des usages non alimentaires. Dans le domaine du bâtiment, l’intérêt de l’utilisation de matériaux biosourcés (destinés à l’isolation thermique) est croissant et encouragé par les pouvoirs publics dans la construction ou la rénovation. Toutefois, à notre connaissance, la question de la gestion de la fin de vie de ces matériaux après déconstruction des bâtiments n’est pas encore abordée. Afin de mieux comprendre le retour aux sols agricoles de matières végétales de natures diversifiées (paille de blé, paille de colza et tiges de tournesol), nous avons combiné différentes caractérisations biochimiques/physicochimiques tels que le fractionnement biochimique, l’analyse thermogravimétrique et la spectroscopie infra rouge, avec l’étude de la dynamique microbienne (abondance, diversité, fonction), complétées du suivi de minéralisation du carbone et de l’azote durant 3 mois d’incubation, en microcosmes. La minéralisation des résidus de grandes cultures est principalement régie par des microbiodiversités initialement différentes, issues de la prairie permanente ou la grande culture, et dans une moindre mesure par leur qualité biochimique. Quant à la dynamique microbienne, elle est impactée par ces deux types de sols et la nature de apports. Dans le cas de coproduits contrastés de la tige de tournesol (moelle et écorce), la minéralisation du C est principalement dictée par leur qualité initiale. Concernant la mise en oeuvre d’un matériau biosourcé à base de moelle de tige de tournesol, elle semble favoriser sa minéralisation dans le sol. Le retour au sol de ce type de matériau pourrait donc constituer un moyen intéressant de gestion de sa fin de vie
Waste management is a major problem worldwide. In agriculture, the return of crop residues to the soil is a common practice and represents an interesting opportunity to maintain soil fertility and / or to store carbon. The decomposition of plant materials in soils is influenced by several factors (such as microbial composition, plant material’s nature and quality), and soil microorganisms are its main actors. Moreover, other ways of valorization of non-harvested plant materials are possible, such as their transformation for non-food applications. In the building industry, the interest in using biobased materials (for thermal insulation) is growing and encouraged by the public authorities in construction or renovation projects. However, to our knowledge, the issue of management of these materials end-of-life is not yet addressed, after deconstructing the buildings. In order to better understand different crop residues (wheat straw, rapeseed straw and sunflower stems) decomposition in agricultural soils, we have combined different biochemical / physicochemical characterizations such as biochemical fractionation, thermogravimetric analysis and infrared spectroscopy, with microbial dynamics monitoring (abundance, diversity, function), supplemented by carbon and nitrogen mineralization measures during 3 months incubation in microcosms. Crop residues mineralization is mainly governed by initially different microbiodiversities (derived from permanent grassland or conventional cropping system), and to a lesser extent by their biochemical quality. However, microbial dynamics are influenced by both, types of soils and nature of inputs. As for the sunflower stem coproducts (pith and bark), C mineralization is mainly dictated by their initial quality. Concerning the manufacturing process of a sunflower pith biobased material, it seems to favor its mineralization in soil. The return of this type of material to soil could thus constitute an interesting means of managing its end-of-life

Cette étude effectuée sur le lac Taabo ⁄ (Sud-Est de la Côte d’Ivoire), porte sur l’évaluation des paramètres de la qualité de l’eau, le peuplement phytoplanctonique, et le suivi de la production primaire. Ce lac de 69 km² se caractérise par une profondeur moyenne de 8 m, avec un temps de résidence moyen de 49,2 jours, une température moyenne de 29,5°C, absence de stratification; il concerne une population environnante de 140 000 habitants. Les entrées d’eaux dans le lac sont influencées par le barrage de Kossou situé en amont, la gestion hydroélectrique de Taabo, et le régime du fleuve Bandama qui est affecté par l’alternance saison des pluies, saison sèche. L’analyse des paramètres physico-chimiques a montré une homogénéité spatiale des eaux du lac de Taabo tandis qu’au niveau temporel une saisonnalité marquée est observée entre les périodes des pluies et celle de saison sèche. Cette saisonnalité est principalement imputable aux importantes variations de paramètres tels que la conductivité, la turbidité, la transparence et les éléments nutritifs (valeurs moyennes en nitrate et orthophosphate, respectivement de 1,62 et 10 mg.l-1). Le lac de barrage hydroélectrique est gouverné par la combinaison de deux gradients, celui de l’enrichissement en nutriments et celui de la minéralisation. L’aval du lac présente toutefois quelques particularités : minéralisation et oxygénation plus élevées qu’en amont, au niveau temporel. La chlorophylle a varie de 4,8 à 16,5 μg/l. Au niveau de la composition spécifique algale, 118 taxons repartis en 5 grands groupes et 45 genres ont été identifiés. Le peuplement algal est dominé par les chlorophycées (30,5 %) suivi par des cyanobactéries (27,1 %). La productivité varie de 0,4 à 0,8 mg Oxygène produit par mg Chl a-1 heure -1 (soit ± 2,31 à 4,6 mg C. mg Chl a-1. heure -1). Extrapolées à l’échelle annuelle, nos estimations de production primaire phytoplanctonique journalière se situent entre 1,5 à 2,66 g C m-2, avec une valeur annuelle de 167 à 306 g C m-2. Une étude théorique de la production des macrophytes implantés dans la zone amont et centrale, montre que ceux-ci représentent 77 % de la production primaire du lac. Ceux-ci affectent aussi les activités socio-économiques. Le lac Taabo est remarquable par les nombreux conflits d’usages liés à l’eau engendrées par la gestion hydraulique et les diverses activités humaines, aux quels se rajoutent des risques sanitaires (comme vecteurs de maladies humaines et des conflits d’usages, etc.).

L'optimisation joue un rôle essentiel dans la conception industrielle, mais ne se limite pas à la minimisation d'une simple fonction, comme le coût ou la résistance. Ces outils sont également utilisés dans les phases conceptuelles, pour mieux comprendre ce qui est possible. Pour soutenir cette exploration, nous nous concentrons sur les algorithmes de diversité de qualité (QD), qui produisent des ensembles de solutions variées et performantes. Ces techniques nécessitent souvent l'évaluation de millions de solutions, ce qui les rend peu pratiques dans les cas de conception. Dans cette thèse, nous proposons des méthodes pour améliorer radicalement l'efficacité des données de la QD avec l'apprentissage machine, permettant son application à la conception. Dans notre première contribution, nous développons une méthode de modélisation des performances des réseaux neuronaux évolués utilisés pour le contrôle et la conception. Les structures de ces réseaux se développent et changent, ce qui les rend difficiles à modéliser - mais grâce à une nouvelle méthode, nous sommes en mesure d'estimer leurs performances en fonction de leur hérédité, améliorant ainsi l'efficacité des données à plusieurs reprises. Dans notre deuxième contribution, nous combinons l'optimisation basée sur un modèle avec MAP-Elites, un algorithme QD. Un modèle de performance est créé à partir de modèles connus, et MAP-Elites crée un nouvel ensemble de modèles en utilisant cette approximation. Un sous-ensemble de ces conceptions est évalué pour améliorer le modèle, et le processus se répète. Nous montrons que cette approche améliore l'efficacité de MAP-Elites par des ordres de grandeur. Notre troisième contribution intègre des modèles générateurs dans MAP-Elites pour apprendre des codages spécifiques à un domaine. Un auto-codeur variationnel est formé sur les solutions produites par MAP-Elites, capturant la "recette" commune pour une haute performance. Ce codage appris peut ensuite être réutilisé par d'autres algorithmes pour une optimisation rapide, y compris MAP-Elites. Tout au long de cette thèse, bien que notre vision se concentre sur la conception, nous examinons les applications dans d'autres domaines, comme la robotique. Ces avancées ne sont pas exclusives à la conception, mais servent de travail de base à l'intégration de la DQ et de l'apprentissage machine
Optimization plays an essential role in industrial design, but is not limited to minimization of a simple function, such as cost or strength. These tools are also used in conceptual phases, to better understand what is possible. To support this exploration we focus on Quality Diversity (QD) algorithms, which produce sets of varied, high performing solutions. These techniques often require the evaluation of millions of solutions -- making them impractical in design cases. In this thesis we propose methods to radically improve the data-efficiency of QD with machine learning, enabling its application to design. In our first contribution, we develop a method of modeling the performance of evolved neural networks used for control and design. The structures of these networks grow and change, making them difficult to model -- but with a new method we are able to estimate their performance based on their heredity, improving data-efficiency by several times. In our second contribution we combine model-based optimization with MAP-Elites, a QD algorithm. A model of performance is created from known designs, and MAP-Elites creates a new set of designs using this approximation. A subset of these designs are the evaluated to improve the model, and the process repeats. We show that this approach improves the efficiency of MAP-Elites by orders of magnitude. Our third contribution integrates generative models into MAP-Elites to learn domain specific encodings. A variational autoencoder is trained on the solutions produced by MAP-Elites, capturing the common “recipe” for high performance. This learned encoding can then be reused by other algorithms for rapid optimization, including MAP-Elites. Throughout this thesis, though the focus of our vision is design, we examine applications in other fields, such as robotics. These advances are not exclusive to design, but serve as foundational work on the integration of QD and machine learning

Dans le contexte de l'intérêt croissant des régulateurs, des législateurs et de la recherche universitaire pour l'identité des commissaires aux comptes, cette thèse explore l'environnement français de co-commissariat qui impose aux sociétés préparant des états financiers consolidés de nommer conjointement deux cabinets d'audit. Le collège des commissaires aux comptes peut inclure des auditeurs externes du même genre (deux hommes, deux femmes) ou de genre différent (un homme et une femme). Nous souhaitons examiner les facteurs liés à la demande et à l'offre des services d’audit externe apportés par des commissaires aux comptes de genre différent. Nous soutenons qu’un audit mené par un collège mixte de commissaires aux comptes est plus susceptible de promouvoir un suivi efficace et un comportement collaboratif en ce qui concerne le processus d'audit et peut influencer positivement la qualité de l'audit. Nous examinons l'effet de la composition du collège de commissaires aux comptes sur les honoraires d'audit et sur la qualité des résultats comptables. Nous utilisons des données sur les sociétés françaises cotées en bourse soumis au principe de co-commissariat et appliquons des procédures économétriques appropriées pour atténuer les problèmes d'endogénéité. Nos résultats empiriques montrent qu’un collège mixte de commissaires aux comptes bénéficie en moyenne d’une prime de 11% sur les honoraires d'audit et l’audit conduit par ce type de collège réduit davantage les incitations à la manipulation des résultats comptables. Nous examinons comment la diversité du genre des conseils d’administration des entreprises clientes affecte la composition du collège de commissaires aux comptes quant à sa mixité homme/femme. Nous montrons que les femmes administrateurs, occupant des postes clés de contrôle au sein du conseil d'administration (entant qu’indépendantes ou membres du comité d’audit) ont plus tendance à sélectionner un collège mixte de commissaires aux comptes et que ce phénomène est encore plus accentué après la promulgation de la loi sur les quotas en faveur des femmes dans les conseils d’administration
In the context of rapidly increasing interest of regulators, legislators and academic research in the identity of audit engagement partners, this dissertation explores French mandatory joint audit environment where firms preparing consolidated financial statements are jointly audited by two independent audit firms. The composition of joint audit partners may include same gender audit partners (two male, two female) or gender-diverse audit partners (one male and one female). This dissertation aims to examine whether gender-diverse audit partners provide higher audit quality compared with same gender audit partners. We argue that gender-diverse engagement partners are more likely to promote effective monitoring and collaborative behavior with regard to audit process and may positively influence audit quality. We investigate the issue of audit quality by examining input- and output-based measures, namely, audit fees and discretionary accruals. We use data on French listed firms and apply appropriate econometrical procedures to alleviate concerns about endogeneity issues. The empirical findings show that gender-diverse audit partners charge 11% audit fee premium and their clients exhibit lower levels of absolute and signed discretionary accruals. Collectively, we provide considerable evidence that gender-diverse audit partners produce higher-quality audits. In the aftermath of gender quota legislation, the current dissertation also examines whether gender profile of audit clients affect the selection/assignment of gender-diverse audit partners. Contrary to the gender similarity (homophily) argument—based on comprehensive analyses of client-partner gender alignments—we provide compelling evidence that that female directors appointed to monitoring positions on the board, compared to female inside directors, tend to select higher quality “auditor pairs” (i.e., gender-diverse engagement partners)

En Haïti, plusieurs ménages sont en situation d’insécurité alimentaire, c’est-à-dire qu’ils n’ont pas accès à une alimentation suffisante, saine et nutritive pour assurer leur santé. Cependant, peu d’études ont examiné les déterminants du problème au niveau des ménages. À l’aide d’une méthodologie quantitative, cette étude a exploré les déterminants de l’accès et de la qualité alimentaire (deux dimensions de la sécurité alimentaire) auprès de 529 ménages dans le département de la Grande Anse. Selon les résultats, la majorité des ménages avait une alimentation de faible qualité nutritionnelle. Un accès alimentaire insuffisant était aussi très répandu avec plus de deux tiers des ménages rapportant des expériences de privation alimentaire. Nos résultats ont de plus confirmé que les déterminants de l’insécurité alimentaire étaient multidimensionnels. En effet, l’accès et la qualité alimentaire ont été associés à des caractéristiques démographiques, géographiques et socio-économiques des ménages et des répondantes. Nos résultats soulignent l’importance des interventions multisectorielles ciblant à la fois les ménages et les individus, particulièrement les femmes, dans la lutte contre l’insécurité alimentaire en Haïti.

La nutrition est l'ensemble des processus par lesquels un être vivant transforme des aliments pour assurer son fonctionnement. Etudier la nutrition d’un organisme permet de comprendre les rapports entre la nourriture consommée et la santé de l’individu. L'ensemble des organes assurant l'extraction d'énergie est le système digestif, qui transforme les sucres en glucose, les corps gras en acides gras, et les protéines en acides aminés. L’objectif de cette étude est de déterminer l’influence que peut avoir la nutrition pollinique sur la santé de l’abeille domestique, Apis mellifera L.. Pour assurer cette nutrition, l’abeille est inféodée aux ressources florales. Du pollen récolté sur les plantes à fleurs, l’organisme puise les corps gras (ou lipides), les vitamines et les protéines. Or l’accès à ces ressources est variable en qualité, en quantité, et en diversité selon le temps et le milieu. Des problèmes de mortalités et affaiblissements des colonies sont observés depuis une vingtaine d’années, et l’une des causes suspectées est le manque de disponibilité et la faible valeur nutritionnelle des ressources polliniques en zones agricoles céréalières. Nous avons donc testé en conditions contrôlées les effets de la quantité, la qualité et la diversité pollinique sur la physiologie d’abeilles nourrices, sur leur immunité, ainsi que sur leur survie. La nutrition jouant un rôle essentiel dans la prévention de nombreuses maladies, les effets de l’alimentation pollinique ont été déterminés en présence ou non d’un stresseur biotique, Nosema ceranae, dont la prévalence dans les colonies est très élevée. Il s’agit d’une microsporidie invasive qui se développe dans l’intestin de son hôte, provoquant divers effets sublétaux et létaux. Etant donné que la valeur nutritionnelle d’un aliment dépend de sa composition mais aussi de sa digestibilité, une troisième partie porte sur l’influence que peut avoir le stresseur sur les capacités de digestion des protéines contenues dans le pollen par l’abeille. Nos résultats apportent des connaissances sur l’impact d’une déplétion en pollen que peuvent subir les colonies dans un paysage d’agriculture intensive. En effet, des abeilles carencées à plus ou moins 60 %, comme cela peut être observé entre deux cultures à floraison massives, subissent des perturbations au niveau individuel (perturbations du développement physiologique des abeilles nourrices, diminution de leur survie), ce qui peut les rendre moins performantes et plus sensibles aux stress présents dans l’environnement. De plus, nous avons pu démontrer que la valeur nutritionnelle des pollens, influence la tolérance des abeilles à Nosema ceranae. La qualité d’un pollen se définit par sa composition chimique totale (protéines, acides aminés, lipides, vitamines, sucres, etc…), et non pas uniquement par sa teneur en protéines ou acides aminés essentiels. Notre étude met d’ailleurs en évidence l’effet négatif d’une alimentation à base de pollen de maïs sur le développement des glandes hypopharyngiennes, l’expression du gène de la vitellogénine, et la survie des abeilles. Au regard de la présence élevée de cette culture dans les zones d’agriculture intensive et sa haute exploitation par les butineuses, nos résultats sont discutés en fonction des répercussions envisagées sur les colonies. Dans ces milieux, la diversité des ressources polliniques, par l’apport de pollens de qualité, compense la pauvreté nutritionnelle d’autres pollens. Dans nos conditions, nous pouvons observer la plus-value d’une alimentation pollinique polyflorale chez des abeilles infestées par Nosema. Les mesures agro-écologiques œuvrant pour régulariser dans le temps les apports polliniques aux colonies, et pour leur offrir une diversité alimentaire participent donc à renforcer leur capacité à lutter contre les stress présents dans l’environnement
Nutrition is the set of processes by which a living organism transforms food for its functions. Studying nutrition allows to understanding the relationship between food intake and health of the individual. All organs for extracting energy are the digestive system, which converts sugars into glucose, fats into fatty acids, and proteins into amino acids. The objective of this study is to determine the possible influence of pollen nutrition on the honeybee health, Apis mellifera L. To ensure that nutrition, the bee is subservient to floral resources. Of pollen collected from the flowering plants, the body draws fats (or lipids), vitamins and proteins. Access to these resources is variable in quality, quantity, and diversity depending on the time and the environment. Problems of mortality and weakening of colonies are observed for some twenty years, and one of the suspected causes is the lack of availability and low nutritional value of pollen resources in agricultural areas. We therefore tested under controlled conditions the effects of quantity, quality and diversity of pollen on nurse worker physiology and on their immunity, as well as their survival. Nutrition plays a vital role in the prevention of many diseases, the effects of pollen diet were determined in the presence or absence of a biotic stressor, Nosema ceranae, whose prevalence in the colonies is very high. It is an invasive microsporidia that develops in the intestine of its host, causing various sublethal and lethal effects. Since the nutritional value of a food depends on its composition but also its digestibility, a third part focuses on the possible influence of the stressor on bee ability digestion of the proteins provided by the pollen.Our results provide knowledge on the impact of pollen depletion that may undergo the colonies in an intensive agricultural landscape. Indeed, bees starved to roughly 60%, as can be observed between two cultures massive flowering undergo disturbances at individual level (disturbances of nurse worker physiological development, reduced survival), which may make them less efficient and more susceptible to stress from the environment. In addition, we demonstrated that the nutritional value of pollen influences the Nosema ceranae‘s bee tolerance. The pollen quality is determined by the total chemical composition (proteins, amino acids, lipids, vitamins, sugars, etc ...), not only by its content of essential amino acids or proteins. Our study also demonstrated the negative effect of a diet based on maize pollen on hypopharyngeal glands development, the vitellogenin gene expression, and the bee survival. In view of the high presence of this culture in intensive agriculture areas and high exploitation by foragers, our results are discussed in terms of their impact on the proposed settlements. In these environments, the diversity of pollen resources by providing pollen of quality compensates nutritional poverty of other pollens. In our conditions, we can observe the gain of power of a polyfloral pollen in Nosema infested bees. Agro-ecological measures working to regularize, in time, the pollen contributions to the colonies, and to provide them with food diversity thus participate in building their capacity to fight against stress in the environment

L'écosystème océanique Néo-Calédonien dans le Pacifique sud-ouest contient une forte diversité de prédateurs, comme les oiseaux marins ou les cétacés. La récente création du Parc naturel de la mer de corail a ouvert un besoin d'informations solides sur le fonctionnement de cet écosystème remarquable, notamment sur la dynamique du micronecton (organismes entre 1 et 20cm constituant la nourriture des prédateurs supérieurs) et de son rôle central dans les réseaux alimentaires, d'autant plus que ce maillon est le plus méconnu. Dans ce contexte, cette thèse a montré une forte influence de l’environnement sur sa distribution spatiale et saisonnière avec en moyenne plus de micronecton dans le sud que dans le nord, et plus en hiver qu’en été. Les espèces composant le micronecton sont plus riches en crustacés au nord en céphalopodes et poissons au sud. L’abondance de micronecton aurait tendance à diminuer sous l’influence du changement climatique. Enfin, nous avons montré que la répartition spatiale de ce groupe influençait la présence de six groupes de prédateurs : thon jaune, thon germon, dorade coryphène, dauphins, puffin et fou à pieds rouges
The New Caledonian pelagic ecosystem in the southwest Pacific contains a high diversity of predators, such as seabirds and cetaceans. The recent creation of the Natural Park of the Coral Sea created a need for solid information on the functioning of this remarkable ecosystem, particularly on the dynamics of the micronecton (organisms between 1 and 20 cm constituting food of top predators) and its central role in food webs, especially since is the most poorly understood. In this context, this PhD showed a strong influence of environment on its spatial and seasonal distribution with on average more micronekton in the south than in the north, and more in winter than in summer. The species composing the micronecton are riche in crustaceans in the north and in cephalopods and fish in the south. The micronecton abundance would tend to decrease under the influence of climate change. Finally, we showed that the spatial distribution of this group influenced the presence of six groups of predators: yellowfin tuna, albacore tuna, dolphin, dolphin, shearwater and red-footed body

Le rôle de la méiofaune sur le fonctionnement des biofilms lotiques a été examiné par l'étude de son effet potentiel sur la capacité de consommation de l'azote des biofilms, au cours de quatre expérimentations. Les deux premières (Chapitres 2 et 3) concernent les biofilms épilithiques (phototrophes) tandis que les deux autres ont porté sur les biofilms (hétérotrophes) de la zone hyporhéique. Les biofilms sont soumis (1) à différents niveaux de densités (méiofaune) et à un enrichissement en nutriments ou (2) à différents niveaux de diversité (biofilm/méiofaune/macrofaune). Une partie des microcosmes présentant chaque niveau de diversité a été exposée à l'effet d'un herbicide, le diuron. Dans l'ensemble, la méiofaune associée aux biofilms des microcosmes était largement dominée par les rotifères. Les résultats basés sur les biofilms phototrophes montrent que les rotifères peuvent répondre à court terme, à un enrichissement en N-NO3 par une augmentation significative de leur densité et biomasse. De plus, le taux de consommation de N-NO3 est apparu significativement plus élevé dans les microcosmes dont les densités de méiofaune étaient les plus élevées. Cet effet positif de la méiofaune sur la consommation de N- NO3 par les biofilms a été retrouvé dans l'étude basée sur le biofilm hyporhéique pour les microcosmes non soumis aux effets du diuron. Dans l'ensemble, ce travail met donc en évidence le rôle significatif que peut avoir la méiofaune dans les processus de consommation de l'azote par les biofilms lotiques. De plus, les résultats suggèrent fortement que les invertébrés interagissent avec les micro-organismes impliqués dans les processus de réduction des concentrations en azote, dans le biofilm phototrophe comme dans le biofilm hyporhéique. Enfin, l'exposition à l'herbicide a engendré une modification significative du taux de consommation de N-NO3 dans les microcosmes hyporhéiques. Cependant, la comparaison du taux de consommation moyen de N-NO3 entre les traitements exposés à l'herbicide et ceux non exposés, a montré que la présence des invertébrés (méiofaune + macrobenthos) a significativement réduit l'effet du diuron sur ces processus. Cette étude met en exergue le rôle potentiellement important des interactions micro- organismes - invertébrés dans (1) le cycle de l'azote des biofilms et donc, dans les fonctions relatives à leur contribution aux processus " d'auto-épuration " des cours d'eau, et (2), dans la capacité de résistance des écosystèmes hyporhéiques face aux perturbations chimiques
The role of meiofauna on the functioning of riverine biofilms was examined by studying their potential effect on nitrogen consumption capacity of biofilms in four experiments (Chapters 2 and 3: epilithic phototrophic biofilms; Chapters 4 and 5: heterotrophic biofilms of hyporheic zone). Biofilms are subjected to (1) different levels of densities (meiofauna) and nutrient enrichment or (2) different levels of diversity (biofilm/meiofauna/macrofauna). A part of the microcosms of each level of diversity was exposed to the effect of an herbicide, diuron. Overall, biofilm-associated meiofauna in microcosms was dominated by rotifers. Results in phototrophic biofilms showed that the response of rotifers to short-term nutrient enrichment was significant increases in their density and biomass. In addition, N-NO3 uptake rates appeared significantly higher in microcosms with highest meiofauna densities. This positive effect of meiofauna on biofilm N-NO3 uptake was also found in hyporheic biofilm microcosms, but not under the effect of diuron. Therefore, this thesis highlights that meiofauna can have a significant role in nitrogen consumption processes by lotic biofilms. In addition, the results strongly suggest that invertebrates interact with microorganisms involved in the reduction processes of nitrogen concentrations in the phototrophic biofilm as well as the hyporheic biofilm. Finally, the herbicide exposure resulted in a significant modification of N-NO3 uptake rate in hyporheic microcosms. However, the comparison of the average N- NO3 uptake rate between treatments exposed to herbicide and those unexposed, showed that the presence of invertebrates (meiofauna + macrofauna) significantly reduced the effect of diuron on these processes. This study highlights the potentially important role of microorganism-invertebrate interactions (1) in the nitrogen cycle of biofilms and thus functions related to their contribution to the "self-purification" process in streams, and (2) in resilient capacity of the hyporheic ecosystem to chemical perturbations

Les prairies semi-naturelles constituent des espaces multifonctionnels susceptibles de rendre de nombreux services à la société. Ce sont en particulier des agro-écosystèmes favorables à l'expression d'une grande diversité floristique et faunistique permettant de concilier enjeux écologiques et agronomiques. Ce travail de thèse vise à analyser (i) l'influence des facteurs environnementaux sur l'assemblage des communautés in situ et (ii) les relations entre la structure fonctionnelle des assemblages (i.e. valeurs de traits agrégées et diversité fonctionnelle) et leurs performances (i.e. production de biomasse et digestibilité de cette biomasse). Cette étude s'appuie sur des approches expérimentales et de terrain dans les prairies humides pâturées du Marais Poitevin. Nos résultats montrent des réponses très différentes des traits aériens et racinaires étudiés aux gradients de stress et de perturbation rencontrés dans ces prairies. Ils ont également permis de mettre en évidence l'influence prépondérante des valeurs de traits agrégées sur la fourniture de services écosystémiques (i.e. productivité et digestibilité du fourrage), en accord avec la "Biomass ratio hypothesis" énoncée par Grime. L'influence du niveau de diversité fonctionnelle sur les services rendus par les assemblages varie selon le service considéré. Contrairement aux résultats attendus selon la "Diversity hypothesis" énoncée par Tilman, le niveau de diversité fonctionnelle est lié négativement à la productivité des assemblages. En revanche, un effet positif de la diversité fonctionnelle sur la digestibilité a été mis en évidence. Cette étude a par ailleurs permis de montrer un compromis entre la productivité des assemblages et la digestibilité de la biomasse produite dans ces prairies humides. Ce travail suggère que des outils de diagnostics de la valeur fourragère du couvert peuvent être construits sur la base de la structure fonctionnelle des assemblages, et ce avec un haut niveau de fiabilité. Il met également en avant les bénéfices agronomiques associés à l'hétérogénéité des couverts végétaux rencontrés dans ces prairies.

Les pratiques d'assolement pourraient améliorer la qualité des paysages agricoles pour l'avifaune, et plus généralement pour la biodiversité. Les relations entre avifaune et cultures sont habituellement abordées aux échelles locales (valeurs des différentes cultures comme habitat) et nationales (analyses de tendances), mais peu à celle du paysage. Nous avons confronté les données du Suivi Temporel des Oiseaux Communs sur environ 500 paysages de 400 ha à des données d'occupation du sol à haute résolution. Pour paramétrer des modèles de réponse de l'avifaune, nous avons exploité les variations entre paysages distants (modèles synchroniques), et les variations de paysages suivis d'une année à l'autre (modèles diachroniques). Nous avons observé d'une part que la valeur des cultures comme habitat ne préjuge pas des réponses à l'échelle du paysage, et d'autre part que les réponses synchroniques sont plus fortes que les diachroniques, et parfois contraires. Nous en déduisons une disjonction entre la qualité du paysage pour l'avifaune et l'effet immédiat de son attractivité sous l'effet des cultures. Les réponses sont modestes et variables selon les contextes paysagers et géographiques. Elles sont plus marquées en contexte de bocage et concernent davantage les spécialistes agricoles que l'ensemble de la communauté. La diversité des cultures est favorable ou neutre selon les cas. L'intérêt des modèles prenant en compte explicitement les interactions entre cultures nous permet de conjecturer que la valeur de chaque culture comme habitat n'est pas fixe et dépend de leur combinaison. Les signaux détectés par cette étude corrélative sont faibles et doivent être interprétés comme tendances qui ne permettent pas de produire du conseil dans des situations particulières. Si l'on considère les niveaux des filières et des territoires, les résultats remettent en cause certains modèles simples utilisés pour réaliser des évaluations
The management of crop mosaic could improve the quality of agricultural landscapes for birds, and more generally for biodiversity. Knowledge is available at the field (crop suitability) and national scales (trend analysis), but few at the landscape scale. We therefore linked the French Breeding Bird Survey on about 500 landscapes of 400 hectares, with a high-resolution multi-years land use database. Response models linking birds to crop mosaics were set, based on the variations between separate landscapes (synchronic models), and the variations of landscapes from one year to the other (diachronic models). We found that the information on crop suitability did not allow for prediction at the landscape scale and that the synchronic responses were stronger than diachronic ones, sometimes opposite. We deduced a disjunction between the landscape quality for birds and the immediate effect of its attractiveness under crop influence. Synchronic responses were modest, and varied with the landscape and geographical contexts. They were more pronounced in complex landscapes with grass and hedges, and for farmland birds compared to the whole bird community. We found that the responses to crop diversity were positive or neutral. The interest of the models taking into account explicitly the interactions between crops allows us to suggest that the crop suitability is not invariable but depends on the crop combination. The signals detected by this study were low and should be interpreted as trends that do not allow advice in specific situations. However, the results challenge some simple models used to perform biodiversity assessments on territories or agri-food and feed chains

L’alimentation durable et saine est un facteur important qui peut avoir un impact sur la santé et le bien-être optimal d’un individu. Chez la femme, elle constitue l’un des principaux facteurs d’influence de son statut nutritionnel, du développement du fœtus, de la santé de l’enfant à court et à long terme. Il est alors primordial que les femmes, avant la conception et pendant la grossesse aient une alimentation de qualité afin de réduire les prévalences de morbidité et de mortalité maternelles et néonatales. L’objectif de l’étude est d’apprécier la qualité du régime alimentaire et les changements dans l’alimentation avant et pendant grossesse. De façon spécifique, nous avons étudié la diversité alimentaire, les apports en énergie et nutriments, le niveau de couverture des besoins en nutriments avant et pendant la grossesse ainsi que les facteurs influençant la qualité de l’alimentation dans les communes d’Abomey-Calavi et de Sô-Ava au sud du Bénin (Afrique de l’Ouest).Une cohorte de 897 femmes a été recrutée suite à un test de grossesse révélé négatif et 234 ont été suivies jusqu’à l’accouchement. Les scores de diversité alimentaire des femmes (WDDS) ont été calculés à partir de données de rappel de 24h en utilisant les 10 groupes d’aliments définis par la FAO pour les femmes en âge de procréer. La compilation d’une table de composition des aliments et l’élaboration d’une table et d’un catalogue de recettes ont permis d’apporter une contribution à l’estimation des apports nutritionnels au Bénin. En plus de l’énergie et des macronutriments, au total 8 minéraux (Fer, calcium, magnésium, zinc, sodium, potassium, phosphore et cuivre) et 10 vitamines (C, D, E, B1, B2, B3, B5, B6, B9 et B12) ont été explorés. Les modèles de régressions linéaires et logistiques à effets mixtes ont été utilisés pour les analyses statistiques.Les résultats ont montré qu’à la préconception, le WDDS moyen des femmes (4,3±1,1) était faible et n’a pas changé de façon significative pendant la grossesse. Le régime alimentaire était principalement composé de céréales, d'huile, de légumes et de poissons. La parité des femmes et l'indice de richesse des ménages étaient positivement associés au WDDS avant et pendant grossesse. Une comparaison des apports moyens en nutriments a montré que les femmes absorbaient moins d'énergie, de protéines, de glucides, de fer, de calcium, de phosphore, de vitamines D, B1, B3, B9 et B12 pendant la grossesse qu’avant grossesse. Les apports moyens en magnésium, en vitamines C, D et B12 ont atteint les apports nutritionnels recommandés avant la grossesse, en raison de la forte consommation d'arachides, de afitin (graines de néré fermentées) pour le magnésium, de patate douce, piment, ananas, agrumes et mangues pour la vitamine C, d'espèces de poissons riches en vitamine D comme la silure, le salomon, de crabes et d’huîtres pour la vitamine B12. Avant grossesse, plus de 50% des femmes ont atteint les apports journaliers recommandés en macronutriments, sodium, vitamine D et B12 contre moins de 50% pendant grossesse, à l'exception du sodium glucidique et de la vitamine B12.En conclusion, la qualité de l’alimentation des femmes au Sud-Bénin est inadéquate aussi bien avant que pendant grossesse. Des efforts doivent être déployés pour encourager les femmes et les communautés à améliorer la diversité des régimes alimentaires à partir de choix alimentaires sains et durables ancrés dans leur système alimentaire local. Il est prioritaire de faire des recherches qualitatives complémentaires sur les facteurs socioculturels et institutionnels qui influencent le choix alimentaire des femmes avant et pendant grossesse pour mieux comprendre les perceptions des populations sur la consommation alimentaire. De plus les institutions de santé et de nutrition au Bénin devraient supporter le développement d’une table nationale de composition des aliments et des recettes pour une optimisation de l’appréciation des ingérés alimentaires
Dietary pattern is an important and modifiable lifestyle that can influence individual health and well-being. For women, it is one of the main determinants of her nutritional statut, of embryo and fetal development. It is essential that women have a quality diet in order to reduce the prevalence of maternal and neonatal morbidity and mortality, before conception and throughout pregnancy. This is important and worrying, because it’s now a consensus that maternal nutrition influences the health of the child not only in the short term but also in the long term. In developing countries, studies are increasingly focusing on the assessment of the quality of the diet and the nutritional status of women during pregnancy, but very few follow up them from preconception to delivery.The present study, which has recruited 897 women before pregnancy, of whom 234 have been followed up to delivery, had aimed to assess the quality of the diet and the changes in women's diets before and during pregnancy. This assessment was made through the study of dietary diversity and the level of coverage of nutrient requirements in Abomey-Calavi and Sô-Ava dostricts in southern Benin. Dietary diversity score and his influencing factors, the energy and nutrient intakes, and the level of satisfaction of the recommended dietary allowences were compared before and during pregnancy.At inclusion, women entered in the first phase of follow up called "primary cohort" and once they were pregnant, they were considered to second phase called "secondary cohort". Women were included after a negative pregnancy test. They were received a 24-hours recall questionnaire at baseline and one at each trimester of pregnancy. Womens’ dietary diversity scores (WDDS) were calculated using the 10 food groups defined by FAO. Food composition table compiled, recipe table elaborated and a recipe catalog (with average quantification of each ingredient) allowed to determine their nutritional intakes in Benin. In addition to energy and macronutrients (carbohydrates, proteins and lipids), a total of 8 minerals (iron, calcium, magnesium, zinc, sodium, potassium, phosphorus and copper) and 10 vitamins (C, D, E, B1, B2, B3, B5, B6, B9 and B12) were explored. Mixed-effect linear and logistic regression models were used for statistical analysis.The results showed that at preconception the mean WDDS was low (4.3±1.1 food groups) and the diet was mainly composed of cereals, oils, vegetables, and fish. This mean WDDS did not change during pregnancy and was equally low at all trimesters. Parity and household wealth index were positively associated with the WDDS before and during pregnancy. Women had lower intakes of vitamins D, B1, B3, B9 and B12 during pregnancy compare to preconceptional period (p<0.05). More than 50% of women had adequate vitamin intake only for vitamin D and B12. The lowest proportions (less than 10%) were observed for vitamin B1, B2, B3, B5 and B9. The median intake of magnesium, vitamin C, D and B12 achieved the RDA before pregnancy, because of large consumption of peanut, fermented seed of nere, of potatoes, chilli peper, pineapple, citrus fruits and mangos, of fish species rich in vitamin D such as catfish or salomon, of horse mackerel, crab and oysters. Higher than 50% of women were reached RDA for macronutrients, sodium, vitamin D and B12 before pregnancy. But during pregnancy, lower than 50% were cover recommended intake excepted for carbohydrate sodium and vitamin B12. Additional qualitative researches on determinants of women's food consumption before and during pregnancy in Benin are necessary. Actions should be carried out to provide Benin with a national food and recipes composition table. Women should be informed on the importance of nutrients and the food sources of these nutrients

La main d'oeuvre québécoise vit une diversification majeure dans sa composition depuis déjà plusieurs années. Cette main d'oeuvre devient, à chaque année, de plus en plus multiculturelle. Selon l'Institut de la statistique du Québec, le pourcentage de la population active immigrante était de 12,3% en 2008. De cet état de fait, la gestion de la diversité devient un enjeu pour les entreprises. Plus précisément, il s'agit pour le supérieur immédiat d'être capable de comprendre les comportements et attitudes au travail de tous les travailleurs, peu importe leur origine, afin d'agir de façon à ce qu'ils atteignent les objectifs de travail et de performance. Cette étude s'inscrit dans cette problématique. Elle a pour objectif de vérifier si certains styles de leadership contribueraient plus à augmenter la qualité du LMX lorsque nous sommes dans un contexte de diversité culturelle. Plusieurs recherches ont déjà démontré que le LT est apprécié à travers de nombreuses cultures et qu'il contribuait à augmenter la qualité du LMX. L'apport de notre recherche est d'étudier la relation entre le LA et le LMX. Nous avons posé comme hypothèses que le LA est positivement lié au LMX et qu'il apporte quelque chose de nouveau au lien entre le LT et le LMX, de sorte que la variance expliquée augmente significativement lorsque l'on introduit le LA dans l'équation de régression qui lie le LT au LMX. Nous avons aussi considéré l'effet des traits culturels comme variable modératrice de cette relation. Afin de répondre à notre objectif, nous avons développé un questionnaire que nous avons administré, version papier et électronique, à des employés répartis dans trois entreprises et oeuvrant dans les secteurs des transports, de la production / transformation et des télécommunications. Notre échantillon compte 210 répondants, ce qui présente un taux de réponse de 80%. Nos analyses de régression multiple linéaire selon la méthode «pas à pas» nous ont permis de constater que le LA est positivement lié au LMX. Bien que la force de la relation soit assez élevée, elle ne l'est pas plus que le LT. D'autre part, nos analyses de régression hiérarchique selon la méthode pas à pas nous ont permis d'identifier que seul l'individualisme / collectivisme est directement lié à la relation entre le LA et le LMX. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Leadership authentique, Leadership transformationnel, Leader-member exchange, Diversité culturelle.

Sur le raisin coexiste, dans un système organisé, une grande variété de microorganismes, dont une partie comprend les principales espèces utiles à la vinification. Après le foulage, les interactions entre les levures et les bactéries assurent les fermentations alcoolique et malolactique et, après le sulfitage, les suivis des espèces résiduelles suggèrent que ces interactions persistent durant la période d'élevage du vin ce qui peut conduire à une altération des vins si des espèces comme la levure Brettanomyces bruxellensis persistent et se multiplient. La compréhension de ces évolutions implique une vision globale de la diversité microbienne. Chaque opération technologique et chaque processus fermentaire influence la diversité des espèces et des souches présentes. Globalement, le système se simplifie car le vin devient de plus en plus carencé et toxiques pour les micro-organismes. O. oeni et B. bruxellensis sont les espèces les plus résistantes. Des collections de ces espèces isolées de vin ont été étudiées. La diversité intraspécifique est révélée par des études phénotypiques et génétiques pour la première. La variabilité dans la production des phénols volatils, qui altèrent le vin est démontrée chez la seconde.