Zeitschriftenartikel zum Thema „Continuous conformational variability of biomolecules“
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Vuillemot, Rémi, Mohamad Harastani, Ilyes Hamitouche und Slavica Jonic. „MDSPACE and MDTOMO Software for Extracting Continuous Conformational Landscapes from Datasets of Single Particle Images and Subtomograms Based on Molecular Dynamics Simulations: Latest Developments in ContinuousFlex Software Package“. International Journal of Molecular Sciences 25, Nr. 1 (19.12.2023): 20. http://dx.doi.org/10.3390/ijms25010020.
Der volle Inhalt der QuelleLuchinat, Claudio. „Exploring the conformational heterogeneity of biomolecules: theory and experiments“. Physical Chemistry Chemical Physics 18, Nr. 8 (2016): 5684–85. http://dx.doi.org/10.1039/c6cp90029a.
Der volle Inhalt der QuelleDeVore, Kira, und Po-Lin Chiu. „Probing Structural Perturbation of Biomolecules by Extracting Cryo-EM Data Heterogeneity“. Biomolecules 12, Nr. 5 (24.04.2022): 628. http://dx.doi.org/10.3390/biom12050628.
Der volle Inhalt der QuelleSorzano, C. O. S., A. Jiménez, J. Mota, J. L. Vilas, D. Maluenda, M. Martínez, E. Ramírez-Aportela et al. „Survey of the analysis of continuous conformational variability of biological macromolecules by electron microscopy“. Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications 75, Nr. 1 (01.01.2019): 19–32. http://dx.doi.org/10.1107/s2053230x18015108.
Der volle Inhalt der QuelleMa, Shaoqing, Zhiwei Li, Shixiang Gong, Chengbiao Lu, Xiaoli Li und Yingwei Li. „High Frequency Electromagnetic Radiation Stimulates Neuronal Growth and Hippocampal Synaptic Transmission“. Brain Sciences 13, Nr. 4 (19.04.2023): 686. http://dx.doi.org/10.3390/brainsci13040686.
Der volle Inhalt der QuelleValimehr, Sepideh, Rémi Vuillemot, Mohsen Kazemi, Slavica Jonic und Isabelle Rouiller. „Analysis of the Conformational Landscape of the N-Domains of the AAA ATPase p97: Disentangling the Continuous Conformational Variability in Partially Symmetrical Complexes“. International Journal of Molecular Sciences 25, Nr. 6 (16.03.2024): 3371. http://dx.doi.org/10.3390/ijms25063371.
Der volle Inhalt der QuellePancera, S. M., H. Gliemann, D. F. S. Petri und T. Schimmel. „Adsorption Behaviour of Creatine Phosphokinase onto Silicon Wafers: Comparison between Ellipsometric and Atomic Force Microscopy Data“. Microscopy and Microanalysis 11, S03 (Dezember 2005): 56–60. http://dx.doi.org/10.1017/s1431927605050889.
Der volle Inhalt der QuelleHarastani, Mohamad, Mikhail Eltsov, Amélie Leforestier und Slavica Jonic. „TomoFlow: Analysis of Continuous Conformational Variability of Macromolecules in Cryogenic Subtomograms based on 3D Dense Optical Flow“. Journal of Molecular Biology 434, Nr. 2 (Januar 2022): 167381. http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2021.167381.
Der volle Inhalt der QuelleWang, Chenzheng, Yuexia Lin, Devin Bougie und Richard E. Gillilan. „Predicting data quality in biological X-ray solution scattering“. Acta Crystallographica Section D Structural Biology 74, Nr. 8 (24.07.2018): 727–38. http://dx.doi.org/10.1107/s2059798318005004.
Der volle Inhalt der QuelleMora-Navarro, Camilo, Mario E. Garcia, Prottasha Sarker, Emily W. Ozpinar, Jeffrey R. Enders, Saad Khan, Ryan C. Branski und Donald O. Freytes. „Monitoring decellularization via absorbance spectroscopy during the derivation of extracellular matrix scaffolds“. Biomedical Materials 17, Nr. 1 (26.11.2021): 015008. http://dx.doi.org/10.1088/1748-605x/ac361f.
Der volle Inhalt der QuelleRakhimov, Adil, Miras Zekebayev, Aray Kuatbek und Vyacheslav Dyachkov. „Comparison of dosimetry parameters of three-dimensional conformational radiation therapy and volumetric modulated arc therapy on the example of treatment of a patient with salivary gland adenocarcinoma“. Oncologia i radiologia Kazakhstana 59, Nr. 1 (31.03.2021): 25–30. http://dx.doi.org/10.52532/2521-6414-2021-1-59-25-30.
Der volle Inhalt der QuelleTissino, Erika, Tamara Bittolo, Dania Benedetti, Riccardo Bomben, Gabriela Forestieri, Eva Szenes, Andrea Haerzschel et al. „The VLA-4 Integrin Is Constitutively Activated in a Subset of CD49d-Expressing CLL: A Relationship with the Autonomous BCR-Mediated Signaling?“ Blood 132, Supplement 1 (29.11.2018): 5531. http://dx.doi.org/10.1182/blood-2018-99-111450.
Der volle Inhalt der QuelleHarastani, Mohamad, Mikhail Eltsov, Amélie Leforestier und Slavica Jonic. „HEMNMA-3D: Cryo Electron Tomography Method Based on Normal Mode Analysis to Study Continuous Conformational Variability of Macromolecular Complexes“. Frontiers in Molecular Biosciences 8 (19.05.2021). http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2021.663121.
Der volle Inhalt der QuelleDsouza, Raison, Ghoncheh Mashayekhi, Roshanak Etemadpour, Peter Schwander und Abbas Ourmazd. „Energy landscapes from cryo-EM snapshots: a benchmarking study“. Scientific Reports 13, Nr. 1 (25.01.2023). http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-28401-w.
Der volle Inhalt der QuelleDashti, Ali, Ghoncheh Mashayekhi, Mrinal Shekhar, Danya Ben Hail, Salah Salah, Peter Schwander, Amedee des Georges, Abhishek Singharoy, Joachim Frank und Abbas Ourmazd. „Retrieving functional pathways of biomolecules from single-particle snapshots“. Nature Communications 11, Nr. 1 (18.09.2020). http://dx.doi.org/10.1038/s41467-020-18403-x.
Der volle Inhalt der QuelleNierzwicki, Łukasz, und Giulia Palermo. „Molecular Dynamics to Predict Cryo-EM: Capturing Transitions and Short-Lived Conformational States of Biomolecules“. Frontiers in Molecular Biosciences 8 (05.04.2021). http://dx.doi.org/10.3389/fmolb.2021.641208.
Der volle Inhalt der QuelleBogetti, Xiaowei, und Sunil Kumar Saxena. „Integrating Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy and Computational Modeling to Measure Protein Structure and Dynamics“. ChemPlusChem, 06.10.2023. http://dx.doi.org/10.1002/cplu.202300506.
Der volle Inhalt der QuelleVuillemot, Rémi, Isabelle Rouiller und Slavica Jonić. „MDTOMO method for continuous conformational variability analysis in cryo electron subtomograms based on molecular dynamics simulations“. Scientific Reports 13, Nr. 1 (30.06.2023). http://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-37037-9.
Der volle Inhalt der QuelleGiraldo-Barreto, Julian, Sebastian Ortiz, Erik H. Thiede, Karen Palacio-Rodriguez, Bob Carpenter, Alex H. Barnett und Pilar Cossio. „A Bayesian approach to extracting free-energy profiles from cryo-electron microscopy experiments“. Scientific Reports 11, Nr. 1 (01.07.2021). http://dx.doi.org/10.1038/s41598-021-92621-1.
Der volle Inhalt der QuelleZhang, Jingxing, Rundong Wu, Yancong Feng, Rongzeng Lai, Jinglun Liao, Zhijian Mai, Yao Wang, Ying Xiang, Hao Li und Guofu Zhou. „Optically Tunable Multistable Liquid Crystal Grating for Anti‐Counterfeiting through Multilayer Continuous Phase Analysis“. Advanced Optical Materials, 27.03.2024. http://dx.doi.org/10.1002/adom.202302423.
Der volle Inhalt der QuellePunjani, Ali, und David J. Fleet. „3DFlex: determining structure and motion of flexible proteins from cryo-EM“. Nature Methods, 11.05.2023. http://dx.doi.org/10.1038/s41592-023-01853-8.
Der volle Inhalt der QuelleHarastani, Mohamad, Rémi Vuillemot, Ilyes Hamitouche, Nima Barati Moghadam und Slavica Jonic. „ContinuousFlex: Software package for analyzing continuous conformational variability of macromolecules in cryo electron microscopy and tomography data“. Journal of Structural Biology, Oktober 2022, 107906. http://dx.doi.org/10.1016/j.jsb.2022.107906.
Der volle Inhalt der QuelleRibeiro, I., F. Pires, C. R. C. Calado und M. Gallard. Molina. „P–769 FTIR spectroscopy analysis reveals differences between human embryo culture media composition by type of formulation and by manufacturer“. Human Reproduction 36, Supplement_1 (01.07.2021). http://dx.doi.org/10.1093/humrep/deab130.768.
Der volle Inhalt der QuelleReynolds, Matthew J., Carla Hachicho, Ayala G. Carl, Rui Gong und Gregory M. Alushin. „Bending forces and nucleotide state jointly regulate F-actin structure“. Nature, 26.10.2022. http://dx.doi.org/10.1038/s41586-022-05366-w.
Der volle Inhalt der QuelleHolguin, Bianka A., Zacariah L. Hildenbrand und Ricardo A. Bernal. „Insights Into the Role of Heat Shock Protein 27 in the Development of Neurodegeneration“. Frontiers in Molecular Neuroscience 15 (30.03.2022). http://dx.doi.org/10.3389/fnmol.2022.868089.
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