Zeitschriftenartikel zum Thema „Acidic patch“
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Skrajna, Aleksandra, Dennis Goldfarb, Katarzyna M. Kedziora, Emily M. Cousins, Gavin D. Grant, Cathy J. Spangler, Emily H. Barbour et al. „Comprehensive nucleosome interactome screen establishes fundamental principles of nucleosome binding“. Nucleic Acids Research 48, Nr. 17 (07.07.2020): 9415–32. http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa544.
Der volle Inhalt der QuelleCucinotta, Christine E., A. Elizabeth Hildreth, Brendan M. McShane, Margaret K. Shirra und Karen M. Arndt. „The nucleosome acidic patch directly interacts with subunits of the Paf1 and FACT complexes and controls chromatin architecture in vivo“. Nucleic Acids Research 47, Nr. 16 (21.06.2019): 8410–23. http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz549.
Der volle Inhalt der QuelleKalashnikova, Anna A., Mary E. Porter-Goff, Uma M. Muthurajan, Karolin Luger und Jeffrey C. Hansen. „The role of the nucleosome acidic patch in modulating higher order chromatin structure“. Journal of The Royal Society Interface 10, Nr. 82 (06.05.2013): 20121022. http://dx.doi.org/10.1098/rsif.2012.1022.
Der volle Inhalt der QuelleOleinikov, Pavel D., Anastasiia S. Fedulova, Grigoriy A. Armeev, Nikita A. Motorin, Lovepreet Singh-Palchevskaia, Anastasiia L. Sivkina, Pavel G. Feskin et al. „Interactions of Nucleosomes with Acidic Patch-Binding Peptides: A Combined Structural Bioinformatics, Molecular Modeling, Fluorescence Polarization, and Single-Molecule FRET Study“. International Journal of Molecular Sciences 24, Nr. 20 (14.10.2023): 15194. http://dx.doi.org/10.3390/ijms242015194.
Der volle Inhalt der QuelleNavarro Negredo, Paloma, James R. Edgar, Antoni G. Wrobel, Nathan R. Zaccai, Robin Antrobus, David J. Owen und Margaret S. Robinson. „Contribution of the clathrin adaptor AP-1 subunit µ1 to acidic cluster protein sorting“. Journal of Cell Biology 216, Nr. 9 (25.07.2017): 2927–43. http://dx.doi.org/10.1083/jcb.201602058.
Der volle Inhalt der QuelleDebelouchina, Galia T., Karola Gerecht und Tom W. Muir. „Ubiquitin utilizes an acidic surface patch to alter chromatin structure“. Nature Chemical Biology 13, Nr. 1 (21.11.2016): 105–10. http://dx.doi.org/10.1038/nchembio.2235.
Der volle Inhalt der QuelleBirrane, Gabriel, Anne P. Beigneux, Brian Dwyer, Bettina Strack-Logue, Kristian Kølby Kristensen, Omar L. Francone, Loren G. Fong et al. „Structure of the lipoprotein lipase–GPIHBP1 complex that mediates plasma triglyceride hydrolysis“. Proceedings of the National Academy of Sciences 116, Nr. 5 (17.12.2018): 1723–32. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1817984116.
Der volle Inhalt der QuelleBatchelor, Lucinda K., Louis De Falco, Paul J. Dyson und Curtis A. Davey. „Viral peptide conjugates for metal-warhead delivery to chromatin“. RSC Advances 14, Nr. 13 (2024): 8718–25. http://dx.doi.org/10.1039/d4ra01617c.
Der volle Inhalt der QuelleCROWLEY, Peter B., David M. HUNTER, Katsuko SATO, William McFARLANE und Christopher DENNISON. „The parsley plastocyanin-turnip cytochrome f complex: a structurally distorted but kinetically functional acidic patch“. Biochemical Journal 378, Nr. 1 (15.02.2004): 45–51. http://dx.doi.org/10.1042/bj20031423.
Der volle Inhalt der QuelleHaneburger, Ina, Andreas Eichinger, Arne Skerra und Kirsten Jung. „New Insights into the Signaling Mechanism of the pH-responsive, Membrane-integrated Transcriptional Activator CadC of Escherichia coli“. Journal of Biological Chemistry 286, Nr. 12 (06.01.2011): 10681–89. http://dx.doi.org/10.1074/jbc.m110.196923.
Der volle Inhalt der QuelleGuiney, Evan L., Till Klecker und Scott D. Emr. „Identification of the endocytic sorting signal recognized by the Art1-Rsp5 ubiquitin ligase complex“. Molecular Biology of the Cell 27, Nr. 25 (15.12.2016): 4043–54. http://dx.doi.org/10.1091/mbc.e16-08-0570.
Der volle Inhalt der QuelleNakabayashi, Yu, und Masayuki Seki. „Functional Analyses of an Evolutionarily Conserved Acidic Patch on the Nucleosome“. Biological and Pharmaceutical Bulletin 46, Nr. 11 (01.11.2023): 1619–24. http://dx.doi.org/10.1248/bpb.b23-00480.
Der volle Inhalt der QuelleKujirai, Tomoya, Christian Zierhut, Yoshimasa Takizawa, Ryan Kim, Lumi Negishi, Nobuki Uruma, Seiya Hirai, Hironori Funabiki und Hitoshi Kurumizaka. „Structural basis for the inhibition of cGAS by nucleosomes“. Science 370, Nr. 6515 (10.09.2020): 455–58. http://dx.doi.org/10.1126/science.abd0237.
Der volle Inhalt der QuelleHo, Cheng-Han, Yoshimasa Takizawa, Wataru Kobayashi, Yasuhiro Arimura, Hiroshi Kimura und Hitoshi Kurumizaka. „Structural basis of nucleosomal histone H4 lysine 20 methylation by SET8 methyltransferase“. Life Science Alliance 4, Nr. 4 (11.02.2021): e202000919. http://dx.doi.org/10.26508/lsa.202000919.
Der volle Inhalt der QuelleLesbats, Paul, Erik Serrao, Daniel P. Maskell, Valerie E. Pye, Nicola O’Reilly, Dirk Lindemann, Alan N. Engelman und Peter Cherepanov. „Structural basis for spumavirus GAG tethering to chromatin“. Proceedings of the National Academy of Sciences 114, Nr. 21 (10.05.2017): 5509–14. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1621159114.
Der volle Inhalt der QuelleGallego, Laura D., Medini Ghodgaonkar Steger, Anton A. Polyansky, Tobias Schubert, Bojan Zagrovic, Ning Zheng, Tim Clausen, Franz Herzog und Alwin Köhler. „Structural mechanism for the recognition and ubiquitination of a single nucleosome residue by Rad6–Bre1“. Proceedings of the National Academy of Sciences 113, Nr. 38 (06.09.2016): 10553–58. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.1606863113.
Der volle Inhalt der QuelleDao, Hai T., Barbara E. Dul, Geoffrey P. Dann, Glen P. Liszczak und Tom W. Muir. „A basic motif anchoring ISWI to nucleosome acidic patch regulates nucleosome spacing“. Nature Chemical Biology 16, Nr. 2 (09.12.2019): 134–42. http://dx.doi.org/10.1038/s41589-019-0413-4.
Der volle Inhalt der QuelleSato, Katsuko, Takamitsu Kohzuma und Christopher Dennison. „Pseudospecificity of the Acidic Patch of Plastocyanin for the Interaction with Cytochromef“. Journal of the American Chemical Society 126, Nr. 10 (März 2004): 3028–29. http://dx.doi.org/10.1021/ja038188k.
Der volle Inhalt der QuelleBortoluzzi, Alessio, Anastasia Amato, Xavier Lucas, Manuel Blank und Alessio Ciulli. „Structural basis of molecular recognition of helical histone H3 tail by PHD finger domains“. Biochemical Journal 474, Nr. 10 (04.05.2017): 1633–51. http://dx.doi.org/10.1042/bcj20161053.
Der volle Inhalt der QuelleZhu, Michael X. „A well-known potassium channel plays a critical role in lysosomes“. Journal of Cell Biology 216, Nr. 6 (16.05.2017): 1513–15. http://dx.doi.org/10.1083/jcb.201704017.
Der volle Inhalt der QuelleLehmann, Laura C., Luka Bacic, Graeme Hewitt, Klaus Brackmann, Anton Sabantsev, Guillaume Gaullier, Sofia Pytharopoulou et al. „Mechanistic Insights into Regulation of the ALC1 Remodeler by the Nucleosome Acidic Patch“. Cell Reports 33, Nr. 12 (Dezember 2020): 108529. http://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2020.108529.
Der volle Inhalt der QuelleWong, Won Fen, Kuan Ping Ang, Gautam Sethi und Chung Yeng Looi. „Recent Advancement of Medical Patch for Transdermal Drug Delivery“. Medicina 59, Nr. 4 (17.04.2023): 778. http://dx.doi.org/10.3390/medicina59040778.
Der volle Inhalt der QuelleMcBride, Matthew J., Nazar Mashtalir, Evan B. Winter, Hai T. Dao, Martin Filipovski, Andrew R. D’Avino, Hyuk-Soo Seo et al. „The nucleosome acidic patch and H2A ubiquitination underlie mSWI/SNF recruitment in synovial sarcoma“. Nature Structural & Molecular Biology 27, Nr. 9 (03.08.2020): 836–45. http://dx.doi.org/10.1038/s41594-020-0466-9.
Der volle Inhalt der QuelleSato, Shoko, Yoshimasa Takizawa, Fumika Hoshikawa, Mariko Dacher, Hiroki Tanaka, Hiroaki Tachiwana, Tomoya Kujirai et al. „Cryo-EM structure of the nucleosome core particle containing Giardia lamblia histones“. Nucleic Acids Research 49, Nr. 15 (05.08.2021): 8934–46. http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkab644.
Der volle Inhalt der QuelleDhar, Surbhi, Ozge Gursoy-Yuzugullu, Ramya Parasuram und Brendan D. Price. „The tale of a tail: histone H4 acetylation and the repair of DNA breaks“. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 372, Nr. 1731 (28.08.2017): 20160284. http://dx.doi.org/10.1098/rstb.2016.0284.
Der volle Inhalt der QuelleUbbink, M., X. S. Gong, J. C. Gray und D. S. Bendall. „Protein:protein interactions studied by NMR: does cytochrome c bind to plastocyanin on its acidic patch?“ Journal of Inorganic Biochemistry 59, Nr. 2-3 (August 1995): 282. http://dx.doi.org/10.1016/0162-0134(95)97385-4.
Der volle Inhalt der QuelleSubramanian, Vidya, Aprotim Mazumder, Lauren E. Surface, Vincent L. Butty, Paul A. Fields, Allison Alwan, Lillian Torrey et al. „H2A.Z Acidic Patch Couples Chromatin Dynamics to Regulation of Gene Expression Programs during ESC Differentiation“. PLoS Genetics 9, Nr. 8 (22.08.2013): e1003725. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1003725.
Der volle Inhalt der QuelleShaytan, Alexey, Grigoriy A. Armeev, Pavel D. Oleinikov, Nikita A. Motorin, Lavprit Singh-Palchevskaya, Anastasiia L. Sivkina, Pavel G. Feskin et al. „Interactions of nucleosomes with acidic patch binding peptides: Combining structural analysis, MD simulations, and experiments“. Biophysical Journal 123, Nr. 3 (Februar 2024): 3a. http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2023.11.150.
Der volle Inhalt der QuelleWu, Yinsheng, Haoshen Xue, Fei Liu, Xinyue Wang, Ling Chen, Maoshen Chen, Bor-Sen Chiou, Xinghu Zhou, Xue Jiao und Fang Zhong. „Improving stability of phycocyanin under acidic conditions by surface patch binding induced complexation with gelatin“. Food Hydrocolloids 161 (April 2025): 110876. http://dx.doi.org/10.1016/j.foodhyd.2024.110876.
Der volle Inhalt der QuelleEvlanenkov, Konstantin K., Maxim V. Nikolaev, Natalia N. Potapieva, Konstantin V. Bolshakov und Denis B. Tikhonov. „Probing the Proton-Gated ASIC Channels Using Tetraalkylammonium Ions“. Biomolecules 13, Nr. 11 (08.11.2023): 1631. http://dx.doi.org/10.3390/biom13111631.
Der volle Inhalt der QuelleMerchant, Mark, Felix F. Vajdos, Mark Ultsch, Henry R. Maun, Ulrich Wendt, Jennifer Cannon, William Desmarais, Robert A. Lazarus, Abraham M. de Vos und Frederic J. de Sauvage. „Suppressor of Fused Regulates Gli Activity through a Dual Binding Mechanism“. Molecular and Cellular Biology 24, Nr. 19 (01.10.2004): 8627–41. http://dx.doi.org/10.1128/mcb.24.19.8627-8641.2004.
Der volle Inhalt der QuelleGuce, Abigail, Sarah Mortimer, Elizabeth Mellins, Lars Karlsson und Lawrence Stern. „Structural basis of HLA-DO inhibition of HLA-DM catalyzed peptide exchange on MHC class II (100.53)“. Journal of Immunology 186, Nr. 1_Supplement (01.04.2011): 100.53. http://dx.doi.org/10.4049/jimmunol.186.supp.100.53.
Der volle Inhalt der QuelleCucinotta, Christine E., Alexandria N. Young, Kristin M. Klucevsek und Karen M. Arndt. „The Nucleosome Acidic Patch Regulates the H2B K123 Monoubiquitylation Cascade and Transcription Elongation in Saccharomyces cerevisiae“. PLOS Genetics 11, Nr. 8 (04.08.2015): e1005420. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1005420.
Der volle Inhalt der QuelleValencia, Alfredo M., Clayton K. Collings, Hai T. Dao, Roodolph St. Pierre, Yung-Chih Cheng, Junwei Huang, Zhen-Yu Sun et al. „Recurrent SMARCB1 Mutations Reveal a Nucleosome Acidic Patch Interaction Site That Potentiates mSWI/SNF Complex Chromatin Remodeling“. Cell 179, Nr. 6 (November 2019): 1342–56. http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2019.10.044.
Der volle Inhalt der QuelleLeung, Justin W., Poonam Agarwal, Marella D. Canny, Fade Gong, Aaron D. Robison, Ilya J. Finkelstein, Daniel Durocher und Kyle M. Miller. „Nucleosome Acidic Patch Promotes RNF168- and RING1B/BMI1-Dependent H2AX and H2A Ubiquitination and DNA Damage Signaling“. PLoS Genetics 10, Nr. 3 (06.03.2014): e1004178. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1004178.
Der volle Inhalt der QuelleYu, Y., N. N. Jiménez-Vargas, C. D. Lopez Lopez, J. O. Jaramillo Polanco, N. W. Bunnett und S. Vanner. „A213 A NOVEL PH-SENSITIVE OPIOID ANALGESIC THAT IS SELECTIVELY ACTIVATED IN ACIDIC INFLAMMATORY ENVIRONMENTS“. Journal of the Canadian Association of Gastroenterology 3, Supplement_1 (Februar 2020): 85–87. http://dx.doi.org/10.1093/jcag/gwz047.212.
Der volle Inhalt der QuelleHodges, Amelia J., Lisa M. Gloss und John J. Wyrick. „Residues in the Nucleosome Acidic Patch Regulate Histone Occupancy and Are Important for FACT Binding in Saccharomyces cerevisiae“. Genetics 206, Nr. 3 (03.05.2017): 1339–48. http://dx.doi.org/10.1534/genetics.117.201939.
Der volle Inhalt der QuelleChen, Qinming, Renliang Yang, Nikolay Korolev, Chuan Fa Liu und Lars Nordenskiöld. „Regulation of Nucleosome Stacking and Chromatin Compaction by the Histone H4 N-Terminal Tail–H2A Acidic Patch Interaction“. Journal of Molecular Biology 429, Nr. 13 (Juni 2017): 2075–92. http://dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2017.03.016.
Der volle Inhalt der QuelleYakushiji, Fumika, Aoi Ishikawa, Akira Katsuyama und Satoshi Ichikawa. „Development of cyclic peptide derivatives from the N-terminal region of LANA for targeting the nucleosome acidic patch“. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 30, Nr. 2 (Januar 2020): 126839. http://dx.doi.org/10.1016/j.bmcl.2019.126839.
Der volle Inhalt der QuellePathak, Prasad, und Stephen Whalen. „Using Geospatial Techniques to Analyze Landscape Factors Controlling Ionic Composition of Arctic Lakes, Toolik Lake Region, Alaska“. International Journal of Applied Geospatial Research 3, Nr. 3 (Juli 2012): 37–57. http://dx.doi.org/10.4018/jagr.2012070103.
Der volle Inhalt der QuelleMiller, Gregory J., Stanley D. Dunn und Eric H. Ball. „Interaction of the N- and C-terminal Domains of Vinculin“. Journal of Biological Chemistry 276, Nr. 15 (21.12.2000): 11729–34. http://dx.doi.org/10.1074/jbc.m008646200.
Der volle Inhalt der QuelleGeorgiev, Yordan N., Manol H. Ognyanov, Hiroaki Kiyohara, Tsvetelina G. Batsalova, Balik M. Dzhambazov, Milan Ciz, Petko N. Denev et al. „Acidic polysaccharide complexes from purslane, silver linden and lavender stimulate Peyer’s patch immune cells through innate and adaptive mechanisms“. International Journal of Biological Macromolecules 105 (Dezember 2017): 730–40. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2017.07.095.
Der volle Inhalt der QuelleAl Hanbali, Othman A., Haji Muhammad Shoaib Khan, Muhammad Sarfraz, Mosab Arafat, Shakeel Ijaz und Abdul Hameed. „Transdermal patches: Design and current approaches to painless drug delivery“. Acta Pharmaceutica 69, Nr. 2 (01.06.2019): 197–215. http://dx.doi.org/10.2478/acph-2019-0016.
Der volle Inhalt der QuelleMarcianò, G., und D. T. Huang. „Structure of the human histone chaperone FACT Spt16 N-terminal domain“. Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications 72, Nr. 2 (22.01.2016): 121–28. http://dx.doi.org/10.1107/s2053230x15024565.
Der volle Inhalt der QuelleBociąg, Katarzyna. „The impact of acidic organie Matter on the diversity of underwater vegetation in soft water lakes“. Acta Societatis Botanicorum Poloniae 72, Nr. 3 (2011): 221–29. http://dx.doi.org/10.5586/asbp.2003.029.
Der volle Inhalt der QuelleHuang, Ren-Qi, und Glenn H. Dillon. „Effect of Extracellular pH on GABA-Activated Current in Rat Recombinant Receptors and Thin Hypothalamic Slices“. Journal of Neurophysiology 82, Nr. 3 (01.09.1999): 1233–43. http://dx.doi.org/10.1152/jn.1999.82.3.1233.
Der volle Inhalt der QuelleZeilhofer, H. U., D. Swandulla, P. W. Reeh und M. Kress. „Ca2+ permeability of the sustained proton-induced cation current in adult rat dorsal root ganglion neurons“. Journal of Neurophysiology 76, Nr. 5 (01.11.1996): 2834–40. http://dx.doi.org/10.1152/jn.1996.76.5.2834.
Der volle Inhalt der QuelleLo, Stanley M., Kyle A. McElroy und Nicole J. Francis. „Chromatin Modification by PSC Occurs at One PSC per Nucleosome and Does Not Require the Acidic Patch of Histone H2A“. PLoS ONE 7, Nr. 10 (11.10.2012): e47162. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0047162.
Der volle Inhalt der QuelleMcNitt, Dudley H., Soo Jeon Choi, Douglas R. Keene, Livingston Van De Water, Flavia Squeglia, Rita Berisio und Slawomir Lukomski. „Surface-exposed loops and an acidic patch in the Scl1 protein of group AStreptococcusenable Scl1 binding to wound-associated fibronectin“. Journal of Biological Chemistry 293, Nr. 20 (02.04.2018): 7796–810. http://dx.doi.org/10.1074/jbc.ra118.002250.
Der volle Inhalt der QuelleYe, Youpi, Hao Wu, Kangjing Chen, Cedric R. Clapier, Naveen Verma, Wenhao Zhang, Haiteng Deng, Bradley R. Cairns, Ning Gao und Zhucheng Chen. „Structure of the RSC complex bound to the nucleosome“. Science 366, Nr. 6467 (31.10.2019): 838–43. http://dx.doi.org/10.1126/science.aay0033.
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