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Dissertationen zum Thema „Modelage Biophysique“

Autor: Grafiati
Veröffentlicht am 25. Mai 2024

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1

Fernandes, Gonçalo. "Imaging transcription in living embryos to decipher the robustness of patterning." Electronic Thesis or Diss., Université Paris sciences et lettres, 2022. http://www.theses.fr/2022UPSLS025.

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Au cours du développement, les gradients morphogénétiques fournissent l’information positionnelle nécessaire à l’établissement des axes de polarité. Si l’importance de ces gradients est bien établie, la façon dont ils assurent la reproductibilité des patrons d’expression malgré la nature stochastique de la transcription reste énigmatique.Pour répondre à cette question, j’étudie l’établissement de l’axe antéro-postérieur (AP) de l’embryon de drosophile, sous contrôle de Bicoid (Bcd), un facteur de transcription et morphogène bien connu. Les ARNs de bcd sont exprimés maternellement et ancrés au
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2

VRIGNEAUD, JEAN-MARC. "Developpement d'un modele biophysique pour l'evaluation des dommages radio-induits dans la fibre chromosomique." Toulouse 3, 2000. http://www.theses.fr/2000TOU30054.

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Cette etude s'inscrit dans le cadre de calculs de structure de trace par monte carlo dans un modele elabore d'adn, considere comme cible du rayonnement. Les radiations simulees sont les electrons issus d'emetteurs auger incorpores dans le milieu cellulaire et les photons de basse energie. Les dommages, directs et indirects, sont analyses au niveau moleculaire (cassures de brins) et confrontes aux resultats experimentaux. Les donnees disponibles sont utilisees pour representer l'adn et son environnement a l'interieur de la cellule. A l'aide d'un logiciel de modelisation moleculaire, nous avons
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3

Ranchon, Isabelle. "La photodegenerescence retinienne : quantification d'un modele et place des radicaux libres dans le processus degeneratif (doctorat : biophysique sensorielle)." Clermont-Ferrand 1, 1999. http://www.theses.fr/1999CLF1PP01.

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4

Vermeulen, Arthur. "Modélisation biophysique du neurone récepteur olfactif : influence de la structure spatiale du neurone, de l'environnement sensillaire et de la rétropropagation des potentiels d'action sur le codage de l'intensité olfactive." Grenoble INPG, 1997. http://www.theses.fr/1997INPG0156.

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Le present travail porte sur le neurone recepteur olfactif et en particulier sur le codage de l'intensite d'un stimulus olfactif a l'etat stationnaire. En premier lieu, nous presentons les bases biologiques du travail. Puis nous proposons un modele biophysique decrivant les etapes successives de la conversion d'une concentration odorante en un train des potentiels d'action : le changement de la conductance membranaire (transduction), la generation du potentiel recepteur et celle des potentiels d'action. Nous demontrons une expression analytique decrivant chacune des etapes ; l'expression qui d
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5

Colloc'h, Nathalie. "Analyse qualitative des surfaces moleculaires a l'aide de fonctions de lissage b-spline et etudes topologiques quantitatives : application aux proteines." Paris 6, 1988. http://www.theses.fr/1988PA066162.

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6

Mouttahar, Abdelhak. "Etude du comportement mecanique d'une coque anisotrope et fibreuse : application a la mecanique ventriculaire gauche." Toulouse 3, 1987. http://www.theses.fr/1987TOU30168.

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David, Laurent. "Modelisation des interactions electrostatiques des biomolecules en solution." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1996. http://www.theses.fr/1996GRE10159.

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Les interactions electrostatiques jouent un role crucial dans la modelisation d'une macromolecule biologique, et particulierement dans la comprehension de l'effet du solvant sur le systeme considere. La resolution de l'equation lineaire de poisson-boltzmann (lpb) permet d'obtenir une representation de ces interactions. Plusieurs methodes resolvant cette equation (ou une approximation de cette equation) sont developpees dans le but d'etre utilisees en dynamique moleculaire. La premiere etude utilise la methode des differences finies pour discretiser le systeme et differents algorithmes mathemat
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Khalid, Naciri Jaâfar. "Modelisation d'ecoulements instationnaires en conduites deformables : applications aux ecoulements arteriels." Toulouse 3, 1988. http://www.theses.fr/1988TOU30052.

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Pavard-Ohanessian, Jacqueline. "Contribution à l'étude de la stéréochimie des chaines glycaniques de glycoprotéines et à l'étude de leurs interactions avec la lectine d'arachide spécifique des substrats d-galactosyles terminaux." Paris 13, 1986. http://www.theses.fr/1986PA132005.

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Cordier, Florence. "Développements méthodologiques et études dynamiques de protéines en solution par relaxation en RMN." Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015), 1998. http://www.theses.fr/1998GRE10090.

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Dans la premiere partie de ce travail, nous avons propose le principe de dimensionalite reduite dans des experiences heteronucleaires multidimensionnelles sur des proteines marquees #1#5n/#1#3c. Deux experiences (3d-mq-hncoca et 3d-mq-noesy doublement filtree #1#5n/#1#5n et/ou #1#5n/#1#3c) utilisant ce principe ont ete mises au point et en ont montre l'interet pour l'attribution et le calcul de structure tridimensionnelle preliminaire. La majeure partie de ce travail concerne l'etude de la dynamique des proteines dans la gamme ps-ms par la mesure de parametres de relaxation. Dans un premier te
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11

Furois-Corbin, Sylvie. "Contribution à l'étude théorique des biopolymères : acides nucléiques et protéines membranaires." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066384.

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Saadat, Abdelkader. "Etude de la mobilite moleculaire du collagene par courants thermostimules : modelisation du vieillissement cutane." Toulouse 3, 1988. http://www.theses.fr/1988TOU30178.

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Amerein, Béatrice. "Modelisation et representation dynamique de macromolecules biologiques." Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008), 1988. http://www.theses.fr/1988STR13040.

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Etchebest, Catherine. "Etudes theoriques d'un canal ionique transmembranaire : la gramicidine a." Paris 6, 1987. http://www.theses.fr/1987PA066049.

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Saad, Mohamed. "Études structurales à basse résolution par diffraction de rayons X synchrotron des fibres de collagène dans le tendon : Détermination des facteurs de structure, évaluation des méthodes du remplacement isomorphe et autres modélisations." Grenoble 1, 1994. http://www.theses.fr/1994GRE10187.

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Le collagene est le constituant majeur de toutes les proteines des organismes vertebres. Son role principal est de contenir ainsi que de servir de support et d'intercalaire pour les tissus. Cette fonction, essentiellement structurale du collagene, est principalement due a la resistance mecanique des fibres de collagene et est assuree grace a une conformation moleculaire unique tres reguliere au niveau de la sequence d'acides amines ou l'on retrouve une tres grande regularite dans la distribution des residus. Il en resulte un alignement specifique lors de l'assemblage extracellulaire et qui pos
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Coppel, Yannick. "Études de la structure de complexes ADN-ligand par résonance magnétique nucléaire et modélisation nucléaire : sondes de chiralite de l'ADN, modèles d'AP-endonuclease." Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015), 1996. http://www.theses.fr/1996GRE10079.

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Les avancees considerables realisees dans le domaine de la synthese de fragments d'adn et des methodes d'analyse de structures, notamment en resonance magnetique nucleaire (rmn) et en modelisation moleculaire, ont permis d'ameliorer nos connaissances des interactions adn-ligand. Notre travail s'inscrit dans cette problematique. Nous avons plus particulierement etudie deux classes de molecules qui ont respectivement des applications potentielles comme (1) sondes de chiralite de l'adn ou comme (2) nucleases artificielles interagissant specifiquement au niveau des lesions abasiques (ap-lyases). A
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CELIA, HERVE. "Etudes structurales de la sous-unite b de la gyrase d'escherichia coli et de l'arn polymerase a de saccharomyces cerevisiae. Microscopie electronique et analyse d'images de cristaux bidimensionnels." Strasbourg 1, 1993. http://www.theses.fr/1993STR13175.

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Des cristaux bidimensionnels de sous-unite b de la gyrase avaient ete obtenus par interaction specifique de la proteine avec un film de lipides greffes covalament a la novobiocine, un inhibiteur des fonctions atpasiques de l'enzyme. Nous avons calcule un modele tridimensionnel de la sous-unite b a partir d'images de cristaux de la proteine colores negativement. Ce modele montre a 2,5-3,0 nm de resolution deux bras allonges formant une structure en v, la base du v contenant le site de liaison a la novobiocine. L'analyse d'images effectuee sur les memes cristaux hydrates congeles a permis de det
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Gruza, Jan. "Modélisation de la flexibilité des glycannes complexes en solution et en interaction avec des protéines." Grenoble 1, 1998. http://www.theses.fr/1998GRE10158.

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Le comportement conformationnel des glycannes, et donc leur flexibilite, peuvent influencer directement la reactivite chimique et l'activite biologique de ces molecules. Dans ce travail, la modelisation moleculaire d'une serie de glycannes de complexite croissante a ete realisee en utilisant plusieurs methodes d'exploration de l'espace conformationnel, dont la methode heuristique cicada, associees a differents champs de force : mm3 et amber avec plusieurs parametrisations disponibles pour les glycannes. La validation des modeles a ete apportee par des methodes theoriques de chimie quantique et
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Morelle, Nathalie. "Attribution assistée par ordinateur des spectres RMN de protéines : application à l'étude structurale des ferrocytochromes c555 de Chlorobium limicola f. thiosulfatophilum et c2 de Rhodobacter capsulatus." Université Joseph Fourier (Grenoble), 1995. http://www.theses.fr/1995GRE10166.

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La structure tridimensionnelle de proteines en solution peut etre determinee par rmn, au prix d'une longue et complexe etape d'interpretation des spectres. Dans ce travail, nous avons concu une panoplie d'outils pour automatiser cette attribution. Pour l'attribution des frequences de resonance aux protons de la molecule a partir de spectres 2d, l'expertise de l'il humain est souvent indispensable et nous proposons une approche semi-automatique, effectuee a l'aide d'un nouveau programme informatique utilisant la technique d'optimisation par recuit simule. Pour les proteines doublement marquees
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