Dissertationen: „Poissons d'eau douce – Mensurations“

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Marin, Valentin. „Utilisation de la pyramide des biomasses pour quantifier les réponses des écosystèmes d'eau douce aux changements globaux“. Electronic Thesis or Diss., Toulouse 3, 2023. http://www.theses.fr/2023TOU30255.

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La taille du corps est une caractéristique importante pour décrire la façon dont les organismes interagissent avec leur environnement biotique et abiotique. La distribution en taille dans les réseaux trophiques peut être synthétisée par une relation linéaire négative entre la taille des organismes et leur abondance. Cette relation, communément appelée "spectre de taille", est largement utilisée dans les écosystèmes marins pour évaluer les impacts des pêcheries commerciales sur les propriétés des réseaux trophiques. Dans ce travail, notre objectif était de développer cette approche basée sur la taille des organismes dans le but de quantifier les effets des changements globaux sur le fonctionnement des écosystèmes lacustres. Dans un premier chapitre, nous avons étudié la variation spatiale du spectre de taille des poissons dans les lacs naturels et de barrages à l'échelle nationale en utilisant de nombreuses campagnes de biosurveillance. Alors que les bioindicateurs étaient significativement affectés par l'eutrophisation et les invasions biologiques, nos résultats ont souligné la valeur ajoutée de l'utilisation du spectre de taille pour déceler les impacts des altérations physiques de l'habitat sur les communautés. Dans un deuxième chapitre, nous avons quantifié la stabilité temporelle de ces communautés de poissons en réponse aux changements d'intensité des facteurs du changement global. L'invasion biologique n'a pas eu d'influence sur la dynamique temporelle du spectre de taille, mais nous avons observé que l'augmentation de la température de l'eau, ainsi que l'augmentation de la charge en nutriments, pouvaient être liés à des changements à court terme dans les spectres de taille. Dans un troisième chapitre, nous avons évalué la relation entre le spectre de taille et la structure trophique réelle des communautés de poissons. En utilisant l'analyse des isotopes stables, nous avons montré qu'un faible rapport de masse prédateur-proie, suggérant une efficacité de transfert trophique plus élevée, induisait des pentes du spectre de taille plus plates (abondances plus élevées des poissons de large taille corporelle). Cependant, la présence d'espèces non-natives altère cette relation et réduit la pertinence d'utiliser le spectre de taille pour refléter les flux d'énergies dans les réseaux trophiques. Dans le quatrième chapitre, notre objectif était d'identifier expérimentalement comment les changements dans le spectre de taille reflètent les changements dans le fonctionnement de l'écosystème. Les résultats ont démontré que le spectre de taille peut être lié à productivité primaire et secondaire par des processus ascendants, ainsi qu'aux changements dans l'intensité des cascades trophiques. Dans l'ensemble, ces résultats démontrent la pertinence de l'utilisation de la structure en taille des communautés pour quantifier les impacts anthropiques sur les communautés lacustres et les conséquences potentielles sur le fonctionnement des écosystèmes, avec des applications possibles dans les programmes de gestion au niveau de l'écosystème
Body size is a powerful trait to describe how organisms interact with their biotic and abiotic environments. Size distribution in food webs can be formalized by a negative linear relationship between organism size and abundance. This relationship, usually referred as the "size spectrum", is commonly used in marine ecosystems to assess the impacts of commercial fisheries on food webs properties. In this work, our aim was to develop this size-based approach on communities to quantify the effects of global changes on the functioning of lacustrine ecosystems. In a first chapter, we investigated the spatial variation of the fish size spectrum in natural and reservoir lakes on a national scale using various biomonitoring surveys. While bioindicators were significatively affected by eutrophication and biological invasions, our findings highlighted the added value of using the size spectrum to highlight the impacts of habitat alterations. In a second chapter, we quantified the temporal stability of these communities in response to changes in the intensity of global change drivers. Biological invasion had no influence on the fish size spectrum dynamic, but we observed that increased water temperature, as well as increased nutrient loading could be linked to short-term changes in size spectra. In the third chapter, we assessed the relationship between size spectrum slope and the trophic structure of fish communities. Using stable isotope analysis, we showed that a low predator-prey mass ratio, suggesting to higher trophic transfer efficiency, induced flatter size spectrum slopes (higher abundance of large fishes). However, the presence of non-native species disrupted this relationship and reduced the potential for using the size spectrum to reflect energy flux in food webs. In the fourth chapter, our goal was to experimentally identify how changes in the size spectrum reflect changes in ecosystem functioning (e.g. productivity or metabolism). Results demonstrated that size spectrum can be linked to primary and secondary production through bottom-up processes, and changes in the intensity of trophic cascades through top-down processes. Taken together, these results demonstrate the relevance of using size structure to quantify anthropogenic impacts on lacustrine communities and the potential consequences on ecosystem functioning, with possible applications in biomonitoring programs at ecosystem level

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Ibañez, Luna Carla. „Degré de convergence entre peuplements de poissons de cours d'eau tropicaux et tempérés“. Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2007. http://www.theses.fr/2007MNHN0020.

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Dans le présent travail nous avons testé l'hypothèse de "convergence" selon laquelle les communautés soumises aux mêmes contraintes environnementales convergent vers une structure commune. Nous avons choisi comme modèle les poissons des cours d'eau tempérés et tropicaux de quatre régions zoogéographiques : Europe (France), Amérique du Nord (USA), Amérique du Sud (Bolivie) et Afrique (Gabon). Pour atteindre notre objectif, des comparaisons locales, régionales et intercontinentales des communautés de poissons ont été menées entre différents sites et entre différents cours d'eau en étudiant leurs caractéristiques écomorphologiques et leur structure trophique. Les résultats montrent que l'organisation locale des communautés résulte de la combinaison de processus locaux et régionaux, abiotiques et biotiques, et s'inscrit par conséquent dans un contexte historique et biogéographique. A l'échelle locale nous avons pu montrer que certaines guildes trophiques peuvent être prédites à partir de quelques attributs morphologiques. Par ailleurs, la richesse des communautés de poissons et leur structure trophique se sont avérées substantiellement convergentes d'une région à l'autre : le pourcentage des espèces omnivores augmente. Néanmoins, à position égale des sites sur le gradient longitudinal, les guildes herbivores/détritivores et piscivores, présentes dans les cours d'eaux africains et sud-américains, sont pratiquement absentes des cours d'eau européens et nord-américains étudiés, peut-être en raison de différences en énergie disponible entre les systèmes tempérés et tropicaux. Ces résultats seront certainement utiles aux décideurs pour les aider à mettre des plans de conservation et de gestion des systèmes lotiques
This work has tested the assumption of "convergence" according to which communities subjected to the same environmental constraints converge towards a common structure. We chose as a model, fishes of the temperate and tropical streams of four zoogeographical areas: Europe (France), North America (USA), South America (Bolivia) and Africa (Gabon). Hence, ecomorphologic characteristics and trophic structure of fish communities were compared at local, regional and intercontinental scales between various sites and various streams. The results show that local communities’ organization depends on the combination of both local and regional and abiotic and biotic processes, relying on a historical and biogeographical context. These results could be useful for the decision makers to implement efficient conservation and management plans of the lotic systems

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Mathieu-Bégné, Eglantine. „Mécanismes d'infection de l'ectoparasite de poissons d'eau douce Tracheliastes polycolpus“. Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30008.

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Quels mécanismes écologiques et évolutifs rendent les interactions entre espèces possibles ? J'ai abordé cette question en considérant l'interaction entre un parasite de poisson d'eau douce (Tracheliastes polycolpus) et plusieurs de ses hôtes cyprinidés. J'ai d'abord mis en avant le rôle de l'environnement à une échelle spatiale très fine (quelques centaines de mètres) sur le taux de rencontre entre ce parasite et ses hôtes. A plus large échelle spatiale (la France) j'ai illustré le rôle limitant de la résistance des populations hôtes sur la distribution de T. polycolpus. Par ailleurs j'ai montré que T. polycolpus parvient à parasiter différentes espèces hôtes en s'appuyant sur une expression plastique de ses gènes. Enfin, j'ai montré que les communautés bactériennes associées à l'hôte changent consécutivement à l'infection parasitaire dans une dynamique de co-infection avec le parasite. Par le déploiement d'approches variées et complémentaires, il apparaît que des facteurs environnementaux, liés à l'hôte, au parasite ou encore à leur cortège de bactéries contribuent à la réalisation d'une interaction étroite et durable tel que le parasitisme
What are the ecological evolutionary mechanisms governing species interactions? I addressed this issue considering the interaction between the parasite Tracheliastes polycolpus and several of its cyprinid hosts. First, I highlighted the role of the environment at a very fine spatial scale (few hundred meters) on the encountering rate between this parasite and its hosts. At larger spatial scale (France) I illustrated the limiting role of resistance of host populations on the distribution of T. polycolpus. I further showed that T. polycolpus manages to infect different host species by relying on a plastic expression of its genes. Finally, I showed that host bacterial communities change after T. polycolpus infection in a co-infection dynamics with the parasite. Through the deployment of various and complementary approaches, it appears that both environmental factors, factors related to the host, to the parasite and to their associated bacterial communities contribute to the success of an intimate interaction such as parasitism

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Denys, Gaël. „Taxonomie intégrative des poissons d’eau douce de France métropolitaine“. Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2014. http://www.theses.fr/2015MNHN0015.

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La publication du catalogue des poissons d'eau douce par Kottelat et Freyhot en 2007, dans lequel 16 espèces natives supplémentaires sont listées en France, a montré l'intérêt d’une révision taxonomique de l'ichtyofaune française. L'objectif de la thèse était de réviser 5 genres de poissons d'eau douce de France selon une approche de taxonomie intégrative en utilisant des données morphologiques, moléculaires et écologiques : Squalius (chevesne), Phoxinus (vairon), Gobio (goujon), Esox (brochet) et gasterosteus (épinoche). Plus de 1700 individus provenant de 283 stations en France ont été analysés morphologiquement. Parmi eux, plus de 40 spécimens ont fait l'objet d’analyses génétiques dont pour certains le séquençage du mitogénome. Nous avons également réalisé une comparaison des robes nuptiales de vairons entre les bassins, ainsi qu'une analyse des niches occupées par les différentes espèces supposées de goujons. Les résultats confirment la présence de 2 espèces de chevesnes en France S. Cephalus et S. Laietanus. L'utilisation des données moléculaires ne valide qu'une seule espèce d’épinoche G. Aculeatus, invalidant G. Gymnurus. L'utilisation des collections a indiqué la présence de 3 espèces de brochet : E. Lucius, E. Cisalpinus et E. Aquitanicus nov sp. La comparaison des robes nuptiales corroborée par la génétique discrimine 3 espèces de vairons dont P. Phoxinus, P. Bigerri; P. Septimaniae et P. Marsilii qui serait valide, ainsi que deux espèces nouvelles. Enfin l'utilisation des données morphologiques, moléculaires, et écologiques corrobore 3 des 4 espèces de goujons (G. Gobio, G. Lozanoi et G. Occitaniae, G. Alverniae serait synonyme junior de ce dernier). Ces nouvelles données en taxonomie confirment les lacunes dans les connaissances sur l'ichtyofaune de France et ouvrent de nouvelles perspectives de recherche dans beaucoup de disciplines en biologie. Cette étude devrait être étendue à l’ensemble des taxons français
The publication of the handbook of European freshwater fishes by Kottelat and Freyhof in 2007, in which the authors list 16 additional native species in France, set off e taxonomical revision of French and European ichtyofauna. The objective of the present thesis is to revise 5 genera of freshwater fisches of France in an integrative taxonomy framework using morphological, molecular and ecological data : Squalius (chub), Phoxinus (minnow), Gobio (gudgeon), Esox (pike) et gasterosteus (three-spined stickleback). More than 1700 specimens were collected in 283 locations in France, studied and analyzed morphologically, before integration in the MNHN collections. More than 460 specimens were studied genetically, including complete mitogenome sequencing for a subset. Also we compared secondary sexual ornamentation of minnows among basins as well as analysis of the niches occupied by the different gudgeon species. The results confirm the presence of two chub species in France S. Cephalus and S. Laietanus. The use of molecular data invalisates G. Gymnurus, so there is a single species of three-spined stickleback G. Aculeatus. The study of collection materials shows the presence of three pike species : E. Lucius, E. Cisalpinus and a previously undetected new species E. Aquitanicus. Secondary sexual ornamentation corroborated by sequence data discriminates 6 minnow species, including P. Phoxinus, P. Bigerri; P. Septimaniae, P. Marsilii which would be valid, as well as two new species. The use of morphological, molecular and ecological data support 3 out of the 4 gudgeon species (G. Gobio, G. Lozanoi et G. Occitaniae; G. Alverniae would be a junior synonym of G. Occitaniae). The new taxonomical data highlight the gaps in our knowledge of the French freshwater fauna. It oepns new perspectives and opportunities of research in numerous fields of biology. However this kind of in-depth study should be applied to all French taxonomic groups

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Mairesse, Guillaume. „Déterminisme ante mortem et variabilité de la qualité nutritionnelle, technologique et organoleptique (couleur et morphologie) de la perche commune perca fluviatilis (L. )“. Vandoeuvre-les-Nancy, INPL, 2005. http://docnum.univ-lorraine.fr/public/INPL/2005_MAIRESSE_G.pdf.

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L'objet de ce travail est d'étudier la variabilité de la qualité de la perche commune d'élevage et sauvage (Perca fluviatilis) ainsi que le déterminisme de cette qualité. Cette dernière est définie par trois composantes: organoleptique (morphologie et couleur), technologique (rendement de filetage, indices morpho-anatomiques) et nutritionnelle (teneur en lipides, profil en acides gras du filet). La qualité de la perche présente une variabilité selon l'origine géographique, la saison de capture et le mode d'élevage. Pour les poissons sauvages, cette variabilité affecte principalement la composante organoleptique et la composante nutritionnelle. Les perches d'élevage se différencient des poissons sauvages par les composantes technologiques et nutritionnelles: les teneurs en graisse périviscérale augmentent avec le niveau d'intensification de l'élevage, de même que les teneurs en acides gras mono-insaturés et poly-insaturés n-6 (n-6 PUFA) au détriment des n-3 PUFA. Il n'existe donc pas une qualité de la perche mais plutôt des qualités. Dès lors, des hypothèses ont été formulées quant aux facteurs responsables de cette variabilité, puis testées. Deux populations de perches sauvages d'origine géographique différente ont été élevées, dès le stade œuf, au laboratoire, dans des conditions environnementales et trophiques identiques. Les résultats ont montré que seule la composante nutritionnelle présente des différences entre ces deux populations. Ainsi, l'expression phénotypique de la qualité est sous la dépendance du facteur origine (génotype) et de facteurs environnementaux. Parmi ceux-ci, 4 facteurs à 2 modalités ont été testés dans 8 unités expérimentales par plan d'expériences fractionnaires: origine des lipides alimentaires, taux de rationnement, densité et domestication. La domestication et l'origine des lipides alimentaires sont les facteurs essentiels du déterminisme de la qualité chez la perche. Ils agissent soit en facteur simple soit en interaction
The purpose of these experimental studies was to assess the variability of quality in farmed and wild Eurasian perch (Perca fluviatilis) and its determinism. Quality is divided into three components: organoleptical (morphology and color), technological (filleting yield, morpho-anatomical index) and nutritional (total lipids content and fatty acids composition in fillet). The quality of perch shows variability according to the geographic origin, season and rearing systems. Farmed perch differ from wild counterparts by technological and nutritional components: perivisceral fat content and n-6 poly-unsaturated fatty acids (PUFA) increase with the intensification level of farmed system, whereas n-3 PUFA decrease. Thus, there is not only one perch quality but rather many perch qualities. Consequently, hypothesis have been formulated about factors responsible for the variability of quality and then tested. Two populations of wild perch from different geographic origin were reared in laboratory from eggs stage, in the same environmental and trophic conditions. The results show that only nutritional component displays differences between the two populations. Thus, phenotypical expression of the quality is under control of both origin (genotype) and environmental factors. Among these factors, 4 factors with 2 modalities were tested in 8 experimental units using a fractional factorial design: dietary lipids origin, feeding rate, density and domestication. Domestication and dietary lipids origin (simple factor or interaction) were found as the main factors of the determinism of perch quality

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Mairesse, Guillaume Brun-Bellut Jean. „Déterminisme ante mortem et variabilité de la qualité nutritionnelle, technologique et organoleptique (couleur et morphologie) de la perche commune perca fluviatilis (L.)“. Vandoeuvre-les-Nancy : INPL, 2005. http://www.scd.inpl-nancy.fr/theses/2005_MAIRESSE_G.pdf.

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Bouzid, Lamine Wafa. „Structure génétique de Ligula intestinalis (Cestode : Diphyllobothriidea), parasite des poissons d'eau douce“. Toulouse 3, 2008. http://thesesups.ups-tlse.fr/296/.

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Les parasites présentant une large distribution géographique et un cycle de vie complexe offrent une rare occasion pour l'étude des mécanismes de spéciation et d'évolution. Ligula intestinalis (Cestoda, Diphyllobothriidea) présente une large distribution géographique et évolue dans un cycle de vie à plusieurs hôtes. Les études montrent que le spectre d'hôte varie en fonction des populations étudiées et qu'il existe des différences de pathologie entre des espèces hôtes vivant en sympatrie. En outre, le tableau de L. Intestinalis est d'autant plus complexe du fait de la paraphylie de cette espèce avec les espèces Ligula colymbi et Digramma interrupta. Le but de cette étude est de comprendre l'origine des différences écobiologiques et des discordances phylogénétiques et de tester l'hypothèse de l'existence de différentes lignées/espèces de ce parasite. Pour ce faire, nous avons analysé la phylogénie et la structure génétique de plérocercoides de ligules appartenant à différentes espèces hôtes et régions géographiques à large échelle. Les résultats basés sur les séquences génomiques montrent l'existence de différents patrons évolutifs: A l'échelle locale, une structure génétique plate a été trouvée et est vraisemblablement due à la migration de l'hôte définitif empêchant la formation d'entités génétiques différentes. A contrario, à large échelle des groupes génétiquement distants et bien isolés sont présents montrant une forte correspondance entre la structuration génétique et l'isolement géographique. De plus, une structuration liée à l'espèce hôte est également observée. Les spécimens de ligules identifiés comme des individus de l'espèce L. Colymbi se répartissent dans différents clades de L. Intestinalis tandis que les individus de Digramma montrent une différentiation claire du reste des individus de Ligula. Cependant, leur clade monophylétique apparaît au sein des spécimens de L. Colymbi et L. Intestinalis. Ainsi le genre Digramma devra être reconsidéré
Parasite species with global distribution and complex life cycle offer a rare opportunity to study mechanisms of speciation and evolution. Ligula intestinalis (L. ) (Cestoda, Diphyllobothriidea) has a widespread distribution and a life cycle with several hosts Available records indicate that the host spectra used by this species is not uniform across the investigated populations and show differences in the pathology between sympatric cyprinid species. Furthermore, complication of L. Intestinalis picture stems from the indication that this species may be paraphyletic with the species Ligula colymbi and Digramma interrupta. The aim of this study was to understand the origin of eco-biological differences and phylogenetic discrepancies and to test the hypothesis of the existence of several strains/species. . For this purpose, phylogeny and genetic structure have been analyzed for Ligula plerocercoids native to different host species and geographic regions at a global scale. Data based on genomic sequences and hypervariable markers show different evolutionary patterns: At a local scale, a flat genetic structure was found and is most likely due to bird migration preventing the creation of different genetic strains/species. In contrast, at a global scale, genetically distant and well separated clusters are present, indicating a conspicuous correspondence between genetics and geography. Beside geography, obvious host-specific-based structures are found. Ligula specimens identified as L. Colymbi are partitioned in separate clades of L. Intestinalis thus questions the reliability of species identification primarily based on definitive host species when morphological characters are inconclusive. Samples of Digramma show a clear differentiation from the analysed Ligula specimens. However, their monophyletic clade appears within Ligula specimens indicating that D. Interrupta may well represent a valid species of the genus Ligula rather than of Digramma

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Chevalier, Mathieu. „Changements globaux et poissons d'eau douce : déterminants et implications de variations démographiques“. Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/2629/.

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Les changements climatiques on fait l'objet d'une attention grandissante, mais leurs influences sur les dynamiques de populations restent mal appréhendées. Nos résultats montrent que la température influence les dynamiques de populations de plusieurs espèces de poissons d'eau douce en France. Bien que des mécanismes communs aient été mis en évidence, les dynamiques de populations varient fortement en fonction des conditions environnementales locales. Les caractéristiques intrinsèques des espèces, au contraire de leur histoire évolutive, apparaissent comme des déterminants importants des dynamiques observées. Ces résultats pourraient permettre de mettre en place des mesures de gestion adaptées pour ces espèces, visant à réduire l'impact des changements environnementaux à venir
Climate change has been a subject of great interest across the past few years but its influence on population dynamics has seldom been considered. In this thesis, we demonstrate that climatic factors and in particular water temperatures have an influence on population dynamics of several freshwater fish species found in French rivers. Although common mechanisms acting at large spatial scales have been identified for the different species, considerable variations among populations have been revealed due to spatial heterogeneity of environmental conditions. Intrinsic characteristics of species appeared as important determinants of interspecific differences in population dynamics, contrary to their evolutionary history. Our results could be used to set up management conservation planning to limit the consequences of climate warming on freshwater fish species

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Cilleros, Kévin. „Diversité et règles d'assemblage des communautés de poissons d'eau douce de Guyane“. Thesis, Toulouse 3, 2017. http://www.theses.fr/2017TOU30287/document.

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Les écosystèmes tropicaux, en particulier les écosystèmes amazoniens, sont connus pour abriter une importante diversité d'organismes, terrestres ou aquatiques. Cependant, les causes et les processus responsables de cette grande diversité dans les assemblages de poissons d'eau douce restent encore peu connus, et leur identification est un fort enjeu dans l'évaluation future des impacts des perturbations humaines qui sont grandissantes dans ces milieux. Nous avons étudié les processus qui façonnent la diversité et la structure des assemblages de poissons d'eau douce de Guyane dans les petits cours d'eau et les fleuves non impactés par les activités humaines. La diversité au sein des assemblages de petits cours d'eau augmente le long du gradient amont/aval et dans les milieux où l'habitat est plus diversifié. L'identité des espèces change le long de ce gradient, définissant des zones le long du cours d'eau. Les relations spatiales entre les assemblages et leur isolement ont aussi un fort effet sur les assemblages. En incorporant les informations sur les traits des espèces (diversité fonctionnelle) et leur relation de parenté (diversité phylogénétique), nous avons montré que la diversité au sein des assemblages n'était pas influencée par l'environnement ou les interactions entre les espèces. Nous avons aussi confirmé le fort effet de la limite à la dispersion entre les assemblages, en lien avec l'histoire passée des bassins versants, dans les petits cours d'eau et dans les fleuves. De telles études sur les processus structurant les assemblages nécessitent l'acquisition de données biologiques plus complètes, et donc le développement d'une nouvelle méthode d'échantillonnage qui soit exhaustive et non invasive. Pour cela, nous avons testé le metabarcoding environnemental (l'identification moléculaire des espèces présentes à partir d'un échantillon d'eau). Cette méthode donne des résultats complémentaires aux pêches traditionnelles et nécessite encore un travail de développement et des tests supplémentaires pour améliorer son efficacité et permettre son utilisation pour identifier les processus structurant les assemblages. Ces travaux, aussi bien pratiques que théoriques, sont nécessaires au développement d'un meilleur cadre conceptuel sur la structure des assemblages de poissons tropicaux, et dans la construction d'indicateurs d'impacts d'activités humaines sur les écosystèmes
Tropical ecosystems, especially Amazonian ecosystems, host a great diversity of terrestrial and aquatic organisms. However, the causes and the processes behind this high diversity for freshwater fish assemblages are little known, but their identification will be an asset in the assessment of anthropogenic impacts that are increasing in these regions. We studied the processes that shape the diversity and the structure of freshwater fish assemblages of non-impacted streams and rivers located in French Guiana. Within-assemblage diversity increased along an upstream/downstream gradient and was higher in sites where the habitat was diversified. Species identity changed along this gradient, which created zones along the stream. Spatial relationships between assemblages and their isolation also greatly impacted species assemblages. Using information about species traits (functional diversity) and their phylogenetic relationships (phylogenetic diversity), we showed that within-assemblage diversity was not influenced by the environment or by species interactions. We also confirmed that dispersal limitation, linked with the past history of drainage basins, had a strong effect on assemblage structure in both streams and in rivers. Future investigations on the processes structuring fish assemblages will need to acquire more exhaustive biological data, and therefore to develop an efficient, and non-destructive sampling method. To this aim, we evaluated the efficiency of environmental metabarcoding applied to aquatic assemblages (the molecular identification of species present from a water sample) and compared it to traditional sampling methods. Currently, metabarcoding gives complementary information to traditional sampling. It thus needs developments and further tests to increase its efficiency and allow its use for assembly processes studies. Pursuing the formalization of a conceptual framework to investigate assembly rules together with the development of an efficient fish sampling protocol are now needed to better understand the structure of tropical fish assemblages. Those theoretical and practical developments will contribute to better evaluate anthropogenic disturbances on aquatic ecosystems

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Birgi, Emile. „Monogènes parasites de Poissons d'eau douce au Tchad et au Sud-Cameroun : taxonomie et essai de biogéographie comparée“. Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20173.

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81 especes de dactylogyridea ont ete decouvertes et decrites chez 78 especes de poissons hotes. Un genre nouveau est propose. On signale, dans la majorite des cas, un parasitisme branchial simultane par des especes congeneriques parfois nombreuses. Un parasitisme resultant d'un phenomene de capture est mis en evidence. Une systematique intragenerique est ebauchee sur la base de la morphologie de l'appareil copulateur male. La comparaison des deux regions etudiees permet d'avancer des hypotheses sur la repartition biogeographique des parasites et des poissons hotes

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April, Julien. „Étude de l'évolution et de la diversité des poissons d'eau douce de l'Amérique du Nord par une approche génétique comparative“. Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/30173/30173.pdf.

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La variation génétique des poissons d’eau douce de l’Amérique du Nord a été analysée aux niveaux intraspécifique et interspécifique afin d’approfondir les connaissances actuelles sur l’évolution de la biodiversité et de faciliter la conservation de cette richesse. Premièrement, une banque de données de séquence d’ADN mitochondrial (codes-barres génétiques) a été générée pour 5674 individus représentant 752 espèces dans le but d’établir un outil d’identification moléculaire et de fournir une calibration de l’incertitude taxonomique. Cette analyse démontre que 90 % des espèces peuvent être délimitées à l’aide de codes-barres génétiques. De plus, il apparait que la taxonomie actuelle pourrait largement sous-estimer la diversité des poissons d’eau douce dans son ensemble tout en surestimant la diversité spécifique de certains groupes particuliers. Deuxièmement, les niveaux de divergences génétiques intraspécifique et interspécifique ont été étudiés afin d’identifier les mécanismes évolutifs responsables des patrons généraux de répartition de la biodiversité. L’hypothèse suggérant un rôle combiné des cycles glaciaires du Pléistocène et de l’activité métabolique influençant les taux de mutation est appuyée par les données représentant la presque totalité des poissons d’eau douce de l’Amérique du Nord. Troisièmement, les patrons de variation aux niveaux de l’ADN mitochondrial et de l’ADN nucléaire (AFLP) ont été analysés parmi plusieurs paires de lignées évolutives codistribuées dans le nord-est de l’Amérique afin de vérifier l’importance du processus de spéciation allopatrique. Les résultats indiquent que l’est du bassin des Grands Lacs représente une zone de suture impliquant plusieurs taxons et que les niveaux de divergence sont variables d’une paire de lignées à l’autre. Parmi ces paires de races glaciaires, celles divergeant par plus de 2 % au niveau de l’ADN mitochondrial présentent d’importants signes d’isolement reproducteur. En décrivant les diverses étapes du processus de spéciation allopatrique au sein de différentes espèces d’une même région, cette étude démontre que le processus de spéciation allopatrique a joué un rôle important parmi les poissons d’eau douce de l’Amérique du Nord. L’ensemble de ces travaux aura donc permis de fournir un nouvel outil d’identification et d’appuyer l’hypothèse stipulant que la spéciation allopatrique est le principal moteur de diversification pour les poissons d’eau douce.
Intraspecific and interspecific genetic variation has been studied among North America’s freshwater fishes in order to improve our current knowledge on the evolution of biodiversity and to facilitate the conservation of this richness. Firstly, we generated a standard reference library of mitochondrial DNA sequences (DNA barcodes) for 752 North American freshwater fish species to provide an independent calibration of taxonomic uncertainty and to establish a more accessible molecular identification key for its application. This study demonstrates that 90% of known species can be delineated using barcodes. Results further suggest that current North American freshwater fish taxonomy at the species level significantly conceals diversity in some groups, while artificially creating diversity in others. Secondly, we studied intraspecific and interspecific genetic divergence in order to describe and identify the underlying evolutionary causes of general patterns of biodiversity distribution. This study supports a dual role involving both the late Pliocene-Pleistocene climatic fluctuations and metabolic rate in determining latitudinal gradients of genetic divergence. Thirdly, patterns of mitochondrial DNA and nuclear DNA (AFLP) have been studied among different codistributed pairs of glacial lineages in order to verify the generality of allopatric speciation. This study shows that the Eastern Great-Lakes drainage represents a multi-species suture zone for glacial lineages of freshwater fishes with variable levels of genetic divergence. AFLP analyses among four pairs of lineages indicate that lineages with relatively deep levels of mitochondrial DNA sequence divergence (>2 %) developed strong reproductive barriers. By describing different levels of divergence and reproductive isolation in different co-occurring fishes, we offer strong evidence that allopatric speciation has contributed significantly to the diversification of North Eastern American freshwater fishes. This thesis therefore offers a new molecular identification tool for freshwater fish of North America and brings strong evidences that allopatric speciation has played a predominant role in generating biodiversity.

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Leprieur, Fabien Brosse Sébastien. „Les introductions d'espèces de poissons d'eau douce distribution spatiale, déterminants et impacts sur les espèces natives /“. Toulouse (Université Paul Sabatier, Toulouse 3), 2008. http://thesesups.ups-tlse.fr/151.

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Hutagalung, Rory Anthony. „Évolution du peuplement piscicole de la Garonne à Toulouse dans un environnement anthropise : analyses biologique et écologique“. Toulouse, INPT, 1998. http://www.theses.fr/1998INPT018A.

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L'étude de la variabilité physico-chimique et de la typologie ichtyenne a été réalisée dans les deux bras de la Garonne à Toulouse de 1994 à 1997. Ces deux bras sont soumis aux contraintes de l'endiguement, des barrages, et aux rejets industriels pour le bras inférieur. Ces perturbations créent une singularité au niveau du peuplement piscicole, qui apparaît différent du peuplement à l'amont et à l'aval. Les rejets industriels ont eu pour effet de rendre le bras inférieur abiotique jusqu'en 1985, mais une diminution de ces mêmes rejets depuis 1992 a conduit à la recolonisation de ces rejets depuis 1992 a conduit à la recolonisation de ce bras par une communauté piscicole aussi diversifiée que celle du bras supérieur. Les investigations écotoxicologiques et écologiques montrent peu de différences entre les deux bras. Paradoxalement, la densité de poissons est plus importante dans le bras pollué. Cependant, l'étude de la biologie permet de mieux démontrer l'effet de perturbations anthropiques, notamment sur la croissance. En effet, celle-ci apparaît moins rapide dans le bras pollué que dans le bras non pollué. Le peuplement de l'ensemble des deux bras est constitué de 30 espèces, et très largement dominé par les cyprinidés. Un tel peuplement est caractéristique des zones situées plus en aval, et se retrouve sur la Garonne à 100 km de Toulouse. Ainsi, lorsque l'on considère l'évolution du peuplement de poissons de la Garonne à Toulouse d'un point de vue spatio-temporel, celui-ci apparaît comme une discontinuité dans le continuum fluvial, et présente une différence entre les communautés piscicoles des deux bras. De plus, il a été également mis en évidence que ce peuplement change en fonction des saisons et selon le type d'habitat considéré.

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Keith, Philippe. „Evolution des peuplements ichtyologiques de France et stratégies de conservation“. Rennes 1, 1998. http://www.theses.fr/1998REN10092.

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L'histoire de l'ichtyologie française est très riche et l'évolution des peuplements ichtyologiques d'eau douce a été très importante, notamment au cours des deux derniers siècles. Tel qu'il nous apparait actuellement, le peuplement ichtyologique de France est le fruit d'une multitude de phénomènes qui se sont déroulés ou se déroulent encore à différents pas de temps. L'étude des changements intervenus sur la période allant de la fin du tertiaire jusqu'à nos jours est fondamentale pour la conservation et la gestion de l'ichtyofaune. Bien des problèmes ou des conflits générés par les introductions d'espèces, par exemple, peuvent changer d'aspect lorsque l'on tient compte de la spécificité des bassins et de l'histoire de leurs peuplements. Ce travail étudie donc les apports de la biogéographie, de la paléontologie, de l'archéo-ichtyologie, de l'écologie et de l'histoire pour la compréhension de l'évolution des peuplements ichtyologiques de France. Il analyse en premier lieu les fossiles tertiaires et les restes archéo-ichtyologiques quaternaires en les replaçant dans le contexte européen et national, puis il étudie les répartitions historiques et actuelles des espèces à l'aide d'outils spécifiques. Il propose des peuplements de référence pour les grands bassins versants français, définissant un état de référence et permettant de comparer la répartition des espèces entre cet état et l'état actuel afin de mesurer l'impact des facteurs naturels et anthropiques sur l'évolution des peuplements dans les 5000 dernières années. Il établit, en liaison avec l'évolution des répartitions et des populations, la liste des espèces menacées, propose pour celles-ci, en liaison avec leur écologie, des mesures de conservation et l'établissement de plans d'actions ; enfin, il analyse le rôle des outils existants, notamment des espaces protégés, pour la conservation de l'ichtyofaune.

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Hugueny, Bernard. „Biogéographie et structure des peuplements de poissons d'eau douce de l'Afrique de l'ouest : approches quantitatives“. Paris 7, 1989. http://www.theses.fr/1989PA077198.

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En faisant appel à trois principaux domaines de l'écologie théorique (biogéographie insulaire, zones refuges forestières et river continuum concept) et a l'aide d'outils statistiques et quantitatifs, une étude de la biogéographie et de la structure des peuplements de poissons d'eau douce d'Afrique de l'ouest a été entreprise, afin de rechercher certaines lois générales de leur organisation. L'étude a été faite a trois niveaux de perception géographique emboites. Au premier niveau (Afrique de l'ouest dans son ensemble), on s'est intéresse a la richesse spécifique des fleuves, a la délimitation de régions biogéographiques et a la mise en évidence de centres d'endémisme. Les résultats sont discutes en fonction de la biogéographie insulaire et de l'histoire climatique de l'Afrique au cours du pléistocène. Dans un contexte de biogéographie insulaire, les études réalisées au second niveau de perception géographique (région sahélo-soudanienne) sont centrées sur le rôle des processus d'immigration et d'extinction dans la mise en place des peuplements. Dans le niandan (affluent du haut Niger), troisième niveau de perception géographique, les études ont porte essentiellement sur la modification de la richesse et de la composition (spécifique et trophique) des peuplements selon la taille de la rivière et selon les caractéristiques locales du milieu (nature du substrat et vitesse du courant). Les caractéristiques de la zonation longitudinale mise en évidence sont discutées en fonction du river continuum concept

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Perga, Marie-Elodie. „Origines et flux de carbone en lacs : étude par analyse de la composition en isotopes stables du carbone et de l'azote du zooplancton et des poissons“. Chambéry, 2004. http://www.theses.fr/2004CHAMS031.

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Les communautés piscicoles sont situées au sommet des chaînes trophiques. Cette position dans le réseau trophique lacustre leur confère, de ce fait, un rôle potentiel d'intégrateurs des processus sous- jacents, à l'échelle de l'écosystème. De plus, la composition en isotopes stables d'un organisme dépend des voies qui transfèrent le carbone jusqu'à cet organisme. Notre hypothèse de base était donc que la composition en isotopes stables des poissons pourrait donc constituer un indicateur relatif de fonctionnement trophique des lacs. Pour valider cette hypothèse, nous avons employé, dans un premier temps, le corégone, Coregomus lavaretus, un salmoniforme zooplanctonophage commun dans les lacs alpins, comme modèle biologique. Une étude préalable avait révélée que la composition en isotopes stables du carbone des corégones était très variable au sein des lacs alpins. Selon notre hypothèse, cette variabilité serait le reflet de différences dans les voies de transferts du carbone dans les réseaux trophiques de ces lacs. Les facteurs explicatifs de cette variabilité inter-lacs ont donc, dans un premier temps, été étudiés. Au terme de cette première partie, la composition isotopique du corégone s'est montrée être effectivement un indicateur du fonctionnement trophique des lacs. Les perturbations peuvent modifier les flux de carbone au sein des systèmes et devraient, de fait, conduire à des changements dans les compositions isotopiques des communautés de poissons. L'effet de deux perturbations d'origine anthropique sur la composition isotopique des poissons a, par la suite, été analysé: la première est relative à l'eutrophisation -restauration de deux lacs alpins, la seconde concerne le marnage dans deux réservoirs africains. Les résultats de ces deux études indiquent que des modifications majeures, engendrées par ces perturbations, dans l'origine et les flux de carbone dans les réseaux trophiques, sont enregistrées dans l'histoire isotopique des communautés piscicoles
Fish communities occupy the top of food chains. How fish obtain their constitutive carbon depends consequently of all the carbon pathways at the downer levels of the food web. This trophic position confers to fish a potential role of integrators of the underlying processes, at the ecosystem scale. Moreover, stable isotopes composition of an organism depends on all the pathways that transfer carbon up to this organism. Consequently, we wondered in what extent the stable isotopes composition of fish could be a proxy of the trophic functioning of lakes. To address this assumption, whitefish, Coregonus lavaretus, a zooplanktivorous salmonid common in alpine lake, was, in a first time, used as biological model. A preliminary study had revealed the stable isotope composition of whitefish was quite variable among alpine lakes. According to our idea, this variability mirrors differences in the carbon pathways of the food web of these lakes. To understand what was reflected by this variability, we studied initially in what extent it resulted from intrinsic factors (such as lake size or trophic status). This study has then lead us to deepen the role played by the zooplankton compartment in carbon pathways up to Whitefish. In the final stage of this first part, the isotopic composition of whitefish appeared as a proxy for lake trophic functioning. Changes in environmental factors can alter carbon pathways in food webs. If fish are efficient integrators of carbon pathways, impacts of perturbations should be mirrored on their isotopic compositions. Impacts of two anthropogenic perturbations of stable isotope composition of fish were then evaluated : the first one relates to eutrophication - restoration of two alpine lakes, the second one to water levels changes in two Malian reservoirs. Results from these two studies reveal that major changes, ensuing from these perturbation, in carbon origins and fluxes within lake food webs are recorded in the isotopic history of fish communities

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Belkessam, Djamila. „Structure des peuplements de poissons de cours d'eau du nord ouest de la France : degré de saturation, interactions biotiques et variabilité temporelle“. Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2001. http://www.theses.fr/2001MNHN0010.

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Connaître les facteurs et les processus responsables des variations de la structure spatio-temporelle des peuplements, s'impose comme une nécessité fondamentale pour l'étude de la biodiversité et la mise en place d'outils de gestion. Ce travail est consacré à l'étude de la structure des peuplements de poissons de cours d'eau du nord-ouest de la France. Il révèle les caractéristiques suivantes : 1- à l'échelle régionale (d'un bassin versant), la richesse spécifique des peuplements de poissons est régulée, en partie, par le jeu des processus d'extinction et de colonisation, et ne semble pas, à priori, limitée par la diversité de l'habitat. 2- à l'échelle locale les peuplements sont insaturés en espèces et en individus. Les interactions biotiques, n'ont pas un effet prépondérant sur leur structure. Celle-ci serait régulée par des processus s'opérant à une échelle spatiale plus large, tel que la colonisation à partir de sites voisins. Ces résultats soulignent l'importance des facteurs régionaux dans la régulation des peuplements locaux. 3- on note un maintien de la composition spécifique des peuplements (persistance) et une relative stabilité de leur structure temporelle. En revanche, les populations sont fortement fluctuantes. Cette instabilité est déterminée, en partie, par les importantes variations stochastiques des conditions hydroclimatiques. 4- l'influence des facteurs hydroclimatiques sur les populations dépend de leurs positions sur le bassin versant, de même que des stratégies démographiques des espèces vis à vis des contraintes abiotiques. La stochasticité environnementale tend à modifier les interactions inter-spécifiques et intra-spécifiques (densité-dépendance) de même que la configuration des peuplements. Enfin,

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Leprieur, Fabien. „Les introductions d'espèces de poissons d'eau douce : distribution spatiale, déterminants et impacts sur les espèces natives“. Toulouse 3, 2007. http://thesesups.ups-tlse.fr/151/.

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Bien que les espèces non natives de poissons d'eau douce soient bien identifiées, les facteurs déterminant leur distribution spatiale ainsi que leurs impacts sur la biodiversité sont encore peu connus, en particulier à de larges échelles spatiales. Dans ce contexte, cette thèse vise : (i) à une meilleure compréhension de l'impact des espèces non natives de poissons d'eau douce sur les espèces natives ; et (ii) à identifier les facteurs qui contrôlent la distribution spatiale des espèces non natives. Pour cela, différents niveaux de perception du processus d'introduction d'espèces et différentes échelles spatiales ont été considérés. Les résultats obtenus à l'échelle locale (135 stations au sein d'un bassin hydrographique de Nouvelle Zélande) ont permis de mettre en évidence que l'impact d'une espèce invasive (la truite, Salmo trutta L. ) sur une espèce native (Galaxias anomalus Stockell) peut varier spatialement en fonction des caractéristiques abiotiques locales. En particulier, les perturbations anthropiques, telles que la modification des habitats résultant des variations de débit, ne favorisent pas forcément les espèces invasives. Ainsi, la conservation d'une espèce native menacée nécessite des mesures de gestion adaptées au contexte environnemental local. Enfin, une étude expérimentale souligne le fait qu'une espèce considérée à priori comme invasive et nuisible (le poisson chat, Ameiurus melas Raff. ) doit faire l'objet d'études quant à son impact réel sur les espèces natives ; ceci afin de mettre en place des mesures de gestion adaptées aux caractéristiques comportementales et écologiques de l'espèce impactée. Les résultats obtenus à l'échelle régionale (bassin hydrographique) montrent que les introductions d'espèces de poissons d'eau douce en Europe ont conduit à une augmentation de la diversité alpha des bassins hydrographiques (c'est-à-dire une augmentation du pool régional d'espèces), mais ont provoqué une diminution de la diversité beta (homogénéisation taxonomique). L'augmentation du pool régional de poissons d'eau douce en Europe ne doit pas forcément être interprétée comme bénéfique pour la biodiversité, car les extinctions d'espèces se déroulent généralement à des échelles de temps plus grandes que le phénomène d'introduction d'espèces. .
Although non-native fish species are well identified, the determinants of their spatial distribution and their impacts on biodiversity are poorly documented, especially at large spatial scales. In that context, this thesis aims (i) at improving our knowledge on the potential impacts of non-native fish species and (ii) at identifying the factors controlling their spatial distribution. This was achieved by considering different spatial scales. The local-scale approach (stream reach within a river basin) first shows that local abiotic conditions can influence the spatial distribution of an invasive species (brown trout, Salmo trutta L. ) in a New Zealand river basin and hence can mediate its impact on a native species (Galaxias anomalus Stockell). Especially, anthropogenic disturbances (such as water abstraction for agricultural purposes) do not necessarily promote species invasions as reported by most previous studies. Therefore, the effective conservation of threatened native species implies the implementation of management strategies adapted to the local environmental context. Last, an experimental study reveals that a species considered as invasive (such as brown bullhead, Ameiurus melas Raff. ) should be systematically studied in regards to its impact on native species. This is necessary to set up management strategies that account for the behavioural and ecological characteristics of the impacted native species. The regional-scale approach (river basin) first shows that the introductions of non-native fish species in Europe led to (i) an increase of the size of the regional pool of species (i. E. An increase in alpha diversity) and (ii) a decrease of the taxonomic similarity between river basins (i. E. A decrease in beta diversity corresponding to a taxonomic homogenization). .

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Toussaint, Aurèle. „Diversité fonctionnelle des poissons d'eau douce à l'échelle mondiale : patrons, déterminants et impacts des activités humaines“. Thesis, Toulouse 3, 2016. http://www.theses.fr/2016TOU30403.

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Pendant longtemps, la biodiversité était caractérisée uniquement par sa diversité taxonomique, c'est-à-dire par le nombre et la composition en espèces des assemblages. Cependant, de récentes études montrent que la biodiversité ne peut être résumée uniquement à cette composante, car elle ne prend pas en compte les caractéristiques écologiques des espèces. Pour cela, la diversité fonctionnelle est un outil permettant de considérer les traits fonctionnels des espèces. Peu d'études à larges échelles ont décrit cette facette de la biodiversité et son lien avec la diversité taxonomique. L'objectif de cette thèse est donc de 1) décrire et comprendre la distribution de la diversité fonctionnelle des assemblages de poissons d'eau douce à l'échelle globale et de 2) quantifier les conséquences des activités humaines sur cette facette. Pour cela, nous avons construit une base de données de traits fonctionnels de plus de 9000 espèces de poissons d'eau douce. Nous avons mis en évidence que la diversité fonctionnelle mondiale est distribuée de façon très hétérogène. Elle est essentiellement concentrée dans les bassins Néotropicaux, contrastant avec des zones taxonomiquement riches mais fonctionnellement redondantes comme l'Afrique ou l'Asie. Ces patrons pouvaient être expliqués par une diversification fonctionnelle de certains ordres de poissons Néotropicaux. À l'échelle des bassins versants, nous avons montré une faible, mais significative, influence des variables environnementales en particulier des variables historiques pour expliquer l'hétérogénéité des patrons de diversité fonctionnel des bassins versants. Nous avons également montré que les activités humaines, sous l'effet des introductions d'espèces, ont contribué à modifier considérablement les patrons de diversité fonctionnelle par rapport aux changements de diversité taxonomique. Ces changements mettent en évidence la nécessité de prendre en compte les conséquences des espèces non-natives sur le fonctionnement des écosystèmes. Dans ce travail de thèse, nous avons ainsi démontré que la diversité fonctionnelle est une facette complémentaire à la diversité taxonomique chez des poissons d'eau douce. Ces résultats contribuent à enrichir les connaissances de la structure des assemblages et peuvent avoir des implications en termes de gestion de la biodiversité
For a long time, biodiversity was characterised solely by its taxonomic diversity, i.e. the number and species composition of assemblages. However, recent studies show that biodiversity cannot be summed up solely by this component as it does not take into account the ecological characteristics of species. For this, functional diversity is a tool for considering the functional traits of species. Few large-scale studies have described this facet of biodiversity and its link with taxonomic diversity. The aim of this thesis is therefore to 1) describe and understand the distribution of functional diversity of freshwater fish assemblages on a global scale and 2) quantify the consequences of human activities on this facet. For this purpose, we have built a database of functional traits of more than 9000 species of freshwater fish. We have shown that the world's functional diversity is very heterogeneously distributed. It is essentially concentrated in the Neotropical basins, contrasting with taxonomically rich but functionally redundant areas such as Africa or Asia. These patterns could be explained by a functional diversification of certain orders of Neotropical fish. At the watershed scale, we showed a weak, but significant, influence of environmental variables, in particular historical variables, to explain the heterogeneity of the functional diversity patterns of watersheds. We have also shown that human activities, under the effect of species introductions, have contributed to a significant change in functional diversity patterns compared to changes in taxonomic diversity. These changes highlight the need to take into account the consequences of non-native species on ecosystem functioning. In this thesis work, we have thus demonstrated that functional diversity is a complementary facet of taxonomic diversity in freshwater fish. These results contribute to knowledge of the structure of assemblages and may have implications in terms of biodiversity management

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Madéore-Le, Pichon Céline. „Une approche "Paysage aquatique" pour une meilleure connaissance du fonctionnement des écosystèmes fluviaux et l'amélioration de la conservation des peuplements de poissons“. Paris 6, 2006. http://www.theses.fr/2006PA066538.

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Comte, Lise. „Changements globaux et distribution spatiale des espèces de poisson d'eau douce : observations récentes et prédictions futures“. Toulouse 3, 2013. http://thesesups.ups-tlse.fr/2258/.

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Les changements climatiques actuels reçoivent une attention grandissante mais leurs impacts sur la biodiversité restent mal appréhendés. Cette thèse a permis de mettre en évidence une réponse cohérente des poissons d'eau douce au réchauffement climatique des dernières décennies se traduisant par des remontées en altitudes et vers les sources. Il est cependant apparu que des facteurs non-climatiques avaient majoritairement contribué aux changements observés, ce qui pourrait indiquer l'existence de délais importants dans la réponse des espèces et avoir des conséquences importantes pour leur capacité à faire face aux changements climatiques à venir. Néanmoins, certains mécanismes en lien avec des caractéristiques clés des espèces et leur histoire évolutive semblent conditionner leur capacité à persister in situ ou à suivre leur niche climatique. Ces résultats pourraient avoir des implications importantes quant à notre capacité à anticiper les changements à venir et à initier des politiques de gestion adaptées, dont les missions futures ne peuvent désormais plus être conçues sans tenir compte de l'évolution du climat
Despite increasing recognition that recent climate changes are influencing biodiversity, the specific impacts of those changes are still largely unknown. This thesis highlights systematic stream fish species shifts towards higher elevation and upstream habitats, consistent with the geographic variation associated with climate change. The results demonstrated, however, that patterns in climate-driven range shifts were less marked than those attributed to non-climatic drivers, suggesting more severe longer-term effects of climate warming on stream fish and profound consequences on the ability of species to cope with future climate modifications. Nevertheless, the results also provide evidence that several mechanisms are linked to species' evolutionary history and some key biological and ecological traits, allowing species to persist in situ or to track their climatic niche through space. These research findings improve our ability to anticipate future climate change-induced impacts and will assist with initiating effective conservation and management strategies, which can no longer be effectively designed without taking into account climate change

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Gourene, Germain. „Révision systématique des Clupeidae d'eau douce de l'Ouest et du Centre africain : morphologie, biométrie, ostéologie et zoogéographie des genres Pellonula, Odaxothrissa, Cynothrissa, Poecilothrissa et Microthrissa“. Toulouse, INPT, 1988. http://www.theses.fr/1988INPT010A.

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Deux mille specimens ont ete examinés. Les résultats obtenus ont permis d'introduire la synonymie entre odaxothrissa et cynothrissa d'une part et entre microthrissa et poecilothrissa d'autre part. Le genre pellonula est confirmé et comprend deux espèces valides. Des synonymies sont établies. Au sein du genre microthrissa deux sous-genres ont été reconnus. Le nombre des genres valides des clupeidae dulcaquicole de l'ouest et du centre du continent africain a été réduit a dix. Une nouvelle clé générique a été établie ainsi qu'un cladogramme hypothétique représentant leur phylogénie

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Carvajal-Quintero, Juan. „Évaluation des déterminants de l'aire de répartition des poissons d'eau douce pour éclairer leur écologie et conservation“. Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30090.

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Comprendre la répartition géographique des espèces dans l'espace et le temps est un défi de longue date en écologie et évolution. Parmi les principales composantes de la répartition des espèces, la taille de l'aire de répartition géographique a été étudiée dans plusieurs groupes taxonomiques, et liée à de multiples facteurs écologiques et évolutifs. La taille de l'aire de répartition géographique des espèces est également liée au risque d'extinction, où les espèces occupant des aires géographiques plus petites présentent un risque d'extinction plus élevé, et relève donc d'une importance primordiale dans les stratégies de conservation. Les résultats concernant ces aspects fondamentaux et appliqués de la taille de l'aire de répartition géographique ont largement négligé les poissons d'eau douce, se concentrant généralement sur d'autres groupes de vertébrés (p.ex. les mammifères, les oiseaux). Cependant, les poissons d'eau douce, le groupe de vertébrés le plus diversifié, peuvent fournir de nouvelles perspectives sur les déterminants de la taille de l'aire géographique et sur l'impact des perturbations anthropiques en raison de la forme dendritique unique et la taille réduite de leur habitat (des réseaux fluviaux) par rapport aux autres écosystèmes terrestres et marins. Dans ce travail de doctorat, nous avons analysé pour la première fois les patrons globaux de la taille de l'aire géographique des espèces de poissons d'eau douce et testé les hypothèses explicatives précédemment proposées pour d'autres groupes taxonomiques. Nos résultats ont montré que la connectivité actuelle et historique sont les facteurs les plus importants qui déterminent la taille de l'aire de répartition géographique des poissons d'eau douce, contrastant avec les principaux déterminants signalés chez les vertébrés terrestres et marins. D'un point de vue appliqué, nous nous sommes concentrés sur la relation macroécologique communément observée entre la taille de l'aire géographique et la taille corporelle des espèces. Cette relation permettrait d'estimer la taille minimale de l'aire géographique nécessaire aux espèces pour leur persistance à long terme. En se basant sur les fluctuations temporelles des abondances des espèces, nous fournissons une validation mécaniste de cette relation, confortant son utilisation pour identifier les espèces vulnérables et leurs changements de risque d'extinction face aux réductions de l'aire géographique induites par des facteurs anthropiques. En utilisant un bassin fluvial tropical comme étude de cas, nous avons utilisé cette relation macroécologique pour quantifier les changements dans le risque d'extinction des espèces en raison de la fragmentation de leurs aires de répartition due au développement de l'hydroélectricité. Les résultats et les données compilés dans cette thèse représentent des informations utiles pour guider et informer la conservation des poissons d'eau douce et fourni des éléments pour continuer à combler les lacunes théoriques
Understanding the geographic distribution of species across space and time is one of the long-standing challenges in ecology and evolution. Among the major components of species distribution, the species' geographic range size has been studied across several taxonomic groups and has been related to multiple ecological and evolutionary factors. The geographic range size of species is also of paramount importance in conservation strategies because it consistently emerges as a key correlate of extinction risk, where species occupying smaller geographic ranges are assumed to have a higher risk of extinction. Results concerning these fundamental and applied aspects of geographic range size have largely neglected freshwater fish, commonly focusing on the usual vertebrate groups (e.g. mammals, birds). However, freshwater fish, the most diverse vertebrate group, can provide novel insights about the geographic range size determinants and threats because of the unique dendritic shape and reduced amount of their habitat (i.e. river networks) compared to other terrestrial and marine ecosystems. In this PhD work, we analyzed for the first time the global patterns of geographic range size in freshwater fish species and tested previous hypotheses proposed to explain the variation of geographic range size in other taxonomic groups. Our findings showed that current and historical connectivity are the most important factors driving the geographic range size of freshwater fishes, contrasting with the main determinants reported for terrestrial and marine taxa. From an applied point of view, we focused on the usually observed macroecological relationship between the species' geographic range size and body size. This relationship would allow estimating the minimum geographic range size needed by species for long-term persistence. Based on ecological theory of species temporal fluctuations of abundances, we provide a mechanistic validation of this relationship, supporting its use to identify vulnerable species and their changes in extinction risk through reduced geographic ranges induced by anthropogenic factors. Using a tropical river basin as a case study, we used this macroecological relationship to quantify changes in species extinction risk due to the fragmentation of their ranges caused by hydropower development. The results and the data compiled in this thesis represent useful information to guide and inform conservation in freshwater fish and give the opportunity to continue filling theoretical gaps

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Ben, Ammar Imen. „Approche comparée du déterminisme environnemental de l'induction du cycle de reproduction chez cinq poissons d'eau douce tempérée“. Thesis, Université de Lorraine, 2014. http://www.theses.fr/2014LORR0265/document.

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Un des moyens de développer durablement l’aquaculture européenne est la domestication d’espèces locales. Etant donné les coûts liés à la domestication d’une espèce, la mise en œuvre d’une démarche générique semble pertinente. Ainsi, l’analyse de 29 traits reproducteurs a généré une classification en 10 groupes structurés par la période de ponte et la température d’incubation des œufs. L’objet de cette thèse est de tester la pertinence de ces regroupements en étudiant l’effet d’une photophase constante longue PC et naturelle PN sur l’induction du cycle de reproduction chez des pondeurs printaniers précoces PPP (perche, sandre, gardon et brochet) et un pondeur printanier tardif PPT (rotengle). Au cours de ce travail, nous avons analysé des paramètres morpho-anatomiques, histologiques et physiologiques pour étudier les effets des traitements photopériodiques. De fortes similarités de réponse au traitement photopériodique entre les PPP ont été observées avec une inhibition du cycle de reproduction sous PC et une induction du cycle de reproduction sous PN. Si le développement gonadique et les teneurs en E2 et vitellogénine chez les femelles semblent être affectés de la même manière chez les espèces du même groupe, les teneurs en androgènes chez les deux sexes présentent des réponses espèce-spécifiques. Ceci suggère l’existence de mécanismes de régulation spécifiques qui semblent avoir peu de conséquences zootechniques. En conclusion, les similarités entre les PPP apportent des éléments de réponse sur la pertinence des regroupements surtout au niveau des paramètres les plus intégrateurs et sur la pertinence de la démarche générique qui s’appuie sur la biologie comparée
A way for the development of a sustainable inland aquaculture is the domestication of local species. As domestication usually results from a long, costly and empirical zootechnical process, the use of classifications could be a relevant strategy. In our laboratory, a generic method was developed based on grouping species sharing similar reproductive traits (29) and resulted in 10 clusters structured by spawning period and temperature of egg incubation. The aim of this work is to assess the relevance of this clustering by testing the effect of constant long (CP) and natural photoperiod (NP) on the onset of the reproductive cycle in “early spring” ESS (Eurasian perch, pikeperch, roach and pike) and a “late spring” spawner LSS (rudd). This work is based on a morpho-anatomic, histological and physiological analysis of the broodstock to study the effect of photoperiod treatments. Strong similarities were shown in the response of the ESS with inhibition of the reproductive cycle under CP and induction under NP. The gonadal development and the plasma levels of E2 and vitellogenin showed similar responses to the photoperiodic treatment between ESS, while, the androgens levels showed different responses even in species belonging to the same group and the same family. The observed similarities allow us to provide an evidence about the relevance of clusters especially for the most integrative parameters. However, even if extrapolation of current knowledge may be possible from Eurasian perch to other ESS especially for zootechnical purposes, the mechanisms of gonadogenesis regulation and especially androgenesis may be different between the studied species

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Birgi, Emile. „Monogènes parasites de poissons d'eau douce au Tchad et au Cameroun taxonomie et essai de biogéographie comparée /“. Grenoble 2 : ANRT, 1987. http://catalogue.bnf.fr/ark:/12148/cb376030212.

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Hette, Tronquart Nicolas. „Organisation trophique des peuplements piscicoles des cours d'eau : approche par l'analyse des isotopes stables“. Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2012. http://www.theses.fr/2012MNHN0022.

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L'étude des réseaux trophiques est un prérequis à la compréhension du fonctionnement des écosystèmes. Cependant, les déterminants potentiels des réseaux trophiques (disponibilité des ressources, stabilité et taille de l'écosystème) restent discutés. Dans ce contexte, 3 nouvelles questions portant sur les réseaux trophiques des cours d'eau sont abordés par l'analyse des isotopes stables. Une première étude confirme le rôle structurant du gradient amont-aval dans le fonctionnement des cours d'eau, en précisant son in fluence directe et indirecte sur le réseau trophique piscicole. Une deuxième étude montre l'incidence négative de la variabilité du régime thermique des cours d'eau sur la longueur de chaîne trophique et apporte un nouveau soutien au déterminant "stabilité de l'écosystème". Enfin, une troisième étude explore les effets de l'occupation des sols à 2 échelles spatiales, et suggère une influence complexe jouant sur la diversité des ressources et des niveaux trophiques du réseau.

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Seenevaragachetty, Jessica. „Approches biologiques pour la prévention et le traitement de la moisissure aquatique, saprolegnia parasitica, chez le poisson“. Thesis, Université Laval, 2013. http://www.theses.ulaval.ca/2013/29521/29521.pdf.

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Saprolegnia parasitica est une moisissure aquatique responsable des infections fongiques chez les poissons d’eau douce. Auparavant, ces infections étaient traitées au vert de malachite jusqu’à qu’il soit interdit à cause de ses propriétés cancérigènes. Les nouveaux enjeux de la recherche sont donc le développement de produits naturels pour prévenir et contrôler S. parasitica. Les expériences, in vitro, consistaient à déterminer la concentration minimale d’inhibition (CMI) par la méthode de graines de chanvre. Les expériences par bain, in vivo, consistaient à évaluer l’efficacité des produits sur des alevins infectés par S. parasitica. Le Neemazal WSP 5%, le Rhus typhina JN02141A et la bactérie Burkholderia cepacia ont présenté une activité antifongique contre S. parasitica. Cependant, le Rhus typhina JN02141A s’est avéré inefficace en présence d’alevins infectés par S. parasitica. Les prochaines étapes seraient donc la recherche des ingrédients actifs et de les tester sur des alevins infectés par S. parasitica.
Saprolegnia parasitica is a water mold responsible of the fungal infections of fish in fresh water environments. Previously, these infections were treated with malachite green until it is banned due to its carcinogenic properties. Novel research avenues include the development of natural products to prevent and control S. parasitica. The purpose of the experiments in vitro was to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) by the Hempseed MicroPlate (HeMP) – method. Experiments in bath in vivo were to assess the effectiveness of products on fry infected with S. parasitica. Neemazal WSP 5%, Rhus typhina JN02141A, and Burkholderia cepacia showed antifungal activity against S. parasitica. However, Rhus typhina JN02141A was ineffective on fry infected with S. parasitica. The further research is to identify the active ingredients and test them on fry infected with S. parasitica.

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Trinchet, Isabelle. „Effets toxicologiques de l'exposition chronique à des efflorescences de cyanobactéries productrices de microcystines sur les poissons d'eau douce : étude anatomo-pathologique“. Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2014. http://www.theses.fr/2014MNHN0008.

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Les microcystines sont des hépatotoxines fréquemment produites par les efflorescences de certains genres de cyanobactéries. Responsables de nombreux dommages tissulaires pouvant conduire au décès lors d’intoxications aiguës, leurs conséquences lors d’une intoxication chronique ont encore été peu étudiées. L’objectif de ce travail de thèse a été d’étudier l’impact d’une exposition chronique à des efflorescences de cyanobactéries productrices de microcystines sur les poissons d’eau douce. Pour cela, dans un premier temps, le poisson médaka Oryzias⠀latipes⠀a été utilisé pour évaluer la toxicité des microcystines lors d’une exposition sub-chronique (1 à 2 mois) au laboratoire à de faibles concentrations fréquemment rencontrées dans le milieu aquatique. La microcystine-LR, qui est un des variants les plus toxiques, a été choisie pour ces expérimentations. Ces analyses ont porté d’abord sur l’observation des lésions histologiques après 1 mois d’exposition à une concentration de 5µg. L-1de MC-LR. Puis, les effets à différentes doses (1 et 5µg. L-1) et différents pas de temps (14 et 28 jours) ont été étudiés afin de déterminer les lésions histologiques dues aux microcystines et leur évolution au cours de l’exposition ainsi que les variations de leur intensité. Les modifications de différents paramètres de reproduction à ces deux concentrations ont également été étudiées. Dans un deuxième temps, les effets toxiques liés à l’exposition chronique de poissons, dans l’environnement, à des efflorescences de cyanobactéries productrices de microcystines, ont été observés afin de les comparer aux résultats obtenus précédemment. Des poissons médakas ont ainsi été exposés, en cage pendant 1 mois in⠀situ, à une efflorescence naturelle productrice de microcystines afin de comparer l’intensité des effets constatés et d’en rechercher les causes en impliquant éventuellement un rôle d’autres métabolites secondaires produits par ces cyanobactéries. Puis, des poissons issus de l’environnement et exposés de manière naturelle à des efflorescences productrices de microcystines ont été étudiés et les effets observés comparés à ceux obtenus sur les médakas afin d’en déduire un impact possible de ces efflorescences sur les populations de poissons. Les résultats obtenus révèlent que d’une manière générale, l’ensemble des tissus sont sensibles aux microcystines avec des lyses cellulaires plus ou moins importantes ainsi qu’une réaction inflammatoire plus ou moins prononcée. Pour les gonades, nouvellement étudiées, des anomalies notables avec incidences possibles sur la fertilité ont été remarquées, d’ailleurs corrélées avec les modifications de certains paramètres de reproduction. Toutefois dans le milieu naturel, des métabolites autres que les microcystines peuvent intervenir. Les conséquences de cette toxicité sur les organes reproducteurs conduisent donc à s’interroger sur l’impact des efflorescences productrices de microcystines, sur la fécondité des populations de poissons et donc sur leur répercussion en termes de biodiversité. De plus, les conséquences sur la santé humaine et la reproduction, via l’exposition par l’eau ou la consommation de chairs contaminées, ne doivent pas être négligées et nécessitent une évaluation plus poussée.

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Copp, Gordon Howard. „Le rôle et le fonctionnement des milieux aquatiques du haut-Rhône français commes sites de reproduction et de nurserie pour les poissons du fleuve“. Lyon 1, 1987. http://www.theses.fr/1987LYO10118.

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Utilisant une approche a la fois experimentale et statistique, la reproduction des poissons a ete evaluee dans 48 milieux potamiques, a partir des estimations de l'abondance relative et de la biomasse totale des juveniles a la fin de l'ete cette etude typologique met en evidence l'influence majeure de l'origine geomorphologique et des conditions hydrologiques des ecosystemes potamiques sur leur potentiel reproductif

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Lauzeral, Christine. „Prédiction du potentiel d'invasion des espèces non natives par des modèles de niche : approches méthodologiques et applications aux poissons d'eau douce sur le territoire français“. Toulouse 3, 2012. http://thesesups.ups-tlse.fr/1876/.

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Les espèces invasives sont une des perturbations les plus importantes des milieux aquatiques d'eau douce. La prévention des invasions passe par l'identification des zones dans lesquelles ces espèces sont susceptibles de s'installer. Cette thèse a mis en évidence que : - le changement de grain spatial modifie la mesure de l'aire de la distribution observée. Par contre, le grain des données utilisées pour calibrer les modèles influence peu la qualité des prédictions. - les grains les plus larges restent utilisables pour identifier les espèces changeant de niche climatique lors du processus d'invasion. - la majorité des six espèces de poissons étudiées présentent un fort risque d'établissement sous l'effet du changement climatique, même en l'absence de changement de niche de ces espèces. - la qualité des prédictions des modèles corrélatifs peut être améliorée en utilisant la méthode d'ensemble itérative que nous avons développée. Cette méthode est particulièrement adaptée pour les espèces invasives, mais aussi pour les espèces difficiles à détecter ou les espèces en danger
Freshwaters are among the most anthropogenicaly threatened ecosystems in the world. They especially face serious threats due to invasive species. Efforts are thus needed to control invasions and increase the accuracy of the models used to predict the potential distribution of invasive species. We showed that: - the area of the observed distribution, and thus the area of the distribution predicted by correlative models, increases exponentially with the spatial grain of the data. However, model quality is little affected by the grain of the data and decreases only for the largest grains. - coarse-grained occurrence data remain useful in identifying the species that experience niche shifts. - most of the six fish species that we have studied were able to establish in France under climate change, even without niche shift. - the iterative ensemble modeling method that we developed increases the accuracy of predictions as soon as the occurrence data set contained abundant non environmental absences. This new method is of interest for invasive species niche modeling but also to model the distribution of difficult to detect or endangered species

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Jézéquel, Céline. „Les communautés de poissons du bassin de l'Amazone : habitats aquatiques, gradients de diversité, facteurs et processus associés et options de conservation“. Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30182.

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La biodiversité aquatique du bassin versant de l'Amazone, le plus grand système fluvial au monde et le plus diversifié en espèces, reste encore relativement mal répertoriée malgré toute l'attention que le bassin suscite au niveau de la communauté scientifique internationale. La répartition spatiale des espèces dans le bassin, et notamment celle des poissons d'eau douce, reste encore assez peu documentée, très parcellaire et dispersée entre les pays et institutions, associée à une taxonomie parfois confuse. Il en va de même pour la distribution des habitats aquatiques et des formes fluviales associées à l'échelle de l'ensemble du bassin, la dimension de celui-ci limitant l'acquisition de données de terrain. Améliorer la connaissance sur la répartition de la biodiversité et des habitats aquatiques dans le bassin versant de l'Amazone est pourtant une étape cruciale afin de pouvoir appréhender les facteurs et processus à l'origine de la diversification des espèces, identifier les zones à protéger prioritairement (hotspots de biodiversité) et mieux évaluer la vulnérabilité des espèces face aux changements globaux. Ce travail de thèse découle de l'ensemble de ces constats et vise à réduire les lacunes importantes de connaissances soulevées
The aquatic biodiversity of the Amazon basin, the largest and most species rich river basin on Earth, is still relatively poorly documented despite all the attention received from the international scientific community. Knowledge about the spatial distribution of species, and in particular of freshwater fishes, is very fragmented and dispersed between countries and institutions. The distribution of river forms has been also poorly explored at the scale of the entire basin, its continental dimension limiting the acquisition of field data. Improving the knowledge on the distribution of biodiversity and aquatic habitats in the basin is however a crucial step to better understand the factors and processes behind species diversification, identify priority areas for conservation (biodiversity hotspots) and assess the species vulnerability to global changes. This thesis work aims to reduce these significant knowledge gaps

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Pustelnik, Guy. „Etude écologique préalable à l'aménagement piscicole de la rivière Dordogne“. Bordeaux 3, 1987. http://www.theses.fr/1987BOR30045.

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Afin de faciliter la mise sur pied d'un plan de gestion piscicole de la riviere Dordogne et d'envisager la realisation d'amenagements, plusieurs recherches ont ete realisees. Le but du present travail est de mettre au point une methode d'analyse qui facilite l'etablissement d'un diagnostic piscicole et la mise en place de procedures de gestion adaptees. La premiere partie definit les principaux aspects de la vie piscicole a travers l'analyse des phenomenes de reproduction des exigences d'abris et de nourrissage. Dans la seconde partie, directement issue des conclusions de la premiere, les methodes et les techniques d'etudes sont mises en place. La troisieme partie definit le cadre de l'etude : - la riviere Dordogne et ses caracteristiques morphologiques et dynamiques (de cette etude sont issus les descriptifs des principaux facies rencontres), - la physicochimie des eaux, - la biologie du cours d'eau et plus particulierement l'etude du peuplement piscicole a travers l'utilisation du milieu par especes. La quatrieme partie traite de l'habitabilite de la riviere pour les differentes especes de poissons. Un nouvel indice (indice de qualite globale de l'habitat) est propose et sa fiabilite est analysee et critiquee pour la riviere Dordogne. La derniere partie constitue l'application de la methode d'analyse pro- posee, a la mise en place d'un plan de gestion sur un troncon type de la riviere Dordogne. Enfin, la conclusion reprend les principaux resultats presentes dans cette etude
In order to make easy the realization of a piscicult management plan of the river Dordogne and to consider the realization of gradings, several searches have been realized. The purpose of this work is to develop an analysis method which makes easy the establishment of a piscicult diagnostic and the development of adapted gestion procedures. The first part states clearly the principal aspects of the piscicult life through of the phenomena's reproduction analysis of requirements'shelters and nourishment. In the second part, directly derived from the conclusions of the first, methods and technics of studies are established. The third part defines the study range : - the Dordogne river and its morphological characteristics and dynamics (descriptives of principal facies meted are derived from this study), - water's physiocochemistry, - the course biology and specially the piscicult peopling study through surrounding utilization by species. The fourth part talks about habitability of the river for the different fishes species. A new indication (indication of total quality of habitat) is suggested and its reliability is analysed and criticized for the river dordogne. The last part forms the application of the suggested analysis method for the putting of gestion plan on a pattern stump of river Dordogne. Finally, the end takes again the principal results presented in this study

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Bengen, Dietriech Geoffrey. „Contribution à la typologie fonctionnelle des bras morts de la Garonne : approches physico-chimique et ichtyologique“. Toulouse, INPT, 1992. http://www.theses.fr/1992INPT012A.

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L'etude de la variabilite physico-chimique des eaux et de la typologie ichtyenne a ete realisee dans trois bras morts de la garonne de 1988 a 1990. L'eau de la garonne est soumise a un cycle climatique annuel de temperature et de debit. Les flux de nitrates ont un pic accentue au printemps; les phosphates presentent un accroissement automnal. Par rapport a la garonne, les trois bras morts sont caracterises par un cycle thermique accentue en ete. La mineralisation des eaux de ces trois bras morts evolue selon un cycle saisonnier parallelement aux fluctuations de debit de la garonne. Elle indique un gradient de mineralisation croissante de l'hiver a l'automne, maximal en ete, au sein des trois bras morts. Les peuplements ichtyques de ces trois bras morts sont domines par les cyprinides et presentent une forte similitude globale entre eux. L'afc conduit a distinguer trois types d'habitats (groupes spatiaux). La bouviere, ainsi que les juveniles de grands cyprinides, preferent les zones peu profondes a proximite de vegetation aquatique ou se trouvent les substrats a granulometrie fine. Le second type d'habitat concerne surtout la vegetation aquatique semi-immergee; il accueille favorablement les especes carnassieres de petite taille (perche soleil, perche, black-bass). Enfin, les rives a pente moyenne ou forte en bordure des zones profondes sur substrats graviers (galets) favorisent les populations d'adultes. L'abondance de ces trois groupes de poissons evolue dans le temps selon trois grandes tendances: recrutement estival et automnal de juveniles dans les bras morts, preponderance hivernale d'individus immatures de cyprinides et entree d'adultes dans les bras morts au printemps

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Rasoarahona, Jean Roger Emile. „Variation annuelle de la composition en acides gras des lipides de poissons d'eau douce de Madagascar : Cyprinus, Carassius, Arius et Tilapia : application à la différenciation du genre Tilapia“. Aix-Marseille 3, 1992. http://www.theses.fr/1992AIX30030.

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L'etude des variations de composition des lipides de poissons d'eau douce, contenant des acides gras polyinsatures essentiels, peut servir de moyen d'approche de leur biologie. Les acides gras ont ete analyses par chromatographie gazeuse, associee a la chromatographie sur silice/nitrate d'argent; plus de 40 acides gras ont ete identifies, dont des acides gras polyinsatures avec 3 a 6 doubles liaisons. Les couplages cg/sm et cg/irtf ont confirme la structure des plus importants d'entre eux. L'etude des variations de la composition en acides gras majeurs a ete effectuee mensuellement sur cyprinus carpio l. , carassius auratus l. , seratherodon niloticus l. Et arius madagascariensis vail. Elle a mis en evidence des cycles d'evolution analogues: maximum de concentration en acides gras polyinsatures (jusqu'a 30% du total, dont 6-7% pour 20:46 et 8-10% pour 22:63) a la fin de l'hivernage. L'analyse en composantes principales sur l'ensemble des acides gras a montre une differenciation suivant l'origine par les acides gras mineurs, notamment impairs et/ou ramifies. L'etude du genre tilapia a ete menee sur des series quadrimestrielles sur t. Rendalli, s. Niloticus, s. Macrochir et t. Zilii. L'analyse de donnees multidimensionnelle a montre une evolution similaire. Les especes sont bien differenciees a chaque periode. Chaque periode possede egalement ses caracteristiques propres. La variabilite liee a la saison a une influence plus forte que celle liee a l'espece

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Zhao, Tian. „Effets des invasions biologiques sur les patrons de diversité fonctionnelle et la structure trophique des communautés de poissons d'eau douce“. Thesis, Toulouse 3, 2015. http://www.theses.fr/2015TOU30120.

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Comprendre la relation entre biodiversité et fonctionnement des écosystèmes est une question centrale de l'écologie moderne. Cette problématique est d'autant plus importante dans le contexte général des perturbations anthropiques sur la biodiversité et les écosystèmes. Les invasions biologiques représentent l'une des causes principales de perte de diversité taxonomique et de modification des écosystèmes. Ceci est particulièrement le cas dans les écosystèmes aquatiques d'eau douce qui sont soumis à de nombreuses introductions d'espèces non-natives de poissons qui peuvent modifier la structure des communautés et altérer les interactions biotiques entre espèces. Les interactions trophiques et les réseaux trophiques qu'elles forment sont à la base des liens entre la structure même de la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes. Par conséquent, identifier les impacts des espèces non-natives sur la structure trophique des communautés est crucial pour estimer comment le fonctionnement des écosystèmes et les services qu'ils rendent peuvent répondre aux invasions biologiques. Dans cette étude, 18 lacs de gravières ont été sélectionnés et leurs communautés piscicoles quantifiées durant deux années consécutives afin de tester les effets des invasions biologiques sur les patrons de diversité fonctionnelle et la structure trophique des communautés piscicoles. Dans un premier temps, nous avons étudié le rôle des facteurs environnementaux sur la composition et la structure des communautés de poissons. Nos résultats ont démontré que la structure des communautés de poissons différait de manière significative entre lacs et nous avons notamment observé que les lacs gérés principalement à des fins halieutiques présentaient une plus forte richesse taxonomique. Nous avons également démontré que les espèces natives et non-natives étaient dominantes dans des lacs avec des caractéristiques environnementales différentes, alors que les pratiques de gestion jouaient davantage un rôle sur structures des communautés. Dans l'ensemble, cette étude a permis de démontrer que la composition des communautés piscicoles évoluait de manière prévisible le long d'un gradient environnemental associé au niveau de maturité des lacs et des pratiques de gestion associées. Dans un second temps, nous avons quantifié l'importance de la variabilité intraspécifique des traits fonctionnels au sein d'une espèce modèle, le black-bass (Micropterus salmoides). Plus précisément, nous avons échantillonné l'ensemble d'une population and nous avons démontré que la variabilité des traits fonctionnels entre les individus était forte et pouvait affecter les estimations de diversité fonctionnelle. De plus, le très faible chevauchement de niches fonctionnelles et isotopiques entre les différentes classes d'âge indiquaient qu'elles doivent être considérées comme des entités fonctionnelles distinctes. Nous avons également démontré l'existence d'une corrélation entre les traits fonctionnels et les valeurs isotopiques du carbone et de l'azote, suggérant ainsi un lien entre spécialisation trophique et les différences de traits fonctionnels au sein des différents stades de vie. Dans un troisième temps, en intégrant la variabilité intraspécifique des traits fonctionnels à l'échelle de la communauté, nous avons examiné les structures fonctionnelles des différentes communautés piscicoles le long d'un gradient d'invasions. Nos résultats ont démontré que les entités natives et non-natives de poissons différaient significativement en terme de traits fonctionnels et que le " niche partitioning " était le mécanisme principal permettant la coexistence des espèces natives et non-natives ayant des traits fonctionnels similaires
Understanding the relationship between biodiversity and ecosystem functioning is a central question in modern ecology. This question is particularly crucial in the general context of human perturbations on both biodiversity and ecosystems. Biological invasions are considered as one of the leading causes of the ongoing taxonomic diversity crisis and the modification of ecosystems. This is especially true in freshwater ecosystems since the widespread introductions of non-native fish can modify recipient communities notably by changing the biotic interactions between species. Trophic interactions represent the linkage between the structural characteristics of biodiversity and the functioning of ecosystems, describing the network of species and the energy links between them. Identifying the impacts of non-native fish species on the trophic structure of recipient communities is therefore crucial to estimate how ecosystem functioning and ecosystem services might respond to biological invasions. In the present study, fish communities from 18 gravel pit lakes were selected and monitored during two consecutive years to test the effects of biological invasions on functional diversity patterns and the trophic structure of fish communities. We first investigated the environmental determinants of fish community composition and structure in these gravel pit lakes. Our results demonstrated that fish community structure significantly differed between lakes and we notably found that lakes highly managed for angling hosted higher levels of taxonomic diversity. We also found that native and non-native species were dominant in lakes with different environmental conditions, while management practices play a critical role in shaping fish species composition. Overall, these findings demonstrated that fish community composition followed a predictable shift along an environmental gradient linked to the natural maturation of gravel pit lakes and the associated human practices. Second, we quantified the importance of intraspecific variability in functional traits in a model species, the largemouth bass (Micropterus salmoides). We sampled a whole population in a private pond and found that functional trait variability among individuals within the same population could affect estimates of functional diversity. Moreover, the extremely low overlap for both functional and stable isotope niches between age-classes indicated that different age classes within a species should be considered as distinct functional entities. We also demonstrated the existence of a significant correlation between functional traits and stable isotope values, suggesting the existence of a linkage between trophic specialization and differences in functional traits within each life stage. Third, incorporating intraspecific variation in functional traits at the community level, we examined the functional attributes of fish communities in the studied lakes. Our results demonstrated that native and non-native fish significantly differed in terms of functional traits. We also demonstrated that niche partitioning was the principal mechanism allowing the coexistence of native and non-native fish with similar functional traits

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Léger, Arnaud. „Indice de vulnérabilité à l'extinction des poissons d'eau douce du Québec une analyse multivariée des traits biologiques, écologiques et biogéographiques /“. Thèse, [Rimouski, Québec] : Université du Québec à Rimouski, 2006.

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Thèse (M. Sc.) - Université du Québec à Rimouski, 2006.
Titre de lʹécran-titre (visionné le 25 avril 2007). Mémoire présenté à l'Université du Québec à Rimouski comme exigence partielle du programme de maîtrise en gestion de la faune et de ses habitats. CaQRU CaQRU Bibliogr.: f. 56-64. Paraît aussi en éd. imprimée. CaQRU

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Glasser, Frédéric. „L'influence des facteurs externes sur la reproduction de la carpe herbivore (Ctenopharyngodon idella) en zone tropicale : une approche descriptive et expérimentale“. Rennes 1, 2003. http://www.theses.fr/2003REN10016.

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La carpe herbivore Ctenopharyngodon idella est très demandée pour la pisciculture artisanale en Côte d'Ivoire. La reproduction artificielle, obligatoire en conditions tropicales, implique de disposer de géniteurs femelles de qualité. La description histologique et endocrinienne des cycles sexuels a montré des dysfonctionnements. Des données obtenues in vivo et in vitro ont montré des inhibitions thermiques à plusieurs niveaux de l'axe reproducteur : sur la libération des gonadotropines, sur les capacités stéroidogènes des ovaires, sur la maturation ovocytaire. Les taux d'ovulation après induction de ponte sont réduits à 28ʿC par rapport à 24ʿC. L'ajout d'un aliment concentré au régime alimentaire herbacé permet d'améliorer la proportion de femelles achevant leur vitellogénèse, mais pas les autres caractéristiques de la reproduction. Parmi les protocoles d'induction de ponte comparés, deux injections d'extraits hypophysaires à 12 h d'intervalle semblent la pratique la plus adaptée.

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Dartiguelongue, Jean. „Contribution à l'étude de la mortalité des poissons au passage des turbines d'installations hydroélectriques : méthodologie et analyse des données“. Toulouse, INPT, 1988. http://www.theses.fr/1988INPT009A.

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Si le problème du franchissement des adultes est en voie de résolution, grâce, notamment, à des efforts menés depuis une décennie dans le domaine des passes à poissons, celui du franchissement des ouvrages par les juvéniles reste posé et, notamment, l'importance des préjudices subis lorsque la passage par les turbines est obligatoire. L'intérêt pour ce problème a été ravivé ces dernières années par le lancement de programmes de restauration de ces espèces migratrices sur nos cours d'eau initiés par le Ministère de l'environnement et, parallèlement, par la multiplication d'ouvrages énergétiques de petites et moyennes tailles. Avant d'envisager systématiquement la mise en place de dispositifs de guidage ou de dissuasion au niveau des prises d'eau, il convenait d'évaluer l'importance des mortalités résultant du passage au travers des turbines. Une étude générale a été entreprise par le CEMAGREF pour analyser les données existantes : mettre au point un protocole expérimental standard d'évaluation des mortalités susceptibles d'être utilisé par la suite sur des sites présentant un intérêt particulier ; apprécier les dommages potentiels d'un certain nombre de turbines installées, pour la plupart, sur les cours d'eau à migrateurs ; établir des modèles prédictifs de la mortalité potentielle, sur la base d'une analyse statistique de l'ensemble des données.

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Ausseil, Olivier. „Contribution à l'étude de la multipollution des hydrosystèmes fluviaux : étude de l'influence de micropolluants métalliques et organiques sur la bioaccumulation des radionucléides par les poissons d'eau douce“. Aix-Marseille 1, 2001. http://www.theses.fr/2001AIX11026.

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L'influence de divers polluants métalliques (cadmium, zinc) et organiques (17 β-oestradiol, atrazine, polychlorobiphéniles, hydrocarbures aromatiques polycycliques) sur les caractéristiques de la bioaccumulation de radionucléides artificiels (110mAg, 134Cs 57CO) par la truite arc-en-ciel ("Oncorhynchus mykiss") a été testée. L'hypothèse de base de ce travail est de supposer que l'exposition des organismes aux polluants entraîne l'induction de mécanismes de réponse qui pourraient interférer avec la bioaccumulation des radionucléides et en modifier les caractéristiques. Afin de tenter de caractériser la nature et l'intensité du stress induit dans les organismes par l'exposition aux polluants non radioactifs, différentes mesures biologiques et biochimiques (biomarqueurs) ont été réalisées au cours des différentes expériences. Ces différentes expériences ont été réalisées sur le terrain ou en laboratoire. Leurs résultats montrent qu'une exposition au cadmium et/ou au zinc entraîne la mise en route de systèmes visant à lutter contre le stress oxydant généré par les métaux, ou visant à séquestrer ces derniers sous une forme chimiquement inactive. Elle entraîne aussi une forte diminution des quantités d'110mAg(-60%) et de 134Cs(-33%) accumulés par les organismes. Par contre, aucun effet n'a été observé sur la bioaccumulation du 57Co. Tous les composés organiques testés, sauf le fluoranthène, entraînent une augmentation des quantités de césium (+10 à 45%) et de cobalt (+30 à 60%) radioactifs accumulées par la truite arc-en-ciel. Par contre, seul le 17 β-oestradiol entraîne une augmentation des quantités d'110mAg (+30%) accumulées par la truite. Des hypothèses visant à expliquer les mécanismes impliqués sont proposées, et les principales implications de ces travaux dans le cadre de la radioécologie opérationnelle sont discutées.

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Sloterdijk, H. „Utilisation des jeunes poissons comme indicateurs de bioaccumulation des substances toxiques“. Toulouse 3, 1992. http://www.theses.fr/1992TOU30084.

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Lorsqu'on utilise les poissons adultes comme indicateurs de bioaccumulation des substances chimiques toxiques persistantes, il y a souvent une grande variabilite de donnees. Le present ouvrage presente une alternative a l'emploi de poissons adultes pour l'evaluation de la bioaccumulation des contaminants du milieu aquatique, soit l'utilisation de jeunes poissons de l'annee comme bioindicateurs a cette fin. Le queue a tache noire (notropis hudsonius) a ete choisie comme espece cible et deux especes de remplacement ont ete retenues, a savoir la perchaude (perca flavescens) et le mene emeraude (notropis atherinoides). Les trois especes ont ete prises dans le fleuve saint laurent au quebec, lors de quatre annees successives. On a evalue les facteurs qui peuvent influencer l'utilisation de ces bioindicateurs, comme les differences de longueurs, la periode de l'annee durant laquelle l'echantillonnage est fait, leur teneur en lipides, la taille de l'echantillon, les variations entre stations et la specificite par site. Les contaminants etudies comprenaient les metaux lourds (hg, cd, pb, cu, zn, cr, ni), deux metalloides (as, se) et les composes organochlores (pcb, dde, hcb, hch, aldrine, mirex et heptachlore). Les resultats ont demontre que ces bioindicateurs etaient tres regio specifiques, manifestaient une variabilite intra station faible et pouvaient identifier des sources ponctuelles, alors qu'un modele de regression permettait la conversion des concentrations de contaminants entre especes. Donc, les jeunes poissons de l'annee peuvent etre utilises comme des indicateurs fiables et rapides de la concentration environnementale et des tendances spatio temporelles

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Ponton, Dominique. „Croissance et alimentation de deux poissons planctonophages du lac Léman : le corégone (Coregonus schinzi palea, Jurine) et le gardon (Rutilus rutilus (L.))“. Lyon 1, 1986. http://www.theses.fr/1986LYO11707.

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Ce travail porte sur une estimation de la structure des populations de coregones et de gardons du lac leman, ainsi que sur leur regime alimentaire et sur leur croissance. Les deux populations etudiees sont planctonophages, et l'auteur tente d'etablir quelles sont les relations entre predateurs et proies. De plus des methodes d'echantillonnage sont indiquees dans ce travail

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Blanck, Aurélie. „Variabilité des traits d'histoire de vie de poissons d'eau douce Européens à différentes échelles spatiales et niveaux biologiques : (population et espèce)“. Lyon 1, 2007. http://www.theses.fr/2007LYO10071.

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Un objectif récurrent en écologie concerne la connaissance des traits d’histoire de vie et de leur variabilité. En eau douce, les contraintes environnementales sont omniprésentes pour les poissons et jouent un rôle important dans la variabilité des traits d’histoire de vie des organismes. Dans ce cadre, l’objectif principal de cette thèse consiste à étudier les liens entre les traits des poissons d’eau douce européens et l’environnement en privilégient une approche à plusieurs niveaux biologiques (population et espèce) et échelles spatiales (continentale, régionale et locale). Grâce à une importante somme de données biologiques et environnementales acquises à la fois par une vaste recherche bibliographique à l’échelle de l’Europe et un important travail de terrain sur le bassin Rhodanien, ce travail illustre (1) un effet de la température à l’échelle continentale et régionale sur plusieurs traits de populations, qui ne se confirme cependant pas pour toutes les espèces et (2) un effet très faible de l’hydraulique à l’échelle continentale et régionale sur les traits des populations. A l’opposé, au niveau de l’espèce, les relations entre les traits et l’hydraulique semblent prédominer sur les relations entre les traits et la température. L’hydraulique à l’échelle du micro-habitat joue un rôle d’ "habitat template" pour les stratégies des espèces, les milieux peu profonds et rapides sélectionnant les espèces à stratégie démographique opportuniste. La comparaison entre la variabilité intraspécifique et la variabilité interspécifique des traits illustre la pertinence d’utiliser dans les approches comparatives interspécifiques et inter-communautés des traits d’espèces mesurés à l’échelle régionale et des traits d’espèces issus de la littérature comme la fécondité et les traits liés à la taille, et cela malgré leur variabilité intraspécifique. En intégrant la variabilité de nombreux traits à plusieurs niveaux biologiques et échelles spatiales, ma thèse apporte des éléments de réflexion aux écologues de différentes disciplines telles que la dynamique et la biologie des populations, la biologie des espèces, l’écologie des communautés et l’écologie évolutive
The objective of improving understanding of life-history traits of organisms and their variation is recurrent in ecology. It is now widely accepted that environmental constraints in freshwaters play a key role in life-history trait variations in fish. In this context, this work aims to study the relationships between life-history traits of European freshwater fish and their environment focusing on different biological levels (population and species) and different spatial scales (continental, regional and local scales). Using biological and environmental data from published sources at the European scale and from field work in the Rhone river basin, this work illustrates (1) the effect of temperature at the continental and regional scales on several population traits, that are not confirmed for all species and (2) the weak effect of hydraulics at the continental and regional scales on population traits. By contrast, this work identifies more important relationships between hydraulics and traits than between temperature and traits at the species level. Microhabitat hydraulics seems to provide a template for species ecological strategies with fast-flowing and shallow microhabitats (riffles) selecting opportunistic species. The comparison between the intraspecific variation in traits and the interspecific variation in traits illustrates the relevance of using traits estimated at the species level and at the regional scale, and traits such as fecundity and traits associated with body size estimated at the species level from literature, in interspecific and inter-communities comparative approaches. By integrating variation of multiple traits in different biological levels and at different spatial scales, my thesis provides interesting elements for ecologists of different disciplines such as population biology and dynamics, species biology, community ecology and evolutionary ecology

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Rod, Astrid. „Le cadmium : Polluant chimique de l'atmosphère, du sol et des eaux : Recherche du cadmium dans la chair des poissons d'eau douce /“. [S.l : s.n.], 1986. http://www.ub.unibe.ch/content/bibliotheken_sammlungen/sondersammlungen/dissen_bestellformular/index_ger.html.

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Sholihah, Arni. „Diversification des biotas aquatiques de Sundaland : accumulation de la biodiversité chez les poissons d'eau douce et distribution dans un hotspot de biodiversité“. Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTG024.

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Sundaland est l'un des points chauds de biodiversité les plus menacés, en raison d’une augmentation rapide des menaces au cours des dernières décennies. Couvrant la péninsule malaise, Sumatra, Java et Bornéo, cette région possède l'une des plus grandes richesses en espèces et endémisme pour les vertébrés, y compris les poissons d'eau douce. Cette biodiversité a longtemps attiré l'attention des biologistes évolutionnistes, notamment en raison de la complexité de l'histoire géologique de Sundaland. Cette question a été abordée en explorant les patrons de fragmentation et dispersion durant la diversification des espèces de poissons d'eau douce de Sundaland. Ainsi, j'ai d'abord cherché à évaluer la correspondance entre la distribution des lignées moléculaires de plusieurs taxons avec les limites des paléorivières en ré-analysant les données moléculaires existantes avec une couverture biologique et spatiale représentative en Asie du Sud-Est (en particulier pour Sundaland). Deuxièmement, je me suis concentré sur l’estimation de l’âge des clades et de la répartition géographique des lignées de Rasborinae, un groupe répandu et extrêmement diversifié de poissons d’eau douce primaires du Sundaland, pour tester l’hypothèse des Paléorivières du Pléistocène en utilisant des données empiriques nouvellement générées. Sur les deux études, je me suis posé les questions suivantes: 1) les paléorivières servaient-elles de corridors de dispersion entre les îles pendant les périodes glaciaires du Pléistocène; 2) les bassins versants des paléorivières ont-ils initié une divergence allopatrique à travers leurs frontières; et 3) les fluctuations climatiques du Pléistocène ont-elles augmenté les taux de speciation. Dans l'ensemble, un niveau élevé de diversité cryptique est observé. Les aires ancestrales inférées révèlent une origine continentale des lignées de poissons d'eau douce de Sundaland, datée à l'Oligocène. Ce résultat valide l'hypothèse d’une installation pré-pléistocène. Ces lignées sont entrées à Sundaland par la paléorivière de la Sonde Nord à Bornéo et se sont dispersées par la suite via une dispersion à longue distance, souvent suivie de diversification in situ. Ces résultats suggèrent que la partie de Bornéo de la paléorivière de la Sonde Nord est le centre d'origine le plus probable des poissons d'eau douce de Sundaland. Contrairement à l'hypothèse initiale que l'abaissement du niveau de la mer en périodes glaciaires reconnecte les bassins versants au sein des paléorivières, cela n'ouvre pas nécessairement de canaux de dispersion inter-îles pour les poissons d'eau douce. Les couloirs de savane et d'écosystèmes forestiers saisonniers à l'intérieur du Sundaland ont servi de barrière à la dispersion. En outre, la perméabilité des limites physiques des bassins versants des paléorivières, ainsi que les variabilités géomorphologique et écologique ont créé temporairement des flux de gènes. Bien qu'une proportion significative des lignées de poissons d'eau douce du Sundaland datent du Pléistocène, nous avons constaté que la dynamique du Pléistocène n'affectait pas le taux de diversification. Les modèles de diversification dépendant du niveau de la mer expliquent mal les schémas de prolifération des espèces pour tous les clades, à l'exception de Channa. En outre, aucun des taxons examinés ne présente de taux de diversification en baisse comme le suggère le modèle de diversification dépendante de la diversité (DDD). Il est suggéré alors que les fluctuations eustatiques du Pléistocène et la dynamique des paléorivières ne sont pas les seuls moteurs de la diversification des poissons d'eau douce du Sundaland, mais seulement une partie des aspects abiotiques qui l'affectent. Les fluctuations climatiques du Pléistocène ont probablement interagi avec d'autres facteurs tels que: la géomorphologie du paysage, la variabilité des écosystèmes et les caractéristiques biologiques des organismes
Sundaland is one of the most threatened biodiversity hotspots, experiencing a fast increase of threat levels during last decades. Covering Malayan Peninsula, Sumatra, Java and Borneo, this hotspot has one of the highest species richness and endemism for vertebrates in SEA, including freshwater fishes. This level of biodiversity has long attracted the attention of evolutionary biologists, particularly by considering effects of Sundaland complex geological history. This study addressed it by exploring time frame of vicariance and dispersal during diversity build-up of freshwater fish species in Sundaland. To support this, we first aimed to assess the match between distribution of molecular lineages from multiple taxa with palaeoriver boundaries using metadata analysis of existing molecular dataset with representative biological and spatial coverage in Southeast Asia (especially in Sundaland). Second, we focussed on estimating clades’ age and geographic distribution of Rasbora lineages in relation to the Pleistocene Palaeoriver Hypothesis by utilising newly generated empirical data for Rasborinae, a widespread and extremely diversified group of primary freshwater fishes in Sundaland. On both steps, we questioned: 1) if palaeorivers served as corridors of dispersal between islands during Pleistocene sea levels low stands; 2) if palaeoriver watersheds initiated allopatric divergence across their boundaries; and 3) if Pleistocene climatic fluctuation increased rates of species diversification. Overall, this study detected high level of cryptic diversity. Ancestral area reconstructions revealed that Sundaland freshwater fish lineages originated from Mainland Asia, and further colonised the region since Oligocene. This result validated the pre-Pleistocene settlement hypothesis. These lineages entered Sundaland mainly through North Sunda palaeoriver in contemporary Borneo and dispersed to other parts of Sundaland via long distance dispersal, often followed by in situ diversification. These results suggest Bornean part of North Sunda palaeoriver is the most likely centre of origin for Sundaland freshwater fishes. Contrary to the initial hypothesis, we found that although lowered sea level during glacial periods reconnected watersheds within palaeorivers, it did not necessarily open up inter-island dispersal channels for freshwater fishes. Corridors of savanna and seasonal forest ecosystems in the interior of Sundaland served as barrier to dispersal. Also, permeability of the physical boundaries of palaeoriver’s watersheds as well as geomorphological and habitat variabilities within palaeoriver created respectively gene flow between palaeorivers and allopatric speciation within palaeoriver. Moreover, although significant proportion of Sundaland freshwater fish lineages originated during Pleistocene, we found that Pleistocene dynamics did not affect diversification rate as sea level-dependent diversification models poorly account for species proliferation patterns for all clades excepting Channa. Besides, none of the taxa examined has declining diversification rates as suggested by diversity-dependent diversification (DDD) model. It is suggested then that global Pleistocene eustatic fluctuation and regional paleoriver dynamics are not sole drivers for Sundaland freshwater fish diversification, but only a part of abiotic aspects affecting it. Pleistocene Climatic Fluctuations likely interacted with other factors such as: landscape geomorphology, local ecosystem/habitat variability and life history traits of organisms

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Tisseuil, Clément. „Modéliser l'impact du changement climatique sur les écosystèmes aquatiques par approche de downscaling“. Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/763/.

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L'objectif était d'évaluer l'impact du changement global sur les écosystèmes aquatiques au cours du 21ème siècle, dans le bassin Adour Garonne (S-O France). Une approche de " downscaling " a été développée à l'interface entre les sciences du climat, de l'hydro-chimie et de l'écologie. Les résultats suggèrent une augmentation globale des débits hivernaux ainsi que des débits d'étiages plus faibles. Les concentrations en nitrate pourraient augmenter, de même que la distribution des espèces de poissons les plus thermophiles. Toutefois, une diminution des gaz à effet de serre ainsi qu'une modification des pratiques agricoles (ex. Diminution des fertilisants azotés) pourraient limiter l'intensité des perturbations écologiques. Cette thèse offre une contribution originale, notamment pour la gestion future des ressources hydriques et écologiques
This thesis aimed at assessing the impact of global change on freshwater ecosystems during the 21st century in the Adour Garonne area (SW France). A downscaling approach was developed linking techniques from climate, hydro-chemical and ecological sciences. The main results suggest an increase of high flows in winter as well as more severe low flows in summer. Nitrogen concentrations and thermophile fish species distribution may also increase. Reducing green house gas emissions and modifying agricultural practices (e. G reducing nitrate fertilizers) could reduce the intensity of ecological disturbances. This study is an original contribution to the management of future hydrological and ecological resources

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Richert, Caroline. „Comparaison de marqueurs biochimiques chez les poissons (induction de l'activité éthoxyrésorufine-O-deéthylase et inhibition de l'activité acétylcholinestérase) et d'indicateurs écologiques (peuplement de macroinvertébrés) pour le diagnostic in situ de la pollution toxique dans les cours d'eau“. Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10356.

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Hamlaoui-Rézig, Sahima. „Rôles des nutriments et des poissons dans la structure du peuplement phytoplanctonique d'un écosystème lentique peu profond : étude expérimentale en mésocosmes“. Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2001. http://www.theses.fr/2001MNHN0031.

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Cette étude expérimentale réalisée in situ, à l'aide de mésocosmes, a permis de déterminer certains effets simples et interactifs de la prédation (force top-down) et des nutriments (force bottom-up) sur la structure d'un peuplement phytoplanctonique lacustre. Les résultats montrent que quels que soient les apports en nutriments, il n'y a pas eu dégradation de la qualité de l'eau dans les enceintes sans poissons zooplanctonophages et que la biomasse algale a été régulée par des espèces de grands cladocères très abondantes dans ce cas. En présence de cyprinidés et d'apports conséquents en nutriments, la diversité spécifique, l'abondance totale et le biovolume des microalgues ont subi un net accroissement. Dans ces conditions, la prédation exercée par les poissons a favorisé l'installation de petits herbivores (rotifères et petits cladocères) au détriment des grandes formes. L'augmentation de la taille des microalgues et le développement de certains de leurs appendices concomitants avec la réduction de la taille des herbivores a pour conséquence une nette réduction de la pression du broutage et une dégradation de la qualité de l'eau par la prolifération algale. Par ailleurs, les résultats de l'étude font ressortir des stratégies de défense anti-herbivorie chez Scenedesmus quadricauda et Ceratium hirundinella. Les observations et les données acquises au cours de ce travail, confirment l'importance des forces top-down et bottom-up, dont les actions sont simultanées et déterminantes pour la structure et le fonctionnement des réseaux trophiques pélagiques lacustres

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Pampoulie, Christophe. „Conséquences d'une arrivée massive d'eau douce sur la communauté de gobies (Téléostéens, Poissons) d'une lagune méditerranéenne : l'exemple de l'étang du Vaccarès (Camargue, France)“. Montpellier 2, 1999. http://www.theses.fr/1999MON20148.

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Nous avons etudie l'effet d'une arrivee massive d'eau douce sur une communaute de gobies, constituee de gobius niger, pomatoschistus minutus et p. Microps, d'une lagune saumatre mediterraneenne, l'etang du vaccares. Trois points principaux ont ete abordes : - l'effet de cet evenement sur les parametres du milieu. Nos resultats montrent des modifications de nombreux parametres physico-chimiques dont certaines se sont maintenues durant notre suivi. Nous discutons des effets possibles directs et indirects de ces modifications sur le peuplement de poissons. - l'effet de cet evenement sur la communaute de gobies. Nous montrons la modification de la composition specifique de cette communaute, et discutons des parametres responsables de la disparition de g. Niger, des variations de captures de p. Minutus et de l'augmentation de celles de p. Microps. Les modifications observees dans la structure du peuplement et dans la croissance de p. Microps sont expliquees par un changement de sa strategie de reproduction. - l'effet de cet evenement sur les traits d'histoire de vie des trois especes. Nous montrons que p. Microps investit plus d'energie dans la reproduction apres les inondations, et ce malgre la presence d'un parasite intraclomique dont les effets sur la survie et l'effort reproducteur sont importants. Nous discutons egalement des differences observees dans les reactions de ces trois especes, et tentons de les expliquer par les differences de strategies et par leur tolerance aux variations des parametres environnementaux.

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Cravinho, Stéphanie. „Les poissons d'eau douce à la fin du paléolithique supérieur en France : réexamen et étude complémentaire du site de Pont d'Ambon (Bourdeilles, Dordogne)“. Aix-Marseille 1, 2009. http://www.theses.fr/2009AIX10049.

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Les restes ichtyofauniques retrouvés dans les sites paléolithiques supérieur appartiennent principalement à des espèces d'eau douce et sont représentés à plus des trois quarts par des éléments vertébraux. Les méthodes d'analyses permettant la reconstitution de la taille des poissons et de l'estimation d'un Nombre Minimal d'Individus (NMI) restent cependant axées sur les éléments crâniens les plus robustes. La mise en oeuvre d'une méthodologie permettant une quantification plus fine de l'apport des poissons sur un site, et ce, à partir de l'ensemble des éléments crâniens et post-crâniens est ainsi proposée. Les travaux se sont concentrés sur les Cyprinidés, majoritairement représentés dans les occupations aziliennes. Deux référentiels ostéométriques ont été réalisés, celui du chevaine "Leuciscus cephalus" (Linnaeus, 1758) et du gardon "Rutilus rutilus" (Linnaeus, 1758). L'ensemble de ces données est appliqué sur le matériel ichtyofaunique de Pont d'Ambon (Bourdeilles, Dordogne) dont les périodes d'occupation sont comprises entre le Magdalénien final et l'Azilien terminal et qui présente un nombre de restes exceptionnellement élevé. Le spectre ichtyofaunique est faible, comprenant une majorité de Cyprinidés, suivie de l'anguille, du brochet et anecdotiquement de Salmonidès dont l'origine anthropique de leur appot ne fait aucun doute. L'analyse archéozoologique et taphonomique de l'ensemble du matériel démontre l'intérêt de l'utilisation des données rachidiennes : la quantification de l'apport de poisson sur le site est plus précise et les modes de pêches des Chasseurs-Cueilleurs sont mieux appréciés.

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Munyandorero, Joseph. „La pêche dans les lacs du parc national de l'Akagera : biologie de Clarias gariepinus et exploitation des stocks dans le lac Ihema“. Toulouse, INPT, 1993. http://www.theses.fr/1993INPT021A.

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Depuis aout 1980, l'entreprise pecherie du lac ihema a ete creee pour organiser et gerer les activites de peche dans les lacs du parc national de l'akagera. La peche a ete d'abord developpee dans le lac ihema de 1980 a 1984, puis aussi dans les autres lacs du parc. Les variations des captures, de sa production en valeur financiere, des efforts de peche nominal et effectif et des p. U. E. * ont ete analysees. La part prise dans la production par les lacs du parc autres que le lac ihema est devenue importante depuis 1988. C. Gariepinus, une des especes exploitees dans le lac ihema, a fait l'objet d'une etude de la reproduction, de la fecondite, de la croissance et de l'estimation des parametres demographiques. Les modeles generalises de production ont ete proposes pour la gestion des stocks des tilapia spp. Et c. Gariepinus dans le lac ihema: le diagnostic est celui d'une surexploitation. Pour la peche des tilapia spp. , il faudrait reduire l'effort actuel de 55%; pour la peche de c. Gariepinus, il conviendrait d'encourager sa peche car ses p. U. E. Ne sont pas un indice representatif de son abondance. Un modele de fonctionnement de l'ecosysteme du lac ihema a ete aussi propose: il prevoit la diminution des biomasses des taxons precedents si l'effort augmente; cette augmentation de l'effort n'aurait pas de consequences importantes sur la biomasse des autres compartiments

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Dissertationen zum Thema „Poissons d'eau douce – Mensurations“

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