Thematische Bibliographien / Position 2 des protéines

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Auswahl der wissenschaftlichen Literatur zum Thema „Position 2 des protéines“

Autor: Grafiati

Veröffentlicht am 25. Mai 2024

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Zeitschriftenartikel zum Thema "Position 2 des protéines"

HODEN, A., B. MARQUIS und L. DELABY. „Association de betteraves fourragères à une ration mixte d’ensilages de maïs et de trèfle violet pour vaches laitières“. INRAE Productions Animales 1, Nr. 3 (11.07.1988): 165–69. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.1988.1.3.4448.

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Des betteraves fourragères entières ont été distribuées (20 kg/j) en complément d’une ration mixte d’ensilages de maïs et de trèfle violet afin de mettre en évidence leurs effets sur les performances des vaches laitières. Cette association a permis d’améliorer les productions de lait (+ 2 kg/j) et de matière utile (+ 100 g/j matières grasses, + 60 g/j matières protéiques) ainsi que la composition du lait (taux butyreux : + 2 g/kg, taux protéique : + 1 g/kg). Ces effets positifs sont probablement à attribuer aux modifications d’orientations fermentaires dans le rumen concernant le taux butyreux et au meilleur niveau d’apport énergétique pour la synthèse des protéines. Dans nos conditions d’utilisation, ces betteraves apportées en quantités relativement faibles ont permis d’augmenter le niveau de production permis par la ration de base d’environ 2,5 kg de lait. Leur valorisation énergétique correspond à celle proposée par les nouvelles Tables INRA (1988).

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Bouziri, Abdeldjalal, Ali Sebai, Ahmed Kebir, Maamar Khames, Taha Moussadak Hamdi und Djamel Khelef. „ARTICLE RÉTRACTÉ - Fièvre aphteuse chez les bovins et les petits ruminants en Algérie. Enquête séroépidémiologique dans la région de l’ouest“. Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 74, Nr. 4 (13.12.2021): 225–30. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.36815.

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Cet article a été rétracté le 12/04/2022. La fièvre aphteuse (FA) est une maladie infectieuse d’origine virale qui affecte les ruminants et les porcins. Une enquête séroépidémiologique a été menée chez les ruminants de la région ouest de l’Algérie afin d’estimer la séroprévalence de la FA et de déterminer les facteurs de risque susceptibles de favoriser l’atteinte des animaux par cette pathologie. Au total 420 sérums ont été collectés (210 de bovins et 210 de petits ruminants) et soumis au test Elisa NSP permettant la détection des anticorps dirigés contre le virus de la FA induits par les protéines non structurales, puis à des tests Elisa détectant les protéines structurales spécifiques des sérotypes A, O, SAT 1, SAT 2 et Asia 1. Les résultats ont montré une différence non significative (p > 0,05) de la séroprévalence entre les espèces avec 23,8 % chez les bovins et 27,1 % chez les petits ruminants. Le sérotype O était présent dans 95,3 % des sérums positifs. Il était présent seul chez 64,9 % des petits ruminants alors que les bovins étaient généralement infectés par plusieurs sérotypes simultanément, avec l’association prédominante des quatre sérotypes A, O, SAT 1 et Asia 1, qui représentait 36 % des infections. Le taux de couverture vaccinale a atteint 48,7 % du cheptel (bovins et petits ruminants) âgé de plus de six mois. Aucun lien statistique n’a été mis en évidence entre le mode d’élevage (extensif, semi-intensif ou intensif) et l’atteinte par la FA (p > 0,05). En revanche, une association significative (p < 0,05) a été établie entre la vaccination des animaux et l’infection, les animaux vaccinés ayant été moins infectés par la FA.

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Jones, John, Vivian Blok und Geert Smant. „SXP/RAL-2 proteins of the potato cyst nematode Globodera rostochiensis: secreted proteins of the hypodermis and amphids“. Nematology 2, Nr. 8 (2000): 887–93. http://dx.doi.org/10.1163/156854100750112833.

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AbstractA family of secreted proteins (the SXP/RAL-2 proteins) has been identified in animal parasitic nematodes and Caenorhabditis elegans. In this paper, we describe two full length cDNA sequences from the potato cyst nematode Globodera rostochiensis which could encode proteins similar to SXP/ RAL-2 proteins. We show that although both genes are expressed in second stage juveniles and in sedentary females of G. rostochiensis, they have remarkably different spatial expression patterns. The mRNA derived from one of the genes (gr-sxp-1) was present in the hypodermis, as has been described previously for one of these genes in an animal parasitic nematode. However, expression of the mRNA from the other gene was restricted to the gland cells surrounding the amphidial sense organs (the sheath cells). In addition to providing the first description of SXP proteins from a plant parasitic nematode, this work provides the first detailed characterisation of a protein secreted from the amphids of a plant parasite. Les protéines SXP/ RAL-2 du nématode à kyste de la pomme de terre Globodera rostochiensis : les protéines sécrétées par l'hypoderme et les amphides - Une famille de protéines sécrétées - les protéines SXP/RAL-2 - avait déjà été identifiée chez les nématodes zooparasites et chez Caenorhabditis elegans. Dans cet article nous décrivons deux séquences en longueur totale de cADN provenant du nématode à kyste de la pomme de terre Globodera rostochiensis, séquences qui pourraient coder des protéines similaires aux protéines SXP/RAL-2. Nous montrons que, bien que l'un et l'autre gène s'expriment chez les juvéniles de deuxième stade et chez les femelles sédentaires de Globodera rostochiensis, ils possèdent des profils d'expression spatiale remarquablement différents. Le rARN dérivé à partir d'un de ces gènes (gr-sxp-1) était présent dants l'hypoderme, comme cela avait déjà été décrit pour l'un de ces gènes chez un nématode zooparasite. Cependant, l'expression du mRNA de l'autre gène était limitée aux cellules glandulaires entourant les organes sensoriels amphidiens (les cellules de la gaine). Offrant la première description de protéines SXP provenant de nématodes phytopathogènes, le présent travail fournit de plus la première caractérisation détaillée d'une protéine sécrétée par les amphides d'un nématode parasite de plantes.

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Grangeot-Keros, L., und D. Cointe. „Les protéines recombinantes en infectiologie“. Immuno-analyse & Biologie Spécialisée 15, Nr. 3 (Mai 2000): 155–60. http://dx.doi.org/10.1016/s0923-2532(00)80002-2.

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Bigard, AX. „Apport en protéines et masse musculaire“. Science & Sports 11, Nr. 4 (Januar 1996): 195–204. http://dx.doi.org/10.1016/s0765-1597(97)82278-2.

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Mafwila, M., K. Budiongo und M. Bavanda. „Effets du mode de préparation et de la durée de stockage sur les teneurs en protéines et en matières grasses de la farine du fruit de l'arbre à pain (Artocarpus incisus (Thunb.) L. f.)“. Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux 44, Nr. 4 (01.04.1991): 463–68. http://dx.doi.org/10.19182/remvt.9154.

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Des fruits de l'arbre à pain ont été découpés et séchés sur une claie, avec ou sans leur peau, sous l'action du feu et du soleil. Le séchage a eu lieu soit directement après la récolte, soit un à cinq jours plus tard. Les tranches de fruit sèches ont servi à produire des farines qui ont été entreposées et analysées sur la base de leur teneur en protéines et en matières grasses, le jour de leur préparation puis 2, 4, 6 et 8 semaines après leur entreposage. Les résultats ont permis de constater : une diminution sensible de la teneur en protéines (1,9 à 1,3 % de la matière sèche) et en matières grasses (5,2 à 2,2 %) au cours du stockage, surtout à partir de la 4e semaine; la durée de conservation des fruits a une incidence sur la teneur en protéines des farines, il faudrait donc sécher ceux-ci le plus tôt possible après la récolte; les fruits non épluchés produisent des farines significativement plus riches en protéines que les fruits épluchés, mais la différence est très faible (1,6 et 1,5 %, respectivement)

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Brousse, C. „Anomalies de l'électrophorèse des protéines du sang“. EMC - Traité de médecine AKOS 3, Nr. 2 (Januar 2008): 1–6. http://dx.doi.org/10.1016/s1634-6939(08)49391-2.

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Pecquet, C., und M. Laurière. „Hydrolysats de protéines du blé : nouveaux allergènes“. Revue Française d'Allergologie et d'Immunologie Clinique 43, Nr. 1 (Januar 2003): 21–23. http://dx.doi.org/10.1016/s0335-7457(02)00010-2.

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Reboud-Ravaux, Michèle. „Dégradation induite des protéines par des molécules PROTAC et stratégies apparentées : développements à visée thérapeutique“. Biologie Aujourd’hui 215, Nr. 1-2 (2021): 25–43. http://dx.doi.org/10.1051/jbio/2021007.

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Alors que, pour la plupart, les médicaments actuels sont de petites molécules inhibant l’action d’une protéine en bloquant un site d’interaction, la dégradation ciblée des protéines, découverte il y a une vingtaine d’années via les petites molécules PROTAC, connaît aujourd’hui un très grand développement, aussi bien au niveau universitaire qu’industriel. Cette dégradation ciblée permet de contrôler la concentration intracellulaire d’une protéine spécifique comme peuvent le faire les techniques basées sur les acides nucléiques (oligonucléotides antisens, ARNsi, CRISPR-Cas9). Les molécules PROTAC sont des chimères hétéro-bifonctionnelles capables de lier simultanément une protéine spécifique devant être dégradée et une E3 ubiquitine ligase. Les PROTAC sont donc capables de provoquer l’ubiquitinylation de la protéine ciblée et sa dégradation par le protéasome 26S. De nature peptidique, puis non peptidique, les PROTAC sont maintenant administrables par voie orale. Ce détournement du système ubiquitine protéasome permet aux molécules PROTAC d’élargir considérablement le champ des applications thérapeutiques puisque l’élimination de protéines dépourvues de poches ou de crevasses bien définies, dites difficiles à cibler, devient possible. Cette technologie versatile a conduit à la dégradation d’une grande variété de protéines comme des facteurs de transcription, des sérine/thréonine/tyrosine kinases, des protéines de structure, des protéines cytosoliques, des lecteurs épigénétiques. Certaines ligases telles que VHL, MDM2, cereblon et IAP sont couramment utilisées pour être recrutées par les PROTAC. Actuellement, le nombre de ligases pouvant être utilisées ainsi que la nature des protéines dégradées sont en constante augmentation. Deux PROTAC sont en étude clinique pour les cancers du sein (ARV471) et de la prostate (ARV110). La dégradation spécifique d’une protéine par le protéasome peut aussi être induite par d’autres types de molécules synthétiques : colles moléculaires, marqueurs hydrophobes, HaloPROTAC, homo-PROTAC. D’autres constituants cellulaires sont aussi éligibles à une dégradation induite : ARN-PROTAC pour les protéines se liant à l’ARN et RIBOTAC pour la dégradation de l’ARN lui-même comme celui du SARS-CoV-2. Des dégradations induites en dehors du protéasome sont aussi connues : LYTAC, pour des chimères détournant la dégradation de protéines extracellulaires vers les lysosomes, et MADTAC, pour des chimères détournant la dégradation par macroautophagie. Plusieurs techniques, en particulier des plates-formes de criblage, la modélisation mathématique et la conception computationnelle sont utilisées pour le développement de nouveaux PROTAC efficaces.

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RULQUIN, H., R. VÉRITÉ, J. GUINARD-FLAMENT und P. M. PISULEWSKI. „Acides aminés digestibles dans l’intestin. Origines des variations chez les ruminants et répercussions sur les protéines du lait“. INRAE Productions Animales 14, Nr. 3 (16.06.2001): 201–10. http://dx.doi.org/10.20870/productions-animales.2001.14.3.3740.

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La production de protéines (lait, viande, laine, poil) des ruminants peut être limitée par des apports insuffisants en certains acides aminés (AA) appelés pour l’occasion AA limitants. En effet, contrairement à ce qui était généralement admis, la composition des acides aminés digérés par les ruminants n’est pas constante. Si la part des protéines microbiennes et leur composition en AA relativement constante tamponnent les variations de la composition en AA des contenus intestinaux, celle-ci varie en fonction de la composition en AA de la ration et de sa richesse en protéines peu dégradables. L’importance des conséquences des variations de la composition en AA des contenus digestifs sur la production de protéines du lait a été étudiée grâce à des apports postruminaux de doses croissantes d’un acide aminé. La supplémentation postruminale en lysine ou en leucine peut faire gagner jusqu’à 4 g/kg de taux protéique. Le gain maximum n’est que de 2 g/kg avec la méthionine, l’histidine, la phénylalanine et la thréonine. Dans tous les cas l’augmentation du taux protéique porte sur le taux de caséine. En milieu de lactation, l’histidine et la thréonine accroissent aussi le volume de lait produit de façon dose-dépendante.

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Mehr Quellen

Dissertationen zum Thema "Position 2 des protéines"

Nashed, Salomé. „Étude fonctionnelle et évolutive du résidu situé en position 2 des protéines“. Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS219.

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Le résidu situé en position 2 des protéines, suivant leur méthionine initiatrice, est un signal clé pour le recrutement co-traductionnel de diverses enzymes de modification qui impactent précocement leur destinée cellulaire (adressage, repliement, temps de demi-vie). Bien que l’importance de ce résidu soit établie pour quelques protéines, son rôle à l’échelle globale du protéome et la nature des pressions sélectives auxquelles il pourrait être soumis demeurent à ce jour inexplorés. Durant ma thèse, j’ai pour la première fois utilisé des méthodologies d’analyse globale pour réaliser une étude fonctionnelle et évolutive du résidu situé en position 2 des protéines. J’ai mis au profit de cette étude deux approches complémentaires, développées in silico chez la levure modèle Saccharomyces cerevisiae. La première approche utilisée consiste en l’étude d’enzymes de modification dont le recrutement dépend du résidu en position 2 de leurs cibles. Je me suis en particulier intéressée aux N-acétyltransférases. Celles-ci possèdent la même activité enzymatique de N-acétylation, mais ciblent des sous-ensembles distincts de protéines et leurs délétions sont associées à des phénotypes différents, ce qui pose la question du rôle spécifique de chacune dans la physiologie cellulaire. Grâce à l’analyse de données expérimentales relatives à ces enzymes, j’ai caractérisé leur sélectivité globale in vivo et j’ai formellement démontré qu’elles ont effectivement des rôles physiologiques différentiels. La seconde approche utilisée est l’étude de la distribution des acides aminés en position 2 dans le protéome et dans les groupes fonctionnels de protéines définis par la Gene Ontology. Alors que les outils actuels utilisés pour réaliser des analyses de Gene Ontology ne tiennent pas compte de la structure hiérarchique de cette ressource, j’ai développé un algorithme permettant de synthétiser et de visualiser les résultats obtenus par une telle analyse pour en faciliter l’interprétation. Cette approche a permis l’identification de groupes fonctionnels de protéines présentant en position 2 une utilisation d’acides aminés distincte de celle observée dans le protéome à cette position. Ces deux méthodes d’analyse globale ont convergé vers un même résultat, à savoir que les précurseurs mitochondriaux possédant une séquence N-terminale d’adressage (MTS pour mitochondrial targeting sequence) présentent en position 2 une sur-représentation de larges résidus hydrophobes, critique pour leur import à la mitochondrie et permettant leur reconnaissance par la N-acétyltransférase NatC. Le biais d’acides aminés en position 2 des MTS est très conservé dans la lignée des Saccharomycotina et a partiellement évolué chez l’Homme et la plante Arabidopsis thaliana. J’ai de plus mis en évidence l’existence de plusieurs catégories de MTS en fonction de la nature du résidu qu’ils portent en position 2, ce qui peut indiquer une co-évolution de la position 2 des MTS et de leur composition globale et pose la question des propriétés optimales de ces séquences. Enfin, j’ai montré que les peptides signaux de la levure et la séquence N-terminale d’adressage au chloroplaste d’Arabidopsis thaliana présentent également des biais d’acides aminés en position 2, suggérant que le résidu à cette position pourrait jouer un rôle clé dans la reconnaissance de ces séquences par les systèmes d’adressage et d’import associés
The residue located at position 2 of proteins, following their initiator methionine, is a key signal for the co-translational recruitment of various modification enzymes that early impact their cellular fate (addressing, folding, half-life). Although the importance of this residue is established for a few proteins, its role at the global scale of the proteome and the nature of the selective pressures it may be subject to remain unexplored to this day. During my thesis, I used for the first time global analysis methodologies to conduct a functional and evolutionary study of the residue located at position 2 of proteins. I used two complementary in silico approaches developed in the model yeast Saccharomyces cerevisiae. The first approach I used is the study of modification enzymes whose recruitment depends on the residue at position 2 of their targets. I focused in particular on N-acetyltransferases. These enzymes have the same enzymatic activity of N-acetylation but target distinct subsets of proteins, and their deletions are associated with different phenotypes, raising the question of the specific role of each enzyme in cellular physiology. Through the analysis of experimental data related to these enzymes, I characterized their global selectivity in vivo and formally demonstrated that they indeed have differential physiological roles. The second approach I used is the study of the distribution of amino acids at position 2 in the proteome and in functional groups of proteins defined by the Gene Ontology. While current tools used to perform Gene Ontology analyses do not take into account the hierarchical structure of this resource, I developed an algorithm to synthesize and visualize the results obtained by such analyses to facilitate their interpretation. This approach allowed the identification of groups of proteins that present a distinct amino acid usage at position 2 compared to that observed in the proteome at this position. These two global analysis methods converged toward the same result, namely that mitochondrial precursors possessing an N-terminal addressing sequence (MTS for mitochondrial targeting sequence) exhibit at position 2 an overrepresentation of large hydrophobic residues, critical for their import into mitochondria and enabling their recognition by the NatC acetyltransferase. The amino acid bias at position 2 of MTS is highly conserved in the Saccharomycotina lineage and has partially evolved in humans and the plant Arabidopsis thaliana. I also highlighted the existence of several categories of MTS depending on the nature of the residue they carry at position 2, which may indicate co-evolution of position 2 of MTS and their overall composition and raises the question of optimal properties of these sequences. Finally, I showed that yeast signal peptides and the chloroplast N-terminal addressing sequence in Arabidopsis thaliana also exhibit amino acid biases at position 2, suggesting that the residue at this position could play a key role in the recognition of these sequences by associated addressing and import systems

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El, Barbry Houssam. „Découverte du rôle crucial du résidu en position 2 des séquences MTS d’adressage mitochondrial“. Electronic Thesis or Diss., Sorbonne université, 2023. http://www.theses.fr/2023SORUS035.

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Les mitochondries sont des organites complexes impliquant un millier de protéines, la plupart codées dans le génome nucléaire. Leur biogenèse a nécessité au cours de l’évolution la mise en place de systèmes efficaces d’adressage et d’import protéique, et des défaillances de ces systèmes sont associées à des pathologies graves, neuropathies, troubles cardiovasculaires, myopathies, maladies neurodégénératives ainsi que cancers. De nombreuses protéines mitochondriales possèdent en N-terminal une séquence d’adressage appelée MTS (Mitochondrial Targeting sequence) qui forme une hélice alpha amphiphile essentielle pour leur import mitochondrial. La séquence des divers MTSs est néanmoins très variables et leur caractéristiques critiques ne sont pas encore bien comprises. Le point de départ de ma thèse est la découverte, chez les levures, d’une surreprésentation en position 2 des séquences MTSs de 4 acides aminés hydrophobes (F, L, I, W). Au cours de mes années de thèse, j’ai pu confirmer, par des expériences de mutagenèse dirigée, le rôle critique de la nature du résidu en position 2 des MTSs. En effet, grâce au développement d’un système novateur de criblage des défauts d’import basé sur le sauvetage fonctionnel de la toxicité d’une protéine mitochondriale, j’ai pu observer que seuls les résidus surreprésentés en position 2 des protéines mitochondriales permettaient un import efficace. Mon travail a ainsi démontré l'existence de fortes contraintes évolutives s’exerçant au niveau de la position 2 des MTSs dont la compréhension pourrait à terme être utile pour optimiser l’adressage mitochondrial de protéines thérapeutiques chez des patients atteints de maladies mitochondriales
Mitochondria are complex organelles involving a thousand proteins, most of which are encoded in the nuclear genome. Their biogenesis has required the evolutionary development of efficient protein addressing and import systems, and failures of these systems are associated with serious pathologies, neuropathies, cardiovascular disorders, myopathies, neurodegenerative diseases and cancers.Many mitochondrial proteins have an N-terminal addressing sequence called MTS (Mitochondrial Targeting Sequence) which forms an amphiphilic alpha helix essential for their mitochondrial import. However, the sequence of the various MTSs is highly variable and their critical characteristics are not yet well understood. The starting point of my thesis was the discovery in yeast of an overrepresentation of 4 hydrophobic amino acids (F, L, I, W) at position 2 of the MTSs sequences. During my thesis, I was able to confirm the critical role of the nature of the residue in position 2 of the MTSs through directed mutagenesis experiments. Indeed, thanks to the development of an innovative system for screening import defects based on the functional rescue of the toxicity of a mitochondrial protein, I was able to observe that only residues overrepresented at position 2 of mitochondrial proteins allowed efficient import. My work has thus demonstrated the existence of strong evolutionary constraints at position 2 of MTSs, the understanding of which could ultimately be useful for optimising the mitochondrial addressing of therapeutic proteins in patients suffering from mitochondrial diseases

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Bastin, Guillaume. „Les résidus cystéines en positions 2 et 12 de RGS4 influencent son trafic intracellulaire et ses fonctions“. Thesis, Lille 1, 2013. http://www.theses.fr/2013LIL10003/document.

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Les protéines RGS (Regulator of G-protein Signaling) sont des inhibiteurs des voies de signalisation des protéines G. RGS4 atténue l’activité de protéines G dans plusieurs tissus tel que la diminution de son activité peut accroître la sévérité de la bradycardie, cardiomyopathies liées au diabète, l’invasion de cellule cancéreuse du sein, résistance à l’insuline et intolérance au glucose. RGS4 a été localisé à la membrane plasmique ainsi que dans des compartiments intracellulaires, cependant, son mode de trafique intracellulaire reste méconnu. En utilisant des outils de microscopie confocale sur cellules vivantes et méthode de détection d’activité des voies de signalisation conditionnée par les protéines G, nous avons caractérisé l’importance de deux sites de palmitoylation, ces deux sites : Cys2 et Cys12 montrent des intérêts complémentaires dans le trafic de RGS4 vers la membrane cellulaire. Dans un axe linéaire, nous avons identifié DHHC3 et 7, deux enzymes de palmitoylation participant au trafique intracellulaire de RGS4 et donc à la maximalisation de son activité inhibitrice des voies de signalisation contrôlées par Galphaq. Enfin des marqueurs de membranes endosomales, les protéines rab ont permis de caractériser les voies de trafic intracellulaire empruntée par RGS4, par exemple RGS4 est internalisé de la membrane plasmique par Rab5 et recyclé à la membrane cellulaire par Rab11. L’activation ou inhibition de Rab5 et 11 ont permis d’observer des changements d’activité de RGS4. Ces travaux confèrent une base de données pour des études ultérieures visant à développer des stratégies thérapeutiques à accroître les fonctionnalités de RGS4
RGS proteins (Regulator of G-protein Signaling) are potent inhibitors of heterotrimeric G-protein signaling. RGS4 attenuates G-protein activity in several tissues such that loss of its function may lead to bradycardia, diabetic cardiomyopathy, breast cancer cell invasion, insulin resistance and glucose intolerance. RGS4 has been localized to both plasma membrane and intracellular pools, however, the nature of its intracellular trafficking remains to be elucidated. G-protein inhibition requires the presence of RGS4 at the plasma membrane. In this work, we characterized the complementary roles of two putative palmitoylation sites on RGS4 to target intracellular compartments and plasma membrane. We identified palmitoylation on Cys2 and 12 respectively important for RGS4 endosomal targeting and plasma membrane localization, when mutations were introduced to the palmitoylation sites, RGS4 capability of inhibiting Gq-mediated signaling was impaired. As a continuum we identified two palmitoylating enzymes, DHHC3 and 7 as modulator of RGS4 localization and function. Knock downs of DHHC3 and 7 impaired RGS4 endosomal and plasma membrane targeting and capability of inhibiting M1-muscarinic receptor signaling. Finally we used live cell confocal microscopy to define RGS4 intracellular trafficking routes. Specifically Rab5 mediated RGS4 trafficking from the plasma membrane to intracellular compartments while Rab11 mediated RGS4 trafficking to the plasma membrane. Activation and inhibition of Rab5 and 11 routes impaired RGS4 capability of inhibiting M1-muscarinic receptor signaling pathway. These novel findings provide a strong rationale for future studies aimed at developing new strategies to increase the function of RGS4

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Guérin, Mathilde. „Développement d'une approche de protéomique quantitative appliquée au diagnostic des cancers du sein HER2 positif“. Thesis, Aix-Marseille, 2018. http://www.theses.fr/2018AIXM0046.

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Introduction : De nombreuses thérapeutiques ciblant la protéine HER2 ou des protéines clés de la voie HER2 ont transformé le pronostic des cancers du sein HER2 positif. Les anomalies moléculaires tumorales, la richesse des thérapeutiques actuelles et leur coût nécessitent de rationnaliser la décision thérapeutique par l’utilisation de biomarqueurs. La protéomique ciblée, capable de détecter et mesurer un panel de protéines au sein d’échantillons complexes, est l’une des approches les plus performantes pour quantifier un jeu de biomarqueurs spécifiques simultanément dans un tissu tumoral. Objectif : développer une approche de protéomique quantitative ciblée de type PRM (Parallel Reaction Monitoring) pour évaluer les protéines clés de la voie HER2 dans différents échantillons tumoraux. Résultats : 1/ Sélection des peptides protéotypiques de nos protéines d’intérêt (EGFR, HER2 et phospho-HER2, HER3, PTEN) et développement des méthodes d’analyse. 2/ Détection et quantification de ces peptides a/ dans 17 lignées cellulaires mammaires, en conditions standard et après exposition au trastuzumab ou lapatinib. b/ dans des xénogreffes dérivées de cancer du sein humain. 4/ Corrélation des résultats a/ aux « gold » standards actuels : western blot et immuno-cyto/histo-chimie, b/ aux données issues d’analyses transcriptomiques validées. Conclusion : cette approche pourrait permettre dans le futur une vision globale de l’expression et l’activation des protéines de la voie HER2 et progresser vers une médecine « personnalisée ». Elle pourrait être améliorée par l’utilisation de spectromètres de masse plus performants et le recours à la microdissection laser sur tissu conservé en FFPE
Therapeutics targeting HER2 protein or its pathway considerably improved the prognosis of HER2-positive BC. The actual approaches to evaluate HER2 expression, immunohistochemistry (IHC) and FISH (fluorescent in situ hybridization), are labor-intensive and low-throughput, and present discrepancies between them. Therefore, there is a real need to develop other strategies to rationalize the use of targeted therapeutics. Parallel Reaction Monitoring (PRM) is a mass spectrometry-based approach for targeted proteomics able to detect and quantify numerous proteins with high-throughput allowing to follow mutated or activated status of targeted proteins. PRM could be a way to rationalize the use of targeted therapeutics to go through a more « personalized » medicine. The objective was to detect and quantify proteins implicated in HER2 pathway (EGFR, HER2, HER3, PTEN), phosphorylated peptides of HER2 and their response under treatment. We first selected proteotypic peptides of each protein and protein assays were generated. We detected and quantified proteotypic peptides of proteins of interest 1/on 17 breast cell lines on control condition and under treatment (trastuzumab or lapatinib). 2/ on more complex samples including patients-derived xenografts and human breast cancers. We correlated our data to gold standards western blot and IHC and to transcriptomic signatures previously validated. In the future, this approach could envision a picture of the expression and activation of proteins implicated in HER2-pathway. However, our strategy could be improved by more efficient mass spectrometers and the use of formalin-fixed paraffin-embedded samples to be used in clinical practice

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Morin, Nathalie. „Protéines d'échafaudage et assemblage de l'adénovirus 2“. Lille 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LIL10005.

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Régimbald-Dumas, Yannik. „Régulation positive du récepteur à l'inisitol 1,4,5-trisphosphate de type 2 par la protéine kinase A et par mTOR“. Thèse, Université de Sherbrooke, 2010. http://savoirs.usherbrooke.ca/handle/11143/4320.

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Le récepteur de l'inositol 1,4,5-trisphosphate (IP[indice inférieur 3]R) est un canal calcique qui joue un rôle majeur dans la régulation du Ca[indice supérieur 2+] intracellulaire. Il existe trois sous-types d'IP[indice inférieur 3]R. Peu d'information est disponible sur les propriétés de l'IP[indice inférieur 3]R-2 et de l'IP[indice inférieur 3]R-3. De plus, la régulation spécifique du mécanisme de signalisation calcique peut être accomplie par l'activation simultanée de plusieurs voies de signalisation. Les kinases intervenant lors de l'activation concomitante de la voie de production de l'AMPc et des voies prolifératives sont susceptibles de réguler les IP[indice inférieur 3]R. Ainsi, l'objectif de ma thèse fut de caractériser l'effet de la protéine kinase dépendante de l'AMPc (PKA) et de la cible mammalienne de la rapamycine (mTOR) sur l'activité de l'IP[indice inférieur 3]R-2. La première partie de ma thèse consista à étudier l'effet possible de la PKA sur l'activité de l'IP[indice inférieur 3]R-2 dans les cellules AR4-2J, une lignée cellulaire exprimant principalement l'IP[indice inférieur 3]R-2. Nous avons d'abord démontré que l'IP[indice inférieur 3]R-2 est un bon substrat de la PKA. Qui plus est, des essais calciques réalisés sur des cellules AR4-2J perméabilisées suggèrent que la PKA augmente l'affinité apparente de l'IP[indice inférieur 3]R-2. Enfin, la stimulation de la production d'AMPc entraîne une augmentation des relâches calciques dans les cellules AR4-2J intactes. Ces résultats suggèrent donc que la PKA augmente l'activité de l'IP[indice inférieur 3]R-2. Dans la seconde partie de cette thèse, nous démontrons que la kinase mTOR, point de convergence des voies prolifératives, phosphoryle l'IP[indice inférieur 3]R-2 dans les cellules AR4-2J. Les essais calciques réalisés sur des cellules AR4-2J perméabilisées suggèrent également que mTOR augmente l'affinité apparente de l'IP[indice inférieur 3]R-2. De surcroît, la rapamycine (un inhibiteur de mTOR) réduit les relâches calciques induites par le carbachol dans les cellules AR4-2J et dans les cellules HEK 293A exprimant presque exclusivement l'IP[indice inférieur 3]R-2. Ces résultats suggèrent donc que mTOR augmente l'activité de l'IP[indice inférieur 3]R-2. L'ensemble de ces travaux approfondit notre compréhension des mécanismes par lesquels les signaux calciques sont finement régulés dans les cellules.

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Reed, Eric Christopher. „Improvement of MPEG-2 compression by position-dependent encoding“. Thesis, Massachusetts Institute of Technology, 1996. http://hdl.handle.net/1721.1/38823.

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Ozkaya, Tugba. „Hezbollah And Its Position Towards Israel“. Master's thesis, METU, 2009. http://etd.lib.metu.edu.tr/upload/2/12611119/index.pdf.

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This thesis analyses how Hezbollah has perceived Israel since its establishment. In this study it is argued that Israel is the main enemy of and source of hatred for Hezbollah. The references of this overall statement are the ideology and political, social and military history of Hezbollah. The armed struggle of Hezbollah against Israel started with the 1982 Israeli invasion of Lebanon evolved into both a political participation with the continued armed militia in the period between 1982 to today. During this period, in addition to its armed conflict with Israel, Hezbollah came on the stage with social services for Lebanese society and political propaganda in Lebanese elections. The intersection point of these three identities is the endless encouragement of Hezbollah for a determined resistance against Israel. While on the one hand Hezbollah defines Israel to be the most dangerous threat for the world, in addition to being a prominent enemy for the Arab and Muslim community
on the other hand Israel regards Hezbollah to be the highest impact menace. Consequently, the thesis is finalized with outputs and predictions taking all historical and ideological aspects into concern.

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Jacquet, Eric. „Relations structure-fonction du domaine d'ef-tu liant les nucleotides guanyliques : mutation de la val20, residu homologue a la position 12 de la p21“. Paris 6, 1988. http://www.theses.fr/1988PA066307.

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La valine 20 du facteur d'elongation eftu est substituee par une glycine par mutagenese dirigee. Cette mutation a des consequences sur l'activite gtp asique et sur la vitesse d'association-dissociation du complexe eftu (gly 20)-gdp. Les etudes d'homologie des sequences primaires indiquent que le residu val 20 de eftu correspond a la position 12 de la proteine p21 codee par les genes ras humains

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FREVILLE-HERENTHALS, STEPHANIE. „Synthese enantioselective d'alcaloides monosubstitues en position 2 et disubstitues en positions 2 et 6“. Paris 6, 1996. http://www.theses.fr/1996PA066557.

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La these presentee porte sur l'elaboration de nouvelles syntheses enantioselectives d'alcaloides piperidiniques monosubstitues en position 2 et disubstitues en positions 2 et 6. Le travail a pour point de depart un substrat bicyclique oxazolopiperidonique, lui-meme issu de la condensation du phenylglycinol et d'un -cetoacide dont une nouvelle methode de preparation a ete developpee. Ce bicycle possede en et de l'atome d'azote des reactivites potentielles: fonction carbonyle du lactame et fonction iminium aminal masquee. Une ouverture stereoelectronique en (cycle oxazolidinique) conduit aux lactames n-proteges. Trois voies sont alors envisagees: la premiere donne acces aux 2-alkylpiperidines apres une reaction d'extrusion d'oxygene et une elimination de la partie chirale. La deuxieme conduit aux lactames chiraux par debenzylation. Ces derniers sont des synthons-cles permettant l'acces direct aux 2-alkylpiperidines apres une reaction d'extrusion d'oxygene et aux 2,6-dialkylpiperidines trans ou cis par une suite de reactions stereoselectives effectuee en de la fonction carbonyle. Une inversion de configuration du carbone portant la fonction hydroxyle de l'un de ces derives conduit au (-)-pinidinol. C'est la premiere synthese enantioselective de ce compose. La derniere voie conduit aux oxazolopiperidines par action d'organomagnesiens sur la fonction carbonyle du lactame. L'ouverture ulterieure du cycle oxazolopiperidinique et la debenzylation conduisent stereoselectivement aux 2,6-dialkylpiperidines trans. La plupart des composes obtenus sont des produits naturels et presentent un interet biologique

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Mehr Quellen

Bücher zum Thema "Position 2 des protéines"

Coalition, Northern Ireland Women's. Position on Strands 1, 2, and 3. Belfast: Women's Coalition, 1998.

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Geller, Helmut. Position — Rolle — Situation. Wiesbaden: VS Verlag für Sozialwissenschaften, 1994. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-322-95981-2.

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Burdea, Grigore C. 2 piece jig-saw puzzle robot assembly with vision, position, and force feedback. New York: Courant Institute of Mathematical Sciences, New York University, 1987.

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Bolanakis, Dimosthenis E. MEMS Barometers Toward Vertical Position Detection. Cham: Springer International Publishing, 2017. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-031-79573-2.

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United States. National Aeronautics and Space Administration., Hrsg. Guidance of nonlinear nonminimum-phase dynamic systems: Performance report; period: 3/1/96 - 2/28/97; grant number: NAG 2-1042. [Washington, DC: National Aeronautics and Space Administration, 1996.

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Lamon, Pierre. 3D-Position Tracking and Control for All-Terrain Robots. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2008. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-78287-2.

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American Institute of Certified Public Accountants. Accounting Standards Executive Committee. Amendment to scope of Statement of position 95-2, Financial reporting by nonpublic investment partnerships, to include commodity pools. New York, NY: The Institute, 2001.

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William, Hutchens T., J.T. Baker Chemical Co. und University of California, Los Angeles., Hrsg. Protein recognition of immobilized ligands: Proceedings of a J.T. Baker-UCLA Colloquium, held at Santa Fe, New Mexico, December 2-7, 1987. New York: A.R. Liss, 1989.

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Freund, Holger, Hrsg. E&G - Quaternary Science Journal Vol. 61 No 2. Greifswald, Germany: Geozon Science Media, 2012.

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Mehr Quellen

Buchteile zum Thema "Position 2 des protéines"

De Lonlay, Pascale, Sandrine Dubois, Vassili Valayannopoulos, Eliane Depondt, Chris Ottolenghi und Daniel Rabier. „Intolérance aux protéines dibasiques avec lysinurie“. In Prise en charge médicale et diététique des maladies héréditaires du métabolisme, 183–86. Paris: Springer Paris, 2013. http://dx.doi.org/10.1007/978-2-8178-0046-2_10.

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Robert, Jacques. „Les voies des récepteurs couplés aux protéines G“. In Signalisation cellulaire et cancer, 91–102. Paris: Springer Paris, 2010. http://dx.doi.org/10.1007/978-2-8178-0028-8_7.

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Sotoudehnia, Maral. „An uncomfortable position“. In Writing Intimacy into Feminist Geography, 33–40. Abingdon, Oxon ; New York, NY : Routledge, [2017]: Routledge, 2017. http://dx.doi.org/10.4324/9781315546186-2.

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Johansen, Ken. „Root Position Triads“. In Harmony at the Piano, 4–19. New York: Routledge, 2023. http://dx.doi.org/10.4324/9781003333289-2.

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Nyce, David S. „Specifications“. In Understanding Position Sensors, 17–76. Boca Raton: CRC Press, 2023. http://dx.doi.org/10.1201/9781003368991-2.

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Monk, Alex. „The Curse Position (2)“. In Trauma and the Supernatural in Psychotherapy, 54–67. London: Routledge, 2023. http://dx.doi.org/10.4324/9781003168027-5.

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„2. ET COMMENT ON SAIT TOUT ÇA?“ In Protéines, 25–36. EDP Sciences, 2021. http://dx.doi.org/10.1051/978-2-7598-2677-3.c003.

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„LES AUTRICES“. In Protéines 2, 95–96. EDP Sciences, 2022. http://dx.doi.org/10.1051/978-2-7598-2748-0.c011.

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„2. SOUS L’OCÉAN“. In Protéines 2, 25–42. EDP Sciences, 2022. http://dx.doi.org/10.1051/978-2-7598-2748-0.c004.

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„BIBLIOGRAPHIE“. In Protéines 2, 90–94. EDP Sciences, 2022. http://dx.doi.org/10.1051/978-2-7598-2748-0.c010.

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Konferenzberichte zum Thema "Position 2 des protéines"

„WC6: position measurements 2“. In Proceedings of the 21st IEEE Instrumentation and Measurement Technology Conference. IEEE, 2004. http://dx.doi.org/10.1109/imtc.2004.1351230.

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Patrikakis, Charalampos Z. „Session details: Position paper session 2“. In MM '10: ACM Multimedia Conference. New York, NY, USA: ACM, 2010. http://dx.doi.org/10.1145/3252131.

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Shaik, A., N. S. Tlale und G. Bright. „2 DOF Resolution Adjustment Laser Position Sensor“. In 2008 15th International Conference on Mechatronics and Machine Vision in Practice (M2VIP). IEEE, 2008. http://dx.doi.org/10.1109/mmvip.2008.4749539.

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Walczak, Andrzej, und Leszek Puzio. „2-D wavelet with position controlled resolution“. In Congress on Optics and Optoelectronics, herausgegeben von Andrzej Kowalczyk, Adolf F. Fercher und Valery V. Tuchin. SPIE, 2005. http://dx.doi.org/10.1117/12.622783.

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Mohd Azrel Abu Talib, Ahmad Shahril Khamarazaman, Mohd Yusuf Salimun, Johari Jaafar und Ruhizan Liza Ahmad Shauri. „PID position control for 2-DOF robotic finger“. In 2013 IEEE 4th Control and System Graduate Research Colloquium (ICSGRC). IEEE, 2013. http://dx.doi.org/10.1109/icsgrc.2013.6653294.

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Kepesi, Marian, Franz Pernkopf und Michael Wohlmayr. „Joint Position-Pitch Tracking for 2-Channel Audio“. In 2007 International Workshop on Content-Based Multimedia Indexing. IEEE, 2007. http://dx.doi.org/10.1109/cbmi.2007.385426.

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Dietrich, S. „Session details: Network security and position papers 2“. In CCS '10: 17th ACM Conference on Computer and Communications Security 2010. New York, NY, USA: ACM, 2010. http://dx.doi.org/10.1145/3258340.

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Bodenstaff, Lianne, Roel Wieringa, Andreas Wombacher und Manfred Reichert. „Towards Management of Complex Service Compositions - Position Paper“. In 2009 World Conference on Services - II (SERVICES-2). IEEE, 2009. http://dx.doi.org/10.1109/services-2.2009.27.

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Silva, Gustavo, Pedro Leite und Fábio Meneghetti Ugulino de Araújo. „Intelligent Position Control in a Multivariable 2 DOF System“. In 25th International Congress of Mechanical Engineering. ABCM, 2019. http://dx.doi.org/10.26678/abcm.cobem2019.cob2019-0968.

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Yamamoto, Yuji, und Takuya Matsuzaki. „Absolute Position Embedding Learns Sinusoid-like Waves for Attention Based on Relative Position“. In Proceedings of the 2023 Conference on Empirical Methods in Natural Language Processing. Stroudsburg, PA, USA: Association for Computational Linguistics, 2023. http://dx.doi.org/10.18653/v1/2023.emnlp-main.2.

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Berichte der Organisationen zum Thema "Position 2 des protéines"

Elder, H. H. Position Paper on Sludge Batch 2 Qualification Strategy and Simulant Composition. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), September 2001. http://dx.doi.org/10.2172/786669.

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Connolly, M. J., K. J. Liekhus, S. M. Djordjevic, C. A. Loehr und L. R. Spangler. Position for determining gas-phase volatile organic compound concentrations in transuranic waste containers. Revision 2. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), Juni 1998. http://dx.doi.org/10.2172/663400.

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Pstuty, Norbert, Mark Duffy, Dennis Skidds, Tanya Silveira, Andrea Habeck, Katherine Ames und Glenn Liu. Northeast Coastal and Barrier Network Geomorphological Monitoring Protocol: Part I—Ocean Shoreline Position, Version 2. National Park Service, Juni 2022. http://dx.doi.org/10.36967/2293713.

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Following a review of Vital Signs – indicators of ecosystem health – in the coastal parks of the Northeast Coastal and Barrier Network (NCBN), knowledge of shoreline change was ranked as the top variable for monitoring. Shoreline change is a basic element in the management of any coastal system because it contributes to the understanding of the functioning of the natural resources and to the administration of the cultural resources within the parks. Collection of information on the vectors of change relies on the establishment of a rigorous system of protocols to monitor elements of the coastal geomorphology that are guided by three basic principles: 1) all of the elements in the protocols are to be based on scientific principles; 2) the products of the monitoring must relate to issues of importance to park management; and 3) the application of the protocols must be capable of implementation at the local level within the NCBN. Changes in ocean shoreline position are recognized as interacting with many other elements of the Ocean Beach-Dune Ecosystem and are thus both driving and responding to the variety of natural and cultural factors active at the coast at a variety of temporal and spatial scales. The direction and magnitude of shoreline change can be monitored through the application of a protocol that tracks the spatial position of the neap-tide, high tide swash line under well-defined conditions of temporal sampling. Spring and fall surveys conducted in accordance with standard operating procedures will generate consistent and comparable shoreline position data sets that can be incorporated within a data matrix and subsequently analyzed for temporal and spatial variations. The Ocean Shoreline Position Monitoring Protocol will be applied to six parks in the NCBN: Assateague Island National Seashore, Cape Cod National Seashore, Fire Island National Seashore, Gateway National Recreation Area, George Washington Birthplace National Monument, and Sagamore Hill National Historic Site. Monitoring will be accomplished with a Global Positioning System (GPS )/ Global Navigation Satellite System (GNSS) unit capable of sub-meter horizontal accuracy that is usually mounted on an off-road vehicle and driven along the swash line. Under the guidance of a set of Standard Operating Procedures (SOPs) (Psuty et al., 2022), the monitoring will generate comparable data sets. The protocol will produce shoreline change metrics following the methodology of the Digital Shoreline Analysis System developed by the United States Geological Survey. Annual Data Summaries and Trend Reports will present and analyze the collected data sets. All collected data will undergo rigorous quality-assurance and quality-control procedures and will be archived at the offices of the NCBN. All monitoring products will be made available via the National Park Service’s Integrated Resource Management Applications Portal.

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Hutzel, W. J., J. L. III Hill und E. L. Foster. Innovative directional and position specific sampling technique. Phase 2, Final report, [July 28, 1992--February 15, 1994]. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), Januar 1994. http://dx.doi.org/10.2172/10142446.

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Sterbentz, James. ECAR-2066 JMOCUP As-Run Daily Depletion Calculation for the AGR-2 Experiment in ATR B-12 Position. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), April 2014. http://dx.doi.org/10.2172/1964092.

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Kopp, Daniel M. Final technical report. Development and installation of a high resolution position sensitive 40x40 cm{sup 2} gas detector for small angle neutron scattering applications at IPNS: ORDELA model 2410N position-sensitive proportional counter system. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), März 2001. http://dx.doi.org/10.2172/807502.

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LeVert, F. E. Large area self-powered gamma ray detector. Phase 2, Development of a source position monitor for use on industrial radiographic units. Office of Scientific and Technical Information (OSTI), Januar 1994. http://dx.doi.org/10.2172/10119124.

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Feliu, Vicente, Kuldip S. Rattan, Jr Brown und H. B. A New Approach to Control Single-Link Flexible Arms. Part 2. Control of the Tip Position in the Presence of Joint Friction. Fort Belvoir, VA: Defense Technical Information Center, Juli 1989. http://dx.doi.org/10.21236/ada213365.

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Pradelli, Juan Jose, Kimberly Waithe, Allan Wright, Dillon Clarke, Jeetendra Khadan, Juan Pedro Schmid und Mark D. Wenner. Caribbean Region Quarterly Bulletin: Commodities in the Caribbean: Volume 6: Issue 2: June 2017. Inter-American Development Bank, Juni 2017. http://dx.doi.org/10.18235/0008152.

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Annotation:

This issue of the Caribbean Region Quarterly Bulletin explores the importance of commodities for the region’s countries. While the Caribbean includes commodity producers, most members depend heavily on energy imports. The fall in oil prices was a huge relief for these countries, improving the external position, keeping prices stable and increasing the purchasing power for households. At the same time, Suriname and Trinidad and Tobago were hit hard with falls in exports, revenues, and economic contractions. As usual, the Quarterly Bulletin also covers recent economic developments in The Bahamas, Barbados, Guyana, Jamaica, Suriname, and Trinidad and Tobago, and includes a section on the Organisation of Eastern Caribbean States (OECS).

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Gilewski, Teresa A. Position Emitter I124 Iododeoxyuridine as a Tracer to Follow DNA Metabolism on Scans and in Tumor Samples in Advanced Breast Cancer: Comparison of 18F 2-Fluror-2-Deoxy-(D)-Glucose, as a Tracer for Glycolysis. Fort Belvoir, VA: Defense Technical Information Center, Dezember 2005. http://dx.doi.org/10.21236/ada450668.

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