Dissertationen: „Phase quantification“

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Butler, Jonny. "Phase structure, phrase structure, and quantification." Thesis, University of York, 2004. http://ethos.bl.uk/OrderDetails.do?uin=uk.bl.ethos.415175.

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Gouverneur, Yves. "Phase de Berry et quantification de skyrmions." Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1998. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk2/tape15/PQDD_0002/MQ33663.pdf.

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Beese, Allison M. "Quantification of phase transformation in stainless steel 301LN sheets." Thesis, Massachusetts Institute of Technology, 2008. http://hdl.handle.net/1721.1/44870.

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Thesis (S.M.)--Massachusetts Institute of Technology, Dept. of Mechanical Engineering, 2008. Includes bibliographical references (p. 101-102). This thesis investigates the large deformation behavior of stainless steel 301LN cold-rolled sheets which is largely governed by the initial anisotropy combined with the phase transformation during deformation. Stainless steel offers high strength with relatively high ductility as compared with other structural steels. The effect of initial anisotropy on the strength in different material directions is studied in order to predict forming and crash response of vehicle components. It is observed that loading in the material rolling direction results in increased strength in the cross direction, however loading in the material cross-rolling direction results in decreased strength in the rolling direction. The mechanism responsible for the above cross-hardening is complex and requires investigation of the microstructural evolution of the sheets. The austenitic stainless steel studied is comprised of only austenite when in bulk form. However, the process of cold-rolling the bulk material into sheets results in strain-induced martensitic phase transformation. Additional straining of the material leads to even more transformation of austenite to martensite. Because martensite is a harder phase than austenite, micromechanical arguments suggest that the amount of martensite has an effect on the plasticity and eventual fracture of this material. In this thesis, the martensitic evolution as a function of material direction and strain level is measured using three different techniques: X-ray diffraction, microscopy, and magnetic induction. The first two methods require interrupted tests, while using a Feritscope allows for in-situ measurement of the martensite content. However, the Feritscope must be calibrated by another measurement method. (cont.) Observations of the measurements from each of the three methods confirm that the output of the Feritscope, Ferrite Number, is proportional to the martensite content. Therefore in-situ tests employing the Feritscope will allow for monitoring of the martensite content with evolution of stress and strain. From experiments described here, a directional dependence on martensite content is observed. The results from this study can be used to formulate an anisotropic martensite transformation kinetics law to describe the evolution of martensite content as a function of material anisotropy, stress state, and strain state. by Allison M. Beese. S.M.

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Chatzimavroudis, George P. "Quantification of valvular regurgitation with magnetic resonance phase velocity mapping." Diss., Georgia Institute of Technology, 1997. http://hdl.handle.net/1853/11808.

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Wallin, Ashley Kay. "Renal Arterial Blood Flow Quantification by Breath-held Phase-velocity Encoded MRI." Thesis, Georgia Institute of Technology, 2004. http://hdl.handle.net/1853/4982.

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Autosomal dominant polycystic disease (ADPKD) is the most common hereditary renal disease and is characterized by renal cyst growth and enlargement. Hypertension occurs early when renal function is normal and is characterized by decreased renal blood flow. Accordingly, the measurement of blood flow in the renal arteries can be a valuable tool in evaluating disease progression. In studies performed in conjunction with this work, blood flow was measured through the renal arteries using magnetic resonance imaging (MRI). In order to validate these in vivo measurements, a vascular phantom was created using polyvinyl alcohol (PVA) and also scanned using MRI under controlled steady flow conditions. Ranges of vessel diameters and flow velocities were used to simulate actual flow in a normal and diseased population of adults and children. With the vessel diameters studied in this experiment, minimization of field of view and an increase in spatial resolution is important in obtaining accurate data. However, a significant difference does not exist between the results when using the 160 or 200 mm FOV. An increase in the number of phase encodings provides improved results, although an increase in image acquisition time is observed. Velocity-encoding in all three orthogonal directions does not improve image data. This method of using MRI to measure flow through a vessel is shown to be both accurate and reproducible, and the protocol providing the most correct results is prescribed. Breath-hold phase-velocity encoded MRI proves to be an accurate and reproducible technique in capturing flow and has the potential to be used for the purpose of observing hemodynamic changes in the renal arteries with the progression of ADPKD.

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Engberg, Jonas. "Deep morphological quantification and clustering of brain cancer cells using phase-contrast imaging." Thesis, Uppsala universitet, Avdelningen för visuell information och interaktion, 2021. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-454959.

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Glioblastoma Multiforme (GBM) is a very aggressive brain tumour. Previous studies have suggested that the morphological distribution of single GBM cells may hold information about the severity. This study aims to find if there is a potential for automated morphological qualification and clustering of GBM cells and what it shows. In this context, phase-contrast images from 10 different GBMcell cultures were analyzed. To test the hypothesis that morphological differences exist between the cell cultures, images of single GBM cells images were created from an image over the well using CellProfiler and Python. Singlecellimages were passed through multiple different feature extraction models to identify the model showing the most promise for this dataset. The features were then clustered and quantified to see if any differentiation exists between the cell cultures. The results suggest morphological feature differences exist between GBM cell cultures when using automated models. The siamese network managed to construct clusters of cells having very similar morphology. I conclude that the 10 cell cultures seem to have cells with morphological differences. This highlights the importance of future studies to find what these morphological differences imply for the patients' survivability and choice of treatment.

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Lin, Hung-Yu. "REAL-TIME FLOW QUANTIFICATION TECHNIQUES IN CARDIOVASCULAR MRI APPLICATIONS." The Ohio State University, 2009. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1238594589.

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Milet, Sylvain F. "Visualization and quantification of left heart blood flow by phase encoding magnetic resonance imaging." Thesis, Georgia Institute of Technology, 1994. http://hdl.handle.net/1853/16056.

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ROTEM, RANY. "Development of Reliable Experimental Models for the Study of the Biological Behavior of Drug Nanocarriers." Doctoral thesis, Università degli Studi di Milano-Bicocca, 2019. http://hdl.handle.net/10281/241245.

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The curative effectiveness of current and new drugs is often limited by poor pharmacokinetics in-vivo. The use of nanoparticles as drug carriers seems promising in solving this problem. In this work we aimed to further explore and improve common drug delivery components and techniques. Starting with the synthesis of nanoparticles with a controlled number of molecular recognition ligands, we used bulky ligands and gel separation to obtain nanoparticles with a discrete number of chemical functional groups, used later to conjugate the same number of molecular recognition ligands. These nanoparticles later showed substantial difference in the in-vivo behavior. A second project focused on the in-depth characterization of the relationship between hydrophobic inorganic nanoparticles and the polymer surfactants used to enable their water dispersibility, as well enabling their functionalization. This investigation was done through separate quantification of polymer and inorganic nanoparticles and assessment of stability. Our results showed that the removal of excess polymer from such systems can result in loss of colloidal stability. A third project was aimed to describe the mechanism of polymeric nanoparticle’s endosomal escape and provide a platform for qualitative investigation and enhancement of this process. This goal was accomplished through two complementary in-vitro experiments testing two proposed mechanisms of endosomal escape. These results raised a key consideration when matching a particle capable of endosomal escape to a specific cell type as well as methods reduce interaction with serum proteins. A fourth project focused on developing an assay to quantify cytosolic delivery of nanoparticles and theoretically assessed the possibility of using fluorescence resonance energy transfer (FRET) - which was found to be not practical in this case - as well as implementing a pro-fluorophore to generate a measurable signal. Our preliminary results indicate this method might indeed be useful for this purpose in the future. The curative effectiveness of current and new drugs is often limited by poor pharmacokinetics in-vivo. The use of nanoparticles as drug carriers seems promising in solving this problem. In this work we aimed to further explore and improve common drug delivery components and techniques. Starting with the synthesis of nanoparticles with a controlled number of molecular recognition ligands, we used bulky ligands and gel separation to obtain nanoparticles with a discrete number of chemical functional groups, used later to conjugate the same number of molecular recognition ligands. These nanoparticles later showed substantial difference in the in-vivo behavior. A second project focused on the in-depth characterization of the relationship between hydrophobic inorganic nanoparticles and the polymer surfactants used to enable their water dispersibility, as well enabling their functionalization. This investigation was done through separate quantification of polymer and inorganic nanoparticles and assessment of stability. Our results showed that the removal of excess polymer from such systems can result in loss of colloidal stability. A third project was aimed to describe the mechanism of polymeric nanoparticle’s endosomal escape and provide a platform for qualitative investigation and enhancement of this process. This goal was accomplished through two complementary in-vitro experiments testing two proposed mechanisms of endosomal escape. These results raised a key consideration when matching a particle capable of endosomal escape to a specific cell type as well as methods reduce interaction with serum proteins. A fourth project focused on developing an assay to quantify cytosolic delivery of nanoparticles and theoretically assessed the possibility of using fluorescence resonance energy transfer (FRET) - which was found to be not practical in this case - as well as implementing a pro-fluorophore to generate a measurable signal. Our preliminary results indicate this method might indeed be useful for this purpose in the future.

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Deroche, Annabelle. "Optimisation de la limite de quantification d'une méthode chromatographique en phase gazeuse couplée à une détection par capture d'électrons : développement et application au dosage d'un antiandrogène dans le plasma humain." Paris 5, 1997. http://www.theses.fr/1997PA05P224.

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Zhao, Xuandong. "A study of Quantification of Aortic Compliance in Mice using Radial Acquisition Phase Contrast MRI." University of Cincinnati / OhioLINK, 2010. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=ucin1273001921.

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Corazzola, Alessandro. "Quantification of condensed tannins in red wines by Fourier transform mid-infrared spectroscopy (FTIR)." Master's thesis, ISA/UL, 2012. http://hdl.handle.net/10400.5/8609.

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Mestrado Vinifera EuroMaster - Instituto Superior de Agronomia Grape-derived condensed tannins, also known as proanthocyanidins, are critical quality components for red wines. They have been subject of numerous studies in order to find a fast and reliable methodology for their quantification. In this work it has been tested the method using Fourier transform mid-infrared (FTIR) and chemometrics to quantify the amount of condensed tannins present in 88 different red wines, with the reference method of precipitation with methylcellulose. As well it has been provided a single laboratory validation of the method of fractionation of condensed tannins by reverse phase and quantification by reaction with vanillin. The models developed for the FTIR spectroscopy were not enough robust for the estimation of total condensed tannins, with low values of coefficient of determination and low RPD values (R2 cross-validation: 0,76 and RPD cross-validation: 1,86). Validation of the fractionation method showed good performance in precision, with values of coefficient of variance for the three fractions FIII, FII and FI respectively of 5,2%; 11,4% and 11,6% and values of reproducibility of 168,1; 32,9 and 3,4 mg/L of epicatechin equivalents, but it was not possible to perform effective recovery studies

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Dyverfeldt, Petter. "Extending MRI to the Quantification of Turbulence Intensity." Doctoral thesis, Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV, 2010. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-52561.

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In cardiovascular medicine, the assessment of blood flow is fundamental to the understanding and detection of disease. Many pharmaceutical, interventional, and surgical treatments impact the flow. The primary purpose of the cardiovascular system is to drive, control and maintain blood flow to all parts of the body. In the normal cardiovascular system, fluid transport is maintained at high efficiency and the blood flow is essentially laminar. Disturbed and turbulent blood flow, on the other hand, appears to be present in many cardiovascular diseases and may contribute to their initiation and progression. Despite strong indications of an important interrelationship between flow and cardiovascular disease, medical imaging has lacked a non-invasive tool for the in vivo assessment of disturbed and turbulent flow. As a result, the extent and role of turbulence in the blood flow of humans have not yet been fully investigated. Magnetic resonance imaging (MRI) is a versatile tool for the non-invasive assessment of flow and has several important clinical and research applications, but might not yet have reached its full potential. Conventional MRI techniques for the assessment of flow are based on measurements of the mean velocity within an image voxel. The mean velocity corresponds to the first raw moment of the distribution of velocities within a voxel. An MRI framework for the quantification of any moment (mean, standard deviation, skew, etc.) of arbitrary velocity distributions is presented in this thesis. Disturbed and turbulent flows are characterized by velocity fluctuations that are superimposed on the mean velocity. The intensity of these velocity fluctuations can be quantified by their standard deviation, which is a commonly used measure of turbulence intensity. This thesis focuses on the development of a novel MRI method for the quantification of turbulence intensity. This method is mathematically derived and experimentally validated. Limitations and sources of error are investigated and guidelines for adequate application of MRI measurements of turbulence intensity are outlined. Furthermore, the method is adapted to the quantification of turbulence intensity in the pulsatile blood flow of humans and applied to a wide range of cardiovascular diseases. In these applications, elevated turbulence intensity was consistently detected in regions where highly disturbed flow was anticipated, and the effects of potential sources of errors were small. Diseased heart valves are often replaced with prosthetic heart valves, which, in spite of improved benefits and durability, continue to fall short of matching native flow patterns. In an in vitro setting, MRI was used to visualize and quantify turbulence intensity in the flow downstream from four common designs of prosthetic heart valves. Marked differences in the extent and degree of turbulence intensity were detected between the different valves. Mitral valve regurgitation is a common valve lesion associated with progressive left atrial and left ventricular remodelling, which may often require surgical correction to avoid irreversible ventricular dysfunction. The spatiotemporal dynamics of flow disturbances in mitral regurgitation were assessed based on measurements of flow patterns and turbulence intensity in a group of patients with significant regurgitation arising from similar valve lesions. Peak turbulence intensity occurred at the same time in all patients and the total turbulence intensity in the left atrium appeared closely related to the severity of regurgitation. MRI quantification of turbulence intensity has the potential to become a valuable tool in investigating the extent, timing and role of disturbed blood flow in the human cardiovascular system, as well as in the assessment of the effects of different therapeutic options in patients with vascular or valvular disorders.

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Goldstein, Lucas. "Three-dimensional visualization and quantification of residual non-aqueous phase liquids using x-ray computed tomography." Thesis, McGill University, 2004. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=81334.

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If spilled in significant quantities, non-aqueous phase liquids (NAPLs), such as gasoline, coal tar, and chlorinated solvents, will migrate downward through the subsurface. As the NAPL migrates through the soil or rock matrix, a significant fraction becomes 'trapped' due to capillary forces and may form pools above less permeable soil or rock layers. These 'trapped' NAPL globules and pools may partition into the groundwater and/or vapor phases, and serve as ongoing sources of contamination (i.e. source zones). Currently, the presence of NAPL in the subsurface is typically inferred from chemical analysis data. There are no techniques available for the direct observation of NAPLs entrapped inside soil aggregates or core samples. Furthermore, accurate, three-dimensional, and non-destructive NAPL characterization techniques are an important component of studies aimed at improving our understanding of NAPL movement, dissolution, and remediation. In this study, experiments were conducted to demonstrate the capabilities and limitations of X-ray Computed Tomography (CT) to non-destructively quantify contaminants in soil columns.

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Wang, Dewei. "Uncertainty Quantification and Accuracy Improvement of the Double-Sensor Conductivity Probe for Two-Phase Flow Measurement." Diss., Virginia Tech, 2019. http://hdl.handle.net/10919/103074.

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The double-sensor conductivity probe is one of the most commonly used techniques for obtaining local time-averaged parameters in two-phase flows. The uncertainty of this measurement technique has not been well understood in the past as it involves many different steps and influential factors in a typical measurement. This dissertation aims to address this gap by performing a systematic and comprehensive study on the measurement uncertainty of the probe. Three types of uncertainties are analyzed: that of measurands, of the model input parameters, and of the mathematical models. A Monte Carlo uncertainty evaluation framework closely simulating the actual measuring process is developed to link various uncertainty sources to the time-averaged two-phase flow quantities outputted by the probe. Based on the Monte Carlo uncertainty evaluation framework, an iteration method is developed to infer the true values of the quantities that are being measured. A better understanding of the uncertainty of the double-sensor conductivity probe is obtained. Multiple advanced techniques, such as high speed optical imaging and fast X-ray densitometry, recently become mature and easily accessible. To further improve the accuracy of local two-phase flow measurement, a method is developed to integrate these techniques with the double-sensor conductivity probe by considering the measuring principles and unique advantages of each technique. It has been demonstrated that after processing and synergizing the data from different techniques using the current integration method, the final results show improved accuracy for void fraction, gas velocity and superficial gas velocity, compared to the original probe measurements. High-resolution two-phase flow data is essential for the further development of various two-phase flow models and validation of two-phase CFD codes. Therefore, a comprehensive high-accuracy database of two-phase flows is acquired. The gas-phase information is obtained by the integration method developed in this dissertation, and the recently developed Particle Image Velocimetry and Planar Laser Induced Fluorescence (PIV-PLIF) technique is utilized to measure liquid-phase velocity and turbulence characteristics. Flow characteristics of bubbly flow, slug flow and churn-turbulent flow are investigated. The 1-D drift-flux model is re-evaluated by the newly obtained dataset. The distribution parameter model has been optimized based on a new void-profile classification method proposed in this study. The optimized drift-flux model has significant improvements in predicting both gas velocity and void fraction. Doctor of Philosophy The double-sensor conductivity probe is one widely used technique for measuring local time-averaged parameters in two-phase flows. Although a number of studies have been carried out in the past, a good understanding of the uncertainty of this technique is still lacking. This paper aims to address this gap by performing a systematic and comprehensive study on the measurement uncertainty of the probe. Three types of uncertainties are analyzed: that of measurands, of the model input parameters, and of the mathematical models. A better understanding of the uncertainty of the double-sensor conductivity probe has been obtained. Considering the unique measuring principles and advantages of multiple advanced techniques, a method is developed to integrate these techniques with the double-sensor conductivity probe to further improve the accuracy of local two-phase flow measurement. It has been demonstrated that the integration method significantly improves the accuracy of probe measurements. Realizing the needs of high-resolution two-phase flow data to the further development of various two-phase flow models and validation of two-phase CFD codes, a comprehensive database of two-phase flows is acquired. The gas-phase and liquid-phase information are acquired by the new integration method and the recently developed Particle Image Velocimetry and Planar Laser Induced Fluorescence (PIV-PLIF) technique, respectively. The classical 1-D drift-flux model is re-evaluated by the newly obtained dataset. The distribution parameter model has been optimized, resulting in significant improvements in predicting both gas velocity and void fraction.

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Mobile, Michael Anthony. "Quantification of Parameters in Models for Contaminant Dissolution and Desorption in Groundwater." Diss., Virginia Tech, 2012. http://hdl.handle.net/10919/37812.

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One of the most significant challenges faced when modeling mass transfer from contaminant source zones is uncertainty regarding parameter estimates. These rate parameters are of particular importance because they control the connectivity between a simulated contaminant source zone and the aqueous phase. Where direct observation has fallen short, this study attempts to interpret field data using an inverse modeling technique for the purpose of constraining mass transfer processes which are poorly understood at the field scale. Inverse modeling was applied to evaluate parameters in rate-limited models for mass transfer. Two processes were analyzed: (i) desorption of hydrophobic contaminants and (ii) multicomponent Non-Aqueous Phase Liquid (NAPL) dissolution. Desorption was investigated using data obtained from elution experiments conducted with weathered sediment contaminated with 2,4,6 trinitrotoluene (TNT) (Sellm and Iskandar, 1994). Transport modeling was performed with four alternative source models, but predictive error was minimized by two first-order models which represented sorption/desorption using a Freundlich isotherm. The results suggest that first-order/Freundlich models can reproduce dynamic desorption attributed to high-and-low relative energy sorption sites. However, additional experimentation with the inversion method suggests that mass constraints are required in order to appropriately determine mass transfer coefficients and sorption parameters. The final portion of this research focused on rate-limited mass transfer from multicomponent NAPLs to the aqueous phase. Previous work has been limited to bench and intermediate scale findings which have been shown to inadequately translate to field conditions. Two studies were conducted in which numerical modeling was used to reproduce dissolution from multicomponent NAPL sources. In the first study, a model was generated to reproduce dissolution of chloroform (TCM), trichloroethylene (TCE) and tetrachloroethylene (PCE) observed during an emplaced-source field experiment conducted within a flow cell (Broholm et al., 1999). In the second study, a methodology was developed for analyzing benzene, toluene, ethylbenzene and xylene (BTEX) data during a field-scale mass transfer test conducted within a vertically-smeared source zone (Kavanaugh, 2010). The findings suggest that the inversion technique, when provided appropriate characterization of site and source parameters and when given appropriate dataset resolution, represents a viable method for parameter determination. Furthermore, the findings of this research suggest that inversion-based modeling provides an innovative predictive method for determining mass transfer parameters for multicomponent mixtures at the field scale. Ph. D.

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Promelle, Véronique. "Quantification de la vascularisation ophtalmique par IRM en contraste de phase : application à la pathologie du glaucome." Thesis, Amiens, 2020. http://www.theses.fr/2020AMIE0037.

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La connaissance de la dynamique artérielle ophtalmique est pauvre, principalement issue des études Doppler et rien n'existe sur la composante veineuse. La physiopathologie du Glaucome est encore débattue et perfectible. Les études pointent notamment la vascularisation comme origine potentielle de cette affection, sans parvenir à proposer un modèle physiopathologique qui rassemble les différentes hypothèses. L'IRM en contraste de phase (IRM-PC) est une séquence non invasive, quantitative pour la mesure de la dynamique vasculaire. Principalement utilisée sur les artères de larges diamètres l'IRM PC, n'est à ce jour, pas utilisée sur l'artère et la veine ophtalmique. Le but de ce travail est de quantifier par IRM PC la dynamique vasculaire de l'artère ophtalmique (AO) et de la veine ophtalmique supérieure (VOS) sur une population saine. Dans une seconde étape d'appliquer l'IRM PC chez des patients atteints de glaucome. 21 volontaires sans affections ophtalmiques et 11 patients diagnostiqués comme porteurs d'un Glaucome ont été inclus. Les sujets ont bénéficié dans les mêmes conditions d'un examen sur une IRM 3 Tesla disposant d'une séquence IRM PC. Les AO et VOS gauches et droites ont été identifiées sur des séquences morphologiques pour positionner perpendiculairement l'IRM PC. Les IRM PC ont été analysées par un logiciel dédié pour calculer le débit a chaque phase du cycle cardiaque et construire la courbe d'évolution du débit au cours du cycle cardiaque de chaque vaisseau. Et en calculer : le débit moyen, maximal et minimal et les vitesses. Les résultats obtenus comme référence physiologique, montrent la faisabilité de cette technique. Il est mis en évidence l'existence d'une pulsatilité veineuse non négligeable au cours du cycle cardiaque. La dynamique vasculaire des patients glaucome (pulsatilité) était diminuée. Une corrélation largement significative entre le débit et la vitesse maximale a été mise en évidence dans la veine ophtalmique supérieure des témoins, qui n'était pas retrouvée chez les patients. En conclusion, notre travail a confirmé la possibilité d'étudier par IRM-PC la dynamique du débit sanguin dans l'AO et la VOS. Dans le glaucome, nous avons montré l'existence d'une modification significative de la dynamique vasculaire de la VOS pouvant résulter d'une altération de l'écoulement du réseau capillaire et/ou de la pression d'aval The dynamics of the vascular arterial and venous supply of the eye remains poorly understood, coming mainly from studies in Doppler color imaging with very little quantitative data about venous component. The physiopathology of glaucoma is still under debate, with many ongoing investigations and hypotheses. Among them, vascular changes have been suggested to be a possible cause for the disease, but no pathophysiology model could be proposed that connect the different current hypotheses. Phase contrast magnetic resonance imaging (PC MRI) is a non-invasive MRI sequence for quantitative measurement of the vascular dynamics of a system. So far mainly used to investigate large caliber arteries, PC MRI has not yet been used to measure flows of the ophthalmic artery and vein. The objective of this work was to quantify by PC MRI the blood flow and vascular dynamics of the ophthalmic artery (OA) and the superior ophthalmic vein (SOV) in a population of healthy subjects in a first part, and in glaucoma patients in a second part. In total, 21 volunteers without ocular disease and 11 patients diagnosed with glaucoma were included. They all underwent 3 Tesla MRI examination with PC MRI sequence, in the same settings. The right and left OA and SOV were identified using anatomic sequences, to place a PC MRI acquisition plane perpendicular to their course. PC MRI series were analyzed using a dedicated software, calculating the flow for each phase of the cardiac cycle and displaying the curve of flow during cardiac cycle for each vessel. From this data the mean, maximal and minimal blood flow for each vessel were calculated. The results obtained in healthy subjects showed the feasibility and reliability of the technique. They were considered as normal reference and were later used as control. Notably, a significant pulsatility of the venous flow during the cardiac cycle was demonstrated. In glaucoma patients, this venous pulsatility was significantly lower. Also in patients our results showed a loss of the correlation between the mean flow and the maximal velocity in the OA. The flow waveform and the relationships between flow, velocity and section of the SOV suggested an impairment of the venous hemodynamics in glaucoma, which could result from capillary changes and/or from downstream pressure changes

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Vo, Duyen Thuy. "Detection and Attempted Quantification of Allelopathic Chemicals in Buffelgrass (Pennisetum ciliare) Root Leachates Using Reverse Phase-HPLC." Thesis, The University of Arizona, 2013. http://hdl.handle.net/10150/297777.

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Pennisetum ciliare, commonly known as buffelgrass, is an invasive grass that has led to noticeable declines in perennial diversity and abundance. Allelopathy, which describes the exudation of secondary metabolites that result in detrimental effects upon neighboring species, has been implicated as a possible mechanism for buffelgrass' success due to observations that its root leachates inhibit the growth of native plants. Since past researchers have only revealed the identity of the acids present within the leachates (Table 1), I have proposed methods in which to extract and quantify these chemicals by employing reverse phase-HPLC. By comparing retention times with that of standards for the identified allelochemicals, p-hydroxybenzoic, vanillic, syringic, and p-coumaric acid were confirmed in buffelgrass root leachates by HPLC. Using calibration curves, buffelgrass roots were found to consist of 5.801x10⁻³±5x10⁻⁶% p-hydroxybenzoic acid, 3.259x10⁻³±8x10⁻⁶% vanillic acid, 4.940x10⁻³±5x10⁻⁶% syringic acid, and 4.369x10⁻³±5x10⁻⁶% p-coumaric acid, by weight. The detection of the acids demonstrated that these compounds were at a significant enough concentration to be detected, thereby suggesting that they may play a major role in plant interference. By detecting and quantifying phytotoxins in native and invasive plants, the chemicals responsible for inhibiting plant growth could be elucidated, establishing a quantifiable criterion of allelopathy.

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Jonathan, Bremer Lin Weili. "Single scan MR velocity quantification in ROI by alternating velocity encoding gradient pulse polarity between phase encoding steps." Chapel Hill, N.C. : University of North Carolina at Chapel Hill, 2008. http://dc.lib.unc.edu/u?/etd,2046.

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Thesis (M.S.)--University of North Carolina at Chapel Hill, 2008. Title from electronic title page (viewed Feb. 17, 2009). "... in partial fulfillment of the requirement for the degree of Master in the Department of Biomedical Engineering." Discipline: Biomedical Engineering; Department/School: Medicine.

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Klein, Marlène. "Identification et quantification de métabolites séléniés dans l’urine humaine." Pau, 2010. http://www.theses.fr/2010PAUU3034.

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La barrière entre l’aspect bénéfique du sélénium (Se) et son aspect toxique est étroite. Afin de mieux contrôler les apports de cet élément dans l’alimentation, de nombreux travaux s’intéressent à la compréhension de son métabolisme. Cette thèse présente le développement et l’optimisation de méthodes d’analyse des espèces séléniées dissoutes et volatiles présentes dans l’urine de sujets non supplémentés. Le couplage entre la chromatographie liquide et la spectrométrie de masse atomique précédé d’un prétraitement de l’échantillon par extraction sur phase solide a permis non seulement de confirmer la présence de métabolites séléniés précédemment détectés dans l’urine de sujets supplémentés mais également, de mettre en évidence des composés inconnus. Un de ces composés a été identifié par spectrométrie de masse moléculaire. Les couplages entre la chromatographie gazeuse et les spectrométries de masse atomique et moléculaire, précédés d’une micro-extraction sur phase solide ont été utilisés pour l’analyse des formes volatiles de Se. Ces méthodes ont permis de confirmer la présence de composés séléniés et mixtes Se/S dans les urines de sujets non supplémentés et, de définir des conditions de stockage permettant de préserver la spéciation originelle dans l’échantillon The concentration range between beneficial and toxic effects for selenium (Se) is very narrow. In order to monitor selenium intake and to improve knowledge of Se metabolism, studies on selenium species ingested and excreted are performed. This report presents the development and the optimization of speciation analysis of dissolved and volatile Se species in urine of non supplemented subjects by coupling liquid chromatography or gas chromatography to inductively coupled plasma mass spectrometry. In the case of dissolved species, solid phase extraction of the sample as sample pretreatment allowed us to confirm the presence of known selenium compounds and to highlight unknown selenium species. One of these new species was further identified by molecular mass spectrometry. The analysis of volatile selenium compounds was performed by gas chromatography coupled to ICP-MS after sample extraction by SPME. This method led to the identification of some selenium and mixed selenium/sulphur species in urine from non supplemented subjects and allowed us to define suitable storage conditions to maintain original speciation

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Carlier, Julien. "Schémas aux résidus distribués et méthodes à propagation des ondes pour la simulation d’écoulements compressibles diphasiques avec transfert de chaleur et de masse." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLY008/document.

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Ce travail a pour thème la simulation numérique d’écoulements diphasiques dans un contexte industriel. En effet, la simulation d’écoulements diphasiques est un domaine qui présente de nombreux défis, en raison de phénomènes complexes qui surviennent, comme la cavitation et autres transferts entre les phases. En outre, ces écoulements se déroulent généralement dans des géométries complexes rendant difficile une résolution efficiente. Les modèles que nous considérons font partie de la catégorie des modèles à interfaces diffuses et permettent de prendre en compte aisément les différents transferts entre les phases. Cette classe de modèles inclut une hiérarchie de sous-modèles pouvant simuler plus ou moins d’interactions entre les phases. Pour mener à bien cette étude nous avons en premier lieu comparé les modèles diphasiques dits à quatre équations et six équations, en incluant les effets de transfert de masse. Nous avons ensuite choisi de nous concentrer sur le modèle à quatre équations. L’objectif majeur de notre travail a alors été d’étendre les méthodes aux résidus distribués à ce modèle. Dans le contexte des méthodes de résolution numérique, il est courant d’utiliser la forme conservative des équations de bilan. En effet, la résolution sous forme non-conservative conduit à une mauvaise résolution du problème. Cependant, résoudre les équations sous forme non-conservative peut s’avérer plus intéressant d’un point de vue industriel. Dans ce but, nous utilisons une approche développée récemment permettant d’assurer la conservation en résolvant un système sous forme non-conservative, à condition que la forme conservative soit connue. Nous validons ensuite notre méthode et l’appliquons à des problèmes en géométries complexes. Finalement, la dernière partie de notre travail est dédiée à étudier la validité des modèles à interfaces diffuses pour des applications à des problèmes industriels réels. On cherche alors, en utilisant des méthodes de quantification d’incertitude, à obtenir les paramètres rendant nos simulations les plus vraisemblables et cibler les éventuels développements pouvant rendre nos simulations plus réalistes The topic of this thesis is the numerical simulation of two-phase flows in an industrial framework. Two-phase flows modelling is a challenging domain to explore, mainly because of the complex phenomena involved, such as cavitation and other transfer processes between phases. Furthermore, these flows occur generally in complex geometries, which makes difficult the development of efficient resolution methods. The models that we consider belong to the class of diffuse interface models, and they allow an easy modelling of transfers between phases. The considered class of models includes a hierarchy of sub-models, which take into account different levels of interactions between phases. To pursue our studies, first we have compared the so-called four-equation and six-equation two-phase flow models, including the effects of mass transfer processes. We have then chosen to focus on the four-equation model. One of the main objective of our work has been to extend residual distribution schemes to this model. In the context of numerical solution methods, it is common to use the conservative form of the balance law. In fact, the solution of the equations under a non-conservative form may lead to a wrong solution to the problem. Nonetheless, solving the equations in non-conservative form may be more interesting from an industrial point of view. To this aim, we employ a recent approach, which allows us to ensure conservation while solving a non-conservative system, at the condition of knowing its conservative form. We then validate our method and apply it to problems with complex geometry. Finally, the last part of our work is dedicated to the evaluation of the validity of the considered diffuse interface model for applications to real industrial problems. By using uncertainty quantification methods, the objective is to get parameters that make our simulations the most plausible, and to target the possible extensions that can make our simulations more realistic

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Carlier, Julien. "Schémas aux résidus distribués et méthodes à propagation des ondes pour la simulation d’écoulements compressibles diphasiques avec transfert de chaleur et de masse." Electronic Thesis or Diss., Université Paris-Saclay (ComUE), 2019. http://www.theses.fr/2019SACLY008.

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Ce travail a pour thème la simulation numérique d’écoulements diphasiques dans un contexte industriel. En effet, la simulation d’écoulements diphasiques est un domaine qui présente de nombreux défis, en raison de phénomènes complexes qui surviennent, comme la cavitation et autres transferts entre les phases. En outre, ces écoulements se déroulent généralement dans des géométries complexes rendant difficile une résolution efficiente. Les modèles que nous considérons font partie de la catégorie des modèles à interfaces diffuses et permettent de prendre en compte aisément les différents transferts entre les phases. Cette classe de modèles inclut une hiérarchie de sous-modèles pouvant simuler plus ou moins d’interactions entre les phases. Pour mener à bien cette étude nous avons en premier lieu comparé les modèles diphasiques dits à quatre équations et six équations, en incluant les effets de transfert de masse. Nous avons ensuite choisi de nous concentrer sur le modèle à quatre équations. L’objectif majeur de notre travail a alors été d’étendre les méthodes aux résidus distribués à ce modèle. Dans le contexte des méthodes de résolution numérique, il est courant d’utiliser la forme conservative des équations de bilan. En effet, la résolution sous forme non-conservative conduit à une mauvaise résolution du problème. Cependant, résoudre les équations sous forme non-conservative peut s’avérer plus intéressant d’un point de vue industriel. Dans ce but, nous utilisons une approche développée récemment permettant d’assurer la conservation en résolvant un système sous forme non-conservative, à condition que la forme conservative soit connue. Nous validons ensuite notre méthode et l’appliquons à des problèmes en géométries complexes. Finalement, la dernière partie de notre travail est dédiée à étudier la validité des modèles à interfaces diffuses pour des applications à des problèmes industriels réels. On cherche alors, en utilisant des méthodes de quantification d’incertitude, à obtenir les paramètres rendant nos simulations les plus vraisemblables et cibler les éventuels développements pouvant rendre nos simulations plus réalistes The topic of this thesis is the numerical simulation of two-phase flows in an industrial framework. Two-phase flows modelling is a challenging domain to explore, mainly because of the complex phenomena involved, such as cavitation and other transfer processes between phases. Furthermore, these flows occur generally in complex geometries, which makes difficult the development of efficient resolution methods. The models that we consider belong to the class of diffuse interface models, and they allow an easy modelling of transfers between phases. The considered class of models includes a hierarchy of sub-models, which take into account different levels of interactions between phases. To pursue our studies, first we have compared the so-called four-equation and six-equation two-phase flow models, including the effects of mass transfer processes. We have then chosen to focus on the four-equation model. One of the main objective of our work has been to extend residual distribution schemes to this model. In the context of numerical solution methods, it is common to use the conservative form of the balance law. In fact, the solution of the equations under a non-conservative form may lead to a wrong solution to the problem. Nonetheless, solving the equations in non-conservative form may be more interesting from an industrial point of view. To this aim, we employ a recent approach, which allows us to ensure conservation while solving a non-conservative system, at the condition of knowing its conservative form. We then validate our method and apply it to problems with complex geometry. Finally, the last part of our work is dedicated to the evaluation of the validity of the considered diffuse interface model for applications to real industrial problems. By using uncertainty quantification methods, the objective is to get parameters that make our simulations the most plausible, and to target the possible extensions that can make our simulations more realistic

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Zhang, Zhong Yi. "Visualisation and quantification of the defects in glass-fibre reinforced polymer composite materials using electronic speckle pattern interferometry." Thesis, Loughborough University, 1999. https://dspace.lboro.ac.uk/2134/22078.

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Non-destructive testing (NDT) of glass-fibre reinforced polyester (GRP) composite materials has been becoming increasingly important due to their wide applications in engineering components and structures. Electronic Speckle Pattern Interferometry (ESPI) has promising potential in this context because it is a non-contact, whole-field and real-time measurement system. This potential has never been fully exploited and there is only limited knowledge and understanding available in this area. This reality constrains the wide popularity and acceptance of ESPI as a novel NDT technique. Therefore it is of considerable importance to develop an understanding of the capability of ESPI with respect to damage evaluation in GRP composite materials. The research described in this thesis is concerned with an investigation into the applicability of ESPI in the NDT of GRP composite materials. Firstly, a study was carried out to determine excitation techniques in terms of practicality and effectiveness in the ESPI system. Three categories of defects were artificially introduced in GRP composite materials, namely holes, cracks and delaminations each with different geometrical features. ESPI was then employed to evaluate the three kinds of defects individually. It has been found that cracks and holes on back surfaces can be defined when the technique is used in conjunction with thermal excitation. Internal Temperature Differential (ITD) induced fringe patterns were more efficient than External Thermal Source (ETS) induced fringe patterns with regard to detecting the presence of holes and cracks. In the case of delamination, ESPI was found to be capable of detecting the damage when used in combination with mechanical excitation originating from a force transducer hammer. The geometrical features and magnitudes of delaminations were also established as being quantifiable. The validation of ESPI as an NDT technique was carried out in an attempt to establish a better understanding of its suitability and have more confidence in its applications. Four damaged specimens were Subjected to ESPI examination in conjunction with visual inspection, ultrasonic C-scan and sectioning techniques. The geometrical features and magnitudes of damage evaluated using ESPI showed a good correlation with those evaluated by conventional techniques. Poor visibility and readability is an inherent problem associated with ESP! due to an overlapping between the noise and signal frequencies. An improvement of image quality is expected in an attempt to achieve a wide acceptance of ESPI as a novel NDT technique. It has also been demonstrated that this problem can be tackled using optical phase stepping techniques in which optical phase data can be extracted from the intensity fringes. A three-frame optical phase stepping technique was employed to produce the "wrapped" and "unwrapped" phase maps which are capable of indicating internal damage with high visibility and clarity. Finally ESPI was practically employed to evaluate damage in GRP composites introduced by quasi-static and dynamic mechanical loading. It was found that ESP! was capable of monitoring the progressive damage development of specimens subjected to incremental flexural loading. The initial elastic response, damage initiation, propagation and ultimate failure of specimens were clearly characterised by the abnormal fringe pattern variations. In a similar manner, ESPI was employed to evaluate the low velocity falling weight impact induced damage. A correlation was established between the magnitude of damage and the impact event parameters as well as the residual flexural properties.

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Lesponne, Martine. "Quantification de deux substances odorantes par trois sujets humains et par trois chromatographes en phase gazeuse. Contribution à la mise en évidence des points critiques de la mesure sensorielle." Dijon, 1994. http://www.theses.fr/1994DIJOS032.

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Le double objectif de ce travail était de comparer la qualité des réponses obtenues avec un processus de mesure chromatographique et avec un processus de mesure sensorielle dans le cas d'estimations d'intensité d'un composé volatil et de contribuer à l'amélioration de la qualité du processus de mesure sensorielle par la recherche de ses points critiques. Dans une première partie, des échantillons gazeux d'acétate d'éthyle et de benzaldéhyde présentes dans des sacs souples ont été quantifiés par trois chromatographes en phase gazeuse et par trois sujets humains (avec la technique de l'estimation de la grandeur). Les réponses ont été comparées du point de vue de la fidelité, de la justesse et de l'efficacité. Les résultats montrent l'inferiorité des sujets par rapport aux chromatographes en phase gazeuse. Dans une seconde partie, quatre expériences ont permis d'étudier les causes des variations du processus de mesure sensorielle mises en lumière dans la première partie. L'analyse des résultats conduit aux deux conclusions suivantes: l'effet d'un facteur, quand il existe, dépend du composé volatil étudié et du critère de qualité retenu; les différences interindividuelles sont considérables

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Ghandour, Houda. "Analyse et quantification des émissions polluantes de composés organiques volatils d'origine industrielle par mesures directes aux sources." Lille 1, 1997. http://www.theses.fr/1997LIL10057.

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La connaissance des émissions des COV précurseurs de l'ozone troposphérique est exigée pour une approche modélisante du problème. Leur spéciation moléculaire est indispensable vu la sophistication des mécanismes chimiques impliqués et aboutira à établir des cadastres d'émission en kg/km2/h. Travail commençant par une étude méthodologique de laboratoire du couplage GC/MS EM640 BRUKER et des conditions d'échantillonnage à appliquer sur le terrain. Résultats de mesures faites dans une UIOM, une raffinerie, une usine de boites peintes, une sidérurgie et une cimenterie. Détermination précise des émissions, comportant beaucoup d'aromatiques, allant de 7 a 50000 g/h. Appréciation du caractère utilitaire des résultats comme donnée d'entrée en modélisation, et intérêt de proposer une modélisation des émissions. Appréciation du caractère aveugle de l'actuelle taxe parafiscale sur les COV.

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Sémard, Gaëlle. "Recherche et quantification de substances cibles et émergentes dans les eaux résiduaires à l’aide de la chromatographie en phase gazeuse bidimensionnelle." Rouen, 2009. http://www.theses.fr/2009ROUES002.

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La découverte de nouveaux contaminants dans les eaux naturelles, ayant des effets biologiques à de faibles niveaux de concentration, a amené les législateurs à fixer des seuils d’émission, ou des Normes de Qualité environnementale (NQ) pour un nombre croissant de contaminants. L’analyse, l’identification et la quantification de ces substances dans des matrices complexes représentent un véritable défi. La chromatographie en phase gazeuse bidimensionnelle (GCxGC) est une technique de séparation prometteuse, capable de pallier aux problèmes de saturation conventionnelles. Du fait de sa capacité de séparation importante, les étapes de préparation de l’échantillon ont été considérablement allégées par rapport à une analyse de GC classique, minimisant ainsi la perte de traces de composés cibles. Après optimisation des conditions analytiques, la GCxGC a été appliquée, dans notre étude, pour la recherche d’une cinquantaine de substances cibles et de composés émergents dans des eaux résiduaires brutes et traitées de six stations d’épuration The discovery of new contaminants in natural waters, with biological effects at low concentration levels, has led legislators to set emission threshold, or environmental quality standards (EQS) for a growing number of contaminants. The analysis, identification and quantification of these substances in complex matrices represent a real challenge. Comprehensive two-dimensional gas chromatography (GCxGC) is a promising separation technique that can resolve the problems of saturation of other conventional analytical techniques. Because of its important capacity of separation, steps of sample preparation have been significantly reduced compared to a conventional GC analysis, thus minimizing the loss of traces of target compounds. After optimisation of analytical conditions, the GCxGC has been applied in our study, to seek a fifty target substances and emerging compunds in raw and treated urban wastewaters from six wastewaters treatment purfication station

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Luchetta, Laurent. "Caractérisation et quantification dans la basse atmosphère de composés organiques volatils biogéniques et anthropiques contribuant à la pollution de l'air." Toulouse, INPT, 1999. http://www.theses.fr/1999INPT015H.

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Les composés organiques volatils (COV) sont considérés avec les oxydes d'azote (NOX) comme les principaux précurseurs de la formation de l'ozone dans la troposphère. Ils ont des origines naturelles ou résultent des activités humaines. La connaissance qualitative et quantitative des principaux COV est indispensable à la compréhension de la physico-chimie de l'atmosphère. Le travail réalisé comporte une série de résultats dont les plus marquants sont : - la réalisation et la mise au point d'une chaîne analytique permettant de déterminer les concentrations atmosphériques des hydrocarbures anthropiques légers (C 4 - C 9); - la participation, après validation du système analytique, à diverses campagnes de mesures sur site, principalement dans la région Midi-Pyrénées, afin de mettre en exergue la pollution atmosphérique engendrée par les hydrocarbures anthropiques; - la détermination, lors de campagnes internationales, de taux et flux d'émission monoterpéniques (COV Biogéniques) de plusieurs écosystèmes différents, à partir de la méthode des cuvettes instrumentées; - l'estimation annuelle des COV naturels de l'écosystème forestier français, par application de modèles mathématiques.

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Monmarson, Bastien. "Simulation en présence d'incertitude d'un gazosiphon de grande échelle. Application à l'optimisation d'un nouveau système géothermique urbain." Thesis, Université Grenoble Alpes (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015GREAI045/document.

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Cette thèse s’inscrit dans le cadre du projet ANR « Uncertain flow optimization » (UFO) consacré au développement et à l’application de méthodes efficaces de quantification d’incertitudes pour l’analyse et l’optimisation d’écoulements. Dans ce contexte, ces méthodes sont appliquées à des gazosiphons de grande échelle utilisés comme pompe. Plus particulièrement, on s’intéresse à de tels gazosiphons choisis pour constituer l’organe central d’un système géothermique innovant, compatible avec un environnement urbain. On souhaite en quantifier le potentiel énergétique par voie numérique avec la recherche d’un compromis entre justesse des résultats et efficacité optimale. La simulation de l’écoulement diphasique produit dans le gazosiphon est fondée sur un modèle quasi-1D à flux de dérive et s’appuie sur une démarche de résolution implicite. Les résultats sont validés sur les études expérimentales les plus pertinents de la littérature, dont aucune toutefois n’atteint les longueurs requises de l'ordre du kilomètre. Le code de simulation du gazosiphon fait ensuite l’objet d’une démarche de prise en compte d’incertitudes physiques et de modélisation, précédée par une analyse de deux méthodes de quantification d’incertitude : une méthode non-intrusive de type chaos polynomial, et une méthode plus récente dite semi-intrusive qui fut développée en amont du projet UFO. Cet outil est intégré dans une modélisation simplifiée du système géothermique urbain dans son ensemble impliquant les composants en surface, notamment le compresseur d'air. Il en résulte une optimisation énergétique robuste préliminaire de deux variantes du système géothermique urbain proposé, respectivement de récupération de chaleur et de production d’électricité This PhD thesis is part of the ANR project « Uncertain Flow Optimization » (UFO). The project is devoted to the development and application of efficient uncertainty quantification methods for flow analysis and optimization. In this framework, these methods are applied to the study of a large-scale airlift pump. The airlift pump is selected to be part of an innovative geothermal system, which can be exploited within an urban environment. We wish to quantify and optimize the energy potential of this new system with numerical tools. They provide both good accuracy and efficiency properties. The airlift two-phase flow simulation is based on a quasi one-dimensional drift flux model, which is implicitly solved. The solver is validated by comparison with relevant experimental airlift studies from the literature. However, these studies remain below the kilometric-targeted pipe length. Thanks to the analysis of two uncertainty quantification methods, a non-intrusive approach relying on polynomial chaos expansion and a new semi-intrusive method developed ahead of the UFO project, we perform airlift pump simulations taking into account physical and modelling uncertainties. This numerical tool is inserted into a simplified model of the complete urban geothermal system that involves surface devices, such as an air compressor. Finally, a robust preliminary optimization process is performed for two versions of the proposed geothermal urban system. They are designed respectively for heat recovery and electricity production

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Galbincea, Nicholas D. "Critical Analysis of Dimensionality Reduction Techniques and Statistical Microstructural Descriptors for Mesoscale Variability Quantification." The Ohio State University, 2017. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1500642043518197.

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Wiest, Laure. "Méthodologies analytiques basées sur la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse pour la quantification multi-familles de tensioactifs dans les rivières." Electronic Thesis or Diss., Lyon, 2021. http://www.theses.fr/2021LYSE1138.

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Le nombre de nouveaux produits chimiques sur le marché augmente chaque année. De surcroit, ils sont de plus en plus complexes et les formulations contiennent des mélanges qui sont finalement disséminés dans divers compartiments de l’environnement. Parmi ces micropolluants, les tensioactifs présentent quelques particularités. Tout d’abord, les tensioactifs sont des mélanges complexes d’homologues et isomères dont la composition dépend des matières premières et des procédés de synthèse utilisés. Deuxièmement, certains, comme les alkylbenzène sulfonate linéaires (LAS) et les triethanolamine esterquats (TEAQ), sont utilisés en très grandes quantités, ce qui peut faire craindre une « pseudo-persistance » dans les milieux récepteurs. Enfin, les domaines d’application des tensioactifs sont extrêmement variés, allant du domestique à l’industriel, en passant par l’agricole et l’hospitalier, ce qui suggère un grand nombre de sources de transfert vers l’environnement. Les données concernant leur occurrence sont très hétérogènes selon les familles, et certains types de tensioactifs n’ont jamais été recherchés dans les rivières jusqu’à présent. L’objectif de cette thèse est donc de développer des méthodologies analytiques sensibles et fiables qui permettent de combler ce manque de connaissance concernant l’occurrence des tensioactifs dans l’environnement. Afin d’obtenir une sensibilité suffisante, une méthode de chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (LC-MS/MS) a tout d’abord été optimisée. Une contamination des blancs instrumentaux, en particulier par les tensioactifs anioniques, à des concentrations comprises entre 0,1 µg/L et 3 µg/L a été observée. Les limites de quantification (LQ) étant encore trop élevées par rapport aux PNEC, une étape de préconcentration par extraction sur phase solide a été mise au point pour l’analyse dans les eaux de rivière. Concernant l’analyse des sédiments, une extraction assistée par ultrasons a été optimisée puis validée. Avec des LQ entre 0,015 et 0,485 µg/L pour les eaux et entre 6,4 et 158 µg/kg pour les sédiments, les performances analytiques obtenues sont compatibles avec l’analyse de traces. L’application de ces méthodologies à des eaux et sédiments de rivière prélevés en France a montré une forte présence des tensioactifs dans ces milieux. En particulier, les LAS présentent à la fois des fréquences de quantification et des rapports concentrations moyennes sur PNEC élevés, et représentent donc un risque important pour les écosystèmes The number of chemicals on the market is increasing every year. Moreover, they are more and more complex and the formulations contain mixtures that are finally disseminated in various compartments of the environment. Among these micropollutants, surfactants present some particularities. First, surfactants are complex mixtures of homologues and isomers whose composition depends on the raw materials and the synthesis processes used. Secondly, some, such as linear alkylbenzene sulfonates (LAS) and triethanolamine esterquats (TEAQ), are used in very large quantities, which may induce "pseudo-persistence" in the receiving environments. Finally, the fields of application of surfactants are extremely varied, ranging from domestic to industrial, agricultural and hospital, which suggests a large number of sources of transfer to the environment. The data concerning their occurrence are very heterogeneous according to the families, and some types of surfactants have never been looked for in rivers until now. The objective of this thesis was therefore to develop sensitive and reliable analytical methodologies to fill this knowledge gap concerning the occurrence of surfactants in the environment. In order to obtain sufficient sensitivity, a liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) method was first optimized. Contamination of instrumental blanks, in particular by anionic surfactants, at concentrations between 0.1 µg/L and 3 µg/L was observed. As the limits of quantification (LOQ) were still too high compared to the PNEC, a pre-concentration step by solid phase extraction was developed for the analysis in river water. For sediment analysis, an ultrasound-assisted extraction was optimized and validated. With LOQs between 0.015 and 0.485 µg/L for water and between 6.4 and 158 µg/kg for sediment, the analytical performances obtained are compatible with trace analysis. The application of these methodologies to river waters and sediments sampled in France showed a high occurrence of surfactants in these media. In particular, LAS have both high quantification frequencies and high mean concentration to PNEC ratios, and therefore represent a significant risk to ecosystems

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Ismailov, Taner. "Quantification of resin acids, fatty acids and sterols in process and waste water from forest industry." Thesis, Karlstads universitet, Avdelningen för kemi och biomedicinsk vetenskap, 2013. http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kau:diva-28179.

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This work focuses on wood extractives in effluents from the CTMP plant at Skoghall Mill. Pulp and paper industry effluents contain mostly natural compounds which are part of the trees. They are toxic to aquatic life but harmless in nature, as they are present in low concentrations. Processing tons of wood, such as in a pulp mill, strongly increases the concentrations of the toxic compounds (Ali, M. and Sreekrishnan, T., 2001) which have to be treated before transferring to the aquatic environment.Extractives can be found in different forms, as micelles soluble in water, unprocessed in fibers or absorbed on the surface of fibers. It is important to know in which forms extractives are mostly present in the effluent, so that they can be treated more efficiently. It is desired to have extractives absorbed on the fibers and fibrils present in the waste water, so they can be separated from the water and treated separately, e.g. burned for energy recovery. Dissolved extractives complicate the oxygen transfer in an aerated biological treatment step with their surface active properties (Sandberg, 2012).The aim of this study is quantification of extractives on the fibers suspended in the waste water and extractives dissolved in the water. The distribution between the two forms is an important input when designing future effluent treatment. Wood extractives itself are a wide group with different compounds. This work focuses on the main groups present in waste water: resin acids, free and esterified fatty acids and, free and esterified sterols. These groups are analyzed in different process waters and waste water before the waste water treatment plant. The measured concentrations of extractives were as expected, higher in process and effluent waters, lower in white water. Most of the extract was dissolved in the water and unfortunately fiber samples contained very low concentration from the total extract in the samples.

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Sonnabend, Kristina [Verfasser], David [Akademischer Betreuer] Maintz, Marc [Gutachter] Tittgemeyer, and Mathias [Gutachter] Hoehn. "Quantification of cerebrospinal fluid dynamics using phase-contrast magnetic resonance imaging / Kristina Sonnabend ; Gutachter: Marc Tittgemeyer, Mathias Hoehn ; Akademischer Betreuer: David Maintz." Köln : Deutsche Zentralbibliothek für Medizin, 2021. http://d-nb.info/1226872476/34.

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GOURDON, PIERRE. "Etude physiologique d'une souche de corynebacterium glutamicum productrice d'acide glutamique : quantification des flux metaboliques et des contraintes biochimiques en phase de production." Toulouse, INSA, 1999. http://www.theses.fr/1999ISAT0043.

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L'objectif de ce travail est l'etude de la distribution des flux chez c. Glutamicum 2262 en phase de production de glutamate. L'excretion du glutamate est induite par une elevation de la temperature. Ce traitement permet la production de 90 g/l de glutamate en 24 heures. L'etude du role de l'enzyme malique dans la fonction anaplerotique en phase de production montre qu'elle n'est pas essentielle ou impliquee dans la voie de production du glutamate. L'enzyme fonctionnerait in vivo dans le sens neoglucogenique. L'analyse cinetique de la culture montre un shift metabolique de la production de glutamate vers la synthese de co-produits. Le dosage des metabolites intracellulaires revele une accumulation des metabolites glycolytiques en phase de production due au rapport nadh/nad +, qui va favoriser la synthese des co-produits. Nous avons suivi l'evolution de la distribution des flux dans le metabolisme central en utilisant du glucose enrichit au carbone 13. Cette etude montre que le pourcentage du flux entrant dans la voie des pentoses diminue rapidement apres l'augmentation de la temperature. Le niveau intracellulaire de fructose-1,6-bisphosphate regulerait, en partie, le flux dans cette voie en inhibant la glucose-6-phosphate deshydrogenase. Le bilan energetique fait apparaitre une augmentation de la production d'energie associee a la maintenance qui est probablement liee aux conditions de stress en phase de production et a l'excretion du glutamate.

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Gandubert, Anne. "Caractérisation et quantification de la phase sulfure des catalyseurs d'hydrotraitement : influence de la nature des précurseurs oxydes et des conditions de sulfuration." Lille 1, 2006. http://www.theses.fr/2006LIL10140.

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Ces travaux de thèse concernent la caractérisation, la quantification et la genèse par sulfuration de la phase active de catalyseurs d'hydrotraitement CoMo(P) supportés sur alumine et préparés à partir des sels de cobalt des hétéropolyanions CO2Mo10O38H4 6- et P2Mo5O23 6-. Une méthodologie de caractérisation multitechniques des catalyseurs sulfures a été mise au point en étudiant des échantillons CoMoP à 14 % poids en Mo et à rapport atomique Co/Mo variant de 0. 1 à 0. 7. Cette méthodologie s'appuie principalement sur l' X-ray photoelectron spectroscopy, la microscopie électronique à transmission et les tests d'hydrogénation du toluène. Les phases présentes sur les échantillons ont été identifiées et quantifiées. Le rôle essentiel de la phase mixte CoMoS dans l'activité hydrogénante des catalyseurs a également été confirmé. Le rapport Co/Mo optimal, pour ce type de précurseur, a été déterminé et est proche de 0. 3. Pour ce rapport, la phase active CoMoS correspondrait à des feuillets hexagonaux MoS2 avec 100 % des Mo de bord-S et 50 % des Mo de bord-Mo substitués par le Co. La sulfurabilité de précurseurs CoMo(P) à Co/Mo de 0. 5, séchés ou calcinés, a ensuite été étudiée entre 20°C et 600°C. Le mécanisme de sulfuration du Mo s'avère différent pour les catalyseurs avec ou sans phosphore. Concernant le Co, le précurseur CoMo séché présente un comportement singulier avec une sulfurabilité du Co en phase CoMoS dès les basses températures nettement supérieure à celle des autres précurseurs. Malgré ces différences de sulfurabilité, les quatre précurseurs présentent leur état de sulfuration optimal entre 300°C et 400 °C, le CoMo séché se distinguant des trois autres par une proportion de phase CoMoS plus élevée. Ces travaux montrent également que la substitution totale des Mo de bord des feuillets par le Co ne conduit pas à une meilleure activité. Le gain d'activité doit passer par une augmentation du nombre de feuillets partiellement promus, nécessitant une meilleure sulfuration du Mo.

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Khoury, Spiro. "Aspects théoriques et pratiques de la quantification des classes lipidiques par usage des détecteurs universels et de la spectrométrie de masse." Thesis, Université Paris-Saclay (ComUE), 2015. http://www.theses.fr/2015SACLS191.

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Le lipidome désigne la sous-fraction lipidique du métabolome d’une cellule, d’un tissu ou d’un organisme. Cependant, bien qu’appartenant au cadre général de la métabolomique, la lipidomique représente un champ d’investigation particulier en raison des spécificités fonctionnelles et métaboliques des lipides de même que de leurs propriétés physico-chimiques. L’analyse lipidomique représente un changement majeur d’échelle par rapport à l’analyse des lipides telle que pratiquée classiquement. L’objectif est ici d’atteindre l’échelle de l’espèce moléculaire lipidique en termes d’identification et de quantification afin de décrire l’ensemble des perturbations d’un réseau métabolique liées à un état physiologique ou pathologique. L’identification des classes et espèces repose sur principalement sur l’utilisation du couplage de la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse. La quantification peut faire appel à la spectrométrie de masse quand la spécificité et des faibles limites de détection sont requises ou à l’utilisation de détecteurs « universels » ou détecteurs par nébulisation que sont le détecteur évaporatif à diffusion de la lumière (DEDL) ou le détecteur d’aérosol chargé (Corona®-CAD) quand l’objectif est de quantifier l’ensemble de la classe lipidique The lipidome means the lipid subfraction of a metabolome, of a cell, a tissue or an organism. Lipidomics represents a particular field of investigation because of the functional and metabolic specificities of lipids as well as their physico-chemical properties. Lipidomics analysis represents a major change of scale with respect to lipid analysis as practiced conventionally. The aim of this work is to reach across the lipid molecular species in terms of identification and quantification in order to describe all the perturbations of a metabolic network related to a physiological or pathological state. The identification of the classes and the specie is based mainly on the use of liquid chromatography coupled to mass spectrometry. Quantification may use mass spectrometry when the specificity and low detection limits are required or the use of "universal" detectors that are nebulized detectors:evaporative detector light scattering (ELSD) or charged aerosol detector (CAD-Corona®) when the aim is to quantify the total lipid classes

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Leleu, Thomas. "Variabilité spatio-temporelle de la composition des fluides hydrothermaux (observatoire fond de mer EMSO-Açores, Lucky Strike) : traçage de la circulation hydrothermale et quantification des flux chimiques associés." Thesis, Toulouse 3, 2017. http://www.theses.fr/2017TOU30023/document.

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Cette thèse présente une étude détaillée de la composition des fluides de haute température du champ hydrothermal de Lucky Strike (37°N, dorsale médio atlantique) s'appuyant sur 3 campagnes d'échantillonnage réalisées dans le cadre de l'observatoire fond de mer EMSO-Açores. Ce champ hydrothermal s'est développé autour d'un lac de lave fossile bordé au Nord-Ouest, Nord Est et Sud Est par des cônes volcaniques plus anciens. En 2013, la découverte du site hydrothermal de Capelinhos à l'Est, et présentant des compositions de fluides inédites à Lucky Strike (concentration faible en Cl et forte en Fe et Mn), nous permet de proposer un nouveau modèle de circulation hydrothermale basé sur l'application de géothermobaromètres (Si ; Si-Cl ; Fe-Mn) chimiques sur 13 évents hydrothermaux. Nous avons défini 5 groupes de sites selon leur chlorinité et leur position par rapport au lac de lave. Les fluides de Capelinhos, dominés par la phase vapeur, sont rapidement extraits de la zone de séparation de phase (estimée à 2600 m sous le plancher océanique). Les fluides à proximité du lac de lave, avec des chlorinités variables, suggèrent un rééquilibrage à des pressions et températures plus faibles qu'à Capelinhos, cohérent avec des processus de refroidissement conductif et/ou d'entrainement de saumures prenant place lors de la remontée des fluides jusqu'à la base de la couche 2A. La fluctuation de la chlorinité témoigne de la variabilité du temps de résidence du fluide dans la zone de remontée, et ses relations avec les caractéristiques physiques de la croûte océanique. Nous avons évalué la variabilité temporelle de la composition des fluides collectés au cours des campagnes effectuées entre 2009 et 2015. Deux échelles de temps sont mises en évidence. (1) l'échelle de l'échantillonnage, i.e. de l'heure, répond à des phénomènes de subsurface, et révèle qu'un fluide hydrothermal refroidi conductivement (T<150°C) est stocké dans la roche poreuse entourant le site de décharge. (2) l'échelle de temps pluri-annuelle montre une fluctuation des conditions de P et T apparentes de la zone de séparation de phase et du degré d'altération du substratum dans la zone de réaction. Les variations intersites du rapport Ca/Na (indicateur du degré d'albitisation) sont dues à la séparation de phase, à l'exception des sites du Sud-Est du lac de lave qui indiquent un degré d'altération plus élevé. La concentration en Li et sa composition isotopique indiquent que le basalte du substratum est relativement frais avec des rapports W/R proches de 1 pour tous les groupes, avec des d7Li du fluide identiques au substratum. Pour le Sr nous calculons des rapports W/R plus élevés, autour de 7-8, qui sont dus au Sr de l'eau de mer initiale qui est partiellement stocké et à la formation de minéraux secondaires(l'albite et l'anhydrite) lors des interactions eau-roche dans le faciès schiste vert. La faible teneur en métaux des fluides situés autour du lac de lave est probablement due à un piégeage en subsurface, équivalent à ~65% du Fe mobilisé dans la zone de réaction (basé sur les teneurs des fluides de Capelinhos). La variabilité de chlorinité des fluides de Lucky Strike offre l'opportunité d'étudier le comportement des terres rares à l'échelle d'un site hydrothermal. Ainsi, nous montrons l'effet de la séparation de phase sur les terres rares légères et lourdes ainsi que le lien entre l'Eu et le cycle géochimique du Sr. Les terres rares dissoutes dans le panache hydrothermal montrent une perte au cours du mélange ainsi que des phénomènes de redissolution visible via la signature isotopique en Nd. Cette modification des compositions isotopiques en Nd de l'eau de mer profonde est similaire au " boundary exchange " observé aux interfaces océan-plateforme continentale. Au vue de la répartition des champs hydrothermaux sur les dorsales océaniques, ce phénomène pourrait avoir un impact sur le bilan océanique du Nd et donner lieu à un phénomène de " ridge exchange " This thesis present a detailed study of the composition of high temperature fluid from the Lucky Strike hydrothermal field (37°N, Mid Ocean Ridge) collected during three sampling campaigns within the framework of the deep sea observatory EMSO-Azores. The hydrothermal field has developped around a fossil lava lake framed by three ancient volcanic cones. In 2013, the discovery of a new active site to the East of the system, and presenting an unprecedented fluid composition at Lucky Strike (low Cl concentration and high Fe and Mn concentration), lead to a new model of hydrothermal circulation based on chemical geothermobarometer (Si; Si-Cl) and geothermometer (Fe-Mn) applied to 13 venting sites. We defined 5 groups of sites based on their chlorinity and location around the lava lake. It appears that vapor-dominated Capelinhos fluids were extracted relatively fast from the phase separation zone (estimated at ~2600mbsf). Nevertheless, fluids in the vicinity of the lava lake, both vapor and brine dominated, display P and T conditions of equilibration lower than for Capelinhos fluids. This highlights on-going equilibration process through conductive cooling and/or brine entrainment in the upflow zone up to the layer 2A of the oceanic crust. Chlorinity variations highlight the varying residence time in the upflow of the fluids between vents which depends on physical characteristics of the crust. We studied the temporal variability of fluid composition collected between 2009 and 2015. Two time scales have been evidenced. The first is the sampling scale, i.e. ~1h, and corresponds to subsurface processes indicating that a hydrothermal fluid, conductively cooled (T<150°C), was stored in the porous substratum close to the discharge. The second is at the scale of the year. It shows fluctuations of P and T conditions in the phase separation and different degree of alteration of the substratum in the reaction zone. Intersites variations of Ca/Na ratios (proxies for albitisation) are related to phase separation expected the South Eastern sites that display a more altered substratum. To avoid this issue, we use Li and Sr isotopes which are not affected phase separation. Li concentration and isotopic composition indicates that basalt substratum is relatively fresh with W/R ratio close to 1 calculated for all groups with d7Li of fluid equivalent to substratum. Sr concentration and isotopic composition suggest higher W/R ratio (~7-8) because of seawater Sr partially removed in the recharge. Moreover, other parameters are at play such as secondary mineral formation (albite, anhydrite) during water rock interaction in the greenschist facies. Because the basalt is relatively fresh, the low metal content in the fluid around the lava lake is due to storage, in the subsurface, of approximately ~60-70% of Fe that is mobilized in the reaction zone compared to Fe-Mn rich Capelinhos fluids. Furthermore, the Cl variability from the fluids at Lucky Strike brings a unique opportunity to study the REE distribution from the reaction zone to the discharge into the deep ocean. We show that the LREE are preferentially concentrated into the brine phase. Furthermore, the Eu is linked to the Sr geochemical cycle. Dissolved REE from buoyant plume fluids highlight a scavenging effect. The Nd isotopic compositions indicate redissolution process. This Nd isotopes modification of the deep seawater is similar to the process of "boundary exchange" that occurs at the ocean/continents interface. Considering the global distribution of submarine hydrothermalism, the Nd modification at the ridge could have an impact on the global Nd cycle in the oceans and act as a "ridge exchange"

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Rougemont, Blandine. "Quantification de protéines dans des matrices complexes par spectrométrie de masse : nouveaux outils et apllications." Thesis, Lyon, 2016. http://www.theses.fr/2016LYSE1084/document.

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La spectrométrie de masse en tandem est désormais une technique de choix pour l'analyse du protéome humain ou de micro-organismes. Typiquement, les protéines sont tout d'abord digérées en peptides protéotypiques, ceux-ci étant ensuite séparés par chromatographie liquide avant d'être analysés par MS/MS. L'identification et la quantification de ces peptides rapporteurs de protéines permet la mise en évidence d'un phénotype ou d'un mécanisme cellulaire particulier, dans un organisme complexe. Des approches par spectrométrie de masse ciblée et non ciblée coexistent et sont complémentaires dans l'analyse protéomique. Les travaux présentés ici se sont focalisés sur le développement de méthodes ciblées, et plus particulièrement en mode SRM, à travers deux applications chez des micro-organismes modèles. Ainsi, une première étude s'est portée sur la quantification absolue des protéines du virus chimère dengue – fièvre jaune candidat vaccin. Par l'utilisation d'une stratégie de quantification de type AQUA, nous avons pu développer, valider et transférer le dosage des quatre sérotypes du virus chimère candidat vaccin. Les problématiques soulevées à travers ce projet nous ont amené à proposer des étapes à contrôler lors du développement d'un dosage par la stratégie AQUA.Dans une seconde partie, nous nous sommes attachés à développer une analyse quantitative sans marquage de 445 protéines afin d'étudier l'infection d'un phytopathogène, Dickeya dadantii, sur une plante modèle. Afin d'assurer un transfert simple et rapide de cette analyse multiplexée, nous proposons un nouvel outil d'acquisition indépendant des temps de rétention. Cet outil développé en partenariat avec la R&D Sciex à Toronto est appelé « Scout-MRM » Tandem mass spectrometry is now a technique of choice for human or micro-organisms proteome analysis. Typically, proteins are first digested into surrogates’ peptides, separated by liquid chromatography before being analyzed by MS/MS. The ultimate goal is the identification and the quantification of these peptides, belonging to proteins and highlighting a phenotype or a cellular mechanism in a complex organism. Both targeted and untargeted approaches are used and are complementary in proteomic analysis. The work presented here is focused on the development of targeted methods, and more particularly in the SRM mode, through two applications involving micro-organisms. So, the first study concerned to absolute quantification of viral proteins of the chimeric yellow-dengue fever, vaccine candidate against dengue. By using the AQUA quantification strategy, we were able to develop, to validate and to transfer the method for the four chimeric virus serotypes. Then, problems met during development process, lead us to suggest check points to verify when using AQUA strategy. In a second part, we attempted to develop a quantitative label free analysis of 445 proteins to study the infection of the phytopathogen Dickeya dadantii, on a model plant. To ensure a simple and fast transfer of this multiplex, we purpose a new acquisition tool, independent from retention time. This tool was developed in a partnership with the R&D Sciex, Toronto and is called “Scout-SRM”

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Fedi, Baptiste. "Etude multi-échelle des mécanismes d'élaboration de revêtements d'alliage zinc-nickel à base d'électrolytes alcalins : germination, complexation et structures cristallines." Thesis, Besançon, 2016. http://www.theses.fr/2016BESA2078.

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Les travaux présentés dans ce mémoire ont pour but d’approfondir la compréhension des mécanismes d’élaboration de revêtements électrolytiques de zinc-nickel obtenus à partir d’électrolytes alcalins. Les dépôts de zinc-nickel contenant entre 12% et 16%de nickel, connus pour leur performances anti-corrosion, nécessitent l’utilisation d’agents complexants afin de d’obtenir des formes solubles et réductibles du nickel dans un électrolyte à base de zincates à haut pH. Une étude des mécanismes de complexation a permis d’améliorer la compréhension du rôle respectif des agents complexants et de leurs interactions sur la stabilité des mélanges, ainsi que sur la morphologie de la structure cristalline des revêtements obtenus. Les phases cristallines d’alliages de zinc-nickel électro déposés,contenant entre 1% et 20% de nickel ont été quantifiés par déconvolution de courbes d’oxydation potentio dynamique et par DRX. Cette approche donne accès à une cartographie précise des phases d’alliages obtenus en fonction de la teneur en nickel du dépôt. La stabilité thermique des différentes phases à également pu être évaluée et quantifiée par cette méthode. La formulation des électrolytes ainsi que les paramètres des procédés peuvent modifier les cinétiques de germination des revêtements. Une étude fondamentale des mécanismes de germination par chrono ampérométrie couplée à des méthodes d’identification paramétrique a permis de quantifier l’évolution de certains paramètres de germination d’éléments simples en fonction du potentiel d’électrodéposition. L’étude de la germination d’alliage a mis en évidence que des réactions de décomplexation d’espèces modifient les cinétiques de nucléation, sans permettre d’aboutir à un modèle descriptif complet The present work aims to deepen the understanding of the mechanisms of zinc-nickelelectrodeposition in alkaline baths. Zinc-nickel deposits containing between 12% and 16%nickel known for their anti-corrosion performance. Complexing agents are required toobtain soluble and reactive nickel forms, and to stabilize the electrolytes. A study ofthe complexing mechanisms has improved the understanding of their respective role andbehavior, and their influence on the stability and the morphology and crystalline structureof the coatings obtained. The crystalline phases of electroplated zinc-nickel alloys in therange from 1% to 20% nickel content were quantified by deconvolution of potentiodynamicoxidation curves and XRD. This approach has led to a precise mapping of the alloyphases obtained as a function of the nickel content. The thermal stability of the differentphases has also been evaluated and quantified by this method. The formulation of theelectrolytes and the process parameters may modify the kinetics of coating germination. Afundamental study of the mechanisms of germination by chronoamperometry coupled witha parametric identification allows the quantification of parameter evolution in relation tonucleation phenomenon of simple elements. The study of alloy germination has shownthat decomplexing reactions are able to modify nucleation kinetics, without achieving acomplete comprehensive modeling

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Qoku, Elsa [Verfasser], Thomas [Gutachter] Bier, Thomas [Akademischer Betreuer] Bier, and Herbert [Gutachter] Pöllmann. "Characterization and quantification of crystalline and amorphous phase assemblage in ternary binders during hydration / Elsa Qoku ; Gutachter: Thomas Bier, Herbert Pöllmann ; Betreuer: Thomas Bier." Freiberg : Technische Universität Bergakademie Freiberg, 2019. http://d-nb.info/1220636495/34.

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Jeudy, Jérémy. "Quantification de biomarqueurs protéiques dans des matrices biologiques complexes par spectrométrie de masse : développements et applications." Thesis, Lyon 1, 2014. http://www.theses.fr/2014LYO10242/document.

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Le travail présenté ici s'est penché sur les problèmes rencontrés sur ce type d'études protéomiques, et sur les solutions qui peuvent être explorées pour améliorer le débit d'évaluation des candidats biomarqueurs. Les peptides à méthionine sont généralement évités en raison de leur sensibilité à l'oxydation. Cependant, il semblait intéressant d'étudier leur modification endogène pouvant affecter les processus biologiques. Une première évaluation de l'impact de l'oxydation des apolipoproteins dans le cas de la maladie d'Alzheimer, a permis de mettre de côté ce biomarqueur potentiel, et de faire apparaître un certain nombre de problèmes liés au prélèvement et au stockage des échantillons biologiques. L'évaluation de dispositifs DBS (Dried Blood Spot) et Vivid à partir d'un panel de 32 protéines sanguines a permis de fournir une première solution envisageable pour maîtriser ces problèmes. Par la suite, un nouveau mode de quantification des peptides appelé MRM3 a été utilisé pour dépasser la complexité de la matrice biologique, et fournir une évaluation fiable des niveaux de concentration de 2 protéines plasmatiques, la C-Reactive protein et la TIMP-1, ainsi que 2 protéines urinaires, l'aquaporin-2 et la podocin. Pour améliorer la sensibilité d'analyse et réduire les coûts de solvants nécessaires aux analyses, l'évaluation d'une plate-forme de micro-chromatographie a été réalisée par comparaison à une plate-forme narrow-bore. Cette étude a permis de mettre en évidence l'impact important de l'effet matrice sur le processus analytique, nécessitant de développer de nouvelles stratégies de travail. Enfin, afin de réduire la complexité de l'échantillon, l'évaluation de cartouches d'extraction en phase solide à base de large taille de pores a été réalisé, et un protocole développé a permis d'analyser avec succès des enzymes contenus dans un échantillon de lessive commerciale. De plus, la durée nécessaire à la préparation d'échantillons biologiques a pu être fortement réduite en combinant une digestion rapide assistée par température combinée au dessalage en ligne, afin de permettre l'analyse quantitative des protéines qu'il contient seulement quelques heures après son arrivée au laboratoire Over the past decade, interest in the use of biomarkers in clinical studies has greatly increased. Quantification of a candidate protein biomarker in complex samples (eg. plasma) requires targeted and multiplexed assays. Immunoassays are the gold standard for their quantification. However, with the need for targeted and multiplexed methods, recent developments in mass spectrometry (MS) make a viable alternative to ELISA. The present work has addressed the problems encountered in this type of proteomic studies, and solutions that can be explored to improve the workflow of candidate biomarker’s evaluation. Methionine peptides are generally avoided due to their susceptibility to oxidation. However, it seemed interesting to study how their endogenous modifications could affect biological processes. In a first time, apolipoproteins were dismissed as a potential biomarker of Alzheimer’s disease due to oxidation impact. In the same time, problems associated with biological sample collection and storage were highlighted. DBS (Dried Blood Spot) and Vivid device evaluation from a panel of 32 blood proteins has provided a first possible solution to overcome these troubles. Thereafter, a new peptide quantification method called MRM3 was used to overcome biological matrix complexity. Reliable level determinations of 2 plasma proteins (C-Reactive protein and TIMP-1) and 2 urinary proteins (aquaporin-2 and podocin) were obtained. To improve sensitivity and reduce analysis solvent costs, performances of a micro chromatography platform were compared to a narrow-bore platform. This study highlighted the significant impact of the matrix effect on the analytical process, requiring new strategie development. Finally, to reduce sample complexity, evaluation of wide pore solid-phase extraction cartridges has been achieved. A protocol was successfully developed to analyze enzymes contained in commercial laundry samples. Finally to optimize biological sample preparation time, heated-assisted digestion and online desalting step were successfully associated. Only few hours were then required for quantitative analysis

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Simonnet, Titouan. "Apprentissage et réseaux de neurones en tomographie par diffraction de rayons X. Application à l'identification minéralogique." Electronic Thesis or Diss., Orléans, 2024. http://www.theses.fr/2024ORLE1033.

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La compréhension du comportement chimique et mécanique des matériaux compactés (par exemple sol, sous-sol, matériaux ouvragés) nécessite de se baser sur une description quantitative de structuration du matériau, et en particulier de la nature des différentes phases minéralogiques et de leur relation spatiale. Or, les matériaux naturels sont composés de nombreux minéraux de petite taille, fréquemment mixés à petite échelle. Les avancées récentes en tomographie de diffraction des rayons X sur source synchrotron (à différencier de la tomographie en contraste de phase) permettent maintenant d'obtenir des volumes tomographiques avec des voxels de taille nanométrique, avec un diffractogramme pour chacun de ces voxels (là où le contraste de phase ne donne qu'un niveau de gris). En contrepartie, le volume de données (typiquement de l'ordre de 100~000 diffractogrammes par tranche d'échantillon), associé au grand nombre de phases présentes, rend le traitement quantitatif virtuellement impossible sans codes numériques appropriés. Cette thèse vise à combler ce manque, en utilisant des approches de type réseaux de neurones pour identifier et quantifier des minéraux dans un matériau. L'entrainement de tels modèles nécessite la construction de bases d'apprentissage de grande taille, qui ne peuvent pas être constituées uniquement de données expérimentales. Des algorithmes capables de synthétiser des diffractogrammes pour générer ces bases ont donc été développés. L'originalité de ce travail a également porté sur l'inférence de proportions avec des réseaux de neurones.Pour répondre à cette tâche, nouvelle et complexe, des fonctions de perte adaptées ont été conçues. Le potentiel des réseaux de neurones a été testé sur des données de complexités croissantes : (i) à partir de diffractogrammes calculés à partir des informations cristallographiques, (ii) en utilisant des diffractogrammes expérimentaux de poudre mesurés au laboratoire, (iii) sur les données obtenues par tomographie de rayons X. Différentes architectures de réseaux de neurones ont aussi été testées. Si un réseau de neurones convolutifs semble apporter des résultats intéressants, la structure particulière du signal de diffraction (qui n'est pas invariant par translation) a conduit à l'utilisation de modèles comme les Transformers. L'approche adoptée dans cette thèse a démontré sa capacité à quantifier les phases minérales dans un solide. Pour les données les plus complexes, tomographie notamment, des pistes d'amélioration ont été proposées Understanding the chemical and mechanical behavior of compacted materials (e.g. soil, subsoil, engineered materials) requires a quantitative description of the material's structure, and in particular the nature of the various mineralogical phases and their spatial relationships. Natural materials, however, are composed of numerous small-sized minerals, frequently mixed on a small scale. Recent advances in synchrotron-based X-ray diffraction tomography (to be distinguished from phase contrast tomography) now make it possible to obtain tomographic volumes with nanometer-sized voxels, with a XRD pattern for each of these voxels (where phase contrast only gives a gray level). On the other hand, the sheer volume of data (typically on the order of 100~000 XRD patterns per sample slice), combined with the large number of phases present, makes quantitative processing virtually impossible without appropriate numerical codes. This thesis aims to fill this gap, using neural network approaches to identify and quantify minerals in a material. Training such models requires the construction of large-scale learning bases, which cannot be made up of experimental data alone.Algorithms capable of synthesizing XRD patterns to generate these bases have therefore been developed.The originality of this work also concerned the inference of proportions using neural networks. To meet this new and complex task, adapted loss functions were designed.The potential of neural networks was tested on data of increasing complexity: (i) from XRD patterns calculated from crystallographic information, (ii) using experimental powder XRD patterns measured in the laboratory, (iii) on data obtained by X-ray tomography. Different neural network architectures were also tested. While a convolutional neural network seemed to provide interesting results, the particular structure of the diffraction signal (which is not translation invariant) led to the use of models such as Transformers. The approach adopted in this thesis has demonstrated its ability to quantify mineral phases in a solid. For more complex data, such as tomography, improvements have been proposed

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Poupon, Julien. "Quantification des voies métaboliques de l'éthanol par le cytochrome P450 2E1 : rôles respectifs de l'acétaldéhyde et des radicaux libres hydroxyéthyles dans l'hépatotoxicité de l'éthanol." Brest, 2003. http://www.theses.fr/2003BRES3108.

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L'hépatotoxicité alcoolique met en jeu les produits du métabolisme de l'éthanol par le cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) tels que l'acétaldéhyde (oxydation bi-électronique) et les radicaux hydroxyéthyles (HER) (oxydation mono-électronique). Le CYP2E1 est le principal site d'oxydation micromal de l'éthanol (84% chez le rat, 30% chez l'Homme). L'oxydation produit de l'acétaldéhyde et des HER dans le rapport 9/1. La voie mono-électronique représente 5 à 7 %. L'incubation de guanine avec des HER produits in situ entraîne la formation d'adduits HER-guanine (HEG) (12% de la guanine). Les adduits HEG n'ont pas pu être détectés au niveau de l'Adn de patients alcooliques, d'hépatocytes en culture traotés à l'alcool, ni d'ADN incubé avec des microsomes et de l'alcool. L'étude de l'alkylation des protéines microsomales montre que les adduits HER se forment principalement avec le CYP2E1. Néanmoins, la formation d'HER-CYP2E1 n'affecte pas son activité catalytique sous des conditions normales Hepatotoxicity of alcoholic intoxication brings into play the products resulting from the metabolism of ethanol by the cytochrome P4502E1 (CYP2E1): acetaldehyde (two-electron oxidation), and hydroxyethyl radicals (HER) (one electron-oxidation). This products can form adducts with surrounding molecules. CYP2E1 is the principal site of oxidation microsomal of ethanol (84% in the rat, only 30% in the Man ). Ethanol oxidation leads to the formation of acetaldehyde and HER in the 9/1 ratio. The contribution of the mono-electronics pathway, revealed by spin-trapping method of HER, accounts for 5 to 7 %. Incubation of guanine with HER formed in situ results in HER-guanine adducts (HEG) (12% of incubated guanine). However, HEG adducts could not be detected either in DNA from several biological materiels. Alkylation of the microsomals proteins shows that adduits HER are formed mainly with the CYP2E1. The formation of HER-CYP2E1 does not affect the catalytic activity under normal conditions

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Kouzayha, Abir. "Développement des méthodes analytiques pour la détection et la quantification de traces des HAP et de pesticides dans l'eau : application à l'étude de la qualité des eaux libanaises." Thesis, Bordeaux 1, 2011. http://www.theses.fr/2011BOR14414/document.

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La pollution des eaux est particulièrement problématique pour les pays industrialisés et les pays en développement. Des suivis environnementaux se sont alors avérés nécessaires afin de progresser dans la compréhension des origines et des conséquences de la présence de ces polluants. Parmi les polluants organiques les plus dangereux, les Hydrocarbures Aromatiques Polycycliques (HAP) et les pesticides qui peuvent se retrouver à l’état de traces dans les milieux aquatiques. Leur analyse nécessite des méthodes analytiques à la fois spécifiques et sensibles. L’Extraction sur Phase Solide (SPE) suivi d’une analyse par la Chromatographie Gazeuse couplée à la Spectrométrie de Masse (GC-MS) est la méthode la plus couramment employée. Les travaux de thèse s’inscrivent ainsi dans l’optique généralevisant à développer des nouvelles méthodes analytiques pour l’extraction et l’analyse de cesdeux familles de polluants organiques présents dans l’eau. Afin de pallier les contraintes classiques de la SPE, une nouvelle approche a été développée qui consiste à introduire latechnique de centrifugation dans certaines étapes de la procédure SPE. La nouvelle méthodeélaborée a permis de réduire considérablement le temps de préparation et d’économiserl’utilisation et le rejet des solvants organiques, en réduisant presque 10 fois les volumes nécessaires à l’obtention des rendements de récupération satisfaisants. Une méthoded’analyse par injection à température programmable (PTV) a été optimisée afin d’améliorerles seuils de détection des HAP. Cette étude a permis également d’avoir les informations surla qualité des eaux de pluie, eaux souterraines et eaux de surface au Liban quant au niveau deleur contamination pour les HAP et les pesticides Water pollution presents a very critical problem facing industrial and developping countries. The environmental monitoring of the contaminants seems necessary to understand their sources and impacts. Among a wide variety of organic pollutants present in water,polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) and pesticides are of particular importance as widespread, persistent, and toxic contaminants. They are usually present at trace levels in theacquatic surfaces; therefore their detection and control require selective and sensitiveanalytical procedures. The Solid-Phase Extraction (SPE) followed by the Gas-Chromatography coupled to Mass Spectrometry (GC-MS) are the most commonly usedtechniques for their analysis in water. Thesis objectives are focused on the development of new analytical methods for the extraction and analysis of these two families of pollutants present in water. To overcone the contraints of the traditional SPE, a new approach was developed consisting on the introduction of the centrifugation in several steps of the procedure. The new method showed practical environmental and economical advantages interms of sample preparation time, simplicity, reduction in solvent use, and cost and isparticularly suitable for routine applications requiring a high sample throughput. Aprogrammed temeperature vaporizing (PTV) injection method was also optimized and validated in order to improve the detection limits for the GC-MS analysis of PAHs. The evaluation of the quality of different water systems in Lebanon including rainwater,groundwater, drinking water and surface water was accomplished in this study

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Le, Ven Jessica. "Contribution à l'étude du lien entre Annonaceae et parkinsonisme : identification et quantification d'acétogénines par déréplication; métabolisation de phase I et approche de la distribution de l'annonacine." Phd thesis, Université Paris Sud - Paris XI, 2012. http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00784165.

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Dans les Antilles françaises, une proportion anormalement élevée de parkinsonismes atypiques sporadiques - des tauopathies - est observée. Un lien avec la consommation de plantes de la famille des Annonaceae, en particulier Annona muricata L. (corossol) a été démontré. Les acétogénines d'Annonaceae, des inhibiteurs puissants du complexe I de la chaine respiratoire mitochondriale, sont considérées comme des toxines candidates. L'annonacine, une acétogénine représentative, majoritaire dans A. muricata, est neurotoxique in vitro et in vivo. L'Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments a exprimé ses doutes quant à ce problème de santé publique. Elle insiste sur l'importance d'évaluer l'exposition des consommateurs d'Annonaceae aux acétogénines, et de déterminer les paramètres pharmacocinétiques de ces molécules. Au cours de cette thèse, nous avons cherché à répondre à ces interrogations, avec l'annonacine pour modèle. Après l'analyse structurale d'acétogénines étalons, une méthode de déréplication puissante et innovante a été mise au point par CLHP-ESI-LTQ-Orbitrap® avec infusion post-colonne de lithium. Les profils complets des acétogénines d'extraits bruts issus d'un nectar d'A. muricata et d'un alcool d'Annona cherimolia Mill. (annone, chérimole) ont été élucidés, mettant en évidence une composition plus complexe et plus variée que celle envisagée dans la littérature. A. cherimolia n'avait pas été identifiée comme une source d'exposition jusqu'à maintenant. Des données quantitatives ont été obtenues par CLHP-DAD-MS, à partir d'une quinzaine d'échantillons de produits commerciaux, confirmant une exposition humaine importante à ces molécules par voie alimentaire, via des produits d'origines géographiques, de statuts et de modes d'obtention variés. Des travaux préliminaires d'étude du passage de l'annonacine à travers des membranes biologiques ont été amorcés (modèles de barrières intestinale - Caco-2 - et hémato-encéphalique - hCMEC/D3). Une étude de métabolisation de phase I de l'annonacine sur microsomes de foie de Rat a permis d'identifier 25 métabolites mono-hydroxylés par CLHP-ESI-LTQ-Orbitrap®. Seuls trois d'entre eux sont observés avec des microsomes humains. Ces métabolites ont été obtenus par hémisynthèse (bioconversion, catalyse par porphyrines) et leur structure a été déterminée. Les résultats montrent que cette étape de métabolisation n'est pas cruciale dans le devenir de l'annonacine, et ne peut expliquer de susceptibilité différentielle aux acétogénines. Après la présentation de rappels concernant les Annonaceae, les parkinsonismes et leurs formes atypiques guadeloupéennes et tropicales, puis d'aspects méthodologiques en spectrométrie de masse, nos travaux de phytochimie analytique, d'analyse métabolique, d'hémisynthèse et de détermination structurale sont présentés, et discutés en regard d'un problème de santé publique potentiellement large et préoccupant.

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Zhang, Gongwang. "THE FORMATION MECHANISM OF α-PHASE DISPERSOIDS AND QUANTIFICATION OF FATIGUE CRACK INITIATION BY EXPERIMENTS AND THEORETICAL MODELING IN MODIFIED AA6061 (AL-MG-SI-CU) ALLOYS". UKnowledge, 2018. https://uknowledge.uky.edu/cme_etds/90.

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AA6061 Al alloys modified with addition of Mn, Cr and Cu were homogenized at temperatures between 350 ºC and 550 ºC after casting. STEM experiments revealed that the formation of α-Al(MnFeCr)Si dispersoids during homogenization were strongly affected by various factors such as heating rate, concentration of Mn, low temperature pre-nucleation treatment and homogenization temperature. Through analysis of the STEM results using an image software Image-Pro, the size distributions and number densities of the dispersoids formed during different annealing treatments were quantitatively measured. It was revealed that increasing the heating rate or homogenization temperature led to a reduction of the number density and an increase in size of the dispersoids. The number density of dispersoids could be markedly increased through a low temperature pre-nucleation treatment. A higher Mn level resulted in the larger number density, equivalent size and length/width ratio of the dispersoids in the alloy. Upsetting tests on two of these Mn and Cr-containing AA6061 (Al-Mg-Si-Cu) Al alloys with distinctive Mn contents were carried out at a speed of 15 mm s-1 under upsetting temperature of 450 ºC after casting and subsequent homogenization heat treatment using a 300-Tone hydraulic press. STEM experiments revealed that the finely distributed α-Al(MnFeCr)Si dispersoids formed during homogenization showed a strong pinning effect on dislocations and grain boundaries, which could effectively inhibit recovery and recrystallization during hot deformation in the two alloys. The fractions of recrystallization after hot deformation and following solution heat treatment were measured in the two alloys with EBSD. It was found that the recrystallization fractions of the two alloys were less than 30%. This implied that the finely distributed α-dispersoids were rather stable against coarsening and they stabilized the microstructure by inhibiting recovery and recrystallization by pinning dislocations during deformation and annealing at elevated temperatures. By increasing the content of Mn, the effect of retardation on recrystallization were further enhanced due to the formation of higher number density of the dispersoids. STEM and 3-D atom probe tomography experiments revealed that α-Al(MnFeCr)Si dispersoids were formed upon dissolution of lathe-shaped Q-AlMgSiCu phase during homogenization of the modified AA6061 Al alloy. It was, for the first time, observed that Mn segregated at the Q-phase/matrix interfaces in Mn-rich regions in the early stage of homogenization, triggering the transformation of Q-phase into strings of Mn-rich dispersoids afterwards. Meanwhile, in Mn-depleted regions the Q-phase remained unchanged without segregation of Mn at the Q-phase/matrix interfaces. Upon completion of α-phase transformation, the atomic ratio of Mn and Si was found to be 1:1 in the α-phase. The strengthening mechanisms in the alloy were also quantitatively interpreted, based on the measurements of chemical compositions, dispersoids density and size, alloy hardness and resistivity as a function of the annealing temperature. This study clarified the previous confusion about the formation mechanism of α-dispersoids in 6xxx series Al alloys. Four-point bend fatigue tests on two modified AA6061 Al alloys with different Si contents (0.80 and 1.24 wt%, respectively) were carried out at room temperature, f = 20 Hz, R = 0.1, and in ambient air. The stress-number of cycles to failure (S-N) curves of the two alloys were characterized. The alloys were solution heat treated, quenched in water, and peak aged. Optical microscopy and scanning electron microscopy were employed to capture a detailed view of the fatigue crack initiation behaviors of the alloys. Fatigue limits of the two alloys with the Si contents of 0.80 and 1.24 wt% were measured to be approximately 224 and 283.5 MPa, respectively. The number of cracks found on surface was very small (1~3) and barely increased with the applied stress, when the applied stress was below the yield strength. However, it was increased sharply with increase of the applied stress to approximately the ultimate tensile strength. Fatigue crack initiation was predominantly associated with the micro-pores in the alloys. SEM examination of the fracture surfaces of the fatigued samples showed that the crack initiation pores were always aspheric in shape with the larger dimension in depth from the sample surface. These tunnel-shaped pores might be formed along grain boundaries during solidification or due to overheating of the Si-containing particles during homogenization. A quantitative model, which took into account the 3-D effects of pores on the local stress/strain fields in surface, was applied to quantification of the fatigue crack population in a modified AA6061 Al alloy under cyclic loading. The pores used in the model were spherical in shape, for simplicity, with the same size of 7 μm in diameter. The total volume fraction of the pores in the model were same as the area fraction of the pores measured experimentally in the alloy. The stress and strain fields around each pore near the randomly selected surface in a reconstructed digital pore structure of the alloy were quantified as a function of pore position in depth from the surface using a 3-D finite element model under different stress levels. A micro-scale Manson-Coffin equation was used to estimate the fatigue crack incubation life at each of the pores in the surface and subsurface. The population of fatigue cracks initiated at an applied cyclic loading could be subsequently quantified. The simulated results were consistent with those experimentally measured, when the applied maximum cyclic stress was below the yield strength, but the model could not capture the sudden increase in crack population at UTS, as observed in the alloy. This discrepancy in crack population was likely to be due to the use of the spherical pores in the model, as these simplified pores could not show the effects of pore shape and their orientations on crack initiation at the pores near surface. Although it is presently very time-consuming to calculate the crack population as a function of pore size and shape in the alloy with the current model, it would still be desirable to incorporate the effects of shape and orientation of the tunnel-shaped pores into the model, in the future, in order to simulate the fatigue crack initiation more accurately in the alloy.

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Comte, Julien. "Mise au point d’une méthodologie d’échantillonnage utilisant la micro-extraction sur phase solide pour la quantification de goudrons sur des procédés de thermolyse de la biomasse." Grenoble 1, 2008. http://www.theses.fr/2008GRE10152.

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La gazéification de la biomasse par voie thermochimique apparaît aujourd'hui comme une voie prometteuse pour la production de H2 et CO utilisés dans la synthèse de biocarburants. Le traitement thermique subi par la biomasse entraîne toutefois la production de composés indésirables appelés goudrons (hydrocarbures lourds) dont la teneur dans les gaz de synthèse doit être inférieure à 0,1 mg. Nm-3. Le suivi de la quantité de goudrons produits est, par conséquent, indispensable. Dans ce contexte, une méthodologie d'échantillonnage utilisant la SPME (micro-extraction sur phase solide) a été mise au point pour la quantification de "composés types" représentatifs de la quantité globale de goudrons émis principalement par deux pilotes de gazéification et de pyrolyse. L'introduction de la notion de composés types est destinée d'une part, à simplifier la méthodologie d'échantillonnage et d'autre part, à s'affianchir des éventuelles limitations liées au système de prélèvement des effluents gazeux développé dans le cadre de ce travail pour autoriser l'extraction par SPME. Pour les deux pilotes, 15 composés types ont été retenus. Leur quantification a d'abord nécessité l'étalonnage préalable des fibres SPME (revêtue de polydimethylsiloxane) qui a permis, à plusieurs températures, d'établir les profils d'absorption et de déterminer les coefficients de partage. L'influence des conditions d'extraction sur l'absorption ainsi que les performances du couplage SPME-chromatographie gazeuse ont également été évaluées. De manière à éviter les étalonnages répétitifs, un modèle basé sur la théorie des équilibres thermodynamiques a été développé pour déterminer la valeur des coefficients de partage The gasification of biomass by thermochemical processes is presently a promising method of producting H2 and CO which are used for synthesis of biogasoil. However, the thermal treatment of biomass leads to the production of unwanted compounds referred to as "tar" (heavy hydrocarbons) of which the content in syngas must to be inferior to 0. 1 mg. Nm-3. Knowledge oftar content is consequently needed. To this end, a sampling methodology using SPME (Solid Phase MicroExtraction) was developed for the quantification of "model compounds" which represents the total tar content mainly emitted by two gasification or pyrolysis processes. Introduction of the notion of model compounds is intended to simplify the sampling methodology on one hand to overcome the possible limitations related to the sampling system developed in this work to allow SPME extraction on the other. For the two thermochemical processes,15 model compounds were selected. The quantification of these compounds required calibration of SPME fibres (polydimethylsiloxane coating) which allow us, over a range oftemperatures, to establish the absorption profiles and to determine distribution coefficients. Influence of the sampling conditions on the absorption and performance of the coupled SPME-gas Chromatography were also evaluated. Ln order to avoid repetitive calibrations, a model based on thermodynamic considerations was developed to speed-up determination of the distribution coefficient

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Oursel, Delphine. "Influence de l’expression de l’ATP synthétase sur la composition lipidique des membranes bactériennes chez Escherichia coli : Identification et quantification relative des phospholipides et acides gras constitutifs par spectrométrie de masse." Rouen, 2008. http://www.theses.fr/2008ROUES062.

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Depuis quelques années, la recherche de préférences lipidiques de protéines et/ou d’enzymes membranaires suscite un intérêt grandissant, ces phénomènes d’affinité étant susceptibles d’induire la formation de domaines lipidiques dans les membranes biologiques. C’est pourquoi, nous avons cherché à savoir si l’ATP-synthétase, protéine membranaire, était capable d’induire des domaines lipidiques dans un modèle cellulaire, la bactérie d’E. Coli. Ainsi, l’influence de l’expression de cette protéine a été évaluée au moyen de 4 souches bactériennes; la souche sauvage ainsi que 3 souches génétiquement modifiées présentant des taux variables d’enzyme. La méthodologie analytique développée fait appel à diverses techniques de MS. Les couplages LC-MS et GC-MS sont mis à profit pour l’analyse des phospholipides et des acides gras constitutifs. Cette approche a permis d’identifier l’ensemble des phospholipides, de déterminer la structure fine des acides gras les constituants ainsi que de localiser chaque acide For years, investigations of growing interest deal with the potential lipids preference of membrane proteins and/or enzymes, these affinity phenomenons are supposed to induce the formation of lipids domains also called lipids rafts inside biological membranes. This thesis focused on the ability of ATP-synthetase, a membrane protein, to induce lipids domains in a cellular model, the E. Coli bacteria. Hence, 4 bacterial strains were studied to evaluate the influence of protein expression, a wild type and three genetically modified strains with variable enzyme rates. Analytical methodologies were developed for this purpose and involved various MS techniques. Then, LC-MS and GC-MS techniques were used for the analysis of phospholipids and constitutive fatty acids, respectively. This approach provided the identification of all the phospholipids. Moreover, the structure of the constitutive fatty acids and their location on the glycerol backbone were determined

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Huynh, Huu Hien. "Développement d’une méthode de référence candidate pour la quantification de la procalcitonine dans le sérum humain." Thesis, Université Paris sciences et lettres, 2021. http://www.theses.fr/2021UPSLS037.

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Le dosage de la procalcitonine (PCT) est un outil de choix pour le diagnostic précoce du sepsis et la gestion du traitement antibiotique. Comme les prises de décision médicales et la stratégie de prise en charge thérapeutique des patients reposent en général sur des valeurs seuil de concentration de PCT, il apparaît primordial de disposer de résultats de mesure fiables et comparables, quelle que soit la méthode de dosage employée, dans le temps, et dans l’espace. Or, de nombreuses méthodes de dosage de la PCT de type immunoessai sont actuellement disponibles et les résultats fournis par celles-ci ne sont pas toujours comparables. Cette situation peut s’expliquer en partie par l’absence de méthode de référence et de matériaux de référence certifiés d’ordre supérieur.Ces travaux ont consisté dans un premier temps à documenter l’état actuel de la comparabilité des mesures de la PCT entres les méthodes de routine afin d’évaluer la nécessité d’établir la traçabilité métrologie des résultats aux unités SI. L’analyse de l’ensemble des études de corrélation publiées et des résultats de contrôles externes de qualité a montré qu’il est difficile d’évaluer correctement la comparabilité des résultats et de comprendre l’origine de leur variabilité à partir de matériaux dont la commutabilité n’a pas été démontrée. Aussi, parait-il indispensable de mener des campagnes d’évaluation externe de qualité utilisant des matériaux de contrôle commutables. Par ailleurs, afin de répondre aux exigences réglementaires relatives au raccordement métrologique des résultats de mesure et afin de pouvoir évaluer la justesse des méthodes de routine, une méthode de référence candidate pour la quantification absolue de la PCT dans le sérum humain par dilution isotopique associée à la chromatographie en phase liquide couplée à la spectrométrie de masse a été développée et validée avec une limite de quantification de 0,25 ng/mL. Le raccordement des résultats aux unités SI a été établi par l’utilisation d’étalons primaires dont la pureté a été préalablement caractérisée par analyse des acides aminés avec correction de la contribution des impuretés identifiées par spectrométrie de masse haute résolution Procalcitonin measurement is a usefully tool to aid the early diagnosis and antibiotic stewardship for patients with sepsis. As sepsis diagnosis and antibiotic stewardship rely on fixed clinical cutoffs (threshold concentration values), ensuring accuracy and comparability of PCT results over time and space is essential to ensure an appropriate diagnostic and therapeutic management. Multiple immunoassays have been developed and commercialized. However, comparability of results remains questionable. There is no metrological traceability to the international system of units (SI) for PCT measurement due to the lack of higher order reference method and certified reference materials.This work initially consisted in documenting the current state for results’ comparability between the different commercially available immunoassays for PCT in order to evaluate the need to establish metrological traceability to the SI. The evaluation of correlation studies and external quality assessment schemes results indicate that properly evaluating the current state of result’s comparability and discriminating the origin of result’s discrepancies is made difficult because studies were conducted in non-harmonized conditions and commutability of the materials was not characterized. Thus, it seems essential to conduct quality external evaluation using commutable control materials. In order to evaluate accuracy of commercially available immunoassays for PCT and to meet the regulatory requirements for the metrological traceability of results, a candidate reference method based on isotopic dilution liquid chromatography coupled to mass spectrometry was developed and validated for an absolute quantification of PCT in human serum with a limit of quantification of 0.25 ng/mL. Results traceability to the SI units could be established thanks to a thorough purity assessment of the primary calibrators by amino acid analysis and correction of impurities contribution

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Santos, Ivan. "Quantification of gas-phase ion-molecule reactions of complex organic compounds and a study of the factors involved in these determinations by Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry /." The Ohio State University, 1987. http://rave.ohiolink.edu/etdc/view?acc_num=osu1487335992902583.

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Gru, Yvan. "Couplage avancé de type HPLC avec préconcentration en ligne et spectrométrie de masse (SPE-LC/MS/MS) : identification et quantification de micropolluants organiques dans les eaux : effets de la matrice." Rennes 1, 2010. http://www.theses.fr/2010REN1S020.

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De nombreux composés d’origine anthropique sont détectés dans l’environnement, particulièrement dans les eaux de surface utilisées comme ressource. Parmi ces molécules, les pesticides, bien qu’ils soient parfois présents à de très faibles concentrations, peuvent causer des dommages sanitaires ou environnementaux. La préparation de l’échantillon et la méthode de détection sont les deux points critiques de la qualité du dosage de tels substances dans les eaux. L’extraction demeure notamment une étape fastidieuse qui génère des problèmes de récupération. Pour les réduire, une technique de chromatographie liquide avec préconcentration en ligne (SPE-LC) couplée à un spectromètre de masse de type piège ionique linéaire (LIT) a été développée et validée en matrice eau propre (type eau d’Evian) et en eau de rivière (type rivière Loire - Nantes). Les critères de performances retenus étaient les suivants : exactitude, reproductibilité, sélectivité et sensibilité afin d’atteindre aisément des limites de quantification (LQ) au niveau 10 ng/L, pour un grand nombre de molécules. Près de 210 pesticides sont analysés dans le même run chromatographique en mode ElectroSpray positif. 2 ml d’échantillon d’eau sont percolés à travers une cartouche appropriée. Les LQ atteintes dans les deux matrices sont, pour la plupart des molécules inférieures ou égales à 10 ng/L. Les résultats montrent que la SPE-LC couplée à la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) est une technique adaptée, entièrement automatisable, pour réaliser une analyse multi-résidus de routine dans ces types d’eaux. La dégradation des molécules a par la suite été étudiée par la recherche de quelques métabolites, et aussi par la modification des conditions de stockage, montrant ainsi l’importance d’évaluer la stabilité des composés en milieu aqueux (hydrolyse, photolyse). L’étude s’est ensuite focalisée sur la qualité d’identification des composés par l’utilisation du mode d’acquisition MRM-EPI (Full scan MS/MS) disponible sur ce type de spectromètre. Ce mode de balayage se révèle comme un outil de choix pour assurer l’identification en dosage multi-résidus. Enfin, le thème d’effet matrice a été largement abordé, car la technique développée donnait lieu à des suppressions de signal non négligeables pour un certain nombre de composés (exaltations de signal plus rarement). L’origine de ces effets matrice a été évaluée par des essais d’introduction post-colonne, montrant que l’ionisation par Electrospray est un point critique. Il a fallu apporter des solutions à la maîtrise et à la réduction de ces effets incommodants pour la restitution juste d’une concentration d’un analyte présent dans un échantillon d’eau. L’étalonnage interne s’est montré efficace et ainsi a été choisi, par application ou non d’un étalon interne adapté pour une molécule précise To analyze swiftly and reliably numerous pesticides in waters, an on-line solid phase extraction liquid chromatography technique (on-line SPE-HPLC) coupled with triple quadripole linear ion trap mass spectrometry (Q-Trap MS/MS) procedure was developed for a large range of chemical families with detection limits at the 10 ng/L level. In this study, triazines, phenylureas, organophosphorus compounds and others (near than 210 compounds) were tested in the same ESI positive chromatographic run (less than 25 min). 2 ml of water sample (filtered if necessary) were injected into the SPE-HPLC system through a preconcentration cartridge. Analytes were eluted by a suitable mobile phase towards an analytical column (monolithic stationary phase), then detected and quantified by the mass spectrometer (MS/MS). The LOQ were achieved under the 10 ng/L level for the most of compounds in the both matrices (tap water and river water). Degradation of molecules was studied by research of few metabolites, and also by modification of storage conditions, showing the importance to evaluate stability of compounds in aqueous environment (hydrolysis, photolysis). The study was then focused on the identification by using the MRM-EPI scan mode (Full scan MS/MS), available on this kind of mass spectrometer. Results show that on-line-SPE-LC technique, coupled with hybrid triple quadripole linear ion trap mass spectrometry is a suitable way to determine multiple organic residues in waters. Finally, matrix effects theme was largely approached, since developed technique gave place non negligible signal suppressions for few compounds (signal enhancement more rarely). Matrix effects origin was evaluated by post-column introductions tests, showing that Electrospray ionization is a critical point. It was necessary to bring solutions of the control and the reduction of these annoying effects in the just restoration of an analyte concentration. The internal calibration showed effective and so was chosen, by application or not of an internal standard adapted for a particular molecule

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Dissertationen zum Thema „Phase quantification“

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