Dissertationen: „Distribution poissons“

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Chalant, Anaïs. „Etude macroécologique de la distribution, diversité et vulnérabilité des poissons diadromes“. Thesis, Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2016. http://www.theses.fr/2016MNHN0018/document.

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La diadromie représente un cycle de vie qui implique obligatoirement des migrations entre la mer et l’eau douce. La diadromie s’est maintenue dans différentes lignées évolutives de poissons, mettant ainsi en évidence l’existence d’avantages adaptatifs comme la capacité à coloniser des milieux vierges ou de mieux exploiter la variabilité spatio-temporelle de l’environnement. Une hypothèse pour expliquer l’origine et le maintien de la diadromie postule que les migrations entre mer et rivière ont pour but de placer les individus dans le milieu qui favorisera la croissance avant la première reproduction. Une croissance en mer et une reproduction en rivière (anadromie) serait favorisée si la productivité primaire en eau douce est inférieure à celle des milieux marins environnants tandis que la situation inverse (catadromie ; reproduction en mer, croissance en rivière) est attendue quand le différentiel de productivité est en faveur des eaux douces. Les résultats de notre étude réalisée à l’échelle du globe confirment cette hypothèse et montrent également que les poissons diadromes se trouvent majoritairement dans des rivières à faible richesse spécifique et/ou ouvertes à la colonisation après le retrait des glaciers au Quaternaire. Leur capacité à coloniser de nouveaux milieux permet aux diadromes d’être très présents sur les îles océaniques. Si la biodiversité sur les îles océaniques a été largement étudiée, très peu d’études ont porté sur les poissons d’eau douce qui s’y trouvent. Notre étude des peuplements de poissons des îles polynésiennes confirme la généralité d’un modèle proposé pour les faunes terrestres prédisant une relation en dôme entre richesse spécifique et âge de l’île. Nos résultats montrent également que la richesse diminue avec la distance au centre de biodiversité le plus proche et augmente avec l’altitude maximale de l’île.Malgré leur succès évolutif, les poissons diadromes se révèlent très vulnérables face aux activités humaines (surexploitation, pollution de l’eau, barrages…). De ce fait, de nombreuses espèces sont classées comme vulnérables par l’IUCN. Paradoxalement, notre étude sur les caractéristiques biologiques et écologiques des espèces qui se sont éteintes récemment à l’échelle du globe n’identifie pas la diadromie comme un facteur aggravant. Cette étude montre que le critère biologique principal menant à l’extinction est l’endémisme et une aire de distribution géographique restreinte. Bien que souvent en déclin, beaucoup d’espèces diadromes ont jusqu’ici échappé à l’extinction du fait de leur aire de distribution initiale de grande taille, résultat probable de leur grande capacité de dispersion. Un très bon exemple est l’esturgeon européen, Acipenser sturio, initialement largement distribué en Europe mais qui après un fort déclin à partir de 1850 ne se reproduit plus que dans le seul bassin de la Garonne. Pour mieux suivre le déclin de cette espèce au cours du temps, nous avons étudié sa distribution avant 1850 à l’aide de données archéozoologiques. L’analyse de ces données suggère une diminution des populations très ancienne, initiée il y a 2500 ans. A l’aide de températures passées reconstituées, nous avons montré que des températures élevées expliquent en partie l’occurrence d’esturgeons dans les sites archéologiques mais sans contribuer à expliquer son déclin. Ces résultats suggèrent un impact de l’homme précoce sur les populations d’esturgeons. Cette thèse a permis de synthétiser les connaissances sur les poissons diadromes concernant leur distribution géographique à diverses échelles de temps et d’espace, et de contribuer à une meilleure compréhension de leur diversité et de leur vulnérabilité
Diadromous species exhibit a life-cycle implying migrations between freshwater and ocean. Diadromy is observed in many fish lineages suggesting that adaptive traits are associated with this strategy such as better dispersal ability and more efficient tracking of the spatio-temporal variability of the environment. One of the hypotheses that have been put forward to explain the evolution and persistence of diadromy states that the purpose of migrations is to select environmental conditions that will optimize pre-reproductive growth. Growing at sea and reproducing in river (anadromy) is supposed to be favored when freshwater primary productivity is lower in freshwater than in the nearby sea. The reverse (growing in freshwater, reproducing in ocean; catadromy) is expected when productivity is higher in sea than in freshwater. According to our study, conducted at a global scale, this hypothesis holds true. In addition it is shown that diadromous species are overrepresented in species poor rivers and/or in those that have been open to colonization after the retreat of glaciers after the last glacial maximum. Because of their dispersal ability, diadromous species are also over-represented on oceanic islands. Biodiversity on islands is classical topic of biogeography but yet few studies have dealt with freshwater fishes. In our study of fish communities from the Polynesian islands, we demonstrate the generality of a model initially built to explain terrestrial biodiversity on oceanic islands. As predicted by this model, species richness peaks at peaks at intermediate island age. Also revealed by our results are a positive relationship between island elevation and species richness and a decrease in species richness as the distance from the nearest biodiversity hotspot increases. Diadromy has been a successful strategy over geologic times but in face to human activities it seems to contribute to extinction proneness, as exemplified by the numerous diadromous species red listed by IUCN. Paradoxically, our study about the biological and ecological traits shared by the freshwater fishes that have been recently globally extinct does not suggest that diadromy has been a major factor. This study points to endemism and restricted geographic range size as the major determinants of extinction. It seems that because of their dispersal abilities, diadromous species tend to have widespread historical distributions and, even if many species are declining, this prevented most of them from being entirely extirpated. This is well exemplified by the European sturgeon (Asipenser sturio), formerly widely distributed over Europe and now restricted to one reproducing population in the Garonne River, because of dramatic population collapses after 1850. To have a better idea of the fate of this species before 1850, we analyzed archaeozoological records. According to our analyses, sturgeons started to decline a long time ago, about 2500 years ago. Using reconstructed past temperatures, our analyses show that a high temperature increases the probability of finding this species in archeological remains but cannot explain entirely the observed decline. This suggests that human activities impacted sturgeon populations well before the industrial revolution. This thesis by synthesizing species occurrence data over different spatial and temporal scales contributed to a better knowledge about the diversity and vulnerability of diadromous fishes

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Soewardi, Kadarwan. „Caractérisation des populations de Thymallus thymallus L. (poissons, salmonidés) et de Rutilus rutilus L. (poissons, cyprinidés) dans le réseau fluvial du Rhône : approche par l'étude du polymorphisme enzymatique“. Lyon 1, 1988. http://www.theses.fr/1988LYO10110.

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Vaslet, Amandine. „Ichtyofaune des mangroves des Antilles : influence des variables du milieu et approche isotopique des réseaux trophiques“. Antilles-Guyane, 2009. http://www.theses.fr/2009AGUY0262.

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Les communautes ichtyologiques ont ete etudiees dans 38 stations de mangrove bordant les baies du grand cul-de-sac marin (gcsm) et du petit cul-de-sac marin en guadeloupe. Au total, 119 espèces de poissons ont pu être identifiées dont 40 présentent un intérêt commercial. Près de 70 % des effectifs de poissons observés en mangrove sont représentés par des juvéniles. Des analyses canoniques des correspondances ont révélé que, dans les deux baies de mangrove, les espèces sont influencées par la proximité des récifs ou des rivières, par la transparence de l'eau et par l'étendue des mangroves. Un gradient environnemental « côte-large» a pu être observé dans le lagon du gcsm et a permis de distinguer les îlets de mangrove, caractérisés par la présence d'espèces récifales et d'herbiers, des sites proches de rivières composés d'espèces inféodées aux mangroves. En saison des pluies, les apports d'eaux douces issus des précipitations renforcent un gradient terrigène qui va être à l'origine du remplacement des espèces récifales par des espèces de mangrove tolérant des eaux dessalées et turbides. Les analyses des isotopes stables du carbone (13c:12c) et de l'azote (15n:14n) ont permis de déterminer l'importance des mangroves comme zones d'alimentation pour l'ichtyofaune. Les rapports isotopiques en carbone des proies de mangrove sont plus appauvris en 13c par rapport à celles des herbiers. Ces signatures isotopiques ont ainsi permis de différencier trois groupes d'espèces en fonction de l'origine des sources de carbone consommées: celles qui s'alimentent dans les herbiers, celles qui consomment des proies présentes en mangrove et celles qui s'alimentent dans les deux ecosystemes
Fish communities were studied in 38 mangrove sites bordering the bays of grand cul-de-sac marin (gcsm) and petit cul-de-sac marin in guadeloupe. Out of a total of 119 fish species, 42 species are of commercial interest. Juveniles represent around 70 % of fish totalabundance in mangroves. Canonical correspondence analyses revealed that, in the two mangrove bays, fishes were influenced by reef or river mouth proximities, water transparency and the extent of mangrove areas. In the gcsm, an environmental gradient from the coast seawards was observed. This gradient separated reef and seagrass beds species of mangrove islets. Located near the barrier reef, to mangrove resident fish species located in the close vicinity of river and channel mouths. During the wet season, important rainfall and fresh water runoffs created a terrestrial gradient influencing the replacement of reef species by mangrove species, more tolerant to turbid and less salty waters. Stable isotopes analyses of carbon (13c:12c) and nitrogen (15n:14n) enabled to determine the importance of mangrove habitat as fish feeding grounds. Carbon isotopic ratios of mangrove preys were more depleted compared to preys from seagrass beds. These isotopic signatures enabled the differentiation of three groups of fish species: species that consume preys from seagrass beds, species feeding in mangroves and species feeding in both ecosystems

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Birgi, Emile. „Monogènes parasites de Poissons d'eau douce au Tchad et au Sud-Cameroun : taxonomie et essai de biogéographie comparée“. Montpellier 2, 1987. http://www.theses.fr/1987MON20173.

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81 especes de dactylogyridea ont ete decouvertes et decrites chez 78 especes de poissons hotes. Un genre nouveau est propose. On signale, dans la majorite des cas, un parasitisme branchial simultane par des especes congeneriques parfois nombreuses. Un parasitisme resultant d'un phenomene de capture est mis en evidence. Une systematique intragenerique est ebauchee sur la base de la morphologie de l'appareil copulateur male. La comparaison des deux regions etudiees permet d'avancer des hypotheses sur la repartition biogeographique des parasites et des poissons hotes

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Leprieur, Fabien Brosse Sébastien. „Les introductions d'espèces de poissons d'eau douce distribution spatiale, déterminants et impacts sur les espèces natives /“. Toulouse (Université Paul Sabatier, Toulouse 3), 2008. http://thesesups.ups-tlse.fr/151.

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Patty, Wilhelmina. „Déterminisme de la répartition spatio-temporelle des populations de poissons pélagiques à partir d'observations acoustiques et environnementales“. Brest, 1996. http://www.theses.fr/1996BRES2043.

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Le determinisme du comportement des bancs de poissons pelagiques est etudie a partir de donnees de prospection acoustique et en utilisant des facteurs environnementaux, geographiques et biologiques. On etait en droit de penser que ces facteurs jouaient un role important sur les fluctuations de disponibilite du poisson et sur la variabilite spatio-temporelle de son organisation dans l'espace en bancs. Les observations faites au coup de quatre annees dans le golfe de gascogne montrent que les descripteurs pertinents de bancs tels que: nombre de bancs, surface, energie, forme et position dans la tranche d'eau varient de facon significative selon l'annee et la saison. On note egalement que les bancs de poissons sont distribues geographiquement de facon anisotrope. La taille moyenne des structures homogenes differe selon les descripteurs et l'annee. Nous tentons dans cette etude d'identifier une relation eventuelle entre la variation des formes, de la densite, de la taille et de la distribution des bancs et les facteurs environnementaux. Ce travail a ete realise en utilisant les methodes d'acp, d'ace et le modele lineaire general. La forme et la distribution des bancs varient d'une part, en fonction des especes qui les constituent, d'autre part avec les facteurs environnementaux. La variabilite des bancs situes entre deux eaux (dits pelagiques) est expliquee par la temperature de surface, la profondeur du fond et le gradient vertical de temperature, tandis que celle des bancs situes pres du fond (dits demebaux) est plus liee a la temperature au fond

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Lassalle, Géraldine Rochard Eric. „Impacts des changements globaux sur la distribution des poissons migrateurs amphihalins une approche par modélisation à l'échelle continentale /“. S. l. : Bordeaux 1, 2008. http://ori-oai.u-bordeaux1.fr/pdf/2008/LASSALLE_GERALDINE_2008.pdf.

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Renno, Jean-François. „Génétique des populations et biogéographie de l'ichtyofaune néotropicale : le modèle Leporinus de Guyane“. Montpellier 2, 1989. http://www.theses.fr/1989MON20219.

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Les causes de la diversite de l'ichtyofaune neotropicale sont abordees a travers plusieurs niveaux de perception: genetique, morphologie, ecologie et zoogeographie, dans l'etude du genre leporinus (anostomidae). L'isolement reproductif entre sept especes de leporinus a ete confirme en guyane. L'etude intraspecifique a ete entreprise ches l. Friderici, espece largement distribuee en amerique du sud. Cette espece constitue un groupe monophyletique dans le genre leporinus en guyane, mais apparait comme un groupe paraphyletique a l'echelle de l'amerique du sud. La differenciation genetique (electromorphes de proteines et patrons de restriction de l'adn mitochondrial) a ete confrontee a la differenciation morphologique de l. Riderici. En guyane, la structure genetique intraspecifique de l. Friderici est en accord avec la structure zoogeographique de deux grandes familles de poissons neotropicaux, les serrasalmides et les anostomides et celle de groupes d'organismes autres que les poissons. La faune est structuree en deux ensembles: un ensemble oriental qui est sous l'influence de la faune amazonienne et un ensemble occidental dont l'endemisme est plus prononce. Les resultats mis en evidence par les differentes approches sont congruents et renforcent l'hypothese de l'existence de refuges aquatiques, qui auraient joue un role dans la speciation de l'ichtyofaune neotropicale lors des bouleversements paleoecologiques durant l'ere quaternaire. Un guide dans la constitution des souches d'elevage est propose base sur l'analyse de la structure genetique de l. Friderici espece d'interet aquacole

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Persohn, Cécile. „Sensibilité des populations de poissons aux changements globaux en fonction de leurs traits d’histoire de vie étudiée par une approche empirique“. Brest, 2009. http://www.theses.fr/2009BRES2034.

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L’effet attendu des variations environnementales sur la biologie des poissons peut varier selon les espèces et selon leurs traits d’histoire de vie. De même, les conséquences des changements globaux n’étant pas les mêmes selon la latitude, différentes populations d’une même espèce pourront être affectées différemment selon leur localisation. Durant cette thèse, nous avons étudié l’impact des variations environnementales sur une sélection d’espèces présentes au large des côtes françaises. Une comparaison inter-espèces et inter-zones a été réalisée. Des modèles monospécifiques d’habitat ont été réalisés sur différentes populations du golfe de Gascogne et de mer Celtique afin d’établir leurs préférences pour certaines conditions de profondeur, température et salinité, et l’impact des variations environnementales sur la distribution de ces populations a été étudié. Des analyses multivariées ont permis de compléter cette étude en observant la variabilité de la distribution à l’échelle des communautés. Les espèces sélectionnées (merlu, merlan, merlan bleu, tacaud commun, petit tacaud, grondin rouge, cardine et petite roussette) montrent de fortes préférences pour des conditions particulières de profondeur, mais ne sélectionnent pas, ou rarement, des conditions particulières de température ou de salinité. De fait, les variations de ces paramètres n’ont que peu d’effet sur la distribution des populations. Par contre pour certaines espèces telle que le grondin rouge, la petite roussette ou le merlan bleu, cette distribution est affectée par des effets densité-dépendants.

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Leprieur, Fabien. „Les introductions d'espèces de poissons d'eau douce : distribution spatiale, déterminants et impacts sur les espèces natives“. Toulouse 3, 2007. http://thesesups.ups-tlse.fr/151/.

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Bien que les espèces non natives de poissons d'eau douce soient bien identifiées, les facteurs déterminant leur distribution spatiale ainsi que leurs impacts sur la biodiversité sont encore peu connus, en particulier à de larges échelles spatiales. Dans ce contexte, cette thèse vise : (i) à une meilleure compréhension de l'impact des espèces non natives de poissons d'eau douce sur les espèces natives ; et (ii) à identifier les facteurs qui contrôlent la distribution spatiale des espèces non natives. Pour cela, différents niveaux de perception du processus d'introduction d'espèces et différentes échelles spatiales ont été considérés. Les résultats obtenus à l'échelle locale (135 stations au sein d'un bassin hydrographique de Nouvelle Zélande) ont permis de mettre en évidence que l'impact d'une espèce invasive (la truite, Salmo trutta L. ) sur une espèce native (Galaxias anomalus Stockell) peut varier spatialement en fonction des caractéristiques abiotiques locales. En particulier, les perturbations anthropiques, telles que la modification des habitats résultant des variations de débit, ne favorisent pas forcément les espèces invasives. Ainsi, la conservation d'une espèce native menacée nécessite des mesures de gestion adaptées au contexte environnemental local. Enfin, une étude expérimentale souligne le fait qu'une espèce considérée à priori comme invasive et nuisible (le poisson chat, Ameiurus melas Raff. ) doit faire l'objet d'études quant à son impact réel sur les espèces natives ; ceci afin de mettre en place des mesures de gestion adaptées aux caractéristiques comportementales et écologiques de l'espèce impactée. Les résultats obtenus à l'échelle régionale (bassin hydrographique) montrent que les introductions d'espèces de poissons d'eau douce en Europe ont conduit à une augmentation de la diversité alpha des bassins hydrographiques (c'est-à-dire une augmentation du pool régional d'espèces), mais ont provoqué une diminution de la diversité beta (homogénéisation taxonomique). L'augmentation du pool régional de poissons d'eau douce en Europe ne doit pas forcément être interprétée comme bénéfique pour la biodiversité, car les extinctions d'espèces se déroulent généralement à des échelles de temps plus grandes que le phénomène d'introduction d'espèces. .
Although non-native fish species are well identified, the determinants of their spatial distribution and their impacts on biodiversity are poorly documented, especially at large spatial scales. In that context, this thesis aims (i) at improving our knowledge on the potential impacts of non-native fish species and (ii) at identifying the factors controlling their spatial distribution. This was achieved by considering different spatial scales. The local-scale approach (stream reach within a river basin) first shows that local abiotic conditions can influence the spatial distribution of an invasive species (brown trout, Salmo trutta L. ) in a New Zealand river basin and hence can mediate its impact on a native species (Galaxias anomalus Stockell). Especially, anthropogenic disturbances (such as water abstraction for agricultural purposes) do not necessarily promote species invasions as reported by most previous studies. Therefore, the effective conservation of threatened native species implies the implementation of management strategies adapted to the local environmental context. Last, an experimental study reveals that a species considered as invasive (such as brown bullhead, Ameiurus melas Raff. ) should be systematically studied in regards to its impact on native species. This is necessary to set up management strategies that account for the behavioural and ecological characteristics of the impacted native species. The regional-scale approach (river basin) first shows that the introductions of non-native fish species in Europe led to (i) an increase of the size of the regional pool of species (i. E. An increase in alpha diversity) and (ii) a decrease of the taxonomic similarity between river basins (i. E. A decrease in beta diversity corresponding to a taxonomic homogenization). .

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Ballón, Soto Roberto Michael. „Étude acoustique du macrozooplancton au Pérou : estimation de biomasse, distribution spatiale, impact du forçage physique, et conséquences sur la distribution des poissons fourrage“. Thesis, Montpellier 2, 2010. http://www.theses.fr/2010MON20052/document.

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La partie nord du Système du courant de Humboldt (NSCH) couvre moins de 0.1% de la surface océanique mondiale mais produit plus de poisons, en particulier d'anchois du Pérou (Engraulis ringens), par unité de surface que n'importe quelle autre région du monde. Bien que ce système produise suffisamment de macrozooplancton pour alimenter les populations de poisson fourrage, le manque d'informations sur ce compartiment limite nos capacités d'étude. L'objectif de cette thèse est d'étudier la dynamique de la distribution spatiotemporelle de la biomasse en macrozooplancton du NSCH en relation avec l'environnement physique et les poissons fourrage, à différentes échelles. Pour ce faire une méthode acoustique bi-fréquences a été développée et appliqué à des séries de données acoustiques historiques. Des informations à haute résolution ont ainsi pu être extraite sur la biomasse et les patrons de distribution du macrozooplancton, de la galathée pélagique 'munida', des poissons et des autres compartiments. Cette méthode nous a également permis d'estimer l'extension verticale de la communauté épipélagique (ZVEEC). Nous avons démontré que ZVEEC coïncide avec la limite supérieure de la zone de minimum d'oxygène (ZMO), ce qui permet de produire des donnés spatialisées à haute résolution de la limite supérieure de la ZMO et d'estimer le volume d'habitat de l'anchois. Notre estimation de biomasse en macrozooplancton, environ quatre fois supérieures aux estimations antérieures, est en accord avec les découvertes récentes sur l'écologie trophique des poissons fourrage du NSCH et fournit des éléments étayant les théories actuelles sur l'origine de la haute productivité en poissons du NSCH. L'étude des impacts des structures physiques de submeso- et mesoéchelle sur la distribution du macrozooplancton supporte l'hypothèse d'une structuration de type 'bottom-up'. Nous avons également mis en évidence l'impact de la structuration spatiale du macrozooplancton sur la distribution des poissons fourrage. Les données physiques et biologiques à haute résolution obtenues grâce à cette étude ouvrent de nouvelles perspectives pour réaliser des études écologiques intégrées à échelles multiples et pour calibrer les modèles biogéochimiques, trophiques ou End-to-End
The Northern Humboldt Current system (NHCS) represents less than 0.1% of the world ocean surface but produces more fish, mainly Peruvian anchovy (Engraulis ringens), per unit area than any other region in the world. Although this system produces enough macrozooplankton to feed its high production of forage fish, the paucity of information on zooplankton hampers research in the system. The objective of this study was to investigate the multiscale dynamics of the spatiotemporal distribution of the macrozooplankton biomass off Peru in relation to the physical environment and their fish predators. For that a bi-frequency acoustic method was developed and applied to extract, from historical acoustic data, high-resolution information on the biomass and the patterns of distribution of macrozooplankton, the pelagic red squad 'munida', fish and other marine compartments. This method also allows estimating the vertical extension of this epipelagic community (ZVEEC). We demonstrated that ZVEEC coincide with the upper limit of the oxygen minimum zone (OMZ), which allowed both producing high-resolution spatial data of the upper limit of the OMZ and estimating the volume habitat of anchovy. The estimated macrozooplankton biomass was about four times higher than previously reported. This estimate is in agreement with the recent findings on forage fish trophic ecology and supports the current hypotheses explaining the NHCS high fish production. The study of the impacts of the submeso- and mesoscale physical structures on macrozooplankton provided evidence of the bottom-up physical effect on the distribution of macrozooplankton biomass. We also found further evidence of the structuring bottom-up effect that macrozooplankton exert on forage fish. The high-resolution biological and physical data obtained in this study opens new perspective to perform integrated multiscale ecological studies and to calibrate biogeochemical, trophic and End-to-End models

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Comte, Lise. „Changements globaux et distribution spatiale des espèces de poisson d'eau douce : observations récentes et prédictions futures“. Toulouse 3, 2013. http://thesesups.ups-tlse.fr/2258/.

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Les changements climatiques actuels reçoivent une attention grandissante mais leurs impacts sur la biodiversité restent mal appréhendés. Cette thèse a permis de mettre en évidence une réponse cohérente des poissons d'eau douce au réchauffement climatique des dernières décennies se traduisant par des remontées en altitudes et vers les sources. Il est cependant apparu que des facteurs non-climatiques avaient majoritairement contribué aux changements observés, ce qui pourrait indiquer l'existence de délais importants dans la réponse des espèces et avoir des conséquences importantes pour leur capacité à faire face aux changements climatiques à venir. Néanmoins, certains mécanismes en lien avec des caractéristiques clés des espèces et leur histoire évolutive semblent conditionner leur capacité à persister in situ ou à suivre leur niche climatique. Ces résultats pourraient avoir des implications importantes quant à notre capacité à anticiper les changements à venir et à initier des politiques de gestion adaptées, dont les missions futures ne peuvent désormais plus être conçues sans tenir compte de l'évolution du climat
Despite increasing recognition that recent climate changes are influencing biodiversity, the specific impacts of those changes are still largely unknown. This thesis highlights systematic stream fish species shifts towards higher elevation and upstream habitats, consistent with the geographic variation associated with climate change. The results demonstrated, however, that patterns in climate-driven range shifts were less marked than those attributed to non-climatic drivers, suggesting more severe longer-term effects of climate warming on stream fish and profound consequences on the ability of species to cope with future climate modifications. Nevertheless, the results also provide evidence that several mechanisms are linked to species' evolutionary history and some key biological and ecological traits, allowing species to persist in situ or to track their climatic niche through space. These research findings improve our ability to anticipate future climate change-induced impacts and will assist with initiating effective conservation and management strategies, which can no longer be effectively designed without taking into account climate change

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Buisson, Laetitia. „Poissons des rivières françaises et changement climatique : impacts sur la distribution des espèces et incertitudes des projections“. Thesis, Toulouse, INPT, 2009. http://www.theses.fr/2009INPT005A/document.

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Les changements climatiques et leurs impacts sur la biodiversité font aujourd'hui l'objet d'une attention croissante de la part de la communauté scientifique et des gestionnaires des écosystèmes naturels. En effet, le climat influence la biologie et l'écologie des espèces animales et végétales, depuis leur physiologie jusqu'à leur répartition. Les modifications climatiques pourraient donc avoir des répercussions importantes sur les espèces et les assemblages. Au sein des écosystèmes aquatiques continentaux, les poissons de rivière sont des organismes incapables de réguler leur température corporelle et soumis à une variabilité hydrologique importante ainsi qu'à de fortes pressions anthropiques. Leur réponse aux modifications du climat actuelles et à venir a pourtant été encore peu abordée. L'objectif de ce travail de thèse est donc d'évaluer les impacts potentiels du changement climatique sur les poissons des rivières françaises, et plus particulièrement sur la distribution des espèces et la structure des assemblages. Des données fournies par l'Office National de l'Eau et des Milieux Aquatiques ainsi qu'une approche de modélisation basée sur les niches écologiques des espèces (i.e., modèles de distribution) ont été utilisées. Différentes sources d'incertitude ont également été testées dans une approche d'ensembles afin de prendre en compte la variabilité entre les impacts projetés et fournir ainsi une évaluation robuste de ces impacts. La première partie de ce travail a consisté en l'identification des principaux déterminants environnementaux qui structurent la répartition spatiale des espèces de poisson au sein des réseaux hydrographiques. Globalement, il apparaît qu'une combinaison de facteurs climatiques et de variables décrivant l'habitat local et la position des habitats au sein des réseaux hydrographiques est importante pour expliquer la distribution actuelle des espèces. De plus, les espèces ont toutes des réponses différentes aux facteurs de l'environnement. Dans un second temps, nous avons mis en évidence que le choix de la méthode statistique de modélisation de la niche écologique est crucial, les patrons actuels et futurs de distribution prédits étant fortement contrastés selon la méthode de modélisation considérée. Cette dernière s'avère même être la principale source d'incertitude dans les projections futures, bien plus encore que les modèles climatiques de circulation générale et les scénarios d'émission de gaz à effet de serre. La variabilité entre les prédictions issues de plusieurs techniques de modélisation peut être prise en compte par une approche de consensus. Un modèle consensuel basé sur la valeur moyenne de l'ensemble de prédictions est capable de prédire correctement la distribution actuelle des espèces et la composition des assemblages. Nous avons donc choisi de retenir cette approche pour évaluer au mieux les impacts potentiels du changement climatique sur les poissons des rivières françaises à la fin du 21ème siècle. Nous avons montré que la majorité des espèces de poisson pourrait être affectée par les futures modifications du climat. Seules quelques espèces d'eau froide (e.g. truite fario, chabot) pourraient restreindre leur distribution aux parties les plus apicales des réseaux hydrographiques. Au contraire, les espèces tolérant des températures plus élevées pourraient coloniser de nouveaux habitats et étendre ainsi leur répartition. Ces modifications de la distribution des espèces pourraient conduire à un réarrangement des assemblages au niveau taxonomique et fonctionnel. Une augmentation de la diversité locale et de la similarité régionale (i.e., homogénéisation) sont ainsi prédites simultanément. L'ensemble de ces résultats apporte donc des éléments sur la compréhension de la distribution des poissons d'eau douce et sur les conséquences du changement climatique qui peuvent être envisagées. Ce travail fournit ainsi une base aux acteurs de la gestion de la biodiversité afin d'initier des mesures de conservation concrètes. De plus, les considérations méthodologiques développées dans cette thèse sont une contribution importante à l'amélioration des projections issues de modèles statistiques de distribution et à la quantification de leur incertitude
Climate change and its impact on biodiversity are receiving increasing attention from scientists and people managing natural ecosystems. Indeed, climate has a major influence on the biology and ecology of fauna and flora, from physiology to distribution. Climate change may thus have major consequences on species and assemblages. Among freshwater ecosystems, stream fish have no physiological ability to regulate their body temperature and they have to cope with streams' hydrological variability and strong anthropogenic pressures. Yet their response to current and future climate change has been poorly studied. The aim of this PhD thesis is to assess the potential impact of climate change on fish in French streams, mainly on species distribution and assemblages' structure. Data provided by the Office National de l'Eau et des Milieux Aquatiques combined with a modelling approach based on species' ecological niche (i.e., distribution models) have been used. Several sources of uncertainty have also been considered in an ensemble modeling framework in order to account for the variability between projected impacts and to provide reliable estimates of such impact. First, we have identified the main environmental factors that determine the spatial distribution of fish species within river networks. Overall, it appears that a combination of both climatic variables and variables describing the local habitat and its position within the river network is important to explain the current species distribution. Moreover, each fish species responded differently to the environmental factors. Second, we have highlighted that the choice of the statistical method used to model the fish ecological niche is crucial given that the current and future patterns of distribution predicted by different statistical methods vary significantly. The statistical method appears to be the main source of uncertainty, resulting in more variability in projections than the global circulation models and greenhouse gas emission scenarios. The variability between predictions from several statistical methods can be taken into account by a consensus approach. Consensual predictions based on the computation of the average of the whole predictions ensemble have achieved accurate predictions of the current species distribution and assemblages' composition. We have therefore selected this approach to assess the potential impacts of climate change on fish in French streams at the end of the 21st century with the highest degree of confidence. We have found that most fish species could be sensitive to the future climate modifications. Only a few cold-water species (i.e., brown trout, bullhead) could restrict their distribution to the most upstream parts of river networks. On the contrary, cool- and warm-water fish species could colonize many newly suitable habitats and expand strongly their distribution. These changes of species distribution could lead to a rearrangement of fish assemblages both at the taxonomic and functional levels. An increase in local diversity together with an increase in regional similarity (i.e., homogenization) are therefore expected. All these results bring new insights for the understanding of stream fish species distribution and expected consequences of climate change. This work thus provides biodiversity managers and conservationists with a basis to take efficient preservation measures. In addition, methodological developments considered in this PhD thesis are an important contribution to the improvements of projections by statistical models of species distribution and to the quantification of their uncertainty

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Gerlotto, François. „Méthodologie d’observation et d'évaluation par hydroacoustique des stocks tropicaux de poissons pélagiques côtiers : impact du comportement et de la distribution spatiale“. Brest, 1993. http://www.theses.fr/1993BRES2008.

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L’évaluation et la cartographie des stocks de poissons pélagiques côtiers tropicaux, lorsqu'elles sont réalisées à partir de données de prospection acoustique, sont biaisées par les réactions comportementales des populations. Des expérimentations au Venezuela et en Afrique de l'ouest montrent que les traits comportementaux déterminants pour l'évaluation quantitative peuvent être décrits par la technique hydroacoustique elle-même et que les biais et erreurs peuvent être éliminés ou connus. Le comportement n'est donc pas un facteur limitant dans l'application de l'acoustique aux évaluations des stocks tropicaux. Les méthodes statistiques d'évaluation et de calcul de précision doivent aussi prendre en compte les types de distribution spatiale des données acoustiques et la méthode d'échantillonnage. Les méthodes les plus adaptées sont la géostatistique, et les stratifications par rectangles géographiques et par contours. Une méthodologie de prospection et de calcul est mise au point. Une méthode d'identification des principaux groupes d'espèces par la délimitation de populations acoustiques est présentée et testée sur deux régions différentes. Elle permet de cartographier les principales communautés pélagiques. Le jeu de méthodes mises au point est applique sur le stock de Sardinella aurita du Venezuela oriental. Il permet d'évaluer a 35% la précision que l'on peut attendre des évaluations

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Lassalle, Géraldine. „Impacts des changements globaux sur la distribution des poissons migrateurs amphihalins : une approche par modélisation à l’échelle continentale“. Thesis, Bordeaux 1, 2008. http://www.theses.fr/2008BOR13647/document.

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Les poissons migrateurs amphihalins évoluent dans un environnement qui est perturbé, à l’échelle globale, par le changement climatique et à l’échelle régionale, par les pressions anthropiques telles que les barrages et la pollution des cours d’eau. Cette étude, menée à l’échelle continentale, avait pour objectif d’évaluer, de comprendre et de prédire les impacts de changements globaux sur la distribution de ce groupe. Afin de répondre à cette problématique, des modèles empiriques de distribution ont été construits pour chacune des 28 espèces étudiées. Leurs distributions ont été décrites au début et à la fin du XXème siècle, en termes de présence-absence et de classes d’abondance. Les variables explicatives potentielles étaient de type physique, climatique, biotique et anthropique. Dans un premier temps, il a été mis en évidence que la répartition vers 1900 des poissons migrateurs amphihalins était fortement contrainte par leur histoire biogéographique et par les conditions thermiques et hydrauliques de l’habitat continental. La projection de ces distributions, à la fin du XXIème siècle, dans le contexte du changement climatique, a montré la forte sensibilité de ce groupe aux modifications du climat. Bien que spécifiques à chaque espèce, les réponses ont pu être classées en trois catégories : expansion de l’aire de répartition, contraction de l’aire de répartition et peu ou pas de changement. Dans un deuxième temps, pour la première fois à l’échelle continentale, l’importance des grands barrages et de la densité de populations humaines pour expliquer la distribution actuelle de ces espèces a été démontrée. Les relations sont apparues complexes et dépendantes des caractéristiques écologiques des espèces, notamment de la position de leurs habitats de croissance et de reproduction le long du réseau hydrographique et de leur place au sein du réseau trophique
Diadromous fishes live in an environment disturbed, at global scale, by climate change and at regional scale, by anthropogenic pressures such as dams and river pollution. This study, performed at continental scale, aimed to assess, understand and predict the impacts of global changes on the distribution of this group. To address this issue, empirical distribution models were built for each of the 28 species studied. Their distributions were described at the beginning and the end of the twentieth century, in terms of presence-absence and abundance. Different types of explanatory variables were used, i.e. physical, climatic, biotic and anthropogenic. On the one hand, it was demonstrated that the distribution of diadromous fishes around 1900 was constrained by their biogeographical history and by the thermal and hydraulic characteristics of the continental habitat. Projection of these distributions, at the end of the twenty-first century, under climate change, highlighted the sensitivity of this group to climatic modifications. Responses were species-specific but could be classified into three categories: expansion of the distribution range, contraction of the distribution range and little or no change. On the other hand, for the first time at continental scale, the importance of large dams and human population density to explain the current diadromous fish distribution was demonstrated. The relationships seemed complex and to be dependent on the species’ ecological characteristics, particularly the position of their essential habitats along the river network and their place within the food web

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Toutant, Jean-Pierre. „Etude des cholinestérases : polymorphisme et interactions moléculaires, régulation de la synthèse des formes asymétriques, distribution tissulaire“. Paris 7, 1985. http://www.theses.fr/1985PA077087.

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Le présent travail porte sur les cholinestérases (acétylcholinestérase, AChE, EC 3117 et pseudocholinestérase, ΨChE, EC 3118) que j'ai étudiées à la fois par des techniques histochimiques et des techniques biochimiques. Les principaux résultats concernent d'une part le polymorphisme moléculaire de l'AChE et de la ΨChE (formes moléculaires, variation dans la structure des sous-unités catalytiques) et d'autre part la distribution tissulaire de l'AChE dans le muscle squelettique et la régulation physiologique de la synthèse des formes asymétriques d'AChE dans ce tissu. La thèse débute par un exposé sur la structure des molécules d'AChE des organes électriques d’Electrophorus et de Torpedo, basé sur le modèle proposé par le groupe de Jean Massoulié : l'enzyme peut présenter six types de structures quaternaires : Al2, A8, A4, G4, G2, G1. Le deuxième chapitre de la première partie présente des résultats expérimertaux portant sur l'AChE des organes électriques de la Torpille. Il existe un polymorphisme des sous-unités catalytiques de l'enzyme qui se superpose au polymorphisme des structures quaternaires. Trois types de sous-unités catalytiques sont mis en évidence : une sous-unité dc 76-80 kD qui correspond à des dimères hydrophobes ne comportant pas de ponts S-S intercaténaires, solubilisés à basse force ionique en absence de détergent (extrait LSS). Une sous-unité de 69 kD qui correspond à la majeure partie des dimères hydrophobes, associés par des ponts S-S, solubilisés en présence de détergent (extrait DS). Une sous-unité de 72 kD constituant des formes asymétriques solubilisées à haute force ionique (extrait HSS). . .

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BAHRI, TARUB. „Relations entre des variables environnementales et la distribution et structure de la biomasse de poissons pelagiques cotiers en mediterranee“. Paris 6, 2000. http://www.theses.fr/2000PA066023.

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La structure des bancs de petits pelagiques cotiers est etudiee en mers catalane et adriatique, l'influence de parametres environnementaux mesures in situ est examinee. L'analyse des facteurs environnementaux (a l'aide d'acp) montre des periodes d'echantillonnage marquees par les decharges d'eau douce de l'ebre et du po. Malgre des caracteristiques communes (revelees par la methode statis), chaque campagne possede une variabilite a petite echelle propre liee aux tempetes. La structure spatiale des descripteurs de bancs dans le plan horizontal est etudiee a l'aide de variogrammes calcules sur les moyennes par esdu et sur les mesures sur les bancs. Les descripteurs de position verticale montrent les structures spatiales les plus marquees. Les deux types de donnees (bancs et esdu) revelent une variabilite importante que nous avons tente d'expliquer par les tempetes. Descripteurs de bancs et variables environnementales sont relies a l'aide d'analyses de co-inertie, sous l'hypothese d'une stabilite des masses d'eau dans un rayon de 6-7 milles. La thermocline, l'halocline et les pics de fluorescence sont les variables les plus structurantes pour les bancs. Les resultats sont marques par des biais lies au comportement d'evitement des bancs, par des biais lies aux instruments acoustiques utilises et par la presence probable de plusieurs especes qui se traduit par des effets contradictoires de la thermocline et de l'halocline sur la position verticale des bancs. L'application de la methode statico a montre qu'aucun schema stable ne se degage de l'analyse de l'ensemble des campagnes. Nous avons verifie que cette importante variabilite n'etait pas liee a notre hypothese de depart en analysant les bancs a une plus petite echelle spatiale (a l'aide d'une regression pls). Le plan d'echantillonnage et la representativite des donnees sont discutes, ainsi que les choix methodologiques de cette etude. L'importante variabilite temporelle du processus etudie ici est egalement evoquee.

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Keith, Philippe. „Evolution des peuplements ichtyologiques de France et stratégies de conservation“. Rennes 1, 1998. http://www.theses.fr/1998REN10092.

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L'histoire de l'ichtyologie française est très riche et l'évolution des peuplements ichtyologiques d'eau douce a été très importante, notamment au cours des deux derniers siècles. Tel qu'il nous apparait actuellement, le peuplement ichtyologique de France est le fruit d'une multitude de phénomènes qui se sont déroulés ou se déroulent encore à différents pas de temps. L'étude des changements intervenus sur la période allant de la fin du tertiaire jusqu'à nos jours est fondamentale pour la conservation et la gestion de l'ichtyofaune. Bien des problèmes ou des conflits générés par les introductions d'espèces, par exemple, peuvent changer d'aspect lorsque l'on tient compte de la spécificité des bassins et de l'histoire de leurs peuplements. Ce travail étudie donc les apports de la biogéographie, de la paléontologie, de l'archéo-ichtyologie, de l'écologie et de l'histoire pour la compréhension de l'évolution des peuplements ichtyologiques de France. Il analyse en premier lieu les fossiles tertiaires et les restes archéo-ichtyologiques quaternaires en les replaçant dans le contexte européen et national, puis il étudie les répartitions historiques et actuelles des espèces à l'aide d'outils spécifiques. Il propose des peuplements de référence pour les grands bassins versants français, définissant un état de référence et permettant de comparer la répartition des espèces entre cet état et l'état actuel afin de mesurer l'impact des facteurs naturels et anthropiques sur l'évolution des peuplements dans les 5000 dernières années. Il établit, en liaison avec l'évolution des répartitions et des populations, la liste des espèces menacées, propose pour celles-ci, en liaison avec leur écologie, des mesures de conservation et l'établissement de plans d'actions ; enfin, il analyse le rôle des outils existants, notamment des espaces protégés, pour la conservation de l'ichtyofaune.

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Guo, Chuanbo. „Modélisation des effets des changements climatiques et des activités anthropiques sur les assemblages des poissons des lacs en Chine“. Toulouse 3, 2014. http://thesesups.ups-tlse.fr/2333/.

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La connaissance de la distribution spatiale des espèces et des communautés dans les écosystèmes est un préalable indispensable à la compréhension du fonctionnement et les processus des écosystèmes ainsi que les questions de conservation et d'aménagement du territoire. Dans le contexte des changements globaux, le changement climatique et les activités anthropiques sont reconnus comme des déterminants majeurs de la diversité et des patrons de distribution des poissons, affectant ainsi les propriétés et la structure des écosystèmes aquatiques. Cependant, très peu d'efforts ont été entrepris pour étudier la diversité et le fonctionnement de ces écosystèmes lacustres en Chine. Dans cette thèse, nous contribuons à mettre en évidence les effets des changements climatiques et des activités anthropiques sur les patrons de diversité et de distribution des poissons, ainsi que sur le fonctionnement des écosystèmes en nous appuyant sur des approches de modélisation écologique. Dans le premier temps, nous avons déterminé les distributions et les assemblages globales de 425 espèces et sous-espèces de poissons dans 135 lacs distribués à travers le territoire chinois en utilisant une nouvelle approche multi-espèce ajustée par l'arbre multi-variable de régression et connu sous le nom de MRT. Cinq assemblages de poissons ont pu être définis par la classification contrainte avec un total de 107 espèces indicatrices identifiées. Nous avons montré une différence significative de la diversité spécifique pour chaque assemblage : la diversité spécifique des poissons dans le plateau étant significativement plus faible que celle des lacs des plaines. Cependant, la diversité de l'assemblage de l'ensemble des plateaux est plus importante que celle d'autres régions. Par ailleurs, nos résultats indiquent que l'altitude, la température minimale du mois le plus froid, la gamme de température annuelle et les précipitations du mois le plus sec sont des facteurs important dans la détermination des assemblages et des patrons de distribution des poissons des lacs chinois. Dans un 2ème temps, le modèle MRT a été utilisé pour prédire la richesse spécifique et la distribution des espèces de poissons sous l'influence du changement climatique dans le but d'améliorer la gestion et la conservation des poissons en Chine. Nos résultats montrent que MRT est un modèle fiable et idéal pour prédire la communauté multi-spécifique de poissons. Au niveau de la composition spécifique, l'altitude apparait comme le meilleur des prédicteurs, suivi par les précipitations au cours du mois le plus sec, la gamme de température annuelle et la température annuelle moyenne. Pour la richesse spécifique, les précipitations au cours du mois le plus sec, la température maximale du mois le plus chaud et l'aire des lacs sont des facteurs majeurs pour prédire les patrons de distribution et de richesse des poissons. Dans un 3ème temps, nous examinons la capacité et l'incertitude associé aux modèles d'ensemble (c'est à dire à la combinaison des prédictions issues de diffrents modèles de distribution d'espèces (SDM)) pour prédire la distribution et la diversité des espèces de poissons. L'impact potentiel de 2 sources d'incertitude a été démontré : les caractéristiques des espèces (c'est à dire la prévalence des espèces, l'altitude, les gammes de températures et de précipitations) et les techniques de modélisation (méthodes de calibration et d'évaluation). Nos résultats montrent que les prédictions issues d'un simple modèle de distribution (SDM) est très variable et même douteuse pour l'ensemble des espèces considérée alors qu'une approche d'ensemble donne de meilleures prédiction. Nous avons aussi montré qu'il n'y a pas d'influence significative des méthodes d'évaluation sur les sorties du modèle. Nous montrons que les caractéristiques des espèces, la prévalence des espèces, l'altitude et la gamme de précipitations pourraient fortement affecter les résultats des SDMs, alors que la gamme de températures n'a pas d'influence significative. Finalement, nous avons vérifié l'hypothèse selon laquelle la distribution des espèces à faible aire de distribution peut être prédite avec plus de précision que la distribution des espèces à large échelle de distribution. Finalement, l'étude a été focalisée sur l'évaluation des effets des activités anthropiques sur la structure et les fonctions des écosystèmes lacustres peu profond riche en macrophytes (lac Bao'an, localisé dans la partie médiane du Yangtze) en utilisant le modèle ECOPATH. Les résultats montrent que les espèces de poissons commercialisables souffrent d'une très forte pression de pêche, tandis que les ressources fourragères comme les algues, les plantes immergés et les mollusques ne présentes pas de signe de surexploitation. En outre, nos résultats montrent que l'écosystème du lac Bao'an est un système "mûr" selon la théorie d'Odum. Cependant, comparé aux autres écosystèmes lacustres, le lac Bao'an, comme beaucoup d'autres lacs en Chine, montrent une très faible valeur de CI (Connectance Index), de FCI (Finn'sCycling Index) et de SOI (System Omnivory Index), indiquant que les fonctions de ces écosystèmes lacustres chinois ont tendance à être plus simple et plus linéaire que les écosystèmes lacustres d'autres pays. En conséquence, notre étude témoigne d'un besoin urgent d'orientation et de management des activités anthropiques, principalement le repeuplement et la pêcherie traditionnelle
Knowledge of the spatial distribution of species and communities in ecosystems is an essential prerequisite for the understanding of ecosystem functioning and processes as well as conservation and spatial planning issues. During the last several decades, in the context of global change, climate change and anthropogenic activities have long been acknowledged as the two main determinants which drive the fish diversity and distributions patterns, and ultimately affect the aquatic ecosystem properties and structure. However, up until now, very few efforts aimed at the fish diversity and ecosystem in the lakes across China. Consequently in the present study, we contribute to highlight the effects of climate change and anthropogenic activities on fish diversity and distribution patterns as well as the ecosystem properties with the approach of several ecological modelling. Specifically, we first build the global perspective on the fish distribution and assemblage patterns for a total of 425 fish species (subspecies) in 135 lakes across China using a novel multi-species approach fitted by the Multivariate Regression Tree (MRT). Five fish assemblages were defined by the constrained clustering, 107 indicator species were thus identified. Species diversity showed significantly differences among each assemblage: fish species richness in plateau lakes was significantly lower than plain lakes; however the diversity of the whole assemblage in plateaus was higher than other regions. Altitude, minimum temperature of the coldest month, annual temperature range and precipitation during the driest month were found to be the most important determinants affecting fish assemblages and distribution patterns in Chinese lakes. Then, MRT model was used to predict both species richness and species distribution in order to improve the management and conservation of fish species in China. Our results showed that MRT is a reliable and ideal community-based predictive technique for multi-species prediction. At the species composition level, altitude was the main determinant for the prediction, followed by precipitation of the driest month, temperature annual range and annual mean temperature. While at the richness level, precipitation of driest month, maximum temperature of warmest month and lake area were the main drivers for the prediction of the fish species richness pattern. Thirdly, we examine the capacity and uncertainty of ensemble modelling in predicting fish species distribution and diversity. Potential impacts from two main kinds of uncertainty sources were thus considered: species characteristics (contained species prevalence, altitude range, temperature range and precipitation range) and model techniques (calibration technique and evaluation technique). Finally, our results highlight that predictions from single SDM were so variety and unreliable for all species while ensemble approaches could yield more accurate predictions; we also found that there was no significant influence on the model outcomes from the evaluation measures; we emphasized that species characteristics as species prevalence, altitude range size and precipitation range size would strongly affect the outcomes of SDMs, but temperature range size didn't show a significantly influence; our findings finally verified the hypothesis that species distributed with a smaller range size could be more accurately predicted than species with large range size to be plausible in aquatic ecosystems. Lastly, a case study focused on evaluating the lake ecosystem properties and foodweb structure as well as the effects in a typical shallow macrophytic lake (Bao'an Lake, distributed in the middle reaches of the Yangtze River basin), using the Ecopath model. Finally, the results showed that all the commercial fish suffered from high fishing pressure while forage resources such as attached algae, submerged plants and molluscs were not fully utilized. Moreover, we highlight that the Bao'an Lake ecosystem was a mature system according to Odum's theory. However when compared with some other lake ecosystems, the Bao'an Lake ecosystem, as well as some China lake ecosystems, showed extremely low values of CI (Connectance Index), FCI (Finn's Cycling Index) and SOI (System Omnivory Index), indicating that the ecosystem functions and food web structure of these Chinese lake tended to be simpler and linear than lake ecosystems in other countries. Consequently, this study indicated an urgent need for the adjustment and management of artificial fishery stocking in such type of lakes. Our present study have pictured the global perspective of lake fish diversity and distribution patterns in China, defined the main determinants, and examined the potential effects of climate change and anthropogenic activities on fish diversity and ecosystem properties. Our results will benefit the conservation and management of fish resources, biodiversity, as well as the lake ecosystems all over the world

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Tirard, Claire. „Biodiversité et biogéographie évolutive dans les systèmes hôtes-parasites : le modéle Gadiformes (Téleostéens) - Copépodes et Monogènes“. Montpellier 2, 1991. http://www.theses.fr/1991MON20140.

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L'analyse de la speciation et de la specificite chez des monogenes (diclidophora) nous permet de reconsiderer non seulement la taxonomie, mais aussi l'histoire evolutive de leur groupe hote (trisopterus). Cependant, si une evolution de type phylogenetique est mise en evidence dans les associations trisopterus-diclidophora, l'etude concernant les populations de copepodes du genre lernaeocera (parasites du meme groupe hote) nous amene a decrire un phenomene de capture. Nous discutons de la repartition et de la structure des populations hotes (trisopterus luscus et merluccius merluccius) en atlantique et dans le nouvel environnement mediterranee et de leur role dans la dispersion des parasites (lernaeocera). Nos resultats montrent que l'hote de capture, m. Merluccius, est devenu, de par sa biologie particuliere, l'hote de capture, m. Merluccius, est devenu, de par sa biologie particuliere, l'hote preferentiel et largement majoritaire du copepode en mediterranee. Tous ceci se rapporterait a un phenomene d'effet de bascule (switching), consecutif aux variations de la disponibilite de l'hote d'origine (t. Luscus) dans les differentes zones geographiques (atlantique et mediterranee). Si la specialisation des monogenes diclidophora semble imposee par des contraintes phylogenetiques (nature physiologique et biochimique de l'hote), la specialisation des especes du genre lernaeocera pourrait dependre davantage de parametres ecologiques (abondance relative et/ou disponibilite des ressources)

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Kaimuddin, Awaluddin Halirin. „Impact du changement climatique sur la distribution des populations de poissons. Approche par SIG, modèles et scénarios d'évolution du climat“. Thesis, Brest, 2016. http://www.theses.fr/2016BRES0039/document.

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La compréhension des interactions liant la répartition des espèces, la biodiversité, les habitats marins et le changement climatique est nécessaire voire fondamentale pour la mise en oeuvre d’une gestion efficace de la conservation, par exemple la mise en place d’aires marines protégées. Dans cette étude, nous avons travaillé sur l’évolution de richesse de 89 espèces de poissons notées «rares» ou «exotiques» (observées en dehors de leur aire de répartition connue) lié au changement climatique. Nous avons modélisé et prédit leur distribution saisonnière par le modèle SIG en fonction de leurs niches écologiques (déterminée dans cette étude). En superposant tous les modèles en fonction du temps, cette approche permet d’identifier des zones d’occupation préférentielle de forte biodiversité (hotspots). La méthode offre une alternative pour mesurer la richesse d’espèces de façon saisonnière dans des zones peu connues, et de suivre leur mouvement au cours de temps, puis avoir information de base sur l’efficacité de positionnement des aires marines protégés liées à ces zones hotspots. La zone d’étude s’est située dans trois grands écosystèmes marins : le courant des Canaries, le plateau sud de l’Atlantique Européen et les mers celtiques. La région centrale est une zone de transition (entre les eaux tropicales et tempérés) connue pour sa sensibilité aux effets du changement climatique. De 1982 à 2012, la SST augmente constamment au fil du temps, avec des tendances et des magnitudes qui varient selon l’écosystème. Une augmentation du nombre d'espèces dans un écosystème dans une période a été généralement suivie par une tendance à la baisse ou à la hausse dans des écosystèmes adjacents. Les niches écologiques des espèces étudiées ont été estimées par l’extraction des valeurs environnementales à l’échelle mondiale au point d'occurrence au moment de l'observation. Les résultats de niches sont cohérents avec ceux obtenus à partir d’études observationnelles ou expérimentales. La flexibilité du modèle SIG nous a permis de suivre l'évolution saisonnière de distribution des espèces au fil du temps. En général, les espèces montrent une tendance à élargir leur distribution vers le nord, montrant l'effet du réchauffement de l'océan sur la distribution des poissons marins. L’approche de modèle peut être utilisée pour modéliser la distribution des espèces moins connues, ou dans des zones où les données d’occurrences sont peu nombreuses, ainsi que pour prédire le modèle de distribution future. L'analyse spatiale de la superficie des AMPs (Aires Marines Protégées) par pays appartenant à la zone d'étude, montre que le Royaume-Uni puis la France possèdent le plus grand nombre d'AMP ainsi que les superficies totales protégées les plus importantes. La fréquence à laquelle les AMPs (Aires Marines Protégées) sont touchées par les zones de hotspots est fortement influencée par les variations de l’environnement, les zones favorables évoluant alors au fil des saisons. Ainsi, il est important de prendre en compte les variations saisonnières pour la création des AMPs afin de préserver les capacités adaptative des espèces soumises au changement global
Understanding connectivities among species distributions, biodiversity, marine habitats and climate change is necessary for the design of an effective conservation management, such as in the implementation of marine protected area (MPA). In this study, we observed the richness of 89 "rare" or "exotic" fish species (observed outside their known distribution range) related to climate change. We modeled and predicted their seasonal distributions according to the species ecological niches (determined in this study) using the GIS model. Superposing the models of all species using GIS, we determined the preferential zones or zones of high biodiversity (hotspots) over time. The GIS approach offers an alternative to measure seasonal species richness in poor-data areas. This approach allowed also species track movement over time. This information could be then used to measure the effectiveness of MPA positioning related to the hotspot areas. Our study area covers a wide latitudinal range of the Eastern Atlantic waters, from the warm tropical/subtropical waters to the temperate waters. This area is located in three large marine ecosystems: the Canary current, the South European Atlantic Shelf and the Celtic Seas. The transitional zone in the central region has well known for its sensitivity to the detection of climate change. From 1982 to 2012, the SST in all of studied ecosystems has increased consistently over time, with magnitude and trend varied among ecosystems. The change of number of species in each decadal period differed among ecosystems. Increasing number of species in an ecosystem was generally followed by decreasing trend in adjacent ecosystems. Species ecological niches were obtained by extracting the environmental values in the location of species occurrence at the time of observation. The environmental data and the occurrence records used were at global scale, and the methods yields coherent results with the results obtained from observational studies. The flexibility of GIS Model used in this study allowed us to follow the evolution of species seasonal distribution over time. Generally, most of the studied species showed a northbound trend in their distribution. These northbound tendencies were more evident in the middle region, confirming the effect of global warming in shifting marine species distribution. This approach provides an alternative of measuring seasonal richness of poor-known species and/or modeling in poor-data areas. The results present a complete picture of predictive number of species in an area over time. MPAs superficial analysis by country (countries lying in the study area) showed that UK has the highest number of MPA and the largest protected areas, following by France and Mauritania. Frequencies of the MPAs touched by the hotspot were strongly influenced by seasonal variations. Thus, considering seasonal variations in a conservation effort could preserve species adaptive variation under environmental changes. Overall, our works provide several alternative methods for species distribution studies and for studies poor-known species in data-poor area. The results provide evidences of ocean warming effect in shifting marine fish distribution

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Blanquer, Anne. „Phylogéographie intraspécifique d'un poisson marin, le flet Platichthys flesus L. (Heterosomata) : polymorphisme des marqueurs nucléaires et mitochondriaux“. Montpellier 2, 1990. http://www.theses.fr/1990MON20015.

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Le polymorphisme genetique et la structure geographique des populations de flets platichthys flesus l. , ont ete etudies a partir de resultats obtenus par deux techniques d'analyse, l'electrophorese des proteines enzymatiques et le plfr de l'adn mitochondrial. Ces deux techniques permettent d'obtenir des informations complementaires provenant de deux compartiments du genome ayant des caracteristiques evolutives differentes (adn mit. Transmis maternellement). Nous cherchons a determiner des unites genetiques et a proposer des hypotheses sur leur origine et leur maintien, en relation avec les facteurs biologiques, environnementaux et biogeographiques. Huit locus enzymatiques polymorphes et 80 fragments de restriction ont ete analyses. Trois sous-unites genetiques ont ete mises en evidence: le golfe du lion, la region du portugal, et l'ensemble mer du nord-manche-kattegat. En desaccord avec les predictions, les divergences genetiques revelees par electrophorese des proteines sont plus importantes que celles montrees par les marqueurs mitochondriaux. Nous discutons les caracteristiques et l'utilisation de ces marqueurs et proposons une hypothese paleographique sur l'origine des populations de flets en europe

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Aguilar, Ibarra Alonso. „Les peuplements de poissons comme outil pour la gestion de la qualité environnementale du réseau hydrographique de la Garonne“. Phd thesis, Toulouse, INPT, 2004. http://oatao.univ-toulouse.fr/7394/1/aguilar.pdf.

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Cette étude concerne le bassin hydrographique de la Garonne en utilisant les communautés piscicoles comme outils d'analyses et de gestion de la qualité environnementale. La première partie aborde l'approche globale à l'échelle du bassin versant. La diversité du peuplement de poissons a été étudiée selon le profil longitudinal et les guildes, en relation avec les facteurs environnementaux. Les variables utilisées sont la composition spécifique des peuplements ainsi que les caractéristiques physico-chimiques et topographiques du chaque cours d'eau. L'analyse statistique s'effectue par des méthodes multivariées, y compris les réseaux de neurones artificiels. La deuxième partie concerne l'approche à l'échelle locale. Deux cas d'anthropisation ont été étudiés. L'un porte sur la dégradation du milieu par le rejet d'une usine de pâte à papier. L'indice de comparaison abondance-biomasse est utilisé afin d'évaluer le stress au sein du peuplement de poissons. L'autre cas étudie une rivière à truites soumise aux débits réservés et à la pêche de loisir. L'analyse s'effectue selon le modèle de Ricker (stock-recrutement) pour estimer un seuil de conservation. Les résultats montrent l'importance de la caractérisation des peuplements de poissons, de leurs habitats, de l'échelle spatiale de l'étude, de la prise en compte de l'hétérogénéité du paysage et l'application des approches mathématiques pour la gestion de la qualité environnementale des grands bassins.

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Morin, Bernard. „Description et distribution de la communauté de poissons à Wemindji, Baie de James, et écologie de la morue du Groenland (Gadus ogac)“. Thesis, McGill University, 1990. http://digitool.Library.McGill.CA:80/R/?func=dbin-jump-full&object_id=60425.

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The coastal fish community of Wemindji, eastern James Bay, was studied to describe seasonal utilization of the Maquatua River estuary and the adjacent coastal waters by marine and anadromous fishes. During summer, the estuarine fishes are numerically dominated by the fourhorn sculpin (Myoxocephalus quadricornis) and the slender eelblenny (Lumpenus fabricii), and also by juvenile cisco (Coregonus artedii) and whitefish (C. clupeaformis). In coastal waters, three marine species are abundant: the shorthorn sculpin (M. scorpius), the arctic sculpin (M. scorpioides) and the Greenland cod (Gadus ogac).
Greenland cod were studied in the same period. During the summer, they principally occupied shallow coastal waters, characterized by a belt of eelgrass (Zostera marina). In winter, more cod were found in the estuary. This movement corresponds to sexual maturity; spawning occurs in April to June. Greenland cod life history variables differ from those of most arctic benthic fishes: they show rapid growth, high fecundity, low age at first maturity and high mortality.

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Sholihah, Arni. „Diversification des biotas aquatiques de Sundaland : accumulation de la biodiversité chez les poissons d'eau douce et distribution dans un hotspot de biodiversité“. Thesis, Montpellier, 2020. http://www.theses.fr/2020MONTG024.

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Sundaland est l'un des points chauds de biodiversité les plus menacés, en raison d’une augmentation rapide des menaces au cours des dernières décennies. Couvrant la péninsule malaise, Sumatra, Java et Bornéo, cette région possède l'une des plus grandes richesses en espèces et endémisme pour les vertébrés, y compris les poissons d'eau douce. Cette biodiversité a longtemps attiré l'attention des biologistes évolutionnistes, notamment en raison de la complexité de l'histoire géologique de Sundaland. Cette question a été abordée en explorant les patrons de fragmentation et dispersion durant la diversification des espèces de poissons d'eau douce de Sundaland. Ainsi, j'ai d'abord cherché à évaluer la correspondance entre la distribution des lignées moléculaires de plusieurs taxons avec les limites des paléorivières en ré-analysant les données moléculaires existantes avec une couverture biologique et spatiale représentative en Asie du Sud-Est (en particulier pour Sundaland). Deuxièmement, je me suis concentré sur l’estimation de l’âge des clades et de la répartition géographique des lignées de Rasborinae, un groupe répandu et extrêmement diversifié de poissons d’eau douce primaires du Sundaland, pour tester l’hypothèse des Paléorivières du Pléistocène en utilisant des données empiriques nouvellement générées. Sur les deux études, je me suis posé les questions suivantes: 1) les paléorivières servaient-elles de corridors de dispersion entre les îles pendant les périodes glaciaires du Pléistocène; 2) les bassins versants des paléorivières ont-ils initié une divergence allopatrique à travers leurs frontières; et 3) les fluctuations climatiques du Pléistocène ont-elles augmenté les taux de speciation. Dans l'ensemble, un niveau élevé de diversité cryptique est observé. Les aires ancestrales inférées révèlent une origine continentale des lignées de poissons d'eau douce de Sundaland, datée à l'Oligocène. Ce résultat valide l'hypothèse d’une installation pré-pléistocène. Ces lignées sont entrées à Sundaland par la paléorivière de la Sonde Nord à Bornéo et se sont dispersées par la suite via une dispersion à longue distance, souvent suivie de diversification in situ. Ces résultats suggèrent que la partie de Bornéo de la paléorivière de la Sonde Nord est le centre d'origine le plus probable des poissons d'eau douce de Sundaland. Contrairement à l'hypothèse initiale que l'abaissement du niveau de la mer en périodes glaciaires reconnecte les bassins versants au sein des paléorivières, cela n'ouvre pas nécessairement de canaux de dispersion inter-îles pour les poissons d'eau douce. Les couloirs de savane et d'écosystèmes forestiers saisonniers à l'intérieur du Sundaland ont servi de barrière à la dispersion. En outre, la perméabilité des limites physiques des bassins versants des paléorivières, ainsi que les variabilités géomorphologique et écologique ont créé temporairement des flux de gènes. Bien qu'une proportion significative des lignées de poissons d'eau douce du Sundaland datent du Pléistocène, nous avons constaté que la dynamique du Pléistocène n'affectait pas le taux de diversification. Les modèles de diversification dépendant du niveau de la mer expliquent mal les schémas de prolifération des espèces pour tous les clades, à l'exception de Channa. En outre, aucun des taxons examinés ne présente de taux de diversification en baisse comme le suggère le modèle de diversification dépendante de la diversité (DDD). Il est suggéré alors que les fluctuations eustatiques du Pléistocène et la dynamique des paléorivières ne sont pas les seuls moteurs de la diversification des poissons d'eau douce du Sundaland, mais seulement une partie des aspects abiotiques qui l'affectent. Les fluctuations climatiques du Pléistocène ont probablement interagi avec d'autres facteurs tels que: la géomorphologie du paysage, la variabilité des écosystèmes et les caractéristiques biologiques des organismes
Sundaland is one of the most threatened biodiversity hotspots, experiencing a fast increase of threat levels during last decades. Covering Malayan Peninsula, Sumatra, Java and Borneo, this hotspot has one of the highest species richness and endemism for vertebrates in SEA, including freshwater fishes. This level of biodiversity has long attracted the attention of evolutionary biologists, particularly by considering effects of Sundaland complex geological history. This study addressed it by exploring time frame of vicariance and dispersal during diversity build-up of freshwater fish species in Sundaland. To support this, we first aimed to assess the match between distribution of molecular lineages from multiple taxa with palaeoriver boundaries using metadata analysis of existing molecular dataset with representative biological and spatial coverage in Southeast Asia (especially in Sundaland). Second, we focussed on estimating clades’ age and geographic distribution of Rasbora lineages in relation to the Pleistocene Palaeoriver Hypothesis by utilising newly generated empirical data for Rasborinae, a widespread and extremely diversified group of primary freshwater fishes in Sundaland. On both steps, we questioned: 1) if palaeorivers served as corridors of dispersal between islands during Pleistocene sea levels low stands; 2) if palaeoriver watersheds initiated allopatric divergence across their boundaries; and 3) if Pleistocene climatic fluctuation increased rates of species diversification. Overall, this study detected high level of cryptic diversity. Ancestral area reconstructions revealed that Sundaland freshwater fish lineages originated from Mainland Asia, and further colonised the region since Oligocene. This result validated the pre-Pleistocene settlement hypothesis. These lineages entered Sundaland mainly through North Sunda palaeoriver in contemporary Borneo and dispersed to other parts of Sundaland via long distance dispersal, often followed by in situ diversification. These results suggest Bornean part of North Sunda palaeoriver is the most likely centre of origin for Sundaland freshwater fishes. Contrary to the initial hypothesis, we found that although lowered sea level during glacial periods reconnected watersheds within palaeorivers, it did not necessarily open up inter-island dispersal channels for freshwater fishes. Corridors of savanna and seasonal forest ecosystems in the interior of Sundaland served as barrier to dispersal. Also, permeability of the physical boundaries of palaeoriver’s watersheds as well as geomorphological and habitat variabilities within palaeoriver created respectively gene flow between palaeorivers and allopatric speciation within palaeoriver. Moreover, although significant proportion of Sundaland freshwater fish lineages originated during Pleistocene, we found that Pleistocene dynamics did not affect diversification rate as sea level-dependent diversification models poorly account for species proliferation patterns for all clades excepting Channa. Besides, none of the taxa examined has declining diversification rates as suggested by diversity-dependent diversification (DDD) model. It is suggested then that global Pleistocene eustatic fluctuation and regional paleoriver dynamics are not sole drivers for Sundaland freshwater fish diversification, but only a part of abiotic aspects affecting it. Pleistocene Climatic Fluctuations likely interacted with other factors such as: landscape geomorphology, local ecosystem/habitat variability and life history traits of organisms

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Des, Clers Sophie. „Contribution à la biologie des populations de brochets (Esox lucius, Linné 1756) : étude de la répartition spatio-temporelle et estimations des probabilités de capture et de survie à partir des données de marquage et recaptures multiples“. Lyon 1, 1985. http://www.theses.fr/1985LYO11679.

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Taillebois, Laura. „Endémisme et dispersion chez les Gobiidae Sicydiinae : traits d'histoire de vie et histoire évolutive“. Paris, Muséum national d'histoire naturelle, 2012. http://www.theses.fr/2012MNHN0012.

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La sous-famille des Sicydiinae (teleostei : Gobioidei) représente la plus grande part de la biodiversité des communautés de poissons dans les rivières des îles tropicales. On trouve des représentants dans les systèmes insulaires de l'Indo-Pacifique, des Caraïbes et de l'Afrique de l'ouest. Leur cycle de vie est particulièrement bien adapté aux conditions de ces habitats qui sont oligotrophes et soumis à de fortes variations saisonnières hydrologiques et climatiques. Ces espèces se reproduisent en eau douce et, à l'éclosion, les larves sont entrainées par le courant vers la mer où elles vont passer une phase de vie plancto-pélagique. A l'issue de cette phase, elles retournent en rivière pour grandir et se reproduire. La réalisation de la phylogénie complète des Sicydiinae, avec cinq gènes et incluant tous les genres connus, soutient la monophylie de la sous-famille. Elle a permis d'appréhender l'évolution de celle-ci et de replacer les genres les uns par rapports aux autres, avec un focus particulier sur le genre Smilosicyopus. En effet, l'effort d’échantillonnage a permis de collecter l'ensemble des espèces décrites de ce genre et de valider la taxonomie et les distributions des sept espèces connues. Les traits de vie étudiés de certaines de ces espèces, sélectionnées pour leur caractère endémique ou la large répartition, parmis lesquelles : Sicyopus zosterophorum, Smilosicyopus chloe, Smilosicyopus fehlmanni et Akihito vanuatu ont été analysés. La microanalyse chimique du rapport Sr:Ca a tout d'abord permis de confirmer leur amphidromie. Les ratios Ba:Ca et Sr:Ca dans la phase adulte ont révélés quatre types de profils dont les différences pourraient être attribuées à la géomorphologie des rivières et la variabilité de l'environnement traversé par le poisson. Aucun comportement migratoire le long de la rivières n'a été mis en évidence pour ces espèces, ce qui confirme les hypothèses concernant leur sédentarité à l'état adulte dans les parties moyennes et hautes des cours d'eau. Nous montrons aussi que la durée de phase larvaire (DPL) marine est la même pour les espèces étudiées, qu'elles soient endémiques ou à répartition plus large (55 jours en moyenne). La DPL marine ne jouerait donc pas, dans le cas des espèces étudiées, un rôle prépondérant dans la distribution des taxons et dans l'établissement de l'endémisme ; d'autres facteurs sont à prendre en considération. Nous avons analysé les gènes mitochondriaux du COI et du Cytb ainsi que le gène nucléaire de la Rhodopsine chez trois des quatre espèces sélectionnées et échantillonnées dans toute leur aire de répartition. La diversité génétique est élevée pour les trois espèces qui présentent cependant des patrons de connectivité bien différents. Chez Smilosicyopus fehlmanni, largement réparti, la connectivité entre les populations est importante, ce qui indique que pour cette espèce, ni la fragmentation de l'habitat, ni les courants océaniques n'a crée de barrière aux flux de gènes. En revanche, nous avons pu mettre en évidence une très forte structure génétique entre deux zones géographiques, de part et d'autre du détroit de Torres, chez l'espèce à large répartition Pacifique S. Zosterophorum. Cette séparation est datée, grâce aux données moléculaires à environ 300 000 ans. Les variations du niveau marin durant le Pléistocène ont permis l'établissement d'une barrière géographique intermittente entre l'Australie et la Papouasie au cours des 250 000 dernières années. Cette barrière biogéographique est mise en avant pour expliquer la séparation des deux populations de S. Zosterophorum mise en évidence. Nos résultats montrent ainsi que les patrons d'évolution des espèces sont complexes et dépendants de nombreux facteurs
The Sicydiinae subfamily (Teleostei : Gobioidei) is the biggest contributor to the diversity of fich communities in tropical insular river systems. These species are found in the Indo-Pacific area, the Caribbean region and West Africa. They spawn in freshwater, their planktotrophic larvae drift downstream to the sea where they begin a planktonic life phase before returning to the rivers to grow and reproduce. The phylogeny of the Sicydiinae, realised with five markers (including a new one) and including all known genera, supported the monophyly of the subfamily. This work allowed us to understand the evolution of the group and to focus on Smilosicyopus genus. Indeed, the sampling effort made through the central Pacific ocean, concerning Smilosicyopus species, allowed us to collect all species from this genus and to confirm, or not, their taxonomy and their distribution range. Thus, species life history traits can be attributed surely to the concerned one. Life history traits of several species, belonging to different genera, among which Sicyopus zosterophorum, Smilosicyopus chloe, Smilosicyopus fehlmanni and Akihito vanuatu were analysed. These species were chosen owing to their differences in their distribution range from endemism to widespread species. Microchemical analysis of the Sr:Ca ratio in the otolith confirmed the amphidromous life cycle of the studied species. The Ba:Ca and Sr:Ca ratios in the adult life phase revealed four types of patterns, and we suggest that the river geomorphology and the variability in the fish environment could be responsible for such different patterns. No inland migratory behaviour was revealed for these species, confirming the hypothesis of their adult sedentarity in middle and higher courses of river. Otolith microstructure of the studied species was also analyzed. Deposition of the daily growth increments on the otoliths of S. Zosterophorum was validated using an alizarin red S time marking technique. We estimatd the pelagic larval duration (PLD) by counting the number of growth increments from the core to the metamorphosis check mark, and it was shorter, for all the studied species, than the one of previous studie on Sicydiinae species. The PLD of the widespread species, S. Zosterophorum was similar to those of the endemic species, S. Chloe and A. Vanuatu (around 55 days). Here we show that in contrast to the most diverse Sicydiinae genus, Sicyopterus, the PLD could not explainendemism and we must take into account other elements to explain the differences observed in the distribution range. Contrasting patterns of genetic structure and probably a distinct biogeographic history could explain such differences. The analysis of the population connectivity over the sampled region revealed these contrasting patterns. The connectivity among Smilosicyopus fehlmanni populations ( a species with a large distribution range) was high, suggesting that for this species, neither the fragmentation of freshwater habitat nor the oceanic currents surrounding the West Pacific ocean created significiant barriers to gene exchanges. But, S. Zosterophorum, another large distribution range species, displayed a deep division into two haplogroups with one retsricted to the northwest Pacific and the other restricted to the southwest Pacific. The estimated time of divergence between the two populations of S. Zosterophorum (i. E 306 kyr) is coherebr with a Pleistocene separation, produced by the Torres strait barrier. Pleistocene event may have shaped the genetic pattern observed in the present days on both side of the Torres Strait. Our results showed that the evolution and dispersion patterns of Sicydiinae are complex and depending of numerous factors

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Durand, Jean-Dominique. „La phylogéographie du chevaine, Leuciscus cephalus : validation d'hypothèses biogéographiques sur les cyprinidae en Europe“. Lyon 1, 1999. http://www.theses.fr/1999LYO10308.

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Sadhotomo, Bambang. „Bioécologie des principales espèces pélagiques exploitées en mer de Java“. Montpellier 2, 1998. http://www.theses.fr/1998MON20184.

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Cette etude est une synthese des aspects environnementaux, biologiques et ecologiques des principales especes de la mer de java. Les relations indirectes entre ces aspects, et l'evaluation du stock de la mer de java sont discutes. L'hydrologie de la mer de java est principalement dirigee par la variabilite climatique. La mousson engendre le gradient de la salinite et de la masse d'eau dans axe ouest-est, de meme qu'elle induit l'effet de masse continentale sur la productivite de la region cotiere. Ces phenomenes influencent la repartition de l'abondance et le schema de migration des poissons pelagiques. Deux types de migrations sont supposes dans cette etude, c'est a dire celui de la phase planctonique et celui de la phase nectonique. Nous supposons que le stock de la mer de java est une part d'une large population s'etendant du sud de la mer chine meridionale a la mer de flores. La repartition des tailles par zones et epoques montre un mouvement interne possible de l'agregation du poisson et une emigration des adultes vers la direction nord-est, ce qui survient simultanement avec l'immigration provenant de la mer de flores pendant la mousson de sud-est. La migration saisonniere peut etre consideree comme le principal facteur influencant les oscillations de croissance qui sont apparemment observees pour les especes migrantes. Au cours de l'annee, deux recrutements existent. Ils prennent place au debut de chaque mousson. Dans les zones, le recrutement principal s'effectue en mousson de sud-est. Les recrues ne proviennent pas de la cohorte dominante relevee l'annee precedente. Les observations acoustiques indiquent l'existence d'une stratification de l'agregation du poisson selon deux axes nord-sud et ouest-est. Dans la region prospectee, trois strates sont distinguees : une zone ouest, une zone centrale et une zone est. Pendant la saison humide, la partie ouest serait occupee par des especes neritiques (d. Russellii), alors que, pendant la saison seche, les bancs rencontres seraient composes d'un melange de jeunes poissons de l'espece precedente et d'individus appartenant aux especes cotieres. Tout au long de l'annee, la zone est (du banc de matasiri a la pente continentale) est occupee par les especes oceaniques ou un melange d'especes migrantes. Ces stratifications sont relatives au schema migratoire decrit plus haut. La plupart des poissons occupant la mer de java est jeune et immature. La comparaison de la biomasse theorique et capturee est en accord avec l'argumentation de l'emigration du poisson adulte vers la region est. L'interaction entre la pecherie semi-industrielle et artisanale semble apparente ; la derniere pecherie exploite la taille plus petite. Les pecheries javanais exploitent seulement une partie des stocks et l'etude de l'amenagement devrait couvrir l'ensemble du stock.

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Sarré, Abdoulaye. „Approche acoustique de la dynamique et la distribution spatiale des ressources halieutiques de petits pélagiques dans l'upwelling sénégalo-mauritanien“. Thesis, Brest, 2017. http://www.theses.fr/2017BRES0062/document.

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Le long des côtes nord-ouest africaines, parmi les plus poissonneuses au monde, les ressources halieutiques sont importantes tant du point de vue socio-économique que culturel. Les petits poissons pélagiques sont suivis au niveau sous régional depuis plus de trois décennies en s’appuyant sur les méthodes hydroacoustiques d’évaluation de stocks. Ces campagnes ont ainsi permis de fournir aux gouvernants une base scientifique en matière de prise de décision à des fins d’aménagement des pêcheries pélagiques. Un défi spécifique est de connaitre leur représentativité par rapport aux stocks ciblés. Nous rassurons sur cette représentativité sur la couverture de Sardinella aurita par ces campagnes. Par contre, pour S. maderensis une partie du stock ne serait pas échantillonnée et la méthode n’est pas adaptée pour Illisha africana et Ethmalosa fimbriata. Nous reportons des déplacements vers le nord dans la répartition de S. aurita et d’autres espèces de pélagique, attribués à la redistribution de l'intensité et de la productivité des upwellings [découpé en 5 sous zones du sud Maroc au sud Sénégal], diminuant ainsi l’abondance de la sardinelle dans la région côtière intertropicale. Pour la première fois en utilisant des séries chronologiques d'observation indépendantes à la méso-échelle, nous montrons un changement vers le nord dans la distribution de S. aurita depuis 1995 et l'attribuons au fort réchauffement de l'océan dans la région. De plus les changements spatiaux observés dans la biomasse de S. aurita au cours des 20 dernières années sont du même ordre de grandeur que ceux enregistrés pour les isothermes de surface. De tels changements auront une incidence sur les considérations politiques dans la gestion de la sécurité alimentaire dans plusieurs pays d'Afrique de l'Ouest
Along the coast of North-West Africa, among the richest waters over the word, fish supply is important at both socio-economic and cultural levels. In this region, the small pelagic fish are the most abundant marine resources and are monitored using hydroacoustic stock assessment methods since more than three decades. These surveys have allowed providing to local authorities a sound scientific basis for deciding about the management of pelagic fisheries. A specific challenge is to know the representativity of these surveys with respect to the stocks targeted. In this work, we confirm this representativity for Sardinella aurita stock while for S. maderensis, a part of the stock could have not been sampled and for pour Ilisha africana and Ethmalosa fimbriata these surveys are not the best tool. Furthermore, Northward shifts in the distribution of sardinella in the Canary Current Large Marine Ecosystem are recorded in this work and have been attributed to the redistribution of upwelling intensity and productivity, resulting in the abundance of sardinella decreasing in the inter-tropical coastal region. Here for the first time using independent observational time series, we report a robust northward shift in S. aurita since 1995 and attribute it to the strong ocean warming in the region. The observed spatial shifts in biomass in the last 20 years are of the same order of magnitude as those recorded for surface isotherms. Such changes will impact policy considerations in the management of food security in several West African countries and should be considered with respect to “Intended Nationally Determined Contributions”

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Mérigoux, Sylvie. „Variabilité spatio-temporelle de l'environnement et structure des peuplements de juvéniles de poissons : cas d'un fleuve intertropical soumis à un aménagement hydroélectrique“. Lyon 1, 1998. http://www.theses.fr/1998LYO10261.

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En systemes lotiques, les hypotheses des concepts du patch dynamics et du river habitat templet predisent que la richesse specifique et les combinaisons de traits biologiques des especes changent selon la variabilite spatio-temporelle de l'environnement. J'ai teste ces hypotheses avec les communautes de jeunes poissons du sinnamary (guyane francaise) en conditions naturelles en milieux soumis aux perturbations d'un barrage. J'ai realise 200 peches d'une surface d'environ 50 m 2, par empoisonnement a la rotenone, afin d'obtenir les caracteristiques des communautes de poissons de ces habitats. J'ai decrit la variabilite temporelle (c'est-a-dire la variabilite de l'hydrologie) et spatiale (par exemple la variabilite de la profondeur, des debris organiques et du substrat) de ces 200 echantillons. Pour chaque echantillon, j'ai egalement determine les conditions d'etat (conditions moyennes) de nombreux parametres du milieu. Mon travail a permis d'inventorier les jeunes stades de 73 taxons (60% des especes du sinnamary) et confirme ainsi le role de nurserie des affluents de ce fleuve et de leurs zones d'inondation associees. J'ai decrit pour les 57 taxons les plus abondants les trois strategies vitales d'equilibre, d'opportuniste et de periodique definies par winemiller (1989). Les predictions du patch dynamics concept ne sont pas validees par mon travail ; je n'ai pas observe une richesse maximale pour une variabilite temporelle intermediaire et une variabilite spatiale maximale. Les predictions de l'habitat templet concept sont partiellement confirmees. Ainsi, la taille a la premiere maturite, le diametre des oocytes et la hauteur relative du corps des jeunes stades diminuent avec une augmentation de la variabilite temporelle tandis que la taille a la premiere maturite et le diametre des oocytes augmentent avec la variabilite spatiale. En considerant la variabilite et les conditions d'etat de l'habitat, j'ai pu predire en conditions naturelles, 37% et expliquer 47% de la variabilite de la richesse specifique et 34% de la variabilite biologique. L'approche sur les traits biologiques developpee dans cette these ouvre des perspectives pour evaluer de maniere pertinente la diversite fonctionnelle des communautes aquatiques.

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Roy, Romain. „Distribution spatiale et activité des poissons en milieu lacustre - Impacts des facteurs environnementaux à partir d'une approche multi-échelle. Application à la retenue des Bariousses“. Thesis, Aix-Marseille, 2014. http://www.theses.fr/2014AIXM4326/document.

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Le fonctionnement des milieux aquatiques d’origine anthropique est étroitement dépendant des usages ; l’environnement des communautés biologiques est donc généralement fluctuant. L’étude du lien entre environnement et organisme est alors plus complexe que dans les environnements stables. Ce travail de thèse vise à mieux comprendre comment l’ichtyofaune réagit face aux changements des conditions environnementales dans une retenue soumise à marnage, la retenue des Bariousses, située sur la Vézère.Une approche multi-échelle à la fois biologique (communauté et individus) et temporelle (cycles annuel et journalier) a été adoptée. Une attention particulière a été donnée à la zone littorale car elle joue un rôle crucial pour les communautés piscicoles des milieux lacustres et constitue la première zone affectée par les variations du niveau de l’eau. L’étude se décompose en quatre parties. La première présente les caractéristiques du site d’étude et la seconde décrit l’impact des variations du niveau de l’eau sur les habitats à partir d’une analyse cartographique de la zone littorale. Les conséquences de la contrainte hydrologique via les modifications des conditions d’habitats ont été ensuite analysées en parallèle des effets de la température de l’eau et de la photopériode. Ensuite, la troisième partie présente l’effet de la variabilité temporelle des conditions environnementales, induites par les variations du niveau de l’eau, sur la composition de la communauté littorale (échantillonnage par pêche électrique). Un système innovant de positionnement par télémétrie acoustique (Vemco Positioning System) a finalement permis dans une quatrième partie d’étudier cet impact à un niveau individuel en analysant le comportement de 90 individus de trois espèces différentes (sandre, brochet et perche commune) avec une précision satisfaisante (erreur moyenne de 3.3 m après filtration). Nous avons mis en évidence que les fluctuations du niveau de l’eau induisent une variabilité temporelle de la surface et du volume occupés par la zone littorale. De plus, une diminution progressive de la complexité structurelle des habitats littoraux avec une tendance à l’homogénéisation (dominance des substrats fins et de l’absence de végétation) est observée suite à un abaissement du niveau de l’eau. Malgré ces changements des conditions d’habitats induites par les variations du niveau de l’eau, la communauté piscicole littorale n’a pas montré de nets changements de composition. Une forte variabilité inter individuelle des réponses comportementales aux fluctuations environnementales est notée mais, la température et la photopériode représentent deux paramètres structurant majeurs de l’activité et du choix des habitats. Le niveau d’eau affecte une partie du peuplement, certains individus fréquentent davantage la zone littorale et sont moins mobiles lorsque les habitats accessibles en bordure sont plus complexes (niveau d’eau élevé). Ces résultats ont permis de proposer quelques pistes de réflexion sur la gestion des niveaux d’eau sur cette retenue, en lien avec le peuplement de poissons
Aquatic ecosystem functioning in human-impacted environments is highly dependent of its uses; in consequence, the environment of biological communities is generally fluctuating. Studying the link between environment and organism in fluctuating environments is generally more complex compared to steady environments. The main objective of this work was to better understand how fish populations respond to environmental modifications in a reservoir affected with water level fluctuations (WLF), the Bariousses’s reservoir located on the Vézère River.A multiscale approach was used with different biological (community and individual) and temporal (annual and daily cycles) scales. A special attention was given to the littoral zone as it plays a key role for lake fish communities and since it is strongly affected by WLF. This work is divided in 4 parts. The first part presents the characteristics of the study site and the second part describes the impact of WLF on the studied habitats using a mapping of the littoral zone. The consequences of hydrological stress through the changes in habitat conditions were also analyzed as well as the effects of water temperature and photoperiod. The third part shows the effect of the temporal variability of environmental conditions induced by WLF on the composition of the littoral fish community (sampled by electrofishing). The fourth part presents an innovative positioning system acoustic telemetry (Vemco Positioning System) that was used to study the impact of WLF at the individual scale by analyzing the behavior of 90 individuals from three different fish species (pikeperch, pike and perch) with a satisfactory accuracy (average error of 3.3 m after filtration).The results of this work showed that WLF induced a temporal variability of the littoral zone surface and volume. In addition, a gradual decrease of the structural complexity of littoral habitats was associated with lower water level inducing a trend to homogenization (dominance of thinner substrates without vegetation). Despite these changes in habitats conditions induced by WLF, littoral fish community did not show any clear change in composition. High inter-individual variability of behavioral responses was observed in response to environmental fluctuations, but the temperature and photoperiod were the two major structural parameters controlling fish activity and spatial distribution. Water level affected a part of the fish population since more individuals attended the littoral zone and were less mobile when available habitats were more complex (with a high water level). These results allowed us to suggest some ideas for the management of water levels in the studied reservoir focused on the fish population

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Chan, Bunyeth. „Dynamique spatiale et temporelle des espèces et de communauté de poissons dans le système d'inondation pulsé de Tonle Sap“. Thesis, Toulouse 3, 2018. http://www.theses.fr/2018TOU30244/document.

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Le lac Tonle Sap (TSL) est l'un des plus grands lacs du monde et est connu comme un hot-spot de la biodiversité en Asie du Sud-Est. En raison de la grande diversité ainsi que de la productivité élevée de poissons, le lac contribue à un apport important en protéines pour la population cambodgienne. Cette étude vise principalement à étudier (1) la dynamique spatiale et temporelle de la composition des communautés de poissons, (2) les effets des facteurs environnementaux sur la distribution des espèces et (3) l'effet de l'abolition des lots de pêche sur la biomasse, les communautés de poissions et le structure des poissons. En utilisant des méthodes statistiques multivariées sur les données de poissons et de variables environnementales, je suis en mesure de mettre en évidence les principales conclusions suivantes: * Les communautés de poissons du TSL étaient composées de deux assemblages de poissons: l'assemblage du nord, principalement caractérisé par des poissons noirs, et l'assemblage du sud, principalement lié aux poissons blancs, gris et estuariens. Les assemblages de poissons de la période 1994-1995 étaient représentés par l'abondance de tous les groupes fonctionnels, c'est-à-dire les poissons noirs, blancs et gris, et pour la période de 1996 à 1999, les assemblages étaient liés aux poissons blancs et gris. * Les distributions des abondances espèces de poissons n'étaient pas homogènes dans le TSL. De plus, les aires de distributions des espèces étaient différentes et étaient régies par des combinaisons distinctes de caractéristiques de l'habitat et de facteurs climatiques. * H. lobatus et H. siamensis peuvent coexister ensemble, mais la synchronisation et la migration de H. lobatus conduisent toujours à celles de H. siamensis. Ces résultats suggèrent que la population de H. lobatus est plus sensible aux variations d'impulsion de flux que celles de H. siamensis. Ceci indique que les variations des impulsions d'écoulement sont les principaux déterminants responsables de la dynamique temporelle de chaque espèce.[...]
Tonle Sap Lake (TSL) is one of the world's largest lakes and is a biodiversity hotspot in Southeast Asia. It supports high fish productivity which sustains protein supply for millions of people in the region. This study aims to investigate (1) spatial and temporal dynamics of fish community composition, (2) the effects of environmental factors on fish distribution and (3) effects of fishing lot abolishment on fish biomass, community and structure in TSL. By using multivariate statistical methods on fish and environmental data, the thesis highlights that: * There were two fish assemblages in TSL: the northern assemblage, mostly characterised by black fishes, and the southern assemblage, mainly linked to white, grey and estuarine fishes. Fish assemblages from earlier years (1994 and 1995) were represented by the abundances of all functional groups, i.e. black, white and grey fishes, and from 1996 to 1999, the assemblages were linked only to white and grey fishes. * Fish species distributions were not homogeneous within TSL. In addition, species distribution areas were different and were governed by distinct combinations of the local habitat characteristics and regional climatic factors. * H. lobatus and H. siamensis can co-occur together, but synchronisation and migration of H. lobatus always lead those of H. siamensis. These results suggest that the population of H. lobatus is more responsive to flow pulse variations than those of H. siamensis.[...]

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Pouilly, Marc. „Relations entre l'habitat physique et les poissons des zones à cyprinidés rhéophiles dans trois cours d'eau du bassin rhodanien : vers une simulation de la capacité d'accueil pour les peuplements“. Lyon 1, 1994. http://www.theses.fr/1994LYO10147.

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Les relations habitat-poissons sont etudiees dans 3 cours d'eau du bassin rhodanien (ordre 6 a 9). Cette etude a 2 objectifs: 1 decrire et comprendre la repartition des poissons dans les habitats physiques ; 2 developper des modeles biologiques pour estimer la capacite d'accueil potentielle des cours d'eau pour chaque espece et ses variations en fonction du debit. L'echantillonnage s'appuie sur une stratification prenant en compte l'organisation morphologique des cours d'eau. Ceci permet d'obtenir une bonne representativite de l'habitat physique et des populations de poissons presentes sur un secteur de plusieurs kilometres. Les donnees recoltees ont permis de decrire les preferences d'habitat de 33 taxons (differents stades de developpement de 14 especes). L'organisation spatiale de ces taxons et leur regroupement en guildes d'utilisation de l'habitat, en fonction des conditions hydrodynamiques locales (hauteur, vitesse, substrat), ont ete mis en evidence par des analyses multivariees. L'interpretation de ces resultats permet de distinguer deux fonctions d'utilisation de l'habitat: cache/repos et alimentation. Differents types de modeles biologiques ont ete construits et testes: courbes de preferences, modeles multivariees issus d'analyses factorielles et de regressions multiples. La comparaison de la qualite predictive des modeles multivaries a celle des courbes de preference montre la superiorite des premiers. Des applications completes de simulations de la capacite d'accueil ont ete realisees. Elles servent de support pour l'exploration d'une nouvelle demarche visant a predire la capacite d'accueil pour toutes les especes du peuplement

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Carvajal-Quintero, Juan. „Évaluation des déterminants de l'aire de répartition des poissons d'eau douce pour éclairer leur écologie et conservation“. Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30090.

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Comprendre la répartition géographique des espèces dans l'espace et le temps est un défi de longue date en écologie et évolution. Parmi les principales composantes de la répartition des espèces, la taille de l'aire de répartition géographique a été étudiée dans plusieurs groupes taxonomiques, et liée à de multiples facteurs écologiques et évolutifs. La taille de l'aire de répartition géographique des espèces est également liée au risque d'extinction, où les espèces occupant des aires géographiques plus petites présentent un risque d'extinction plus élevé, et relève donc d'une importance primordiale dans les stratégies de conservation. Les résultats concernant ces aspects fondamentaux et appliqués de la taille de l'aire de répartition géographique ont largement négligé les poissons d'eau douce, se concentrant généralement sur d'autres groupes de vertébrés (p.ex. les mammifères, les oiseaux). Cependant, les poissons d'eau douce, le groupe de vertébrés le plus diversifié, peuvent fournir de nouvelles perspectives sur les déterminants de la taille de l'aire géographique et sur l'impact des perturbations anthropiques en raison de la forme dendritique unique et la taille réduite de leur habitat (des réseaux fluviaux) par rapport aux autres écosystèmes terrestres et marins. Dans ce travail de doctorat, nous avons analysé pour la première fois les patrons globaux de la taille de l'aire géographique des espèces de poissons d'eau douce et testé les hypothèses explicatives précédemment proposées pour d'autres groupes taxonomiques. Nos résultats ont montré que la connectivité actuelle et historique sont les facteurs les plus importants qui déterminent la taille de l'aire de répartition géographique des poissons d'eau douce, contrastant avec les principaux déterminants signalés chez les vertébrés terrestres et marins. D'un point de vue appliqué, nous nous sommes concentrés sur la relation macroécologique communément observée entre la taille de l'aire géographique et la taille corporelle des espèces. Cette relation permettrait d'estimer la taille minimale de l'aire géographique nécessaire aux espèces pour leur persistance à long terme. En se basant sur les fluctuations temporelles des abondances des espèces, nous fournissons une validation mécaniste de cette relation, confortant son utilisation pour identifier les espèces vulnérables et leurs changements de risque d'extinction face aux réductions de l'aire géographique induites par des facteurs anthropiques. En utilisant un bassin fluvial tropical comme étude de cas, nous avons utilisé cette relation macroécologique pour quantifier les changements dans le risque d'extinction des espèces en raison de la fragmentation de leurs aires de répartition due au développement de l'hydroélectricité. Les résultats et les données compilés dans cette thèse représentent des informations utiles pour guider et informer la conservation des poissons d'eau douce et fourni des éléments pour continuer à combler les lacunes théoriques
Understanding the geographic distribution of species across space and time is one of the long-standing challenges in ecology and evolution. Among the major components of species distribution, the species' geographic range size has been studied across several taxonomic groups and has been related to multiple ecological and evolutionary factors. The geographic range size of species is also of paramount importance in conservation strategies because it consistently emerges as a key correlate of extinction risk, where species occupying smaller geographic ranges are assumed to have a higher risk of extinction. Results concerning these fundamental and applied aspects of geographic range size have largely neglected freshwater fish, commonly focusing on the usual vertebrate groups (e.g. mammals, birds). However, freshwater fish, the most diverse vertebrate group, can provide novel insights about the geographic range size determinants and threats because of the unique dendritic shape and reduced amount of their habitat (i.e. river networks) compared to other terrestrial and marine ecosystems. In this PhD work, we analyzed for the first time the global patterns of geographic range size in freshwater fish species and tested previous hypotheses proposed to explain the variation of geographic range size in other taxonomic groups. Our findings showed that current and historical connectivity are the most important factors driving the geographic range size of freshwater fishes, contrasting with the main determinants reported for terrestrial and marine taxa. From an applied point of view, we focused on the usually observed macroecological relationship between the species' geographic range size and body size. This relationship would allow estimating the minimum geographic range size needed by species for long-term persistence. Based on ecological theory of species temporal fluctuations of abundances, we provide a mechanistic validation of this relationship, supporting its use to identify vulnerable species and their changes in extinction risk through reduced geographic ranges induced by anthropogenic factors. Using a tropical river basin as a case study, we used this macroecological relationship to quantify changes in species extinction risk due to the fragmentation of their ranges caused by hydropower development. The results and the data compiled in this thesis represent useful information to guide and inform conservation in freshwater fish and give the opportunity to continue filling theoretical gaps

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Geoffroy, Maxime. „Signature bioacoustique, distribution et abondance des poissons pélagiques et des mammifères marins en mer de Beaufort (Arctique canadien) : une réponse à l’énigme de la morue arctique manquante“. Doctoral thesis, Université Laval, 2016. http://hdl.handle.net/20.500.11794/26568.

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Tableau d’honneur de la Faculté des études supérieures et postdoctorales, 2015-2016
La mer de Beaufort canadienne subit la double pression des changements climatiques et de l’accroissement des activités industrielles. Malgré l’importance de l’écosystème marin de la région pour les communautés locales, certaines de ses composantes demeurent peu documentées, en particulier la distribution et l’abondance des poissons pélagiques et des mammifères marins. Cette thèse repose sur des bases de données hydroacoustiques, de filets et de chaluts recueillies de 2006 à 2014 afin d’améliorer nos connaissances de la signature bioacoustique des poissons pélagiques et des mammifères marins de la mer de Beaufort et, ultimement, d’estimer plus précisément leur distribution et leur abondance. Pour ce faire, je documente : (1) la distribution verticale et les migrations ontogéniques des poissons pélagiques sur un cycle annuel complet; (2) la distribution spatiale et le recrutement des poissons pélagiques en fonction de la date de la débâcle et des températures de surface; et (3) l’indice de réflexion acoustique et la forme des échos des principaux mammifères marins. La morue arctique (Boreogadus saida) formait 95% de l’assemblage des poissons pélagiques et les individus de plus d’un an demeuraient au-dessus du talus, dans l’halocline pacifique et la couche atlantique (> 100 m), tout au long de l’année. Au contraire, les jeunes de l’année colonisaient la couche épipélagique (< 100 m) de leur éclosion au printemps jusqu’à leur descente en profondeur à l’automne. L’abondance et la biomasse de morues arctiques mesurées acoustiquement atteignaient des valeurs significativement plus élevées au sud de la mer de Beaufort et dans le golfe d’Amundsen qu’au nord. Le taux de croissance larvaire et le recrutement augmentaient les années où la débâcle survenait plus tôt et où les températures de surface vernales étaient plus élevées. Le stock pélagique de morues arctiques suffisait généralement à soutenir les besoins énergétiques des principales espèces de mammifères marins. Cependant, ceux-ci doivent probablement plonger plus profondément les années où le stock diminue afin d’attraper les morues arctiques de plus grandes tailles (> 10 cm) demeurant près du fond. La signature acoustique des baleines et des phoques documentée dans cette thèse pourrait être utilisée afin de compléter les levés visuels à l’aide de sonars et d’échosondeurs scientifiques. La présence de faux positifs limite cependant l’utilisation de ces instruments sous leur forme actuelle et des recommandations sont fournies afin d’améliorer les techniques de détection de mammifères marins à l’aide de l’hydroacoustique.
The Canadian Beaufort Sea faces the double pressure of climate change and increasing industrial activities. Despite the importance of the marine ecosystem of the region for local communities, some of its components remain poorly documented, in particular the distribution and abundance of pelagic fish and marine mammals. This thesis is based on hydroacoustic, net, and trawl datasets collected from 2006 to 2014 and documents the acoustic signature of pelagic fish and marine mammals to, ultimately, estimate their abundance and distribution more accurately. I study and discuss: (1) the vertical distribution and ontogenic migrations of pelagic fish over the annual cycle; (2) the spatial distribution and recruitment of pelagic fish in relation with the date of the ice breakup and sea-surface temperatures; and (3) Target Strengths and echotraces of the main marine mammal species. Arctic cod (Boreogadus saida) formed 95% of the pelagic fish assemblage and age-1+ individuals remained over the slope, in the Pacific Halocline and the Atlantic Layer (> 100 m), throughout the year. In contrast, age-0 arctic cod colonized the epipelagic layer (< 100 m) from hatching in spring until their descent to depth during fall. The abundance and biomass of arctic cod measured acoustically was significantly higher in southern Beaufort Sea and the Amundsen Gulf than in northern areas. Larval growth and recruitment increased during years with an early ice breakup and warmer sea-surface temperatures in spring. The stock of pelagic arctic cod was generally high enough to support the energetic requirements of the main marine mammal species. However, they likely had to dive deeper to feed on large (> 10 cm) bottom-dwelling arctic cod when the pelagic stock diminished. The acoustic signature of whales and seals documented here could be used to complement visual surveys with scientific sonars and echosounders. The occurrence of false positives, however, limits the use of these instruments under their current form and recommendations are provided to improve the efficiency of active acoustic monitoring at detecting marine mammals.

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Tisseuil, Clément. „Modéliser l'impact du changement climatique sur les écosystèmes aquatiques par approche de downscaling“. Toulouse 3, 2009. http://thesesups.ups-tlse.fr/763/.

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L'objectif était d'évaluer l'impact du changement global sur les écosystèmes aquatiques au cours du 21ème siècle, dans le bassin Adour Garonne (S-O France). Une approche de " downscaling " a été développée à l'interface entre les sciences du climat, de l'hydro-chimie et de l'écologie. Les résultats suggèrent une augmentation globale des débits hivernaux ainsi que des débits d'étiages plus faibles. Les concentrations en nitrate pourraient augmenter, de même que la distribution des espèces de poissons les plus thermophiles. Toutefois, une diminution des gaz à effet de serre ainsi qu'une modification des pratiques agricoles (ex. Diminution des fertilisants azotés) pourraient limiter l'intensité des perturbations écologiques. Cette thèse offre une contribution originale, notamment pour la gestion future des ressources hydriques et écologiques
This thesis aimed at assessing the impact of global change on freshwater ecosystems during the 21st century in the Adour Garonne area (SW France). A downscaling approach was developed linking techniques from climate, hydro-chemical and ecological sciences. The main results suggest an increase of high flows in winter as well as more severe low flows in summer. Nitrogen concentrations and thermophile fish species distribution may also increase. Reducing green house gas emissions and modifying agricultural practices (e. G reducing nitrate fertilizers) could reduce the intensity of ecological disturbances. This study is an original contribution to the management of future hydrological and ecological resources

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Rougier, Thibaud. „Repositionnement des poissons migrateurs amphihalins européens dans un contexte de changement climatique : une approche exploratoire par modélisation dynamique mécaniste“. Thesis, Bordeaux, 2014. http://www.theses.fr/2014BORD0055/document.

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Le changement climatique en cours modifie les conditions environnementales et les espèces doivent s'adapter à ces nouvelles conditions, en restant sur place ou en se déplaçant conduisant alors à de nouvelles distributions. Ce repositionnement revêt deux dimensions principales : (i) l'adaptabilité des espèces aux nouvelles conditions (changement de traits d'histoire de vie) liée à la résilience des populations et (ii) leur capacité à explorer de nouveaux habitats favorables. Cette étude avait pour objectif l’élaboration d’un modèle dynamique mécaniste intégrant ces deux dimensions de manière à pouvoir évaluer, comprendre et prédire les possibilités de repositionnement des poissons migrateurs amphihalins européens face au changement climatique.Pour accomplir leurs cycles de vie, les espèces migratrices amphihalines utilisent nécessairement des écosystèmes dulçaquicoles, estuariens et marins. Ces cycles de vie particuliers leur confèrent un plus grand potentiel de repositionnement que les espèces dulçaquicoles. Une base de données sur les traits de vie de ces espèces intégrant notamment ceux pouvant potentiellement être influencés par le changement climatique et ceux pouvant jouer un rôle dans le potentiel de dispersion des espèces a été construite pour l’ensemble des espèces amphihalines européens. Une méthode d’analyse multicritère hiérarchique a été proposée pour définir un indice basé sur les traits de vies visant à caractériser le potentiel de repositionnement des espèces migratrices amphihalines.Le modèle GR3D (Global Repositioning Dynamics for Diadromous fish Distribution) a ensuite été développé pour étudier de façon dynamique le repositionnement potentiel de ces espèces, à large échelle, dans un contexte scénarisé de changement climatique. Il s’agit d’un modèle de simulation stochastique, individus centré, intégrant les principaux processus de dynamique de population d’un poisson migrateur amphihalin (reproduction, mortalité, croissance, migration de montaison avec dispersion, migration de dévalaison).Un premier cas d’étude exploratoire simulant le repositionnement d’une population virtuelle de grande alose (Alosa alosa) de son bassin versant d’origine à un bassin versant voisin inhabité dans un contexte d’augmentation de la température a permis de réaliser une analyse de sensibilité globale du modèle GR3D à la fois aux paramètres incertains de dynamique de population et aux paramètres reliés à la structure de l’environnement. Il a été mis en évidence une sensibilité particulière du modèle aux paramètres liés à la durée de vie et à la mortalité en mer ainsi qu’à la distance entre les deux bassins versants de l’environnement pour déterminer le succès de colonisation.Enfin, l’utilisation du modèle GR3D sur un cas d’application réel a permis de commencer à évaluer l’évolution de la persistance de la grande alose à l’échelle de son aire de répartition (i.e. la façade atlantique) dans un contexte de changement climatique.Les simulations du modèle GR3D devraient ainsi trouver à terme des applications pour la gestion et la conservation des espèces migratrices amphihalines
The ongoing climate change is modifying the environmental conditions and species have to adapt to these new constraints, either on the same site or migrating in new suitable sites leading to a modification of distribution area. This repositioning has two main dimensions: (i) the species capacity to adapt to the new conditions (modification of life history traits) which is linked to the species resilience and (ii) the species capacity to explore new suitable habitats. The objective of this study was to build a mechanistic model incorporating these two dimensions in order to evaluate, understand and predict the repositioning possibilities of European diadromous fish facing climate change.In their life cycles, diadromous fish species have to use freshwater, estuarine and marine ecosystems. These specific life history strategies represent a great repositioning potential in comparison to freshwater fish species. A database of diadromous fish life history traits, incorporating those that could be influenced by climate change and those that could have an importance in the species repositioning potential, has been built. An Analytic Hierarchy Process has been suggested to develop a composite score based on life traits aiming at assessing the diadromous species repositioning potential.Then, the GR3D model (Global Repositioning Dynamics for Diadromous fish Distribution) has been developed in order to study with a dynamic approach the repositioning potential of diadromous fish, at a large scale, in a context of climate change. This model is a simulation, stochastic and individual-based model incorporating the main population dynamics processes of a diadromous fish (reproduction, mortality, growth, upstream migration with dispersal and downstream migration).A first exploratory application case simulating the repositioning of a virtual allis shad (Alosa alosa) population between two river catchments under a scenario of temperature increase has been carried out and the associated global sensitivity analysis has been performed in order to determine the influence of uncertain population dynamics parameters and of parameters defining the landscape stucture. The results showed that dispersal distance and parameters related to sea lifespan and to survival at sea were crucial to determine the success of colonization.Finally, the use of GR3D in a real application case allowed improving the understanding of allis shad persistence at the scale of its distribution area (i.e. the Atlantic coast) in a context of climate change.Over time, simulation results of GR3D should be relevant and useful in management and conservation of diadromous fish species

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Maire, Anthony. „Comment sélectionner les zones prioritaires pour la conservation et la restauration des communautés de poissons de rivière ? Applications aux échelles de la France et du Pas-de-Calais“. Phd thesis, Toulouse, INPT, 2014. http://oatao.univ-toulouse.fr/13313/1/Maire.pdf.

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Face à l’érosion globale de la biodiversité des écosystèmes aquatiques continentaux, l’identification des mesures de gestion les plus urgentes à mettre en place est cruciale. En s’appuyant sur une approche innovante et multi-facettes de la diversité, les priorités de conservation pour les assemblages de poissons de rivière ont pu être déterminées à l’échelle de la France. La durabilité de ces priorités de conservation face aux principales composantes des changements globaux a ensuite été évaluée afin d’identifier les zones qui protégeront efficacement la biodiversité actuelle dans le futur. La méthodologie développée a finalement été appliquée au réseau hydrographique du département du Pas-de-Calais dans le but d’identifier précisément les priorités locales de conservation et de restauration. Ces outils pourront par la suite être utilisés comme support d’aide à la décision et adaptés selon les besoins des gestionnaires des milieux aquatiques.

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Chaumillon, Gilles. „Déterminisme du recrutement chez les poissons plats du plateau néo-écossais, Atlantique nord-ouest, une étude basée sur la distribution de fréquence des dates de naissances et la croissance“. Thesis, National Library of Canada = Bibliothèque nationale du Canada, 1997. http://www.collectionscanada.ca/obj/s4/f2/dsk3/ftp04/nq25225.pdf.

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Bourgeaud, Luana. „Histoire évolutive et potentiel adaptatif : une approche éco-évolutive de la vulnérabilité des espèces aux changements climatiques“. Thesis, Toulouse 3, 2020. http://www.theses.fr/2020TOU30263.

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Comprendre les processus influençant la distribution géographique des espèces est un des objectifs en écologie et il revêt actuellement un intérêt particulier puisque le changement climatique causé par les activités humaines entraine la redistribution des espèces à la surface du globe. Dans ce contexte, nous avons exploré la dynamique temporelle de la niche climatique (ensemble des exigences climatiques d'une espèce) dans le but de déterminer la capacité des espèces à faire face aux changements climatiques. Pour cela, nous nous sommes intéressés aux taux de changements de niches climatiques passés qui décrivent les changements de niches climatiques survenus au cours de l'histoire évolutive des espèces faisant alors l'hypothèse que les changements climatiques passés pourraient refléter les changements climatiques actuels. Suite à la reconstruction d'une phylogénie datée pour 12616 espèces de poissons, nous avons compilé des données climatiques et de distributions afin d'estimer pour chaque espèce les taux de changements de niches climatiques passés. Dans un premier projet, nous avons étudié les facteurs influençant les taux de changements de niches climatiques passés dans les milieux aquatiques. Nous avons en particulier confirmé que les taux de changements de niches climatiques passés sont plus forts vers les latitudes les plus hautes. Nous avons également discuté des différences entre les écosystèmes marins et d'eau douce. Dans un deuxième projet, nous avons corrélé les taux de changements de niches climatiques avec des mesures de déplacements d'aires de distribution contemporains. Nous avons montré que les taux de changements de niches climatiques sont positivement associés aux déplacements d'aires de distribution contemporains chez les poissons marins. Nos résultats suggèrent que l'influence des taux de changements de niches climatiques passés et plus généralement de l'histoire évolutive des espèces sur leurs réponses aux changements climatiques actuels doit être explorée plus amplement pour définir comment ce domaine pourra informer la conservation de la biodiversité
Understanding the processes influencing the geographical distribution of species is one of the main aims in ecology and is of particular interest since climate change caused by human activities is currently leading to the geographical redistribution of species. In this context, we explored the temporal dynamics of the climatic niche (the set of climatic requirements of a species) in an attempt to determine species' ability to cope with climate change. To do this, we investigated historical rates of climatic niche change which describe past climatic niche changes that occurred over the course of species evolutionary history assuming that past climatic changes reflect current climate change. Following the reconstruction of a dated phylogeny for 12,616 fish species, we compiled climate and distribution data to estimate historical rates of climatic niche change. In a first project, we studied the factors influencing historical rates of climatic niche change in aquatic environments. In particular, we confirmed that historical rates of climatic niche change are greater at higher latitudes. We also discussed the differences between marine and freshwater ecosystems. In a second project, we correlated historical rates of climatic niche change with measures of contemporary range shifts. We showed that historical rates of climatic niche change are positively associated with contemporary range shifts in marine fish. Our results suggest that the influence of historical rates of climatic niche change and more generally of species evolutionary history on their response to current climate change needs to be further explored to determine how it can inform biodiversity conservation

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Chambert, Christine. „Caractérisation des déplacements de poissons dans et entre compartiments d'un réseau fluvial (Rhône) : étude par marquage et recaptures multiples“. Lyon 1, 1989. http://www.theses.fr/1989LYO10012.

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La lone des pecheurs, au nord-est de lyon, est un bras mont du rhone alimente en eau phreatique a l'amont et communicant avec le fleuve a l'aval. La double origine des eaux entraine l'installation d'un gradient saisonnier amont/aval des parametres physico-chimiques, qui se repercute sur la repartition spatio-temporelle des poissons. Le peuplement comporte des tanches, des poissons-chats et des gardons, qui ont fait l'objet d'echantillonnage et de marquage depuis 1978. L'analyse des deplacements met en evidence une fonte sedentarite des tanches, et des trajets plus importants en periode de reproduction. L'emplacement des frayeres semble varier d'une annee a l'autre. Les recaptures multiples permettent de considerer l'importance de la variabilite individuelle chez cette espece. Les poissons-chats sont presents dans toute la lone en hiver. Au debut de l'ete, les individus devalent et abandonnent la partie superieure du bras mont. Le deplacement inverse s'effectue a l'automne. Ces mouvements equivalent a se placer dans les eaux les plus chaudes. La variete des comportements est grande: migration d'hivernage a l'amont, sedentarisation a l'aval, recaptures successives dans les differentes stations. Les effectifs de gardons captures augmentent au printemps, a la remontee sur les frayeres (parties moyennes et superieures de la lone). En dehors de la fraye, les captures sont irregulieres, mais surtout localisees a l'aval, ou refluent les eaux du fleuve. Plusieurs recaptures ont eu lieu dans le rhone. L'influence des debits du fleuve sur les variations d'effectifs de gardons est discutee, ainsi que le role des fluctuations saisonnieres de temperature dans les deplacements des trois especes etudiees. L'utilisation de modeles log-lineaires permet d'estimer les probabilites de capture et de survie apparente des individus marques. On compare les trois especes, et on considere l'impact des conditions exterieures sur ces parametres (variations des probabilites de capture suivant la station, evolution de la survie. . . )

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Lteif, Myriam. „Biology, distribution and diversity of cartilaginous fish species along the Lebanese coast, eastern Mediterranean“. Thesis, Perpignan, 2015. http://www.theses.fr/2015PERP0026/document.

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L’objectif de cette étude était de contribuer à une meilleure compréhension des poissons cartilagineux dans les eaux côtières libanaises du bassin oriental de la Méditerranée. Dans ce contexte, les différents aspects relatifs à la distribution, la diversité, la biologie et l’écologie de ces espèces ont été développés. Au total, 315 spécimens de poissons cartilagineux ont été échantillonnés appartenant à 25 espèces, dont 11 espèces de requins et 14 espèces de batoïdes. Aucune chimère n’a été enregistrée. Les données ont été collectées à partir (a) de captures expérimentales dans le cadre du projet "CIHEAM PESCA-Libano" et (b) d’observations périodiques des poissons dans les poissonneries et capturés par les pêcheurs. A partir des données de captures expérimentales, la distribution spatio-temporelle a été évaluée à travers lecalcul de ‘la capture par unité d'effort’. Cette dernière a été estimée à la fois à partir des données des scientifiques et commerciales, en prenant en considération le nombre total d’espèces. Différentes relations longueur-poids ont été établies pour 3 requins et 5 batoïdes, et cela pour les espèces présentant un nombre d’individus supérieur à 10. Finalement, la biologie et l’écologie de deux espèces commerciales bien exploitées dans les eaux côtières libanaises ont été présentées
The aim of this study is to contribute to a better knowledge of cartilaginous fish in the Lebanese coastal waters, Eastern Mediterranean. Emphasis was placed on various aspects of the distribution, diversity, biology and ecology of these species. In this study, a total of 314 specimens of cartilaginous fish were sampled. These specimens constituted of 25 cartilaginousfish species, 11 shark species and 14 batoid species. No chimaeras were recorded. The data was collected from two sources: (a) an experimental survey in the framework of the CIHEAM PESCA-Libano project and (b) periodic observation of fisheries and catches of hired fishermen. Spatiotemporal distribution was evaluated using the Catch Per Unit Effort of the experimental survey data. Spatiotemporal diversity was also estimated taking into account the total number of species caught in the survey and fisheries/fishermen data. Length-weight relationships for three sharks and five batoids were also presented for species of the combined data sources having more than 10 individuals. Finally, the biology and ecology of two commercially significant and exploited species were also presented as a first step in their fishery management andconservation

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Lasne, Émilien. „Connectivité hydrologique et distribution spatiale de l’ichtyofaune dans le bassin versant de la Loire : de l’assemblage à la population (cas de l’anguille européenne)“. Rennes 1, 2007. http://www.theses.fr/2007REN1S110.

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Dans un contexte d’érosion de la biodiversité riveraine, cette thèse s’intéresse à l’influence de la connectivité hydrologique sur la distribution de l’ichtyofaune dans le bassin de la Loire à différentes échelles spatiales (le bassin dans son ensemble et la plaine inondable) et biologiques (l’assemblage et la population d’anguille européenne). Les résultats montrent que la connectivité hydrologique influence fortement les patrons de distribution des poissons aux deux échelles spatiales considérées. Elle détermine la qualité de l’habitat et la composition et la structure des assemblages. Les faibles niveaux de connectivité créent des habitats lentiques favorables aux espèces exotiques et défavorables aux espèces natives vulnérables. Elle détermine par ailleurs les possibilités de déplacements des poissons entre éléments de l’hydrosystème comme cela a été illustré par le cas de l’anguille
In a context of river biodiversity loss, this work aims at understanding the influence of hydrological connectivity on fish distribution in the Loire catchment at different spatial (the whole catchment and the floodplain) and biological (the assemblage and the European eel’s population) scales. The results show that hydrological connectivity strongly drives fish distribution patterns at both spatial scales. It determines the habitat quality and the composition and structure of fish assemblages. Low connectivity levels create lentic habitats that favour exotic species and disfavour threatened native species. Connectivity also determines fish opportunities to move between various elements of the hydrosystem as it has been shown for the European eel

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Lenoir, Sylvain. „Impact du réchauffement climatique sur la distribution spatiale des ressources halieutiques le long du littoral français : observations et scénarios“. Thesis, Lille 1, 2011. http://www.theses.fr/2011LIL10047/document.

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Cette thèse doctorale, réalisée dans le cadre d’un partenariat avec des professionnels de la pêche, a pour objet l’étude de l’impact du réchauffement climatique sur la distribution spatiale des poissons en Atlantique Nord, à l’aide de l’application d’un nouveau modèle d’habitat appelé le Non-Parametric Probabilistic Ecological Niche Model (NPPEN). Le modèle NPPEN est non-paramétrique et basé sur le concept de niche écologique (sensu Hutchinson). Le modèle ne requiert que des données de présence. Il est donc bien adapté à l’étude à macro-échelle de la biogéographie des espèces marines Le modèle NPPEN teste la distance généralisée de Mahalanobis par un test non-paramétrique de permutations afin de produire et de cartographier les probabilités de présence des espèces. L’application de ce nouveau modèle, sur plus de cinquante espèces marines en Atlantique Nord, a mis en évidence l’impact du réchauffement climatique sur la biogéographie des espèces et sur la structure et la trophodynamique de l’écosystème marin. Des bouleversements, déjà observés dans la distribution spatiale et l’abondance (probabilités de présence) d’espèces de poissons, tels la morue de l’Atlantique ou le lançon nordique, ont été retrouvés. En majorité, les espèces vont effectuer un déplacement dirigé vers le nord, pour rester dans un environnement conforme à leur niche écologique. L’intensité et la vitesse des mouvements biogéographiques attendus, de même que le bilan des gains ou pertes d’aires de répartition spatiale diffèrent selon les poissons ; régis par les capacités de déplacements des espèces, leur domaine de tolérance environnementale (largeur de leur niche) et l’intensité du réchauffement climatique
This aims to study the impact of climate warming on the spatial distribution of fish in the North Atlantic, using the new habitat model called the Non-Parametric Probabilistic Ecological Niche Model (NPPEN). The model NPPEN is nonparametric and requires only presence data. It is based on concept of the ecological niche sensu Hutchinson. The model NPPEN tests the Mahalanobis generalised distance by permutations to produce and map the probability of species occurrence. The model is therefore well suited to study expected changes in the biogeography of marine species at macro-scale. Applying this new model on more than fifty marine species in the North Atlantic, has highlighted the impact of global warming on the biogeography of species, structure and trophodynamic of the marine ecosystem. Disruption, already observed in spatial distribution and abundance (probability of occurrence) of fish species such as Atlantic cod and lesser sandeel were found again. The majority of species will move northward to stay in an environment consistent with their ecological niche. The intensity and rapidity of the biogeographic movements expected, as the balance of gains or losses in the spatial range differ among fish; governed by the ability of species movement, their range of environmental tolerance (niche breadth) and the intensity of global warming

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Loots, Christophe. „Contrôle de la distribution spatiale de l'habitat de reproduction chez les populations de poissons : approche multi-modèles appliquée à la plie et au merlan de Mer du Nord et à l'anchois du Golfe de Gascogne“. Paris 6, 2009. http://www.theses.fr/2009PA066496.

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La reproduction est une phase importante du cycle de vie des poissons car elle assure le renouvellement du nombre d’individus dans la population. La détermination des facteurs qui influencent sa dynamique spatiale est donc un point capital car elle va affecter le succès de la reproduction. Une approche multi-modèles a été développée afin d’identifier les facteurs contrôlant la distribution spatiale des adultes reproducteurs pour la plie et le merlan de Mer du Nord et pour l’anchois du golfe de Gascogne. Les modèles additifs généralisés ont été utilisés pour relier la présence-absence des individus et leurs abondances aux différentes hypothèses de contrôle externes (position géographique et environnement) et internes à la population (dépendance spatiale, taille, structure en âge et mémoire). Les modèles construits ont été classés en fonction de leur aptitude à refléter les distributions observées. Les hypothèses de contrôle importantes ont alors été identifiées à partir des meilleurs modèles. L’habitat de reproduction montre une structuration très importante dans l’espace. L’approche multi-modèles révèle (1) l’influence de l’environnement sur l’occupation des zones de reproduction et (2) le degré d’abondance avec lequel ces zones sont occupées est déterminé par des facteurs internes à la population. La persistance dans le temps de la structuration spatiale de la reproduction est facilitée par un attachement des individus à leur site de reproduction. Celui ci est plus fort pour des bentho-démersaux comme la plie et le merlan que pour un pélagique comme l’anchois.

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Gu, Kangxia. „Testing the rates of Poisson distribution“. Ann Arbor, Mich. : ProQuest, 2006. http://gateway.proquest.com/openurl?url_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:dissertation&res_dat=xri:pqdiss&rft_dat=xri:pqdiss:3213456.

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Thesis (Ph.D. in Statistical Science)--S.M.U.
Title from PDF title page (viewed July 6, 2007). Source: Dissertation Abstracts International, Volume: 67-03, Section: B, page: 1504. Advisers: Hon Keung Tony Ng; William R. Schucany. Includes bibliographical references.

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Cohen, Pierre. „Régionalisation de l'habitat physique du poisson : approche multi-scalaire et application au bassin de la Loire, France“. Lyon 1, 1998. http://www.theses.fr/1998LYO10099.

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Le theme de la regionalisation de l'habitat physique du poisson a ete aborde sur les cours d'eau de taille moyenne (rang 5) de quatre regions-test du bassin de la loire. Nous avons teste la pertinence d'un decoupage hydroecoregional de ce bassin, realise sur la base de criteres geologiques, hydroegeologiques, de relief et de climat (wasson et coll. , 1993). L'objet de cette these est d'etudier l'habitat physique du poisson avec une approche multi-scalaire (depuis la region jusqu'a la station), de chercher les modes de structuration de l'habitat et les variables de controle de ces modes de structuration. Les hypotheses generales de ce travail sont : i/ qu'il existe une variabilite intra-regionale, controlee essentiellement par des facteurs de proximite, tels que la taille et la pente de la riviere, et ii/ que cette variabilite se double d'une variabilite inter-regionale, avec les facteurs de controle de large echelle qui ont servi au decoupage hydroecoregional teste. Nous avons testes ces hypotheses ; i/ a l'echelle de la vallee, en etudiant la morphologie de la vallee grace a des donnees morphometriques simples relevees sur cartes, ii/ a l'echelle du troncon, en etudiant les distributions de facies morphologiques d'ecoulement et leur agencement grace a des donnees de terrain simples, iii/ a l'echelle de la station, en caracterisant la morphologie et l'hydraulique des facies d'ecoulement de meme type mais de regions differents sur 15 stations-test, iv/ a l'echelle de la station, par l'intermediaire de modeles d'habitat couplant un modele hydraulique et des modeles biologiques de preference d'habitat sur les memes 15 stations. Les resultats principaux permettent d'opposer les regions deux a deux. En sedimentaire et armoricain, l'evolution longitudinale des caracteristiques moyennes de la vallee et des distributions de facies est significative, ce qui se traduit par un mode de structuration de l'habitat domine par les mecanismes d'erosion/sedimentation. En sagnes et limousin, le profil longitudinal des cours d'eau est beaucoup plus irregulier, souvent marque par des alternances de secteurs pentus et plateaux. Le lit des cours d'eau est souvent cohesifs et la structuration de l'habitat est controlee localement, par des affleurements de roche, des ruptures de pente ou encore par des accidents topographiques. Les resultats de la modelisation de l'habitat sont insuffisant pour mettre en valeur les differences inter-regionales observees par d'autre moyens.

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Wang, Ling. „Homogeneity tests for several poisson populations“. HKBU Institutional Repository, 2008. http://repository.hkbu.edu.hk/etd_ra/909.

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Rodrigues, Cristiane. „Distribuições em série de potências modificadas inflacionadas e distribuição Weibull binominal negativa“. Universidade de São Paulo, 2011. http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11134/tde-28062011-095106/.

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Neste trabalho, alguns resultados, tais como, função geradora de momentos, relações de recorrência para os momentos e alguns teoremas da classe de distribuições em séries de potencias modificadas (MPSD) proposta por Gupta (1974) e da classe de distribuições em séries de potências modificadas inflacionadas (IMPSD) tanto em um ponto diferente de zero como no ponto zero são apresentados. Uma aplicação do Modelo Poisson padrão, do modelo binomial negativo padrão e dos modelos inflacionados de zeros para dados de contagem, ZIP e ZINB, utilizando-se as técnicas dos MLGs, foi realizada para dois conjuntos de dados reais juntamente com o gráfico normal de probabilidade com envelopes simulados. Também foi proposta a distribuição Weibull binomial negativa (WNB) que é bastante flexível em análise de dados positivos e foram estudadas algumas de suas propriedades matemáticas. Esta é uma importante alternativa para os modelos Weibull e Weibull geométrica, sub-modelos da WNB. A demostração de que a densidade da distribuição Weibull binomial negativa pode ser expressa como uma mistura de densidades Weibull é apresentada. Fornecem-se, também, seus momentos, função geradora de momentos, gráficos da assimetria e curtose, expressoes expl´citas para os desvios médios, curvas de Bonferroni e Lorenz, função quantílica, confiabilidade e entropia, a densidade da estat´stica de ordem e expressões explícita para os momentos da estatística de ordem. O método de máxima verossimilhança é usado para estimar os parametros do modelo. A matriz de informação esperada ´e derivada. A utilidade da distribuição WNB está ilustrada na an´alise de dois conjuntos de dados reais.
In this paper, some result such as moments generating function, recurrence relations for moments and some theorems of the class of modified power series distributions (MPSD) proposed by Gupta (1974) and of the class of inflated modified power series distributions (IMPSD) both at a different point of zero as the zero point are presented. The standard Poisson model, the standard negative binomial model and zero inflated models for count data, ZIP and ZINB, using the techniques of the GLMs, were used to analyse two real data sets together with the normal plot with simulated envelopes. The new distribution Weibull negative binomial (WNB) was proposed. Some mathematical properties of the WNB distribution which is quite flexible in analyzing positive data were studied. It is an important alternative model to the Weibull, and Weibull geometric distributions as they are sub-models of WNB. We demonstrate that the WNB density can be expressed as a mixture of Weibull densities. We provide their moments, moment generating function, plots of the skewness and kurtosis, explicit expressions for the mean deviations, Bonferroni and Lorenz curves, quantile function, reliability and entropy, the density of order statistics and explicit expressions for the moments of order statistics. The method of maximum likelihood is used for estimating the model parameters. The expected information matrix is derived. The usefulness of the new distribution is illustrated in two analysis of real data sets.

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Dissertationen zum Thema „Distribution poissons“

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